一种抽提低拷贝质粒的方法与流程

文档序号:12167090阅读:6580来源:国知局

本发明属于分子生物学领域,涉及一种抽提低拷贝质粒的方法。



背景技术:

现在的质粒抽提一般是利用碱裂解法,是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异达到分离目的,高pH使质粒DNA和染色体DNA变性,同时沉淀蛋白质,再将pH值调至中性,质粒DNA较小,很容易复性成双链,而染色体DNA较大,缠结成网状不溶物质,从而可以通过离心除去。质粒拷贝数较低的情况下,用常规的碱裂解法抽提质粒,产量较低,不适合大量抽提,有氯霉素可以增加抽提产量的文献,但规模普遍较小,不适用大量质粒抽提。



技术实现要素:

本发明的目的是针对现有技术的上述不足,提供一种大量抽提低拷贝质粒的方法。

本发明的目的可通过以下技术方案实现:

一种抽提低拷贝质粒的方法,其特征在于挑取单菌落接种于3‐6ml含有相应抗生素的丰富培养基试管内,于37℃、220rpm,培养14‐17h至生长对数期,将培养的菌液扩大至300ml含有相应抗生素的丰富培养基,37℃、220rpm,培养2.5‐3h至OD600为1.5‐1.7,加入终浓度为150~200μg/ml的氯霉素,于37℃、220rpm诱导培养约14‐20h,然后常规抽提方法进行抽提。所述的常规抽提方法优选碱裂解法。

有益效果:

本发明通过氯霉素诱导,大大提高了低拷贝质粒的抽提量,成功降低基因组污染发生概率,提升产品一次通过率。

具体实施方式

实施例1

以抽提300μg pET系列的质粒为例:

1挑斑摇菌:

17:30在已转化好的LB平板上挑取长势较好的单菌落(圆形,饱满,非实心斑)于4ml含有相应抗生素的丰富培养基(配方:丰富1L氯化钠0.5g磷酸二氢钾3g硫酸铵5g十二水和磷酸氢二钠15g大豆蛋白胨10g酵母粉20g),于37℃、220rpm,过夜培养至次日8:30(OD600≈4)。

2扩大培养

将过夜培养的4ml菌液扩大至300ml含有相应抗生素的丰富培养基,37℃、220rpm,培养约3h,至OD600≈1.5-1.7。

3诱导

加入终浓度为170μg/ml的氯霉素,于37℃、220rpm诱导培养约14-20h。

4抽提

1)500mL离心杯收菌;

2)加10ml溶液P1悬浮菌体,涡旋震荡30s,加200μl RNase(10mg/ml)于悬浮的菌体;

3)加10ml溶液P2裂解菌体,上下颠倒混匀,操作一定要轻柔;

4)加10ml溶液S3上下颠倒混匀,静置10min;

5)7500rpm离心15min;

6)将上清用滤纸过滤到玻璃瓶;

7)加1/3V上清(10ml)异丙醇于玻璃瓶,充分混匀;

8)将过滤后的上清加入吸附柱SD5004,7500rpm,1min;

9)7.2ml Wash Buffer洗柱两次;

10)弃废液,将吸附柱重新放回收集管中,空转2min;

11)将吸附柱放在一个新的50ml离心管中,在超净工作台中挥发酒精10min;

12)将1mL TE(EF)Buffer(65℃预热)加在吸附柱的中央,静置1min;

13)7500rpm离心2min至50mL灭菌离心管;

14)将质粒DNA转移至2mL灭菌离心管;

15)重复步骤4.12-4.14一次;

16)去除内毒素。

说明:

采用氯霉素诱导,最终得到了300ug质粒

直接采用正常方法进行抽提,最终只得到了100ug质粒

正常方法抽提步骤:

以抽提300μg pET系列的质粒为例:

1挑斑摇菌:

16:30在已转化好的LB平板上挑取长势较好的单菌落(圆形,饱满,非实心斑)扩大至300ml含有相应抗生素的丰富培养基,37℃、220rpm,培养约14h。

2抽提

1)500mL离心杯收菌;

2)加10ml溶液P1悬浮菌体,涡旋震荡30s,加200μl RNase(10mg/ml)于悬浮的菌体;

3)加10ml溶液P2裂解菌体,上下颠倒混匀,操作一定要轻柔;

4)加10ml溶液S3上下颠倒混匀,静置10min;

5)7500rpm离心15min;

6)将上清用滤纸过滤到玻璃瓶;

7)加1/3V上清(10ml)异丙醇于玻璃瓶,充分混匀;

8)将过滤后的上清加入吸附柱SD5004,7500rpm,1min;

9)7.2ml Wash Buffer洗柱两次;

10)弃废液,将吸附柱重新放回收集管中,空转2min;

11)将吸附柱放在一个新的50ml离心管中,在超净工作台中挥发酒精10min;

12)将1mL TE(EF)Buffer(65℃预热)加在吸附柱的中央,静置1min;

13)7500rpm离心2min至50mL灭菌离心管;

14)将质粒DNA转移至2mL灭菌离心管;

15)重复步骤2.12-2.14一次;

16)去除内毒素。

运用本发明方法进行抽提,对于pET的质粒来说,基因组污染的比例降低了约90%。

当前第1页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1