与赖氨酰氧化酶样蛋白2(loxl2)相关的治疗和诊断方法
【专利说明】与赖氨酰氧化酶样蛋白2(L0XL2)相关的治疗和诊断方法
[0001]相关申请的夺叉引用
[0002] 本申请要求2012年11月9日提交的美国临时申请第61/724, 858号和2012年10 月30日提交的美国临时申请第61/720, 350号，所述申请以全文引用的方式并入本文中。
[0003] 关于序列表的陈沐
[0004] 以文本格式代替纸本拷贝提供与本申请相关的序列表，并且在此以引用的方式 并入本说明书中。含有序列表的文本文件的名称为GILE-077_03W0_ST25.txt。文本文件 66KB，创建于2013年10月30日，并且以电子方式经由EFS-Web提交。
技术领域
[0005] 本发明在一些方面中涉及使用赖氨酰氧化酶样蛋白2 (L0XL2)的抑制剂和/或与 赖氨酰氧化酶样蛋白2结合的药剂治疗并且改善疾病症状以及疾病的诊断性和预后性方 法，所述疾病包括与纤维化相关的疾病，如肝脏疾病。
【背景技术】
[0006] 赖氨酰氧化酶样蛋白2 (L0XL2)是多种纤维化疾病和病况以及肿瘤中所诱导的细 胞外基质的蛋白质。其由活化成纤维细胞、疾病相关的平滑肌细胞、内皮细胞以及上皮细胞 分泌。存在对治疗和诊断纤维化疾病和病况以及与L0LX2相关的其它疾病和病况（包括与 纤维化相关的肝脏疾病和肺脏疾病）的需求。
【发明内容】
[0007] 本发明在一些方面中涉及检测、诊断以及治疗疾病和病况的方法；以及用于此类 方法中的组合物、药剂、装置、试剂盒以及分析系统。
[0008] 提供了用于治疗或改善疾病或病况的一或多种症状的方法，所述疾病或病况如肝 脏疾病或病况；纤维化疾病或病况，例如纤维化肝脏疾病。此类方法一般通过向患有肝脏疾 病或病况的个体投与结合和/或抑制L0XL2的药剂来进行，从而治疗或改善疾病或病况。
[0009] 在一些实施例中，疾病或病况是肝脏疾病或病况，如肝脏疾病或与纤维化相关 的病况。在一些方面中，疾病或病况选自由以下各者组成的群组：C型肝炎病毒（HCV)、 NASH(非酒精性脂肪性肝炎）、PSC(原发性硬化性胆管炎）、肝硬化、肝脏纤维化、门静脉血 压过高。在一些方面中，疾病或病况选自由以下各者组成的群组：PBC(原发性胆汁性肝硬 化）、自身免疫性肝炎、酒精性肝硬化、a 1抗胰蛋白酶缺乏疾病、遗传性血色沉着病、威尔 逊氏病（Wilson's disease)、B型肝炎病毒（HBV)以及HIV相关的脂肪性肝炎。在一些方 面中，肝脏疾病或病况是病毒性肝炎，如HCV或HBV。在一些方面中，肝脏疾病是代偿性肝脏 疾病。在其它方面中，其是代偿失调性肝脏疾病，如与腹水、食道静脉曲张、脑病和/或黄疸 相关的肝脏疾病。
[0010] 在一些实施例中，药剂是与L0XL2特异性结合的抗体。在一些方面中，所述抗体是 单克隆抗体。在一些方面中，其是抗体片段，例如Fv、scFv、Fab、Fab' F(ab'）2或Fab 2片段。 在一些方面中，其是单克隆抗体。在一些方面中，所述药剂是L0XL2的抑制剂，如非竞争性 抑制剂。在一些方面中，药剂与催化域外的L0XL2结合，如与L0XL2的SRCR3-4域内的抗原 决定基结合。
[0011] 在一些实施例中，所述抗体与具有重链可变区序列SEQ ID N0:8和/或轻链可变 区序列SEQ ID N0:9和/或具有此类序列的一或多个⑶R的抗体竞争性结合L0XL2。在一些 实施例中，所述抗体包含重链可变区，其具有与SEQ ID N0:6、SEQ ID N0:8、SEQ ID N0:10、 SEQ ID N0:11、SEQ ID 勵：12中所阐述的序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、 97%、98%、99%或 100%或约 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100% 一致性的氨基酸序列；和/或轻链可变区，其具有与SEQ ID N0:7、SEQ ID N0:9、SEQ ID N0:13 或 SEQ ID N0:14 的序列具有至少 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、 99 %或100 %-致性的氨基酸序列。在一些实施例中，所述抗体包含重链可变区，其具有与 SEQ ID N0:8 中所阐述的序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99% 或 100%或约 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100% - 致性的氨基 酸序列；以及轻链可变区，其具有与SEQ ID N0:9的序列具有至少75%、80%、85%、90%、 95%、96%、97%、98%、99%或100%或约75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、 99%或100%-致性的氨基酸序列。在一些实施例中，所述抗体包括SEQ ID N0:8中所阐述 的重链可变区序列的重链⑶R和/或SEQ ID N0:9中所阐述的轻链可变区序列的轻链⑶R。 在一些方面中，此类⑶R包括⑶R3或包括⑶Rl、OTR2和/或⑶R3，如此类重链和轻链序列 的 CDR1、CDR2 和 / 或 CDR3。
[0012] 在一些实施例中，所述药剂以处于或约或至少处于或至少约10mg/kg或20mg/kg 或约10mg/kg与20mg/kg之间的剂量投与，以至少处于或至少约或处于或约200mg或700mg 或约200mg与700mg之间的剂量投与，以至少处于或至少约或处于或约75mg或125mg或 75mg与125mg之间或约75mg与125mg之间的剂量投与。在其它实施例中，所述药剂以 处于或约或至少处于或约 l〇mg/kg、15mg/kg、20mg/kg、25mg/kg、30mg/kg、35mg/kg、40mg/ kg、45mg/kg、50mg/kg、55mg/kg、60mg/kg、65mg/kg、70mg/kg、80mg/kg、90mg/kg、100mg/ kg、125mg/kg、150mg/kg、175mg/kg、200mg/kg、225mg/kg、250mg/kg、275mg/kg、300mg/kg、 325mg/kg、350mg/kg、375mg/kg、400mg/kg、425mg/kg、450mg/kg、475mg/kg 或 500mg/kg 的剂 量投与。在此类实施例的一些方面中，静脉内投与所述药剂，例如通过输注。在此类实施例 的一些方面中，皮下投与所述药剂。在此类实施例的一些方面中，每周或每隔一周投与所述 药剂。在另一个实施例中，每隔一周、两周、三周、四周、五周或六周投与所述药剂。在又一 个实施例中，在一个月、两个月、三个月、四个月、五个月、六个月、七个月、八个月、九个月或 十个月的时间段内多次投与所述药剂。
[0013] 在一些实施例中，所述方法增加或延长个体的生存期，减少或防止桥接纤维化增 加，减少或防止a平滑肌肌动蛋白（a SMA)含量增加，减少或防止星状细胞活化增加，和/ 或减少或防止丙氨酸转氨酶（ALT)或天冬氨酸转氨酶（AST)增加。在一些实施例中，所述 方法进一步包括评定桥接纤维化、a平滑肌肌动蛋白（a SMA)含量、星状细胞活化、丙氨酸 转氨酶（ALT)、天冬氨酸转氨酶（AST)、Y _谷氨酰转移酶（GGT)和/或炎症和/或坏死的 步骤。在一些方面中，所述方法包括确定相比于无治疗的情况或参数的预处理测量，此类参 数降低或参数提高得以阻止。在一些情况下，所述方法将ALT、AST、GGT或ALT/AST比率降 低到低于上限或正常值（ULN)或少于正常值上限（ULN)的2倍、5倍或10倍。在一些情况 下，所述方法减少例如纤维化或患病组织中的炎症和/或坏死。
[0014] 在一些方面中，所述方法进一步包括检测或监测步骤，如检测例如蛋白质或mRNA 的L0XL2基因产物的水平。在一些方面中，此类检测和监测步骤指示治疗功效。
[0015] 还提供了检测例如L0XL2多肽的赖氨酰氧化酶样蛋白2 (L0XL2)的方法以及其在 诊断、预后、预测以及治疗方法中的用途。举例来说，提供了检测和/或定量L0XL2的分析， 如检测和/或定量个体中的循环的赖氨酰氧化酶样蛋白2(L0XL2)多肽的分析。还提供了 诊断性、预后性以及预测性应用中此类分析的方法和用途以及供用于所述分析的试剂盒和 分析装置。
[0016] 提供了在个体中检测L0XL2 (典型地为循环L0XL2)的方法。在所提供的方法中有 检测方法、诊断方法、预测方法、监测方法以及预后方法。在一些实例中，通过使获自个体的 样品（一般是液体样品）与对L0XL2具有特异性的抗体接触以及检测所述抗体与样品中存 在的多肽（例如L0XL2多肽）的结合来进行所述方法。在一些实例中，所述分析法检测到 液体样品中的L0XL2达到300pg/mL、250pg/mL、200pg/mL、175pg/mL或更少，或检测到样品 中的11)乂1^2浓度低到30(^8/1111^、25(^8/1111^、20(^8/1111^、175。8/1111^例如低到约15(^8/1111^到约 175pg/mL，约 125pg/mL 到约 150pg/mL，约 100pg/mL 到约 125pg/mL，约 75pg/mL 到约 100pg/ mL，约 50pg/mL 到约 75pg/mL，或约 40pg/mL 到约 50pg/mL。
[0017] 在一些实例中，所检测到的L0XL2水平指示疾病或病况存在或不存在。在一些实 例中，其指示个体将对疾病的特定治疗作出反应的可能性，或指示治疗功效。在一些实例 中，如其中方法是预后方法，所检测到的L0XL2水平指示疾病或病况的结果、事件或终点的 可能性。在一些方面中，疾病或病况通过循环L0XL2表征或与循环L0XL2或较高循环L0XL2 相关。在一些方面中，个体患有疾病或病况；在一些方面中，个体疑似患有疾病或病况。在 一些方面中，所述方法进一步包括判定个体患有或未患有疾病或病况，可能或不可能对特 定治疗作出反应，或可能或不可能具有特定结果或事件，或治疗有效或无效。
[0018] 在一些实例中，所述个体经受疾病或病况治疗，并且低于如治疗前水平的较早时 间点测定的水平的L0XL2检测水平指示治疗功效。
[0019] 所述样品典型地是液体样品，如血液、血液部分（如血清