浸润性和预后的乳腺癌生物标志物标签的制作方法与工艺

文档序号:13108562阅读:来源:国知局
技术特征:
1.一种用于检测受试者的乳腺浸润性导管癌(IDC)的标志物,其包括miR-210基因产物。2.检测权利要求1的miR-210基因产物相较于测试样品的增加的试剂在制备用于检测受试者的乳腺浸润性导管癌的试剂中的用途。3.一种用于检测患有乳腺癌的受试者的从DCIS至IDC的转化的标志物,其包括权利要求1的miR-210基因产物。4.一种用于区分浸润性导管癌(IDC)与原位导管癌(DCIS)的microRNA标签,其包含:i)IDC中的let-7d、miR-181a、miR-210和miR-221的至少一种的上调;和ii)IDC中的miR-10b、miR-126、miR-143、miR-218和miR-335-5p的至少一种的下调。5.一种用于患有乳腺癌的受试者的总体存活预后和转移时间预后的microRNA标签,其包括:miR-210、miR-21、miR-106b*、miR-197和/或let-7i。6.一种用于区分浸润性导管癌(IDC)与原位导管癌(DCIS)的microRNA标签,其包括在原位下调的let-7d、miR-210和miR-221以及在浸润转化中上调的let-7d、miR-210和miR-221的至少一种。7.一种用于乳腺癌的总体存活期和转移时间的microRNA标签,其包括:miR-210、miR-21、miR-106b*、miR-197和let-7i。8.一种浸润转化的标志物,其包括具有与miR-210反相关的特征谱的蛋白质编码基因,其中BRCA1、FANCD、FANCF、PARP1、E-钙粘蛋白、Rb1的一个或多个在原位癌中被激活并且在浸润性癌中被下调。9.一种原位导管癌的标志物,其包括至少一个差异剪接同种型,例如不存在激酶结构域的截短的EGFR,其中这样的标志物仅在原位导管癌中过表达。10.测定miR-210的表达的试剂在制备用于基于miR-210表达的增加将患者鉴定为具有与乳腺浸润性导管癌(IDC)相关的标志物的试剂中的用途,其中所述鉴定包括:a)分析来自怀疑具有IDC的患者的测试样品的miR-210的表达;和,b)将所述患者鉴定为:i)如果检测到来自所述患者的样品相较于非癌性乳腺样品的miR-210表达的增加,则具有与IDC癌相关的标志物或ii)如果未检测到所述增加,则不具与IDC癌相关的标志物。11.权利要求10的用途,其中所述鉴定还包括分析相较于非癌性乳腺样品,测试样品的let-7d、miR-221和miR-181a的一个或多个的增加;和/或miR-10b、miR-126、miR-143、miR-218和miR-335-5p的一个或多个的降低。12.测量至少一种miR-210基因产物的水平的试剂在制备用于诊断受试者是否具有乳腺导管浸润性癌(IDC)的试剂中的用途,其中所述诊断包括:测量来自所述受试者的测试样品的至少一种miR-210基因产物的水平,其中所述测试样品的至少miR-210基因产物的水平相较于对照样品的对应miR基因产物的水平的升高表明所述受试者具有IDC。13.测定至少一种标志物的表达水平的试剂在制备用于测试受试者的乳腺癌的浸润性的试剂中的用途,其中所述测试包括:a)测定来自具有乳腺浸润性导管癌(IDC)的受试者的样品的至少一种标志物的表达水平;所述至少一种标志物包括至少一种miR-210基因产物;b)将步骤(a)中测定的表达水平与来自健康受试者的样品的标志物的对照表达水平相比较;和c)当步骤(b)中比较的结果表明所述测试受试者中至少一种标志物的表达水平高于对照中的所述表达水平时,则判断所述受试者具有IDC的诊断。14.权利要求13的用途,其中所述样品包含乳腺组织。15.权利要求13的用途,其中体外进行所有方法步骤。16.包含miR-210特异性探针寡核苷酸的微阵列在制备用于诊断受试者是否具有乳腺浸润性导管癌(IDC)的试剂中的用途,其中所述诊断包括:a)从获自所述受试者的测试样品逆转录RNA,以提供一组靶寡脱氧核苷酸,其中所述受试者具有乳腺IDC;b)使所述靶寡脱氧核苷酸与包含miR-210特异性探针寡核苷酸的微阵列杂交,以提供所述测试样品的杂交特征谱;和c)将所述测试样品的杂交特征谱与从对照样品产生的杂交特征谱相比较,其中miR-210的信号的增强表明所述受试者具有IDC。17.权利要求16的用途,其中步骤c)包括将所述测试样品的杂交特征谱与与非癌性样品相关的miR水平的数据库、统计资料或表格相比较。18.权利要求16的用途,其中在所述微阵列中包括至少一种另外的miR。19.权利要求16的用途,其中通过检测转录的多核苷酸或其部分的存在来评估miR-210基因产物的表达水平,其中所述转录的多核苷酸包含miR-210基因产物的编码区。20.权利要求16的用途,其中所述样品包含随时间采集的获自所述患者的细胞。21.权利要求16的用途,其中所述至少一种miR-210基因产物包括其分离的变体或生物活性片段。22.测定miR-210表达的试剂在制备用于诊断受试者的乳腺浸润性导管癌(IDC)的试剂中的用途,其中所述诊断包括:a)鉴定相较于对照的相对miR-210表达;和b)i)如果所述受试者相较于对照具有增加的miR-210表达,则受试者被诊断为具有IDC;或,ii)如果所述受试者相较于对照不具有增加的miR-210表达,则所述受试者被诊断为无IDC。23.权利要求22的用途,其还包括鉴定let-7d和miR-221的至少一种相较于对照的相对表达。24.权利要求23的用途,其中相较于对照减少的let-7d和/或miR-221表达确认浸润性乳腺癌的诊断。25.权利要求22的用途,其还包括基于诊断设计治疗方案。26.权利要求22的用途,其还包括基于诊断施以治疗。27.权利要求22的用途,其还包括基于诊断测定预后。28.测定miR-210、let-7d和miR-221表达水平的试剂在制备用于诊断受试者的乳腺浸润性导管癌(IDC)癌症的试剂中的用途,其中所述诊断包括:a)鉴定相较于对照miR-210水平的测试miR-210表达水平,鉴定相对于对照let-7d水平的测试相对let-7d表达水平,和鉴定相较于对照miR-221水平的测试miR-221表达水平;和b)i)如果所述受试者相较于对照具有增加的miR-210表达,相较于对照具有增加的let-7d表达,以及相较于对照具有增加的miR-221,则受试者被诊断为具有IDC,或ii)如果所述受试者相较于对照不具有增加的miR-210表达,相较于对照不具有增加的let-7d表达,以及相较于对照不具有增加的miR-221表达,则诊断受试者无IDC。29.抑制人ER+和/或HER2+表达或活性的试剂在制备用于治疗具有乳腺浸润性导管癌(IDC)的人受试者的药剂中的用途,其中所述试剂包括通过RNA干扰起作用的寡核苷酸,并且其中所述寡核苷酸包括至少miR-210基因产物。30.测定hsa-miR-210的表达水平的试剂在制备用于通过下列步骤测定乳腺癌进展的可能性的试剂中的用途:a)测定包含来自具有乳腺癌的受试者的乳腺癌细胞的样品的hsa-miR-210的表达水平,和b)将来自步骤a)的表达水平与对照样品的标准miRNA表达水平相比较,其中具有乳腺癌的受试者的hsa-miR-210的相对于对照样品的更高表达与更高的进展风险相关。31.权利要求30的用途,其中所述对照样品包括来自具有乳腺癌的代表性个体或个体库的组织,其中所述乳腺癌还未进展。32.权利要求30的用途,其中所述对照样品包括相对于步骤a)的测定表达水平的时间在更早的时间点从所述受试者采集的组织。33.权利要求30的用途,其中所述标准miRNA表达水平来自代表性个体库,并且为所述受试者的对照组织的miRNA水平的平均、中位或其它统计学处理的或另外地概括的或合计的代表性miRNA表达水平。34.权利要求30的用途,其中还相对于对照样品的let-7d和/或miR-221的表达水平测量let-7d和/或miR-221的一个或多个的表达水平,并且其中let-7d和/或miR-221的一个或多个的升高的表达水平与更高的进展风险相关。35.权利要求30的用途,其中还相对于对照样品的表达水平测量miR-10b、miR-126、miR-143、miR-218和miR-335-5p的一个或多个的表达水平,并且其中miR-10b、miR-126、miR-143、miR-218和miR-335-5p的一个或多个的降低的表达水平与更高的进展风险相关。
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