用于在执行磁性分离工序的仪器中实现磁体的自动移动的方法和设备与流程

文档序号:25996684发布日期:2021-07-23 21:11阅读:75来源:国知局
用于在执行磁性分离工序的仪器中实现磁体的自动移动的方法和设备与流程

本案是申请日为2010年5月17日、申请号为201511001054.0、发明名称为“用于在执行磁性分离工序的仪器中实现磁体的自动移动的方法和设备”的分案申请的再分案申请。

背景

相关专利申请的交叉引用

本专利申请要求根据35u.s.c.119(e)于2009年5月15日提交的美国临时专利申请号61/178,671的权益,该专利的公开内容以全文引用方式并入本文。

本发明涉及用于将所关注的分析物(如,靶核酸)与样品中的其他组分分开和分离的方法、系统和设备。



背景技术:

本文引用的所有文献或指定部分均以引用方式并入本文。然而,对于现有技术,没有文献承认本文要求保护的主题。

核酸检测(nat)工序、以及分析物检测的其他形式通常需要用于将分析物与样品中有可能妨碍检测方案的其他组分分开和分离的样品制备工序。这些样品制备工序中的多个需要将分析物固定在磁响应粒子上,所述磁响应粒子随后在暴露于磁力时被吸出悬浮液。对于所关注的分析物,固定作用可为特异性的或非特异性的。一旦在容器内分离磁响应粒子后,就可抽吸样品的未分离组分并且将磁响应粒子再悬浮于流体介质中。然后可将此过程重复一次或多次以进一步纯化样品。

因此需要具有用于在分析仪中执行样品制备工序的分离、抽吸和再悬浮步骤的紧凑、自动装置,其包括用于移除抽吸步骤中所用的保护尖端的结构。



技术实现要素:

本发明的若干方面在包括流体转移装置和滑动件(包括一个或多个导管剥除元件)的设备中实施。流体转移装置包括一个或多个抽吸器探针,每个抽吸器探针均具有远端并且每个远端均适于具有安装在其上的导管。滑动件的每个剥除元件与对应的抽吸器探针相关联并且每个剥除元件适于从相关联的抽吸器探针的远端移除导管。滑动件可在所述设备中的第一位置与第二位置之间移动,以使得当滑动件位于第一位置中时,没有剥除元件位于接合相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的导管的位置中,并且当滑动件位于第二位置中时,每个剥除元件均位于接合相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的导管的位置中。

在一个实施例中,所述设备还包括由滑动件承载的一个或多个磁体。

在一个实施例中,所述设备还包括被构造用于承载相对抽吸器探针处于操作位置的容器装置的容器支架,并且容器支架被构造和设置用于向由容器支架承载的容器装置选择性地施加轨道运动。

在一个实施例中,流体转移装置包括多个抽吸器探针,并且容器装置包括多个容器,每个容器均与抽吸器探针中的一者相关联。

在一个实施例中,流体转移装置还包括探针移动机构,该探针移动机构适于相对相关联的容器一起移动多个抽吸器探针。

在一个实施例中,所述设备还包括导向结构和滑动件移动机构,其中导向结构用于支承在第一和第二位置之间平移的滑动件,滑动件移动机构适于实现滑动件在第一和第二位置之间的动力移动。

在一个实施例中,滑动件移动机构包括电机、耦接至电机的输出轴的螺纹驱动螺杆以及安装至滑动件的螺杆从动器。驱动螺杆与螺杆从动器接合以使得驱动螺杆通过电机进行动力旋转从而引起滑动件的平移。

在一个实施例中,滑动件移动机构包括电机(具有安装至其输出轴的驱动皮带轮)、惰轮、以及承载在驱动皮带轮和惰轮上并且耦接至滑动件以将驱动皮带轮的动力旋转转换为滑动件的平移的驱动皮带。

在一个实施例中,所述设备还包括多个抽吸器探针,并且滑动件包括多个剥除元件。剥除元件设置成交错构型以使得当多个抽吸器探针相对多个剥除元件移动时,剥除元件从相关联的抽吸器探针逐一连续地移除导管。

本发明的其他方面在包括容器支架、流体转移装置和磁体移动设备的设备中实施。容器支架被构造用于承载容纳包含磁响应固体载体的溶液的容器以及在整个流体转移过程中承载该容器。流体转移装置包括多个抽吸器探针。容器支架被构造和设置用于向由该容器支架承载的容器选择性地施加运动以混合容器的内容物以及在相对流体转移装置的第一位置与相对流体转移装置的第二位置之间选择性地移动容器。磁体移动设备包括至少一个产生磁场的磁体并且被构造和设置用于实现磁体在操作位置(相对承载在容器支架中的容器)与非操作位置(相对承载在容器支架中的容器)之间的线性平移。当至少一个磁体位于操作位置中时,磁场将磁响应固体载体吸引至容器中邻近磁体的内表面,并且当磁体位于非操作位置中时(与磁体位于操作位置中时相比),磁场对磁响应固体载体的影响较小。当容器设置在相对流体转移装置的第一位置中时,其干扰磁体移动设备从非操作位置到操作位置的平移。

在一个实施例中,容器支架被构造和设置用于向由其承载的容器装置施加轨道运动。

在一个实施例中,流体转移装置还包括探针移动机构,该探针移动机构适于相对容器支架一起移动多个探针。探针移动机构和容器支架被构造和设置为使得当容器支架位于第一位置中时,多个探针相对容器支架的移动将引起每个探针的远端接合承载于容器装置(由容器支架承载)上的相关联的导管,从而导管变为安装在每个探针的远端上。

在一个实施例中,磁体移动设备包括多个剥除元件。每个剥除元件与对应的抽吸器探针相关联并且适于从相关联抽吸器探针的远端移除导管。当磁体移动设备位于操作位置中时,每个剥除元件位于接合相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的导管的位置中,并且当磁体移动设备位于非操作位置中时,没有剥除元件位于接合相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的导管的位置中。

在一个实施例中,磁体移动设备包括被构造用于承载磁体的磁体支架、电机、耦接至电机的输出轴的螺纹驱动螺杆、以及安装至磁体支架的螺杆从动器。驱动螺杆与螺杆从动器接合以使得驱动螺杆通过电机进行动力旋转从而引起磁体支架的平移。

在一个实施例中,磁体移动设备包括被构造用于承载磁体的磁体支架、电机(具有安装至其输出轴的驱动皮带轮)、惰轮、以及承载在驱动皮带轮和惰轮上并且耦接至磁体支架以将驱动皮带轮的动力旋转转换为磁体支架的平移的驱动皮带。

本发明的其他方面在用于从多个流体转移探针的每一个的远端移除导管的方法中实施。通过沿横向于探针从第一位置到第二位置的轴线的方向的动力平移来移动滑动件。当滑动件位于第一位置中时,滑动件中没有一部分位于通过探针中的任何一个探针接合的位置中,并且当滑动件位于第二位置中时,滑动件的导管剥除部分位于通过探针的远端接合的位置中。当滑动件位于第二位置中时,相对滑动件轴向移动探针从而将探针的远端与滑动件的导管剥除部分接合以便从探针剥除导管。

在一个实施例中,从探针的远端剥除导管包括沿轴向方向朝滑动件移动探针直至设置在探针远端的导管接合滑动件的导管剥除部分并且随后沿远离滑动件的相反轴向方向移动探针同时利用滑动件的导管剥除部分保留导管以便从探针的远端拉出导管。

在一个实施例中,利用滑动件的导管剥除部分保留导管包括为每个导管剥除部分提供具有第一部分和第二部分的锁孔开口,所述第一部分具有足以允许导管从中穿过的横向尺寸,所述第二部分具有足以允许探针从中穿过、但不足以允许导管从中穿过的横向尺寸;将其上设置有导管的探针的远端穿过锁孔开口的第一部分。在探针和滑动件之间进行相对移动以使得探针位于锁孔开口的第二部分中。然后从锁孔开口退出探针同时通过导管剥除部分保留导管,此时导管不能穿过锁孔开口的第二部分。

在一个实施例中,导管中的每个导管在探针远离滑动件进行轴向移动期间相继被保留,使得全部导管并非同时从探针的远端拉出。

在一个实施例中,将一个或多个磁体安装在滑动件上,以使得当滑动件位于第一位置中时,磁体对容纳在容器装置(设置为便于可通过探针接合)中的磁响应固体载体基本上不具有影响,并且当滑动件位于第二位置中时,磁体设置为邻近容器装置以便磁体将磁响应固体载体的至少一部分吸引至容器装置的壁处。

在一个实施例中,磁响应固体载体适于在其上固定分析物。

本发明的其他方面在用于将所关注的分析物与容纳在容器内的样品的其他组分分离的系统中实施。所述系统包括容器保持站(station)和磁性分离站。容器保持站被构造用于接纳和保持通过容器传送器递送至该容器保持站的容器并且包括一个或多个固定磁体,所述固定磁体设置为将磁场施加至保持在容器保持站内的容器中的内容物。磁性分离站包括一个或多个磁体并且被构造和设置为对于通过容器传送器从容器保持站传送至磁性分离站的容器中的内容物执行磁性分离工序,具体方式为磁性分离固定在磁响应固体载体上的分析物并且从容器移除样品的其他组分。

在一个实施例中,所述系统还包括被构造用于在容器保持站和磁性分离站之间自动移动容器的容器传送器。

在一个实施例中,容器保持站被构造用于接纳和保持包括多个独立容器的容器装置。

在一个实施例中,容器保持站被构造用于接纳和保持至少两个容器装置。

在一个实施例中,容器保持站包括基底块、从基底块向上延伸的两个或更多个壁、以及部分覆盖两个或更多个壁并且限定相邻的每对壁之间的容器狭槽的护罩。在一个实施例中,容器保持站包括从基底块向上延伸并且限定第一和第二壁之间的第一容器狭槽以及第二和第三壁之间的第二容器狭槽的第一壁、第二壁、和第三壁。

在一个实施例中,容器保持站的基底块由塑料制成。

在一个实施例中,容器保持站还包括弹性容器保持元件,所述弹性容器保持元件位于每个容器狭槽内并且被构造用于以可释放方式保持位于每个容器狭槽内的容器。

在一个实施例中,弹性容器保持元件中的每一个均包括设置在夹片凹槽中的夹片,所述夹片凹槽形成于限定容器狭槽的每对壁中的一个壁内。

在一个实施例中,容器保持站还包括附接至限定容器狭槽的每对壁中的一个壁的磁体子组件。磁体子组件包括多个磁体、上夹持板、和下夹持板,所述上夹持板设置在形成于磁体中的每一个的顶表面中的夹持板凹槽内并且在其每一末端以及相邻磁体之间均包括分立凸起以将每个磁体保持在其相应位置内,所述下夹持板设置在形成于磁体的下表面中的夹持板凹槽内并且在其相对末端以及相邻磁体之间均包括分立凸起以将每个磁体保持在其相应位置内。

在一个实施例中,磁体中的每个磁体均具有大致实心、矩形的形状。

在一个实施例中,磁性分离站包括被构造和设置用于在第一位置和第二位置之间移动一个或多个磁体的磁体移动设备,在所述第一位置中,磁体对容纳在容器内的磁响应固体载体基本上不具有影响,在所述第二位置中,磁体引起固体载体在容器内变为分离的。

本发明的其他方面在用于将所关注的分物与容纳在容器内的样品的其他组分分离的方法中实施。在第一位置处,将容纳分散于包含样品材料的流体介质中的磁响应固体载体的容器暴露于第一磁场,由此在容器内分离固体载体。固体载体适于在其上固定分析物。然后将容器转移至第二位置。在第二位置处,使容器中的内容物经受第二磁场由此在容器内分离固体载体、从分离的固体载体移除容器中的流体内容物、随后移除第二磁场、将悬浮液流体分配到容器内、并且再悬浮固体载体。

在一个实施例中,将在第二位置处进行的步骤重复一次或多次。

在一个实施例中,在重复该步骤一次或多次之后,从第二位置移出容器。

在一个实施例中,第一位置包括被构造用于接纳和保持容器的容器保持站并且包括一个或多个被构造和设置用于向保持在容器保持站内的容器中的内容物施加第一磁场的固定磁体。

在一个实施例中,第二位置包括磁性分离站,所述磁性分离站被构造和设置用于通过下述方式在容器上执行磁性分离工序,所述方式为设置磁体以磁性分离磁响应固体载体并且随后从容器移除流体介质。

在一个实施例中,转移步骤包括利用自动化容器传送器从第一位置退出容器、利用容器传送器将容器从第一位置运送至第二位置、并且利用容器传送器将容器设置在第二位置处。

在一个实施例中,容器内的固体载体在从第一位置转移到第二位置期间基本上保持为分离的。

本发明包括:

1.一种设备,包括:

流体转移装置,所述流体转移装置包括一个或多个抽吸器探针,每个抽吸器探针均具有远端,并且每个远端均适于具有安装在其上的导管;

滑动件,所述滑动件包括一个或多个导管剥除元件,每个剥除元件均与对应的抽吸器探针相关联,并且每个剥除元件均适于从所述相关联的抽吸器探针的远端移除导管,

其中所述滑动件可在所述设备中的第一位置和第二位置之间移动,以使得当所述滑动件位于所述第一位置时,没有剥除元件位于接合所述相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的所述导管的位置,并且当所述滑动件位于所述第二位置时,每个剥除元件均位于接合所述相关联的抽吸器探针以剥除安装在其上的所述导管的位置。

2.根据项1所述的设备,还包括由所述滑动件承载的一个或多个磁体。

3.根据项1或2中任一项所述的设备,还包括被构造用于承载相对所述抽吸器探针位于操作位置中的容器装置的容器支架,其中所述容器支架被构造和设置用于向由所述容器支架承载的容器装置选择性地施加轨道运动。

4.根据项1-3中任一项所述的设备,其中所述流体转移装置包括多个抽吸器探针,并且其中所述容器装置包括多个容器,每个容器均与所述抽吸器探针中的一个抽吸器探针相关联。

5.根据项4所述的设备,其中所述流体转移装置还包括探针移动机构,所述探针移动机构适于相对所述相关联的容器一起移动所述多个抽吸器探针。

6.根据项1-5中任一项所述的设备,还包括导向结构和滑动件移动机构,所述导向结构用于支承在所述第一位置和第二位置之间平移的所述滑动件,所述滑动件移动机构适于实现所述滑动件在所述第一位置和第二位置之间的动力移动。

7.根据项6所述的设备,其中所述滑动件移动机构包括:

电机;

螺纹驱动螺杆,所述螺纹驱动螺杆耦接至所述电机的输出轴;和

螺杆从动器,所述螺杆从动器安装至所述滑动件,其中所述驱动螺杆与所述螺杆从动器接合以使得所述驱动螺杆通过所述电机进行动力旋转从而引起所述滑动件的平移。

8.根据项6所述的设备,其中所述滑动件移动机构包括:

电机,所述电机具有安装至其输出轴的驱动皮带轮;

惰轮;和

驱动皮带,所述驱动皮带承载于所述驱动皮带轮和所述惰轮上并且耦接至所述滑动件以将所述驱动皮带轮的动力旋转转换为所述滑动件的平移。

9.根据项1-8中任一项所述的设备,其包括多个所述抽吸器探针,并且其中所述滑动件包括多个剥除元件,并且所述剥除元件设置成交错构型以使得当所述多个抽吸器探针相对所述多个剥除元件移动时,所述剥除元件从所述相关联的抽吸器探针逐一连续地移除所述导管。

10.一种设备,所述设备包括:

容器支架,所述容器支架被构造用于承载容纳包含磁响应固体载体的溶液的容器装置以及在整个流体转移过程中承载所述容器装置;

流体转移装置,所述流体转移装置包括多个抽吸器探针;

其中所述容器支架被构造和设置用于向由所述容器支架承载的容器装置选择性地施加运动以混合所述容器装置中的内容物以及在相对所述流体转移装置的第一位置与相对所述流体转移装置的第二位置之间选择性地移动所述容器装置;以及

磁体移动设备,所述磁体移动设备包括至少一个产生磁场的磁体,所述磁体移动设备被构造和设置用于实现所述至少一个磁体在相对承载于所述容器支架中的所述容器装置的操作位置与相对承载于所述容器支架中的所述容器装置的非操作位置之间的线性平移,

其中当所述至少一个磁体位于所述操作位置中时,所述至少一个磁体的所述磁场将所述磁响应固体载体吸引至所述容器装置中邻近所述至少一个磁体的内表面,并且其中与当所述至少一个磁体位于所述操作位置中时相比,当所述至少一个磁体位于所述非操作位置中时,所述磁场对所述磁响应固体载体的影响较小,并且

当所述容器装置设置在相对所述流体转移装置的所述第一位置中时,所述容器装置干扰所述磁体移动设备从所述非操作位置到所述操作位置的平移。

11.根据项10所述的设备,其中所述容器支架被构造和设置用于向由其承载的所述容器装置施加轨道运动。

12.根据项10或11中任一项所述的设备,其中所述流体转移装置还包括适于相对所述容器支架一起移动所述多个探针的探针移动机构,并且其中所述探针移动机构和所述容器支架被构造和设置为使得当所述容器支架位于所述第一位置中时,所述多个探针相对所述容器支架的移动将引起每个探针的远端接合承载于由所述容器支架承载的所述容器装置上的相关联的导管,从而导管变为安装在每个探针的远端上。

13.根据项10-12中任一项所述的设备,其中所述磁体移动设备包括多个剥除元件,每个剥除元件均与对应的抽吸器探针相关联,并且每个剥除元件均适于从所述相关联的抽吸器探针的远端移除导管,

其中当所述磁体移动设备位于所述操作位置中时,每个剥除元件均位于接合所述相关联的抽吸器探针以剥除其上安装的所述导管的位置中,并且当所述磁体移动设备位于所述非操作位置中时,没有剥除元件位于接合所述相关联的抽吸器探针以剥除其上安装的所述导管的位置中。

14.根据项10-13中任一项所述的设备,其中所述磁体移动设备包括:

磁体支架,所述磁体支架被构造用于承载所述磁体;

电机;

螺纹驱动螺杆,所述螺纹驱动螺杆耦接至所述电机的输出轴;和

螺杆从动器,所述螺杆从动器安装至所述磁体支架,其中所述驱动螺杆与所述螺杆从动器接合以使得所述驱动螺杆通过所述电机进行动力旋转从而引起所述磁体支架的平移。

15.根据项10-13中任一项所述的设备,其中所述磁体移动设备包括:

磁体支架,所述磁体支架被构造用于承载所述磁体;

电机,所述电机具有安装至其输出轴的驱动皮带轮;

惰轮;和

驱动皮带,所述驱动皮带承载于所述驱动皮带轮和所述惰轮上并且耦接至所述磁体支架以将所述驱动皮带轮的动力旋转转换为所述磁体支架的平移。

16.一种用于从多个流体转移探针的每个流体转移探针的远端移除导管的方法,包括:

实现滑动件沿横向于所述探针的轴线的方向从第一位置到第二位置的动力线性平移,其中当所述滑动件位于所述第一位置中时,所述滑动件中没有一部分位于通过所述探针中的任何一个探针接合的位置中,并且当所述滑动件位于所述第二位置中时,所述滑动件的导管剥除部分均位于通过所述探针的远端接合的位置中;以及

实现所述探针相对所述滑动件的动力轴向移动以将所述探针的远端与所述滑动件的导管剥除部分接合并且从所述探针剥除导管。

17.根据项16所述的方法,其中从所述探针的远端剥除所述导管包括沿轴向方向朝所述滑动件移动所述探针直至设置在所述探针的远端的所述导管接合所述滑动件的导管剥除部分并且随后沿远离所述滑动件的相反轴向方向移动所述探针同时利用所述滑动件的导管剥除部分保留所述导管以便从所述探针的远端拉出所述导管。

18.根据项16所述的方法,其中利用所述滑动件的导管剥除部分保留所述导管包括:

为每个导管剥除部分提供具有第一部分和第二部分的锁孔开口,所述第一部分具有足以允许所述导管从中穿过的横向尺寸,所述第二部分具有足以允许所述探针从中穿过、但不足以允许所述导管从中穿过的横向尺寸;

将其上设置有所述导管的所述探针的远端穿过所述锁孔开口的第一部分;

在所述探针和所述滑动件之间实现相对移动以使得所述探针位于所述锁孔开口的第二部分中;以及

从所述锁孔开口退出所述探针,当所述导管不能穿过所述锁孔开口的第二部分时,所述导管被所述导管剥除部分保留。

19.根据项18所述的方法,包括在所述探针远离所述滑动件进行轴向移动期间相继保留所述导管的每个导管,使得全部导管并非同时从所述探针的远端拉出。

20.根据项16-19中任一项所述的方法,还包括将一个或多个磁体安装在所述滑动件上,以使得当所述滑动件位于所述第一位置中时,所述磁体对容纳在设置为便于可通过所述探针接合的容器装置中的磁响应固体载体基本上不具有影响,并且当所述滑动件位于所述第二位置中时,所述磁体设置为邻近所述容器装置以便所述磁体将所述磁响应固体载体的至少一部分吸引至所述容器装置的壁处。

21.根据项20所述的方法,其中所述磁响应固体载体适于在其上固定分析物。

22.一种用于将容纳在容器内的样品的所关注的分析物与其他组分分离的系统,所述系统包括:

容器保持站,所述容器保持站被构造用于接纳和保持通过容器传送器递送至所述容器保持站的容器,所述容器保持站包括一个或多个固定磁体,所述固定磁体设置为将磁场施加至保持在所述容器保持站内的所述容器中的内容物;和

磁性分离站,所述磁性分离站包括一个或多个磁体,所述磁性分离站被构造和设置为通过下述方式对于通过容器传送器从所述容器保持站传送至所述磁性分离站的容器中的内容物执行磁性分离工序,所述方式为磁性分离固定在磁响应固体载体上的分析物并且从所述容器移除所述样品的其他组分。

23.根据项22所述的系统,还包括容器传送器,所述容器传送器被构造用于在所述容器保持站和所述磁性分离站之间自动移动所述容器。

24.根据项22或23中任一项所述的系统,其中所述容器保持站被构造用于接纳和保持包括多个独立容器的容器装置。

25.根据项22-24中任一项所述的系统,其中所述容器保持站被构造用于接纳和保持至少两个容器装置。

26.根据项22-25中任一项所述的系统,其中所述容器保持站包括:

基底块;

两个或更多个壁,所述壁从所述基底块向上延伸;和

护罩,所述护罩部分覆盖所述两个或更多个壁并且限定每个相邻的一对壁之间的容器狭槽。

27.根据项26所述的系统,其中所述容器保持站包括第一壁、第二壁和第三壁,所述第一壁、第二壁和第三壁从所述基底块向上延伸并且限定所述第一壁和第二壁之间的第一容器狭槽以及所述第二壁和第三壁之间的第二容器狭槽。

28.根据项26或27中任一项所述的系统,其中所述容器保持站的基底块由塑料制成。

29.根据项26-28中任一项所述的系统,其中所述容器保持站还包括弹性容器保持元件,所述弹性容器保持元件位于每个容器狭槽内并且被构造用于以可释放方式保持位于每个容器狭槽内的容器。

30.根据项29所述的系统,其中所述弹性容器保持元件的每一个均包括设置在夹片凹槽中的夹片,所述夹片凹槽形成于限定容器狭槽的每对壁中的一个壁内。

31.根据项26-30中任一项所述的系统,其中所述容器保持站还包括附接至限定容器狭槽的每对壁中的一个壁的磁体子组件,其中所述磁体子组件包括:

多个磁体;

上夹持板,所述上夹持板设置在形成于所述磁体中每个磁体的顶表面中的夹持板凹槽内,并且在其每一末端和相邻磁体之间均包括分立凸起以将每个磁体保持在其相应位置内;以及

下夹持板,所述下夹持板设置在形成于所述磁体的下表面中的夹持板凹槽内,并且在其相对末端和所述相邻磁体之间均包括分立凸起以将每个磁体保持在其相应位置内。

32.根据项31所述的系统,其中所述磁体中的每个磁体均具有大致实心、矩形的形状。

33.根据项22-32中任一项所述的系统,其中所述磁性分离站包括被构造和设置用于在第一位置和第二位置之间移动所述磁性分离站的所述一个或多个磁体的磁体移动设备,在所述第一位置中,所述磁体对容纳在所述容器内的所述磁响应固体载体基本上不具有影响,在所述第二位置中,所述磁体使得所述固体载体在所述容器内变为分离的。

34.一种用于将容纳在容器内的样品的所关注的分析物与其他组分分离的方法,所述方法包括下述自动步骤:

a)在第一位置处,将容纳分散于包含样品材料的流体介质中的磁响应固体载体的容器暴露于第一磁场,由此在所述容器内分离所述固体载体,其中所述固体载体适于在其上固定分析物;

b)将所述容器转移至第二位置;

c)在所述第二位置处,执行下述步骤:

i)使所述容器中的内容物经受第二磁场,由此在所述容器内分离所述固体载体;

ii)从所述分离的固体载体移除所述容器中的流体内容物;

iii)移除所述第二磁场;

iv)将悬浮液流体分配到所述容器内;以及

v)再悬浮所述固体载体。

35.根据项34所述的方法,还包括重复步骤c)至g)一次或多次。

36.根据项35所述的方法,还包括在重复步骤c)至g)一次或多次之后,从所述第二位置移出所述容器。

37.根据项34-36中任一项所述的方法,其中所述第一位置包括容器保持站,该容器保持站被构造用于接纳和保持所述容器并且包括一个或多个被构造和设置用于在步骤a)期间向保持在所述容器保持站内的所述容器中的内容物施加所述第一磁场的固定磁体。

38.根据项34-37中任一项所述的方法,其中所述第二位置包括磁性分离站,所述磁性分离站被构造和设置用于通过下述方式在所述容器上执行磁性分离工序,所述方式为设置磁体以磁性分离所述磁响应固体载体并且随后从所述容器移除所述流体介质。

39.根据项34-38中任一项所述的方法,其中所述转移步骤包括:

利用自动化容器传送器从所述第一位置退出容器;

利用所述容器传送器将所述容器从所述第一位置运送至所述第二位置;以及

利用所述容器传送器将所述容器设置在所述第二位置处。

40.根据项34-39中任一项所述的方法,其中所述固体载体在步骤b)期间于所述容器内基本上保持为分离的。

对于本领域的技术人员而言,在考虑下述具体实施方式、所附权利要求书和附图之后,本发明的这些和其它特征、方面和优点将变得显而易见。

附图说明

图1为与实施本发明的若干方面的设备结合使用的形式为多容器装置的反应容器的透视图;

图2为与用于执行磁性分离工序且承载于图1所示的多容器装置上的仪器结合使用的接触限制性尖端的侧视图;

图3为沿图1中的箭头“60”方向观察的多容器装置的一部分的放大仰视图;

图4为其中移除侧板的磁性分离站的透视图;

图5为磁性分离站的局部横截面;

图6为其末端带有污染限制性尖端的磁性分离站的抽吸器管的尖端的局部横截面;

图7为磁性分离站的容器支架单元、轨道搅拌器组件和隔离板的分解透视图;

图8为磁性分离站的洗涤溶液分配器喷嘴、末端接合有污染限制性尖端的抽吸器管以及容器支架单元的局部横截面图,其中示出承载于容器支架单元内的多容器装置反应容器以及插入到多容器装置的容器内的抽吸器管和污染限制性尖端;

图9为磁性分离站的洗涤溶液分配器喷嘴、抽吸器管和容器支架单元的局部横截面图,其中示出承载于容器支架单元内的多容器装置以及接合污染限制性尖端的抽吸器管,所述污染限制性尖端保持在多容器装置的污染限制性元件保持结构内;

图10为示出磁体移动设备的替代实施例的磁性分离站的一部分的俯视透视图;

图11为图10中的磁体移动设备的局部透视图;

图12为示出磁体移动设备的另一个替代实施例的磁性分离站的局部透视图;

图13为图12中的磁体移动设备的磁体滑车的俯视透视图;

图14为图13中的磁体滑车的仰视透视图;

图15为图13和14中的磁体滑车的俯视图。

图16为用于反应容器的磁性容器保持站的主视透视图。

图17为磁性容器保持站的后视透视图。

图18为从附图中省去容器保持站的多个组件的容器保持站的局部主视透视图。

图19为磁性容器保持站中的磁体子组件的透视图。

图20为适于与本发明的实施例结合使用的形式为容器分配器的容器转移设备的透视图。

图21为处于伸展位置的容器分配头和钩致动器系统的透视图。

图22为示出用于将所关注的分析物(如,靶核酸)与使用磁体和磁响应固体载体的样品中的其他组分分离或分开的工序的流程图。

具体实施方式

样品通常包括能够干扰分析物(如,靶核酸)检测的材料或者被处理以释放所述材料。为了移除这些干扰材料,可利用靶捕集试剂来处理样品,所述靶捕集试剂包括用于固定分析物的磁响应固体载体。参见例如美国专利号4,486,539、4,751,177、5,288,609、5,780,224、6,433,160和6,534,273。合适的固体载体为具有共价结合寡(脱氧胸苷酸)14的顺磁性粒子(0.7-1.05微米的粒子,sera-magtmmg-cm,以目录号no.24152105-050450得自seradyn公司(indianapolis,in))。当使固体载体极度靠近磁力时,固体载体被吸出悬浮液并且聚集在样品保持容器的表面附近,由此分离出容器内的任何固定分析物。然后可抽吸样品中的非固定材料或者或是使其与固定的分析物分离。可执行一个或多个洗涤步骤以进一步纯化分析物。

用于执行将所关注的分析物与样品中的其他组分分开和分离工序的方法、系统、和设备在磁性分离站中实施,所述磁性分离站的实施例示于图4中。磁性分离站包括被构造用于接纳反应容器的壳体,所述反应容器容纳样品材料和包括磁响应固体载体的靶捕集试剂,所述磁响应固体载体适于直接或间接结合至可存在于样品中的所关注分析物,例如核酸。示例性的反应容器和样品制备工序的细节更详细地描述于下文中。

磁性分离站包括用于将磁响应固体载体吸引至反应容器的侧壁的磁体以及用于在第一位置(在该位置中,磁体对容纳在反应容器内的磁响应固体载体基本上不具有影响)与第二位置(在该位置中,磁体将磁响应固体载体吸引至反应容器的侧壁)之间选择性地移动磁体的设备。在特定实施例中,用于选择性移动磁体的设备被构造用于实现磁体在第一和第二位置之间的线性平移。这种设备可包括其上承载磁体并且可通过由电机驱动的皮带或螺杆进行致动以用于线性平移的滑车。磁性分离站还包括用于从保持在该站中的反应容器抽吸流体的设备、用于将流体分配到反应容器内的设备、以及用于在抽吸和分配步骤之后摇动反应容器以再悬浮磁响应固体载体和其他材料的设备。用于从反应容器抽吸流体的设备可包括抽吸器管,并且可移除的保护尖端可设置在抽吸器管的末端上且在每个反应容器通过磁性分离站进行处理之后更换为新尖端以避免从一个反应容器到下一个反应容器的污染。用于实现磁体的线性移动的设备可包括尖端移除元件,所述尖端移除元件适于在每个容器通过磁性分离站进行处理之后从抽吸器管移除尖端。

将容纳样品材料和靶捕集试剂(包括磁响应固体载体)的反应容器设置在磁性分离站内,并且将磁体从第一、无影响位置移至邻近反应容器的第二位置。将磁体在第二位置中保持指定的驻留时间以将磁响应固体载体吸引至反应容器的侧面。在指定的驻留时间之后,使磁体仍位于第二位置中,此时从容器抽吸反应容器中的流体内容物。然后将洗涤溶液或其他悬浮流体分配到反应容器内,将磁体移回至第一位置,并且摇动反应容器以洗涤得自反应容器壁的磁响应固体载体且再悬浮磁响应固体载体。然后将磁体移回至第二位置以将磁响应固体载体吸引至反应容器的壁并且吸引出悬浮液。可将施加指定的驻留时间的磁力、从反应容器抽吸流体、以及再悬浮磁响应固体载体的这个过程重复指定的次数。

磁性分离站可为包括被构造用于接纳一个或多个反应容器的多个模块的仪器的一部分,其中在所述反应容器内执行多步骤分析过程(例如核酸检测(nat))或者其他化学、生化或生物过程的一个或多个步骤。所述仪器还可包括被构造用于在各个模块之间转移反应容器(包括将反应容器传送到磁性分离站内部和外部)的转移设备。所述仪器和每个独立组件(例如磁性分离站)为自动化的并且可通过仪器控制模块(包括执行其上存储的仪器控制程序的微处理器)进行控制。

磁性分离站的其他细节描述于下文中。

本发明的其他方面在磁性容器保持站中实施,所述磁性容器保持站的实施例示于图16中。容器保持站包括被构造用于在固定位置中接纳和临时保持反应容器的结构。容器保持站包括磁体,所述磁体被构造成当容器保持在容器保持站内时便于设置在反应容器附近。可将容纳已添加磁响应固体载体的样品材料的反应容器在容器保持站内放置指定的驻留时间,随后将反应容器移至磁性分离站内。在将容器设置到磁性分离站中之前,磁响应固体载体将被吸引至反应容器的侧壁以形成固体载体的聚集体,由此至少降低磁性分离站内所需的第一磁性驻留时间。

磁性容器保持站的其他细节描述于下文中。

多容器装置

如图1所示,可与本发明的磁性分离站和磁性容器保持站结合使用的形式为多容器装置(“mrd”)160的反应容器包括多个独立容器162(优选五个)。其他类型的容器装置(包括具有单个独立容器的装置)可与磁性分离站和磁性容器保持站结合使用。在图示实施例中,容器162为具有开放顶端和封闭底端的圆柱形管形式并且彼此通过连接肋结构164进行连接,所述连接肋结构164限定沿mrd160的任一侧面纵向延伸的向下面对的肩部。在mrd160的图示实施例中,容器162中的全部容器均具有基本上相同的尺寸和形状。在其他实施例中,mrd160可包括可被构造成与磁性分离站和磁性容器保持站结合使用的具有不同尺寸和形状的容器。

在一个实施例中,mrd160由注塑成型的聚丙烯(例如由flinthillsresources以产品号p5m6k-048制备的聚丙烯)形成。

在mrd160的一端提供弓形防护结构169。mrd操作结构166从防护结构169延伸。该操作结构适于接合传送机构,所述传送机构用于在仪器的不同位置或模块之间移动mrd160。与mrd160相容的示例性传送机构描述于美国专利号6,335,166和美国临时专利申请号61/178,728以及对应的非临时美国专利申请序号12/781,241中。mrd操作结构166包括从防护结构169延伸的横向延伸板168以及位于板168的相对末端上的竖直延伸片167。角撑板壁165从防护结构169与竖直片167之间的横向板168向下延伸。

如图3所示,防护结构169和竖直片167具有相互面对的凸表面。mrd160可通过将接合构件(沿方向"a")横向移动到防护结构169和竖直片167之间的空间内来接合传送机构和其他组件。防护结构169和竖直片167的凸表面为进行横向相对运动以进入所述空间的接合构件提供较宽的进入点。

具有平坦标签接纳表面175的标签接纳结构174设置在mrd160中背对防护结构169和mrd操作结构166的末端上。可将人和/或机器可读标签(例如可扫描条形码)设置在表面175上以在mrd160上提供识别和指示信息。

mrd160优选包括位于每个相应容器162的开口附近的尖端保持结构176。每个尖端保持结构176提供其内接纳适于设置到抽吸器管860的末端上的导管(例如接触限制性尖端170)的圆柱形孔口。尖端170的构造和功能将在下文进行描述。每个保持结构176可被构造和设置用于以摩擦方式接纳尖端170,这样避免尖端170在倒转mrd160时从保持结构176滑出,但允许尖端170在接合抽吸器管860时从保持结构176移除。

如图2所示,尖端170包括大致圆柱形的结构,其具有周边凸缘177和上颈环178,所述上颈环178与尖端170的下部179相比具有通常较大的直径。尖端170优选由导电性聚丙烯形成。当将尖端170插入到保持结构176的孔口内时,凸缘177接触结构176的顶部并且颈环178在尖端170和保持结构176之间提供适当但可释放的过盈配合。作为另外一种选择,每个保持结构176可被构造为松散地接纳尖端170以使得尖端170在接合抽吸器管860时更易从保持结构移除。

轴向延伸的通孔180穿过尖端170。孔180包括位于尖端170的顶部的外喇叭形末端181,所述外喇叭形末端181有利于将管状探针(未示出)插入到尖端170内。可在孔180的内壁上设置两个环状脊183。脊183在尖端170和插入到尖端170内的管状探针之间提供过盈摩擦配合。

尖端170的底端优选包括倾斜部分182。当将尖端170用于插入到反应容器(例如mrd160中的容器162)底部的抽吸器管860的末端上时,倾斜部分182避免在尖端170的末端和反应容器的底部之间形成真空。

有关mrd160的其他细节可见于美国专利号6,086,827中。

样品制备工序

对于核酸检测而言,可能需要裂解或透化细胞以首先释放靶向核酸并且可使其可用于与检测探针进行混成。参见例如clark等人的美国专利号5,786,208“methodforextractingnucleicacidsfromawiderangeoforganisms”。如果细胞得到裂解,则所得裂解物的内容物除核酸之外还可包括细胞器、蛋白(包括诸如蛋白酶和核酸酶之类的酶)、糖、和脂质,从而可能需要进一步地纯化核酸。另外,对于病原生物体,可能需要生物体的化学或热灭活。可通过本领域的技术人员熟知的多种方式来裂解或透化细胞,包括通过化学、机械(如,超声波降解)和/或热方式。

使用磁响应固体载体捕集核酸的各种方法为本领域中已知的并且可用于本发明中。这些方法可对于靶向核酸为特异性或非特异性的。一种此类方法为固相可逆化固定法,该方法基于核酸在具有羧基涂布表面的磁性微固体载体上的选择性固定。参见美国专利号5,705,628。在另一种方法中,其上衍生有聚(脱氧胸苷酸)序列的磁性粒子结合具有5'聚(脱氧腺苷酸)尾和3'靶结合序列的捕集探针。参见美国专利号6,534,273。另一种方法基于技术(invitrogen公司(carlsbad,ca);目录号cs12000),该技术为基于磁珠的技术,其提供电荷依赖于周围缓冲液ph以有利于核酸纯化的可转换表面。在低ph环境下,磁珠具有正电荷,其结合带负电荷的核酸主链。未结合的蛋白和其他污染物可被洗涤掉。通过将ph增加至8.5,表面上的电荷得到中和并且结合的核酸被洗脱。

对于包括捕集探针的方法,捕集探针可对于靶向核酸为特异性或非特异性的。特异性捕集探针包括靶结合区,所述靶结合区被选择为在预定组的条件下结合靶核酸且不结合非靶核酸。非特异性捕集探针在使用条件下不区分靶核酸和非靶核酸。摆动捕集探针为非特异性捕集探针的实例并且可包括至少一个随机或非随机聚(k)序列,其中“k”可表示鸟嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶碱基。参见美国专利申请公开号us2008-0286775a1。除了氢键合胞核嘧啶,其嘧啶补体鸟嘌呤也将氢键合胸腺嘧啶和尿嘧啶。每个“k”也可表示简并核苷(例如肌苷或水粉蕈素)、一般碱基(例如,3-硝基吡咯、5-硝基吲哚或4-甲基吲哚)、或者嘧啶或嘌呤碱基类似物(例如dp或dk)。摆动捕集探针的聚(k)序列具有足够的长度以便非特异性地结合靶核酸,并且优选长度为6至25个碱基。

通过将指定量的靶捕集试剂分配到容器装置的每个样品保持容器内来制备用于磁性分离工序的样品材料。可通过手动方式或通过自动化机器人移液设备来执行分配到mrd160的容器162中的每个容器内。靶捕集试剂包括固体载体材料,所述固体载体材料能够直接或间接结合至分析物(例如通过捕集探针),由此将分析物固定在包括磁响应粒子或珠的固体载体上。分配到每个容器162内的量通常在100-500微升的范围内。

磁性分离站

转到图4-5,磁性分离站800包括具有上部801和下部803的模块壳体802。安装凸缘805、806从用于安装磁性分离站800的下部803延伸以通过合适的机械紧固件来支承表面。定位销807和811从壳体802的下部803的底部延伸。销807和811与形成于支承表面中的孔口(未示出)对准以有助于在通过紧固件固定壳体802之前来将磁性分离站800定位在支承表面上。

装载狭槽804延伸穿过下部803的前壁以允许传送机构(未示出)将容器装置(例如mrd160)设置到磁性分离站800内以及将容器装置从磁性分离站800中移出。锥形狭槽延伸件821可设置在装载狭槽804的一部分的周围以有利于通过狭槽804插入容器。隔离板808将上部801与下部803分开。

容器支架单元820设置在位于隔离板808下方的装载狭槽804附近,以用于操作性地支承设置在磁性分离站800内的容器。为了示例性目的,图5中所示的容器支架单元820承载mrd160,但可使用其他容器,包括单个独立的容器以及具有不同形状和尺寸的容器的多容器装置。转到图7,容器支架单元820具有用于接纳容器装置(例如mrd160)的上端的狭槽822。在图示实施例中,下分叉板824附接至容器支架单元820的底部并且在mrd160滑入支架单元820内时支承其连接肋结构164的底面(参见图8和9)。弹簧夹片826附接至支架单元820,且其相对叉片831、833延伸到狭槽822内从而将容器以可释放方式保持在支架单元820内。

作为图7中所示的装置的替代形式,容器支架单元820可包括单个注塑成型的部件,其可包括整体形成的凸缘(如果被构造用于支承mrd160)和整体形成的塑性弹簧元件(用于将容器保持在容器支架单元820内)。

轨道混合器组件828耦接至支架单元820以用于轨道混合由容器支架单元820保持的mrd或其他容器装置中的内容物。轨道混合器组件828包括安装在电机安装板832上的步进电机830、具有偏心销836的驱动皮带轮834、具有偏心销840的惰轮838、以及连接驱动皮带轮834与惰轮838的皮带835。合适的步进电机包括得自orientalmotors公司(tokyo,japan)的型号pk245-02a的vexta,并且合适的皮带835包括得自sdp/si(newhydepark,newyork)的型号a6g16-170012的同步皮带。如图5和7所示,偏心销836适配在纵向形成于容器支架单元820中的狭槽842内。偏心销840适配在形成于容器支架单元820的相对端中的圆形孔口844内。当电机830转动驱动皮带轮834时,惰轮838也通过皮带835旋转并且容器支架单元820通过分别接合形成于支架单元820中的孔口842、844的偏心销836、840沿水平轨道路径进行移动。惰轮838的转轴839优选向上延伸并且具有形成于其中的横向狭槽841。光学狭槽传感器843与狭槽841设置在相同水平并且在转轴839旋转时通过间断引导穿过狭槽841的传感器光束来测定惰轮838的频率。合适的传感器包括得自optektechnology公司(carrollton,texas)的型号opb980t11的optektechnology公司传感器。

作为狭槽841和传感器843的替代形式,可通过安装在转轴839的顶部的编码器(未示出)来测定惰轮838的频率。

驱动皮带轮834还包括定位板846。定位板846穿过安装至传感器安装托架845(延伸自电机安装板832)的狭槽光学传感器847、848。合适的传感器包括得自optektechnology公司(carrollton,texas)的型号opb980t11的optektechnology公司传感器。定位板846具有形成在其中的多个周向间隔开的轴向开口,所述轴向开口与一个或两个传感器847、848对准以指示出轨道混合器组件828的位置并从而指示出容器支架单元820的位置。

作为定位板和传感器847、848的替代形式,可通过耦接至皮带轮834的编码器(未示出)来测定驱动皮带轮834的频率和位置。

枢转型磁体移动设备810附接在下部803内以便可围绕点812枢转。磁体移动设备810承载永磁体814,所述永磁体814设置在形成于磁体移动设备810中的狭槽815的任一侧面上。磁体移动设备810被构造和设置用于在操作位置和非操作位置(相对承载于容器支架单元820中的容器装置)之间移动磁体814。在操作位置中,磁体814设置为邻近容器(如,mrd160)并且足够靠近容器以便每个容器162内的磁响应固体载体被磁体814的磁场的吸引力吸出悬浮液。在非操作位置中,磁体设置为足够远离容器162以便对容器162的内容物不具有显著影响。在本上下文中,“无显著影响”是指磁响应固体载体未被磁体814的磁场的吸引力吸出悬浮液。

优选的是,将mrd160的五个磁体(每个磁体对应每个独立的容器162)以对齐的布置方式保持在磁体移动设备810的每一侧。磁体优选由最小等级n-35的钕铁硼(ndfeb)制成并且具有0.5英寸宽、0.3英寸高和0.3英寸深的优选尺寸。电动致动器(通常表示在816处)上下枢转磁体移动设备810,由此来移动磁体814。如图5所示,致动器816优选包括旋转步进电机819,其旋转耦接至磁体移动设备810的驱动螺杆机构以选择性地升高和降低磁体移动设备810。电机819优选为得自haydonswitchandinstrument公司(waterbury,connecticut)的型号26841-05的hsi线性步进致动器。

传感器818(优选光学狭槽传感器)设置在壳体的下部803内以用于指示磁体移动设备810的下、或“原始”、或非操作位置。另一个传感器817(也优选光学狭槽传感器)优选设置为指示磁体移动设备810的上或操作位置。合适的传感器包括得自optektechnology公司(carrollton,texas)的型号opb980t11。

用于在相对容器的操作位置和非操作位置之间移动磁体的磁体移动设备的替代实施例示于图10和11中。磁体移动设备包括磁体滑动件200,其包括通过驱动系统232沿线性路径进行移动的磁体滑车202。

更具体地讲,磁体滑车202包括具有导杆孔口206和直角u形切口208的第一壁204。磁体滑车202还包括其中形成有导杆孔口216和直角切口218的第二壁214。第一磁体220设置在相应切口208、218一侧的第一壁204和第二壁214之间并且由第一磁体背衬板224支承。类似地,第二磁体222设置在相应直角切口208、218对侧的第一壁204和第二壁214之间并且由磁体背衬板(未示出)支承。磁体220、222可由等级n-35或等级n-40的ndfeb制成。作为位于磁体滑车202的相对侧的单个磁体220、222的替代形式,可将独立磁体设置在滑车202的每一侧(每个容器162对应一个磁体)。在一个实施例中,滑车在每一侧包括五个磁体,其中每个磁体具有大约12mm×12mm×7.5mm的尺寸并且由等级n-40的ndfeb制成。磁体的数量对应于包括mrd160的容器162的数量。

磁体滑车202还包括具有多个尖端剥除元件(形式为其中形成的剥除开口228)的底板226。尖端剥除开口228的操作将在下文进行描述。最后,磁体滑车202包括部分地通过平直横向延伸边缘230(形成于第一壁204中)形成的导向表面。类似的横向延伸的平直边缘形成于后壁214中。第一和第二壁204、214中的任何一个、第一和第二磁体背衬板224、以及底板226可彼此一体地形成。用于第一和第二壁204、214以及底板226的合适材料包括非磁响应材料,例如塑料和铝。用于第一和第二磁体背衬板224的优选材料包括磁响应材料(例如钢)以增加穿过磁体的磁通量。

驱动系统232包括具有驱动皮带轮236且安装在下壳体803的外部的驱动电机234。驱动皮带238承载于驱动皮带轮236和惰轮248上并且延伸穿过形成于下壳体803中的开口813。驱动皮带238的相对末端243、245通过耦接托架240附接至磁体滑车202。合适的皮带得自gates公司。

耦接托架240包括设置在第二磁体222的整个顶部上并且具有皮带保持狭槽(其内插入并且固定驱动皮带238的相对末端243、245)的顶板241。相对顶板241横向弯曲的保持插片247设置在形成于第一壁204中的适形狭槽内。类似的插片(未示出)设置在顶板241的相对末端上并且延伸到形成于第二壁214中的适形狭槽内以用于将耦接托架240固定至磁体滑车202。

磁体滑车202设置在下壳体803内,其中导向表面230支承在沿下壳体803的内表面延伸的导向凸缘242上。磁体滑车202的相对侧由延伸横跨下壳体803并且穿过导杆孔口206和216的导杆212支承。可在导杆孔口206、216中的一者或两者处设置套管(未示出)以用于安全且可滑动地支承磁体滑车202。

驱动皮带轮236通过驱动电机234进行旋转从而转动驱动皮带238,由此在非操作位置(例如图10和11中所示)和操作位置(此时磁体滑车202移至下壳体803的相对侧)之间移动磁体滑车202。当磁体滑车202移至操作位置时,容器162的下端分别穿过第一壁204和第二壁214的直角切口208、218,以便设置在第一磁体220和第二磁体222之间。

安装至下壳体803的内表面的回缩位置传感器244指示出磁体滑车202何时位于回缩或非操作位置中。类似地,另外安装至下壳体803的内表面的伸展位置传感器246指示出磁体滑车202何时位于伸展或操作位置中。传感器244和246可包括狭槽光学传感器,其可检测从磁体滑动件202下部凸出的插片(未示出)的存在。

磁体移动设备的另一个替代实施例示于图12-15中。图12-15中的磁体移动设备包括下述磁体滑动件250,其包括磁体滑车252和驱动系统284,所述驱动系统284在相对容器的非操作位置(如图12所示)和操作位置之间移动磁体滑车252。

更具体地讲,磁体滑车252包括具有螺杆从动器256和直角开口258的第一壁254。可在直角开口258周围设置延伸凸缘260。磁体滑车252还包括具有导向套管264和直角开口266的第二壁262。第一磁体268设置在第一壁254和第二壁262之间并且由第一磁体背衬板272支承。类似地,第二磁体270设置在直角开口258、266对侧的第一壁254和第二壁262之间并且由第二磁体背衬板274支承。此外,作为位于磁体滑车252的相对侧的单个磁体268、270的替代形式,可在滑车252的每一侧设置五个独立磁体,所述磁体具有大约12mm×12mm×8mm的尺寸并且由等级n-40的ndfeb制成。

磁体滑车252还包括其中形成有多个尖端剥除开口278的底板276、导向表面280和保持托架282。导向表面280可包括设置在保持托架282的相对侧的两个表面。

驱动系统284包括安装至下壳体803的外部并且具有驱动皮带轮288的驱动电机286。螺纹驱动螺杆292延伸跨过下壳体803并且在其相对两端枢接至下壳体壁以便围绕其纵向轴旋转。螺纹驱动螺杆292还包括位于其一端的皮带轮294。螺纹驱动螺杆292通过承载于驱动电机286的驱动皮带轮288和螺纹驱动螺杆292的皮带轮294上的驱动皮带290操作性地耦接至驱动电机286。

螺纹驱动螺杆292延伸穿过第一壁254的螺杆从动器256和第二壁262的导向套管264。导向表面280位于磁体滑车252的底面上并且位于滑车252中与螺杆从动器256和导向套管264的相对侧,其可滑动地支承在沿下壳体803的内壁延伸的导向凸缘295上。保持托架282的下部延伸到导向凸缘295下面从而使得导向凸缘设置在导向表面280和保持托架282之间。

驱动皮带轮288借助驱动电机286的旋转通过驱动皮带290传递至螺纹驱动螺杆292。接合螺杆从动器256的旋转驱动螺杆292引起磁体滑车252沿相对驱动螺杆292的纵向方向进行线性平移。驱动螺杆292沿一个方向的旋转将引起磁体滑车252从左到右平移,并且螺杆292沿相反方向的旋转将引起磁体滑车252从右到左平移。接合导向凸缘295下侧的保持托架282避免磁体滑车252因驱动螺杆292和螺杆从动器256之间的摩擦而倾斜以致与导向凸缘295脱离接触。

当磁体滑车252从非操作位置(示于图12中)移动到操作位置时,容器穿过直角开口258、266并且设置在第一磁体268和第二磁体270之间。形成于第一壁254的直角开口258周围的延伸凸缘260将有助于引导容器穿过开口258。

安装至下壳体803的内壁的回缩位置传感器296指示出磁体滑车252何时位于回缩或非操作位置中,并且另外安装至下壳体803的内壁的伸展位置传感器298指示出磁体滑车252何时位于相对容器的伸展或操作位置中。传感器296和298可包括光学传感器,其检测从磁体滑车252的一部分延伸的插片的存在。

返回到图4,洗涤溶液递送管854连接至配件856并且延伸穿过模块壳体802的顶表面。洗涤溶液递送管854通过配件856延伸穿过隔离板808,从而形成洗涤溶液递送网。

如图8和9所示,从配件856延伸的洗涤溶液分配器喷嘴858设置在隔离板808内。每个喷嘴位于mrd160中的相应容器162上方且位于相对容器162的横向偏心位置处。每个喷嘴均包括用于将洗涤溶液从偏心位置引导至相应容器162内的横向定向的下部859。合适的洗涤溶液为本领域的技术人员已知的,并且其实例包含10mm三羟甲基氨基甲烷(trizmabase)、0.15mlicl、1mmedta和3.67mm月桂基硫酸锂(lls),ph为7.5。将流体沿具有横向分量的方向分配到容器162内可限制流体沿相应容器162流下时的飞溅。另外,横向定向的流体可清洗掉粘附至相应容器162的侧面的材料。

如图4和5所示,抽吸器管860或探针延伸穿过管架862(管860牢固地固定至管架862)并且延伸穿过隔离板808中的开口861。尖端感测印刷电路板(“pcb”)809(参见图7)通过机械紧固件附接至隔离板808位于开口861下方的一侧。连接至抽吸器管860的抽吸器软管864延伸至真空泵(未示出),其中抽吸流体被吸出并进入备有的流体废物容器(未示出)。在一个实施例中,抽吸器管860中的每一个均具有12英寸的长度以及0.041英寸的内径。

管架862附接至由提升电机868致动的驱动螺杆866。合适的提升电机包括得自orientalmotors公司(tokyo,japan)d的型号pk245-02a的vexta,并且合适的驱动螺杆包括得自kerkmotionproducts公司(hollis,newhampshire)的zbx系列螺纹反后冲导螺杆。在图示实施例中,管架862附接至驱动螺杆866的螺纹套管863。杆865和滑轨867用作管架862的导向装置。作为另外一种选择,可将直线轴承(未示出)用作管架862的导向装置。z轴传感器829、827(狭槽光学传感器)与从管架862和/或螺纹套管863延伸的插片相配合来指示抽吸器管860的冲程位置的顶部和底部。合适的z轴传感器包括得自optektechnology公司(carrollton,texas)的型号opb980t11的optektechnology公司传感器。管架862、提升电机868和驱动螺杆866一起组成管860的移动机构的实施例。

电缆将功率和控制信号通过一个或多个连接器(一个此类连接器示于附图标记870处)传送至磁性分离站800。

当将容器通过插入开口804插入到磁性分离站800内并且插入到容器支架单元820内时,如通过回缩位置传感器818、244、296所检验,磁体移动设备810、200、250初始位于非操作位置中(如,如图5中和图10和12中的虚线所示)。当磁体移动设备位于非操作位置中时,磁体的磁场将对容纳在容器内的磁响应固体载体不具有显著影响。轨道混合器组件828沿完整轨道的一部分移动容器支架单元820以便横向移动容器支架单元820和mrd160,从而将由mrd160的尖端保持结构176承载的尖端170与抽吸管860中的每一个对准,如图9所示。通过例如定位板846和传感器847、848中的一者来检验容器支架单元820的位置。作为另外一种选择,步进电机830可移动已知数量的节距以将容器支架单元820设置在所需位置内,并且可省去传感器847、848中的一者。应当注意,当容器支架单元820已移至此尖端接合位置时,磁体移动设备不可移至操作位置,因为由单元820承载的mrd160将干扰磁体移动设备的移动。

通过提升电机868和驱动螺杆866来降低管架862和抽吸器管860直至抽吸器管860中的每一个均以摩擦方式接合保持在位于mrd160上的相关联的承载结构176中的导管(如,尖端170)。

如图6所示,每个抽吸器管860的下端的特征在于锥形、台阶构造,由此管860具有沿管的长度的大部分的第一部分851、直径小于第一部分851的第二部分853、和直径小于第二部分853的第三部分855。第三部分855的直径使得允许管860的末端插入到尖端170的通孔180的喇叭口部分181内并且在第三部分855的外表面和通孔180的内壁的一部分(例如沿尖端170的孔180的内壁的两个环状脊183(参见图2)或作为另外一种选择,纵走向脊(未示出))之间产生过盈摩擦配合。环状肩部857被限定在第二部分853和第三部分855的过渡位置。肩部857限定管860可插入到尖端170内的程度,以使得尖端在使用之后可被剥除掉,如将在下文所述。

尖端170可为至少部分导电的,以使得可通过电容器(其中将抽吸器管860和尖端170作为此电容器的一半并且将磁性分离站800的周围硬件(如,金属隔离板808)作为此电容器的另一半)的电容来检验尖端170在抽吸器管860上的存在。用于形成尖端170的合适树脂以产品号pp-61/ec/pbk得自engineeredplastics公司,其为碳填充的导电性聚丙烯。如通过尖端感测pcb809所测定,当尖端170接合抽吸器管860的末端时,电容将改变。

除电容尖端感测之外或者作为其替代形式,可将五个光学狭槽传感器(未示出)策略性地设置在隔离板808上方以验证尖端170在每个抽吸器管860末端上的存在。合适的“尖端存在”传感器包括得自optektechnology公司(carrollton,texas)的型号opb930w51的optektechnology公司传感器。抽吸器管860末端的尖端170将中断相关联的传感器的光束从而来检验尖端170的存在。如果在尖端吸取移动之后,所有五个抽吸器管860的尖端存在传感器均未检验到尖端接合,则将产生错误信号。可放弃mrd160并且将放弃的mrd160从磁性分离站800退出并最终丢弃,或者可在成功检验到尖端存在的相应抽吸器管860的容器162中继续进行处理。

在成功接合导管之后,轨道混合器组件828将容器支架单元820移回至图8中所示的流体转移位置(如通过定位板846和传感器847、848中的一者或两者所检验的)。

然后将磁体移动设备810、200、250移至操作位置(如图4所示),以使得磁体设置为邻近容器(例如mrd160)的相对侧。使容器的内容物经受磁体的磁场,则其上固定有靶向核酸的磁响应固体载体将被吸引至各个容器162中邻近磁体的侧面。容器162内的其余材料应未受显著影响,由此分离出靶核酸。如通过分析方案所定义和通过分析管理程序所控制的,磁体移动设备将在操作位置中保持适当的驻留时间,以使得磁性固体载体附着至相应容器162的侧面。在一个实施例中,磁体移动设备的相对侧的相对磁体之间的距离为约12.4mm并且mrd160的每个容器162的直径为11.4mm,这意味着当磁体移动设备位于操作位置中时,磁体和容器162侧面之间存在0-1mm的间隙。当磁体移动设备移至非操作位置时,磁体和容器160之间存在至少30mm的间隙。

然后将抽吸器管860下降到mrd160的容器162内以抽吸各个容器162中的流体内容物,此时磁性固体载体仍保持在容器162中且沿其邻近磁体的侧面聚集。抽吸器管860末端处的尖端170确保每个容器162中的内容物在抽吸工序期间不会接触抽吸器管860的侧面。由于后续mrd160在磁性分离站800中进行处理之前将丢弃尖端170,则通过抽吸器管860引起交叉污染的机会降至最低。

导电性尖端170可以已知方式用于mrd160的容器162内的电容流体水平感测。抽吸器管860和导电性尖端170组成电容器的一半,磁性分离站内的周围导电性结构组成电容器的第二半,并且电容器这两半之间的流体介质构成电介质。因电介质的特性改变引起的电容改变可被检测到。

抽吸器管860的电容电路可被设置为使得所有五个抽吸器管860用作单套水平感测机构。当抽吸器管860中的任何一个及其相关联的尖端170接触容器162内的流体材料时,系统的电容因电解质的改变而改变。如果抽吸器管860中出现电容变化的z位置过高时,则指示出至少一个容器162中的高流体水平,由此暗示抽吸失效或过度分配。另一方面,如果抽吸器管860中出现电容变化的z位置恰当,但其他管中的一个或多个因低流体水平而仍未接触流体的顶面时,则将指示出低流体水平。

作为另外一种选择,抽吸器管电容电路可被设置为使得五个抽吸器管860中的每一个均用作独立的水平感测机构。

利用五个独立的水平感测机构,如果容器162中的一个或多个容器内的流体水平高,则电容水平感测电路可检测到容器162中的一个或多个容器内的失效流体抽吸。如果容器162中的一个或多个容器内的流体水平低,则独立的电容水平感测电路可检测到容器162中的一个或多个容器内的失效流体分配。此外,电容水平感测电路可用于体积检验以确定每个容器162中的体积是否位于预定范围内。可通过下述方式执行体积检验:在高于预期流体水平的位置处(如预期流体水平的110%)停止抽吸器管860下降以确保容器162中的任何一个均不具有如此高的水平,并且随后在低于预期流体水平的位置处(如预期流体水平的90%)停止抽吸器管860下降以确保容器162中的任何一个均具有至少如此高的流体水平。

在抽吸之后,升高抽吸器管860、将磁体移动设备移至非操作位置、将容器支架单元820移至流体分配位置(图9)、并且通过洗涤溶液分配器喷嘴858将预定体积的洗涤溶液分配到mrd160的每个容器162内。为了避免洗涤溶液滴悬挂在洗涤溶液分配器喷嘴858上,优选进行简单的、分配后空气抽吸。

轨道混合器组件828随后将容器支架820以高频率(在一个实施例中,14hz,在1秒内从0hz加速至14hz)移动到水平轨道路径内以混合容器的内容物。通过移动进行混合或搅拌时,优选mrd160位于水平面中,以便避免容器中的流体内容物的飞溅和避免气雾的产生。混合之后,轨道混合器组件828将容器支架单元820停留在流体转移位置处。

为了进一步纯化靶向核酸,将磁体移动设备810、200、250再次移至操作位置并且在操作位置中保持预定的驻留间期。在磁性驻留之后,按照与上述基本上相同的抽吸工序,将抽吸器管860与接合的尖端170下降至mrd160的容器162的底部以抽吸检测样品流体和洗涤溶液。

可按照分析方案的限定来执行一个或多个附加洗涤周期,其中每个周期包括分配、混合、磁性驻留和抽吸序列。nat领域的技术人员将能够针对所需的靶捕集工序来确定适当的磁性驻留时间、洗涤周期的数量、洗涤溶液等。

可在仪器中使用多个磁性分离站800以允许在多个mrd160上并行执行分离洗涤工序。磁性分离站800的数量将根据仪器的所需吞吐量而改变。

在最终洗涤步骤之后,将磁体移动设备810、200、250移至非操作位置,并且通过传动机构将mrd160从磁性分离站800移出。在从磁性分离站800移出mrd160之前,并且优选在磁体回缩之前,通过下述方式来执行最终残余体积的检查:将抽吸器管860和尖端170下降至每个容器162的底部的刚好上方以确定容器162中是否仍存在任何过量的流体体积。

在将mrd160从磁性分离站800移出之后,通过尖端剥除开口228、278将尖端170从抽吸管860剥除。

图10中所示的磁体滑动件200的磁体滑车202和图12中所示的磁体滑动件250的磁体滑车252均分别包括沿其位于第一和第二磁体之间的下表面的中央部分形成的尖端剥除开口228、278。如图15所示,尖端剥除开口包括具有第一部分279和第二部分277的锁孔形开口,其中第一部分279大于第二部分277。尖端剥除开口的数量等于抽吸器管860的数量,在此图示实施例中为五个。

为了从抽吸器管860的每个抽吸器管中剥除导管或尖端170,将磁体滑车202、252设置在抽吸器管860下方,以使得尖端剥除开口278的较大部分279与抽吸器管860中的每一个对准。将其上设置有尖端170的抽吸器管860下降穿过剥除开口的第一部分279,所述第一部分279足够大以允许尖端170从中穿过。在尖端170已穿过尖端剥除开口之后,轻微移动磁体滑车以使得抽吸器管860设置在剥除开口的第二较小部分277内,所述第二较小部分277足够大以容纳抽吸器管860,但小于尖端170的边缘凸缘177的外径。然后升高抽吸器管860,并且尖端170接合围绕剥除开口的第二部分277的周边边缘,从而当抽吸器管860上升时将尖端170从抽吸器管860拉出。优选的是,尖端剥除开口设置在交错的竖直位置处以使得当抽吸器管860一起升高时,尖端170以交错方式碰到剥除开口的周边边缘。例如,每个剥除开口可位于不同的竖直位置处,以使得当抽吸器管860相对剥除开口进行移动时,尖端170逐一连续地从相关联抽吸器管860移除。交错排列剥除开口的一个有益效果在于其使得较小的力被施加到由管架862、提升电机868和驱动螺杆866定义的移动机构上。

尽管此前主要结合mrd160来描述磁性分离站800的操作,但磁性分离站800的创造性方面并不限于其与mrd160结合使用,因为在实施本发明的若干方面的磁性分离站中可处理其他类型的容器(包括单容器和多容器装置、包括具有不同尺寸的容器)。

磁性容器保持站

磁性容器保持站及其各个组件示于图16-19中。如图16和17所示,磁性容器保持站300包括具有第一壁330、第二壁360和第三壁368(固定至基底块310并且从其向上延伸)的基底块310以及部分覆盖第一、第二和第三壁330、360、368的护罩370。第一和第二壁330、360之间限定的第一容器狭槽356以及第二和第三壁360、368之间限定的第二容器狭槽358各自被构造用于接纳mrd160或其他容器,如图16所示。如其中省去第二壁360、第三壁368和护罩370的图18所示,基底块310包括用于将容器保持站300固定至基准板的安装凸缘312、用于分别固定第一壁330和第三壁368的外壁凹槽314、316,以及其内固定第二壁360的中央狭槽318。基底块310以及壁330、360、368可由合适的塑料(例如缩醛树脂或pvc)制成。

将接地连接器元件322固定至安装凸缘312中的一个上。

参见图18,第一壁330包括沿其下部形成的磁体狭槽332和沿其上部形成的夹片狭槽334。通过机械紧固件(例如螺钉)将磁体子组件338安装在磁体狭槽332内。将夹片元件352安装在夹片狭槽334内。钩接入拐角切口354设置在第一壁330的前上拐角中。第三壁368基本上为第一壁330的镜像并且包括其内安装磁体子组件的磁体狭槽和其内安装夹片的夹片狭槽。在图示实施例中,第三壁368不包括钩接入切口。第二壁360包括其内安装磁体子组件364的磁体狭槽362。部分拐角钩接入切口366设置在第二壁360的前上部分处。

护罩370包括顶板372、侧板374和后板376(参见图17)。护罩370可由合适的材料(例如金属片)形成。将护罩370固定至第一和第三壁330、368,并且将接地连接器320固定至护罩370的一个侧面374。

参见图19,磁体子组件包括多个磁体340(在图示实施例中为五个),其中每个磁体均具有大致实心的矩形形状。上夹持板344设置在形成于磁体340中的每一个的顶表面中的夹持板凹槽342内。上夹持板344在其每一末端以及相邻磁体340之间均包括分立凸起346以将每个磁体保持在其相应位置内。类似地,磁体子组件338包括下夹持板348,所述下夹持板348被接纳在形成于磁体340的下表面中的夹持板凹槽内并且在其相对末端以及相邻磁体340之间均包括分立凸起350。

容器(例如mrd160)可设置在容器保持狭槽356或358内并在支承在相对的第一和第二壁或第二和第三壁的上边缘336上。夹片352(可包括延伸到狭槽356内的弹性凸起)以可释放方式固定狭槽内的mrd160。钩接入切口354、366允许操作钩(未示出)设置在mrd160的操作结构166的旁侧并且沿如图3所示的方向a接合操作结构166。

可将容纳样品材料和靶捕集试剂(包括磁响应固体载体)的mrd160设置在磁性容器保持站300的狭槽356、358中的一者内,并且在其中保持指定的驻留时间,此时磁响应固体载体被磁性容器保持站300中的磁体吸出溶液。在指定的驻留时间之后,将mrd160从磁性容器保持站300移至磁性分离站800。在将mrd160移到磁性分离站800内之前通过将mrd160在磁性容器保持站300内放置指定的驻留时间,可减少磁性分离站800中所需的磁性驻留时间量,由此减少每个mrd160必须在磁性分离站800中花费的时间量并改善整体仪器吞吐量。

示于图16-18中的磁性容器保持站300仅用于示例性目的。应当认识到,实施本发明的若干方面的容器保持站可具有少于或多于三个直立壁以及两个限定在相对壁之间的容器保持狭槽。

传送机构

现在将描述适于将容器(例如mrd160)移到磁性分离站800和磁性容器保持站300之内和之外以及在磁性分离站800和磁性容器保持站300之间进行移动的传送机构的实施例。

如图20所示,形式为容器分配器400的容器转移设备包括容器支架组件402,所述容器支架组件402通过x平移系统(下文所述)的功率在“x”方向上沿传送器轨道组件408平移。容器支架组件402包括被构造用于承载反应容器(例如mrd160)、支承在支架组件滑架418(被构造和设置用于实现分配头404的z轴平移和θ旋转)上的容器分配头404。在图示实施例中,轨道组件408为线性的(即,平直的)且基本水平的,但在其他实施例中,轨道组件为非线性的(即,至少部分弯曲的)和/或非水平的(即,轨道组件的至少一部分为倾斜或竖直的)。

在图示实施例中,轨道组件408包括大致“l”形的沟槽424,其包括基底部分434(在图示实施例中基本上为水平取向)和以直立方式从水平基底434的一个边缘延伸的直立背板440(在图示实施例中基本上为竖直取向)。刚性凸缘430从基底部分434中与直立背板440相对的边缘直立延伸,并且刚性凸缘442从直立背板440的上边缘横向延伸。导向轨道446安装至直立背板440并且沿相对基底部分434平行的取向延伸。电缆导向轨道432安装至基底部分434。

x平移系统410包括环套在驱动皮带轮412和惰轮436上的驱动或传输皮带448,所述驱动皮带轮412设置在直立背板440的一侧且位于沟槽424的远端414,所述惰轮436设置在直立背板440的同一侧且位于沟槽424的近端428并且在其相对末端附接至支架组件滑架418。驱动皮带轮412操作性地耦接至安装在直立背板440的相对侧的支架平移电机(未示出)。旋转编码器(未示出)耦接至驱动电机。

驱动皮带448优选装配有皮带张紧器438。皮带张紧器438包括滑动皮带轮安装件(其上安装惰轮436)和弹簧。皮带轮安装件由直立背板440可滑动地支承,并且可通过紧固件元件来相对直立背板440进行选择性地固定以避免安装件的滑动。当皮带轮安装件436未相对直立背板440进行固定时,弹簧沿皮带绷紧方向驱动皮带轮安装件。

支架组件402的分配头404通过支架组件滑架418沿传送器轨道组件408进行传送。支架组件滑架418接合导向轨道446,并且沿传送器轨道组件408平移。可在导向轨道446的相对末端设置橡胶缓冲器444、406以吸收滑架418的接触。通过驱动皮带448实现支架组件滑架418沿导向轨道446的移动。当支架平移电机以逆时针方式旋转驱动皮带轮412时,支架组件402沿第一x方向(在图示实施例中向左)朝传送器轨道组件408的近端428移动。类似地,当支架平移电机以顺时针方式旋转驱动皮带轮412时,支架组件402沿第二x方向(在图示实施例中向右)朝传送器轨道组件408的远端414平移。

分配头402的细节示于图21中。分配头402包括分配框架454,所述分配框架454被支承以用于支架组件滑架418围绕旋转竖直轴的旋转。侧板488附接至分配头框架454的一侧。侧板488可为透明的以便分配头402的内部为可见的。分配头402还包括容器钩500,其被构造用于接合mrd160的操作结构166。除钩之外的用于接合容器且能够物理操作所接合容器的装置可被替换。

钩致动器系统456实现容器钩500在伸展位置(如图21所示)和回缩位置(其中mrd160退回到分配头402内)之间的线性平移(相对z轴沿r方向和θ方向)。钩致动器系统456包括容器钩500附接的钩滑架480。通过490处指示的螺钉和托架将驱动皮带486附接至钩滑架480。驱动皮带486承载于驱动轮462和空转轮464、496、452、458上。空转轮452和458附接至固定的空转轮托架460,并且空转轮496附接至板488外部的门接合托架494的上部。

门接合托架494可设置用于打开覆盖装载狭槽804的门。可为枢转、滑动、或旋转门的门将包括悬挂于门的一部分上的臂或其他凸起。在一个实施例中,分配头402与接触臂的门接合托架494的下端一起设置,并且分配头402的微小x和/或θ移动实现门从关闭位置移动至开放位置。门优选弹簧偏置于关闭位置中,以使得当壁从接触门接合托架494释放时,门将被弹回闭合位置。

驱动轮462附接至驱动电机(未示出)(优选步进电机)的输出轴,所述驱动电机安装至分配框架454的相对侧。旋转编码器(未示出)附接至驱动电机。驱动轮462优选具有9.55mm的直径,从而带来每完整电机节距0.15mm的分辨率。编码器具有200计数/转(a-b信号)的分辨率,以带来800计数/转的四倍分辨率。

钩致动器系统456优选包括用于保持皮带486中的适当张力的皮带张紧器476。皮带张紧器476包括附接空转轮464并且通过枢转螺钉478可枢转地附接至侧板488的枢转型空转轮托架474。狭槽470形成于枢转型空转轮托架474的末端内,并且位置锁定螺钉468穿过狭槽470延伸到侧板488内。弹簧472设置在枢转型空转轮托架474的一部分和固定型空转轮托架460之间。可通过下述方式来调整皮带486中的张力:松动位置锁定螺钉468,由此允许弹簧472枢转枢转型空转轮托架474并从而向上推动空转轮464以在驱动皮带486中产生适当的张力。当在驱动皮带486中实现适当的张力时,可随后重新固定位置锁定螺钉468。

钩滑架480包括沿钩滑架导向轨道450(附接至分配头框架454的上部)平移的轨道沟槽484。容器钩500附接至绝缘安装件498,其设置在轨道沟槽484和钩500之间以将钩500和分配头402电隔离从而有利于电容感测钩500与例如磁性分离站800或容器保持站300的另一个结构元件的接触。

容器分配器的其他细节可见于美国专利申请号61/178,728中,该专利申请的公开内容以引用方式并入。

用于将所关注的分析物(例如靶核酸)与样品中的其他组分分离或分开的工序由图22中所示的过程510表示。该过程开始于具有样品制备工序的步骤512,由此将样品样本和包括磁响应固体载体的靶捕集试剂添加至容器装置(单个容器或多个容器,如mrd160)。可通过本领域中已知的任何方式(包括手动和自动方式)将样品样本和靶捕集试剂添加至容器装置。

在步骤514中,使容纳样品样本和靶捕集试剂的容器装置经受足以引起所关注的分析物固定到磁响应固体载体上的条件。条件可包括将容器装置在一个或多个预定的温度下培养预定的时间段。用于将靶向核酸固定到磁响应固体载体上的工序示例于美国专利号6,534,273和美国专利申请公开号2008-0286775中。

在步骤516中,制定决策以确定(1)在将容器装置移至磁性分离站800之前将容器装置移至磁性容器保持站300,还是(2)将容器装置直接移到磁性分离站800内。

如果决策被制定为省去将容器装置设置在磁性容器保持站300中,则在步骤526中,优选使用容器传送机构(例如上述容器分配器400)将容器装置设置在磁性分离站800中。

在步骤530中,利用由磁性分离站800的容器支架单元820支承的容器装置,容器支架单元820设置为将每个抽吸器管860与承载于容器装置上的尖端170对齐,并且降低每个抽吸器管860直至其插入到尖端170内且以摩擦方式接合尖端170。在替代实施例中,尖端未承载于容器装置上而是以其他方式提供给每个抽吸器管860。

在步骤526中,当容器装置首先设置到磁性分离站800内时,磁体初始位于相对容器装置的非操作位置中,在步骤532中,将磁体移至相对容器装置的操作位置中以将磁响应固体载体吸引至容器装置的侧面。在步骤534中,将容器装置在容器支架单元820(其中磁体位于操作位置)中保持静止指定的驻留间期(在一个实施例中,120秒),以便足以将磁响应固体载体的相当大一部分吸引至容器装置的侧壁并且吸引出悬浮液。

在步骤536中,在执行工序以检验出每个抽吸器管860上存在尖端170之后,移动容器支架单元820以将每个容器设置在相关联的抽吸器管860的下方,将每个抽吸器管860降至相关联的容器内,并且在步骤536中从容器抽吸流体,此时优选将磁体保持在相对容器装置的操作位置中。

在步骤538中,将磁体移至相对容器装置的非操作位置,以便靶捕集试剂中的磁响应固体载体将不受磁体的磁力的影响。

在步骤540中,将洗涤溶液分配到每个容器内(如,1ml洗涤缓冲液),并且在步骤542中,摇动容器装置以从容器装置的壁移去磁响应固体载体并且再悬浮磁响应固体载体。

在步骤544中,制定决策以确定是否必须执行附加的洗涤步骤。根据工序方案,可将洗涤工序重复一次或多次。在一个实施例中,执行2个洗涤周期。如果将重复洗涤工序,则该过程返回步骤532,并且重复步骤532至542。如果将不执行其他洗涤步骤,则在步骤546中将容器装置从磁性分离站800移出。

在步骤548中,将尖端170从每个抽吸器管860剥除,并且磁性分离站800当前预备接纳下一个容器装置以执行磁性分离洗涤过程。

如果在步骤516处,决策被制定为在容器装置移至磁性分离站800之前将其设置在容器保持站300内,则在步骤518中优选使用容器传送机构(例如上述容器分配器400)将容器装置设置在容器保持站300内。

在步骤520中,允许容器装置在磁性容器保持站300中静置指定的驻留间期(在一个实施例中,580秒),以便足以将磁响应固体载体的相当大一部分吸引至容器装置的壁并且吸引出悬浮液。

在步骤522中,在指定的驻留间期之后,并且假定存在磁性分离站800,则利用例如上述容器分配器400将容器装置从容器保持站300移至磁性分离站800。在一个实施例中,从容器保持站300转移至磁性分离站发生在4秒内。

在步骤524中,按照上文结合步骤530所述,将每个抽吸器管860与尖端170接合。

在步骤522中,当容器装置首先设置到磁性分离站800内时,磁体初始位于相对容器装置的非操作位置中,在步骤528中,将磁体移至相对容器装置的操作位置中。在步骤520中,当容纳在容器装置内的靶捕集探针中的磁响应固体载体已在磁性容器保持站300内经受指定驻留间期的磁力时,可显著缩短或完全省去磁性分离站800的初始磁性驻留间期。即,如果未摇动容器装置中的内容物,则当将容器装置从容器保持站转移至磁性分离站时,固体载体的相当大一部分将仍聚集到容器装置的侧面。在实验中,发明者已确定通过使用磁性容器保持站300可将初始磁性驻留降低180秒(在未首先将容器装置放置到磁性容器保持站中的情况下初始驻留为300秒,与之相比,当将容器装置在磁性容器保持站中放置580秒时,初始驻留为120秒)。

所述过程接下来进行到步骤536,并且从容器装置抽吸流体,此时磁响应固体载体通过磁体固定至容器装置的壁。所述过程然后如上文所述进行步骤540至548,如果需要,返回步骤532以重复步骤532-542。

尽管本发明已参照某些示例性实施例进行极其详细地描述和示出,但本领域的技术人员将易于理解本发明的其他实施例。因此,本发明应视为包括涵盖于下述所附权利要求书的精神和范围内的所有修改形式和变型形式。

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