生物相容的含n,n-二取代磺酰胺的荧光染料标记的制作方法

专利名称：生物相容的含n,n-二取代磺酰胺的荧光染料标记的制作方法
生物相容的含N， N-二取代磺跣胺的荧光染料标记
相关申请
本申请要求享有2005年9月2日申请的美国临时申请 No. 60/713, 632的权益.
在此将上述申请的全部教导通过引入作为参考.
背景技术：
光学成像是一种正在发展的用穿透性光线产生图像的临床成像方 式。将红外区和近红外区(NIR)范围(600-1200 nm)的光用于使组
织穿透力最大并且使天然生物吸收体例如血红蛋白和水的吸收最小. (Wyatt， Phil. Trans. R. Soc. London B 352: 701-706, 1997 ; Tromberg等，Phil. Trans. R. Soc. London B 352: 661-667, 1997 )
除了是非-侵入性的，光学成像法还提供了许多优于其它成像法的 优势它们通常提供高的灵敏度，不需要将试验受试者或实验室工作 人员暴露于电离辐射下；可允许同时使用多种可区分的探针(在分子 成像中很重要)；以及提供高的时间和空间分辨率(分别在功能成像 和体内显微术中很重要)，
在荧光成像中，将具有确定带宽的滤过光或激光用作激发光源. 让激发光穿透身体组织.当它遇到报道分子(即造影剂或成像探针) 时，该激发光被吸收.报道分子随后发出与激发光有可检测到的不同 的特性的光。随后可将得到的发射光用于构建图像。
大多数光学成像技术依赖于使用有机和无机荧光分子作为报道分子。
荧光染料通常是已知的并且通过例如荧光显微术、荧光免疫测定 法和流式细胞术等方法用于荧光标记和检测多种生物和非生物材料。 一种用于用荧光染料标记这些材料的典型方法是借助于染料分子上的合适基团和要标记材料上的匹配基团之间的键合来产生荧光复合物. 以这种方式，材料例如细胞、组织、氨基酸、蛋白质、抗体、药物、 激素、核苷酸、核酸、脂类和多糖等可以经化学标记并得以检测或定 量，或者可以用作可特异性结合靶物质的荧光探针并通过荧光检测方 法检测.明亮的荧光染料使得能以极大的灵敏度检测或定位所连接的 材料.
一些碳普或聚甲炔荧光染料已经展示可用作标记试剂用于多种生
物学应用，例如Waggoner的美国专利No. 5, 627, 027 (1997)、 Brush 等的美国专利No. 5， 808， 044(1998)、 Reddington等的美国专利No.
5, 877, 310(1999)、 Shen等的美国专利No. 6， 002， 003(1999) 、 Leung 等的美国专利No. 6, 004, 536 (1999)、 Waggoner等的美国专利No.
6, 008, 373 (1999)、 Minden等的美国专利No. 6, 043, 025 (2000)、 Minden等的美国专利No. 6, 127, 134 (2000)、 Waggoner等的美国专利 No. 6，130， 094 (2000)、Waggoner等的美国专利No. 6， 133， 445 (2000)， 以及WO 97/40104、 W 0 99/51702、 WO 01/21624和EP 1 065 250 Al、 Caputo等的美国专利No. 6, 448, 008和Tetrahedron Letters 41， 9185-88 (2000),上述所有出版物都通过引入作为参考。
下面的文献对聚甲炔染料作了全面的综述L. G. S. Brooker， "The Theory of the Photographic Process" Mees Ed. ， Macmillan, New York, (1942)， p. 987和(1966)， p. 198; Frances M. Hamer, "The Chemistry of Heterocyclic Compounds", Vol 18， "The Cyanine Dyes and Related Compounds " ， Weissberger, Ed, Wiley Interscience， New York, (1964); G. E. Ficken，"The Chemistry of Synthetic Dyes" ， VoM, K. Venkataraman Ed. ， Academic Press, New York, (1971)， p. 211 ; A. I. Kiprianov， Usp. Khim. ， 29, 1336,(1960)， 35， 361 (1966)， 40， 594 (1971); D. W. Heseltine， "The Theory of the Photographic Process"，增补笫4版，James Ed.， Macmillan, New York, (1977)，第8章，"Sensitising and Desensitising Dyes" 5 S, Daehne， Phot. Sci. Eng. ， 12， 219 (1979) jD. J. Fry, "Rodd's Chemistry of Carbon Compounds" ， "Cyanine Dyes and Related Compounds" ， Vol. IVb, chapter 15, p. 369 Elsevier, Amsterdam, (1977); Supplement to Vol, IVb，增补笫2 版(1985), p. 267; H. Zollinger, "Color Chemistry" ， VCH, Weinhei迈(1987),第3和14章；D. M. Stur迈er, "The Chemistry of Heterocyclic Compounds" ， "Special Topics in Heterocyclic Chemistry", 笫VIII章, "Synthesis and Properties of Cyanino and Related Dyes" ， Weissberger Ed., Wiley, New York, (1977);
"The Kirk-Othmer Encyclopaedia of Chemical Technology" Vol 7, p. 782, "Cyanine Dyes" , Wiley, New-York, (1993) 多年来，聚 甲炔染料已经作为敏化剂在照相术，尤其在光镨的红外和近红外光谗 区中非常有用.然而，在更近几年里，这些染料在创新技术领域，例 如激光和电光应用、光记录介质、医学、生物学和诊断应用中的新用 途已有急剧增长，聚甲炔染料的这些新的应用对所需纯度有高的要求， 并且合成方法和纯化步骤的可重复性非常重要.
要可用作标记，荧光染料必须提供有含官能团的合适侧链.为了 缀合或结合至另一分子例如生物分子(BM)而将含官能团的侧链引入 结构中的方法和位点代表了涉及使用荧光染料作为标记试剂的发明中 的创新步骤.设计聚曱炔标记试剂的一种方法是将官能化侧臂连接至 式(1)荧光染料由聚甲炔连接物(PML)分开的杂环部分之一 (Z'或 Z2)上
Z^PML-Z2 (1)
设计聚甲炔标记试剂的另一方法是将官能化侧臂连接至式(la) 荧光染料由聚甲炔连接物(PML)隔开的杂环部分之一 (例如Z2)上
Z2-PML-Z2 (la)
参见，例如J. S. Lindsey， P. A. Brown和D. A. Siesel， "Visible Light Harvesting in Covalently-Linked Porphyrin-Cyanine Dyes, Tetrahedron, 45， 4845,(1989); R. B. Mujumdar， L. A. Ernst, S. R. Mujumdar和A. S. Waggoner,"Cyanine Dye Label 1 ing ReagentsContaining Isothiocyanate Groups" ， Cytometry, 10， 11 (1989)', L. A. Ernst, R. K. Gupta, R. B. Muj咖dar和A. S. Waggoner, "Cyanine Dye Labelling Reagents for sulphydryl Groups", Cytometry, 10, 3,(1989); P. Southwick P. L. ， L A, Ernst, E. W. Tauriello, S. R. Parker, R. B, Mujumdar, S. R. Muj咖dar,
H. A. Clever 和 A. S. Waggoner, "Cyanine Dye Labelling Reagents—Carboxymethylindocyaiiine Succini迈idyl Esters M , Cytometry 11， 418 (1990); R. B. Mujumdar, L. A. Brnst, Swati R. Mujumdar, C. J. Lewis和A. S. Waggoner, "Cyanine Dye Labelling Reagents: Sulfoindocyanine Succinimidyl Esters" ， Bioconjugate Chemistry, 4, 105,(1993); A. J. G. Mank， E. J. Molenaar， H. Lingeman， C. Goojer， U. A. Th. Brinkman和N. H. Velthorst,
"Visible Diode Laser Induced Fluorescence Detection in Liquid Chromatography af ter Precolumn Derivatisation of Thiols" ， Anal. Chem., 65, 2197， (1993); H, Yu. ， J. Chao， D. Patek， S. R. Mujumdar 和 A. S. Waggoner, "Cyanine dye dUTP analogs for enzymatic labelling of ■ Probes" , Nucl. Acids Res 22， 3226， (1994); A. J. G. Mank, H. T. C. van der Laan， H. Lingeman， Cees Goojer， U. A. Th. Brinkman 和 N. H. Velthorst, " Visible Diode Laser-Induced Fluorescence Detection in Liquid Chromatography after Precolumn Derivatisation of Amines" ， Anal. Chem. ， 67， 1742,(1995); S. R. Mujumdar, R. B. Mujumdar, C. M. Grant和 A. S. Waggoner, "Cyanine Labelling Reagents: sulfobenzoindocyanine succinimidyl esters " ， Bioconjugate Chemistry, 7， 356,(1996).专利文献P. L. Southwick和A. S. Waggoner, " Intermediate for and Fluorescent Cyanine Dyes containing Carboxylic Acid Groups",美国专利No. 4,981, 977, Jan.
I, 1991; A. S. Waggoner, L. A. Ernst和Mujumdar, R. B. ， "Method for Labelling and Detecting Materials Employing ArylsulfonateCyanine Dyes",美国专利No. 5, 268, 486， Dec. 7., 1993; A. S. Waggoner, "Cyanine Dyes as Labelling Reagents for Detection of Biological and Other Materials by Luminescence Methods", 美 国专利No. 5, 627, 027， May 6, 1996; A. S. Waggoner和R. B. Muj咖dar: "RigidisedTri坦ethine Cyanine Dyes" , W099/311181j G.-Y. Shen, T. S. Dobashi, "Cyanine Dye Activating Group with Improved Coupling Selectivity" ; G. M. Little, R. Raghavachari; N. Narayanan; H. L. Oster迈an, "Fluorescent Cyanine Dyes", 美国 专利No. 6, 027, 709, Feb. 22, 2000.
制备这些标记试剂所需的一般合成策略如下.首先，制备季铵化 的氮杂环Z1.然后，将该杂环碱与聚甲炔连接物(PML)反应以获得半 花胥(hemicyanine )例如Z1-(CH=CH) n-CH=NHPh 或 Z1-(CH-CH)n-CH NAcPh (其中Ac是乙酰基)或Z1-(CH-CH)n-0R，所述 的连接物是一种亲电子试剂例如PhNH-(CH CH)n-CH-NHPh.HCl或 R0-(CH-CH)n-CH(0R)2，其中Ph是苯环而R是甲基或乙基.随后将这 些中间产物与一种不同的季氮杂环(Z2)反应.将官能化侧臂连接至 第一个季铵化氮杂环(Z1)或第二个季铵化氮杂环(Z2)。最终结果是 不对称的聚甲炔标记试剂Z1-PML-Z2.半花菁中间产物的实例在F. M. Hamer的"Some Unsy咖etrical Pentamethincyanine Dyes and their Tetramethin Intermediates" , J. Chem. Soc， 32 (1949)和R. B. Mujumdar、 L. A. Ernst、 Swati R. Mujumdar、 C. J. Lewis和A. S. Waggoner的"Cyanine Dye Labelling Reagents: Sulfoindocyanine Succinimidyl Esters" ， Bioconjugate Chemistry, 4， 105， (1993) 中有描述.
有效且容易产生以及适合用于制备与生物分子的缀合物的聚甲炔 荧光染料是理想的。
发明概述
本发明人成功地合成了如本申请中描述的聚曱炔荧光染料.在一个实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物:
X!和X2独立地选自C(CH2L) (CHX)、 0、 S和Se;
L和L独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R，、 N(ir)2或-SR'取 代的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分；
L和L各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；
n,是l、 2或3;
R2、 Ru和Ru独立地是H、卣素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、 磺酸根(sulfonate)、含S02NR6-Q-CHR7-(CH上的基团;i是0或1;并 且m-O-12、亚氨基季铵离子(iminium ion) 、 S-芳基、S-烷基，或者 任意两个相邻的R"和Rn取代基或R2和Ru取代基组合在一起时形成 4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环 或者取代或未经取代的芳香碳环(carbocyclicaryl ring)，其中碳 环各自独立地任选被d-Ce烷基、卣素或者Ob或SIU取代一次或多次；
在x是选自0至6的整数时，^和Ru是-H、 (CH2)XCH3;或者在n 是选自2至6的整数时，R!和Rn独立地是(CH丄S03—或(CH2)nS03H;
R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；
R6选自取代或未经取代的d-"脂族基团；取代或未经取代的芳 基；取代或未经取代的烷基芳基，其中IU在不存在Q时任选被卤素、 0R*、 N(R')2或SR^取代；为羰基；取代或未经取代的d-C6烷基，其 中烷基的0-2个亚甲基基团被NH、 O或S替代；或者取代或未经取代
或其盐，的d-C6碳环、非芳香破环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个 杂原子；或者
在Q是羰基时，R6是H;并且
R7选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的坑基芳基，其中R，任选被由素、0R*、 N(夏'): 或Sb取代；或者
!U和R7—起形成任选被卣素、0R*、 N(hh或S^取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者
NR6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代或者杂环或非芳香杂环的 环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任逸被-0R、N(！02 或-SI^取代；并且
W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR广、-0-、 -COO-和-CONH-的基
团；
h = 0-70; k = 0或1; d+12; m=0-12; p=0-12;
Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且
每个IU独立地是-H或d-20烷基，
条件是该化合物不是<formula>formula see original document page 30</formula>在另一实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物或其盐， 其中X!和&独立地选自C(CH2U (CH2K2)、 0、 S和Se;
K,和K2独立地选自H、 C广C2。脂族基团和被-0R*、 N(R.)2或-SR,取 代的d-"脂族基团；或者Id和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分；
L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；
川是1、 2或3;
R2、 Rn和Ru独立地是H、 F、 Br、 Cl、 d-C6烷基、C广"烷氧基、 芳氧基、含氮的杂环、含氮的芳香杂环(heteroaromatic ring)、磺酸根、亚氨基季铵离子，或者任意两个相邻的R"和Ru取代基或Rz和 Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的破环、 取代或者未经取代的非芳香碳环或取代或未经取代的芳香碳环，其中 所述碳环各自独立地任选被d-C6就基、离素或者OR"o或SIU取代一次 或多次；
在x是选自0至6的整数时，R,和Ru是(CH2)xCH3;或者在n是选 自2至6的整数时，l和Ru独立地是(CH丄SO，-或(CH丄S03H;
R3、 R,和R5独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸翁、胺、酰胺、橫 跣胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；
R6选自取代或未经取代的C广Cw脂族基团；取代或未经取代的芳 基；取代或未经取代的烷基芳基，其中R6在Q不存在时任选被离素、 0R*、 N(R')2或SI^取代；为羰基；取代或未经取代的C广C6烷基，其中 烷基的0-2个亚甲基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的d-C6 碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子； 或者
在Q是羰基时，Re是H;并且
R7选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被囟素、0R*、 N(R')2 或SR，取代；或者
R6和R7—起形成任选被卤素、0R*、 N(R"2或SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者
NR6、 Q和CHR7 —起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-Sl^取代;并且
W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR广、-0-、 -C00-和-C0NH-的基
团；
h = 0-70; k = 0或1; d=0-12; m=0-12; p=0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且
每个!^独立地是-H或Cw。烷基.
在另一实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物或其盐， 其中
X,和X2独立地选自C (CH山)(CH2K2) 、 0、 S和Se;
Id和K2独立地选自H、 C广C2。脂族基团和被-0R、 N(R')2或-SI^取 代的C广C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分；
Y!和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合
的环；
iii是l、 2或3;
R2、 Ru和Ru独立地是H、卣素、C广C6烷基、C「G烷氧基、芳氧基、 含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子、含 S02NR6-Q-CHR7-(CH上的基团(i是Q或1;并且m = 0-12)，或者任 意两个相邻的Ru和Ru取代基或R2和Rn取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者 取代或未经取代的芳香碳环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、 卤素或者Oh或SIU取代一次或多次；
在x是选自0至6的整数时，R!和Rn是(CH》xCH3;或者在n是选 自2至6的整数时，R!和Rn独立地是(CH丄S(V或(CH丄S03H;
R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；
R6选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团；取代或未经取代的芳 基；取代或未经取代的烷基芳基，其中R6在Q不存在时任选被囟素、 0R*、 N(R')2或SR"""取代；为羰基；取代或未经取代的C！-06烷基，其中 烷基的0-2个亚甲基由NH、 0或S代替，或者取代或未经取代的d-C6碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子； 或者
在Q是羰基时，Re是H;并且
R7选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被离素、0R*、 N(IO: 或SR，取代；或者
R6和R7—起形成任选被卤素、0R*、 N(R"2或SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者
NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SR，取代;并且
W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -C00-和-C0NH-的基
团；
h = 0-70; k - 0或1; d-0-12; m=0-12; p-0-12;
Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 O或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且
每个IU独立地是-H或Cw。烷基。
在另一实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物或其盐， 其中l和Xi独立地选自CC (CH2K2) 、 0、 S和Se;
L和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R.)2或-SR拿取 代的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分；
Y!和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；
n,是1、 2或3;
R2、 Ru和Ru独立地是含S02NR6-Q-CHR7-(CH丄的基团U是0或1; 并且m-0-12)、垸基、芳基、烷氧基、囟素、S-芳基或S-烷基， ^和Ru是H;R3、 1U和^独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸醋、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；
R6选自取代或未经取代的d-Cw脂族基团；取代或未经取代的芳 基；取代或未经取代的烷基芳基，其中Rs在Q不存在时任选被面素、 0R*、 N0r)2或SR,取代；为羰基；取代或未经取代的C「C6烷基，其中 烷基的0-2个亚甲基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的C!-C6 碳环、非芳香破环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子； 或者
在Q是羰基时，IU是H;并且
R7选自H、取代或未经取代的C广C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的垸基芳基，其中R7任选被囟素、0R*、 N(R')2 或SIU取代；或者
R6和R7—起形成任选被卣素、0R*、 N(R"2或SIU取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者
NR6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环的或非芳香杂 环的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-0R*、 N(R')2或-SR-取代;并且
W不存在或者是选自-S02NR广Q-CHR7-、 -0-、 -C00-和-C0NH-的基
团；
h = 0-70; k = 0或1; d+12; m-0-12; p+12;
Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 O或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且
每个IU独立地是-H或Cw。烷基，
在另一实施方案中，本发明涉及含有一种或多种化学连接至本发 明化合物的生物分子的生物相容性荧光分子.
在另一实施方案中，本发明涉及含有化学连接至本发明化合物的 生物分子的生物相容性荧光分子，其中所述的化合物具有约400 nm 至约900 nm的吸收最大值和发射最大值。在另一实施方案中，本发明涉及含有化学连接至本发明化合物的 生物分子的生物相容性荧光分子，其中所述的化合物在与把标相互作 用后被激活.
在另一实施方案中，本发明涉及含有化学连接至本发明化合物的 生物分子的生物相容性荧光分子，其中所迷化合物对靶标具有高的亲 和力.
在另一实施方案中，本发明涉及体内光学成像的方法，该方法包
括
(a) 施用给受试者一种或多种本发明的化合物或生物相容性荧 光分子；
(b) 让所述化合物或生物相容性荧光分子分布于受试者体内或 者与生物靶标接触或相互作用 一定时间；
(c )用波长可被所述化合物或生物相容性荧光分子吸收的光照 射受试者；并且
(d)检测由所述化合物或生物相容性荧光分子发出的光信号. 在另一实施方案中，本发明涉及含有化学连接至本发明化合物的 生物分子的生物相容性荧光分子，其中所述的生物分子是经标记的细 胞。
附图
简述
图l是在荧光反射系统(FRI， Kodak 2000MM)上24小时后，雌 性NU/NU小鼠(6-8周大)的肿瘤中本发明化合物的荧光图像。
图2是在荧光反射系统VisEn'荧光体层摄影系统(FMT)上24小 时后，雌性NU/NU小鼠(6-8周大)的肿瘤中本发明化合物的荧光图 像。
图3是注射有本发明化合物的5天大的BALB/c x CF-1 F！小鼠在 用荧光反射成像(FRI)系统(Kodak 2000MM) 24小时后得到的骨生 长荧光图像。发明详迷接下来是本发明的优选实施方案的描迷.本发明涉及在约440至约1100 nm、约550至约800 nm、约500 至约900 nm或约600至约900 nm吸收和/或发射的明亮的、高度荧光 化合物(染料)及其級合物.应该理解，在其他光谦，例如可见光和 紫外线光谱中具有激发波长和发射波长的化合物(荧光染料)也包含 于本发明中.通常，本发明化合物的结构是基于赋予高荧光性的N，N-二取代橫 酰胺侧臂衍生物.此外，在本发明的一些实施方案中，该化合物含有 可用于与靶分子上的互补基团化学连接的官能团或活性基团."化学连接"意指通过原子之间足够强而使得结合的聚集体能作 为一个单元起作用的吸引力连接.这包括(但不限于)化学鍵(例如 共价鍵、非共价键如离子键、金属键和桥鍵)、疏水性相互作用、氢 键和范德华相互作用，这也包括交联或笼闭.如在此使用的，术语"化合物"指本发明的"聚曱炔荧光染料"、 "荧色物"、"荧光染料"、"花菁染料"、"碳菁染料"和"染料" 这些术语可交换使用用于指本发明的化合物.在一个实施方案中，本发明的化合物含有根据式(l)的通过聚甲 炔连接物(PML)结合在一起的两个杂环体系Z1-,) -Z2(1)其中^是一个杂环体系，例如吲哚镇(indolinium)环，f是另一个 杂环体系，例如吲咮镇环，而PML是聚甲炔连接物.^和Z'环体系用 多种取代基进一步取代或者与另外的可进一步取代的环稠合.引入取生物分子的功能性侧臂.在一方面，本发明的化合物进一步由磺基或磺烷基取代一次或多 次。"磺基"意指磧酸或磧酸的盐(磺酸盐).类似地，"羧基"意 指羧酸、羧酸酯或羧酸盐，"磷酸酯"是磷酸的酯，并且包括磷酸酯 的盐。"膦酸(盐)"指膦酸并包括膦酸的盐。同样，对于"羰基"，包括(但不作为限制)基团例如羰基离化物(例如，氯化物)和甲酰 胺.如在此使用的，除非另外说明，取代基的坑基部分例如烷基、烷 氧基、芳基烷基、炕基氨基、二烷基氨基、三烷基铵或全氟烃基任选 为饱和的、不饱和的、直链的或分支的，并且所有的烷基、烷氣基、 烷基氨基和二就基氨基取代基自身任选进一步由羧基、磺基、氨基或 羟基取代.在一个实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物或其盐其中Xi、 &独立地选自C(CHA) (CH2K2) 、 0、 S、 Se, K!和K2独立地选 自H和直链或支链的、饱和或不饱和的C广C2。烷基，其任选含有各种 形式的N、 S、 0;或者独立地，其中L和K2—起是任选进一步被取代 的环的一部分。Yi、 L是形成苯并稠合的环或萘并稠合的环或吡啶并 稠合的环所需的非金属原子并且ih是1、 2或3。 R2、 Ru和Ru独立地 是H、 F、 Br、 Cl、 C「C6烷基、d-C6烷氧基、芳氧基、氮杂环、磺酸 根、亚氨基季铵离子，或者任意两个相邻的IU或Ru取代基或R2和Ru 取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元饱和或不饱和的烃环，该烃环 任选被d-Cs烷基、卣素或者具有0或S的部分取代一次或多次.l 和Rn选自H、 (CH2)nCH3、 (CH2)nSOr^(CH2)nS03H，其中当R,或R"是 (CH丄CH3时n为选自0至6的整数，并且当R!或Ru是(CH2)nS0广或 (CH2)nS03H时n为选自2至6的整数。R3、 114和Rs独立地选自H、羧 酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分 和磺酸盐部分。Rs独立地选自直链或支链的、饱和或不饱和的C「C20 烷基、芳基、烷基芳基，其任选含有各种形式的卣素、N、 S、 0; R7 独立地选自H、直链或支链的、饱和或不饱和的d-C2。烷基、芳基、烷 基芳基，其任选含有各种形式的囟素、N、 S、 0; R6和R,组合在一起时 形成4-、 5-、 6-或7-元饱和或不饱和的烃环，所述烃环任选含有各种,S02NRrQ-CHR7 H(CH2)nrWKCHaV(0)^CH2)jZ形式的离素、N、 S、 0 . Q不存在或者是C广Cs就基、C广C6环坑基，其 中烷基或环基团含有0-2个选自N、 0、 S的杂原子.所述环基团可以 并入NR6和C肌7为环体系的一部分.Q是羰基(CO)并且R6独立地选 自H、直链或支链的、饱和或不饱和的d-Cw烷基、芳基、烷基芳基， 其任选含有各种形式的卤素、N、 0、 S.
W不存在或者是选自-S02NRHhCHR7-、 -0-、 -COO-和-CONH-的基 团.并且，h-0-70; k漏O或l; d-0-12;迈謹0-12; p-0-12. Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或者是能够与 N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S亲核体反应的 官能度.将该式(2 )化合物化学连接至生物相容性荧光分子用于多种 应用，包括体内成像.
在另一实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物或其盐
其中1、 X2独立地选自C(CH2KJ (CH2K2)、 0、 S、 Se, Ki和L独立地选 自H和直链或支链的、饱和或不饱和的d-C2。烷基，其任选含有各种 形式的N、 S、 0;或者独立地，其中L和K2—起是任选进一步被取代 的环的一部分。L、 Y2是形成苯并稠合的环或萘并稠合的环或吡啶并 稠合的环所需的非金属原子并且n!是1、 2或3. R2、 Rn和L独立地 是H、 F、 Br、 Cl、 C「C6烷基、C广C6烷氧基、芳氧基、氮杂环、磺酸 根、亚氨基季铵离子，或者任意两个相邻的Ru或Ru取代基或R2和Rn 或l和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元饱和或不饱和的烃 环，该烃环任选被d-Ce烷基、卣素或者具有0或S的部分取代一次或 多次。Id和Rn选自(CH2)nCH3、 (CH2)nS03+(CH2)nS03H,其中当Id或Ru 是(CH丄CH3时n为选自0至6的整数，并且当Ri或R"是(CH2)。S0厂或 (CH丄S03H时n为选自2至6的整数.R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸 盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.Re独立地选自直链或支链的、饱和或不饱和的C广Cw烷基、芳基、烷基芳基，其任选含有各种形式的离素、N、 S、 0; 117独立 地选自H、直链或支链的、饱和或不饱和的C广C"烷基、芳基、烷基芳 基，其任逸含有各种形式的卤素、N、 S、 0; !U和R7组合在一起时形成 4-、 5-、 6-或7-元饱和或不饱和的烃环，该烃环任选含有各种形式的 卤素、N、 S、 0. Q不存在或者是d-C6烷基、C广Cs环烷基，其中坑基 或环基团含有0-2个选自N、 0、 S的杂原子.环基团可以并入冊6和 C肌7作为环体系的一部分.Q是羰基(C0)并且R6独立地选自H、直 链或支链的、饱和或不饱和的d-Cw烷基、芳基、烷基芳基，其任选 含有各种形式的离素、N、 0、 S.W不存在或者是选自-S02NRHhC肌广、-0-、 -COO-和-C0NH-的基 团。并且，h 0-70、 k ' 0或1、 d - 0-12、 m ， 0-12、 p - 0-12. Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 O或S亲核性官能度，或者 是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S亲核 体反应的官能度。将该式(2 )化合物化学连接至生物相容性荧光分子 用于多种应用，包括体内成像。在一个实施方案中，本发明涉及由下式表示t-(PML)-Z2的化合物或其盐，其中Yi、 Y2是形成苯并稠合的环或萘并稠合的环或吡啶并稠合的环所 需要的非金属原子。在一个实施方案中，L、 L表示形成1至2个稠合芳香环(每个 环中具有6个原子)所需要的原子，该原子选自-CH、 -C、 -018和-冊9， 其中Rs是0或1 (这样每个环氮是季铵化的或者不是季铵化的)，并且每个Rg独立地含有磺基、三氟甲基或卤素；R,独立地含有C广C,烷基， 依次独立地含有H、氨基或磺基.在所迷稠环上并入一个或多个非氢取代基可用于调节所产生的染 料的吸收和发射光谦.下面显示，式(1)和(2)中f的基本结构的逸择性实例.这些 基本结构任选被进一 步取代.在一个实施方案中，在式(2 )中，Xm X2独立地选自C (CH^) (CH2K2)、 0、 S、 Se，其中L和K2独立地选自H和直链或支链的、饱和或不饱和 的d-"烷基，其任选含有各种形式的N、 S、 0;或者独立地，其中 L和L一起是环的一部分或者X独立地选自-CR2。Rn，其中1(2。和R21(它 们可以相同或不同)是烷基、环烷基或芳基烷基， 一起为环体系的一 部分，并且任选被进一步取代。在本发明的一个方面，对于由式(2)表示的化合物，R3和IU组合 在一起时形成一个5或6元环，在一个实施方案中，在由式(2)表示的化合物中，R!和IU3选自H、 (CH2)nCH3、 (CH丄S0「和(CH丄S03H，其中当^或R"是(CH丄CH3时n为 选自0至6的整数，并且当Id或R"是(CH丄S0「或(CH2)nS03H时n为选 自2至6的整数。在本发明的一个方面，R!和I^是含有芳基磺酸盐或 氨基或邻苯二甲酰亚氨基的取代基.在一个实施方案中，在由式(2)表示的化合物中，R!和Ru选自 (CH2) nCH3、 (CH2) nSO广和(CH2) nS03H，其中当Id或R"是(CH2) nCH3时n为 选自0至6的整数，并且当^或Rn是(CHJ nSO广或(CH2) nS03H时n为选 自2至6的整数。在本发明的一个方面，^和Ru是含有芳基磺酸盐或 氨基或邻苯二曱酰亚氨基的取代基.由式(2)表示的化合物中的取代基R,、 R4和Rs独立地选自H，离 素、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、氨基、酰胺、烷基或芳基橫跣胺、幾基、 烷氣基、芳氧基、碟酸盐、氛基、硝基、叠氮基、烷基氨基、二烷基 氨基、三烷基铵、磷酸盐、磷酸酯、膦酸盐(phosphonate)、橫酸和 磺酸根部分.
在一个实施方案中，将本发明的化合物经橫化一次或多次.如果 本发明的化合物由橫基(即例如橫酸部分、磺酸盐部分或橫酰胺)取 代，通常在113或IU或Rs或者这三处磺化，或者独立地在每个R,或Ru 或这两者处磺坑基化(即，例如(CH:hS0r或(CH》nS03H),或者既经橫 化又经磺坑基化.
如在此使用的，术语磺酸和(CH丄SOJI或磺酸根基团和(CH上S(V 可以交换使用.然而，在一些实施方案中，术语磺酸部分、磧酸根部 分或磺酰胺指通过磺酸部分、磺酸根部分或磺酰胺部分(即-S02NR'R") 连接至分子的残余部分的取代基.
在一个实施方案中，本发明涉及由结构式(2)表示的化合物
Xi和X2独立地选自C(CH&) (CH2K2) 、 0、 S和Se. 在一个实施方 案中，L和X2独立地是C (CHA) (CH2K2),
Jd和L独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R.)2或-S1^取 代的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分.在一个实施方案中，L和L独立地是H或C广C2。烷基. 在一个实施方案中，L和L独立地是H或d-d。烷基。在一个实施方 案中，L和K2独立地是H或d-C"烷基.
Y,和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环。n,是l、 2或3.R2、 Ru和Ru独立地是H、离素、烷基、烷氣基、芳氧基、芳基、 磺酸根、含S02NRHhCHR7-(Ciy ,的基团(i是0或1;并且m ■ 0-12 )、 亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的R"和Rn取 代基或112和Rn取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取 代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香 碳环.在一个实施方案中，碳环各自独立地任选被C广Cs烷基、面素或 OR*或Sb取代一次或多次.在一个实施方案中，Rz、 R"和Ru独立 地是H、烷基、芳基、磺酸根、含SO,NRHhC肌7-(CH2),的基团'(i是0 或1;并且m - 0-12)、亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任 意两个相邻的Ru和Rn取代基或Rz和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者 取代或未经取代的芳香碳环，其中所述碳环各自独立地任选被 烷基、卣素或OR*或SIU取代一次或多次.在一个实施方案中，R2、 Rn和Ru独立地是H、 Cw。烷基、磺酸根、含S02NR6-Q-CHR7-(CH丄的基 团(i是0或l;并且m-0-12)，或者任意两个相邻的Ru和Ru取代 基或R2和Rn取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元碳环、非芳香碳 环或芳香碳环.在x是选自0至6的整数时，R!和Ru是-H、 (CH2)XCH3;或者在n 是选自2至6的整数时，!U和Rn独立地是(CH丄S0r或(CH2)nS03H。R3、 JU和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、跣胺、磺 酰胺、^基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.在一个实施方案中， R3、 R4和Rs独立地选自H、磺酰胺、磺酸部分和磺酸根部分.在一些 实施方案中，R3、 R4和Rs独立地是磺酸或其盐.Re选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团，取代或未经取代的芳 基，取代或未经取代的烷基芳基，在Q不存在时，羰基，取代或未经 取代的C「C6烷基，其中烷基的0-2个亚甲基被NH、 O或S替代；或者 取代或未经取代的d-C6碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中 杂环含有l-2个杂原子。在一个实施方案中，R6任选被g素、OR、N(R')2或SR傘取代.在另一实施方案中，Q-0R*、 JUrh或-SR,取代.在一个 实施方案中，R6选自C广C26烷基，芳基，烷基芳基，在Q不存在时， 羰基，d-C6烷基或d-C6碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环.在 一个实施方案中，R6是C「d。烷基，在Q不存在时，羰基、C广Cs烷基 或d-C6碳环、非芳香破环、杂环或非芳香杂环. 备选地，在Q是羰基时，l是H.R，选自H、取代或未经取代的C广Cw脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卣素、0R*、 NOT), 或Sh取代.在一个实施方案中，R7任选被0R、 N(R1或SP取代. 在一个实施方案中，1选自H、 C广Cm坑基、芳基、烷基芳基.在一个 实施方案中，R，选自H或d-d。烷基；或者备选地，Rs和R7—起形成4-、 5-、 6-或7-元杂环或非芳香杂环. 在一个实施方案中，碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环任选被卤素、 0R*、 N(R')2或SIU取代.在一个实施方案中，116和117组合在一起时形 成4-、 5-、 6-或7-元碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环.备选地，NR6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非 芳香杂环的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子.在一个实施 方案中，碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环任选被卤素、0R*、 N(R')2 或Sb取代.在一个实施方案中，IU和R7组合在一起时形成4-、 5-、 6-或7-元碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环。W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -COO-和-C0NH-的基 团。在一个实施方案中，W不存在.h - 0-70、 k 0或1、 d 一 0-12、 m豕0-12、 p 0-12,在一 个实施方案中，h = 0-10; k = 0或1; d=0-6; m-0-6; p=0-6。Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且每个^独立地是-H或Cw。烷基，在一个实施方案中，每个R-独 立地是-H或Cw。烷基.在一个实施方案中，对于由式(2)表示的化合物 R!和R"是-H，并且基团-((C(Rj-C0U)wCa2)-由选自下列的 结构式表示其中Rg选自H、卤素原子、S-芳基、S-烷基、烷基、芳基、烷氣 基、芳氣基和含S02NRHhCHR广(CH2),的基团；i是0或1;并且m-0-12, 并且剩余的变量是如上描述的.在一些实施方案中，对于由式(2)表示的化合物，Z是选自-NH，、 -OH和-SH的亲核性官能度，并且剩余的变量是如上描述的.在一些其他的实施方案中，对于由式(2)表示的化合物，Z是能 够与N、 0、 S亲核体反应的官能度，所述的亲核体选自-COCl、 -(CO)O(CO)R、 -CONHNH2、取代和未经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、硝 基-或氟-苯酚酯、-NCS、 -CHO、 -COCHJ、亚磷酰胺和马来跣亚胺基团， 并且剩余的变量是如上描述的.在一个实施方案中，亲核体选自-C0C1 、 -(CO)O(CO)R、 -CONHNH2、取代和未经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、 -NCS、 -CHO、 -COCH2I、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团.在另一实施方案中，本发明涉及由式(2)表示的化合物l和X2独立地选自C(Ciyd) (CH2K2) 、 0、 S和Se, 在一个实施方 案中，1和X2独立地是C (CH2K!) (CH2K2)。L和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R')2或-SIU取 代的C「Q脂族基团；或者Id和L一起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分。在一个实施方案中，L和L独立地是H或d-C"烷基.或其盐。在一个实施方案中，K,和L独立地是H或d-d。烷基基团.在一个实 施方案中，^和K2独立地是H或C广C"烷基基团.L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；n,是l、 2或3;R2、 Ru和Ru独立地是H、 F、 Br、 Cl、 C广C6烷基、C广Cs烷氣基、 芳氧基、含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子，或者任意两个相邻的R12和Ru取代基或R2和Rn取代基组合在一起时形 成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳 环或者取代或未经取代的芳香破环，在一个实施方案中，碳环各自独 立地任选被d-C6烷基、面素或OR*或SRo取代一次或多次.在一个 实施方案中，R2、 Ru和L独立地是H、 C广Cs烷基、含氮的杂环、含氛 的芳香杂环，或者任意两个相邻的Ru和Ru取代基或Ra和Ru取代基组 合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取 代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香碳环，其中所述的碳环各 自独立地任选被d-C6烷基、卣素或者OIU或Sh取代一次或多次.在 一个实施方案中，R2、 Ru和Ru独立地是H、 Cw烷基、含氮的杂环，或 者任意两个相邻的Ru和Ru取代基或R2和Ru取代基组合在一起时形成 4-、 5-或6-元的碳环、非芳香碳环或芳香碳环.在x是选自0至6的整数时，l和Ru是(CH2)XH3;或者在n是选 自2至6的整数时，Id和Ru独立地是(CH丄S(V或(CH丄S03H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分，在一个实施方案中， R3、 R4和Rs独立地选自H、磺酰胺、磺酸部分和磺酸根部分.在一些实 施方案中，R3、 R4和Rs独立地是磺酸或其盐。Rs选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团，取代或未经取代的芳 基，取代或未经取代的烷基芳基，在Q不存在时，羰基，取代或未经 取代的C广Ce烷基，其中坑基的0-2个亚曱基被NH、 0或S替代，或者 取代或未经取代的d-C6碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子.在一个实施方案中，l任选被囟素、OR*、 N (R'): 或SR,取代.在另一实施方案中，Q经-0R,、 N0O2或-SR,取代.在一 个实施方案中，Rs选自d-C"烷基、芳基、烷基芳基，在Q不存在时， 羰基，C广C6烷基或d-Cs碳环、非芳香破环、杂环或非芳香杂环.在 一个实施方案中，Rs是C广d。烷基，在Q不存在时，羰基，d-C6烷基 或C广Cs碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环. 备选地，在Q是羰基时，l是H.R7选自H、取代或未经取代的d-C,。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的垸基芳基，其中R7任选被离素、0R*、 N(R'), 或SR，取代.在一个实施方案中，R，任选被卣素、0R*、 N(IO,或SR* 取代.在一个实施方案中，R7选自H、 d-C,。烷基、芳基、烷基芳基. 在一个实施方案中，R，选自H或C广d。烷基；或者备选地，l和R7—起形成4-、 5-、 6-或7-元杂环或非芳香杂环. 在一个实施方案中，碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环任选被卤素、 0R*、 N(R')2或SIU取代.在一个实施方案中，R6和R7组合在一起时形 成4-、 5-、 6-或7-元碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环.备选地，NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非 芳香杂环的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子.在一个实施 方案中，碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环任选被卤素、R*、 N(R')2 或Sh取代。在一个实施方案中，1和117组合在一起时形成4-、 5-、 6-或7-元碳环、杂环、非芳香碳环或芳香环.W不存在或者是选自-S02NR「Q-CHR广、-0-、 -C00-和-C0NH-的基 团。在一个实施方案中，W不存在.h - 0-70、 k - 0或1、 d - 0-12、 m = 0-12、 p 0-12'在一 个实施方案中，h = 0-10; k - 0或1; d=0-6; m=0-6; p=0—6.Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且每个R，独立地是-H或Cw。烷基.在一个实施方案中，每个^独 立地是-H或Ch。坑基.在一些实施方案中，对于由式(2)表示的化合物，Z是选自-NH2、 -0H和-SH的亲核性官能度，并且剩余的变量是如上描述的.在一些其他的实施方案中，对于用式(2)表示的化合物，Z是能 够与N、 0、 S亲核体反应的官能度，所述的亲核体选自-COCl、 -(C0)0(C0)R、 -C0NHNH2、取代和未经取代的N-雍基琥珀跣亚胺酯、硝 基-或氟-苯酚酯、-NCS、 -CHO、 -C0CH2I、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团， 并且剩余的变量是如上描述的.在一个实施方案中，亲核体选自 -C0C1、 -(C0)0(C0)R、 -CONHNH,、取代和未经取代的N-鞋基琥珀跣亚 胺酯、-NCS、 -CHO、 -C0CH2I、亚磷酰胺和马来跣亚胺基团.在本发明的一个实施方案中，对于由如在前面第36段中所描迷的 式(2)表示的化合物，基团l、 Rj、 IU Rs或Ru的至少两个含有磺酸 或磺酸根基团.在本发明的一个实施方案中，对于由如在前面第37段中所描述 的式(2)表示的化合物，R" IU和Rs各自独立地是式 -S02M「Q—CHR7- [ (CH2) ,-W- (CH2) p- (0) k] h- (CH2) dZ的基团.在本发明的一个实施方案中，对于由如在前面笫38段中所描迷的 式 (2 ) 表示的化合物，I 、 IU和 R5之 一 是 -S02NR6-Q-CHR7- [ (CH2)B-W— (CH2) p- (0) k〗h- (CH2) dZ.在本发明的一个实施方案中，对于由如前面笫39段中所描迷的式(2)表示的化合物，X!和X2两者都是-C(CH3)2.在本发明的一个实施方案中，对于由如前面第40段中所描述的式(2)表示的化合物，基团-((C(Rn)"C(W)n广C(R2)"由选自下面的结构式表示其中Rs选自H或者Cl、 Br或F.在一些实施方案中，本发明的化合物由式3-5的任意之一表示:<formula>formula see original document page 48</formula>其中-.l和Ru独立地选自(CH2)XCH3、 (CH丄S03-和(CH丄S03H;其中x是 选自0至6的整数并且n是选自2至6的整数.R3选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺醜胺、羟基、 烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分。在一个实施方案中，本发明涉及由结构式(2)表示的化合物R4 S02NRffOOHRH(CHa)nrW"(CH2V(OWh(CH2)a2 ■， 、 R咖 "^^R^X,和X2独立地选自C(CH2U (CH2K2)、 0、 S和Se;K!和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R.)2或-SR'取 代的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂 环的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或^啶并稠合的环；n,是1、 2或3;R2、 Ru和Ru独立地是H、离素、C「C6烷基、C广C6烷氧基、芳氣基、 含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子、含 S02NR「Q-CHR「(CH丄的基团；i是0或1;并且m 0-12，或者任意 两个相邻的Ru和Rn取代基或&和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香破环或者 取代或未经取代的芳香碳环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、 卤素或者0R，或SR，取代一次或多次；在x是选自0至6的整数时，^和R"是(CH丄CH3;或者在n是选 自2至6的整数时，R!和Ru独立地是(CH丄S(V或(CH2)nS0sH;R3、 l和R5独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、跣胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.R6选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的芳 基、取代或未经取代的烷基芳基，其中Rs在Q不存在时任选被卣素、 0R*、 N(R')2或SIU取代，为羰基、取代或未经取代的d-Cs烷基，其中 烷基的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者为取代或未经取代的C广C^ 碳环或杂环，其中所述的环可并入NIU和C肌7作为该环体系的一部分， 并且所述杂环含有0-2个杂原子，其中Q任选被-0IU、 N(R')2或-SR， 取代；或者在Q是羰基时，l是H;&选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卤素、0R*、 N(R')2 或S^取代；或者Re和R7组合在一起时形成任逸被卤素、0R*、 N(I^)2或SR* 取代的4-、 5-、 6-或7元破环、杂环、非芳香碳环或芳基；W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -COO-和-CONH-的基团；h 0-70; k豕0或1; d= 0-12; m-0-12; p豕0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S 亲核体反应的官能度；并且每个！^独立地是-H或Cw。烷基.在一些实施方案中，基团- ((C (Rn) "C (R12)) nl-C (R2) -由选自下面的 结构式表示其中R8选自H、卣素原子和含S02NRHhC肌7-(CH2),的基团；i是 0或1;并且m-0-12，并且剩余的其他变量如上描述.在一个实施方案中，本发明涉及由结构式(2)表示的化合物或其盐，其中Xi和X2独立地选自C(CHA) (CH2K2)、 0、 S和Se;K!和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0IU、 N(R.)2或-SR'取 代的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代的或未经取代的碳环或 杂环的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；m是l、 2或3;R2、 Ru和Ru独立地是含S02NR广Q-CHR7-(CH2),的基团(i是0或1; 并且nH)-12)、烷基、芳基、烷氧基、卣素、S-芳基或S-烷基， R,和Rn是H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、跣胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.R6选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团；取代或未经取代的芳 基；取代或未经取代的烷基芳基，其中IU在Q不存在时任选被卤素、,S02NRrQ"CHR7 "Cm-W-(CH2 V(0)iJh(CH^0R*、 N(R')2或Sh取代；为羰基；取代或未经取代的C广Cs烷基，其中 烷基的0-2个亚甲基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的d"(^ 碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中所述杂环含有l-2个杂 原子；或者在Q是羰基时，1U是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-C"脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被面素、0R*、 NOT), 或SI^取代；或者Rs和R7—起形成任选被面素、0R*、 N(I^)2或SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和CHR7 —起形成取代或未经取代的或者杂环的或非芳香杂 环的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SI^取代；并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR广、-0-、 -C00-和-C0NH-的基团；h - 0-70; k - 0或1; d=0-12; m-0-12; p理0-12; Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度， 或者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲核体反应的官能度；并且每个！^独立地是-H或d,烷基.在本发明的一些实施方案中，R" Rn和Rn独立地是S-芳基或S-烷基，并且剩余的变量是如刚刚在上文中描述的.用于本发明化合物(碳胥染料)的合适的PML部分的合适实例以 前在文献中有描述，包括结合了非氨取代基、环结构和刚性化元素 (rigidizing element)的PML部分(Ollmann, Jr的美国专利No. 5, 831, 098 (1998)、 Patonay等的美国专利No. 6, 086, 737 (2000)、 Waggoner的美国专利No. 6, 048, 982 (2000)，以及Lee等的美国专利 No. 5, 453, 505 (1995) 、 Middendorf 等的美国专利 No. 5, 639, 874 (1997)、 Lincoln等的美国专利No. 3, 864, 644 (1975)、Simson的美国专利No. 4, 011, 086 (1977)、 Caputo的美国专利No. 6, 747, 159 (2004);将所有这些都通过引入作为参考).在本发明的一个实施方案中，可以将活性基团(或化学连接的分 子)连接至本发明的某些化合物(吲哚華染料)中的L上.除了 Y2 处的活性基团，该化合物还可以另外橫化至少4次(在R3和R4处，并 且在R,和Ru两处为磺烷基).在本发明的一个实施方案中，可以将活 性基团(或化学连接分子)连接至本发明的一些化合物(丐l咮普染料) 中的L上.除了 Y2处的活性基团，该化合物还可以另外碌化至多4次 (在Rs和R^处，并且在^和Ru两处为磺烷基).这种额外的磺化产 生了具有新特性，例如改善的水溶性的活性染料和染料缀合物.如在此使用的，"活性基团"意指能与不同化合物上的官能团进 行化学反应形成共价键的本发明化合物上的部分或可加成至该本发明 化合物上的部分，或者意指能与本发明化合物上的官能团进行化学反 应而形成共价键的不同化合物上的部分.通常，所述活性基团是可通 过暴露于相应官能团(分别为亲核体或亲电体)而形成共价键的亲电 体或亲核体.备选地，活性基团是可光敏化的基团，并且只有在用合 适波长的光照射后才变成是有化学活性的.通常，本发明化合物和被 缀合的物质之间的缀合反应导致活性基团的一个或多个原子被并入新 的鍵中，该新键使染料连接至该缀合的物质.PML部分通常源自在本发明化合物(染料)的合成中使用的偶联 剂.例如，N，N'-二苯基甲脒和原甲酸三乙醋产生PML部分.丙二搭双 (苯基亚胺)盐酸盐、1,1,3-三甲氣基丙烷以及1,1,3, 3-四甲氣基丙 烷和戊烯二眵双苯胺一氯化物也产生染料.PML的选择(实际上是对m和R2、 R12、 Ru的选择)也可以影响荧 光染料的吸收和荧光特性.^和f之间的PML的长度也影响荧光染料 的吸收和荧光特性.如果ih-l，并且吲哚铕杂环不与另外的环稠合， 则产生的荧光染料通常显示吸收最大值接近550 n迈.如果nr2，则荧 光染料的最大吸收通常接近650 nm.如果n，3,则荧光染料的最大吸 收通常接近750 nm.在本发明的一方面，ih是l、 2或3; R2、 Rn和Ru独立地是H、 F、 Br、 Cl、 C广C6烷基、C「(^烷氧基、芳氧基、氮杂环、磺酸根、亚氛基 季铵离子，或者任意两个相邻的Ru或Ru取代基或l和Ru取代基组合 在一起时形成4-、 5-或6-元饱和或不饱和的烃环，所述径环任选被 d-C6烷基、面素或者具有O或S的部分取代一次或多次.本发明的一方面是式(2)化合物，其中只有一个Ru选自官能化 的含氮杂环(经取代的含氮杂芳环).在该实施方案中，杂环和杂芳 环指如在此定义的杂芳环，例如吡啶而官能化指取代.本发明的另一方面是式(2)化合物，其中只有一个Rn选自吡啶环.在本发明的一方面，用下面显示的丙二眵部分将PML部分引入染 料中在本发明的一方面，可使PML上的吡啶氮季铵化以改变本发明化 合物的物理和药理学特性.可将官能侧臂引入^或Z2中.该官能侧臂位于由L或Y2描述的 部分中的任何位置.在本发明的一方面，式Z^(PML)-f由下列式子表示其中每个IU独立地选自(CH2),CH3、 (CH2)nS03-—(CH2)nS03H;其中x 是选自Q至6的整数并且n是选自2至6的整数，官能側臂通常通过合适的胺官能化侧臂与Y!或L上的磺酰氯基团 的反应引入.所述的胺官能化侧臂可以以胺盐的形式存在.在一个实施方案中，用于与L或Y,上的磺酰氯基团偶合的胺官能 侧臂是盐酸盐.因此，Rs独立地选自直链或支链的、饱和或不饱和的 d-C"烷基、芳基、烷基芳基，其任选含有各种形式的卤素、N、 0、 S.在本发明的一方面，Rs是甲基.因此，R,独立地选自H、直链或支 链的、饱和或不饱和的d-C"烷基、芳基、烷基芳基，其任选含有各 种形式的囟素、N、 0、 S.在一方面，Q不存在.在另一方面，Q是C广"烷基.在另一实施 方案中，Q是d-Cs环烷基，其中烷基或环基团含有0-2个选自N、 0、 S的杂原子.该环基团可以并入NRs和C肌7作为环体系的一部分.在 另外的方面，Q是羰基(CO)并且l独立地选自H、直链或支链的、 饱和或不饱和的d-C,。烷基、芳基、烷基芳基，其任选含有各种形式 的卣素、N、 0、 S.在一个实施方案中，部分-S02NRHhCHR广具有下式-S02N (CH3) -CH2-在本发明的另一方面，Q、 IU和R，组合在一起时形成4-、 5-、 6-或7-元饱和或不饱和的烃环，该烃环任选含有各种形式的卣素、N、 S、 0*在一个实施方案中，部分-S02NR6-Q-CHR7-具有下式 一sor"^^^"4在本发明的一方面，当m-0、 p-0、k-0、h-0并且d - 0 时，部分-S02NR6-Q-CHR7-Z用环状ct-氨基酸(例如脯氨酸、雍脯氨酸)、 1， 2， 3， 4-四氢异会啉-3-羧酸和合适的磺酰氯制备.在本发明的 一 方面，部分-S02NR广Q-C肌7-具有下式在本发明的 一 方面，部分-S02NR6-Q-CHR7-具有下式、 "W不存在或者是选自-S02NR广Q-CHR广、-0-、 -COO-和-CONH-的基团.在本发明的一方面，值h-0-70、 k-O或l、 d-0-12、迈-0-12、 p 0-12.在一方面，Z是羧酸、羧酸的琥珀酰亚胺酯、离代乙酰胺、肼、 异硫氛酸酯、马来酰亚胺基团、脂肪族胺、全氟苯甲酰氨基、叠氮基 全氣苯甲跣氨基或补骨脂素.在本发明的另一方面，Z是羧酸的琥珀 酰亚胺酯、马来酰亚胺、碘乙酰胺或羧酸的琥珀酰亚胺酯.在本发明 的另外的方面，Z独立地是选自-NH，、 -OH和-SH的亲核性官能度.而 且，Z可以是能够与N、0、S亲核体(包括但不限于，、- (CO) 0 (CO) R、 -C0NHNH2、取代和未经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、-NCS、 -CHO、 -C0CH2I、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团)反应的官能度.在本发明的一方面，Z"C0-01^或者Z-CO-R"并且是能够与亲核体 反应的活化酯U")或碳酰卤(R"，F、 Cl、 Br)的形式.羧基C0-0R" 也可以是选自C0-0苯并三唑基、CO-ON-羟基琥珀酰亚胺基、C0-0四 氟苯基、CO-0五氟苯基、C0-0咪唑基、CO-O对硝基苯基的形式.在本发明的一方面，Z - C0-0R"或者Z CO-R"并且是能够与亲 核体反应的活化酯(R15)或碳酰卤(R" - F、 Cl、 Br)的形式.羧 基C0-0R^也可以是选自CO-0苯并三唑基、C0-0N-琥珀跣亚胺基、C0-0 四氟苯基、C0-0五氟苯基、C0-0咪唑基、CO-O对硝基苯基的形式.在发明的一方面，Z是叠氮化物。在本发明的另一方面，Z是炔烃.在本发明的一方面，当Z是活化酯时，可以将化合物在中性或碱 性条件下于合适的溶剂中化学连接至双官能连接物例如氨乙基马来酰 亚胺、氨丙基马来醜亚胺、氨丙基叠氮化物、氨丙基疏醇、巯基乙胺、 炔丙胺3-氨丙醇、二氨基丙烷和二氨基丁烷，以提供额外的活性官能 团。在本发明的一方面，当Z是NH2时，可以将本发明的化合物在中 性或碱性条件下于合适的溶剂中化学连接至双官能连接物例如丙炔酸、琥珀跣亚胺基吡咬二硤代丙酸酯、马来跣亚胺-PEG-N-羟基琥珀酰 亚胺酯，以提供额外的活性官能团.在本发明的一方面，式Zi-(PML)-^根据下面表示，其中基团R" R3、 R4、 R5或Ru的至少两个含有橫酸或磧酸根基团.在本发明的一方面，式Z^(PML)-f根据下面表示，其中R3、 R4 和R5都独立地是式-S02NR6-Q-CHR广[(CH丄-W-(CH2)p-(0)k]h-(CH丄Z的基团.在本发明的一方面，式Z^(PML)-f根据下面表示，其中)d和X, 都是-C (CH3)2.在本发明的一方面，式Z^(PML)-Z'根据下面表示，其中具有3-7 个碳原子的聚甲炔连接物选自其中R,选自H、卣素原子、基团-S-芳基、S-坑基、烷基、芳基、 烷氧基、芳氧基和含S02NR6-Q-CHR广(CH2),的基团并且i是0或1; m=0-12.在本发明的一方面，式Z^(PML)-f根据下面表示，其中具有3-7 个碳原子的聚甲炔连接物如上显示，其中R,是H:、 、, 在本发明的一方面，式ZL(PML)-f根据下面表示，其中具有3-7 个碳原子的聚甲炔连接物选自<formula>formula see original document page 56</formula>其中R,选自H、卤素原子、含S02NRHhCHR7-(CH2),的基团并且i 是0或1; m-0-12.在本发明的一方面，式ZL(PML)-f根据下式表示当本发明化合物是在此通过显示在聚甲炔连接物环中双鍵的位置 的结构来描述时，应该理解该结构还包括如例如在下图中显示的任何 共振结构在本发明的一些实施方案中，当IU不是氢时，不需要的側链反应 得以减少、防止或抑制.在一个实施方案中，本发明涉及通过下式表示Z1-(PML)-Z2-BM的 化合物其中BM是化学连接至Z以形成生物相容性分子的生物分子.BM是改变或修改或增强通式结构Z1-(PML)-Z2的荧光染料的蓄积、 生物分布、消除、靶向、结合和/或识别的部分.BM包括但不限于抗 体及其片段、蛋白质、肽、氨基酸、抗体(或结合抗原的抗体片段， 例如单链抗体)、糖蛋白、细胞受体的配体、多糖、核苷、适配体、 细胞受体本身、酶底物、辅酶因子(enzyme cof actor)、生物素、激 素、神经激素、神经递质、生长因子、细胞因子、淋巴因子、凝集素、 选择蛋白、毒素和糖类.也可以使用利用不同生物分子的其他靶向和 递送方法,例如叶酸介导的把向(Leamon & Low, Drug Discovery Today 6:44-51， 2001)、运铁蛋白、维生素、糖类和靶标内化受体的配体，Vy、包括但不限于唾液酸糖蛋白受体、生长激素抑制素、神经生长因子、 催产素、蛙皮素、降钙素、精氨酸升压素、血管紧张素II、心房钠尿 肽、胰岛素、胰高血糖素、催乳激素、促性腺激素、各种阿片类物质 和尿激酶型纤维蛋白溶酶原激活物.还包括膜、跨膜和核转运倌号序列，其可源自许多来源，包括但不限于病毒和细菌.BM也可以是有 机分子、聚合物、树状高分子、药物、脂类、脂聚集体(lipid assembly), 治疗性药物分子、髙分子微粒、细胞或纳米顆粒.在一些实施方案中， BM还可以包括小分子药物、光治疗性分子及其衍生物.在本发明的一些实施方案中，当将BM化学连接至本发明的化合物 时，本发明化合物的荧光性增强.在一些实施方案中，与未连接的化 合物比较，荧光性增强了约10 %、约25 X、约50 %或大于约50在本发明的一方面，将几个拷贝的BM经由多价连接物或含几个活 性官能团的连接物化学连接至Z,以形成结构为(Z1-(PML)-Z2) -((L)w-(BM)q)t的生物相容性荧光分子，其中L是连接物或多价连接 物，并且t-l-6、 w"l-500而q=l-500. (L)，表示相同连接物的拷贝或 不同连接物的组合.用于本发明化合物(碳菁染料)的合适连接物部分的实例以前在 文献中有描述(美国专利申请2002/0064794 (2002) 、 Patonay等的美 国专利 No. 6,086, 737 (2000) 、 Waggoner的美国专利No. 6, 048, 982 (2000)、 Caputo的美国专利No. 6, 747, 159 (2004)、 Caputo 的美国专利No. 6, 448, 008 (2002)，它们都通过引入作为参考) 在本发明的另一方面，可以将多于一种结构为^-(PML)-f的本发 明化合物(荧光染料)化学连接至单个BM来形成结构为[ZL(PML)-Zlk-BM的生物相容性荧光分子，其中k"l-500.在一个实施方案中，本发明的化合物(荧光染料)和生物相容性 荧光分子具有约440至约1100 nm、约550至约800 nm、约500至约 900 nm或约600至约900 nm的吸收最大值和发射最大值.在一个实施方案中，本发明的化合物(荧光染料)和生物相容性 荧光分子在靶标相互作用后被激活."在靶标相互作用后被激活"意指改变了荧光染料或生物相容性荧光分子的可检测特性如光学特性的 变化.这包括(但不限于)导致荧光染料或生物相容性荧光分子的性 质如光学特性的可检测差异，例如荧光信号大小(例如去猝灭和猝灭) 的变化、波长、荧光寿命、光傳特性或极性的变化的修饰、改变或结 合(共价或非共价结合).在另一实施方案中，将猝灭刑分子用于猝 灭生物相容性荧光分子的荧光信号.通过采取这些活化态和非活化态， 因而能够通过鉴定信号强度的变化来确定荧光染料或生物相容性荧光 分子在受试者中^i否是活性的还是非活性的.另外，可以设计荧光染 料和生物相容性荧光分子，这样它们在激活以前显示出很小信号或无 信号.激活可以通过(不限制于)酶促裂解、酶转化、砩酸化或去磷 酸化、由结合引起的构象变化、酶介导的剪接、酶介导的转移、互补DNA或RNA的杂交、分析物结合(analyte binding)，例如与分析物 如Na+、 T、 Ca2+、 C1—或另一种分析物的结合、环境的疏水性的改变和 化学修饰来实现.在一个实施方案中，本发听的化合物(荧光染料)和生物相容性 荧光分子对靶标具有高的亲和力.在这里还提供了体内光学成像的方法，该方法包括(a)施用给受 试者本发明的化合物(荧光染料)或生浙相容性荧光分子；(b)使所迷 化合物(荧光染料)或生物相容性荧光分子分布在受试者体内或与生 物把标接触或相互作用一定时间；(c)用所述化合物(荧光染料)或生 物相容性荧光分子可吸收的波长的光照射受试者；以及(d)检测由所迷 化合物(荧光染料)或生物相容性荧光分子发出的光信号.由本发明化合物(荧光染料)或生物相容性荧光分子产生的光倌 号也认为是本发明的一个方面，不管所述光信号是通过体层摄影、反 射成像、平面成像、内窥镜成像、显微成像、手术护目镜成像、视频 成像技术还是通过其他方法如显微术(包括活体内显微术和双光子显 微术)收集，并且不管是定量还是定性使用.本发明的一方面是一种其中由本发明化合物(荧光染料)或生物 相容性荧光分子发出的光信号的存在、不存在、分布或水平指示出疾 病状态的方法.本发明的特征还在于用本发明的化合物(荧光染料)和生物相容性 荧光分子来检测患者或受试者体内的异常，例如，与癌症、心血管疾病、AIDS、神经变性疾病、炎性疾病、呼吸疾病、代谢病、骨病或免疫学疾 病相关的任何异常的方法.本发明的特征还在于用本发明化合物(组 合物)评估化合物或疗法对指定分子靶标的作用的方法，其中在用化合 物或疗法处理之前和之后使受试者成像，并比较对应的图像.本发明的一方面是与药物、配体、蛋白质、肽、大分子、聚合物、 纳米颗粒或其他具有多个活性基团的BM缀合.这种缀合导致荧光染料的吸收蓝移.这在可激活但淬灭了的荧光探针的体内成像过程中提供了使背景荧光最小化的机制.在另一方面，本发明的特征在于体内或体外光学成像法，该方法 包括(a)施用给样品或受试者本发明的化合物，例如本发明的生物相容 性含N， N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针；(b)使所述的含N, N-二 取代磺酰胺荧光染料的成像探针分布在受试者体内或者与生物靶标接 触或相互作用一定时间；(c)用所迷的含N，N-二取代磺酰胺荧光染料 的成像探针可吸收的波长的光照射受试者；以及(d)检测由所述的含 N， N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针发出的光倌号.也可以以预定的时间间隔重复本发明的成像方法步骤，从而使得 能评估受试者或样品中含N, N - 二取代磺酰胺荧光染料的成像探针随 时间所发出的信号.所发出的信号可以采取图像的形式.所迷受试者 可以是脊推动物例如哺乳动物，包括人.该动物也可以是无脊推动物 (例如，秀丽隐杆线虫(C. elegans)、果蝇或其他模型研究生物等). 所述样品可以包括(不作为限制)细胞、细胞培养物、组织切片、器 官、器官切片、细胞离心涂片(cytospin)样品等.本发明的特征还在于用于同时选择性检测和成像两种或更多种含 N， N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针的体内方法.该方法包括将两种或更多种含N,N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针同时或依次施 用给受试者，这些探针的光学特性是可辨别的.该方法因而使得能记 录多个事件或靶标.本发明的特征还在于一种用于选择性检测和成像一种或多种含 N， N-二取代磺醜胺荧光染料的成像探针的体内方法，该方法同时使用一种或多种靶向或可激活的光学成像探针，或者在使用核磁共振成像、 计算机断层摄影术(CT)、 X-射线、超声或核医学成像模式及它们各自 的成像刑的双模成像方案中.该方法包括同时或依次施用给受试者一 种或多种成像探针，包括至少一种含N,N-二取代磺跣胺荧光染料的成 像探针，它的特性是可与其它探针的特性相区分.在一方面，双棋成 像方案是依次或几乎同时使用含N, N-二取代磺跣胺荧光染料的成像 探针和核磁共振成像试刑(例如，基于氧化铁的试剂或基于钆的试剂 如钆喷酸盐)的光学和核磁共振成像.该方法因此使得能用多于一种 的成像模式或成像剂来纪录多个事件或靶标.在另一方面，本发明的特征在于一种体外光学成像法，该方法包 括将样品与含N,N-二取代橫酰胺荧光染料的成像探针接触；让所述 探针被活化或结合至样品中的目的靶标一定时间；任逸地，除去未结 合的探针；用波长可被含N, N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针吸收 的光照射靶标；并检测由含N,N-二取代橫酰胺荧光染料的成像探针发 出的光倌号.在施用后，检测可例如通过体外方法，即流式细胞术或者通过体 内成像法，即断层摄像、导管、平面/反射成像系统或内窥镜成像系统 进行.在一个实施方案中，可将N,N-二取代的磺酰胺荧光染料(或由其 衍生的成像探针)用于离体标记样品.所述样品例如细胞可以直接来 自受试者或来自另 一来源(例如来自另 一受试者、细胞培养物等).可 以将含N，N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针与细胞混合以便有效 地标记该细胞(共价或非共价地)，并且将得到的经标记细胞注射进 受试者中.该方法可用于监测某些细胞类型，包括T细胞、肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞和其他细胞类型的运输和定位.特别地，该方法可 用于监测基于细胞的疗法.样品也可以来自非哺乳动物源，包括但不 限于植物、昆虫、病毒、细菌和噬菌体.本发明另一方面的特征在于N,N-二取代磺酰胺荧光染料的成像 探针，所述探针可用于体内成像和标记离体样品(包括细胞)，而无 需使用通常对生物受试者或样品有毒的二甲基亚砜(DMSO)或其他有 机溶剂(即生理緩冲液或溶液).为了标记BM或细胞，可以将本发明化合物(荧光染料)与不同浓度 的BM在约4-37 "C下孵育约5分钟至24小时或更长时间.在孵育后， 可以例如通过本领域熟知的色谦法或超滤方法除去游离的或没有化学连 接至BM的荧光染料.对于细胞，在孵育后，可以将细胞离心以产生去除 了上清液的细胞沉淀颗粒.可以将该细胞再悬浮于培养基或生理盐水中 以洗掉残留的、未结合的或游离的荧光染料.这可以被重复数次.以这 种方式，所述细胞可以通过直接缀合至内部或外部的细胞分子或者通过 非特异性细l&m取i^多种细胞内区室，包括但不限于胞质溶胶、内体、 细胞核、高尔基体和其他细胞内细胞器中而得以标记.本发明另一方面的特征在于配制成适合施用给动物(包括人)受 试者的药物组合物的含N， N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针 该药 物组合物可以包含生理学相关栽体中的纳米颗粒和一种或多种穗定 剂.本发明另 一方面的特征在于生物相容性的荧光性N， N-二取代磺 酰胺荧光染料和含N， 二取代磺跣胺荧光染料的成像探针，其被配制 为适合施用给动物(包括人)受试者和细胞的药物組合物.所述药物 组合物可以包含生理学相关栽体中的一种或多种穗定剂.用于本发明方法中的稳定剂的合适实例包括但不限于低分子量的 糖类，在一方面，它是一种线性多元醇(polyalcohol)，例如山梨糖 醇和甘油；或甘露醇.也可以使用其他的低分子量糖类，例如肌醇. 生理学相关的栽体可以包括水、盐水，并且可以进一步包括试剂如緩 冲剂和其他的试剂如可配伍用于药物组合物中的防腐剂.本发明的特征还在于一种基因序列识别的方法，其使用荧光性N，N-二取代磺酰胺荧光染料、标记的核酸识别分子，包括DNA、 RNA、 经修饰的核酸、PNA、分子倌标、适配体或其他的核酸结合分子(例如， 小千扰RNA或siRNA).该方法包括一种或多种荧光性N，N-二取代橫 酰胺荧光染料与技术例如杂交、连接、裂解、重組、合成、测序、突 变检测、实时聚合酶链式反应、原位杂交一起使用，以及微阵列的使 用.例如，对于通过核酸杂交原理检测样品中的单链核酸(即，mRNA、 cDNA或变性的双链DNA ),让化学连接至单链核酸的荧光性N, N-二取 代磺跣胺荧光染料与含有一种或多种单链核酸的样品接触并检测荧光 性N, N-二取代磺酰胺荧光染料的荧光，其中荧光性N， N-二取代磺耽胺 荧光染料发出的荧光信号的存在或水平表明样品中核酸的存在或含 量.由N，N-二取代磺酰胺荧光染料或含N，N-二取代磺酰胺荧光染料 的成像探针或其衍生物产生的光信号也认为是本发明的一个方面，不 管所述光信号是通过断层摄影、反射成像、平面成像、内窥镜成像、 显微成像、手术护目镜或成像器成像、视频成像技术还是通过其他方 法如显微术(包括活体内显微术和双光子显微术)收集，并且不管是 定量还是定性使用，本发明另一方面的特征在于试剂盒，其包含N,N-二取代橫酰胺荧 光染料或含N，N-二取代磺酰胺荧光染料的成像探针，并且任选地，包 含使用该荧光染料或成像探针用于体内或体外成像方法的说明书.该 试剂盒可任选包含有助于该荧光染料或成像探针用于所迷公开方法的 组分，例如緩冲剂和其他配制剂；备选地，该试剂盒可包含有助于施 用成像探针给受试者的医疗器械.本发明的N，N-二取代磺酰胺荧光染料或含N,N-二取代磺跣胺荧 光染料的成像探针以及药物组合物可经口、经肠胃外、通过吸入、局 部、经直肠、经鼻、经颊、经阴道或通过植入型储库施用.术语"肠 胃外施用"包括静脉内、肌内、皮下、动脉内、关节内、滑膜内、胸 骨内、鞘内、腹膜内、脑池内、肝内、病灶内、颅内和淋巴内注射或输注技术.所迷的N， N-二取代橫酰胺荧光染料或含N, N-二取代磺醜胺 荧光染料的成像探针也可以通过导管或通过针施用给组织.在一个实施方案中，施用有效量(其为有效引起或增强荧光的量) 的本发明化合物.在一个实施方案中，施用约lng/kg至约100mg/kg、 约100 ng/kg至约10 mg/kg、约1 m g /kg至约5 mg/kg、约10 n g/kg至约2 mg/kg、约50 pg/kg至约l mg/kg的本发明化合物.优选的N, N-二取代橫跣胺荧光染料或含N,N-二取代磺酰胺荧光 染料的成像探针具有下列特性(l)髙的量子产率(例如，在含水介质 中量子产量大于5 %); (2)窄的发射光谦(例如小于75 nm;更优选小 于50 nm) ; (3)光谦分开的吸收和发射光谦(例如分开大于20 nm; 更优选大于50nm) ; (4)具有高的化学穗定性和光穗定性(例如在暴 露于光后保持荧光特性)；(5)在用于成像方案的剂量下对细胞或受试 者是无毒或极小毒性的(例如通过LDs。或刺激性试验或本领域巳知的 其他类似方法测量)和/或(6)具有商业生存力和大量(例如克和千克 量)可称的生产.本发明的化合物可具有一个或多个充分酸性的质子，其可与合适 的有机或无机碱反应形成碱加成盐.碱加成盐包括源自无机减如铵或 碱或碱土金属氢氣化物、碳酸盐、碳酸氢盐等和有机碱如醇盐、烷基 酰胺、烷基和芳基胺等的那些.可用于制备本发明盐的这样的碱因此 包括氩氣化钠、氩氣化钾、氩氧化铵、碳酸钾等.具有充分碱性的基团如胺的本发明化合物可与有机酸或无机酸反 应以形成酸加成盐.通常用于由具有碱性基团的化合物形成酸加成盐 的酸是无机酸例如盐酸、氢溴酸、氢硪酸、疏酸、磷酸等，以及有机 酸例如对甲苯磺酸、甲磺酸、草酸、对溴苯基磺酸、碳酸、琥珀酸、 柠檬酸、苯甲酸、醋酸等.这种盐的实例包括疏酸盐、焦疏酸盐、疏 酸氩盐、亚疏酸盐、亚硫酸氢盐、磷酸盐、磷酸一氢盐、磷酸二氩盐、 偏磷酸盐、焦磷酸盐、氯化物、澳化物、硪化物、醋酸盐、丙酸盐、 癸酸盐、辛酸盐、丙烯酸盐、甲酸盐、异丁酸盐、己酸盐、庚酸盐、 丙炔酸盐、草酸盐、丙二酸盐、琥珀酸盐、辛二酸盐、癸二酸盐、延胡索酸盐、马来酸盐、丁炔-l，4-二酸盐、己炔-l，6-二酸盐、苯甲酸 盐、氯苯曱酸盐、甲基苯甲酸盐、二硝基苯甲酸盐、羟苯甲酸盐、甲 氧基苯甲酸盐、邻苯二甲酸盐、磺酸盐、二甲苯磺酸盐、苯乙酸盐、 苯丙酸盐、苯丁酸盐、柠檬酸盐、乳酸盐、Y-羟丁酸盐、幾乙酸盐、 酒石酸盐、甲磺酸盐、丙磺酸盐、萘-l-橫酸盐、萘-2-橫酸盐、扁桃 酸盐等.如在此使用的，术语"烷基"意指饱和的直链、支链或环状烃.当 是直链或支链时，烷基通常为d-C2。，更典型为d-d。；当是环状时， 坑基通常为C3-C12，更典型为C3-C7.烷基的实例包括甲基、乙基、正 丙基、异丙基、正丁基、仲丁基和叔丁基以及l，l-二甲基己基."脂族基团"是非芳香的，并且可任逸含有一个或多个不饱和单元， 例如双键和/或三鍵.脂族基团可以是直链或支链的并且通常含有1-12 个碳原子，更典型含有1-6个碳原子，并且甚至更典型地含有1-4个破 原子.脂族基团中的一个或多个亚甲基基团可任选被O、 S或冊替代.如在此使用的，术语非芳香碳环或非芳香杂环(单独使用或用作 更大部分的一部分)指含非芳香碳或杂原子的环，其可以是饱和的或 者含有一个或多个不饱和单元，具有3-14个原子包括单环和多环，其中碳环或杂环可稠合至一个或多个非芳香碳环或杂环或者一个或多个 芳香(碳环或杂环)环.如在此使用的，术语"烷氧基"由-0R"表示，其中R"是如上定 义的烷基.如在此使用的，术语"羰基"由-C("0)R"表示，其中R"是如上 定义的烷基.术语"芳香基"包括芳香破环和杂芳环.术语"芳香基"可以与 术语"芳基"、"芳基环"、"芳香环"、"芳基基团"和"芳族基 团"交换使用.芳香碳环基团只具有碳环原子(通常6-14个)并包括单环芳香环 (例如苯基)和稠合的多环芳香环体系，在所述多环芳香环中芳香破 环与一个或多个芳香环(芳香碳环或芳香杂环)稠合.实例包括l-萘基、2-萘基、1-蒽基和2-蒽基.还包括在如在此使用的术语"芳香碳 环"范围内的是其中芳香环稠合至一个或多个非芳香环(碳环或杂环) 的基团，例如茚满基、苯邻二甲跣亚胺基、萘嘧焚基(naphthimidyl)、 菲啶基或四氦萘基中的基团.单独使用或作为更大的部分如"杂芳坑基"中的一部分使用的术 语"杂芳基"、"杂芳香的"、"杂芳环"、"杂芳基基团"和"杂 芳香基团"指具有5-14个成员的杂芳香环基团，包括单环杂芳香环和 其中单环芳香环稠合至一个或多个其它芳香环(碳环或杂环)的多环 芳香环.杂芳基基团具有一个或多个环杂原子.杂芳基的实例包括2-呋喃基、3-呋喃基、N-咪唑基、2-咪唑基、4-咪唑基、5-咪唑基、3-异'恶唑基、4-异'悉唑基、5-异嗜唑基、喝二唑基、喁二唑基、2-喝唑 基、4-嚙峻基、5-喝唾基、N-吡喳基、3-魂唑基、4-吡峻基、 基、N-吡咯基、2-吡咯基、3-吡咯基、2-吡咬基、3-吡梵基、 基、2-嘧啶基、4-嘧啶基、5-嘧咬基、3-歧嗪基、4-歧唤基、2-噻唑 基、4-漆唑基、5-嚷唑基、三唑基、四唑基、2-漆吩基、3-漆吩基、 吵唑基、苯并噻汾基、苯并呋喃基、吲哚基、喹啉基、苯并漆唑、苯 并喁唑、苯并咪唑基、异喹啉基和异吲哚基.还包括在如在此使用的 术语"杂芳基"范围内的是其中芳香环稠合至一个或多个非芳香环(碳 环或杂环)的基团.单独使用或用作更大部分的一部分的术语"非芳香杂环基团"指 具有3-14个成员的非芳香杂环基团，包括单环杂环和其中单环稠合至 一个或多个其他非芳香碳环或杂环或者芳香环(碳环或杂环)的多环. 杂环基团具有一个或多个环杂原子，并且可以是饱和的或含有一个或 多个不饱和单元.杂环基团的实例包括哌咬基、哝唤基、吡咯烷基、 吡唑烷基、咪唑烷基、四氬喹啉基、二氢吲哚基、异二氢吲哚基、四 氢呋喃基、-悉唑烷基、噻唑烷基、二氧戊环基、二硫戊环基、四氩吡 喃基、二氢吡喃基、氮杂环庚烷基和氮杂环丁烷基.术语"杂原子"意指氮、氧或硫并且包括任何氧化形式的氮和疏, 以及任何碱性氮的季铵化形式.此外，术语"氮"包括杂芳基或非芳香杂环基的可取代的氮.例如，在具有0-3个选自氧、疏或氮的杂原 子的饱和或部分不饱和的环中，氮可以是N (如在3，4-二氩-2H-吡咯 基中)、NH (如在吡咯烷基中)或NR"(如在N-取代的吡咯烷基中)， 其中R"是在含非芳香氮的杂环基团的环中的氮原子的合适取代基(如 下定义的).优选氮是未经取代的.如在此定义的取代的芳基含有一个或多个可取代的环原子，例如 碳或氮环原子.芳基或脂族基团的可取代的环碳原子上的合達取代基 的实例包括面素(例如-Br、 Cl、 I和F) 、 -OH、 C「C,烷基、C广C^面 代烷基、-N02、 d-C4烷氧基、d-C4囟代烷氣基、-CN、 -NHi、 d-C豸烷基 氨基、Cl-C4 二坑基氨基、-C (0) NH,、 -C (0) NH (C「C4烷基)、-C (0) (d-C4 烷基)、-OC(O) ( C「C4就基)、-OC(O)(芳基)、-OC(O)(取代的芳基)、 -OC (0)(芳烷基)、-OC (0)(取代的芳烷基)、-NHC (0) H、 -NHC (0) ( d-C, 烷基)、-C(0)N(C广C4烷基)2、 -NHC(O)O-( C广C4烷基)、-C(0)OH、 -C (0) 0- ( d-。烷基)、-NHC (0) NH2 、 -NHC (0) NH (C「G烷基)、 -NHC(0)N(d-C4烷基)2、 -NH-C( NH)NH2、 -S02NH2 -S02NH (C广C3烷基)、 -S02N(d-Cs烷基)2、 NHS02H、 NHS(Ud-C4烷基)和芳基.芳基上的优选 取代基是如整个说明书中所定义的.芳基可取代的环氮原子上的合适取代基的实例包括d-C4烷基、 NH2 、 C广C4烷基氨基、d-C4 二烷基氨基、-C (0) NH2 、 -C (0) NH (C广G烷基)、 -C(O)( C「。垸基)、-C02 R**、 -C(0)C(0)R"、 -C(O)CH" -C(0)0H、 -C (0) 0- ( d-C4烷基)、-S02NH2 -S02NH (d-C3烷基)、-S02N (d-C3烷基)2 、 NHS02H、 NHS02(d-a统基)、-C(-S)NH2、 -C( S)NH(CH^烷基)、 -C (-S) N (d-C4烷基)2 、 -C (=NH) -N (H) 2 、 -C ( NH) -NH (d-C4烷基)和 -C ( NH) -N (C广C4烷基)2.如在此定义的取代的烷基、脂族基团、非芳香碳环或杂环基团含 有一个或多个取代基.烷基的合适取代基的实例包括上面列出的用于 芳基和脂族基团的可取代碳的那些取代基以及下列取代基"0、 -S、 NNHR**、 -NN(R—2、 -NNHC(0)R**、 NNHC02 (烷基)、《NNHS02 (烷基)、 NR**、螺环烷基或稠合的环烷基基团。R"每次出现都独立地是-H或d-Cs烷基.烷基、脂族基团、非芳香碳环或杂环基团上的优选取代基是如整个说明书中所定义的. 体外检测和用途本发明的荧光染料和生物相容性荧光分子可以通过本领域技术人 员体外检测，以评估它的生物学特征和性能特征.例如，生长于培养 基中的不同类型的细胞可用于评估它们的生物学特征和性能特征.焚 光染料和生物相容性荧光分子的摄取、标记、结合靶向或细胞定位可 用本领域已知的技术如光谦法、荧光显微镜法和流式细胞术评估.例 如，可以使本发明的荧光染料和生物相容性荧光分子与样品接触一段 时间，然后洗涤以除去任何游离的或未结合的分子.然后，可以用安 装有合适滤光器的荧光显微镜观察该样品，所述滤光器与本发明荧光 染料和生物相容性荧光分子的光学特性匹配.培养基中的细胞的荧光 显微镜法也是一种用于确定在一个或多个亚细胞区室中是否发生了摄 取和结合的便捷方法.也可以将组织、组织切片和其他类型的样品如 细胞离心涂片样品以类似的方式用于评估所述分子的生物学特征和性 能特征.还可以使用其他的荧光检测方法，包括但不限于流式细胞术、 免疫测定法、杂交检测法和微阵列分析.光学成像可以将荧光、光学图像获取和图像处理的一般原理应用于本发明实践.关于光学成像技术的综述，参见，例如Alfano等，Ann. NY Acad, Sci. 820:248-270， 1997,可用于实践本发明的成像系统通常包括三个基本组件U)用于荧 光染料和生物相容性荧光分子激发的合适光源；(2)用于分开或区分发 射和用于激发的光的装置；以及(3)检测发射出的光倌号的检测系统.一般而言，光学检测系统可认为包括光采集/图像形成組件和光学 检测/图像记录组件。尽管光学检测系统可以是一个整合了这两种组件 的单个集成装置，但将分开讨论光采集/图像形成组件和光学检测/困 像记录组件.特别有用的光采集/图像形成组件是内窥镜.内寇镜装置和已经用 于许多组织和器官的体内光学成像的技术可用于本发明实践，所述的组织和器官包括腹膜(Gahlen等，J. Photochem. Photobiol. B 52: 131-135， 1999)、卵巢癌(Major等，Gynecol. Oncol. 66: 122-132,1997) 、结场和直肠(Mycek等，Gastrointest Bndosc. 48:390-304, 1998;和Stepp等，Endoscopy 30: 379-386, 1998)、胆管(Izuishi等， Hepatogastroenterology 46: 804-807， 1999)、胃(Abe等，Endoscopy 32: 281-286, 2000)、膀胱(Kriegmair等，Urol. Int. 63:27-31, 1999; 和Riedl等，J. Endourol. 13: 755-759， 1999)、肺(Hirsch等，Clin Cancer Res 7: 5-220, 2001)、脑(Ward, J. Laser Appl 10: 224-228,1998) 、食道和头颈区. 可用于本发明的其他类型的光采集组件是基于导管的装置，包括纤维光学装置.这类装置尤其适用于血管内成像.参见，例如Tearney 等，Science 276:2037—2039, 1997;和Circulation 94: 3013, 1996.而且，其他成像技术，包括相控阵技术(Boas等，Proc. Natl. Acad. Sci.USA 91: 4887-4891，1994;Chance,Ann.NY Acad. Sci. 838: 29-45, 1998)、光学断层摄影术(Cheng等，Optics Express 3:118-123， 1998;和Siegel等，Optics Express 4: 287—298, 1999)、 活体内显微术(Dellian等，Br. J. Cancer 82: 1513-1518, 2000; Monsky等，Cancer Res. 59-4129-4135, 1999;和Fukumura等，Cell 94:715-725， 1998)、共聚焦成像术(Korlach等，Proc. Natl Acad. Sci. USA 96: 8461-8466, 1999; Rajadhyaksha等，J. Invest. Der边atol. 104: 946-952， 1995;和Gonzalez等，J. Med. 30: 337—356， 1999)和 荧光分子断层摄影术(FMT) (Nziachristos等，Nature Medicine 5: 757-760， 2002;美国专利No. 6， 615, 063, PCT Application No. W0 03/102558和PCT US/03/07579)可用于本发明实践，IVIS⑧成像系统 (Xenogen， Ala迈eda， CA) 、 Maestro(CRI, Woburn, MA) 、 SoftScan 和explore Optix (Advanced Research Technologies, Montreal, Canada)系统都可用于本发明实践.合适的光学检测/图像记录组件，例如电荷耦合器件(CCD)系统 或照相胶片可用于本发明 光学检测/图像记录的选择将取决于包括使 用的光采集/图像形成组件的类型在内的多种因素.选择适合的组件、 将它们组装成光学成像系统和操作该系统是在本领域一般技术人贝的 能力范围之内.诊断和疾病应用及方法本发明的方法可用于测定许多标记，包括追踪荧光染料和生物相 容性荧光分子随时间在受试者体内的定位或评估该分子随时间在受试 者体内的代谢和/或排泄的变化或改变.该方法也可用于通过使由这种 疗法调控的分子亊件和生物途径成像来跟踪用于该疾病的疗法，包括 但不限于测定效力、最佳时间选择、最佳剂量水平(包括用于个体患 者或试验受试者的最佳剂量水平)和联合疗法的协同效应.本发明还可用于帮助内科医师或外科医师鉴定和表征疾病如关节 炎、癌以及尤其是结肠息肉或易损斑块的区域以区分患病的和正常的 组织，例如如在脑手术中检测用普通手术显微镜很难检测到的肿瘤边 缘，帮助指导治疗性介入或手术介入，例如通过确定病变是癌性的且 应该切除还是非癌性的且可不予理睬，或者在将疾病手术分期中，例 如手术中淋巴结分期、前哨淋巴结定位，或评估术中出血.本发明的方法还可用于检测、表征和/或确定疾病尤其是早期疾病 的定位、疾病或疾病相关病症的严重性、疾病的分期，以及监测和引 导多种治疗性干预如手术操作，并且监测药物疗法，包括基于细胞的 疗法.本发明的方法还可用于疾病或疾病病状的预后.所迷疾病或疾 病病状的实例包括炎症(例如，由关节炎，如类风湿性关节炎引起的炎 症)、癌(例如，结炀直肠癌、卵巢癌、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、宫 颈癌、皮肤癌、脑癌、胃肠癌、口腔癌、食管癌、骨癌)、心血管疾病 (例如，动脉粥样硬化和血管的炎性疾病、局部缺血、中风、血栓形成)、 皮肤病(例如，卡波济肉瘤、牛皮癣)、眼科病(例如，黄斑变性、糖尿 病性视网膜病)、感染性疾病(例如，细菌、病毒、真菌和寄生虫感染， 包括获得性免疫缺陷综合征)、免疫性疾病(例如，自身免疫性疾病、淋巴瘤、多发性硬化症、类风湿性关节炎、糖尿病)、中枢神经系统疾 病(例如，神经变性疾病如帕金森病或阿耳茨海默病)、遣传性疾病、 代谢病、环境性疾病(例如铅、汞和放射性中毒、皮肤癌)，以及骨相 关疾病(例如，骨质疏松症、原发性和转移性骨肿瘤、骨关节炎).本 发明的方法因此可用于例如测定肿瘤细胞的存在和肿瘤细胞的位置、 炎症的存在和位置(包括例如动脉粥样硬化或关节炎中活化的巨噬细 胞的存在)、血管疾病的存在和位置，包括冠状动脉和外周动脉中有 急性梗塞风险的区域(即，易损的斑块)、颈动脉中膨胀性动脉瘤、 不稳定性斑块的区域和局部缺血区域.本发明的方法和化合物(组合 物)还可用于鉴定和评估凋亡、坏死、缺氣和血管发生.光学成像模式和测量技术包括但不限于荧光成像、内窥镜成像、 荧光内寇镜成像、光学相干的断层摄影术、透射比成像、时间分辨透 射比成像、共聚焦成像、非线性显微术、光声成像、声-光成像、光谱 法、反射光傳法、活体内成像、双光子成像、干涉测定法、相干干涉 测量法、扩散光断层摄影术和荧光分子断层摄影术，以及光散射、吸 收、偏振、发光、荧光寿命、量子产率和猝灭的测量.本发明的化合物(组合物)和方法可与其他的成像组合物和方法联合使用.例如，本发明方法可与其他传统成傳厲式如x射线成^^、计算机断层摄影术(CT)、正电子发射断层摄影术(PET)、单光子计算机 断层摄影术(SPECT)和核磁共振成像(MRI)联合使用.例如，本发明的 化合物(组合物)和方法可与CT和MR成像联合使用，以便例如通过 共记录体层摄影困像和由另一种成像棋式产生的困像的来同时获得解 剖学和生物学信息.特别地，与MRI或CT组合是优选的，因为这些成 像技术有高的空间分辨率.本发明的化合物(组合物)和方法也可与 X-射线、CT、 PET、 SPECT組合使用，并且本发明的MR造影剂或荧光 性硅纳米颗粒成〗象探针也可含有组分如碘、钆原子和放^"性同位素， 其可与光学成像组合用CT、 PET、 SPECT和MR成像模式检测.试剂盒在此描述的化合物(组合物)可以包装成试刑盒，该试剂盒可任 选包含关于在各个实例性应用中使用荧光染料或生物相容性荧光分子的说明书.非限制性实例包括这样一种试剂盒其包含例如粉末或冻 干形式的化合物(组合物)和使用说明书，该说明书包括用于体内和/ 或体外应用的重构、剂量信息和贮藏信息.试剂盒可任选包含化合物 (组合物)的容器，所述化合物(组合物)是以可立即使用或者需要 进一步与用于施用的溶液混合的液体形式.对于体内应用，试剂盒可 以包含适用于特殊应用的剂量和形式的化合物(组合物)，例如瓶装 液体剂、局部用乳剂等.试剂盒可以包含任选的有助于施用单位剂量给受试者的组件，例 如用于重构粉末形式的管形瓶、注射用注射器、定制的IV递送系统、 吸入器等.试剂盒可以在容器中提供，所述的容器具有适于用皮下针 进行一次或多次穿刺，同时维持无菌完整性的密封盖(例如有皱褶的 隔膜密封盖).这种容器可以容纳单个或多个受试者剂量.另外，单 位剂量试剂盒可包含有助于体内或体外检测化合物(组合物)的定制 组件，例如专用内窥镜、滤光器.试剂盒还可以包含关于制备和施用 化合物(组合物)的说明书.可以将试剂盒制成用于一位受试者的单 次使用单位剂量、用于特殊受试者的多次使用的单位刑量；或者试刑 盒可包含适合施用给多个受试者的多个剂量("成批包装").可以 将试剂盒的组件装在紙盒、泡眼包装物、瓶子、试管等中.除非另外定义，这里使用的所有技术和科学术语具有与本发明所 属领域中的普通技术人员通常理解的相同的含义.尽管与在此描迷的 那些相似或等价的方法和材料都可用于实践或试验本发明，但在下面描述了合适的方法和材料.在此提及的所有出版物、专利申请、专利 和其他参考文献都通过全文引入作为参考.此外，材料、方法和实例只是说明性的而无意于限制性。在本发明的一些实施方案中，本发明的化合物不是<formula>formula see original document page 73</formula>实施例下列非限制性实施例证实了 N, N-二取代磺酰胺荧光染料的合成. 可用于制备本发明化合物的代表性材料和方法在下文中进一步描述. 所有化学品和溶剂(试刑等级)都作为商业提供的使用，通常不需进 一步纯化.通常使用的分析型和制备型HPLC方法是A 柱Agilent Zorbax 80A， Extend C 18, 4. 6 x 250咖(5 jam).流动相 乙猜，25 mM醋酸三乙铵.B 柱Varian Dynamax, 100 A, C 18, 41. 4 x 250咖，流动相 乙猜，25 mM醋酸三乙铵.C 柱Phe謹enex Jupiter, 300 A， C18,流动相 乙腈，25 mM醋酸三乙铵.实施例1样品1的合成<formula>formula see original document page 74</formula>化合物AA部分.6-肼基-1-萘磺酸盐I的制备<formula>formula see original document page 74</formula>将6-氨 基-l-萘磺酸盐(10 g, 45 mmol) (TCI)、氢氧化钠(1. 8 g, 45 mmol) (Mallinckrodt)和亚硝酸钠(3. 7 g， 54 mmol) (Aldrich)合 并于50mL水中，并将其搅拌以获得澄清的褐色溶液.将该溶液冷却 至0 C并在15分钟内滴加入至在冰/盐浴中冷却至〈0 tl的50mL浓盐酸和30g冰中.将氯化亚锡(18.7g， 99mmo1, Aldrich)溶解于 50 mL的6M盐酸中，将其冷却至0 1C并在15分钟内伴随搅拌滴加入 至上述反应混合物中.将得到的混悬液在O IC下搅拌I小时.过滤出 黄色沉淀物并用蒸馏水、甲醇、异丙醇且最后用乙醚洗涂以收获9 g 期望的肼(84 X).B部分.2, 3, 3-三甲基苯并吲哚-7-磺酸盐II的制备将6-肼基-l-萘磺酸盐(5 g, 21 mmol)、异丙甲基嗣(8.1 g, 93 mmol， Aldrich)和醋酸钾(6 g， 61咖ol)合并于具有搅动棒的100 mL 高压容器中的70 mL水醋酸中.将该容器密封并加热至145 "C 22小 时.将浆液倾注入乙瞇中并借助于加热和超声处理将沉淀物溶解于乙 醇中，然后过滤.蒸发滤出液而获得标题化合物的黄色吸湿性固体.C部分.乙基-4-(甲基氨基)丁酸酯盐酸盐III的制备将4-(甲基氨基)丁酸盐酸盐(7.5 g, 49咖ol， Aldrich)溶解于 75 mL无水乙醇中，并加入乙醚中的4 mL 2. 0 M HC1 ( Aldrich) 将 一旦加热至70 C就会变澄清的该溶液回流20小时.在真空中除去溶 剂，得到定量产率的白色固体状盐酸盐.^NMR(300 MHz, CDCl,) 5 1.20(t, J-7.2 Hz, 3H), 2.13(m， 2H)， 2.47(t ， J一7.2 Hz, 2H)5 2.67(t, J=5.7Hz, 3H)， 3.00(宽峰m， 2H), 4. 07 (q， 2 Hz, 2H), 9. 50(宽峰s， 2H).D部分.2，3，3-三甲基苯并吲哚-6-[N-甲基-N-(乙基-4-丁酸根合)]磺酰胺IV的制备<formula>formula see original document page 76</formula>将2, 3, 3-三甲基苯并吲哚-6-橫酸钾盐(3 g, 9. 2咖ol)置于50迈L 无水乙腈中.緩慢加入五氯化磷(4 g, 19咖ol， Aldrich)，并将 该混合物回流l小时得到具有米色固体的红色溶液.将该红色溶液过 滤并通过在减压下蒸发来使溶剂减少至lOmL.将该溶液倾注入200 mL 乙醚中并通过过滤收集红色固体沉淀物.将该固体再溶解于乙猜中并 加入乙基-4-(甲基氨基)丁酸酴盐酸盐(2 g, ll咖ol),之后加入三乙 胺(1.1 g， 11咖ol).将该溶液过滤、蒸发至干燥，并通过急骤色 谦法在硅胶60上用含0. 5 X三乙胺的二氯甲烷洗脱纯化.E部分.2,3, 3-三甲基-l-(磺酸根合丙基)-苯并吲哚镇-6-[N-甲 基-N-(乙基-4-丁酸根合)]磺酰胺V的制备<formula>formula see original document page 76</formula>将2, 3， 3-三曱基-6-[N-甲基-N-(乙基-4-丁酸根合)]磺酰胺(250 mg， 0.6 mmol)和1, 3-丙碌酸内酯(140 mg， 1.15咖ol, Aldrich)溶 解于2 mL的邻二氯苯中。将该溶液在120 1C下于密封试管中加热16 小时.让该溶液冷却至室溫，然后加入40mL乙瞇.过滤出紫色固体， 将其用三份25mL的乙醚沖洗并在真空中干燥.得到260 mg暗紫色的 吸湿性粉末(80 , MALDI-TOF-MS m/e [M]+ C"H"!M)7Sr计算值 为539. 19,实测值539. 19.F部分.6-肼基-l， 3-萘二磺酸盐VI的制备<formula>formula see original document page 76</formula>将6-氛基-1, 3-萘二磺酸二钠盐(10 g, 29咖ol) (TCI)溶解于30 迈L水中并加入至50 mL水和15 mL的浓盐酸中.将浆液在冰/丙網浴 中冷却至<0 C并在IO分钟内将亚硝酸钠(2. 2g, 32咖o1, Aldrich) 滴加入40 mL冷水中.将氯化亚锡(11 g， 58咖ol) (Aldrich)溶 解于30 mL水和6迈L浓盐酸中，在10分钟内将其冷却至0 1C并加入 上述反应混合物中IO分钟.搅拌得到的溶液并在3小时内使其升温至 室温，得到澄清的褐色溶液.将该溶液通过旋转蒸发减少体积并通过 加入异丙醇沉淀出产物.将该产物过滤、用异丙醇洗涤并在真空中干 燥.G部分.2,3，3-三甲基苯并吲哚-5,7-二磺酸盐VII的制备将6-肼基-l,3-萘二磺酸盐(10 g， 25咖ol)、异丙甲基酮(12 g, 140咖o1， Aldrich)和醋酸钾(6 g, 61咖ol)合并于有搅动棒的100迈L 高压容器中的75 mL水醋酸中.将该容器密封并加热至1451C 22小时. 冷却该溶液并通过旋转蒸发去除醋酸.将残留物溶解于甲醇中并过滤. 然后用异丙醇从甲醇滤出液中沉淀出产物并将其过滤、用异丙醇和乙醚洗涤并在真空中干燥.H部分.2, 3, 3-三甲基-1-(3-磺酸根合丙基)苯并吲咪镇-5, 7-二磺酸盐VIII的制备将2，3，3-三甲基苯并吲哚-6,8-二磺酸盐(2.2g， 5 mmol)溶解于 50 mL无水DMF中，得到澄清的橙色溶液.加入1, 3-丙磺酸内酯(2. 8 g, 23 mmol, Aldrich)并将该溶液在密封管中加热至1451C 15小时，颜 色变成暗紫色。将溶液冷却并倾注入150 mL的2-丙醇中.将该混合物离心并倾析出上清液.将固体产物在过滤器上用三个50 mL部分的 2-丙醇，之后用50 mL的乙醚洗涤并在真空中干燥，得到2.5 g暗紫 色固体(90 0 MALDI-TOF-MS m/e [M] + C"H"NO,Sr计算值为492. 05， 实测值492. 05.I部分.化合物IX的制备将三磺化的苯并丐I哚银VIII ( 250 mg， 0.44 mmol)溶解于5 mL 水醋酸和2mL乙酸酑中，加入盐酸丙二醛酰苯胺(112mg， 0.43mmo1) (TCI)并将该溶液在密封管中加热至120 ^C2小时.冷却该溶液并 加入25mL乙酸乙酯使产物沉淀.将该混合物离心并倾析出乙酸乙醋， 并且用25mL乙酸乙酯洗涤固体物质.将该固体物质溶解于6mL冰醋 酸和2 mL的乙酸酐中 将磺酰胺苯并吲哚铕V ( 235 mg, 0. 44咖ol) 与300 mg醋酸钾一同加入并将溶液在密封管中加热至125 XH8小时. 冷却该溶液，并加入25 mL乙酸乙酯使产物沉淀.将该混合物离心并 倾析出乙酸乙酯，并且用25 mL乙酸乙酯，之后用25 mL乙腈洗涤固 体物质.通过HPLC纯化产物，得到67 mg純的乙酯染料U3 X) MALDI-TOF-MS m/e [M]+ (1"115具01635+计算值为1066. 23，得出 1066. 18.UH20) 673 nm,J部分.化合物X的制备将化合物IX ( 65 mg， 0. 048 mmol)溶解于5 mL 0. 4 M的NaOH 中并在20 1C下搅拌1小时，通过HPLC定量转化成游离酸.将该溶液 用lMHCl酸化至pH ~3,将其脱盐并冷冻千燥以产生期望的产物X.MALDI-TOF-MS迈/e[M]+ C"H52N3016S5、t算值为1038.20，实测值 1038. 21. u (H20) 673 n迈. K部分.样品1的制备将化合物X ( 21 mg， 0. 019咖ol)溶解于1. 5 mL无水DMF中. 将二琥珀酰亚胺基破酸癍(37 mg， 0.14咖ol) (Aldrich)与4-二甲 氨基吡啶(2. 5 mg, 0.02咖ol) (Aldrich) —同加入.将该溶液伴随扰 拌地加热至60-651C 1小时.将该活性癍用20 mL乙酸乙欲沉淀并通 过离心分离.将该深蓝色固体用4份20 mL的乙酸乙醋洗涤并在真空 中干燥以获得标题化合物(化合物A) . MALDI-TOF-MS m/e [M〗+ "8115晶01835+计算值为1135.21，实测值1135.19,入』20) - 673 nm.实施例2样品2的合成A部分.2， 3， 3-三甲基吲味5-磺酰氯(XI)的制备 cioa 一、 z将可商业获得的5-磺-2， 3， 3-三甲基吲咮(indolinine )K盐(5. 45 g， 19. 6咖ol)在氮气氛下加入至安装有空气冷凝器的圃底烧瓶中的五 氯化磷(PCls， 6.12 g， 29.42國l， 1. 5当量)和POCl3(3边L)混合物 中，并将其在120 X:下剧烈搅拌45分钟.将内含物冷却至室温，加 入二氯甲烷并用乙醚中的25 %己烷使磺酰氯沉淀，并且将其在氮气氛 下过滤.重复一次，并用己烷中的10%乙酸乙酯洗涤.将固体物质转 移至RBF中并将其在真空下干燥30分钟，将得到的粉末(XI)直接用 于进一步的反应(3.2 g， 53 %的产率).B部分.化合物XII的制备EtOOO将2.22g橫跣氯XI溶解于25mL乙猜中并冷却至0 tJ.将1. 35 g六氢异烟酸乙酯(8.6 mmol)溶解于5 mL的乙腈中，并在2分钟内 滴加入3迈L三乙胺.暗褐色溶液开始变成黄色并随后便成橙色.在0 C下搅拌30分钟后，将反应混合物升温至室温.通过TLC(硅胶，二 氯曱烷中的5 %乙腈)观察到反应的完成.通过旋转蒸发去除溶剂. 将浓缩的粗产物在硅胶上进行色谦法并用乙猜-二氯甲烷混合物(10 X 至50 %的梯度)纯化.得出1.2 g黄色千燥固体物质(XII)的产率 为43 % IR (酯为1728 cnf1).C部分.化合物XIII的制备将1. 2 g从上面获得的磺耽胺XII (MW 395. 2， 3. 06咖ol)在20 mL的1 ，2-二氯苯中与2 mL的1, 4-丁磺酸内酯(20咖ol)反应，并在 125 x:下加热过夜(16小时).用乙醚沉淀该粘稠溶液并用具有 乙酸乙酯的己烷洗涤得到300 mg期望的季铵盐XIII的暗褐色粉末(产 率为20 %).D部分.化合物XIV的制备将0. 1 g 2，3,3-三甲基-1-(3-橫酸根合丁基)-吲哚铕-5-磺酸盐 (0.25 mmol)在110 1C下与10 mL乙酸酐中的0.072 g N-[5-(苯氨 基)-2，4-亚戊二烯基]苯胺一盐酸盐(MW 284. 8, 0. 25咖ol)—同加热 l小时.将该内含物搅拌冷却至0匸.加入0. 133 g(O. 25咖ol)季铵 盐XIII，随后加入0. 082 g醋酸钠(l咖ol， 4当量).在0 "C下搅拌 IO分钟后，用15分钟将烧瓶升温至室温，然后用30分钟逐渐加热达 到65 1C.在65 1C下继续加热7小时.用HPLC监测反应进程，其显 示所有这三种期望染料产物的存在，并且期望的不对称染料相当大的 量(约55 %)存在.将该反应混合物与乙醚混合，其与醋酸钠一起 使染料沉淀.在沙芯漏斗(中等孔径)上过滤收集残余物，将其用乙 瞇仔细洗涂，干燥并溶解于水中，将其在制备型RPC 18 HPLC柱上纯 化.收集与上述三种染料对应的所有级分，将其在真空离心蒸发浓缩 器(speed vac)上蒸发溶剂并干燥.每种级分用MALDI鉴定. MALDI-TOF-MS m/e [M+l]+ C"H"N力"S/计算值为952.18,实测值 952.26，入』20)- 758 nm. 期望的不对称染料XIV以42 9i的产率 (0.1 g)获得.E部分.样品2的制备将0. 05 g化合物XIV (乙酯)溶解于20 mL玻璃管形ife中的1 mL 水中，并将其搅拌冷却至O t!.滴加入IOO uL 2M的氩氣化钠溶液并 在0 1C下继续搅拌1小时。HPLC显示乙酴完全水解成羧酸.将该水溶 液用5 M盐酸(100 uL)中和并随后将其在真空离心蒸发浓缩器上干燥.将得到的化合物未经进一步纯化就用于下一步骤激活，其在65TC 下用DMF中的二琥珀跣亚胺基碳酸醋和DMAP进行30分钟.入, (H20) =748 nm.实施例3样品3的合成A部分.化合物XV的制备将如上获得的3.0 g 2,3, 3-三甲基吲哚5-磺醜氯(9. 65咖ol)溶 解于25 mL无水乙腈中并将其冷却至0 tJ.在2分钟内滴加溶解于5 mL 的乙腈和3mL三乙胺中的1.86g (N-甲基)甘氨酸乙酶(12. ll咖ol). 暗褐色溶液开始变成黄色并随后变为橙色.在0 C下搅拌3小时后， 将反应混合物升温至室温.通过TLC (硅胶，二氯甲烷中19 9i的乙請 和1 %的三乙胺)显示反应的完成.通过旋转蒸发去除溶剂.将浓缩 的粗产物在硅胶上进行色谦分析并用乙猜-二氯甲烷混合物(10 X至 50%的梯度)洗脱.得到1.7g黄色物质，产率为50%. IR(酯为1732 cnf1).B部分.化合物XVI的制备将1. 7 g从上面获得的磺酰胺XV ( 5咖ol)在20 mL的1, 2-二氯 苯中与2 mL的1,4-丁磺酸内酯(20咖ol)反应，并在125 1C下加热 过夜(16小时).用乙醚沉淀该粘稠溶液并用己烷和丙辆的混合物洗 涤得到1.5 g期望的季铵盐暗褐色粉末(产率为63 94).C部分.化合物XVII的制备将0.22 g化合物XVI (0.55 mmol)在110 t;下与10 mL乙酸酐中 的0.157 g N-[5-(苯基氨基)-2，4-亚戊二烯基]苯胺一盐酸盐(0. 55 咖ol)—起加热一个半小时.将该内容物搅拌冷却至0 t:并加入0. 261 g(0.55咖ol)季铵盐1-(5-磺酸根合丁基)-2,3,3-三甲基假吲哚-5-磺酸钾，随后加入0. 1 g醋酸钠(1.22咖ol, 2.2当量).在0 1C下 挽拌20分钟后，用15分钟将烧瓶升温至室温，然后在45分钟内逐渐 加热至70 TC.在70 1C下继续加热4小时.通过HPLC跟踪反应进展， 其显示全部三种期望的染料产物，期望的不对称染料具有相当大的量 (约50 %).将反应混合物与乙醚混合，其与醋酸钠一起使染料沉淀. 在沙芯漏斗(中等孔径)上过滤收集剩余物，将其用乙醚充分洗涤， 并干燥有机溶剂.将粗染料溶解于水中，通过0.2uM过滤器过滤并随 后在制备RPC 18 HPLC柱上纯化，将其在真空离心蒸发浓缩器上蒸发 溶剂并干燥得到XVII(43%), MALDI-TOF-MS m/e [M+l] + C4。H53N3013S4+ 计算值为912.12，实测值912.22。D部分.化合物XVIII的制备将0.22 g化合物XVII溶解于圃底烧瓶中的10 mL水中，并将其 搅拌冷却至0匸.滴加入0.5 mL 2M的氢氣化钠溶液并在0 1C下继 续搅拌1小时.HPLC显示〉98 X的乙酯完成水解成羧酸.将该水溶液 用5 M盐酸(0. 25 mL)中和并随后将其在真空离心蒸发浓缩器上千燥. 将得到的化合物未经进一步纯化就用于下一步骤激活.通过质谱分析 确认同一性(产率0.19 g， 90 %).E部分.化合物XIX的制备将150迈g XVIII (0.160 mmol)在室温下与1 mL无水DMF中的206 mg DCC(l mmol)和138 mg N-羟基琥珀酰亚胺(1. 2 mmol)反应16小时. 离心二环己基脲沉淀物并收集DMF中的中间产物.MALDI-TOF-MS边/e [M]+ C"H5。N4NaA5Sr计算值为1025. 10，实测值1025. 27.然后将该中间产物加入至冷却至0 "C的6-氨基己酸的水溶液 (210 mg， 1.6 mmol,在2 mL水中)中，同时搅拌.級合进程通过 RP HPLC监测。将含水DMF溶液通过旋转蒸发浓缩并随后通过制备型 HPLC纯化而产生化合物XIX.通过质谦分析表征纯化的产物(产率110 mg, 69 %).F部分.样品3的制备通过在65 1c下加热具有DSC和DMAP的无水DMF中的染料溶液90 分钟来活化化合物XIX而产生标题化合物.509 HQ3《A部分.5-(S02-NMe-CH2CIM;H2C02Et)-2, 3, 3-三甲基-(3H)-'引咮 (XX)的制备在干燥的氮气流下，将1.2 g磺酰氯XI(4. 0 mmol)加入至干燥的 lOOmL圆底烧瓶中，随后加入25 mL无水乙腈，并将该溶液在冰浴中 冷却，将N-甲基丁酸乙酯的盐酸盐(1. 5 g， 8. 1咖ol)溶解于25 mL 无水乙腈中并加入1. 2 mL三乙胺(8. 9 mmol)而使其转化成相应的游离 碱.冷却该溶液， 一旦季铵盐沉淀，就将该溶液倾注入均压添加漏斗 中.在Q C下在30分钟期间伴随激烈搅拌滴加入胺. 一旦加入完成， 去除冰浴，并让该反应在室温下继续进行1小时。在减压下通过旋转 蒸发除去溶剂，并通过柱色谦法纯化.硅石柱用二氯甲统中的1%的 三乙胺和20 %的乙腈并逐渐变成30 %的乙腈制备.在蒸发洗脱剂后 获得660 mg磺酰胺XX (1. 7咖ol， 42 90的橙色油状产物.随后将 该磺酰胺在真空干燥器中干燥过夜，该真空干燥器连通氢氣化钟以确 保假吲哚保持其游离碱形式.MALDI-TOF m/z(强度)367. 0837 (100 %).B部分.l-( y -磺酸根合丙基)-5-(S0广雨e-CH2CH2CH2C02Bt) -2， 3, 3-三甲基-(3H) -^哚(XXI)的制备实施例4样品4的合成将橫酰胺XX ( 660 mg， 1. 8 mmol)溶解于5 mL的1, 2-二氯苯中， 并将其转移至100 mL的压力管中.在加入157 ul 1,3-丙磺酸内癍 (1.82咖ol)后，将反应容器用干燥的氮气吹洗、密封并置于130 1C 的油浴中.在8小时后停止加热.将油状紫色固体与5 mL丙鹏，之 后与75 mL乙醚进行超声处理直到该固体作为细粉沉淀.将该紫色固 体过滤并在减压下干燥以产生XXI. MALDI-T0F m/z(强度) 489. 1463(100 50 C部分.化合物XXII的制备KO3i向100 mL压力管中装填520 mg季铵化的假吲哚(l. 3mmol)和370 mg N-[5-(苯基氨基)-2，4-亚戊二烯基]苯胺一氩氣化物(1.3咖ol). 该试剂在搅拌加入3 mL乙酸和3迈L乙酸秆后溶解.将该压力管用千 燥的氮气冲洗、密封并在110 1C下加热3小时.在冷却至室温后，加 入50 mL乙醚使产物沉淀，产量为740 mg.D部分.乙酯(XXIII)的制备向100 mL 2-颈圃底烧瓶中装填3 mL乙酸和3 mL乙酸酐，之后 装填500 mg XXI (1.0 mmol).将温度维持在75 1C并将560 mg XXII(l. 0mmol)在2小时内以四等份加入.在第一次加入后，加入200 mg醋酸钠(2.4 ,ol). 6小时后，将染料在乙醚中沉淀、过滤并在减 压下干燥.用HPLC分离期望的产物.B部分.化合物XXIV的制备将XXIII (125 ymol)的水溶液的体积用水加至25mL并将其在 水浴中冷却.冷却后，激烈搅拌加入6. 2 mL IN氢氧化钠水溶液.除 去冰浴并且让反应在室温下继续进行1小时，之后在4 1C下存储过夜. 将该反应物在0 "C下用1N盐酸中和至pH7. 0.减少溶剂并将该反应 物在C18柱上脱盐。将相对纯的产物用制备型HPLC再次纯化.在除 去洗脱剂后，将产物XXIV溶解于无水乙腈中、在乙醚中沉淀、过滤并 在真空中干燥以收获179 mg蓝色固体物质.MALDI-T0F m/z(强度) 884. 2034 (100 %) F部分.样品4的制备将羧酸XXIV (10.7 mg, 12.2 n mol)溶解于1迈L无水二甲基甲 酰胺中，之后溶解4. 6mg二琥珀酰亚胺基碳酸酯(18 jjmol)和2.2mg 二甲氨基吡啶(18 iamol).将反应在60 t!下加热40分钟。在冷却至 室温后，在乙醚中沉淀活化酯并在0. 22 nm过滤器上回收，实施例5样品5的合成将1.4 mg马来酰亚胺N-乙胺三氣乙酸盐(7. 2 nmol)和3. 8 jiL 二异丙基乙胺(22 nmol)依次加至lmL无水二甲基甲酰胺中.将该溶 液直接加至含有1. Omg无水琥珀酸亚胺酯(1. 0 Mmol)的管形瓶中. 将该管形瓶密封并在室温下于黑暗中旋转过夜.HPLC方法A: 8.235 分钟(750nm).用制备型HPLC分离期望的化合物.MALDI-TOF m/z (强 度)1006. 3552 (55实施例6细胞标记将小鼠脾细胞制备成单细胞悬液，并且通过流过去除B细胞和巨 噬细胞的柱(R& D Kit,小鼠T细胞富集柱，MTCC500 )而富集脾细 胞制备物中的T细胞亚群.将T细胞离心以产生10'个细胞的细胞沉 淀颗粒，去除细胞沉淀颗粒中的上清液，并且加入100ul的10mg/边l 化合物A溶液.将细胞在室温下孵育5分钟，之后进行2轮离心和再 悬浮于生理緩冲液中以洗掉未结合的化合物A.通过荧光显微术评估 细胞.实施例7细胞标记和体内成像 将小鼠4T1乳腺腺癌细胞离心以产生107个细胞的细胞沉淀颗粒. 去除细胞沉淀颗粒中的上清液，并且加入IOO ul中的10 mg/迈l化合 物A溶液.将细胞在室温下孵育5分钟，之后进行2轮离心和再悬浮于生理緩冲液中以洗掉未结合的化合物A.通过荧光显微术评估细胞. 将该细胞以每只小鼠5 x 105个细胞静脉内注入小鼠中，并且在注射 后立即以及在注射后24小时通过荧光分子断层摄影术使活小鼠成像. 由于4T1细胞主要转移至肺，所以定量肺部荧光.实施例8将化合物A的溶液在碱性条件下化学连接至含Arg-Gly-Asp的肽 上，以产生生物相容性荧光分子用于体内光学成像.从ATCC( Manassas, VA)获得肿瘤细胞系HT-29 (人结肠癌/HTB-38) 在含5 X 002的潮 湿气氛中，让HT-29细胞于37 1C下在补充有10 4 FBS的McCoy's中 生长.将成指数生长的细胞进行胰蛋白酶处理并以3xl(^细胞/ml的浓 度再悬浮于汉克(Hank)平衡盐液中.将3 x 10s HT-29细胞从两側 皮下注入进6-8周大的雌性NU/NU小鼠(Charles River Laboratory, Wilmington, MA)的第一乳腺脂肪垫中. 一周后，当肿瘤约30咖3时， 将荧光分子(在150 p 1的1 xPBS中)静脉内注入小鼠并在24小时 后在荧光反射系统(FRI, Kodak 2000MM)和VisEn， s荧光断层摄影 系统(FMT)上成像。实施例9将化合物A的溶液在碱性条件下化学连接至含双膊酸盐的生物分 子上，以产生用于体内光学成像的生物相容性荧光分子.将5天大的 BALB/c x CF-1 FJ、鼠皮下注入该荧光分子(在15 p 1 1 x PBS中) 并在24小时后用焚光反射成像(FRI)系统(Kodak 2000MM)成像. 可以清晰地看见骨生长的区域.实施例10将10 mg本发明化合物X的NHS酯溶解于100 uL的无水DMF中， 向其中加入20 uL无水DMS0中的3-叠氮基丙胺(5 mg)溶液，并将该 混合物在室温下旋转1小时.加入1 mL乙醚该反应混合物中，并将其离心IO分钟.弃去上清液，并将残留物在真空离心蒸发浓缩器上干燥 5分钟，将其再溶解于水中并在RPC18半制备型柱上纯化.收集对应 产物的级分，并将其在真空离心蒸发浓缩器上干燥.实施例11将10 mg本发明化合物X的NHS酯溶解于100 uL的无水DMF中， 向其中加入10 uL无水DMS0中的3-炔丙胺(5 mg)溶液，并将该混合 物在室温下旋转l小时.加入lmL乙醚至该反应混合物中，并将其离 心IO分钟.弃去上清液，并将残留物在真空离心蒸发浓缩器上干燥5 分钟，将其再溶解于水中并在RPC18半制备型柱上纯化.收集对应产 物的级分，并将其在真空离心蒸发浓缩器上干燥.实施例12将17 mg本发明化合物X的NHS酯溶解于250 uL的无水DMF中， 向其中加入10 uL无水DMS0和4 uL三乙胺中的2- (2-氨乙基-二硫基) 吡啶盐酸盐(llmg)溶液，并将该混合物在室温下旋转过夜.加入lmL 乙酸乙酯至该反应混合物中，并将其离心IO分钟.弃去上清液，并将 残留物在真空离心蒸发浓缩器上干燥5分钟，将其再溶解于水中并在 RPC18半制备型柱上纯化.收集产品的级分，并将其在真空离心蒸发 浓缩器上干燥.虽然参考其优选的实施方案而特别地显示和描迷了本发明，但本 领域技术人员应理解，其中可以在形式和细节上做多种改变而不会脱 离附带的权利要求书所包括的本发明范围.
权利要求
1.由下列结构式表示的化合物id="icf0001" file="S2006800403608C00011.gif" wi="146" he="24" top= "56" left = "38" img-content="drawing" img-format="tif" orientation="portrait" inline="no"/>或其盐，其中X1和X2独立地选自C(CH2K1)(CH2K2)、O、S和Se；K1和K2独立地选自H、C1-C20脂族基团和被-OR*、N(R*)2或-SR*取代的C1-C20脂族基团；或者K1和K2一起是取代的或未经取代的碳环或杂环的一部分；Y1和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；n1是1、2或3；R2、R11和R12独立地是H、卤素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、磺酸根、含SO2NR6-Q-CHR7-(CH2)m的基团；i是0或1；并且m ＝0-12；亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的R12和R11取代基或R2和R11取代基组合在一起时形成4-、5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香碳环，其中碳环各自独立地任选被C1-C6烷基、卤素或者OR*或SR*取代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，R1和R13是-H、(CH2)xCH3；或者当n是选自2至6的整数时，R1和R13独立地是(CH2)nSO3-或(CH2)nSO3H；R3、R4和R5独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；R6选自取代或未经取代的C1-C20脂族基团；取代或未经取代的芳基；取代或未经取代的烷基芳基，其中R6当Q不存在时任选被卤素、OR*、N(R*)2或SR*取代；为羰基；取代或未经取代的C1-C6烷基，其中烷基的0-2个亚甲基被NH、O或S替代；或者取代或未经取代的C1-C6碳环、非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子；或者当Q是羰基时，R6是H；并且R7选自H、取代或未经取代的C1-C20脂族基团、取代或未经取代的芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卤素、OR*、N(R*)2或SR*取代；或者R6和R7一起形成任选被卤素、OR*、N(R*)2或-SR*取代的4-、5-、6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、Q和CHR7一起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-OR*、N(R*)2或-SR*取代；并且W不存在或者是选自-SO2NR6-Q-CHR7-、-O-、-COO-和-CONH-的基团；h＝0-70；k＝0或1；d＝0-12；m＝0-12；p＝0-12；Z是N、O或S亲核性官能度或者含有N、O或S亲核性官能度，或者是能够与N、O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、O或S亲核体反应的官能度；并且每个R*独立地是-H或C1-20烷基，条件是所述化合物不是id="icf0002" file="S2006800403608C00031.gif" wi="160" he="134" top= "27" left = "35" img-content="drawing" img-format="tif" orientation="portrait" inline="no"/>
2.<image>image see original document page 3</image>其中Rs选自H、离素原子、S-芳基、S-烷基、烷基、芳基、烷氧 基、芳氧基和含S02NR6-Q-CHR7- (CH2) 的基团；i是0或1;并且m-0-12。
3. 权利要求1的化合物，其中Z是选自-NH2、 -OH和-SH的亲核体 的官能度。
4. 权利要求1的化合物，其中Z是能够与N、 0、 S亲核体反应的 官能度，所述亲核体选自-COCl、 -(CO)O(CO)R、 -C0NHNH2、取代和未 经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、硝基-或氟-苯酚酯、-NCS、 -CHO、 -COCIU、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团
5. 权利要求4的化合物，其中所述的亲核体选自-C0C1、 -(C0)0(C0)R、 -C0NHNH2、取代和未经取代的N-幾基琥珀酸亚胺酯、 -NCS、 -CHO、 -C0CIU、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团.
6. 权利要求l的化合物，其中基团R!、 R;、 FU、 R:或Rn的至少两 个含有磺酸或磺酸根基团.
7. 权利要求1的化合物，其中R3、 l和R，各自独立地是式 -SO,NR「Q-CHR7- [ (CH2),+ (CH2) 「 (0) k]h- (CH2) dZ的基团.
8. 权利要求1的化合物，其中R3 、 R4和R5之 一 是 -S02NRs-Q-CHR「 [ (CH2) B-W- (CH2) 「 (0) J h- (CH》dZ.
9. 权利要求1的化合物，其中X,和X2都是-C(CH》2.
10. 权利要求l的化合物，其中-((C(Rn)-C(Ru))m-C(R2)-由选自 下列的结构式表示<formula>formula see original document page 5</formula>其中Rs选自H或者C1、 Br或F.
11. 权利要求l的化合物，该化合物具有式3-5的任意之一<formula>formula see original document page 5</formula> (3)<formula>formula see original document page 5</formula> (4)<formula>formula see original document page 5</formula> (5)其中l和Ru独立地选自(CH2)XCH3、 (CH2)nSOXCH2)nS03H;其中x是选 自0至6的整数并且n是选自2至6的整数；&选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺酰胺、羟基、烷 氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.
12.由下列结构式表示的化合物或其盐，其中Xi和Xi独立地选自C(CHA) (CHA)、 0、 S和Se;Ki和K2独立地选自H、 C广C2。脂族基团和被-0R、 N(R')2或-Si^取代 的d-"脂族基团；或者L和K2—起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；L和L各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；n:是1、 2或3;R2、 Ru和Ru独立地是H、 F、 Br、 Cl、 C广C6烷基、C!-"烷氧基、 芳氧基、含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子， 或者任意两个相邻的Ru和Ru取代基或112和Ru取代基组合在一起时形 成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳 环或取代或未经取代的芳香碳环，其中所述碳环各自独立地任选被 d-Cs烷基、囟素或者011*或SI^取代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，Ri和Ri3是(C!UxCH3;或者当n是选 自2至6的整数时，R!和Rn独立地是(CH丄SOr或(CH丄SOJI;R3、 ^和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；R6选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中R6当在Q不存在时任选被卣素、OR* 、 N(R')2或SR-取代；为羰基；取代或未经取代的C「C6烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的d-C6碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，Rs是H;并且R，选自H、取代或未经取代的d-Cw脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的坑基芳基，其中R7任选被囟素、0R*、 N(R')2 或SIU取代；或者R6和R，一起形成任选被卤素、0R*、 N(R')2或-SI^取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-0R，、 N(R')2或-SI^取代；并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -O-、 -COO-和-CONH-的基团；h - 0-70; k = 0或1; d+12; m-0-12; p+12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S亲核体反应的官能度；并且每个R+独立地是-H或d-2。烷基.
13. 权利要求12的化合物，其中Z是选自-NH2、 -OH和-SH的亲核 体的官能度.
14. 权利要求12的化合物，其中Z是能够与N、 0、 S亲核体反应 的官能度，所述亲核体选自-COCl、 - (C0)0(C0)R、 -C0NHNH2、取代和 未经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、硝基-或氟-苯酚酯、-NCS、 -CHO、 -C0CH2I、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团.
15. 权利要求14的化合物，其中所述的亲核体选自-COCl、 -(C0)0(C0)R、 -C0NHNH2、取代和未经取代的N-羟基琥珀酰亚胺酯、 -NCS、 -CHO、 -C0CH2I、亚磷酰胺和马来酰亚胺基团。
16. 权利要求12的化合物，其中基团&、 R3、 IU、 1或1(13的至少 两个含有磺酸或磺酸根基团。
17. 权利要求12的化合物，其中R3、 R^和Rs各自独立地是式 -S02NR6-Q-CHR7- [ (CH2) -W- (CH2) p- (0) k] h- (CH2) dZ的基团.
18. 权利要求12的化合物，其中l、 R4和R5之一是 -S02NRs-Q-CHR7- [ (CH2) ,-W- (CH2) p- (0) k〗h- (CH,) J.
19. 权利要求12的化合物，其中X,和X2都是-C(CH,),.
20. 权利要求12的化合物，其中基团-((C(Rn)"C0U)-广C(R2)" 由选自下列的结构式表示\久,,0^、 、^^V sf^fV其中R,选自H或者C1、 Br或F.
21. 权利要求12的化合物，该化合物具有式3-5的任意之一(5)其中R!和Ru独立地选自(CH2)XCH3、 (CH丄S03-和(CH上S03H;其中x是选 自0至6的整数并且n是选自2至6的整数；R3选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺酰胺、羟基、烷 氧基、磺酸部分和磺酸盐部分.
22.由下列结构式表示的化合物Al \ ni &3 Rg(3)或其盐，其中l和X2独立地选自C(CH&) (CH2K2)、 0、 S和Se;K,和L独立地选自H、 C广C2。脂族基团和被-0R、 Na'),或-SR,取代 的d-Cw脂族基团；或者L和K2—起是取代的或未经取代的破环或杂 环的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；n!是l、 2或3;R2、 Rn和Ru独立地是H、离素、C广G烷基、d-Cs烷氧基、芳氣基、 含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子、含 S02NR6-Q-CHR广(CH丄的基团；i是0或1;并且m = 0-12;或者任意 两个相邻的Ru和Ru取代基或^和Rn取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者 取代或未经取代的芳香碳环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、 卤素或者OIU或SI^取代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，R!和R13A(CH2)XCH3;或者当n是选 自2至6的整数时，R!和Rn独立地是(ClU nS03—或(CH2)nS03H;R3、 R4和R5独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、幾基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；R6选自取代或未经取代的Cr-Cw脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中H当Q不存在时任选被S素、0R*、 N(R')2或SIU取代；为羰基；取代或未经取代的CrC6烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的C「C6碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子；或者当Q是羰基时，Rs是H;并且R,选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卤素、0R*、 N(R')2 或SI^取代；或者R6和R7—起形成任选被fi素、0R*、 N(R'),或-SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR" Q和CHR，一起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所迷的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SR，取代；并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -COO-和-CONH-的基团；h - 0-70; k - 0或1; d-0-12; m-0-12; p薩0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲 核体反应的官能度；并且每个IU独立地是-H或Cw。坑基.
23.权利要求22的化合物，其中基团-((C(Ru)-C0Uh「C(R2)" 由选自下列的结构式表示<formula>formula see original document page 10</formula>其中Rs选自H、 g素原子、含S02NR6-Q-CHR7-(CH2)-的基团;i是O 或1;并且m-Q-12。
24.由下列结构式表示的化合物<formula>formula see original document page 10</formula>或其盐，其中X,和X2独立地选自C(CIU》(CH2K2)、 0、 S和Se;Id和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R\ N(R')2或-SR'取代 的d-C2。脂族基团；或者Id和L一起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；Yi和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；m是1、 2或3;R2、 Rn和Ru独立地是含S0!NR「Q-C肌7-(CH丄的基团;i是0或1; 并且m-0-12、烷基、芳基、烷氣基、离素、S-芳基或S-烷基， !^和Ru是H;R;、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸癍、胺、酰胺、橫 酰胺、羟基、坑氧基、磺酸部分和橫酸盐部分；R6选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中R(当Q不存在时任选被离素、0R*、 N(R')2或SR-取代；为羰基；取代或未经取代的C广C6烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的d-Cs破环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，IU是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-C"脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的垸基芳基，其中R7任选被卤素、0R*、 N(R')2 或SIU取代；或者R6和R7—起形成任选被卤素、0R*、 N(R')2或-SI^取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、N(R')2或-SI^取代；并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -C00-和-CONH-的基团；h = 0-70; k = 0或1; d=0-12; m+12; p-0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或者是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲核体反应的官能度；并且每个！^独立地是-H或Ch。坑基。
25. 权利要求15的化合物，其中R2、 Ru和Ru独立地是S-芳基或 S-烷基。
26. 含有一种或多种生物分子的生物相容性荧光分子，所述的生 物分子化学连接至由下列结构式表示的化合物<formula>formula see original document page 12</formula>或其盐，其中l和X2独立地选自C(CHD (CHJ》、0、 S和S。;L和L独立地选自H、 C广Cw脂族基团和被-0R、 N(R')2或-SR,取代 的d-"脂族基团；或者L和2—起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；n,是1、 2或3;R2、 Rn和Ru独立地是H、离素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、 磺酸根、含S02M6-Q-CHR广(CH2)边的基团;i是0或1;并且m"0-12; 亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或任意两个相邻的Ru和Rh取代 基或R2和Rn取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取代 的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香碳 环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、卣素或者011*或SI^取代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，Ri和Rn是-H、 (CH2)XCH3;或者当n 是选自2至6的整数时，！U和Ru独立地是(CH丄S03—或(CH丄S03H.R3、 R4和R5独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、幾基、烷氧基、磺酸部分和磧酸盐部分；IU选自取代或未经取代的d-C2。脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中Re当Q不存在时任选被卣素、0R*、 N0O2或SIU取代；为羰基；取代或未经取代的d-Ce烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的d-Cs碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子；或者当Q是羰基时，l是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-Cw脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的垸基芳基，其中R7任选被面素、0R*、 或SIU取代；或者R6和R7—起形成任选被卣素、0R*、 N(R')2或-SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所迷的环含有l或2个杂原子，其中环任逸被-OR*、 N0O2或-SI^取代；并且W不存在或者是选自-S02NRHhCHR广、-0-、 -COO-和-CONH-的基团；h = 0-70; k = 0或1; d-0-12; m-0-12; p-0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S亲 核体反应的官能度；并且每个！^独立地是-H或Cw。烷基，
27.含有生物分子的生物相容性荧光分子，所述的生物分子化学 连接至由下列结构式表示的化合物或其盐，其中X!和X2独立地选自C(CH2K》(CH2K2)、 0、 S和Se;K!和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和经-0R、 N(R')2或-SI^取代 的d-C2。脂族基团；或者L和K2—起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；Yi和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；ih是1、 2或3;R2、 Rn和Ru独立地是H、卣素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、 磺酸根、含S02NR6-Q-CHR广(CH丄的基团；i是0或1;并且m-0-12;,SQ2NRrOCHR7 -KCHaWWKCH^CWJHzJdZ亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的Ru和Rn取 代基或112和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取 代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香 碳环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、离素或者0R，或SI^取 代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，H和R"是-H、 (CH2)XCH3;或者当n 是选自2至6的整数时，R,和Rn独立地是(CH》,SOr或(CH丄S()3H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氣基、磺酸部分和磺酸盐部分；Rs选自取代或未经取代的C广C2。脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中IU当Q不存在时任选被卣素、0R*、 N(R')2或Sh取代；为羰基；取代或未经取代的d-Cs烷基，其中烷基 的0-2个亚曱基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的d-Cs碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，l是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-Cw脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卣素、0R*、 N(R')2 或SR,取代；或者R6和R7—起形成任选被面素、0R*、 N(R')2或-SIU取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SI^取代;并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR7-、 -0-、 -COO-和-C0NH-的基团；h = 0-70; k = 0或1; d=0-12; m=0-12; p=0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲 核体反应的官能度；并且每个^独立地是-H或Cw。烷基；其中该化合物具有约400 n迈至约900 nm的吸收最大值和发射最 大值.
28. 权利要求27的生物相容性荧光分子，其中所迷的化合物具有 约600 nm至约800 nm的吸收最大值和发射最大值.
29. 含有生物分子的生物相容性荧光分子，所述的生物分子化学 连接至由下列结构式表示的化合物》 、X！和X2独立地选自C (歸)(CH2K2) 、 0、 S和Se;L和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R')2或-SI^取代 的d-C2。脂族基团；或者K!和L一起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；Yi和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；^是1、 2或3;R2、 Rn和Ru独立地是H、卣素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、 磺酸根、含S02NR6-Q-CHR广(CH丄的基团；i是0或l;并且ffl"0-12; 亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的Ru和Ru取 代基或R2和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取 代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香 碳环，其中碳环各自独立地任选被d-C6烷基、囟素或者0I^或SR，取 代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，Ri和Ru是-H、 (CH2)XCH3;或者当n 是选自2至6的整数时，R,和I^独立地是(CH丄S03—或(CH2hS03H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；或其盐，其中Rs选自取代或未经取代的d-Cw脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中IU当Q不存在时任选被由素、0R*、 N(R')2或SR，取代；为羰基；取代或未经取代的d-C^就基，其中坑基 的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的CH^碳环、 非芳香破环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，l是H;并且IU选自H、取代或未经取代的d-Cw脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被面素、0R*、 N(R')2 或S1U取代；或者FU和R7—起形成任选被面素、0R*、 N(R')2或-SR，取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SI^取代;并且W不存在或者是选自-S02NR6-Q-CHR广、-0-、 -COO-和-CONH-的基团；h = 0-70; k = 0或1; d+12; m+12; p+12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 0或S亲 核体反应的官能度；并且每个IU独立地是-H或d—2。烷基，其中所述化合物在与靶标相互作用后被激活.
30.含有生物分子的生物相容性荧光分子，所述的生物分子化学 连接至由下列结构式表示的化合物或其盐，其中X,和X2独立地选自C(CH丄)(CH2K2)、 0、 S和Se;L和L独立地选自H、 C广C2。脂族基团和经-0R，、 NOO,或-SR，取代 的C广C2。脂族基团；或者L和L一起是取代的或未经取代的破环或杂 环的一部分；l和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；m是l、 2或3;R2、 Rn和R"独立地是H、卤素、烷基、垸氧基、芳氣基、芳基、 磺酸根、含S02NRHhCHR7-(CH2),的基团；i是0或l;并且m-0-12; 亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的Ru和Rn取 代基或l和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取 代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香 碳环，其中碳环各自独立地任选被d-Cs烷基、囟素或者OR，或SR，取 代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，^和R"是-H、 (CH2)XCH3;或者当n 是选自2至6的整数时，R!和Rn独立地是(CH丄S(V或(CH丄S03H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、酰胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；Rs选自取代或未经取代的d-"脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中W当Q不存在时任选被卤素、0R*、 N(R')2或SR,取代；为羰基；取代或未经取代的d-C6烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的C广Cs碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有1-2个杂原子；或者当Q是羰基时，L是H;并且117选自H、取代或未经取代的C广C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卤素、0R*、 N(R')2 或SIU取代；或者R6和R7—起形成任选被卣素、0R*、 N(R')2或-SI^取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者M6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有l或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-S1^取代；并且W不存在或者是选自-S02NRHhCHR7-、 -0-、 -COO-和-CONH-的基团；h - 0-70; k 0或1; d-0-12; m-0-12; p-0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲 核体反应的官能度；并且每个R'独立地是-H或Cw。烷基；其中所述化合物对靶标具有高亲和力.
31. —种体内光学成像方法，该方法包括(a)施用给受试者一种或多种由下列结构式表示的化合物 V ,、 一S02NIVCKJHRH(CH2)nrW"(CH2V(。))dh(CHii)^或其盐，其中X!和X2独立地选自C(CHD (CH2K2)、 0、 S和Se;K!和K2独立地选自H、 d-C2。脂族基团和被-0R、 N(R')2或-S1^取代 的d-C2。脂族基团；或者K!和K2—起是取代的或未经取代的碳环或杂 环的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合的环；m是1、 2或3;R2、 Ru和Ru独立地是H、囟素、烷基、烷氧基、芳氧基、芳基、 磺酸根、含S02NR6-Q-CHR7-(CH2!L的基团；i是0或1;并且m-0-12; 亚氨基季铵离子、S-芳基、S-烷基，或者任意两个相邻的Ru和Ru取 代基或l和Ru取代基组合在一起时形成4-、 5-或6-元取代或未经取 代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳环或者取代或未经取代的芳香碳环，其中碳环各自独立地任选被d-Cs就基、卣素或者0^或SR,取 代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，R!和Ru是-H、 (CH2)XCH3;或者在n 是选自2至6的整数时,R!和Ru独立地是(CH》nS0「或(CH2)nS03H;R3、 l和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸醋、胺、跣胺、橫 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；l选自取代或未经取代的C广C2。脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中l当Q不存在时任选被卣素、0R*、 N(R')2或SI^取代；为羰基；取代或未经取代的C广。烷基，其中烷基 的0-2个亚甲基被NH、0或S替代；或者取代或未经取代的C广C《碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，l是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-Ca。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卣素、0R*、 N(R')2 或SR"""取代；或者R6和R7—起形成任选被卤素、0R*、 N(R')2或-SR^取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者NR6、 Q和C肌7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SR-取代;并且W不存在或者是选自-S02M6-Q-CHR广、-0-、 -COO-和-CONH-的基团；h = 0-70; k = 0或1; d+12; m+12; p-0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 0或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲核体反应的官能度；并且每个IU独立地是-H或C!-2。烷基；(b) 让所述化合物分布于受试者体内或者与生物靶标接触或相互作用一定时间；(c) 用该化合物可吸收的波长的光照射受试者；以及(d)检测由该化合物发出的光信号.
32. 权利要求31的方法，其中将所迷化合物发出的倌号用于构建 图像.
33. 权利要求31的方法，其中以预定的时间间隔重复步骤(a) - (d) 从而使得能评估受试者中生物相容性荧光分子随时间发出的倌号.
34. 权利要求31的方法，其中所述受试者是动物或人.
35. 权利要求31的方法，其中在步骤(a)中，将两种或更多种其 信号特性可区别的化合物施用给受试者.
36. 权利要求31的方法，其中使用内窥镜、导管、断层成像系统、 手持式光学成像系统、手术护目镜或术中显微镜进行照射和检测步骤.
37. 权利要求31的方法，其中由所述荧光分子发出的信号的存在、 不存在或水平指示出疾病状态.
38. 权利要求37的方法，其中所述方法用于检测和监测疾病.
39. 权利要求38的方法，其中所述的疾病选自癌、心血管疾病、 神经变性疾病、免疫学疾病、自身免疫性疾病、呼吸疾病、代谢病、 遗传性疾病、感染性疾病、骨病和环境性疾病，
40. 权利要求39的方法，其中在步骤(a)之前，将所述化合物与 细胞混合来标记细胞并且在步骤(a)中将得到的标记细胞施用给受试者.
41. 权利要求40的方法，其中将化合物发出的信号用于监测细胞的运输和定位或评估细胞疗法.
42. 含有生物分子的生物相容性荧光分子，所述的生物分子化学 连接至由下列结构式表示的化合物<formula>formula see original document page 20</formula>或其盐，其中X!和X2独立地选自C(CIUi) (CH2K2)、 0、 S和Se;L和L独立地选自H、 C广C2。脂族基团和被-0R、 N(R'),或-SR,取代 的C「C:。脂族基团；或者L和K2—起是取代或未经取代的碳环或杂环 的一部分；L和Y2各自独立地是苯并稠合的环、萘并稠合的环或吡啶并稠合 的环；ih是l、 2或3;R,、 Ru和R"独立地是H、 F、 Br、 Cl、 C广G烷基、d-Cs烷氣基、 芳氧基、含氮的杂环、含氮的芳香杂环、磺酸根、亚氨基季铵离子， 或者任意两个相邻的Rn和Ru取代基或R2和Ru取代基组合在一起时形 成4-、 5-或6-元取代或未经取代的碳环、取代或未经取代的非芳香碳 环或取代或未经取代的芳香碳环，其中所述碳环各自独立地任选被 d-C6烷基、卣素或者0b或Sb取代一次或多次；当x是选自0至6的整数时，！^和IU是(CH2)xCH3;或者当n是选 自2至6的整数时，Id和Ru独立地是(CH丄SOr或(CH2)nS03H;R3、 R4和Rs独立地选自H、羧酸盐、羧酸、羧酸酯、胺、跣胺、磺 酰胺、羟基、烷氧基、磺酸部分和磺酸盐部分；l选自取代或未经取代的d-Cw脂族基团；取代或未经取代的芳基； 取代或未经取代的烷基芳基，其中IU当Q不存在时任选被面素、0R*、 N0O2或SI^取代；为羰基；取代或未经取代的d-C6烷基，其中烷基 的0-2个亚曱基被NH、 0或S替代；或者取代或未经取代的C广C6碳环、 非芳香碳环、杂环或非芳香杂环，其中杂环含有l-2个杂原子；或者当Q是羰基时，Rs是H;并且R7选自H、取代或未经取代的d-C2。脂族基团、取代或未经取代的 芳基、取代或未经取代的烷基芳基，其中R7任选被卤素、0R*、 N(R')2 或SIU取代；或者R6和R7—起形成任选被卣素、0R*、 N(R')2或-SIU取代的4-、 5-、 6-或7元杂环或非芳香杂环；或者M6、 Q和CHR7—起形成取代或未经取代的或者杂环或非芳香杂环 的环体系，其中所述的环含有1或2个杂原子，其中环任选被-OR*、 N(R')2或-SIU取代；并且W不存在或者是选自-S02M6-Q-CHR7-、 -0-、 -COO-和-CONH-的基团；h0-70; k - 0或1; d-0-12; m+12; p-0-12;Z是N、 0或S亲核性官能度或者含有N、 0或S亲核性官能度，或 者是能够与N、 O或S亲核体反应的官能度或含有能够与N、 O或S亲核体反应的官能度；并且每个h独立地是-H或Cw。烷基； 其中所述生物分子是被标记的细胞.
全文摘要
本发明涉及新的荧光化学实体，尤其是包含生物相容性的N，N-二取代磺酰胺荧光染料的荧光分子。本发明还涉及该分子相应的活性形式。本发明也涉及具有部分例如肽、蛋白质、不同生物分子、碳环和杂环化合物、糖的相应缀合物，以及它们的用途。
文档编号G01N33/533GK101296927SQ200680040360
公开日2008年10月29日 申请日期2006年9月1日 优先权日2005年9月2日
发明者J·D·彼得森, K·格罗夫斯, M·拉约帕德耶, N·纳拉亚南 申请人:Visen医药公司