抗cd138嵌合抗原受体、编码基因、重组表达载体及其构建方法和应用

文档序号:10466342阅读:603来源:国知局
抗cd138嵌合抗原受体、编码基因、重组表达载体及其构建方法和应用
【专利摘要】本发明公开了一种抗CD138嵌合抗原受体、编码基因、重组表达载体及其构建方法和应用。该抗CD138嵌合抗原受体包括依次串联的CD8 leader嵌合受体信号肽、CD138单链抗体轻链VL、Optimal Linker C、CD138单链抗体重链VH、CD8 Hinge嵌合受体铰链、CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、CD137嵌合受体共刺激因子,以及TCR嵌合受体T细胞激活域。此外,还公开了该抗CD138嵌合抗原受体的编码基因、重组表达载体及其构建方法和应用。本发明能显著提高细胞因子的分泌、CAR?T细胞的体外杀伤作用,且临床治疗效果突出。
【专利说明】
抗CD138嵌合抗原受体、编码基因、重组表达载体及其构建方 法和应用
技术领域
[0001] 本发明属于肿瘤免疫治疗技术领域,具体涉及一种抗CD138嵌合抗原受体、编码基 因、重组表达载体(尤其是一种基于复制缺陷性重组慢病毒的CAR-T转基因载体)及其构建 方法和应用。
【背景技术】
[0002] 肿瘤免疫治疗的理论基础是免疫系统具有识别肿瘤相关抗原、调控机体攻击肿瘤 细胞(高度特异性的细胞溶解)的能力。这个生物过程十分复杂,目前仍处于研究之中。上世 纪90年代,多个科研小组已经发现了肿瘤抗原(twnor antigens),T淋巴细胞可以通过主要 组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)依赖性方式识别这些肿瘤 抗原。
[0003] 肿瘤免疫治疗通常分为两类,非特异性免疫和特异性免疫。非特异性免疫治疗主 要包括白细胞介素-2( interleiikin-2,IL-2),干扰素a( interf erona,IFN-a),肿瘤坏死因 子(tymor necrosisfactor,TNF-a),卡介苗等细胞因子和毒素,过继性细胞免疫治疗等。特 异性免疫治疗主要是肿瘤疫苗。
[0004] 1.1肿瘤非特异性免疫治疗
[0005] 非特异性免疫应答是与生倶来的,它的形成并不需要抗原刺激,能广泛地针对多 种抗原,是免疫应答的基础,但特异性不强,对某种特定抗原物质往往不能产生足够强度的 反应非特异性的免疫治疗。在进入临床试验的多种细胞因子中,白细胞介素-2和干扰素应 用最为广泛[Rosenberg S A,Lotze M L M,et al .A progressreport on the treatment of 157patients with advanced cancerasing lymphokine-activated killer cells and interletikin-2orhigh-dose interletikin-2alone[J] .NEngl J Med, 1987,316(15):889-897.]。
[0006] 1.2肿瘤单克隆抗体的免疫治疗
[0007] 近20多年来单克隆抗体已在肿瘤治疗领域得到广泛应用。抗肿瘤单抗药物一般包 括两类:一是抗肿瘤单抗,二是抗肿瘤单抗偶联物,或称免疫偶联物。免疫偶联物分子由单 抗与"弹头"药物两部分组成,"弹头"主要包括放射性核素、药物和毒素,与单抗连接后分别 构成放射免疫偶联物、化学免疫偶联物和免疫毒素。在1997年11月和1998年10月美国FDA分 别通过了用于临床肿瘤治疗的两个单抗一 Ritiiximab(ritiixan)和Trastiizymab (herceptin)[Dillman R 0.Magic bullets at lastIFinally-approval of amonoclonal antibody for the treatment of cancer [J].CancerBiother Radiopharm,1997,12:223 - 225.]。目前认为单抗的作用机制有阻断作用、信号传导作用以 及靶向作用等三种作用机制,没有直接的杀伤作用。另外还存在药理学方面的问题,主要是 到达肿瘤的药量不足。由于偶联物是异体蛋白,会被网状内皮系统摄取,有相当数量将积聚 于肝、脾和骨髓。偶联物是大分子物质,通过毛细血管内皮层及穿透肿瘤细胞外间隙均受到 限制。
[0008] 1.3肿瘤的过继免疫治疗
[0009] 肿瘤的过继免疫治疗是指将体外激活的自体或异体免疫效应细胞输注给患者,以 杀伤患者体内的肿瘤细胞。肿瘤过继性免疫治疗中的一个关键问题是寻找合适的肿瘤杀伤 细胞。自上世纪80年代以来,包括LAK、细胞因诱导的杀伤细胞(cytokine-indycedki 1 lers, CIK)、TIL等细胞已先后应用于临床,但由于存在着扩增倍速较低、细胞来源困难、细胞毒力 不高等诸多问题,在临床应用上受到限制。如何提高T细胞的肿瘤抗原特异性具有重要的临 床意义。T细胞对肿瘤抗原的识别主要是通过T细胞受体(T cell receptor,TCR)识别肿瘤 细胞表面的人类白细胞抗原(hyman leykocyte antigen,HLA)-肽复合物,因此,T细胞对肿 瘤抗原识别的特异性取决于T细胞表面的TCR。利用分子生物学的手段克隆肿瘤特异性T细 胞的TCR,并通过构建含TCR的病毒载体,把TCR转入正常的T细胞中,使这些T细胞因携带肿 瘤特异性而成为特异性肿瘤杀伤细胞[Johnson L A,Morgan R A,Dydley M E,et al .Gene therapywith human and mouse T-cell receptors mediates cancerregression and targets normal tissues expressing cognate antigen[J]?Blood,2009,114(3): 535 - 546.]〇
[0010] 1.4肿瘤疫苗治疗
[0011] 肿瘤疫苗治疗是通过给患者体内导入肿瘤抗原来激发患者的特异性抗肿瘤免疫 反应。由于疫苗治疗具有特异性、在体内免疫效应维持时间长等优点,目前已成为研究热 点。近年来多肽疫苗、核酸疫苗、全蛋白疫苗、抗独特性抗体疫苗、重组病毒疫苗、细菌疫苗、 基因修饰的肿瘤细胞疫苗、树突状细胞(dendriti CCells,DC)疫苗等得到广泛研究和应用 [Robbins P F,Morgan R A,Feldman S A,et al.Tumor regressionin patients with metastatic synovial cell sarcoma andmelanomausing genetically engineered lymphocytes reactivewith NY-ES0_1[J].J Clin Oncol,2011,29(7):917 -924.]。肿瘤 疫苗治疗的大规模应用还有三个方面的问题亟待解决。首先,肿瘤相关抗原,每个肿瘤、每 个亚型、每个肿瘤分期,这些相对抗原表达是不一样的,所以选准抗原,选准病人人群是致 关重要的。第二,如何达到肿瘤抗原在树突状细胞中髙效吸收与表达?抗原被树突状细胞吸 收是以表面受体为介导的。树突状细胞有十几个受体,如何根据特定的抗原选择相应的受 体?第三,针对树突状细胞分化成熟的调控。树突状细胞的分化成熟是一个非常复杂的过 程,它既可走向激活T细胞也可以走向抑制T细胞。[靶向DC细胞的治疗型肿瘤疫苗:亮点与 挑战并存。
[0012] http://www.biodiscover.com/news/research/115794.html]
[0013] 1.5肿瘤 CAR-T 治疗
[0014] CAR-T,全称是Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy,嵌合抗原受 体T细胞免疫疗法,结构如图 1 所不[Eleanor J.Cheadle,et al.CAR T cells:driving the road fromthe laboratory to the clinic.Immunological Reviews 2014.Vol.257:91-106]〇
[0015]第一代CAR介导的T细胞激活是通过⑶3z链或FceRIg上的酪氨酸激活基序完成的。 CD3z链能够提供T细胞激活、裂解靶细胞、调节IL-2分泌以及体内发挥抗肿瘤活性所需的信 号。但第一代CAR改造T细胞的抗肿瘤活性在体内受到了限制,T细胞增殖减少最终导致T细 胞的凋亡。
[0016]第二代CAR在胞内增加了一个新的共刺激信号,实验证明,这使得原有的使源自 TCR/CD3复合体的"信号1"扩大,许多研究都表明,搭载了 "信号2"的第二代CAR与第一代CAR 相比,抗原特异性不变,T细胞增殖、细胞因子分泌增加,抗细胞凋亡蛋白分泌增加,细胞死 亡延迟。常用的共刺激分子为⑶28,但之后有研究将⑶28用⑶137(4-1BB)进行替换,除此之 外,一种使用NK细胞受体CD244的思路也被提出来。虽然不同的第二代CAR究竟孰优孰劣,不 同的研究者用不同的肿瘤在体内和体外的研究中得到的结果不尽相同。[深度完整版:CAR-T的现状和未来?生物谷? 2015-051-15]
[0017]为了进一步改良CAR的设计,许多研究组开始着眼于发展第三代CAR,不仅包括"信 号1"、"信号2",还包括了额外的共刺激信号。不同研究者们用不同的靶点和共刺激信号开 展的研究所得到的第二代CAR和第三代CAR的比较结果存在一定的差异性。一些研究报道表 达第三代CAR的重组T细胞在抗肿瘤活性、存活周期及细胞因子释放方面均显著提高; Wilkie等的研究结果显示靶向MMC1的第二代CAR与第三代CAR重组T细胞在抗肿瘤细胞毒 性方面并无明显差异,虽然表达第三代CAR的T细胞能够分泌更大量的IFN-y (Wilkie S, Picco G,Foster J,et al.Retargeting of human T cells to tumorassociated MMC1: the evolution of a chimeric antigen receptor.J Immunol 2008;180:4901-4909?)〇 值得注意的是,上述区别仅仅是体外实验中获得的结论,目前尚未在体内比较第二代和第 三代CAR的报道。
[0018]这几代CAR之间的差异可能不止来自于信号传导域,胞外的抗原结合域(scFv)、重 组T细胞的转染方法(慢病毒VS逆转录病毒)、重组T细胞的回输方式(静脉回输VS腹膜VS瘤 体)等均可能影响CAR-T细胞的最终抗肿瘤效果。

【发明内容】

[0019] 本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供了一种抗CD138嵌合抗原受体、编码 基因、重组表达载体及其构建方法和应用。
[0020] 本发明的目的通过以下技术方案来实现:
[0021] 本发明的第一目的在于提供一种抗CD138嵌合抗原受体(二代CAR),包括依次串联 的如3£〇10勵.15所示的0)816 &〇^^嵌合受体信号肽、如3£〇10勵.16所示的0)138单链抗 体轻链¥1、如5£0 10勵.19所示的(^衍11^11^111?^(:、如5£0 10勵.20所示的〇)138单链抗 体重链¥11、如3£〇10腸.21所示的008把叫6嵌合受体铰链、如3£〇10腸.22所示的 ⑶8Transmembrane嵌合受体跨膜区、如SEQIDN0.23所示的⑶137嵌合受体共刺激因子,以 及如SEQ ID N0.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域。
[0022]进一步的,所述嵌合抗原受体的氨基酸序列如SEQ ID N0.50所示。
[0023] 一种抗⑶138嵌合抗原受体(三代CAR),包括依次串联的如SEQ ID NO. 15所示的 CD81eader嵌合受体信号肽、如SEQIDN0.16所示的CD138单链抗体轻链VL、如SEQID NO. 19所示的Optimal Linker C、如SEQ ID NO. 20所示的CD138单链抗体重链VH、如SEQ ID 勵.21所示的〇)8把即6嵌合受体铰链、如5£0 10如.22所示的〇)81'抑118111611113瓜116嵌合受体 跨膜区、如SEQID NO.25所示的⑶28嵌合受体共刺激因子、如SEQ ID NO.23所示的⑶137嵌 合受体共刺激因子、以及如SEQ ID N0.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域。
[0024] 进一步的,所述嵌合抗原受体的氨基酸序列如SEQ ID NO.51所示。
[0025] 本发明的第二目的在于提供一种编码上述抗CD138嵌合抗原受体的基因。
[0026] 进一步的,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID N0.52(二代CAR)或SEQ ID N0.53(三 代CAR)所示。
[0027]本发明的第三目的在于提供含有上述基因的重组表达载体。
[0028] 进一步的,所述重组表达载体为慢病毒表达载体、逆转录病毒表达载体、腺病毒表 达载体、腺相关病毒表达载体或质粒。
[0029] 进一步的,所述的慢病毒表达载体包含上述抗⑶138嵌合抗原受体的基因。
[0030]进一步的,所述的慢病毒表达载体包括:用于质粒复制的原核复制子pUC Ori序 列,如SEQ ID NO. 2所示;用于目的菌株大量扩增的含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列,如SEQ ID NO. 1所示;用于增强真核细胞内的复制的病毒复制子SV400ri序列,如SEQ ID NO. 3所 示;用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件;用于真核细胞表达绿色荧光的ZsGreenl绿色 荧光蛋白,如SEQ ID N0.11所示;用于共同转录表达蛋白质的IRES核糖体结合序列,如SEQ ID N0.12所示;用于嵌合抗原受体基因的真核转录的人EFla启动子,如SEQ ID N0.14所示; 用于组成集识别、传递、启动于一体的二代CAR或三代CAR的嵌合抗原受体的编码基因,如 SEQ ID N0.52或SEQ ID N0.53所示;用于增强转基因的表达效率的eWPRE增强型土拨鼠乙 肝病毒转录后调控元件,如SEQ ID N0.13所示。
[0031]进一步的,所述慢病毒包装顺式元件采用第二代慢病毒载体包括:如SEQ ID NO.5 所不的慢病毒5terminal LTR、如SEQ ID N0.6所不的慢病毒3terminal Self-Inactivating LTR、如SEQ ID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元 件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ ID NO. 10所示的cPPT顺式元件。
[0032]进一步的,所述慢病毒包装顺式元件采用第三代慢病毒载体包括:如SEQ ID NO. 5 所不的慢病毒5terminal LTR、如SEQ ID N0.6所不的慢病毒3terminal Self-Inactivating LTR、如SEQ ID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元 件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ ID NO. 10所示的cPPT顺式元件所述慢病毒 包装顺式元件,以及如SEQ ID NO.4所示的RSV启动子。
[0033]进一步的,所述eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件有6个核苷酸的增强 突变,具体为:g.396G>A、g.397C>T、g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T。
[0034]本发明的第四目的在于提供一种上述慢病毒表达载体的构建方法,包括以下步 骤:
[0035] (1)将含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列(如SEQ ID N0.1所示)、原核复制子pUC 〇ri序列(如SEQ ID NO.2所示)、病毒复制子SV400ri序列(如SEQ ID NO.3所示)、用于慢病 毒包装的慢病毒包装顺式元件、ZsGreenl绿色荧光蛋白(如SEQ ID勵.11所示)、11^3核糖 体结合序列(如SEQ ID ^).12所示)、洲?1^增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件(如5£〇 ID N0.13所示)存储于慢病毒骨架质粒上;
[0036] (2)将人EFla启动子(如SEQ ID N0.14所示)、用于组成集识别、传递、启动于一体 的二代CAR或三代CAR的嵌合抗原受体组合成二代CAR或三代CAR设计方案,经过酶切、连接、 重组反应克隆至慢病毒骨架质粒中,得到二代CAR或三代CAR设计的重组慢病毒质粒;
[0037] (3)将得到的重组慢病毒质粒与慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac_R以及膜蛋白质粒 pEnv-G共同转染HEK293T/17细胞,在HEK293T/17细胞中进行基因转录表达后,包装成功重 组慢病毒载体会释放到细胞培养上清中,收集包含的重组慢病毒载体的上清液;
[0038] (4)将得到的重组慢病毒上清采用抽滤、吸附、洗脱的离子交换方式进行纯化,分 别得到重组慢病毒载体。
[0039] 进一步的,步骤(1)中,所述慢病毒包装顺式元件采用第二代慢病毒载体包括:如 5£〇10勵.5所示的慢病毒5七6^1丨仙11^1?、如5£〇10勵.6所示的慢病毒3七6^11仙1561卜 111&(^"3^即1^1?、如5£〇10腸.7所示的638顺式元件、如5£〇10腸.8所示的1?1^顺式元 件、如3£〇10勵.9所示的61^顺式元件、如3£〇10勵.10所示的〇??1'顺式元件;所述慢病毒 包装顺式元件采用第三代慢病毒载体包括 :如3£〇10勵.5所示的慢病毒5丨6^^11&11^1?、 如3£〇10腸.6所不的慢病毒3七61'111;[仙1361;1^-111&(31:;[¥&1:;[1^1^1?、如3£( >)10腸.7所不的 6&8顺式元件、如3£010勵.8所示的1?1^顺式元件、如3£010^).9所示的61^顺式元件、如 SEQ ID N0.10所示的cPPT顺式元件所述慢病毒包装顺式元件,以及如SEQ ID N0.4所示的 RSV启动子。
[0040] 进一步的,步骤(2)中,所述用于组成集识别、传递、启动于一体的二代CAR的嵌合 抗原受体包括:如3£0 10勵.15所示的〇)816&(^嵌合受体信号肽、如3£0 10勵.16所示的 〇)138单链抗体轻链¥1、如5£0 10勵.19所示的(^衍11^11^111?^(:、如5£0 10勵.20所示的 〇)138单链抗体重链¥11、如3£0 10勵.21所示的〇)8把即6嵌合受体铰链、如3£0 10勵.22所 示的⑶8Transmembrane嵌合受体跨膜区、如SEQIDN0.23所示的⑶137嵌合受体共刺激因 子、如SEQ ID N0.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域;所述用于组成集识别、传递、启动于 一体的三代CAR的嵌合抗原受体包括:如SEQ ID N0.15所示的⑶81eader嵌合受体信号肽、 如5£0 10勵.16所示的〇)138单链抗体轻链¥1、如5£0 10勵.19所示的(^衍11^11^111?^(:、 如3£0 10勵.20所示的〇)138单链抗体重链¥11、如3£0 10^).21所示的〇)8把即6嵌合受体 铰链、如3£0 10勵.22所示的〇)81'瓜118111611113瓜116嵌合受体跨膜区、如3£0 10^).25所示的 ⑶28嵌合受体共刺激因子、如SEQ ID N0.23所示的⑶137嵌合受体共刺激因子、以及如SEQ ID N0.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域。
[0041]进一步的,步骤(1)中,所述eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件有6个核 苷酸的增强突变,具体为:g.396G>A、g.397C>T、g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T。 [0042] 进一步的,步骤(2)中,由人EFla启动子启动整个CAR基因表达;CD81eader嵌合受 体信号肽位于CAR编码序列的N端,用于引导CAR蛋白定位于细胞膜;CD138单链抗体轻链VL、 Optimal Linker C、CD138单链抗体重链VH组合成scfv区域,用于识别⑶138抗原;CD8Hinge 嵌合受体铰链用于将scfv锚定于细胞膜外侧;CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区用于将整 个嵌合受体固定于细胞膜上;CD137嵌合受体共刺激因子用于刺激T细胞增殖和细胞因子分 泌;TCR嵌合受体T细胞激活域用于激活下游信号通路的表达;当scfv区域与CD138抗原结合 时,信号通过嵌合受体传递至细胞内,从而产生包括T细胞增殖、细胞因子分泌增加、抗细胞 凋亡蛋白分泌增加、细胞死亡延迟、裂解靶细胞的一系列生物学效应。
[0043]进一步的,步骤(4)中,所述慢病毒载体有带焚光标签zsGreenl的版本和不带焚光 标签zsGreenl版本,带荧光标签的版本用于体外实验,不带荧光标签的版本用于临床实验。 [0044] 进一步的,步骤(4)中,所述抽滤步骤控制上清体积在200ml~2000ml,真空度控制 在-0.5MPA~-0.9MPA,防止由于堵孔带来的载体损失;所述吸附步骤控制溶液的PH值在6~ 8,防止PH的变化导致载体失活;所述洗脱步骤控制洗脱液的离子强度在0.5M~1. OM,防止 离子强度的变化导致洗脱不完全或者载体失活。
[0045] 本发明所采用的表达载体包括原核复制子(pUC ori)用于质粒复制;原核筛选标 记(AmpR)用于目的菌株大量扩增;病毒复制子(SV400ri)用于增强真核细胞内的复制;慢病 毒包装顺式元件(RSV、5terminal LTR、3terminal Self-Inactivating LTR、Gag、RRE、env、 cPPT)用于慢病毒包装;真核荧光标签蛋白(ZsGreenl)用于真核细胞表达绿色荧光;共表达 元件(IRES)用于共同转录表达蛋白质;真核启动子(EFla)用于嵌合抗原受体基因的真核转 录;嵌合抗原受体(CD81eader、CDl38VL、Common Linker A(SEQ ID N0.17)/Common Linker B(SEQ ID N0.18)/0ptimal Linker C(SEQ ID N0.19)、CD138VH、CD8Hinge、 CD8Transmembrane、CD137、TCR)用于组成集识别、传递、启动于一体的二代和三代CAR;转录 后调控元件(eWPRE)用于增强转基因的表达效率。
[0046] 本发明的第五目的在于提供一种CAR-T细胞,所述的CAR-T细胞是由上述抗⑶138 嵌合抗原受体修饰的T淋巴细胞。
[0047] 本发明的再一目的在于提供上述CAR-T细胞在制备多发性骨髓瘤治疗药物中的应 用。
[0048] 本发明涉及含肽的医药配置品,具体涉及:
[0049] 一、含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列、原核复制子pMC Ori序列,、病毒复制子 3¥40〇1':[序列、1^¥启动子、人£?1(1启动子、慢病毒5七61'111;[仙11^1?、慢病毒3七61'111;[仙1361;1^-Inactivating LTR、Gag顺式元件、RRE顺式元件、env顺式元件、cPPT顺式元件、IRES核糖体 结合序列、ZsGreenl绿色荧光蛋白、WPRE 土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件的重组慢病毒载 体骨架,这种重组慢病毒载体骨架可以搭载不同的治疗性基因并广泛的用于过继性细胞治 疗领域。
[0050]二、重组慢病毒载体骨架、CD81eader嵌合受体信号肽、CD138单链抗体轻链VL、单 链抗体铰链LinkerA、单链抗体铰链Linker B、单链抗体铰链Linker C、⑶138单链抗体重链 VH、CD8Hinge嵌合受体铰链、CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区、CD28嵌合受体共刺激因 子、CD137嵌合受体共刺激因子、TCR嵌合受体T细胞激活域构建形成重组慢病毒载体,该方 法得到的重组慢病毒载体可以实现在人T淋巴细胞上表达CD138嵌合抗原受体,引导并激活 T淋巴细胞对CD138阳性细胞的杀伤作用,在临床上用于治疗多发性骨髓瘤。
[0051]本发明所采用的针对CD138的CAR-T技术,是一种综合了肿瘤单克隆抗体的免疫治 疗和肿瘤的过继免疫治疗优点的靶向治疗新技术。CD138在多发性骨髓瘤细胞中有着非常 高的表达并且参与肿瘤的进展和增殖,因而是一个非常有吸引力的治疗性靶标。CART-138 在移植后在外周血和骨髓中增殖超过1000倍,并且在这个过程中没有表现出任何的毒性。 (Bo Guo,ffeidong Han et,al.CD138-directed adoptive immunotherapy of chimeric antigen receptor(CAR)-modified T cells for multiple myeloma.Journal of Cellular Immunotherapy xx(2015)l_8.),CART_138具有安全,灵活的特点和潜在的抗肿 瘤活性,被认为是最有前景的多发性骨髓瘤治疗方式之一。
[0052]嵌合抗原受体(CAR)是CAR-T的核心部件(图1所示),赋予T淋巴细胞HLA非依赖的 方式识别肿瘤抗原的能力,这使得经过CAR改造的T细胞相较于天然T细胞表面受体TCR能够 识别更广泛的目标。CAR的基础设计中包括一个肿瘤相关抗原(tumor-associated antigen,TAA)结合区(通常来源于单克隆抗体抗原结合区域的scFV段),一个胞外铰链区, 一个跨膜区和一个胞内信号转导区。scFV段的设计对于CAR的特异性、有效性以及基因改造 T细胞自身的安全性来是关键的决定因素。
[0053]与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
[0054] 本发明采用的scFV段的linker设计,是使用世翱公司的Linkers pool,经过蛋白 质结构生物信息学数据库(https :// www.predictprotein.org/)的分析,通过对蛋白质二 级结构、溶剂可接触性、蛋白质柔韧性、二硫键桥、结合位点等蛋白质特性的比较,优选得 出。通过体外细胞因子分泌检测试验以及杀伤效率试验证明,与国外的设计相比,能够显著 提高CAR-T细胞的体外杀伤作用。并且,在临床治疗的效果上也比国外临床实验的效果好。 该scFV段的linker设计,同样可以应用于第三代CAR设计方案。第三代CAR设计与第二代设 计相比,增加了CD28嵌合受体共刺激因子(SEQ ID NO. 25),会有更强的信号放大作用。
[0055] 本发明所采用的慢病毒载体柱纯化系统,系本
【申请人】开发出的慢病毒规模化生产 工艺。常用的超速离心法或者高速离心法,是利用离心沉降原理分离慢病毒颗粒,不可避免 的会残留很多沉降系数相近的杂质,对后续实验带来不利影响。并且,装管过程复杂、操作 繁琐、多次转换容器带来更多的污染机会。而本
【申请人】开发的慢病毒载体柱纯化工艺为半 自动化操作,全部过程在百级实验区域完成,避免人工操作的繁琐和污染几率,所回收的慢 病毒载体在内毒素、支原体等指标上完全达到临床标准。后续可跟进开发全自动纯化仪。
[0056] 本发明所采用CAR设计方案也可以应用于第二代慢病毒载体结构上。第二代和第 三代慢病毒载体在结构上的区别(如图2B所示),主要是第三代慢病毒载体把第二代载体5 ' LTR的U3区域替换为RSV启动子,这样就消除了U3转录时对Tat蛋白的依赖,既可以在慢病毒 的结构基因里去除Tat序列,也提高了慢病毒基因组转录水平和转录持续性。第二代和第三 代慢病毒载体主要是基因组转录方式的区别,因此本发明所采用CAR设计方案可以应用于 这两代慢病毒载体。
[0057]本发明采用的第三代慢病毒骨架质粒pLenti_3G basic,与宾州大学Carl H.June 等人(Porter DL , Levine BL , Ka 1 o s M , BaggA , June CH . Chimeri c antigen receptormodifiedT cells in chronic lymphoid leukemia.N Engl J Med 2011;365: 725-33.)所采用的第三代慢病毒载体相比,去除了噬菌体fl复制起点,采用真核病毒SV40 复制子,增加了目的基因在真核细胞内的拷贝数,增强了真核表达效果。
[0058] 本发明采用的的第三代慢病毒骨架质粒pLenti_3G basic,采用enhancedWPRE元 件,与宾州大学 Carl H.June 等人(Porter DL, Levine BL,Kalos M, BaggA, June CH.Chimeric antigen receptormodif iedT cells in chronic lymphoid leukemia.N Engl J Med 2011;365:725-33.)所采用的WPRE元件相比,有6个核苷酸的增强突变(g.396G >A、g.397C>T、g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T),能够增强初级转录产物的多聚腺 苷化,增加细胞内mRNA的含量,增强转基因的表达效率。
[0059]本发明采用的Lentival包装系统是无辅助病毒的四质粒包装系统,通过四种质粒 共同转染至HEK293T/17细胞中,产生重组慢病毒载体。重组后的慢病毒载体是复制缺陷型 载体,能将外源片段整合入宿主基因,一次性使用,无法复制和增殖,安全性有很大提高。 [0060]本发明采用的慢病毒载体有带荧光标签zsGreenl的版本和不带荧光标签 zsGreenl版本,带焚光标签的版本用于体外实验,不带焚光标签的版本用于临床实验。
[0061] 本发明优选采用第三代慢病毒载体(图2A所示),3'SIN LTR去除了U3区域,消除了 慢病毒载体自我复制的可能性,大大提高了安全性;增加了 cPPT和WPRE元件,提高了转导效 率和转基因的表达效率;采用RSV启动子保证了慢病毒载体包装时核心RNA的持续高效转 录;采用人自身的EFla启动子,使CAR基因能够在人体内长时间持续表达。
[0062] 可见,本发明所述的重组慢病毒载体将给多发性骨髓瘤的CAR-T治疗提供可靠的 转基因保障。
【附图说明】
[0063] 图1是本发明所述的CAR的示意图,其中,图1(A)是CAR的基本结构图,图1(B)是CAR 的代次改进示意图;
[0064] 图2是本发明所述的慢病毒载体结构示意图;其中,图2(A)是本发明采用的第三代 慢病毒载体结构示意图,图2(B)是第二代和第三代慢病毒载体结构比较;
[0065] 图3是本发明实施例1中构建本发明所述的重组慢病毒载体的构建流程图,其中, 图3(A)是慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic的结构示意图;图3(B)是Pcarl38-CLA质粒的结 构示意图;图3(C)图是pCAR138-CLB质粒的结构示意图;图3(D)图是pCAR138-0LC质粒的结 构示意图;图3(E)图是慢病毒包装质粒pPac-GP的结构示意图;图3(F)图是慢病毒包装质粒 pPac-R的结构示意图;图3(G)图是膜蛋白pEnv-G的结构示意图;
[0066]图4是本发明实施例1中重组慢病毒质粒pCAR138-CLA的酶切预测及酶切琼脂糖凝 胶电泳图;其中,图4A是重组慢病毒质粒pCAR138-CLA的酶切预测示意图,其中,lanel是lkb DNA ladderMarker:条带从上到下依次为:1 Okb、8Kb、6kb、5Kb、4kb、3 ? 5Kb、3Kb、2 ? 5kb、2Kb、 1 ? 5kb、1Kb、750bp、500bp、250bp; lane2是pCARl38-CLA的Kpn I酶切预测:条带从上到下依 次为:658%?、174%?、1426&?;图48是重组慢病毒质粒?041?138-〇^的酶切琼脂糖凝胶电泳 图;其中,lanel是lkb DNA ladder Marker的电泳结果;lane2是pCAR138_CLA的Kpn I酶切 电泳结果;
[0067]图5是本发明实施例1中重组慢病毒质粒pCAR138-CLB的酶切预测及酶切琼脂糖凝 胶电泳图;其中,图5A是重组慢病毒质粒pCAR138-CLB的酶切预测示意图,其中,lanel是lkb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:1 Okb、8Kb、6kb、5Kb、4kb、3 ? 5Kb、3Kb、2 ? 5kb、 2Kb、1 ? 5kb、1Kb、750bp、500bp、250bp; lane2是pCARl38-CLB的Nco I酶切预测:条带从上到 下依次为:5867bp、3897bp;图5B是重组慢病毒质粒pCAR138-CLB的酶切琼脂糖凝胶电泳图; 其中,lanel是lkb DNA ladder Marker的电泳结果;lane2是pCAR138_CLB的Nco I酶切电泳 结果;
[0068]图6是本发明实施例1中重组慢病毒质粒pCAR138-0LC的酶切预测及酶切琼脂糖凝 胶电泳图;其中,图6A是重组慢病毒质粒pCAR138-0LC的酶切预测示意图,其中,lanel是lkb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:1 Okb、8Kb、6kb、5Kb、4kb、3 ? 5Kb、3Kb、2 ? 5kb、 2Kb、1 ? 5kb、1Kb、750bp、500bp、250bp; lane2是pCARl38-0LC的Sac II酶切预测:条带从上到 下依次为:5577&?、384(^?、377&?;图68是重组慢病毒质粒?041?138-0^:的酶切琼脂糖凝胶 电泳图,其中,lanel是lkb DNA ladder Marker的电泳结果;lane2是pCAR138_0LC的Sac II 酶切电泳结果;
[0069]图7是本发明实施例2中离子交换色谱法纯化重组慢病毒载体的流程图;
[0070] 图8是本发明实施例2中重组慢病毒载体的不同纯化方式的滴度检测结果示意图;
[0071] 图9是本发明实施例2中重组慢病毒载体的不同纯化方式的支原体检测结果示意 图;其中,lanel为DL2000marker,从上到下条带条带从上到下依次为:2kb、lkb、750bp、 500bp、250bp、100bp; lane2为阳性对照;lane3为阴性对照;lane4为PBS; lane5为水;lane6 为裂解液;lane7为超速离心纯化的慢病毒;laneS为高速离心纯化的慢病毒;lane9为离子 交换色谱纯化的慢病毒;lanelO为空细胞;
[0072] 图10是本发明实施例3中mRNA相对表达量的柱状图,RT-QPCR结果表明CAR在TOMC 细胞内高效转录;
[0073]图11是本发明实施例3中CAR蛋白表达量的WB检测图,结果表明CAR蛋白在TOMC细 胞内高效表达;其中,图11A中,lanel为PBMC空细胞,lane2为对照病毒M0CK,lane3为 lvCAR138-CLA,lane4为lvCAR138-CLB,lane5为lvCAR138-0LC;图 11B是beta-actin内参条 带;
[0074]图12是本发明实施例3中LDH检测不同效靶比条件下的杀伤效率,E为效应细胞,T 为靶细胞;
[0075]图13是本发明实施例3中qPCR检测不同效靶比条件下细胞因子表达水平示意图,E 为效应细胞,T为靶细胞;其中,图13A表示E-2的mRNA转录水平;图13B表示IFN- Y的mRNA转 录水平;图14是本发明实施例3中回输病人后,CART-138细胞和多发性骨髓瘤细胞的变化情 况;其中,图14A表示CART-138细胞回输后,外周血中CART-138的拷贝数变化情况;图14B表 示CART-138细胞回输后,骨髓中CART-138的拷贝数变化情况;图14C表示免疫组化检测回输 后多发性骨髓瘤细胞随时间的变化情况;图14D表示流式检测回输后多发性骨髓瘤细胞随 时间的变化情况;
[0076]图15是本发明实施例4中连续3个批次的第二代和第三代重组慢病毒载体的滴度 结果比较;
[0077] 图16为本发明实施例5中LDH检测不同效靶比条件下的杀伤效率,其中,E为效应细 胞,T为靶细胞。
【具体实施方式】
[0078] 以下实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。实施例中未注明具体 条件的实验方法,通常按照常规条件,或按照制造厂商所建议的条件。
[0079]实施例1构建重组慢病毒载体 [0080] 一、材料
[0081 ] 1、慢病毒骨架质粒pLenti_3G basic,慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac_R以及膜蛋 白质粒pEnv-G,HEK293T/17细胞、同源重组酶由世翱(上海)生物医药科技有限公司提供; [0082] 2、引物:根据引物设计原则设计扩增DNA片段和靶位点所需的引物,该引物由上海 生物公司合成,具体为:

[0111] 3、SEQ ID N0.14、SEQ ID N0.15、SEQ ID N0.16、SEQ ID N0.17、SEQ ID N0.18、 SEQ ID N0.19、SEQ ID N0.20、SEQ ID N0.21、SEQ ID N0.22、SEQ ID N0.23、SEQ ID N0.24、SEQ ID N0.25、SEQ ID N0.26、SEQ ID N0.27、SEQ ID N0.28、SEQ ID N0.29、SEQ ID N0.30、SEQ ID N0.31、、SEQ ID N0.32、SEQ ID N0.33、SEQ ID N0.34、SEQ ID N0.35、SEQ ID N0.36、SEQ ID N0.37、SEQ ID N0.38、SEQ ID N0.39、SEQ ID N0.40、SEQ ID N0.41、SEQ ID N0.42、SEQ ID N0.43、SEQ ID N0.44、SEQ ID N0.45、SEQ ID N0.46、SEQ ID N0.47、SEQ ID NO.48、SEQ ID NO.49所示的DNA序列由上海捷瑞生物工程有限公司合成,并以寡核苷酸 干粉或者质粒形式保存;SEQ ID NO.52、SEQ ID N0.53由常州基宇生物科技有限公司合成。
[0112] 4、工具酶Kpn I、Nco I、Sac II、ApaL I、Sal I、Sac I、Cla I、Sal I、T4DNA连接酶 均购自NEB公司;
[0113] 5、高保真酶PrimeSTAR、RN贝勾自Takara公司;
[0114] 6、0? 22um-〇? 8tim PES滤器购自millipore公司;
[0115] 7、质粒抽提试剂盒、琼脂糖凝胶回收试剂盒均购自MN公司;
[0116] 8、感受态细胞T0P10购自tiangen公司;
[0117] 9、NaCl、KCl、Na2HP04.12H20、KH2P04、Trypsin、EDTA、CaC12、Na0H、PEG6000 均购自 上海生工;
[0118] 10、0口衍-|^]\^85、01^]\1、、1640、拖口68、购自11^1廿(^611公司 ;
[0119] 11'Biotinylated protein L购自GeneScript公司;
[0120] 12、辣根过氧化物酶标记的二抗、DAB工作液均购自北京中杉金桥;
[0121] 13、ECL+plusTM Western blotting system购自Amersham公司;
[0122] 14、DNeasy试剂盒购自上海捷瑞公司;
[0123] 15、淋巴细胞分离液购自深圳达科为公司;
[0124] 16、phycoerythrin(PE)_conjugated streptavidin购自BD Bioscience公司;
[0125] 17、SA_HRP购自上海翊圣公司;
[0126] 18、支原体检测试剂盒、内毒素检测试剂盒、CD138+K562细胞购自世翱(上海)公 司;
[0127] 19、LDH检测试剂盒购自promega公司;
[0128] 二、重组慢病毒载体 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 的构建方法。
[0129] 参见图3,本发明所述重组慢病毒载体的构建方法如下:
[0130] 1、将人EFla启动子、CD81eader嵌合受体信号肽、CD138单链抗体轻链VUCommon Linker A.Common Linker B、0ptimal Linker C、CD138单链抗体重链VH、CD8Hinge嵌合受 体铰链、CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区、CD137嵌合受体共刺激因子、TCR嵌合受体T细 胞激活域片段克隆至慢病毒骨架质粒pLenti_3G basic,分别得到重组慢病毒质粒 pCARl38-CLA,pCARl38-CLB,pCARl38-0LC。
[0131] (1)将慢病毒骨架质粒pLenti_3G basic使用Cla I和Sal I限制性内切酶进行双 酶切,产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认8303bp的片段VI(图4所示),并割胶回收置于 Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物 的纯度和浓度;
[0133] 表1琼脂糖凝胶回收步骤
[0134] (2)用引物EFla-F和EFla-R以合成的SEQ ID勵.14为模板,使用表2中的体系,卩0? 循环条件为:98£€31^11,(98°(:1〇86(3,55°(:1586(3,72 1€2111111)*35〇7(316,72°(:1〇111111。产物经过 1.5 %的琼脂糖凝胶电泳,确认1208bp的片段a,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司 的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;

[0136] 表2 50yl PCR反应体系
[0137] (3)用引物0)816&〇^4和0)8163〇^-1?以合成的3£〇10勵.15为模板,使用表2中 的体系,PCR 循环条件为:98°C3min,(98°C10sec,55°C15sec,72°C30sec)*35cycle,72°C 5min。产物经过1.5 %的琼脂糖凝胶电泳,确认10 lbp的片段b,并割胶回收置于Eppendorf管 内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓 度;
[0138] (4)用引物VL-F和VL-R以合成的SEQ ID勵.16为模板,使用表2中的体系,?0?循环 条件为:98°C3min,(98。(:1〇86(:,55。(:1586(3,72 1€3〇86(3)*35。7(316,721€5111111。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认336bp的片段c,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0139] (5)用引物CLA-VH-F和VH-R以合成的SEQ ID勵.20为模板,使用表2中的体系,卩〇? 循环条件为:98£€31^11,(98°(:1〇86(3,55°(:1586(3,72 1€3〇86(3)*35〇7(316,721€5111111。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认424bp的片段d,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0140] (6)用引物CLB-VH-F和VH-R以合成的SEQ ID勵.20为模板,使用表2中的体系,卩〇? 循环条件为:98£€31^11,(98°(:1〇86(3,55°(:1586(3,72 1€3〇86(3)*35〇7(316,721€5111111。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认430bp的片段e,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0141] (7)用引物0LC-VH-F和VH-R以合成的SEQ ID勵.20为模板,使用表2中的体系,卩〇? 循环条件为:98£€31^11,(98°(:1〇86(3,55°(:1586(3,72 1€3〇86(3)*35〇7(316,721€5111111。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认421bp的片段f,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0142] (8)用引物CD8Hinge-F和CD8Hinge-R以合成的SEQ ID N0.21为模板,使用表2中的 体系,PCR 循环条件为 JST^minJgsriOsecJSriSsecJSt^OsechSScycleJSrSmin。 产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认147bp的片段g,并割胶回收置于Eppendorf管内,用 MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0143] (9)用引物0081'抑11811161111?^116-?和0081'抑118111611113抑116-1?以合成的3£( >)10繼.22为 模板,使用表 2 中的体系,PCR 循环条件为:98°C3min,(98°C10sec,55°C15sec,72°C30sec)* 35cy c 1 e,7 2 °C 5min。产物经过1.5 %的琼脂糖凝胶电泳,确认100bp的片段h,并割胶回收置 于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产 物的纯度和浓度;
[0144] (10)用引物〇)1374和〇)137-1?以合成的5£0 10勵.23为模板,使用表2中的体系, PCR 循环条件为:981€3111111,(98。(:1〇86(3,55。(:1586(3,721€3〇86(3)*35。7(316,72 1€5111111。产物 经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认142bp的片段i,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公 司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0145] (11)用引物TCR-F和TCR-R以合成的SEQ ID ^).24为模板,使用表2中的体系,卩0? 循环条件为:98£€31^11,(98°(:1〇86(3,55°(:1586(3,72 1€3〇86(3)*35〇7(316,721€5111111。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认355bp的片段j,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0146] (12)将DNA片段b、c、d各lyl作为模板,使用表3中的体系,除引物外加入Eppendorf 管内,PCR 循环条件为:98°〇3111111,(98°(:1086(3,60°(:1086(3,721€3086(3)*6〇7(316,加入引物 CDSleader-F/VL-RjgsriOsecJCTClOsecJStMOsec^^^ycleJSrSmin。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认814bp的片段k,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0148] 表3 50yl重叠PCR反应体系
[0149] (13)将DNA片段b、c、e各lyl作为模板,使用表3中的体系,除引物外加入Eppendorf 管内,PCR 循环条件为:98°〇3111111,(98°(:1086(3,60°(:1086(3,721€3086(3)*6〇7(316,加入引物 CDSleader-F/VL-RjgsriOsecJCTClOsecJStMOsec^^^ycleJSrSmin。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认820bp的片段1,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0150] (14)将DNA片段b、c、f各lyl作为模板,使用表3中的体系,除引物外加入Eppendorf 管内,PCR 循环条件为:98°〇3111111,(98°(:1086(3,60°(:1086(3,721€3086(3)*6〇7(316,加入引物 CDSleader-F/VL-RjgsriOsecJCTClOsecJStMOsec^^^ycleJSrSmin。产物经过 1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认81 lbp的片段m,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的 琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0151] (15)将DNA片段g、h、i、j各1 yl作为模板,使用表3中的体系,除引物外加入 Eppendorf管内,PCR循环条件为:98°C3min,(98°C 10sec,6CTC 10sec,72°C30sec)*6cycle, 加入引物 CDSHinge-F/TCR-R^gsriOsecJOriOsecJST^OsechSAcycleJSrSmin。产 物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认704bp的片段n,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN 公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表1),并测定产物的纯度和浓度;
[0152] (16)将DNA片段Vl、a、k、n以5yl总体积且摩尔比1:1:1:1的比例加入Eppendorf管 内,加入同源重组酶反应液15iil,混匀后在42°C孵育30分钟,转移至冰上放置2-3分钟,将反 应液加入50ylT0P10中,轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟,将管放到预加温到42 °C的恒温水浴锅中热激90秒,快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却2-3分钟,每管加900yl LB培养液,然后将管转移到37 °C摇床上,温育1小时使细菌复苏,取100yl的转化菌液涂布于 Amp LB琼脂平板上,倒置平皿,于恒温培养箱中37°C培养,16小时。
[0153] 挑取克隆进行菌落PCR鉴定,鉴定正确的克隆即为重组慢病毒质粒pCAR138-CLA, 对正确的克隆进行酶切鉴定(见图4);
[0154] (17)将DNA片段Vl、a、l、n以5yl总体积且摩尔比1:1:1 :1的比例加入£口口611(1〇"管 内,加入同源重组酶反应液15iil,混匀后在42°C孵育30分钟,转移至冰上放置2-3分钟,将反 应液加入50yl T0P10中,轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟,将管放到预加温到42 °C的恒温水浴锅中热激90秒,快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却2-3分钟,每管加900yl LB培养液,然后将管转移到37 °C摇床上,温育1小时使细菌复苏,取100yl的转化菌液涂布于 Amp LB琼脂平板上,倒置平皿,于恒温培养箱中37°C培养,16小时。
[0155] 挑取克隆进行菌落PCR鉴定,鉴定正确的克隆即为重组慢病毒质粒pCAR138-CLB, 对正确的克隆进行酶切鉴定(见图5);
[0156] (18)将DNA片段Vl、a、m、n以5yl总体积且摩尔比1:1:1:1的比例加入Eppendorf管 内,加入同源重组酶反应液15iil,混匀后在42°C孵育30分钟,转移至冰上放置2-3分钟,将反 应液加入50yl T0P10中,轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟,将管放到预加温到42 °C的恒温水浴锅中热激90秒,快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却2-3分钟,每管加900yl LB培养液,然后将管转移到37 °C摇床上,温育1小时使细菌复苏,取100yl的转化菌液涂布于 Amp LB琼脂平板上,倒置平皿,于恒温培养箱中37°C培养,16小时。挑取克隆进行菌落PCR鉴 定,鉴定正确的克隆即为重组慢病毒质粒PCAR138-0LC,对正确的克隆进行酶切鉴定(见图 6)〇
[0157] 2、重组慢病毒载体 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 的包装。
[0158] (1)完全培养基:取出预热好的新鲜培养基,加入10%FBS+5ml Pen-Srep,上下颠 倒混匀即可;
[0159] (2)1XPBS溶液:称量NaCl 8g,KCl 0.2,Na2HP04.12H20 3.58g,KH2P04 0.24g
[0160] 置于1000ml烧杯中,加入900ml Milli-Q grade超纯水溶解,溶解完成后,使用 1000ml量筒定容至1000ml,121°C高温湿热灭菌20min;
[0161] (3)0.25%Trypsin溶液:称量Trypsin 2.5g,EDTA 0.19729g置于 1000ml烧杯中, 加入900mllXPBS溶解,溶解完成后,使用1000ml量筒定容至1000ml,0.22yM过滤除菌,长期 使用可保存至_20°C冰箱;
[0162] (4)0.5M CaC12溶液:称量36.75g CaC12用400ml Milli-Q grade超纯水溶解;用 Mi 11 i-Q grade超纯水将总体积定容至500ml,混匀;0.22mi过滤除菌,分装保存到50ml离心 管中,每管45ml左右,4°C保存。
[0163] (5)2XHBS溶液:称量4.09g NaCl,0.269g Na2HP04,5.96g Hepes,用400ml Milli-Q grade超纯水溶解;校准pH仪后,用2M NaOH溶液将HBS溶液的pH调到7 ? 05。调整每瓶HBS的 PH消耗2M NaOH为3ml左右;
[0164] (6)从液氮罐中取出冻存的HEK293T/17细胞,迅速转移到37°C水浴中,1~2min后 转移到超净台中,无菌操作将冻存管中的液体全部转移至10cm2培养皿中,补足含10%FBS 的01^11至81111710〇112(1匕11,2411后显微镜观察细胞,细胞汇合的程度大于80%进行传代;
[0165] (7)选择细胞状态良好、无污染的HEK293T/17细胞,每2-6个培养皿为一组,将细胞 胰酶消化后,用电动移液器吸取4-12ml完全培养基,向每个消化后的培养皿中加2ml,避免 培养皿变干;使用lml移液器将所有细胞吹打成单细胞悬液,转移到培养基瓶中;
[0166] (8)将上述2-6个培养皿中的剩余细胞转移到培养基瓶中,并用培养基再冲洗一便 培养皿;
[0167] (9)盖紧培养基瓶盖,上下颠倒10次左右充分混匀细胞悬液,将细胞传到8-24个 10cm2培养皿中,每皿的细胞密度应当约4X106个/10ml完全培养基左右。如果细胞密度和 预期的相差较大,则需要对细胞进行计数,然后按照4 X 106个/皿的量接种;
[0168] (10)每6个培养皿整理为一摞,注意保持上下皿之间的配合。将培养皿左右,前后 晃动数次,使细胞充分铺开,然后放入5 % C02培养箱。剩余细胞做同样处理;
[0169] (11)检查所传代细胞,细胞汇合度应当为70-80%,轮廓饱满,贴壁良好,在细胞培 养皿中均勾分布;
[0170] (12)为细胞换液,将培养基替换为新鲜完全培养基,每皿9ml,并将培养箱的C02浓 度设定值提高到8% ;
[0171] (13)按照N+0.5配DNA/CaC12溶液。每皿HEK293T/17细胞转染质粒量按照下列比例 使用:重组慢病毒质粒(20yg),pPac-GP(15yg),pPac-R(1 Oyg),pEnv-G(7 ? 5yg)。取一个新的 5ml离心管,加入0.5M CaC12:0.25ml,重组慢病毒质粒20iig:pPac-GP 15yg:pPac-R lOyg: pEnv-G 7.5yg,补充超纯水至0.5ml盖上盖子,充分混匀;
[0172] (14)另取一支5ml离心管,加入0.5ml DNA/CaC12溶液。打开涡旋振荡器,一只手拿 住5ml离心管的上端,使管底接触振荡头,使液体在管壁上散开流动,另一只手拿一把lmL移 液枪,吸取0.5mL2 X HBS溶液,缓慢滴加进入离心管,控制流速,以半分钟滴完为宜。2 X HBS 加入后,继续振荡5秒钟,停止振荡,可直接加入需要转染的细胞中;
[0173] (15)取一皿细胞,将离心管中的lmL钙转液滴加进去,尽可能使钙转试剂分布到整 个培养皿中;
[0174] (16)钙转液加入后,在皿盖上做好标记,将培养皿放还到另一个5 % C02培养箱中。 确保培养皿水平放置,每摞培养皿不要超过6个。在5%C02培养箱中放置(6-8h);
[0175] (17)将第一个培养箱的C02浓度设定值调回到5% ;
[0176] (18)24小时后,检查细胞状态。细胞汇合度应当为80-85%左右,状态良好。将培养 基吸走,更换l〇ml新鲜的DMEM完全培养基;
[0177] (19)48小时后,观察转染效率。绝大多数细胞仍然是贴壁的。可以看到超过95%细 胞都会带有绿色荧光。将同一个病毒包装上清液收集到一起,并向培养皿中继续添加10mL 新鲜培养基;
[0178] (20)72小时后,再次将同一个病毒上清液收集到一起,两次收集的病毒可以放在 一起,丢弃培养皿;此时收集的上清里包含了重组慢病毒载体lvCAR138-CLA、lvCAR138-CLB、lvCAR138-0LC〇
[0179] 实施例2重组慢病毒载体的浓缩及检测
[0180] 超速离心法纯化重组慢病毒载体;
[0181] (1)将收集的上清液分装到50ml离心管中,500g室温离心10min,除去细胞和大的 碎片;
[0182] (2)用0 ? 22wn-0 ? 8mi滤器过滤上清液;
[0183] (3)取6个Hitachi 40PA超速离心管,表面喷洒70%乙醇消毒,放在超净台用紫外 灯照射杀菌30分钟。也可以通过高温湿热灭菌;
[0184] (4)将第2步处理好的细胞上清样品分装32ml到离心管中;
[0185] (5)盖上金属盖,将离心管连同金属盖一起配平,用1XPBS调整使重量偏差在0.02g 范围内;
[0186] (6)将配平的离心管对称放置于超速离心转子P50AT2中。设置离心转速100,000g, 4°C离心2小时;
[0187] (7)离心结束后,小心将离心管从转子中拿出,可以看到在离心管底有一小团沉 淀,用Marker笔在外管壁上做标记,倒掉上清。将离心管倒扣在预先铺好的纸巾上,使残余 液体流掉。可以用移液枪将挂在壁上的液滴吸走;
[0188] (8)向每个离心管中加入200yl的Opti-MEM,用200yl移液器吹打使沉淀溶解,尽量 减少泡沫的产生;
[0189] (9)将超速离心管插入50ml离心管中,盖上盖子,放入4°C冰箱过夜;
[0190] (10)500g,室温离心lmin,使病毒液集中到管底;
[0191] (11)将所有相同的病毒浓缩液集中到一起,用0.22_-0.8圓的PES滤器过滤;将病 毒分成25到50yl-管,冻存到-80°C冰箱,进行长期保存;
[0192] 二、高速离心法纯化重组慢病毒载体;
[0193] (1)将收集的上清液204ml使用0.22wn-0.8mi的PES滤器过滤;
[0194] (2)加入51ml 50%的PEG 6000溶液;
[0195] (3)加入21.711114]\1恥(:1溶液;
[0196] (4)加入23.31111的?83溶液,这时溶液总体积为3001111.?£6 6000的终浓度8.5%、 NaCl终浓度0.3M;
[0197] (5)将溶液分装进250ml广口瓶中,每份150ml;
[0198] (6) 4°C放置1.5小时,每20-30分钟混匀一次;
[0199] (7)4°C、7000g 离心 lOmin;
[0200] (8)离心后能看见管底有白色沉淀;
[0201] (9)小心弃去上清液,每瓶加入1.211115〇11^1>4-11(:1化117.4),剧烈摇晃重悬沉 淀;
[0202] (10)涡旋震荡20-30秒进一步重悬沉淀;
[0203] (11)将病毒分成25到50iil-管,冻存到-80°C冰箱,进行长期保存;
[0204]三、离子交换色谱法纯化重组慢病毒载体(如图7所示);
[0205] (1)将收集的上清液使用Thermo真空栗,经0 ? 22M-0 ? 8wii的PES滤器抽滤,除去杂 质;
[0206] (2)按1:1 ~1:10的比例往上清中加入 1.5M NaCl 250mM Tris-HCl(pH 6-8);
[0207] (3)将2个离子交换柱串联放置,用4ml 1M NaOH、4ml 1M NaCl、5ml 0.15M NaCl 25mM Tris-HCl(pH 6-8)溶液依次过柱;
[0208] (4)将步骤2中获得的溶液通过蠕动栗以l-10ml/min的速度给离子交换柱上样;
[0209] (5)全部上清液过柱后,使用10ml 0.15M NaCl 25mM Tris-HCl(pH 6-8)溶液清洗 一遍;
[0210] (6)根据上样量使用l-5ml 1.5M NaCl 25mM Tris-HCl(pH 6-8)进行洗脱,收集洗 脱液;
[0211] (7)将洗脱液分成25到50y 1-管,冻存到-80°C冰箱,进行长期保存;
[0212]四、滴度测定及比较;
[0213] (1)取24孔板接种293T细胞。每孔细胞为5X104个,所加培养基体积为500ul,不同 种类的细胞生长速度有所差异,进行病毒感染时的细胞融合率为40 % -60 % ;
[0214] (2)准备3个无菌EP管,在每个管中加入90ul的新鲜完全培养基(高糖DMEM+10% FBS)接种细胞24小时后,取两个孔的细胞用血球计数板计数,确定感染时细胞的实际数目, 记为N;
[0215] (3)取待测定的病毒原液10ul加入到第一个管中,轻轻混匀后,取10ul加入到第二 个管中,然后依次操作直到最后一管;在每管中加入410ul完全培养基(高糖DMEM+10% FBS),终体积为500ul;
[0216] ⑷感染开始后20小时,除去培养上清,更换为500yl完全培养基(高糖DMEM+10% FBS),5%C02继续培养48小时;
[0217] (5)72小时后,观察荧光表达情况,正常情况下,荧光细胞数随稀释倍数增加而相 应减少,并拍照;
[0218] (6)用0.2ml 0.25%胰酶-EDTA溶液消化细胞,在37°C放置1分钟。用培养基吹洗整 个细胞面,离心收集细胞。按照DNeasy试剂盒的说明抽提基因组DNA。每个样品管中加入200 yl洗脱液洗下DNA并定量;
[0219] (7)准备目的DNA检测qPCRmix总管I(QPCR引物序列为SEQ ID N0.44-SEQ ID NO.45): 2.y TnqMnn Master Mix 25 ul y n Forward primer (!00 pmol inl-l) O.lul ^ n
[0220] Reverse primer (100 pmol ral-1) 0.1|il x n Probe (100 pmo! ml-1) 0. \ ul x n H20 I9.7ul xn
[0221 ] n = number of reactions ?例如:总反应数为40,将lml 2 X TaqMan Universal PCR Master Mix,4ul forward primer,4ul reverse primer?4ul probe和788卩1 H20混 和。震荡后放在冰上;
[0222] (8)准备内参DNA检测qPCRmix管 II (QPCR引物序列为SEQ ID NO.46SEQ ID NO.47):
[0223] 2 XTaqMan Master Mix 25ul Xn
[0224] lOXRNaseP primer/probe mix 2.5ulXn
[0225] H20 17.5ulXn
[0226] n = number of reactions ?例如:总反应数为40,将lml 2 X TaqMan Universal PCR Master Mix,100]ill0XRNaseP primer/probe mix和700U1 H20混和D震荡后放在冰 上;
[0227] (9)在预冷的96孔PCR板上完成PCR体系建立。从总管I中各取45yl加入到A-D各行 的孔中,从总管II中各取45iil加入到E-G各行的孔中。
[0228] (10)分别取5iU质粒标准品和待测样品基因组DNA加入到A-D行中,每个样品重复1 次。另留1个孔加入5yl的水做为无模板对照(no-template control)。
[0229] (11)分别取5iil基因组标准品和待测样品基因组DNA加入到E-G行中,每个样品重 复1次。另留1个孔加入5yl的水做为无模板对照(no-template control)。
[0230] (12)所使用定量PCR仪为ABI PRISM 7500定量系统。循环条件设定为:50°C2分钟, 95 °C 10分钟,然后是95 °C 15秒,60 °C 1分钟的40个循环。
[0231] 数据分析:测得的DNA样品中整合的慢病毒载体拷贝数用基因组数加以标定,得到 每基因组整合的病毒拷贝数。
[0232] 滴度(integration units per ml,IU ml_l)的计算公式如下:
[0233] IU ml-l = (CXNXDX1000)/V
[0234] 其中:C =平均每基因组整合的病毒拷贝数
[0235] N=感染时细胞的数目(约为IX 105)
[0236] D =病毒载体的稀释倍数
[0237] V =加入的稀释病毒的体积数
[0238] (13)重组慢病毒载体 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 的滴度结果(如 图8所示),离子交换色谱法的结果明显优于超速离心法和高速离心法;
[0239]五、内毒素测定及比较;
[0240] (1)、内毒素工作标准品为15EU/支;
[0241] (2)、鲎试剂灵敏度A = 〇 ? 25EU/ml,0 ? 5ml/管
[0242] (3)、内毒素标准品稀释:取内毒素标准品一支,分别用BET水按比例稀释成牡和2入 的溶解,封口膜封口,震荡溶解15min;稀释时每稀释一步均应在漩涡混合器上混匀30s;
[0243] (4)、加样:取鲎试剂若干支,每支加入BET水0.5ml溶解,分装至若干支无内毒素试 管中,每管0. lml。其中2支为阴性对照管,加入BET水0. lml;
[0244] 2支为阳性对照管,加入2A浓度的内毒素工作标准品溶液〇. lml;
[0245] 2支为样品阳性对照管,加入0.1ml含2A内毒素标准品的样品溶液(稀释20倍的待 测样品lml+4人的内毒素标准品溶液lml = 2ml含2人内毒素标准品的稀释40倍样品)。
[0246] 样品管中加入0.1ml样品,稀释比例见表4,37±1 °C水浴(或培养箱)保温60 土 lmin;
[0247] (5)、重组慢病毒载体 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 的内毒素检测 结果(如表4所示),超速离心法的内毒素含量在20~40EU/ml之间,高速离心法的内毒素含 量在20~40EU/ml之间,离子交换色谱法的内毒素含量在1.25~2.5EU/ml之间明显优于超 速离心法和高速离心法;
[0249]表4重组慢病毒载体的不同纯化方式的内毒素检测结果 [0250]六、支原体测定及比较;
[0251] (1)在实验前三日,细胞样品用无抗生素培养基进行培养;
[0252] (2)收集lml细胞悬浮液(细胞数大于1*105),置于1.5ml离心管中;
[0253] (3) 13000 X g离心lmin,收集沉淀,弃去培养基;
[0254] (4)加入500ul PBS用枪头吹吸或涡旋振荡,重悬沉淀。13000Xg离心5min;
[0255] (5)步骤4重复一次;
[0256] (6)加入50yl Cell Lysis Buffer,用枪头吹吸,充分混匀后,在55°C水浴中孵育 20min;
[0257] (7)将样品置于95°C中加热5min;
[0258] (8) 13000 X g离心5min后,取5yl上清作为模板,25ylPCR反应体系为:ddH20 6 ? 5y l、Myco Mixlul、2x Taq Plus Mix Master(Dye 卩1118)12.5111、模板5111;?0?循环条件为:95 t^OsecAgSt^Osecjet^OsecJSt^OsechSOcycleJSrSmino
[0259] (9)支原体检测结果显示(如图9和表5所示),超速离心法、高速离心法、离子交换 色谱法纯化的重组慢病毒载体均不含支原体。
[0261 ] 表5支原体检测
[0262] 实施例3重组慢病毒载体1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC的功能检测
[0263] 一、CAR基因的细胞水平表达检测:
[0264] (1)重组慢病毒载体 1<六1?138-〇^、1¥〇41?138-〇^、1¥〇41?138-〇1^:感染?81?:细胞 后,收集细胞采用RT-PCR进行CAR mRNA转录水平的检测,验证CAR基因的表达,如果CAR mRNA转录水平增高,则说明CAR基因的转录水平表达成功;
[0265] (2)重组慢病毒载体 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 感染 PBMC 细胞 后,收集细胞采用western blot进行CAR蛋白表达水平的检测,验证CAR基因的表达,如果 CAR蛋白表达水平增高,则说明CAR基因的翻译水平表达成功;
[0266] (3)分别将 M0I = 15 的 1vCAR138-CLA、1vCAR138-CLB、1vCAR138-0LC 和对照病毒 MOCK感染细胞,48h后提取6孔板中细胞的总RNA和总蛋白分别进行荧光定量PCR实验和免疫 印迹实验。具体步骤:包被6孔板的四个孔,每个孔加入相应的roS和RN,4 °C过夜。12小时后 按M0I = 15包被病毒,37 °C培养箱放置5h;取出的6孔板,弃掉病毒上清,用PBS洗两遍,按1* 106/孔,包被PBMC(用淋巴细胞分离液从人血中分离),加入500ul培养基(含10%血清、20U/ ml IL_2、Polybrene 8ug/ml)。静置20min,1000g 2CTC离心3〇111;[11,37。0培养48h0
[0267] (4)Tr iz〇 1法提取6孔板中PBMC细胞的总RNA,逆转录扩增cDNA,用QPCR引物(序列 为SEQ IDN0.46-3£〇10^).49)进行荧光定量?0?实验,反应体系见表6,以内参六(^111为 对照组,验证其mRNA的转录情况。
[0270] 表6 20yl qPCR反应体系
[0271] (5)蛋白免疫印迹(Western Blot)通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将从PBMC中提取的总 蛋白质按相对分子质量分离。采用湿转(4°C,400mA,120min),将蛋白转移到PVDF膜上。用封 闭液(含5 %脱脂牛奶的TBST溶液)室温封闭PVDF膜lh,封闭液1:1000稀释Biotinylated protein L,然后与封闭好的PVDF膜室温孵育4°C过夜。TBST洗膜3次,每次lOmin。封闭液1: 500稀释相应的SA-HRP,室温下孵育PVDF膜2h,TBST洗膜3次,每次10min。采用Amersham公司 ECL+plusTM Western blotting system试剂盒进行显色。X光显影获得显示条带的胶片。
[0272] (6)RT_QPCR检测显示,重组慢病毒载体感染PBMC后的CAR的表达水平比对照病毒 MOCK和空细胞有明显升高(如图10和表7所示),说明CAR基因的转录水平表达成功。
[0274]表 7RT-QPCR 检测
[0275] (7)蛋白免疫印迹(Western Blot)的结果表明,CAR蛋白在重组慢病毒系统中表达 (如图11所示),说明CAR基因的翻译水平表达成功。
[0276] 二、细胞因子分泌及杀伤效果评估。
[0277] (1)分别培养 CD138+K562 细胞和效应细胞1¥〇六1?138-〇^-?81?:、1¥〇41?138-〇^-PBMC、1vCARl38-0LC-PBMC;
[0278] (2)收集靶细胞(CD138+K562)4xl05cells 和效应细胞(CART 细胞)2.8xl06cells, 800g,6min离心,弃上清;
[0279] (3)用1ml lxPBS溶液分别重悬靶细胞和效应细胞,800g,6min离心,弃上清;
[0280] (4)重复步骤3-次;
[0281] (5)用700ul培养基(1640培养基+10%FBS)重悬效应细胞,用2ml培养基(1640培养 基+10%FBS)重悬靶细胞;
[0282] (6)设置效靶比为1:1、5:1、10:1的实验孔,并设置对照组,每组3个复孔;
[0283] (7)250xg,5min 平板离心;
[0284] (8) 37 °C 5 % C02培养箱中培养4小时;
[0285] (9)25〇xg,5min 平板离心;
[0286] (10)取每个孔的50ul上清到新96孔板中,并且每孔加入50ul底物溶液(避光操 作);
[0287] (11)避光孵育25分钟;
[0288] (12)每孔加入50ul终止液;
[0289] (13)酶标仪检测490nm吸光度;
[0290] (14)将3个复孔取平均值;将所有实验孔、靶细胞孔和效应细胞孔的吸光值减去培 养基背景吸光值的均值;将靶细胞最大值的吸光值减去体积校正对照吸光值的均值。
[0291] (15)将步骤14中获得的经过校正的值带入下面公式,计算每个效靶比所产生的细 胞毒性百分比。结果如图12所示,重组慢病毒载体lvCAR138-0LC转导的PBMC细胞在不同效 靶比条件下杀伤效率明显高于lvCAR138-CLA和lvCAR138-CLB转导的PBMC细胞;
[0292] 杀伤效率=(实验孔-效应细胞孔-靶细胞孔)/(靶细胞最大孔-靶细胞孔)X100%
[0293] (16)重复准备一份步骤6的样品用于qPCR检测细胞因子表达水平,结果如图13所 示,重组慢病毒载体lvCAR138-0LC转导的PBMC细胞在不同效靶比条件下IL-2和IFN-y的 mRNA转录水平明显高于1 vCARl 38-CLA和1 vCARl 38-CLB转导的PBMC细胞。
[0294] 三、根据文献报道(Bo Guo,Weidong Han et,al ? CD138_directed adoptive immunotherapy of chimeric antigen receptor(CAR)-modified T cells for multiple myeloma.Journal of Cellular Immunotherapy xx(2015)l-8.),CART_138载体针对多发 性骨髓瘤有着良好的效果。
[0295] 本研究在www. cl ini cal trials .gov的注册号是#NCT01886976。本研究中使用表达 CAR138基因的T淋巴细胞用于治疗化疗复发难治的⑶138+多发性骨髓瘤的病人。5个患者在 分别回输CART-138淋巴细胞后,检测外周血中CART-138的拷贝数,结果显示CART-138在外 周血中长期存在并保持较高水平(如图14A所示);5个患者在分别回输CART-138淋巴细胞 后,骨髓中CART-138的拷贝数的检测结果显示CART-138在骨髓中依旧长期存在并保持较高 水平(如图14B所示);骨髓穿刺涂片的免疫组化结果显示,患者UPN1在接受CART-138细胞回 输后,与回输前相比,肿瘤细胞数量明显减少(如图14C所示);流式检测结果显示,患者UPN1 在接受CART-138细胞回输后16天与回输前6天相比,外周血中的CD138+细胞由10.5%下降 至2.03%(如图140所示)。过继性041?138-1'细胞疗法在针对多发性骨髓瘤的治疗方面拥有 良好的发展前景。
[0296] 实施例4第三代慢病毒骨架载体3rdLV-CAR138与第二代慢病毒骨架载体2ndLV-CAR138滴度比较
[0297] 分别构建3rdLV-CAR138和2ndLV-CAR138;质粒构建、病毒包装、病毒超速离心浓 缩、滴度测定过程参考实施例1;连续3个批次的滴度结果如图15所示,第三代慢病毒骨架载 体3rdLV-CAR138的滴度要优于第二代慢病毒骨架载体2ndLV-CAR138;因此,本专利选择使 用第三代慢病毒骨架载体作为CAR基因的搭载骨架。
[0298] 实施例5第二代CAR慢病毒载体3rdLV-2ndCAR138与第三代CAR慢病毒载体3rdLV-3rd CAR138杀伤效率比较
[0299] 分别构建3rdLV-2ndCAR138和3rdLV-3rdCAR138;质粒构建、病毒包装、病毒超速离 心浓缩、滴度测定过程参考实施例1;杀伤实验参考实施例3;第二代CAR慢病毒载体3rdLV-2ndCAR138与第三代CAR慢病毒载体3rdLV-3rd CAR138杀伤效率结果比较如图16所示, 3rdLV-3rd CAR138针对靶细胞的杀伤效率在不同效靶比条件下并未表现的比3rdLV-2ndCAR138更高效;因此,本专利选择使用第二代CAR设计的慢病毒载体作为临床实验载体。
[0300] 以上已对本发明创造的较佳实施例进行了具体说明,但本发明创造并不限于所述 实施例,熟悉本领域的技术人员在不违背本发明创造精神的前提下还可作出种种的等同的 变型或替换,这些等同的变型或替换均包含在本申请权利要求所限定的范围内。
【主权项】
1. 一种抗⑶138嵌合抗原受体,包括依次串联的⑶8 leader嵌合受体信号肽、CD138单 链抗体轻链VUOptimal Linker C、CD138单链抗体重链VH、CD8 Hinge嵌合受体铰链、CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、CD137嵌合受体共刺激因子,以及TCR嵌合受体T细胞激活 域。2. 根据权利要求1所述的抗CD138嵌合抗原受体,其特征在于:所述嵌合抗原受体的氨 基酸序列如SEQ ID NO.50所示。3. -种抗⑶138嵌合抗原受体,包括依次串联的⑶8 leader嵌合受体信号肽、CD138单 链抗体轻链VUOptimal Linker C、CD138单链抗体重链VH、CD8 Hinge嵌合受体铰链、CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、⑶28嵌合受体共刺激因子、CD137嵌合受体共刺激因子、以 及TCR嵌合受体T细胞激活域。4. 根据权利要求3所述的抗CD138嵌合抗原受体,其特征在于:所述嵌合抗原受体的氨 基酸序列如SEQ ID NO.51所示。5. 编码权利要求1-4任一项所述的抗CD138嵌合抗原受体的基因。6. 根据权利要求5所述的基因,其特征在于:所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.52或 SEQ ID NO .53所示。7. 含有权利要求5或6所述的基因的重组表达载体。8. 根据权利要求7所述的重组表达载体,其特征在于:所述表达载体为慢病毒表达载 体、逆转录病毒表达载体、腺病毒表达载体、腺相关病毒表达载体或质粒。9. 根据权利要求8所述的重组表达载体,其特征在于:所述的慢病毒表达载体包含权利 要求5所述的基因。10. 根据权利要求9所述的重组表达载体,其特征在于:所述的慢病毒表达载体包括:用 于质粒复制的原核复制子pUC Ori序列;用于目的菌株大量扩增的含氨苄青霉素抗性基因 AmpR序列;用于增强真核细胞内的复制的病毒复制子SV40 Ori序列;用于慢病毒包装的慢 病毒包装顺式元件;用于真核细胞表达绿色荧光的ZsGreenl绿色荧光蛋白;用于共同转录 表达蛋白质的IRES核糖体结合序列;用于嵌合抗原受体基因的真核转录的人EFla启动子; 用于组成集识别、传递、启动于一体的二代CAR或三代CAR的嵌合抗原受体的编码基因;用于 增强转基因的表达效率的eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件。11. 根据权利要求9所述的重组表达载体,其特征在于,所述慢病毒包装顺式元件采用 第二代慢病毒载体包括:慢病毒5 terminal LTR、慢病毒3 terminal Self-Inactivating LTR、Gag顺式元件、RRE顺式元件、env顺式元件,以及cPPT顺式元件。12. 根据权利要求9所述的重组表达载体,其特征在于,所述慢病毒包装顺式元件采用 第三代慢病毒载体包括:慢病毒5 terminal LTR、慢病毒3 terminal Self-Inactivating LTR、Gag顺式元件、RRE顺式元件、env顺式元件、cPPT顺式元件所述慢病毒包装顺式元件,以 及RSV启动子。13. 根据权利要求9-12任一项所述的重组表达载体,其特征在于,所述eWPRE增强型土 拨鼠乙肝病毒转录后调控元件有6个核苷酸的增强突变,具体为:g.396G>A、g.397C>T、 g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T。14. 一种如权利要求9-13中任一项所述的重组表达载体的构建方法,包括以下步骤: (1)将含氨苄青霉素抗性基因 AmpR序列、原核复制子pUC Ori序列、病毒复制子SV40 Ori序列、用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件、ZsGreenl绿色荧光蛋白、IRES核糖体结 合序列、eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件存储于慢病毒骨架质粒上; (2) 将人EFla启动子、用于组成集识别、传递、启动于一体的二代CAR或三代CAR的嵌合 抗原受体组合成二代CAR或三代CAR设计方案,经过酶切、连接、重组反应克隆至慢病毒骨架 质粒中,得到二代CAR或三代CAR设计的重组慢病毒质粒; (3) 将得到的重组慢病毒质粒与慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac_R以及膜蛋白质粒 pEnv-G共同转染HEK293T/17细胞,在HEK293T/17细胞中进行基因转录表达后,包装成功重 组慢病毒载体会释放到细胞培养上清中,收集包含的重组慢病毒载体的上清液; (4) 将得到的重组慢病毒上清采用抽滤、吸附、洗脱的离子交换方式进行纯化,分别得 到重组慢病毒载体。15. 根据权利要求14所述的构建方法,其特征在于,步骤(4)中,所述抽滤步骤控制上清 体积在200ml~2000ml,真空度控制在-0.5MPA~-0.9MPA,;所述吸附步骤控制溶液的PH值 在6~8;所述洗脱步骤控制洗脱液的离子强度在0.5M~1.0M。16. -种CAR-T细胞,所述的CAR-T细胞是由权利要求1-4任一项所述的抗⑶138嵌合抗 原受体修饰的T淋巴细胞。17. 根据权利要求16所述的CAR-T细胞在制备多发性骨髓瘤治疗药物中的应用。
【文档编号】C12N15/65GK105820254SQ201610224682
【公开日】2016年8月3日
【申请日】2016年4月12日
【发明人】祁伟, 俞磊
【申请人】上海优卡迪生物医药科技有限公司
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1