用于治疗和检测癌症的被称为98p4b6的核酸和相应的蛋白质的制作方法

专利名称：：用于治疗和检测癌症的被称为98p4b6的核酸和相应的蛋白质的制作方法
技术领域：
：本文所述的发明涉及某些癌症中表达的被称为98P4B6或STEAP-2的基因及其编码的蛋白质，并且涉及可用于处置表达98P4B6的癌症的诊断和治疗方法以及组合物。
背景技术：
：癌症是仅次于冠状疾病的导致人类死亡的第二大病因。世界上每年有数百万人死于癌症。据美国癌症学会报道，仅在美国，癌症每年导致50万以上的健康人死亡，每年诊断出的新病例超过120万。尽管由心脏病所致的死亡已显著减少，但由癌症导致的死亡却普遍呈上升趋势。预测在下个世纪早期，癌症将成为导致死亡的首要原因。在世界范围内，有几种癌症突显为主要杀手。具体地说，肺癌、前列腺癌、乳腺癌、结肠癌、胰腺癌和卵巢癌成为癌症死亡主要原因的代表。这些癌症和事实上所有其它癌症都具有共同的致死特征。除了极少数的例外，癌症的转移疾病也是致死性的。另外，即便有些癌症患者起初从原发性癌症中生还，但它们共同的体验表明它们的生活已发生明显变化。很多患者担心癌症很可能会复发或治疗会失败，因而感到非常焦虑。很多癌症患者在治疗后感到身体虚弱。另外，很多癌症患者还会遭遇癌症复发。在世界范围内，前列腺癌在男性最易发癌症中列第四位。在北美和北欧，前列腺癌是男性中最常见的癌症，是导致男性死于癌症的第二大病因。仅在美国，每年死于此病的男人远远超过30,000人-仅次于肺癌。尽管这些数字的数量级很大，但针对转移的前列腺癌仍无有效的治疗方法。外科前列腺切除术、放疗、激素脱离疗法、外科阉割和化疗仍是主要的治疗形式。不幸的是这些疗法对很多人都不起效果，并且经常与不良的后果有关。在诊断方面，缺乏可准确检测早期、定位前列腺肿瘤的肿瘤标记显著限制了前列腺癌的诊断和治疗。尽管血清前列腺特异性抗原(PSA)测定法已成为很有用的工具，但人们普遍认为该方法在几个重要的方面缺乏特异性和普遍实用性。能在小鼠体内重演疾病的不同阶段的前列腺癌异种移植物的产生推进了鉴定前列腺癌其它特异性标记的进程。LAPC(LosAngelesProstateCancer)异种移植物是前列腺癌异种移植物，它能在严重联合免疫缺陷(SCID)小鼠中幸免于死，并能表现出模拟从雄激素依赖型转变为雄激素非依赖型的能力(Kleinetal.，1997，Nat.Med.3402)。最新鉴定的前列腺癌标记包括PCTA-1(Suetal.，1996，Proc.Natl.Acad.Sci.USA937252)、前列腺-特异性膜(PSM)抗原(Pintoetal.，C1inCancerRes1996Sep2(9)1445-51)、STEAP(Hubert，etal，ProcNatlAcadSciUSA.1999Dec7；96(25)14523-8)和前列腺干细胞抗原(PSCA)(Reiteretal.，1998，Proc.Natl.Acad.Sci.USA951735)。尽管以前鉴定的标记，如PSA，PSM，PCTA和PSCA对诊断和治疗前列腺癌起到一定作用，但是，为了进一步完善诊断和治疗，仍需要鉴定前列腺和相关癌症的其它标记和治疗靶标。肾细胞癌(RCC)造成了约3％的成年人恶性肿瘤。一旦腺瘤的直径达到2至3cm，就存在恶变的可能。在成年人中，两种主要的恶性肾肿瘤是肾细胞腺癌以及肾盂或输尿管的移行细胞癌。据估计，美国的肾细胞腺癌的发病率超过29,000例，1998年，有11,600多位患者死于该病。移行细胞癌较少发生，美国每年的发病率约为500例。几十年来，外科手术是肾细胞腺癌的主要疗法。直至最近，任何全身性疗法都对付不了转移疾病。借助于全身性疗法，特别是免疫疗法的最新进展，可以进攻性地接近适当患者体内的转移肾细胞癌，并且有可能伴有持久的反应。然而，这些患者仍需要有效的疗法。在美国的所有癌症新病例中，膀胱癌约占男性肿瘤的5％(在常见肿瘤中名列第五)和女性肿瘤的3％(在常见肿瘤中名列第八)。发病率随着老年人群的逐渐增加而缓慢增加。据估计，1998年有54,500个病例，包括39,500位男性和15,000位女性。在美国，受年龄调节的发病率为每100,000位男性有32位患者，每100,000位女性有8位患者。与女性的吸烟模式相关联，历史性的男性/女性患病比例3∶1可能会降低。据估计，1998年有11,000位患者死于膀胱癌(7,800位男性和3,900位女性)。膀胱癌的发病率和死亡率随着年龄的增加而急剧增加，随着种群老龄化的出现，这将成为日益严重的问题。大多数膀胱癌在膀胱中复发。膀胱癌的治疗方法为联合使用膀胱经尿道切除术(TUR)以及膀胱内化学疗法或免疫疗法。膀胱癌的多病灶和复发特征显出TUR的局限性。仅通过TUR不能治愈大多数的肌肉-受侵癌症。膀胱根治切除术和尿流改道术是消除癌症的最有效方法，但不可否认的是，它们对泌尿和性功能有影响。因此，十分需要有利于膀胱癌患者的治疗形式。据估计，2000年美国有130,200例结肠直肠癌发生，包括93,800例结肠癌和36,400例直肠癌。结肠直肠癌是男性和女性第三多发的癌症。1992-1996年，发病率显著降低(每年下降2.1％)。研究表明发病率的下降可能应归功于筛查和切除息肉，防止息肉发展成为侵害性癌症。据估计，2000年有56,300位患者死亡(47,700位死于结肠癌，8,600位死于直肠癌)，约占所有美国癌症死亡人数的11％。目前，最普遍的结肠直肠癌疗法是外科手术，对于尚未扩散的癌症而言，经常是可治愈的。对于癌症已深度穿入肠壁或已扩散至淋巴结的大多数患者而言，在手术前或手术后应给予化学疗法或化学疗法加放疗。结肠癌患者有时需要永久性结肠造口术(在腹部开一个小口以排出体内废物)，而直肠癌患者较少需要该手术。结肠直肠癌患者仍需要有效的诊断和治疗形式。据估计，2000年新出现164,100个肺和支气管癌病例，占所有美国癌症诊断病例的14％。男性肺和支气管癌的发病率显著降低，从1984年每100,000人中高达86.5人患病至1996年的70.0人患病。在上个世纪九十年代，女性发病率的增加速度开始减缓。1996年，女性的发病率为每100,000人中42.3人患病。据估计，2000年肺和支气管癌导致156,900人死亡，占所有癌症死亡人数的28％。1992-1996年，男性中的肺癌死亡率显著下降(每年下降1.7％)，而女性中的死亡率仍然逐渐增加(每年增加0.9％)。自1987年以来，与乳腺癌相比，每年死于肺癌的妇女更多，对于40岁以上的妇女来说，肺癌是女性癌症死亡的主要病因。前30年降低吸烟人数的比例最有可能导致肺癌发病率和死亡率的降低；然而，相对于男性而言，减少女性吸烟模式的工作有些滞后。值得关注的是，尽管成人烟草使用率的下降速度趋于缓慢，但年轻人中的烟草使用率再次呈逐渐增加的趋势。可根据癌症的类型和阶段，确定肺和支气管癌的治疗选择，其包括外科手术、放疗和化疗。对于多种固定于局部的癌症来说，通常选择的疗法是外科手术。由于在发现癌症之前，癌症通常已扩散，经常需要在外科手术的同时联合使用放疗和化疗。对于小细胞肺癌而言，可以选择的疗法是仅用化疗或将化疗与放疗联合；通过使用此方案，高百分比患者的病情减轻，在有些情况下，这种好的疗效会长时间保持。然而，肺和支气管癌不断需要有效的治疗和诊断方法。预计2000年美国妇女中会出现约182,800例新的乳腺癌侵害病例。另外，预计2000年会诊断出约1,400例新的男性乳腺癌病例。自上个世纪八十年代每年约增加4％之后，妇女乳腺癌的发病率在九十年代已停止增长，维持在每100,000人中约110.6个病例。仅在美国，据估计2000年有41,200人(40,800名女性，400名男性)死于乳腺癌。乳腺癌在女性癌症死亡中名列第二。根据最新的数据，在1992-1996年，死亡率显著降低，在年轻白人和黑人妇女中死亡率的降低最为显著。死亡率的降低可能是早期检测和改进疗法的结果。考虑到就医环境和患者的选择，乳腺癌疗法包括肿块切除术(局部切除肿瘤)和摘除胳膊下方的淋巴结；乳房切除术(手术切除乳房)和摘除胳膊下方的淋巴结；放疗；化疗；或激素疗法。经常联合使用两种或多种疗法。多项研究表明对于早期乳腺癌而言，肿块切除术加放疗之后的长期存活率类似于改良根治性乳房切除术之后的存活率。重建术的显著进步给乳房切除术后的乳房重建提供了几种选择。最近，已在乳房切除术的同时进行乳房重建。针对周围有足够量的正常乳腺组织的原位导管癌(DCIS)的局部切除术可防止DCIS的局部复发。对乳房进行放疗和/或他莫昔芬可减少其余乳腺组织发生DCIS的机会。这一点至关重要，因为如果对DCIS不加治疗，即可发展为侵害性乳腺癌。然而，这些疗法有严重的副作用或后遗症。因此，需要有效的乳腺癌疗法。据估计，2000年美国有23,100例新的卵巢癌病例。占妇女所有癌症的4％，并在妇产科癌症中名列第二。在1992-1996年，卵巢癌发病率显著降低。据估计，2000年有14,000人死于卵巢癌。与任何其它女性生殖系统癌症相比，卵巢癌导致更多患者死亡。外科手术、放疗和化疗是可选择的卵巢癌疗法。外科手术通常包括摘除一个或两个卵巢，输卵管(输卵管卵巢切除术)和子宫(子宫切除术)。对一些很早期的肿瘤，特别是对那些希望生孩子的年轻妇女而言，仅需要摘除染病的卵巢。对晚期卵巢癌而言，应尝试摘除所有腹内病灶以增强化疗的效果。卵巢癌仍需要有效的治疗方法。据估计，2000年美国有28,300例新的胰腺癌病例。在过去的20年内，男性胰腺癌的发病率下降。女性胰腺癌的发病率基本保持不变，但人数已开始下降。2000年美国约有28,200人死于胰腺癌。在过去的20年内，男性死亡率有微弱但显著的下降趋势(每年约下降0.9％)，而女性死亡率略有增加。外科手术、放疗和化疗是可选择的胰腺癌疗法。这些疗法可以延长很多患者的存活期和/或减轻它们的症状，但不可能治愈大多数患者。显然，还需要其它针对胰腺癌的治疗和诊断方法。发明简述本发明涉及被称为98P4B6的基因，目前，已发现该基因在表I所列的癌症中超表达。对正常组织中98P4B6基因表达的Northern印迹表达分析显示出该基因在成人组织中的受限表达模式。本文提供了98P4B6的核苷酸(图2)和氨基酸(图2和图3)序列。98P4B6在正常成人组织中的组织-相关分布模式，以及在表I所列组织中观察到的超表达显示出98P4B6至少在某些癌症中异常地超表达，因此，98P4B6可用作诊断、预防、预测和/或治疗如表I所列组织的癌症的靶标。本发明提供了与全部或部分98P4B6基因、mRNA和/或编码序列(优选它们为分离形式)相对应或互补的多核苷酸，包括编码98P4B6-相关蛋白质及其长度为4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，或大于25个邻接氨基酸的片段，98P4B6-相关蛋白质的至少30，35，40，45，50，55，60，65，70，80，85，90，95，100或大于100个邻接氨基酸，以及肽/蛋白质本身的多核苷酸；DNA，RNA，DNA/RNA杂合体和相关分子，与98P4B6基因或mRNA序列或其部分互补或与之具有至少90％同源性的多核苷酸或寡核苷酸，以及能与98P4B6基因，mRNA或编码98P4B6的多核苷酸杂交的多核苷酸或寡核苷酸。本发明还提供了分离cDNA和编码98P4B6的基因的方法。还提供了含有98P4B6多核苷酸的重组DNA分子，被所述分子转化或转导的细胞以及用于表达98P4B6基因产物的宿主-载体系统。本发明还提供了能与98P4B6蛋白及其多肽片段结合的抗体，包括多克隆和单克隆抗体，鼠和其它哺乳动物抗体，嵌合抗体，人源化和全人抗体，以及用可测标记或治疗剂标记的抗体。在一些实施方案中，需满足的前提条件是不编码图2的完整核酸序列和/或不制备图2的完整氨基酸序列。在某些实施方案中，编码了图2的完整核酸序列和/或制备了图2的完整氨基酸序列，它们中的任一种皆为其各自的人单位剂量形式。本发明还提供了检测多种生物样品中98P4B6多核苷酸和蛋白质的存在和状况的方法，以及鉴定表达98P4B6的细胞的方法。本发明的典型实施方案提供了监测具有或怀疑具有某些形式的生长调节异常，如癌症的组织或血液样品中是否具有98P4B6基因产物的方法。本发明还提供了多种用于治疗表达98P4B6的癌症，如表I所列组织的癌症的免疫原性或治疗性的组合物和策略，包括目的在于抑制98P4B6转录、翻译、加工或功能的疗法以及癌症疫苗。一方面，本发明提供了用于治疗人受试者中表达98P4B6的癌症的组合物和包括使用该组合物的方法，其中组合物含有适用于人的载体，以及人单位剂量的一种或多种可抑制98P4B6产生或功能的药剂。优选载体是独特的人载体。在本发明的另一方面，药剂是能与98P4B6蛋白发生免疫反应的组成成分。所述组成成分的非限制性例子包括但不限于抗体(如单链、单克隆、多克隆、人源化、嵌合或人抗体)，其功能等同物(可以是天然的，也可以是合成的)及其组合。抗体可以与诊断或治疗组成成分偶联。另一方面，药剂是本文定义的小分子。另一方面，药剂含有一种或多种含有细胞毒T淋巴细胞(CTL)表位的肽和/或一种或多种含有辅助性T淋巴细胞(HTL)表位的肽，前一表位能与人体内的I类HLA分子结合以引发针对98P4B6的CTL反应，后一表位能与人体内的II类HLA分子结合以引发HTL反应。本发明的肽可以位于相同的或一种或多种分开的多肽分子上。在本发明的另一方面，药剂含有一种或多种核酸分子，所述核酸分子表达一种或多种上文所述的能刺激CTL或HTL反应的肽。在本发明的另一方面，一种或多种核酸分子可表达能与上述98P4B6发生免疫反应的组成成分。一种或多种核酸分子也可以是或编码抑制98P4B6产生的分子。所述分子的非-限制性例子包括但不限于与产生98P4B6所必需的核苷酸序列互补的分子(如反义序列或与产生98P4B6所必需的核苷酸双螺旋形成三股螺旋的分子)或能有效裂解98P4B6mRNA的核酶。需说明的是为了测定表VIII-XXI和XXII至XLIX(通称为HLA肽表)中所示的与其亲代蛋白质相对应的任何肽，如变体1，变体2等的起始位置，应参考三个因素特定的变体、HLA肽表中的肽长度和表VII中的检索肽。一般说来，使用独特的检索肽来获得特定变体的特定HLA肽。表VII列出了每个检索肽相对于其各自的亲代分子的位置。因此，如果检索肽从第“X”位开始，必需给表VIII-XXI和XXII至XLIX中的每个位置加上数值“X-1”，以获得HLA肽在其亲代分子中的实际位置。例如，如果特定的检索肽自其亲代分子的第150位开始，必需给每个HLA肽氨基酸位置加上150-1，即149，以计算出该氨基酸在亲代分子中的位置。本发明的一个实施方案包括HLA肽或者编码HLA肽的寡核苷酸，所述HLA肽在表VIII-XXI和XXII至XLIX中总共出现至少两次。本发明的另一个实施方案包括HLA肽或者编码HLA肽的寡核苷酸，所述HLA肽在表VIII-XXI中出现至少一次，在表XXII至XLIX中出现至少一次。本发明的另一个实施方案是抗体表位，其含有肽区域或编码肽区域的寡核苷酸，并具有下述特征中的1，2，3，4或5种i)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的肽区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图5的亲水性分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；ii)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的肽区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图6的亲/疏水性分布图中，数值等于或小于0.5，0.4，0.3，0.2，0.1，或等于0.0的氨基酸位置；iii)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的肽区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图7的可及残基百分比分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；iv)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的肽区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图8的平均柔性分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；或v)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的肽区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图9的β-转角分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置。图1.183个氨基酸长的98P4B6SSH序列。图2.A)98P4B6变体1(也称为“98P4B6v.1”或“98P4B6变体1”)的cDNA和氨基酸序列示于图2A。下划线的是起始甲硫氨酸。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。B)98P4B6变体2(也称为“98P4B6v.2”)的cDNA和氨基酸序列示于图2B。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸4延伸至138，其中包括起始密码子。C)98P4B6变体3(也称为“98P4B6v.3”)的cDNA和氨基酸序列示于图2C。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸188延伸至1552，其中包括起始密码子。D)98P4B6变体4(也称为“98P4B6v.4”)的cDNA和氨基酸序列示于图2D。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸318延伸至1682，其中包括起始密码子。E)98P4B6变体5(也称为“98P4B6v.5”)的cDNA和氨基酸序列示于图2E。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸318延伸至1577，其中包括起始密码子。F)98P4B6变体6(也称为“98P4B6v.6”)的cDNA和氨基酸序列示于图2F。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸318延伸至1790，其中包括起始密码子。G)98P4B6变体7(也称为“98P4B6v.7”)的cDNA和氨基酸序列示于图2G。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。H)98P4B6变体8(也称为“98P4B6v.8”)的cDNA和氨基酸序列示于图2H。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。I)98P4B6变体9(也称为“98P4B6v.9”)的cDNA和氨基酸序列示于图2I。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。J)98P4B6变体10(也称为“98P4B6v.10”)的cDNA和氨基酸序列示于图2J。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。K)98P4B6变体11(也称为“98P4B6v.11”)的cDNA和氨基酸序列示于图2K。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。L)98P4B6变体12(也称为“98P4B6v.12”)的cDNA和氨基酸序列示于图2L。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。M)98P4B6变体13(也称为“98P4B6v.13”)的cDNA和氨基酸序列示于图2M。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。N)98P4B6变体14(也称为“98P4B6v.14”)的cDNA和氨基酸序列示于图2N。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。O)98P4B6变体15(也称为“98P4B6v.15”)的cDNA和氨基酸序列示于图2O。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。P)98P4B6变体16(也称为“98P4B6v.16”)的cDNA和氨基酸序列示于图2P。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。Q)98P4B6变体17(也称为“98P4B6v.17”)的cDNA和氨基酸序列示于图2Q。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。R)98P4B6变体18(也称为“98P4B6v.18”)的cDNA和氨基酸序列示于图2R。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。S)98P4B6变体19(也称为“98P4B6v.19”)的cDNA和氨基酸序列示于图2S。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸355延伸至1719，其中包括起始密码子。T)98P4B6变体2Q(也称为“98P4B6v.20”)的cDNA和氨基酸序列示于图2T。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。U)98P4B6变体21(也称为“98P4B6v.21”)的cDNA和氨基酸序列示于图2U。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。V)98P4B6变体22(也称为“98P4B6v.22”)的cDNA和氨基酸序列示于图2V。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。W)98P4B6变体23(也称为“98P4B6v.23”)的cDNA和氨基酸序列示于图2W。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。X)98P4B6变体24(也称为“98P4B6v.24”)的cDNA和氨基酸序列示于图2X。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸295延伸至2025，其中包括起始密码子。Y)98P4B6变体25(也称为“98P4B6v.25”)的cDNA和氨基酸序列示于图2Y。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。Z)98P4B6变体26(也称为“98P4B6v.26”)的cDNA和氨基酸序列示于图2Z。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AA)98P4B6变体27(也称为“98P4B6v.27”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AA。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AB)98P4B6变体28(也称为“98P4B6v.28”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AB。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AC)98P4B6变体29(也称为“98P4B6v.29”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AC。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AD)98P4B6变体30(也称为“98P4B6v.30”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AD。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AE)98P4B6变体31(也称为“98P4B6v.31”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AE。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AF)98P4B6变体32(也称为“98P4B6v.32”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AF。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AG)98P4B6变体33(也称为“98P4B6v.33”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AG。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AH)98P4B6变体34(也称为“98P4B6v.34”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AH。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AI)98P4B6变体35(也称为“98P4B6v.35”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AI。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AJ)98P4B6变体36(也称为“98P4B6v.36”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AJ。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AK)98P4B6变体37(也称为“98P4B6v.37”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AK。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。AL)98P4B6变体38(也称为“98P4B6v.38”)的cDNA和氨基酸序列示于图2AL。下划线的是起始甲硫氨酸的密码子。开放阅读框从核酸394延伸至1866，其中包括起始密码子。图3.A)98P4B6v.1的氨基酸序列示于图3A；它具有454个氨基酸。B)98P4B6v.2的氨基酸序列示于图3B；它具有45个氨基酸。C)98P4B6v.5的氨基酸序列示于图3C；它具有419个氨基酸。D)98P4B6v.6的氨基酸序列示于图3D；它具有490个氨基酸。E)98P4B6v.7的氨基酸序列示于图3E；它具有576个氨基酸。F)98P4B6v.8的氨基酸序列示于图3F；它具有490个氨基酸。G)98P4B6v.13的氨基酸序列示于图3G；它具有454个氨基酸。H)98P4B6v.14的氨基酸序列示于图3H；它具有454个氨基酸。I)98P4B6v.21的氨基酸序列示于图3I；它具有576个氨基酸。J)98P4B6v.25的氨基酸序列示于图3J；它具有490个氨基酸。除非另有说明，本文所用的98P4B6包括其所有的变体，包括图2，3，10和11所示的变体。图4.98P4B6与已知基因人STAMP1、人前列腺2的6个跨膜上皮细胞抗原和小鼠前列腺2的6个跨膜上皮细胞抗原之间的比较。图4(A)98P4B6变体1与人STAMP1(gi15418732)的序列比对。图4(B)98P4B6变体1与人STEAP2(gi23308593)的序列比对。图4(C)98P4B6变体1与小鼠STEAP2(gi28501136)的序列比对。图4(D)三种98P4B6变体的群集序列比对，显示出98P4B6V1B相对于V1而言，在其N-末端含有额外的62个氨基酸，98P4B6V2相对于V1而言，在第225位氨基酸处携有一个I至T的点突变。图5.通过ExPasy分子生物学服务器，从位于www.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl的Protscale站点可进入使用Hopp和Woods的方法(HoppT.P.，WoodsK.R.，1981.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.783824-3828)的计算机算法序列分析，通过此分析测定出98P4B6v.1、v.2、v.5、v.6和v.7的亲水性(hydrophilicity)氨基酸分布图。图6.通过ExPasy分子生物学服务器，从位于www.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl的Protscale站点可进入使用Kyte和Doolittle的方法(KyteJ.，DoolittleR.F.，1982.J.Mol.Biol.157105-132)的计算机算法序列分析，通过此分析测定出98P4B6v.1、v.2、v.5、v.6和v.7的亲/疏水性(hydropathicity)氨基酸分布图。图7.通过ExPasy分子生物学服务器，从位于www.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl的Protscale站点可进入使用Janin的方法(JaninJ.，1979Nature277491-492)的计算机算法序列分析，通过此分析测定出98P4B6v.1、v.2、v.5、v.6和v.7的可及(accessible)氨基酸残基百分比分布图。图8.通过ExPasy分子生物学服务器，从位于www.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl的Protscale站点可进入使用Bhaskaran和Ponnuswamy的方法(BhaskaranR.，andPonnuswamyP.K.，1988.Int.J.Pept.ProteinRes.32242-255)的计算机算法序列分析，通过此分析测定出98P4B6v.1、v.2、v.5、v.6和v.7的平均柔性(averageflexibility)氨基酸分布图。图9.通过ExPasy分子生物学服务器，从位于www.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl的Protscale站点可进入使用Deleage和Roux的方法(Deleage，G，RouxB.1987ProteinEngineering1289-294)的计算机算法序列分析，通过此分析测定出98P4B6v.1、v.2、v.5、v.6和v.7的β-转角(beta-turn)氨基酸分布图。图10.图10(a)98P4B6v.1SNP变体的序列比对图。变体98P4B6v.9至v.19是与v.1有单个核苷酸差异的变体。尽管分开显示这些SNP变体，但它们也可以任意组合出现，并且可出现于任何转录变体，如图12所示的含有碱基的变体中。该图未显示其它转录变体，如v.2，v.6和v.8中与v.1不共有之区域的SNP。编号与98P4B6v.1中的相对应。黑色框显示出与98P4B6v.1相同的序列。黑框上方显示出SNP。图10(b)98P4B6v.7SNP变体的序列比对图解。变体98P4B6v.20至v.24是与v.7有单个核苷酸差异的变体。尽管分开显示这些SNP变体，但它们也可以任意组合出现，并且可出现于任何转录变体，如图12所示的含有碱基的变体中。该图未显示与v.1共有之区域中的SNP。编号与98P4B6v.7中的相对应。黑色框显示出与98P4B6v.7相同的序列。黑框上方显示出SNP。图10(c)98P4B6v.8SNP变体的序列比对图解。变体98P4B6v.25至v.38是与v.8有单个核苷酸差异的变体。尽管分开显示这些SNP变体，但它们也可以任意组合出现，并且可出现于任何转录变体，如图12所示的含有碱基的变体中。该图未显示与v.1共有之区域中的SNP。编号与98P4B6v.8中的相对应。黑色框显示出与98P4B6v.8相同的序列。黑框上方显示出SNP。图11.98P4B6蛋白质变体的序列比对图。蛋白质变体对应于核苷酸变体。核苷酸变体98P4B6v.3，v.4，v.9至v.12以及v.15至v.19编码与v.1相同的蛋白质。核苷酸变体98P4B6v.6和v.8编码相同的蛋白质，不同之处仅在于v.8第475位的单个氨基酸为“M”。变体v.25由v.8的SNP变体v.25翻译得到，在第565位有一个氨基酸差异。类似地，v.21与v.7的差异仅表现在第565位的一个氨基酸。黑框上方显示出单个氨基酸差异。黑框表示与98P4B6v.1相同的序列。黑框下方的编号对应于98P4B6v.1。图12.98P4B6转录变体的结构。变体98P4B6v.2至v.8是v.1的转录变体。变体v.2是单外显子转录物，其3’部分与v.1的最后一个外显子相同。v.3的前两个外显子位于v.1的内含子1中。变体v.4，v.5和v.6剪接出v.1第一个外显子中的224-334，v.5剪接出外显子5，而v.6剪接出外显子6，但延伸了v.1的外显子5。变体v.7使用另一个转录起点和不同的3’外显子。变体v.8延伸5’末端并保留v.1的完整内含子5。在人类基因组的最新装配上，v.1的前35个碱基不在附近的v.15’区域。黑框上方标出了转录物中外显子的末端。按照在人类基因组中的次序，显示出该基因可能的外显子。图中未显示出polyA尾和单个核苷酸差异。黑框下方“()”中的编号对应于98P4B6v.1。内含子和外显子的长度不成比例。图13.98P4B6蛋白质变体的二级结构和跨膜结构域预测。13(A)，13(B)，13(C)，13(D)，13(E)使用可从位于www.expasy.ch/tools.的ExPasy分子生物学服务器进入的、位于www.pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsaautomat.pi？page＝npsa_nn.html的HNN-HierarchicalNeuralNetwork法(Guermeur，1997)，预测98P4B6蛋白质变体1(SEQIDNO193)、变体2(SEQIDNO194)、变体5(SEQIDNO195)、变体6(SEQIDNO196)和变体7(SEQIDNO197)的二级结构。该方法可由一级蛋白质序列预测α螺旋、伸展链(Extendedstrand)和无规卷曲(randomcoil)的存在和位置。图中还列出了给定二级结构中的蛋白质百分比。13(F)，13(H)，13(J)，13(L)和13(N)基于利用TMBASE(K.Hofmann，W.Stoffe.TMBASE-跨膜蛋白质区段数据库，Biol.Chem.Hoppe-Seyler374166，1993)的Hofmann和Stoffel的TMpred算法，分别图解显示出98P4B6变体1，2，5-7存在跨膜区的可能性和方向。13(G)，13(I)，13(K)，13(M)和13(O)基于Sonnhammer，vonHeijne和Krogh的TMHMM算法(ErikL.L.Sonnhammer，GunnarvonHeijne，andAndersKroghAhiddenMarkovmodelforpredictingtransmembranehelicesinproteinsequences.InProc.ofSixthInt.Conf.onIntelligentSystemsforMolecularBiology，p175-182EdJ.Glasgow，T.Littlejohn，F.Major，R.Lathrop，D.Sankoff，andC.SensenMenloPark，CAAAAIPress，1998)，分别图解显示出98P4B6变体1，2，5-7存在跨膜区的可能性以及胞外和胞内方向。可从位于www.expasy.ch/tools/的ExPasy分子生物学服务器进入TMpred和TMHMM算法。图14.正常人和患者癌症组织中的98P4B6表达。由正常胃、正常脑、正常心脏、正常肝脏、正常骨骼肌、正常睾丸、正常前列腺、正常膀胱、正常肾脏、正常结肠、正常肺、正常胰腺以及前列腺癌患者、膀胱癌患者、肾癌患者、结肠癌患者、肺癌患者、胰腺癌患者的癌症样品库和2名转移至淋巴结的前列腺癌患者的癌症样品制备第一链cDNA。通过使用肌动蛋白引物的PCR进行归一化。使用针对98P4B6v.1，v.13和v.14(A)或特异于剪接变体98P4B6v.6和v.8(B)的引物，以26和30轮扩增循环进行半-定量PCR。在琼脂糖凝胶上电泳样品，使用Alphalmager软件定量PCR产物。结果显示出正常前列腺和前列腺癌样品中98P4B6v.1，v.13和v.14及其剪接变体v.6和v.8的强表达。与所有受试的正常组织相比，还在膀胱癌、肾癌、结肠癌、肺癌、胰腺癌、乳腺癌、癌转移以及转移至淋巴结的前列腺癌样品中检测到表达。图15.肺癌、卵巢癌、前列腺癌、膀胱癌、宫颈癌、子宫癌和胰腺癌患者癌症样品中的98P4B6表达。由一系列患者的癌症样品制备第一链cDNA。通过使用肌动蛋白引物的PCR进行归一化。使用针对98P4B6v.1，v.13和v.14的引物，以26和30轮扩增循环进行半-定量PCR。在琼脂糖凝胶上电泳样品，使用Alphalmager软件定量PCR产物。将表达记录为无、低、中等或强。结果表明在受试的所有患者癌症样品的大多数中皆有98P4B6表达。图16.胃癌患者样品中的98P4B6表达。(A)从正常胃(N)和10个不同的胃癌患者样品(T)中提取RNA。用98P4B6序列探测每个泳道10μg总RNA的Northern印迹。结果表明98P4B6在胃肿瘤组织中强表达，在正常胃中表达量较低。下方的实验组表示对显示RNA样品性质的印迹的溴化乙锭染色。(B)在RNA点印迹上检测一系列人胃癌(T)及其各自匹配的正常组织(N)中的98P4B6表达。在8个胃肿瘤中的7个中检测到98P4B6，但在匹配的正常组织中未检测到98P4B6。图17.用多克隆抗体检测98P4B6表达。用98P4B6.GFP.pcDNA3.1/mychis构建体克隆A12或克隆B12转染293T细胞。将STEAPl.GFP载体用作阳性对照。将空载体用作阴性对照。40小时后，收集细胞裂解液。在SDS-PAGE丙烯酰胺凝胶上电泳样品，印迹并用抗-GFP抗体(A)、针对氨基酸198-389产生的抗-98P4B6抗体(B)或针对氨基酸153-165产生的抗-98P4B6抗体进行染色。使用ECL化学发光试剂盒显色印迹并通过放射自显影观察结果。结果显示出所预期的经抗-GFP抗体检测到的98P4B6.GFP融合蛋白的表达。另外，我们还能产生2个不同的多克隆抗体，所述抗体能识别B和C所示的98P4B6.GFP融合蛋白。图18.用多克隆抗体检测98P4B6表达。用98P4B6.GFP.pcDNA3.1/mychis构建体克隆A12或克隆B12转染293T细胞。通过流式细胞术(A)和荧光显微术(B)检测98P4B6.GFP融合蛋白的表达。结果表明大多数细胞显示出强绿色荧光。融合蛋白定位于核周区域和细胞膜。图19.STEAP-2的特征。正常组织中的STEAP-2表达主要局限于前列腺。STEAP-2在几个癌组织中表达。STEAP-2在得自患者(inpatient-derived)的前列腺、结肠和肺癌样品中表达；并且在多种癌症细胞系，包括前列腺、结肠、Ewing肉瘤、肺、肾脏、胰腺和睾丸中表达。通过ISH，STEAP-2表达似乎主要局限于导管上皮细胞。图20.STEAP-2在PC3细胞中诱导酪氨酸磷酸化。STEAP-2诱导140-150，120，75-80，62和40kDa蛋白质的酪氨酸磷酸化。图21.STEAP-2在NIH3T3细胞中增强酪氨酸磷酸化。STEAP-2在NIH3T3细胞中增强p135-140，p78-75的磷酸化。STEAP-2C-Flag增强p180的磷酸化，并诱导p132，p82和p75的去磷酸化。图22.STEAP-2诱导ERK磷酸化。STEAP-2在处于0.5和10％FBS中的PC3和3T3细胞中诱导ERK磷酸化。3T3-STEAP-2-cflag细胞中缺乏ERK磷酸化。有可能用作显性失活对照。图23.STEAP增强PC3细胞中的钙流动。PC-STEAP-1和PC3-STEAP-2对LPA作出反应，表现出增强的钙流动。PC3-STEAP-1表现出对L型钙通道抑制剂蜗牛毒素的敏感性。PC3-STEAP-2显示出对PQ型钙通道抑制剂agatoxin的敏感性。NDGA和TEA对PC3-STEAP-2细胞的增殖没有影响。图24.STEAP-2改变紫杉醇(paclitaxel)对PC3细胞的作用。其它未在表达STEAP的细胞和对照细胞之间产生示差反应的受试化疗剂是氟他氨(flutamide)、金雀异黄素(Genistein)、雷怕霉素(Rapamycin)。STEAP-2赋予PC3细胞对紫杉醇的部分抗性。相对于PC3-Neo细胞而言，PC3-STEAP-2的存活百分比增加8倍以上。图25.通过STEAP-2抑制细胞凋亡。用紫杉醇处理PC3细胞60小时，并通过膜联蛋白V-PI染色分析细胞凋亡。STEAP-2的表达部分抑制了紫杉醇所致的细胞凋亡。图26.STEAP-2减缓紫杉醇介导的细胞凋亡。用紫杉醇处理PC3细胞68小时并分析细胞凋亡。STEAP-2而不是STEAP-2CFlag的表达部分抑制了紫杉醇所致的细胞凋亡。发明详述章节概述I.)定义II.)98P4B6多核苷酸II.A.)98P4B6多核苷酸的用途II.A.1)监测基因异常II.A.2)反义实施方案II.A.3.)引物和引物对II.A.4.)分离编码98P4B6的核酸分子II.A.5.)重组核酸分子和宿主-载体系统III.)98P4B6-相关蛋白质III.A.)携有基元的蛋白质的实施方案III.B.)98P4B6-相关蛋白质的表达III.C.)98P4B6-相关蛋白质的修饰III.D.)98P4B6-相关蛋白质的用途IV.)98P4B6抗体V.)98P4B6细胞免疫反应VI.)98P4B6转基因动物VII.)检测98P4B6的方法VIII.)监测98P4B6-相关基因及其产物之状态的方法IX.)鉴定与98P4B6相互作用的分子X.)治疗方法和组合物X.A.)抗癌疫苗X.B.)98P4B6用作基于抗体之疗法的靶标X.C.)98P4B6用作细胞免疫反应的靶标X.C.1.小基因疫苗X.C.2.CTL肽与辅助肽的组合X.C.3.CTL肽与T细胞引发剂的组合X.C4.含有用CTL和/或HTL肽脉冲的DC的疫苗组合物X.D.)过继免疫疗法X.E.)为了治疗或预防的目的施用疫苗X.I.)98P4B6的诊断和预测实施方案XII.)抑制98P4B6蛋白质的功能XII.A.)用胞内抗体抑制98P4B6XII.B.)用重组蛋白质抑制98P4B6XII.C.)抑制98P4B6转录或翻译XII.D.)有关治疗策略的一般性考虑XIII.)98P4B6调制剂的鉴定、表征和应用XIV.)制备所需的试剂盒/材料I.)定义除非另有说明，本文所用的所有技术术语、注释和其它科学术语或专用名词与本发明所属
技术领域：
的技术人员所一般理解的意思相同。在有些情况下，为了清楚说明和/或易于引用，本文定义了具有公知含义的术语，本文所述定义的内容与本领域一般理解的意思没有什么本质的不同。本文所描述或引用的很多技术和方法是易于理解的，本领域技术人员使用常规的方法学，例如Sambrooketal.，MolecularCloningALaboratoryManual2nd.edition(1989)ColdSpringHarborLaboratoryPress，ColdSpringHarbor，N.Y.中所述的被广泛使用的分子克隆方法学，可以一般性地使用这些技术和方法。除非另有说明，适当时可根据厂商定义的方法和/或参数，一般性地进行包括使用商购试剂盒和试剂的方法。术语“晚期前列腺癌”、“局部晚期前列腺癌”、“晚期疾病”和“局部晚期疾病”指的是已经由前列腺囊扩散的前列腺癌，包括美国泌尿协会(AUA)系统下的C期疾病、Whitmore-Jewett系统下的C1-C2期疾病和TNM(肿瘤、淋巴结、转移)系统下的T3-T4和N+期疾病。一般说来，不推荐给局部晚期疾病患者进行外科手术，与患有临床上定位(局限于器官)的前列腺癌的患者相比，这些患者的结果要差很多。在临床上，局部晚期疾病的特点是在前列腺外侧边缘上方可触及硬物，或者前列腺基底上方不对称或有硬物存在。目前，如果肿瘤侵入或渗入前列腺囊，扩散至手术边缘或侵入精囊，可在根治性前列腺切除术之后对局部晚期前列腺癌进行病理学诊断。本文中的“改变天然糖基化模式”指的是(通过除去构成糖基化之基础的糖基化位点或经化学和/或酶学方法消除糖基化)缺失天然98P4B6序列中存在的一个或多个糖组成成分，和/或添加一个或多个天然98P4B6序列中原本不存在的糖基化位点。另外，该术语包括天然蛋白质糖基化性质上的变化，包括所存在的不同糖组成成分性质和比例的变化。术语“类似物”指的是与另一种分子结构类似或具有类似或相应特征的分子(如98P4B6-相关蛋白质)。例如，98P4B6蛋白的类似物可以被特异性结合98P4B6的抗体或T细胞特异性结合。术语“抗体”的含义是最宽泛的。因此，“抗体”可以是天然的或人工制备的，例如通过常规杂交瘤技术产生的单克隆抗体。抗-98P4B6抗体包括单克隆和多克隆抗体以及含有这些抗体的抗原-结合结构域和/或一个或多个互补决定区的片段。“抗体片段”被定义为能与其靶标结合的至少部分免疫球蛋白分子可变区，即抗原-结合区。在一个实施方案中，它特别地覆盖单个抗-98P4B6抗体及其克隆(包括激动剂、拮抗剂和中和抗体)和具有多表位特异性的抗-98P4B6抗体组合物。术语“密码子最优化的序列”指的是通过替换任何使用频率低于约20％的密码子，针对特定宿主物种而最优化的核苷酸序列。本文将除了密码子最优化以外，通过消除错误的聚腺苷酸化序列，消除外显子/内含子剪接信号，消除转座子-样重复序列和/或最优化GC含量而被最优化以在给定宿主物种中表达的核苷酸序列称为“表达增强的序列”。“组合文库”是通过混合多种化合物“构件”(如试剂)进行化学合成或生物合成而产生的多种化合物的集合。例如，线性组合化合物文库，如多肽(如突变蛋白)文库是通过以每一种可能的方式混合一套被称为化合物构件的具有给定化合物长度(即多肽化合物中的氨基酸数目)的氨基酸而形成的。通过组合混合化合物构件即可合成多种化合物(Gallopetal.，J.Med.Chem.37(9)1233-1251(1994))。组合文库的制备和筛选是本领域技术人员众所周知的技术。所述组合化合物文库包括但不限于肽文库(参见例如美国专利5,010,175，Furka，Pept.Prot.Res.37487-493(1991)，Houghtonetal.，Nature，35484-88(1991))，peptoid(PCT公开号WO91/19735)，编码肽(PCT公开号WO93/20242)，随机生物-寡聚体(PCT公开号WO92/00091)，苯并二氮杂卓(美国专利5,288,514)，diversomer，如乙内酰脲、苯并二氮杂卓和二肽(Hobbsetal.，Proc.Nat.Acad.Sci.USA906909-6913(1993))，插烯多肽(Hagiharaetal.，J.Amer.Chem.Soc.1146568(1992))，具有β-D-葡萄糖支架的非肽类肽模拟物(Hirschmannetal.，J.Amer.Chem.Soc.1149217-9218(1992))，小化合物文库的类似有机合成(Chenetal.，J.Amer.Chem.Soc.1162661(1994))，寡氨基甲酸酯(Cho，etal.，Science2611303(1993))，和/或肽基膦酸酯(Campbelletal.，J.Org.Chem.59658(1994))。一般可参见Gordonetal.，J.Med.Chem.371385(1994)，核酸文库(参见例如Stratagene，Corp.)，肽核酸文库(参见例如美国专利5,539,083)，抗体文库(参见例如Vaughnetal.，NatureBiotechnology14(3)309-314(1996)和PCT/US96/10287)，糖类文库(参见例如Liangetal.，Science2741520-1522(1996)和美国专利5,593,853)，以及小有机分子文库(参见例如苯并二氮杂卓，Baum，C&EN，Jan18，page33(1993)；类异戊二烯，美国专利5,569,588；噻唑烷二酮(thiazolidinone)和间噻唑烷酮(metathiazanone)，美国专利5,549,974；吡咯烷，美国专利5,525,735和5,519,134；吗啉代化合物，美国专利5,506,337；苯并二氮杂卓，美国专利5,288,514等)。制备组合文库的仪器可以商购(参见例如357NIPS，390NIPS，AdvancedChemTech，LouisvilleKY；Symphony，Rainin，Woburn，MA；433A，AppliedBiosystems，FosterCity，CA；9050，Plus，Millipore，Bedford，NIA)。已开发出多种众所周知的机器人系统用于溶液相化学。这些系统包括自动化工作站，如由TakedaChemicalIndustries，LTD.(Osaka，Japan)开发的自动化合成仪，以及多种利用机器手的机器人系统(ZymateH，ZymarkCorporation，Hopkinton，Mass.；Orca，Hewlett-Packard，PaloAlto，Calif.)，所述机器人系统能模拟化学家进行的人工合成操作。上述任一种仪器都适用于本发明。(必要时)对这些仪器进行改装以使它们能按本文所述的方式操作，这一点对相关领域的熟练技术人员而言是显而易见的。另外，多种组合文库本身也是可以商购的(参见例如ComGenex，Princeton，NJ；Asinex，Moscow，RU；Tripos，Inc.，St.Louis，MO；ChemStar，Ltd，Moscow，RU；3DPharmaceuticals，Exton，PA；MartekBiosciences，Columbia，MD等)。术语“细胞毒性剂”指的是能抑制或防止细胞表达活性、细胞功能和/或导致细胞被破坏的物质。该术语欲包括放射性同位素、化学治疗剂和毒素，如小分子毒素或细菌、真菌、植物或动物来源的有酶促活性的毒素，包括其片段和/或变体。细胞毒性剂的例子包括但不限于auristatin、金霉素、美登木素生物碱、钇、铋、蓖麻毒蛋白、蓖麻毒蛋白A-链、combrestatin、倍癌霉素、dolostatin、多柔比星、柔红霉素、紫杉醇、顺式铂氨、cc1065、溴化乙锭、丝裂霉素、表鬼臼毒素吡喃葡糖苷、tenoposide、长春新碱、长春碱、秋水仙素、二羟基炭疽菌素二酮、放线菌素、白喉毒素、假单胞菌外毒素(PE)A、PE40、相思豆毒蛋白、相思豆毒蛋白A链、modeccinA链、α-帚曲菌素、gelonin、mitogellin、retstrictocin、酚毒素、依诺霉素、curicin、巴豆毒素、加利车霉素、Sapaonariaoffcinalis抑制剂、糖皮质激素、其它化学治疗剂以及放射性同位素，如、、、、、、、、和放射性同位素，包括。抗体也可与抗-癌前药激活酶偶联，所述酶能将前药转变为其活性形式。“基因产物”在本文中有时被称作蛋白质或mRNA。例如，“本发明的基因产物”在本文中有时被称为“癌症氨基酸序列”、“癌症蛋白质”、“表I所列癌症的蛋白质”、“癌症mRNA”、“表I所列癌症的mRNA”等。在一个实施方案中，癌症蛋白质由图2的核酸编码。癌症蛋白质可以是片段，或者是图2的核酸所编码片段的全长蛋白质。在一个实施方案中，使用癌症氨基酸序列测定序列同一性或相似性。在另一个实施方案中，序列是图2的核酸所编码蛋白质的天然等位基因变体。在另一个实施方案中，序列是本文详细描述的序列变体。测定特定核酸或蛋白质产物的存在、缺乏、含量或其它特性的“高通量筛选”试验是本领域技术人员众所周知的。类似地，结合试验和报道基因测定法也是众所周知的。因此，例如，美国专利5,559,410公开了蛋白质的高通量筛选法；美国专利5,585,639公开了核酸结合的高通量筛选法(即阵列)；而美国专利5,576,220和5,541,061公开了高通量筛选配体/抗体结合的方法。另外，高通量筛选系统可以商购(参见例如AmershamBiosciences，Piscataway，NJ；ZymarkCorp.，Hopkinton，MA；AirTechnicalIndustries，Mentor，OH；BeckmanInstruments，Inc.Fullerton，CA；PrecisionSystems，Inc.，Natick，MA等)。这些系统的整个操作流程一般是自动进行的，包括所有样品和试剂的移取、分液、定时保温和最终对适用于测定法的检测仪中的微量培养板进行读数。这些成型的系统提供了高流通量和快速起动以及高水平的灵活性和可定制性。这些系统的制造商提供了针对多种高通量系统的详细操作方法。因此，例如，Zymark公司提供了技术公报，其中描述了用于检测基因转录调制、配体结合等的筛选系统。术语“同系物”指的是与另一种分子有同源性的分子，例如，在相应位置具有相同或相似化合物残基序列的分子。“人白细胞抗原”或“HLA”是人I类或II类主要组织相容性复合物(MHC)蛋白(参见例如Stites，etal.，IMMUNOLOGY，8THED.，LangePublishing，LosAltos，CA(1994))。有关多核苷酸的上下文中使用的术语“杂交”指的是常规的杂交条件，优选例如在50％甲酰胺/6×SSC/0.1％SDS/100μg/mlssDNA中的杂交，其中杂交温度高于37℃，在0.1×SSC/0.1％SDS中的洗涤温度高于55℃。术语“分离的”或“生物纯的”指的是基本上或实质上不含通常与天然状态的物质相伴存在的组分的物质。因此，本发明的分离的肽优选不含通常与处于原位环境中的肽相关的物质。例如，当一种多核苷酸基本上与污染的多核苷酸分离开时，即可将其称为“分离的”，所述污染的多核苷酸对应于除98P4B6基因以外的基因或与之互补，或者编码除98P4B6基因产物或其片段以外的多肽。本领域技术人员能容易地使用核酸分离方法来获得分离的98P4B6多核苷酸。当利用物理、机械或化学方法，从通常与98P4B6蛋白相关的细胞组分中提取出98P4B6蛋白时，即可认为该蛋白质是“分离的”。本领域技术人员能容易地利用标准的纯化方法来获得分离的98P4B6蛋白。或者，可通过化学方法制备分离的蛋白质。术语“哺乳动物”指的是被归为哺乳动物的任何生物，包括小鼠、大鼠、兔、狗、猫、奶牛、马和人。在本发明的一个实施方案中，哺乳动物是小鼠。在本发明的另一个实施方案中，哺乳动物是人。术语“转移的前列腺癌”和“转移疾病”指的是已扩散至局部淋巴结或远端位点的前列腺癌，欲包括AUA系统下的D期疾病和TNM系统下的TxNxM+期疾病。与局部晚期前列腺癌的情况相同，一般不给转移疾病的患者进行外科手术，激素(雄激素脱离)疗法是优选的治疗形式。已转移的前列腺癌患者在治疗开始后的12至18个月内，最终发展成为对雄激素不起反应的状态。在发展成为此状态后的6个月内，约有半数对雄激素没反应的患者死亡。前列腺癌转移的最常见位点是骨。前列腺癌的骨转移经常是成骨细胞而不是骨质溶解(即导致网状骨形成)。骨转移最常见于脊柱，其次是股骨、骨盆、肋支袈、头骨和肱骨。其它常见的转移位点包括淋巴结、肺、肝脏和脑。一般通过开口或腹腔镜检查下的盆腔淋巴结切除术、全身放射性核素扫描、骨骼X射线照像术和/或骨损害活检来诊断转移的前列腺癌。本文所用术语“调制剂”或“受试化合物”或“候选药物”或语义等同的术语描述的是任何欲测定其直接或间接改变癌症表型或癌症序列(如核酸或蛋白质序列)的表达，或癌症序列的作用(如信号转导、基因表达、蛋白质相互作用等)的能力的分子，例如蛋白质、寡肽、小有机分子、多糖、多核苷酸等。一方面，调制剂可中和本发明癌症蛋白质的作用。“中和”指的是蛋白质活性受到抑制或阻断，以及随后对细胞的作用。另一方面，调制剂通过中和所述蛋白质的水平可中和本发明的基因及其相应蛋白质的作用。在优选实施方案中，调制剂改变本文所提供核酸或蛋白质的表达分布图或下游的效应物途径。在一个实施方案中，调制剂抑制癌症表型，例如使之成为正常组织指纹。在另一个实施方案中，调制剂诱导癌症表型。一般说来，平行电泳多种具有不同试剂浓度的受试混合物，从而获得针对不同浓度的差异反应。一般将其中一个浓度用作阴性对照，即作为零浓度或低于检测水平。调制剂、候选药物或受试化合物包含多个化合物类别，但一般为有机分子，优选为分子量大于100至小于约2,500道尔顿的小的有机化合物。优选的小分子小于2000，或小于1500或小于1000或小于500道尔顿。候选药物含有与蛋白质进行结构上的相互作用，特别是氢键所必需的官能团，一般至少包括胺、羰基、羟基或羧基，优选含有至少两个化学官能团。候选药物经常含有被一个或多个上述官能团取代的碳环或杂环结构和/或芳族或聚芳族结构。调制剂还含有生物分子，例如肽、糖类、脂肪酸、类固醇、嘌呤、嘧啶、衍生物、结构类似物及其组合。特别优选的是肽。一类调制剂是肽，例如约5至约35个氨基酸的肽，优选约5至约20个氨基酸的肽，特别优选约7至约15个氨基酸的肽。优选癌症调制蛋白是可溶性的，包括非-跨膜区，和/或具有N-末端Cys以有助于溶解性。在一个实施方案中，片段的C-末端保持为游离的酸，而N-末端是游离的胺以有助于与半胱氨酸偶联。在一个实施方案中，本发明的癌症蛋白质与本文所述的免疫原性的药物偶联。在一个实施方案中，癌症蛋白质与BSA偶联。本发明的肽，例如具有优选长度的肽可以互相连接或与其它氨基酸连接以产生较长的肽/蛋白质。调制肽可以是上文所述天然蛋白质的消化物、随机肽或“偏性”随机肽。在优选实施方案中，基于肽/蛋白质的调制剂是本文所定义的抗体或其片段。癌症调制剂也可以是核酸。核酸调制剂可以是天然核酸、随机核酸、或“偏性”随机核酸。例如，可以在与上文所述针对蛋白质的方法相类似的方法中使用原核或真核基因组的消化物。术语“单克隆抗体”指的是由一群基本上均一的抗体获得的抗体，即除了可能存在极少量的天然突变外，含有抗体群的抗体是相同的。在98P4B6-相关蛋白质的生物基元中提及的“基元”指的是形成蛋白质部分一级序列的任何氨基酸模式，它与特定的功能(例如蛋白质-蛋白质相互作用，蛋白质-DNA相互作用等)或修饰(例如磷酸化、糖基化或酰胺化)，或定位(例如分泌序列，核定位序列等)相关，或者是与体液或细胞免疫原性相关联的序列。基元可以是邻接的或能排列至一般与某些功能或特性相关的某些位置处。在HLA基元的上下文中，“基元”指的是能被特定HLA分子识别的限定长度的肽中的残基模式，通常对I类HLA基元而言，所述肽的长度为约8至约13个氨基酸，对II类HLA基元而言，所述肽的长度为约6至约25个氨基酸。对于由每个人HLA等位基因编码的每个蛋白质而言，与HLA结合的肽基元一般是不同的，不同之处在于一级和二级锚残基的模式。“药物赋形剂”包括如下所述的物质佐剂、载体、pH-调制剂和缓冲剂、滋补调制剂、润湿剂、防腐剂等。“药物可接受”指的是无毒、惰性和/或与人或其它哺乳动物生理上相容的组合物。术语“多核苷酸”指的是长度至少为10个碱基或碱基对的核苷酸聚合物形式，它可以是核糖核苷酸或脱氧核苷酸或任一种核苷酸的修饰形式，它包括单链和双链形式的DNA和/或RNA。在本领域中，该术语经常与“寡核苷酸”互换使用。多核苷酸可含有本文所述的核苷酸序列，其中图2所示的胸苷(T)也可以是尿嘧啶(U)；该定义与DNA和RNA化学结构之间的差异相关，与RNA中4个主要碱基之一是尿嘧啶(U)而不是胸苷(T)这一观察结果特别相关。术语“多肽”指的是至少约为4，5，6，7或8个氨基酸的聚合物。在整个说明书中，使用了标准的三字母或单字母氨基酸名称。在本领域中，该术语经常与“肽”或“蛋白质”互换使用。HLA“一级锚残基”是肽序列特定位置处的氨基酸，它可提供免疫原性肽与HLA分子之间的接触点。一般将限定长度的肽内部的1至3个，通常为2个一级锚残基定义为免疫原性肽的“基元”。据认为这些残基适合与HLA分子的肽结合沟密切接触，其侧链掩埋于结合沟的特殊袋中。例如，在一个实施方案中，针对I类HLA分子的一级锚残基位于本发明的8，9，10，11或12残基肽表位的第2位(自氨基末端位置起)和羧基末端的位置。或者，在另一个实施方案中，与II类HLA分子结合的肽一级锚残基彼此间隔，而不是位于肽的末端，其中肽的长度一般至少为9个氨基酸。表IV中列出了每个基元和超基元的一级锚位置。例如，通过改变表IV所示一级和/或二级锚位置中的特定残基的存在或缺乏，即可产生类似肽。可以使用所述类似肽来调制含有特定HLA基元或超基元的肽的结合亲和性和/或群体覆盖范围。“放射性同位素”包括但不限于下述例子(同时列出了非限制性用途的例子)医用同位素举例同位素用途描述锕-225()参见钍-229()锕-227()镭-223()之父代，为α辐射源，可用于治疗由癌症(即乳腺癌和前列腺癌)导致的骨架转移和癌症放射免疫疗法铋-212()参见钍-228()铋-213()参见钍-229()镉-109()癌症检测钴-60()癌症放射疗法、食品辐射器和消毒医用品的放射源铜-64()用于癌症疗法和SPECT显象的阳离子发射体铜-67()用于癌症放射免疫疗法和诊断研究(即乳腺癌、结肠癌和淋巴瘤)的β/γ发射体镝-166()癌症放射免疫疗法铒-169()治疗类风湿性关节炎，特别是与手指和脚趾相关的小关节铕-152()食品辐射和消毒医用品的放射源铕-154()食品辐射和消毒医用品的放射源钆-153()骨质疏松检测和核医学质量保证装置金-198()卵巢癌、前列腺癌和脑癌的植入和腔内疗法钬-166()靶向骨骼疗法中的多发性骨髓瘤疗法，癌症放射免疫疗法，骨髓剥离和类风湿性关节炎疗法碘-125()骨质疏松检测，诊断显象，示踪药物，脑癌治疗，放射性标记，肿瘤显象，脑受体作图，间质放射疗法，治疗前列腺癌的近距离放射疗法，测定肾小球滤过率(GFR)，测定血浆体积，测定腿部深静脉血栓形成碘-131()甲状腺功能评价，甲状腺疾病检测，治疗甲状腺癌以及其它非-恶性甲状腺疾病(即格雷夫斯病、甲状腺肿和甲状腺功能亢进)，使用放射免疫疗法治疗白血病、淋巴瘤和其它形式的癌症(例如乳腺癌)铱-192()近距离放射疗法，治疗脑和脊髓瘤，治疗阻滞动脉(即动脉硬化和再狭窄)，以及乳腺癌和前列腺癌的植入镥-177()癌症放射免疫疗法和治疗阻滞动脉(即动脉硬化和再狭窄)钼-99()锝-99m()之父代，可用于显象脑、肝脏、肺、心脏和其它器官。目前，是应用最广泛的放射性同位素，它可用于多种与脑、心脏、肝脏、肺有关的癌症和疾病的诊断显象；也可用于检测腿部的深静脉血栓形成锇-194()癌症放射免疫疗法钯-103()治疗前列腺癌铂-195m()研究化学治疗药物顺式铂氨的生物分布和代谢磷-32()治疗真性红细胞增多症(血细胞疾病)和白血病，诊断/治疗骨癌；治疗结肠、前列腺和肝癌；放射性标记体外研究用的核酸，诊断表面肿瘤，治疗阻滞动脉(即动脉硬化和再狭窄)，以及腔内疗法磷-33()治疗白血病，诊断/治疗骨疾病，放射性标记，以及治疗阻滞动脉(即动脉硬化和再狭窄)镭-223()参见锕-227()铼-186()减轻骨癌疼痛，治疗类风湿性关节炎，诊断淋巴瘤和骨癌、乳腺癌、结肠癌和肝癌并使用放射免疫疗法对其进行治疗铼-188()诊断癌症并使用放射免疫疗法治疗癌症，减轻骨癌疼痛，治疗类风湿性关节炎，和治疗前列腺癌铑-105()癌症放射免疫疗法钐-145()治疗眼癌钐-153()癌症放射免疫疗法和减轻骨癌疼痛钪-47()癌症放射免疫疗法和减轻骨癌疼痛硒-75()用于脑研究的放射性示踪元素，通过γ-闪烁扫描术显象肾上腺皮质，侧定位分泌类固醇的肿瘤，前列腺扫描，检测甲状旁腺功能亢进，测定内源库中胆汁酸损失的速率锶-85()骨癌检测和脑扫描锶-89()减轻骨癌疼痛，治疗多发性骨髓瘤和成骨细胞疗法锝-99m()参见钼-99()钍-228()铋-212()之父代，是用于癌症放射免疫疗法的α发射体钍-229()锕-225()之父代，铋-213()之祖代，是用于癌症放射免疫疗法的α发射体铥-170()血液辐射器的γ源，植入医用装置的能量源锡-117m()癌症免疫疗法和减轻骨癌疼痛钨-188()铼-188()之父代，用于癌症诊断/治疗，减轻骨癌疼痛，治疗类风湿性关节炎和治疗阻滞动脉(即动脉硬化和再狭窄)氙-127()脑病的神经显象，高分辨率的SPECT研究，肺功能检测和脑血流研究镱-175()癌症放射免疫疗法钇-90()得自辐射中的钇-89()的微种，用于治疗肝癌钇-91()钇-90()的γ-发射标记，可用于癌症放射免疫疗法(即淋巴瘤、乳腺癌、结肠癌、肾癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌、胰腺癌和不能手术的肝癌)本文提及核酸和蛋白质时所用的“随机化”或语义等同的词指的是每种核酸和蛋白质分别由实质上随机的核苷酸和氨基酸组成。这些随机的肽(或本文所述的核酸)可在任何位置掺入任何核苷酸或氨基酸。可以设计合成方法以产生随机化的蛋白质或核酸，从而在序列长度上形成所有或大多数可能的组合，进而形成随机化的候选生物活性蛋白质剂文库。在一个实施方案中，文库是“完全随机化的”，在任何位置处都没有序列偏好或不变的序列。在另一个实施方案中，文库是“偏性随机”文库。即，序列内的一些位置保持不变，或只有有限数目的可能性。例如，核苷酸或氨基酸残基只在有限的类别，例如疏水氨基酸、亲水残基、有空间偏性(小或大)的残基中随机化，用于产生核酸结合结构域，产生交联用的半胱氨酸，SH-3结构域所用的脯氨酸，磷酸化位点所用的丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸或组氨酸等，或者对嘌呤有偏好等。“重组”DNA或RNA分子是已经在体外进行过分子操作的DNA或RNA分子。小分子的非限制性例子包括与98P4B6结合或相互作用的化合物，包括激素、神经肽、趋化因子、添味剂、磷脂在内的配体及其能结合优选能抑制98P4B6蛋白质功能的功能等同物。所述非限制性小分子的分子量优选小于约10kDa，更优选小于约9，约8，约7，约6，约5或约4kDa。在某些实施方案中，小分子与98P4B6蛋白在生理上相关或与之结合；天然代谢途径中不存在所述小分子；和/或相对于非水溶液而言，所述小分子更容易溶于水溶液。本领域技术人员易于测定杂交条件的“严紧度”，一般根据探针长度、洗涤温度和盐浓度凭经验计算严紧度。一般说来，较长的探针需要较高的温度维持适当退火，而较短的探针需要较低的温度。当低于其解链温度的环境中存在互补链时，杂交一般取决于变性核酸序列重新退火的能力。探针和可杂交序列之间所需的同源性越高，可使用的相对温度越高。结果，较高的相对温度倾向于使反应条件更加严紧，而较低的温度会使反应条件较不严紧。有关杂交反应严紧度的其它细节和解释，可参见Ausubeletal.，CurrentProtocolsinMolecularBiology，WileyIntersciencePublishers，(1995)。本文所定义的“严紧条件”或“高严紧条件”的特征如下，但并不局限于此(1)利用低离子强度和高温洗涤，例如0.015M氯化钠/0.0015M柠檬酸钠/0.1％十二烷基硫酸钠，50℃；(2)在杂交过程中使用变性剂，如甲酰胺，例如含0.1％牛血清白蛋白的50％(v/v)甲酰胺/0.1％Ficoll/0.1％聚乙烯吡咯烷酮/含750mM氯化钠，75mM柠檬酸钠的50mM磷酸钠缓冲液，pH6.5，42℃；或(3)利用50％甲酰胺、5×SSC(0.75M，0.075M柠檬酸钠)、50mM磷酸钠(pH6.8)、0.1％焦磷酸钠、5×Denhardt溶液、经超声处理的鲑精DNA(50μg/ml)、0.1％SDS和10％葡聚糖硫酸酯，42℃，洗涤时用0.2×SSC(氯化钠/柠檬酸钠)，42℃和50％甲酰胺，55℃，接着于55℃在含有EDTA的0.1×SSC中进行高-严紧度的洗涤。“中度严紧条件”描述于，但不限于Sambrooketal.，MolecularCloningALaboratoryManual，NewYorkColdSpringHarborPress，1989，包括使用严紧度比上述条件低的洗涤溶液和杂交条件(例如温度、离子强度和％SDS)。中度严紧条件的例子是在含有20％甲酰胺、5×SSC(150mM，15mM柠檬酸三钠)、50mM磷酸钠(pH7.6)、5×Denhardt溶液、10％葡聚糖硫酸酯和20mg/ml经变性剪切的鲑精DNA的溶液中37℃保温过夜，接着于约37-50℃，用1×SSC洗涤滤膜。必要时本领域技术人员懂得如何调整温度、离子强度等以顺应诸如探针长度等的因素。HLA“超基元”是由两个或多个HLA等位基因所编码的HLA分子共有的肽结合特异性。表IV(F)列出了不同人群中HLA-超级类型的整体表型频率。多个超级类型的非限制性组分如下A2A*0201，A*0202，A*0203，A*0204，A*0205，A*0206，A*6802，A*6901.A*0207A3A3，A11，A31，A*3301，A*6801，A*0301，A*1101，A*3101B7B7，B*3501-03，B*51，B*5301，B*5401，B*5501，B*5502，B*5601，B*6701，B*7801，B*0702，B*5101，B*5602B44B*3701，B*4402，B*4403，B*60(B*4001)，B61(B*4006)A1A*0102，A*2604，A*3601，A*4301，A*8001A24A*24，A*30，A*2403，A*2404，A*3002，A*3003B27B*1401-02，B*1503，B*1509，B*1510，B*1518，B*3801-02，B*3901，B*3902，B*3903-04，B*4801-02，B*7301，B*2701-08B58B*1516，B*1517，B*5701，B*5702，B58B62B*4601，B52，B*1501(B62)，B*1502(B75)，B*1513(B77)表IV(G)列出了不同HLA-超级类型组合提供的经计算的群体覆盖范围。本文所用的“治疗”一词和语义相关的术语指的是对任何疾病后果的任何改善，例如存活期延长、发病率降低，和/或减轻与所选择的治疗形式相伴随的副作用；不需要完全根除疾病。“转基因动物”(例如小鼠或大鼠)是细胞中含有转基因的动物，所述转基因被导入动物或出生前(例如胚胎阶段)动物的祖先。“转基因”是整合至细胞基因组中的DNA，由所述细胞发育成转基因动物。本文所用的HLA或细胞免疫反应“疫苗”是含有或编码本发明的一种或多种肽的组合物。所述疫苗有多个实施方案，例如一种或多种单个肽的混合物；由多表位肽所包含的一种或多种肽；或编码所述单个肽或多肽的核酸，例如编码多表位肽的小基因。“一种或多种肽”包括从1至150种或更多种的任何整数种肽，例如至少为2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35，36，37，38，39，40，41，42，43，44，45，46，47，48，49，50，55，60，65，70，75，80，85，90，95，100，105，110，115，120，125，130，135，140，145或150种或更多种本发明的肽。任选通过脂化、添加靶向或其它序列来修饰肽或多肽。本发明的I类HLA肽可与II类HLA肽混合或连接，以便于活化细胞毒T淋巴细胞和辅助性T淋巴细胞。HLA疫苗也可含有肽-脉冲的抗原呈递细胞，例如树状细胞。术语“变体”指的是与所述类型或规范有差异的分子，例如在具体描述的蛋白质(如图2或图3所示的98P4B6蛋白)的相应位置有一个或多个不同氨基酸残基的蛋白质。类似物是一例变体蛋白质。剪接同种型和单核苷酸多态性(SNP)是另一例变体。本发明的“98P4B6-相关蛋白质”包括本文具体鉴定的那些蛋白质以及等位基因变体、保守取代变体、类似物和同系物，根据本文概述的方法或本领域中易于获得的方法，无需进行过度的实验即可分离/产生和鉴定出它们。还包括不同98P4B6蛋白的部分或其片段组合而成的融合蛋白，以及98P4B6蛋白和异源多肽的融合蛋白。将所述98P4B6蛋白通称为98P4B6-相关蛋白质，本发明的蛋白质或98P4B6。术语“98P4B6-相关蛋白质”指的是4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25或25个氨基酸以上；或至少为30，35，40，45，50，55，60，65，70，80，85，90，95，100，105，110，115，120，125，130，135，140，145，150，155，160，165，170，175，180，185，190，195，200，225，250，275，300，325，350，375，400，425，450，475，500，525，550，575或576或更多个氨基酸的多肽片段或98P4B6蛋白质序列。II.)98P4B6多核苷酸一方面，本发明提供了与全部或部分98P4B6基因、mRNA和/或编码序列(优选它们为分离形式)相对应或互补的多核苷酸，包括编码98P4B6-相关蛋白质及其片段的多核苷酸，DNA，RNA，DNA/RNA杂合体和相关分子，与98P4B6基因或mRNA序列或其部分互补的多核苷酸或寡核苷酸，以及能与98P4B6基因，mRNA或编码98P4B6的多核苷酸杂交的多核苷酸或寡核苷酸(通称为“98P4B6多核苷酸”)。在本节中提到的所有情况下，图2中的T也可以是U。98P4B6多核苷酸的实施方案包括具有图2所示序列的98P4B6多核苷酸，具有图2所示的98P4B6核苷酸序列，其中T是U的98P4B6多核苷酸；具有图2所示多核苷酸序列的至少10个邻接核苷酸的98P4B6多核苷酸；或具有图2所示多核苷酸序列的至少10个邻接核苷酸，其中T是U的98P4B6多核苷酸。例如，98P4B6核苷酸的实施方案包括但不限于(I)含有图2所示序列，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(II)含有图2A所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(III)含有图2B所示核苷酸残基第4位至核苷酸残基第138位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(IV)含有图2C所示核苷酸残基第188位至核苷酸残基第1552位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(V)含有图2D所示核苷酸残基第318位至核苷酸残基第1682位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(VI)含有图2E所示核苷酸残基第318位至核苷酸残基第1577位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(VII)含有图2F所示核苷酸残基第318位至核苷酸残基第1790位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(VIII)含有图2G所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(IX)含有图2H所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(X)含有图2I所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XI)含有图2J所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XII)含有图2K所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XIII)含有图2L所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XIV)含有图2M所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XV)含有图2N所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XVI)含有图20所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XVII)含有图2P所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XVIII)含有图2Q所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XIX)含有图2R所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XX)含有图2S所示核苷酸残基第355位至核苷酸残基第1719位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXI)含有图2T所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXII)含有图2U所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXIII)含有图2V所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXIV)含有图2W所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXV)含有图2X所示核苷酸残基第295位至核苷酸残基第2025位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXVI)含有图2Y所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXVII)含有图2Z所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXVIII)含有图2AA所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXIX)含有图2AB所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXX)含有图2AC所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXI)含有图2AD所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXII)含有图2AE所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXIII)含有图2AF所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXIV)含有图2AG所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXV)含有图2AH所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXVI)含有图2AI所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXVII)含有图2AJ所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXVIII)含有图2AK所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XXXIX)含有图2AL所示核苷酸残基第394位至核苷酸残基第1866位的序列，包括终止密码子，实质上由其组成或由其组成的多核苷酸，其中T也可以是U；(XL)编码与图2A-AL所示的完整氨基酸序列至少90，91，92，93，94，95，96，97，98，99或100％同源的98P4B6-相关蛋白质的多核苷酸；(XLI)编码与图2A-AL所示的完整氨基酸序列至少90，91，92，93，94，95，96，97，98，99或100％相同的98P4B6-相关蛋白质的多核苷酸；(XLII)编码表VIII-XXI和XXII-XLIX中所示的至少一种肽的多核苷酸；(XLIII)编码图3A，3G和3H所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至454个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XLIV)编码图3A，3G和3H所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至454个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(XLV)编码图3A，3G和3H所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至454个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XLVI)编码图3A，3G和3H所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至454个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XLVII)编码图3A，3G和3H所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至454个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XLVIII)编码图3B所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至45个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XLIX)编码图3B所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至45个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(L)编码图3B所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至45个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LI)编码图3B所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至45个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LII)编码图3B所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至45个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LIII)编码图3C所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至419个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LIV)编码图3C所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至419个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(LV)编码图3C所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至419个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LVI)编码图3C所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至419个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LVII)编码图3C所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至419个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LVIII)编码图3D，3F和3J所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至490个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LIX)编码图3D，3F和3J所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至490个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(LX)编码图3D，3F和3J所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至490个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXI)编码图3D，3F和3J所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至490个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXII)编码图3D，3F和3J所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至490个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXIII)编码图3E和3I所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至576个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXIV)编码图3E和3I所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至576个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(LXV)编码图3E和3I所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至576个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXVI)编码图3E和3I所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至576个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXVII)编码图3E和3I所示肽的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸长，以任何整数延长至576个氨基酸的肽区域的多核苷酸，所述肽区域中包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(LXVIII)与(I)-(LXVII)中任何一种多核苷酸完全互补的多核苷酸。(LXIX)由(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸编码的肽。(LXX)含有(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽以及药物赋形剂，和/或以人用单位剂量形式存在的组合物。(LXXI)在调制表达98P4B6之细胞的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法；(LXXII)在诊断、预防、预测或治疗携有表达98P4B6之细胞的个体的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法；(LXXIII)在诊断、预防、预测或治疗携有表达98P4B6之细胞的个体的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法，所述细胞得自表I所列组织的癌症；(LXXIV)在诊断、预防、预测或治疗癌症的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法；(LXXV)在诊断、预防、预测或治疗表I所列组织的癌症的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法；和(LXXVI)在鉴定或表征表达98P4B6之细胞的调制剂的方法中使用(I)-(LXVIII)中任何一种多核苷酸或(LXIX)的肽或(LXX)的组合物的方法。应将本文所用的范围理解成具体公开了所有整数的情况。本文公开的本发明的典型实施方案包括编码98P4B6mRNA序列(以及与所述序列互补的序列)的特定部分的98P4B6多核苷酸，例如编码如下所述蛋白质和/或其片段的多核苷酸(a)98P4B6变体1的4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，30，35，40，45，50，55，60，65，70，75，80，85，90，95，100，105，110，115，120，125，130，135，140，145，150，155，160，165，170，175，180，185，190，195，200，225，250，275，300，325，350，375，400，410，420，430，440，450或454或更多个邻接的氨基酸；与其它变体相关的最大长度是变体2，44个氨基酸；变体5，419个氨基酸；变体6，490个氨基酸；变体7，576个氨基酸；变体8，490个氨基酸；变体13，454个氨基酸；变体14，454个氨基酸；变体21，576个氨基酸；和变体25，490个氨基酸。例如，本文公开的本发明的代表性实施方案包括编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸1至约氨基酸10的多核苷酸及其编码的肽本身，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸10至约氨基酸20的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸20至约氨基酸30的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸30至约氨基酸40的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸40至约氨基酸50的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸50至约氨基酸60的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸60至约氨基酸70的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸70至约氨基酸80的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸80至约氨基酸90的多核苷酸，编码图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸90至约氨基酸100的多核苷酸，以约10个氨基酸的级别增加，到图2或图3所示的羧基末端氨基酸处为止。因此，编码98P4B6蛋白羧基末端的100个氨基酸，氨基酸序列的一部分(约10个氨基酸)的多核苷酸都是本发明的实施方案。其中应理解每个特定的氨基酸位置公开的是加上或减去5个氨基酸残基的该位置。编码相对较长的98P4B6蛋白部分的多核苷酸也落入本发明的范围。例如，通过本领域众所周知的多种技术可以产生编码图2或图3所示98P4B6蛋白或变体的约氨基酸1(或20或30或40等)至约氨基酸20(或30，或40或50等)的多核苷酸。这些多核苷酸片段可包括图2所示98P4B6序列的任何部分。本文公开的本发明的其它说明性实施方案包括98P4B6多核苷酸片段，其编码98P4B6蛋白或变体序列(包括表VIII-XXI和XXII-XLIX所示98P4B6蛋白或变体的携有基元的亚序列)中所含的一个或多个生物基元。在另一个实施方案中，本发明的典型多核苷酸片段编码与已知分子具有同源性的98P4B6蛋白或变体的一个或多个区域。在本发明的另一个实施方案中，典型的多核苷酸片段可编码一个或多个98P4B6蛋白或变体N-糖基化位点，cAMP和cGMP-依赖型蛋白质激酶磷酸化位点，酪蛋白激酶II磷酸化位点或N-十四烷酰化位点和酰胺化位点。需说明的是为了测定表VIII-XXI和表XXII-XLIX(通称为HLA肽表)所示的任何肽各自相对于其亲代蛋白质，如变体1，变体2等的起始位置，可参考三个因素特定的变体，HLA肽表中肽的长度和表VII中列出的检索肽。一般说来，使用唯一的检索肽来获得针对特定变体的HLA肽。表VII中列出了每个检索肽相对于其各自的亲代分子的位置。因此，如果检索肽自“X”位开始，必须给表VIII-XXI和表XXII-IL中的每个位置加上数值“X减1”，以获得HLA肽在其亲代分子中的实际位置。例如，如果特定的检索肽自其亲代分子的第150位开始，必须在每个HLA肽氨基酸位置处加上150-1，即149，以计算出该氨基酸在亲代分子中的位置。II.A.)98P4B6多核苷酸的用途II.A.1.)监测基因异常上文所述的多核苷酸具有多种不同的具体用途。将人98P4B6基因作图于题为“98P4B6的染色体作图”的实施例中所示的染色体位置。例如，由于98P4B6基因作图于该染色体，可以使用编码98P4B6蛋白不同区域的多核苷酸来鉴定该染色体位点的细胞遗传异常，例如被鉴定为与多种癌症相关的异常。在某些基因中，包括重排的多种染色体异常被鉴定为多种不同癌症中的常见细胞遗传异常(参见例如Krajinovicetal.，Mutat.Res.382(3-4)81-83(1998)；Johanssonetal.，Blood86(10)3905-3914(1995)和Fingeretal.，P.N.A.S.85(23)9158-9162(1988))。因此，编码98P4B6蛋白特定区域的多核苷酸提供了新的工具，它可用于以优于从前的准确度来描述编码98P4B6的染色体区域中可能会导致恶性表型的细胞遗传异常。在本上下文中，这些多核苷酸能满足本领域扩展染色体筛选的敏感性，从而鉴定出更细微和较罕见的染色体异常的需求(参见例如Evansetal，Am.J.Obstet.Gynecol171(4)1055-1057(1994))。另外，由于已证实98P4B6在前列腺癌和其它癌症中高表达，可以在评价98P4B6基因产物在正常对癌症组织中的状况的方法中使用98P4B6多核苷酸。一般使用编码98P4B6蛋白特定区域的多核苷酸来评价98P4B6基因特定区域，如含有一个或多个基元的区域中微扰(如导致抗原等的丧失的缺失、插入、点突变或改变)的存在。例举的试验包括RT-PCR试验以及单链构象多态性(SSCP)分析(参见例如Marrogietal.，J.Cutan.Pathol.26(8)369-378(1999))，它们都利用编码蛋白质特定区域的多核苷酸来检测蛋白质内的这些区域。II.A.2)反义实施方案本文公开的本发明欲包括的其它具体核酸-相关实施方案是基因组DNA、cDNA、核酶和反义分子以及基于可选择主链或包括可选择碱基的核酸分子，它们可以是天然来源的或合成的，并包括能抑制98P4B6的RNA或蛋白质表达的分子。例如，反义分子可以是RNA或其它分子，包括肽核酸(PNA)或非-核酸分子，例如以依赖于碱基对的方式与DNA或RNA特异性结合的硫代磷酸酯衍生物。本领域技术人员使用本文公开的98P4B6多核苷酸和多核苷酸序列可以容易地获得这些类别的核酸分子。反义技术必需施用能与位于细胞内的靶多核苷酸结合的外源性寡核苷酸。术语“反义”指的是寡核苷酸与其细胞内的靶，如98P4B6互补这一事实。参见例如JackCohen，Oligodeoxynucleotides，AntisenseInhibitorsofGeneExpression，CRCPress，1989；andSynthesis11-5(1988)。本发明的98P4B6反义寡核苷酸包括表现出增强的癌症细胞生长抑制作用的衍生物，如S-寡核苷酸(硫代磷酸酯衍生物或S-oligo，参见JackCohen，文献同上)。S-oligo(核苷硫代磷酸酯)是寡核苷酸(O-oligo)的等电类似物，其中磷酸基团的非桥连氧原子被硫原子取代。通过用硫转运试剂3H-1，2-苯并二硫代-3-酮-1，1-二氧化物处理相应的O-oligo，即可制备本发明的S-oligo。参见例如Iyer，R.P.etal.，J.Org.Chem.554693-4698(1990)；andIyer，R.P.etal.，J.Am.Chem.Soc.1121253-1254(1990)。本发明的其它98P4B6反义寡核苷酸包括本领域已知的吗啉代反义寡核苷酸(参见例如Partridgeetal.，1996，Anbsense&NucleicAcidDrugDevelopment6169-175)。本发明的98P4B6反义寡核苷酸一般可以是与98P4B6基因组序列的前100个5’密码子或后100个3’密码子或相应的mRNA互补和稳定杂交的RNA或DNA。不需要绝对互补，但优选高水平的互补。使用与该区域互补的寡核苷酸能选择性地与98P4B6mRNA杂交，而不与蛋白质激酶的其它调节亚单位所特有的mRNA杂交。在一个实施方案中，本发明的98P4B6反义寡核苷酸是具有与98P4B6mRNA杂交之序列的反义DNA分子的15至30-聚体片段。任选98P4B6反义寡核苷酸是与98P4B6的前10个5’密码子或后10个3’密码子中的区域互补的30-聚体寡核苷酸。或者，对反义分子进行修饰以利用核酶来抑制98P4B6的表达，参见例如LA.Couture&D.T.Stinchcomb；TrendsGenet12510-515(1996)。II.A.3.)引物和引物对本发明的这些核苷酸的其它具体实施方案包括引物和引物对，它们可以特异性地扩增本发明的多核苷酸或其任何特定部分，还包括探针，它们可以与本发明的核酸分子或其任何部分选择性地或特异性地杂交。可以用可测标记，例如放射性同位素、荧光化合物、生物发光化合物、化学发光化合物、金属螯合剂或酶标记探针。所述探针和引物可用于检测样品中98P4B6多核苷酸的存在，并可用作检测表达98P4B6蛋白之细胞的工具。所述探针的例子包括含有图2所示的全部或部分人98P4B6cDNA序列的多核苷酸。实施例中还描述了能特异性扩增98P4B6mRNA的引物对的例子。本领域技术人员懂得基于本文提供的序列可以制备很多种不同的引物和探针，并将它们有效地用于扩增和/或检测98P4B6mRNA。本发明的98P4B6多核苷酸可用于多种目的，包括但不限于用作探针和引物以扩增和/或检测98P4B6基因、mRNA或其片段；用作试剂以诊断和/或预测前列腺癌和其它癌症；用作能介导98P4B6多肽表达的编码序列；用作调制或抑制98P4B6基因表达和/或98P4B6转录物翻译的工具；和用作治疗剂。本发明包括使用本文所述的任何探针从天然来源，如人或其它哺乳动物中鉴定和分离出98P4B6或98P4B6相关核酸序列，本发明还包括分离的核酸序列本身，所述序列可含有所用探针的全部或大多数序列。II.A.4.)分离编码98P4B6的核酸分子本文所述的98P4B6cDNA能分离其它编码98P4B6基因产物的多核苷酸，以及分离编码98P4B6基因产物同系物，或者98P4B6基因产物的剪接同种型、等位基因变体和突变体形式的多核苷酸，以及分离编码98P4B6-相关蛋白质的类似物的多核苷酸。用于分离编码98P4B6基因的全长cDNA的多种分子克隆方法是众所周知的(参见例如Sambrook，J.etal.，MolecularCloningALaboratoryManual，2dedition，GoldSpringHarborPress，NewYork，1989；CurrentProtocolsinMolecularBiology.Ausubeletal.，Eds.，WileyandSons，1995)。例如，可以方便地使用可使用商购克隆系统(如LambdaZAPExpress，Stratagene)的λ噬菌体克隆方法学。通过用经标记的98P4B6cDNA或其片段进行探测，即可鉴定出含有98P4B6基因cDNA的噬菌体克隆。例如，在一个实施方案中，可以合成98P4B6cDNA(如图2)或其部分，并将它们用作探针以获取对应于98P4B6基因的重叠和全长cDNA。通过用98P4B6DNA探针或引物筛选基因组DNA文库，细菌人工染色体文库(BAC)，酵母人工染色体文库(YAC)等，即可分离出98P4B6基因本身。II.A.5.)重组核酸分子和宿主-载体系统本发明还提供了含有98P4B6多核苷酸，其片段、类似物或同系物的重组DNA或RNA分子，包括但不限于噬菌体、质粒、噬粒、粘粒、YAC、BAC以及多种本领域众所周知的病毒和非-病毒载体，本发明还提供了被所述重组DNA或RNA分子转化或转染的细胞。产生所述分子的方法是众所周知的(参见例如Sambrooketal，1989，文献同上)。本发明还提供了在适当的原核或真核宿主细胞内含有重组DNA分子的宿主-载体系统，所述重组DNA分子含有98P4B6多核苷酸、其片段、类似物或同系物。适当真核宿主细胞的例子包括酵母细胞、植物细胞、或动物细胞，如哺乳动物细胞或昆虫细胞(如可被杆状病毒感染的细胞，如Sf9或HighFive细胞)。适当哺乳动物细胞的例子包括多种前列腺癌细胞系，如DU145和TsuPr1，其它可转染或转导的前列腺癌细胞系，原代细胞(PrEC)，以及多种常规用于表达重组蛋白质的哺乳动物细胞(如COS、CHO、293、293T细胞)。更具体地，可以使用本领域常规使用和公知的任何一种宿主-载体系统，使用含有98P4B6编码序列或其片段、类似物或同系物的多核苷酸产生98P4B6蛋白或其片段。适于表达98P4B6蛋白或其片段的多种宿主-载体系统是可以获得的(参见例如Sambrooketal，1989，文献同上；CurrentProtocolsinMolecularBiology，1995，文献同上)。用于哺乳动物表达的优选载体包括但不限于pcDNA3.1myc-His-tag(Invitrogen)和逆转录病毒载体pSRαtkneo(Mulleretal.，1991，MCB111785)。使用这些表达载体，可以在包括例如293，293T，rat-1，NIH3T3和TsuPrl的几种前列腺癌和非-前列腺细胞系中表达98P4B6。本发明的宿主-载体系统可用于产生98P4B6蛋白或其片段。可以使用所述宿主-载体系统研究98P4B6和98P4B6突变或类似物的功能特性。通过被编码98P4B6-相关核苷酸的构建体转染的哺乳动物细胞，可以产生重组人98P4B6蛋白或其类似物或同系物或片段。例如，用编码98P4B6或其片段、类似物或同系物的表达质粒转染293T细胞，在293T细胞中表达98P4B6-相关蛋白质，使用标准的纯化方法(例如使用抗-98P4B6抗体进行亲和纯化)分离重组98P4B6蛋白。在另一个实施方案中，将98P4B6编码序列亚克隆至逆转录病毒载体pSRαMSVtkneo，并用于感染多种哺乳动物细胞系，如NIH3T3，TsuPrl，293和rat-1，从而建立表达98P4B6的细胞系。也可以使用本领域众所周知的多种其它表达系统。编码与98P4B6编码序列框内连接的前导肽的表达构建体可用于产生分泌形式的重组98P4B6蛋白。如本文所讨论的，遗传密码的丰余性允许98P4B6基因序列中出现变异。特别地，本领域已知特定的宿主种类经常具有特殊的密码子偏好，因此可以将公开的序列修改为所需宿主偏好的序列。例如，优选的类似物密码子序列一般以使用频率较高的密码子替代罕见密码子(即在所需宿主的已知序列中使用频率低于约20％的密码子)。例如，利用可得自互联网，如URLdna.affrc.go.jp/-nakamura/codon.html上的密码子使用表，计算出特定物种的密码子偏好。已知其它序列修饰可增强细胞宿主中的蛋白质表达。所述修饰包括除去编码错误聚腺苷酸化信号、外显子/内含子剪接位点信号、转座子-样重复的序列和/或其它为人们所熟知的对基因表达有害的序列。参照宿主细胞中表达的已知基因进行计算，将序列的GC含量调整为给定细胞宿主的平均水平。可能的话，对序列进行修饰以避免推测的发夹二级mRNA结构。其它有用的修饰包括如Kozak，Mol.CellBiol.，95073-5080(1989)所述，在开放阅读框的起点处添加翻译起始共有序列。本领域技术人员懂得真核生物核糖体仅在邻近5’的AUG密码子处起始翻译这一一般性原则仅在罕见的条件下被废除(参见例如KozakPNAS92(7)2662-2666，(1995)andKozakNAR15(20)8125-8148(1987))。III.)98P4B6-相关蛋白质本发明的另一方面提供了98P4B6-相关蛋白质。98P4B6蛋白的具体实施方案包括具有图2或图3所示人98P4B6的全部或部分氨基酸序列的多肽。或者，98P4B6蛋白的实施方案包括在图2或图3所示98P4B6氨基酸序列中具有改变的变体、同系物或类似物。98P4B6多肽的实施方案包括具有图2所示序列的98P4B6多肽；具有图2所示98P4B6的肽序列，其中T是U的多肽；具有图2所示序列的至少10个邻接氨基酸的多肽；或具有图2所示序列的至少10个邻接氨基酸，其中T是U的多肽。例如，98P4B6肽的实施方案包括但不限于(I)含有图2A-AL或图3A-J所示氨基酸序列，实质上由其组成，或由其组成的蛋白质；(II)与图2A-AL所示的全部氨基酸序列至少90，91，92，93，94，95，96，97，98，99或100％同源的98P4B6-相关蛋白质；(III)与图2A-AL或3A-J所示的全部氨基酸序列至少90，91，92，93，94，95，96，97，98，99或100％相同的98P4B6-相关蛋白质；(IV)含有表VIII至XLIX中所示的至少一种肽的蛋白质，任选的附加条件是该蛋白质不是图2所示的完整蛋白质；(V)含有表VIII至XXI中所示的至少一种肽的蛋白质，所述肽也出现在表XXII至XLIX中，任选的附加条件是该蛋白质不是图2所示的完整蛋白质；(VI)含有选自表VIII至XLIX中所示肽的至少两种肽的蛋白质，任选的附加条件是该蛋白质不是图2所示的完整蛋白质；(VII)含有选自表VIII至XLIX中所示肽的至少两种肽的蛋白质，附加条件是该蛋白质不是图2所示氨基酸序列中的邻接序列；(VIII)含有选自表VIII至XXI中所示肽的至少一种肽和选自表XXII至XLIX中所示肽的至少一种肽的蛋白质，附加条件是该蛋白质不是图2所示氨基酸序列中的邻接序列；(IX)含有图3A，3B，3C，3D，3E，3F，3G，3H，3I或3J所示蛋白质的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸，以任何整数分别延长至454，45，419，490，576，490，454，454，576或490个氨基酸的多肽，所述多肽包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(X)含有图3A，3B，3C，3D，3E，3F，3G，3H，3I或3J所示蛋白质的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸，以任何整数分别延长至454，45，419，490，576，490，454，454，576或490个氨基酸的多肽，所述多肽包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；(XI)含有图3A，3B，3C，3D，3E，3F，3G，3H，3I或3J所示蛋白质的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸，以任何整数分别延长至454，45，419，490，576，490，454，454，576或490个氨基酸的多肽，所述多肽包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XII)含有图3A，3B，3C，3D，3E，3F，3G，3H，3I或3J所示蛋白质的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个氨基酸，以任何整数分别延长至454，45，419，490，576，490，454，454，576或490个氨基酸的多肽，所述多肽包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XIII)含有图3A，3B，3C，3D，3E，3F，3G，3H，3I或3J所示蛋白质的至少5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34个氨基酸，以任何整数分别延长至454，45，419，490，576，490，454，454，576或490个氨基酸的多肽，所述多肽包括至少1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30，31，32，33，34，35个在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；(XIV)在表VIII-XXI和XXII至XLIX中总共出现过至少两次的肽；(XV)在表VIII-XXI和XXII至XLIX中总共出现过至少三次的肽；(XVI)在表VIII-XXI和XXII至XLIX中总共出现过至少四次的肽；(XVII)在表VIII-XXI和XXII至XLIX中总共出现过至少五次的肽；(XVIII)在表VIII-XXI中出现过至少一次，在表XXII至XLIX中出现过至少一次的肽；(XIX)在表VIII-XXI中出现过至少一次，在表XXII至XLIX中出现过至少两次的肽；(XX)在表VIII-XXI中出现过至少两次，在表XXII至XLIX中出现过至少一次的肽；(XXI)在表VIII-XXI中出现过至少两次，在表XXII至XLIX中出现过至少两次的肽；(XXII)含有下述的1，2，3，4或5个特征，或编码所述肽的寡核苷酸的肽i)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图5的亲水性分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；ii)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图6的亲/疏水性分布图中，数值等于或小于0.5，0.4，0.3，0.2，0.1，或等于0.0的氨基酸位置；iii)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图7的可及残基百分比分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；iv)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图8的平均柔性分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置；或v)图3中特定肽的至少5个氨基酸长的区域，其长度以任何整数增长直至达到图3所示蛋白质的全长，它包括在图9的β-转角分布图中，数值等于或大于0.5，0.6，0.7，0.8，0.9，或等于1.0的氨基酸位置。(XXIII)含有(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域以及药物赋形剂和/或以人用单位剂量形式存在的组合物。(XXIV)在调制表达98P4B6之细胞的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域的方法。(XXV)在诊断、预防、预测或治疗携有表达98P4B6之细胞的个体的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域或(XXIII)的组合物的方法；(XXVI)在诊断、预防、预测或治疗携有表达98P4B6之细胞的个体的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域或(XXIII)的组合物的方法，所述细胞得自表I所列组织的癌症；(XXVII)在诊断、预防、预测或治疗癌症的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域或(XXIII)的组合物的方法；(XXVIII)在诊断、预防、预测或治疗表I所列组织的癌症的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域或(XXIII)的组合物的方法；和(XXIX)在鉴定或表征表达98P4B6之细胞的调制剂的方法中使用(I)-(XXII)的肽或其抗体或结合区域或(XXIII)的组合物的方法。应将本文所用的范围理解成具体公开了所有整数的情况。本文公开的本发明的典型实施方案包括编码98P4B6mRNA序列(以及与所述序列互补的序列)的特定部分的98P4B6多核苷酸，例如编码如下所述蛋白质和/或其片段的多核苷酸(a)98P4B6变体1的4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，30，35，40，45，50，55，60，65，70，75，80，85，90，95，100，105，110，115，120，125，130，135，140，145，150，155，160，165，170，175，180，185，190，195，200，225，250，275，300，325，350，375，400，410，420，430，440，450或454或更多个邻接的氨基酸；与其它变体相关的最大长度是变体52，45个氨基酸；变体5，419个氨基酸；变体6，490个氨基酸；变体7，576个氨基酸；变体8，490个氨基酸；变体13，454个氨基酸；变体14，454个氨基酸；变体21，576个氨基酸；和变体25，490个氨基酸。一般说来，人98P4B6的天然等位基因变体共有高水平的结构同一性和同源性(例如90％或更高的同源性)。通常，98P4B6蛋白的等位基因变体在本文所述的98P4B6序列内含有保守的氨基酸取代，或含有来自98P4B6同系物中相应位置的氨基酸的取代。一类98P4B6等位基因变体是与特定98P4B6氨基酸序列的至少一小部分共有高水平的同源性，但仍含有与所述序列本质上的不同点的蛋白质，所述不同点如非-保守取代、截短、插入或移码。在比较蛋白质序列时，术语相似性、同一性和同源性各自具有遗传学领域所公知的不同含义。另外，定向进化同源性和平行进化同源性是描述一种生物中给定蛋白质家族成员与另一种生物中相同家族成员的关系的重要概念。表II中提供了氨基酸缩写。可以在蛋白质中进行频繁的保守氨基酸取代而不会改变蛋白质的构象或功能。本发明的蛋白质可含有1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15个保守的取代。所述改变包括用异亮氨酸(I)、缬氨酸(V)和亮氨酸(L)中的任何一种取代任何其它的疏水氨基酸；用天冬氨酸(D)取代谷氨酸(E)和反之；用谷氨酰胺(Q)取代天冬酰胺(N)和反之；以及用丝氨酸(S)取代苏氨酸(T)和反之。其它取代也可被认为是保守的，这取决于特定氨基酸的环境以及它在蛋白质三维结构中的作用。例如，甘氨酸(G)和丙氨酸(A)经常可以互换使用，丙氨酸(A)和缬氨酸(V)也是如此。相对疏水的甲硫氨酸(M)经常可与亮氨酸和异亮氨酸互换使用，有时可与缬氨酸互换使用。在氨基酸残基的显著特征为其电荷的位置处，赖氨酸(K)和精氨酸(R)经常可以互换使用，这两个氨基酸残基pK的差异不显著。在特殊的环境中，其它改变也可被认为是“保守的”(参见例如本文的表III；pages13-15″Biochemistry″2ndED.LubertStryered(StanfordUniversity)；Henikoffetal.，PNAS1992Vol8910915-10919；Leietal.，JBiolChem1995May19；270(20)11882-6)。本文公开的本发明的实施方案包括多种为本领域所接受的98P4B6蛋白变体或类似物，例如具有氨基酸插入、缺失和取代的多肽。使用本领域已知的方法，如定点诱变、丙氨酸扫描和PCR诱变即可制备98P4B6变体。可以对克隆的DNA进行定点诱变(Carteretal.，Nucl.AcidsRes.，134331(1986)；Zolleretal.，Nucl.AcidsRes.，106487(1987))、盒诱变(Wellsetal.，Gene，34315(1985))、限制性选择诱变(Wellsetal.，Philos.Trans.R.Soc.LondonSerA，317415(1986))或其它已知的技术以产生98P4B6变体DNA。也可使用扫描氨基酸分析来鉴定沿着与特定生物活性，如蛋白质-蛋白质相互作用有关的邻接序列的一个或多个氨基酸。优选的扫描氨基酸是相对较小的、中性的氨基酸。所述氨基酸包括丙氨酸、甘氨酸、丝氨酸和半胱氨酸。其中优选丙氨酸作为扫描氨基酸，因为它消除了β碳上的侧链，不太可能改变变体的主链构象。优选丙氨酸的另一个原因是它是最常见的氨基酸。另外，经常在被掩盖和暴露的位置发现丙氨酸(Creighton，TheProteins，(W.H.Freeman&Co.，N.Y.)；Chothia，J.Mol.Biol.，1501(1976))。如果丙氨酸取代不能产生足够量的变体，则可使用同配氨基酸。本文所定义的98P4B6变体、类似物或同系物具有区别性特征，它们具有至少一个能与98P4B6蛋白“交叉反应”的表位，所述98P4B6蛋白具有图3的氨基酸序列。所述“交叉反应”指的是与98P4B6变体特异性结合的抗体或T细胞也能与具有图3所示氨基酸序列的98P4B6蛋白特异性结合。当多肽不再含有任何能被与原始98P4B6蛋白特异性结合的抗体或T细胞所识别的表位时，该多肽不再是图3所示蛋白质的变体。本领域技术人员懂得识别蛋白质的抗体与不同大小的表位结合，级别约为4或5个氨基酸的一组邻接或不邻接氨基酸被认为是最小表位的典型氨基酸数目。参见例如Nairetal.，J.Immunol.2000，165(12)6949-6955；Hebbesetal.，MolImmunol(1989)26(9)865-73；Schwartzetal.，JImmunol(1985)135(4)2598-608。其它类98P4B6-相关蛋白质变体与图3的氨基酸序列或其片段共享70％，75％，80％，85％或90％或更高的同源性。另一特殊类别的98P4B6蛋白变体或类似物含有一种或多种本文所述或本领域已知的98P4B6生物基元。因此，本发明包括相对于原始片段而言具有经改变的功能(如免疫原性)特性的98P4B6片段类似物(核酸或氨基酸)。应懂得本文所述或本领域已知的基元适用于图2或图3的核酸或氨基酸序列。如本文所讨论的，本发明的实施方案包括多肽，其含有图2或图3所示98P4B6蛋白全长氨基酸序列的部分序列。例如，本发明的代表性实施方案包括具有图2或图3所示98P4B6蛋白的任意4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15或更多个邻接氨基酸的肽/蛋白质。另外，本文公开的本发明的代表性实施方案包括贯穿全部的98P4B6氨基酸序列，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸1至约氨基酸10组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸10至约氨基酸20组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸20至约氨基酸30组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸30至约氨基酸40组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸40至约氨基酸50组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸50至约氨基酸60组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸60至约氨基酸70组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸70至约氨基酸80组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸80至约氨基酸90组成的多肽，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸90至约氨基酸100组成的多肽等。另外，由图2或图3所示98P4B6蛋白的约氨基酸1(或20或30或40等)至约氨基酸20(或130或140或150等)组成的多肽也是本发明的实施方案。应懂得本段落中的起始和终止位置指的是特定的位置以及该位置加上或减去5个残基的位置。使用标准的肽合成技术或使用本领域众所周知的化学裂解法可以产生98P4B6-相关蛋白质。或者，可以使用重组法产生编码98P4B6-相关蛋白质的核酸分子。在一个实施方案中，核酸分子提供了产生98P4B6蛋白(或其变体、同系物或类似物)的限定片段的工具。III.A.)携有基元的蛋白质的实施方案本文公开的本发明的其它说明性实施方案包括98P4B6多肽，其含有图2或图3所示98P4B6多肽序列内所含一种或多种生物基元的氨基酸残基。多种基元是本领域已知的，通过多个公知的互联网站点可以评价蛋白质中是否存在所述基元(参见例如URL网址pfam.wustl.edu/；searchlauncher.bcm.tmc.edu/seq-search/struc-predict.html；psort.ims.u-tokyo.ac.jp/；cbs.dtu.dk/；ebi.ac.uk/interpro/scan.html；expasy.ch/tools/scnpsitl.html；EpimatrixTM和EpimerTM，BrownUniversity，brown.edu/Research/TB-HIV_Lab/epimafix/epimatrix.html；和BIMAS，bimas.dcrt.nih.gov/.)。表VIII-XXI和XXII-XLIX中列出并鉴定了所有98P4B6变体蛋白质的携有基元的亚序列。表V列出了几种基于pfam检索(参见URL网址pfam.wusti.edu/)的常见基元。表V中的各栏列出了(1)基元名称的缩写，(2)在基元家族不同成员中发现的同一性百分比，(3)基元名称或描述和(4)最常见的功能；如果基元与位置相关，还包括位置信息。上文所讨论的98P4B6基元与生长异常调节有关，而且98P4B6在某些癌症中过表达(参见例如表I)，鉴于此观察结果，可以使用含有上文所讨论的一种或多种98P4B6基元的多肽来阐明恶性表型的特殊特征。例如，已知酪蛋白激酶II，cAMP和camp依赖型蛋白质激酶以及蛋白质激酶C是与恶性表型发展有关的酶(参见例如Chenetal.，LabInvest.，78(2)165-174(1998)；Gaiddonetal.，Endocrinology136(10)4331-4338(1995)；Halletal.，NucleicAcidsResearch24(6)1119-1126(1996)；Peterzieletal.，Oncogene18(46)6322-6329(1999)andO′Brian，Oncol.Rep.5(2)305-309(1998))。另外，糖基化和十四酰化也是与癌症和癌症进展有关的蛋白质修饰(参见例如Dennisetal.，Biochem.Biophys.Acta1473(1)21-34(1999)；Rajuetal.，Exp.CellRes.235(1)145-154(1997))。酰胺化是另一种与癌症和癌症进展有关的蛋白质修饰(参见例如Trestonetal.，J.Nab.CancerInst.Monogr.(13)169-175(1992))。在另一个实施方案中，本发明的蛋白质含有一种或多种根据为本领域所接受的方法鉴定的免疫活性表位，如表VIII-XXI和XXII-XLIX所示的肽。使用特殊的算法可确定CTL表位，从而鉴定出98P4B6蛋白内能最佳地与特定HLA等位基因结合的肽(例如表IV；EpimatrixTMandEpimerTM，BrownUniversity，URLbrown.edu/Research/TB-HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html；andBIMAS，URLbimas.dcrt.nih.gov/.)。另外，鉴定与HLA分子有足够结合亲和性并且与成为免疫原性表位有关的肽的方法是本领域众所周知的，无需经过过度的实验即可实施。另外，鉴定可用作免疫原性表位的肽的方法是本领域众所周知的，无需经过过度的实验即可在体外或体内实施该方法。另外，本领域已知为了调制免疫原性而产生所述表位的类似物的原理。例如，可以以携有CTL或HTL基元(参见例如表IV的HLAI类和HLAII类基元/超基元)的表位开始。通过换下一个特定位置处的氨基酸，用该位置特有的另一个氨基酸取代之，即可制备类似表位。例如，以表IV定义的残基为基础，用任何其它残基，如优选的残基取代有害的残基；用优选的残基取代较不优选的残基；或用另一个优选的残基取代原来出现的优选残基。取代可发生在肽中的一级锚位置或其它位置；参见例如表IV。多篇参考文献反映了有关鉴定和产生所需蛋白质及其类似物中的表位的技术。参见例如Chesnutetal.的WO97/33602；Sette，Immunogenetics199950(3-4)201-212；Setteetal.，J.Immunol.2001166(2)1389-1397；Sidneyetal.，Hum.Immunol.199758(1)12-20；Kondoetal，Immunogenetics199745(4)249-258；Sidneyetal.，J.Immunol.1996157(8)3480-90；andFalketal.，Nature351290-6(1991)；Huntetal，Science2551261-3(1992)；Parkeretal.，J.Immunol.1493580-7(1992)；Parkeretal.，J.Immunol.152163-75(1994)；Kastetal，1994152(8)3904-12；Borras-Cuestaetal.，Hum.Immunol.200061(3)266-278；Alexanderetal.，J.Immunol.2000164(3)1625-1633；Alexanderetal.，PMID7895164，UI95202582；O′Sullivanetal.，J.Immunol.1991147(8)2663-2669；Alexanderetal.，Immunity19941(9)751-761andAlexanderetal.，Immunol.Res.199818(2)79-92。本发明的相关实施方案包括含有表VI所示的不同基元，和/或表VIII-XXI和XXII-XLIX的一种或多种推测CTL表位，和/或表XLVI-XLIX的一种或多种推测HTL表位，和/或本领域已知的一种或多种T细胞结合基元的组合的多肽。优选实施方案在基元内或多肽的间插序列内都不含插入、缺失或取代。另外，在这些基元的任一侧包括多个N-末端和/或C-末端氨基酸残基的实施方案是合乎需要的(例如，包括多肽结构的较大部分，其中包含有基元)。通常，位于基元任一侧的N-末端和/或C-末端氨基酸残基的数目约为1至100个氨基酸残基，优选为5至约50个氨基酸残基。本发明包括多种形式(优选为分离形式)的98P4B6-相关蛋白质。纯化的98P4B6蛋白分子基本上不含其它有损于98P4B6与抗体、T细胞或其它配体的结合的蛋白质或分子。分离和纯化的性质和水平取决于欲实现的用途。98P4B6-相关蛋白质的实施方案包括纯化的98P4B6-相关蛋白质和功能性的、可溶的98P4B6-相关蛋白质。在一个实施方案中，功能性的、可溶的98P4B6蛋白或其片段保留了与抗体、T细胞或其它配体结合的能力。本发明还提供了含有图2或图3所示98P4B6氨基酸序列的生物活性片段的98P4B6蛋白。所述蛋白质表现出原始98P4B6蛋白的特性，例如引发产生能特异性结合原始98P4B6蛋白相关表位的能力；能被抗体结合；能导致HTL或CTL激活；和/或被也能与原始蛋白质特异性结合的HTL或CTL识别。使用多种本领域众所周知的分析技术，包括例如Chou-Fasman，Gamier-Robson，Kyte-Doolittle，Eisenberg，Karplus-Schultz或Jameson-Wolf分析法，或基于免疫原性，即可推测和/或鉴定出含有特别令人感兴趣之结构的98P4B6-相关多肽。含有所述结构的片段可特别地用于产生亚单位-特异性抗-98P4B6抗体或T细胞，或用于鉴定与98P4B6结合的细胞因子。例如，使用Hopp，T.P.andWoods，K.R.，1981，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.783824-3828的方法，可以产生亲水性分布图并鉴定出免疫原性的肽片段。使用Kyte，J.andDoolittle，R.F.，1982，J.Mol.Biol.157105-132的方法，可以产生亲/疏水性分布图并鉴定出免疫原性的肽片段。使用JaninJ.，1979，Nature277491-492的方法，可以产生可及残基百分比(％)分布图并鉴定出免疫原性的肽片段。使用BhaskaranR.，PonnuswamyP.K.，1988，Int.J.Pept.ProteinRes.32242-255的方法，可以产生平均柔性分布图并鉴定出免疫原性的肽片段。使用Deleage，G，RouxB.，1987，ProteinEngineering1289-294的方法，可以产生β-转角分布图并鉴定出免疫原性的肽片段。使用特殊的算法可确定CTL表位，从而鉴定出98P4B6蛋白内能最佳地与特定HLA等位基因结合的肽(例如通过使用SYFPEITHI站点www.URLsyfpeithi.bmi-heidelberg.com/；表IV(A)-(E)；EpimatrixTMandEpimerTM，BrownUniversity，URL(brown.edu/Research/TB-HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html)；andBIMAS，URLbimas.dcrt.nih.gov/.)。阐明了这些表位，即可推测出人MHCI类分子，如HLA-A1，A2，A3，A11，A24，B7和B35环境中呈递的98P4B6肽表位(参见例如表VIII-XXI，XXII-XLIX)。具体地说，除了位于URLsyfpeithi.bmi-heidelberg.com/的SYFPEITHI站点外，还将98P4B6蛋白的完整氨基酸序列和其它变体的相关部分(即对HLAI类分子而言，推测在点突变的任一侧或在外显子的连接处有9个侧翼残基，对HLAII类分子而言，推测在点突变的任一侧或在对应于该变体的外显子连接处有14个侧翼残基)输入上文所述BioinformaticsandMolecularAnalysisSection(BIMAS)站点中的HLA肽基元检索算法中。KenParker博士根据HLAI类分子，特别是HLA-A2的沟中特定肽序列的结合研究出HLA肽基元检索算法(参见例如Falketal.，Nature351290-6(1991)；Huntetal.，Science2551261-3(1992)；Parkeretal，J.Immunol.1493580-7(1992)；Parkeretal.，J.Immunol.152163-75(1994))。该算法能够定位得自完整蛋白质序列的8-聚体、9-聚体和10-聚体肽，并将它们与HLA-A2以及多种其它HLAI类分子推测的结合按级别排列。很多种HLAI类结合肽是8-、9-、10或11-聚体。例如，对I类HLA-A2而言，表位优选在第2位含有亮氨酸(L)或甲硫氨酸(M)，并在C-末端含有缬氨酸(V)或亮氨酸(L)(参见例如Parkeretal.，J.Immunol.1493580-7(1992))。98P4B6推测结合肽的选定结果示于本文的表VIII-XXI和XXII-XLIX。在表VIII-XXI和XXII-XLVII中，显示了针对每个家族成员的选定候选9-聚体和10-聚体及其位置、每个特定肽的氨基酸序列和估计的结合评分。在表XLVI-XLIX中，显示了针对每个家族成员的选定候选15-聚体及其位置、每个特定肽的氨基酸序列和估计的结合评分。结合评分相当于37℃，pH6.5时所估计的含肽复合物解离所需时间的一半。推测具有最高结合评分的肽与细胞表面HLAI类分子的结合最紧密，结合的时间也最长，因此是T-细胞识别的最佳免疫原性靶。通过使抗原-加工有缺陷的细胞系T2上的HLA表达稳定化，即可评价肽与HLA等位基因的实际结合情况(参见例如Xueetal.，Prostate3073-8(1997)andPeshwaetal.，Prostate36129-38(1998))。通过在抗原呈递细胞，如树状细胞的存在下刺激CD8+细胞毒T淋巴细胞(CTL)，可以在体外评价特定肽的免疫原性。应懂得通过BIMAS位点、EimerTM和EpimatrixTM位点推测，或通过本领域已知或已成为本领域的一部分的HLAI类或II类基元，如表IV中所示的基元特化(或使用www站点URLsyfpeithi.bmi-heidelberg.com/，或BIMAS，bimas.dcrt.nih.gov/测定)的每一种表位都“适用于”本发明的98P4B6蛋白。本文所用的“适用于”指的是凭视觉或通过基于计算机的模式发现法来评价98P4B6蛋白，这些技术是本领域技术人员可以掌握的。每一种携有HLAI类基元、长度为8，9，10或11个氨基酸残基的98P4B6蛋白亚序列，或携有HLAII类基元、长度为9或更多个氨基酸残基的亚序列也落入本发明的范围。III.B.)表达98P4B6-相关蛋白质在下文实施例描述的实施方案中，可以方便地在被可商购的表达载体转染的细胞(如293T细胞)中表达98P4B6，所述表达载体如编码98P4B6、具有C-末端6×His和MYC标记的CMV-驱动表达载体(pcDNA3.1/mycHIS，Invitrogen或Tag5，GenHunterCorporation，NashvilleTN)。Tag5载体提供了IgGK分泌信号，该信号有利于在转染细胞中产生分泌的98P4B6蛋白。例如，按照标准技术使用镍柱，可以从培养基中纯化出分泌的HIS-标记的98P4B6。III.C.)修饰98P4B6-相关蛋白质98P4B6-相关蛋白质的修饰，如共价修饰包括在本发明的范围之内。一种类型的共价修饰包括使98P4B6多肽的目的氨基酸残基与有机衍生试剂反应，所述试剂能与98P4B6蛋白的选定侧链或N-或C-末端残基反应。本发明范围所包含的另一种98P4B6多肽共价修饰包括改变本发明蛋白质的天然糖基化模式。另一种98P4B6共价修饰包括以美国专利4,640,835；4,496,689；4,301,144；4,670,417；4,791,192或4,179,337中所述的方式，将98P4B6多肽与多种非蛋白质类聚合物，如聚乙二醇(PEG)、聚丙二醇或聚氧化烯中的一种连接。也可以修饰本发明的98P4B6-相关蛋白质以形成含有与另一种异源多肽或氨基酸序列融合的98P4B6的嵌合分子。可以通过化学或重组的方法合成所述嵌合分子。嵌合分子可具有与另一种肿瘤-相关抗原或其片段融合的本发明的蛋白质。或者，本发明的蛋白质可含有98P4B6序列(氨基酸或核酸)片段的融合物，以产生在其整个长度上不与图2或图3所示氨基酸或核酸序列直接同源的分子。所述嵌合分子可含有多个相同的98P4B6亚序列。嵌合分子可含有98P4B6-相关蛋白质与多聚组氨酸表位标记的融合物，所述融合物可提供表位与固定化的镍选择性结合，嵌合分子还可含有98P4B6-相关蛋白质与细胞因子或生长因子的融合物。表位标记一般位于98P4B6蛋白的氨基或羧基末端。在另一个实施方案中，嵌合分子可含有98P4B6-相关蛋白质与免疫球蛋白或免疫球蛋白特定区域的融合物。对于二价形式的嵌合分子(也称为“免疫粘附素”)而言，所述融合物可以是与IgG分子Fc区域的融合物。Ig融合物优选包括用可溶(跨膜结构域缺失或失活)形式的98P4B6多肽取代Ig分子内的至少一个可变区。在优选实施方案中，免疫球蛋白融合物包括IgG1分子的绞链区，CH2和CH3，或绞链区，CH1、CH2和CH3区。关于产生免疫球蛋白融合物，可参见例如1995年6月27日颁布的美国专利5,428,130。III.D.)98P4B6-相关蛋白质的用途本发明的蛋白质具有多种不同的具体用途。由于98P4B6在前列腺癌和其它癌症中高表达，可以在评价正常对癌症组织中98P4B6基因产物状况的方法中使用98P4B6-相关蛋白质，从而阐明恶性表型。一般使用得自98P4B6蛋白特定区域的多肽评价区域(如含有一种或多种基元的区域)中微扰(如缺失、插入、点突变等)的存在。例举的试验利用靶向98P4B6-相关蛋白质的抗体或T细胞，以评价正常对癌症组织中该区域的特征或引发针对表位的免疫应答，所述蛋白质含有98P4B6多肽序列所含一种或多种生物基元的氨基酸残基。或者，使用98P4B6-相关蛋白质来筛选与98P4B6的该区域相互作用的因子，所述蛋白质含有98P4B6蛋白的一种或多种生物基元的氨基酸残基。98P4B6蛋白的片段/亚序列可特别地用于产生和鉴定结构域-特异性抗体(例如识别98P4B6蛋白的胞外或胞内表位的抗体)，用于鉴定与98P4B6或其特殊结构域结合的试剂或细胞因子，和用于多种治疗和诊断目的，包括但不限于诊断试验、癌症疫苗和制备所述疫苗的方法。由98P4B6基因或其类似物、同系物或片段编码的蛋白质具有多种用途，包括但不限于产生抗体和用于鉴定与98P4B6基因产物结合的配体和其它试剂和细胞组分的方法中。针对98P4B6蛋白或其片段产生的抗体可用于诊断和预测试验，以及用于处理特征在于表达98P4B6蛋白的人类癌症(如表I所列的癌症)的显象方法学。所述抗体可在细胞内表达并用于治疗所述癌症之患者的方法中。也可使用98P4B6-相关核酸或蛋白质来产生HTL或CTL反应。可以使用多种可用于检测98P4B6蛋白的免疫学试验，包括但不限于多种类型的放射免疫测定、酶联免疫吸附试验(ELISA)、酶联免疫荧光试验(ELIFA)、免疫细胞化学方法等。可以标记抗体，并将其用作能检测表达98P4B6之细胞的免疫显象试剂(例如用于放射闪烁照相显象法)。如本文进一步地描述，98P4B6蛋白也可特别地用于产生癌症疫苗。IV.)98P4B6抗体另一方面，本发明提供了与98P4B6-相关蛋白质结合的抗体。在生理条件下，优选的抗体特异性结合98P4B6-相关蛋白质，但并不结合(或微弱地结合)不是98P4B6-相关蛋白质的肽或蛋白质。在本文中，生理条件的例子包括1)磷酸缓冲盐水；2)含有25mMTris和150mM的Tris-缓冲盐水；或3)普通盐水(0.9％)；4)动物血清，如人血清；或5)1)至4)的任意组合；优选这些反应在pH7.5时发生，或者在pH7.0至8.0的范围内发生，或者在pH6.5至8.5的范围内发生；这些反应在4℃至37℃的温度下发生。例如，与98P4B6结合的抗体可以结合98P4B6-相关蛋白质，例如其同系物或类似物。本发明的98P4B6抗体可特别地用于癌症(参见例如表I)诊断和预测试验和显象方法学。类似地，所述抗体可用于治疗、诊断和/或预测其它也能表达或过表达98P4B6的癌症。另外，细胞内表达的抗体(如单链抗体)能用于治疗与98P4B6表达有关的癌症，如晚期或转移前列腺癌。本发明还提供了多种可用于检测和定量98P4B6和突变的98P4B6-相关蛋白质的免疫学试验。适当时，所述试验包括一种或多种能识别和结合98P4B6-相关蛋白质的98P4B6抗体。这些试验在本领域众所周知的多种免疫学试验，包括但不限于多种类型的放射免疫测定、酶联免疫吸附试验(ELISA)、酶联免疫荧光试验(ELIFA)等中进行。本发明的免疫学非-抗体试验还包括T细胞免疫原性试验(抑制或刺激)以及主要组织相容性复合物(MHC)结合试验。另外，本发明还提供了能检测前列腺癌和其它能表达98P4B6的癌症的免疫显象方法，包括但不限于使用经标记98P4B6抗体的放射闪烁照相显象法。所述试验在临床上可用于检测、监测和预测表达98P4B6的癌症，如前列腺癌。98P4B6抗体也可用于纯化98P4B6-相关蛋白质和分离98P4B6同系物和相关分子的方法中。例如，纯化98P4B6-相关蛋白质的方法包括在允许98P4B6抗体与98P4B6-相关蛋白质结合的条件下，将已与固体基质偶联的98P4B6抗体与含有98P4B6-相关蛋白质的裂解液或其它溶液一起保温；洗涤固体基质以清除杂质；从偶联的抗体上洗脱98P4B6-相关蛋白质。本发明的98P4B6抗体的其它用途包括产生模拟98P4B6蛋白的抗-独特型抗体。多种制备抗体的方法是本领域众所周知的。例如，通过用分离或免疫偶联形式的98P4B6-相关蛋白质、肽或片段免疫适当的哺乳动物宿主，即可制备抗体(AntibodiesALaboratoryManual，CSHPress，Eds.，Harlow，andLane(1988)；Harlow，Antibodies，ColdSpringHarborPress，NY(1989))。另外，也可使用98P4B6的融合蛋白，如98P4B6GST-融合蛋白。在具体的实施方案中，先产生含有图2或图3的全部或大部分氨基酸序列的GST融合蛋白，再将其用作免疫原以产生适当的抗体。在另一个实施方案中，合成98P4B6-相关蛋白质并将其用作免疫原。另外，使用本领域已知的裸DNA免疫技术(含或不含纯化的98P4B6-相关蛋白质或表达98P4B6的细胞)以产生针对编码的免疫原的免疫应答(有关评述可参见Donnellyetal.，1997，Ann.Rev.Immunol.15617-648)。可以分析图2或图3所示的98P4B6蛋白氨基酸序列，以选择出98P4B6蛋白的特定区域用于产生抗体。例如，使用98P4B6氨基酸序列的疏水性和亲水性分析，以鉴定出98P4B6结构中的亲水性区域。使用本领域已知的多种其它方法，可以容易地鉴定出显示出免疫原结构的98P4B6蛋白区域以及其它区域和结构域，所述方法如Chou-Fasman，Gamier-Robson，Kyte-Doolittle，Eisenberg，Karplus-Schultz或Jameson-Wolf分析。使用Hopp，T.P.andWoods，K.R.，1981，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.783824-3828的方法，可以产生亲水性分布图。使用Kyte，J.andDoolittle，R.F.，1982，J.Mol.Biol.157105-132的方法，可以产生亲/疏水性分布图。使用JaninJ.，1979，Nature277491-492的方法，可以产生可及残基百分比(％)分布图。使用BhaskaranR.，PonnuswamyP.K.，1988，Int.J.Pept.ProteinRes.32242-255的方法，可以产生平均柔性分布图。使用Deleage，G.，RouxB.，1987，ProteinEngineering1289-294的方法，可以产生β-转角分布图。因此，由这些程序或方法中的任一种鉴定出的每个区域都落入本发明的范围内。本文提供的实施例将进一步阐明产生98P4B6抗体的方法。制备用作免疫原的蛋白质或多肽的方法是本领域众所周知的。制备蛋白质与载体，如BSA、KLH或其它载体蛋白质的免疫原性偶联物的方法也是本领域众所周知的。在一些情况下，使用例如碳二亚胺试剂进行直接偶联；在其它情况下，诸如PierceChemicalCo.，Rockford，IL提供的连接试剂是有效的。经常通过在适当长的时间内注射并使用适当的佐剂来施用98P4B6免疫原，这一点是本领域技术人员可以理解的。在免疫程序中，可以检测抗体滴度以测定是否形成了足够量的抗体。通过多种本领域众所周知的方法可以产生98P4B6单克隆抗体。例如，使用Kohler和Milstein的标准杂交瘤技术或公知的无限增殖化产生抗体的B细胞的修饰技术，制备能分泌所需单克隆抗体的无限增殖细胞系。通过抗原为98P4B6-相关蛋白质的免疫测定筛选出能分泌所需抗体的无限增殖细胞系。当鉴定出适当的无限增殖细胞培养物时，可以扩充细胞，并从体外培养物或腹水中产生抗体。也可以通过重组方法产生本发明的抗体或片段。也可以在多种来源的嵌合或互补决定区(CDR)移植抗体中产生与98P4B6蛋白的所需区域特异性结合的区域。也可以产生人源化或人98P4B6抗体，并优选将它们用于治疗目的。通过用一个或多个非人抗体CDR取代相应的人抗体序列，从而使鼠和其它非人抗体人源化的方法是众所周知的(参见例如Jonesetal，1986，Nature321522-525；Riechmannetal.，1988，Nature332323-327；Verhoeyenetal.，1988，Science2391534-1536)。也参见Carteretal.，1993，Proc.Natl.Acad.Sci.USA894285和Simsetal.，1993，J.Immunol.1512296。产生完整人单克隆抗体的方法包括噬菌体展示和转基因法(有关评述可参见Vaughanetal.，1998，NatureBiotechnology16535-539)。使用利用了大型人Ig基因组合文库(即噬菌体展示)的克隆技术，可以产生完整的人98P4B6单克隆抗体(GriffithsandHoogenboom，Buildinganinvitroimmunesystemhumanantibodiesfromphagedisplaylibraries.InProteinEngineeringofAntibodyMoleculesforProphylacticandTherapeuticApplicationsinMan.Clark，M.(Ed.)，NottinghamAcademic，pp45-64(1993)；BurtonandBarbas，HumanAntibodiesfromcombinatoriallibraries.Id.，pp65-82)。按照1997年12月3日公开的Kucherlapati和Jakobovits等的PCT专利申请W098/24893所述，使用经基因工程改造后含有人免疫球蛋白基因座的转基因小鼠也可以制备完整的人98P4B6单克隆抗体(也可参见Jakobovits，1998，Exp.Opin.Invest.Drugs7(4)607-614；2000年12月19日颁布的美国专利6,162,963；2000年11月12日颁布的6,150,584；和2000年9月5日颁布的6,114,598)。该方法避免了噬菌体展示技术所需的体外操作，并能有效产生高亲和性的真正的人抗体。适当时，使用98P4B6-相关蛋白质、表达98P4B6的细胞或其提取物，通过多种众所周知的方法，包括Western印迹、免疫沉淀、ELISA和FACS分析确定98P4B6抗体与98P4B6-相关蛋白质的反应性。98P4B6抗体或其片段可被可测标记标记或与第二种分子偶联。适当的可测标记包括但不限于放射性同位素、荧光化合物、生物发光化合物、化学发光化合物、金属螯合剂或酶。另外，使用本领域公知的方法产生特异于两个或多个98P4B6表位的双-特异性抗体。通过本领域已知的交联技术也可以产生同二聚体抗体(例如Wolffetal.，CancerRes.532560-2565)。V.)98P4B6细胞免疫反应T细胞识别抗原的机理已被描述。本发明的有效肽表位疫苗组合物能在世界种群范围内的很多种族中诱导治疗或预防性的免疫反应。为了理解本发明的组合物诱导细胞免疫反应的数值和效力，本文提供了与免疫学相关的技术的简单评述。将HLA分子和肽抗原的复合物用作被HLA-受限的T细胞识别的配体(Buus，S.etal.，Cell471071，1986；Babbitt，B.P.etal，Nature317359，1985；Townsend，A.andBodmer，H.，Annu.Rev.Immunol.7601，1989；Germain，R.N.，Annu.Rev.Immunol.11403，1993)。通过研究单个氨基酸被取代的抗原类似物并测序内源性结合、天然加工的肽，鉴定出对应于特异性结合HLA抗原分子所需基元的关键残基，并示于表IV(参见例如Southwood，etal，J.Immunol.1603363，1998；Rammensee，etal，Immunogenetics41178，1995；Rammenseeetal，SYFPEITHI，accessviaWorldWideWebatURL(134.2.96.221/scripts.hlaserver.dll/home.htm)；Sette，A.andSidney，J.Curr.Opin.Immunol.10478，1998；Engelhard，V.H.，Curr.Opin.Immunol.613，1994；Sette，A.andGrey，H.M.，Curr.Opin.Immunol.479，1992；Sinigaglia，F.andHammer，J.Curr.Biol.652，1994；Ruppertetal.，Cell74929-937，1993；Kondoetal.，J.Immunol.1554307-4312，1995；Sidneyetal.，J.Immunol.1573480-3490，1996；Sidneyetal.，HumanImmunol4579-93，1996；Sette，A.andSidney，J.Immunogenetics1999Nov，50(3-4)201-12，Review)。另外，对HLA-肽复合物的X-射线晶体学分析揭示出HLA分子的肽结合裂缝/沟内的袋，它以等位基因-特异性的方式容纳肽配体携有的残基，这些残基反过来决定了含有这些残基的肽的HLA结合能力(参见例如Madden，D.R.Annu.Rev.Immunol.13587，1995；Smith，etal.，Immunity4203，1996；Fremontetal，Immunity8305，1998；Sternetal，Structure2245，1994；Jones，EY.Curr.Opin.Immunol975，1997；Brown，J.H.etal.，Nature36433，1993；Guo，H.C.etal，Proc.Natl.Acad.Sci.USA908053，1993；Guo，H.C.etal，Nature360364，1992；Silver，M.L.etal.，Nature360367，1992；Matsumura，M.etal，Science257927，1992；Maddenetal，Cell701035，1992；Fremont，D.H.etal，Science257919，1992；Saper，M.A.，Bjorkman，P.J.andWiley，D.C.，J.Mol.Biol.219277，1991.)。因此，I类和II类等位基因-特异性HLA结合基元或I类或II类超基元的定义能够鉴定出蛋白质内与结合特定HLA抗原有关的区域。因此，通过鉴定HLA基元的过程，已鉴定出基于表位的候选疫苗；通过HLA-肽结合试验可进一步评价候选疫苗，以测定表位及其相应HLA分子的结合亲和性和/或结合时间。可进行其它的确证工作，从而在这些候选疫苗中选择出在种群覆盖和/或免疫原性方面具有优选特性的表位。可利用多种策略评价细胞免疫原性，包括1)评价得自正常个体的原代T细胞培养物(参见例如Wentworth，P.A.etal，MolImmunol32603，1995；Celis，E.etal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA912105，1994；Tsai，V.etal.，J.Immunol.1581796，1997；Kawashima，I.etal.，HumanImmunol591，1998)。该方法包括在体外，在存在抗原呈递细胞时，用受试肽刺激得自正常受试者的外周血淋巴细胞达几周时间。特异于所述肽的T细胞在此时间内被激活，使用例如涉及到肽致敏靶细胞的淋巴因子-或释放试验可以检测所述T细胞。2)免疫HLA转基因小鼠(参见例如Wentworth，P.A.etal.，J.Immunol.2697，1996；Wentworth，P.A.etal，Int.Immunol8651，1996；Alexander，J.etal，J.Immunol.1594753，1997)。例如，在所述方法中，将处于不完全弗氏佐剂中的肽皮下施用于HLA转基因小鼠。免疫几周后，取出脾细胞，在受试肽的存在下体外培养脾细胞约1周。使用例如涉及到肽致敏靶细胞和表达内源产生之抗原的靶细胞的释放试验检测肽-特异性T细胞。3)阐明经有效免疫接种的免疫个体和/或慢性病患者的回忆T细胞反应(参见例如Rehermann，B.etal.，J.Exp.Med.1811047，1995；Doolan，D.L.etal，Immunity797，1997；Bertoni，R.etal.，J.Clin.Invest.100503，1997；Threlkeld，S.C.etal.，J.Immunol.1591648，1997；Diepolder，H.M.etal.，J.Virol.716011，1997)。因此，通过培养PBL检测回忆反应，所述PBL得自因疾病而暴露于抗原，因而产生了“自然”免疫应答的受试者，或得自已进行过针对该抗原的免疫接种的患者。在受试肽与抗原呈递细胞(APC)的存在下，在体外将受试者的PBL培养1-2周以激活“记忆”T细胞(与“原初”T细胞相比)。在培养结束时，使用例如涉及到肽致敏靶、T细胞增殖或淋巴因子释放的释放试验检测T细胞活性。VI.)98P4B6转基因动物也可以使用编码98P4B6-相关蛋白质的核酸产生转基因动物或“敲除”动物，所述动物反过来可用于开发和筛选在治疗上有用的试剂。根据已建立的技术，可以使用编码98P4B6的cDNA克隆编码98P4B6的基因组DNA。然后将克隆的基因组序列用于产生转基因动物，所述动物含有表达编码98P4B6之DNA的细胞。产生转基因动物，特别是诸如小鼠或大鼠之类的动物的方法是本领域的常规技术，其描述于例如1988年4月12日颁布的美国专利4,736,866和1989年9月26日颁布的美国专利4,870,009。通常，特定的细胞成为掺入组织-特异性增强子的98P4B6转基因的目标。可以使用包括一拷贝编码98P4B6的转基因的转基因动物来检查编码98P4B6的DNA表达增加所起的作用。所述动物可用作测试动物，用于检测据认为可防止动物遭受与所述DNA过表达有关的病理学疾病的试剂。根据本发明的此方面，用试剂治疗动物，与携有转基因的未治疗动物相比，病理学疾病发病率的降低可表示对病理学疾病的潜在治疗性干预。或者，可以使用98P4B6的非-人同系物来构建98P4B6“敲除”动物，作为编码98P4B6的内源性基因和导入动物胚胎细胞中的、编码98P4B6的经改变基因组DNA之间同源重组的结果，所述动物具有缺损的或经改变的编码98P4B6的基因。例如，可以根据已建立的技术，使用编码98P4B6的cDNA来克隆编码98P4B6的基因组DNA。编码98P4B6的基因组DNA的一部分可以被缺失或被另一种基因，如编码可用于监测整合的选择标记的基因所取代。通常，载体(的5’和3’末端)包括几千个碱基的未改变侧翼DNA(有关同源重组载体的描述，可参见例如ThomasandCapecchi，Cell，51503(1987))。将载体导入胚胎干细胞系(例如通过电穿孔)，选择其中的导入DNA已与内源性DNA发生同源重组的细胞(Lietal.，Cell，69915(1992))。然后将选定的细胞注射至动物(如小鼠或大鼠)的胚泡中以形成聚集嵌合体(参见例如Bradley，inTeratocarcinomasandEmbryonicStemCellsAPracticalApproach.E.J.Robertson，ed.(IRL，Oxford，1987)，pp.113-152)。然后将嵌合胚胎植入适当的假孕雌性养育动物体内，胚胎最终只能长成“敲除”动物。通过标准技术可鉴定出生殖细胞中携有同源重组DNA的子代，将其用于繁殖动物，其中动物的所有细胞都含有经同源重组的DNA。例如，敲除动物的特征在于能够防御某些病理学疾病，或因缺乏98P4B6多肽而产生病理学疾病。VII.)检测98P4B6的方法本发明的另一方面涉及检测98P4B6多核苷酸和98P4B6-相关蛋白质的方法，以及鉴定表达98P4B6之细胞的方法。98P4B6的表达分布图使其成为转移疾病的诊断标记。因此，98P4B6基因产物的状况所提供的信息可用于预测多种因素，包括对晚期疾病的易感性、发展速率和/或肿瘤攻击力。如本文所详细讨论的，可通过本领域众所周知的多种方法分析患者样品中的98P4B6基因产物状况，所述方法包括免疫组化分析、包括原位杂交的多种Northern印迹技术、(例如在激光-捕获微-解剖样品上进行的)RT-PCR分析、Western印迹分析和组织阵列分析。更特别地，本发明提供了检测生物样品，如血清、骨、前列腺和其它组织、尿、精液、细胞制品等中的98P4B6多核苷酸的试验。可测的98P4B6多核苷酸包括例如98P4B6基因或其片段、98P4B6mRNA、可选择的剪接变体98P4B6mRNA、和含有98P4B6多核苷酸的重组DNA或RNA分子。多种扩增98P4B6多核苷酸和/或检测其存在的方法是本领域众所周知的，可用于本发明此方面的实践中。在一个实施方案中，检测生物样品中的98P4B6mRNA的方法包括使用至少一个引物通过逆转录产生所述样品的cDNA；使用98P4B6多核苷酸作为有义和反义引物扩增所产生的cDNA，以扩增出98P4B6cDNA；检测所扩增的98P4B6cDNA的存在。任选测定扩增的98P4B6cDNA的序列。在另一个实施方案中，检测生物样品中98P4B6基因的方法包括首先分离样品的基因组DNA；使用98P4B6多核苷酸作为有义和反义引物扩增分离的基因组DNA；并检测扩增的98P4B6基因的存在。可由98P4B6核苷酸序列(参见例如图2)设计出任何数目的适当有义和反义探针组合，并将它们用于此目的。本发明还提供了检测组织或其它生物样品，如血清、精液、骨、前列腺、尿、细胞制品等中是否存在98P4B6蛋白的试验。检测98P4B6-相关蛋白质的方法也是众所周知的，包括例如免疫沉淀、免疫组化分析、Western印迹分析、分子结合试验、ELISA、ELIFA等。例如，检测生物样品中98P4B6-相关蛋白质的存在的方法包括首先使样品与98P4B6抗体、其98P4B6-反应片段、或含有98P4B6抗体的抗原-结合区域的重组蛋白质接触；然后检测样品中98P4B6-相关蛋白质的结合。鉴定表达98P4B6的细胞的方法也落入本发明的范围。在一个实施方案中，鉴定表达98P4B6基因之细胞的试验包括检测细胞中98P4B6mRNA的存在。检测细胞中的特定mRNA的方法是众所周知的，包括例如使用互补DNA探针的杂交试验(如使用经标记98P4B6核糖探针的原位杂交、Northern印迹和相关技术)，以及多种核酸扩增试验(如使用98P4B6特异性互补引物的RT-PCR和其它扩增型检测法，如分支DNA、SISBA、TMA等)。或者，鉴定表达98P4B6基因之细胞的试验包括检测细胞中或由细胞分泌的98P4B6-相关蛋白质的存在。多种检测蛋白质的方法是本领域众所周知的，可用于检测98P4B6-相关蛋白质和表达98P4B6-相关蛋白质的细胞。98P4B6表达分析也可用作鉴定和评价调制98P4B6基因表达之药剂的工具。例如，98P4B6表达在前列腺癌中显著上调，98P4B6在表I所列组织的癌症中表达。鉴定能抑制癌症细胞中的98P4B6表达或过表达的分子或生物试剂具有治疗价值。例如，通过使用经RT-PCR、核酸杂交或抗体结合定量98P4B6表达的筛选，即可鉴定出所述药剂。VIII.)监测98P4B6-相关基因及其产物之状态的方法已知癌症发生是一个多步骤的过程，其中细胞生长逐渐被异常调节，细胞由正常的生理状态发展成为前癌状态，然后发展成为癌症状态(参见例如Alersetal.，LabInvest.77(5)437-438(1997)andIsaacsetal.，CancerSurv.2319-32(1995))。在此上下文中，在生物样品中查找被异常调节的细胞生长的证据(如癌症中的异常98P4B6表达)能够在诸如癌症的病理学状态发展成为治疗选择更加局限和或预测较差的阶段之前早期检测出所述异常生理状态。在所述查找过程中，可将例如感兴趣生物样品中的98P4B6状态与相应正常样品(例如得自该个体或另一个未受病理学影响的个体的样品)中的98P4B6状态相比较。生物样品中98P4B6状态的改变(与正常样品相比)提供了细胞生长被异常调节的证据。除了使用未受病理学影响的生物样品作为正常样品外，也可以使用预定的标准值，如预定的正常mRNA表达水平(参见例如Greveretal.，J.Comp.Neurol.1996Dec9；376(2)306-14和美国专利5,837,501)来比较样品中的98P4B6状态。根据为其领域所接受的含义使用此上下文中的术语“状态”，该术语指的是基因及其产物的情况或状态。通常，本领域技术人员使用多个参数评价基因及其产物的情况或状态。所述参数包括但不限于基因产物表达的位置(包括表达98P4B6的细胞的位置)和水平，以及表达的基因产物(如98P4B6mRNA、多核苷酸和多肽)的生物活性。一般说来，98P4B6状态的改变包括98P4B6和/或表达98P4B6之细胞的位置的改变，和/或98P4B6mRNA和/或蛋白质表达的增加。通过多种本领域众所周知的方法，包括但不限于免疫组化分析、原位杂交、在激光捕获微-解剖样品上进行的RT-PCR分析、Western印迹分析和组织阵列分析可以分析样品中的98P4B6状态。评价98P4B6基因和基因产物之状态的一般方法可参见例如Ausubeletal于1995年编辑的CurrentProtocolsInMolecularBiology第2(Northern印迹)、4(Southern印迹)、15(免疫印迹)和18(PCR分析)单元。因此，通过本领域技术人员可利用的多种方法来评价生物样品中的98P4B6状态，所述方法包括但不限于基因组Southern分析(用于检查例如98P4B6基因中的微扰)、98P4B6mRNA的Northern分析和/或PCR分析(用于检查例如98P4B6mRNA多核苷酸序列或表达水平的变化)，以及Western和/或免疫组化分析(用于检查例如多肽序列的变化、样品中多肽定位的变化、98P4B6蛋白表达水平的变化和/或98P4B6蛋白与多肽结合配对物的结合的变化)。可测98P4B6多核苷酸包括例如98P4B6基因或其片段、98P4B6mRNA、可选择的剪接变体98P4B6mRNA、和含有98P4B6多核苷酸的重组DNA或RNA分子。98P4B6的表达分布图使其成为局部和/或转移疾病的诊断标记，并提供了有关生物样品生长或致癌潜能的信息。特别是，98P4B6的状态提供的信息可用于预测对特殊疾病时期、发展和/或肿瘤攻击性的易感性。本发明提供了测定98P4B6状态和诊断表达98P4B6之癌症，如表I所列组织的癌症的方法和试验。例如，由于相对于正常前列腺组织而言，前列腺癌和其它癌症中的98P4B6mRNA表达水平非常高，可以使用评价生物样品中98P4B6mRNA转录物或蛋白质水平的试验来诊断与98P4B6异常调节有关的疾病，所述试验可提供用于确定适当治疗选择的预测信息。98P4B6表达状态提供的信息包括发育异常细胞、前癌和癌症细胞的存在、时期和位置，能预测对各个疾病时期的易感性和/或评价肿瘤的攻击性。另外，98P4B6表达分布图使其可用作转移疾病的显象试剂。因此，本发明一方面涉及多种分子预测和诊断方法，所述方法可用于检查生物样品中的98P4B6状态，所述样品例如得自患有或怀疑患有特征在于异常调节的细胞生长的病理学，如癌症的个体。如上所述，通过本领域众所周知的多种方法可检查生物样品中的98P4B6状态。例如，通过评价样品中是否存在表达98P4B6的细胞(例如表达98P4B6mRNA或蛋白质的细胞)，即可检查取自身体特定位置的生物样品中的98P4B6状态。例如，由于生物样品中98P4B6状态的改变经常与异常调节的细胞生长有关，因此，当在通常不含有表达98P4B6的细胞的生物样品(如淋巴结)中发现所述细胞时，该检查即可提供细胞生长受异常调节的证据。具体地说，异常调节的细胞生长的一个标志是癌症细胞从最初的器官(如前列腺)转移至身体的不同区域(如淋巴结)。在此上下文中，受异常调节的细胞生长的证据是重要的，因为在大多数前列腺癌患者中可以检测到隐藏的淋巴结转移，所述转移与已知的疾病进展预测因子有关(参见例如Murphyetal.，Prostate42(4)315-317(2000)；Suetal.，Semin.Surg.Oncol.18(1)17-28(2000)andFreemanetal.，JUrol1995Aug154(2Pt1)474-8)。一方面，本发明提供了通过测定得自怀疑患有与异常调节细胞生长有关之疾病(如增生或癌症)的个体的细胞所表达98P4B6基因产物的状态，然后将所测定的状态与相应的正常样品中的98P4B6基因产物状态比较，从而监测98P4B6基因产物的方法。相对于正常样品而言，受试样品中存在异常98P4B6基因产物提供了个体细胞内存在受异常调节的细胞生长的指示。另一方面，本发明提供了可用于测定个体中是否存在癌症的试验，其包括检测受试细胞或组织样品中98P4B6mRNA或蛋白质表达相对于相应正常细胞或组织表达水平而言的显著增加。例如，可评价包括但不限于表I所列组织中是否存在98P4B6mRNA。任何这些组织中显著98P4B6表达的存在可用于表示癌症的出现、存在和/或严重性，因为相应的正常组织不表达或仅表达较低水平的98P4B6mRNA。在相关实施方案中，在蛋白质水平而不是核酸水平上测定98P4B6状态。例如，所述方法包括测定受试组织样品中由细胞表达的98P4B6蛋白水平，将所测定的水平与相应正常样品中表达的98P4B6水平相比较。在一个实施方案中，使用例如免疫组化法评价98P4B6蛋白的存在。可以在针对此目的的本领域众所周知的多种试验形式中使用能检测98P4B6蛋白表达的98P4B6抗体或结合配对物。在另一个实施方案中，可评价生物样品中98P4B6核苷酸和氨基酸序列的状态以鉴定出这些分子结构中的微扰。所述微扰包括插入、缺失、取代等。所述评价是有用的，因为能在大量与生长被异常调节的表型有关的蛋白质中观察到核苷酸和氨基酸序列中的微扰(参见例如Marrogietal.，1999，J.Cutan.Pathoi.26(8)369-378)。例如，98P4B6序列中的突变可以表示肿瘤的存在或加强。因此，所述试验具有诊断和预测的价值，其中98P4B6的突变表示功能的潜在损失或肿瘤生长的增加。多种可用于观察核苷酸和氨基酸序列中的微扰的试验是本领域众所周知的。例如，通过本文所讨论的Northern、Southern、Western、PCR和DNA测序法可观察到98P4B6基因产物的核酸或氨基酸序列的大小和结构。另外，其它可用于观察核苷酸和氨基酸序列中的微扰的方法，如单链构象多态性分析也是本领域众所周知的(参见例如1999年9月7日颁布的美国专利5,382,510和1995年1月17日颁布的5,952,170)。另外，可以检查生物样品中98P4B6基因的甲基化状态。基因5’调节区中CpG岛的异常脱甲基化和/或过度甲基化经常发生于无限增殖化和转化细胞中，并可改变多种基因的表达。例如，pi-类谷胱甘肽S-转移酶(在正常前列腺中表达但在＞90％的前列腺癌中不表达的蛋白质)的启动子过度甲基化似乎能永久地沉默该基因的转录，并且是前列腺癌中最经常被检测到的基因组改变(DeMarzoetal.，Am.J.Pathol.155(6)1985-1992(1999))。另外，该改变存在于至少70％高级别的前列腺上皮内肿瘤(PIN)中(Brooksetal，CancerEpidemiol.BiomarkersPrev.，1998，7531-536)。在另一个例子中，通过脱氧-氮胞苷诱导类淋巴母细胞中的LAGE-1肿瘤特异性基因(在正常前列腺中不表达，但在25-50％的前列腺癌中表达)的表达，暗示肿瘤表达是脱甲基化引起的(Letheetal.，Int.J.Cancer76(6)903-908(1998))。多种检查基因甲基化状态的试验是本领域众所周知的。例如，可以在Southem杂交法中使用对甲基化敏感的限制性酶来评价CpG岛的甲基化状态，所述酶不能裂解含有甲基化CpG位点的序列。另外，MSP(甲基化特异性PCR)可快速描绘给定基因的CpG岛中存在的所有CpG位点的甲基化状态。该方法包括起初用亚硫酸氢钠(可将所有未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶)修饰DNA，接着使用特异于甲基化对非甲基化DNA的引物进行扩增。涉及甲基化干预的方法也可参见例如CurrentProtocolsInMolecularBiology，Unit12，FrederickM.Ausubeletal.eds.，1995。基因扩增是另一种可用于评价98P4B6状态的方法。可基于本文提供的序列，使用适当的经标记探针，直接通过例如常规的Southern印迹或定量mRNA转录的Northern印迹(Thomas，1980，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，775201-5205)、点印迹(DNA分析)或原位杂交来测定样品中的基因扩增。或者，使用能识别特异性双链体，包括DNA双链体、RNA双链体和DNA-RNA杂合双链体或DNA-蛋白质双链体的抗体。反过来标记抗体，进行双链体与表面结合的试验，使得通过表面双链体的形成，可以检测与双链体结合的抗体的存在。使用例如Northern、点印迹或RT-PCR分析检测98P4B6表达，可以方便地分析出活检组织或外周血中是否存在癌细胞。RT-PCR可扩增的98P4B6mRNA的存在提供了存在癌症的指示。RT-PCR试验是本领域众所周知的。最近，外周血中肿瘤细胞的RT-PCR检测试验被评价，以用于多种人实体肿瘤的诊断和处理。在前列腺癌领域，所述试验包括用于检测表达PSA和PSM之细胞的RT-PCR试验(Verkaiketal.，1997，Urol.Res.25373-384；Ghosseinetal.，1995，J.Clin.Oncol.131195-2000；Hestonetal，1995，Clin.Chem.411687-1688)。本发明的另一方面是评价个体对处于发展中的癌症的易感性。在一个实施方案中，预测对癌症的易感性的方法包括检测组织样品中的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白，其存在表示对癌症易感，其中98P4B6mRNA表达的水平与易感性的程度相关。在具体实施方案中，检查前列腺或其它组织中是否存在98P4B6，样品中存在98P4B6表示对前列腺癌易感(或出现或存在前列腺肿瘤)。类似地，可以评价生物样品中98P4B6核苷酸和氨基酸序列的完整性以鉴定出这些分子结构中的微扰，如插入、缺失、取代等。样品中98P4B6基因产物内一种或多种微扰的存在表示对癌症的易感性(或肿瘤的出现或存在)。本发明还包括评价肿瘤攻击性的方法。在一个实施方案中，评价肿瘤攻击性的方法包括测定肿瘤细胞所表达的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白的水平，将所测定的水平与取自相同个体的相应正常组织或正常组织参照样品中表达的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白的水平相比较，其中相对于正常样品而言，肿瘤样品的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白表达水平显示出攻击性水平。在具体实施方案中，通过测定肿瘤细胞表达98P4B6的水平来评价肿瘤的攻击性，较高的表达水平表示肿瘤更具攻击性。另一个实施方案是评价生物样品中98P4B6核苷酸和氨基酸序列的完整性以鉴定出这些分子结构中的微扰，如插入、缺失、取代等。一种或多种微扰的存在表示肿瘤更具攻击性。本发明的另一个实施方案涉及观察个体的恶性肿瘤在整个时间内的发展的方法。在一个实施方案中，观察个体的恶性肿瘤在整个时间内的发展的方法包括测定肿瘤样品中的细胞所表达的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白的水平，将所测定的水平与在不同时间取自相同个体的等同组织样品中表达的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白的水平相比较，其中在整个时间内肿瘤样品中的98P4B6mRNA或98P4B6蛋白表达水平提供了有关癌症发展的信息。在具体实施方案中，通过测定肿瘤细胞中在整个时间内的98P4B6表达来评价癌症的发展进程，其中在整个时间内表达的增加表示癌症的发展。也可以评价生物样品中98P4B6核苷酸和氨基酸序列的完整性以鉴定出这些分子结构中的微扰，如插入、缺失、取代等，其中一种或多种微扰的存在表示癌症的发展。上述诊断方法可以与本领域已知的多种预测和诊断方法中的任何一种联合使用。例如，本发明的另一个实施方案涉及观察98P4B6基因和98P4B6基因产物的表达(或98P4B6基因和98P4B6基因产物中的微扰)与恶性肿瘤相关因子之间的一致性的方法，所述方法可用于诊断和预测组织样品状态。可以利用多种与恶性肿瘤相关的因子，例如恶性肿瘤相关基因的表达(如对前列腺癌等而言的PSA、PSCA和PSM表达)以及总体细胞学观察(参见例如Bockingetal.，1984，Anal.Quant.Cytol.6(2)74-88；Epstein，1995，Hum.Pathol.26(2)223-9；Thorsonetal.，1998，Mod.Pathol.11(6)543-51；Baisdenetal，1999，Am.J.Surg.Pathol.23(8)918-24)。例如，由于一套与疾病相符的特定因子的存在可提供对于诊断和预测组织样品状态而言至关重要的信息，因此，观察98P4B6基因和98P4B6基因产物的表达(或98P4B6基因和98P4B6基因产物中的微扰)与另一个恶性肿瘤相关因子之间的一致性的方法是有用的。在一个实施方案中，观察98P4B6基因和98P4B6基因产物的表达(或98P4B6基因和98P4B6基因产物中的微扰)与另一个恶性肿瘤相关因子之间的一致性的方法必需检测组织样品中98P4B6mRNA或蛋白质的过表达，检测组织样品中PSAmRNA或蛋白质的过表达(或PSCA或PSM表达)，和观察98P4B6mRNA或蛋白质与PSAmRNA或蛋白质过表达(或PSCA或PSM表达)之间的一致性。在具体实施方案中，检测前列腺组织中98P4B6和PSAmRNA的表达，其中样品中98P4B6和PSAmRNA过表达的一致性表示前列腺癌的存在，前列腺癌易感性或前列腺肿瘤的出现或状态。本文描述了检测和定量98P4B6mRNA或蛋白质表达的方法，标准的核酸和蛋白质检测和定量技术是本领域众所周知的。检测和定量98P4B6mRNA的标准方法包括使用经标记98P4B6核糖探针的原位杂交，使用98P4B6多核苷酸探针的Northern印迹和相关技术，使用98P4B6特异性引物的RT-PCR分析，和其它扩增型检测法，如分支DNA、SISBA、TMA等。在具体实施方案中，使用半-定量的RT-PCR检测和定量98P4B6mRNA表达。能扩增98P4B6的任何数目的引物都可用于此目的，包括但不限于本文具体描述的多种引物套。在具体实施方案中，可以在活检组织的免疫组化试验中使用与野生型98P4B6蛋白特异性反应的多克隆或单克隆抗体。IX.)鉴定与98P4B6相互作用的分子本文公开的98P4B6蛋白和核酸序列使本领域技术人员可以鉴定出与98P4B6相互作用的蛋白质、小分子和其它试剂，以及经由多种为本领域所接受的方法中的任一种被98P4B6激活的途径。例如，可以利用一种所谓的相互作用陷阱系统(也称为“双-杂合试验”)。在所述系统中，分子与介导报道基因表达的转录因子相互作用，并重建所述转录因子，由此测定报道基因的表达。其它系统通过重建真核转录激活物来鉴定体内蛋白质-蛋白质相互作用。参见例如1999年9月21日颁布的美国专利5,955,280；1999年7月20日颁布的5,925,523；1998年12月8日颁布的5,846,722和1999年12月21日颁布的6,004,746。有关基于基因组预测蛋白质功能的算法也是本领域已知的(参见例如Marcotte，etal.，Nature4024November1999，83-86)。或者可以筛选肽文库以鉴定与98P4B6蛋白序列相互作用的分子。在所述方法中，通过筛选编码随机或受控氨基酸集合的文库，鉴定出与98P4B6结合的肽。将文库编码的肽表达成噬菌体包被蛋白的融合蛋白，然后筛选与98P4B6蛋白结合的噬菌体颗粒。因此，无需先知道任何有关预期配体或受体分子结构的信息，也可鉴定出具有多种用途的肽，如治疗、预测或诊断试剂。可用于鉴定与98P4B6蛋白序列相互作用的分子的典型肽文库和筛选方法公开于例如1998年3月3日颁布的5,723,286和1998年3月31日颁布的5,733,731。或者，表达98P4B6的细胞系可用于鉴定由98P4B6介导的蛋白质-蛋白质相互作用。可使用免疫沉淀技术检测所述相互作用(参见例如HamiltonB.J.，etal.Biochem.Biophys.Res.Commun.1999，261646-51)。使用抗-98P4B6抗体可从表达98P4B6的细胞系中免疫沉淀98P4B6蛋白。或者，可在经改造后可表达98P4B6与His-tag的融合物(上述载体)的细胞系中使用抗His-tag抗体。通过诸如Western印迹、蛋白质的35S-甲硫氨酸标记、蛋白质微量测序、银染和二维凝胶电泳的方法，可以检测免疫沉淀复合物的蛋白质结合情况。通过所述筛选试验的相关实施方案即可鉴定出与98P4B6相互作用的小分子和配体。例如，可以鉴定出能妨碍蛋白质功能的小分子，包括能妨碍98P4B6介导磷酸化和去磷酸化、与DNA或RNA分子的相互作用(作为细胞周期调节、第二信使信号传导或肿瘤发生的指示)之能力的分子。类似地，鉴定出能调制98P4B6-相关离子通道、蛋白质泵或细胞通讯功能的小分子，并将它们用于治疗患有表达98P4B6之癌症的患者(参见例如Hille，B.，ionicChannelsofExcitableMembranes2ndEd.，SinauerAssoc.，Sunderland，MA，1992)。另外，基于其结合98P4B6和激活报道构建体的能力鉴定出调节98P4B6功能的配体。典型的方法讨论于例如1999年7月27日颁布的美国专利5,928,868，其包括形成杂合配体的方法，其中至少一个配体是小分子。在说明性的实施方案中，使用经改造可表达98P4B6与DNA-结合蛋白的融合蛋白的细胞共表达杂合配体/小分子和cDNA文库转录激活物蛋白质的融合蛋白。细胞还含有报道基因，在第一和第二融合蛋白彼此的近侧调节报道基因的表达，该事件仅当杂合配体结合两种杂合蛋白质上的靶位点时才会发生。选择表达报道基因的细胞，并鉴定未知的小分子或未知的配体。该方法提供了鉴定能激活或抑制98P4B6的调制剂的方法。本发明的实施方案包括筛选能与图2或图3所示98P4B6氨基酸序列相互作用的分子的方法，所述方法包括下述步骤使分子群体与98P4B6氨基酸序列接触，在有利于相互作用的条件下使分子群体与98P4B6氨基酸序列相互作用，测定与98P4B6氨基酸序列相互作用的分子的存在，然后将不与98P4B6氨基酸序列相互作用的分子同与98P4B6氨基酸序列相互作用的分子分开。在具体实施方案中，该方法进一步包括纯化、表征和鉴定与98P4B6氨基酸序列相互作用的分子。使用鉴定的分子调制98P4B6行使的功能。在优选实施方案中，98P4B6氨基酸序列与肽文库接触。X.)治疗方法和组合物将98P4B6鉴定为一般在有限的一套组织中表达，但也在前列腺癌和其它癌症中表达的蛋白质开发了多种治疗所述癌症的治疗方法。如本文所期望的那样，98P4B6能用作参与激活肿瘤-促进基因或抑制阻断肿瘤发生的基因的转录因子。因此，抑制98P4B6蛋白活性的治疗方法对患有表达98P4B6的癌症患者是有用的。这些治疗方法一般分为两类。一类包括多种抑制98P4B6蛋白与其结合配对物或其它蛋白质结合或缔合的方法。另一类包括多种抑制98P4B6基因转录或98P4B6mRNA翻译的方法。X.A.)抗-癌疫苗本发明提供了含有98P4B6-相关蛋白质或98P4B6-相关核酸的癌症疫苗。由于98P4B6的表达，癌症疫苗能防止和/或治疗表达98P4B6的癌症，而对非-靶组织的影响很小或无影响。在疫苗中使用能产生体液和/或细胞-介导的免疫应答的肿瘤抗原作为抗-癌疗法是本领域众所周知的，并且已用于使用人PSMA和啮齿动物PAP免疫原的前列腺癌疫苗中(Hodgeetal.，1995，Int.J.Cancer63231-237；Fongetal，1997，J.Immunol.1593113-3117)。通过利用98P4B6-相关蛋白质，或编码98P4B6的核酸分子和能表达和呈递98P4B6免疫原(一般含有多种抗体或T细胞表位)的重组载体，可以容易地实施该方法。本领域技术人员懂得多种传递免疫反应表位的疫苗系统是本领域已知的(参见例如Heryinetal.，AnnMed1999Feb31(1)66-78；Maruyamaetal.，CancerImmunolImmunother2000Jun49(3)123-32)。简单地说，所述的在哺乳动物中产生(例如体液和/或细胞-介导的)免疫应答的方法包括下述步骤将哺乳动物免疫系统暴露于免疫反应表位(如图3所示98P4B6蛋白或其类似物或同系物中存在的表位)，以使哺乳动物产生特异于该表位的免疫应答(例如产生特异性识别该表位的抗体)。在优选的方法中，98P4B6免疫原含有生物基元，参见例如表VIII-XXI和XXII-XLIX，或大小范围得自图5、图6、图7、图8和图9所示98P4B6的肽。可通过多种方法组合和传递完整的98P4B6蛋白，其免疫原性区域或其表位。所述疫苗组合物可包括例如脂肽(例如Vitiello，A.etal.，J.Clin.Invest.95341，1995)，包裹于聚(DL-丙交酯-共-乙交酯)(“PLG”)微球体中的肽组合物(参见例如Eldridge，etal.，Molec.Immunol.28287-294，1991；Alonsoetal.，Vaccine12299-306，1994；Jonesetal.，Vaccine13675-681，1995)，包含于免疫刺激复合物(ISCOMS)中的肽组合物(参见例如Takahashietal，Nature344873-875，1990；Huetal.，ClinExpImmunol.113235-243，1998)，多抗原肽系统(MAP)(参见例如Tam，J.P，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.855409-5413，1988；Tam，J.P.，J.Immunol.Methods19617-32，1996)，配制成多价肽的肽；用于弹道传递系统的肽，典型晶体化的肽，病毒传递载体(Perkus，M.E.etal.，InConceptsinvaccinedevelopment，Kaufmann，S.H.E.，ed.，p.379，1996；Chakrabarti，S.etal.，Nature320535，1986；Hu，S.L.etal.，Nature320537，1986；Kieny，M-P.etal.，AIDSBiolTechnology4790，1986；Top，F.H.etal.，J.InfectDis.124148，1971；Chanda，P.K.etal.，Virology175535，1990)，病毒或合成来源的颗粒(例如Kofier，N.etal.，J.Immunol.Methods.19225，1996；Eldridge，J.H.etal.，Sem.Hematol.3016，1993；Falo，L.D.，Jr.etal.，NatureMed.7649，1995)，佐剂(Warren，H.S.，Vogel，F.R.，andChedid，L.A.Annu.Rev.Immunol.4369，1986；Gupta，R.K.etal.，Vaccine11293，1993)，脂质体(Reddy，R.etal.，J.Immunol.1481585，1992；Rock，K.L.，Immunol.Today17131，1996)，或裸露的或吸附于颗粒的cDNA(Ulmer，J.B.etal.，Science2591745，1993；Robinson，H.L.，Hunt，L.A.，andWebster，R.G.，Vaccine11957，1993；Shiver，J.W.etal.，InConceptsinvaccinedevelopment，Kaufmann，S.H.E.，ed.，p.423，1996；Cease，K.B.，andBerzofsky，J.A.，Annu.Rev.Immunol.12923，1994andEldridge，J.H.etal.，Sem.Hemato.3016，1993)。也可以使用毒素-靶向传递技术，也已知为受体介导的靶向，如AvantImmunotherapeutics，Inc.(Needham，Massachusetts)的技术。对98P4B6-相关癌症的患者而言，本发明的疫苗组合物也可以与其它用于癌症的疗法，如外科手术、化疗、药物疗法、放疗等联合使用，包括与免疫佐剂，如IL-2、IL-12、GM-CSF等联合使用。细胞疫苗使用特殊算法即可测定CTL表位，以鉴定出98P4B6蛋白中与相应HLA等位基因结合的肽(参见例如表IV；EimerTMandEpimatrixTM，BrownUniversity(URLbrown.edu/Research/TB-HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html)；和BIMAS，(URLbimas.dcrt.nih.gov/；SYFPEITHIatURLsyfpeithi.bmi-heidelberg.com/)。在优选实施方案中，98P4B6免疫原含有一种或多种使用本领域众所周知的技术鉴定的氨基酸序列，如表VIII-XXI和XXII-XLIX所示的序列或被HLAI类基元/超基元特化的8，9，10或11个氨基酸的肽(如表IV(A)，表IV(D)或表IV(E))和/或含有HLAII类基元/超基元的至少9个氨基酸的肽(如表IV(B)或表IV(C))。本领域技术人员应懂得HLAI类结合沟必需封闭末端，使得只有特定大小范围的肽适合进入沟内并且被结合，通常，I类HLA表位的长度为8，9，10或11个氨基酸。相反，HLAII类结合沟必需开放末端，因此，约9个或更多个氨基酸的肽可以被HLAII类分子结合。由于HLAI类和II类之间结合沟的差异，HLAI类基元是长度特异性的，即I类基元的第2位是肽的氨基至羧基方向的第二个氨基酸。II类基元的氨基酸位置仅是相对于彼此而言的，而不是相对于整个肽而言的，即可以在携有基元之序列的氨基和/或羧基末端结合其它的氨基酸。HLAII类表位的长度经常为9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24或25个氨基酸，或长于25个氨基酸。基于抗体的疫苗多种在哺乳动物中产生免疫应答的方法是本领域已知的(例如作为产生杂交瘤的第一步)。在哺乳动物中产生免疫应答的方法包括将哺乳动物的免疫系统暴露于蛋白质(如98P4B6蛋白)上的免疫原性表位以产生免疫应答。典型的实施方案由在宿主中产生抗98P4B6免疫应答的方法组成，通过使宿主与足够量的至少一种98P4B6B细胞或细胞毒T-细胞表位或其类似物接触；至少间隔一段时间之后，使宿主与98P4B6B细胞或细胞毒T-细胞表位或其类似物再次-接触即可实施此方法。具体实施方案由产生抗98P4B6-相关蛋白质或人造多表位肽的免疫应答的方法组成，所述方法包括给人或另一种哺乳动物施用疫苗制品中包含的98P4B6免疫原(如98P4B6蛋白或其肽片段，98P4B6融合蛋白或类似物等)。通常，所述疫苗制品还含有适当的佐剂(参见例如美国专利6,146,635)或通用的辅助表位，如PADRETM肽(EpimmuneInc.，SanDiego，CA；参见例如Alexanderetal.，J.Immunol.2000164(3)；164(3)1625-1633；Alexanderetal.，Immunity19941(9)751-761andAlexanderetal.，Immunol.Res.199818(2)79-92)。另一种可选择的方法包括通过给个体的肌肉或皮肤体内施用DNA分子，在个体中产生抗98P4B6免疫原的免疫应答，所述DNA分子含有编码98P4B6免疫原的DNA序列，所述DNA序列与控制DNA序列表达的调节序列可操作相连；其中DNA分子被细胞摄取，DNA序列在细胞中表达，从而产生抗免疫原的免疫应答(参见例如美国专利5,962,428)。任选也施用基因疫苗促进剂，如阴离子脂质；皂苷；凝集素；雌激素化合物；羟化低级烷基；二甲基亚砜；和尿素。另外，为了产生针对靶抗原的应答，可以施用模拟98P4B6的抗独特型抗体。核酸疫苗本发明的疫苗组合物包括核酸-介导的疫苗。可以给患者施用编码本发明蛋白质的DNA或RNA。可使用基因免疫法产生针对表达98P4B6之癌症细胞的预防性或治疗性体液和细胞免疫应答。可以将含有编码98P4B6-相关蛋白质/免疫原的DNA和适当调节序列的构建体直接注射至个体的肌肉或皮肤，使肌肉或皮肤细胞摄取构建体，并表达编码的98P4B6蛋白/免疫原。或者，疫苗含有98P4B6-相关蛋白质。98P4B6-相关蛋白质免疫原的表达导致产生针对携有98P4B6蛋白之细胞的预防性或治疗性体液和细胞免疫力。可以使用多种本领域已知的预防和治疗性基因免疫技术(有关评述可参见国际互联网地址genweb.com公开的信息和参考文献)。基于核酸的传递描述于例如Wolffet.al.，Science2471465(1990)以及美国专利5,580,859、5,589,466、5,804,566、5,739,118、5,736,524、5,679,647和WO98/04720。基于DNA的传递技术的例子包括“裸露的DNA”、促进(bupivicaine、聚合物、肽-介导的)传递、阳离子脂质复合物和颗粒-介导(“基因枪”)或压力-介导的传递(参见例如美国专利5,922,687)。为了进行治疗或预防性免疫，可经由病毒或细菌载体表达本发明的蛋白质。可用于本发明实践的多种病毒基因传递系统包括但不限于痘苗病毒、禽痘病毒、金丝雀痘病毒、腺病毒、流感病毒、脊髓灰质炎病毒、腺-伴随病毒、慢病毒和新培斯病毒(参见例如Restifo，1996，Curr.Opin.Immunol.8658-663；TsangetalJ.Nat.CancerInst.87982-990(1995))。也可通过将编码98P4B6-相关蛋白质的裸露DNA导入患者(例如肌内或皮内)来利用非-病毒传递系统诱导抗-肿瘤应答。将痘苗病毒用作例如表达编码本发明肽的核苷酸序列的载体。通过导入宿主，重组痘苗病毒表达蛋白质免疫原性肽，籍此引发宿主免疫应答。用于免疫接种方案的痘苗病毒载体和方法描述于例如美国专利4,722,848。另一种载体是BCG(BacilleCalmetteGuerin)。BCG载体描述于Stoveretal.，Nature351456-460(1991)。根据本文的描述，多种可用于治疗性施用或免疫接种本发明肽的其它载体，例如腺和腺-伴随病毒载体、逆转录病毒载体、伤寒沙门氏菌载体、脱毒的炭疽毒素载体等对于本领域技术人员而言是显而易见的。因此，可使用基因传递系统传递98P4B6-相关核酸分子。在一个实施方案中，利用了全长人98P4B6cDNA。在另一个实施方案中，利用了编码特异性细胞毒T淋巴细胞(CTL)和/或抗体表位的98P4B6核酸分子。来自体内的疫苗可以利用多种来自体内的策略产生免疫应答。一种方法包括使用抗原呈递细胞(APC)，如树状细胞(DC)为患者的免疫系统呈递98P4B6抗原。树状细胞表达MHCI类和II类分子、B7共刺激物和IL-12，因此是高度特化的抗原呈递细胞。在前列腺癌中，用前列腺-特异性膜抗原(PSMA)肽脉冲的自身树状细胞被用于I期临床试验以刺激前列腺癌患者的免疫系统(Tjoaetal.，1996，Prostate2865-69；Murphyetal.，1996，Prostate29371-380)。因此，在MHCI类或MHCII类分子环境中，可使用树状细胞将98P4B6肽呈递给T细胞。在一个实施方案中，用能与MHCI类和/或II类分子结合的98P4B6肽脉冲自身树状细胞。在另一个实施方案中，用完整的98P4B6蛋白脉冲树状细胞。另一个实施方案包括使用多种本领域已知的工具载体，如腺病毒(Arthuretal.，1997，CancerGeneTher.417-25)、逆转录病毒(Hendersonetal.，1996，CancerRes.563763-3770)、慢病毒、腺-伴随病毒、DNA转染(Ribasetal.，1997，CancerRes.572865-2869)或得自肿瘤的RNA转染(Ashleyetal.，1997，J.Exp.Med.1861177-1182)对树状细胞中的98P4B6基因过表达进行改造。也可改造表达98P4B6的细胞以使其表达免疫调制剂，如GM-CSF并用作免疫剂。X.B.)98P4B6用作基于抗体之疗法的靶98P4B6是有吸引力的基于抗体之治疗策略的靶。本领域已知多种靶向细胞外和细胞内分子的抗体策略(参见例如补体和ADCC介导的杀伤以及内体的使用)。由于相对于相应的正常细胞而言，多种谱系的癌症细胞表达98P4B6，准备全身性施用98P4B6-免疫反应组合物，该组合物表现出极好的敏感性，未表现出由免疫反应组合物与非-靶器官和组织的结合导致的毒性、非-特异性和/或非-靶作用。与98P4B6结构域特异性反应的抗体作为与毒素或治疗剂的偶联物，或作为能抑制细胞增殖或功能的裸露抗体，可用于全身性治疗表达98P4B6的癌症。可将98P4B6抗体导入患者以使抗体与98P4B6结合并调制功能，如与结合配对物的相互作用，随后介导肿瘤细胞的破坏和/或抑制肿瘤细胞的生长。所述抗体发挥治疗作用的机理包括补体-介导的细胞裂解、依赖于抗体的细胞介导的细胞毒性、调制98P4B6的生理功能、抑制配体结合或信号转导途径、调制肿瘤细胞分化、改变肿瘤血管生成因子分布和/或细胞凋亡。本领域技术人员懂得可以使用抗体特异性靶向和结合免疫原性分子，例如图2或图3所示98P4B6序列的免疫原性区域。另外，本领域技术人员懂得抗体与细胞毒性剂的偶联是常规技术(参见例如Sleversetal.Blood93113678-3684(June1，1999))。例如，当通过使细胞毒性和/或治疗剂与特异于细胞所表达分子(如98P4B6)的抗体偶联而将它们直接传递至细胞时，细胞毒性剂将对所述细胞发挥其已知的生物学作用(即细胞毒性)。使用抗体-细胞毒性剂偶联物以杀死细胞的多种组合物和方法是本领域已知的。在癌症的上下文中，典型的方法必需给患有肿瘤的动物施用生物有效量的偶联物，所述偶联物含有与靶向剂(如抗-98P4B6抗体)连接的选定细胞毒性剂和/或治疗剂，所述靶向剂与表达的标记(如98P4B6)结合，易于结合或定位于细胞表面。典型的实施方案是将细胞毒性剂和/或治疗剂传递至表达98P4B6的细胞的方法，所述方法包括使细胞毒性剂与免疫特异性结合98P4B6表位的抗体偶联，并将细胞暴露于抗体-细胞毒性剂偶联物。另一个说明性的实施方案是治疗怀疑患有转移癌症的个体的方法，所述方法包括给所述个体非肠道施用药物组合物的步骤，所述组合物含有治疗有效量的与细胞毒性剂和/或治疗剂偶联的抗体。可根据多种已成功用于治疗其它类型的癌症的方法来进行使用抗-98P4B6抗体的癌症免疫疗法，所述癌症包括但不限于结肠癌(Arlenetal.，1998，Crit.Rev.Immunol.18133-138)，多发性骨髓瘤(Ozakietal.，1997，Blood903179-3186，Tsunenarietal.，1997，Blood902437-2444)，胃癌(Kasprzyketal.，1992，CancerRes.522771-2776)，B-细胞淋巴瘤(Funakoshietal.，1996，J.Immunother.EmphasisTumorImmunol.1993-101)，白血病(Zhongetal.，1996，Leuk.Res.20581-589)，结肠直肠癌(Mounetal.，1994，CancerRes.546160-6166；Veldersetal.，1995，CancerRes.554398-4403)和乳腺癌(Shepardetal.，1991，J.Clin.Immunol.11117-127)。一些治疗方法包括使裸露的抗体与毒素或放射性同位素偶联，如Y91或I131与抗-CD20抗体偶联(例如ZevalinTM，IDECPharmaceuficalsCorp.orBexxarTM，CoulterPharmaceuficals)，而其它治疗方法包括共同施用抗体和其它治疗剂，如同时施用HerceptinTM(trastuzumab)与paclitaxel(Genentech，Inc.)。抗体可与治疗剂偶联。例如，为了治疗前列腺癌，可以在施用98P4B6抗体的同时使用放疗、化疗或激素脱离疗法。另外，抗体可与毒素偶联，所述毒素如刺孢霉素(如MylotargTM，Wyeth-Ayerst，Madison，NJ，一种与抗-肿瘤抗生素刺孢霉素偶联的重组人源化IgG4K抗体)或美登木素生物碱(如基于taxane的肿瘤-激活前体药物，TAP，platform，ImmunoGen，Cambridge，MA，也可参见例如美国专利5，416,064)。尽管98P4B6抗体疗法可用于所有阶段的癌症，但抗体疗法特别适于晚期或转移癌症。对已接受一轮或多轮化疗的患者进行本发明的抗体疗法。或者，对未接受过化疗的患者进行本发明的抗体疗法与化疗或放疗方案。另外，抗体疗法能使相伴随的化疗剂量降低，对于不能很好耐受化疗药剂之毒性的患者更是如此。Fan等(CancerRes.534637-4642，1993)，Prewett等(InternationalJ.ofOnco.9217-224,1996)和Hancock等(CancerRes.514575-4580，1991)描述了多种抗体与化疗剂的联合使用。尽管98P4B6抗体疗法可用于所有阶段的癌症，但抗体疗法特别适于晚期或转移癌症。对已接受一轮或多轮化疗的患者进行本发明的抗体疗法。或者，对未接受过化疗的患者进行本发明的抗体疗法与化疗或放疗方案。另外，抗体疗法能使相伴随的化疗剂量降低，对于不能很好耐受化疗药剂之毒性的患者更是如此。优选使用肿瘤组织的免疫组化评价、定量98P4B6显象或其它能可靠表示98P4B6表达的存在和水平的技术来评价癌症患者中98P4B6表达的存在和水平。为此优选对肿瘤活检或手术样品进行免疫组化分析。对肿瘤组织进行免疫组化分析的方法是本领域众所周知的。治疗前列腺癌和其它癌症的抗-98P4B6单克隆抗体包括能引发强有力的抗肿瘤免疫应答或直接具有细胞毒性的单克隆抗体。在这一点上，抗-98P4B6单克隆抗体(mAb)能通过补体-介导的或依赖于抗体的细胞介导的细胞毒性(ADCC)机理引起肿瘤细胞裂解，这两种机理都需要免疫球蛋白分子的完整Fc部分，以与补体蛋白质上的效应细胞Fc受体位点相互作用。另外，对肿瘤生长直接发挥生物学作用的抗-98P4B6mAb可用于治疗表达98P4B6的癌症。直接细胞毒mAb的作用机理包括抑制细胞生长、调制细胞分化、调制肿瘤血管生成因子分布和诱导细胞凋亡。使用任何一种评价细胞死亡的体外试验，如ADCC、ADMMC、补体-介导的细胞裂解等来评价特定抗-98P4B6mAb发挥抗-肿瘤作用的机理，所述试验一般是本领域已知的。在一些患者中，使用鼠或其它非-人单克隆抗体，或人/小鼠嵌合mAb可诱导抗-非人抗体的中度至强烈的免疫应答。这会导致抗体从循环中被清除且效力降低。在大多数严重病例中，所述免疫应答可导致免疫复合物的广泛形成，所述复合物可潜在导致肾衰竭。因此，用于本发明的治疗方法的优选单克隆抗体是那些全人或人源化，并以高亲和性与靶98P4B6抗原特异性结合，但在患者中表现出低抗原性或无抗原性的单克隆抗体。本发明的治疗方法期望单独施用抗-98P4B6mAb以及联合或混合使用不同的mAb。所述mAb混合物由于含有靶向不同表位的mAb、利用不同效应物机理或直接联合细胞毒mAb与依赖免疫效应物功能性的mAb而具有某些优点。所述mAb组合可表现出协同治疗作用。另外，抗-98P4B6mAb可以与包括但不限于多种化学治疗剂、雄激素-阻断剂、免疫调制剂(如IL-2，GM-CSF)、外科手术或放疗的其它治疗形式相伴使用。可以施用“裸露”或未偶联形式的抗-98P4B6mAb，或者使治疗剂与所述mAb偶联。可经由任何能将抗体传递至肿瘤细胞的途径施用抗-98P4B6抗体制剂。给药途径包括但不限于静脉内、腹膜内、肌内、肿瘤内、皮内等。治疗一般包括经由可接受的给药途径，如静脉内注射(IV)重复施用抗-98P4B6抗体制品，剂量范围一般约为0.1，.2，.3，.4，.5，.6，.7，.8，.9，1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，15，20或25mg/kg体重。一般说来，每周10-1000mgmAb是有效的并且能被较好地耐受。基于用HerceptinTMmAb治疗转移的乳腺癌的临床经验，可接受的剂量方案是原始静脉内负荷剂量约为4mg/kg患者体重，接着，每周的静脉内剂量约为2mg/kg抗-98P4B6mAb制品。优选以90分钟或更长时间的输注施用原始负荷剂量。如果原始剂量能被较好地耐受，以30分钟或更长时间的输注施用周期维持剂量。本领域技术人员懂得多种因素可影响具体病例的理想剂量方案。所述因素包括例如所用Ab或mAb的结合亲和性和半寿期、患者中的98P4B6表达水平、循环流出98P4B6抗原的程度、所需的稳态抗体浓度水平、治疗频率和与本发明的治疗方法联合使用的化学治疗剂或其它药剂的影响、以及特定患者的健康状况。任选评价患者的给定样品中98P4B6的水平(例如循环98P4B6抗原和/或表达98P4B6的细胞的水平)，以辅助确定最有效的剂量方案等。所述评价也可用于治疗过程中的监测，并可用于与其它参数(如膀胱癌疗法中的尿细胞学和/或ImmunoCyt水平，或类似地，前列腺癌疗法中的血清PSA水平)的评价相结合来评价治疗是否成功。在抗-癌疗法中，抗-独特型抗-98P4B6抗体也可用作疫苗以引发针对表达98P4B6-相关蛋白质的细胞的免疫应答。特别是，产生抗-独特型抗体的方法是本领域众所周知的；可以容易地改动此方法以产生模拟98P4B6-相关蛋白质上的表位的抗-独特型抗-98P4B6抗体(参见例如Wagneretal.，1997，Hybridoma1633-40；Foonetal.，1995，J.Clin.Invest.96334-342；Herlynetal.，1996，CancerImmunol.Immunother.4365-76)。所述抗-独特型抗体可用于癌症疫苗策略。X.C.)98P4B6用作细胞免疫应答的靶本发明的其它实施方案是疫苗和制备疫苗的方法，所述疫苗含有免疫原性有效量的一种或多种本文所述的HLA-结合肽。另外，本发明的疫苗包含一种或多种所要求肽的组合物。肽可以单独存在于疫苗中。或者，肽可以作为含有多拷贝相同肽的同聚物存在，或作为与多种肽的异聚物存在。聚合物的优点是能增强免疫反应，当使用不同的肽表位组成聚合物时，还能诱导产生与病原体生物的不同抗原决定簇或免疫应答所靶向的肿瘤-相关肽反应的抗体和/或CTL。组合物可以是抗原的天然区域，通过例如重组或化学合成即可制备所述组合物。可与本发明疫苗一起使用的载体是本领域众所周知的，包括例如甲状腺球蛋白、如人血清白蛋白的白蛋白、破伤风类毒素、如聚L-赖氨酸和聚L-谷氨酸的聚氨基酸、流感病毒、乙肝病毒核心蛋白质等。疫苗可含有生理可耐受的(即可接受的)稀释剂，如水、或盐水，优选为磷酸缓冲盐水。疫苗一般还包括佐剂。如不完全弗氏佐剂、磷酸铝、氢氧化铝或明矾的佐剂是本领域众所周知的佐剂材料的例子。另外，如本文所公开的，通过使本发明的肽与脂质，如tripalmitoyl-S-甘油基半胱氨酰丝氨酰-丝氨酸(P3CSS)偶联，可以引发CTL反应。另外，已发现诸如含有合成的胞嘧啶-硫代磷酸化-鸟嘌呤(CpG)的寡核苷酸的佐剂可将CTL反应增强10至100倍(参见例如DavilaandCelis，J.Immunol.165539-547(2000))。通过经由注射、气溶胶、口服、经皮、经粘膜、胸膜内、鞘内或其它适当途径用本发明的肽组合物进行免疫接种，宿主的免疫系统通过产生大量特异于所需抗原的CTL和/或HTL对疫苗作出反应。结果，宿主至少对后来产生的表达或过表达98P4B6抗原的细胞产生了部分免疫力，或当抗原是肿瘤-相关抗原时，至少能获得一些治疗上的益处。在一些实施方案中，需要组合使用I类肽组分与能诱导或促进针对靶抗原的中和抗体和或辅助T细胞反应的组分。所述组合物的优选实施方案含有本发明的I类和II类表位。所述组合物的另一个可选择的实施方案含有本发明的I类和/或II类表位以及交叉反应的HTL表位，如PADRETM(Epimmune，SanDiego，CA)分子(描述于例如美国专利5,736,142)。本发明的疫苗也可包括抗原-呈递细胞(APC)，如树状细胞(DC)作为呈递本发明肽的载体。在活动化和收集树状细胞之后，可以在体外产生疫苗组合物，从而在体外进行树状细胞的荷载。例如，用例如根据本发明的小基因转染树状细胞，或用肽脉冲树状细胞。接着可以将树状细胞施用于患者以在体内引发免疫反应。无论是基于DNA或肽的疫苗组合物也可以与树状细胞活动化联合体内给药，从而在体内进行树状细胞的荷载。优选地，当选择包括在用于疫苗的多表位合成物中的表位阵列时，或选择包括在疫苗中和/或由核酸如小基因编码的离散表位时，采用下述原则。优选平衡下列原则的每一种以进行选择。包括在给定疫苗组合物的多个表位可以是，但不一定是获得表位的天然抗原中的邻近序列。1.)选择表位，所述表位经给药后可模拟经观察与肿瘤清除相关的免疫应答。对HLAI类而言，这包括来自至少一个肿瘤相关抗原(TAA)的3-4个表位。对HLAII类而言，采用类似的原理；由至少一个TAA再选择3-4个表位(参见例如Rosenbergetal.，Science2781447-1450)。来自一个TAA的表位可以与来自一个或多个其它TAA的表位联合使用，以生产靶向肿瘤的疫苗，所述肿瘤具有频繁表达的TAA的不同表达模式。2.)选择表位，所述表位具有已确定与免疫原性相关的必须的结合亲和性对HLAI类而言，IC50为500nM或更低，通常为200nM或更低；对II类而言，IC50为1000nM或更低。3.)选择足够的携有超基元的肽或足够的携有等位基因特异性基元的肽阵列来给予广泛的种群覆盖面。例如，优选具有至少80％的种群覆盖面。MonteCarlo分析，一种本领域已知的统计评估，可以被用于评估种群覆盖的范围或冗余。4.)当从癌症相关抗原中选择表位时，由于患者可以已产生对天然表位的耐受性，选择类似物通常是有益的。5.)特别相关的表位指的是“嵌套表位”。在给定肽序列至少两个表位的重叠处出现嵌套表位。嵌套肽序列可以包括B细胞、HLAI类和/或HLAII类表位。当提供嵌套表位时，一个通常的目的是每个序列提供最大数目的表位。因此，一方面是为了避免提供比肽序列中氨基端表位的氨基端和羧基端表位的羧基端长的肽。当提供一个多表位序列，例如含有嵌套表位的序列时，筛选序列以确定其不具有病理的或其它有害的生物特性通常是很重要的。6.)如果制备多表位蛋白质或制备小基因时，目的是产生最小的包含感兴趣表位的肽。这一原则与选择具有嵌套表位的肽时采用的原则如果不相同也是类似的。然而，对于人工的多表位肽，最小化的目的与在多表位蛋白质的表位间整合任意间隔序列的需要相平衡。例如，可以引入间隔氨基酸残基以避免连接表位(被免疫系统识别的表位，不存在于靶抗原中，且只由人工并列表位产生)，或辅助表位间的裂解，从而增强表位呈递。通常应当避免连接表位，因为接受者可能对非天然表位产生免疫应答。特别关注的是身为“决定簇表位”的连接表位。决定簇表位可能导致强烈的应答，从而使对其它表位的免疫应答减低或抑制。7.)当同一靶蛋白的多个变体的序列存在时，也可以基于它们的保守性选择潜在的肽表位。例如，保守性的原则可定义为，HLAI类结合肽的全序列或II类结合肽的整个9-聚体核心，在被评价特异性蛋白质抗原的指定比例的序列中保守。X.C.1.小基因疫苗可以使用多种不同的允许同时传递多个表位的方法。编码本发明的肽的核酸是本发明的特别有用的实施方案。根据前一部分列出的指南，优选在包含在小基因中的表位。优选的施用编码本发明肽的核酸的方式使用了编码含有一个或多个本发明表位的肽的小基因构建体。多表位小基因的应用如下文和Ishiokaetal，J.Immunol.1623915-3925，1999；An，L.andWhitton，J.L.，J.Virol.712292，1997；Thomson，S.A.etal，J.Immunol.157822，1996；Whitton，J.L.etal.，J.Virol.67348，1993；Hanke，R.etal，Vaccine16426，1998所述。例如，可对多表位DNA质粒进行改造，所述质粒编码得自98P4B6的携有超基元和/或基元的表位，PADRE_通用辅助T细胞表位或得自98P4B6的多个HTL表位(参见例如表VIII-XXI和XXII至XLIX)，以及内质网转运信号序列。疫苗也可以包括得自其它TAA的表位。多表位小基因的免疫原性可以在转基因小鼠中确定，以评估CTL诱导的针对受试表位的反应。另外，体内DNA编码的表位的免疫原性可以与特定CTL系针对用DNA质粒转染的靶细胞的体外反应相关联。因此，这些实验可以表明小基因用于1.)产生CTL应答以及2.)诱导的CTL识别表达编码表位的细胞。例如，为产生编码选择表位的DNA序列(小基因)以在人细胞中表达，表位的氨基酸序列可以被反向翻译。人密码子使用表可以用来指导每个氨基酸的密码子选择。这些编码表位的DNA序列可以直接连接，使得当被翻译时可产生连续的多肽序列。为了最优化表达和/或免疫原性，可以向小基因设计中加入附加的元件。可以反向翻译并包含在小基因序列中的氨基酸序列实例包括HLAI类表位，HLAII类表位，抗体表位，遍在蛋白化信号序列和/或内质网靶向信号。另外，CTL和HTL表位的HLA呈递可以通过包括合成的(例如多聚丙氨酸)或天然的与CTL或HTL表位相邻的侧翼序列来改善，这些含有表位的较大的肽也在本发明的范围内。可以通过装配编码小基因正链和负链的寡核苷酸将小基因序列转化为DNA。可以在适宜的条件下用众所周知的技术合成、磷酸化、纯化和退火重叠寡核苷酸(长30-100个碱基)。寡核苷酸的末端可以用例如T4DNA连接酶连接，这一合成的编码表位多肽的小基因可以克隆入一个所需的表达载体。优选将本领域技术人员已知的标准调节序列包括在载体中以确保靶细胞中的表达。需要一些载体元件具有下游克隆位点共小基因插入的启动子；有效终止转录的聚腺苷酸信号；大肠杆菌复制起点；以及大肠杆菌选择标记(如氨苄青霉素或卡那霉素抗性)。为此可采用多种启动子，例如人巨细胞病毒(hCMV)启动子，其它合适的启动子序列可参见例如美国专利5,580,859和5,589,466。可能需要其它的载体修饰来优化小基因的表达和免疫原性。在一些情况下，有效的基因表达需要内含子，一个或多个合成或天然的内含子可以掺入小基因的转录区域。为增加小基因的表达，也可以考虑包括mRNA稳定序列和在哺乳动物细胞中复制所需的序列。一旦选择了表达载体，将小基因克隆入启动子下游的多接头区域。将该质粒转化至适宜的大肠杆菌菌株，用标准技术制备DNA。用限制性图谱和DNA序列分析确定小基因的方向和DNA序列以及载体中包括的其它所有元件。含有正确质粒的细菌细胞可以保存为主细胞库和工作细胞库。另外，免疫刺激序列(ISS或CpG)似乎在DNA疫苗的免疫原性中起作用。如果需要提高免疫原性，这些序列可以包括在载体中，位于小基因编码序列的外部。在一些实施方案中，可以采用允许同时产生小基因编码表位和第二种蛋白质(包括在内以提高或降低免疫原性)的双顺反子表达载体。共表达可以有益地提高免疫应答的蛋白质或多肽的实例包括细胞因子(如IL-2，IL-12，GM-CSF)、细胞因子诱导分子(如LeIF)、共刺激分子，或对于HTL应答而言的pan-DR结合蛋白(PADRETM，Epimmune，SanDiego，CA)。辅助(HTL)表位可以与细胞内靶向信号相结合，并与表达的CTL表位分开表达；这允许指引HTL表位进入与CTL表位不同的细胞区室。必要时，这有助于HTL表位更有效地进入HLAII类途径，因此改善HTL诱导。与HTL或CTL诱导相反，通过共表达免疫抑制分子(例如TGF-β)特异性降低免疫应答在某些疾病中是有益的。可以通过例如在大肠杆菌中发酵然后纯化来制备治疗量的质粒。根据众所周知的技术，将工作细胞库的等分试样用于接种生长培养基，生长至在摇瓶或生物反应器中饱和。质粒DNA可以用标准的生物分离技术纯化，例如QIAGENInc.(Valencia，California)提供的固相阴离子交换树脂。如果需要，可以用凝胶电泳或其它方法从开环和线性形式中分离出超螺旋DNA。可以用多种制剂制备纯化的质粒DNA用于注射。最简单是将冷冻的DNA在无菌磷酸缓冲盐水(PBS)中重建。已知为“裸DNA”的该方法目前在临床试验中被用于肌内(IM)注射。为使小基因DNA疫苗的免疫治疗效果最大化，需要一个可选择的配制纯化质粒DNA的方法，已经描述了多种方法，也可以使用新技术。阳离子脂质、糖脂和融合脂质体也可以用在配方中(参见例如WO93/24640；Mannino&Gould-Fogerite，BioTechniques6(7)682(1988)；美国专利5,279,833；WO91/06309；和Felgner，etal，Proc.Nat′lAcad.Sci.USA847413(1987))。另外，总称为保护性、有活性的、非凝聚化合物(PINC)的肽和化合物可以与纯化的质粒DNA复合以影响例如稳定性、肌内分散或到达特定器官或细胞类型的变量。靶细胞致敏可以用作小基因编码的CTL表位的表达和HLAI类呈递的功能性分析。例如，将质粒DNA引入适宜用作标准CTL铬释放试验的靶的哺乳动物细胞系。所用转染方法将依赖于最终的配方。电穿孔可以用于“裸”DNA，而阳离子脂质允许介导体外转染。表达绿色荧光蛋白(GFP)的质粒可以被共转染以用荧光激活的细胞分选(FACS)富集转染的细胞。接着将这些细胞用铬-51()标记，并用作表位特异性CTL系的靶细胞；通过释放检测到的细胞裂解暗示小基因编码的CTL表位的产生和HLA呈递。可以用与评估HTL活性类似的方式评估HTL表位的表达。体内免疫原性是功能性测定小基因DNA配方的第二种方法。用DNA产物免疫表达合适的人HLA蛋白的转基因小鼠。给药剂量和途径依赖于配方(例如，PBS中的DNA用IM，与脂质复合的DNA用腹膜内(i.p.)注射)。免疫后21天，收集脾细胞并在编码每个被测定表位的肽的存在下重新刺激一周。然后，对于CTL效应细胞，用标准技术对荷载有肽的经标记的靶细胞的细胞裂解进行分析。用带有与小基因编码的表位相对应的肽表位的HLA致敏的靶细胞的裂解显示了DNA疫苗用于体内诱导CTL的功能。用类似方式在转基因小鼠内确定HLT表位的免疫原性。可选地，核酸可以用所述的弹道传递方式给药，例如美国专利5,204,253。采用这一技术，施用仅含有DNA的颗粒。在进一步可选的实施方案中，DNA可以被粘附在颗粒上，例如金粒。小基因也可以用现有技术中已知的其它细菌或病毒传递系统传递，例如，编码本发明表位的表达构建体可以掺入病毒载体，例如痘苗病毒。X.C.2.CTL肽与辅助肽的组合含有本发明CTL肽的疫苗组合物可以被修饰，例如类推以提供需要的属性，例如提高的血清半寿期、扩大的种群覆盖率或提高的免疫原性。例如，肽诱导CTL活性的能力可以通过将肽与含有至少一个可以诱导T辅助细胞应答的表位的序列连接而提高。尽管CTL肽可以直接与T辅助肽相连，通常是CTL表位/HTL表位偶联物通过间隔分子相互连接。间隔分子通常由相对较小的中性分子，如在生理条件下基本上不带电的氨基酸或氨基酸类似物组成。间隔分子通常选自例如Ala，Gly或其它非极性氨基酸或中性极性氨基酸的中性间隔分子。可以理解任选的间隔分子不必由相同的残基组成，因此可以是异源或同源的寡聚体。当出现时，间隔分子通常至少有1或2个残基，更常见的是3到6个残基，有时为10个或更多的残基。CTL肽表位可以与T辅助肽表位直接连接或通过间隔分子在CTL肽的氨基端或羧基端连接。免疫原性肽或T辅助肽的氨基端均可被酰化。在某些实施方案中，T辅助肽被大多数基因不同的种群中存在的T辅助细胞识别。这可以通过选择结合许多、大多数或所有的HLAII类分子的肽来完成。结合许多HLAII类分子的氨基酸的例子包括来自抗原的序列，例如破伤风类毒素830-843(QYIKANSKFIGITE；SEQIDNO97)、恶性疟原虫环孢子(CS)蛋白378-398(DIEKKIAKMEKASSVFNWNS；SEQIDNO98)以及链球菌18kD蛋白116-131(GAVDSILGGVATYGAA；SEQIDNO99)。其它的实例包括携有DR1-4-7超基元或任一DR3基元的肽。可选地，可以松弛HLA限制形式，用自然界中没有发现的氨基酸序列制备能够刺激T辅助淋巴细胞的合成肽(参见例如PCT公开号W95/07707)。这些被称为Pan-DR-结合表位的合成化合物(例如PADRETM，Epimmune，Inc.，SanDiego，CA)最优选被设计为与大多数HLA-DR(人HLAII类)分子结合。例如，pan-DR-结合表位肽具有通式XKXVAAWTLKAAX(SEQIDNO100)，这里″X″指环己基丙氨酸、苯丙氨酸或酪氨酸，以及为D-丙氨酸或L-丙氨酸，已经发现所述肽可以与大多数HLA-DR等位基因结合，并刺激大多数个体的T辅助淋巴细胞(不论其HLA类型如何)的应答。一个可选的pan-DR结合表位包含所有的“L”天然氨基酸，并可以以编码表位的核酸的形式提供。HTL肽表位也可以被修饰来改变其生物特性。例如，它们可以被修饰为包含D-氨基酸来提高它们对蛋白酶的抗性，因此延长了它们的血清半寿期。或它们可以与其它分子，例如脂质、蛋白质、糖类等偶联以提高它们的生物活性。例如，T辅助肽可以与一个或更多棕榈酸链的氨基或羧基端连接。X.C.3.CTL肽与T细胞引发剂的组合在一些实施方案中，也许需要将至少一种能引发B淋巴细胞或T淋巴细胞的成分包括在本发明的药物组合物中。已经确定脂质是一种可以在体内引发CTL的试剂。例如，棕榈酸残基可以连接到赖氨酸残基的ε-和α-氨基基团，然后经由例如一个或更多个连接残基例如Gly，Gly-Gly-，Ser，Ser-Ser等连接到免疫原性肽上。脂化肽可以直接在微胶粒或颗粒中，掺入脂质体，或在如不完全弗氏佐剂的佐剂中乳化以进行给药。在优选的实施方案中，一种显著有效的免疫原性组合物含有与Lys的ε-和α-氨基基团结合的棕榈酸，其通过接头，例如Ser-Ser，与免疫原性肽的氨基端结合。作为另一个脂质引发CTL应答的例子，大肠杆菌脂蛋白，例如与适合的肽共价连接的tripalmitoyl-S-甘油基半胱氨酰丝氨酰-丝氨酸(P3CSS)可以用来引发病毒特异性的CTL(参见例如Deresetal，Nature342561，1989)。本发明的肽可以与P3CSS偶联，例如，给予个体脂肽以特异性引发针对靶抗原的免疫应答。另外，由于中和抗体的诱导也可以用与P3CSS偶联的表位引发，两个这样的组合物可以联合使用从而更有效地引发体液和细胞介导的应答。X.C.4.含有用CTL和/或HTL肽脉冲的DC的疫苗组合物本发明的疫苗组合物实施方案包括给患者血液中的PBMC或从中分离的DC来自体外地施用携有表位的肽的混合物。可以使用有助于收集DC的药物，例如，ProgenipoietinTM(Pharmacia-Monsanto，St.Louis，MO)或GM-CSF/IL-4。在用肽脉冲DC后，以及再输注于患者之前，冲洗DC以去除未结合的肽。在该实施方案中，疫苗包含肽脉冲的DC，在其表面存在与HLA分子复合的脉冲肽表位。DC可以用肽混合物来自体外地脉冲，其中一些刺激针对98P4B6的CTL应答。任选地，辅助T细胞(HTL)肽，例如天然或人工松弛限制的HLAII类肽，可以包括在内以便于CTL应答。因此本发明的疫苗可用来治疗表达或过表达98P4B6的癌症。X.D.过继免疫疗法抗原性98P4B6相关肽也可用于来自体外地引发CTL和/或HTL应答，得到的CTL或HTL细胞可以用来治疗那些对其它常规形式的治疗没有反应，或对治疗性疫苗肽或本发明的核酸没有反应的肿瘤患者。通过在组织培养物中将患者的或遗传相容的CTL或HTL前体细胞与抗原呈递细胞(APC)来源，如树状细胞，和适宜的免疫原性肽共同保温，诱导对特定抗原的来自体外的CTL或HTL应答。在合适的保温时间后(通常大约7-28天)，其中前体细胞被活化并扩展为效应细胞，将细胞回输至患者体内，在那里它们将破坏(CTL)或促进破坏(HTL)它们特异性的靶细胞(例如，肿瘤细胞)。转染的树状细胞也可以用作抗原呈递细胞。X.E.为了治疗或预防的目的施用疫苗本发明的药物和疫苗组合物通常用于治疗和/或预防表达或过表达98P4B6的癌症。在治疗性应用中，以足够引发针对抗原的有效B细胞、CTL和/或HTL应答，和治愈或至少部分遏制或减缓症状和/或并发症的量，给患者施用肽和/或核酸组合物。足够完成这些目的的量被定义为″治疗有效剂量″。这种应用的有效量取决于例如，施用的特定组合物、给药的方式，被治疗疾病的阶段和严重程度、患者的体重和一般健康状况以及开药医师的判断。对于药物组合物，本发明的免疫原性肽或编码它们的DNA，通常被给与已经患有表达98P4B6的肿瘤的个体。肽或编码它们的DNA可以单独或作为一个或多个肽序列的融合物给药。可以单独用免疫原性肽或适当时与其它疗法，如外科手术联合治疗患者。对于治疗性应用，给药通常应该从98P4B6相关癌的首次诊断开始。然后加强剂量直到至少症状实质上减轻以及一段时间以后。给与患者的疫苗组合物的实施方案(即包括但不限于如肽混合物，多表位多肽，小基因或TAA-特异性CTL或脉冲树状细胞的实施方案)可依照疾病的阶段或患者的健康状态调整。例如，在表达98P4B6的肿瘤患者中，含有98P4B6-特异性CTL的疫苗可以在患有更高阶段疾病的患者体内，比可选择的实施方案更有效地杀灭肿瘤细胞。提供一定量的通过足以有效刺激细胞毒T细胞应答的给药模式传递的肽表位一般是重要的；根据本发明的此实施方案，也可提供刺激辅助T细胞应答的组合物。起始治疗性的免疫剂量通常在单位剂量的范围内，较低值大约为1，5，50,500或1,000μg，较高的值约为10,000；20,000；30,000；或50,000μg。人的剂量值范围典型地为大约500μg到大约50,000μg每70公斤患者体重。遵照数周至数月的加强方案，大约1.0μg到50,000μg的加强剂量的肽，依照通过测量从患者血液中获得的CTL和HTL比活性确定的患者应答和情况而给药。给药应该持续直到至少临床症状或实验检测表明肿瘤已经被除去或缩小并达一段时间之后。根据本领域已知的方法学调整剂量、给药途径和剂量时间表。在某些实施方案中，本发明的肽和组合物在严重的疾病状态中使用，即威胁生命的或可能威胁生命的情形。在这种情形下，本发明的优选组合物中存在最小量的外来物质和肽的相对无毒的性质的结果，治疗医师可能和觉得需要相对于规定的剂量给予实质上超量的肽组合物。本发明的疫苗组合物也能被单纯用作预防剂。通常起始预防免疫的剂量为单位剂量，较低值约为1，5，50，500或1000μg，较高值约为10,000；20,000；30,000或50,000μg。通常的人用剂量值为大约500μg到大约50,000μg每70公斤患者体重。在首次施用疫苗后，以确定的大约4周至6个月的间隔，给予约1.0μg到50,000μg的加强剂量的肽。可以通过测量从患者的血样获得的CTL和HTL比活来评估疫苗的免疫原性。治疗性处理的药物组合物可以非肠道、局部、口服、鼻饲、鞘内或局部(如乳膏或局部软膏)给药。优选地，药物组合物被非肠道给药，例如，静脉内、皮下、皮内或肌内给药。因此，本发明提供了含有溶解或悬浮在可接受载体，优选为含水载体中的免疫原性肽溶液的非肠道给药组合物。可以采用多种含水载体，例如水、缓冲水、0.8％盐水、0.3％甘氨酸、透明质酸等。这些成分可用传统又众所周知的灭菌技术消毒，或进行无菌过滤。产生的水溶液可被包装以备使用或冻干，在给药之前将冻干的制剂与无菌溶液混合。组合物可包含药物可接受的接近生理条件所需的辅助物质，如pH-调节和缓冲剂、渗透压调制剂、润湿剂、防腐剂等，例如乙酸钠、乳酸钠、氯化钠、氯化钾、氯化钙、山梨聚糖单十二酸酯、三乙醇胺油酸盐等。本发明的肽在药物制剂中的浓度可以有很大的不同，即从占重量小于约0.1％，通常为或至少为大约2％到多达20％至50％或更多，而且将根据选择的特定给药模式，主要通过液体体积，粘度等进行选择。组合物的人单位剂量形式通常包括在含有人单位剂量可接受载体的药物组合物中，在一个实施方案中，所述载体是含水载体，以本领域技术人员已知的用于将这种组合物施用于人类的体积/用量进行给药(参见例如Remington′sPharmaceuticalSciences，17Edition，A.Gennaro，Editor，MackPublishingCo.，Easton，Pennsylvania，1985)。例如，对于一个70公斤的患者，起始免疫的肽剂量可为大约1到大约50,000μg，通常为100-5,000μg。例如，对于核酸来说，可以使用在多个位点以0.5-5毫克的量IM(或SC或ID)给药的裸核酸形式的表达载体进行初次免疫。核酸(0.1到1000μg)也能用基因枪给药。在3-4周的保温期后，施用加强剂量的药物。加强剂量可以是以5×107到5×109pfu剂量给药的重组禽痘病毒。对于抗体，治疗通常包括抗98P4B6抗体制剂经由多种可接受的给药途径，例如静脉内注射(IV)的重复给药，剂量范围通常约为0.1到约10mg/kg体重。大体上，每周剂量为10-500mgmAb是有效的并能被较好耐受。而且，约为4毫克/公斤患者体重的起始IV荷载剂量，接着每周大约2毫克/公斤IV剂量的抗98P4B6mAb制剂代表了可接受的剂量方案。如本领域熟练技术人员所知，各种因素能影响特定病例的理想剂量。这些因素包括例如组合物的半寿期、Ab的结合亲和力、物质的免疫原性、患者中98P4B6的表达程度、98P4B6抗原循环流出的程度、所需的稳态浓度水平、治疗的频率和与本发明治疗方法联合使用的化疗或其它试剂的影响、以及特定患者的健康状态。非限制的优选人单位剂量为例如500μg-1mg，1mg-50mg，50mg-100mg，100mg-200mg，200mg-300mg，400mg-500mg，500mg-600mg，600mg-700mg，700mg-800mg，800mg-900mg，900mg-1g或1mg-700mg。在某些实施方案中，剂量范围为2-5mg/kg体重，例如接着施用1-3mg/kg的每周剂量；0.5mg，1，2，3，4，5，6，7，8，9，10mg/kg体重，接着例如在2，3或4个星期中施用每周剂量；0.5-10mg/kg体重，例如在2，3或4个星期中施用每周剂量；每周225，250，275，300，325，350，375，400mg/m2身体表面积；每周1-600mg/m2身体表面积；每周225-400mg/m2身体表面积；然后可以实行2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12或更多周的每周剂量。在一个实施方案中，多核苷酸的人单位剂量形式包含能提供任何治疗效果适当剂量范围或有效量。如本领域技术人员所知，治疗效果取决于多个因素，包括多核苷酸序列，多核苷酸的分子量和给药途径。通常由医师或其它的保健专业人士根据本领域已知的多种参数，如症状严重程度、患者病史等来选择剂量。通常，对大约20个碱基的多核苷酸而言，剂量值范围可选自例如独立挑选的下限，如大约0.1，0.25，0.5，1，2，5，10，20，30，40，50，60，70，80，90，100，200，300，400或500mg/kg直到独立挑选的比下限大的上限，如大约60，80，100，200，300，400，500，750，1000，1500，2000，3000，4000，5000，6000，7000，8000，9000或10,000mg/kg。例如，剂量可能为大约下列任何一项0.1到100mg/kg，0.1到50mg/kg，0.1到25mg/kg，0.1到10mg/kg，1到500mg/kg，100到400mg/kg，200到300mg/kg，1到100mg/kg，100到200mg/kg，300到400mg/kg，400到500mg/kg，500到1000mg/kg，500到5000mg/kg或500到10,000mg/kg。通常，与更直接地将核酸应用于生病组织相比，非肠道途径给药需要较高剂量的多核苷酸，增加长度的多核苷酸也是如此。在一个实施方案中，人单位剂量形式的T细胞含有能提供任意治疗效果的适当剂量范围或有效量。如本领域普通技术人员所知，治疗效果依赖于多个因素。通常由医师或其它的保健专业人士根据已知的多种参数，如症状严重程度，患者病史等来选择剂量。剂量可以为大约104个个细胞至大约106个细胞，大约106个细胞至大约108个细胞，大约108个到大约1011个细胞，或大约108个到大约5×1010个细胞，也可以为大约106个细胞/m2到大约1010个细胞/m2，或大约106细胞/m2到大约108细胞/m2。本发明的蛋白质和/或编码蛋白质的核酸也可以通过脂质体给药，所述脂质体可用于1)使蛋白质靶向特定的组织，如淋巴组织；2)选择性靶向疾病细胞；或3)增加肽组合物的半寿期。脂质体包括乳剂、泡沫、微胶粒、不溶解的单层、液晶、磷脂分散剂、薄片层等。在这些制剂中，被传递的肽可作为脂质体的一部分单独地、或与能和淋巴细胞中普遍存在的受体结合的分子，例如结合CD45抗原的单克隆抗体，或与其它治疗性的或免疫原性组合物联合被掺入。因此，用本发明所需的肽填充或修饰的脂质体可被递送到淋巴细胞的位点，在那儿脂质体输送肽组合物。本发明所用的脂质体由标准的小泡形成脂质形成，通常包括中性和带负电的磷脂和固醇，例如胆固醇。脂质的选择通常考虑例如，脂质体大小、血流中脂质体的酸易变性和稳定性。多种方法可用来制备脂质体，如Szokaetal，AnnRev.Biophys.Bioeng.9467(1980)和美国专利4,235,871、4,501,728、4,837,028和5,019,369所描述的。为靶向免疫系统的细胞，掺入脂质体的配体包括例如特异性针对所需免疫系统细胞的细胞表面决定簇的抗体或其片段。含肽脂质体悬浮液可以静脉内、局部、外用等方式，以根据给药方式、传递的肽和治疗疾病的阶段调整的剂量给药。对于固体组合物，可采用传统的无毒固体载体，包括例如药学等级的甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、滑石粉、纤维素、葡萄糖、蔗糖、碳酸镁等。对于口服给药，通过组合任意通常采用的赋形剂，例如前面所列的载体，和通常为10-95％的活性成分，即一种或多种本发明的肽，更优选其浓度为25％-75％，来制备药物可接受的无毒组合物。对于气溶胶给药，免疫原性肽优选以精细分开的形式与表面活性剂和推进剂一起应用。肽通常的重量百分比为大约0.01％-20％，优选大约1％-10％。表面活性剂当然必须是无毒的，并优选可溶解在推进剂中。这类试剂的代表是含有6到22个碳原子的脂肪酸，例如，己酸、辛酸、月桂酸、棕榈酸、硬脂酸、亚油酸、亚麻酸、olesteric和油酸与多羟基脂肪醇或其环酐形成的酯或部分酯。可以采用混合酯，如混合或天然的甘油脂。表面活性剂可构成组合物重量的大约0.1％-20％，优选大约0.25-5％。组合物的平衡通常使用推进剂。必要时，载体也可包括在内，如用于鼻内传递的卵磷脂。XI.)98P4B6诊断和预测的实施方案如本文公开的，98P4B6多核苷酸、多肽、反应性细胞毒T细胞(CTL)、反应性辅助T细胞(HTL)和抗多肽抗体被用于广为人知的诊断、预测和治疗性的分析，该分析用于确定与异常细胞生长有关的疾病，如癌症，特别是表I中所列的癌症(参见例如题为“正常组织和患者样品中98P4B6的表达分析”的实施例中所述的组织表达特异性模式和在某些癌症中的过表达)。98P4B6可以类推至前列腺相关抗原PSA，PSA是医疗实践者多年采用的识别和监测前列腺癌存在的原型标记(参见例如Merrilletal，J.Urol.163(2)503-5120(2000)；Polasciketal.，J.Urol.Aug；162(2)293-306(1999)andFortieretal.，J.Nat.CancerInst.91(19)1635-1640(1999))。在类似的上下文中也可以使用多种其它诊断标记，包括p53和K-ras(参见例如Tulchinskyetal.，IntJMolMed1999Jul4(1)99-102andMinimotoetal.，CancerDetectPrev2000；24(1)1-12)。因此，98P4B6多核苷酸和多肽(以及用来识别这些分子存在的98P4B6多核苷酸探针和抗98P4B6抗体)和它们的特性的公开使本领域技术人员在与这些应用类似的方法，例如在多种用于确定癌症相关疾病的诊断试验中利用这些分子。利用98P4B6多核苷酸、多肽、反应性T细胞和抗体的诊断方法的典型实施方案与那些已经确立的利用例如PSA多核苷酸、多肽、反应性T细胞和抗体的诊断试验类似。例如，正如PSA多核苷酸被用作探针(例如在Northern分析中，参见例如Shariefetal.，Biochem.Mol.Biol.Int.33(3)567-74(1994))和引物(例如在PCR分析中，参见例如Okegawaetal，J.Urol.163(4)1189-1190(2000))，以在监测PSA过表达或前列腺癌转移的方法中观察PSAmRNA的存在和/或水平。本文所述的98P4B6多核苷酸可以用同样的方式检测98P4B6的过表达或前列腺和其它表达该基因的癌症的转移。可选地，正如在监测PSA蛋白过表达的方法中，PSA多肽可用来生产针对PSA的特异性抗体，从而用来观察PSA蛋白的存在或水平(参见例如Stephanetal，Urology55(4)560-3(2000))或前列腺细胞的转移(参见例如Alanenetal.，Pathol.Res.Pract.192(3)233-7(1996))，本文所述的98P4B6可以用来生产抗体，用来检测98P4B6过表达或前列腺细胞和其它表达该基因的癌细胞的转移。具体地，因为转移涉及到癌细胞从原始器官(例如肺或前列腺等)向身体不同区域(例如淋巴结)移动，确定生物样品中表达98P4B6多核苷酸和/或多肽的细胞的存在的分析可以用来提供转移的证据。例如，当来自异常含有98P4B6表达细胞的组织(淋巴结)的生物样品被发现包含98P4B6表达细胞时，例如在LAPC4和LAPC9(分别分离自淋巴结和骨转移的异种移植物)中可见的98P4B6表达时，这一发现预示了转移。可选地，例如，当异常表达98P4B6或以不同水平表达98P4B6的生物样品中的细胞被发现表达98P4B6或98P4B6表达增强时(参见例如表I中所列癌症和患者样品中的98P4B6表达等，如附图中所示)，98P4B6多核苷酸和/或多肽可以用来提供癌症的证据。在这样的分析中，技术人员可以进一步希望通过检测生物样品中第二组织限制性标记(除98P4B6之外)，例如PSA，PSCA等的存在来产生辅助的转移证据(参见例如Alanenetal.，Pathol.Res.Pract.192(3)233-237(1996))。正如PSA多核苷酸片段和多核苷酸变体被熟练技术人员用在监测PSA的方法中，98P4B6多核苷酸片段和多核苷酸变体可以用类似的方式应用。特别是，监测PSA的方法中使用的典型PSA多核苷酸是由PSAcDNA序列片段组成的探针或引物。对此举例说明，PCR扩增PSA多核苷酸所用的引物必须包括比全长PSA序列短的序列以在多聚酶链反应中发挥功能。在PCR反应的上下文中，熟练技术人员通常制备多个不同的可以用作引物的多核苷酸片段以扩增感兴趣多核苷酸的不同部分或最优化扩增反应(参见例如Caetano-Anolles，G.Biotechniques25(3)472-476，478-480(1998)；Robertsonetal.，MethodsMol.Biol.98121-154(1998))。另一这种片段应用的示例在题为“正常组织和患者样品中98P4B6的表达分析”的实施例中提供，98P4B6多核苷酸片段用作探针来显示癌细胞中98P4B6的表达。另外，不同的多核苷酸序列通常还用作PCR和Northern分析中相应mRNA的引物和探针(参见例如Sawaietal.，FetalDiagn.Ther.1996Nov-Dec11(6)407-13andCurrentProtocolsInMolecularBiology，Volume2，Unit2，FrederickM.Ausubeletaleds.，1995))。在高度严紧性的条件下，能够结合靶多核苷酸序列的多核苷酸片段和变体(例如图2中显示的98P4B6多核苷酸或其变体)是有用的。而且，含有可以被抗体或T细胞识别的表位的PSA多核苷酸被用于监测PSA的方法中，所述抗体或T细胞可以与该表位特异性结合。98P4B6多肽片段和多肽类似物或变体也可以以类似的方式被利用。使用多肽片段或多肽变体生产抗体(如抗PSA抗体或T细胞)的实践是本领域典型的，可以使用多种系统，例如被实践者利用的融合蛋白(参见例如CurrentProtocolsInMolecularBiology，Volume2，Unit16，FrederickM.Ausubeletal.eds.，1995)。在此上下文中，每个表位的功能为提供与抗体或T细胞反应的结构。典型地，为产生针对感兴趣多肽不同部分的免疫应答，熟练技术人员可生产多种不同的多肽片段(参见例如美国专利5,840,501和美国专利5,939,533)。例如，优选利用含有一个本文讨论的98P4B6基元或携有基元的亚序列的多肽，本领域熟练技术人员基于本领域可以用到的基元能容易地鉴定所述多肽。这种情况下，只要多肽片段、变体或类似物含有能够产生特异性针对靶多肽序列(例如图3中所示的98P4B6多肽)的抗体或T细胞的表位，它们通常是有用处的。如本文所示，98P4B6多核苷酸和多肽(以及用来识别这些分子存在的98P4B6多核苷酸探针和抗98P4B6抗体或T细胞)表现出特定的性质，使它们在诊断例如表I所列的癌症中是有用的。为了评估本文描述的疾病例如前列腺癌的存在或开始，检测98P4B6基因产物存在的诊断试验被用于鉴定患者以进行预防性措施或进一步监测，正如利用PSA所成功实现的。而且，在例如基于单独检测PSA不能作出对前列腺起源转移的明确诊断等情况下，这些材料满足了现有技术对具有和PSA相似或补充性质的分子的需要(参见例如Alanenetal，Pathol.Res.Pract.192(3)233-237(1996))。因而，如98P4B6多核苷酸和多肽的物质(以及用来识别这些分子存在的98P4B6多核苷酸探针和抗98P4B6抗体)需要被用来确定前列腺来源的转移。最后，除了它们在诊断分析中的应用，本文公开的98P4B6多核苷酸还有一些其它应用，例如它们在鉴定与癌发生相关的98P4B6基因作图的染色体区域中的染色体异常中的应用(见下面题为“98P4B6的染色体作图”的实施例)。而且，除了它们在诊断分析中的应用，这里公开的98P4B6相关蛋白质和多核苷酸还具有其它的应用，例如在不明来源组织的法医鉴定方面的应用(参见例如TakahamaKForensicSciInt1996Jun28；80(1-2)63-9)。另外，本发明的98P4B6相关蛋白质或多核苷酸可用于治疗以高表达98P4B6为特征的病理疾病。例如，图2或图3中的氨基酸或核酸序列，或它们的片段可用来产生对98P4B6抗原的免疫应答。可采用与98P4B6反应的抗体或其它分子来调制该分子的功能，因此提供治疗性的效益。XII.)抑制98P4B6蛋白的功能本发明包括多种抑制98P4B6与其结合配对物结合或与其它蛋白质结合的方法和组合物以及抑制98P4B6功能的方法。XII.A.)用细胞内抗体抑制98P4B6在一个方法中，通过基因转移技术将编码与98P4B6特异性结合的单链抗体的重组载体引入表达98P4B6的细胞。相应的，编码的单链抗98P4B6抗体在细胞内表达，与98P4B6蛋白结合并因此抑制其功能。生产这种细胞内单链抗体的方法是广为人知的。这种细胞内抗体，也被称为″内体(intrabodies)″，是特异性靶向细胞内的特定区室的，在治疗的抑制活性集中的地方提供控制。这一技术已经成功地应用于现有技术中(综述见RichardsonandMarasco，1995，TIBTECHvol.13)。内体已经表现出实质上减弱了其它冗余的细胞表面受体的表达(参见例如Richardsonetal，1995，Proc.Natl.Acad.Sci.USA923137-3141；Beerlietal，1994，J.Biol.Chem.28923931-23936；Deshaneetal，1994，GeneTher.1332-337).单链抗体包括通过柔性接头多肽连接的重链和轻链可变区，并作为单个多肽被表达。任选地，单链抗体作为与轻链恒定区连接的轻链可变区片段被表达。通过生物工程技术将熟知的细胞内运输信号引入编码这种单链抗体的重组多肽载体，以使内体精确靶向所需的胞内区室。例如通过生物工程技术在靶向内质网的内体中掺入前导肽，和任选的如KDEL氨基酸基元的C端ER保留信号。在欲在细胞核内发挥活性的内体中通过生物工程技术加入核定位信号。为了将内体限制在质膜的胞质溶胶面，脂质组成成分被加入内体。内体也可以用于在胞质溶胶中发挥功能，例如胞质溶胶内体被用于隔离胞质溶胶内的因子，从而抑制它们向它们天然的细胞位置转运。在一个实施方案中，内体被用于捕获细胞核内的98P4B6，从而抑制其在细胞核内的活性。为了到达所需的靶，核靶向信号被引入这种98P4B6内体。设计这种98P4B6内体来与特定的98P4B6结构域结合。在另一实施方案中，与98P4B6蛋白特异性结合的胞质溶胶内体被用于抑制98P4B6进入细胞核，从而抑制其在细胞核内发挥生物活性(例如抑制98P4B6与其它因子形成转录复合物)。为了特异性介导这种内体在一定细胞内的表达，将内体的转录置于合适的肿瘤特异性启动子和/或增强子的调控下。例如，为了使内体表达特异性靶向前列腺，可以利用PSA启动子和/或增强子(参见例如美国专利5,919,652，1999年7月6日出版)。XII.B.)用重组蛋白质抑制98P4B6在另一方法中，重组分子与98P4B6结合并因此抑制98P4B6的功能。例如，这些重组分子防止或抑制98P4B6与其结合配对物靠近/结合或与其它蛋白质结合。例如，这种重组分子可以包括例如98P4B6特异性抗体分子的活性部分。在一个特定的实施方案中，98P4B6结合配对物的98P4B6结合结构域被改造成二聚体融合蛋白，因此该融合蛋白包含2个与人IgG，如人IgG1的Fc部分连接的98P4B6配体结合结构域。这种IgG部分可以包含例如CH2和CH3结构域以及铰链区，但是没有CH1结构域。这种二聚体融合蛋白以可溶解的形式给予患有与98P4B6表达相关的癌症患者，籍此，该二聚体融合蛋白与98P4B6特异性结合，并阻断98P4B6与其结合配对物的相互作用。用已知的抗体连接技术将这种二聚体融合蛋白进一步与多聚体蛋白质组合。XII.C.)抑制98P4B6的转录和翻译本发明也包含抑制98P4B6基因转录的多种方法和组合物。类似地，本发明也提供了抑制98P4B6mRNA翻译成蛋白质的方法和组合物。在一个方法中，抑制98P4B6基因转录的方法包括使98P4B6基因与98P4B6反义多核苷酸接触。在另一方法中，抑制98P4B6mRNA翻译的方法包括使98P4B6mRNA与反义多核苷酸接触。在另一方法中，98P4B6特异性核酶被用来裂解98P4B6mRNA，从而抑制翻译。这种基于反义和核酶的方法也可以被导入98P4B6基因的调节区，如98P4B6启动子和/或增强子元件。类似地，能够抑制98P4B6基因转录因子的蛋白质被用来抑制98P4B6mRNA转录。多种用于前述方法中的多核苷酸和组合物已经在上面描述。反义和核酶分子在抑制转录和翻译中的应用在现有技术中已经广为人知。其它干扰98P4B6转录活性的抑制98P4B6转录的因子也可以用来治疗表达98P4B6的癌症。类似地，干扰98P4B6加工的因子也可用于治疗表达98P4B6的癌症。利用这种因子的癌症治疗方法也在本发明的范围内。XII.D.)治疗策略的一般性考虑基因转移和基因治疗技术可以用来将治疗性多核苷酸分子转移到合成98P4B6的肿瘤细胞中(即反义，核酶，编码内体的多核苷酸和其它的98P4B6抑制分子)。现有技术中已知有多种基因治疗方法。可以用这些基因治疗方法将编码98P4B6反义多核苷酸、核酶、能够干扰98P4B6转录的因子等的重组载体传递到靶肿瘤细胞中。上述的治疗方法可以与其它多种外科手术、化疗或放疗方案结合。使用本发明的治疗方法可以使化疗(或其它治疗)降低使用剂量以及/或降低治疗频率，这对所有患者特别是那些对化疗剂毒性无法较好耐受的患者有利。可以用多种体外和体内分析系统评估特定组合物(例如，反义，核酸酶，内体)或这些组合物的组合的抗肿瘤活性。评估治疗活性的体外试验包括细胞生长试验，软琼脂试验和其它可以指示肿瘤增殖活动的试验，能够确定治疗性组合物抑制98P4B6与其结合配对物结合程度的结合试验等等。在体内，98P4B6治疗性组合物的效果可以在合适的动物模型中评估。例如，可以采用异种的前列腺癌模型，其中人前列腺癌外植体或者继代移种的异种移植组织被引入无免疫应答的动物，例如裸鼠或SCID小鼠(Kleinetal，1997，NatureMediane3402-408)。例如，PCT专利申请WO98/16628和美国专利6,107,540中描述了多种人前列腺癌的异种移植物模型，所述模型能够重演原始肿瘤的发育，微转移，和疾病晚期阶段的骨转移特征的形成。用测量肿瘤形成抑制、肿瘤衰退或转移的试验可以预测功效。评价细胞凋亡促进的体内试验有助于评估治疗性组合物。在一个实施方案中，可以检测用治疗性组合物治疗的含有肿瘤异种移植物的小鼠中是否存在细胞凋亡病灶，并与未治疗的携有异种移植物的对照小鼠相比较。被治疗小鼠的肿瘤中发现细胞凋亡病灶的程度提供了组合物治疗效果的指示。在前述方法的实践中用到的治疗性组合物可以被配制成含有适于所需传递方法的载体的药物组合物。适合的载体包括当与治疗性组合物混合时，可保留治疗性组合物的抗肿瘤活性，且通常不与患者的免疫系统反应的任意物质。例子包括但不限于多种标准药物载体的任意一种，例如无菌磷酸缓冲盐水溶液，抑菌水等(一般参见Remington′sPharmaceuticalSciences16tEdition，A.Osal.，Ed.，1980)。治疗制剂可以被溶解和通过任意能够将治疗组合物传递到肿瘤位点的途径给药。潜在有效的给药途径包括但并不限于静脉内、非肠道、腹膜内、肌内、肿瘤内、皮内、器官内、邻位等。优选的静脉内注射的制剂包含保存在防腐抑菌水、无菌未防腐水中的治疗性组合物，和/或包含稀释于含有0.9％无菌氯化钠的聚氯乙烯或聚乙烯袋中供注射，USP的治疗性组合物。治疗性的蛋白质制品可以冻干，作为无菌粉末保存，优选在真空中保存，然后在注射前重新用抑菌水(含有防腐剂，例如苯甲醇)或无菌水重建。用前述方法治疗癌症的剂量和给药方案将随着方法和靶癌症的改变而变化，且通常依赖于现有技术中所知的多种其它因素。XIII.)98P4B6调制剂的鉴定、表征和应用鉴定和利用调制剂的方法在一个实施方案中，进行筛选以鉴定能诱导或抑制特定表达分布图、抑制或诱导特定途径的调制剂，优选由此产生相关表型的调制剂。在另一个实施方案中，已经鉴定了在特定状态下重要的差异表达基因，进行筛选以鉴定改变单独的基因表达(无论是增加还是降低)的调制剂。在另一个实施方案中，进行筛选以鉴定改变差异表达基因所表达产物的生物功能的调制剂。另外，已经鉴定了特定状态下基因的重要性，进行筛查以鉴定结合和/或调制基因产物的试剂。此外，筛选对候选试剂反应的基因。鉴定出调制剂(那些抑制癌症表达模式从而导致正常表达模式，或导致如正常组织中的基因表达的癌症基因的调制剂)之后，进行筛选来鉴定那些对试剂反应而被特异性调制的基因。比较正常的组织和用药剂治疗过的癌症的表达分布图，揭示了那些不能在正常组织或癌组织中表达，但可以在经药剂治疗过的组织表达的基因，反之亦然。用本文描述的方法鉴定这些药剂-特异性序列并将其用于癌症基因或蛋白质。特别地，这些序列和它们编码的蛋白质被用于标记或鉴别用药剂治疗过的细胞。除此之外，生产针对药剂诱导的蛋白的抗体，并用于将新疗法靶向经治疗的癌症组织样品。调制剂相关的鉴定和筛选试验基因表达相关试验本发明的蛋白质、核酸和抗体可用于筛选试验。癌症-相关蛋白质、抗体、核酸、修饰的蛋白质和含有这些序列的细胞可用于筛选试验，例如评价候选药物对“基因表达分布图”、多肽表达分布图或生物功能的改变的影响。在一个实施方案中，表达分布图优选与高通量的筛选技术联合应用，以便用候选药剂治疗后追踪监测基因表达的状况(如，Davis，GF，etal，JBiolScreen769(2002)；Zlokarnik，etal，Science27984-8(1998)；Heid，GenomeRes6986-94，1996)。癌症蛋白质、抗体、核酸、修饰蛋白质和包含天然的或修饰的癌症蛋白质或基因的细胞被用于筛选试验。即，本发明包括筛选组合物的方法，该组合物调制癌症的表型或本发明的癌症蛋白质生理学功能。对基因本身进行或通过评估候选药物对“基因表达分布图”或生物功能的影响。在一个实施方案中，表达分布图优选与高通量的筛选技术联合应用，以便用候选药剂治疗后追踪监测基因表达的状况，见前文Zlokamik。针对本发明的基因和蛋白质实行了多种试验。试验在各个核酸或蛋白质水平上进行。也就是说，鉴定出在癌症中上调的特定基因，筛选受试化合物调制基因表达或者结合本发明中的癌症蛋白质的能力。这种情况下的“调制”包括基因表达的提高或降低。优选的调制量依赖于癌症中正常组织对癌组织的基因表达的初始变化，变化至少是10％，优选50％，更优选为100-300％，在某些实施方案中达300-1000％或更高。因此，与正常组织相比，如果一个基因在癌组织中显示出4倍的增加，经常需要4倍的减少；同样地，与正常组织相比，在癌组织中10倍的减少经常需要被测试化合物表达的10倍目标值的增加。增加癌症中可见的基因表达类型的调制剂也是有用的，例如，在进一步分析中用作上调的靶标。通过使用核酸探针和基因表达水平的量化来监测基因表达的量，或者，可选地，例如通过使用癌症蛋白质的抗体和标准的免疫测定监测基因产物本身。蛋白质组学和分离技术也可进行表达的量化。鉴定修饰基因表达的化合物的表达监测在一个实施方案中，同时监测多个个体的基因表达，即表达分布图。这些分布图典型地包括图2中的一个或多个基因。在该实施方案中，例如，在生物芯片上固定癌的核酸探针来检测并量化特定细胞中的癌序列。可选择地，可以用PCR。因此，可以使用微滴板上的一系列孔，其中所需的孔中分散有引物。然后进行PCR反应并对每个孔进行分析。进行表达监测来鉴定能调制一个或多个癌相关序列表达的化合物，如图2中显示的多核苷酸序列。通常，在分析之前往细胞中加入受试调制剂。而且，也提供筛选来鉴定药剂，所述药剂能调制癌症、调制本发明的癌症蛋白质、与本发明的癌症蛋白质结合或者干扰本发明的癌症蛋白与抗体或其它结合配对物的结合。在一个实施方案中，高通量的筛选方法包括提供含大量潜在治疗化合物(候选化合物)的文库。这种“组合化学文库”随后用一种或多种试验来筛选以鉴定显示出所需特征性活性的文库成员(特殊化合物种类或亚类)。如此鉴定的化合物可用作常规的“主导化合物”作为筛选用化合物或治疗剂。在某些实施方案中，筛选组合文库中潜在的能与癌症多肽结合或能调制活性的调制剂。按照惯例，通过鉴定具有一些所需性质或活性，例如抑制活性的化合物(被称为主导化合物)，制备主导化合物的变体，以及评估这些变体化合物的特性和活性，可产生新的有可利用性质的化学个体。通常，采用高通量筛查(HTS)方法来进行这种分析。如上所述，基因表达监测可便利地用于检验候选调制剂(例如蛋白质、核酸或小分子)。加入候选药剂后，使细胞保温一段时间，要分析的含有靶序列的样品被加入生物芯片。如果需要，用已知的技术制备靶序列。例如，用已知的裂解缓冲液等处理样品以裂解细胞，电穿孔，适当时进行纯化和/或扩增如PCR。例如，进行标记物与核酸共价连接的体外转录。通常，核酸用生物素-FITC或PE，或用cy3或cy5标记。靶序列可以用例如荧光，化学发光物质，化学药品，或放射性信号标记，从而提供检测靶序列与探针的特异性结合的方式。标记也可以是酶，例如碱性磷酸酶或辣根过氧化物酶，当提供合适的底物时，会产生可检测的产物。可选地，该标记是被标记的化合物或小分子，例如酶抑制剂，该抑制剂与酶结合但并不被其催化或改变。该标记也可以是组成成分或化合物，例如与链霉亲和素特异性结合的表位标记或生物素，至于生物素的例子，如上所述标记链霉亲和素，从而提供针对结合的靶序列的可测信号。未结合的经标记链霉亲和素通常在分析之前除去。如本领域技术人员所知，这些试验可以是直接的杂交试验或可以包括“夹心试验”，包括使用多种探针，如美国专利5,681,702；5,597,909；5,545,730；5,594,117；5,591,584；5,571,670；5,580,731；5,571,670；5,591,584；5,624,802；5,635,352；5,594,118；5,359,100；5,124,246；和5,681,697中所略述的。在这一实施方案中，通常如前略述制备靶核酸，然后在使杂交复合物形成的条件下，加入含有大量核酸探针的生物芯片中。本发明中运用了多种杂交条件，包括如上指出的高度、中度和低度严紧性条件。试验通常在严紧性条件下进行，使只有当靶存在时才能形成标记探针杂交复合物。可以通过调整热力学可变的步骤参数来控制严紧度，包括但不限于温度、甲酰胺浓度、盐浓度、离液序列高的盐浓度pH、有机溶剂浓度等。这些参数也可以用来控制非特异性结合，如美国专利5,681,697中大体指出的。因此，在较高严紧度条件下进行某些步骤来降低非特异性结合是令人满意的。本文简述的反应可以经多种途径完成。反应成分可以以不同的顺序同时或相继加入，下面有略述的优选的实施方案。另外，反应可以包括多种其它试剂。包括盐、缓冲液、中性蛋白质(如白蛋白)、去污剂等，可以用来促进最佳的杂交和检测，和/或降低非特异性或背景相互作用。也可以合适地应用其它提高试验效率的试剂，例如蛋白酶抑制剂，核酶抑制剂，抗微生物试剂等，这取决于样品的制备方法和靶的纯度。分析试验数据来确定不同基因的表达水平，以及不同状态间的表达水平改变，形成基因表达分布图。生物活性相关试验本发明提供了鉴定或筛选调制本发明中癌症相关基因或蛋白质活性的方法。这些方法包括在含有本发明癌症蛋白质的细胞中加入如前文详细说明的受试化合物，细胞含有编码本发明癌症蛋白质的重组核酸。在另一实施方案中，在大量细胞中检测候选制剂库。一方面，试验在生理学信号存在或不存在或之前或之后暴露的情况下评估，上述信号包括例如激素、抗体、肽、抗原、细胞因子、生长因子、作用潜力、包括化疗、放疗、致癌物质或其它细胞(即细胞一细胞接触)的药剂。在另一例子中，鉴定在细胞周期的不同阶段进行。调制本发明基因或蛋白质的化合物被以这种方式鉴别出来。具有药学活性的化合物能够增强或干扰本发明癌症蛋白质的活性。一旦被鉴定，评估类似的结构来识别化合物的关键结构特征。在一个实施方案中，提供了调制(如抑制)癌细胞分裂的方法；该方法包括给与癌症调制剂。在进一步的实施方案中，提供了治疗癌症细胞或患癌症个体的方法；该方法包括给与癌调制剂。在一个实施方案中，提供了调制表达本发明基因的细胞状态的方法。本文使用的状态包括为本领域所接受的参数，例如细胞的生长，增殖，存活，器官功能，细胞凋亡，衰老，定位，酶活性，信号传导等。在一个实施方案中，癌症抑制剂是前文讨论的抗体。在另一实施方案中，癌症抑制剂是反义分子。如本文所述，细胞生长、增殖和转移的试验是本领域熟练技术人员已知的。鉴定调制剂的高通量筛查鉴定合适调制剂的试验应当是高通量筛选。因此，优选的试验检测癌症基因转录的增强或抑制，多肽表达的抑制或增强，和多肽活性的抑制和增强。在一个实施方案中，高通量筛查方法中评估的调制剂是蛋白质，通常为天然蛋白质或天然蛋白质的片段。因此，利用例如含有蛋白质的细胞提取物，或随机的或直接消化的蛋白质细胞提取物。通过这种方式，制备蛋白质文库供本发明的方法筛选。在该实施方案中特别优选的是细菌，真菌，病毒，以及哺乳动物蛋白质文库，优选后者，特别优选人蛋白质。特别有价值的检测化合物靶向靶所属的蛋白质种类，例如酶的底物，或配体和受体。用软琼脂生长和集落形成来鉴定和表征调制剂正常细胞需要粘附于固体基质上生长。当细胞被转化，它们失去这一表型，并脱离基质生长。例如，转化的细胞可以在搅动的悬浮培养物或悬浮的半固态培养基，如半固态琼脂或软琼脂上生长。当用肿瘤抑制基因转染转化的细胞时，可以重新建立正常的表型并再次需要吸附于固体基质生长。试验中软琼脂生长或集落形成用来鉴定癌症序列的调制剂，当在宿主细胞中表达时，所述调制剂抑制异常细胞的增殖和分化。调制剂降低或消除宿主细胞在固态或半固态培养基例如琼脂中悬浮生长的能力。悬浮试验中的软琼脂生长或集落形成技术描述于Freshney，CultureofAnimalCellsaManualofBasicTechnique(3rded.，1994)。也可参见Garkavtsev等.(1996)，文献同上的方法部分。评估接触抑制和生长密度限制来鉴定和表征调制剂正常细胞通常以平铺和有组织的方式在细胞培养物中生长直至它们接触到其它的细胞。当细胞相互接触时，它们被接触抑制并停止生长。然而转化的细胞并不受接触抑制，且继续生长至高密度无规则的病灶。因此，与相应的正常细胞相比，转化的细胞可生长至一个更高饱和度的密度。这可以通过无规单层细胞或细胞集落的形成在形态学上检测出来。可选地，在饱和密度下，(3H)-胸苷的标记指数被用来检测生长的密度限制。类似地，MTT或Alamar蓝实验可以揭示细胞的增殖能力和调制剂对其影响的能力，参见Freshney(1994)，文献同上。当用肿瘤抑制基因转染转化的细胞后，可以产生正常的表型，变为受接触抑制并生长为较低的密度。在这一实验中，饱和密度下的3H-胸苷标记指数是检测生长密度限制的优选方法。用癌症相关序列转染转化的宿主细胞，并在非限制培养基的条件下以饱和密度生长24小时。通过掺入cpm确定用3H-胸苷标记的细胞的百分比。将不依赖于接触的生长用来鉴定癌症序列，所述序列导致异常的细胞增殖和转化。调制剂可以降低或消除不依赖于接触的生长，使细胞恢复正常表型。评估生长因子或血清依赖性以鉴定和表征调制剂与其正常配对物相比，转化细胞具有较低的血清依赖性(参见例如Temin，J.Natl.CancerInst.37167-175(1966)；Eagleetal，J.Exp.Med131836-879(1970))；Freshney，文献同上。这部分是由于转化细胞释放的多种生长因子。可以比较转化宿主细胞与对照细胞的生长因子和血清依赖性水平。例如，在鉴定和表征调制本发明的癌症相关序列的化合物的方法中监测细胞的生长因子和血清依赖性水平。用肿瘤特异性的标记水平来鉴定和表征调制剂与其正常配对物相比，肿瘤细胞释放某些因子(下文称为“肿瘤特异性标记”)的量增加。例如，人神经胶质瘤释放了比正常脑细胞增高的纤溶酶原激活物(PA)(参见例如Gullino，Angiogenesis，TumorVascularization，andPotentialInterferencewithTumorGrowth.inBiologicalResponsesinCancer，pp.178-184(Mihich(ed.)1985))。类似地，肿瘤细胞释放的肿瘤血管生成因子(TAF)比其正常配对物增高。(参见例如Folkman，AngiogenesisandCancer，SemCancerBiol.(1992))，而内皮细胞瘤释放bFGF(Ensoli，Betal)。多种检测这些因子释放的技术由Freshney(1994)，文献同上描述。也可参见Unklessetal，J.Biol.Chem.2494295-4305(1974)；Strickland&Beers，J.Biol.Chem.2515694-5702(1976)；Whuretal.，Br.J.Cancer42305312(1980)；Gullino，Angiogenesis，TumorVascularization，andPotentialinterferencewithTumorGrowth，inBiologicalResponsesinCancer，pp.178-184(Mihich(ed.)1985)；Freshney，AnticancerRes.5111-130(1985)。例如，在鉴定和表征调制本发明癌症相关序列的化合物的方法中监测肿瘤特异性标记水平。侵入Matrigel来鉴定和表征调制剂侵入Matrigel或细胞外基质组分的程度可以用作鉴定和表征调制癌症相关序列的化合物的试验。肿瘤细胞表现出恶性度与细胞侵入Matrigel或一些其它细胞外基质组分之间的正相关性。在这一试验中，肿瘤发生细胞通常用作宿主细胞。这些宿主细胞中肿瘤抑制基因的表达将降低宿主细胞的进攻性。可以采用前述的CancerRes.1999；596010；Freshney(1994)中的技术。简要地说，通过采用被Matrigel或其它细胞外基质组分包被的过滤器来检测宿主细胞的进攻水平。渗透入凝胶，或穿透至过滤器的末端被认为具有进攻性，并通过移动的细胞数和距离，或通过预先用标记细胞并在过滤器远端或盘的底部计数放射性来进行组织学分级，参见例如前述的Freshney(1984)，文献同上。评估体内肿瘤的生长来鉴定和表征调制剂在转基因或免疫抑制生物体中检测癌症相关序列对细胞生长的影响。通过多种为本领域所接受的方法制备转基因生物体。例如，制备如小鼠的哺乳动物的敲除转基因生物体，其中癌症基因被破坏或插入了癌症基因。经由同源重组，在小鼠基因组的内源性癌基因位点插入标记基因或其它异源性基因，以制备敲除转基因小鼠。这种小鼠也可通过用突变型癌症基因取代内源性癌基因而制备，或者通过使内源性癌症基因突变而制备，如通过暴露于致癌物质。为制备转基因的嵌合动物，如小鼠，往胚胎干细胞的核中导入DNA构建体。含有新改造的遗传损伤的细胞被注射入宿主小鼠的胚胎中，将胚胎重新植入雌性受体。这些胚胎中的一部分发育成为具有生殖细胞的嵌合小鼠，这些细胞中的一些来源于突变的细胞系。因此，通过饲养该嵌合鼠，可能获得包含引入的遗传损伤的小鼠新品系(参见例如Capecchietal.，Science2441288(1989))。嵌合小鼠可依照以下文献获得2002年4月2日出版的美国专利6,365,797；出版于2000年8月22日的美国专利6,107,540；Hoganetal，ManipulatingtheMouseEmbryoAlaboratoryManual，ColdSpringHarborLaboratory(1988)andTeratocarcinomasandEmbryonicStemCellsAPracticalApproach，Robertson，ed.，IRLPress，Washington，D.C.，(1987)。可选地，可以采用多种免疫抑制或免疫缺陷宿主动物。例如，遗传性无胸腺的“裸”鼠(参见例如Giovanellaetal，J.Natl.CancerInst.52921(1974))、SCID鼠、切除胸腺的小鼠或经照射的小鼠(参见例如Bradleyetal，Br.J.Cancer38263(1978)；Selbyetal，Br.J.Cancer4152(1980))均可以用作宿主。注射入同基因宿主的可移植肿瘤细胞(通常大约106个细胞)在高比例的病例中产生进攻性肿瘤，而类似起源的正常细胞则不会。在长出进攻性肿瘤的宿主中，表达癌症相关序列的细胞被皮下或原位注射。然后小鼠被分成组，包括对照组和治疗试验组(例如，用调制剂治疗)。在适宜长度的时间后，优选4-8周，检测肿瘤的生长(例如，通过体积或它的两个最大的尺寸，或重量)并与对照相比较。具有统计学显著性的缩小的肿瘤(采用例如Student′sT检验)被称为有生长抑制。鉴定和表征调制剂的体外试验鉴定具有调制活性的化合物的试验可在体外进行。例如，首先使癌症多肽与潜在的调制剂接触并保温一段合适的时间，例如，从0.5到48小时。在一个实施方案中，通过测量蛋白质或mRNA的水平在体外确定癌症多肽水平。使用与癌症多肽或其片段选择性结合的抗体，采用例如Western印迹，ELISA等的免疫分析来检测蛋白质水平。采用例如PCR、LCR的扩增方法或例如优选为Northern杂交、RNAse保护、点印迹的杂交分析来检测mRNA。如本文所述，用直接或间接标记的检测试剂，例如经荧光或放射性标记的核酸、放射性或酶标记的抗体等来检测蛋白质或mRNA水平。可选地，可以采用癌症蛋白质启动子设计报告基因系统，该癌症蛋白质启动子与诸如萤光素酶、绿色荧光蛋白、CAT或P-gal的报道基因可操作相连。通常将报道基因构建体转染至细胞。用潜在的调制剂处理后，根据本领域技术人员已知的标准技术检测报道基因的转录、翻译或活性的量(DavisGF，见前文；Gonzalez，J.&Negulescu，P.Curr.Opin.Biotechnol.19989624)。如上所述，可以对各个基因和基因产物进行体外筛选。也就是说，先鉴定出对特定状态至关重要的特殊差异表达的基因，再筛选基因或基因产物本身的表达调制剂。在一个实施方案中，筛选特定基因的表达调制剂。通常，仅评价一个或几个基因的表达。在另一个实施方案中，设计筛选以首先发现能结合差异表达蛋白质的化合物。然后评价这些化合物调制差异表达活性的能力。另外，一旦鉴定出原始的候选化合物，可进一步筛选变体以更好地评价结构活性关系。鉴定和表征调制剂的结合试验在本发明的结合试验中，一般使用本发明的纯化或分离的基因产物。例如，产生针对本发明蛋白质的抗体，进行免疫测定以确定蛋白质的量和/或位置。或者，在试验中使用含有癌症蛋白质的细胞。因此，方法包括混合本发明的癌症蛋白质和候选化合物，如配体，并测定化合物与本发明的癌症蛋白质的结合。优选实施方案利用了人癌症蛋白质；也可以开发和使用人类疾病的动物模型。另外，本领域技术人员懂得也可以使用其它类似的哺乳动物蛋白质。另外，在一些实施方案中，使用了变异或衍生的癌症蛋白质。一般说来，本发明的癌症蛋白质或配体非-弥散性地与不溶性支持物结合。支持物可以是例如具有接受分离样品之区域的支持物(微滴板、阵列等)。不溶性支持物可由任何能结合合成物的成分制成，所述支持物能容易地与可溶性材料分开，要不然就是可以与整个筛选方法相容。所述支持物的表面可以是固体或孔状，并且可以是任何方便的形状。适当不溶性支持物的例子包括微滴板、阵列、膜和珠。它们一般由玻璃、塑料(如聚苯乙烯)、多糖、尼龙、硝酸纤维素或TeflonTM等制成。微滴板和阵列特别方便，因为可以使用少量试剂和样品同时进行大量试验。对于合成物与支持物结合的特定方式没有特别限制，只要它能与试剂和本发明的整个方法相容、能保持合成物的活性并且是非弥散的即可。优选的结合方法包括使用抗体，所述抗体当使蛋白质与支持物结合、直接结合于“粘性”或离子支持物、化学交联表面蛋白质合成或试剂等时，不会在空间上封闭配体结合位点或激活序列。使蛋白质或配体/结合剂与支持物结合之后，通过洗涤除去过量的未结合材料。然后通过与牛血清白蛋白(BSA)、酪蛋白或其它无毒蛋白质或其它组成成分保温来封闭样品接受区域。一旦本发明的癌症蛋白质与支持物结合，在试验中添加受试化合物。或者，使候选结合剂与支持物结合，然后添加本发明的癌症蛋白质。结合剂包括特异性抗体、筛选化学文库鉴定出的非-天然结合剂、肽类似物等。特别令人感兴趣的是鉴定对人细胞低毒的药剂的试验。为此可以使用多种试验，包括增殖试验、cAMP试验、体外标记的蛋白质-蛋白质结合试验、电泳迁移率转变试验、蛋白质结合的免疫测定、功能试验(磷酸化试验等)等。可以用多种方法测定受试化合物(配体、结合剂、调制剂等)与本发明的癌症蛋白质的结合。可以标记受试化合物，通过例如使本发明的全部或部分癌症蛋白质与固体支持物结合，添加经标记的候选化合物(如荧光标记)，洗下过量试剂并测定固体支持物上是否存在标记来直接测定结合。适当时可以利用多种封闭和洗涤步骤。在某些实施方案中，仅标记一种组分，例如仅标记本发明的蛋白质或配体。或者，用不同的标记物标记一种以上的组分，如用I125标记蛋白质，用氟标记化合物。邻近试剂，如淬灭或能量转移试剂也是有用的。竞争性结合以鉴定和表征调制剂在一个实施方案中，通过与“竞争剂”的竞争结合试验来测定“受试化合物”的结合。竞争剂是与靶分子(如本发明的癌症蛋白质)结合的结合组成成分。竞争剂包括如抗体、肽、结合配对物、配体等的化合物。在某些情况下，受试化合物与竞争剂之间的竞争结合置换了受试化合物。在一个实施方案中，受试化合物被标记。在蛋白质中加入受试化合物，竞争剂，或这两者，维持足够长的时间以使它们结合。在有利于最佳活性的温度下，一般为4至40℃进行保温。通常最优化保温时间以有利于快速高通量筛选；一般0至1小时就足够了。通常需除去或洗去过量的试剂。然后加入第二种组分，测定是否存在经标记组分以显示结合。在一个实施方案中，首先加入竞争剂再加入受试化合物。置换竞争剂表示受试化合物与癌症蛋白质结合，因此能结合并潜在调制癌症蛋白质的活性。在此实施方案中，可以标记任一种组分。因此，例如，如果标记竞争剂，后-测试化合物洗涤溶液中存在标记表示被受试化合物置换。或者，如果标记受试化合物，支持物上存在标记表示置换。在可选择的实施方案中，首先加入受试化合物，保温并洗涤，接着加入竞争剂。缺乏竞争剂结合表示与竞争剂相比，受试化合物以更高的亲和性与癌症蛋白质结合。因此，如果标记受试化合物，支持物上标记的存在合并竞争剂结合的缺乏表示受试化合物结合因此潜在调制本发明的癌症蛋白质。因此，竞争结合方法包括差异筛选以鉴定出能调制本发明癌症蛋白质活性的药剂。在此实施方案中，该方法包括在第一个样品中混合癌症蛋白质和竞争剂。第二个样品含有受试化合物、癌症蛋白质和竞争剂。测定两个样品中的竞争剂结合，两个样品之间结合的改变或差异表示存在能与癌症蛋白质结合并潜在调制其活性的药剂。即，如果相对于第一个样品而言，第二个样品中的竞争剂结合是不同的，该药剂即能与癌症蛋白质结合。或者，使用差异筛选鉴定出能与天然癌症蛋白质结合，但不能与经修饰的癌症蛋白质结合的候选药物。例如，制作癌症蛋白质的结构模型，并将其用于理性药物设计以合成能与该位点相互作用的药剂，一般不与位点经修饰的蛋白质结合的药剂。另外，通过筛选药物增强或降低所述蛋白质活性的能力也可鉴定出能影响天然癌症蛋白质活性的候选药物。在此试验中使用了阳性对照和阴性对照。优选在至少三份试验中进行对照和受试样品试验以获得统计学显著的结果。所有样品的保温时间足以使药剂与蛋白质结合。保温之后，从样品中洗去非-特异性结合的物质，测定结合的，通常是经标记的药剂的量。例如，当利用放射性标记时，可在闪烁计数器中计数样品以测定结合化合物的量。筛选试验中可包括多种其它试剂。其包括如盐、中性蛋白质(如白蛋白)、去污剂等的试剂，所述试剂有利于最佳蛋白质-蛋白质结合和/或降低非-特异性或背景相互作用。也可以使用能改善试验效率的试剂，如蛋白酶抑制剂、核酶抑制剂、抗-微生物药剂等。以能提供所需结合的次序添加组分的混合物。使用多核苷酸下调或抑制本发明的蛋白质如WO91/04753所述，通过与配体-结合分子形成偶联物，将癌症的多核苷酸调制剂导入含有靶核苷酸序列的细胞中。适当的配体-结合分子包括但不限于细胞表面受体、生长因子、其它细胞因子或其它与细胞表面受体结合的配体。优选配体结合分子的偶联实质上不会干扰配体结合分子结合其相应分子或受体的能力，或妨碍有义或反义寡核苷酸或其偶联形式进入细胞。或者，可如WO90/10448所述，通过例如形成多核苷酸-脂质复合物将癌症的多核苷酸调制剂导入含有靶核酸序列的细胞中。应懂得除了治疗方法外，还可以在上文所述的筛选试验中使用反义分子或敲除和嵌入(knockin)模型。抑制性和反义核苷酸在某些实施方案中，通过使用反义多核苷酸或抑制性的小核RNA(snRNA)，即互补于并优选能特异性杂交编码mRNA核酸序列，如本发明的癌症蛋白质，mRNA或其亚序列的核酸可下调或完全抑制癌症-相关蛋白质的活性。反义多核苷酸与mRNA的结合降低了mRNA的翻译和/或稳定性。在本发明的上下文中，反义多核苷酸可含有天然核苷酸，或由天然亚单位或其密切同系物形成的合成核苷酸。反义多核苷酸也可具有经改变的糖组成成分或糖内连键。例如硫代磷酸酯和本领域已知的其它含硫组分。本发明还包括类似物，只要它们能有效地与本发明的核苷酸杂交即可。参见例如IsisPharmaceuticals，Carlsbad，CA；Sequitor，Inc.，Natick，MA。使用重组方法可容易地合成所述反义多核苷酸，或者也可以在体外合成所述多核苷酸。所述合成的仪器可购自几个厂商，包括AppliedBiosystems。其它寡核苷酸，如硫代磷酸酯和烷基化衍生物的制备也是本领域技术人员众所周知的。本文使用的反义分子包括反义或有义寡核苷酸。例如，可使用有义寡核苷酸通过与反义链结合来阻断转录。反义和有义寡核苷酸含有能结合癌症分子的靶mRNA(有义)或DNA(反义)序列的单链核酸序列(RNA或DNA)。本发明的反义或有义寡核苷酸含有一般至少约为12个核苷酸，优选约为12至30个核苷酸的片段。基于编码给定蛋白质的cDNA序列获得反义或有义寡核苷酸的能力描述于例如Stein&Cohen(CancerRes.482659，(1988))和vanderKroletal.(BioTechniques6958(1988))。核酶除了反义多核苷酸以外，也可使用核酶靶向和抑制癌症-相关核苷酸序列的转录。核酶是能催化裂解其它RNA分子的RNA分子。已描述了不同类型的核酶，包括I组核酶、锤头核酶、发夹核酶、RnaseP和斧头核酶(有关不同核酶之特性的评述参见例如Castanottoetal.，Adv.inPharmacology25289-317(1994))。发夹核酶的一般性特征描述于例如Hampeletal.，Nucl.AcidsRes.18299-304(1990)；欧洲专利公开号0360257；美国专利5,254,678。制备方法是本领域技术人员众所周知的(参见例如WO94/26877；Ojwangetal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA906340-6344(1993)；Yamadaetal.，HumanGeneTherapy139-45(1994)；Leavittetal.，Proc.Natl.AcadSci.USA92699-703(1995)；Leavittetal.，HumanGeneTherapy51151-120(1994)和Yamadaetal.，Virology205121-126(1994))。在表型筛选中使用调制剂在一个实施方案中，给一群具有相关癌症表达分布图的癌症细胞施用受试化合物。本文的“施用”或“接触”指的是以特定的方式在细胞中加入调制剂，使调制剂通过摄取和细胞内作用或通过细胞表面的作用对细胞发挥作用。在一些实施方案中，将编码蛋白质试剂(即肽)的核酸导入病毒构建体，如腺病毒或逆转录病毒构建体，并加入至细胞中，从而完成肽剂的表达，参见例如PCTUS97/01019。也可使用可调节的基因治疗系统。一旦给细胞施用了调制剂，必要时洗涤细胞，优选使细胞在生理条件下保温一段时间。然后收集细胞，产生新的基因表达分布图。因此，例如，针对癌症组织筛选调制，如诱导或抑制癌症表型的药剂。至少一个基因，优选多个基因表达分布图的改变表示该药剂对癌症活性起作用。类似地，改变生物功能或信号传导途径是调制剂活性的显示。通过限定癌症表型的特征，设计能改变表型的新药的筛选。使用此方法，不必知道药物靶，也不必将药物靶呈现在原始基因/蛋白质表达筛选平台上，也不必改变靶蛋白质转录物的水平。调制剂抑制功能可用作替代标记。如上所述，需进行筛选以评价基因或基因严物，也就是说，先鉴定出对特定状态至关重要的特殊差异表达的基因，再筛选基因或基因产物本身的表达调制剂。使用调制剂影响本发明的肽使用多种试验测定癌症多肽活性或癌症表型。例如，通过检测上述参数测定调制剂对癌症多肽功能的影响。使用影响活性的生理学改变评估受试化合物对本发明多肽的影响。当使用完整细胞或动物测定功能结果时可评价多种作用，例如对与实体肿瘤相关的癌症而言，可评价肿瘤生长、肿瘤转移、新血管生成、激素释放、已知和未鉴定的基因标记的转录改变(如通过Northern印迹)、细胞代谢的改变(如细胞生长或pH改变)和细胞内第二信使(如cGNIP)的改变。鉴别待征性癌症相关序列的方法多种基因序列的表达与癌症相关，相应地，鉴定了基于突变或变异癌症基因的疾病。在一个具体实施方案中，本发明提供了鉴定含有变异癌症基因的细胞的方法，例如，确定细胞中至少一个内源性癌症基因全部或部分序列的存在。这可通过运用任意数目的测序技术来完成。本发明包括鉴定个体癌症基因型的方法，例如，确定个体中至少一种本发明的基因的全部或部分序列的存在。这通常在个体的至少一种组织，例如表1所列组织中进行，还可以包括对多种组织或同一组织不同样品的评估。该方法可以包括将已测序基因的序列与已知癌症基因，即野生型基因进行比较，来确定家族成员、同源性、突变或变异的存在，然后可将该基因的全部或部分序列与已知癌症基因的序列进行比较来确定是否有差异存在。这可以通过任何数目的已知同源性程序进行，如BLAST，Bestfit等。如本文所述，患者癌症基因和已知癌症基因序列之间差异的存在与疾病状态或疾病状态倾向相关。在一个优选实施方案中，用癌症基因作为探针来确定基因组中癌症基因拷贝的数目。用癌症基因作探针来确定其在染色体上的位置。特别是，当在癌症基因的基因座中鉴定出如易位等的染色体异常时，如染色体定位的信息可以应用于提供诊断或预测。XIV.)试剂盒/产品物件为了用于本文描述的诊断和治疗应用，试剂盒也在本发明的范围之内。所述试剂盒可以包括载体、包装或容器，容器可以被分隔为小室以盛放一个或多个容器如小瓶、试管等，每个容器分别含有本方法所用到的一种独立成分。例如，容器可以含有被可测标记的探针。这种探针可以是分别特异性针对图2相关蛋白质或图2基因或信息的抗体或多核苷酸。当该方法利用核酸杂交来检测目标核酸时，试剂盒也可以包括含有扩增目标核酸序列的核苷酸的容器和/或含有报道体系的容器，如与报道分子如酶、荧光或放射性同位素标记结合的生物素结合蛋白，例如亲和素或链霉亲和素。该试剂盒可以包括图2或图3所示的全部或部分氨基酸序列或其类似物，或者编码所示氨基酸序列的核苷酸序列。本发明的试剂盒通常包括上述的容器及一个或多个其它容器，其中含有符合商业和用户需要的材料，包括缓冲液、稀释剂、过滤器、针、注射器；载体、包装、容器、小瓶、和/或试管标签，其上列有供使用的内容物和/或说明，以及写有使用说明的包装插页。容器上可以贴有标签来说明组合物用于特定的治疗或非治疗的应用，如诊断或实验室应用，也可以说明如本文所述的体内或体外应用的指示。指示和/或其它信息也可以包括在试剂盒中的插页或标签上。术语“试剂盒”与“产品物件”可以被用作同义词。在本发明的另一个实施方案中，提供了一种包含如氨基酸序列、小分子、核酸序列和/或抗体的组合物的产品物件，例如，用于诊断、预测、预防和/或治疗如表I中所列举组织的肿瘤的材料。产品物件通常包括至少一个容器及至少一个标签。合适的容器包括例如瓶子、小瓶、注射器以及试管。容器可以由多种材料制成，如玻璃或塑料。该容器可以包含氨基酸序列、小分子、核酸序列和/或抗体。在一个实施方案中，容器包含用于检测细胞中mRNA表达分布图的多核苷酸，同时含有用于此目的的试剂。容器也可以选择性地包含用于有效地治疗、诊断、预测或预防某种疾病的组合物，同时可以含有无菌接口(如容器可以是一个静脉内溶液袋或一个具有用皮下注射针穿孔的塞子的小瓶)。组合物中的活性剂可以是能够特异性结合98P4B6和调制其功能的抗体。标签可以置于容器上或与之相关连。当字母、数字或其它组成标签的文字铸模或蚀刻在容器上时，标签置于容器上；当标签存在于盛放容器的贮器或载体中时，标签与所述的容器相关连，例如作为包装的插页。标签可以说明组合物用于诊断、治疗、预防或预测疾病，如表I所示组织的肿瘤。产品物件可以进一步包括第二容器，其含有药学上可接受的缓冲液，例如磷酸缓冲盐水，林格氏溶液和/或葡萄糖溶液。它可以进一步包括其它符合商业和用户需要的材料，包括缓冲液、稀释剂、过滤器、针、注射器和/或附有使用指示和/或说明的包装插页。实施例通过以下的一些实施例对本发明的不同方面进行进一步描述和举例说明，所有实施例不应被理解为对本发明范围的限制。实施例1SSH产生的分离的98P4B6基因cDNA片段为了分离前列腺癌中过表达的基因，我们用前列腺组织来源的cDNA进行抑制扣除杂交(SSH)。98P4B6SSHcDNA序列来源于正常的前列腺组织除去LAPC-4AD前列腺异种移植物的cDNA，鉴定出98P4B6cDNA在前列腺癌中高表达。材料与方法人组织患者的癌组织和正常组织购自不同的来源，如NDRI(Philadelphia，PA)。一些正常组织mRNA购自Clontech，PaloAlto，CA。RNA分离在Trizol试剂(LifeTechnologies，GibcoBRL)中，以10ml试剂/g组织匀浆组织，以分离总RNA。用Qiagen′sOligotexmRNA迷你型和中型试剂盒由总RNA纯化PolyARNA，用分光光度分析(O.D.260/280nm)对总RNA和mRNA进行定量，并通过凝胶电泳进行分析。寡核苷酸使用下列HPLC纯化的寡核苷酸。DPNCDN(cDNA合成引物)5′TTTTGATCAAGCTT303′(SEQIDNO101)衔接子15′CTAATACGACTCACTATAGGGCTCGAGCGGCCGCCCGGGCAG3′(SEQIDNO102)3′GGCCCGTCCTAG5′(SEQIDNO103)衔接子25′GTAAIACGACTCACTATAGGGCAGCGTGGTCGCGGCCGAG3′(SEQIDNO104)3′CGGCTCCTAG5′(SEQIDNO105)PCR引物15′CTAATACGACTCACTATAGGGC3′(SEQIDNO106)巢式引物(NP)15′TCGAGCGGCCGCCCGGGCAGGA3′(SEQIDNO107)巢式引物(NP)25′AGCGTGGTCGCGGCCGAGGA3′(SEQIDNO108)抑制扣除杂交抑制扣除杂交(SSH)用来鉴定对应于在前列腺癌中可能差别表达的基因的cDNA。SSH反应使用来自前列腺癌异种移植物和正常组织的cDNA。98P4B6基因序列来源于正常的前列腺组织除去前列腺癌异种移植物LAPC-4ADcDNA的扣除。鉴定出SSHDNA序列(图1)。将来源于LAPC-4AD的cDNA作为“驱动(driver)”cDNA，而来自正常前列腺的cDNA作为“试验”cDNA。如上所述，使用CLONTECH的PCR-选择cDNA扣除试剂盒并以1ng寡核苷酸DPNCDN作为引物，由2μg从相关组织分离的poly(A)+RNA合成对应于试验和驱动cDNA的双链cDNA。第一和第二链的合成按试剂盒中使用手册所描述的程序进行(CLONTECHProtocolNo.PT1117-1，目录号K1804-1)。得到的cDNA用DpnII在37℃消化3小时。消化后的cDNA用苯酚/氯仿(1∶1)抽提，乙醇沉淀。由1∶1比例的经DpnII消化的相关组织来源(如上所述)的cDNA和来源于正常组织的经消化cDNA混合产生驱动cDNA。将1μl用DpnII消化的相关组织来源(如上所述)的cDNA(400ng)稀释于5μl水中以产生试验cDNA。然后于16℃，在总体积为10μl的分别的连接反应中，使用400uT4DNA连接酶(CLONTECH)将稀释的cDNA(2μl，160ng)连接到2μl衔接子1和衔接子2(10μM)上过夜。以1μl0.2MEDTA，和72℃加热5分钟终止连接。通过在两个分别含有1.5μl(20ng)与衔接子1-和衔接子2-连接的试验cDNA的试管中各加入1.5μl(600ng)驱动cDNA以进行第一轮杂交。在4μl的终体积中，用矿物油覆盖样品，在MJResearch热循环仪中98℃变性1.5分钟，然后在68℃杂交8小时。然后使两次杂交的产物与另外的1μl新鲜变性的驱动cDNA混合，68℃杂交过夜。然后将第二轮杂交产物在200μl20mMHepes，pH8.3，50mM，0.2mMEDTA中稀释，70℃加热7分钟，-20℃保存。由SSH产生的基因片段的PCR扩增、克隆和测序为扩增由SSH反应产生的基因片段，进行两轮PCR扩增反应。在首次PCR反应中，将1μl稀释的最终杂交混合物加入至1μlPCR引物1(10μM)，0.5μldNTP混合物(10μM)，2.5μl10×反应缓冲液(CLONTECH)和0.5μl50×高级cDNA聚合酶混合物(CLONTECH)中，终体积为25μl。PCR1在以下条件下进行75℃5分钟，94℃25秒，然后94℃10秒，66℃30秒，72℃1.5分钟共27轮循环。每个实验分别完成5个独立的首次PCR反应。收集产物并用水按110稀释。在第二轮PCR反应里，从收集并稀释的首次PCR反应物中取出1μl加入同样的反应混合物中，就像在PCR1中那样，除了用引物NP1和NP2(10μM)代替了PCR引物1。PCR2以94℃10秒，68℃30秒，和72℃1.5分钟共进行10-12个循环。PCR产物用2％琼脂糖凝胶电泳进行分析。用T/A载体克隆试剂盒(Invitrogen)将PCR产物插入pCR2.1。对转化的大肠杆菌进行蓝/白及氨苄青霉素选择。挑选白色菌落排列在96孔板之内，在液体培养物中生长过夜。为了鉴定插入物，使用PCR1的条件，并以NP1和NP2作为引物对1μl细菌培养物进行PCR扩增，使用2％琼脂糖凝胶电泳分析PCR产物。将细菌克隆储存于96孔板的20％甘油中。制备质粒DNA，进行测序，在GenBank、dBest和NCI-CGAP数据库中进行核酸同源性检索。RT-PCR表达分析使用Gibco-BRL的SuperscriptPreamplification系统，可用寡(dT)12-18引发，由1μgmRNA产生第一链cDNA。采用厂家的方法，包括在42℃下与逆转录酶保温50分钟，然后在37℃下用RNAseH处理20分钟。在完成反应之后，在标准化之前可用水将体积增加至200μl。来自16个不同的正常人组织的第一链cDNA可由Clontech获得。来自多种组织的第一链cDNA的标准化通过运用引物5′atatcgccgcgctcgtcgtcgacaa3′(SEQIDNO109)和5′agccacacgcagctcattgtagaagg3′(SEQIDNO110)扩增β-肌动蛋白来进行。在50μl总体积中扩增第一链cDNA(5μl)，其中含有0.4μM引物，0.2μM每种dNTP，1×PCR缓冲液(Clontech，10mMTris-，1.5mM，50mM，pH8.3)以及1×KlentaqDNA聚合酶(Clontech)。在18、20和22轮循环时分别取5μlPCR反应产物进行琼脂糖凝胶电泳。采用MJResearch热循环仪进行PCR反应，反应条件如下起始变性可以是94℃15秒，然后以94℃15秒，65℃2分钟，72℃5秒进行18、20和22轮循环。最终在72℃延伸2分钟。在琼脂糖凝胶电泳之后，将来自多种组织的283bp的β-肌动蛋白带的强度用视觉进行检验比较。计算在22轮PCR循环后使得所有组织的β-肌动蛋白条带强度相等的第一链cDNA的稀释倍数。需要进行三轮的标准化才能达到在22轮PCR循环后所有组织的条带强度相等。为了确定98P4B6基因的表达水平，通过进行26和30轮循环的PCR扩增分析5μl标准化的第一链cDNA。可以通过比较产生亮条带强度的循环数下的PCR产物进行半-定量表达分析。采用98P4B6SSH序列设计RT-PCR使用的引物，所述引物如下所示98P4B6.15′-GACTGAGCTGGAACTGGAATTTGT-3′(SEQIDNO111)98P4B6.25′-TTTGAGGAGACTTCATCTCACTGG-3′(SEQIDNO112)实施例2分离编码全长98P4B6的cDNA98P4B6SSHcDNA序列得自由正常前列腺减去前列腺癌异种移植物组成的扣除。SSHcDNA序列(图1)被称为98P4B6。183bp的98P4B6SSHDNA序列如图1所示。2453bp的全长98P4B6v.1(克隆GTD3)克隆自前列腺cDNA文库，显示出454个氨基酸长的ORF(图2和图3)。98P4B6v.6也克隆自正常前列腺文库。其它98P4B6变体也被鉴定并在图2和3中列出。98P4B6v.2，v.3，v.4，v.5，v.6，v.7和v.8是98P4B6v.1的剪接变体。98P4B6v.9至v.19是SNP变体并且有一个氨基酸不同于v.1。98P4B6v.20至v.24是v.7的SNP变体。98P4B6v.25至v.38是v.8的SNP变体。虽然这些SNP变体分开显示，但是它们也可以任何的组合在任何转录变体中出现。实施例398P4B6的染色体作图染色体的定位能指示疾病致病基因。可采用一些染色体作图方法，包括荧光原位杂交(FISH)、人/仓鼠辐射杂合体(RH)试验组(panel)(Walteretal.，1994；NatureGenetics722；ResearchGenetics，HuntsvilleAl)、可得自Comell研究所(Camden，NewJersey)的人-啮齿动物体细胞杂合体试验组、和利用BLAST同源性对基因组克隆进行测序和作图的基因组阅读器(NCBI，Bethesda，Maryland)。利用98P4B6序列和NCBIBLAST工具将98P4B6作图于染色体7q21在万维网的网址为ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/page.cgi？F＝HsBlast.html&&ORG＝Hs)。实施例498P4B6的表达分析RT-PCR表达分析证明98P4B6在前列腺癌患者的样品中高度表达(图14)。由正常胃、正常脑、正常心脏、正常肝脏、正常骨骼肌、正常睾丸、正常前列腺、正常膀胱、正常肾、正常结肠、正常肺、正常胰腺以及来自前列腺癌患者，膀胱癌患者，肾癌患者，结肠癌患者，肺癌患者，胰腺癌患者的癌症样品库，和2个前列腺癌淋巴结转移患者的样品库产生第一链cDNA。使用肌动蛋白引物进行PCR反应来使其标准化。使用针对98P4B6v.1，v.13，或/和v.14(A)的引物，或使用剪接变体98P4B6v.6和v.8(B)的特异性引物进行26和30轮扩增循环以进行半-定量PCR。样品在琼脂糖凝胶中电泳，使用Alphalmager软件定量PCR产物。结果显示98P4B6及其剪接变体v.6和v.8在正常前列腺和前列腺癌中强烈表达。与被测试的所有正常组织相比较，在膀胱癌、肾癌、结肠癌、肺癌、胰腺癌、乳腺癌、癌转移和前列腺癌的淋巴结转移样品中也检测到了表达。如下文所指出，例如，在实施例6中，98P4B6v.1在表I中所列的癌组织中表达，其它的编码蛋白质的98P4B6变体也在这些组织中表达；图14中所列的数据确证了这一原则，因为了在本文中被称为98P4B6v.6或v.8的蛋白质存在于例如前列腺、肺、卵巢、膀胱、乳腺、结肠、肾脏和胰腺癌中，文献(Porkkaetal.，LabInvest，2002andKorkmazetal.，JBC，2002)中的数据也确证了这一原则，其中在正常前列腺和前列腺癌中鉴定出蛋白质98P4B6v.8。当基因所作图的基因组区域在特定癌症中被调制时，其它转录物或基因剪接变体也被调制。本文揭示了98P4B6与癌症相关的特定表达分布图。98P4B6的其它转录物和剪接变体也与相同或其它组织的癌症相关，因此可以用作肿瘤相关标记/抗原。98P4B6v.1，v.13和/或v.14的表达可在前列腺、肺、卵巢、膀胱、宫颈、子宫和胰腺癌患者的样品中检测到(图15)。由一组患者癌症样品制备第一链cDNA。通过使用肌动蛋白引物的PCR进行标准化。使用98P4B6引物进行26和30轮扩增循环以进行半-定量PCR。在琼脂糖凝胶中电泳样品，使用Alphalmager软件定量PCR产物。表达被记录为无、低、中等或强。结果显示受试的大多数患者癌症样品中可以检测到98P4B6的表达。图16显示98P4B6在胃癌患者的样品中表达。(A)从正常胃(N)和10个不同的胃癌患者样品(T)中提取RNA。用10μg总RNA/泳道进行Northern印迹，用98P4B6序列进行探查。结果显示胃肿瘤组织中98P4B6强烈表达而正常胃组织中表达较低。下方的试验组表示溴化乙锭对印迹的染色，显示出RNA样品的量。(B)用RNA点印迹检测98P4B6在一组人胃癌(T)及其各自匹配正常组织(N)中的表达。在8个胃肿瘤中有7个检测到了98P4B6的表达，但匹配的正常组织中没有表达。实施例598P4B6的转录变体转录变体是来自通过可变转录或可变剪接产生的来自同一基因的成熟mRNA的变体。可变转录物是来自相同的基因但是在不同点开始转录的转录物。剪接变体是得自相同转录物但剪接不同的mRNA变体。在真核生物中，当多-外显子基因由基因组DNA转录时，原始RNA经过剪接产生功能性的mRNA，它只有外显子，用来翻译成氨基酸序列。相应地，一个给定的基因可以有零个或多个可变转录物，每个转录物有零个或多个剪接变体。每个转录变体都有独特的外显子组成，而且与原始转录物相比，可有不同的编码和/或非编码(5′或3′末端)部分。转录变体可以编码具有相同或相似功能的相似或不同的蛋白质，或能编码具有不同功能的蛋白质，而且可以同时在相同的组织中、或同时在不同的组织中、或在不同时间在相同的组织中、或不同时间在不同的组织中表达。转录变体编码的蛋白质可有相似或不同的细胞或细胞外定位，例如，分泌的相对于细胞内的。可以通过多种为本领域所接受的方法来鉴定转录变体。例如，可变转录物和剪接变体可以通过全长克隆实验，或采用全长转录物和EST序列来鉴定。首先，所有人类的EST聚集成簇，相互之间表现出直接或间接的同一性。其次，相同聚簇中的EST被进一步分组为亚簇，并且装配为共有序列。将原始基因序列与共有序列或其它的全长序列相比较。每个共有序列都是该基因的潜在剪接变体。即使变体被鉴定为不是全长克隆，通过采用本领域已知的技术，变体的该部分对产生抗原和进一步克隆全长剪接变体是很有用的。另外，本领域已知基于基因组序列鉴定转录变体的计算机程序。基于基因组的转录变体鉴定程序包括FgenesH(A.SalamovandV.Solovyev，″AbinitiogenefindinginDrosophilagenomicDNA，″GenomeResearch.2000April；10(4)516-22)；Grail(URLcompbio.ornl.gov/Grail-bin/EmptyGrailForm)和GenScan(URLgenes.mit.edu/GENSCAN.html)。有关剪接变体鉴定方案的一般性讨论可以参见例如Southan，C.，Agenomicperspectiveonhumanproteases，FEBSLett.2001Jun8；498(2-3)214-8；deSouza，S.J.，etal.，Identificationofhumanchromosome22transcribedsequenceswithORFexpressedsequencetags，Proc.NatlAcadSciUSA.2000Nov7；97(23)12690-3。为进一步确认转录变体的参数，可使用本领域已知的多种技术，例如全长克隆、proteomic确认、基于PCR的确认以及5′RACE确认等(参见例如ProteomicValidationBrennan，S.O.，etal.，Albuminbankspeninsulaanewterminationvariantcharacterizedbyelectrospraymassspectrometry，BiochemBiophysActa.1999Aug17；1433(1-2)321-6；FerrantiP，etal.，Differentialsplicingofpre-messengerRNAproducesmultipleformsofmaturecaprinealpha(s1)-casein，EurJBiochem.1997Oct1；249(1)1-7.ForPCR-basedValidationWellmannS，etal.，Specificreversetranscription-PCRquantificationofvascularendothelialgrowthfactor(VEGF)splicevariantsbyLightCyclertechnology，ClinChem.2001Apr；47(4)654-60；Jia，H.P.，etal，Discoveryofnewhumanbeta-defensinsusingagenomics-basedapproach，Gene.2001Jan24；263(1-2)211-8.ForPCR-basedand5′RACEValidationBrigle，K.E.，etal.，Organizationofthemurinereducedfolatecarriergeneandidentificationofvariantspliceforms，BiochemBiophysActa.1997Aug7；1353(2)191-8)。本领域已知癌症中的基因组区域被调制了。近来，Porkkaetal.(2002)报道了STEAP2转录变体的表达，在正常和恶性前列腺组织中均被发现(Porkka，K.P.，etal.Cloningandcharacterizationofanovelsix-transmembraneproteinSTEAP2，expressedinnormalandmalignantprostate.LaboratoryInvestigation2002Nov；82(11)1573-1582)。另一组科学家也报道了STEAP2转录变体(本文的98P4B6v.6)在前列腺癌中比正常前列腺中的表达显著增高(Korkmaz，K.S.，etal.MolecularcloningandcharacterizationofSTAMP1，ahighlyprostate-specificsixtransmembraneproteinthatisoverexpressedinprostatecancer.TheJournalofBiologicalChemistry.2002Sept.277(39)36689-36696.)。当基因所作图的基因组区域在特定癌症中被调制时，可变的转录物或基因剪接变体也被调制。本文揭示的是98P4B6具有与癌症相关的特定表达分布图。在相同或其它组织中，98P4B6的可变转录物和剪接变体也与癌症相关，因此可以用作肿瘤相关标记/抗原。应用全长基因和EST序列，鉴定出7个转录变体，命名为98P4B6v.2、v.3、v.4、v.5、v.6、v.7和v.8(如图12所示)。原始转录物98P4B6v.1中外显子的边界如表LI所示。v.1的前22个碱基并不在目前装配的人类基因组中v.1的5’区域附近。与98P4B6v.1相比，变体v.2是单外显子转录物，它的3′部分与v.1的最后一个外显子相同。v.3的前两个外显子在v.1的内含子中。变体v.4、v.5和v.6剪接出v.1第1个外显子的224-334。另外，v.5剪接出外显子5而v.6剪接出外显子6但延伸了v.1的外显子5。变体v.7使用可变转录起始位点和不同的3′外显子。变体v.8延伸了5′端，并保留了v.1的整个内含子5。理论上讲，外显子在空间次序上的每个不同组合，例如外显子2和3均是一个潜在的剪接变体。以变体挨着变体为基础列出表LII到LV。表LII(a)-(g)显示转录变体的核苷酸序列。表LIII(a)-(g)显示了转录变体与98P4B6v.1核酸序列的比对。表LIV(a)-(g)列出了转录变体在鉴定的读码框方向上的氨基酸翻译。表LV(a)-(g)显示了剪接变体编码的氨基酸序列与98P4B6v.1氨基酸序列的比对。另外，在比对中显示出单核苷酸多态性(SNP)。实施例698P4B6的单核苷酸多态性单核苷酸多态性(SNP)是核苷酸序列特定位置的单个碱基对改变。在基因组中任何给定的点，均有四种可能的核苷酸碱基对A/T、C/G、G/C和T/A。基因型指的是个体基因组中一个或多个位置的特定碱基对序列。单元型指同一DNA分子上(或高等生物的同一染色体上)多个位置的碱基对序列，通常在提及一个基因或几个紧密连锁基因时使用。在cDNA上发生的SNP称为cSNP。这种cSNP可以改变基因所编码蛋白质的氨基酸，因此改变蛋白质的功能。一些SNP可导致遗传病；其它的可造成表型的数量变化和影响个体对包括饮食和药物的环境因素的反应。因此，SNP和/或等位基因组合(被称为单元型)有许多应用，包括诊断遗传病、确定药物反应和剂量、鉴定造成疾病的基因、以及分析个体间遗传关系(P.Nowotny，J.M.KwonandA.M.Goate，″SNPanalysistodissecthumantraits，″Curr.Opin.Neurobiol.2001Oct；11(5)637-641；M.PirmohamedandB.K.Park，″Geneticsusceptibilitytoadversedrugreactions，″TrendsPharmacol.Sci.2001Jun；22(6)298-305；J.H.Riley，C.J.Allan，E.LaiandA.Roses，″Theuseofsinglenucleotidepolymorphismsintheisolationofcommondiseasegenes，″Pharmacogenomics.2000Feb；1(1)39-47；R.Judson，J.C.StephensandA.Windemuth，″Thepredictivepowerofhaplotypesinclinicalresponse，″Pharmacogenomics.2000feb；1(1)15-26)。SNP可以通过多种为本领域所接受的方法来鉴定(P.Bean，″ThepromisingvoyageofSNPtargetdiscovery，″Am.Clin.Lab.2001Oct-Nov；20(9)18-20；K.M.Weiss，″Insearchofhumanvariation，″GenomeRes.1998Jul；8(7)691-697；M.M.She，″Enablinglarge-scalepharmacogeneficstudiesbyhigh-throughputmutationdetectionandgenotypingtechnologies，″Clin.Chem.2001Feb；47(2)164-172)。例如，可以通过以凝胶为基础的方法对显示多态性的DNA片段进行测序，如限制性片段长度多态性(RFLP)和变性梯度凝胶电泳(DGGE)来鉴定SNP。也可以通过对收集自不同个体的DNA样品直接测序或通过比较来自不同DNA样品的序列来发现SNP。随着公共和私人数据库的序列数据的迅速累积，可以运用计算机程序比较序列来发现SNP(Z.Gu，L.HillierandP.Y.Kwok，″Singlenucleotidepolymorphismhuntingincyberspace，″Hum.Mutat.1998；12(4)221-225)。SNP可以被确定，且个体的基因型或单元型可以通过一系列方法确定，包括直接测序和高通量微阵列(P.Y.Kwok，″Methodsforgenotypingsinglenucleotidepolymorphisms，″Annu.Rev.GenomicsHum.Genet2001；2235-258；M.Kokoris，K.Dix，K.Moynihan，J.Mathis，B.Erwin，P.Grass，B.HinesandA.Duesterhoeft，″High-throughputSNPgenotypingwiththeMasscodesystem，Mol.Diagn.2000Dec；5(4)329-340)。运用上述方法，鉴定出原始转录物98P4B6v.1的11个SNP，分别位于46(A/G)，179(C/T)，180(A/G)，269(A/G)，404(G/T)，985(C/T)，1170(T/C)，1497(A/G)，1746(T/G)，2046(T/G)和2103(T/C)。如图10a所示，具有可选择等位基因的转录物或蛋白质被命名为变体98P4B6v.9至v.19。图11图解显示了与核苷酸变体相对应的蛋白质变体的序列比对。编码与v.1相同的氨基酸序列的核苷酸变体没有在图11中显示。尽管在这里分开表示这些SNP的等位基因，但它们可以以不同的组合(单元型)出现并可在任一含有该SNP位点的转录变体(如98P4B6v.5)中出现。另外，在其它转录变体的不与v.1共享的区域中也存在SNP。例如，v.1的第5个内含子中有14个SNP，它们是转录变体v.2、v.6和v.8的一部分。这些SNP如图10c所示，并在下面列出(数字与v.8相关)1760(G/A)，1818(G/T)，1870(C/T)，2612(T/C)，2926(T/A)，4241(T/A)，4337(A/G)，4338(A/C)，4501(A/G)，4506(C/T)，5434(C/A)，5434(C/G)，5434(C/T)和5589(C/A)。图10b显示了转录变体v.7的独特区域中的SNP1956(A/C)，1987(T/A)，2010(G/C)，2010(G/T)和2059(G/A)(数字与v.7核苷酸序列相对应)。实施例7在原核系统中生产重组98P4B6为了在原核细胞中表达重组98P4B6和98P4B6变体，将全长或部分98P4B6和98P4B6变体cDNA序列克隆入多种本领域已知的表达载体的任何一种，98P4B6的一个或多个下列区域被表达图2和3中所示的全长序列，或98P4B6、其变体或其类似物的任意8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30或更多个邻接的氨基酸。A.体外转录和翻译构建体pCRII为了生产原位检测RNA的98P4B6有义和反义RNA探针，制备编码98P4B6cDNA全长或片段的pCRII构建体(Invitrogen，CarlsbadCA)。pCRII载体在插入序列的侧翼具有Sp6和T7启动子，可启动98P4B6RNA的转录，用作RNA原位杂交实验的探针。这些探针可用于分析细胞和组织中98P4B6在RNA水平的表达。表示98P4B6基因的cDNA氨基酸编码区域的经转录98P4B6RNA用于体外翻译系统，如TnTTMCoupledReticulolysateSystem(Promega，Corp.，Madison，WI)来合成98P4B6蛋白。B.细菌构建体pGEX构建体为了在细菌中生产与谷胱甘肽S-转移酶(GST)蛋白融合的重组98P4B6蛋白，将全部或部分98P4B6cDNA蛋白编码序列克隆入GST融合载体的pGEX家族(AmershamPharmaciaBiotech，Piscataway，NJ)。这些构建体允许氨基末端融合了GST和羧基末端融合了6个组氨酸表位(6×His)的重组98P4B6蛋白序列可控制的表达。GST和6×His标记允许通过适宜的亲和基质纯化来自诱导细菌的重组融合蛋白，并允许运用抗GST和抗His抗体来识别融合蛋白。6×His标记通过在例如，开放阅读框(ORF)克隆引物的3′末端添加6个组氨酸密码子来产生。可以使用蛋白酶裂解位点，例如pGEX-6P-1内的PreScissionTM识别位点，这样可以允许GST标记从98P4B6相关蛋白上裂解下来。氨苄青霉素抗性基因和pBR322来源允许在大肠杆菌中选择和维持pGEX质粒。在pGEX载体中产生含有STEAP-2蛋白质序列的氨基酸2-204的谷胱甘肽-S-转移酶(GST)融合蛋白。通过谷胱甘肽-sepaharose亲和层析法从诱导细菌中纯化重组GST-STEAP-2融合蛋白，并将其用作免疫原来生产多克隆抗体。pMAL构建体为了在细菌中生产融合了麦芽糖-结合蛋白(MBP)的重组98P4B6蛋白，通过克隆到pMAL-c2X和pMAL-p2X载体(NewEnglandBiolabs，Beverly，MA)上，将全部或部分的98P4B6cDNA蛋白编码序列与MBP基因融合。这些构建体允许氨基端融合了MBP和羧基端融合了6个组氨酸表位标记的重组98P4B6蛋白序列可控制地表达。MBP和6×His标记允许通过适宜的亲和基质纯化来自诱导细菌的重组蛋白质，并允许运用抗MBP和抗His抗体来识别融合蛋白。6×His表位标签通过在克隆引物的3′端添加6个组氨酸密码子来产生。Xa因子识别位点允许将pMAL标记从98P4B6中裂解下来。pMAL-c2X和pMAL-p2X载体被最优化从而分别在细胞质或细胞周质内表达重组蛋白。细胞周质表达增强了蛋白质通过二硫键的折叠。pET构建体为了在细菌细胞中表达98P4B6，将全部或部分的98P4B6cDNA蛋白编码序列克隆到pET家族的载体中(Novagen，Madison，WI)。这些载体允许在细菌中严密控制地表达重组98P4B6蛋白，所述蛋白质可以与提高溶解性的蛋白质，例如NusA和硫氧还蛋白(Trx)以及有助于纯化和检测重组蛋白质的表位标记例如6×His和S-TagTM融合，也可以不与它们融合。例如，采用pETNusA融合系统43.1来生产构建体，使得98P4B6蛋白的区域被表达成与NusA氨基末端的融合蛋白。C.酵母构建体pESC构建体为了在酵母种酿酒酵母中表达98P4B6以生产重组蛋白质和进行功能研究，将全部或部分98P4B6cDNA蛋白编码序列克隆到pESC家族的载体中，每个载体包含4个选择标记HIS3，TRP1，LEU2，和URA3的一个(Stratagene，LaJolla，CA)。这些载体允许在同一酵母细胞内由同一质粒可控制地表达直至2个包含FlagTM或Myc表位标记的不同基因或克隆序列。这个系统可用于确定98P4B6的蛋白质-蛋白质相互作用。另外，酵母中的表达产生类似的翻译后修饰，例如糖基化和磷酸化，当在真核细胞中表达时可发现这些修饰。pFSP构建体为了在酵母种Saccharomycespombe中表达98P4B6，将全部或部分的98P4B6cDNA蛋白编码序列克隆到pESP家族的载体中。这些载体允许氨基端或羧基端融合了有助于纯化重组蛋白质的GST的98P4B6蛋白序列可控制地高表达。FlagTM表位标记允许运用抗FlagTM抗体来检测重组蛋白质。实施例8在高等真核系统中生产重组98P4B6A.哺乳动物构建体为了在真核细胞中表达重组98P4B6，将全部或部分的98P4B6cDNA序列克隆到本领域已知的表达载体的任何一种。这些构建体中表达了一个或多个下列98P4B6区域98P4B6v.1到v.11的氨基酸1到255，或8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30或更多个邻接氨基酸中的任一种；98P4B6v.12和v.13或其变体或其类似物的氨基酸1到1266，或8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30或更多个邻接氨基酸中的任一种。该构建体可以被转染至多种哺乳动物细胞的任意一种，如293T细胞中。可以用本文描述的抗98P4B6多克隆血清来检测被转染的293T细胞裂解产物。pcDNA4/HisMax构建体为了在哺乳动物细胞中表达98P4B6，将98P4B6的ORF，或其一部分克隆入pcDNA4/HisMaxVersionA(Invitrogen，Carlsbad，CA)。采用巨细胞病毒(CMV)启动子和SP16翻译增强子来驱动蛋白质的表达。重组蛋白质的氨基末端融合有XpressTM和6个组氨酸(6×His)表位。pcDNA4/HisMax载体也含有牛生长激素(BGH)多聚腺苷酸信号和转录终止序列来提高mRNA的稳定性，同时含有在表达大T抗原的细胞系中用于附加型复制和简单载体拯救的SV40起点。Zeocin抗性基因允许对表达蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因和ColE1起点允许在大肠杆菌中选择和维持质粒。pcDNA3.1/MycHis构建体为了在哺乳动物细胞中表达98P4B6，将具有共有Kozak翻译起始位点的98P4B6ORF，或其一部分克隆入pcDNA3.1/MycHisVersionA(Invitrogen，Carlsbad，CA)。蛋白质的表达通过巨细胞病毒(CMV)启动子来驱动。重组蛋白质的羧基末端融合有myc表位和6×His表位。pcDNA3.1/MycHis载体也包含牛生长激素(BGH)多聚腺苷酸信号和转录终止序列来提高mRNA的稳定性，同时含有在表达大T抗原的细胞系中用于附加型复制和简单载体拯救的SV40起点。可应用新霉素抗性基因，因为可它允许对表达蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因和ColE1起点允许在大肠杆菌中选择和维持质粒。pcDNA3.1/GFP构建体为了在哺乳动物细胞中表达98P4B6，并允许采用荧光检测重组蛋白质，根据Mirzabekovetal.(1999)对98P4B6ORF序列进行密码子最优化，并将其克隆入pcDNA3.1/GFP载体以产生98P4B6.GFP.pcDNA3.1构建体。蛋白质的表达通过巨细胞病毒(CMV)启动子来驱动。重组蛋白质的羧基末端融合有绿色荧光蛋白(GFP)，有助于非侵入性的体内检测和细胞生物学研究。pcDNA3.1/GFP载体也包含牛生长激素(BGH)多聚腺苷酸信号和转录终止序列来提高mRNA的稳定性，同时含有在表达大T抗原的细胞系中用于附加型复制和简单载体拯救的SV40起点。新霉素抗性基因允许对表达蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因和ColE1起点允许在大肠杆菌中选择和维持质粒。如图17和18所示用98P4B6.GFP.pcDNA3.1转染293T细胞。Western印迹分析(图17)、流式细胞计数(图18A)及荧光显微检测(图18B)的结果显示出融合蛋白的强烈表达。氨基末端融合有GFP的其它构建体在pcDNA3.1/NT-GFP-TOPO中制成，其跨越了全长的98P4B6蛋白。PAPtag将98P4B6的ORF，或其一部分克隆入pAPtag-5(GenHunterCorp.Nashville，TN)。该构建体产生了羧基末端融合了碱性磷酸酶而氨基末端融合了IgGκ信号序列的98P4B6蛋白。同时还制备了具有氨基末端IgGκ信号序列的碱性磷酸酶与98P4B6蛋白氨基末端融合的构建体。使得到的重组98P4B6蛋白最优化，以分泌至被转染哺乳动物细胞的培养基中，并可用于鉴定与98P4B6蛋白相互作用的蛋白质，如配体或受体。蛋白质的表达通过CMV启动子来驱动，重组蛋白质也含有在羧基末端融合的有助于纯化和检测的myc和6×His表位。载体上的Zeocin抗性基因允许对表达重组蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因允许在大肠杆菌中选择质粒。pTag5将98P4B6ORF或其一部分克隆入pTag-5。该载体与pAPtag类似但没有融合碱性磷酸酶。该构建体产生的98P4B6蛋白在氨基末端具有IgGκ信号序列，同时羧基末端具有有助于检测和亲和纯化的myc和6×His表位标记。将得到的重组98P4B6蛋白最优化，以分泌入被转染哺乳动物细胞的培养基，并可用作鉴定与98P4B6蛋白相互作用的蛋白质，如配体或受体的免疫原或配体。蛋白质的表达通过CMV启动子来驱动，载体上的Zeocin抗性基因允许对表达蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因允许在大肠杆菌中选择质粒。PsecFc将98P4B6ORF或其一部分也克隆入psecFc。通过将人免疫球蛋白G1(IgG)Fc(铰链区，CH2，CH3区)克隆至pSecTag2(Invitrogen，California)来装配psecFc载体。该构建体在98P4B6蛋白的羧基末端产生IgG1Fc融合蛋白，而在N末端融合了IgGκ信号序列。也使用了利用鼠IgG1Fc区域的98P4B6融合蛋白。将得到的重组98P4B6蛋白最优化以分泌入被转染哺乳动物细胞的培养基，并可用作鉴定与98P4B6蛋白相互作用的蛋白质，如配体或受体的免疫原。蛋白质的表达通过CMV启动子来驱动，载体上的潮霉素抗性基因允许对表达重组蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因允许在大肠杆菌中选择质粒。pSRα构建体为了产生组成型表达98P4B6的哺乳动物细胞系，将98P4B6ORF或其一部分克隆入pSRα构建体。通过将pSRα构建体转染至293T-10A1包装系，或分别将pSRα和辅助质粒(包含缺失的包装序列)共转染至293细胞，来产生兼嗜性和亲嗜性逆转录病毒。使用所述逆转录病毒感染多种哺乳动物细胞系，导致克隆基因98P4B6整合至宿主细胞系。蛋白质的表达通过长末端重复序列(LTR)驱动，载体上存在的新霉素抗性基因允许对表达蛋白质的哺乳动物细胞进行选择，同时氨苄青霉素抗性基因和ColE1起点允许在大肠杆菌中选择和维持质粒。因此逆转录病毒载体可以用于感染和生产多种使用如PC3，NIH3T3，TsuPr1，293或rat-1细胞的细胞系。另外制备了使98P4B6序列的羧基端融合如FLAGTM标记的表位标记的pSRα构建体，从而允许使用抗Flag抗体来检测。例如，将FLAGTM序列5′gattacaaggatgacgacgataag3′(SEQIDNO113)加入ORF3′末端的克隆引物。另外制备了pSRα构建体，来生产全长98P4B6蛋白的氨基端和羧基端GFP和myc/6×His融合蛋白。其它的病毒载体另外制备了用于病毒介导的98P4B6传递和表达的构建体。在病毒传递系统如腺病毒载体和疱疹病毒扩增子载体中获得了导致98P4B6高水平表达的高病毒滴度。通过PCR扩增98P4B6编码序列或其片段，并亚克隆至AdEasy穿梭载体(Stratagene)。根据厂家说明进行重组和病毒包装来生产腺病毒载体。可选地，将98P4B6编码序列或其片段克隆至HSV-1载体(Imgenex)来生产疱疹病毒载体。然后将这些病毒载体用于感染多种细胞系如PC3，NIH3T3，293或rat-1细胞。受调节的表达系统为了调控哺乳动物细胞中98P4B6的表达，将98P4B6的编码序列或其部分克隆入受调节的哺乳动物表达系统如T-Rex系统(Invitrogen)、GeneSwitch系统(Invitrogen)和紧密调节的Ecdysone系统(Sratagene)。这些系统允许对重组98P4B6依赖于时间和浓度的效应进行研究。然后可将这些载体用于控制多种细胞系，如PC3，NIH3T3，293或rat-1细胞中的98P4B6表达。B.杆状病毒表达系统为了在杆状病毒表达系统中产生重组98P4B6蛋白，将98P4B6ORF或其部分克隆入杆状病毒转移载体pBlueBac4.5(Invitrogen)中，所述载体的N末端提供了His-标记。具体地说，将pBlueBac-98P4B6与辅助质粒pBac-N-Blue(Invitrogen)共转染入SF9(草地夜蛾)昆虫细胞来生产重组杆状病毒(详见Invitrogen操作手册)。然后从细胞上清液中收集杆状病毒并用斑点分析进行纯化。然后通过用纯化的杆状病毒感染HighFive昆虫细胞(Invitrogen)来生产重组98P4B6蛋白。可以用抗98P4B6或抗-His标记抗体检测重组98P4B6蛋白。可以纯化98P4B6蛋白，将其用于多种基于细胞的分析或作为免疫原来生产98P4B6特异性的多克隆和单克隆抗体。实施例9抗原性分布图和二级结构图5(A-E)，图6(A-E)，图7(A-E)，图8(A-E)和图9(A-E)图解描述了5种98P4B6变体1，2，5-7的氨基酸分布图，对每个变体的评估可以通过访问位于万维网.expasy.ch/cgi-bin/protscale.pl)的ProtScale网站的ExPasy分子生物学服务器获得。这些分布图图5，亲水性(HoppT.P.，WoodsK.R.，1981.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.783824-3828)；图6，亲/疏水性(KyteJ.，DoolittleR.F.，1982.J.Mol.Biol.157105-132)；图7，可及残基百分比(JaninJ.，1979Nature277491-492)；图8，平均柔性(BhaskaranR.，andPonnuswamyP.K.，1988.Int.J.Pept.ProteinRes.32242-255)；图9，β-转角(Deleage，G，RouxB.1987ProteinEngineering1289-294)以及任何其它可在本领域，如在ProtScale站点获得的分布图可用来鉴定每种98P4B6变体蛋白质的抗原性区域。应用下述ProtScale参数来生成98P4B6变体的上述每一个氨基酸分布图1)窗口大小为9；2)与窗口中心相比窗口边缘占100％的权重；以及3)氨基酸分布图的数值标准化至介于0和1之间。使用亲水性(图5)，亲/疏水性(图6)和可及残基百分比(图7)分布图来确定亲水性(即亲水性和可及残基百分比值大于0.5，亲/疏水性分布图上的值小于0.5)氨基酸片段。这些区域很可能暴露于水环境，出现在蛋白质的表面，因此可以用于免疫识别，如被抗体识别。平均柔性(图8)和β转角(图9)分布图可确定不受二级结构如β折叠和α折叠约束的氨基酸片段(即，β-转角分布图和平均柔性分布图的数值大于0.5)。这些区域也很可能暴露于蛋白质的表面，因此可以用于免疫识别，如被抗体识别。通过例如图5(A-E)，图6(A-E)，图7(A-E)，图8(A-E)和/或图9(A-E)所示的分布图显示出来的98P4B6变体蛋白质的抗原性序列可用于制备或者是肽或是编码肽的核酸的免疫原，用以产生治疗和诊断用的抗98P4B6抗体。该免疫原可以是图2和3中所列98P4B6蛋白变体1，2，5-7的5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，30，35，40，45，50或50个以上邻接的氨基酸，或相应的编码它们的核酸。特别地，本发明的肽免疫原可含有图2和3中的以任何整数增加但至少为5个氨基酸的肽区域，其中包括在图5的亲水性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；图2和3中的以任何整数增加但至少为5个氨基酸的肽区域，其中包括在图6的亲/疏水性分布图中数值小于0.5的氨基酸位置；图2和3中的以任何整数增加但至少为5个氨基酸的肽区域，其中包括在图7的可及残基百分比分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；图2和3中的以任何整数增加但至少为5个氨基酸的肽区域，其中包括在图8的平均柔性分布图中数值大于0.5的氨基酸位置；以及图2和3中的以任何整数增加但至少为5个氨基酸的肽区域，其中包括在图9的β-转角分布图中数值大于0.5的氨基酸位置。本发明的肽免疫原也可以包括编码前述任一个的核酸。本发明所有的免疫原、肽或核酸均可以包含在人的单位剂量形式中，或包含在包括与人体生理学相容的药物赋形剂的组合物中。可运用通过ExPasy分子生物学服务器访问(万维网网址为expasy.ch/tools/)的HNN-等级神经网络法(Guermeur，1997，http//pbil.ibCp.fr/cgi-bin/npsa～automat.pl？page＝npsa～nn.html)，由一级氨基酸序列来预测98P4B6蛋白变体1，2，5-7的二级结构，即α螺旋、延伸链和无规卷曲的出现和位置。分析显示98P4B6变体1由54.41％的α螺旋，12.33％的延伸链，33.26％无规卷曲(图13A)组成，变体2由17.78％的α螺旋，6.67％的延伸链，和75.56％的无规卷曲(图13B)组成，变体5由51.55％的α螺旋，13.13％延伸链，和35.32％的无规卷曲(图13C)组成，变体6由54.49％的α螺旋，11.84％的延伸链，和33.67％的无规卷曲(图13D)组成，变体7由48.26％的α螺旋，15.28％的延伸链，和36.46％的无规卷曲(图13E)组成。对98P4B6变体蛋白跨膜结构域可能的存在的分析采用通过ExPasy分子生物学服务器访问(万维网网址为expasy.ch/tools/)的多种跨膜预测算法进行。图13F和13G显示的是对变体1的分析结果，描述了运用TMpred程序测定的6个跨膜结构域(图13F)以及运用TMHMM程序测定的5个跨膜结构域(图13G)的存在和位置。图13H和13I图示的是对变体2的分析结果，描述了运用TMpred程序测定的1个跨膜结构域(图13H)的存在和位置，运用TMHMM程序没有发现跨膜结构域(图13I)。图13J和13K图示的是对变体5的分析结果，描述了运用TMpred程序测定的6个跨膜结构域(图13J)的存在和位置，以及运用TMHMM程序测定的4个跨膜结构域(图13K)的存在和位置。图13L和13M图示的是对变体6的分析结果，描述了运用TMpred程序测定的6个跨膜结构域(图13L)的存在和位置，以及运用TMHMM程序测定的6个跨膜结构域(图13M)的存在和位置。图13N和13O图示的是对变体7的分析结果，描述了运用TMpred程序测定的6个跨膜结构域(图13N)的存在和位置，以及运用TMHMM程序测定的4个跨膜结构域(图13O)的存在和位置。每个程序的结果，即编码跨膜结构域的氨基酸总结于表VI。实施例10生产98P4B6多克隆抗体多克隆抗体可以在哺乳动物中生成，例如通过一次或多次注射免疫剂，以及需要时注射佐剂。典型地，免疫剂和/或佐剂通过多重皮下或腹膜内注射给哺乳动物注射。另外，为用全长98P4B6蛋白变体免疫，采用计算机算法来设计免疫原，根据氨基酸序列分析，所述免疫原包括抗原性特征和被免疫宿主的免疫系统识别的特征(参见实施例9，标题为“抗原性分布图和二级结构”)。这样的区域被预测为有亲水性、柔性、有β-转角构象并暴露在蛋白质表面(参见例如图5(A-E)，图6(A&B)，图7(A-E)，图8(A-E)，或图9(A-E)中显示98P4B6蛋白变体的该区域的氨基酸分布图)。例如，包含98P4B6蛋白变体的亲水性、柔性、β-转角区域的重组细菌融合蛋白或肽被用作抗原，在新西兰白兔(NewZealandWhiterabbits)中生产多克隆抗体或如实施例11所述产生单克隆抗体。例如，在98P4B6变体1中，这种区域包括但并不限于氨基酸153-165，氨基酸240-260以及氨基酸345-358。在变体2的特异性序列中，这种区域包括但并不限于氨基酸26-38。在变体5的特异性序列中，这种区域包括但并不限于氨基酸400-410。在变体6的特异性序列中，这种区域包括但并不限于氨基酸455-490。在变体7的特异性序列中，这种区域包括但并不限于氨基酸451-465和氨基酸472-498。将免疫剂与已知的对免疫哺乳动物具有免疫原性的蛋白质偶联是有益的。这种免疫原性蛋白质的实例包括但并不限于匙孔戚血蓝蛋白(KLH)、血清白蛋白、牛甲状腺球蛋白以及大豆胰蛋白酶抑制剂。在一个实施方案中，编码98P4B6变体1的氨基酸153-165的肽与KLH偶联，并用来免疫兔。可选择地，免疫剂可以包括全部或部分的98P4B6变体蛋白质、其类似物或融合蛋白。例如，可以用重组DNA技术使98P4B6变体1氨基酸序列与任一种本领域众所周知的融合蛋白配对物相融合，所述配对物如谷胱甘肽S转移酶(GST)和HIS标记的融合蛋白。在另一个实施方案中，用重组技术和pGEX表达载体将98P4B6变体1的氨基酸2-204与GST融合，表达、纯化并用来免疫兔。采用适宜的亲和基质从诱导的细菌中纯化该融合蛋白。其它可以利用的重组细菌融合蛋白包括麦芽糖结合蛋白、LacZ、硫氧还蛋白、NusA或免疫球蛋白的恒定区(参见题为“在原核系统中生产98P4B6”的部分，以及CurrentProtocolsInMolecularBiology，Volume2，Unit16，FrederickM.Ausubuletal.eds.，1995；Linsley，P.S.，Brady，W.，Urnes，M.，Grosmaire，L，Damle，N.，andLedbetter，L.(1991)J.Exp.Med.174，561-566)。除了细菌来源的融合蛋白，也采用了哺乳动物表达的蛋白质抗原。这些抗原由哺乳动物表达载体如Tag5和Fc-融合载体表达(参见题为“在真核生物系统中生产重组98P4B6”的部分)，并保留翻译后修饰，如在天然蛋白质中发现的糖基化等。在一个实施方案中，将变体1的氨基酸324-359(编码跨膜结构域之间的胞外环)克隆入Tag5哺乳动物分泌载体。通过金属螯合层析由稳定表达重组载体的293T细胞的组织培养物上清中纯化重组蛋白质。然后将纯化的Tag598P4B6蛋白用作免疫原。在免疫操作期间，在佐剂中混匀或乳化抗原对提高宿主动物的免疫应答是有益的。免疫佐剂的实例包括但并不限于完全弗氏佐剂(CFA)和MPL-TDM佐剂(单磷酰基脂质体A，合成海藻糖dicorynomycolate)。在典型的操作中，起先用200μg，典型地为100-200μg与完全弗氏佐剂(CFA)混合的与KLH偶联的融合蛋白或肽对兔进行皮下免疫。接着用200μg，典型地为100-200μg处于不完全弗氏佐剂(IFA)中的免疫原给兔每2周皮下注射一次。每次免疫后大约7-10天取血检验，用ELISA监测抗血清滴度。为了检验免疫血清，如用Tag5-98P4B6变体1蛋白质免疫获得的兔血清的反应性和特异性，将全长98P4B6变体1cDNA克隆入pCDNA3.1myc-his表达载体(Invitrogen，参见题为″在真核系统中生产重组98P4B6″的实施例)。将构建体转染至293T细胞后，用抗98P4B6血清和抗His抗体(SantaCruzBiotechnologies，SantaCruz，CA)检测细胞裂解液，从而用Western印迹技术确定对变性98P4B6蛋白的特异反应性。分别如图17B和17C所示，用针对GST融合蛋白和肽产生的多克隆抗体检测293T中表达的98P4B6变体1蛋白质。另外，通过荧光显微术、流式细胞仪和对293T和其它重组表达98P4B6的细胞的免疫沉淀反应检测免疫血清，确定对天然蛋白质的特异性识别。也可进行应用内源性表达98P4B6的细胞的Western印迹、免疫沉淀、荧光显微术和流式细胞仪技术以检测反应性和特异性。通过流经包含单独的或处于其它不相关融合蛋白中的融合配对物的亲和柱来耗损与融合配对物序列反应的抗体，籍此纯化用98P4B6变体融合蛋白，如GST和MBP融合蛋白免疫兔获得的抗血清。例如，首先通过流经与GST蛋白共价结合的AffiGel基质(BioRad，Hercules，Calif.)柱纯化由GST-98P4B6变体1融合蛋白获得的抗血清。然后通过流经由与MBP-98P4B6融合蛋白共价结合的AffiGel基质组成的柱子亲和纯化抗血清。接着，进一步通过G蛋白亲和层析来纯化血清以分离IgG组分。通过流经由原始蛋白质免疫原或游离肽组成的柱基质来亲和纯化得自其它被His标记的抗原和肽免疫的兔的血清和耗尽融合配对物的血清，如图17C中用到的抗肽多克隆抗体。实施例11生产98P4B6单克隆抗体(mAb)在一个实施方案中，98P4B6变体的治疗性mAb包含与特异性针对每个变体蛋白质或特异性针对变体间共同序列的表位反应的mAb，所述mAb会破坏或调制98P4B6变体的生物学功能，例如，那些会破坏与配体和结合配对物的相互作用的mAb。用于生产这种mAb的免疫原包括那些指定的编码或包含全部98P4B6蛋白变体序列，由氨基酸序列的计算机分析推测具有抗原性的98P4B6蛋白变体的区域(参见例如图5(A-E)，图6(A-E)，图7(A-E)，图8(A-E)，或图9(A-E)，以及题为“抗原性分布图和二级结构”的实施例9)。免疫原包括肽、重组细菌蛋白质以及哺乳动物表达的Tag5蛋白和人和鼠IgGFC融合蛋白。另外，使用经改造可高水平表达各个98P4B6变体的细胞，例如293T-98P4B6变体1或300.19-98P4B6变体1鼠前B细胞来免疫小鼠。为了生产98P4B6变体的mAb，首先用与完全弗氏佐剂混合的10-50μg蛋白质免疫原或107个98P4B6-表达细胞腹膜内(IP)免疫小鼠，接着用与不完全弗氏佐剂混合的10-50μg蛋白质免疫原或107个细胞每2-4周IP免疫小鼠一次。可选的，将MPL-TDM佐剂用于免疫。除上述蛋白和基于细胞的免疫策略外，可采用基于DNA的免疫规程，其中编码98P4B6变体序列的哺乳动物表达载体被用于通过直接注射质粒DNA来免疫小鼠。例如，氨基酸序列324-359被克隆入Tag5哺乳动物分泌载体，且重组载体被用作免疫原。在另外一个例子中，同样的氨基酸被克隆入Fc融合分泌载体，其中98P4B6变体1序列的氨基末端与IgK前导序列融合，羧基末端与人或鼠IgGFc区域的编码序列融合。然后将这一重组载体用作免疫原。该质粒免疫操作程序可与由同一载体表达的纯化蛋白质以及表达各个98P4B6变体的细胞联合使用。在免疫操作的过程中，每次注射后7-10天取血检验，监测免疫反应的滴度和特异性。一旦通过ELISA、Western印迹、免疫沉淀、荧光显微术和流式细胞仪技术确定已获得适宜的反应性和特异性，便采用本领域众所周知的操作程序(参见例如，HarlowandLane，1988)进行融合与杂交瘤的产生。在一个生产98P4B6单克隆抗体的实施方案中，Tag5-98P4B6变体1抗原的编码氨基酸324-359由稳定转染的293T细胞表达，从中纯化出所述抗原。起初用与完全弗氏佐剂混合的25μgTag5-98P4B6变体1蛋白腹膜内(IP)免疫BalbC小鼠，接着用与不完全弗氏佐剂混合的25μg抗原每2周免疫小鼠一次，总共进行3次免疫。采用Tag5抗原进行ELISA确定被免疫小鼠的血清滴度。通过用转染了编码98P4B6变体1cDNA的表达载体的293T细胞进行Western印迹、免疫沉淀、荧光显微术和流式细胞仪技术监测血清与全长98P4B6变体1蛋白质的反应性和特异性(参见例如题为“在真核系统中生产重组98P4B6蛋白”的实施例，图20)。也可采用其它重组98P4B6变体1表达细胞或内源性表达98P4B6变体1的细胞。使表现出最强反应性的小鼠睡眠，并最后用溶于PBS中的Tag5抗原注射，4天后处死。收集处死小鼠的脾脏并使用标准操作(HarlowandLane，1988)与SPO/2骨髓瘤细胞融合。采用ELISA、Western印迹、免疫沉淀、荧光显微术和流式细胞仪技术筛查HAT选择生长孔的上清液，从而鉴定出能产生98P4B6特异性抗体的克隆。为了生产针对每个98P4B6变体蛋白质的特异性单克隆抗体，可设计免疫原，使其针对每一变体的编码序列都是独一无二的。在一个实施方案中，制备出编码98P4B6变体2(AA1-45)全长序列的Tag5抗原，纯化并用作免疫原来获得针对98P4B6变体2的特异性单克隆抗体。在另一个实施方案中，由98P4B6变体5的氨基酸400-410组成的抗原性肽与KLH连接并用作免疫原。在另一个实施方案中，编码98P4B6变体6的氨基酸455-490的GST融合蛋白被用作免疫原来获得针对变体6的特异性单克隆抗体。在另一个实施方案中，由变体7的氨基酸472-498组成的肽与KLH连接并用作免疫原来获得针对变体7的特异性单克隆抗体。对杂交瘤上清液的各自的抗原进行筛查，然后进一步筛查表达特异性变体的细胞，并交叉筛查表达其它变体的细胞以获得变体特异性的单克隆抗体。采用标准技术确定98P4B6变体单克隆抗体的结合亲和性。亲和性检测能定量抗体与表位结合的强度，并用于帮助确定哪种98P4B6变体单克隆抗体优选用于诊断或治疗性应用，这一点是本领域技术人员所熟知的。B1Acore系统(Uppsala，Sweden)是用于测定结合亲和性的优选方法。BIAcore系统采用表面胞质基因组共振(SPR，WelfordK.1991，Opt.Quant.Elect.231；MortonandMyszka，1998，MethodsinEnzymology295268)来监测生物分子实时的相互作用，B1Acore分析能便利地生成缔合常数、解离常数、平衡解离常数以及亲和常数。实施例12HLAI类和II类结合分析根据公开的方法，使用纯化的HLA分子进行HLAI类和II类结合试验(例如，PCT公开号WO94/20127和WO94/03205；Sidneyetal.，CurrentProtocolsinImmunology18.3.1(1998)；Sidney，etal，J.lmmunol.154247(1995)；Sette，etal.，Mol.Immunol.31813(1994))。简而言之，如其所述，将纯化的MHC分子(5-500nM)与多种未标记的肽抑制剂和1-10nM125I放射性标记的探针肽共同保温。保温后，通过凝胶过滤将MHC-肽复合物与游离肽分开，确定结合肽组分。典型地，在预试验中，在固定量的经放射性标记的肽的存在下滴定每个MHC制品以确定结合10-20％的总放射性所需的HLA分子浓度。所有后序的抑制和直接结合试验都用这些HLA浓度进行。由于在这些条件下，[标记]＜[HLA]而IC50≥[HLA]，故测出的IC50值为合理的真正KD的近似值。典型地，肽抑制剂在浓度为120μg/ml-1.2ng/ml时可被检测出来，并在2-4个完全独立的实验中检测。为了能够比照从不同实验中得出的数据，通过用阳性抑制对照的IC50除以每个受试肽(典型地为经放射性标记的探针肽的未标记版本)的IC50，计算出每个肽的相对结合数值。为了数据库的用途和内部实验的比较，编辑了相对结合值。随后，通过用阳性抑制对照IC50的nM值除以感兴趣肽的相对结合，将这些值变回至IC50nM值。这种数据编辑方法对比较在不同的天数或者用不同份额的纯化MHC测定的肽来说是精确的和一致的。上面概述的结合分析可用来分析携有HLA超基元和/或HLA基元的肽(见表IV)。实施例13鉴定携有HLA超基元和基元的CTL候选表位本发明中的HLA疫苗组合物可以包括多个表位。多个表位可包含多个HLA超基元或者基元，借此达到广泛的种群覆盖面。这个实施例说明了对这种疫苗组合物的内含物中携有超基元-和基元-的表位的鉴定和确认。对种群覆盖面的计算通过下面描述的策略进行。鉴定携有超基元和/或基元的表位的计算机检索和算法为了鉴定题为“抗原性分布图”的实施例和表VIII-XXI和表XXII-XLIX中的携有基元的肽序列而运行的检索采用了图2和图3中列出的98P4B6基因产物的蛋白质序列数据，用于形成表的特异性检索肽在表VII中列出。如下进行对携有HLAI类或II类超基元或基元的表位的计算机检索。利用文字串检索软件程序对所有翻译的98P4B6蛋白质序列进行分析，从而鉴定出包含适当HLA结合基元的潜在肽序列；考虑到已知的基元/超基元，根据本领域的信息，可以容易地产生这种程序。而且，这种计算可以人工进行。鉴定出的A2-，A3-，和DR-超基元序列可利用多项式算法进行评分，来预测它们结合特异性HLAI类或II类分子的能力。这些多项式算法考虑到不同位置的不同氨基酸的影响，基本上基于这样的前提肽-HLA分子相互作用的整体亲和性(或者ΔG)能用″ΔG″＝a1i×a2i×a3i......×ani这种线性多项式函数近似。这里aji表示沿着n个氨基酸的肽序列，在给定位置(i)的给定氨基酸(j)存在的效应的系数。这种方法的关键假设是每个位置的效应实质上并不彼此依赖(例如，各个侧链的非依赖性结合)。当残基j出现在肽的位置i时，假定它给与其它肽序列无关的肽结合自由能量提供不变数量的ji。求导特殊算法系数的方法在Gulukotaetal.，J.Mol.Biol.2671258-126，1997中描述过(同时参见Sidneyetal.，HumanImmunol.4579-93，1996和Southwoodetal，J.Immunol.1603363-3373，1998)。简而言之，在所有的类似于锚和非锚的i位置，相对于组的差数计算携带j的所有肽的平均相对结合(ARB)的几何平均数，并用作ji估计值。对II类肽来说，如果多重对列是可能的，遵循叠代程序，只有最高记分的对列可以利用。为了计算试验组中给定肽的运算记分，把对应于肽序列的ARB值相乘。如果乘积超过了选定的阈值，就可预测该肽可以结合。将适当的阈值选定为所需预测的严格度水平的函数。HLA-A2超级类型交叉反应肽的选择利用基元鉴定软件扫描98P4B6的蛋白质序列，来鉴定包含HLA-A2-超基元主要锚特异性的8-，9-，10-和11-聚体序列。典型地，随后利用上面描述的方案对这些序列记分，再合成对应于得分为正的序列的肽并测定它们在体外结合纯化HLA-A*0201分子的能力(HLA-A*0201被认为是原型A2超级类型分子)。然后测定这些肽结合另外的A2超级类型分子(A*0202，A*0203，A*0206，和A*6802)的能力。能结合5个受试A2超级类型等位基因中的至少3个的肽可典型地被认为是A2超级类型交叉反应的结合剂。优选的肽在亲和力等于或小于500nM时结合3个或更多的HLA-A2超级类型分子。携有HLA-A3超基元的表位的选择还检查了上述经扫描的98P4B6蛋白质序列中具有HLA-A3-超基元一级锚的肽的存在。接着合成与携有HLAA3超基元-的序列相对应的肽，并测定其对HLA-A*0301和HLA-A*1101分子的结合，这些分子由两个最常见的A3-超级类型等位基因编码。对结合亲和力≤500nM，通常≤200nM，至少结合两个等位基因中的一个的肽进行检测，以测定其对其它共有的A3-超级类型等位基因(例如，A*3101，A*3301，和A*6801)的结合交叉反应性，借此鉴定能够结合5个受试HLA-A3-超级类型分子中的至少3个的肽。携有HLA-B7超基元的表位的选择也分析了上述经扫描的98P4B6蛋白质中具有HLA-B7-超基元的8-，9-，10-，或11-聚体肽的存在。合成相应的肽并测定其对HLA-B*0702的结合，该分子由最普遍的B7-超级类型等位基因(即原型B7超级类型等位基因)编码。用标准方法鉴定以IC50≤500nM结合B*0702的肽。然后测定这些肽对其它普通B7-超级类型分子(例如，B*3501，B*5101，B*5301和B*5401)的结合。由此可以鉴定出那些能够结合5个受试B7-超级类型等位基因中的3个或更多个的肽。携有A1和A24基元的表位的选择为进一步扩大种群覆盖面，也将HLA-A1和-A24表位掺入疫苗组合物。也进行了98P4B6蛋白质的分析来鉴定含有HLA-A1和A24基元的序列。利用类似的方法鉴定那些携有其它基元和/或超基元的高亲和性和/或交叉反应性的结合表位。实施例14免疫原性的确认选择按本文描述鉴定的携有CTLA2-超基元的交叉反应性候选肽来确认体外免疫原性，确认以下面的方法学进行用于细胞筛选的靶细胞系将通过把HLA-A2.1基因转移入HLA-A，-B，-C无效突变人类B-类淋巴母细胞系721.221而产生的.221A2.1细胞系用作载有肽的靶，借此检测HLA-A2.1-限制的CTL的活性。在补充抗生素、丙酮酸钠、未必需氨基酸和10％(v/v)热灭活的FCS的RPMI-1640培养基中培养这种细胞系。表达感兴趣抗原的细胞或者含有编码感兴趣抗原的基因的转染体可用作确认肽特异性CTL识别内源性抗原之能力的靶细胞。初始CTL诱导培养产生树状细胞(DC)在含有30μg/mlDNAse的RPMI中解冻PBMC，冲洗两次并悬浮于完全培养基中(RPMI-1640加5％AB型人血清、非必需氨基酸、丙酮酸钠、L-谷氨酰胺和青霉素/链霉素)。通过在6-孔板中以10×106PBMC/孔的量铺板来纯化单核细胞。在37℃放置2小时后，通过轻摇培养板和吸出上清液除去未粘附细胞。共用3mlRPMI洗三次孔来除去大部分非粘附和松弛粘附的细胞，然后在每个孔中加入3毫升含50ng/mlGM-CSF和1，000U/mlIL-4的完全培养基。在第六天往DC中加入75ng/ml的TNFα，在第七天用这些细胞来进行CTL诱导培养。用DC和肽诱导CTL通过用Dynal免疫磁性珠(Dynabeads_M-450)和detacha-bead_试剂进行正向选择分离出CD8+T细胞，典型地，约用200-250×106PBMC来获得24×106CD8+T细胞(足够48-孔板培养)。简而言之，在含有30μg/mlDNAse的RPMI中解冻PBMC，用含1％人AB型血清的PBS洗一次，并悬浮于的PBS/1％AB血清中至浓度为20×106细胞/ml。用PBS/AB型血清冲洗磁珠三次，加到细胞中(140μl珠/20×106细胞)，并在4℃保温同时持续混匀1小时。珠和细胞都用PBS/AB型血清洗四次以除去未粘附细胞，并重新以100×106细胞/ml(以原始细胞数为基础)悬浮于含100μl/mldetacha-bead_试剂和30μg/mlDNAse的PBS/AB血清中。将混合物置于室温下保温1小时，同时持续混匀。再次用PBS/AB/DNAse清洗磁珠来收集CD8+T细胞。收集DC，在1300rpm离心5-7分钟，用含有1％BSA的PBS洗一次，计数，于20℃，在3μg/mlβ2-微球蛋白存在下，以1-2×106/ml的细胞浓度，用40μg/ml的肽脉冲DC达4小时。然后照射DC(4，200拉德)，用培养基洗一次，重新计数。建立诱导培养在10ng/mlIL-7的存在下，在48孔板的每孔中将0.25ml细胞因子产生的DC(1×105细胞/ml)与0.25mlCD8+T-细胞(2×106细胞/ml)共培养。次日加入重组人IL-10至终浓度为10ng/ml，48小时后加入10IU/ml的重组人IL-2。用肽脉冲的粘附细胞重新刺激诱导培养物初始诱导7天和14天后，用肽脉冲的粘附细胞重新刺激细胞。用RPM和DNAse将PBMC解冻并冲洗2次，接着再次以5×106细胞/ml悬浮细胞，并用～4200拉德照射。将2×106个PBMC铺于每孔的0.5ml完全培养基中，37℃保温2小时，通过轻敲培养板用RPMI洗涤板两次以除去未粘附细胞，于37℃，在3μg/mlβ2-微球蛋白存在下，在每孔0.25mlRPMI/5％AB中，用10μg/ml的肽脉冲粘附细胞2小时。吸走每孔的肽溶液，并用RPMI冲洗孔一次。吸走诱导培养物(CD8+细胞)中的大部分培养基，用新鲜培养基定为0.5ml。接着将细胞转移至含有肽脉冲的粘附细胞的孔中。24小时后，加入终浓度为10ng/ml的重组人IL-10，次日加入50IU/ml的重组人IL-2，2-3天后再次加入(Tsaietal.，CriticalReviewsinImmunology18(1-2)65-75，1998)。7天后，在释放试验中分析培养物的CTL活性。在一些实验中，在第2次重新刺激时，用原位IFNγELISA分析培养物的肽特异性识别，7天后分析内源性识别。扩展后，用两个试验测量活性，以进行并列比较。通过释放测定CTL裂解活性第二次刺激7天后，通过以单个E∶T分析各个孔，在标准的(5小时)释放试验中检测细胞毒性。于37℃，将细胞与10μg/ml肽保温过夜以制备肽脉冲靶。用胰蛋白酶-EDTA将粘附的靶细胞从培养瓶中移除，于37℃，用200μCi的铬酸钠(Dupont，Wilmington，DE)标记靶细胞1小时。以106每ml重新悬浮标记的靶细胞，用浓度为3.3×106/ml的K562细胞(一种NK-敏感的成红细胞瘤细胞系，用于降低非特异性裂解)1∶10稀释。将靶细胞(100μl)和效应细胞(100μl)铺于96孔圆底培养板中，37℃保温5小时。届时，从每孔中收集100μl上清液，根据以下公式确定裂解的百分比[(试样的cpm值-自发的释放样品的cpm值)/(最大释放样品的cpm值-自发的释放样品的cpm值)×100。通过分别使1％TritonX-100和单独的培养基与标记的靶共同保温以确定最大和自发的释放。阳性培养物的定义为当分析扩展培养物时，单孔情形下的特异性裂解(样品-背景)为10％或更高，以两个最高的E∶T比例为15％或更高。原位检测人IFNγ产生以作为肽特异性和内源性识别的指示4℃下，用小鼠抗人IFNγ单克隆抗体(4μg/ml0.1M，pH8.2)包被Immulon2培养板过夜。用无，的PBS/0.05％吐温20冲洗培养板，并用PBS/10％FCS封闭2小时，然后将CTL(100μl/孔)和靶细胞(100μl/孔)加入每孔，留空孔作为标准以及空白对照(只加入了培养基)。经肽脉冲或作为内源性靶的靶细胞均以1×106细胞/ml的浓度使用。在37℃，5％存在下保温培养板48小时。开始时，将重组人IFN-γ以400pg或1200pg/100μl/孔加入标准孔，培养板在37℃下保温2小时。洗涤培养板，并加入100μl的生物素化小鼠抗人IFN-γ单克隆抗体(2μg/ml，溶于PBS/3％FCS/0.05％吐温20中)，然后室温保温2小时。再次冲洗后，加入100微升HRP-链霉亲和素(1∶4000)，室温保温培养板1小时。接着用冲洗缓冲液洗涤培养板6次，加入100微升/孔显色液(TMB1∶1)，使培养板显色5-15分钟。用50微升/孔的1M终止反应，并在OD450处读数。如果测量IFN-γ/孔比背景至少高50pg或表达水平是背景的2倍，则认为该培养物是阳性的。CTL扩展用抗-CD3将表现出对肽脉冲靶和/或肿瘤靶有特异性裂解活性的培养物扩展2周以上。简而言之，将5×104的CD8+细胞加入T25瓶，其中含有1×106照射的(4,200拉德)PBMC(自体或同种异体的)/ml，2×105照射的(8,000rad)EBV-转化细胞/ml，30ng/mlOKT3(抗-CD3)，以及含10％(v/v)人AB血清、非必需氨基酸、丙酮酸钠、25μM2-巯基乙醇、L-谷氨酰胺和青霉素/链霉素的RPMI-1640。24小时后加入重组人IL2，终浓度为200IU/ml，其后每3天用新鲜的培养基配成50IU/ml的浓度加一次。如果细胞浓度超过1×106/ml，细胞会裂解，在13天和15天之间，在释放试验中以30，10，3和1∶1的E∶T比例分析培养物，或用与扩展前同样的靶细胞，在原位IFNγ试验中以1×106/ml对培养物进行分析。不存在抗CD3+时对培养物的扩展如下选择显示对肽和内源性靶的特异性裂解活性的培养物，将5×104CD8+细胞加入T25培养瓶，其中含有下列物质于37℃用10μg/ml的肽脉冲2小时并且经照射(4,200拉德)的1×106个自身PBMC/ml；2×105照射(8,000rad)的EBV-转化细胞/mlRPMI-1640，所述RPMI-1640中含有10％(v/v)人AB血清、非必需氨基酸、丙酮酸钠、25mM2-ME、L-谷氨酰胺和庆大霉素。携有A2超基元的肽的免疫原性在细胞分析中检验A2-超基元交叉反应结合肽，以确定其在正常个体中诱导肽特异性CTL的能力。在这项分析中，如果肽至少在个体中诱导了肽特异性的CTL，优选也识别内源性表达的肽，则一般认为它是表位。也可以用由表达98P4B6的肿瘤患者分离的PBMC来确定免疫原性。简而言之，由患者分离PBMC，用肽脉冲的单核细胞重新刺激，分析识别肽脉冲靶细胞以及内源性表达抗原的转染细胞的能力。评价A*03/A11的免疫原性采用类似于评价HLA-A2超基元肽的免疫原性所用方法的方法学，对携有HLA-A3超基元-交叉反应结合肽的免疫原性进行评估。评价B7的免疫原性以与对携有A2-和A3-超基元的肽的确定类似的方式确定对如本文所述鉴定的B7-超级类型交叉反应结合肽的免疫原性筛选。携有其它超基元/基元的肽，如HLA-A1，HLA-A24等也用类似的方法学进行确定。实施例15通过产生类似物实行扩展的超基元来提高天然表位的结合能力如本文所述，HLA基元和超基元(含有一级和/或二级残基)对鉴定和制备高度交叉反应的天然肽有帮助。而且，HLA基元和超基元的确定也能使人们通过在天然肽序列中鉴定可类似地赋予肽某些特性，例如，在一组含有超级类型的HLA分子中有更高的交叉反应性，和/或对一些或所有HLA分子有更大的结合亲和性的残基，对高度交叉反应表位进行改造。表现出可调节的结合亲和性的类似肽的实例在本实施例中列出。一级锚残基类比实行肽工程策略来进一步提高表位的交叉反应性。例如，携有A2-超基元的肽的主要锚被改变，如，在位置2引入优选的L，I，V，或M，在C端引入I或V。为了分析类似肽的交叉反应性，首先检验每个经改造的类似物与原型A2超级类型等位基因A*0201的结合，接着，如果A*0201结合能力能维持，继续检验A2-超级类型的交叉反应性。可选地，确定肽可以结合一个或所有的超级类型成员，并类推它可调节与超级类型成员中的任一个(或多个)的结合亲和性以增加种群覆盖面。典型地，在细胞筛查分析过程中，对免疫原性类似物的选择进一步通过亲本野生型(WT)肽至少微弱的结合能力进行限制，即以5000nM或更低的IC50结合至3个或更多的A2超级类型等位基因。这种要求的基本原理在于WT肽必须以与生物学相关的足够量被内源性提供。已证实类似肽具有提高的免疫原性和与亲本表位特异性T细胞的交叉反应性(参见例如Parkhurstetal.，J.Immunol.1572539，1996；andPogueetal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA928166，1995)。在这些肽类似物的细胞筛选中，确定类似物特异性的CTL也能识别野生型肽以及在可能时内源性表达表位的靶细胞是很重要的。携有HLA-A3和B7-超基元的肽的类推采用与类推携有HLA-A2超基元的肽类似的策略来得到携有HLA-A3超基元的表位的类似物。例如，对与3/5A3-超级类型分子结合的肽的一级锚残基进行改造，以使第2位具有优选的残基(V，S，M或A)。接着检验肽类似物结合A*03和A*11(A3原型超级类型等位基因)的能力，那些显示出≤500nM结合能力的被确认为具有A3-超级类型交叉反应性。与携有A2和A3-基元的肽类似，当可能时，可以改良结合3个或更多个B7-超级类型等位基因的肽，以获得增加的交叉反应结合或更大的结合亲和性或结合半寿期。例如，如Sidney等所描述(J.lmmunol.1573480-3490，1996)，携有B7超基元的肽被改造，使其C-末端一级锚位置具有优选残基(V，I，L或F)。按照类似的方式类推其它携有基元和/或超基元的表位的一级锚残基。接着确认类似肽的免疫原性，通常在细胞筛选试验中进行确认。此外，阐明类似物特异性的CTL也能够识别野生型肽和可能时识别内源性表达表位的靶细胞也是很重要的。二级锚残基类比另外，HLA超基元可用于改造高度交叉反应的肽和/或通过鉴定与这些特性相关的二级锚位置处的特定残基而能以提高的亲和性结合HLA分子的肽。例如，分析携有B7超基元的肽与第1位上的F残基的结合能力。接着将肽类推为例如，在第1位上用L替代F。评估类比的肽的增加的结合亲和性，结合半寿期和/或提高的交叉反应性。这样的步骤用增强的特性来鉴定类似肽。进行了例如IFA免疫或脂肽免疫之后，也可以在HLA-B7-转基因小鼠中检测充分提高了结合能力或交叉反应性的经改造类似物的免疫原性。进一步用取自具有表达98P4B6的肿瘤的患者的PBMC检验类似肽刺激回忆应答的能力。其它类比策略其它形式的与锚位置不相关的肽类比包括用α-氨基丁酸替代半胱氨酸。由于半胱氨酸的化学性质，它具有形成二硫键和充分改变肽结构以至于降低结合能力的性质。用α-氨基丁酸替代半胱氨酸不仅缓解了这一问题，而且在一些情况下，显示出提高了结合和交叉结合能力(参见例如，Sette等的综述PersistentViralInfections，Eds.R.Ahmedand1.Chen，JohnWiley&Sons，England，1999)。因此，通过应用单个氨基酸的替代，可以调制HLA超级类型分子的肽配体结合能力和/或交叉反应性。实施例16用HLA-DR结合基元鉴定和确认98P4B6来源的序列如下所述，用描述HLAI类肽时所用方法类似的方法鉴定和确认携有HLAII类超基元或基元的肽表位。选择携有HLA-DR超基元的表位为鉴定源自98P4B6的HLAII类HTL表位，分析98P4B6抗原中携有HLA-DR-基元或超基元的序列的存在。具体地说，选择15-聚体序列，其含有DR-超基元，含有9-聚体的核心，和3个残基的N和C末端-侧翼区域(共15个氨基酸)。预测肽结合DR分子的方法步骤已经确立(Southwoodetal.，J.Immunol.1603363-3373，1998)。这些特异性针对各个DR分子的方法步骤允许对9-聚体核心区域进行评分、排列。每个方法不仅对肽序列的9-聚体核心区域中DR-超基元一级锚的存在进行评分(即，在位置1和位置6)，而且进一步评估序列中二级锚的存在。采用等位基因特异性的选择表(参见例如Southwoodetal，文献同上)，已经发现这些方法有效的选择与特定DR分子有高度结合特性的肽序列。另外，已经发现先后实行这些方法，特别是针对DR1，DR4w4和DR7的方法，可以有效地选择DR交叉反应肽。检验上文鉴定的得自98P4B6的肽对不同普通HLA-DR分子的结合能力。首先检验所有肽与第一组试验对象中的DR分子的结合能力DR1，DR4w4和DR7，接着在第二轮分析中检验至少结合这3个DR分子中的2个的肽与DR2w2β1，DR2w2β2，DR6w19和DR9分子的结合能力。最后，在第三轮分析中筛查至少结合4个第二组DR分子中的2个，并总计共结合7个不同DR分子中的至少4个的肽与DR4w15，DR5w11和DR8w2分子的结合能力。至少结合包括第一、第二、第三轮筛查分析中的10个DR分子中的7个的肽被认为是交叉反应的DR结合剂。能结合共有HLA-DR等位基因的得自98P4B6的肽特别有价值。选择DR3基元肽由于HLA-DR3是在白种人、黑人和西班牙人种中普遍存在的等位基因，DR3结合能力是一种在HTL表位筛选中相关的标准。因此，也可以检验候选肽与DR3的结合能力。然而，考虑到DR3基元的结合特异性，仅仅结合DR3的肽也可以被认为是疫苗制剂组分的候选者。为有效鉴定结合DR3的肽，分析靶98P4B6抗原中携有Geluk等报道的(J.Immunol.1525742-5748，1994)2个DR3-特异性结合基元中的1个的序列。接着合成相应的肽并确认其具有以1μM或更好的亲和性(即小于1μM)结合DR3的能力。发现肽符合这一结合规则，并确定为HLAII类分子高亲合性的结合剂。以这种方法鉴定的DR3结合表位被包括在含有携有DR超基元的肽表位的疫苗组合物中。与携有HLAI类基元的肽的情况类似，类推携有II类基元的肽以改善亲和性或交叉反应性。例如，9-聚体核心序列位置4上的天冬氨酸是DR3结合的理想残基，用它替代该残基通常可提高与DR3的结合。实施例1798P4B6来源的HTL表位的免疫原性本实施例采用本文所述的方法学从已鉴定的分子中确定免疫原性的携有DR超基元-和DR3基元的表位。通过评定刺激HTL反应的能力和/或采用适宜的转基因小鼠模型，以与确定CTL表位的免疫原性类似的方式确定HTL表位的免疫原性。通过筛查1.)用正常PBMC的体外初级诱导或2.)患有表达98P4B6的肿瘤患者的回忆反应来确定免疫原性。实施例18计算不同人种背景的HLA-超级类型表型频率来确定种群覆盖面本实施例举例说明了对含有含多个超基元和/或基元的多重表位的疫苗组合物的种群覆盖面的评估。为了分析种群覆盖面，确定HLA等位基因的基因频率。运用二项式分布公式gf＝1-(SQRT(1-af))(参见例如Sidneyetal.，Humanlmmunol4579-93，1996)，由抗原或等位基因频率计算每个HLA等位基因的基因频率。为获得整体基因型的频率，计算累积的基因频率，通过应用反向的公式[af＝1-(1-Cgf)2]获得累积抗原频率。在无法获得DNA定型水平的基因频率数据时，评估相应血清学上定义的抗原频率。为取得总体潜在的超级类型种群覆盖面，假定不存在连锁不平衡的情况，且只包括确定属于每个超级类型的等位基因(最小估计)。通过向A覆盖面中加入预期被考虑到的B等位基因覆盖的非A覆盖种群的比例(如总体＝A+B*(1-A))，获得通过内部基因座组合取得的总体潜在覆盖面的估计值。已经确定的A3-类超级类型成员是A3，A11，A31，A*3301和A*6801。尽管A3-类超级类型也可以包括A34，A66和A*7401，这些等位基因并不包括在全部的频率计算中。类似地，确定的A2类超级类型家族成员为A*0201，A*0202，A*0203，A*0204，A*0205，A*0206，A*0207，A*6802和A*6901。最后，确定的B7类超级类型等位基因为B7，B*3501-03，B51，B*5301，B*5401，B*5501-2，B*5601，B*6701和B*7801(潜在地还包括B*1401，B*3504-06，B*4201和B*5602)。在5个主要的人种分组中，通过组合A2、A3和B7-超级类型取得的种群覆盖率接近86％。通过包括含有A1和A24基元的肽可以扩展覆盖率。在涉及5个不同主要人种分组(白种人、北美黑人、中国人、日本人和西班牙人)的种群中，A1的平均出现率为12％，A24为29％。这些等位基因在这些同一人种的种群中总共出现的平均频率为39％。当A1和A24与A2-，A3-和B7-超级类型等位基因的覆盖率组合时，横跨主要人种的总覆盖率＞95％，参见例如表IV(G)。使用类似的方法可以估计携有II类基元的表位组合取得的种群覆盖率。对人类免疫原性的研究(例如Bertonietal.，J.Clin.Invest.100503，1997；Doolanetal.，Immunity797，1997；和Threlkeldetal，J.Immunol.1591648，1997)已经显示高度交叉反应的结合肽几乎总是被识别为表位。在鉴定对不同种群有免疫原性的、可包括在疫苗内的候选表位时，对高度交叉反应结合肽的应用是一个重要的选择标准。使用充分数量的表位(如本文公开的和来自文献的)，推测在5个主要人种的每一个中，平均种群覆盖率大于95％。本领域已知的博奕论MonteCarlo刺激分析(参见例如Osborne，M.J.andRubinstein，A.″Acourseingametheory″MITPress，1994)，可以用来评估包括白种人、北美黑人、中国人、日本人和西班牙人的种群中，多大百分比的个体可识别本文所述的疫苗表位。优选的百分比是90％，更优选的百分比为95％。实施例19引发后对内源性加工抗原的CTL识别本实施例证实如本文所述鉴定和选择的天然或类似肽表位诱导的CTL识别内源性合成的，即天然的抗原。用肽包被的刺激细胞在体外再次刺激从用肽表位，如携有HLA-A2超基元的表位免疫的转基因小鼠中分离的效应细胞。6天后，分析效应细胞的细胞毒性，并进一步刺激那些含有肽特异性细胞毒活性的细胞系。再过6天后，检验这些细胞系在肽存在或不存在的情况下，对标记的Jurkat-A2.1/Kb靶细胞的细胞毒活性，也检验含有内源性合成抗原的标记靶细胞，即稳定转染98P4B6表达载体的细胞。结果表明，从用肽表位引发的动物中获得的CTL细胞系识别内源性合成的98P4B6抗原。用于这种分析的转基因小鼠模型的选择依赖于正在评估的表位。除了HLA-A*0201/Kb转基因小鼠，已经表征了几种其它的转基因小鼠模型，包括具有人A11(也可以用来评估A3表位)和B7等位基因的小鼠，并且正在开发其它的小鼠(例如HLA-A1和A24的转基因小鼠)。HLA-DR1和HLA-DR3小鼠模型也已经建立，它们可以用来评估HTL表位。实施例20转基因小鼠中CTL-HTL偶联表位的活性本实施例举例说明在转基因小鼠中通过应用98P4B6来源的CTL和HTL肽疫苗组合物诱导CTL和HTL。本文用到的疫苗组合物含有给予患有表达98P4B6的肿瘤患者的肽。肽组合物可以含有多重CTL和/或HTL表位。用本文描述的方法学来鉴定该表位。本实施例也举例说明可以通过在CTL疫苗组合物中包含一个或多个HTL免疫决定簇来获得提高的免疫原性；这样的肽组合物可以包含与CTL表位偶联的HTL表位。CTL表位可以是以500nM或更小的亲合力与多重HLA家族成员结合的表位或者该表位的类似物，如果需要，肽可以被脂化。免疫步骤转基因小鼠的免疫步骤按照文献中描述的进行(Alexanderetal.，J.Immunol.1594753-4761，1997)。例如，A2/Kb小鼠是人HLAA2.1等位基因的转基因小鼠，用该小鼠确定携有HLA-A*0201基元或HLA-A2超基元的表位的免疫原性，用0.1ml处于不完全弗氏佐剂中的肽皮下(尾巴的基部)引发小鼠，或者如果肽组合物是处于DMSO/盐水中的脂化CTU/HTL偶联物，或如果肽组合物是处于PBS或不完全弗氏佐剂中的多肽。引发后7天，用经syngenic照射的、LPS激活的、肽包被的同源淋巴母细胞重新刺激由这些动物所获得的脾细胞。细胞系肽特异性细胞毒性分析的靶细胞是用HLA-A2.1/Kb嵌合基因转染的Jurkat细胞(例如Vitielloet.al.，J.Exp.Med.1731007，1991)。体外CTL活化引发后一周，将脾细胞(30×106细胞/瓶)与同源的、经照射的(3000拉德)、肽包被的淋巴母细胞(10×106细胞/瓶)在10ml培养基/T25瓶中37℃共培养。6天后，收集效应细胞并分析细胞毒活性。分析细胞毒活性于37℃，在200μl存在下保温靶细胞(1.0到1.5×106)，60分钟后，将细胞冲洗3次，并重新悬浮于R10培养基。必要时加入浓度为1μg/ml的肽。为了进行分析，在U形底96孔板中，将104标记的靶细胞加入不同浓度的效应细胞(终体积为200μl)。在37℃进行6小时的保温后，从每个孔中移除0.1ml上清等分试样，并用Micromedic自动γ计数器确定放射性。特异性裂解百分比通过下列公式确定特异性释放百分比＝100×(试验释放-自发释放)/(最大释放-自发释放)。为了帮助比较在同一条件下分别进行的CTL分析，将％释放数据表示为裂解单位/106细胞。一个裂解单位被定义为在6小时的释放试验中使10,000个靶细胞30％裂解所需的效应细胞数目。为了获得特异性的裂解单位/106，用肽存在的情况下得到的裂解单位/106减去在肽不存在的情况下得到的裂解单位/106。例如，在肽不存在的情况下，在效应细胞(E)靶细胞(T)比为50∶1时(即，5×105效应细胞对应10,000个靶细胞)，以及在肽存在的情况下为5∶1(即5×104效应细胞对应10,000个靶细胞)时，如果得到了30％释放，特异性裂解单位为[(1/50,000)-(1/500,000)]×106＝18LU。分析结果来估计用免疫原性CTL/HTL偶联物疫苗制品注射的动物的CTL反应量级，并把这些结果与应用例如，前述题为“免疫原性的确认”的实施例中略叙过的CTL表位所获得的CTL反应的量级相比较。进行与此法类似的分析来确认含多重CTL表位和/或多重HTL表位的肽偶联物的免疫原性。根据这些方法，发现诱导了CTL反应，且随着施用此类组合物引起了HTL反应。实施例21选择包括在98P4B6特异性疫苗的CTL和HTL表位本实施例举例说明选择本发明疫苗组合物的肽表位的程序。组合物中的肽可以是编码肽的核酸序列，或是单个或是一个或多个序列(例如小基因)，或者以单个和/或多表位的肽的形式存在。当筛选多个包含在疫苗组合物中的表位时，采用下述原则进行。平衡下述原则中的每一个以进行选择。根据与98P4B6清除相关的给药、模拟免疫反应选择表位。所用表位的数目依赖于对自发清除98P4B6的患者的观察。例如，如果观察到自发清除表达98P4B6的细胞的患者对98P4B6抗原的至少3个表位产生了免疫反应，那么对HLAI类而言，至少应当包括3个表位。类似的原理用于测定HLAII类表位。表位通常选择那些具有与HLAI类分子有500nM或更低的IC50结合亲和性的，或对于II类分子，IC50为1000nM或更低；或由网址为URLbimas.dcrt.nih.gov/的BIMAS网站得到的具有高结合分值的HLAI类肽。为了得到涉及不同种群疫苗的广阔覆盖面，选择充足的携有超基元的肽，或充足的一系列携有等位基因特异性基元的肽来提供广泛的种群覆盖。在一个实施方案中，选择表位以提高至少80％的种群覆盖。可采用MonteCarlo分析，一种本领域已知的统计评价来评估种群覆盖的宽度和冗余。当制备多表位合成物，或编码它的小基因时，通常需要生产尽可能最小的包含感兴趣表位的肽。采用的原则与选择含有嵌套表位的肽时采用的原则不相同，但也是类似的。例如，选择疫苗组合物的蛋白质序列，因为它具有包含在序列中的最大数目的表位，即，它有高浓度的表位。表位可以是嵌套的或重叠的(即，彼此相对框移)。例如，用重叠的表位，2个9-聚体的表位和1个10-聚体的表位可以在10个氨基酸的肽上出现。这样的肽给药时，每个表位可以被暴露并被HLA分子结合，多表位肽可以通过合成、重组或从天然来源中裂解产生。可选地，可以制备天然序列的类似物，由此一个或多个表位包括取代，所述取代改变了多表位肽的交叉反应性和/或结合亲和性的特性。为了治疗或预防的目的施用所述疫苗组合物。本实施方案提供了这样一种可能性，即至今未被发现的免疫系统加工方面可以应用于天然嵌套序列，并因此有助于生产治疗性或预防性的免疫应答-诱导疫苗组合物。另外，所述实施方案提供了目前未知的携有基元的表位用于构成HLA的可能性。另外，该实施方案(不制备任何类似物)介导了对实际存在于98P4B6中的多个肽序列的免疫反应，因此避免了评估任一连接表位的需要。最后，该实施方案提供了生产核酸疫苗组合物时的经济规模。与该实施方案相关，可根据本领域的原则获得计算机程序，所述原则为鉴定靶序列中每个序列长度的最大表位数目。当施用包含所选择肽的疫苗组合物时是安全的、有效的，并能引发与控制或清除携有或过表达98P4B6的细胞的免疫反应数量级相类似的免疫反应。实施例22“小基因”多表位DNA质粒的构建本实施例讨论小基因表达质粒的构建。小基因质粒当然可以包含本文所述的各种构型的B细胞，CTL和/或HTL表位或表位类似物。小基因表达质粒通常包括多个CTL和HTL肽表位。在此实施例中，使用携有HLA-A2、-A3、-B7超基元的肽表位以及携有HLA-A1和-A24基元的肽表位与携有DR超基元的表位和/或DR3表位。选择携有HLAI类超基元或基元的来源于98P4B6的肽表位，使得多种超基元/基元被提供以确保广泛的种群覆盖范围。类似地，HLAII类表位选自98P4B6以提供广泛的种群覆盖范围，即携有HLADR-1-4-7超基元的表位和携有HLADR-3基元的表位均被选择包含在该小基因构建体中。接着，将所选择的CTL和HTL表位掺入小基因而在表达载体中表达。这种构建体还可以包括将HTL表位引导至内质网的序列。例如，li蛋白可以与如本领域所述的一种或多种HTL表位融合，其中去除该li蛋白中的CLIP序列并替换以HLAII类表位序列，从而将HLAII类表位引导至内质网，在此，表位与HLAII类分子结合。此实施例举例说明用于构建携有小基因的表达质粒的方法。其它可用于小基因合成物的表达载体为本领域技术人员所知且是可得的。本实施例中小基因DNA质粒包含共有Kozak序列和共有鼠κ-Ig轻链信号序列，接着的是根据本文公开的原理选择的CTL和/或HTL表位。该序列编码由pcDNA3.1-Myc-His载体编码的与Myc和His抗体表位标记融合的开放读码框。合成并经HPLC纯化重叠寡核苷酸，所述重叠寡核苷酸可以例如平均约为70个核苷酸长并有15个核苷酸重叠。该寡核苷酸编码选择的肽表位和合适的接头核苷酸、Kozak序列以及信号序列。最终的多表位小基因经三套PCR反应延长重叠的寡核苷酸而装配。使用Perkin/Elmer9600PCR仪，并使用下列条件总共进行30轮循环95℃15秒，退火温度(低于各引物对最低的计算Tm5℃)30秒，以及72℃1分钟。例如，按如下方法制备小基因对于最先的PCR反应，两种寡核苷酸各取5μg经退火和延伸在一个实例中使用8个寡核苷酸，即，四对引物，寡核苷酸1+2，3+4，5+6，以及7+8合并于100μl的反应液中，该反应液中包含Pfu聚合酶缓冲液(1×＝10mM，10mM，20mMTris-氯化物，pH8.75，2mM，0.1％TritonX-100，100μg/mlBSA)，0.25mM各种dNTP，以及2.5U的Pfu聚合酶。该全长二聚物产品经凝胶纯化，包含1+2和3+4产物以及5+6和7+8产物的两个反应经混合、退火、并延伸10个循环。然后混合两个反应的一半，并且在加入侧翼引物之前进行5个循环的退火和延伸以扩增全长产物。该全长产物经凝胶纯化并克隆至pCR-blunt(Invitrogen)，通过测序筛选各克隆。实施例23质粒构建体及其诱导免疫原性的程度在体外通过用表达表位的核酸构建体转导或转染APC，然后确定APC所进行的表位呈递，证实质粒构建体，例如根据前面实施例构建的质粒，能够诱导的免疫原性的程度。这样的研究确定了“抗原性”并允许使用人类APC。该试验通过定量细胞表面表位-HLAI型复合物的密度，确定在被T细胞识别的环境中APC呈递该表位的能力。通过直接测定从APC上洗脱的肽的量进行定量(参见例如Sijtsetal，J.Immunol.156683-692，1996；Demotzetal，Nature342682-684，1989)；或通过测定患病或经转染的靶细胞诱导的裂解或淋巴因子释放量，然后确定获得相等水平的裂解或淋巴因子释放所需的肽浓度来估算肽-HLAI类复合物的数目(参见例如，Kageyamaetal，J.Immunol.154567-576，1995)。或者，通过向小鼠体内注射并随后在体外评价CTL和HTL的活性而证实免疫原性，所述的活性分别使用细胞毒性和增殖试验进行分析，例如，Alexanderetal，在Immunity1751-761，1994中进行了详细描述。例如，为了证实包含至少一个HLA-A2超基元肽的DNA小基因构建体在体内诱导CTL的能力，使用例如100μg的裸露cDNA对HLA-A2.1/Kb转基因小鼠进行肌内免疫。作为比较由cDNA免疫诱导的CTL水平的方法，对照组动物仍使用包括多表位的实际肽组合物进行免疫，所述多个表位因由小基因编码而被合成为单个多肽。用各组合物(小基因或多表位肽中编码的肽表位)刺激免疫动物的脾细胞两次，然后在释放试验中测定肽-特异的细胞毒活性。结果显示了针对A2-限制性表位的CTL应答的量级，由此表明该小基因疫苗和多表位疫苗的体内免疫原性。因此，发现该小基因能引发抗HLA-A2超基元肽表位的免疫应答，这与多表位肽疫苗的作用相同。还使用其它的HLA-A3和HLA-B7转基因小鼠模型进行类似的分析以评价由HLA-A3和HLA-B7基元或超基元表位诱导的CTL，借此还发现该小基因能引发针对所提供的表位的合适的免疫应答。为了证实编码II类表位的小基因在体内诱导HTL的能力，使用例如100μg的质粒DNA肌内免疫DR转基因小鼠，或对于那些与合适的小鼠MHC分子交叉反应的表位而言用I-Ab-限制性小鼠。作为比较由DNA免疫诱导的HTL水平的方法，对照动物组仍使用在完全弗氏佐剂中乳化的实际肽组合物进行免疫。由免疫动物的脾细胞中纯化出CD4+T细胞，即HTL，并用各组合物(小基因中编码的肽)刺激。使用3H-胸苷掺入增殖试验测量HTL应答(参见例如AlexanderetalImmunity1751-761，1994)。结果表明HTL应答的量级，由此证明该小基因在体内的免疫原性。使用引发加强免疫方案证实如上文实施例所述构建的DNA小基因可用作与促进剂联合使用的疫苗。该促进剂可以由重组蛋白质(例如Bamettetal，AidsRes.andHumanRetroviruses14Supplement3S299-S309，1998)或重组痘苗病毒，例如，能表达编码完整的所需蛋白质的小基因或DNA的痘苗病毒(参见例如Hankeetal，Vaccine16439-445，1998；Sedegahetal，Proc.Natl.Acad.SciUSA957648-53，1998；HankeandMcmichael，Immunol.Letters66177-181，1999；andRobinsonetal，NatureMed.5526-34，1999)组成。例如，起初在转基因小鼠中评价用于引发加强免疫方案的DNA小基因的效能。在这些实施例中，使用100μg编码免疫原性肽的DNA小基因肌内免疫A2.1/Kb转基因小鼠，该免疫原性肽包括至少一个携有HLA-A2超基元的肽。保温期(3-9周)后，使用107pfu/小鼠的表达与该DNA小基因编码序列相同的序列的重组痘苗病毒腹膜内加强免疫小鼠。对照小鼠使用不含该小基因序列的100μgDNA或重组痘苗病毒进行免疫，或使用编码小基因的DNA进行免疫，但不进行痘苗病毒加强免疫。在为期两周的额外保温后，立即使用ELISPOT试验测定小鼠脾细胞的肽-特异活性。此外，在体外使用小基因和重组痘苗病毒编码的A2-限制性肽表位刺激脾细胞，然后在α、β和/或γIFNELISA中测试肽-特异活性。人们发现，与单独使用DNA相比，用于引发加强免疫方案的小基因能对HLA-A2超基元肽引发更强的免疫应答。还可使用HLA-A11或HLA-B7转基因小鼠模型进行这样的分析，从而评价由HLA-A3或HLA-B7基元或超基元表位诱导的CTL。引发加强免疫方案在人类中的使用描述于下文题为“使用引发加强免疫方案诱导CTL应答”的实施例中。实施例24肽组合物的预防用途本发明的疫苗组合物可以用于预防具有患携有这些抗原的肿瘤的危险的人表达98P4B6。例如，包含多个CTL和HTL表位的多表位肽表位组合物(或组成相同的核酸)被给予有患98P4B6-相关肿瘤危险的个体，其中CTL和HTL表位可以是例如上述实施例中所选择的用来靶向80％以上的种群的那些表位。例如，基于肽的组合物作为包括多表位的单一多肽提供。该疫苗通常在包括佐剂，例如不完全弗氏佐剂的生理溶液中给予。对于70公斤患者，用于首次免疫的肽剂量为约1到约50,000μg，通常为100-5,000μg。首次给予疫苗后4周给予加强免疫剂量，接着使用测定PBMC样品中表位-特异性CTL群体的存在的技术评价该患者免疫反应的量级。必要时再给予额外的加强免疫。发现该组合物在预防98P4B6-相关疾病时是安全有效的。或者，根据本领域已知和本文公开的方法将通常含有转染剂的组合物用于基于核酸的疫苗的给药。实施例25来源于天然98P4B6序列的多表位疫苗组合物优选使用确定各种I类和/或II类超基元或基元的计算机算法分析天然的98P4B6多蛋白序列，以鉴定包括多个表位的多蛋白的“相对短的”区域。该“相对短的”区域优选较完整的天然抗原短。这些包含多个不同的或重叠的“嵌套”表位的相对短的序列可以用于产生小基因构建体。该构建体经基因工程改造可表达与天然蛋白质序列相对应的肽。“相对短的”肽的长度通常小于250个氨基酸，经常小于100个氨基酸，优选小于75个氨基酸，并且更优选小于50个氨基酸。由于疫苗组合物的蛋白质序列具有包含在序列内的最大数目的表位，即具有高浓度的表位，因此需要对其进行选择。如本文所述，表位基元可以是嵌套的或重叠的(即，彼此相对框移)。例如，使用重叠表位，2个9-聚体表位和1个10-聚体表位可以存在于10氨基酸肽中。可以为治疗或预防的目的而施用这样的疫苗组合物。该疫苗组合物将包括，例如，98P4B6抗原的多个CTL表位和至少-个HTL表位。这些多表位天然序列或者作为肽或者作为编码肽的核酸序列给予。或者，可由这些天然序列制备类似物，由此一种或多种表位包括改变了多表位肽的交叉反应性和/或结合亲和性性质的替代。这些实施例的实施方案提供了这样的可能性，可将至今尚未被发现的免疫系统方法的一些方面应用于天然嵌套序列并由此促成制备治疗或预防性的诱导免疫应答的疫苗组合物。此外，这样的实施方案为发现目前未知的用于组成HLA的携有基元的表位提供了可能性。此外，这些实施方案(不包括类比实施方案)介导针对事实上存在于天然98P4B6中的多个肽序列的免疫应答，这样就无需评价任何的连接表位。最后，该实施方案提供了制备肽或核酸疫苗组合物的经济规模。与该实施方案相关，计算机程序可得自本领域，其可用于鉴定靶序列中每个序列长度中最大的表位数目。实施例26得自多抗原的多表位疫苗组合物本发明的98P4B6肽表位用于与其它靶肿瘤相关抗原的表位联合使用，以产生可用于预防或治疗表达98P4B6和此类其它抗原的癌症的疫苗组合物。例如，疫苗组合物可以作为单一多肽提供，该单一多肽中掺入了98P4B6的多个表位和与肿瘤相关的抗原，该抗原通常被与98P4B6表达相关的靶癌症表达，疫苗组合物还可以作为组合物给药，该组合物为包含一种或多种离散表位的混合物式组合物。或者，该疫苗可以作为小基因构建体或作为在体外已经装载肽表位的树状细胞给药。实施例27使用肽评价免疫应答本发明的肽可以用来分析免疫应答，以确定针对98P4B6的特定抗体、CTL或HTL的存在。这样的分析可以使用Ogg等在Science2792103-2106，1998中所述的方法进行。在此实施例中，根据本发明的肽被用作诊断或预测目的的试剂，而非用作免疫原。在此实施例中，高灵敏度的人类白细胞抗原四聚体复合物(“四聚体”)被用于截面分析，例如，分析处于不同病期或经包括包含A*0201基元的98P4B6肽免疫后的HLA-A*0201-阳性个体的98P4B6HLA-A*0201一特异性CTL的频率。四聚体复合物的合成已有描述(Museyetal，N.Engl.J.Med.3371267，1997)。简而言之，通过原核表达系统合成纯化的HLA重链(这些实施例中的A*0201)和β2-微球蛋白。通过缺失该跨膜-胞质尾和在COOH末端增加包含BirA酶促生物素化位点的序列而修饰该重链。通过稀释重新折叠该重链、β2-微球蛋白、以及肽。通过快速蛋白质液相层析分离45-kD的重折叠产物，随后在生物素(Sigma，St.Louis，Missouri)、腺苷5′三磷酸和镁存在下被BirA生物素化。以1∶4摩尔比加入链霉亲和素-藻红蛋白偶联物，并且浓缩该四聚体产品至1mg/ml。所得产品称为四聚体-藻红蛋白。为了分析患者血样，将约100万PBMC以300g离心5分钟，并再悬浮于50μl的冷磷酸缓冲盐水。使用四聚体-藻红蛋白、抗-CD8-三色和抗-CD38进行三-色分析。在冰上保温PBMC以及四聚体和抗体30至60分钟，冲洗两次后用甲醛固定。应用Gates以容纳＞99.98％的对照样品。四聚体的对照包括A*0201-阴性个体以及A*0201-阳性非患病供体。通过流式细胞仪测定经四聚体染色的细胞百分比。结果显示了PBMC样品中包含表位-限制性CTL的细胞数目，由此容易地指示对于98P4B6表位免疫应答的程度，并因此指示暴露于98P4B6或暴露于会引起预防或治疗性应答的疫苗的状态。实施例28使用肽表位评价回忆应答本发明肽表位用作评价患者T细胞应答，例如急性或回忆应答的试剂。这样的分析可以针对已经从98P4B6-相关疾病中恢复或已经接种98P4B6疫苗的患者进行。例如，可以分析已经接种疫苗的人的I型限制性CTL应答。该疫苗可以是任何98P4B6疫苗。从接种疫苗的个体和HLA定型的个体中收集PBMC。然后使用本发明合适的肽表位，最好为携有超基元、能与多个HLA超级类型家族成员交叉反应的肽表位，来分析来源于携有那种HLA类型的个体的样品。在Ficoll-Histopaque密度梯度(SigmaChemicalCo.，St.Louis，MO)上分离来自接种个体的PBMC，用HBSS(GIBCOLaboratories)冲洗三次，于补充有L-谷氨酰胺(2mM)、青霉素(50U/ml)、链霉素(50μg/ml)和包含10％热-灭活人AB血清(完全RPMI)的Hepes(10mM)的RPMI-1640(GIBCOLaboratories)中再悬浮，并采用微量培养模式平铺。将包括本发明表位的合成肽以10μg/ml的量加入每一孔中，HBV核心128-140表位以1μg/ml的量加入每一孔中作为第一周刺激的辅助T细胞来源。在微量培养模式中，在每孔含100μl完全RPMI的96-孔圆底板中的8份复制培养物中，使用肽刺激4×105PBMC。在第3和10天，向各孔中加入100μl完全RPMI和20U/ml终浓度的rIL-2。在第7天将培养物转移至96-孔平底板中并使用肽、rIL-2和经105照射(3，000拉德)的自体饲养细胞进行再刺激。在第14天测试培养物的细胞毒活性。基于与前述非患病对照受试者的比较，阳性CTL应答需要两个或更多的8份复制培养物，从而显示大于10％的特异性的释放(Rehermannetal，NatureMed.21104，1108，1996；Rehermannetal，J.Clin.Invest.971655-1665，1996；andRehermannetal，J.Clin.Invest.981432-1440，1996)。靶细胞系是自体或同种异体的EBV-转化B-LCL，它可购自AmericanSocietyforHistocompatibilityandImmunogenetics(ASHI，Boston，MA)或者从所述的患者库中建立(Guilhot，etal，JVirol662670-2678，1992)。细胞毒性试验按照如下方法进行。靶细胞由同种异体HLA-匹配的和自体EBV-转化的B类淋巴母细胞系组成，将该细胞系与10μM本发明的合成肽表位培养过夜，使用100μCi的(AmershamCorp.，ArlingtonHeights，IL)标记1小时，然后用HBSS冲洗四次。使用包含3,000靶细胞/孔的U型底96孔板在标准的4-h、裂开孔释放试验中测定细胞裂解活性。第14天以效应细胞/靶细胞(E/T)比例为20-50∶1检测受刺激的PBMC。细胞毒性百分比根据公式计算100×[(实验释放-自发释放)/最大释放-自发释放)]。最大释放通过去污剂对靶细胞的裂解来测定(2％TritonX100；SigmaChemicalCo.，St.Louis，MO)。所有实验的自发释放＜25％的最大释放。该分析的结果表明早先暴露于98P4B6或98P4B6疫苗后对HLA-限制性CTL群体刺激的程度。类似地，还可分析II类限制性HTL应答。纯化PBMC以1.5×105细胞/孔的密度被培养于96-孔平底板并使用10μg/ml本发明的合成肽、全部98P4B6抗原或PHA刺激。将细胞常规铺板，每个条件有4-6个孔的重复试验。经过7天的培养，除去培养基并替换以新鲜的包含10U/mlIL-2的培养基。2天后，向各孔中加入1μCi3H-胸苷并继续保温18小时。然后在玻璃纤维垫上收获细胞DNA并分析3H-胸苷的掺入。用存在抗原的情况下3H胸苷掺入量除以缺乏抗原的情况下3H胸苷掺入量的比值就可算得抗原-特异性T细胞的增殖。实施例29在人中特异性CTL应答的诱导关于包含本发明CTL和HTL表位的免疫原性组合物的人类临床试验被建立为INDI期，剂量逐步升级研究并进行了随机、双盲安慰剂-对照试验。这些试验设计如下总共约27人参与试验并分成3组组I3名受试者注射安慰剂，6名受试者注射5μg肽组合物；组II3名受试者注射安慰剂，6名受试者注射50μg肽组合物；组III3名受试者注射安慰剂，6名受试者注射500μg肽组合物。首次注射4周后，所有受试者以相同剂量接受加强接种。研究所测定的终点涉及该肽组合物的安全性和可耐受性及其免疫原性。对于该肽组合物的细胞免疫应答是该肽组合物固有活性的指数，因此可以看作是对生物效能的测定。下面总结了涉及安全性和效能终点的临床和实验室数据。安全性在安慰剂和药物试验组中监测不利事件的发生率并使用程度和可逆性进行评价。疫苗效能的评价为了评价疫苗效能，在受试者接受注射前后取血。经Ficoll-Hypaque密度梯度离心从新鲜的肝素化血液中分离出外周血单核细胞，在冷冻介质中等分试样并冷冻贮存。测试样品的CTL和HTL活性。发现该疫苗是安全有效的。实施例30表达98P4B6的患者中进行的II期试验进行II期试验以研究将CTL-HTL肽组合物给予患有表达98P4B6癌症的患者的效果。本试验的主要目标是确定诱导表达98P4B6的癌症患者的CTL有效剂量和用药方案，确立诱导这些患者CTL和HTL应答的安全性，以及观察CTL活化至何等程度才会改善这些患者的临床症状，例如表现为损害的减轻和/或缩小。这些研究设计如下该研究在多个中心进行。该试验设计为公开-标记、非受控、剂量逐步升级方案，其中该肽组合物作为一次剂量给药，6周后给予同样剂量的单一加强接种，该剂量是每次注射50,500以及5,000微克。记录药物-相关副作用(严重程度以及可逆性)。共有三组患者。第一组注射50微克的肽组合物，第二和第三组分别注射500和5,000微克的肽组合物。各组患者的年龄在21-65范围内，并且代表不同的人种背景。它们全都患有表达98P4B6的肿瘤。监视临床表现或抗原-特异性T细胞应答以评价给予肽组合物的效果。发现疫苗组合物在治疗98P4B6-相关疾病中是安全有效的。实施例31使用引发加强免疫方案诱导CTL应答引发加强免疫方案潜在的原理与用于证实DNA疫苗在转基因小鼠中的效能的原理，例如上文题为“质粒构建体及其降低免疫原性的程度”的实施例中所述的原理相似，该方案还可以用于将疫苗施用于人类。这些疫苗的给药方案可以包括初始给药，例如裸露的DNA，接着使用编码疫苗的重组病毒或存在于佐剂中的重组蛋白质/多肽或肽混合物进行加强免疫。例如，可以使用裸露核酸形式的表达载体，例如题为““小基因”多表位DNA质粒的构建”的实施例中构建的表达载体进行首次免疫，所述载体以0.5-5mg的量在多位点IM(或SC或ID)给药。还可以使用基因枪施用该核酸(0.1至1000μg)。保温3-4周后，给予加强免疫剂量。该加强剂可以是以5-107至5×109pfu的剂量给药的重组禽痘病毒。另一种重组病毒，例如MVA、金丝雀痘病毒、腺病毒或腺伴随病毒也可以用作加强剂，或可以施用多表位蛋白质或肽的混合物。为了评价疫苗效能，在免疫之前以及施用初始疫苗和加强剂量的疫苗后的间歇取得患者血样。通过Ficoll-Hypaque密度梯度离心从新鲜的肝素化血液分离出外周血单核细胞，在冷冻介质中等分试样，并冷冻贮存。测试样品的CTL和HTL活性。分析结果表明产生了足以实现抗98P4B6的治疗或保护性免疫力的应答量级。实施例32使用树状细胞(DC)施用疫苗组合物包括本发明肽表位的疫苗可使用APC，或“专门的”APC例如DC给予。在此实施例中，给予患者肽-脉冲DC以刺激体内CTL应答。在此方法中，树状细胞被分离、扩展、并用包括本发明肽CTL和HTL表位的疫苗脉冲。该树状细胞被注回患者体内从而引起体内CTL和HTL应答。然后，诱导的CTL和HTL分别破坏携有98P4B6蛋白的靶细胞或促进其破坏，疫苗中的表位来源于98P4B6蛋白。例如，将包含表位的肽混合物来自体内地施用于PBMC，或从中分离的DC。可以使用促进收获DC的药物，例如ProgenipoietinTM(Monsanto，St.Louis，MO)或GM-CSF/IL4。用肽脉冲DC后，以及再输注至患者之前，冲洗该DC以除去未结合的肽。熟练人员根据临床结果在临床上能够理解并易于确定，再输注至患者内的DC数目可以改变(参见例如NatureMed.4328，1998；NatureMed.252，1996andProstate32272，1997)。虽然通常给予每位患者2-50×106DC，但是还可以提供较大量的DC，例如107或108。这些细胞群体通常包含50-90％的DC。在一些实施方案中，将荷载有肽的PBMC注入患者而不纯化DC。例如，将例如ProgenipoiefinTM等试剂处理后生成的PBMC注入患者而不纯化DC。施用PBMC的总数通常在108至1010范围内。通常，注入患者的细胞剂量是基于各患者血液内DC的百分比，该百分比是通过例如用特异的抗-DC抗体进行免疫荧光分析测定的。因此，例如，如果ProgenipoietinTM活动化了指定患者外周血中2％的DC，而且该患者将接受5×106DC，那么需要给该患者注射总共2.5×108个荷载有肽的PBMC。由例如ProgenipoietinTM活动化的DC百分比经估算通常为2-10％，但可以变化，这一点是本领域熟练技术人员可以理解的。CTL/HTL应答的来自体外的激活或者，可以通过在组织培养物中一起保温患者或遗传相容的CTL或HTL前体细胞以及APC源，例如DC和免疫原性肽来诱导来自体外的针对98P4B6抗原的CTL或HTL应答。合适的保温期后(通常约7-28天)，其中前体细胞被激活并扩展为效应细胞，将该细胞输注入患者，在那里它们将破坏(CTL)它们特定的靶细胞，即肿瘤细胞或促进其破坏(HTL)。实施例33另一种可选择的鉴定和证实携有基元的肽的方法另一鉴定并证实携有基元的肽的方法是将它们从携有确定MHC分子的细胞上洗脱。例如，用于组织定型的EBV转化的B细胞系已经广泛地被表征以确定它们表达何种HLA分子。在某些情况下这些细胞仅表达单一类型HLA分子。这些细胞可以用表达使人感兴趣的抗原，例如98P4B6的核酸转染。因转染而生成的肽的内源性抗原处理所产生的肽将与细胞内的HLA分子结合，并被转移，展示于细胞表面。然后将肽暴露于中等酸性条件使其从HLA分子上洗脱，通过例如质谱分析测定它们的氨基酸序列(例如Kuboetal，J.Immunol.1523913，1994)。由于与特定HLA分子结合的多数肽都携有基元，这是获得与细胞上表达的特定HLA分子相关的携有基元的肽的另一种可选择模式。可选择地，可使用编码单一HLA等位基因的表达构建体转染不表达内源性HLA分子的细胞系。这些细胞可以如所描述的方法使用，即，它们可被编码98P4B6的核酸转染从而分离出呈递于细胞表面的与98P4B6相对应的肽。从这样的分析中获得的肽将携有基元，该基元相应结合细胞上表达的单一HLA等位基因。如本领域技术人员所理解的，可以对携有一个以上HLA等位基因的细胞进行相似的分析，并接着测定所表达的特异于各个HLA等位基因的肽。此外，本领域技术人员还将认识到除转染外的其它方法，例如装载蛋白质抗原，可用于为细胞提供抗原来源。实施例34互补多核苷酸与编码98P4B6序列互补的序列或其任何部分可用于检测、减少或抑制天然98P4B6的表达。虽然已经描述了使用含有约15至30个碱基对的寡核苷酸，实质上较小或较大的序列片断也可以使用相同的方法。使用例如OLIGO4.06软件(NationalBiosciences)和98P4B6的编码序列设计合适的寡核苷酸。为了抑制转录，由最独特的5′序列设计互补寡核苷酸，并将其用于防止启动子与编码序列结合。为了抑制翻译，设计防止核糖体与编码98P4B6的转录物结合的互补寡核苷酸。实施例35使用98P4B6-特异性抗体纯化天然或重组98P4B6通过使用98P4B6特异性抗体的免疫亲和层析基本纯化天然或重组的98P4B6。通过共价偶联抗-98P4B6抗体与活化的层析树脂，例如CNBr-活化的SEPHAROSE(AmershamPharmaciaBiotech)构建免疫亲和柱。偶联后，根据厂商说明封闭和冲洗树脂。使包含98P4B6的介质通过免疫亲和柱，在允许优先吸附98P4B6的条件下冲洗该柱(例如，存在去污剂的高离子强度缓冲液)。在破坏抗体/98P4B6结合的条件下洗脱该柱(例如pH2至pH3的缓冲液，或高浓度的离液剂，例如尿素或硫氰根离子)，并收集GCR.P。实施例36鉴定与98P4B6相互作用的分子用121IBolton-Hunter试剂标记98P4B6或其生物活性片断(参见例如Boltonetal(1973)Biochem.J.133529)。使预先排列于多孔板的孔中的候选分子与经标记的98P4B6一起保温，冲洗，然后分析任一含有标记的98P4B6复合物的孔。不同浓度的98P4B6所获得的数据被用于计算各种数值，包括数目、亲和性、以及98P4B6与候选分子的缔合。实施例3798P4B6肿瘤生长促进的体内分析通过荷瘤小鼠中基因的过表达体内评价98P4B6蛋白对肿瘤细胞生长的影响。例如，前列腺(PC3)、肺(A427)、胃、卵巢(PA1)以及子宫细胞系经基因工程改造而表达98P4B6。在SCID小鼠的两肋皮下注射1×106的PC3、A427、PA1或包含tkNeo空载体或98P4B6的NIH-3T3细胞。至少可以使用两种策略(1)在启动子的调节下组成型表达98P4B6，所述启动子如得自病毒基因组或异源哺乳动物启动子的组成型启动子，所述病毒如多瘤病毒、禽痘病毒(UK2,211,504，公开于1989年7月5日)、腺病毒(例如腺病毒2)、牛乳头状瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨细胞病毒、逆转录病毒、乙型肝炎病毒和猴病毒40(SV40)，异源哺乳动物启动子如肌动蛋白启动子或免疫球蛋白启动子，条件是所述启动子与宿主细胞系统相容，和(2)在可诱导的载体系统，例如蜕皮素、tet等控制下可调节地表达，条件是所述启动子与宿主细胞系统相容。然后监测可触及的肿瘤表现出的肿瘤体积，接着随着时间推移测定是否表达98P4B6的细胞以更快的速率生长以及是否由表达98P4B6的细胞生成的肿瘤显示了变化了的攻击特征(例如增强的转移、血管化，对化疗药物的反应性降低)。此外，可向小鼠原位移植1×105同样的细胞从而测定是否98P4B6对前列腺的局部生长或细胞的转移能力，特别是转移至肺、淋巴结以及骨髓的能力具有影响。该分析还有助于测定候选治疗合成物对98P4B6的抑制效果，所述合成物如98P4B6内体、98P4B6反义分子以及核酶。实施例3898P4B6单克隆抗体介导的体内肿瘤抑制98P4B6在前列腺、肺、胃、卵巢以及子宫癌症组织中的显著表达，其在正常组织内的限制性表达，以及其预期的细胞表面表达使得98P4B6成为抗体治疗的出色靶点。相似地，98P4B6是基于T细胞免疫治疗的靶点。因此，通过使用不依赖于雄激素的LAPC-4和LAPC-9异种移植物(Craft，N.etal，CancerRes，1999.59(19)p.5030-6)和不依赖于雄激素的重组细胞系PC3-98P4B6(参见例如Kaighn，M.E.etal，InvestUrol，1979.17(1)p.16-23)评价抗-98P4B6mAb在人前列腺癌异种移植小鼠模型中的疗效。利用来源于患者的异种移植物或异种移植细胞系的相似方法被用于列于表I的癌症。在例如小鼠原位前列腺癌异种移植模型和小鼠肺、子宫或胃异种移植模型中研究抗体对肿瘤生长和转移形成的效能。如本实施例中所讨论的，抗体可以是未偶联的，或可以与其它药物相偶联，这一点是本领域技术人员能理解的。抗-98P4B6mAb抑制依赖于雄激素的LAPC-9和不依赖于雄激素的PC3-98P4B6肿瘤异种移植物的形成。抗-98P4B6mAb还阻碍了已建立的原位肿瘤的生长并延长了荷瘤小鼠的存活时间。结果表明抗-98P4B6mAb在治疗局部或晚期癌症中的有效性(参见例如Saffran，D.etal，PNAS101073-1078或互联网上的URL为.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.051624698)。给予抗-98P4B6mAb可以导致阻碍已建立的原位肿瘤的生长并抑制向远处位点的转移，从而显著延长荷瘤小鼠的存活时间。这些研究显示98P4B6是免疫治疗的有吸引力的靶点，并表明了抗-98P4B6mAb治疗局部或转移癌症的治疗潜力。该实施例表明未偶联的98P4B6单克隆抗体能有效抑制人前列腺癌异体移植物以及生长于SCID小鼠体内的肺、子宫或胃异体移植物的生长；相应地，所述有效的单克隆抗体的联合也是有效的。使用多个未偶联的98P4B6mAb抑制肿瘤材料和方法98P4B6单克隆抗体如题为“98P4B6单克隆抗体(mAbs)的生成”的实施例11中的描述，产生针对98P4B6的单克隆抗体。用ELISA、Western印迹、FACS以及免疫沉淀法表征此抗体结合98P4B6的能力。由ELISA和Western分析测定的抗-98P4B6mAb表位作图数据识别98P4B6蛋白上的表位。用这些抗体进行癌组织和细胞的免疫组化分析。通过G蛋白Sepharose层析从腹水或杂交瘤组织培养物上清液中纯化单克隆抗体，对着PBS进行透析，过滤消毒，并于-20℃贮存。通过Bradford试验(Bio-Rad，Hercules，CA)测定蛋白质。制备治疗用单克隆抗体或包含各个单克隆抗体的混合物的混合物，并用于治疗接受皮下或原位注射LAPC-9肿瘤异体移植物的小鼠。癌症异种移植物和细胞系通过s.c.套针植入物(Craft，N.etal文献同上)将表达野生型雄激素受体并生成前列腺特异性抗原(PSA)的LAPC-9异体移植物传入6至8周龄雄性ICR-重症联合免疫缺陷(SCID)小鼠(TaconicFarms)内。前列腺(PC3)、肺(A427)、卵巢(PA1)癌细胞系(美国典型培养物保藏中心)维持于补充有L-谷氨酰胺和10％FBS的RPMI或DMEM中。如Hubert，R.S.etalSTEAPaprostate-specificcell-surfaceantigenhighlyexpressedinhumanprostatetumors.ProcNatlAcadSciUSA，1999.96(25)p.14523-8所述，通过逆转录病毒基因转移生成PC3-98P4B6、A427-98P4B6、PA1-98P4B6和3T3-98P4B6细胞群体。使用FITC-偶联的山羊抗-小鼠抗体(SouthernBiotechnologyAssociates)检测抗-98P4B6染色，然后在CoulterEpics-XL流式细胞仪上进行分析。异种移植小鼠模型在雄性SCID小鼠右肋注射与Matrigel(CollaborativeResearch)以1∶1的稀释度混合的1×106LAPC-9、PC3、PC3-98P4B6、A427、A427-98P4B6、PA1、PA1-98P4B6、3T3或3T3-98P4B6细胞，从而生成皮下(s.c.)肿瘤。为了测试抗体对肿瘤形成的效能，在注射肿瘤细胞的同一天开始腹膜内注射抗体。作为对照，给小鼠注射纯化的小鼠IgG(ICN)或PBS；或识别人细胞不表达的无关抗原的纯化了的单克隆抗体。在前期研究中，没有发现小鼠IgG或PBS之间对肿瘤生长的差异。肿瘤大小通过游标卡尺测定，肿瘤体积由长度×宽度×厚度计算。s.c.肿瘤直径大于1.5cm的小鼠被处死。通过PSAELISA试剂盒(Anogen，Mississauga，Ontario)测定PSA水平。通过俘获ELISA试剂盒(BethylLaboratories，Montgomery，TX)测定抗-98P4B6mAb的循环水平。(参见例如Saffran，D.etal，PNAS101073-1078或互联网上的URL为.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.051624698)。使用氯胺酮/甲苯噻嗪麻醉后进行原位注射。对于前列腺原位研究，切开一穿过腹肌的切口暴露出膀胱和精囊，然后通过切口将其输送至背侧的前列腺。LAPC-9或PC3细胞(5×105)与Matrigel的混合物以10μl的体积被注射入各背叶。为了监测肿瘤生长，每周采集小鼠血样以测定PSA水平。为了合适的治疗将小鼠分组，腹膜内注射抗98P4B6或对照mAb。抗-98P4B6mAb抑制表达98P4B6的异种移植癌肿瘤的生长使用LAPC-9和PC3-98P4B6原位模型测试抗-98P4B6mAb对肿瘤形成的影响。与s.c.肿瘤模型相比，需要分别将肿瘤细胞直接注射入小鼠前列腺、肺或卵巢的原位模型导致局部肿瘤生长，远处位点转移的发展，小鼠健康的恶化，以及随后的死亡(Saffran，D.etal，PNASsupra；Fu，X.etal，IntJCancer，1992.52(6)p.987-90；Kubota，T.，JCellBiochem，1994.56(1)p.4-8)。这些特征使得原位模型更能代表人类疾病的进程并允许我们跟踪mAb对临床上相关终点的疗效。相应地，将肿瘤细胞注射入小鼠前列腺、肺或卵巢中，2天后，将小鼠分成两组，使用a)200-500μg的抗-98P4B6Ab或b)PBS治疗，每周三次，持续二至五周。原位癌症模型的主要优势在于研究转移发展的能力。通过IHC分析肺部切片研究荷有已建立的原位肿瘤的小鼠中的转移的形成，该研究使用抗前列腺特异性细胞表面蛋白STEAP的抗体，所述STEAP在LAPC-9异种移植物中高水平表达(Hubert，R.S.etal，ProcNatlAcadSciUSA，1999.96(25)p.14523-8)。在4周时间内，注射100μg抗-98P4B6mAb或PBS以对荷有已建立的原位LAPC-9或PC3-98P4B6肿瘤的小鼠进行给药。两组小鼠均允许建立高肿瘤负荷(IAPC-9的PSA水平高于300ng/ml)，从而确保小鼠肺转移形成的高频率。然后处死小鼠，通过IHC分析它们的前列腺和肺中是否存在肿瘤细胞。这些研究在异种移植小鼠模型中证明了抗-98P4B6抗体对前列腺癌的起始和发展具有广泛的抗肿瘤效能。抗-98P4B6抗体抑制依赖雄激素和不依赖雄激素肿瘤的形成，并阻碍已建立的肿瘤的生长，从而延长所治疗小鼠的存活时间。此外，抗-98P4B6mAb显示了对局部前列腺瘤扩散至远处位点的引人注目的抑制作用，甚至在大肿瘤负荷存在时同样起效。因此，抗-98P4B6mAb对多数临床上相关终点(肿瘤生长)、存活的延长以及健康有效。实施例39抗-98P4B6抗体对人类的治疗和诊断应用抗-98P4B6单克隆抗体可安全有效地用于人类的诊断、预防、预测和/或治疗目的。使用抗-98P4B6mAb对癌组织和癌异种移植物进行的Western印迹和免疫组化分析显示肿瘤中有强烈染色，而正常组织中显著减低或检测不到。在癌中和转移性疾病中检测的98P4B6证明mAb作为诊断和/或预测指示剂的有用性。因此抗-98P4B6抗体可用于诊断应用，例如肾活检样品的免疫组化分析以检测可疑患者是否患有癌症。如流式细胞仪所测定的，抗-98P4B6mAb特异地结合癌细胞。因此，抗-98P4B6抗体被用于诊断性的全身显象，例如放免液闪法和放射免疫疗法(参见例如PotamianosS.etal，AnticancerRes20(2A)925-948(2000))以检测显示有98P4B6表达的局部和转移的癌。98P4B6细胞外结构域脱落或释放于细胞外环境，如用碱性磷酸二酯酶B10所观察到的那样(Meerson，N.R.，Hepatology27563-568(1998))，允许通过抗-98P4B6抗体在可疑患者的血浆和/或尿样中诊断性监测98P4B6。特异结合98P4B6的抗-98P4B6抗体被用于治疗表达98P4B6的肿瘤。抗-98P4B6抗体以非偶联模式应用或以偶联模式应用，其中在偶联模式中，抗体与本领域所熟知的多种治疗或显像模式中的一种，例如前药、酶或放射性同位素结合。在临床前研究中，在SCID小鼠癌异体移植模型，例如肾癌模型AGS-K3和AGS-K6中测试了未偶联的和偶联的抗-98P4B6抗体对肿瘤预防和生长抑制的效能(参见例如题为“98P4B6单克隆抗体介导的对膀胱和肺肿瘤的体内抑制”的实施例)。偶联的和未偶联的抗-98P4B6抗体被用作人类临床试验的治疗形式，可单独使用或与其它的治疗方法联合应用，在如下实施例中进行了描述。实施例40在体内通过使用人抗-98P4B6抗体治疗和诊断人癌症的人类临床试验本发明所使用的抗体会识别98P4B6上的表位，被用于治疗例如表I中所列出的某些肿瘤。基于多种因素，包括98P4B6的表达水平，如表I中所列出的肿瘤是目前优选的适应症。与各适应症相结合，成功地推行了三种临床方法。I.)辅助治疗在辅助治疗中，使用抗-98P4B6抗体联合化疗或抗肿瘤药物和/或放疗治疗患者。通过在标准一线和二线治疗中加入抗-98P4B6抗体，根据标准方案治疗基本的癌靶，例如表I所列出的癌症。方案设计的有效性通过降低肿瘤的重量以及降低标准化疗剂的常规剂量的能力而进行评价。这些剂量的降低通过降低化疗药物的剂量-相关毒性而允许额外的和/或延长的治疗。在几种辅助临床试验中，抗-98P4B6抗体与化疗或抗肿瘤药物阿霉素(晚期前列腺癌)、顺铂(晚期头颈癌和肺癌)、紫杉醇(乳腺癌)和多柔比星(临床前)联合使用。II.)单一疗法关于抗-98P4B6抗体在肿瘤单一疗法中的应用，给予患者抗体而不给予化疗或抗肿瘤药物。在一个实施方案中，单一疗法在临床上用于广泛转移性疾病患者的末期癌症。患者的病情显示出稳定性。试验证明了对顽固性癌症患者的效果。III.)显象剂通过将放射性核素(例如，碘或钇(，))与抗-98P4B6抗体相连，该免疫标记的抗体可用作诊断和/或显象剂。在这一作用中，标记抗体定位于实体瘤以及表达98P4B6的细胞的转移病灶。关于抗-98P4B6抗体作为显象剂的应用，该抗体被用作外科治疗实体瘤的辅剂，包括手术前筛选以及手术后追踪测定肿瘤残留和/或复发。在一个实施方案中，(111In)-98P4B6抗体用作I期临床试验的显象剂，其中患者的肿瘤表达98P4B6(类比参见例如DivgietalJ.Natl.CancerInst8397-104(1991))。给药的剂量和途径如本领域技术人员所理解的，剂量的考虑可以通过与临床类似产品的比较而确定。因此，可在5至400mg/m2的剂量范围内施用抗-98P4B6抗体，所述剂量是与安全性研究相关的较低剂量。相对于已知抗体对于其靶点的亲和力的抗-98P4B6抗体的亲和力是本领域技术人员确定类似剂量方案的一个参数。此外，与嵌合抗体相比，身为全人抗体的抗-98P4B6抗体清除得更慢；相应地，用于患者的全人抗-98P4B6抗体的剂量可以较低，大概在50至300mg/m2的范围内，此时仍然有效。以mg/m2表示剂量，而不同于常规的mg/kg的剂量表示方式，这是基于表面积的衡量方法，也是可用于包括从婴儿至成年人所有体形大小的患者的方便的剂量衡量方法。三种独特的释放方法有助于传递抗-98P4B6抗体。常规的静脉内传递是一种用于许多肿瘤的标准传递技术。但是，对于腹腔内的肿瘤、例如卵巢瘤、胆管瘤、其它导管瘤等，腹膜内给药被证明是有效的，因为能在肿瘤处聚集高剂量的抗体并能使抗体清除降至最低。在相似的方法中，某些实体瘤具有适合区域性灌注的脉管系统。区域性灌注允许肿瘤位点处有高剂量的抗体并使抗体的短期清除降至最低。临床开发计划(CDP)概述CDP追随并发展了抗-98P4B6抗体的治疗方法连同辅助治疗、单一治疗以及作为显像剂。在重复剂量中，试验最初证明了安全性随后证实了有效性。试验为公开标记，比较了标准化疗与标准治疗加抗-98P4B6抗体。如所理解的，可用于选择患者的一个标准是通过活检测定的其肿瘤中98P4B6的表达水平。对于任何基于蛋白质或抗体灌输的治疗，安全性考虑主要涉及(i)细胞因子释放综合征，即，低血压、发热、振颤、寒战；(ii)对材料的免疫原应答的发生(即，接受抗体治疗的患者产生人抗体，或HAHA应答)；以及，(iii)对于表达98P4B6的正常细胞的毒性。标准测试和追踪观察被用于监测上述各种安全性考虑。发现抗-98P4B6抗体用于人类是安全的。实施例41使用人抗-98P4B6抗体和化疗剂的人类临床试验辅助治疗启动I期人类临床试验以评价关于治疗实体瘤的人抗-98P4B6抗体的六种静脉内剂量的安全性，这些实体瘤如表I所列组织的癌症。在此项研究中，评价了用于辅助抗肿瘤或化疗药物治疗时单一剂量的抗-98P4B6抗体的安全性，其中抗肿瘤或化疗药物如本文所定义，例如，但不限于顺铂、托泊替康、多柔比星、阿霉素、紫杉醇等。试验设计包括在根据下表的疗程内，传递六种单一剂量的抗-98P4B6抗体，该抗体剂量从约25mg/m2升至约275mg/m2。第0天第7天第14天第21天第28天第35天MAb剂量2575125175225275mg/m2mg/m2mg/m2mg/m2mg/m2mg/m2化学治疗++++++(标准剂量)每次给予抗体和化疗剂后，对患者进行严密追踪。特别地，评价患者的上述安全性考虑(i)细胞因子释放综合征，即，低血压、发热、振颤、寒战；(ii)对材料的免疫原应答的发生(即，接受抗体治疗的患者产生人抗体，或HAHA应答)；以及(iii)对于表达98P4B6的正常细胞的毒性。标准测试和追踪观察被用于监测上述各安全性考虑。还评价患者的临床结果，特别是由MRI或其它显象证明的瘤重的降低。抗-98P4B6抗体被证明是安全有效的，II期试验确定了效能并优化了最佳剂量。实施例42人类临床试验使用人抗-98P4B6抗体的单一治疗抗-98P4B6抗体对于上述辅助治疗是安全的，II期人类临床试验确定了单一治疗的效能和最佳剂量。这样的试验已经完成，并进行了相同的安全性和结果分析，与上述辅助治疗不同的是患者在接受抗-98P4B6抗体的同时没有接受化疗剂。实施例43人类临床试验用抗-98P4B6抗体进行诊断显像由于上述辅助治疗在上述安全性标准内是安全的，再次进行关于抗-98P4B6抗体用作诊断显象剂的临床试验。设计的方案与本领域描述的方案基本相似，例如Divgietal，J.Natl.Cancerlnst.8397-104(1991)。发现该抗体用作诊断形式时是安全有效的。实施例4498P4B6与已知序列的同源性比较98P4B6基因与已克隆并测序的名称为人STAMP1(gi15418732)(Korkmaz，K.Setal，J.Biol.Chem.2002，27736689)的基因同源，显示了与该基因99％的同一性和99％的同源性(图4)。98P4B6蛋白也显示了与另一前列腺2人6跨膜上皮抗原(gi23308593)(Walker，M.Getal，GenomeRes.1999，91198；Porkka，K.P.，Helenius，M.A.和Visakorpi，T，Lab.Invest.2002，821573)有99％的同一性和99％的同源性。与98P4B6最接近的小鼠同系物是前列腺2的6跨膜上皮抗原(gi28501136)，具有97％的同一性和99％的同源性。我们已经鉴定了98P4B6蛋白的几种变体，包括4个剪接变体和3个SNP(图11)。98P4B6v.1蛋白由454个氨基酸组成，计算分子量为52kDa，pI为8.7。其是6跨膜蛋白，可以定位于细胞表面或可能定位于内质网(表VI)。几种98P4B6变体，包括v.1、v.5-8、v.13、v.14、v.21、v.25享有相似的特征、具有功能显著性的蛋白质基元以及结构的共同性例如多个跨膜结构域。98P4B6v.2是短蛋白，没有已知的基元。基元分析揭示存在几种已知的基元，包括氧化还原酶、高半胱氨酸水解酶和dudulin基元。变体v.7和该变体的SNP还携带Ets基元，通常伴随着转录活性。在哺乳动物细胞中已经鉴定了几种氧化还原酶，包括NADH/醌氧化还原酶。该蛋白质与细胞膜相关并用作质子/+泵，调节肿瘤抑制p53的蛋白质降解，保护哺乳动物细胞免受氧化应力、细胞毒性和诱变剂(AsherGetal，ProcNatlAcadSciUSA.2002，9913125；JaiswalAK，ArchBiochemBiophys2000，37562；YanoT，MolAspectsMed2002，23345)。高半胱氨酸水解酶是已知催化S-腺苷高半胱氨酸分裂为高半胱氨酸和腺苷的酶，最终调节反式甲基化，从而调节蛋白质表达、细胞周期和增殖(TurnerMAetal，CellBiochemBiophys2000；33101；Zhangetal，JBiolChem.2001；27635867)。这一信息表明98P4B6在哺乳动物细胞生长、基因转录调节以及电子和小分子的运送中起作用。相应地，当98P4B6作为细胞生长、肿瘤形成的调制剂，或作为涉及与炎症、肿瘤生成或增殖相关的激活基因的转录调制剂时，98P4B6可用于治疗、诊断、预测和/或预防的目的。此外，当例如98P4B6的变体或多态性分子在癌症组织中表达时，其可用于治疗、诊断、预测和/或预防的目的。实施例45STEAP-2表达的表型效应本实验有关STEAP-2蛋白质的表达，所述蛋白质具有表2所示的、并由插入质粒的cDNA编码的氨基酸序列，所述质粒于1999年7月2日存放于美国典型培养物保藏中心，且指定的ATCC登录号为PTA-311。从编码序列中可推出，开放读码框编码有6个跨膜结构域的454个氨基酸。图19显示了与STEAP-2蛋白相关的特征概要。本专利申请中列出的数据提供了STEAP-2蛋白的表达分布图，其主要特异地表达于正常组织中的前列腺，某些类型的前列腺肿瘤以及其它肿瘤。这一证据是基于使用Northern印迹监测信使RNA。为了与本产业标准操作保持一致，常规采用Northern印迹评价基因表达，因为其不需要耗时间的过程，包括合成相关蛋白质、产生抗体、确保抗体的特异性，而这些过程为蛋白质的Western印迹和组织的组织学检查所需要。Northern印迹提供了可信的有效的测试RNA表达和表达水平方法。本实施例证明实际产生了STEAP-2蛋白。简而言之，实验表明经修饰包含STEAP-2表达系统的PC-3细胞和3T3细胞显示了酪氨酸磷酸化的水平一般性地增加，ERK蛋白磷酸化的水平特别地增加。数据还表明包含STEAP-2表达系统的PC-3细胞显示了经修饰的钙流量、对紫杉醇经修饰的应答、以及对药物诱导的细胞凋亡的一般性抑制。这些是在蛋白质水平上显示的效果，因此仅有这些数据就可以证明STEAP-2蛋白的存在。此外，尽管这样的表型效应是蛋白质介导的，但是还有证据表明STEAP-2蛋白自身是这些效应的调制剂。通过使用修饰的STEAP-2蛋白得到这一证据。将表达系统稳定地导入PC3和3T3细胞，这些细胞允许表达修饰形式的STEAP-2，被成为STEAP-2CFI，这里“FI”代表Flag。STEAP-2CFI是具有肽延伸的STEAP-2蛋白，即，改变此蛋白质物理构象的Flag表位。此Flag表位是一串8个氨基酸，通常在蛋白质的氨基末端或羧基末端引入，作为鉴别和追踪基因工程细胞中重组蛋白质的工具(SlootstraJWetal，MolDivers1997，2156)。在多数情况下，在蛋白质任何一端引入的Flag表位几乎不会对蛋白质的天然功能和位置产生影响(MolloySSetal，EMBOJ1994，1318)。但是，这取决于Flag所标记的蛋白质的特性。最近的研究表明Flag标记影响选择蛋白，例如CLN3蛋白(参见例如HaskellRE，etal.MolGenetMetab1999，66253)的功能或构象。对于CLN3，在STEAP-2的C-末端引入Flag表位标记改变了该蛋白质的物理构象和性质。使用C-Flag表位改变STEAP-2蛋白导致不改变时观察到的许多作用的减退，包括ERK磷酸化和抵抗药物诱导的细胞死亡。数据表明是STEAP-2蛋白介导这些表型效应。最后，使用兔网织红细胞裂解物的体外翻译研究证实表面STEAP-2蛋白被翻译并表现出预期的分子量。图20和21表示当PC-3和3T3细胞分别被修饰以包含编码所示蛋白质的逆转录病毒表达系统pSR时所获得的结果，其中所述蛋白质包括STEAP-1、STEAP-2和STEAP-2CFI。基因特异性蛋白质的表达由长末端重复(LTR)驱动，新霉素抗性基因被用于选择稳定表达蛋白质的哺乳动物细胞。用逆转录病毒转导PC-3和3T3细胞，在G418存在下筛选，以及在容许STEAP-2编码序列表达的条件下培养。细胞在低浓度的FBS(0.5-1％FBS)中生长过夜，然后用10％FBS刺激。在RIPA缓冲液中裂解细胞并定量蛋白质浓度。用SDS-PAGE分开全细胞裂解物，并经使用抗-磷酸-ERK(CellSignalingInc.)或抗磷酸酪氨酸(UBI)抗体的Western印迹分析(图20，21和22)。如图20所示，与未转化的PC-3细胞相比，修饰后包含STEAP-2的细胞包含提高量的磷酸化酪氨酸。对3T3细胞类似实验的相似结果示于第3页。在后一个实验中，STEAP-2CFI表达系统还被转染入3T3细胞，该细胞被用作对照。如图21所示，天然STEAP-2存在下发现的提高了的磷酸化在蛋白质构象改变时显著地减少。因此，这些结果最终表明产生了STEAP-2蛋白并介导了上述表型效果。图22显示了特别地检测了ERK磷酸化的PC-3和3T3细胞中的相似结果。该方案与上面第5段的方案相似，除了不使用对磷酸酪氨酸特异的抗体探测凝胶，探测凝胶是否有抗-ERK和抗-磷酸-ERK抗体。如图22所示，在10％FBS存在下，修饰的表达STEAP-2的PC-3细胞和3T3细胞显示了ERK磷酸化，而其在转化后包含STEAP-2CFI的细胞中没有检测到。与不显示背景ERK磷酸化的对照PC-3细胞相反，对照3T3-neo细胞显示低水平的内源性ERK磷酸化。相对于3T3-neo细胞，使用10％FBS处理提高了表达STEAP-2的细胞内的ERK蛋白磷酸化，然而在表达修饰的STEAP-2，即STEAP-2CFI的3T3细胞中没有观察到ERK磷酸化的增加。我们的数据也表明了对修饰的包含STEAP-2表达系统的细胞中细胞代谢的其它影响。图23表明在存在LPA下测量有和没有STEAP-2表达系统的细胞的钙流量时，钙流量在包含STEAP-2的细胞中提高了。使用FACS分析和商业可得的指示剂(MolecularProbes)比较亲代细胞和表达STEAP-2的细胞输送钙的能力。PC3-neo和PC3-STEAP-2细胞荷载了钙反应指示剂Fluo4和Furared，在钙和LPA存在和不存在下保温，并经流式细胞仪分析。PC3细胞表达已知的钙转运剂，PC3-83P3H3pCaT被用作阳性对照(BiochemBiophysResCommun.2001，282729)。图23中的表表明STEAP-2介导对LPA反应的钙流量，以及钙流量的强度与已知钙通道产生的强度相当。此外，与PC3-neo细胞相比，表达STEAP-2的PC3细胞显示对agatoxin的敏感度增加，agatoxin是钙离子通道阻滞剂。这些结果显示STEAP-2的表达致使PC3细胞对使用Ca++通道抑制剂治疗敏感。来自上述实验的信息提供调节癌症细胞的机理。这与关于钙的信息特别相关，这是由于已报道了钙通道抑制剂会诱导某些癌症细胞死亡，包括前列腺癌细胞系(参见例如BatraS，PopperLD，Hartley-AspB.Prostate.1991，19299)。图24表明使用STEAP-2表达系统转染的细胞已经提高了暴露于紫杉醇的存活能力。为了测定STEAP-2对存活的影响，使用临床上目前应用的化疗剂治疗缺乏或表达STEAP-2的PC3细胞。通过使用Alamare蓝色试验测量细胞增殖以评价治疗效果(表23)。存在5μM紫杉醇时只有5.2％的PC3-neo细胞能代谢Alalmare蓝且增殖，而同样条件下44.8％的PC3-STEAP-2细胞存活。这些结果显示STEAP-2的表达增加对紫杉醇的抵抗力。这些发现具有重要的体内含意，因为它们显示STEAP-2为使用常见治疗药物治疗的患者内的前列腺肿瘤细胞提供生长优势。这些结果更详细的形式示于图25和26中。这两页中的结果阐明了STEAP-2支持PC3细胞存活的作用模式。在这些研究中，表达或缺乏STEAP-2的PC3细胞经紫杉醇治疗60小时，并测试使用偶联于FITC的膜联蛋白V和碘化丙锭染色分析细胞凋亡。在凋亡细胞中，膜磷脂丝氨酸磷脂(PS)自膜的内小叶易位至外小叶，从而将PS暴露至外部细胞环境。PS被膜联蛋白V识别并与之结合，为科学家提供一种可靠的鉴定正经历程序性细胞死亡的细胞的方法。使用碘化丙锭染色法鉴定死亡细胞。表25显示相对于紫杉醇治疗的PC3-neo细胞，STEAP-2的表达抑制45％由紫杉醇介导的细胞凋亡。当STEAP-2被其C-末端的Flag修饰时，STEAP-2的保护作用被抑制(图26)。公众可得的文献包含几种前列腺癌和其它显示相似的表型特征的癌症的例子，其中的表型特征在表达STEAP-2的PC3细胞中被观察到。特别地，临床研究已报道在使用紫杉醇治疗的患者中短暂的肿瘤退化和/或仅部分应答。例如，进入紫杉醇的单一药物临床试验的前列腺癌患者中只有约50％显示了降低的PSA水平，当使用紫杉醇治疗时诱导3级和4级毒性；基于此剂量水平期望有更高水平的应答，因此，此数据显示在前列腺癌患者中产生了紫杉醇耐药性(BeerTMetal，AnnOncol2001，121273)。在其它研究中观察到相似的减少的应答和累进的肿瘤复发现象(参见例如ObasajuC，andHudesGR.HematolOncolClinNorthAm2001，15525)。此外，内源性表达STEAP-2的细胞，例如LNCaP细胞中的钙流量的抑制诱导其细胞死亡(SkrymaRetal，JPhysio.2000，52771)。因此，STEAP-2蛋白不仅在受试细胞中生成，还在已证实存在mRNA的未修饰肿瘤细胞或未修饰前列腺细胞中生成。说明书中的Northern印迹数据清楚地显示编码STEAP-2的信使RNA在某些前列腺和肿瘤细胞中生成。其自身为肿瘤细胞系的3T3和PC-3细胞显然能够将信使RNA翻译成蛋白质。由于已证实细胞内没有翻译信使RNA的屏障，所述细胞与已显示生成mRNA的肿瘤和前列腺细胞类似，因此可以适当地得出结论如果事实是已证实产生了mRNA，则可以在未修饰的肿瘤或前列腺细胞中检测到蛋白质本身。这一结论还被在经特异性修饰以表达STEAP-2的细胞中观察到的表型改变模式所支持，这些改变与癌症细胞中所观察到的改变相称。基于上述数据，科学地推断产生编码STEAP-2的mRNA的细胞和组织也产生了蛋白质本身。实施例46潜在信号转导途径的鉴定和确认已报道许多哺乳动物蛋白与信号传导分子相互作用并参与调节信号传导途径(JNeurochem.2001；76217-223)。使用免疫沉淀和Western印迹技术，鉴定与98P4B6相关并且介导信号传导事件的蛋白质。98P4B6可调节几种已知在癌症生物学中起作用的途径，包括磷脂途径，如P13K、AKT等，粘附和迁移途径，包括FAK、Rho、Rac-1等，以及促有丝分裂/存活级联蛋白例如ERK、p38等(CellGrowthDiffer.2000，11279；JBiolChem.1999，274801；Oncogene.2000，193003，J.CellBiol.1997，138913)。为了证实98P4B6直接或间接激活细胞内已知的信号传导途径，在表达各个基因的细胞中进行基于萤光素酶(luc)的转录报道基因试验。这些转录报道基因包含针对已知转录因子的共有序列-结合位点，所述位点位于已被较好表征的信号传导途径的下游。报道基因，这些相关转录因子、信号传导途径和活化刺激物的例子列于下文。1.NFkB-luc，NFkB/Rel；Ik-激酶/SAPK；生长/细胞凋亡/应力2.SRE-luc，SRF/TCF/ELK1；MAPK/SAPK；生长/分化3.AP-1-luc，FOS/JUN；MAPK/SAPK/PKC；生长/细胞凋亡/应力4.ARE-luc，雄激素受体；类固醇/MAPK；生长/分化/细胞凋亡5.p53-luc，p53；SAPK；生长/分化/细胞凋亡6.CRE-luc，CREB/ATF2；PKA/p38；生长/细胞凋亡/应力可在显示mRNA表达的细胞中测试基因介导的效果。可通过脂质介导的转染(TFX-50，Promega)导入萤光素酶报道质粒。通过保温细胞提取物和萤光素底物测定萤光素酶活性，该活性为相对转录活性的指示，在发光计中监测反应的发光。对由98P4B6激活的信号传导途径作图，并用于治疗靶点的鉴定和确认。当98P4B6与细胞信号传导有关时，其被用作诊断、预测、预防和/或治疗目的的靶点。实施例4798P4B6用作质子或小分子转运蛋白98P4B6的测序和同源分析显示98P4B6具有转运蛋白的功能。为了证实STEAP-1作为离子通道的功能，使用了FACS分析和荧光显微镜术(GergelyL，etal，ClinDiagnLabImmunol.1997；470；SkrymaRetal，JPhysio.2000，52771)。使用FACS分析和商业可得的指示剂(MolecularProbes)，比较亲代细胞和表达98P4B6的细胞转运电子、钠、钙的能力；以及转运癌症细胞和正常细胞系中的其它小分子的能力。例如，PC3和PC3-98P4B6细胞荷载有钙反应指示剂Fluo4和Furared，在存在和不存在钙和脂磷脂酸(LPA)时保温，并经流式细胞仪分析。离子流量代表调节癌症细胞的重要机理。对于钙来说，这一点特别正确，这是由于据报道钙通道抑制剂能诱导某些癌症细胞死亡，包括前列腺癌细胞系(BatraS，PopperLD，Hartiey-AspB.Prostate.1991，19299)。使用钠、钾、pH等指示剂进行相似的研究。由于与氧化还原酶的同源性，98P4B6可通过活动化和转运小分子而参与促进抗药性。使用改良的MDR试验研究98P4B6对小分子转运的影响。对照细胞和表达98P4B6的细胞荷载有荧光小分子例如钙黄绿素AM。通过检查上清液的荧光化合物测定从细胞挤压的钙黄绿素。使用MDR抑制剂证实MDR样活性。当98P4B6用作转运蛋白时，其可用作诊断、预测、预防和/或治疗目的的靶点。实施例48参与肿瘤发展98P4B6基因促进癌症细胞的生长。98P4B6在肿瘤生长中的作用在许多原代和转染细胞系，包括前列腺以及经基因工程改造可稳定表达98P4B6的NIH3T3细胞中得到证实。使用文献已知的增殖测定法(FraserSP，GrimesJA，DjamgozMB.Prostate.2000；4461，JohnsonDE，OchiengJ，EvansSL.AnticancerDrugs.1996，7288)评价缺乏98P4B6的亲代细胞和表达98P4B6的细胞的细胞生长。为了证实98P4B6在转化过程中的作用，研究了其在集落形成试验中的作用。在严紧和更为柔和的条件下，使用软琼脂试验比较缺乏98P4B6的亲代NIH-3T3与表达98P4B6的NIH-3T3细胞(SongZ.etal.CancerRes.2000；606730)。为了证实98P4B6在癌症细胞侵袭和转移中的作用，使用了已建立的测定法，例如TranswellInsertSystem测定法(BectonDickinson)(CancerRes.1999；596010)。比较了对照细胞和表达98P4B6的细胞，所述对照细胞包括缺乏98P4B6的前列腺和成纤维细胞系。细胞荷载有荧光染料、钙黄绿素，并被平铺在涂有基底膜类似物的Transwellinsert上方孔。通过相对于整个细胞群体的荧光的较低室中细胞的荧光来测定侵袭。98P4B6还在细胞周期和细胞凋亡中起作用。在细胞周期调节中使用已建立的BrdU测定法(Abdel-MalekZA.JCellPhysio.1988，136247)比较亲代细胞和表达98P4B6的细胞的分化。简而言之，细胞在最佳(全血清)和限制的(低血清)条件下生长，使用BrdU标记并使用抗-BrdUAb和碘化丙锭染色。分析细胞是否进入细胞周期的G1、S和G2M期。或者，评价对照亲代细胞和表达98P4B6细胞，包括正常和肿瘤前列腺细胞对凋亡的应力作用。使用各种化疗药物例如表鬼臼毒素吡喃葡糖苷、氟他米特等，和蛋白质合成抑制剂例如放线菌酮处理基因工程细胞和亲代细胞。使用膜联蛋白V-FITC染色细胞并经FACS分析测定细胞死亡。由98P4B6调节的细胞死亡在调节肿瘤发展和肿瘤负荷中起重要作用。当98P4B6在细胞生长、转化、侵袭和细胞凋亡中起作用时，其被用作诊断、预测、预防和/或治疗目的的靶点。实施例49参与血管生成血管生成或新毛细血管形成是肿瘤生长所必需的(HanahanD，FolkmanJ.Cell.1996，86353；FolkmanJ.Endocrinology.1998，139441)。基于磷酸二脂酶抑制剂对内皮细胞的作用，98P4B6在血管生成中起作用(DeFouwLetal，MicrovascRes2001，62263)。已经发展了几种测量体外和体内血管生成的测定法，例如组织培养测试内皮细胞管形成和内皮细胞增殖。使用这些测定法以及体外新血管形成，证实了98P4B6在血管生成、促进或抑制中的作用。例如，使用血管形成和增殖试验评价经基因工程改造可表达98P4B6的内皮细胞。还在体内动物模型中证实了98P4B6的作用。例如，表达或缺乏98P4B6的细胞被皮下植入无免疫应答的小鼠。5-15天后使用免疫组化技术评价内皮细胞迁移和血管生成。98P4B6影响血管生成，因此可用作诊断、预测、预防和/或治疗目的的靶点。实施例50转录的调节98P4B6的位置和其与水解酶的相似性以及其Ets基元(v.7)显示98P4B6可有效地用作真核基因转录调节的调制剂。例如，通过研究表达或缺乏98P4B6的细胞中基因的表达，证实了对基因表达的调节。为此，进行了两类实验。第一组实验中，从亲代和表达98P4B6的细胞中提取RNA，并与商业可得基因阵列(Clontech)杂交(Smid-KoopmanEetal.BrJCancer.2000.83246)。比较静止细胞以及使用FBS或雄激素处理的细胞。依照本领域已知步骤鉴定被差异表达的基因。然后将差异表达的基因作图于生物学途径(ChenKetal，Thyroid.2001.1141)。第二组实验中，使用商业可得(Stratagene)萤光素酶报道基因构建体包括NFkB-luc、SRE-luc、ELK1-luc、ARE-luc、p53-luc和CRE-luc评价特异的转录途径激活。这些转录报道基因包含已知转录因子的共有序列结合位点，所述位点位于已被较好表征的信号传导途径的下游，并代表了确定途径激活和筛选途径激活的正和负调制剂的优良手段。因此，98P4B6在基因调节中起作用。当98P4B6参与基因调节时，其被用作诊断、预测、预防和/或治疗目的的靶点。实施例51蛋白质-蛋白质结合几种6TM蛋白已表明能与其它蛋白质相互作用，从而调节信号传导、基因转录、转化和细胞粘附。使用免疫沉淀技术以及双酵母杂合系统，鉴定与98P4B6有关的蛋白质。比较表达和缺乏98P4B6的细胞的免疫沉淀物的特异性蛋白质-蛋白质结合。进行研究证实98P4B6与效应分子结合的程度，效应分子例如核蛋白、转录因子、激酶、磷酸等。比较98P4B6阳性和98P4B6阴性细胞的研究以及比较非刺激/静止细胞和用上皮细胞激活剂处理的细胞的研究揭示了独特的相互作用，上皮细胞激活剂如细胞因子、生长因子、雄激素和抗-整联蛋白Ab。此外，使用双酵母杂合方法证实了蛋白-蛋白相互作用(CurrOpinChemBiol.1999，364)。将携有融合于转录因子激活结构域的蛋白质文库的载体导入表达98P4B6-DNA-结合结构域融合蛋白和报道基因构建体的酵母中。通过比色报道基因活性检测蛋白质-蛋白质相互作用。效应分子和转录因子的特异性结合指示本领域技术人员了解98P4B6的作用模式，并鉴定出诊断、预测、预防和/或治疗癌症的靶点。该测定法和类似方法还被用于鉴定和筛选与98P4B6相互作用的小分子。因此发现98P4B6与蛋白质以及小分子结合。相应地，98P4B6和这些蛋白质和小分子被用于诊断、预测、预防和/或治疗的目的。在本申请各处引用了多个网站的数据内容，出版物，专利申请和专利。(引用了网站的UniformResourceLocator，或ULR，在万维网上的地址)。各参考文献中公开的内容皆全文列入本文作为参考。本发明不限于本文公开的实施方案的范围，这些实施方案仅为单独阐明本发明的各个方面，任何功能等同的实施方案均在本发明的范围内。除本文描述的，本发明的模式和方法的各种变化，对于参照前文描述和教导的熟练技术人员而言都是显而易见的，同样欲落入本发明的范围内，这样的变化或其它实施方案可在不偏离本发明的实际范围和精神的情况下实施。表格表1表达98P4B6的组织a.恶性组织a.膀胱b.乳腺c.子宫颈d.结肠e.肾脏f.肺脏g.卵巢h.胰腺i.前列腺j.胃k.子宫表II氨基酸缩写表III氨基酸取代矩阵根据GCG软件9.0BLOSUM62氨基酸取代矩阵(块取代矩阵(blocksubstitutionmatrix))修改。值越高，越有可能在相关的天然蛋白中发现取代。(参见互联网址URLikp.unibe.ch/manual/blosum62.html)ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY.40-2-1-20-2-1-1-1-1-2-1-1-1100-3-2A9-3-4-2-3-3-1-3-1-1-3-3-3-3-1-1-1-2-2C62-3-1-1-3-1-4-31-10-20-1-3-4-3D5-3-20-31-3-20-1200-1-2-3-2E6-3-10-300-3-4-3-3-2-2-113F6-2-4-2-4-30-2-2-20-2-3-2-3G8-3-1-3-21-200-1-2-3-22H4-321-3-3-3-3-2-133-1I5-2-10-1120-1-2-3-2K42-3-3-2-2-2-11-2-1L5-2-20-1-1-11-1-1M6-20010-3-4-2N7-1-2-1-1-2-4-3P510-1-2-2-1Q5-1-1-3-3-2R41-2-3-2S50-2-2T4-3-1V112W7Y表IVHLAI类/II类基元/超基元表IV(A)HLAI类超基元/基元粗体的残基为优选的残基，斜体的残基次之当一种肽在每一个一级(primary)锚位置具有上表所指明的基元或超基元的一级锚时，可以认为这种肽携有基元。表IV(B)HLAII类超基元表IV(C)HLAII类基元斜体的残基表示较不优选(lesspreferred)的残基或“耐受”的残基。表IV(D)HLAI类超基元斜体的残基表示较不优选的残基或“耐受”的残基。表IV(E)HLAI类基元表IV(F)表IV(G)由不同的HLA-超型组合所提供的人群覆盖率计算值表VI98P4B6的基元和翻译后修饰cAMP-依赖性和cGMP-依赖性蛋白激酶磷酸化位点。176-179RKET(SEQIDNO114)蛋白激酶C磷酸化位点。235-237SVK酪蛋白激酶II磷酸化位点。9-12SATD(SEQIDNO115)50-53TVME(SEQIDNO116)130-133SCTD(SEQIDNO117)172-175SPEE(SEQIDNO118)N-豆蔻酰化位点。14-19GLSIST(SEQIDNO119)G蛋白-偶联型受体家族1标志(signature)。52-68MESSVLLAMAFDRFVAV(SEQIDNO120)表VII搜索肽v.1aa1-454(SEQIDNO121)9-mers，10-mers和15-mersMESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSRNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMRINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIELARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYARNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQCRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEEEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPDv.2aa1-45(SEQIDNO122)9-mers，10-mers，15-mersSGSPGLQALSLSLSSGFTPFSCLSLPSSWDYRCPPPCPADFFLYFv.5，(在211位置有1个氨基酸差异，并且有不同的C-末端)PartA9-mersaa203-219NLPLRLFTFWRGPVVVA(SEQIDNO123)10-mersaa202-220ENLPLRLFTFWRGPVVVAI(SEQIDNO124)15-mersaa197-225SAREIENLPLRLFTFWRGPVVVAISLATF(SEQIDNO125)PartB9-mersaa388-419WREFSFIQIFCSFADTQTELELEFVFLTLLL(SEQIDNO126)10-mersaa387-419NWREFSFIQIFCSFADTQTELELEFVFLLTLLL(SEQIDNO127)15-mersaa382-419VSNALNWREFSFIQIFCSFADTQTELELEFVFLLTLLL(SEQIDNO.128)v.6，(与我们最初445-490不同)9-mers；aa447-490(SEQIDNO129)VLPSIVILGKIILFLPCISRKLKRIKKGWEKSQFLEEGTGGTIPHVSPERVTVM10-mersaa446-490(SEQIDNO130)LVLPSIVILGKIILFLPCISRKLKRIKKGWEKSQFLEEGIGGTIPHVSPERVTVM15-mersaa441-490(SEQIDNO131)NFVLALVLPSIVILGKIILFLPCISRKLKRIKKGWEKSQFLEEGIGGTIPHVSPERVTVMv.7，(缺失我们的最初的340-394，392-576是不同的)PartA9-mersaa334-350FLNMAYQQSTLGYVALL(SEQIDNO132)10-mersaa333-351LFLNMAYQQSTLGYVALLI(SEQIDNO.133)15-mersaa328-355RSERYLFLNMAYQQSTLGYVALLISTFHV(SEQIDNO134)PartB9-mersaa384-576(SEQIDNO135)PSIVILDLSVEVLASPAAAWKCLGANILRGGLSEIVLPIEWQQDRKIPPLSTPPPPAMWTEEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQDSIDPPESPDRALKAANSWRNPVLPHTNGVGPLWEFLLRLLKSQAASGTLSLAFTSWSLGEELGSGTWMKLETIILSKLTQEQKSKHCMFSLISGS10-mersaa383-576(SEQIDNO136)LPSIVILDLSVEVLASPAAAWKCLGANILRGGLSETVLPIEWQQDRKIPPLSTPPPPAMWTEEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQDSIDPPESPDRALKAANSWRNPVLPHTNGVGPLWEFLLRLLKSQAASGTLSLAFTSWSLGEFLGSGTWMKLETIILSKLTQEQKSKHCMFSLLSGS15-mersaa378-576(SEQIDNO137)VLALVLPSIVILDLSVEVLASPAAAWKCLGANILRGGLSEIVLPIEWQQDRKIPPLSTPPPPAMWTFEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQDSIDPPESPDRALKAANSWRNPVLPHTNGVGPLWEFLLRLLKSQAASGTLSLAFTSWSLGEFLGSGTWMKLETIILSKLTQEQKSKHCMFSLISGSv.8，是v.6的SNP变体，在475位置有一个氨基酸差异9-mersaa466-482KSQFLEEGMGGTIPHVS(SEQIDNO138)10-mersaa465-483EKSQFLEEGMGGTIPHVSP(SEQIDNO139)15-mersaa460-489IKKGWEKSQELEEGMGGTIPHVSPERVTV(SEQIDNO140)V139-mersaa9-25SPKSLSETFLPNGINGI(SEQIDNO141)10-mersaa8-26GSPKSLSETFLPNGINGIK(SEQIDNO.142)15-mersaa3-31SISMMGSPKSLSETFLPNGINGIKDARKV(SEQIDNO143)v.149-mersaa203-219NLPLRLFTFWRGPVVVA(SEQIDNO144)10-mersaa202-220ENLPLRLFTFWRGPVVVAI(SEQIDNO.145)15-mersaa197-225SAREIENLPLRLFTFWRGPVVVAISLATF(SEQIDNO146)V.219-mers557-572SKLTQEQKTKHCMFSLI(SEQIDNO147)10-mers556-573LSKLTQEQKTKHCMFSLIS(SEQIDNO148)15-mers551-576LETIILSKLTQEQKTKHCMFSLISGS(SEQIDNO149)V.259-mersaa447-463ILFLPCISQKLKRIKKG(SEQIDNO15D)10-mersaa446-464IILFLPCISQKLKRIKKGW(SEQIDNO151)15-mersaa440-468VILGKIILFLPCISQKLKRIKKGWEKSQF(SEQIDNO152)表VIII-XXI表XXII-XLIX表L98P4B6的特性表LI.转录为98P4B6v.1的外显子边界表LII(a).转录变体98P4B6v.2的核苷酸序列(部分，5′开放型)(SEQIDNO153)agtggatcccccgggctgcaggctctctctctctctctctcttccgggttcacgccattc60tcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggtgcccgccaccatgcccggctgat120ttctttttgtatttttagtacagacggagtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatc180tcctgacctcgtgatccgcccgccttggcctccaaagtgctgggattacaggtgtgagct240accgcgcccggcctattatcttgtactttctaactgagccctctattttctttattttaa300taatatttctccccacttgagaatcacttgttagttcttggtaggaattcagttgggcaa360tgataacttttatgggcaaaaacattctattatagtgaacaaatgaaaataacagcgtat420tttcaatattttcttattccttaaattccactcttttaacactatgcttaaccacttaat480gtgatgaaatattcctaaaagttaaatgactattaaagcatatattgttgcatgtatata540ttaagtagccgatactctaaataaaaataccactgttacagataaatggggcctttaaaa600atatgaaaaacaaacttgtgaaaatgtataaaagatgcatctgttgtttcaaatggcact660atcttcttttcagtactacaaaaacagaataattttgaagttttagaataaatgtaatat720atttactataattctaaatgtttaaatgcttttctaaaaatgcaaaactatgatgtttag780ttgctttattttacctctatgtgattatttttcttaattgttattttttataatcattat840ttttctgaaccattcttctggcctcagaagtaggactgaattctactattgctaggtgtg900agaaagtggtggtgagaaccttagagcagtggagatttgctacctggtctgtgttttgag960aagtgccccttagaaagttaaaagaatgtagaaaagatactcagtcttaatcctatgcaa1020aaaaaaaatcaagtaattgttttcctatgaggaaaataaccatgagctgtatcatgctac1080ttagcttttatgtaaatatttcttatgtctcctctattaagagtatttaaaatcatattt1140aaatatgaatctattcatgctaacattatttttcaaaacatacatggaaatttagcccag1200attgtctacatataaggtttttatttgaattgtaaaatatttaaaagtatgaataaaata1260tatttataggtatttatcagagatgattattttgtgctacatacaggttggctaatgagc1320tctagtgttaaactacctgattaatttcttataaagcagcataaccttggcttgattaag1380gaattctactttcaaaaattaatctgataatagtaacaaggtatattatactttcattac1440aatcaaattatagaaattacttgtgtaaaagggcttcaagaatatatccaatttttaaat1500attttaatatatctcctatctgataacttaattcttctaaattaccacttgccattaagc1560tatttcataataaattctgtacagtttcccccaaaaaaagagatttatttatgaaatatt1620taaagtttctaatgtggtattttaaataaagtatcataaatgtaataagtaaatatttat1680ttaggaatactgtgaacactgaactaattattcctgtgtcagtctatgaaatccctgttt1740tgaaataagtaaacagcctaaaatgtgttgaaattattttgtaaatccatgacttaaaac1800aagatacatacatagtataacacacctcacagtgttaagatttatattgtgaaatgagac1860accctaccttcaattgttcatcagtgggtaaaacaaattctgatgtacattcaggacaaa1920tgattagccctaaatgaaactgtaataatttcagtggaaactcaatctgtttttaccttt1980aaacagtgaattttacatgaatgaatgggttcttcactttttttttagtatgagaaaatt2040atacagtgcttaattttcagagattctttccatatgttactaaaaaatgttttgttcagc2100ctaacatactgagttttttttaactttctaaattattgaatttccatcatgcattcatcc2160aaaattaaggcagactgtttggattcttccagtggccagatgagctaaattaaatcacaa2220aagcagatgcttttgtatgatctccaaattgccaactttaaggaaatattctcttgaaat2280tgtctttaaagatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttg2340tcttcctattgactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtcctt2400gcagttaggtgtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaag2460gcagcatgtgtcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggag2520ccctggcagctgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagac2580cagaaagaccttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgta2640aatctgggtgtgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcct2700gataccatttaacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagctt2760ttaaaggataatgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactc2820attttcctgccttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttct2880ttttaactgtgtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaa2940ttacacaccatgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaag3000tactatttaatgatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa3041表LIII(a).98P4B6v.1(SEQIDNO154)和98P4B6v.2(SEQIDNO155)的核苷酸序列比对Score＝1429bits(743)，Expect＝0.0ldentities＝750/751(99％)，Gaps＝1/751(0％)Strand＝Plus/PlusV.11687gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt1746||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22291gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt2350V.11747gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt1806||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22351gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt2410V.11807gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg1866||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22411gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg2470V.11867tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc1926||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22471tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc2530V.11927tgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc1986||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22531tgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc2590V.11987ttgactacttccctacttccactgctttt-cctgcatttaagccattgtaaatctgggtg2045|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22591ttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtg2650V.12046tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt2105||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22651tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt2710V.12106aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata2165||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22711aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata2770V.12166atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2225||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22771atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2830V.12226cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2285||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22831cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2890V.12286gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2345||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22891gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2950V.12346tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaa2405||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.22951tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaa3010V.12406tgatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2436|||||||||||||||||||||||||||||||V.23011tgatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa3041注意在V.2的2620处有单个碱基的单核苷酸插入表LIV(a).98P4B6v.2(SEQIDNO156)所编码的蛋白的(部分)肽序列SGSPGLQALSLSLSSGFTPFSCLSLPSSWDYRCPPPCPADFFLYF45表LV(a).98P4B6v.1和98P4B6v.2的氨基酸序列比对-无显著同源性-表LII(b).转录变体98P4B6v.3(SEQIDNO157)的核苷酸序列ttctgctatagagatggaacagtatatggaaagctcccaagaaagtgaagagaggaaatt60ggaaaattgtgagtggaccttctgatactgctcctccttgcgtggaaaaggggaaagaac120tgcatgcatattattcagcgtcctatattcaaaggatattcttggtgatcttggaagtgt180ccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagccctaagagccttagtgaaacttgttt240acctaatggcataaatggtatcaaagatgcaaggaaggtcactgtaggtgtgattggaag300tggagattttgccaaatccttgaccattcgacttattagatgcggctatcatgtggtcat360aggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaattttttcctcatgtggtagatgtcactca420tcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatatttgttgctatacacagagaacatta480tacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgggtaaaatcctgattgatgtgagcaa540taacatgaggataaaccagtacccagaatccaatgctgaatatttggcttcattattccc600agattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtctcagcttgggcacttcagttaggacc660taaggatgccagccggcaggtttatatatgcagcaacaatattcaagcgcgacaacaggt720tattgaacttgcccgccagttgaatttcattcccattgacttgggatccttatcatcagc780cagagagattgaaaatttacccctacgactctttactctctggagagggccagtggtggt840agctataagcttggccacattttttttcctttattcctttgtcagagatgtgattcatcc900atatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaattcctatagagattgtgaataaaac960cttacctatagttgccattactttgctctccctagtataccttgcaggtcttctggcagc1020tgcttatcaactttattacggcaccaagtataggagatttccaccttggttggaaacctg1080gttacagtgtagaaaacagcttggattactaagttttttcttcgctatggtccatgttgc1140ctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagagagatatttgtttctcaacatggctta1200tcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttggaatgaggaagaagtttggagaattga1260aatgtatatctcctttggcataatgagccttggcttactttccctcctggcagtcacttc1320tatcccttcagtgagcaatgctttaaactggagagaattcagttttattcagtctacact1380tggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatggatggaaacgagc1440ttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttcttgctcttgtttt1500gccctcaattgtaattctggatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaac1560tggaatttgtcttcctattgactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctca1620gctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcct1680caaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggata1740taacaggagccctggcagctgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcag1800attagagaccagaaagaccttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaa1860gccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagtt1920ctttatcctgataccatttaacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttt1980tgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaatta2040gttatactcattttcctgccttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatata2100ttatcttctttttaactgtgtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatatt2160gctatcaaattacacaccatgttttctatcattctcatagatctgccttataaacattta2220aataaaaagtactatttaatgatttaacttctgttttgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2280表LIII(b).98P4B6v.1(SEQIDNO158)和98P4B6v.3(SEQIDNO159)的核苷酸序列比对Score＝4013bits(2087)，Expect＝0.0ldentities＝2116/2128(99％)，Gaps＝1/2128(0％)Strand＝Plus/PlusV.1320aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa379||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3153aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa212V.1380gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa439||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3213gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa272V.1440ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac499||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3273ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac332V.1500ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat559||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3333ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat392V.1560tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa619||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3393tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa452V.1620tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg679||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3453tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg512V.1680tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca739||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3513tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca572V.1740atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg799||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3573atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg632V.1800tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca859||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3633tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca692V.1860gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc919||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3693gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc752V.1920ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct979||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3753ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct812V.1980ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1039||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3813ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt872V.11040attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1099||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3873attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca932V.11100aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1159||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3933aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc992V.11160tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1219||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.3993tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1052V.11220ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1279||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31053ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1112V.11280gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1339||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31113gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1172V.11340agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1399||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31173agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1232V.11400ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1459||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31233ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1292V.11460gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1519||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31293gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1352V.11520gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1579||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31353gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1412V.11580atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1639||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31413atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1472V.11640caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctggatcttttgcagc1699||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31473caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctggatcttttgcagc1532V.11700tttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctattgactctacttctt1759||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31533tttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctattgactctacttctt1592V.11760taaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactg1819||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31593taaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactg1652V.11820agtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcc1879||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31653agtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcc1712V.11880cttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagctgtctccagagga1939||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31713cttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagctgtctccagagga1772V.11940tcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagaccttgactacttccc1999||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31773tcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagaccttgactacttccc1832V.12000tacttccactgctttt-cctgcatttaagccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagt2058|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31833tacttccactgctttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagt1892V.12059gaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccatttaacactgtctgaa2118||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31893gaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccatttaacactgtctgaa1952V.12119ttaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcac2178||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.31953ttaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcac2012V.12179attaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgccttgatctttcat2238||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.32013attaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgccttgatctttcat2072V.12239tagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgtgtaattggtaatt2298||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.32073tagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgtgtaattggtaatt2132V.12299actaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacaccatgttttctatcat2358||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.32133actaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacaccatgttttctatcat2192V.12359tctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaatgatttaaaaaaa2418|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.32193tctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaatgatttaacttct2252V.12419aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2446||||||||||||||||||||||V.32253gttttgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2280注意在V.3的1845处插入单个碱基表LV(b).98P4B6v.3(SEQIDNO160)所编码的蛋白的肽序列MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454表LV(b).98P4B6v.1(SEQIDNO161)和98P4B6v.3(SEQIDNO162)的氨基酸序列比对Score＝910bits(2351)，Expect＝0.0ldentities＝454/454(100％)，Positives＝454/454(100％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.31MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.361RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.3121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.3181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.3241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYV.3301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEV.3361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420V.1421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPDV.3421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454表LII(c).转录变体98P4B6v.4(SEQIDNO163)的核苷酸序列cccacgcgtccgcggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaa60gctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctc120cctccttccttctcccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctgg180agtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccgccagtcggagagctaagggcaagtcct240gaggttgggcccaggagaaagaaggcaaggagacattgtcccaggatattcttggtgatc300ttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagccctaagagccttagtg360aaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaaggaaggtcactgtaggtg420tgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgacttattagatgcggctatc480atgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaattttttcctcatgtggtag540atgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatatttgttgctatacaca600gagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgggtaaaatcctgattg660atgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaatgctgaatatttggctt720cattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtctcagcttgggcacttc780agttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagcaacaatattcaagcgc840gacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattcccattgacttgggatcct900tatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactctttactctctggagagggc960cagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttattcctttgtcagagatg1020tgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaattcctatagagattg1080tgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccctagtataccttgcaggtc1140ttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtataggagatttccaccttggt1200tggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagttttttcttcgctatgg1260tccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagagagatatttgtttctca1320acatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttggaatgaggaagaagttt1380ggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggcttactttccctcctgg1440cagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactggagagaattcagttttattc1500agtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatggat1560ggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttcttg1620ctcttgttttgccctcaattgtaattctggatcttttgcagctttgcagatacccagact1680gagctggaactggaatttgtcttcctattgactctacttctttaaaagcggctgcccatt1740acattcctcagctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactgagtgttggccagtgagat1800gaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcccttcatcttgctgctggg1860attgtggatataacaggagccctggcagctgtctccagaggatcaaagccacacccaaag1920agtaaggcagattagagaccagaaagaccttgactacttccctacttccactgcttttcc1980tgcatttaagccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagtgaaaattaattctttctgc2040ccttcagttctttatcctgataccatttaacactgtctgaattaactagactgcaataat2100tctttcttttgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcacattaaaattgattttccat2160tgtcaattagttatactcattttcctgccttgatctttcattagatattttgtatctgct2220tggaatatattatcttctttttaactgtgtaattggtaattactaaaactctgtaatctc2280caaaatattgctatcaaattacacaccatgttttctatcattctcatagatctgccttat2340aaacatttaaataaaaagtactatttaatgattt2374表LIII(c).98P4B6v.1(SEQIDNO164)和98P4B6v.4(SEQIDNO165)的核苷酸序列比对Score＝404bits(210)，Expect＝e-109ldentities＝210/210(100％)Strand＝Plus/PlusV.11ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac60||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.414ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac73V.161gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct120||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.474gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct133V.1121cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcca180||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4134cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcca193V.1181cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag210||||||||||||||||||||||||||||||V.4194cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag223Score＝4022bits(2092)，Expect＝0.0ldentities＝2092/2092(100％)Strand＝Plus/PlusV.1320aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa379||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4283aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa342V.1380gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa439||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4343gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa402V.1440ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac499||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4403ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac462V.1500ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat559||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4463ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat522V.1560tttttcctcatgtggtagattcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa619||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4523tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa582V.1620tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg679||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4583tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg642V.1680tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca739||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4643tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca702V.1740atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg799||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4703atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg762V.1800tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca859||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4763tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca822V.1860gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc919||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4823gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc882V.1920ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct979||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4883ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct942V.1980ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1039||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.4943ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1002V.11040attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1099||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41003attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1062V.11100aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1159||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41063aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1122V.11160tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1219||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41123tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttaactttattacggcaccaagtata1182V.11220ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1279||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41183ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1242V.11280gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1339||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41243gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1302V.11340agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1399||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41303agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1362V.11400ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1459||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41363ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1422V.11460gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1519||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41423gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1482V.11520gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1579||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41483gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1542V.11580atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1639||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41543atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1602V.11640caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctggatcttttgcagc1699||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41603caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctggatcttttgcagc1662V.11700tttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctattgactctacttctt1759||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41663tttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctattgactctacttctt1722V.11760taaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactg1819||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41723taaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggtgtacatgtgactg1782V.11820agtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcc1879||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41783agtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtgtcctttttcatcc1842V.11880cttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagctgtctccagagga1939||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41843cttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagctgtctccagagga1902V.11940tcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagaccttgactacttccc1999||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41903tcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagaccttgactacttccc1962V.12000tacttccactgcttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagtg2059||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.41963tacttccactgcttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtgtgttacatgaagtg2022V.12060aaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccatttaacactgtctgaat2119||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42023aaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccatttaacactgtctgaat2082V.12120taactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcaca2179||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42083taactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggataatgtgcaattcaca2142V.12180ttaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgccttgatctttcatt2239||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42143ttaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgccttgatctttcatt2202V.12240agatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgtgtaattggtaatta2299||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42203agatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgtgtaattggtaatta2262V.12300ctaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacaccatgttttctatcatt2359||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42263ctaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacaccatgttttctatcatt2322V.12360ctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaatgattt2411||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.42323ctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaatgattt2374表LIV(c).98P4B6v.4(SEQIDNO166)所编码的蛋白的肽序列MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454表LV(c).98P4B6v.1(SEQIDNO167)和98P4B6v.4(SEQIDNO168)的氨基酸序列比对Score＝910bits(2351)，Expect＝0.0ldentities＝454/454(100％)，Positives＝454/454(100％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.41MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.461RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.4121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.4181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.4241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYV.4301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEV.4361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420V.1421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPDV.4421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLLQLCRYPD454表LII(d).转录变体98P4B6v.5(SEQIDNO169)的核苷酸序列cccacgcgtccgcggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaa60gctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctc120cctccttccttctcccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctgg180agtgcgaccgctacggcagccaccctgcaaccgccagtcggagagctaagggcaagtcct240gaggttgggcccaggagaaagaaggcaaggagacattgtcccaggatattcttggtgatc300ttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagccctaagagccttagtg360aaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaaggaaggtcactgtaggtg420tgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgacttattagatgcggctatc480atgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaattttttcctcatgtggtag540atgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatatttgttgctatacaca600gagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgggtaaaatcctgattg660atgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaatgctgaatatttggctt720cattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtctcagcttgggcacttc780agttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagcaacaatattcaagcgc840gacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattcccattgacttgggatcct900tatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactctttactttctggagagggc960cagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttattcctttgtcagagatg1020tgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaattcctatagagattg1080tgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccctagtataccttgcaggtc1140ttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtataggagatttccaccttggt1200tggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagttttttcttcgctatgg1260tccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagagagatatttgtttctca1320acatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttggaatgaggaagaagttt1380ggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggcttactttccctcctgg1440cagtcacttctatcccttcggtgagcaatgctttaaactggagagaattcagttttattc1500agatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctat1560tgactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttagg1620tgtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgt1680gtcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcag1740ctgctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc1800ttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtg1860tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt1920aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata1980atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2040cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2100gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2160tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttac2220caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2249表LIII(d).98P4B6v.1(SEQIDNO170)和98P4B6v.5(SEQIDNO171)的核苷酸序列比对Score＝398bits(207)，Expect＝e-107ldentities＝209/210(99％)Strand＝Plus/PlusV.11ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac60||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.514ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac73V.161gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct120||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.574gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct133V.1121cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcca180|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5134cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcta93V.1181cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag210||||||||||||||||||||||||||||||V.5194cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag223Score＝2334bits(1214)，Expect＝0.0ldentities＝1218/1220(99％)Strand＝Plus/PlusV.1320aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa379||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5283aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa342V.1380gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa439||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5343gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa402V.1440ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac499||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5403ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac462V.1500ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat559||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5463ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat522V.1560tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa619||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5523tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa582V.1620tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg679||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5583tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg642V.1680tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca739||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5643tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca702V.1740atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg799||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5703atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg762V.1800tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca859||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5763tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca822V.1860gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc919||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5823gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc882V.1920ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct979||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5883ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct942V.1980ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1039||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.5943ttactttctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1002V.11040attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1099||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51003attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1062V.11100aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1159||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51063aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1122V.11160tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1219||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51123tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1182V.11220ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1279||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51183ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1242V.11280gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1339||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51243gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1302V.11340agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1399||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51303agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1362V.11400ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1459||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51363ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1422V.11460gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1519||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51423gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcggtgagcaatgctttaaactgga1482V.11520gagaattcagttttattcag1539||||||||||||||||||||V.51483gagaattcagttttattcag1502Score＝1375bits(715)，Expect＝0.0ldentities＝741/749(98％)，Gaps＝2/749(0％)Strand＝Plus/PlusV.11687gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt1746||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51502gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt1561V.11747gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt1806||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51562gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt1621V.11807gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg1866||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51622gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg1681V.11867tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc1926||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51682tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc1741V.11927tgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc1986|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51742tg-ctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc1800V.11987ttgactacttccctacttccactgctttt-cctgcatttaagccattgtaaatctgggtg2045|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51801ttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtg1860V.12046tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt2105||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51861tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt1920V.12106aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata2165||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51921aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata1980V.12166atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2225||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.51981atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2040V.12226cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2285||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.52041cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2100V.12286gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2345||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.52101gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2160V.12346tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaa2405|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.52161tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttac2220V.12406tgatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2434||||||||||||||||||||||||V.52221caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa2249注意在V.5的192和1510位有SNP，在1742-1743位有缺失，在1830位插入了单个碱基表LIV(d).98P4B6v.5(SEQIDNO172)所编码的蛋白的肽序列MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTFWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQIFCSFADTQTELELEFVFLLTLLL419表LV(d).98P4B6v.1(SEQIDNO173)和98P4B6v.5(SEQIDNO174)的氨基酸序列比对Score＝788bits(2036)，Expect＝0.0ldentities＝394/395(99％)，Positives＝394/395(99％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.51MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.561RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.5121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.5181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTFWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.5241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYV.5301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQ395ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQV.5361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQ395注意在211位的SNP导致单个氨基酸差异表LII(e).转录变体98P4B6v.6(SEQIDNO175)的核苷酸序列cccacgcgtccgcggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaa60gctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctc120cctccttccttctcccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctgg180agtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccgccagtcggagagctaagggcaagtcct240gaggttgggcccaggagaaagaaggcaaggagacattgtcccaggatattcttggtgatc300ttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagccctaagagccttagtg360aaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaaggaaggtcactgtaggtg420tgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgacttattagatgcggctatc480atgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaattttttcctcatgtggtag540atgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatatttgttgctatacaca600gagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgggtaaaatcctgattg660atgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaatgctgaatatttggctt720cattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtctcagcttgggcacttc780agttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagcaacaatattcaagcgc840gacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattcccattgacttgggatcct900tatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactctttactctctggagagggc960cagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttattcctttgtcagagatg1020tgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaattcctatagagattg1080tgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccctagtataccttgcaggtc1140ttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtataggagatttccaccttggt1200tggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagttttttcttcgctatgg1260tccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagagagatatttgtttctca1320acatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttggaatgaggaagaagttt1380ggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggcttactttccctcctgg1440cagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactggagagaattcagttttattc1500agtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatggat1560ggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttcttg1620ctcttgttttgccctcaattgtaattctgggtaagattattttattccttccatgtataa1680gccgaaagctaaaacgaattaaaaaaggctgggaaaagagccaatttctggaagaaggta1740ttggaggaacaattcctcatgtctccccggagagggtcacagtaatgtgatgataaatgg1800tgttcacagctgccatataaagttctactcatgccattatttttatgacttctacgttca1860gttacaagtatgctgtcaaattatcgtgggttgaaacttgttaaatgagatttcaactga1920cttagtgatagagttttcttcaagttaattttcacaaatgtcatgtttgccaatatgaat1980ttttctagtcaacatattattgtaatttaggtatgttttgttttgttttgcacaactgta2040accctgttgttactttatatttcataatcagacaaaaatacttacagttaataatataga2100tataatgttaaaaacaatttgcaaaccagcagaattttaagcttttaaaataattcaatg2160gatatacatttttttctgaagattaagattttaattattcaacttaaaaagtagaaatgc2220attattatacatttttttaagaaaggacacgttatgttagcatctaggtaaggctgcatg2280atagcattcctatatttctctcataaaataggatttgaaggatgaaattaattgtatgaa2340gcaatgtgattatatgaagagacacaaattaaaaagacaaattaaacctgaaattatatt2400taaaatatatttgagacatgaaatacatactgataatacatacctcatgaaagattttat2460tctttattgtgttacagagcagtttcattttcatattaatatactgatcaggaagaggat2520tcagtaacatttggcttccaaaactgctatctctaatacggtaccaatcctaggaactgt2580atactagttcctacttagaacaaaagtatcaagtttgcacacaagtaatctgccagctga2640cctttgtcgcaccttaaccagtcaccacttgctatggtataggattatactgatgttctt2700tgagggattctgatgtgctaggcatggttctaagtactttacttgtattatcccatttaa2760tacttagaacaaccccgtgagataagtagttattatcctcattttacacatgagggaccg2820aaggatagaaaagttatttttcaaaggtcttgcagttaataaatggcagagtgagcattc2880aagtccaggtagtcatattccagaggccacggttttaaccactaggctctagagctcccg2940ccgcgcccctatgcattatgttcacaatgccaatctagatgcttcctcttttgtataaag3000tcactgacattctttagagtgggttgggtgcatccaaaaatgtataaaaatattattata3060ataaacttattactgcttgtagggtaattcacagttacttaccctattcttgcttggaac3120atgagcctggagacccatggcagtccatatgcctccctatgcagtgaagggccctagcag3180tgttaacaaattgctgagatcccacggagtctttcaaaaatctctgtagagttagtcttc3240tccttttctcttcctgagaagttctcctgcctgcataaccattcattagggagtacttta3300caagcatgaaggatattagggtaagtggctaattataaatctactctagagacatataat3360catacagattattcataaaatttttcagtgctgtccttccacatttaattgcattttgct3420caaactgtagaatgccctacattccccccaccccaatttgctatttccttattaaaatag3480aaaattataggcaagatacaattatatgcgttcctcttcctgaaattataacatttctaa3540acttacccacgtagggactactgaatccaactgccaacaataaaaagacttttatttagt3600agaggctacctttccccccagtgactctttttctacaactgccttgtcagtttggtaatt3660cacttatgattttctaatgttctcttggtgaattttattatcttggaccctctttttttt3720tttttttaaagacagagtcttgctctgtcaccca3754表LIII(e).98P4B6v.1(SEQIDNO176)和98P4B6v.6(SEQIDNO177)的核苷酸序列比对Score＝404bits(210)，Expect＝e-109ldentities＝210/210(100％)Strand＝Plus/PlusV.11ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac60||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.614ggacgcgtgggcggacgcgtgggttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcac73V.161gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct120||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.674gcagcccctagcggcgcgtcgctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttct133V.1121cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcca180||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6134cccctggctgttcgcgatccagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgcca193V.1181cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag210||||||||||||||||||||||||||||||V.6194cggcagccaccctgcaaccgccagtcggag223Score＝2630bits(1368)，Expect＝0.0ldentities＝1368/1368(100％)Strand＝Plus/PlusV.1320aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa379||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6283aggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaa342V.1380gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa439||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6343gccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaa402V.1440ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac499||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6403ggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgac462V.1500ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat559||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6463ttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaat522V.1560tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa619||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6523tttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataa582V.1620tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg679||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6583tatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttg642V.1680tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca739||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6643tgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatcca702V.1740atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg799||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6703atgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttg762V.1800tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca859||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6763tctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgca822V.1860gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc919||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6823gcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattc882V.1920ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct979||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6883ccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactct942V.1980ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1039||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.6943ttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttt1002V.11040attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1099||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61003attcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttaca1062V.11100aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1159||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61063aaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccc1122V.11160tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1219||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61123tagtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtata1182V.11220ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1279||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61183ggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaa1242V.11280gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1339||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61243gttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcag1302V.11340agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1399||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61303agagatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactctt1362V.11400ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1459||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61363ggaatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttg1422V.11460gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1519||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61423gcttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactgga1482V.11520gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1579||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61483gagaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttcc1542V.11580atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1639||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61543atgttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacac1602V.11640caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctgg1687||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.61603caccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctgg1650表LIV(e).98P4B6v.6(SEQIDNO178)所编码的肽序列MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILGKIILFLPCISRKLKRIKKGWEKSQFLEEGIGGTIP480HVSPERVTVM490表LV(e).98P4B6v.1(SEQIDNO179)和98P4B6v.6(SEQIDNO180)的氨基酸序列比对Score＝888bits(2294)，Expect＝0.0ldentities＝444/444(100％)，Positives＝444/444(100％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.61MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.661RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.6121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.6181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.6241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYV.6301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEV.6361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420V.1421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVIL444EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILV.6421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVIL444表LII(f).转录变体98P4B6v.7(SEQIDNO181)的核苷酸序列ggagaaaatttacagaaacccagagccaaaggtgctctcaggggatcccctgaaacattc60aaagccattgcggccccagaagcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccg120cggcagccaccctgcaaccgccagtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtg180ggcccttggggagtcggcgccgctcccggggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtg240gagggcgcggggggcgcggaggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaa300tcaatctctatgatgggaagccctaagagccttagtgaaacttttttacctaatggcata360aatggtatcaaagatgcaaggaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgcc420aaatccttgaccattcgacttattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaat480cctaagtttgcttctgaattttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgct540ctcacaaaaacaaatataatatttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgg600gacctgagacatctgcttgtgggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggata660aaccagtacccagaatccaatgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgatt720gtcaaaggatttaatgttgtctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagc780cggcaggtttatatatgcagcaacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcc840cgccagttgaatttcattcccattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaa900aatttacccctacgactctttactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttg960gccacattttttttcctttattcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaac1020caacagagtgacttttacaaaattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagtt1080gccattactttgctctccctagtatacctcgcaggtcttctggcagctgcttatcaactt1140tattacggcaccaagtataggagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtaga1200aaacagcttggattactaagttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgc1260ttaccgatgagaaggtcagagagatatttgtttctcaacatggcttatcagcagtctaca1320cttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatggatggaaacga1380gcttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttcttgctcttgtt1440ttgccctcaattgtaattctggatctgtctgtggaggttctggcttccccagctgctgcc1500tggaaatgcttaggtgctaatatcctgagaggaggattgtcagagatagtactccccata1560gagtggcagcaggacaggaagatccccccactctccaccccgccgccaccggccatgtgg1620acagaggaagccggggcgaccgccgaggcccaggaatccggcatcaggaacaagtctagc1680agttccagtcaaatcccggtggttggggtggtgacggaggacgatgaggcgcaggattcc1740attgatcccccagagagccctgatcgtgccttaaaagccgcgaattcctggaggaaccct1800gtcctgcctcacactaatggtgtggggccactgtgggaattcctgttgaggcttctcaaa1860tctcaggctgcgtcaggaaccctgtctcttgcgttcacatcctggagccttggagagttc1920cttgggagtgggacatggatgaagctggaaaccataattctcagcaaactaacacaggaa1980cagaaatccaaacactgcatgttctcactgataagtgggagttgaacaatgagaacacat2040ggacacagggaggggaacgtcacacaccagggcctgtcgggggtgggaggcctagcaatt2100cattagaattacctgtgaagcttttaaaatgtaaggtttggatggaatgctcagacccta2160ccttagacccaattaagcccacagctttgagg2192表LIII(f).98P4B6v.1(SEQIDNO182)和98P4B6v.7(SEQIDNO183)的氨基酸序列比对Score＝2350bits(1222)，Expect＝0.0ldentities＝1230/1234(99％)Strand＝Plus/PlusV.1141agcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccg200||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.781agcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccgcggcagccaccctgcaaccg140V.1201ccagtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtgggcccttggggagtcggcgc260||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7141ccagtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtgggcccttggggagtcggcgc200V.1261cgctcccgaggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtggagggcgcggggggcgcgga320|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7201cgctcccggggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtggagggcgcggggggcgcgga260V.1321ggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaag380||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7261ggatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaag320V.1381ccctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaag440|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7321ccctaagagccttagtgaaacttttttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaag380V.1441gaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgact500||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7381gaaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgact440V.1501tattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaatt560||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7441tattagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaatt500V.1561ttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataat620||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7501ttttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataat560V.1621atttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgt680||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7561atttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgt620V.1681gggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaa740||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7621gggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaa680V.1741tgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgt800||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7681tgctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgt740V.1801ctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcag860||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7741ctcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcag800V.1861caacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattcc920||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7801caacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattcc860V.1921cattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactctt980||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7861cattgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactctt920V.1981tactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttta1040||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7921tactctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttccttta980V.11041ttcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaa1100||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.7981ttcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaa1040V.11101aattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccct1160||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71041aattcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccct1100V.11161agtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtatag1220|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71101agtatacctcgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtatag1160V.11221gagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaag1280||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71161gagatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaag1220V.11281ttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcaga1340||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71221ttttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcaga1280V.11341gagatatttgtttctcaacatggcttatcagcag1374||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71281gagatatttgtttctcaacatggcttatcagcag1314Score＝298bits(155)，Expect＝2e-77ldentiies＝155/155(100％)Strand＝Plus/PlusV.11537cagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatgga1596||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71312cagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatgttttaatttatgga1371V.11597tggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttctt1656||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71372tggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccaccaaactttgttctt1431V.11657gctcttgttttgccctcaattgtaattctggatct1691|||||||||||||||||||||||||||||||||||V.71432gctcttgttttgccctcaattgtaattctggatct1466表LIV(f).98P4B6v.7(SEQIDNO184)所编码的肽序列MESISMMGSPKSLSETFLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQSTLGYVALLISTFHVLIYGW360KRAFEEEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLSVEVLASPAAAWKCLGANILRGGLSEIVL420PIEWQQDRKIPPLSTPPPPAMWTEEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQ480DSIDPPESPDRALKAANSWRNPVLPHTNGVGPLWEFLLRLLKSQAASGTLSLAFTSWSLG540EFLGSGTWMKLETIILSKLTQEQKSKHCMFSLISGS576表LV(f).98P4B6v.1(SEQIDNO185)和98P4B6v.7(SEQIDNO186)的氨基酸序列比对Score＝753bits(1944)，Expect＝0.0ldentities＝390/446(87％)，Positives＝390/446(87％)，Gaps＝55/446(12％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.71MESISMMGSPKSLSETFLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.761RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.7121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.7181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.7241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQV.7301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQ--------------------340V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420STLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEV.7341-----------------------------------STLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE365V.1421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDL446EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDLV.7366EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILDL391表LII(g).转录变体98P4B6v.8(SEQIDNO187)的核苷酸序列gccccctccgagctccccgactcctccccgcgctccacggctcttcccgactccagtcag60cgttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcg120ctgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttctcccctggctgttcgcgatcca180gcttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccgc240cagtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtgggcccttggggagtcggcgcc300gctcccgaggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtggagggcgcggggggcgcggag360gatattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagc420cctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaagg480aaggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgactt540attagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaattt600tttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataata660tttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtg720ggtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaat780gctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtc840tcagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagc900aacaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattccc960attgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactcttt1020actctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttat1080tcctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaa1140attcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctcccta1200gtataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtatagg1260agatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagt1320tttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagag1380agatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttgg1440aatgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggc1500ttactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactggaga1560gaattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccat1620gttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacacca1680ccaaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctgggtaagattatttta1740ttccttccatgtataagccgaaagctaaaacgaattaaaaaaggctgggaaaagagccaa1800tttctggaagaaggtatgggaggaacaattcctcatgtctccccggagagggtcacagta1860atgtgatgacaaatggtgttcacagctgccatataaagttctactcatgccattattttt1920atgacttctacgttcagttacaagtatgctgtcaaattatcgtgggttgaaacttgttaa1980atgagatttcaactgacttagtgatagagttttcttcaagttaattttcacaaatgtcat2040gtttgccaatatgaatttttctagtcaacatattattgtaatttaggtatgttttgtttt2100gttttgcacaactgtaaccctgttgttactttatatttcataatcaggcaaaaatactta2160cagttaataatatagatataatgttaaaaacaatttgcaaaccagcagaattttaagctt2220ttaaaataattcaatggatatacatttttttctgaagattaagattttaattattcaact2280taaaaagtagaaatgcattattatacatttttttaagaaaggacacgttatgttagcatc2340taggtaaggctgcatgatagcattcctatatttctctcataaaataggatttgaaggatg2400aaattaattgtatgaagcaatgtgattatatgaagagacacaaattaaaaagacaaatta2460aacctgaaattatatttaaaatatatttgagacatgaaatacatactgataatacatacc2520tcatgaaagattttattctttattgtgttacagagcagtttcattttcatattaatatac2580tgatcaggaagaggattcagtaacatttggcttccaaaactgctatctctaatacggtac2640caatcctaggaactgtatactagttcctacttagaacaaaagtatcaagtttgcacacaa2700gtaatctgccagctgacctttgtcgcaccttaaccagtcaccacttgctatggtatagga2760ttatactgatgttctttgagggattctgatgtgctaggcatggttctaagtactttactt2820gtattatcccatttaatacttagaacaaccccgtgagataagtagttattatcctcattt2880tacacatgagggaccgaaggatagaaaagttatttttcaaaggtcttgcagttaataaat2940ggcagagtgagcattcaagtccaggtagtcatattccagaggccacggttttaaccacta3000ggctctagagctcccgccgcgcccctatgcattatgttcacaatgccaatctagatgctt3060cctcttttgtataaagtcactgacattctttagagtgggttgggtgcatccaaaaatgta3120taaaaatattattataataaacttattactgcttgtagggtaattcacagttacttaccc3180tattcttgcttggaacatgagcctggagacccatggcagtccatatgcctccctatgcag3240tgaagggccctagcagtgttaacaaattgctgagatcccacggagtctttcaaaaatctc3300tgtagagttagtcttctccttttctcttcctgagaagttctcctgcctgcataaccattc3360attagggagtactttacaagcatgaaggatattagggtaagtggctaattataaatctac3420tctagagacatataatcatacagattattcataaaatttttcagtgctgtccttccacat3480ttaattgcattttgctcaaactgtagaatgccctacattccccccaccccaatttgctat3540ttccttattaaaatagaaaattataggcaagatacaattatatgcgttcctcttcctgaa3600attataacatttctaaacttacccacgtaggtactactgaatccaactgccaacaataaa3660aagacttttatttagtagaggctacctttcccaccagtgactctttttctacaactgcct3720tgtcagtttggtaattcacttatgattttctaatgttctcttggtgaattttattatctt3780gtaccctctttttttttttttttttttttaaagacagagtcttgctctgtcacccaggct3840ggagtgcagtggcacgatctcggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacgccattc3900tcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggtgcccgccaccatgcccggctgat3960ttctttttgtatttttagtagagacggagtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatc4020tcctgacctcgtgatccgcccgccttggcctccaaagtgctgggattacaggtgtgagct4080accgcgcccggcctattatcttgtactttctaactgagccctctattttctttattttaa4140taatatttctccccacttgagaatcacttgttagttcttggtaggaattcagttgggcaa4200tgataacttttatgggcaaaaacattctattatagtgaactaatgaaaataacagcgtat4260tttcaatattttcttattccttaaattccactcttttaacactatgcttaaccacttaat4320gtgatgaaatattcctaaaagttaaatgactattaaagcatatattgttgcatgtatata4380ttaagtagccgatactctaaataaaaataccactgttacagataaatggggcctttaaaa4440atatgaaaaacaaacttgtgaaaatgtataaaagatgcatctgttgtttcaaatggcact4500atcttcttttcagtactacaaaaacagaataattttgaagttttagaataaatgtaatat4560atttactataattctaaatgtttaaatgcttttctaaaaatgcaaaactatgatgtttag4620ttgctttattttacctctatgtgattatttttcttaattgttattttttataatcattat4680ttttctgaaccattcttctggcctcagaagtaggactgaattctactattgctaggtgtg4740agaaagtggtggtgagaaccttagagcagtggagatttgctacctggtctgtgttttgag4800aagtgccccttagaaagttaaaagaatgtagaaaagatactcagtcttaatcctatgcaa4860aaaaaaaaatcaagtaattgttttcctatgaggaaaataaccatgagctgtatcatgcta4920cttagcttttatgtaaatatttcttatgtctcctctattaagagtatttaaaatcatatt4980taaatatgaatctattcatgctaacattatttttcaaaacatacatggaaatttagccca5040gattgtctacatataaggtttttatttgaattgtaaaatatttaaaagtatgaataaaat5100atatttataggtatttatcagagatgattattttgtgctacatacaggttggctaatgag5160ctctagtgttaaactacctgattaatttcttataaagcagcataaccttggcttgattaa5220ggaattctactttcaaaaattaatctgataatagtaacaaggtatattatactttcatta5280caatcaaattatagaaattacttgtgtaaaagggcttcaagaatatatccaatttttaaa5340tattttaatatatctcctatctgataacttaattcttctaaattaccacttgccattaag5400ctatttcataataaattctgtacagtttccccccaaaaaagagatttatttatgaaatat5460ttaaagtttctaatgtggtattttaaataaagtatcataaatgtaataagtaaatattta5520tttaggaatactgtgaacactgaactaattattcctgtgtcagtctatgaaatccctgtt5580ttgaaatacgtaaacagcctaaaatgtgttgaaattattttgtaaatccatgacttaaaa5640caagatacatacatagtataacacacctcacagtgttaagatttatattgtgaaatgaga5700caccctaccttcaattgttcatcagtgggtaaaacaaattctgatgtacattcaggacaa5760atgattagccctaaatgaaactgtaataatttcagtggaaactcaatctgtttttacctt5820taaacagtgaattttacatgaatgaatgggttcttcactttttttttagtatgagaaaat5880tatacagtgcttaattttcagagattctttccatatgttactaaaaaatgttttgttcag5940cctaacatactgagttttttttaactttctaaattattgaatttccatcatgcattcatc6000caaaattaaggcagactgtttggattcttccagtggccagatgagctaaattaaatcaca6060aaagcagatgcttttgtatgatctccaaattgccaactttaaggaaatattctcttgaaa6120ttgtctttaaagatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaattt6180gtcttcctattgactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtcct6240tgcagttaggtgtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaa6300ggcagcatgtgtcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacagga6360gccctggcagctgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagaga6420ccagaaagaccttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgt6480aaatctgggtgtgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcc6540tgataccatttaacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagct6600tttaaaggataatgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatact6660cattttcctgccttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttc6720tttttaactgtgtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaa6780attacacaccatgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaa6840gtactatttaatgattt6857表LIII(g).98P4B6v.1(SEQIDNO188)和98P4B6v.8(SEQIDNO189)的核苷酸序列比对Score＝3201bits(1665)，Expect＝0.0ldentities＝1665/1665(100％)Strand＝Plus/PlusV.123gttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcgc82||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.862gttcctcgggccctcggcgccacaagctgtccgggcacgcagcccctagcggcgcgtcgc121V.183tgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttctcccctggctgttcgcgatccag142||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8122tgccaagccggcctccgcgcgcctccctccttccttctcccctggctgttcgcgatccag181V.1143cttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccgcc202||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8182cttgggtaggcggggaagcagctggagtgcgaccgccacggcagccaccctgcaaccgcc241V.1203agtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtgggcccttggggagtcggcgccg262||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8242agtcggaggtgcagtccgtaggccctggcccccgggtgggcccttggggagtcggcgccg301V.1263ctcccgaggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtggagggcgcggggggcgcggagg322||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8302ctcccgaggagctgcaaggctcgcccctgcccggcgtggagggcgcggggggcgcggagg361V.1323atattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagcc382||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8362atattcttggtgatcttggaagtgtccgtatcatggaatcaatctctatgatgggaagcc421V.1383ctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaagga442||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8422ctaagagccttagtgaaacttgtttacctaatggcataaatggtatcaaagatgcaagga481V.1443aggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgactta502||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8482aggtcactgtaggtgtgattggaagtggagattttgccaaatccttgaccattcgactta541V.1503ttagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaatttt562||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8542ttagatgcggctatcatgtggtcataggaagtagaaatcctaagtttgcttctgaatttt601V.1563ttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatat622||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8602ttcctcatgtggtagatgtcactcatcatgaagatgctctcacaaaaacaaatataatat661V.1623ttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgg682||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8662ttgttgctatacacagagaacattatacctccctgtgggacctgagacatctgcttgtgg721V.1683gtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaatg742||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8722gtaaaatcctgattgatgtgagcaataacatgaggataaaccagtacccagaatccaatg781V.1743ctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtct802||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8782ctgaatatttggcttcattattcccagattctttgattgtcaaaggatttaatgttgtct841V.1803cagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagca862||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8842cagcttgggcacttcagttaggacctaaggatgccagccggcaggtttatatatgcagca901V.1863acaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattccca922||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8902acaatattcaagcgcgacaacaggttattgaacttgcccgccagttgaatttcattccca961V.1923ttgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactcttta982||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.8962ttgacttgggatccttatcatcagccagagagattgaaaatttacccctacgactcttta1021V.1983ctctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttatt1042||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81022ctctctggagagggccagtggtggtagctataagcttggccacattttttttcctttatt1081V.11043cctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaa1102||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81082cctttgtcagagatgtgattcatccatatgctagaaaccaacagagtgacttttacaaaa1141V.11103ttcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccctag1162||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81142ttcctatagagattgtgaataaaaccttacctatagttgccattactttgctctccctag1201V.11163tataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtatagga1222||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81202tataccttgcaggtcttctggcagctgcttatcaactttattacggcaccaagtatagga1261V.11223gatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagtt1282||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81262gatttccaccttggttggaaacctggttacagtgtagaaaacagcttggattactaagtt1321V.11283ttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagaga1342||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81322ttttcttcgctatggtccatgttgcctacagcctctgcttaccgatgagaaggtcagaga1381V.11343gatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttgga1402||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81382gatatttgtttctcaacatggcttatcagcaggttcatgcaaatattgaaaactcttgga1441V.11403atgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggct1462||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81442atgaggaagaagtttggagaattgaaatgtatatctcctttggcataatgagccttggct1501V.11463tactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactggagag1522||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81502tactttccctcctggcagtcacttctatcccttcagtgagcaatgctttaaactggagag1561V.11523aattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatg1582||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81562aattcagttttattcagtctacacttggatatgtcgctctgctcataagtactttccatg1621V.11583ttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccac1642||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81622ttttaatttatggatggaaacgagcttttgaggaagagtactacagattttatacaccac1681V.11643caaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctgg1687|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.81682caaactttgttcttgctcttgttttgccctcaattgtaattctgg1726Score＝1381bits(718)，Expect＝0.0ldentities＝725/726(99％)，Gaps＝1/726(0％)Strand＝Plus/PlusV.11687gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt1746||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86132gatcttttgcagctttgcagatacccagactgagctggaactggaatttgtcttcctatt6191V.11747gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt1806||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86192gactctacttctttaaaagcggctgcccattacattcctcagctgtccttgcagttaggt6251V.11807gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg1866||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86252gtacatgtgactgagtgttggccagtgagatgaagtctcctcaaaggaaggcagcatgtg6311V.11867tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc1926||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86312tcctttttcatcccttcatcttgctgctgggattgtggatataacaggagccctggcagc6371V.11927tgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc1986||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86372tgtctccagaggatcaaagccacacccaaagagtaaggcagattagagaccagaaagacc6431V.11987ttgactacttccctacttccactgctttt-cctgcatttaagccattgtaaatctgggtg2045|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86432ttgactacttccctacttccactgctttttcctgcatttaagccattgtaaatctgggtg6491V.12046tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt2105||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86492tgttacatgaagtgaaaattaattctttctgcccttcagttctttatcctgataccattt6551V.12106aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata2165||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86552aacactgtctgaattaactagactgcaataattctttcttttgaaagcttttaaaggata6611V.12166atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc2225||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86612atgtgcaattcacattaaaattgattttccattgtcaattagttatactcattttcctgc6671V.12226cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt2285||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86672cttgatctttcattagatattttgtatctgcttggaatatattatcttctttttaactgt6731V.12286gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca2345||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86732gtaattggtaattactaaaactctgtaatctccaaaatattgctatcaaattacacacca6791V.12346tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaa2405||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||V.86792tgttttctatcattctcatagatctgccttataaacatttaaataaaaagtactatttaa6851V.12406tgattt2411||||||V.86852tgattt6857表LIV(g).98P4B6v.8(SEQIDNO190)所编码的肽序列MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILGKIILFLPCISRKLKRIKKGWEKSQFLEEGMGGTIP480HVSPERVTVM490表LV(g).98P4B6v.1(SEQIDNO191)和98P4B6v.8(SEQIDNO192)的氨基酸序列比对Score＝888bits(2294)，Expect＝0.0ldentities＝444/444(100％)，Positives＝444/444(100％)V.11MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGSV.81MESISMMGSPKSLSETCLPNGINGIKDARKVTVGVIGSGDFAKSLTIRLIRCGYHVVIGS60V.161RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNMV.861RNPKFASEFFPHVVDVTHHEDALTKTNIIFVAIHREHYTSLWDLRHLLVGKILIDVSNNM120V.1121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIEV.8121RINQYPESNAEYLASLFPDSLIVKGFNVVSAWALQLGPKDASRQVYICSNNIQARQQVIE180V.1181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYAV.8181LARQLNFIPIDLGSLSSAREIENLPLRLFTLWRGPVVVAISLATFFFLYSFVRDVIHPYA240V.1241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQV.8241RNQQSDFYKIPIEIVNKTLPIVAITLLSLVYLAGLLAAAYQLYYGTKYRRFPPWLETWLQ300V.1301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMYV.8301CRKQLGLLSFFFAMVHVAYSLCLPMRRSERYLFLNMAYQQVHANIENSWNEEEVWRIEMY360V.1361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFEV.8361ISFGIMSLGLLSLLAVTSIPSVSNALNWREFSFIQSTLGYVALLISTFHVLIYGWKRAFE420V.1421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVIL444EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVILV.8421EEYYRFYTPPNFVLALVLPSIVIL44权利要求1.组合物，其含有下述肽，或实质上由下述肽组成，或由下述肽组成a)具有图2蛋白质的8、9、10或11个邻接氨基酸的肽；b)表VIII-XXI所示的一种肽；c)表XXII至XLV所示的一种肽；或d)表XLVI至XLIX所示的一种肽。2.权利要求1的组合物，其含有与图2的蛋白质相关的蛋白质。3.权利要求2的蛋白质，所述蛋白质与图2所示的一种完整氨基酸序列至少90、91、92、93、94、95、96、97、98或99％同源。4.权利要求1的组合物，其中该物质含有得自图2蛋白质的氨基酸序列的CTL多肽或其类似物。5.权利要求4的组合物，其进一步的限制条件是表位不是图2的完整氨基酸序列。6.权利要求1的组合物，其进一步的限制条件是多肽不是图2蛋白质的完整氨基酸序列。7.权利要求1的组合物，其含有得自图2氨基酸序列的抗体多肽表位。8.权利要求7的组合物，其进一步的限制条件是表位不是图2的完整氨基酸序列。9.权利要求7的组合物，其中抗体表位含有肽区域，所述肽区域是图2的至少5个氨基酸，其长度以任何整数增长直至达到所述肽的末端，其中表位含有选自下述的氨基酸位置a)在图5的亲水性分布图中，数值大于0.5的氨基酸位置；b)在图6的亲/疏水性分布图中，数值小于0.5的氨基酸位置；c)在图7的可及残基百分比分布图中，数值大于0.5的氨基酸位置；d)在图8的平均柔性分布图中，数值大于0.5的氨基酸位置；e)在图9的β-转角分布图中，数值大于0.5的氨基酸位置；f)a)至e)中至少2个的组合；g)a)至e)中至少3个的组合；h)a)至e)中至少4个的组合；i)a)至e)中5个的组合。10.编码权利要求1的蛋白质的多核苷酸。11.权利要求10的多核苷酸，其含有图2所示的核酸分子。12.权利要求10的多核苷酸，其进一步的限制条件是编码的蛋白质不是图2的完整氨基酸序列。13.权利要求11的组合物，其中所述物质含有多核苷酸，所述多核苷酸含有图2核酸序列的编码序列。14.权利要求22的多核苷酸，其进一步含有编码权利要求1所述另一种肽的另一核苷酸序列。15.组合物，其含有与权利要求10的多核苷酸完全互补的多核苷酸。16.产生针对图2蛋白质的哺乳动物免疫应答的方法，所述方法包括使哺乳动物免疫系统的细胞暴露于a)98P4B6-相关蛋白质和/或b)编码所述蛋白质的核苷酸序列的一部分，从而产生针对所述蛋白质的免疫应答。17.权利要求16的产生免疫应答的方法，所述方法包括提供含有至少一种T细胞或至少一种B细胞表位的98P4B6-相关蛋白质；和使表位分别与哺乳动物免疫系统T细胞或B细胞接触，从而激活T细胞或B细胞。18.权利要求17的方法，其中免疫系统细胞是B细胞，籍此，经诱导的B细胞产生特异性结合98P4B6-相关蛋白质的抗体。19.权利要求17的方法，其中免疫系统细胞是T细胞，所述T细胞是细胞毒T细胞(CTL)，籍此，激活的CTL杀死表达98P4B6-相关蛋白质的自身细胞。20.权利要求17的方法，其中免疫系统细胞是T细胞，所述T细胞是辅助T细胞(HTL)，籍此，激活的HTL分泌有利于细胞毒T细胞(CTL)的细胞毒活性或B细胞产生抗体的活性的细胞因子。21.检测样品中98P4B6-相关蛋白质或98P4B6-相关多核苷酸的存在的方法，所述方法包括下述步骤使样品分别与特异性结合98P4B6-相关蛋白质或98P4B6-相关多核苷酸的物质接触；和分别测定是否存在所述物质与98P4B6-相关蛋白质的复合物或所述物质与98P4B6-相关多核苷酸的复合物。22.权利要求21的检测样品中98P4B6-相关蛋白质的存在的方法，所述方法包括下述步骤使样品与特异性结合98P4B6-相关蛋白质的抗体或其片段接触；和测定是否存在抗体或其片段与98P4B6-相关蛋白质的复合物。23.权利要求21的方法，进一步包括从患有或怀疑患有癌症的患者中取样。24.权利要求21的检测样品中图2mRNA的蛋白质的存在的方法，其包括使用至少一种引物，通过逆转录由样品产生cDNA；使用98P4B6多核苷酸作为有义和反义引物扩增所产生的cDNA，其中使用用作有义和反义引物的98P4B6多核苷酸扩增98P4B6cDNA；和检测扩增的98P4B6cDNA的存在。25.权利要求21的监测得自患有或怀疑患有癌症的患者的生物样品中的一种或多种98P4B6基因产物的方法，所述方法包括测定个体组织样品中由细胞表达的一种或多种98P4B6基因产物的状态；将所测定的状态与相应正常样品中的一种或多种98P4B6基因产物的状态相比较；和鉴定样品中相对于正常样品而言的一种或多种异常98P4B6基因产物的存在。26.权利要求25的方法，还包括测定是否有一种或多种98P4B6mRNA或98P4B6蛋白质的基因产物有所增加，相对于正常组织样品而言，受试样品中一种或多种基因产物的增加表示癌症的存在或状态。27.权利要求26的方法，其中癌症出现在表I所示的组织中。28.组合物，其含有a)调制图2蛋白质的状态的物质，或b)受图2蛋白质调制的分子，从而使表达图2蛋白质的细胞的状态受到调制。29.权利要求28的组合物，其进一步含有生理可接受的载体。30.药物组合物，其含有人单位剂量形式的权利要求28的组合物。31.权利要求28的组合物，其中所述物质含有特异性结合图2蛋白质的抗体或其片段。32.权利要求31的抗体或其片段，其是单克隆的。33.权利要求31的抗体，其为人抗体、人源化抗体或嵌合抗体。34.产生权利要求31的抗体的非人转基因动物。35.产生权利要求32的抗体的杂交瘤。36.将细胞毒性剂或诊断剂传递至表达图2蛋白质的细胞的方法，所述方法包括提供与权利要求4的抗体或其片段偶联的细胞毒性剂或诊断剂；和将细胞暴露于抗体-试剂或片段-试剂偶联物。37.权利要求28的组合物，其中所述物质含有编码抗体或其片段的多核苷酸，所述抗体或其片段免疫特异性地结合图2蛋白质。38.权利要求28的组合物，其中所述物质含有a)能裂解具有98P4B6编码序列的多核苷酸的核酶，或b)编码核酶的核酸分子；和生理可接受的载体。39.权利要求28的组合物，其中所述物质含有人T细胞，其中所述T细胞特异性识别具体HLA分子环境中的98P4B6肽亚序列。40.抑制表达图2蛋白质的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给细胞施用权利要求28的组合物。41.权利要求40的抑制表达图2蛋白质的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给所述细胞施用抗体或其片段的步骤，所述抗体或其片段特异性地结合98P4B6-相关蛋白质。42.权利要求40的抑制表达图2蛋白质的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给所述细胞施用98P4B6-相关蛋白质的步骤。43.权利要求40的抑制表达图2蛋白质的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给所述细胞施用多核苷酸的步骤，所述多核苷酸含有98P4B6-相关蛋白质的编码序列或含有与98P4B6-相关蛋白质的编码序列互补的多核苷酸。44.权利要求40的抑制表达图2蛋白质的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给所述细胞施用能裂解编码图2蛋白质的多核苷酸的核酶的步骤。45.权利要求40的抑制表达图2蛋白质和特定HLA分子的癌症细胞生长的方法，所述方法包括给所述癌症细胞施用人T细胞的步骤，其中所述T细胞特异性识别具体HLA分子环境中的图2蛋白质的肽亚序列。46.权利要求40的方法，所述方法包括下述步骤施用能传递核苷酸的载体，所述核苷酸编码单链单克隆抗体，籍此在表达图2蛋白质的癌症细胞中胞内表达所编码的单链抗体。全文摘要本文描述了新的基因098P4B6(也称为STEAP－2)及其编码的蛋白质及其变体，其中98P4B6在正常成年组织中表现出组织特异性表达，并且在表I所列的癌症中异常表达。因此，98P4B6提供了癌症的诊断、预测、预防和/或治疗靶。可以使用98P4B6基因或其片段或其编码的蛋白质或其变体或其片段来引发体液或细胞免疫应答；与98P4B6反应的抗体或T细胞可用于主动或被动免疫。文档编号C07H21/02GK1893958SQ0382488公开日2007年1月10日申请日期2003年6月11日优先权日2002年9月6日发明者皮亚·M·查利塔-艾德,阿瑟·B·雷塔诺,玛丽·法里斯,葛旺茂,阿亚·贾科博维茨申请人:阿根西斯公司