技术特征：
技术总结
本发明属于基因工程技术领域，公开了一种基于新一代测序数据的Indel检测方法，包括：利用bwa比对软件对原始的fastq数据做比对，生成sam文件；对二维点根据设定的阈值进行层次聚类；对hang.sam文件中的每一对reads，取出未正常比对的read；将read和截取下来的参考序列做比对即可确定变异类型，变异位置，以及变异大小；利用哈希结构来存储变异；对于某个变异，根据测序的覆盖度设置阈值。本发明通过聚类确定一个变异的范围，提取Split read与变异范围内的参考序列进行比对，使得比对的过程变得简单、范围更加精确；使用层次聚类，突破提前设置聚类个数的限制，操作简单。
技术研发人员：袁细国;许向彦;杨利英;张军英;白俊
受保护的技术使用者：西安电子科技大学
技术研发日：2017.05.25
技术公布日：2017.10.03