用于定量的经调度ms3的制作方法
【专利说明】用于定量的经调度MS3
[0001]相关申请案的交叉参考
[0002]本申请案主张2012年12月20日提出申请的序列号为61/739，841的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的内容以全文弓I用的方式并入本文中。
【背景技术】
[0003]介绍
[0004]质谱/质谱/质谱法(MS3)是用于定量实验的越来越普遍的技术。如同常用于定量中的多反应监测(MRM)或选择反应监测(SRM)，MS3涉及选择用于碎裂的前驱物离子及监测碎片离子或产物离子的碎裂。然而，MS3包含将产物离子碎裂并监测二级碎片离子的所述碎裂的额外步骤。与MRM实验相比，此额外步骤赋予MS3实验更大特定性及对化学噪声的更大恢复力。
[0005]然而，大体来说，MS3实验具有比传统MRM实验长得多的循环时间。另外，MS 3实验需要比MRM实验更复杂的实验发展。因此，MS3实验在用作定量实验的部分时难以动态地或以无针对性方式执行。
【发明内容】
[0006]揭示一种用于经调度MS3的系统。所述系统包含分离装置、质谱仪及处理器。所述分离装置在已知时间周期内将所关注化合物与样本分离。所述质谱仪在所述已知时间周期内对所述分离的所关注化合物执行多个经调度MRM(sMRM)实验。所述质谱仪针对所述多个sMRM实验中的每一者产生所述所关注化合物的产物离子的强度。
[0007]所述处理器从所述质谱仪接收所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度。所述处理器将所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度与阈值强度水平进行比较。当所述多个sMRM实验中的一 sMRM实验的所述产物离子的强度等于或超过所述阈值强度水平时，所述处理器指令所述质谱仪针对所述产物离子执行一或多个MS3实验。因此，处理器针对所述一或多个MS 3实验中的每一者产生所述所关注化合物的一或多个二级碎片离子的强度。
[0008]揭示一种用于经调度MS3的方法。使用分离装置在已知时间周期内将所关注化合物与样本分离。使用质谱仪在所述已知时间周期内对所述分离的所关注化合物执行多个sMRM实验。针对所述多个sMRM实验中的每一者产生所述所关注化合物的产物离子的强度。
[0009]使用处理器从所述质谱仪接收所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度。使用所述处理器将所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度与阈值强度水平进行比较。当所述多个sMRM实验中的一 sMRM实验的所述产物离子的强度等于或超过所述阈值强度水平时，使用所述处理器指令所述质谱仪针对所述产物离子执行一或多个MS3实验。针对所述一或多个MS 3实验中的每一者产生所述所关注化合物的一或多个二级碎片离子的强度。与所检测的MS3实验信号及检测的保留时间有关的所得分析信号可用以对分析期间存在的目标分析物的量进行定量。
[0010]揭示一种包含非暂时性及有形计算机可读存储媒体的计算机程序产品，所述计算机可读存储媒体的内容包含具有在处理器上执行以便执行用于经调度MS3的方法的指令的程序。在各种实施例中，所述方法包含:提供一系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括分析模块及控制模块。
[0011]所述分析模块从质谱仪接收多个sMRM实验所述多个sMRM实验中的每一者的产物离子的强度。通过使用质谱仪在已知时间周期内对分离的所关注化合物执行所述多个sMRM实验来产生所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度。使用分离装置在所述已知时间周期内将所述分离的所关注化合物与样本分离。
[0012]所述分析模块将所述多个sMRM实验中的每一者的所述产物离子的每一强度与阈值强度水平进行比较。当所述多个sMRM实验中的一 sMRM实验的所述产物离子的强度等于或超过所述阈值强度水平时，所述控制模块使用所述处理器指令所述质谱仪针对所述产物离子执行一或多个MS3实验。针对所述一或多个MS 3实验中的每一者产生所述所关注化合物的二级碎片离子中的一或多者的强度。与所检测的MS3实验信号及检测的保留时间有关的所得分析信号可用以对分析期间存在的目标分析物的量进行定量。
[0013]在本文中陈述申请人的教示的这些特征及其它特征。
【附图说明】
[0014]所属领域的技术人员将理解，下文所描述的图式仅用于图解说明目的。所述图式并不打算以任何方式限制本发明教示的范围。
[0015]图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统的框图。
[0016]图2是根据各种实施例的sMRM信号级及由在保留时间(RT)窗内达到阈值级的sMRM信号触发的MS3获取的循环的示范性曲线图。
[0017]图3是展示根据各种实施例的用于经调度MS3的系统的示意图。
[0018]图4是展示根据各种实施例的用于经调度MS3的方法的示范性流程图。
[0019]图5是根据各种实施例的包含一或多个相异软件模块，执行用于经调度MS3的方法的系统的示意图。
[0020]在详细描述本发明教示的一或多个实施例之前，所属领域的技术人员将了解，本发明教示在其应用方面并不限于以下详细描述中所陈述或图式中所图解说明的构造细节、组件布置及步骤安排。此外，应理解，本文中所使用的措辞及术语是用于描述目的且不应视为具限制性。
【具体实施方式】
[0021]计算机实施的系统
[0022]图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统100的框图。计算机系统100包含总线102或用于传递信息的其它通信机构，及与总线102耦合以用于处理信息的处理器104。计算机系统100还包含耦合到总线102以用于存储待由处理器104执行的指令的存储器106，所述存储器可为随机存取存储器(RAM)或其它动态存储装置。存储器106还可用于在待由处理器104执行的指令的执行期间存储临时变量或其它中间信息。计算机系统100进一步包含只读存储器(ROM) 108或耦合到总线102以用于存储用于处理器104的静态信息及指令的其它静态存储装置。例如磁盘或光盘的存储装置110经提供且耦合到总线102以用于存储信息及指令。
[0023]计算机系统100可经由总线102耦合到显示器112 (例如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD))以向计算机用户显示信息。包含字母数字键及其它键的输入装置114耦合到总线102以用于将信息及命令选择传递到处理器104。另一类型的用户输入装置为用于将方向信息及命令选择传递到处理器104且用于控制显示器112上的光标移动的光标控制件116，例如鼠标、轨迹球或光标方向键。此输入装置通常具有在两个轴(第一轴(即，x)及第二轴(即，y))上的两个自由度，此允许所述装置规定在平面中的位置。
[0024]计算机系统100可执行本发明教示。依照本发明教示的特定实施方案，由计算机系统100响应于处理器104执行存储器106中