Vegf多态性和抗血管发生疗法
【专利说明】VEGF多态性和抗血管发生疗法
[0001] 本申请是申请日为2008年11月26日、中国申请号为200880125826. 3、发明名称 为"VEGF多态性和抗血管发生疗法"的发明申请的分案申请。
[0002] 对相关申请的交叉引用
[0003] 本申请要求2007年11月30日提交的美国临时申请No. 60/991，616和2008年3 月21日提交的美国临时申请No. 61/038, 699的权益，通过述及将其公开内容完整收入本 文。
[0004] 生物材料的保藏
[0005] 以下生物材料已经保藏于美国典型培养物保藏中心（American Type Culture Collection,12301 Parklawn Drive, Rockville, MD 20852, USA) (ATCC)：
[0006] 保藏物 保藏日期 保藏编号
[0007] 杂交瘤，Α4· 6. 1 (抗-hVEGF) 1991 年 03 月 29 日 ATCC HB-10709 发明领域
[0008] -般而言，本申请涉及与抗血管发生疗法有关的人类疾病和病症的治疗。具体而 言，本发明涉及癌症的抗血管发生疗法，其或是单独施用的或是与其它抗癌疗法组合施用 的。
[0009] 发明背景
[0010] 癌症仍然是人类健康的最致命威胁之一，在美国每年影响超过1百万新患者。实 体瘤对那些死亡大多负有责任。虽然某些癌症的医学治疗取得了显著进展，但是当前的治 疗方法相对没有选择性：手术切除患病组织；放射疗法缩小实体瘤；及化学疗法杀死正在 快速分裂的细胞。这些治疗方法可导致众多副作用，在有些情况中严重到限制可给予的剂 量并如此排除潜在有效药物的使用。
[0011] 血管发生是重要的细胞事件，其中血管内皮细胞增殖、消减和重新组织，从而从 现有的血管网络形成新血管。血管发生对于大多数原发瘤的生长及其后续转移是至关重 要的。血管内皮细胞生长因子（VEGF)，也称作VEGF-A或血管通透因子（VPF)，被报道成 正常和异常血管发生二者的枢轴调节物。Ferrara and Davis_Smyth(1997)Endocrine Rev. 18:4-25 ;Ferrara(1999)J. Mol. Med. 77:527-543〇
[0012] 抗 VEGF 抗体"贝伐单抗"（Bevacizumab)，也称作 "BV"、"rhuMAb VEGF"、或 "AvastinK"，是依照 Presta et al.(1997)Cancer Res. 57:4593-4599 生成的一种重组 人源化抗VEGF单克隆抗体，当前在美国获得批准用于治疗转移性结肠直肠癌、非小细胞肺 癌、和转移性乳腺癌。与其它癌症治疗方法一样，Avastin?.疗法与某些副作用有关，包括升 尚的尚血压的风险。
[0013] 当特定基因中的不同等位基因导致不同表型时，群体中存在遗传多态性。此类多 态性可以在决定治疗性药物的功效和安全性中发挥作用。例如，已经显示了 VEGF中的特定 多态性与乳腺癌的发病率有关。Schneider et al. (2008)Breast Cancer Research and Treatment 111:157-63〇
[0014] 别的预示特定疗法的功效或安全性的多态性的鉴定可用于更好地为那些会最佳 地受益于该疗法的患者调整该疗法。
[0015] 发明概述
[0016] 本发明部分基于VEGF中如下的多态性的鉴定，所述多态性在正在经历抗VEGF疗 法（包括用Avastin ^)的患者中预示升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性和/或升高 的高血压的风险。
[0017] -方面，本发明提供一种预测患者是否处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关 的高血压的风险的方法，包括对自所述患者分离的样品筛选选自VEGF(-1498C/T)和 VEGF(-634G/C)的基因组多态性，其中若相应的基因型包含VEGF(-1498C)或VEGF(-634G)， 则患者处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风险。在一些实施方案中，所述VEGF 拮抗剂是抗VEGF抗体，例如贝伐单抗。在一些实施方案中，所述治疗进一步包括施用抗肿 瘤组合物。在一些实施方案中，所述患者正在治疗癌症，例如乳腺癌。
[0018] 另一方面，本发明提供一种用于预测患者是否处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有 关的高血压的风险的试剂盒，包括对VEGF中选自下组的多态性特异性的第一寡核苷酸和 第二寡核苷酸：VEGF(-1498C/T)和VEGF(-634G/C)。在一些实施方案中，所述试剂盒中的所 述寡核苷酸对于扩增VEGF中包含这些多态性之一的区域是有用的。
[0019] 另一方面，本发明提供一种预测患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的 可能性的方法，包括对自所述患者分离的样品筛选VEGF(-2578C/A)或VEGF(-1154G/A)处 的基因组多态性，其中若相应的基因型包含VEGF(-2578AA)或VEGF(1154AA)，则患者具有 升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性。在一些实施方案中，所述VEGF拮抗剂是抗VEGF 抗体，例如贝伐单抗。在一些实施方案中，所述治疗进一步包括施用抗肿瘤组合物。在一些 实施方案中，所述患者正在治疗癌症，例如乳腺癌。
[0020] 另一方面，本发明提供一种用于预测患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗剂治 疗的可能性的试剂盒，包括对VEGF中选自下组的多态性特异性的第一寡核苷酸和第二寡 核苷酸：VEGF(-2578C/A)和VEGF(-1154G/A)。在一些实施方案中，所述试剂盒中的所述寡 核苷酸对于扩增VEGF中包含这些多态性之一的区域是有用的。
[0021] 本发明涉及下述各项。
[0022] 1. -种预测患者是否处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风险的方 法，包括对自所述患者分离的样品筛选VEGF(-1498C/T)处的基因组多态性，其中若相应的 基因型包含VEGF (-1498C)，则患者处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风险。
[0023] 2. -种预测患者是否处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风险的方 法，包括对自所述患者分离的样品筛选VEGF(-634G/C)处的基因组多态性，其中若相应的 基因型包含VEGF (-634G)，则患者处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风险。
[0024] 3.项1或2的方法，其中所述VEGF拮抗剂是抗VEGF抗体。
[0025] 4.项3的方法，其中所述抗VEGF抗体是贝伐单抗。
[0026] 5.项1或2的方法，其中所述患者正在用VEGF拮抗剂治疗癌症。
[0027] 6.项5的方法，进一步包括施用抗肿瘤组合物。
[0028] 7.项5的方法，其中所述癌症是乳腺癌。
[0029] 8.项5的方法，其中所述VEGF拮抗剂是抗VEGF抗体。
[0030] 9.项8的方法，其中所述抗VEGF抗体是贝伐单抗。
[0031] 10.项8的方法，进一步包括施用抗肿瘤组合物。
[0032] 11. -种用于预测患者是否处于升高的与VEGF拮抗剂治疗有关的高血压的风 险的试剂盒，包括对VEGF中选自下组的多态性特异性的第一寡核苷酸和第二寡核苷酸： VEGF(-1498C/T)和 VEGF(-634G/C)。
[0033] 12.项11的试剂盒，其中所述第一寡核苷酸和所述第二寡核苷酸可用于扩增包含 VEGF中选自下组的多态性的部分VEGF基因 ：VEGF (-1498C/T)和VEGF (-634G/C)。
[0034] 13. -种预测患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性的方法，包括 对自所述患者分离的样品筛选VEGF (-2578C/A)处的基因组多态性，其中若相应的基因型 包含VEGF (-2578AA)，则患者具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性。
[0035] 14. -种预测患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性的方法，包括 对自所述患者分离的样品筛选VEGF (-1154G/A)处的基因组多态性，其中若相应的基因型 包含VEGF (-1154AA)，则患者具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性。
[0036] 15.项13或14的方法，其中所述VEGF拮抗剂是抗VEGF抗体。
[0037] 16.项15的方法，其中所述抗VEGF抗体是贝伐单抗。
[0038] 17.项13或14的方法，其中所述患者用VEGF拮抗剂治疗癌症。
[0039] 18.项17的方法，进一步包括施用抗肿瘤组合物。
[0040] 19.项17的方法，其中所述癌症是乳腺癌。
[0041] 20.项17的方法，其中所述VEGF拮抗剂是抗VEGF抗体。
[0042] 21.项20的方法，其中所述抗VEGF抗体是贝伐单抗。
[0043] 22.项20的方法，进一步包括施用抗肿瘤组合物。
[0044] 23. -种用于预测患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗剂治疗的可能性的 试剂盒，包括对VEGF中选自下组的多态性特异性的第一寡核苷酸和第二寡核苷酸： VEGF(-2578C/A)和 VEGF(-1154G/A)。
[0045] 24.项11的试剂盒，其中所述第一寡核苷酸和所述第二寡核苷酸可用于扩增包含 VEGF中选自下组的多态性的部分VEGF基因：VEGF(-2578C/A)和VEGF(-1154G/A)。
[0046] 发明详述
[0047] 除非另有说明，本发明的实施将采用分子生物学（包括重组技术）、微生物学、细 胞生物学、生物化学和免疫学的常规技术，这些都在本领域的技术范围内。这些技术在文 献中有充分解释，诸如"Molecular Cloning:A Laboratory Manual"，第二版（Sambrook et al·，1989) ;"01igonucleotide Synthesis"（M.J.Gait 编，1984) ;"Animal Cell Culture"（R. I. Freshney 编，1987) ;"Metho