一种尾巨桉流式检测的方法

文档序号:10722188阅读:300来源:国知局
一种尾巨桉流式检测的方法
【专利摘要】本发明属于植物倍性检测领域,公开了一种尾巨桉流式检测的方法。该方法包括以下步骤:(1)取尾巨桉DH32?29的嫩叶加入裂解液中,用刀片切嫩叶,裂解,得细胞裂解悬浮液;(2)将步骤(1)中所得的细胞裂解悬浮液过滤,将过滤后的液体离心,倒掉上清液,再次加入裂解液,使沉淀中的细胞核重新悬浮,然后再过滤,得滤液;(3)向步骤(2)中所得的滤液中加入RNase酶溶液进行酶解,得酶解液;(4)向步骤(3)中所得的酶解液中加入PI染液进行染色,得染色液;(5)将步骤(4)中所得的染色液在流式细胞仪上进行检测。该方法可实现野外取材后即时制备样品,获得的细胞核染色液2天(48小时)后做流式检测分析条件下,可确保检测效果的稳定性,解除了流式检测要采后即时进行检测的局限。
【专利说明】
一种尾巨桉流式检测的方法
技术领域
[0001] 本发明属于植物倍性检测领域,特别涉及一种尾巨桉流式检测的方法。
【背景技术】
[0002] 流式细胞术(Flow cytometry,FCM)是在二十世纪50年代诞生的一项新技术,但直 到二十世纪80年代末期这项技术才在植物科学领域得到广泛应用,其主要应用于细胞核 DNA含量测定,DNA倍性鉴定以及细胞周期分析等研究。该技术在植物中能否成功运用的关 键点在于能否制备出植物材料的单细胞(或单细胞核)悬浮液,科研人员针对这一难题一直 在不断改进细胞检测前处理技术,例如Hell er(1973)利用水解酶消化植物的细胞壁来释放 细胞核,但是这种方式很耗时,后人很少继续延用这种方法;在此之后,Ulrich( 1986、1988) 和Bergounioux等(1988,1992)改进了方法,利用完整原生质体的低渗裂解作用来释放细胞 核,这一改进也很耗时,而且,从一些物种或某种组织类型获得完整的原生质体的难度也限 制了这一应用。此外,Galbraith等(1983)开发了一种在裂解液中通过切碎植物组织的细胞 进行核裂解的方法,这一方法快速,实用,并成为了一种在植物流式细胞术中裂解细胞核的 主要且最可靠的方法。但是,因为植物存在解除细胞壁的固定和束缚时难度大等问题,因 此,虽然有部分植物流式裂解的前处理获得了成功,但是,仍然有大量植物至今没有获得裂 解效果达到流式检测要求的裂解液。特别是对于木本植物,其木质化程度高,不仅有坚固且 厚的细胞壁,还含有大量次生代谢产物(如单宁酸等物质)--使细胞质对裂解液的染色抵 抗作用大,这些因素导致裂解和悬浮单细胞时更加困难。在实践中,获得效果优良裂解液的 物种也较少。并且,即使裂解获得了成功,也存在碎片多,细胞核不完整,细胞粘连聚集,染 色不均匀,产量低和CV值(反应细胞核完整性的指标)达不到要求等问题。另外,叶片的新鲜 程度也对检测结果有很大影响,已经开发出的裂解液要求采后要及时裂解和检测,否则,检 测结果会受到很大影响,因为植物很多时候是野外取样,但流式细胞仪是大型仪器,不能随 意搬动,很难达到处理后及时在野外或就近检测的要求,因此,如果样品在裂解后能够在常 温下保持较长时间的达到检测效果的稳定,则可以解决这一难题。
[0003] 桉树(Eucalyptus)是世界三大速生树种之一,在世界林业产业中具有非常重要的 地位,桉树现在也是中国人工林木材产量最多的树种。有如此重要地位和价值的树种,开发 和推进包含其遗传育种在内的各项生物技术,发掘其利用潜力,进一步提高其生产、经济和 社会效益,具有非常重要的意义。但因为其细胞核裂解技术一直未能开发成熟,其DNA倍性 鉴定(主要用于桉树的倍性育种)、细胞周期、细胞凋亡和相关代谢等研究一直未能开展,严 重制约了其倍性育种等育种技术的开展。

【发明内容】

[0004] 为克服上述现有的缺点与不足,本发明的首要目的在于提供一种尾巨桉流式检测 的方法。
[0005] 本发明的另一目的在于提供上述尾巨桉流式检测的方法在细胞核DNA含量测定, DNA倍性鉴定以及细胞周期分析等方面的应用。
[0006] 本发明的目的通过下述方案实现:
[0007] -种尾巨桉流式检测的方法,主要包括以下步骤:
[0008] (1)裂解:取尾巨桉DH32-29的嫩叶加入预冷的裂解液中,用刀片切嫩叶,使嫩叶的 大小为0.0025~0.0225mm 2,裂解,得细胞裂解悬浮液;
[0009] (2)过滤:将步骤(1)中所得的细胞裂解悬浮液过滤,将过滤后的液体离心,倒掉上 清液,加入预冷的裂解液,使沉淀中的细胞核重新悬浮,然后再过滤,得滤液;
[0010] (3)酶解:向步骤⑵中所得的滤液中加入RNase酶溶液进行酶解,得酶解液;
[0011] (4)染色:向步骤(3)中所得的酶解液中加入PI染液进行染色,得染色液;
[0012] (5)流式检测:将步骤(4)中所得的染色液在流式细胞仪上进行检测。
[0013] 步骤(1)和步骤(2)中所述的裂解液的配方为0.2mol/L Tris,4mmol/L MgCl2 · 6H20,2mmol/L EDTA Na2,2H2〇,86mmol/L NaCl,10mmol/L焦亚硫酸钠,100mmol/L柠檬酸, 1 % (v/v)PVP_10,1 % (v/v)Triton X_100,0·5% (v/v)Tween 20,裂解液的溶剂为双蒸水, pH=7.5。常温下配制,于4°C冰箱保存。
[0014] 步骤(1)和步骤(2)中所述的预冷的裂解液是指温度保持在0~4°C的裂解液。
[0015] 步骤(1)中所述的裂解是指裂解5~20min。
[0016] 步骤(1)中所用的裂解液的用量为每40~50mg的嫩叶使用0.2~lmL的裂解液。 [0017]步骤(2)中所述的过滤是指用300目的尼龙滤膜过滤,再过滤是指用400目的尼龙 滤膜过滤。
[0018] 步骤(2)中所述的离心是指在4°C,lOOOrpm离心3~8min。
[0019] 步骤(2)中所述的重新悬浮的时间为5~20s。
[0020] 步骤(3)中所述的RNase酶溶液的浓度为lmg/mL,溶剂为双蒸水,酶解在37 °C进行, 酶解时间为30~45min。
[0021] 步骤(4)中所述的PI染液的浓度为lmg/mL,溶剂为双蒸水。
[0022] 步骤(4)中所述的染色在0~4°C下进行,染色时间至少为20min。
[0023]步骤(1)中所用的裂解液、步骤(2)中所用的裂解液、步骤(3)中所用的RNase酶溶 液以及步骤(4)中所用的PI染液的体积比为(0.2~1):(0.2~0.5) :(0.002~0.006): (0.005~0.05)〇
[0024]上述的尾巨桉流式检测的方法在细胞核DNA含量测定,DNA倍性鉴定以及细胞周期 分析等方面的应用。本发明的机理为:
[0025]裂解液既要破坏植物细胞的既有结构,解除细胞壁对细胞的束缚和固定作用,使 细胞核能够裂解出来,同时,还要保证整个检测过程中细胞核的稳定性,保护细胞核不被降 解并且能够被染色;另外,还要保证细胞核不发生粘连。本发明的裂解液中各组分作用如 下:Tris在裂解液中作为缓冲液,维持裂解液的稳定性;MgCl 2 · 6H20用来保持细胞核的完整 性和稳定性,起到防止细胞核破裂的作用;EDTA(乙二胺四乙酸)和柠檬酸作为螯合剂,用来 结合二价阳离子,充当核酸酶的辅酶,增强DNA的染色能力和效果;NaCl用于维持合适的离 子强度;Triton X-100和Tween 20是非离子型洗涤剂,用来解除黏稠的细胞质对细胞核的 包裹和隔离,释放细胞核,减少细胞核和碎片的聚合亲和力;焦亚硫酸钠和PVP_10(聚乙烯 吡咯烷酮)起到防止木本植物所含酚类物质被氧化的作用,且可抵消细胞质对核DNA荧光染 色的负面作用一一木本植物酚类物质被氧化后,其细胞核会难以被染色。
[0026] 本发明相对于现有技术,具有如下的优点及有益效果:
[0027] 本流式裂解液,针对木本植物的特性,进行了改进:(1)木本植物含有更多的单宁 等物质,细胞质粘稠度大,导致裂解和染色难度变大,因此,增加了抗氧化的成分焦亚硫酸 钠和PVP-10; (2)针对木本植物木质化程度高,细胞壁坚固且厚、固着作用强,细胞难以分离 出的特点,采用了Triton X-100和TWeen20,减弱了细胞质对裂解液的染色抵抗作用,显著 提高了细胞裂解率,获得了可达到检测要求(主要是碎片率,CV值等指标达到检测要求)的 裂解效果。
[0028]另外,采用本发明所述的裂解液进行裂解处理后,在常温25°C下保存48h后进行检 测,发现其分析结果无明显变化,说明该裂解液具有良好的稳定性,可以实现野外取材后间 隔2天(48小时)做流式检测分析的可行性,解除了流式检测要采后即时进行检测的局限,显 著拓宽了流式检测的应用场合和应用范围。
【附图说明】
[0029]图1为尾巨桉DH32-29叶片在用裂解液裂解后染色20min后检测的细胞核DNA直方 图。
[0030] 图2为尾巨桉DH32-29叶片在染色20min并放置48h后再次检测的细胞核DNA直方 图。
【具体实施方式】
[0031] 下面结合实施例和附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限 于此。
[0032] 实施例中所用试剂如果没有特殊说明,均可从市场常规购得。
[0033] 流式细胞仪采用美国贝克曼库尔特有限公司(Beckman Coulter,Inc .)的 CytoFLEX流式细胞仪,配置为空气冷却的氩离子激光器,检测结果从其自带软件CyoExpert software(version 1 · 1 · 10.0.)上获得。检测中样品流速限定为低速10yL/min,且在整个实 验过程中保持不变。每个材料设置两次重复,两次重复之间间隔24h以上,即取材时间间隔 一天以上,取平均值,每一个重复检测时的细胞核数量均在8000个以上。
[0034]评价每一个材料检测效果的参数为:FS,用于评价颗粒的相对大小;SS,用于评价 颗粒的相对光学复杂性;FL,指染上PI的细胞核的荧光强度;CV值,评价细胞核的完整性和 DNA染色的效果;BF,评价样本质量;YF,比较悬浮液中细胞核数量和所用叶片组织中的细胞 核总数量。裂解效果较好的标准是高的FL值、YF值和低的CV值、DF值,其中:
[0037] YF(个*秒-1毫克-4的计算公式为:
[0039] 实施例1
[0040] 裂解液的制备:首先用分析天平称取24.23g Tris、0.81g MgCh · 6H2〇、0.82g EDTA Na2,2H2〇、5.03g NaCl、1.90g焦亚硫酸钠、19.21g柠檬酸、lO.OOg PVP-10,放入洗干 净的经双蒸水润洗过的烧杯,加入双蒸水,玻璃棒搅拌至全部溶解;然后用移液枪移取lOmL Triton X-100和5mL Tween 20,待全部溶解后用1L的容量瓶定容;最后用pH计测量pH值后, 用lmo 1 /L的HC1溶液和10mo 1 /L NaOH溶液调整pH到指定值7.5,于4 °C冰箱保存。
[0041 ]摘取尾巨桉DH32-29栽培苗顶端2~3片嫩叶40mg,材料置于培养皿,培养皿放置在 冰上,用移液枪吸取lmL 0~4°C的裂解液浸没材料,用刀片切材料,切至材料呈0.01mm2左 右大小,裂解l〇min;细胞裂解悬浮液经300目尼龙滤膜过滤以除去细胞碎片和大的残渣;滤 液在4°C,lOOOrpm离心5min;倒掉上清液,再加入400yL 0~4°C的裂解液使沉淀中的细胞核 重新悬浮l〇s(此操作仍在冰上进行);用400目尼龙滤膜再次过滤,得滤液;滤液中加入4yL lmg/mL RNase酶溶液(购自上海生工)37°C酶解30min;最后加入20yL lmg/mL PI染液染色 20min;然后进行流式检测,其细胞核DNA直方图如图1所示,其裂解评估参数如表1所示。
[0042] 实施例2
[0043] 将实施例1中进行流式检测后的裂解液置于25°C闭光条件下的泡沫盒内48h,再次 进行流式检测,其细胞核DNA直方图如图2所示,其裂解评估参数如表1所示。
[0044]结果表明,两个实施例检测得到的峰型不变,说明样品在染色后常温25°C闭光保 存48h对裂解液的稳定性没有影响,因此,可以野外取样,染色后常温放置48h后检测。
[0045] 表1尾巨桉DH32-29在不同检测时间条件下的裂解评估参数比较
[0046]
[0047]从流式细胞仪检测的裂解参数结果来看,荧光均值FL有所升高,且BF值有所下降, 说明时间越长染色可能更充分,可检测到的荧光强度增强,也说明了裂解液的稳定性好;YF 略有下降,推测可能是部分细胞核发生分解;CV值从3.87%升高到4.51 %,但是仍然没有超 过5%。从尾巨桉DH32-29叶片的细胞核DNA直方图来看,常温放置48h后得到的峰型与当天 检测所得基本一致。综上所述,样品染色后常温放置48h对裂解液的稳定性影响不大,检测 效果无明显变化。
[0048]上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的 限制,其他的未背离本发明的精神实质与原理下所作的任何改变、修饰、替代、组合、简化, 均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
【主权项】
1. 一种尾巨桉流式检测的方法,其特征在于包括以下步骤: (1) 裂解:取尾巨桉DH32-29的嫩叶加入预冷的裂解液中,用刀片切嫩叶,使嫩叶的大小 为0.0025~0.0225mm2,裂解,得细胞裂解悬浮液; (2) 过滤:将步骤(1)中所得的细胞裂解悬浮液过滤,将过滤后的液体离心,倒掉上清 液,加入预冷的裂解液,使沉淀中的细胞核重新悬浮,然后再过滤,得滤液; (3) 酶解:向步骤(2)中所得的滤液中加入RNase酶溶液进行酶解,得酶解液; (4) 染色:向步骤(3)中所得的酶解液中加入PI染液进行染色,得染色液; (5) 流式检测:将步骤(4)中所得的染色液在流式细胞仪上进行检测。2. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(1)和步骤(2)中所述的裂解液的配方为0.2mol/L Tris · HCl,4mmol/LMgCl2 · 6H20,2mmol/L EDTA Na2,2H2〇,86mmol/L NaCl,10mmol/L焦亚硫酸钠,100mmol/L柠檬酸, 体积分数为1 %的PVP-10,体积分数为1 %的Triton X-100,体积分数为0.5%的Tween 20, 裂解液的溶剂为双蒸水,pH=7.5,常温下配制,4°C冰箱保存; 步骤(1)和步骤(2)中所述的预冷的裂解液是指温度保持在0~4°C的裂解液。3. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(1)中所述的裂解是指裂解5~20min; 步骤(1)中所用的裂解液的用量为每40~50mg的嫩叶使用0.2~lmL的裂解液。4. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(2)中所述的过滤是指用300目的尼龙滤膜过滤,再过滤是指用400目的尼龙滤膜 过滤; 步骤(2)中所述的离心是指在4°C,lOOOrpm条件下离心3~8min; 步骤(2)中所述的重新悬浮的时间为5~20 s。5. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(3)中所述的RNase酶溶液的浓度为lmg/mL,溶剂为双蒸水,酶解温度为37 °C,酶解 时间为30~45min。6. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(4)中所述的PI染液的浓度为lmg/mL,溶剂为双蒸水; 步骤(4)中所述的染色在0~4°C下进行,染色时间至少为20min。7. 根据权利要求1所述的尾巨桉流式检测的方法,其特征在于: 步骤(1)中所用的裂解液、步骤(2)中所用的裂解液、步骤(3)中所用的RNase酶溶液以 及步骤(4)中所用的PI染液的体积比为(0.2~1):(0.2~0.5) :(0.002~0.006) :(0.005~ 0.05)〇8. 根据权利要求1~7任一项所述的尾巨桉流式检测的方法在细胞核DNA含量测定,DNA 倍性鉴定以及细胞周期分析方面的应用。
【文档编号】G01N15/14GK106092864SQ201610402098
【公开日】2016年11月9日
【申请日】2016年6月7日
【发明人】韩超, 徐建民
【申请人】中国林业科学研究院热带林业研究所
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