抗cd-3抗体,与cd3及cd20结合的双特异性抗原结合分子,及其用图

文档序号:8323471阅读:579来源:国知局
抗cd-3抗体,与cd3及cd20结合的双特异性抗原结合分子,及其用图
【专利说明】抗CD-3抗体,与CD3及CD20结合的双特异性抗原结合分 子,及其用途 发明领域
[0001] 本发明关于对CD3具特异性的抗体及其抗原结合片段,及其使用方法。本发明亦 关于与CD3及目标分子例如CD20结合的双特异性抗原结合分子,及其使用方法。
[0002] 背景
[0003] ⑶3为与T细胞受体复合物(TCR)关联表达在T细胞上的同源二聚性或异源二聚 性抗体,且为T细胞活化所需。功能性CD3由四条不同链中的二条链二聚结合所形成:e、 4、S和 Y。CD3二聚体排列包括Y / e、S / e和4 / 4。抗CD3抗体已显现将CD3丛聚 在T细胞上,藉此以类似TCR被肽-承载的MHC分子所吸引的方式,使T细胞活化。因此, 抗-CD3抗体己被提出作为涉及T细胞活化作用的治疗目的。此外,能与CD3和靶抗原结合 的双特异性抗体己被提出作为涉及将T细胞免疫反应靶向表达靶抗原细胞的组织和细胞 的治疗用途。
[0004] ⑶20为表达在成熟B细胞的细胞膜上的非糖基化磷蛋白。⑶20被视为B-细胞肿 瘤相关抗原,因为有超过95%的B-细胞非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)和其他B-细胞恶性肿瘤 表达CD20,但其在前体B-细胞、树突细胞和浆细胞中则无。靶向CD20的治疗癌症的方法 已为本领域所知。例如,嵌合抗-CD20单克隆抗体利妥昔单抗(rituximab)已用于或建议 用于治疗癌症,例如NHL、慢性淋巴性白血病(CLL)和小淋巴性淋巴瘤(SLL)。认为⑶20通 过补体依赖的细胞毒性(CDC)、抗体依赖的细胞介导的细胞毒性(ADCC)/或引发细胞凋亡 和对化学治疗的敏感性,杀死CD20-表达的肿瘤细胞。虽然抗-CD20肿瘤靶向策略在临床 情况已显现很大的潜力,但并非所有的患者皆对抗-⑶20治疗有反应,且某些患者显示对 抗-CD20治疗发生抗性或出现不完全反应(例如,对利妥昔单抗具有抗性)。
[0005] 与CD3和靶抗原(例如CD20)结合的双特异性抗原结合分子应可用于其中期望特 异性靶向和T细胞介导的杀死表达靶抗原的细胞的治疗情况。
[0006] 发明简述
[0007] 在第一方面本发明提供与人类CD3结合的抗体及其抗原-结合片段。根据本发明 此方面的抗体可用于,特别地,靶向表达⑶3的T细胞,及用于刺激T细胞活化,例如在其中 T细胞介导的致死为有利或所欲的情况下。可包括本发明的抗-CD3抗体或其抗原-结合部 分作为双特异性抗体的部分,所述双特异性抗体针对具体细胞类型诸如肿瘤细胞或感染剂 的CD3介导的T细胞活化。
[0008] 本发明的示例性抗-CD3抗体列于文中的表1和表2。表1列出示例的抗-CD3抗体 的重链可变区(HCVR)和轻链可变区(LCVR),以及重链互补决定区(HCDRUHCDR2和HCDR3) 和轻链互补决定区(IXDRUIXDR2和IXDR3)的氨基酸序列标示符。表2列出编码示例的 抗-CD3 抗体的 HCVR、LCVR、HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2 和 LCDR3 的核酸分子的序列 标示符。
[0009] 本发明提供包括HCVR的抗体或其抗原结合片段,该HCVR包括选自由表1所列的 任何HCVR氨基酸序列的氨基酸序列,或与其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少 99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0010] 本发明也提供包括LCVR的抗体或其抗原结合片段,该LCVR包括选自由表1所列 的任何LCVR氨基酸序列的氨基酸序列,或与其具有至少90 %、至少95 %、至少98 %或至少 99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0011] 本发明亦提供包括HCVR和LCVR氨基酸序列对(HCVR/LCVR)的抗体或其抗原结合 片段,该HCVR和LCVR氨基酸序列对包括表1所列的任何HCVR氨基酸序列与表1所列的任 何LCVR氨基酸序列配对。根据某些实施方式,本发明提供包括包含在任何表1所列的示例 性抗-CD3抗体中的HCVR/LCVR氨基酸序列对的抗体或其抗原结合片段。在某些实施方式 中,HCVR/LCVR氨基酸序列对由下列组成的组中选出:SEQ ID N0:2/10(例如H1H2712N); 114/122(例如 H2M2609N) ;514/522(例如 H2M3563N) ;770/778(例如 H1H5778P); 1050/1234 (例如 H1H7195B);及 1090/1234 (例如 H1H7208B)。
[0012] 本发明亦提供包括重链⑶R1 (HCDR1)的抗体或其抗原结合片段,该重链⑶R1包括 由表1所列的任何HCDR1氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0013] 本发明亦提供包括重链⑶R2 (HCDR2)的抗体或其抗原结合片段,该重链⑶R2包括 由表1所列的任何HCDR2氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0014] 本发明亦提供包括重链⑶R3 (HCDR3)的抗体或其抗原结合片段,该重链⑶R3包括 由表1所列的任何HCDR3氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0015] 本发明亦提供包括轻链⑶R1 (IXDR1)的抗体或其抗原结合片段,该轻链⑶R1包括 由表1所列的任何IXDR1氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0016] 本发明亦提供包括轻链⑶R2 (IXDR2)的抗体或其抗原结合片段,该轻链⑶R2包括 由表1所列的任何IXDR2氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0017] 本发明亦提供包括轻链⑶R3 (IXDR3)的抗体或其抗原结合片段,该轻链⑶R3包括 由表1所列的任何IXDR3氨基酸序列中选出的氨基酸序列,或具有至少90 %、至少95 %、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0018] 本发明亦提供包括HCDR3和IXDR3氨基酸序列对(HCDR3/IXDR3)的抗体或其抗 原结合片段,该HCDR3和LCDR3氨基酸序列对包括表1所列的任何HCDR3氨基酸序列与 表1所列的任何LCDR3氨基酸序列配对。根据某些实施方式,本发明提供包括包含在任何 表1所列的示例性抗-CD3抗体中的HCDR3/LCDR3氨基酸序列对的抗体或其抗原结合片 段。在某些实施方式中,HCDR3/IXDR3氨基酸序列对由下列组成的组中选出:SEQ ID N0: 8/16(例如 H1H2712N) ;120/128(例如 H2M2609N) ;520/528(例如 H2M3563N) ;776/784(例 如 H1H5778P) ; 1056/1240 (例如 H1H7195B);及 1096/1240 (例如 H1H7208B)。
[0019] 本发明亦提供包括包含在任何表1所列的示例性抗-⑶3抗体中的一组六个 CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)的抗体或其抗原结合片段。在某些 实施方式中,此HCDR1-HCDR2-HCDR3-IXDR1-IXDR2-IXDR3氨基酸序列组由下列组成的组 中选出:SEQ ID N0:4-6-8-12-14-16(例如 H1H2712N) ;116-118-120-124-126-128(例如 H2M2609N) ;516-518-520-524-526-528(例如 H2M3563N) ;772-774-776-780-782-784(例 如 H1H5778P) ;1052-1054-1056-1236-1238-1240(例如 H1H7195B);及 1092-1094-1096-1236-1238-1240 (例如 H1H7208B)。
[0020] 在相关的实施方案中,本发明提供包括包含在如任何表1所列的示例性抗-CD3 抗体所定义的HCVR/LCVR氨基酸序列对中的一组六个CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LC DR1-IXDR2-IXDR3)的抗体或其抗原结合片段。例如,本发明包括抗体或其抗原结合片段, 所述抗体或其抗原结合片段含有包含在由下列组成的组中选出的HCVR/LCVR氨基酸序 列对中的 HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3 氨基酸序列组:SEQ ID N0 :2/10(例 如 H1H2712N) ;114/122(例如 H2M2609N) ;514/522(例如 H2M3563N) ;770/778(例如 H1H5778P) ; 1050/1234 (例如 H1H7195B);和 1090/1234 (例如 H1H7208B)。用于鉴定 HCVR 和 LCVR氨基酸序列中的CDR的方法和技术已为本领域所熟知并可用于鉴定文中所揭示的指 定HCVR及/或LCVR氨基酸序列内的CDR。可用于鉴定CDR界限的示例性习用法包括,例如 Kabat定义、Chothia定义和AbM定义。一般而言,Kabat定义以序列变异性为基准,Chothia 定义以结构环区域的位置为基准,而AbM定义为介于Kabat和Chothia法的折衷。参见,例 如 Kabat, ''Sequences of Proteins of Immunological Interest, ''National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991) ;A1-Lazikani 等人,(1997),J. Mol. Biol. 273 :927-948 ; 及 Martin 等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 :9268-9272 (1989)。亦可取得公开的数据库 用以鉴定抗体内的⑶R序列。
[0021] 本发明亦提供编码抗-CD3抗体或其部分的核酸分子。例如,本发明提供编码表 1中所列的任何HCVR氨基酸序列的核酸分子;在某些实施方式中,此核酸分子包括由表2 所列的任何HCVR核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其具有至少90%、至少95%、至少 98 %或至少99 %序列同一性的其实质上类似的序列。
[0022] 本发明亦提供编码表1中所列的任何LCVR氨基酸序列的核酸分子;在某些实施方 式中,此核酸分子包括由表2所列的任何LCVR核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其具 有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0023] 本发明亦提供编码表1中所列的任何HCDR1氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何HCDR1核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0024] 本发明亦提供编码表1中所列的任何HCDR2氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何HCDR2核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0025] 本发明亦提供编码表1中所列的任何HCDR3氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何HCDR3核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0026] 本发明亦提供编码表1中所列的任何LCDR1氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何LCDR1核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0027] 本发明亦提供编码表1中所列的任何LCDR2氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何LCDR2核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0028] 本发明亦提供编码表1中所列的任何LCDR3氨基酸序列的核酸分子;在某些实施 方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何LCDR3核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与其 具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0029] 本发明亦提供编码HCVR的核酸分子,其中该HCVR包括一组三个的⑶R(亦即 HCDR1-HCDR2-HCDR3),其中该HCDR1-HCDR2-HCDR3氨基酸序列组如表1所列的任何示例性 抗-CD3抗体所定义。
[0030] 本发明亦提供编码LCVR的核酸分子,其中该LCVR包括一组三个的⑶R(亦即 LCDR1-LCDR2-LCDR3),其中该LCDR1-LCDR2-LCDR3氨基酸序列组如表1所列的任何示例性 抗-CD3抗体所定义。
[0031] 本发明亦提供编码HCVR和LCVR二者的核酸分子,其中此HCVR包括表1中所列的 任何HCVR氨基酸序列的氨基酸序列,及其中此LCVR包括表1中所列的任何HCVR氨基酸序 列的氨基酸序列。在某些实施方式中,此核酸分子包括由表2所列的任何HCVR核酸序列中 选出的多核苷酸序列,或与其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性 的其实质上类似的序列,及由表2所列的任何LCVR核酸序列中选出的多核苷酸序列,或与 其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。在 根据本发明此方面的某些实施方式中,此核酸分子编码HCVR和LCVR,其中该HCVR和LCVR 二者皆衍生自表1中所列的相同抗-CD3抗体。
[0032] 本发明亦提供能表达包括抗-CD3抗体的重链或轻链可变区的多肽的重组表达载 体。例如,本发明包括重组表达载体,该载体包括任何上文所提的核酸分子,亦即编码表1 中所列的任何HCVR、LCVR及/或CDR序列的核酸分子。本发明的范围亦包括其中已导入此 等载体的宿主细胞,以及通过在允许产生抗体和抗体片段的条件下培养宿主细胞,并回收 所产生的抗体和抗体片段来生产抗体或其部分的方法。
[0033] 本发明包括具有修饰的糖基化模式的抗-CD3抗体。在某些实施方案中,修饰以移 除不想要的糖基化位点可能为有用的,或缺乏在寡糖链上存在的岩藻糖部分的抗体,例如 以增加抗体依赖的细胞毒性(ADCC)功能(参见Shield等人(2002)JBC 277 :26733)。在 其他的应用上,可进行半乳糖基化的修饰作用以修改补体依赖的细胞毒性(CDC)。
[0034] 在另一方面,本发明提供包括特异性地结合CD3的重组的人类抗体或其片段以及 可药用的载剂的药物组合物。在一相关的方面,本发明的特征为是抗-CD3抗体和第二治疗 剂的组合的组合物。在一实施方式中,此第二治疗剂为任何有利地与抗-CD3抗体组合的活 性剂。可有利地与抗-CD3抗体组合的示例性活性剂包括(不限于)结合及/或活化CD3 讯号传递的其他活性剂(包括其他抗体或其抗原结合片段等),及/或不直接与CD3结合然 而却活化或刺激免疫细胞活化的活性剂。涉及本发明抗-CD3抗体的另外的组合治疗及共 同制剂揭示于文中的他处。
[0035] 又在另一方面,本发明提供使用本发明的抗-CD3抗体或抗体的抗原结合部分来 刺激T细胞活化的治疗方法,其中该治疗方法包括将治疗上有效量的包括本发明抗体或抗 体的抗原结合片段的药物组合物施用于需要其的对象。所治疗的病症为任何通过刺激CD3 活性或讯号传递加以改善、减轻、抑制或预防的疾病或症状。
[0036] 根据另一方面,本发明提供与CD3和靶抗原结合的双特异性抗原结合分子。根据 某些示例性实施方式,此双特异性抗原结合分子与CD3和CD20结合;此等双特异性抗原结 合分子在文中亦称为"抗-CD3/抗-CD20双特异性分子"。抗-CD3/抗-CD20双特异性分子 的抗-CD20部分可用于靶向表达CD20的肿瘤细胞(例如B-细胞肿瘤),而双特异性分子的 抗-CD3部分可用于活化T细胞。与肿瘤细胞上的CD20和T细胞上的CD3的同时结合促进 了由活化的T细胞定向杀死(细胞裂解)被靶向的肿瘤细胞。本发明的抗-CD3/抗-CD20 双特异性分子,特别地,用于治疗与CD20-表达肿瘤相关或由其引起的疾病和病症(例如淋 巴瘤)。
[0037] 根据本发明此方面的双特异性抗原结合分子,包括特异性与人类CD3结合的第 一抗原结合结构域及特异性与CD20结合的第二抗原结合结构域。本发明包括抗-CD3/ 抗-CD20双特异性分子(例如双特异性抗体),其中各抗原结合结构域包括重链可变区 (HCVR)与轻链可变区(LCVR)配对。在本发明特定的示例性实施方式中,抗-CD3抗原结合 结构域和抗-CD20抗原结合结构域各包括不同、有区别、与共同LCVR配对的HCVR。例如,如 文中实例7所示,构建双特异性抗体包括特异性与CD3结合的第一抗原结合结构域,其中该 第一抗原结合结构域包括衍生自抗-CD3抗体的HCVR/LCVR对;及特异性与CD20结合的第 二抗原结合结构域,其中该第二抗原结合结构域包括衍生自抗-CD20抗体的HCVR与衍生自 抗-CD3抗体的LCVR配对(例如,包括在抗-CD3抗原结合结构域内的相同LCVR)。换言的, 在文中所揭示的示例性分子中,来自抗-CD20抗体的HCVR与来自抗-CD3抗体的LCVR的配 对,产生特异性与CD20结合(但不与CD3结合)的抗原结合结构域。在此等实施方式中,第 一和第二抗原结合结构域包括不同的抗-⑶3和抗-⑶20HCVR,但享有共同的抗-⑶3LCVR。
[0038] 本发明提供抗-CD3/抗-CD20双特异性分子,其中特异性与CD3结合的第一抗原 结合结构域包括表1或表18中所列的任何HCVR氨基酸序列。特异性与CD3结合的第一抗 原结合结构域亦包括表1或表19中所列的任何LCVR氨基酸序列。根据某些实施方式,特 异性与CD3结合的第一抗原结合结构域包括表1或表17中所列的任何HCVR/LCVR氨基酸 序列对。本发明亦提供抗-CD3/抗-CD20双特异性分子,其中特异性与CD3结合的第一抗 原结合结构域包括如表1或表18中所列的任何重链⑶R1-⑶R2-⑶R3氨基酸序列,和/或 如表1或表19中所列的任何轻链⑶R1-⑶R2-CDR3氨基酸序列。
[0039] 根据某些实施方式,本发明提供抗-CD3/抗-CD20双特异性分子,其中特异性与 CD3结合的第一抗原结合结构域包括重链可变区(HCVR),所述重链可变区具有由SEQ ID NO :1250、1266、1282、1298、1314和1329组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、 至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0040] 本发明亦提供抗-⑶3/抗-⑶20双特异性分子,其中特异性与⑶3结合的第一 抗原结合结构域包括轻链可变区(LCVR),所述轻链可变区具有由SEQ ID N0:1258、1274、 1290、1306、1322和1333组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、至少95%、至少 98 %或至少99 %序列同一性的其实质上类似的序列。
[0041] 本发明亦提供抗-CD3/抗-CD20双特异性分子,其中特异性与CD3结合的第一抗 原结合结构域包括由 SEQ ID N0 :1250/1258、1266/1274、1282/1290、1298/1306、1314/1322 和1329/1333组成的组中选出的HCVR和LCVR (HCVR/LCVR)氨基酸序列对。
[0042] 本发明亦提供抗-CD3/抗-CD20双特异性分子,其中特异性与CD3结合的第一抗 原结合结构域包括重链CDR3(HCDR3)结构域,其具有由SEQ ID N0:1256、1272、1288、1304、 1320和1332组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、至少95%、至少98%或至 少99%序列同一性的其实质上类似的序列;及轻链⑶R30XDR3)结构域,其具有由SEQ ID NO :1264、1280、1296、1312、1328和1336组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、 至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0043] 在某些实施方式中,特异性与⑶3结合的第一抗原结合结构域包括由SEQ ID N0 : 1256/1264、1272/1280、1288/1296、1304/1312、1320/1328 和 1332/1336 组成的组中选出的 HCDR3/LCDR3氨基酸序列对。
[0044] 本发明亦提供抗-CD3/抗-CD20双特异性抗原结合分子,其中特异性与CD3结合 的第一抗原结合结构域包括重链⑶Rl(HCDRl)结构域,其具有由SEQ ID N0:1252、1268、 1284、1300、1316和1330组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、至少95%、至 少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列;及重链⑶R2(HCDR2)结构域,其具 有由SEQ ID N0 :1254、1270、1286、1302、1318和1331组成的组中选出的氨基酸序列,或具 有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列;轻链 CDRl(LCDRl)结构域,其具有由 SEQ ID 勵:1260、1276、1292、1308、1324 和 1334 组成的组 中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其 实质上类似的序列;及轻链CDR2(LCDR2)结构域,其具有由SEQ ID N0:1262、1278、1294、 1310、1326和1335组成的组中选出的氨基酸序列,或具有至少90%、至少95%、至少98% 或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0045] 本发明的某些非限定、示例性抗-⑶3/抗-⑶20双特异性抗原结合分子包括 特异性与⑶3结合的含有HCDR1-HCDR2-HCDR3-IXDR1-IXDR2-IXDR3结构域的第一抗 原结合结构域,所述HCDR1-HCDR2-HCDR3-IXDR1-IXDR2-IXDR3结构域分别具有由下 列组成的组中选出的氨基酸序列:SEQ ID N0:1252-1254-1256-1260-1262-1264(例 如 BS3/20-001) ;1268-1270-1272-1276-1278-1280 (例 如 BS3/20-002) ;1284-1286-1288-1292-1294-1296(例 如 BS3/20-003) ; 1300-1302-1304-1308-1310-1312 (例如 BS3/20-004); 1316-1318-1320-1324-1326-1328 (例 如 BS 3 - 2 0 -0 0 5 );及 1330-1331-1332-1334-1335-1336 (例如 BS3/20-007)。
[0046] 本发明亦提供抗-⑶3/抗-⑶20双特异性分子,其中特异性与⑶20结合的第二抗 原结合结构域包括重链可变区(HCVR),其具有SEQ ID N0 :1242的氨基酸序列,或具有至少 90%、至少95%、至少98%或至少99%序列同一性的其实质上类似的序列。
[0047] 本发明亦提供抗-⑶3/抗-⑶20双特异性
当前第1页1 2 3 4 5 6 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1