背景技术:
1、微流体装置是包含处理小规模流体(诸如微升、纳升或更少量的流体)的结构的装置。微流体结构的一种应用是数字聚合酶链式反应(dpcr)。例如,具有多个分区的微流体结构可用于对用于dpcr的核酸样品进行分配。对于基因组研究人员和临床医生而言,dpcr在稀有突变检测、定量拷贝数变异和下一代测序文库定量中特别有效。具有细胞游离dna和病毒载量定量的液体活检在临床环境中的潜在用途进一步提高了dpcr技术的价值。
技术实现思路
1、本文提供了可用于生物样品的分析,例如扩增和定量核酸的方法和装置。本公开提供可实现样品制备、样品扩增和样品分析的方法、系统和装置。可通过使用数字聚合酶链式反应(dpcr)执行样品分析。样品可以被数字化并且样品中的气体可以在分析之前被除气。这种除气或以其它方式从微流体装置和样品中去除气体可减少微流体装置的气体污染,减少样品制备时间,并且改善分析的再现性。与其它系统和方法相比,这可以降低的成本和复杂性实现样品分析,例如核酸扩增和定量。
2、在一方面,本公开提供了用于处理生物样品的微流体装置,包括:第一通道,该第一通道被配置成接收包括生物样品的溶液;与第一通道流体连通的室,其中室被配置成接收来自第一通道的溶液的至少一部分;以及与室相邻设置的第二通道,其中第二通道被配置成(i)在室与第二通道之间施加压差时接收来自室的气体流,以及(ii)在没有压差时阻止来自室的气体流。
3、在一些实施方案中,第二通道不与第一通道或室流体连接。在一些实施方案中,微流体装置不包含设置在室与第二通道之间的阀。在一些实施方案中,气体流过设置在第二通道与室之间的材料。在一些实施方案中,第一通道与第二通道分开(例如,间隔开)。在一些实施方案中,室与第二通道之间的距离小于或等于约50微米(μm)。在一些实施方案中,该距离小于或等于约20μm。在一些实施方案中,该距离为约10μm至20μm。在一些实施方案中,室是与第一通道流体连通的多个室中的一个。在一些实施方案中,第二通道的第一横截面尺寸小于或等于约50μm,并且第二通道的第二横截面尺寸小于或等于约50μm。
4、在一些实施方案中,微流体装置进一步包括密封第一通道、室和第二通道中的至少一者的薄膜。在一些实施方案中,薄膜包括金属层。在一些实施方案中,金属层被配置成阻止气体流通过薄膜。在一些实施方案中,金属层包括选自由铝、钛和镍组成的组的一种或多种元素。在一些实施方案中,金属层包括铝。在一些实施方案中,金属层的厚度小于或等于约50纳米(nm)。在一些实施方案中,薄膜的厚度小于或等于约100μm。在一些实施方案中,厚度为约50μm至100μm。在一些实施方案中,金属层设置在薄膜的外表面上。在一些实施方案中,金属层被配置成减少薄膜的表面污染。在一些实施方案中,薄膜基本上是光学透明的。
5、在另一方面,本公开提供了一种用于处理生物样品的方法,包括:(a)提供装置,该装置包括(i)第一通道、(ii)与第一通道流体连通的室、以及(iii)与室相邻设置的第二通道,其中第二通道(a)在室与第二通道之间施加压差时接收来自室的气体流,并且(b)在没有压差时阻止来自室的气体流进入第二通道;(b)使包括生物样品的溶液的一部分从第一通道流入室;以及(c)在室和第二通道之间施加压差,使得来自室的气体流入第二通道。
6、在一些实施方案中,第二通道不与第一通道或室流体连接。在一些实施方案中,第一通道与第二通道分开(例如,间隔开)。在一些实施方案中,气体流过设置在第二通道与室之间的材料。在一些实施方案中,微流体装置不包含设置在室与第二通道之间的阀。在一些实施方案中,室与第二通道之间的距离小于或等于约50微米(μm)。在一些实施方案中,该距离小于或等于约20μm。在一些实施方案中,该距离为约10μm至20μm。在一些实施方案中,室是与第一通道流体连通的多个室中的一个。在一些实施方案中,第二通道的第一横截面尺寸小于或等于约50μm,并且其中第二通道的第二横截面尺寸小于或等于约50μm。
7、在一些实施方案中,微流体装置进一步包括密封第一通道、室和第二通道中的至少一者的薄膜。在一些实施方案中,薄膜包括金属层。在一些实施方案中,金属层阻止气体流通过薄膜。在一些实施方案中,金属层包括选自由铝、钛和镍组成的组的一种或多种元素。在一些实施方案中,金属层包括铝。在一些实施方案中,金属层的厚度小于或等于约50纳米(nm)。在一些实施方案中,薄膜的厚度小于或等于约100μm。在一些实施方案中,厚度为约50μm至100μm。在一些实施方案中,金属层设置在薄膜的外表面上。在一些实施方案中,金属层减少薄膜的表面污染。在一些实施方案中,薄膜基本上是光学透明的。
8、根据以下具体实施方式,本领域的技术人员将显而易知本公开的额外方面和优势,在具体实施方式中仅示出和描述本公开的说明性实施方案。如将认识到,本公开能够具有其它不同的实施方案,并且其若干细节能够在各种明显的方面进行修改,所有这些都不脱离本公开。因此,附图和说明书本质上被视为是说明性的而非限制性的。
9、通过引用并入
10、本说明书中提及的所有公布、专利和专利申请均以引用的方式并入本文,其程度与每个单独的公布、专利或专利申请被具体且单独地指示以引用的方式并入的程度相同。在通过引用的方式并入的公开和专利或专利申请与本说明书中所包含的公开内容相抵触的情况下,本说明书意欲替代或优先于任何这类矛盾材料。
1.一种用于处理生物样品的微流体装置,包括:
2.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述第二通道不与所述第一通道或所述室流体连接。
3.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述微流体装置不包含设置在所述室和所述第二通道之间的阀。
4.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述气体流过设置在所述第二通道和所述室之间的材料。
5.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述第一通道与所述第二通道间隔开。
6.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述室与所述第二通道之间的距离小于或等于约50微米(μm)。
7.根据权利要求5所述的微流体装置,其中所述距离小于或等于约20μm。
8.根据权利要求5所述的微流体装置,其中所述距离为约10μm至20μm。
9.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述室是与所述第一通道流体连通的多个室中的一个室。
10.根据权利要求1所述的微流体装置,其中所述第二通道的第一横截面尺寸小于或等于约50μm,并且其中所述第二通道的第二横截面尺寸小于或等于约50μm。
11.根据权利要求1所述的微流体装置,进一步包括密封所述第一通道、所述室和所述第二通道中的至少一者的薄膜。
12.根据权利要求11所述的微流体装置,其中所述薄膜包括金属层。
13.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述金属层被配置成阻止气体流通过所述薄膜。
14.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述金属层包括选自由铝、钛和镍组成的组中的一种或多种元素。
15.根据权利要求14所述的微流体装置,其中所述金属层包括铝。
16.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述金属层的厚度小于或等于约50纳米(nm)。
17.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述薄膜的厚度小于或等于约100μm。
18.根据权利要求17所述的微流体装置,其中所述厚度为约50μm至100μm。
19.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述金属层设置在所述薄膜的外表面上。
20.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述金属层被配置成减少所述薄膜的表面污染。
21.根据权利要求12所述的微流体装置,其中所述薄膜基本上是光学透明的。
22.一种用于处理生物样品的方法,包括:
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述第二通道不与所述第一通道或所述室流体连接。
24.根据权利要求22所述的方法,其中所述第一通道与所述第二通道间隔开。
25.根据权利要求22所述的方法,其中所述气体流过设置在所述第二通道和所述室之间的材料。
26.根据权利要求22所述的方法,其中所述微流体装置不包含设置在所述室和所述第二通道之间的阀。
27.根据权利要求22所述的方法,其中所述室和所述第二通道之间的距离小于或等于约50微米(μm)。
28.根据权利要求27所述的方法,其中所述距离小于或等于约20μm。
29.根据权利要求27所述的方法,其中所述距离为约10μm至20μm。
30.根据权利要求22所述的方法,其中所述室是与所述第一通道流体连通的多个室中的一个室。
31.根据权利要求22所述的方法,其中所述第二通道的第一横截面尺寸小于或等于约50μm,并且其中所述第二通道的第二横截面尺寸小于或等于约50μm。
32.根据权利要求22所述的方法,其中所述微流体装置进一步包括密封所述第一通道、所述室和所述第二通道中的至少一者的薄膜。
33.根据权利要求32所述的方法,其中所述薄膜包括金属层。
34.根据权利要求33所述的方法,其中所述金属层阻止气体流通过所述薄膜。
35.根据权利要求33所述的方法,其中所述金属层包括选自由铝、钛和镍组成的组中的一种或多种元素。
36.根据权利要求35所述的方法,其中所述金属层包括铝。
37.根据权利要求33所述的方法,其中所述金属层的厚度小于或等于约50纳米(nm)。
38.根据权利要求33所述的方法,其中所述薄膜的厚度小于或等于约100μm。
39.根据权利要求38所述的方法,其中所述厚度为约50μm至100μm。
40.根据权利要求33所述的方法,其中所述金属层设置在所述薄膜的外表面上。
41.根据权利要求33所述的方法,其中所述金属层减少所述薄膜的表面污染。
42.根据权利要求33所述的方法,其中所述薄膜基本上是光学透明的。