转化植物、使用转化植物的含糖溢泌物的制造方法

文档序号:10493261阅读:303来源:国知局
转化植物、使用转化植物的含糖溢泌物的制造方法
【专利摘要】从植物产生包含高浓度糖的溢泌物。导入编码具有从被分类为进化枝III的SWEET蛋白质的氨基酸序列导出的规定的共有序列的参与糖运输的转运蛋白的核酸,和/或强化该蛋白质的表达。
【专利说明】
转化植物、使用转化植物的含糖溢泌物的制造方法
技术领域
[0001] 本发明涉及通过导入规定的基因而获得了优异特性的转化植物和使用该转化植 物的含糖溢泌物的制造方法。
【背景技术】
[0002] 生物燃料、生物塑料的稳定生产要求廉价且稳定的原料糖供给。最具代表性的原 料糖是甘蔗所蓄积的糖。为了从甘蔗取出糖,一般需要在规定的收获期采伐甘蔗,进行破碎 加工、压榨、浓缩、纯化等处理。另外,收获后的旱田需要进行用于新的栽培的旱田保养、栽 插、散布除草剂和/或防虫剂等管理作业。这样,一直以来,使用甘蔗等植物的原料糖的制造 需要制造工序的成本、栽培成本等巨大的成本。
[0003] 专利文献1中公开了使用能表达地导入了异种基因的植物来回收由该异种基因编 码的异种蛋白质的方法。在专利文献1所公开的方法中,从能表达地导入了异种基因的植物 采集溢泌物,从采集的溢泌物回收异种蛋白质。在专利文献1中作为溢泌物,例示了作为根 莖的溢泌物和叶的介由排水组织(hydathode)的溢泌物而从植物渗出的吐水(guttation)。 [000 4]另一方面,专利文献2和非专利文献1中,对于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、稻 (Oryza sativa),公开了参与植物体内的糖运输的转运蛋白蛋白质。专利文献2和非专利文 献1所公开的转运蛋白蛋白质作为GLUE蛋白质或SWEET蛋白质已知。通过将编码专利文献2 和非专利文献1所公开的转运蛋白蛋白质的核酸导入植物,有时对根的糖运输量提高。
[0005] 另外,非专利文献2中通过人工地使细胞膜小分子转运蛋白定位于内质网 (endoplasmic reticulum;ER),通过测定ER中的小分子转运蛋白活性而确认了细胞膜转运 蛋白的功能。特别是对于葡萄糖转运蛋白GLUTs、SGLTs,使其定位于ER,使用FRET (荧光共振 會泛量车专移,Forster resonance energy transfer或fluorescence resonance energy transfer)法类推了它们本来的功能。
[0006] 现有技术文献
[0007] 专利文献
[0008] 专利文献1:日本特表2002-501755号公报
[0009] 专利文献2:日本特表2012-525845号公报
[00?0]非专利文献
[0011] 非专利文献 l:Nature(2010)468,527-534
[0012] 非专利文献2:FASEB J. (2010)24,2849-2858

【发明内容】

[0013] 发明要解决的课题
[0014] 如上,为了使用植物制造糖,成本的增大是非常大的问题,但如果能够使来自植物 的溢泌物中以高浓度含有糖,则能够通过采集溢泌物来解决上述问题。专利文献1中虽然公 开了从溢泌物回收异种蛋白质,但并没有公开从溢泌物回收糖。专利文献2和非专利文献1 中虽然公开了参与糖运输的被命名为SWEET的转运蛋白蛋白质和编码它们的核酸,但并没 有公开这些转运蛋白蛋白质、编码它们的核酸与溢泌物中的糖含量的关系。
[0015] 因此,本发明鉴于上述事实,目的在于提供产生包含高浓度的糖的溢泌物的转化 植物和使用该转化植物的糖的制造方法。
[0016] 用于解决课题的方法
[0017] 为了实现上述目的,本
【发明人】们进行了深入研究,结果发现,在导入了编码规定的 组(进化枝)所含的SWEET蛋白质的核酸,强化了该蛋白质的表达的转化植物中,溢泌物的糖 含量非常高,从而完成了本发明。
[0018] 本发明包含以下内容。
[0019] (1)转化植物或转化植物细胞,其中,导入了编码参与糖运输的转运蛋白蛋白质的 核酸,和/或强化了该蛋白质的表达,所述参与糖运输的转运蛋白蛋白质具有共有序列,所 述共有序列包含以下的氨基酸序列:
[0020] (L/1/V/M/F)X(G/A)XX(I/L/V/M/F)xxxx(L/1/V/F)(A/S)(P/S)(1-3aa)(P/S/T/A) T(F/L)xx(I/V)xxxKxxxxxxxxPYxxx(L/I)xxxx(L/I)x(I/L/M/V/F)xY(A/S/G)(7-13aa) (1/ L/V/M)(l-2aa)(I/V)Nxxxxxx(E/Q)xxYxxx(Y/F)xx(Y/F)(A/G/S)(35-36aa)(R/Q/H)xxxxGx (V/I/L)xxxxx(V/M/L/I/F)xxxx(A/S/T)P(L/M)x(I/V)(I/M/V/L)(2-7aa)(V/I)(V/I/M)x (T/S)x(S/N)xx(F/Y)(M/L)(P/S)(F/I/V/L)xLSxx(L/I)(T/V)xx(A/G)xxff(F/L)xYGxxxxDxx (V/I)xxPNxxGxx(F/L)(G/S)xxQ(Μ/I)x(L/M/I/V/F)(Y/H/F)。
[0021] (2)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是属于作为基于SWEET蛋白质的氨基酸序列的分类组的进化枝I~V中的进化枝III的蛋白 质。
[0022] (3)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质,
[0023] (a)包含序列号15~137的任一氨基酸序列的蛋白质,
[0024] (b)包含与序列号15~137的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、 且具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。
[0025] (4)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列:
[0026] G(L/I/V/F/M)xGx(I/V/L)(I/V/L)(S/T)xxxxL(A/S)P(L/V/I/M)(P/S/T/A)TFxx (I/V)x(K/R)xK(S/T)xxx(F/Y)x(S/A)xPYxx(A/S/T)LxSxxLx(L/I/M/V)(Y/F)Y(A/G)(7-9aa)(L/1)(I/V/L)(T/S) INxx(G/A)xx(I/V/M)(E/Q)xxYxxx(F/Y)(L/1/V/F)x(Y/F)Ax(K/R/ N)xxxxx(T/A)(7-8aa)(V/F/L/I/M)(18-19aa)(R/Q/H)xxxxGx(I/V)xxxxx(V/I/L/M)x(V/M) F(A/V)(A/S/T)PLx(I/V)(I/M/V/L)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)x(F/Y)MP(F/I/L) xLS(L/F/V)xL(T/V)(L/I)xAxxff(F/L)xYG(L/F)xxxDxx(V/I)xxPNxxGxx(L/F)(G/S)xxQMx (L/V/I)(Y/F)xx(Y/F)〇
[0027] (5)根据(4)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质,
[0028] (a)包含序列号15~35的任一氨基酸序列的蛋白质,
[0029] (b)包含与序列号15~35的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、 且具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。
[0030] (6)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列:
[0031] (A/V)xxxG(I/L/V)xGN(I/L/V)(I/L/V)S(F/L)x(V/T)xL(A/S)P(V/L/I)(P/A)TFxx (I/V)x(K/R)xK(S/T)xx(G/S)(F/Y)(Q/S/E)SxPYxx(A/S/T)LxS(A/C/S)xLx(L/I/M)(Y/F)Y (A/G)xx(K/T)(3-5aa)(L/M/P)(L/I)(I/L/V)(T/S)INxx(G/A)xx(I/V)(E/Q)xxY(I/L)x(L/ M/V/I)(F/Y)(L/I/V/F)x(Y/F)Ax(K/R)xxxxx(T/A)xx(L/M/F/V/I)(L/F/V/I)xxx(N/D)(F/ V/I/L)xx(F/L)xx(I/L/V)xxxxxx(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)xxxxGx(I/V)xxxx(S/A)(V/L/M)(C/ S/A)VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(I/M/V)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)E(F/Y)MP(F/I) xLS(L/F/V)xL(T/V)(L/1)(S/N)A(V/1)xff(F/L)xYGLxx(K/N)Dxx(V/1)xxPN(V/1)xGxx(F/L) (G/S)xxQMxL(Y/F)xx(Y/F)〇
[0032] (7)根据(6)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质,
[0033] (a)包含序列号15~26的任一氨基酸序列的蛋白质,
[0034] (b)包含与序列号15~26的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、 且具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。
[0035] (8)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列:
[0036] (M/L/V)xx(T/K/N/S)xxxxAxxFG(L/I/V)LGN(I/L/V)(I/V)SFxVxL(S/A)P(V/I) PTFxxIxK(K/R)K(S/T)x(E/K)(G/S)(F/Y)(Q/E)S(I/L)PYxx(A/S)LxS(A/C)xLx(L/I/M)YY (A/G)xxK(4-5aa)(L/M)(L/I)(I/V)(T/S)IN(A/S/T)(F/V)(G/A)x(F/V)(I/V)(E/Q)xxY(I/ L)x(L/M/I)(F/Y)(F/V/I/L)x(Y/F)Ax(K/R)xx(R/K)xx(T/A)(L/V/M)K(V/L/M/F)(L/I/V/F) xxx(N/D)(F/V/I)xx(F/L)xx(I/L)(L/I/V/F)(L/M/V)(L/V)xx(F/L)(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)x (K/S/Q)x(L/I/V)Gx(I/V)Cxxx(S/A)(V/L)(S/C/A)VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(M/I/V)xxV(I/ V)(K/R)T(K/R)S(V/A)E(Y/F)MPFxLS(L/F)xLT(I/L)(S/N)A(V/I)xff(L/F)xYGLx(L/I)(K/N) Dxx(V/I)A(L/F/I/M)PN(V/I)(L/I/V)Gxx(L/F)GxxQM(I/V)L(Y/F)(V/L/I/M)(V/L/I/M)(Y/ F)(K/R/Q)〇
[0037] (9)根据(8)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质,
[0038] (a)包含序列号15~21的任一氨基酸序列的蛋白质,
[0039] (b)包含与序列号15~21的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列的 蛋白质。
[0040] (10)根据(1)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,是显花植物。
[0041 ] (11)根据(10)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述显花植物是被 子植物。
[0042] (12)根据(11)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述被子植物是单 子叶植物。
[0043] (13)根据(12)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述单子叶植物是 禾本科植物。
[0044] (14)根据(13)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述禾本科植物是 稻属(Oryza)植物。
[0045] (15)根据(11)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述被子植物是双 子叶植物。
[0046] (16)根据(15)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述双子叶植物是 十字花科植物。
[0047] (17)根据(16)所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述十字花科植物 是拟南芥属(Arabidopsis)植物。
[0048] (18)溢泌物的制造方法,包括栽培上述(1)~(17)的任一项所述的转化植物,从该 转化植物采集溢泌物的工序。
[0049] (19)根据(18)所述的溢泌物的制造方法,其特征在于,将栽培所述转化植物的栽 培条件设置为相对湿度80 % RH以上。
[0050] (20)根据(18)所述的溢泌物的制造方法,其特征在于,所述溢泌物是排水液。
[00511本说明书包含作为本申请的优先权基础的日本专利申请2013-273128号的说明书 和/或附图所记载的内容。
[0052]发明的效果
[0053] 根据本发明,能够大幅提高来自植物的溢泌物中的糖含量。即,本发明所涉及的转 化植物,通过导入编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸和/或强化该蛋白质的 表达,能够产生具有高糖含量这样的特征的溢泌物。另外,本发明所涉及的溢泌物的制造方 法,通过利用导入了编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸和/或强化了该蛋白 质的表达的转化植物,能够制造高糖含量的溢泌物。进而,因为从上述转化植物采集的溢泌 物是高糖含量的,因此能够作为制造醇、有机酸、烷烃和萜类化合物等时的原料使用。
【附图说明】
[0054] 图 1-1 是从美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)提供的数据库 GenBank 收集非专利文献 l(Nature(2010)468,527-532) 中规定的属于进化枝III的SWEET蛋白质的氨基酸序列,基于其氨基酸序列信息制成的系统 树的概略图。
[0055] 图1-2是显示图1-1所示的系统树的部分区域的放大图。
[0056]图1 -3是显示图1 -1所示的系统树的部分区域的放大图。
[0057]图2-1是显示图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果的图。 [0058]图2-2是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-1之下的图。
[0059] 图2-3是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-2之下的图。
[0060] 图2-4是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-1之右的图。
[0061] 图2-5是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-2之右的图。
[0062] 图2-6是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-3之右的图。
[0063] 图2-7是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-4之右的图。
[0064] 图2-8是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-5之右的图。
[0065] 图2-9是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图2-6之右的图。
[0066] 图2-10是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-7之右的图。
[0067] 图2-11是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-8之右的图。
[0068] 图2-12是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-9之右的图。
[0069] 图2-13是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-10之右的图。
[0070] 图2-14是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-11之右的图。
[0071] 图2-15是图1-1所示的系统树所包含的蛋白质的多重比对分析的结果,是接着图 2-12之右的图。
[0072] 图3-1是显示在非专利文献l(Nature(2010)468,527-532)中被分类为进化枝III 的SWEET蛋白质的氨基酸序列的多重比对分析结果的图。
[0073]图3-2是在非专利文献l(Nature(2010)468,527-532)中被分类为进化枝III的 SWEET蛋白质的氨基酸序列的多重比对分析的结果,是接着图3-1之下的图。
[0074]图3-3是在非专利文献l(Nature(2010)468,527-532)中被分类为进化枝III的 SWEET蛋白质的氨基酸序列的多重比对分析的结果,是接着图3-2之下的图。
[0075]图4-1是显示该进化枝III中来自拟南芥的SWEET蛋白质和来自稻的SWEET蛋白质 的多重比对分析的结果的图。
[0076]图4-2是该进化枝III中来自拟南芥的SWEET蛋白质和来自稻的SWEET蛋白质的多 重比对分析的结果,是接着图4-1之下的图。
[0077]图5是显示该进化枝III中来自拟南芥的SWEET蛋白质的多重比对分析的结果的 图。
[0078]图6是显示实施例中制作的核酸AtSWEET/pRI201AN的物理图谱的构成模式图。
[0079] 图7是对于拟南芥中在实施例所记载的条件下产生排水液的部分进行拍摄而得的 照片。
[0080] 图 8 是显示实施例中制作的核酸 pZH2B_GW0x_AtSWEETll 和 pZH2B_GW0x_AtSWEET12 的物理图谱的构成模式图。
[0081] 图9是对于稻中在实施例所记载的条件下产生排水液的部分进行拍摄而得的照 片。
【具体实施方式】
[0082] 以下详细说明本发明。
[0083] 在本发明中,将编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸导入细胞内和/ 或强化该蛋白质的表达。由此,能够从细胞内导入了该核酸和/或强化了该蛋白质的表达的 转化植物,采集高糖浓度的溢泌物。其中,溢泌物是指从植物的组织渗出到外部的液体,是 包含例如根溢泌液、种子渗出液、从排水组织渗出的排水液的含义。此外,液体从排水组织 (hy dathode)渗出的现象也称为吐水现象(gut tat i on)。因此,排水液与吐水是同义的。特别 是细胞内导入了编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸和/或强化了该蛋白质的 表达的转化植物能够产生高糖浓度的排水液。
[0084]此外,在本说明书中,核酸是包含DNA和RNA这样的天然存在的核酸、PNA(肽核酸)、 在碱基?糖?磷酸二酯部添加了化学修饰的核酸分子等人工核酸的含义。另外,作为编码 参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸,是包含基因组中存在的基因和该基因的转录产物两 者的含义。
[0085] 另外,在本说明书中,糖是用匕汨出乂的化学式表示的物质,包含多元醇的醛、酮衍 生物、它们的亲缘衍生物、缩合物,是包含多糖、寡糖(低聚糖)、二糖和单糖的含义。也可以 是糖的还原基结合了醇、苯酚、皂苷、色素等糖苷配基的配糖体。单糖有时基于碳数被分类 为丙糖、丁糖、己糖、戊糖等,有时基于分子内的官能基被分类为具有醛基的醛糖、具有酮基 的酮糖等。糖也有时根据距离醛基、酮基最远的手性碳的立体构型而被区分为D系列和L系 列。作为单糖的具体例,可列举葡萄糖、果糖、半乳糖、甘露糖、木糖、木酮糖、核糖、赤藓糖、 苏糖、赤藓酮糖、甘油醛、二羟基丙酮等,作为二糖的具体例,可列举蔗糖、乳糖、麦芽糖、海 藻糖、纤维二糖等。
[0086] 本发明所适用的植物,通过将编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸导 入细胞内和/或强化该蛋白质的表达,从而排水液等溢泌物所含的糖量与野生型相比有意 义地提高。上述蛋白质可以在植物组织的全体细胞中表达,也可以在植物组织的至少一部 分细胞中表达。其中植物组织是包含叶、茎、种子、根和花等植物器官的含义。本发明中导入 核酸,与使编码转运蛋白蛋白质的核酸的每细胞的分子数与野生型中的分子数相比有意义 地增大是同义的。另外,在本发明中,强化转运蛋白蛋白质的表达是指通过改变编码转运蛋 白蛋白质的核酸的表达控制区域和/或将该核酸本身注入细胞内,来提高转录产物、翻译产 物的表达量。
[0087] 参与糖运输的转运蛋白蛋白质基因
[0088] 上述"编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸",编码具有共有序列1的 参与糖运输的转运蛋白蛋白质,所述共有序列1包含以下的氨基酸序列:
[0089] (L/1/V/M/F)X(G/A)XX(I/L/V/M/F)xxxx(L/1/V/F)(A/S)(P/S)(1-3aa)(P/S/T/A) T(F/L)xx(I/V)xxxKxxxxxxxxPYxxx(L/I)xxxx(L/I)x(I/L/M/V/F)xY(A/S/G)(7-13aa)(1/ L/V/M)(l-2aa)(I/V)Nxxxxxx(E/Q)xxYxxx(Y/F)xx(Y/F)(A/G/S)(35-36aa)(R/Q/H)xxxxGx (V/I/L)xxxxx(V/M/L/I/F)xxxx(A/S/T)P(L/M)x(I/V)(I/M/V/L)(2-7aa)(V/I)(V/I/M)x (T/S)x(S/N)xx(F/Y)(M/L)(P/S)(F/I/V/L)xLSxx(L/I)(T/V)xx(A/G)xxff(F/L)xYGxxxxDxx (V/I)xxPNxxGxx(F/L)(G/S)xxQ(Μ/I)x(L/M/I/V/F)(Y/H/F)。
[0090] 在上述氨基酸序列中,x表示任意的氨基酸残基。该氨基酸序列中,由以-连接的2 个数值与aa组成的标记,表示其位置是由任意的氨基酸组成的序列,其序列由该2个数值所 夹的范围的氨基酸残基数组成。在该氨基酸序列中,在括号内将多个氨基酸用/分开显示的 标记,表示其位置是该多个氨基酸中的任一氨基酸。此外,对于本说明书所记载的氨基酸序 列采用本标记方法。
[0091] 另外,对于上述共有序列1,可以换个说法说成是从N末端到C末端由序列号1的氨 基酸序列、1~3个任意的氨基酸残基、序列号2的氨基酸序列、7~13个任意的氨基酸残基、 序列号3的氨基酸序列、I/L/V/M中的任一氨基酸残基、1~2个的氨基酸残基、序列号4的氨 基酸序列、2~7个氨基酸残基和序列号5的氨基酸序列依次连接而成的氨基酸序列。
[0092] 此外,Nature(2010)468,527-534的Supplementary Figure 8中关于参与糖运输 的转运蛋白蛋白质SWEET公开了基于氨基酸序列的系统树。本文献中,公开了来自拟南芥的 STCET蛋白质、来自稻的SWEET蛋白质、来自蒺藜苜蓿的SWEET蛋白质、来自莱茵衣藻 (Chlamydomonas reinhardtii)的SWEET蛋白质、来自小立碗藓(Physcomitrella patens) 的SWEET蛋白质、来自碧冬茄(Petunia hybrida)的SWEET蛋白质、来自秀丽隐杆线虫 (Caenorhabdi ti s e 1 egans)的SWEET蛋白质、来自哺乳类的SWEET蛋白质。根据该系统树,能 够理解作为参与糖运输的转运蛋白蛋白质的SWEET基于其氨基酸序列的类似性被分类为进 化枝I~V的5类。
[0093]对于本文献所公开的参与糖运输的转运蛋白蛋白质SWEET中来自拟南芥 (Arabidopsis thaliana)的SWEET蛋白质、来自稻(Oryza sativa)的SWEET蛋白质、和漠藜 苜蓿(Medicago truncatula)SWEET蛋白质和碧冬前(Petunia hybrida)SWEET蛋白质,在下 述表1中显示GenBank ID号(GenBank ID No)、从基因组数据算出的蛋白质编码区的索引 (Index in the Genome)、基因名、蛋白质名、蛋白质符号、SWEET蛋白质进化枝号和来源生 物种的对应。
[0094]表 1
[0096] 此外,本说明书中记载为AtSWEET的情况,指表1中的AtSWEETl、AtSTCET2、 AtSWEET3、AtSWEET4、AtSWEET5、AtSWEET6、AtSWEET7、AtSWEET8、AtSWEET9、AtSWEET10、 AtSWEETll、AtSWEET12、AtSWEET13、AtSWEET14、AtSWEET15、AtSWEET16 和 AtSWEETT17,记载 为 OsSWEET 的情况,指表 1 中的0sSWEETla、0sSWEETlb、0sSWEET2a、0sSWEET2b、0sSWEET3a、 0sSWEET3b、0sSWEET4、0sSWEET5、0sSWEET6a、0sSWEET6b、0sSWEET7a、0sSWEET7b、 0sSWEET7c、0sSWEETll、0sSWEET12、0sSWEET13、0sSWEET14、0sSWEET15$K)sSWEET16。
[0097]上述共有序列1,是从GenBank数据库收集属于上述文献中规定的进化枝III的 SWEET蛋白质的氨基酸序列,基于其氨基酸序列信息通过ClustalW制成系统树(图1-1~图 1-3)和多重比对(图2-1~图2-15),由制成的系统树和多重比对导出的氨基酸序列。即,上 述具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白蛋白质包含在上述文献中被分类为进化枝III 的SWEET蛋白质,不包含在上述文献中被分类为进化枝I、II、IV和V的任一类的SWEET蛋白 质。换言之,上述共有序列1是在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质和从 GenBank数据库收集的被分类为进化枝III的SWEET蛋白质的特征序列,是成为与上述文献 中进化枝I、II、IV和V的各组的明确区别基准的序列。
[0098] 此外,图1 -1显示系统树的全体像,图1 -2~图1 -3中将图1 -1所示的全体像的部分 区域放大而显示。图1-1所示的全体像中未记载GenBank ID、蛋白质名等,但图1-2~图1-3 所示的部分区域中记载了GenBank ID、蛋白质名等。
[0099] 具体地,进化枝III如图1-1~1-3所示,除了包含表1所示的来自拟南芥、稻、蒺藜 苜蓿和碧冬前的SWEET蛋白质以外,还包含来自大豆(Glycine max)、日本百脉根(Lotus japonicus)、番前(Solanum lycopersicum)、辣椒(Capsicum annuum)、鹰嘴豆(Cicer arietinum)、黄瓜(Cucumis sativus)、桃(Prunus persica)、草莓(Fragaria vesca)、葡萄 (Vitis vinifera)、养菜(Capsella rubella)、毛果杨(Populus trichocarpa)、蓖麻 (Ricinus communis)、玉米(Zea mays)、高粱(Sorghum bicolor)、节节麦(Aegilops tauschii)、二糖短柄草(Brachypodium distachyon)、乌拉尔图小麦(Triticum urartu)、 大麦(Hordeum vulgare)等的SWEET蛋白质。
[0100] 对于这些进化枝in所包含的SWEET蛋白质中表1所示的来自拟南芥、稻、蒺藜苜蓿 和碧冬茄的SWEET蛋白质,将GenBank ID号、基因名、来源生物种和氨基酸序列的序列号的 对应示于下述表2。
[0101] 表2
[0103] 另外,对于来源于除了拟南芥、稻、蒺藜苜蓿和碧冬茄以外的生物种的图1-1~1-3 所示的SWEET蛋白质,将GenBank ID号、来源生物种和氨基酸序列的序列号的对应示于下述 表3、4和5。
[0104] 表3


[0110] 此外,对于表2~5所示的来自各种生物的SWEET蛋白质的氨基酸序列,将使用 ClustalW多重序列比对程序(能够在国立遗传学研究所的DDBJ使用)进行比对分析的结果 示于图2-1~2-15。以下显示分析所用的版本和各种参数。
[0111] ClustalW Version,2.1
[0112] -Pairwise Alignment Parameters
[0113] --Alignment Type,Slow
[0114] --Slow Pairwise Alignment Options
[0115] ---Protein Weight Matrix,Gonnet
[0116] Gap Open,10
[0117] Gap Extension,0.1
[0118] Multiple Sequence Alignment Parameters
[0119] -Protein Weight Matrix,Gonnet
[0120] -Gap Open,10
[0121] -Gap Extension,0.20
[0122] -Gap Distances,5
[0123] -No End Gaps,no
[0124] -Iteration,none
[0125] -Numiter,1
[0126] -Clustering,NJ
[0127] Output Options
[0128] -Format,Ain w/numbers
[0129] -Order,Aligned
[0130] 如图2-1~2-15所示,可以理解上述被分类为SWEET蛋白质的进化枝III的SWEET蛋 白质具有上述共有序列1。其中,在上述共有序列1中,规定的位置所能够取的氨基酸残基的 变化根据以下的理由。如参考文献(1)(《75/导一生化学》第3版第5章酸· · 夕>、°夕質5.酸,主编:市川厚,主译:福刚申一,出版人:曾根良介,出版社:(株)化 学同人、ISBN4-7598-0944-9)中也记载的那样,氨基酸按照具有同样的性质(化学性质、物 理大小)的侧链分类是公知的。另外,在保持蛋白质的活性的前提下,分类于规定的组的氨 基酸残基之间的分子进化上的替换高频率发生也是公知的。基于该考虑,参考文献(2): Henikoff S.,Henikoff J.G.,Amino-acid substitution matrices from protein blocks,Proc.Natl .Acad. Sci.USA,89,10915-10919( 1992)中的Fig. 2提倡了氨基酸残基的 替换变异的得分矩阵(BL0SUM),被广泛使用。在参考文献(2)中,侧链的化学性质相似的氨 基酸彼此的替换是基于带给蛋白质整体的结构、功能变化少这样的见解。根据上述参考文 献(1)和(2),在多重比对中考虑的氨基酸的侧链的组可以以化学性质、物理大小等指标为 基础考虑。这显示为在参考文献(2)所公开的得分矩阵(BL0SUM)中具有得分为0以上的值的 氨基酸、优选为具有1以上的值的氨基酸的组。作为代表性的组,可列举下述8组。其他细的 分组可以是该得分的值彼此为0以上的氨基酸组、优选彼此为1以上的氨基酸组、进一步优 选为2以上的氨基酸组。
[0131] 1)脂肪族疏水性氨基酸组(ILMV组)
[0132] 该组是上述参考文献(1)所示的中性非极性氨基酸中具有脂肪属性的疏水性侧链 的氨基酸的组,由V(Val、缬氨酸)、L(Leu、亮氨酸)、I(11 e、异亮氨酸)和M(Met、甲硫氨酸)构 成。根据参考文献(1)分类为中性非极性氨基酸的氨基酸中FGACWP由于以下理由而不包含 在该"脂肪族疏水性氨基酸组"中。G(Gly、甘氨酸)、A(Ala、丙氨酸)是因为由于侧链为甲基 以下的大小而非极性的效果弱。C(Cys、半胱氨酸)是因为有时S-S键承担重要的作用,另外, 具有与氧原子、氮原子形成氢键的特性。F(Phe、苯丙氨酸)、W(Trp、色氨酸)是因为侧链具有 特别大的分子量,且芳香族的效果强。P(Pro、脯氨酸)是因为亚氨基酸效果强、固定了多肽 的主链的角度。
[0133] 2)具有羟基亚甲基的组(ST组)
[0134]该组是中性极性氨基酸中侧链具有羟基亚甲基的氨基酸的组,由S (Ser、丝氨酸) 和T(Thr、苏氨酸)构成。存在于S和T的侧链的羟基是糖的结合部位,因而多是对于某种多肽 (蛋白质)具有特定的活性重要的部位。
[0135] 3)酸性氨基酸(DE组)
[0136] 该组是侧链具有为酸性的羧基的氨基酸的组,由D(Asp、天冬氨酸)和E(Glu、谷氨 酸)构成。
[0137] 4)碱性氨基酸(KR组)
[0138] 该组是碱性氨基酸的组,由K (Ly s、赖氨酸)和R( Arg、精氨酸)构成。该K和R在广泛 的pH范围内带正电,具有碱性的性质。另一方面,被分类为碱性氨基酸的H(His、组氨酸)在 PH7基本不离子化,所以不分类到该组。
[0139] 5)亚甲基=极性基(DHN组)
[0140]该组全部具有在α位碳元素上作为侧链结合了亚甲基并且在亚甲基前面具有极性 基这样的特征。具有作为非极性基的亚甲基的物理大小酷似的特征,由N(Asn、天冬酰胺、极 性基为酰胺基)、D(Asp、天冬氨酸、极性基为羧基)和H(His、组氨酸、极性基为咪唑基)构成。
[0141] 6)二亚甲基=极性基(EKQR组)
[0142] 该组全部具有在α位碳元素上作为侧链结合了二亚甲基以上的直链烃并在直链烃 的前面具有极性基这样的特征。具有作为非极性基的二亚甲基的物理大小酷似的特征。由Ε (Glu、谷氨酸、极性基为羧基)、K(Lys、赖氨酸、极性基为氨基)、Q(Gln、谷氨酰胺、极性基为 酰胺基)、R(Arg、精氨酸、极性基为亚氨基和氨基)构成。
[0143] 7)芳香族(FYW 组)
[0144] 该组是侧链具有苯核的芳香族氨基酸,以具有芳香族特有的化学性质为特征。由F (卩116、苯丙氨酸)、¥(171'、酪氨酸)、¥(1'印、色氨酸)构成。
[0145] 8)环状&极性(册组)
[0146] 该组是侧链具有环状结构并同时具有极性的氨基酸,由H(H、组氨酸、环状结构和 极性基都是咪唑基)、Y(Tyr、酪氨酸、环状结构为苯核、极性基为羟基)构成。
[0147] 基于上述氨基酸组,能够容易地预想即使将具有某功能的蛋白质的氨基酸序列中 某一氨基酸残基替换成属于同一组的氨基酸残基也能得到具有同样的功能的新蛋白质。例 如基于上述"1)脂肪族疏水性氨基酸组(ILMV组)",能够容易地预想即使将具有某功能的蛋 白质的氨基酸序列中的异亮氨酸残基替换成亮氨酸残基也能得到具有同样的功能的新蛋 白质。在具有某功能的蛋白质存在多种的情况下,也有时作为共有序列而记载氨基酸序列, 但即使在这种情况下,也能够容易地预想即使将某一氨基酸残基替换成属于同一组的氨基 酸残基也能得到具有同样的功能的新蛋白质。例如,当具有某功能的蛋白质存在多种,由此 算出的共有序列中的氨基酸残基为异亮氨酸或亮氨酸(L/I)的时,基于上述"1)脂肪族疏水 性氨基酸组(ILMV组)",能够容易地预想即使将异亮氨酸或亮氨酸残基替换成甲硫氨酸或 缬氨酸残基也能得到具有同样的功能的新蛋白质。
[0148] 其中,上述"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质",可以作为在上述共有序列1的 N末端侧和C末端侧添加规定的氨基酸残基,并且具有包含在规定的位置限定了能够取的氨 基酸的变化的氨基酸序列的共有序列2的蛋白质而规定。共有序列2的氨基酸序列如下。
[0149] G(L/I/V/F/M)xGx(I/V/L)(I/V/L)(S/T)xxxxL(A/S)P(L/V/I/M)(P/S/T/A)TFxx (I/V)x(K/R)xK(S/T)xxx(F/Y)x(S/A)xPYxx(A/S/T)LxSxxLx(L/I/M/V)(Y/F)Y(A/G)(7-9aa)(L/1)(I/V/L)(T/S) INxx(G/A)xx(I/V/M)(E/Q)xxYxxx(F/Y)(L/1/V/F)x(Y/F)Ax(K/R/ N)xxxxx(T/A)(7-8aa)(V/F/L/I/M)(18-19aa)(R/Q/H)xxxxGx(I/V)xxxxx(V/I/L/M)x(V/M) F(A/V)(A/S/T)PLx(I/V)(I/M/V/L)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)x(F/Y)MP(F/I/L) xLS(L/F/V)xL(T/V)(L/I)xAxxff(F/L)xYG(L/F)xxxDxx(V/I)xxPNxxGxx(L/F)(G/S)xxQMx (L/V/I)(Y/F)xx(Y/F)
[0150] 另外,对于共有序列2的氨基酸序列,可以换个说法说成是从N末端到C末端由序列 号6的氨基酸序列、7~9个任意的氨基酸残基、序列号7的氨基酸序列、7~8个任意的氨基酸 残基、V/F/L/I/M中的任一氨基酸残基、18~19个的氨基酸残基和序列号8的氨基酸序列依 次连接而成的氨基酸序列。
[0151] 共有序列2是在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质所共有的氨基酸序 列。即,共有序列2,是对于上述文献中被分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转 运蛋白蛋白质、来自稻的参与糖运输的转运蛋白蛋白质、来自蒺藜苜蓿的参与糖运输的转 运蛋白蛋白质和来自碧冬茄的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的各氨基酸序列,与上述同样 地利用ClustalW进行分析,由制成的多重比对导出的氨基酸序列。因此,共有序列2是在上 述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质的特征序列,是成为与上述文献中进化枝I、 II、IV和V的各组的明确区别基准的序列。
[0152]此外,对于在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质的氨基酸序列,将使 用ClustalW多重序列比对程序(能够在国立遗传学研究所的DDBJ使用)进行比对分析的结 果示于图3-1~3-3(分析中使用的版本和各种参数如上所述)。如图3-1~3-3所示,能够理 解在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质具有上述共有序列2。
[0153] 进一步地,上述"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质",可以作为在上述共有序 列2的N末端侧添加规定的氨基酸残基,并且具有包含在规定的位置限定了能够取的氨基酸 的变化的氨基酸序列的共有序列3的蛋白质而规定。共有序列3的氨基酸序列如下。
[0154] (A/V)xxxG(I/L/V)xGN(I/L/V)(I/L/V)S(F/L)x(V/T)xL(A/S)P(V/L/I)(P/A)TFxx (I/V)x(K/R)xK(S/T)xx(G/S)(F/Y)(Q/S/E)SxPYxx(A/S/T)LxS(A/C/S)xLx(L/I/M)(Y/F)Y (A/G)xx(K/T)(3-5aa)(L/M/P)(L/I)(I/L/V)(T/S)INxx(G/A)xx(I/V)(E/Q)xxY(I/L)x(L/ M/V/1)(F/Y)(L/1/V/F)x(Y/F)Ax(K/R)xxxxx(T/A)xx(L/M/F/V/1)(L/F/V/1)xxx(N/D)(F/ V/I/L)xx(F/L)xx(I/L/V)xxxxxx(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)xxxxGx(I/V)xxxx(S/A)(V/L/M)(C/ S/A)VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(I/M/V)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)E(F/Y)MP(F/I) xLS(L/F/V)xL(T/V)(L/1)(S/N)A(V/1)xff(F/L)xYGLxx(K/N)Dxx(V/1)xxPN(V/1)xGxx(F/L) (G/S)xxQMxL(Y/F)xx(Y/F)
[0155] 另外,对于共有序列3的氨基酸序列,可以换个说法说成是从N末端到C末端由序列 号9的氨基酸序列、3~5个任意的氨基酸残基、序列号10的氨基酸序列、5~6个任意的氨基 酸残基和序列号11的氨基酸序列依次连接而成的氨基酸序列。
[0156]共有序列3是对于在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质中来自拟南芥 的参与糖运输的转运蛋白蛋白质和来自稻的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的各氨基酸序 列,与上述同样地利用ClustalW进行分析,由制成的多重比对导出的氨基酸序列。因此,共 有序列3是在上述文献中被分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转运蛋白蛋白 质和来自稻的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的特征序列,是成为与上述文献中进化枝I、 II、IV和V的各组的明确区别基准的序列。
[0157] 此外,对于在上述文献中被分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转运 蛋白蛋白质和来自稻的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的氨基酸序列将使用ClustalW多重 序列比对程序(能够在国立遗传学研究所的DDBJ使用)进行比对分析的结果示于图4-1~4-2(分析中使用的版本和各种参数如上所述)。如图4-1~4-2所示,能够理解在上述文献中被 分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转运蛋白蛋白质和来自稻的参与糖运输的 转运蛋白蛋白质具有上述共有序列3。
[0158] 进而另外,上述"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质"可以作为在上述共有序列 3的N末端侧和C末端侧添加规定的氨基酸残基,并且具有包含在规定的位置限定了能够取 的氨基酸的变化的氨基酸序列的共有序列4的蛋白质而规定。共有序列4的氨基酸序列如 下。
[0159] (M/L/V)xx(T/K/N/S)xxxxAxxFG(L/I/V)LGN(I/L/V)(I/V)SFxVxL(S/A)P(V/I) PTFxxIxK(K/R)K(S/T)x(E/K)(G/S)(F/Y)(Q/E)S(I/L)PYxx(A/S)LxS(A/C)xLx(L/I/M)YY (A/G)xxK(4-5aa)(L/M)(L/I)(I/V)(T/S)IN(A/S/T)(F/V)(G/A)x(F/V)(I/V)(E/Q)xxY(I/ L)x(L/M/I)(F/Y)(F/V/I/L)x(Y/F)Ax(K/R)xx(R/K)xx(T/A)(L/V/M)K(V/L/M/F)(L/I/V/F) xxx(N/D)(F/V/I)xx(F/L)xx(I/L)(L/I/V/F)(L/M/V)(L/V)xx(F/L)(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)x (K/S/Q)x(L/I/V)Gx(I/V)Cxxx(S/A)(V/L)(S/C/A)VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(M/I/V)xxV(I/ V)(K/R)T(K/R)S(V/A)E(Y/F)MPFxLS(L/F)xLT(I/L)(S/N)A(V/I)xff(L/F)xYGLx(L/I)(K/N) Dxx(V/I)A(L/F/I/M)PN(V/I)(L/I/V)Gxx(L/F)GxxQM(I/V)L(Y/F)(V/L/I/M)(V/L/I/M)(Y/ F)(K/R/Q)
[0160] 另外,对于共有序列4的氨基酸序列,可以换个说法说成是从N末端到C末端由序列 号12的氨基酸序列、4~5个任意的氨基酸残基、序列号13的氨基酸序列、5~6个任意的氨基 酸残基和序列号14的氨基酸序列依次连接而成的氨基酸序列。
[0161] 共有序列4是对于在上述文献中被分类为进化枝III的SWEET蛋白质中来自拟南芥 的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的各氨基酸序列,与上述同样地利用ClustalW进行分析, 由制成的多重比对导出的氨基酸序列。因此,共有序列4是在上述文献中被分类为进化枝 III的来自拟南芥的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的特征序列,是成为与上述文献中进化 枝I、II、IV和V的各组的明确区别基准的序列。
[0162] 此外,对于在上述文献中被分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转运 蛋白蛋白质的氨基酸序列,将使用ClustalW多重序列比对程序(能够在国立遗传学研究所 的DDBJ使用)进行比对分析的结果示于图5(分析中使用的版本和各种参数如上所述)。如图 5所示,能够理解在上述文献中被分类为进化枝III的来自拟南芥的参与糖运输的转运蛋白 蛋白质具有上述共有序列4。
[0163] 如上,能够在本发明中使用的"编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核 酸",只要是编码具有上述的共有序列1、2、3或4的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸,就 不特别限定。换言之,作为该核酸,不限于编码表2~5中列举的具体的SWEET蛋白质的核酸, 还包含编码来自与表2~5所列的生物种不同的生物种的SWEET蛋白质的核酸。例如,也可以 使用编码来自序列数据未存储在GenBank等数据库的生物的具有共有序列1、2、3或4的参与 糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸。
[0164] 具体地,作为特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质,如表2~5所示,可以列举包含 序列号15~131的任一项所示氨基酸序列的蛋白质。特别是,作为特定的参与糖运输的转运 蛋白蛋白质,优选为包含序列号15~35的任一项所示的氨基酸序列的蛋白质(表2),更优选 为包含序列号15~26的任一项所示氨基酸序列的蛋白质(来自拟南芥或稻),进一步优选为 包含序列号15~21的任一项所示氨基酸序列的蛋白质(来自拟南芥)。进一步地,作为特定 的参与糖运输的转运蛋白蛋白质,最优选为包含序列号17的氨基酸序列的AtSWEETll、包含 序列号18的氨基酸序列的AtSWEET12、包含序列号25的氨基酸序列的0sSWEET14和包含序列 号26的氨基酸序列的0sSWEET15。
[0165] 此外,能够在本发明中使用的"编码特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸" 不限于如上所述编码用具体的序列号特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸,只要是 编码具有上述的共有序列1、2、3或4的参与糖运输的转运蛋白的核酸,就可以使用任何核 酸。
[0166] 编码参与糖运输的转运蛋白的核酸,是指由该核酸编码的蛋白质具有参与糖运输 的转运蛋白活性。参与糖运输的转运蛋白活性,是例如非专利文献1和2的Methods所记载那 样的用细胞质定位或ER定位的FRET(焚光共振能量转移,Forster resonance energy transfer 或 fluorescence resonance energy transfer)|l|传感器 定向内质网 (endoplasmic reticulum;ER)内外的糖运输而得的活性。
[0167] 此外,规定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质是否具有共有序列1、2、3或4,或者编 码该蛋白质的核酸是否编码具有共有序列1、2、3或4的蛋白质,可以通过将该蛋白质的氨基 酸序列或者由该核酸编码的氨基酸序列与共有序列1、2、3或4所示的氨基酸序列比较来容 易地判别。
[0168] 其中,作为包含与序列号15~131的氨基酸序列不同的氨基酸序列、且具有共有序 列1、2、3或4的参与糖运输的转运蛋白蛋白质,例如,也可以编码包含在序列号15~131的任 一项所示的氨基酸序列中缺失、替换、添加或插入了 1个或多个氨基酸序列的氨基酸序列、 且具有共有序列1、2、3或4、具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。其中,作为多个氨基 酸,是指例如,1~20个、优选为1~10个、更优选为1~7个、进一步优选为1个~5个、特别优 选为1个~3个。此外,氨基酸的缺失、替换或添加可以通过将上述编码参与糖运输的转运蛋 白蛋白质的碱基序列通过该技术领域公知的方法改变来进行。为了在碱基序列中导入突 变,可以通过Kunkel法或Gapped duplex(缺口双链体)法等公知方法或依据此的方法来进 行,例如,使用利用了定点诱变法的突变导入用试剂盒(例如Mutant-K、Mutant-G(均为商品 名,TAKARA Bio社制))等,或者使用LA PCR in vitro Mutagenesis系列试剂盒(商品名、 TAKARA Bio社制)来导入突变。另外,作为突变导入方法,可以是使用以EMS(甲磺酸乙酯)、 5-溴尿嘧啶、2-氨基嘌呤、羟胺、N-甲基-N 硝基-N-亚硝基胍、其他致癌性化合物为代表那 样的化学诱变剂的方法,也可以是通过以X射线、α射线、β射线、γ射线、离子束为代表那样 的放射线处理和/或紫外线处理来进行的方法。
[0169] 另外,作为包含与序列号15~131的氨基酸序列不同的氨基酸序列、且具有共有序 列1、2、3或4的参与糖运输的转运蛋白蛋白质,例如,也可以编码具有相对于序列号15~131 的任一项所示的氨基酸序列的类似度(Similarity)或同一1性(identity)例如为70%以上、 优选为80 %以上、更优选为90%以上、最优选为95 %以上的氨基酸序列、且具有共有序列1、 2、3或4、具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。类似度和同一性的值是指使用安装了 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)程序的计算机程序和存储了基因序列信息 的数据库以默认设定求得的值。
[0170]进一步地,编码包含与序列号15~131的氨基酸序列不同的氨基酸序列、且具有共 有序列1、2、3或4的参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸,在植物基因组信息不明的情况 下,可以通过从成为对象的植物提取核酸,分离与编码序列号15~131的氨基酸序列的核酸 在严格条件下杂交的核酸来鉴定。其中,严格条件是指形成所谓特异性杂种、不形成非特异 性杂种的条件。可列举例如,在45°C、6XSSC(氯化钠/柠檬酸钠)下杂交、然后在50~65°C、 0.2~1 X SSC、0.1 %SDS下洗涤,或者作为这样的条件,可列举在65~70°C、1 X SSC下杂交、 然后在65~70°C、0.3XSSC下洗潘。杂交按照J.Sambrook et al.Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2nd Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory(1989)所记载的方法等现 有公知的方法来进行。
[0171]如上,作为具有共有序列1、2、3或4的蛋白质而定义本发明中使用的"特定的参与 糖运输的转运蛋白蛋白质"。但是,能够在本发明中使用的"特定的参与糖运输的转运蛋白 蛋白质"不限于具有该共有序列1、2、3或4的蛋白质。
[0172] 即,作为"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质",也可以编码包含在序列号15~ 131的任一项所示的氨基酸序列中缺失、替换、添加或插入了 1个或多个氨基酸序列的氨基 酸序列、且具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。其中,作为多个氨基酸,是指例如,1 ~20个、优选为1~10个、更优选为1~7个、进一步优选为1个~5个、特别优选为1个~3个。 此外,氨基酸的缺失、替换或添加可以通过将上述编码参与糖运输的转运蛋白蛋白质的碱 基序列通过该技术领域公知的方法改变来进行。在碱基序列中导入突变的方法可以适宜应 用上述的方法。
[0173] 另外,作为"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质",例如,也可以编码具有相对于 序列号15~131的任一项所示的氨基酸序列的类似度(Similarity)或同一 1性(identity)例 如为70 %以上、优选为80%以上、更优选为90%以上、最优选为95 %以上的氨基酸序列、且 具有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。类似度和同一性的值可以通过上述的方法求 出。
[0174] 进一步地,作为"特定的参与糖运输的转运蛋白蛋白质",例如,也可以编码以下蛋 白质:由与编码序列号15~131的氨基酸序列的核酸在严格条件下杂交的核酸编码、且具有 参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。其中,严格条件与上述是同样的。
[0175] 应用本发明的植物,通过将编码如上所述定义的"特定的参与糖运输的转运蛋白 蛋白质"的核酸导入细胞内,或者强化由该核酸编码的蛋白质的表达,从而能够产生高糖浓 度的溢泌物。作为将该编码参与糖运输的转运蛋白的核酸导入细胞内的方法,可列举例如, 将以能够表达编码参与糖运输的转运蛋白的DNA的方式配置的表达载体导入细胞内的方 法。另外,作为强化编码参与糖运输的转运蛋白的核酸的表达的方法,可列举改变位于作为 对象的植物体中的编码参与糖运输的转运蛋白的DNA附近的转录启动子的方法。特别优选 将以在能够恒常表达的启动子的控制下表达上述的编码参与糖运输的转运蛋白的DNA的方 式配置的表达载体导入对象植物的细胞的方法。
[0176] 编码参与糖运输的转运蛋白的人工基因
[0177] 作为上述"编码特定的参与糖运输的转运蛋白的核酸",只要是编码具有共有序列 1、2、3或4、且参与糖运输的转运蛋白的核酸,则不限于具有与自然界中存在的核酸相同的 碱基序列的核酸,也可以是具有人工设计的碱基序列的核酸、即人工基因。其中人工基因是 指作为编码人为设计的氨基酸序列的核酸的、具有天然不存在的碱基序列的DNA。人工基因 可以是编码将天然存在的蛋白质的一部分改变(氨基酸残基的缺失、替换、插入等)而得的 蛋白质的基因,也可以是编码将天然存在的氨基酸序列接合而成的嵌合蛋白质的基因,也 可以编码从N末端到C末端全序列独立设计的蛋白质的基因。
[0178] 作为人工基因,只要是具有编码包含共有序列1、2、3或4的氨基酸序列的碱基序列 的DNA即可。另外,作为人工基因设计参与糖运输的转运蛋白基因时,特别优选设计成也包 含跨膜结构域那样。这是因为,认为通过该结构域,转运蛋白定位在更优选的位置,从而有 助于转运蛋白活性。
[0179] 更具体地,作为编码参与糖运输的转运蛋白的人工基因,可以设计成编码序列号 132~137所示的氨基酸序列那样。这些序列号132~137所示的氨基酸序列中,上述共有序 列存在于N末端侧,另外,C末端侧包含跨膜结构域。将具有序列号132所示的氨基酸序列的 蛋白质称为SWol,将具有序列号133所不的氣基酸序列的蛋白质称为SWo2,将具有序列号 134所不的氣基酸序列的蛋白质称为SWo3,将具有序列号135所不的氣基酸序列的蛋白质称 为SWo4,将具有序列号136所不的氣基酸序列的蛋白质称为SWo5,将具有序列号137所不的 氨基酸序列的蛋白质称为SWo6。
[0180] 表达载体
[0181 ]表达载体以包含具有能够恒常表达的启动子碱基序列的核酸、和编码上述参与糖 运输的转运蛋白的核酸(包含具有天然存在的碱基序列的核酸和人工基因两者。以下同样) 的方式构建。作为成为表达载体的母体的载体,可以使用现有公知的各种载体。例如,可以 使用质粒、噬菌体、或粘粒等,可以根据所导入的植物细胞、导入方法适宜选择。具体地,可 列举例如,pBR322、pBR325、pUC19、pUC119、pBluescript、pBluescriptSK、pBI 系列的载体 等。特别是在向植物细胞导入载体的导入法是使用农杆菌的方法时,优选使用PBI系列的双 元载体。作为pBI系列的双元载体,具体可列举例如,pBIG、pBIN19、pBI101、pBI121、pBI221 等。
[0182] 启动子只要是能在植物体内表达编码参与糖运输的转运蛋白的核酸的启动子就 不特别限定,优选使用公知的启动子。作为该启动子,可列举例如,花椰菜花叶病毒35S启动 子(CaMV35S)、各种肌动蛋白基因启动子、各种遍在蛋白基因启动子、胭脂碱合成酶基因的 启动子、烟草的PRla基因启动子、番茄的核酮糖1,5_二磷酸羧化酶/加氧酶小亚基基因启动 子、Napin(油菜贮藏蛋白)基因启动子、油质蛋白基因启动子等。其中,更优选使用花椰菜花 叶病毒35S启动子、肌动蛋白基因启动子或遍在蛋白基因启动子。如果使用上述各启动子, 则能够使任意的核酸在被导入植物细胞内时增强表达。
[0183] 另外,作为启动子,还可以使用具有使核酸在植物中部位特异性地表达的功能的 启动子。作为这样的启动子,可以使用现有公知的任何启动子。通过使用这样的启动子,部 位特异性地导入上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸,从而能够提高由导入了该核酸的 细胞形成的植物器官、植物组织产生的溢泌物所含的糖含量。
[0184] 此外,表达载体除了启动子和上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸之外,还可 以包含具有其他片段序列的核酸。对该具有其他片段序列的核酸不特别限定,可列举具有 终止子碱基序列的核酸、具有转化体筛选标志物碱基序列的核酸、具有增强子碱基序列的 核酸、具有用于提高翻译效率的碱基序列的核酸等。另外,上述重组表达载体还可以具有Τ'-DNA 区域。 T-DNA 区域特别是在使用农杆菌将具有上述重组表达载体中的碱基序列的核酸导 入植物细胞时能够提高核酸导入的效率。
[0185] 具有终止子碱基序列的核酸只要具有作为转录终止部位的功能即可,不特别限 定,可以是公知的终止子。例如,具体来说,优选使用胭脂碱合成酶基因的转录终止区(Nos 终止子)、花椰菜花叶病毒35S的转录终止区(CaMV35S终止子)等。其中更优选使用Nos终止 子。在上述重组载体中,可以通过将终止子配置在适当的位置,从而防止发生在导入植物细 胞之后合成不必要的长转录物这样的现象。
[0186] 作为具有转化体筛选标志物碱基序列的核酸,例如,可以使用包含耐药性基因的 核酸。作为所述耐药性基因的具体例子,可列举例如,包含针对潮霉素、博来霉素、卡那霉 素、庆大霉素、氯霉素等的耐药性基因的核酸。由此,通过选择在含有上述抗生素的培养基 中生长的植物体,可以容易地筛选出被转化的植物体。
[0187] 作为具有用于提高翻译效率的碱基序列的核酸,可列举例如具有来自烟草花叶病 毒的omega序列的核酸。通过将该具有omega序列的核酸配置在蛋白质编码区上游的非翻译 区(5'UTR),能够提高上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸的表达效率。这样,上述重组 表达载体中,根据其目的可以包含具有各种DNA片段序列的核酸。
[0188] 对于重组表达载体的构建方法不特别限定,可以在适宜选择的成为母体的载体中 以规定的顺序导入上述具有启动子碱基序列的核酸、上述编码参与糖运输的转运蛋白的核 酸和根据需要的上述具有其他DNA片段序列的核酸。例如,可以将上述编码参与糖运输的转 运蛋白的核酸、具有启动子碱基序列的核酸和(根据需要的具有终止子碱基序列的核酸等) 连接,将连接产物导入载体中。
[0189] 另外,对上述重组表达载体的增殖方法(生产方法)也不特别限定,可以使用现有 公知的方法。一般可以以大肠杆菌为宿主使其在该大肠杆菌内增殖。这时,可以根据载体的 种类来选择优选的大肠杆菌的种类。
[0190] 转化
[0191] 上述表达载体可通过一般的转化方法导入对象植物细胞。对将表达载体导入植物 细胞的方法(转化方法)不特别限制,可以根据植物细胞而使用适当的现有公知的方法。具 体地说,例如,可以使用利用农杆菌的方法、直接导入植物细胞的方法。作为利用农杆菌的 方法,例如,可以使用 Bechtold,E.,Ellis,J.和 Pelletier,G.(1993)In Plan ta Agrobacterium-mediated gene transfer by infiltration of adult Arabidopsis plants.C.R.Acad.Sci.Paris Sci.Vie,316,1194-1199.或Zyprian E,Kado Cl, Agrobacterium-mediated plant transformation by novel mini-T vectors in conjunction with a high-copy vir region helper plasmid. Plant Molecular Biology,1990,15(2) ,245-256.所记载的方法。
[0192] 作为将表达载体直接导入植物细胞的方法,例如,可以使用微注射法、电穿孔法、 聚乙二醇法、基因枪法、原生质体融合法、磷酸钙法等。
[0193] 另外,如果采用将上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸直接导入植物细胞的方 法,则只要是包含编码作为对象的转运蛋白的核酸表达所需的转录单元、例如具有启动子 碱基序列的核酸、具有转录终止子碱基序列的核酸和编码作为对象的转运蛋白的核酸的核 酸就足够了,载体功能并不是必须的。进而,即使是不具有转录单元的仅包含上述编码参与 糖运输的转运蛋白的核酸的蛋白质编码区的核酸,只要能够整合到宿主基因组中的转录单 元内、能够表达成为对象的基因即可。另外,即使在不整合到宿主基因组中的情况下,只要 上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸能够在细胞内被转录且/或翻译就足够了。
[0194] 作为导入上述表达载体、不含表达载体的成为对象的编码参与糖运输的转运蛋白 的核酸的植物细胞,可列举例如,花、叶、根等植物器官中的各组织的细胞、愈伤组织、悬浮 培养细胞等。这里,表达载体既可以根据要生产的植物体的种类来适宜构建适当载体,也可 以预先构建通用的表达载体,将其导入植物细胞。
[0195] 作为由成为表达载体的导入对象的细胞形成的植物,不特别限定。即,通过导入上 述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸,能够对于所有植物体提高排水液等溢泌物所含的糖 浓度。作为成为对象的植物,例如,优选为显花植物,在显花植物中更优选为被子植物。作为 成为对象的被子植物,可列举例如,双子叶植物、单子叶植物,属于例如十字花科、禾本科、 茄科、豆科、杨柳科等的植物(参照下述),但不限于这些植物。
[0196] 十字花科:拟南芥(Arabidopsis thaliana)、深山旗竿(玉山筷子芥) (Arabidopsis lyrata)、油菜(Brassica rapa、Brassica napus、Brassica campestris)、 卷心菜(Brassica oleracea var · capitata)、白菜(Brassica rapa var · pekinensis)、青 菜(Brassica rapa var. chinensis)、完青(Brassica rapa var.rapa)、野泽菜(Brassica rapa var .hakabura)、日本完青(Brassica rapa var. lancinifolia)、小松菜(Brassica rapa var · peruviridis)、小白菜(八夕于3七Brassica rapa var .(311;!_11611818)、萝卜 (Brassica Raphanus sativus)、山葵(Wasabia japonica) >^^(Capsella rubella)^〇
[0197] 藜科:甜菜(Beta vulgaris)
[0198] 械树科:糖枫XAcer saccharum)
[0199] 大戟科:蓖麻(Ricinus communis)
[0200] 前科:烟草(Nicotiana tabacum)、前子(Solanum melongena)、马铃薯(Solaneum tuberosum)、番前(So lanum ly coper si cum)、辣椒(Cap si cum annuum)、矮牵牛(Petunia hybrida)^〇
[0201] 豆科:大豆(Glycine max)、碗豆(Pisum sativum)、香豆(Vicia faba)、多花紫藤 (Wisteria f loribunda)、花生(Arachis .hypogaea)、日本百脉根(Lotus japonicus)、菜豆 (Phaseolus vulgaris)、赤小豆(Vigna angularis)、金合欢(Acacia)、漠藜苜蓿(Medicago truncatula) >0^S(Cicer arietinum)^〇
[0202] 菊科:菊(Chrysanthemum morifolium)、向日葵(Helianthus annuus)等。
[0203] 棕榈科:油棕(非洲油棕(Elaeis guineensis)、美洲油棕(Elaeis oleifera))、椰 子(Cocos nucif era)、海率(Phoenix dactyl if era)、巴西棕榈(Copernicia)等。
[0204] 漆树科:野漆树(Rhus succedanea)、腰果(Anacardium occidentale)、漆树 (Toxicodendron vernicif luum)、芒果(Mangifera indica)、阿月浑子(Pistacia vera) 等。
[0205] 萌芦科:南瓜(舆瓜(Cucurbita maxima)、中国南瓜(Cucurbita moschata)、美洲 南瓜(Cucurbita pepo))、黄瓜(Cucumis sativus)、王瓜(Trichosanthes cucumeroides)、 萌芦(Lagenaria siceraria ¥81'.区〇11犷(1&)等。
[0206] 蔷薇科:扁桃(Amygdalus communis)、玫瑰(Rosa)、草莓(Fragaria vesca)、樱 (Prunus)、苹果(Malus pumila var.domestica)、桃(Prunus persica)等。
[0207] 葡萄科:葡萄(Vitis vinifera)
[0208] 石竹科:康乃馨(Dianthus caryophyllus)等。
[0209] 杨柳科:杨(毛果杨(Populus trichocarpa)、黑杨(Populus nigra)、欧洲山杨 (Populus tremula))等。
[0210] 禾本科:玉米(Zea mays)、稻(Oryza sativa)、大麦(Hordeum vulgare)、小麦 (Triticum aestivum)、乌拉尔图小麦(Triticum urartu)、节节麦(Aegilops tauschii)、 二糖短柄草(Brachypodium distachyon)、毛竹属(Phyllostachys)、甘鹿(Saccharum of fi c inarum)、象草(Pennisetum pupureum)N^^fe|l;^(Erianthus ra venae)、芒 (Miscanthus virgatum)、高粱(Sorghum bicolor)、泰属(Panicum)等。
[0211]百合科:有卩金香属(Tulipa)、百合属(Lilium)等。
[0212] 其中,优选以甘蔗、玉米、稻、高粱、小麦、甜菜、糖楓这样的比较多地产生溢泌物、 且糖、淀粉的产生能力高的植物作为对象。因为详细如后所述,可以使用从这些植物采集的 溢泌物作为生物燃料、生物塑料的原料。
[0213] 另外,如上所述,本发明中能够使用的编码参与糖运输的转运蛋白的核酸可以从 各种植物分离而使用,可以根据对象植物的种类适宜选择而使用。即,在对象植物细胞来自 单子叶植物的情况下,作为编码参与糖运输的转运蛋白的核酸,可以导入从单子叶植物分 离的核酸。特别是在对象植物是稻科植物的情况下,优选导入作为编码来自稻的参与糖运 输的转运蛋白的核酸的编码0sSWEET13的核酸(0sl2g047620001)、编码0sSWEET14的核酸 (0sllt050860001)和编码0sSWEET15的核酸(0s02t051310001)。通过导入这些编码 0sSWEET13 的核酸(0sl2g047620001)、编码 0sSWEET14 的核酸(0sllt050860001)和编码 0sSWEET15的核酸(0s02t051310001),能够显著提高稻的溢泌物所含的糖量。
[0214] 另外,即使对象植物细胞来自单子叶植物,也可以导入编码来自双子叶植物的参 与糖运输的转运蛋白的核酸。在对象植物细胞来自单子叶植物的情况下,优选导入编码来 自作为双子叶植物的拟南芥的参与糖运输的转运蛋白的核酸中编码AtSWEETll的核酸 (At3g48740)和编码AtSWEET12的核酸(At5g23660)。这些编码AtSWEETll 的核酸 (At3g48740)和编码AtSWEET12的核酸(At5g23660),即使对象植物是稻等单子叶植物,也能 够显著提高溢泌物所含的糖量。
[0215] 其他工序、其他方法
[0216] 在上述的转化处理后,通过现有公知的方法进行从植物体中筛选适当的转化体的 筛选工序。对筛选的方法不特别限定,例如,可以以潮霉素耐性等耐药性为基准进行筛选, 也可以在育成转化体后从植物体采集溢泌物,测定采集的溢泌物所含的糖分,筛选与野生 型相比糖浓度有意义地提高了的植株。另外,采集的溢泌物所含的糖分测定也可以采用不 是定量而是定性地测定的方法,例如可以通过使用与糖反应而显色的试纸的显色法来测 定。
[0217] 另外,可以从转化处理所得的转化植物按照常规方法获得后代植物。对于保持了 上述编码参与糖运输的转运蛋白的核酸的表达量与野生型有意义地提高这样的性状的后 代植物,以其溢泌物所含的糖量作为基准进行筛选,从而能够通过具有上述性状而制作出 溢泌物所含的糖量增加了的稳定的植物系统。此外,可以从转化植物、其后代获得植物细 胞、种子、果实、植株、愈伤组织、块茎、扦插枝、块等繁殖材料,基于这些通过具有上述性状 而量产溢泌物所含的糖量增加了的稳定的植物系统。
[0218] 如以上说明的那样,根据本发明,通过将上述编码特定的参与糖运输的转运蛋白 的核酸导入细胞,或者强化该核酸的表达,与野生型的植物体相比,能够有意义地提高溢泌 物所含的糖浓度。其中,作为溢泌物所含的糖成分,是包含葡萄糖、半乳糖、甘露糖和果糖这 样的单糖类、蔗糖、乳糖和麦芽糖这样的二糖类的含义。即,通过将上述编码特定的参与糖 运输的转运蛋白的核酸导入细胞,或者强化内源性的该基因的表达,能够提高溢泌物所含 的葡萄糖、半乳糖、甘露糖、果糖、蔗糖、乳糖和麦芽糖等糖成分中的任意1种以上的浓度。特 别是根据本发明,能够大幅提高溢泌物中的葡萄糖、果糖和蔗糖的浓度。
[0219] 特别是采集从排水组织产生的排水液作为溢泌物时,优选将细胞中导入了上述编 码特定的参与糖运输的转运蛋白的核酸、或强化了该核酸的表达的植物在防止所产生的排 水液蒸腾这样的条件下进行栽培。进而,更优选将该植物在排水液的产生量这样的条件下 进行培养。例如,可以通过使栽培该植物时的栽培条件为湿度80 % RH以上、更优选为90 % RH 以上的密闭空间,来防止排水液的蒸腾、并增大排水液的产生量。
[0220] 例如,野生型拟南芥的排水液所含的糖浓度为约2.0μΜ(平均值、单糖当量),与此 相对,在细胞内导入了上述特定的参与糖运输的转运蛋白基因的转化拟南芥中,排水液中 的糖浓度增加到约98.5~6057.5μΜ。特别是,细胞内导入了编码AtSWEET 12的核酸 (At5g23660)的转化拟南芥,与其他转化拟南芥相比,能够产生包含更高浓度的糖成分的排 水液。
[0221 ]另外,野生型稻的排水液所含的糖浓度为约1.3μΜ(平均值、单糖当量),在细胞内 导入了上述编码特定的参与糖运输的转运蛋白的核酸的转化稻中,排水液中的糖浓度增加 到约1074.3~185641.2μM。特别是细胞内导入了编码AtSWEETll的核酸(At3g48740)、编码 0sSWEET13的核酸(0sl2g0476200)或编码SWo5的核酸的转化稻,与其他转化稻相比,能够产 生包含更高浓度的糖成分的排水液。进一步地,细胞内导入了编码OsSWEETl 5的核酸 (0s02g051310001)的转化稻,与细胞内导入了其他编码特定的参与糖运输的转运蛋白的核 酸的转化稻的排水液中的最大糖浓度相比,能够产生包含更高浓度的糖成分的排水液,排 水液中的糖浓度增加到最大450340.4μΜ。
[0222]如上,根据本发明,能够采集高糖浓度的溢泌物。采集的溢泌物能够在醇和/或有 机酸的发酵生产中使用。进一步地,采集的溢泌物还可以作为生物炼制的原料使用。此时, 例如在作为溢泌物利用排水液的情况下,可以将从细胞内导入了上述编码特定的参与糖运 输的转运蛋白的核酸、或者强化了该核酸的表达的植物采集的排水液直接在醇发酵、有机 酸发酵的反应体系中利用,从而可以作为生物炼制的原料利用。或者,也可以将从该植物采 集的排水液进行浓缩处理、添加其他碳源、氮源等的处理之后,在醇发酵、有机酸发酵的反 应体系中利用。
[0223] 实施例
[0224] 以下,使用实施例更详细地说明本发明,但本发明的技术的范围不限于这些实施 例。
[0225] 1.拟南芥转化用DNA构建体的制作
[0226] 1.1通过PCR获得编码AtSWEET蛋白质的DNA
[0227] 1.1.1编码AtSWEET蛋白质的DNA的扩增
[0228] 以从拟南芥制备的c DNA作为模板,通过PCR进行评价用的编码A t SWEE T1、 AtSWEET2、AtSWEET3、AtSWEET4、AtSWEET5、AtSWEET6、AtSWEET7、AtSWEET9、AtSWEETll、 AtSWEET12、AtSWEET13、AtSWEET15 和 AtSWEET17 蛋白质的 DNA 的扩增。为了将评价用 DNA 插入 PRI201AN载体(夕力y,<才社制、#3264)中,设计在5 '末端添加了Sal I限制性酶识别序 列的正向引物,以及在3'末端添加了Sac I或Pst I限制性酶识别序列的反向引物(表6)。
[0231] 然后,使用这些引物和PrimeSTAR GXL DNA聚合酶(TaKaRa、#R050A)进行PCR扩增。 反应液组成示于表7,反应条件示于表8。
[0232] 表 7

[0236] 接着,为了将上述PCR扩增所得的DNA片段插入pCR2 . l-ΤΟΡΟ载体DNA (Invitrogen、#K4500_01)中,进行以下的处理,在5'末端和3'末端添加腺噪呤(Adenine)。 反应液组成示于表9。使表9所示的反应液在70 °C反应15分钟。
[0237] 表 9
[0239] 1.1.2扩增DNA片段的切下和纯化
[0240] 将PCR扩增而得的各DNA片段进行琼脂糖凝胶电泳后,使用MagExtractor-PCR&Gel Clean up试剂盒(T0Y0B0、#NPK-601)进行切下纯化。此外,切下纯化按照试剂盒附带的操作 说明书进行。
[0241] 1.1.3扩增DNA片段的转化
[0242] 将纯化而得的扩增DNA片段使用Τ0Ρ0 TA Cloning(Invitrogen、#K4500-01)导入 pCR2.1-T0P0载体中。反应液组成示于表10。使表10所示的反应液在室温反应5分钟。
[0243] 表1〇
[0245] 接着,将该反应液2μ1添加到大肠杆菌(Escherichia coli)DH5a感受态细胞 (Τ0Υ0Β0、#DNA-903)中,进行转化。在冰浴上放置30分钟后,在42°C进行30秒热处理。然后, 在冰浴上骤冷,添加500μ1的S0C培养基(11^丨廿〇8611、#15544-034),以37°(:、180印111振荡培 养1小时。在添加了终浓度50μg/ml的卡那霉素的LB琼脂平板上涂布溶解在DMF(N,N-二甲基 甲酰胺)中的40mg/ml X-gal 40yl、100mM IPTG 40μ1 后,再涂布培养液 100-200μ1,在37°C 培养一晚,第二天早晨获得菌落。
[0246] 1.1.4通过菌落PCR来进行转化的检查和阳性克隆的筛选
[0247] 转化的结果得到多个菌落。为了对于各菌落确认有无插入DNA,使用Ml 3-F: 5 ' -GTA AAA CGA CCA GTC TTA AG-3'(序列号 164)和M13-R:5'-CAG GAA ACA GCT ATG AC-3'(序列 号165)进行菌落PCR。菌落PCR的反应液组成示于表11,PCR条件示于表12。
[0248] 表11
[0252] 1.1.5来自阳性克隆的质粒DNA纯化
[0253] 从能够确认插入DNA的克隆纯化质粒DNA。质粒DNA的纯化使用QIAprep Spin Minipr印Kit(QIAGEN、#27106),按照附带的方案进行。
[0254] 1.1.6阳性克隆的碱基序列确定
[0255] 以1.1.5中得到的质粒DNA作为模板,使用M13-F和M13-R引物进行PCR扩增,通过双 脱氧法(桑格尔法)来确定DNA片段的碱基序列。
[0256] 1.2通过化学合成来获得编码AtSWEET蛋白质的DNA
[0257] 对于编码AtSWEET8、AtSWEET10、AtSWEET14、AtSWEET16蛋白质的DNA,以在5,末端 添加 Pst I限制性酶识别序列、在3,末端添加 Sail限制性酶识别序列的方式设计碱基序列, 进行化学全合成。其结果能够获得插入了pEX-A载体(才X口 ^,<才于夕y 口 V'-)中的编 码AtSWEET8和AtSWEET14蛋白质的DNA、插入了 pCR2.1-T0P0载体中的编码AtSWEETIO和 AtSWEET16蛋白质的DNA。
[0258] 1.3通过限制性酶反应来进行编码AtSWEET蛋白质的DNA的切下和纯化
[0259] 为了从1.1.5和1.2中得到的质粒DNA取出编码AtSWEET蛋白质的DNA片段,进行两 次的限制性酶处理。针对各DNA的限制性酶的组合记于表13。
[0260] 表13
[0262] 1.3.1扩增DNA片段的Sac I、Nde I或Sail限制性酶反应(第一次)
[0263] 使用Sac I(TaKaRa、#1078A)、Nde I(TaKaRa、#1161A)或Sal I(TaKaRa、#1080A)制 作以下的反应液,在37°C反应一晚,切断1.1.5或1.2中得到的质粒。Sac I的反应液组成示 于表14,Nde I的反应液组成示于表15,Sail的反应液组成示于表16。

[0270] 1.3.2通过限制性酶反应切断的DNA片段的纯化
[0271]接着,为了纯化DNA,进行PCI (苯酚:氯仿:异戊醇=24: 24:1)提取和乙醇沉淀。在 反应液中加入等量的PCI进行搅拌,在以5分钟、15000rpm离心回收的上层中加入等量的氯 仿,同样离心而回收上层。在回收的上层中加入二倍量的乙醇,使用?6116七?3;[1^即(:0-Prec ip i tant ( 夕,^才^^ 卜、#70748)进行乙醇沉淀。干燥后,将所得的DNA溶解在灭 菌水44μ1中。
[0272] 1.3.3扩增DNA片段的Sail、Xba I和Sac I限制性酶反应(第二次)
[0273] 接着,使用Sal I(TaKaRa、#1080A)、Xba I(TaKaRa、#1093A)或SacI(TaKaRa、# 1078A)制作以下的反应液,在37°C反应一晚,切断1.3.2中得到的质粒。Sal I的反应液组成 示于表17,Xba I的反应液组成示于表18,Sac I的反应液组成示于表19。

[0280] 1.3.4通过限制性酶反应切断的DNA片段的纯化
[0281] 将1.3.3中得到的反应液与1.1.2的步骤同样地进行琼脂糖凝胶电泳后,使用 MagExtractor-PCR&Gel Clean up试剂盒进行切下纯化。
[0282] 1.4通过限制性酶反应来进行pRI201AN载体的切下和纯化
[0283] 为了与1.3中得到的编码AtSWEET蛋白质的DNA片段进行连接,将pRI 201AN载体用 与1.3同样的步骤进行限制性酶处理。
[0284] 1.5连接
[0285] 1.5.1连接反应
[0286] 为了将1.3中得到的编码AtSWEET蛋白质的DNA片段插入1.4中得到的pRI201AN载 体中,进行连接反应。反应使用DNA Ligation Kit Ver.2.1(夕力歹才、#6022),在16°C 反应一晚。
[0287] 1.5.2连接反应产物的转化
[0288] 上述连接反应结束后,使用反应液2μ1通过与1.1.3同样的方法进行转化。
[0289] 1.5.3通过菌落PCR检查连接反应
[0290] 通过将在菌落PCR中扩增的DNA片段的长度用琼脂糖凝胶电泳进行可视化,来确认 编码AtSWEET蛋白质的DNA是否插入载体。
[0291 ] 1.5.4通过连接反应获得的DNA构建体的制备
[0292] 从能够确认插入DNA的菌落进行质粒DNA的纯化,得到插入了目的DNA片段的克隆。 质粒DNA的纯化使用QIAprep Spin Miniprep Kit(QIAGEN、#27106)按照附带的方案进行。 所得的DNA构建体(AtSWEET/pRI201AN)的物理图谱示于图6。在图6中,LB表示左边框(left border ),RB表不右边框(right border ),TN0S表不来自根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)的Ti质粒的胭脂碱合成酶基因 N0S的转录终止子,NPTII表示来自大肠杆菌 (Escherichia coli)的新霉素磷酸转移酶II(neomycin phosphotransferasell)基因, Pnos表示来自根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)的Ti质粒的胭脂碱合成酶基因 N0S的转录启动子,THSP表示来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)的热休克蛋白(heat shock protein)基因 HSP的转录终止子,AtSTCET表示编码来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)的SWEET蛋白质的DNA,P35S表示花椰菜花叶病毒35S转录启动子,AtADH 5'-UTR 表不来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)的醇脱氢酶(alcohol dehydrogenase)基因 ADH 的翻译增强子,ColElori表示大肠杆菌(Escherichia coli)的复制起点,Ri ori表示发根 农杆菌(Agrobacterium rhizogene)S的复制起点。
[0293] 1.6.1通过化学合成获得编码OsSWEET蛋白质的DNA以及构建体的制作
[0294] 如下进行设计:在参考拟南芥的密码子频率而以氨基酸序列不改变的方式重新进 行了序列设计的编码 0sSWEET5、0sSWEETll、0sSWEET12、0sSWEET13、0sSWEETl^P0sSWEET15 蛋白质的DNA的起始密码子侧添加 Nde I限制性酶识别序列,在终止密码子侧添加 Sac I限 制性酶识别序列。然后,将设计的DNA进行化学全合成,通过插入pRI201AN载体而获得各DNA 构建体。此外,使添加在5'末端的Nde I限制性酶识别序列(5'CATATG3')所含的ATG与编码 SWEET蛋白质的DNA的起始密码子一致。
[0295] 1.6.2通过化学合成获得编码参与糖运输的转运蛋白的人工基因以及构建体的制 作
[0296] 如下制作作为编码具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白的核酸的具有天然不 存在的碱基序列的DNA、即具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白的人工基因6种。首先, 对于序列号132~137的氨基酸序列所示的转运蛋白51〇1、51〇2、51〇3、51〇4、51〇5和51〇6,作 为编码各转运蛋白的核酸分别设计序列号168、169、170、171、172和173。然后,在这些序列 号168、169、170、171、172和173中的起始密码子侧添加阳61限制性酶识别序列,终止密码子 侧添加 Sac I限制性酶识别序列。然后,将设计的DNA进行化学全合成,通过插入pRI201AN载 体而获得6种DNA构建体。此外,使添加在5'末端的Nde I限制性酶识别序列(5'CATATG3')所 含的ATG与序列号168、169、170、171、172和173的起始密码子一致。
[0297] 1.7向拟南芥的转化
[0298] 将1 .5和1 .6. 1以及1 .6.2中制作的植物表达用载体通过电穿孔法(Plant Molecular Biology Mannal,Second Edition,B.G.Stanton and A.S.Robbert,Kluwer Acdemic Publishers 1994)导入根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)C58Cl株。接下 来将导入了植物表达用载体的根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)通过Clough等所 记载的浸润法(Steven J.Clough and Andrew F.Bent, 1998,The Plant Journal 16,735-743)导入野生型拟南芥生态型Col-0中,回收T1(转化(transformant)第一代)种子。将回收 的T1种子在包含卡那霉素(50mg/L)、羧苄青霉素(100mg/L)和苯菌灵(Benlate)水合剂 (10mg/L:住友化学社制)的MS琼脂培养基(琼脂浓度为0.8% ))中进行无菌播种,培养约2 周,筛选转化体。将筛选的转化体移植在新的上述MS琼脂培养基中,再栽培约1周后,移植在 加入了蛭石与土壤混合物(So i 1 MiX)(f力夕(7)夕氺)以体积比1:1混合而得的土的盆中, 获得T2(转化第二代)种子。
[0299] 1.8拟南芥排水液的获得
[0300] 将通过编码△七5^^1'、085'?^1'、5¥〇1、5¥〇2、5¥〇3、5¥〇4、5¥〇5和5¥〇6蛋白质的0嫩转 化而得的拟南芥的Τ1或Τ2植物体在18L/6D(18小时光条件之后6小时暗条件的24小时光循 环条件)、22°C下进行栽培。对驯化后经过1~2周的植物体给予1/1000花宝(HYPONeX),用缠 绕膜(旭化成制、f" 7 ^ 7 包裹植物使湿度为80 %以上优选为90 %以上,使排水液排出 (图7)。主要回收附着于叶里的排水液,分析排水液中的糖浓度。此外,将使野生型拟南芥感 染农杆菌栽培而收获的种子定义为T1种子,将T1种子通过药剂筛选或PCR等方法确认细胞 中导入了DNA的植物体定义为T1植物,将栽培T1植物而收获的种子定义为T2种子。
[0301] 2.稻转化用DNA构建体的制作
[0302] 2.1编码AtSWEET蛋白质的DNA的扩增
[0303] 以上述1.5.4中制备的拟南芥转化用DNA构建体(编码AtSWEET8蛋白质的DNA、编码 AtSWEETll蛋白质的DNA和编码AtSWEET12蛋白质的DNA)作为模板,通过PCR分别扩增编码 AtSWEET8蛋白质的DNA、编码AtSWEETll蛋白质的DNA和编码AtSWEET12蛋白质的DNA。此外, 为了将扩增产物导入pENTR/D-TOPO载体,在5 '端添加了 CACC序列。
[0304] 2.2使用扩增DNA片段的转化
[0305]将所得的反应液的一部分进行琼脂糖凝胶电泳,确认了存在预定大小的扩增产 物,然后使用pENTER Directional Τ0Ρ0 Cloning试剂盒(彳 ^匕、卜口'2工^)导入pENTR/D-Τ0Ρ0载体中。
[0306] 接着,将反应液总量添加到大肠杆菌(Escherichia coli)DH5a感受态细胞(夕力 yパY才)中,进行转化。在冰浴上放置30分钟后,在42°C进行45秒的热处理。然后,在冰浴 中骤冷,添加300μ1的S0C培养基(夕力y,彳才),以37°C、180rpm振荡培养1小时。将该培养 液涂布在添加了终浓度50μg/ml的卡那霉素的LB琼脂平板上,在37 °C过夜培养,第二天早晨 获得菌落。
[0307] 2.3通过菌落PCR来进行转化的检查和阳性克隆的筛选
[0308]通过将菌落PCR中扩增的DNA片段的长度用琼脂糖凝胶电泳进行可视化,确认编码 AtSWEET蛋白质的DNA插入了载体中。
[0309] 2.4从阳性克隆纯化质粒DNA
[0310]从能够确认插入DNA的克隆进行质粒DNA的纯化。质粒DNA的纯化使用QIAprep Spin Miniprep Kit(QIAGEN、#27106)按照附带的方案进行。
[0311] 2.5阳性克隆的碱基序列确定
[0312 ] 以2.4中纯化的质粒DNA作为模板,使用Ml 3-F和Ml 3-R引物,通过DNA测序仪(<;/夕 7 ^ 3 -少夕一 CEQ8000)进行DNA片段的碱基序列的确定。
[0313] 2.6LR反应和转化
[0314] 使用插入了2.4中得到的编码AtSWEET8蛋白质的DNA、编码AtSWEETll蛋白质的 DNA、编码At SWEET 12蛋白质的DNA的pENTR/D-TOPO质粒DNA和稻转化用载体(pZH2B_GW0x)进 行Gateway LR反应,如图8所示,构建了用于在稻植物体内过表达的构建体。
[0315] 接着,将反应液总量添加到大肠杆菌(Escherichia coli)DH5a感受态细胞(夕力 彳才)中进行转化。在冰浴上放置30分钟后,以42°C进行45秒的热处理。然后,在冰浴中 骤冷,添加300μ1的S0C培养基(夕力y,彳才),以37°C、180rpm振荡培养1小时。将该培养液 涂布在添加了终浓度50μg/ml的奇霉素(spectinomycin)的LB琼脂平板上,在37°C过夜培 养,第二天早晨获得菌落。
[0316] 2.7通过菌落PCR进行转化的检查和阳性克隆的筛选
[0317]通过将在菌落PCR中扩增的DNA片段的长度用琼脂糖凝胶电泳进行可视化,确认编 码AtSWEET蛋白质的DNA插入了载体。
[0318] 2.8从阳性克隆纯化质粒0嫩
[0319]从能够确认插入DNA的克隆进行质粒DNA的纯化。质粒DNA的纯化使用QIAprep Spin Miniprep Kit(QIAGEN、#27106)按照附带的方案进行。
[0320] 2.9阳性克隆的碱基序列确定
[0321] 以2.8中纯化的质粒DNA作为模板,使用以下的引物通过DNA测序仪(^%/夕7 ^ 3 一少夕一 CEQ8000)进行DNA片段的碱基序列的确定。
[0322] Ubi3'F:5'-TGC TGT ACT TGC TTG GTA TTG-3'(序列号 166)
[0323] UbiTseq3:5'_GGA CCA GAC CAG ACA ACC-3'(序列号 167)
[0324] 2.10.1通过化学合成来获得编码OsSWEET蛋白质的DNA
[0325] 对编码 0sSWEET13、0sSWEET14 或者 0sSWEET15蛋白质的DNA,为了导入 pENTR/D-Τ0Ρ0载体中而设计成在5 '端添加了 CACC序列。将设计的DNA进行化学全合成,插入pENTR/D-Τ0Ρ0载体中。
[0326] 2.10.2通过化学合成获得编码参与糖运输的转运蛋白的人工基因
[0327] 如下制作作为编码具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白的核酸的具有天然不 存在的碱基序列的DNA、即具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白的人工基因2种。首先, 对于序列号132和136的氨基酸序列所示的转运蛋白SWol和SW 〇5,作为编码各转运蛋白的核 酸分别设计序列号174和175。然后,对这些序列号174和175,为了导入pENTR/D-TOPO载体中 而设计成在5 '端添加了 CACC序列。将设计的DNA进行化学全合成,插入pENTR/D-TOPO载体 中。
[0328] 2.11编码OsSWEET蛋白质的DNA或人工基因的构建体的制作
[0329] 使用2.10.1和2.10.2中合成的DNA,与上述2.6~2.9同样地构建稻转化用载体。
[0330] 2.12向稻中的转化
[0331] 使用上述2.9和2.11中制作的植物表达用载体,按照11^?1&1^1〇11?1 &1(2006) 47,969-976所记载的方法,将编码AtSWEET、0sSWEET、SWol和SWo5蛋白质的DNA导入稻(日本 晴)中。
[0332] 2.13稻排水液的获得
[0333] 将导入了编码AtSWEET、0sSWEET、SWol和SWo5蛋白质的DNA的稻的转化第一代,移 植到加入了 8分左右的蛭石的直径6cm壶中进行驯化。此外稻的栽培在18L(30°C)/6D(25°C) (18小时30 °C明条件之后6小时25 °C暗条件的24小时光循环条件)下进行。对驯化后经过1~ 2周的植物体充分给予1/1000花宝(HYPONeX),用缠绕膜(旭化成社制、fy 包裹植 物使湿度为80%以上优选为90%以上,使排水液从稻的排水组织中排出(图9)。回收附着于 叶的排水液,分析糖浓度。
[0334] 3.排水液中的糖浓度分析
[0335] 3.1排水液样品的稀释
[0336] 使用移液器测定1.8中得到的拟南芥的排水液、2.13中得到的稻的排水液的体积, 加入纯水定容至0.35ml。接着,进行10000 XG、10分钟的离心分离,然后将上清0.3mL移至自 动取样器瓶中用于HPLC分析。
[0337] 3.2通过HPLC进行的糖浓度的分析
[0338] 糖浓度的分析在以下的条件下使用HPLC进行。此时作为标准物质使用葡萄糖、果 糖、蔗糖各50μΜ混合而成的标准液。
[0339] 分析柱:CarboPac ΡΑ1 (夕、< 才專夕只)
[0340] 洗脱液:100mM NaOH
[0341] 流量:lml/min
[0342] 进样量:25μ1
[0343] 检测器:脉冲安培检测器(夕、V才氺夕'ED40)
[0344] 4.分析结果
[0345] 将对于1.8中得到的拟南芥的排水液、2.13中得到稻的排水液测定糖浓度而得的 结果示于表20和21。

[0350]从表20和21可判定,用编码SWEET蛋白质的核酸中被分类为进化枝III的编码 At SWEET9~15的DNA、编码Os SWEET 13~15的DNA进行了转化的拟南芥和稻,排水液中的糖浓 度全部大幅提高。特别是用编码At SWEET 11的DNA、编码At SWEET 12的DNA、编码At SWEET 15的 DNA、编码OsSWEET13的DNA和编码0sSWEET14的DNA的任一DNA进行了转化的情况下,能够更 大幅地提高排水液中的糖浓度。另外,判明与用被分类为进化枝III的编码SWEET蛋白质的 DNA进行了转化的拟南芥相比,用被分类为进化枝III的编码SWEET蛋白质的DNA进行了转化 的稻,排水液中的糖浓度提高。特别是判明了对稻转化了编码Os SWEET 13的DNA、编码 0sSWEET14的DNA和编码0sSWEET15的DNA的任一 DNA的情况下,与对拟南芥转化了相同DNA的 情况下相比,排水液中的糖浓度显著提高。
[0351] 另外,判明了在导入了具有共有序列1的参与糖运输的转运蛋白的人工基因的植 物体中,也同样地能够提高排水液中的糖浓度。由结果可知,通过导入编码具有共有序列1 的参与糖运输的转运蛋白的核酸,和/或强化该蛋白质的表达,能够不限定宿主植物地,在 任何植物中提高排水液中的糖浓度。
[0352] 在野生型植物中,也有时根据个体不同而稀少地在排出液中检测到50μΜ左右的 糖。但是如本实施例所示,导入编码被分类为进化枝III的SWEET蛋白质的DNA的效果,明显 远高于在野生型植物中检测到的最大浓度。
【主权项】
1. 转化植物或转化植物细胞,其中,导入了编码参与糖运输的转运蛋白蛋白质的核酸, 和/或强化了该蛋白质的表达,所述参与糖运输的转运蛋白蛋白质具有共有序列,所述共有 序列包含以下的氨基酸序列: (L/I/V/M/F)x(G/A)xx(I/L/V/M/F)xxxx(L/I/V/F)(A/S)(P/S)(l-3aa)(P/S/T/A)T(F/ L)xx(I/V)xxxKxxxxxxxxPYxxx(L/I)xxxx(L/I)x(I/L/M/V/F)xY(A/S/G)(7-13aa)(I/L/V/ Μ)(l-2aa)(I/V)Nxxxxxx(E/Q)xxYxxx(Y/F)xx(Y/F)(A/G/S)(35-36aa)(R/Q/H)xxxxGx(V/ I/L)xxxxx(V/M/L/I/F)xxxx(A/S/T)P(L/M)x(I/V)(I/M/V/L)(2-7aa)(V/I)(V/I/M)x(T/S) x(S/N)xx(F/Y)(M/L)(P/S)(F/I/V/L)xLSxx(L/I)(T/V)xx(A/G)xxff(F/L)xYGxxxxDxx(V/I) xxPNxxGxx(F/L)(G/S)xxQ(Μ/I)x(L/M/I/V/F)(Y/H/F)。2. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是属于作为基于SWEET蛋白质的氨基酸序列的分类组的进化枝I~V中的进化枝III的蛋白 质。3. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质, (a) 包含序列号15~137的任一氨基酸序列的蛋白质, (b) 包含与序列号15~137的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、且具 有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。4. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列: G(L/I/V/F/M)xGx(I/V/L)(I/V/L)(S/T)xxxxL(A/S)P(L/V/I/M)(P/S/T/A)TFxx(I/V)x (K/R)xK(S/T)xxx(F/Y)x(S/A)xPYxx(A/S/T)LxSxxLx(L/I/M/V)(Y/F)Y(A/G)(7-9aa)(L/I) (I/V/L)(T/S)INxx(G/A)xx(I/V/M)(E/Q)xxYxxx(F/Y)(L/I/V/F)x(Y/F)Ax(K/R/N)xxxxx (T/A)(7-8aa)(V/F/L/I/M)(18-19aa)(R/Q/H)xxxxGx(I/V)xxxxx(V/I/L/M)x(V/M)F(A/V) (A/S/T)PLx(I/V)(I/M/V/L)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)x(F/Y)MP(F/I/L)xLS(L/ F/V)xL(T/V)(L/I)xAxxff(F/L)xYG(L/F)xxxDxx(V/1)xxPNxxGxx(L/F)(G/S)xxQMx(L/V/I) (Y/F)xx(Y/F)。5. 根据权利要求4所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质, (a) 包含序列号15~35的任一氨基酸序列的蛋白质, (b) 包含与序列号15~35的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、且具 有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。6. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列: (A/V)xxxG(I/L/V)xGN(I/L/V)(I/L/V)S(F/L)x(V/T)xL(A/S)P(V/L/I)(P/A)TFxx(I/ V)x(K/R)xK(S/T)xx(G/S)(F/Y)(Q/S/E)SxPYxx(A/S/T)LxS(A/C/S)xLx(L/I/M)(Y/F)Y(A/ G)xx(K/T)(3-5aa)(L/M/P)(L/I)(I/L/V)(T/S)INxx(G/A)xx(I/V)(E/Q)xxY(I/L)x(L/M/V/ I)(F/Y)(L/I/V/F)x(Y/F)Ax(K/R)xxxxx(T/A)xx(L/M/F/V/I)(L/F/V/I)xxx(N/D)(F/V/I/ L)xx(F/L)xx(I/L/V)xxxxxx(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)xxxxGx(I/V)xxxx(S/A)(V/L/M)(C/S/A) VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(I/M/V)xxV(I/V)(K/R/Q)(T/S)(K/R)S(V/A)E(F/Y)MP(F/I)xLS(L/ F/V)xL(T/V)(L/I)(S/N)A(V/I)xff(F/L)xYGLxx(K/N)Dxx(V/I)xxPN(V/I)xGxx(F/L)(G/S) xxQMxL(Y/F)xx(Y/F)〇7. 根据权利要求6所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质, (a) 包含序列号15~26的任一氨基酸序列的蛋白质, (b) 包含与序列号15~26的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列、且具 有参与糖运输的转运蛋白活性的蛋白质。8. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述共有序列包含以 下的氨基酸序列: (M/L/V)xx(T/K/N/S)xxxxAxxFG(L/I/V)LGN(I/L/V)(I/V)SFxVxL(S/A)P(V/I) PTFxxIxK(K/R)K(S/T)x(E/K)(G/S)(F/Y)(Q/E)S(I/L)PYxx(A/S)LxS(A/C)xLx(L/I/M)YY (A/G)xxK(4-5aa)(L/M)(L/I)(I/V)(T/S)IN(A/S/T)(F/V)(G/A)x(F/V)(I/V)(E/Q)xxY(I/ L)x(L/M/I)(F/Y)(F/V/I/L)x(Y/F)Ax(K/R)xx(R/K)xx(T/A)(L/V/M)K(V/L/M/F)(L/I/V/F) xxx(N/D)(F/V/I)xx(F/L)xx(I/L)(L/I/V/F)(L/M/V)(L/V)xx(F/L)(L/I/V)(5-6aa)(R/Q)x (K/S/Q)x(L/I/V)Gx(I/V)Cxxx(S/A)(V/L)(S/C/A)VF(A/V)(A/S)PLx(I/V)(M/I/V)xxV(I/ V)(K/R)T(K/R)S(V/A)E(Y/F)MPFxLS(L/F)xLT(I/L)(S/N)A(V/I)xff(L/F)xYGLx(L/I)(K/N) Dxx(V/I)A(L/F/I/M)PN(V/I)(L/I/V)Gxx(L/F)GxxQM(I/V)L(Y/F)(V/L/I/M)(V/L/I/M)(Y/ F)(K/R/Q)〇9. 根据权利要求8所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述转运蛋白蛋白质 是以下的(a)或(b)的蛋白质, (a) 包含序列号15~21的任一氨基酸序列的蛋白质, (b) 包含与序列号15~21的任一氨基酸序列有90%以上的同一性的氨基酸序列的蛋白 质。10. 根据权利要求1所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,是显花植物。11. 根据权利要求10所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述显花植物是被 子植物。12. 根据权利要求11所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述被子植物是单 子叶植物。13. 根据权利要求12所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述单子叶植物是 禾本科植物。14. 根据权利要求13所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述禾本科植物是 稻属(Oryza)植物。15. 根据权利要求11所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述被子植物是双 子叶植物。16. 根据权利要求15所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述双子叶植物是 十字花科植物。17. 根据权利要求16所述的转化植物或转化植物细胞,其特征在于,所述十字花科植物 是拟南芥属(Arabidopsis)植物。18. 溢泌物的制造方法,包括栽培权利要求1~17的任一项所述的转化植物,从该转化 植物采集溢泌物的工序。19. 根据权利要求18所述的溢泌物的制造方法,其特征在于,将栽培所述转化植物的栽 培条件设置为相对湿度80 % RH以上。20. 根据权利要求18所述的溢泌物的制造方法,其特征在于,所述溢泌物是排水液。
【文档编号】C12N5/10GK105848471SQ201480070912
【公开日】2016年8月10日
【申请日】2014年12月25日
【发明人】大音德, 米仓円佳, 青木直大, 大杉立, 广濑龙郎
【申请人】丰田自动车株式会社, 国立大学法人东京大学, 国立研究开发法人农业·食品产业技术综合研究机构
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