检测染色体区段信息在原发肝癌患者肝外转移预测中的应用

本发明属于原发肝癌肝外转移预后领域，涉及检测染色体区段信息在原发肝癌患者肝外转移预测中的应用。

背景技术：

1、体细胞拷贝数变异可用于肿瘤早期诊断和新生儿的遗传筛查。膀胱癌试剂盒(urovysion试剂盒)旨在通过荧光原位杂交(fish)检测疑似患有膀胱癌的血尿患者的尿液样本中3号、7号、17号染色体的非整倍性和9p21的缺失来做诊断。拷贝数变异是造成新生儿出生缺陷的第二大类遗传因素，所以产前筛查是必不可少的。目前临床上产前无创筛查仅针对21三体综合征、18三体综合征和13三体综合征。

2、但是，目前上市的癌症检测试剂盒中，极少涉及染色体臂级的拷贝数变异。而在原发肝癌患者的肝外转移风险预测中，采用染色体区段的检测信息作为风险预测因素也并未有相关技术报道。

技术实现思路

1、为了克服上述技术问题，本发明提供了检测染色体区段信息在原发肝癌患者肝外转移预测中的应用。

2、第一方面，本发明提供了检测染色体区段拷贝数信息缺失的检测试剂在制备原发肝癌患者肝外转移风险预测的产品中的应用，所述染色体区段为11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q。

3、采用上述技术方案，本发明通过对小片段和染色体臂长水平基因的扩增和缺失变化情况的研究，从克隆进化的角度发现染色体区段11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q的缺失在转移癌中显著富集。

4、进一步地，所述的产品为试剂盒或检测装置。

5、进一步地，所述风险预测包括如下步骤：

6、步骤a)评估所述原发肝癌患者的肿瘤组织中的所述染色体区段的拷贝数；步骤b)将步骤a)的评估结果与正常人组织中所述染色体区段进行比较；和步骤c)若发生所述染色体区段的拷贝数变异或者染色体区段缺失，则该患者发生原发肝癌手术切除后肝外转移的风险较高。

7、第二方面，本发明还提供了一种原发肝癌患者肝外转移风险预测预后的检测试剂盒或检测装置，所述检测试剂盒或检测装置中包括检测染色体区段的拷贝数信息的检测试剂。

8、进一步地，所述染色体区段为11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q。

9、本发明相对于现有技术具有以下技术效果：

10、1)本发明通过对小片段和染色体臂长水平基因的扩增和缺失变化情况的研究，从克隆进化的角度发现染色体区段11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q的缺失在转移癌中显著富集。将原发灶中这7个缺失变异的数量计算为风险评分，发现与原发肝癌相比，转移癌具有更高的风险评分；同时还发现原发癌具有更高风险评分的患者发生肝外转移的时间更短，提示7个缺失变异可以作为原发肝癌手术切除后肝外转移的风险预测因素。

11、2)本发明还通过单因素和多因素分析发现7个缺失变异对不同数据集中患者的转移风险具有稳定的预测能力。因此，原发肿瘤的染色体拷贝数变异是原发肝癌手术切除后肝外转移的预测指标，是未来预防肝外转移的性治疗靶点。

技术特征：

1.检测染色体区段拷贝数信息的试剂在制备原发肝癌患者肝外转移风险预测的产品中的应用，其特征在于，所述染色体区段为11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的产品为试剂盒或检测装置。

3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述风险预测包括如下步骤：

4.一种原发肝癌患者肝外转移风险预测的检测试剂盒或检测装置，其特征在于，所述检测试剂盒或检测装置中包括检测染色体区段的拷贝数信息的检测试剂。

5.根据权利要求4所述的检测试剂盒或检测装置，其特征在于，所述染色体区段为11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q。

技术总结
本发明属于原发肝癌肝外转移预后领域，涉及染色体缺失在原发肝癌肝外转移预测中的应用。本发明从克隆进化的角度发现染色体区段11p15.5、14q32.33、4q35.2、14q、19p、21p、22q的缺失在转移灶中显著富集。将原发灶中这7个缺失变异的数量计算为风险评分，发现与原发肝癌相比，转移癌具有更高的风险评分；同时还发现原发癌具有更高风险评分的患者发生肝外转移的时间更短，提示7个缺失变异可以作为原发肝癌手术切除后肝外转移的风险预测因素。此外，单因素和多因素分析发现7个缺失变异对不同数据集中患者的转移风险具有稳定的预测能力。因此，原发肿瘤的染色体拷贝数变异是原发肝癌手术切除后肝外转移的预测指标，是未来预防肝外转移的可能性治疗靶点。

技术研发人员：孙云帆,樊嘉,周俭,张泽凡,白超刚,陆彬彬,彭海翔,温冬
受保护的技术使用者：复旦大学附属中山医院
技术研发日：
技术公布日：2024/3/31