一株空间金黄色葡萄球菌lct-sa67菌株的制作方法

文档序号:609757阅读:360来源:国知局
专利名称:一株空间金黄色葡萄球菌lct-sa67菌株的制作方法
技术领域
本发明属于生物技术领域;更具体地,本发明涉及太空环境下金黄色葡萄球菌的生物学特性、全基因组测序信息、转录组测序以及差异蛋白组学分析。
背景技术
空间环境是指大气层以外的宇宙空间,其显著特点是高真空、极端温度、微磁场、微重力和高能核粒子辐射。在空间环境中很多微生物的致病性会受到影响,同时飞行中航天员的免疫功能下降,如何保障进入太空的生命体预防感染性疾病,如何利用空间环境造福人类都是就是其中要解决的关键问题。金黄色葡萄球菌是感染机体的一种重要病原菌,隶属于葡萄球菌属(Staphylococcus),是一种典型的革兰氏阳性菌,可引起许多严重感染,常见于皮肤表面及上呼吸道黏膜,也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包炎等,甚至败血症、脓毒症等全身感染。其在自然界中无处不在,空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中都可找到,很容易污染食品,是常见的引起食物中毒的致病菌,人体中常存在少量金黄色葡萄球菌。因此,在航天活动中,该菌常可随人体或其他航天设备进入太空。随着人类的生物医学研究进入微观水平,人们认识到,DNA遗传信息决定了生物体的生命特征,而生物体的基因组正是这些遗传信息的携带者。因此阐明生物体基因组携带的遗传信息、以及这些遗传信息是如何转录成RNA和翻译成蛋白质执行功能将有助于揭示生物体的遗传规律。目前,测序技术和质谱继续不断更新,这些技术的成本也不断降低,同时细菌的基因组较小,从细菌基因组、转录组和蛋白质组入手研究其对机体的分子作用机制是研究细菌致病的很好切入点。通过这些组学的研究分析太空诱变金黄色葡萄球菌的变化特征,有利于保障航天活动的安全,同时研究结果可服务于地面
发明内容
本发明的一个目的提供空间环境诱变的金黄色葡萄球菌LCT-SA67菌株本发明提供的该菌株,其保藏号为CGMCC N0.6517。一株金黄色葡萄球菌,其特征包括:革兰氏染色阳性,呈球状、聚团排列;同地面对照株的抗生素耐受性相比,无差异;无生长速度的差异;不能利用丙酮酸甲酯为碳源,而地面对照能使用该碳源。所述的金黄色葡萄球菌,利用全基因组测序和比较基因组学分析获得基因突变,见表1,空间环境导致LCT-SA67基因组上SNP的变化,包括SNP在基因组上的位置,突变位点及编码蛋白以及注释出的基因。表1:空间环境导致LCT-SA67菌株基因组上SNP的变化
权利要求
1.一种金黄色葡萄球菌LCT-SA67,其保藏号为:CGMCC N0.6517。
2.根据权利要求1所述的一株金黄色葡萄球菌,其特征在于:革兰氏染色阳性,呈球状、聚团排列;同地面对照株的抗生素耐受性相比,无差异;无生长速度的差异;不能利用丙酮酸甲酯为碳源,而地面对照能使用该碳源。
3.根据权利要求1所述的金黄色葡萄球菌LCT-SA67菌株,进行全基因组测序和比较基因组学分析得出突变基因。
4.根据权利要求1所述的金黄色葡萄球菌LCT-SA67菌株,进行转录组测序得出差异表达基因。
5.根据权利要求1所述的金黄色 葡萄球菌LCT-SA67菌株,进行差异蛋白组学分析得出差异表达蛋白分子。
全文摘要
本发明涉及一株太空环境下金黄色葡萄球菌LCT-SA67菌株的生物学特性、基因组DNA序列、转录组和差异蛋白组学,特别是同地面金黄色葡萄球菌比较分析鉴定出的功能序列和分子在阐明空间环境对微生物的作用及用途,可获得全面、准确的空间诱变金黄色葡萄球菌菌株突变的基因、差异表达基因和蛋白质。
文档编号C12N1/20GK103087943SQ20121038006
公开日2013年5月8日 申请日期2012年9月26日 优先权日2012年9月26日
发明者刘长庭, 王俊峰, 方向群, 李天志, 郭英华, 常德, 苏龙翔, 王雅娟, 陈振鸿, 姜学革 申请人:中国人民解放军总医院
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