一种蛋白功能分型的决策方法、系统和电子设备与流程

本发明涉及生物信息，尤其涉及一种蛋白功能分型的决策方法、系统和电子设备。

背景技术：

1、由于个体基因型的差异不同，导致药物使用的安全范围狭窄。临床应用过程中有多个影响药物选择的辅助判读基因，比如药物代谢基因、药物耐药基因等等，辅助判读基因的蛋白功能不同，增加了个体对药物选择的变动性；同时这些基因常具有多数基因位点的多个方向突变，能够共同作用影响基因功能，因而其蛋白功能的分型判读十分复杂。

2、因此，提出一种蛋白功能分型的决策方法、系统和电子设备。

技术实现思路

1、本说明书提供一种蛋白功能分型的决策方法、系统和电子设备，通过确定需要判读的第一基因位点，根据辅助判读模型判读与第一基因位点对应的第一基因型，得到所述辅助判读基因的判读结果，以辅助对检测对象的蛋白功能进行分型。

2、本申请提供的一种蛋白功能分型的决策方法采用如下的技术方案，包括：

3、获取基本信息，所述基本信息包括辅助判读基因和检测对象的基因检测结果，所述基因检测结果包括基因位点和基因型，所述基因位点和所述基因型一一对应；

4、根据辅助判读基因的名称确定与之对应的第一基因位点，所述辅助判读基因包括至少一第一基因位点，基于所述第一基因位点，在所述基因检测结果中查找与其对应的第一基因型；

5、将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，以辅助决策检测对象的蛋白功能类型。

6、可选的，所述将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，包括：

7、判断判读条目表中是否包括所述第一基因位点和所述第一基因型；

8、根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果。

9、可选的，所述根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果，包括：

10、当所述判读条目表中包括所述第一基因位点和所述第一基因型时，匹配与所述第一基因型对应的所述第一判读结果。

11、可选的，所述根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果，包括：

12、当所述判读条目表中不包括所述第一基因位点和/或所述第一基因型时，发送人工判读请求，所述人工判读请求包括所述第一基因位点和所述第一基因型；

13、收集人工判读结果，将所述人工判读结果作为所述第一判读结果。

14、可选的，所述接收人工判读结果之后，还包括：

15、对辅助判读模型进行优化；

16、所述对辅助判读模型进行优化，包括：

17、在观测条目表中记录所述第一判读结果的出现次数。

18、可选的，所述对辅助判读模型进行优化，还包括：

19、当所述第一判读结果的出现次数达到预设条件时，将所述第一基因位点、所述第一基因型和所述第一判读结果更新到所述判读条目表中；

20、删除所述观测条目表中关于与所述第一基因位点对应的所述第一基因型的判读结果。

21、本申请提供的一种蛋白功能分型的决策系统采用如下的技术方案，包括：

22、获取模块，用于获取基本信息，所述基本信息包括辅助判读基因和检测对象的基因检测结果，所述基因检测结果包括基因位点和基因型，所述基因位点和所述基因型一一对应；

23、查找模块，用于根据辅助判读基因的名称确定与之对应的第一基因位点，所述辅助判读基因包括至少一第一基因位点，基于所述第一基因位点，在所述基因检测结果中查找与其对应的第一基因型；

24、判读模块，用于将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，以辅助决策检测对象的蛋白功能类型。

25、可选的，所述判读模块，包括：

26、判断子模块，用于判断判读条目表中是否包括所述第一基因位点和所述第一基因型；

27、结果生成子模块，用于根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果。

28、可选的，所述结果生成子模块，包括：

29、匹配单元，用于当所述判读条目表中包括所述第一基因位点和所述第一基因型时，匹配与所述第一基因型对应的所述第一判读结果。

30、可选的，所述结果生成子模块，包括：

31、判读请求单元，用于当所述判读条目表中不包括所述第一基因位点和/或所述第一基因型时，发送人工判读请求，所述人工判读请求包括所述第一基因位点和所述第一基因型；

32、收集单元，用于收集人工判读结果，将所述人工判读结果作为所述第一判读结果。

33、可选的，还包括：

34、优化模块，用于对辅助判读模型进行优化。

35、所述优化模块，包括：

36、次数记录子模块，用于在观测条目表中记录所述第一判读结果的出现次数。

37、可选的，所述优化模块，还包括：

38、条目记录子模块，用于当所述第一判读结果的出现次数达到预设条件时，将所述第一基因位点、所述第一基因型和所述第一判读结果更新到所述判读条目表中；

39、删除子模块，用于删除所述观测条目表中关于与所述第一基因位点对应的所述第一基因型的判读结果。

40、本说明书还提供一种电子设备，其中，该电子设备包括：

41、处理器；以及，

42、存储计算机可执行指令的存储器，所述可执行指令在被执行时使所述处理器执行上述任一项方法。

43、本说明书还提供一种计算机可读存储介质，其中，所述计算机可读存储介质存储一个或多个程序，所述一个或多个程序当被处理器执行时，实现上述任一项方法。

44、本申请中，通过获取基本信息，所述基本信息包括辅助判读基因和检测对象的基因检测结果，所述基因检测结果包括基因位点和基因型，所述基因位点和所述基因型一一对应；根据辅助判读基因的名称确定与之对应的第一基因位点，所述辅助判读基因包括至少一第一基因位点，基于所述第一基因位点，在所述基因检测结果中查找与其对应的第一基因型；将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，以辅助决策检测对象的蛋白功能类型。

技术特征：

1.一种蛋白功能分型的决策方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，包括：

3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述通过辅助判读模型根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果，包括：

4.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述通过辅助判读模型根据判断结果得到与所述第一基因型对应的第一判读结果，包括：

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述接收人工判读结果之后，还包括：

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述对辅助判读模型进行优化，还包括：

7.一种蛋白功能分型的决策系统，其特征在于，包括：

8.一种电子设备，其中，该电子设备包括：

9.一种计算机可读存储介质，其中，所述计算机可读存储介质存储一个或多个程序，所述一个或多个程序当被处理器执行时，实现权利要求1-6中任一项所述的方法。

技术总结
本申请提供了一种蛋白功能分型的决策方法、系统和电子设备，涉及生物信息技术领域，包括获取基本信息，所述基本信息包括辅助判读基因和检测对象的基因检测结果，所述基因检测结果包括基因位点和基因型，所述基因位点和所述基因型一一对应；根据辅助判读基因的名称确定与之对应的第一基因位点，所述辅助判读基因包括至少一第一基因位点，基于所述第一基因位点，在所述基因检测结果中查找与其对应的第一基因型；将所述第一基因位点和所述第一基因型输入辅助判读模型，得到判读结果，以辅助决策检测对象的蛋白功能类型。

技术研发人员：何熲,张逸慜,岑忠,倪旭鸣
受保护的技术使用者：上海康黎医学检验所有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/1/13