一种针对icd起搏器的结构化数据提取方法
【专利摘要】本发明公开一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤：1）从ICD起搏器中导出PDF格式的报告文件；2）根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；3）读取文件内容；4）扫描报告文件，并提取文本内容；5）调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据；6）将数据写入数据库；该针对ICD起搏器的结构化数据提取方法能节省人力资源。
【专利说明】
一种针对I CD起搏器的结构化数据提取方法
技术领域
[0001 ]本发明涉及一种针对I⑶起搏器的结构化数据提取方法。
【背景技术】
[0002]充血性心力衰竭是有较高死亡率的严重疾患，每年有成千上万的患者死于心力衰竭。在过去的10余年中，在患者体内植入CRT设备已经成为治疗该级别最显著的非药物治疗方法。
[0003]患者植入CRT设备后，需要定期回医院进行随访，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，并结合CRT的诊断功能，优化设备参数、调整治疗方案。CRT设备植入患者回医院进行随访时，心血管专科医生工作流程如下一一通过CRT厂家提供的程控仪，读取患者体内的CRT程控数据从CRT程仪器中的患者数据导出为PDF格式的随访报告，人工查阅报告中的各项参数指标，做出医学判断。将本次导出的报告进行存档，以便患者下次随访时进行对比。
[0004]目前国内外CRT厂家仅允许将程控数据导出为TOF文件，不允许导出为excel、csv、xml等文件格式。由于PDF文件是典型的非结构化数据格式，国内临床科研工作者进行心血管领域的大数据研究时，只能通过人工抄录的方式从上述TOF文件中提取各项参数指标。由于患者数量多、程控参数复杂，人工抄录劳动强度大。
【发明内容】
[0005]本发明要解决的技术问题是提供一种能节省人力资源的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法。
[0006]为解决上述问题，本发明采用如下技术方案:
一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤:
1)从I⑶起搏器中导出I3DF格式的报告文件；
2)根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；
3)读取文件内容；
4)扫描报告文件，并提取文本内容；
5)调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据；
6)将数据写入数据库。
[0007]作为优选，所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数。
[0008]作为优选，所述步骤3)的具体实现方式为:
3.1)采用JAVA程序打开报告文件；
3.2)编程读取报告文件。
[0009]作为优选，所述步骤4)的具体实现方式为:
4.1)逐行扫描报告文件的内容； 4.2)将每行的内容提取出来。
[0010]作为优选，所述步骤5)的具体实现方式为:
5.1)使用JAVA程序调用CRT参数抽取规则库；
5.2)在CRT参数抽取规则库找到每行内容的抽取规则；
5.3)根据抽取规则将报告文件中整行匹配的数据抽取出来；
作为优选，所述步骤6 )的具体实现方式为:
6.6)编程将抽取出来的数据进行汇总；
6.6)将汇总后的数据写入数据库。
[0011]作为优选，所述数据库为SQL数据库，功能强大、简单易学、使用方便。
[0012]作为优选，所述编程均为JAVA编程，具有简单性、面向对象、分布式、健壮性、安全性、平台独立与可移植性、多线程、动态性等特点，功能强大和简单易用。
[0013]本发明的有益效果为:采用计算机编程读取PDF格式的CRT程控文件中的文本内容，将文本内容抽取出来并保存到数据库，并可导出成Excel和cvs等数据格式进行统计分析，数据抽取效率和数据抽取准确率高，彻底解决了人工抄录模式难以管控质量的难题，能节省人力资源，方便医务人员工作，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，以便患者下次随访时进行对比。
【附图说明】
[0014]为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0015]图1为实施例2中的步骤5)的数据抽取流程图。
【具体实施方式】
[0016]实施例1
一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤:
1)从I⑶起搏器中导出I3DF格式的报告文件；
2)根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；
3)读取文件内容；
4)扫描报告文件，并提取文本内容；
5)调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据，如图1所示；
6)将数据写入数据库。
[0017]本实施例的有益效果为:采用计算机编程读取TOF格式的CRT程控文件中的文本内容，将文本内容抽取出来并保存到数据库，并可导出成Excel和cvs等数据格式进行统计分析，数据抽取效率和数据抽取准确率高，彻底解决了人工抄录模式难以管控质量的难题，能节省人力资源，方便医务人员工作，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，以便患者下次随访时进行对比。
[0018]实施例2 一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，包括以下步骤:
1)从I⑶起搏器中导出I3DF格式的报告文件；
2)根据报告文件设置CRT参数抽取规则库；
3)采用JAVA编程打开报告文件，JAVA编程读取报告文件；
4)逐行扫描报告文件的内容，将每行的内容提取出来；
5)使用JAVA编程调用CRT参数抽取规则库，在CRT参数抽取规则库中找到每行内容的抽取规则;根据抽取规则将报告文件中整行匹配的数据抽取出来，如图1所示；
6)使用JAVA编程将抽取出来的数据进行汇总;将汇总后的数据写入SQL数据库。
[0019]所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数，如设置了规则“体重=$ {体重} (kg)”后，当输入文本为“王强，体重=89 (kg)”时，JAVA程序则通过规则抽取数字“89”，并返回一下结果“体重=89”。
[0020]本实施例的有益效果为:采用JAVA编程读取PDF格式的CRT程控文件中的文本内容，将文本内容抽取出来并保存到SQL数据库，并可导出成Excel和cvs等数据格式进行统计分析，数据抽取效率和数据抽取准确率高，彻底解决了人工抄录模式难以管控质量的难题，能节省人力资源，方便医务人员工作，以便心血管专科医生对CRT近期的工作进行评价，以便患者下次随访时进行对比。
[0021]以上所述，仅为本发明的【具体实施方式】，但本发明的保护范围并不局限于此，任何不经过创造性劳动想到的变化或替换，都应涵盖在本发明的保护范围之内。
【主权项】
1.一种针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:包括以下步骤:。2.1)从I⑶起搏器中导出PDF格式的报告文件； 2)根据报告文件设置CRT参数抽取规则库； 3)读取文件内容； 4)扫描报告文件，并提取文本内容； 5)调用CRT参数抽取规则库，编程抽取符合抽取规则的数据； 6)将数据写入数据库。3.根据权利要求1所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述CRT参数抽取规则库的每条规则均对应着报告文件中的一个指标或参数。4.根据权利要求2所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述步骤3)的具体实现方式为: 3.1)编程打开报告文件； 3.2)读取报告文件。5.根据权利要求3所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述步骤4)的具体实现方式为: 4.1)逐行扫描报告文件的内容； 4.2)将每行的内容提取出来。6.根据权利要求4所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述步骤5)的具体实现方式为: 5.1)使用JAVA程序调用CRT参数抽取规则库； 5.2)在CRT参数抽取规则库找到每行内容的抽取规则； 5.3)根据抽取规则将报告文件中整行匹配的数据抽取出来； 根据权利要求5所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述步骤6)的具体实现方式为: 6.6)编程将抽取出来的数据进行汇总； 6.6)将汇总后的数据写入数据库。7.根据权利要求6所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述数据库为SQL数据库。8.根据权利要求7所述的针对ICD起搏器的结构化数据提取方法，其特征在于:所述编程均为JAVA编程。
【文档编号】G06F17/30GK105912883SQ201610494115
【公开日】2016年8月31日
【申请日】2016年6月30日
【发明人】陈样新, 毛涌泉, 罗超
【申请人】广州市皓轩软件科技有限公司