一种提取rna的提取液和方法

文档序号:9682203阅读:1368来源:国知局
一种提取rna的提取液和方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于分子生物学技术领域,涉及核酸的提取。
【背景技术】
[0002] 分子生物学实验经常需要从样品中提取核酸物质,用于后续的PCR扩增。目前,提 取DNA通常采用水煮法,即,通过水煮10-20分钟裂解样品,利用EDTA、Chele X-100树脂等螯 合剂螯合掉样品裂解后所释放的干扰后续PCR反应的金属离子,从而得到可用于PCR反应的 DNA。水煮法具有简便、易操作、核酸提取率高等特点,广泛应用于疾控、法医等领域(杨电, 刘超,徐曲毅,胡慧英.Chelex-100法提取脱落细胞检材DNA的实时定量研究[J].刑事技术 .2009(05);钱雪琴,张军,沈芳.Chelex-100法和碱性裂解法提取细菌DNA的比较[J].中国 卫生检验杂志.2008(08)) ANA通常用TRIzol法、硅胶柱和磁珠法等方法提取(Trizol:美国 专利号5346994;钟海军,唐孝亮,曾刚毅.核酸纯化柱提取核酸定量检测丙型肝炎病毒RNA 的临床应用[J ].检验医学与临床.2008 (13);何世成,林源,王昌建,刘道新,谭丹,唐小明, 王卫国,鲁杏华,邱立新,何玉玲.五种核酸提取法对猪繁殖与呼吸综合征病毒提取效率的 比较.[J].中国动物检疫.2014(8))。然而TRIzol法中使用的重蒸酚具有毒性;硅胶法、磁珠 法等费用较高,且提取率不高;而普通的水煮法无法直接用于提取RNA,主要是因为样品中 存在内源性的RNA酶,而这些RNA酶会将RNA降解。因此,本领域需要一种能够简便易操作且 能够高效率提取RNA的方法。

【发明内容】

[0003] 本发明的目的是提供一种可以用于水煮法提取RNA的提取液以及一种水煮法提取 RNA的方法,以解决水煮法不能提取用于PCR的RNA的问题。
[0004] 本发明的一个方面是提供一种RNA提取液,用于提取病毒(包括但不限于流感病 毒)拭子、全血等样品中的RNA,所述提取液包含RNA酶抑制剂、阳离子螯合剂、去污剂和反应 缓冲液等成分,其中所述RNA酶抑制剂为尿素和氧钒核糖核酸复合物中的一种或几种的组 合,所述阳离子螯合剂为EDTA、8-羟基喹啉螯合树脂、聚苯乙稀吡啶树脂、Chelex-100树脂、 壳聚糖改性树脂、冠醚树脂和丝瓜络中的一种或几种的组合,所述去污剂是吐温20、 Triton-XlOO和对羟基苯甲酸甲酯中的一种或几种的组合,所述反应缓冲液是醋酸钾/冰醋 酸缓冲液、氯化钾/HC1缓冲液、甘氨酸/盐酸缓冲液或HAc/NaAc缓冲液。
[0005] 优选地,所述尿素的浓度是1~4M;更优选地,尿素的浓度是2.2M。
[0006] 优选地,所述氧钒核糖核酸复合物的浓度是10~100mM;更优选地,氧钒核糖核酸 复合物的浓度是30mM。
[0007] 优选地,所述EDTA的浓度是0.1~5mM;更优选地,所述EDTA的浓度是1.5mM。
[0008] 优选地,所述8-羟基喹啉螯合树脂的浓度是5 %~10 % W/V,更优选地,8-羟基喹啉 螯合树脂的浓度是8 % W/V。
[0009] 优选地,所述聚苯乙烯吡啶树脂的浓度是5 %~10 % W/V,更优选地,聚苯乙烯吡啶 树脂的浓度是8%W/V。
[0010] 优选地,所述Chelex-100树脂的浓度是5%~10%W/V,更优选地,Chelex-100树脂 的浓度是8%W/V。
[0011] 优选地,所述壳聚糖改性树脂的浓度是5 %~10 % W/V,更优选地,壳聚糖改性树脂 的浓度是8%W/V。
[0012] 优选地,所述冠醚树脂的浓度是5%~10%W/V,更优选地,冠醚树脂的浓度是8% ff/Vo
[0013] 优选地,所述丝瓜络的浓度是5 %~10 % W/V,更优选地,丝瓜络的浓度是8 % W/V。 [0014] 优选地,所述吐温20的浓度是0.1 %~2 % W/V,更优选地,吐温20的浓度是0.5 % W/ V。
[0015] 优选地,所述Triton-ΧΙΟΟ的浓度是0.1%~2%1八,更优选地,1^切111100的浓 度是 0.5%W/V。
[0016] 优选地,所述对羟基苯甲酸甲酯的浓度是0.1 %~0.2 % W/V,更优选地,对羟基苯 甲酸甲酯的浓度是〇. 1 % W/V。
[0017]优选地,所述醋酸钾/冰醋酸缓冲液的浓度(钾离子浓度)是20~500mM,更优选地, 浓度是100mM;该缓冲液的pH值范围是4.0~5.5,更优选地,pH值是4.8。
[0018]优选地,所述氯化钾/HC1缓冲液的浓度(钾离子浓度)是20~500mM,更优选地,浓 度是100mM;该缓冲液pH值范围是4.0~5.5,更优选地,pH值是4.8。
[0019 ]优选地,所述甘氨酸/盐酸缓冲液的浓度(甘氨酸浓度)是10~100mM,更优选地,浓 度是50mM;该缓冲液pH值范围是4.0~5.5,更优选地,pH值是4.8。
[0020] 优选地,所述HAc-NaAc缓冲液的浓度(钠离子浓度)是50~500mM,更优选地,浓度 是200mM;该缓冲液的pH值范围是4.0~5.5,更优选地,pH值是4.8。
[0021] 进一步地,一种优选的提取液的成分为:尿素2.2M,氧钒核糖核酸复合物30mM, EDTA 1.5mM,Chelex-100 树脂 8%W/V,吐温 200.5%W/V,TritonX-1000.5%W/V,对羟基苯甲 酸甲酯〇. 1 %W/V,甘氨酸/盐酸缓冲液(甘氨酸浓度)50mM,pH 4.8。
[0022] 本发明的第二个方面提供一种提取RNA的方法,包括:向样品中加入本发明的RNA 提取液,样品与RNA提取液的体积比为3:1,95~100°C加热5~20min,取出后用振荡器剧烈 振荡,12000 ~14000rpm 离心 15 ~30s。
[0023] 本发明的第三个方面是提供一种提取RNA的试剂盒,所述试剂盒包含本发明的RNA 提取液。
[0024] 本发明的第四个方面是提供本发明的RNA提取液在水煮法提取RNA中的应用。
[0025] 本发明的方法中,依靠高温水煮来裂解样品并释放核酸。释放核酸的同时,会有一 部分杂质阳离子也被释放出来,这部分离子会干扰实验,用阳离子螯合剂螯合掉;同时用去 污剂去除样本中的脂质、脂蛋白等。缓冲液选择酸性条件的缓冲液,且不含磷酸根、柠檬酸 根等可能与Mg离子结合沉淀的离子。释放核酸的同时,会有内源性RNA酶释放出来。选用合 适的抑制剂,如尿素或氧钒核糖核酸复合物等,既能灭活RNA酶(尿素可以变性蛋白),又不 会干扰后面的PCR反应(Taq酶可以耐受),从而避免RNA被降解,仅利用水煮法即可获得能够 用于PCR反应的RNA,使得RNA的提取简单易行,成本降低。
【附图说明】
[0026] 图1是TRIzol法(Thermo Fisher货号:15596-026,按说明书操作)提取禽流感病毒 H5亚型血凝抑制试验抗原RNA的PCR扩增图;
[0027]图2是利用本发明的水煮法提取禽流感病毒H5亚型血凝抑制试验抗原RNA的PCR扩 增图;
[0028] 图3是TRIzol法(Thermo Fisher货号:15596-026,按说明书操作)提取禽流感病毒 H7N9亚型血凝抑制试验抗原RNA的PCR扩增图;
[0029]图4是利用本发明的水煮法提取禽流感病毒H7N9亚型血凝抑制试验抗原RNA的PCR 扩增图;
[0030] 图5是阴性对照结果图。
【具体实施方式】
[0031] 下面结合具体的实施方式说明本
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