本发明属于植物分子生物学领域,涉及一种适用于提取杨树干种子mrna的提取液配方。
背景技术:
杨树属于被子植物门(angiosperms)双子叶植物纲(dicots)杨柳科(salicaceae)杨属(populus),为落叶乔木。我国原产杨树近60种,除热带外几乎皆有分布,是主要绿化造林树种,并具有很大的工业用途和一定的药用价值。且由于杨树基因组已成功测序,基因背景清晰,已成为林木科研领域最重要的模式树种之一。
作为林木领域的模式树种,其种子发育过程同样受到人们的关注,但干的杨树种子中脂类、蛋白以及淀粉的大量存在对传统提取mrna的方法形成了巨大的挑战,并且在现有文献中并无解决该困难的报道。故对干的杨树种子中提取mrna的方法亟待解决。
技术实现要素:
本发明目的是在于提供提取杨树干种子中mrna的配方,通过此方法可以快速而高效的提取已储存多年的杨树干种子中的mrna,以供科研需要,在其他种子如拟南芥和烟草等物种中,该方法同样有效。
说明书附图
表1不同年份杨树干种子mrna提取总浓度变化。
表2不同年份杨树干种子mrna提取样本中的230,260,280和320nm波长吸光光度值。
图1不同年份杨树干种子mrna提取样本电泳图。
图2烟草和拟南芥干种子mrna电泳图。
具体实施方式:
1.干种子mrna提取液配方如下:a组分:100mla组分由以下部分组成:丙酮40ml,甘油10ml,0.5mnaac40ml,1mm乙二胺四乙酸二钠10ml,100mlb组分由以下部分组成:盐酸胍35ml,2.5mnacl20ml,0.5mm乙二胺四乙酸二钠5ml,苯酚10ml,2mmtris-cl(ph=8)30ml。
2.其使用方法如下:将干的杨树种子放入研钵中,倒入液氮研磨至完全粉状样,将粉状物加入至1.5ml离心管中,加入a组分1ml,-20℃静止30min,之后用移液器小心地将上清液吸出,加入0.75mlb组分,55℃水浴加热15min,取出后加入0.5ml氯仿震荡15min。12000rpm离心5min。
3.将上清小心转移至另一离心管中,加入等体积氯仿进行震荡。
4.4℃13000rpm离心8min,取上清。重复一次上述步骤。
5.上清加入用1/10体积naac和二倍体积无水乙醇沉淀15min,13000rpm离心10min。75%酒精洗两次,溶于30ul的水(depc水)中。
6.检测提取结果。
实施效果:
⑴通过分光光度法对mrna含量进行检测。结果表明,不同年份杨树干种子mrna提取总浓度无显著差异,说明该方法对提取储存多年的杨树种子mrna的效率基本一致(表1)。
⑵通过分光光度法对mrna纯度进行检测。结果表明,不同年份杨树干种子mrna提取样本中的230,260,280和320nm波长吸光光度值无显著差异(表2),电泳结果证明未发生rna降解现象(图1),图中左起依次为当年样品、第三年样品和第五年样品。
⑶用此方法提取烟草和拟南芥干种子,结果证明该方法同样适用于上述2个物种(图2),图中泳道左起依次为烟草种子、拟南芥种子。
表1不同年份杨树干种子mrna提取总浓度变化
表2不同年份杨树干种子mrna提取样本中的260/280,260/230和320nm波长吸光光度值