能抑制MAT2A基因表达的siRNA及其应用

文档序号:9320566阅读:624来源:国知局
能抑制MAT2A基因表达的siRNA及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物医药领域,具体涉及能抑制MAT2A基因表达的SiRNA及其应用。
【背景技术】
[0002] 肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,位居全 国癌症发病率第二位,每年因肝癌死亡的人数约为35万。目前,手术切除和肝移植是治疗 肝癌最有效的方法。但由于早期诊断率低、肝移植供体紧缺等原因,大部分患者失去了根 治性手术的机会,患者5年生存率仅为10-20%。经动脉灌注化疗栓塞(Transarterial chemoembolization,TACE)是不能手术切除肝癌的主要治疗手段,可促进肿瘤缺血性坏死, 抑制其生长,但栓塞难以彻底,术后的复发与转移始终是提高远期疗效的瓶颈;而传统的手 术、放疗、化疗或中药等方法的治疗效果欠佳。因此,寻求新的治疗模式迫在眉睫,而基因治 疗可能是从根本上解决这一难题的希望。
[0003] 肝细胞癌的多种基因出现异常表达,其中MAT基因较为特别。MAT基因可分为 MAT1A基因与MAT2A基因,编码唯一能催化合成S-腺苷蛋氨酸的酶一一腺苷蛋氨酸转移酶 (Methionine adenosyltransferase,MAT)。MAT 有三种同工酶,分别是 MATI、MATIII和 MATII,前两种是 MAT1A (Methionine Adenosyltransferase 1A)基因编码的产物,后一种 是 MAT2A(Methionine Adenosyltransferase 2A)基因编码的产物。MAT1A 基因主要在成 人肝脏中表达,而MAT2A基因在除肝脏以外的人体组织器官中广泛表达。有趣的是,胎肝中 主要表达的是MAT2A,在胎儿出生后逐步被MAT1A取代。在肝癌中MAT2A被诱导重新表达, MAT1A的表达则发生沉默,这种转变为肝癌细胞生长提供有利条件。国内外学者针对MAT基 因已经做了多方面的研究,也取得可喜的成果。Cai等发现,恢复MAT1A表达的Huh-7细胞 内SAMe的含量增加了 52%,而DNA合成速率下降了 20%,肿瘤细胞生长速度减缓了 25% ; 再导入MAT2A反义RNA后,这些作用进一步增强。Li等构建过表达MAT1A的Huh-7稳定表 达细胞株,发现SAMe升高将近3倍,细胞凋亡率升高超过2倍,生长受抑制;体内实验显示, 过表达MAT1A的Huh-7在裸鼠成瘤速率下降约50 %,微血管密度下降40 %,SAMe含量升高 2倍。Liu等应用RNA干扰技术抑制MAT2A的表达,结果显示MAT2A基因的mRNA含量和MAT II活性均降低,细胞凋亡指数接近30 %。这些研究表明,针对MAT基因的干预可明显抑制肝 癌细胞的增殖,诱导细胞凋亡,减缓肿瘤的生长。然而,至今对于MAT1A和MAT2A联合干预 肝癌细胞成瘤的研究仍然较少,尤其是MAT基因的表达失调对肝癌血管生成及侵袭转移是 否有影响,目前尚未见报道。
[0004] RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指一些外源性或内源性小双链RNA (small interfering RNA,siRNA)在细胞内根据碱基配对原则与相应的mRNA结合,诱导mRNA降 解,特异性、高效地阻断特定基因的表达,导致细胞出现相应基因表达缺失的技术。Guo等在 1995年将正义链或反义链RNA导入线虫体内,发现其par-1基因表达被特异性抑制了。随 后,Fire等在1998年证实,真正有效地抑制目的基因表达的是双链RNA,从此揭开RNAi的 神秘面纱。RNAi特异性降解同源mRNA,对基因的转录过程无影响,而是影响基因的翻译过 程,因此也称转录后基因沉默。RNAi效率高、特异性强、操作简单等特点,已经成为研究特定 基因功能的常用技术。

【发明内容】

[0005] 本发明的第一个目的是提供一种能抑制MAT2A基因表达的siRNA。
[0006] 本发明的能抑制MAT2A基因表达的siRNA,其特征在于,包括siRNA MAT2A-1或 siRNA MAT2A-2 ;
[0007]所述的 siRNA MAT2A-1,其正义链为:5' -GCAACA⑶CACCAGAUAUU-3'(如 SEQ ID NO. 2 所示),其反义链为:5' -AAUAUCUGGUGACUGUUGC-3'(如 SEQ ID NO. 3 所示);
[0008]所述的 siRNA MAT2A-2,其正义链为:5' -GCCUAUGGCCACUUUGGUA-3'(如 SEQ ID NO. 4 所示),其反义链为:5' -UACCAAAGUGGCCAUAGGC-3'(如 SEQ ID NO. 5 所示)。
[0009] 本发明的第二个目的是提供一种抑制MAT2A基因表达的慢病毒表达载体,其特征 在于,其是将能抑制MAT2A基因表达的siRNA转入慢病毒载体而得到的。
[0010] 所述的载体为慢病毒载体P⑶H-U6。
[0011] 本发明的第三个目的是提供过表达MAT1A基因的慢病毒载体联合抑制MAT2A基因 表达的慢病毒表达载体在制备抑制肝癌药物中的应用,所述的MAT1A基因的核苷酸序列如 SEQ ID NO. 1的第256位-1443位碱基所示。
[0012] 所述的抑制肝癌的药物是抑制肝癌血管生成、肝癌迀移和侵袭、肝癌肺转移的药 物。
[0013] 过表达MAT1A基因的慢病毒载体优选是将MAT1A基因插入慢病毒载体p⑶H-CMV 的酶切位点EcoR I和BamH I之间而得到的。
[0014] 通过GenBank搜索,获得人源MAT1A的cDNA序列(Gene ID:4143,其序列如SEQ ID NO. 1所示,具体的MAT1A基因如SEQ ID NO. 1的第256位-1443位碱基所示),设计引 物并经PCR扩增cDNA后,使用EcoR I和BamH I进行酶切,再与经过同样酶切的慢病毒载 体pCDH-CMV连接;然后转化感受态大肠杆菌DH5 a进行扩大培养;进行纯化质粒后可得到 表达MAT1A基因的慢病毒载体p⑶H-MAT1A,测序验证其序列的正确性;通过将慢病毒载体 转染SMMC-7721细胞后验证转染后MAT1A基因的mRNA水平显著升高。
[0015] 敲低MAT2A的慢病毒载体是采用siRNA表达载体法来实现的。根据在GenBank 中搜索确定人源MAT2A的mRNA序列(Gene ID:4144),设计并筛选得到了可有效抑制 SMMC-7721 中 MAT2A 的 mRNA 表达的 siRNA MAT2A-1 和 siRNA MAT2A-2,再合成对应的 siDNA 序列,经PCR扩增后,使用Cal I和BamH I进行酶切,再与经同样酶切的慢病毒载体 p⑶H-U6连接;转化感受态大肠杆菌DH5 a进行扩大培养;纯化质粒后可得到敲低MAT2A的 慢病毒载体P⑶H-sh-MAT2A-l和p⑶H-sh-MAT2A-2,测序验证其序列的正确性;通过将慢病 毒载体转染SMMC-7721细胞后验证转染慢病毒载体pCDH-sh-MAT2A-l和pCDH-sh-MAT2A-2 的SMMC-7721细胞中MAT2A的mRNA水平显著降低。
[0016]将构建好的慢病毒载体 pCDH-MATIA、pCDH-sh-MAT2A-l、pCDH-sh-MAT2A-2 以 及空载体质粒P⑶H-CMV、p⑶H-U6进行慢病毒包装,经过293T细胞扩增,浓缩后得到高 滴度的慢病毒。将已经浓缩回收的5种慢病毒进行重组,得到以下6个组合:p⑶H-CMV/ PCDH-U6 (control)、pCDH-MATlA/pCDH-U6 (MATlA+pCDH)、pCDH-CMV/pCDH-sh-MAT2A-l (pCDH +sh-MAT2A-l)、pCDH-CMV/pCDH-sh-MAT2A-2 (pCDH+sh-MAT2A-2)、pCDH-MATlA/pCDH-sh-MAT 2A-1 (MATlA+sh-MAT2A-l)和 pCDH-MATlA/pCDH-sh-MAT2A-2 (MATlA+sh-MAT2A-2)。根据分 组,将慢病毒组合分别感染SMMC-7721细胞,利用嘌呤霉素筛选出稳定表达细胞株;通过半 定量RT-PCR验证mRNA的表达,利用Western blot检测蛋白表达情况,Western blot检测 结果和RT-PCR的基本保持一致。
[0017] 利用内皮细胞管形成实验证实低表达MAT2A基因、高表达MAT1A基因抑制肝细胞 癌血管生成的能力,两者联合时效果更强。利用小室迀移、小室侵袭和动物实验证实低表达 MAT2A基因联合高表达MAT 1A基因能抑制肝癌血管生成、肝癌迀移和侵袭、肝癌肺转移。
[0018] 本发明的利用siRNA敲低表达MAT2A基因且联合高表达MAT1A基因的用于肝细胞 癌,具有良好的抑制肝癌血管生成、肝癌迀移和侵袭、肝癌肺转移的效果;可进一步将其应 用于肝癌疾病的治疗,具有很高的理论和应用价值。
【附图说明】
[0019] 图1是SMMC-7721细胞转染siRNA后MAT2A的mRNA表达半定量RT-PCR图。以 GAPDH 为内参,siRNA-N、siRNA-c、siRNA-3、siRNA-2 和 siRNA-1 分别代表不转染、转染阴 性对照 siRNA MAT2A-C、转染 siRNA MAT2A-3、转染 siRNA MAT2A-2、转染 siRNA MAT2A-1 的 SMMC-7721 细胞。
[0020] 图2是SMMC-7721细胞转染pCDH-MATIA后MAT1A的mRNA的表达半定量RT-PCR 图。以GAPDH为内参,SMMC-7721、pCDH和pCDH-MATIA分别代表不转染、转染pCDH-CMV空 载体和转染pCDH-MATIA的SMMC-7721细胞。
[0021] 图 3 是 SMMC-7721 细胞转染 pCDH-sh-MAT2A-l 或 pCDH-sh-MAT2A-2 后 MAT2A 的 mRNA 的表达半定量 RT-PCR 图。以 GAPDH 为内参,SMMC-7721、pCDH、sh_MAT2A_l 和sh-MAT2A-2分别代表不转染、转染pCDH-U6空载体、转染pCDH-sh-MAT2A-l和转染 pCDH-sh-MAT2A-2 的 SMMC-7721 细胞。
[0022] 图4是稳定株中MAT1A和MAT2A的mRNA的表达半定量RT-PCR图。以GAPDH为 内参,Control、pCDH+sh-MAT2A-l、pCDH+sh-MAT2A-2、MATlA+pCDH、MATlA+sh-MAT2A-l、 MAT lA+sh-MAT2A-2分别代表转染的质粒载体类型为pCDH-CMV/pCDH-U6、pCDH-CMV/ pCDH-sh-MAT2A-l、pCDH-CMV/pCDH-sh-MAT2A-2、pCDH-MATlA/pCDH-U6、pCDH-MATIA/ pCDH-sh-MAT2A-l、pCDH-MATlA/pCDH-sh-MAT2A-2 的 SMMC-7721 细胞稳定株。
[0023] 图5是稳定株中MAT1A与MAT2A蛋白含量Western blot检测图。以GAPDH为 内参,Control、pCDH+sh-MAT2A-l、pCDH+sh-MAT2A-2、MATlA+pCDH、MATlA+sh-MAT2A-l、 MAT lA+sh-MAT2A-2分别代表转染的质粒载体类型为pCDH-CMV/pCDH-U6、pCDH-CMV/ pCDH-sh-MAT2A-l、pCDH-CMV/pCDH-sh-MAT2A-2、pCDH-MATlA/pCDH-U6、pCDH-MATIA/ pCDH-sh-MAT2A-l、pCDH-MATlA/pCDH-sh-MAT2A-2 的 SMMC-7721 细胞稳定株。
[0024] 图6是稳定株诱导HUVECs (脐静脉内皮细胞)管生成结果图。SFM、TCM、MAT1A、 sh-MAT2A-2、MATlA+sh-MAT2A-2分别代表无血清培养基、未转染细胞、转染pCDH-MATIA细 胞、转染 pCDH-sh-MAT2A-2 细胞、转染 pCDH-MATlA/pCDH-sh-MAT2A-2 的 SMMC-7721 细胞上 清液。
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