1H-N0X H105F、褐鼠 sGC0 1H-N0X I145Y、野生型褐鼠 βΙΗ-NOX、野生型黑腹果 蝇βΙΗ-NOX、野生型黑腹果蝇CG14885-PA Η-Ν0Χ、野生型线虫GCY-35H-N0X、野生型点形 念珠藻Η-Ν0Χ、野生型新月柄杆菌Η-Ν0Χ、野生型沙雷氏菌H-NOX或野生型丙酮丁醇梭菌 Η-Ν0Χ。在药物组合物的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是下列H-NOX蛋白的任何一种，所 述蛋白按它们的基因名称、接着是它们的物种缩写和Genbank标识符加以列出（例如从 2006年5月21日、2006年5月22日、2007年5月21日、2007年5月22日起可获得的以 下蛋白序列）：Npun5905_Npu_23129606、alr2278_Ana_17229770、S02144_Sone_24373702、 Mdegl343_Mde_23027521、VCA0720_Vch_15601476、CC2992_Ccr_16127222、Rsph2043_ Rhsp_22958463(gi:46192757)、Mmcl0739_Mcsp_22999020、Tar4_Tte_20807169、Ddes2822_ Dde_23475919、CAC3243_Cac_15896488、gcy-31_Ce_17568389、CG14885_Dm_24647455、 GUCYlB3_Hs_4504215、 HpGCS-betal_Hpul_14245738、 Gycbeta100 B_Dm_24651577、 CG4154_Dm_24646993(gi:NP_650424. 2、gi :62484298)、gcy-32_Ce_13539160, gcy-36_ Ce_17568391 (gi: 32566352、gi :86564713)、gcy-35_Ce-17507861(gi :71990146)、gcy-37_ Ce_17540904(gi: 71985505)、GCYl a 3_Hs_20535603、GCYl a 2-Hs_899477 或 GYCa -99B_ Dm_729270 (gi:68067738) (Lakshminarayan et al. (2003) ^Ancient conserved domains shared by animal soluble guanylyl cyclases and bacterial signaling proteins," BMG Genomics 4:5-13)。这些名称中使用的物种缩写包括：Ana -鱼腥藻 (Anabaena Sp) ;Ccr_ 新月柄杆菌（Caulobacter crescentus) ;Cac_ 丙酮丁 醇梭菌 (Clostridium acetobutylicum) ；Dde -脱硫脱硫弧菌（Desulfovibrio desulfuricans)； Mcsp-趋磁细菌某种（Magnetococcus sp.) ;Mde-Microbulbifer degradans;Npu_ 点 形念珠藻（Nostoc punctiforme) ;Rhsp_ 球形红细菌（Rhodobacter sphaeroides); Sone -沙雷氏菌（Shewanella oneidensis) ;Tte -腾冲嗜热厌氧菌（Thermoanaerobacter tengcongensis) ;Vch_ 霍乱弧菌（Vibrio cholerae) ;Ce_ 线虫；Dm-黑腹果幡； Hpul -马奠海胆（Hemicentrotus pulcherrimus) ;Hs -智人。在药物组合物的一些实 施方式中，所述H-NOX蛋白不是褐鼠 sGC01H-NOXC78S或褐鼠 sGC01H-NOX C78E。在 药物组合物的一些实施方式中，所述H-NOX蛋白不是以下H-NOX蛋白的任何一种，所述 蛋白质按照它们的生物体名称和Pfam数据库登录号列出（例如从2006年5月21日、 2006年5月22日、2007年5月21日、2007年5月22日起可获得的以下蛋白序列）：线 虫种（Caenorhabditis briggsae)Q622M5_CAEBR、线虫种 Q61P44_CAEBR、线虫种 Q61R54_ CAEBR、线虫种 Q61V90_CAEBR、线虫种 Q61A94_CAEBR、线虫种 Q60TP4_CAEBR、线虫种 Q60M10_ CAEBR、线虫（Caenorhabditis elegans)GCY37_CAEEL、线虫 GCY31_CAEEL、线虫 GCY36_ CAEEL、线虫 GCY32_CAEEL、线虫 GCY35_CAEEL、线虫 GCY34_CAEEL、线虫 GCY33_CAEEL、弓 背青鎌（Oryzias curvinotus)Q7T040_0RYCU、弓背青鎌 Q75WF0_0RYCU、青鎌（Oryzias latipes)P79998_0RYLA、青鎌 Q7ZSZ5_0RYLA、黑青斑河膝（Tetraodon nigroviridis) Q4SW38_TETNG、黑青斑河豚Q4RZ94_TETNG、黑青斑河豚Q4S6K5_TETNG、红鳍东方飩（Fugu rubripes)Q90VY5_FUGRU、非洲爪蟾（Xenopus laevis) Q6INK9_XENLA、智人 Q5T8J7_HUMAN、 智人 GCYA2_HUMAN、智人 GCYB2_HUMAN、智人 GCYB1_HUMAN、大猩猩（Gorilla gorilla) Q9N193_9PRIM、猩猩（Pongo pygmaeus)Q5RAN8_P0NPY、黑猩猩（Pan troglodytes) Q9N192_ PANTR、猕猴（Macaca mulatta)Q9N194_MACMU、白掌长臂猿（Hylobates lar)Q9N191_ HYLLA、小鼠 （Mus musculus)Q8BXH3_M0USE、小鼠 GCYB1_M0USE、小鼠 Q3UTI4_M0USE、 小鼠 Q3UH83_M0USE、小鼠 Q6XE41_M0USE、小鼠 Q80YP4_M0USE、褐鼠 Q80WX7_RAT、褐鼠 Q80WX8_RAT、褐鼠 Q920Q1_RAT、褐鼠 Q54A43_RAT、褐鼠 Q80WY0_RAT、褐鼠 Q80WY4_RAT、褐 鼠 Q8CH85_RAT、褐鼠 Q80WY5_RAT、褐鼠 GCYB1_RAT、褐鼠 Q8CH90_RAT、褐鼠 Q91XJ7_RAT、 褐鼠 Q80WX9_RAT、褐鼠 GCYB2_RAT、褐鼠 GCYA2_RAT、家犬（Canis familiaris)Q4ZHR9_ CANFA、西藏黄牛（Bos taurus)GCYBl_BOVIN、野猪（Sus scrofa)Q4ZHR7_PIG、双斑蟋 (Gryllus bimaculatus)Q59HN5_GRYBI、烟草天蛾（Manduca sexta)077106_MANSE、烟草天 蛾 076340_MANSE、意大利蜂（Apis mellifera) Q5UAR)_APME、意大利蜂 Q5FAN0_APME、 意大利蜂 Q6L5L6_APME、冈比亚疟蚊 str PEST(Anopheles gambiae str PEST)Q7PYK9_ AN0GA、冈比亚疟蚊 str PEST Q7Q9W6_AN0GA、冈比亚疟蚊 str PEST Q7QF31_AN0GA、冈 比亚疟蚊str PEST Q7PS01_AN0GA、冈比亚疟蚊str PEST Q7PFY2_AN0GA、冈比亚疟蚊 Q7KQ93_AN0GA、黑腹果蝇 Q24086_DR0ME、黑腹果蝇 GCYH_DROME、黑腹果蝇 GCY8E_DR0ME、 黑腹果蝇GCYDA_DROME、黑腹果蝇GCYDB_DROME、黑腹果蝇Q9VA09_DR0ME、拟暗果蝇 (Drosophila pseudoobscura)Q29CEl_DR0PS、拟暗果蝇 Q296C7_DR0PS、拟暗果蝇 Q296C8_ DROPS、拟暗果蝇 Q29BU7_DR0PS、海蜗牛（Aplysia californica)Q7YWK7_APLCA、马粪海胆 Q95NK5_HEMPU、莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii) Q5YLC2_CHLRE、鱼腥藻 Q8YUQ7_ ANASP、黄杆菌 BBFL7 (Flavobacteria bacterium BBFL7)Q26GR8_9BACT、Psychroflexus torquis ATCC 700755 Q1VQE5_9FLA0、海洋 γ 蛋白菌（marine gamma proteobacterium) HTCC2207Q1YPJ5_9GAMM、海洋 γ 蛋白菌 HTCC2207Q1YTK4_9GAMM、新月柄杆菌 Q9A451_ 〇八此1?、隐藏嗜酸菌开-5仏(^(1丨口11丨1丨11111(^7口加111开-5)〇20660_4(：10￥、球形红细菌〇31(^9_ RH0S4、Silicibacter pomeroyi Q5LPV1_SILP0、脱氮副球菌（Paracoccus denitrificans) PD1222Q3PC67_PARDE、Silicibacter sp TM1040Q3QNY2_9RH0B、Jannaschia sp Q28ML8_ JANSC、Magnetococcus sp MC_1Q3XT27_9PR0T、嗜肺军团菌（Legionella pneumophila) Q5WXP0_LEGPL、嗜肺军团菌 Q5WTZ5_LEGPL、嗜肺军团菌 Q5X268_LEGPA、嗜肺军团菌 Q5X2R2_ LEGPA、嗜肺军团菌嗜肺亚种（Legionella pneumophila subsp pneumophila)Q5ZWM9_ LEGPH、嗜肺军团菌嗜肺亚种 Q5ZSQ8_LEGPH、嗜冷细菌（Colwellia psychrerythraea) Q47Y43_C0LP3、大西洋假交替单胞菌（Pseudoalteromonas atlantica)T6c Q3CSZ5_ALTAT、 沙雷氏菌 Q8EF49_SHE0N、Saccharophagus degradans Q21E20_SACD2、Saccharophagus degradans Q21ER7_SACD2、 Vibrio angustum S14Q1ZWE5_9VIBR、创伤弧菌（Vibrio vulnificus) Q8DAE2_VIBVU、溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus) 12G01Q1VCP6_VIBAL、弧菌 某种（Vibrio sp)DAT722Q2FA22_9VIBR、副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus)Q87NJl_ VIBPA、费氏弧菌（Vibrio fischeri)Q5ElF5_VIBFl、创伤弧菌 Q7MJS8_VIBVY、发光菌某种 (Photobacterium sp)SKA：MQ2C6Z5_9GAMM、Hahella chejuensis Q2SFY7_HAHCH、海洋螺 旋菌某种（Oceanospirillum sp)MED92Q2BKV0_9GAMM、海洋杆菌某种（Oceanobacter sp) RED65Q1N035_9GAMM、脱硫脱硫弧菌（Desulfovibrio desulfuricans) Q310U7_DESDG、奥 氏嗜热盐丝菌（Halothermothrix orenii)H 168Q2AIW5_9FIRM、腾冲嗜热厌氧菌 Q8RBX6_ THETN、Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903Q2ZH17_CALSA、丙酮丁醇梭 菌 Q97E73_CL0AB、Alkaliphilus metalliredigenes QYMF Q3C763_9CL0T、破伤风梭菌 (Clostridium tetani)Q899J9_CL0TE 和拜氏梭菌 NCMB 8052Q2WVN0_CL0BE。在一些药物 组合物的实施方式中，所述H-NOX蛋白在Y-S-R基序中不具有突变，所述基序包括人H-NOX 的 Tyrl35、Serl37 和 Argl39。
[0028] 除非上下文另外明确说明或规定，本文所述的所有野生型和突变H-NOX蛋白可被 用于本文所述的任何药物组合物中。H-NOX蛋白可具有或可不具有血红素和/或结合氧， 并且可共价结合或可不共价结合于另一个分子或部分，如聚乙二醇。在一些实施方式中， H-NOX蛋白是融合蛋白，其包括H-NOX结构域和另一蛋白如白蛋白（如人血清白蛋白）的部 分或全部。
[0029] -方面，本发明提供了使用H-NOX蛋白向个体（例如，哺乳动物，如灵长类（如 人、猴、大猩猩、猿、狐猴等）、牛、马、猪、狗或猫）输送氧的方法。在一些实施方式中，个体 患有心血管疾病、神经疾病、肿瘤缺氧、失血或受伤或者处于心血管疾病、神经疾病、肿瘤缺 氧、失血或受伤的风险。示例性的心血管指征包括心肌梗死（如ST段抬高型心肌梗死）、 心脏麻痹、镰状细胞性贫血、围术期缺血（perioperative ischemia)、外周血管阻塞和血 管成形术。示例性的神经指征包括缺血性中风、脑外伤和脊髓伤。对于肿瘤缺氧的治疗， H-NOX蛋白可以被用作例如实体瘤（如，具有不良转移前预后的个体）的放射治疗佐剂，或 作为表面肿瘤（如直肠癌、肺癌或皮肤癌，或在其它可接近表面或位置中的癌症）的TOT 治疗佐剂。H-NOX蛋白作为输血替代选择的应用包括外伤（如战场、灾难救援或事故）、手 术（例如腹部动脉瘤手术、整形外科手术如髋关节置换手术、或产生高失血的任何其它手 术）、出血、出血性休克、血液稀释和血液延伸用途（blood extension use)(如补充自体供 应（supplementing auto-donation))。创伤修复应用的实例包括福射后创伤修复（如高压 氧效应）、术后恢复修复、糖尿病溃疡修复和烧伤。
[0030] 因此，在一些实施方式中，本发明提供了向个体（如人）输送氧的方法，其通过 以足以向个体输送有效量的氧的量，给予需要它的个体H-NOX蛋白。在一些实施方式中， H-NOX蛋白的O2解离常数在20°C在约InM到约ImM之间，并且H-NOX蛋白的NO反应性在 20°C小于约700s 4 (例如，在20°C小于约600s'500s'100s'20s4或I. 8s 1。在一些实施 方式中，H-NOX蛋白的02解离常数在血红蛋白的0 2解离常数的2个数量级之内，并且H-NOX 蛋白的NO反应性比血红蛋白的NO反应性低至少10倍。
[0031] 在该方法的一些实施方式中，氧在给予个体H-NOX蛋白之前被结合到H-NOX蛋白。 在该方法的一些实施方式中，氧在在给予个体H-NOX蛋白之前没有被结合到H-NOX蛋白，并 且H-NOX蛋白将氧从该个体中的一个位置运输到该个体中的另一个位置。在该方法的一些 实施方式中，H-NOX蛋白被给予到个体的血液。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白被 给予到个体的血液、伤口、肿瘤、缺氧组织或缺氧器官。在该方法的一些实施方式中，个体遭 受失血或处于失血的风险。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白被给予个体至少两次。
[0032] 在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白的O2解离常数在智人血红蛋白α的〇 2解 离常数的2个数量级之内，例如O2解离常数是智人血红蛋白α的O2解离常数的〇. 1到10 倍或0.5到2倍。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白的NO反应性比智人血红蛋白α 的NO反应性低至少10倍，例如，比智人血红蛋白α的NO反应性低至少100倍或1000倍。 在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白是野生型蛋白。在该方法的一些实施方式中，H-NOX 蛋白是本文所述的突变蛋白。在该方法的多种实施方式中，H-NOX蛋白具有至少一个突变， 与相应的野生型蛋白相比，所述突变改变〇 2解离常数、对氧kf、血红素自氧化速率、NO反应 性或前述的任何两种或多种。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白选自野生型腾冲嗜 热厌氧菌Η-Ν0Χ、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX I5A、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX I5L、腾冲嗜热厌氧菌 H-NOX I5L-P115A、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9F、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9F-Y140L、腾冲嗜 热厌氧菌H-NOX W9F-Y140H、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9F-N74A、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9Y、 腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9N、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9H、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX N74E、腾冲 嗜热厌氧菌H-NOX N74A、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX N74H、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX N74A-Y140H、 腾冲嗜热厌氧菌H-NOX F78Y-Y140F、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX F78Y/Y140L、腾冲嗜热厌氧 菌H-NOX P115A、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX R135Q、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140F、腾冲嗜热厌 氧菌H-NOX Y40L、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140H、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140A、腾冲嗜热 厌氧菌I75F-His6、腾冲嗜热厌氧菌I75F、腾冲嗜热厌氧菌L144F-His6、腾冲嗜热厌氧菌 L144F、嗜肺军团菌2H-N0X F142Y、野生型嗜肺军团菌1H-N0X、野生型嗜肺军团菌2H-N0X、 嗜肺军团菌2F9W-F142Y、野生型脱硫脱硫弧菌Η-Ν0Χ、脱硫脱硫弧菌H-NOX(728-899)、脱 硫脱硫弧菌H-NOX Y139L、野生型智人βΙΗ-ΝΟΧ、智人β1Ι145Υ、智人β 1 (1-385)、智人 β 1 (1-385) Ι145Υ、智人 β 1 (1-385) Ι145Η、智人 β 1(1-194)、智人 β 1(1-194) Ι145Υ、智人 0 1(1-194)1^91-1145￥、智人0 2(1-217)、智人0 2(1-217)1142丫、智人0 1!1-勵父！11〇56、智 人 β 1Η-Ν0Χ H105F、野生型褐鼠 βΙΗ-ΝΟΧ、褐鼠 β 1 (1-385)、褐鼠 β 1 (1-385) Ι145Υ、褐鼠 β 1(1-385) 1145Η、褐鼠 β 1(1-194)、褐鼠 β 1(1-194) 1145Υ、褐鼠 β 1(1-194)L9W-I145Y、 褐鼠 β 2(1-217)、褐鼠 β 2(1-217)1142Υ、褐鼠 β 1Η-Ν0Χ H105G、褐鼠 β 1Η-Ν0Χ H105F、 肉毒梭菌Η-Ν0Χ(1-175)、肉毒梭菌Η-Ν0Χ(1-186)、野生型丙酮丁醇梭菌Η-Ν0Χ、丙酮丁醇 梭菌 H-NOX(1-197)、丙酮丁醇梭菌 H-NOX(1-183)、野生型线虫 GCY-35H-N0X、线虫 H-NOX GCY-35(l-252)、野生型黑腹果蝇β 1Η-Ν0Χ、野生型黑腹果蝇CG14885-PA、野生型黑腹果蝇 CG14886、野生型黑腹果蝇CG4154 ;野生型点形念珠藻Η-Ν0Χ、野生型新月柄杆菌Η-Ν0Χ、野 生型沙雷氏菌Η-Ν0Χ、野生型小鼠 Η-Ν0Χ、野生型家犬Η-Ν0Χ、野生型家牛Η-Ν0Χ、野生型褐 鼠；野生型非洲爪蟾Η-Ν0Χ、野生型青鏘Η-Ν0Χ、野生型0. curivatus Η-Ν0Χ、野生型红鳍东 方飩H-NOX、野生型冈比亚按蚊H-NOX、野生型烟草天蛾H-NOX ;野生型线虫gcy-31、线虫 gcy-32、野生型线虫gcy-33、野生型线虫gcy-34、野生型线虫gcy-35、野生型线虫gcy-36、 野生型线虫gcy-37 ;野生型霍乱弧菌Η-Ν0Χ、野生型费氏弧菌H-NOX和野生型点形念珠藻 Η-Ν0Χ。在该方法的一些实施方式中，一种或多种脂质体或纳米颗粒包含或封装H-NOX蛋 白。
[0033] 在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140H。在 该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y40L、腾冲嗜热厌氧 菌H-NOX F78Y/Y140L、野生型腾冲嗜热厌氧菌H-NOX或嗜肺军团菌2H-N0X F142Y。在 该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是褐鼠 β 2(1-217)、褐鼠 β 1(1-194)、褐鼠 β 1 (1-385)或褐鼠 β 1(1-385) 1145Υ。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾 冲嗜热厌氧菌H-NOX W9F、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140F或智人β1Η-Ν0Χ(1-385)Ι145Υ。 在一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Υ140Η、智人β 1Ι140Υ或 智人β 1Ι145Υ。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾冲嗜热厌氧菌H-NOX Y140F、野生型嗜肺军团菌2Η-Ν0Χ、智人β 1Η-Ν0Χ Ι140Υ、野生型智人β 1Η-Ν0Χ、褐 鼠 sGC0 1Η-Ν0Χ (1-385)、褐鼠 sGC0 1Η-Ν0Χ (1-385) 1145Υ、褐鼠 sGC0 1Η-Ν0Χ H105G、 褐鼠 sGC β 1H-N0X H105F、褐鼠 sGC β 1H-N0X 1145Y、野生型褐鼠 β 1H-N0X、野生型黑 腹果蝇β 1Η-Ν0Χ、野生型黑腹果蝇CG14885-PA Η-Ν0Χ、野生型线虫GCY-35H-N0X、野 生型点形念珠藻H-NOX、野生型新月柄杆菌H-NOX、野生型沙雷氏菌H-NOX或野生型丙 酮丁醇梭菌Η-Ν0Χ。在所述方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是腾冲嗜热厌氧菌 H-NOX Y40L、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX F78Y/Y140L、腾冲嗜热厌氧菌H-NOX W9F、腾冲嗜 热厌氧菌H-NOX Y140F、野生型腾冲嗜热厌氧菌H-NOX、嗜肺军团菌2H-N0X F142Y、野生 型嗜肺军团菌2H-N0X、智人MH-NOX I140Y、智人B1I145Y、野生型智人ΜΗ-Ν0Χ、褐 鼠 sGC0 1H-N0X (1-385)、褐鼠 sGC0 1H-N0X (1-385) 1145Y、褐鼠 sGC0 1H-N0X H105G、褐 鼠 sGC0 1H-N0X H105F、褐鼠 sGC0 1H-N0X I145Y、野生型褐鼠 βΙΗ-ΝΟΧ、野生型黑腹果 蝇β 1Η-Ν0Χ、野生型黑腹果蝇CG14885-PA Η-Ν0Χ、野生型线虫GCY-35H-N0X、野生型点 形念珠藻Η-Ν0Χ、野生型新月柄杆菌Η-Ν0Χ、野生型沙雷氏菌H-NOX或野生型丙酮丁醇梭 菌Η-Ν0Χ。在该方法的一些实施方式中，H-NOX蛋白不是以下H-NOX蛋白的任何一种，所 述蛋白以它们的基因名称、接着是它们的物种缩写和Genbank标识符加以列出（例如从 2006年5月21日、2006年5月22日、2007年5月21日、2007年5月22日起可用的以下 蛋白序列）：Npun5905_Npu_23129606、alr2278_Ana_17229770、S02144_Sone_24373702、 Mdegl343_Mde_23027521、VCA0720_Vch_15601476、CC2992_Ccr_16127222、Rsph2043_ Rhsp_22958463(gi:46192757)、Mmcl0739_Mcsp_22999020、Tar4_Tte_20807169、Ddes2822_ Dde_23475919、CAC3243_Cac_15896488、gcy-31_Ce_17568389、CG14885_Dm_24647455、 GUCYlB3_Hs_4504215、 HpGCS-betal_Hpul_14245738、 Gycbeta100 B_Dm_24651577、 CG41