与多囊卵巢综合征相关的snp标记的制作方法

文档序号:511941阅读:379来源:国知局
与多囊卵巢综合征相关的snp标记的制作方法
【专利摘要】本发明提供与PCOS相关的SNP标记、用于检测所述SNP标记的探针、芯片、引物、试剂盒和方法。另外,本发明还提供所述探针、芯片和引物在预测和诊断PCOS风险中的应用。
【专利说明】与多囊卵巢综合征相关的SNP标记

【技术领域】
[0001] 本发明涉及与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的SNP(单核苷酸多态性)标记。本发 明进一步涉及用于检测所述SNP的探针、芯片、引物和方法。另外,本发明涉及所述探针、芯 片和引物在预测和诊断PCOS风险中的应用。

【背景技术】
[0002] PCOS是一种表现为存在以下两种或多种特征的临床症状:长期排卵过少或排卵 停止、雄激素过多和多囊卵巢^作为无排卵性不孕症的最常见原因,PCOS影响了 6-8%的 育龄妇女2Λ另外,PCOS与重要的内分泌代谢紊乱和广泛范围的不利后遗症(包括血脂障 碍、动脉粥样硬化、胰岛素抵抗和2型糖尿病)相关 4'大约50%的患有PCOS的女性存在 胰岛素抵抗。7在患有葡萄糖耐量降低(IGT)和糖尿病的女性中,约有20%被确认在年轻 时患有PC0S 8_1Q。
[0003] PCOS的发病机制尚不完全清楚。人们早已认识到了可遗传倾向,但遗传因素和环 境因素之间存在复杂的相互作用。已经对至少70个候选基因进行了关联性研究,这些基因 主要涉及生殖激素、胰岛素抵抗和慢性炎症,例如,促卵泡激素受体(FSHR)、细胞色素 P450 家族IlA(CYPllA)、胰岛素受体(INSR)和白细胞介素-6 (11^-6)1145;然而,没有一个基因一 致地与PCOS相关联16。


【发明内容】

[0004] 本发明涉及与PCOS相关的SNP。具体地,本发明提供了与PCOS相关的SNP标记。 此外,本发明提供了用于检测所述SNP的探针、芯片、引物和方法。另外,本发明还涉及所述 探针、芯片和引物在预测和诊断PCOS风险中的应用。
[0005] 本发明的一个方面提供SNP标记,其核苷酸序列如下所示:SEQ ID NO. 1,其中,N 为C或T;SEQIDN0·2,其中,N为A或G;SEQIDN0·3,其中,N为C或T ;SEQIDN0·4, 其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 5,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 6,其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 7,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 8,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 9,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 10,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 11,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 12,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 13,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 14,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 15,其 中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 16,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 17,其中,N 为 A 或 T ;SEQ ID NO. 18,其中,N 为 C 或 G ;SEQ ID NO. 19,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 20,其中,N 为 C 或 T ; SEQ ID NO. 21,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 22,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 23,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 24,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 25,其中 N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 26,其 中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 27,其中,N 为 A 或 T ;SEQ ID NO. 28,其中,N 为 G 或 T ;SEQ ID N0·29,其中,N为A或G;SEQIDN0·30,其中,N为C或T;SEQIDN0·31,其中,N为A或G ; SEQ ID NO. 32,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 33,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 34,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 35,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 36,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 37,其 中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 38,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 39,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 40,其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 41,其中,N 为 G 或 T ;SEQ ID NO. 42,其中,N 为 G 或 T ; SEQ ID NO. 43,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 44,其中,N 为 A 或 G ;或 SEQ ID NO. 45,其中, N为C或T。
[0006] 本发明的另一个方面提供用于检测在本发明的SNP标记的N位点处的基因型的探 针。
[0007] 本发明的又一个方面提供一种用于检测在本发明的SNP标记的N位点处的基因型 的芯片,其中,所述芯片包含本发明的一种或多种探针。
[0008] 本发明的又一个方面提供用于确定在本发明的SNP标记的N位点处的基因型的引 物。
[0009] 本发明的又一个方面提供一种用于检测在SNP标记的N位点处的基因型的试剂 盒,其包含本发明的探针、芯片或引物。
[0010] 本发明的又一个方面提供本发明的引物、探针、芯片和试剂盒在制备用于预测或 诊断PCOS的试剂中的应用。
[0011] 本发明的又一个方面提供本发明的引物、探针、芯片和试剂盒在预测或诊断PCOS 中的应用。
[0012] 本发明的又一个方面提供一种基于SNP标记预测或诊断PCOS的方法,其中,所述 方法包括确定在本发明的SNP标记的N位点处的基因型。

【专利附图】

【附图说明】
[0013] 图 I :GWAS meta-分析(GWAS meta-analysis)的全基因组 Manhattan 图。通过 质量控制的SNP标记显示为负IogltlP-值。水平实线表示KT5的P值。对于那些在以前的 GWAS中识别的并在此处重复的标记,在50kb与PCOS相关的SNP内的标记被标记成红色,而 那些在当前研究中首次识别的标记,在50kb与PCOS相关的SNP内的标记被标记成绿色。
[0014] 图 2 :来自 GWAS I 的 3 个PCOS基因座(2ρ16·3、2ρ21 和 9q33.3)的区域图。(a-c) 用作为基因组位置(hgl8)的函数的P值(以-Iogltl值计)绘制在GWAS中的通过质量控制 措施的基因分型的SNP(a)2pl6. 3、(b)2p21、和(c)9q33. 3。在各组中,索引关联SNP以菱形 表示。绘制估计的重组率(从HapMap得到)以反映局部LD结构。基因注释取自美国加州 大学圣克鲁斯分校基因组浏览器。LD区块是从HapMap计划获得(发布22, CHB+JPT)。
[0015] 图3A-3H :8个新发现PCOS基因座的区域图。用作为基因组位置(NCBI Build 37)的函数的meta-分析P值(以-Iogltl值计)绘制通过质量控制的基因分型和填补的 (imputed)SNP。在各组中,基因分型的SNP被绘制成圆,而填补的SNP被绘制成十字。索引 关联SNP以紫色表示,P gwas^ta是初始数据集的合并结果,而Pamfeta是初始和后续的数据 集的合并结果,以菱形(对于索引SNP)或方形(对于这一区域的另一独立SNP)表示。绘 制估计的重组率(从IOOOGenome ASI得到)以反映局部LD结构。基因注释取自美国加州 大学圣克鲁斯分校基因组浏览器。
[0016] 图4A-4B :45个SNP标记的PCR电泳图。

【具体实施方式】
[0017] 如发明中所用,术语"单核苷酸多态性"或"SNP"是指当在基因组序列中一个核苷 酸(例如,腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)或鸟嘌呤(G))改变为另一个核苷酸时发 生的DNA序列变化或遗传性变型。
[0018] 在本发明中,使用按照NCBI dbSNP数据库的rs识别码(identifier numbers)识 另Ij SNP。
[0019] 术语"基因型"指的是个体或样品中所含的一个或多个基因的等位基因的描述。如 发明中所使用的,对个体的基因型和源自该个体的样品的基因型没有加以区别。术语"比值 比(odd ratio)"或"0R"是指具有所述标记(多态性)的个体的患病可能性相对于没有该 标记(多态性)的个体的患病可能性的比率。
[0020] 在第一个方面,本发明提供SNP标记,其核苷酸序列如下所示:SEQ ID NO. 1,其中, N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 2,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 3,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 4, 其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 5,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 6,其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 7,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 8,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 9,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 10,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 11,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 12,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 13,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 14,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 15,其 中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 16,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 17,其中,N 为 A 或 T ;SEQ ID NO. 18,其中,N 为 C 或 G ;SEQ ID NO. 19,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 20,其中,N 为 C 或 T ; SEQ ID NO. 21,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 22,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 23,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 24,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 25,其中 N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 26,其 中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 27,其中,N 为 A 或 T ;SEQ ID NO. 28,其中,N 为 G 或 T ;SEQ ID N0·29,其中,N为A或G;SEQIDN0·30,其中,N为C或T;SEQIDN0·31,其中,N为A或G ; SEQ ID NO. 32,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 33,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 34,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 35,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 36,其中,N 为 A 或 G ;SEQ ID NO. 37,其 中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 38,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 39,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 40,其中,N 为 A 或 C ;SEQ ID NO. 41,其中,N 为 G 或 T ;SEQ ID NO. 42,其中,N 为 G 或 T ; SEQ ID NO. 43,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 44,其中,N 为 A 或 G ;或 SEQ ID NO. 45,其中, N为C或T。
[0021] 该方面的一种实施方式提供选自以上标记中大于一个的SNP标记,例如,2、3、4、 5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、 32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44 或 45 个 SNP 标记。
[0022] 在本发明中,每个SNP标记都是指被认为与PCOS相关联的SNP。如在本发明中所 用,SNP标记和对应的SNP涉及在核苷酸片段中的相同位点。特别是当适用于检测在SNP标 记的N位点的基因型时,应当理解的是,这意味着检测在相应SNP的相应位点处的基因型, 反之亦然。各个SNP标记的SNP列于下表1中。
[0023] 在另一个方面,本发明提供用于检测在本发明的一个或多个SNP标记的N位点处 的基因型的探针。
[0024] 该方面的一种实施方式提供列于表1中的用于各个SNP标记的探针。
[0025] 表1各个SNP标记的SNP和探针
[0026]

【权利要求】
1.SNP标记,其中,其核苷酸序列如下所示:SEQ ID NO. 1,其中,N为C或T;SEQ ID 勵.2,其中4为六或6;5£〇10勵.3,其中4为(:或1';5£〇10勵.4,其中4为六或(:;5£〇 10勵.5,其中4为(:或1';5£〇10勵.6,其中4为4或(:;5£〇10勵.7,其中4为(:或1' ;5£〇10勵.8,其中4为(:或1';5£〇10勵.9,其中4为六或6;5£〇10勵.10,其中4为〇 或 T ;SEQ ID NO. 11,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 12,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 13,其 中,N 为 A 或 G;SEQ ID NO. 14,其中,N 为 C 或 T;SEQ ID NO. 15,其中,N 为 A 或 G;SEQ ID NO. 16,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 17,其中,N 为 A 或 T ;SEQ ID NO. 18,其中,N 为 C 或 G ; SEQ ID NO. 19,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 20,其中,N 为 C 或 T ;SEQ ID NO. 21,其中,N 为 C或T;SEQIDN0?22,其中,N为A或G;SEQIDN0?23,其中,N为A或G ;SEQIDN0?24, 其中,N为C或T;SEQIDNa25,其中N为A或G;SEQIDNa26,其中,N为C或T ;SEQID 勵.27,其中4为六或1';5£〇10勵.28,其中4为6或1';5£〇10勵.29,其中4为六或6; 5£〇10勵.30,其中4为(:或1';5£〇10勵.31,其中4为六或6;5£〇10勵.32,其中4为 (:或!';5£〇10勵.33,其中4为(:或1';5£〇10勵.34,其中4为(:或1';5£〇10勵.35,其 中,N为C或T;SEQIDN0?36,其中,N为A或G;SEQIDN0?37,其中,N为C或T ;SEQID 勵.38,其中4为(:或1';5£〇10勵.39,其中4为(:或1';5£〇10勵.40,其中4为六或(: ;5£〇10勵.41,其中4为6或1';5£〇10勵.42,其中4为6或!';5£〇10勵.43,其中4为 (:或1';5£〇10勵.44,其中州为六或6;或5£〇10勵.45,其中州为(:或1'。
2. 检测权利要求1所述的一个或多个SNP标记的N位点处的基因型的探针。
3. 根据权利要求2所述的探针,其中,所述探针如下所示:用于SNP标记NO. 1的SEQ ID NO. 46 和 47 ;用于 SNP 标记 NO. 2 的 SEQ ID NO. 48 和 49 ;用于 SNP 标记 NO. 3 的 SEQ ID NO. 50 和 51 ;用于 SNP 标记 NO. 4 的 SEQ ID NO. 52 和 53 ;用于 SNP 标记 NO. 5 的 SEQ ID NO. 54 和 55 ;用于 SNP 标记 NO. 6 的 SEQ ID NO. 56 和 57 ;用于 SNP 标记 NO. 7 的 SEQ ID NO. 58 和 59 ;用于 SNP 标记 NO. 8 的 SEQ ID NO. 60 和 61 ;用于 SNP 标记 NO. 9 的 SEQ ID NO. 62 和 63 ; 用于 SNP 标记 NO. 10 的 SEQ ID NO. 64 和 65 ;用于 SNP 标记 NO. 11 的 SEQ ID NO. 66 和 67 ; 用于 SNP 标记 NO. 12 的 SEQ ID NO. 68 和 69 ;用于 SNP 标记 NO. 13 的 SEQ ID NO. 70 和 71 ; 用于 SNP 标记 NO. 14 的 SEQ ID NO. 72 和 73 ;用于 SNP 标记 NO. 15 的 SEQ ID NO. 74 和 75 ; 用于 SNP 标记 NO. 16 的 SEQ ID NO. 76 和 77 ;用于 SNP 标记 NO. 17 的 SEQ ID NO. 78 和 79 ; 用于 SNP 标记 NO. 18 的 SEQ ID NO. 80 和 81 ;用于 SNP 标记 NO. 19 的 SEQ ID NO. 82 和 83 ; 用于 SNP 标记 NO. 20 的 SEQ ID NO. 84 和 85 ;用于 SNP 标记 NO. 21 的 SEQ ID NO. 86 和 87 ; 用于 SNP 标记 NO. 22 的 SEQ ID NO. 88 和 89 ;用于 SNP 标记 NO. 23 的 SEQ ID NO. 90 和 91 ; 用于 SNP 标记 NO. 24 的 SEQ ID NO. 92 和 93 ;用于 SNP 标记 NO. 25 的 SEQ ID NO. 94 和 95 ; 用于 SNP 标记 NO. 26 的 SEQ ID NO. 96 和 97 ;用于 SNP 标记 NO. 27 的 SEQ ID NO. 98 和 99 ; 用于 SNP 标记 NO. 28 的 SEQ ID NO. 100 和 101 ;用于 SNP 标记 NO. 29 的 SEQ ID NO. 102 和 103 ;用于 SNP 标记 NO. 30 的 SEQ ID NO. 104 和 105 ;用于 SNP 标记 NO. 31 的 SEQ ID NO. 106 和 107 ;用于 SNP 标记 NO. 32 的 SEQ ID NO. 108 和 109 ;用于 SNP 标记 NO. 33 的 SEQ ID NO. 110 和 111 ;用于 SNP 标记 NO. 34 的 SEQ ID NO. 112 和 113 ;用于 SNP 标记 NO. 35 的 SEQ ID NO. 114 和 115 ;用于 SNP 标记 NO. 36 的 SEQ ID NO. 116 和 117 ;用于 SNP 标记 NO. 37 的 SEQ ID NO. 118 和 119 ;用于 SNP 标记 NO. 38 的 SEQ ID NO. 120 和 121 ;用于 SNP 标记 NO. 39 的 SEQ ID NO. 122 和 123;用于 SNP 标记 NO. 40 的 SEQ ID NO. 124 和 125;用于 SNP 标记 NO. 41 的 SEQ ID NO. 126 和 127 ;用于 SNP 标记 NO. 42 的 SEQ ID NO. 128 和 129 ;用于 SNP 标记 NO. 43 的 SEQ ID NO. 130 和 131 ;用于 SNP 标记 NO. 44 的 SEQ ID NO. 132 和 133 ;和 / 或用于 SNP 标记 NO. 45 的 SEQ ID NO. 134 和 135。
4. 用于检测权利要求1所述的一个或多个SNP标记的N位点处的基因型的芯片,其中, 所述芯片包含权利要求2或3所述的探针。
5. 根据权利要求4所述的芯片,其中,所述芯片包含由SEQ ID NO. 46-135组成的探 针,或 SEQ ID NO. 56、57、66、67、88、89、90、91、94、95、102、103、104、105、110、111、112、113、 114、115、118、119、126、127、128、129、130、131、132 和 133 所示的探针。
6. 检测权利要求1所述的一个或多个SNP标记的N位点处的基因型的引物。
7. 根据权利要求6所述的引物,其中,所述引物如下所示:用于SNP标记NO. 1的SEQ ID NO. 136 和 137 ;用于 SNP 标记 NO. 2 的 SEQ ID NO. 138 和 139 ;用于 SNP 标记 NO. 3 的 SEQ ID NO. 140 和 141 ;用于 SNP 标记 NO. 4 的 SEQ ID NO. 142 和 143 ;用于 SNP 标记 NO. 5 的 SEQ ID NO. 144 和 145 ;用于 SNP 标记 NO. 6、7 或 8 的 SEQ ID NO. 146 和 147 ;用于 SNP 标记 NO. 9 的 SEQ ID NO. 148 和 149 ;用于 SNP 标记 NO. 10 的 SEQ ID NO. 150 和 151 ;用于 SNP 标记 NO. 11 的 SEQ ID NO. 152 和 153 ;用于 SNP 标记 NO. 12 的 SEQ ID NO. 154 和 155 ;用于 SNP 标记 NO. 13 的 SEQ ID NO. 156 和 157 ;用于 SNP 标记 NO. 14 的 SEQ ID NO. 158 和 159 ;用于 SNP 标 记 NO. 15 的 SEQ ID NO. 160 和 161 ;用于 SNP 标记 NO. 16 的 SEQ ID NO. 162 和 163 ;用于 SNP 标记 NO. 17 的 SEQ ID NO. 164 和 165 ;用于 SNP 标记 NO. 18 的 SEQ ID NO. 166 和 167 ;用于 SNP 标记 NO. 19 的 SEQ ID NO. 168 和 169 ;用于 SNP 标记 NO. 20 的 SEQ ID NO. 170 和 171 ; 用于 SNP 标记 NO. 21 的 SEQ ID NO. 172 和 173 ;用于 SNP 标记 NO. 22 的 SEQ ID NO. 174 和 175 ;用于 SNP 标记 NO. 23 的 SEQ ID NO. 176 和 177 ;用于 SNP 标记 NO. 24 的 SEQ ID NO. 178 和 179 ;用于 SNP 标记 NO. 25 的 SEQ ID NO. 180 和 181 ;用于 SNP 标记 NO. 26 的 SEQ ID NO. 182 和 183 ;用于 SNP 标记 NO. 27 的 SEQ ID NO. 184 和 185 ;用于 SNP 标记 NO. 28 的 SEQ ID NO. 186 和 187 ;用于 SNP 标记 NO. 29 的 SEQ ID NO. 188 和 189 ;用于 SNP 标记 NO. 30 的 SEQ ID NO. 190 和 191 ;用于 SNP 标记 NO. 31 的 SEQ ID NO. 192 和 193 ;用于 SNP 标记 NO. 32 的 SEQ ID NO. 194 和 195;用于 SNP 标记 NO. 33 的 SEQ ID NO. 196 和 197;用于 SNP 标记 NO. 34 的 SEQ ID NO. 198 和 199 ;用于 SNP 标记 NO. 35 的 SEQ ID NO. 200 和 201 ;用于 SNP 标记 NO. 36 的 SEQ ID NO. 202 和 203 ;用于 SNP 标记 NO. 37 的 SEQ ID NO. 204 和 205 ;用于 SNP 标记 NO. 38 的 SEQ ID NO. 206 和 207 ;用于 SNP 标记 NO. 39 的 SEQ ID NO. 208 和 209 ; 用于 SNP 标记 NO. 40 的 SEQ ID NO. 210 和 211 ;用于 SNP 标记 NO. 41 的 SEQ ID NO. 212 和 213 ;用于 SNP 标记 NO. 42 的 SEQ ID NO. 214 和 215 ;用于 SNP 标记 NO. 43 的 SEQ ID NO. 216 和217 ;用于SNP标记NO. 44的SEQ ID NO. 218和219 ;和/或用于SNP标记NO. 45的SEQ ID NO. 220 和 221。
8. 用于检测权利要求1所述的一个或多个SNP标记的N位点处的基因型的试剂盒,其 中,所述试剂盒包含权利要求2或3所述的探针、权利要求4或5所述的芯片,和/或权利 要求6或7所述的引物。
9. 根据权利要求8所述的试剂盒,其用于检测SNP标记NO. 6、11、22、23、25、29、30、33、 34、35、37、41、42、43和44的別立点处的基因型,其中,所述试剂盒包括由5£0 1〇勵.56、57、 66、67、88、89、90、91、94、95、102、103、104、105、110、111、112、113、114、115、118、119、126、 127、128、129、130、131、132 和 133 组成的探针,或由 SEQ ID NO. 146、147、152、153、174、 175、176、177、180、181、188、189、190、191、196、197、198、199、200、201、204、205、212、213、 214、215、216、217、218 和 219 组成的引物。
10. 权利要求2或3所述的探针、权利要求4或5所述的芯片、权利要求6或7所述的 引物或者权利要求8或9所述的试剂盒在制备用于预测或诊断PC0S的试剂中的应用。
11. 权利要求2或3所述的探针、权利要求4或5所述的芯片、权利要求6或7所述的 引物或者权利要求8或9所述的试剂盒在预测或诊断PC0S中的应用。
12. -种预测或诊断PC0S的方法,其中,所述方法包括确定权利要求1所述的一个或多 个SNP标记的N位点处的基因型。
13. 根据权利要求12所述的方法,其中,所述方法通过杂交进行,例如,使用权利要求2 或3所述的探针、权利要求4或5所述的芯片或者权利要求8或9所述的试剂盒。
14. 根据权利要求12所述的方法,其中,所述方法通过测序进行,例如,PCR、实时定量 PCR或MassARRAY,优选使用权利要求6或7所述的引物或者权利要求8或9所述的试剂盒。
15. 根据权利要求12-14中任一项所述的方法,其中,所述方法包括以下步骤:从受试 者的外周血或唾液中提取DNA,确定一个或多个SNP标记的N位点处的基因型,以及分析结 果以预测PC0S的风险或诊断PC0S。
【文档编号】C12Q1/68GK104411824SQ201280074086
【公开日】2015年3月11日 申请日期:2012年6月18日 优先权日:2012年6月18日
【发明者】陈子江, 赵涵, 贺林, 师咏勇, 马金龙, 赵跃然, 耿玲, 游力 申请人:山东大学, 山东山大附属生殖医院有限公司, 上海交通大学
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