含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物及其合成与应用的制作方法

文档序号:11107668阅读:742来源:国知局
含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物及其合成与应用的制造方法与工艺

本发明涉及一种具有很好的抗酶解稳定性的含D型非天然抗菌肽类似物,本发明同时还涉及该含D型非天然抗菌肽类似物的和成功及其在制备抗菌药物的应用,属于生物化学技术领域。



背景技术:

近年来,滥用抗生素产生的耐药性问题日益严重,对人类疾病造成了巨大的威胁。寻找新的可替代抗生素的新药迫在眉睫。抗菌肽(Antimicrobial peptides),是生物体经诱导产生的一类具有抗菌活性的小分子多肽,来源广泛,其分子量小,大约在 3~6 kD 之间,有耐热、 耐酸性强,水溶性好,快速的杀菌能力等特点(Hancock REW, Scott MG. Proc Natl AcadSci USA,2000,97(16):8856~ 8861)。抗菌肽的抗菌机制不同于普通抗生素,抗菌机制一般包括①快速破坏菌膜,使菌体内容物泄露,细菌死亡②抗菌肽与细菌细胞内容物(如DNA或RNA)作用,干扰细菌细胞正常的合成和代谢,导致菌体死亡(刘立伟,邓磊. 抗菌肽作用机制研究进展[J].河北化工,2012,35(7):13-15)。所以,抗菌肽不易诱导耐药性的产生,使其成为生物医药领域的热门研究内容。

但是天然抗菌肽也存在一些弊端,比如:酶解稳定性差,生物利用度低;选择性不强,对哺乳动物细胞会产生破坏作用等,都会限制天然抗菌肽的进一步发展。因此,对天然抗菌肽进行改造成为研究的热点,其中非天然的D型氨基酸的引入常被作为一种常用的手段,优化抗菌肽,以提高耐受酶降解的能力(Di Grazia A, Cappiello F, Cohen H.et.al.D-Amino acids incorporation in the frog skin-derived peptide esculentin-1a(1-21)NH2 is beneficial for its multiple functions[J].Amino Acids,2015,47(12):2505-19.)。



技术实现要素:

本发明的目的是提供一种含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物;

本发明的另一目的是提供上述含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物的合成方法;

本发明的还有一个目的,就是提供上述含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物在制备抗菌药物中的应用。

一、含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物的设计

本发明含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物,是在抗菌肽Anoplin的亲水面、疏水面分别引入D型非天然氨基酸,对天然抗菌肽Anoplin进行修饰而得。

在抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型氨基酸为D型Leu,引入位点分别为9和10位,命名为Anoplin-D9,10;其结构式为: GLLKRIKTLL-NH2。

在抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型氨基酸为D型Leu,引入位点分别为9,10和3位,命名为Anoplin-D9,10,3;其结构式为:GLLKRIKTLL-NH2。

在抗菌肽Anoplin的亲水面引入的D型氨基酸为D型Lys,引入位点分别为4和7位,命名为Anoplin-D4,7;其结构式为: GLLKRIKTLL-NH2。

在抗菌肽Anoplin的亲水面引入的D型氨基酸为D型Arg和D型Lys,引入位点分别为5和7位,命名为Anoplin-D5,7;其结构式为:GLLKRIKTLL-NH2 。

二、含D型非天然氨基酸的抗菌肽类似物的合成

以Rink-MBHA Resin 为起始原料, 采用Fmoc固相合成方法,按照设计的替换位点在天然抗菌肽Anoplin的相应位置引入非天然D型氨基酸,然后按序列延长肽链即得。

在天然抗菌肽Anoplin的亲水面引入的D型非天然型氨基酸为D型Arg或/和D型Lys:在天然抗菌肽Anoplin的疏水面引入的D型非天然氨基酸 为D型Leu。

三、含D型氨基酸抗菌肽类似物的体外抑菌实验

1. 对标准菌株的抑菌实验

采用常见的二倍稀释法测定药物的最小抑菌浓度,即MIC值。结果重复三次以上的、平行实验。结果见表1:

2. 酶解稳定性试验

具体方法: 将胰蛋白酶或糜蛋白酶配成一系列浓度 2000,200,20,2, 0.2, 0.02μg/ml。将抗菌肽Anoplin; Anoplin-D9,10;Anoplin-D9,10,3;Anoplin-D4,7; Anoplin-D5,7 用PBS配成相应浓度,将母液与不同浓度的胰酶孵育(1:4, v/v),不含胰酶的PBS做对照,孵育物37℃孵育6小时,随后,取出60℃烘箱灭活10min, 后用MH肉汤稀释到2×MIC,加入96孔板中,每孔100μl,设定3个复孔,然后加菌,每孔加菌100μl, 37℃孵育过夜,随后酶标仪测定OD600nm, 根据给药组的OD值比阴性组的OD值作为细菌存活率。

图1为耐受胰酶6小时稳定性试验结果。可以看出,Anoplin-D5,7和Anoplin-D4,7 耐受胰酶降解的能力显著提高,跟母肽Anoplin相比,耐受胰酶分别提高104和105倍。

图2 为耐受糜蛋白酶6小时稳定性试验结果。可以看出,四条D型类似物耐受糜蛋白酶的能力较母肽Anoplin显著提高,Anoplin-D5,7和Anoplin-D4,7 耐受糜蛋白酶降解的能力提高100倍,Anoplin-D9,10和Anoplin-D9,10,3 耐受糜蛋白酶降解的能力提高10倍。

3. RP-HPLC降解率曲线

抗菌肽Anoplin,与其D型类似物D-4,7; D-5,7 与200 μg/ml的胰酶37摄氏度孵育,在不同时间段,吸取孵育液,进行RP-HPLC分析,绘制降解率-时间曲线(图3)。可以看出,母肽Anoplin在120min时间内就被完全快速100%降解,而类似物D-5,7和D-4,7 降解率显著降低,在共孵育24小时(1440min),降解率仅为20%左右。

抗菌肽Anoplin,与其D型类似物D-4,7; D-5,7 与20μg/ml的糜蛋白酶37摄氏度孵育,在不同时间段,吸取孵育液,进行RP-HPLC分析,绘制降解率-时间曲线(图4)。可以看出,母肽Anoplin在300min时间内就被完全快速100%降解,而类似物D-5,7和D-4,7 降解率显著降低,在共孵育24小时(1440min),降解率仅为20%和15%左右。

抗菌肽Anoplin,与其D型类似物D-9,10; D-9,10,3与2μg/ml的糜蛋白酶37摄氏度孵育,在不同时间段,吸取孵育液,进行RP-HPLC分析,绘制降解率-时间曲线(图5)。可以看出,在相同时间间隔,母肽Anoplin的降解率均高于类似物D-9,10和D-9,10,3。

4. 抑制生物膜形成试验

孵育方法:将标准铜绿假单孢菌分别用胰蛋白胨大豆肉汤含0.5%葡萄糖(TSBG)培养到中间对数期,最终用TSBG稀释到5×105 CFU/ml. 将其加到96孔板中,每孔20 μl, 然后将抗菌肽按二倍稀释的方法,使其浓度分别是2×MIC,1×MIC, 0.5×MIC, 0.25×MIC, 0.125×MIC, 0.0625×MIC. 然后将药物分别加到孔中,每个浓度6个平行,将共孵育物37℃孵育24小时。

处理方法:到时间后将平板取出,吸去上清液,加入PBS洗,每孔洗2遍,然后加无水甲醇固定生物膜,固定15min,然后吸去,空气中晾干,然后每孔加入200μl ,0.1% 结晶紫染色15min, 染色后,将其吸去,用去离子水洗,每孔洗2遍,最后加入95%无水乙醇,释放染料15min, 快速测定595nm处的吸光值。

生物膜形成率=(OD给药组-OD阴性组)/OD阴性组

抑制生物膜形成率%= 1-生物膜的形成率

试验结果见图6。横坐标是药物浓度,纵坐标是抑制铜绿假单胞菌生物膜形成率,发现生物膜抑制率呈现出剂量依赖性,母肽Anoplin和类似物D-9,10; D-9,10,3; D-4,7; D-5,7在高浓度2×MIC时,呈现出98%以上的抑膜形成率。在低浓度1×MIC时,母肽Anoplin 和类似物D-9,10; D-5,7抑膜形成率有所降低,但D-9,10,3仍然保留了很强的抑制率。在0.5×MIC时, 母肽Anoplin,D-4,7, D-5,7几乎丧失了抑膜能力,抑制膜形成率低于10%。只有类似物D-9,10和D-9,10,3仍然可以抑制生物膜的形成,抑制率40%。在浓度低于0.5×MIC时,所有肽都不能表现出抑制生物膜形成的能力。

附图说明

图1为本发明含D型氨基酸抗菌肽类似物耐受胰酶6小时稳定性试验。

图2为本发明含D型氨基酸抗菌肽类似物耐受糜蛋白酶6小时稳定性。

图3为Anoplin、D型类似物D-4,7、D-5,7 与200 μg/ml的胰酶37摄氏度孵育不同时间的RP-HPLC降解率曲线。

图4为Anoplin、D型类似物D-4,7、D-5,7 与20 μg/ml的胰酶37摄氏度孵育不同时间的RP-HPLC分析。

图5为Anoplin、D型类似物D-9,10、D-9,10,3与2μg/ml的糜蛋白酶37摄氏度孵育不同时间的RP-HPLC分析。

图6为本发明含D型氨基酸抗菌肽类似物抑制生物膜形成试验。

图7为纯肽Anoplin-D9,10的RP-HPLC分析谱图。

图8为纯肽Anoplin-D9,10,3的RP-HPLC分析谱图。

图9为纯肽Anoplin-D4,7的RP-HPLC分析谱图。

图10为纯肽Anoplin-D5,7的RP-HPLC分析谱图。

具体实施方式

下面通过具体实施例对本发明D型氨基酸抗菌肽类似物的结构、合成作进一步说明。

实施例1、类似物Anoplin-D9,10的合成

称取Rink-MBHA 树脂,取代值为0.43mmol/g, 合肽量为0.15mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分搅拌溶胀树脂,时间为30min, 然后加入10%的六氢吡啶脱树脂Fmoc保护,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗树脂,同样每次2min, 共洗4遍,最后使用茚检指示剂(苯酚:氰化钾吡啶:茚三酮=1:2:1)检验树脂是否脱去Fmoc保护基团,沸水煮树脂1min,立即观察,树脂显蓝色,则证明Fmoc基团已脱出,按合肽的序列,从C末端开始,称取第一个氨基酸为d-Leu,1.5倍过量,加入HOBT (1倍过量),HBTU(1倍过量),待氨基酸溶解后,加入启动剂DIEA (4倍过量)。上述氨基酸与树脂共同搅拌反应,时间1h,反应结束后,茚检试剂检验,沸水煮树脂1min, 树脂变为无色,说明D型Leu氨基酸成功接上,如此重复操作,直至后续接完d-leu-Thr-Lys-Ile-Arg-Lys-Leu-Leu-Gly氨基酸序列。经RP-HPLC制备纯化,使用C18柱纯化,洗脱条件为20%-60%乙腈,8ml/min。纯肽Anoplin-D9,10的RP-HPLC分析谱图见附图说明7。

实施例2 类似物Anoplin-D9,10,3的合成

称取Rink-MBHA 树脂,取代值为0.43mmol/g, 合肽量为0.25mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分搅拌溶胀树脂,时间为30min, 然后加入15%的六氢吡啶脱树脂Fmoc保护,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗树脂,同样每次2min, 共洗4遍,然后茚检指示剂(苯酚:氰化钾吡啶:茚三酮=1:2:1)检验,树脂显蓝色,证明树脂上的Fmoc基团已脱出,按合肽的序列,从C末端开始,称取第一个氨基酸d-Leu氨基酸,2倍过量,加入HOBT (3倍过量),HBTU(3倍过量),待氨基酸溶解后,加入启动剂DIEA (6倍过量)。上述氨基酸与树脂共同搅拌反应,时间1.5h,反应结束后,茚检试剂检验,树脂变为无色,说明第一个氨基酸成功接上,如此重复操作,后续接完d-leu-Thr-Lys-Ile-Arg-Lys-d-Leu-Leu-Gly氨基酸序列。经RP-HPLC制备纯化,使用C18柱纯化,洗脱条件为20%-60%乙腈,8ml/min。纯肽Anoplin-D9,10,3的RP-HPLC分析谱图见附图说明8。

实施例3、类似物Anoplin-D4,7的合成

称取Rink-MBHA 树脂,取代值为0.43mmol/g, 合肽量为0.2mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分搅拌溶胀树脂,时间为30min, 然后加入15%的六氢吡啶脱树脂Fmoc保护,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗树脂,同样每次2min, 共洗4遍,然后茚检指示剂(苯酚:氰化钾吡啶:茚三酮=1:2:1)检验,树脂显蓝色,证明Fmoc基团已脱出,按合肽的序列,从C末端开始,称取第一个氨基酸Leu,3倍过量,加入HOBT (5倍过量),HBTU(5倍过量),待氨基酸溶解后,加入启动剂DIEA (6倍过量)。上述氨基酸与树脂共同搅拌反应,时间1h,反应结束后,茚三酮检验,若树脂变为无色,说明氨基酸成功接上,如此重复操作,直至接完后面的序列leu-Thr-d-Lys-Ile-Arg-d-Lys-Leu-Leu-Gly。经RP-HPLC制备纯化,使用C18柱纯化,洗脱条件为20%-60%乙腈,8ml/min。纯肽Anoplin-D4,7的RP-HPLC分析谱图见附图说明9.

实施例4、类似物Anoplin-D5,7的合成

称取Rink-MBHA 树脂,取代值为0.43mmol/g, 合肽量为0.2mmol,加入重蒸的二氯甲烷溶液,充分搅拌溶胀树脂,时间为30min, 然后加入15%的六氢吡啶脱树脂Fmoc保护,每次洗2min, 共洗4遍,然后用重蒸DMF溶液洗树脂,同样每次2min, 共洗4遍,然后然后茚检指示剂(苯酚:氰化钾吡啶:茚三酮=1:2:1)检验,树脂显蓝色,显蓝色,证明Fmoc基团已脱出,按合肽的序列,从C末端开始,称取第一个氨基酸Leu,3.4倍过量,加入HOBT (6倍过量),HBTU(6倍过量),待氨基酸溶解后,加入启动剂DIEA (8倍过量)。上述氨基酸与树脂共同搅拌反应,时间2h,反应结束后,茚检指示剂检验,若树脂变为无色,说明氨基酸成功接上,如此重复操作,直至按序列接完剩下的氨基酸leu-Thr-d-Lys-Ile-d-Arg- Lys-Leu-Leu-Gly。经RP-HPLC制备纯化,纯肽Anoplin-D5,7的RP-HPLC分析谱图见附图说明10。

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