猴逆转录病毒的rt-lamp检测引物组、试剂盒及其检测方法

文档序号:9466972阅读:767来源:国知局
猴逆转录病毒的rt-lamp检测引物组、试剂盒及其检测方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于分子生物学技术领域,设及实验动物相关病原的检测方法,具体设 及一种猴逆转录病毒(SRV)的RT-LAMP(ReverseI'ranscriptionandLoop-mediated IsothermalAmplification,反转录环介导等溫扩增反应)检测引物组、检测试剂盒及检测 方法。
【背景技术】
[0002] 猴逆转录病毒(SimiantypeDretrovirus,SRV),属于逆转录病毒科、肿瘤病毒 亚科的D型病毒。SRV具有逆转录病毒所共有的特性,是单链RNA病毒,内含逆转录酶,病毒 颗粒呈球形,直径80-lOOnm,囊膜上缺乏明显的纤突,感染细胞浆内的病毒为A型颗粒,细 胞外未成熟病毒的核屯、为圆形,成熟病毒的核屯、为圆柱状。病毒W出芽的方式从细胞膜上 释放。SRV可在多种猴的细胞包括猴的B细胞、T细胞、成纤维细胞、唾液腺上皮细胞、膜腺 细胞等中生长。SRV为猴艾滋病的主要病原体之一,.感染后临床上表现为顽固性腹泻、体 重减轻、全身性淋己腺病脾肿大、贫血、中性白细胞减少、淋己细胞减少、坏死性口炎、腹膜 后纤维瘤病等。
[0003] 到目前为止,发现感染SRV病毒并产生猴艾滋病的非人灵长类动物主要是雜猴属 的动物。近年来,已有SRV感染人的报道。SRV必须通过直接接触才能在猴间进行传播, 主要通过猴间相互撕咬使含于唾液中的病毒进入伤口而传播,而在所有的分泌物和排泄物 中,唾液含病毒量最高。SRV也能通过性传播和经胎盘传播。SRV对不同年龄的猴致病性有 差异,3岁W上的猴抵抗力较未成年猴强,6个月至2岁半的猴最易感,6个月W下的猴有母 源抗体的保护。雄猴和雌猴均易感染,但雌猴的病例较多。
[0004] SRV已经被确认为是导致SAIDS的病原体,因此,在猴艾滋病动物模型建立之前一 定要排除运种病原体的干扰。SRV感染的诊断除了检查临床症状,还要结合实验室诊断方 法,常用的实验室诊断方法有PCR法、酶联免疫吸附试验(ELISA)法、间接免疫巧光(IFA) 法、免疫印迹(WB)法、病毒分离法等。PCR法快速、灵敏,但其扩增产物需要进行再一次验 证。病毒分离需要进行细胞培养,周期长、对试验设备要求高,因此,该方法不适合一般的检 。目前,对SRV的检测常用ELISA法和IFA法作为初筛,还必须用WB检测特异性抗体才 能最终确诊。ELISA法和IFA法检测的假阳性率高及WB法操作程序复杂,在一定程度上限 制了其应用范围。因此,不论是为了保障整个猴群的健康还是饲养人员、科研人员的人身安 全,都有必要建立一种方便、快捷、灵敏、特异性强的检测方法。

【发明内容】

[0005] 本发明的一个目的在于提供一种猴逆转录病毒的RT-LAMP检测引物组。
[0006] 本发明的另一个目的在于提供一种猴逆转录病毒的RT-LAMP检测试剂盒。
[0007] 本发明的另一个目的在于提供猴逆转录病毒的RT-LAMP检测方法。
[000引本发明所采取的技术方案是: 一种用于快速检测猴逆转录病毒的RT-LAMP检测引物组,其包括一对外引物和一对内 引物,其核巧酸序列分别如下所示: 外引物:
[0009] 一种用于快速检测猴逆转录病毒的RT-LAMP检测试剂盒,其包括上述检测引物 组。
[0010] 进一步的,所述猴逆转录病毒的RT-LAMP检测试剂盒中,外引物、内引物的摩尔比 为 1 :8。
[0011] 进一步的,所述猴逆转录病毒的RT-LAMP检测试剂盒中还含有DNA聚合酶、逆转录 酶、RT-LAMP反应液、阳性对照和阴性对照、显色液。
[0012] 进一步的,所述DNA聚合酶为BstDNA聚合酶,所述逆转录酶为AMV逆转录酶。
[001引进一步的,所述RT-LAMP反应液含有IOmM dNTP、IOX化ermo化1反应缓冲液、 150mM M拆04水溶液。
[0014] 进一步的,所述阳性对照为含有目的基因片段的质粒DNA,阴性对照为DEPC水。
[0015] 进一步的,所述显色液含有750mM巧黄绿素和5mMMnClz的溶液。
[0016] 一种猴逆转录病毒的RT-LAMP检测方法,包括如下步骤: O待检样品RNA的提取; 2) 利用权利要求1的引物组对待检样品进行反转录环介导等溫扩增反应; 3) 结果分析:根据反应液颜色变化判定结果,澄色为阴性,绿色为阳性; 进一步的,步骤2)反转录环介导等溫扩增反应的25 反应体系含有:SRV-F3 0. 2yM,SRV-B3 0. 2yM,SRV-FIP1. 6yM,SRV-BIP1. 6yM,RT-LAMP反应液 12. 5",DNA聚合酶8U,逆转录酶2.抓,待检RNA1~10化g,显色液2. 5y1,用DEPC水补齐到25y1 ;然 后于63~65°C反应45~60min。
[0017] 上述检测方法用于非疾病检测或诊断。
[0018] 本发明的有益效果是: 本发明具有高特异性、高灵敏度、快速高效、操作简便、结果易读等有益效果: O高特异性: 本发明根据猴逆转录病毒(SRV) (GenBank登录号为M11841. 1)的主要包膜蛋白基因 (ecK)的部分序列设计了 4条特异性引物,应用上述4条引物,扩增祀序列的6个区域,6个 区域中任何区域与引物不匹配均不能进行核酸扩增,故其特异性极高,且非常稳定,形成引 物二聚体概率低,保证了反应的顺利进行; 2) 高灵敏度:最低检测极限可达到Ifg/y1含SRV目标片段的质粒DNA; 3) 快速高效:整个扩增只用45~60min即可完成,扩增产量可达IO9~10 1°个拷贝; 4) 操作简便:不需要复杂的仪器,不需要特殊试剂,不需要预先进行反转录等繁琐步 骤,只需要恒溫水浴锅即可反应,条件比较溫和; 5)结果易读:通过肉眼观察反应管内颜色变化即可判读检测结果,无需电泳等其他任 何分析步骤,适合非专业人:t的现场检测。
【附图说明】
[0019] 图1是实施例3特异性的检测结果图(1:SRVRNA;2:SIVRNA;3:HTLVRNA;4 : DEPC水对照); 图2是实施例4灵敏度的检测结果图(53¥0臟,1:100口邑/^1质粒0臟61?¥);2:10口邑/ 质粒DNA(SRV) ;3:Ipg/质粒DNA(SRV) ;4:IOOfg/质粒DNA(SRV) ;5:IOfg/ 质粒DNA(SRV) ;6:lfg/yl质粒DNA(SRV) ;7:0.1fg/yl质粒DNA(SRV) ;8:DEPC水对照)。
【具体实施方式】
[0020] W下结合实施例对本发明作进一步的说明,但并不局限于此。
[0021] 实施例1猴逆转录病毒RT-LAMP检测试剂盒的建立 猴逆牵专录病毒的RT-LAMP(ReverseTranscription曰ndLoop-mediatedIsotherm曰I Amplification,反转录环介导等溫扩增反应)检测试剂盒,包括RT-LAMP引物组、RT-LAMP 反应液、化迅NA聚合酶、逆转录酶、阳性对照和阴性对照、显色液。
[0022] (1)RT-LAMP引物设计:W猴逆转录病毒(SRV)的主要包膜蛋白基因(ecK)为祀基 因,利用软件在线设计SRV特异性R
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