一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用

本发明属于分子标记，具体涉及一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用。

背景技术：

1、剩余采食量(residual feed intake，rfi)被定义为在给定体重和体增重的情况下，动物实际饲料摄入量和预期饲料摄入量之间的差值，因此rfi的数值越大，相对的饲料效率也越低，近些年，越来越多的育种工作者开始采用rfi作为衡量饲料效率的主要指标，并且随着时代发展，这种趋势越来越明显，这是因为使用rfi来进行选育不仅能考虑到日增重和代谢体重，而且对于上市体重等重要经济性状的影响也比较微弱，并且rfi的遗传力在0.2～0.4(chen c，su z，li y，et al.estimation of the genetic parameters oftraits relevant to feed efficiency：result from broiler lines divergent forhigh or low abdominal fat content[j].poult sci，2021，100(2)：461-466；zhang y，guo z b，xie m，et al.genetic parameters for residual feed intake in a randompopulation of pekin duck[j].asian-australas j anim sci，2017，30(2)：167-170.)，属于中等遗传力性状，因此可以使用rfi作为育种时的饲料效率衡量指标。

2、超长链脂肪酸延伸酶2(elovl2)是elovl延伸酶家族成员，elovl家族在长链多不饱和脂肪酸的延伸反应中起重要作用，zhao等对生猪饲料效率进行研究，从约克夏猪肝脏中鉴定了300个转录本，发现猪高低饲料转化率组elovl2基因表达差异显著(zhao y，houy，liu f，et al.transcriptome analysis reveals that vitamin a metabolism in theliver affects feed efficiency in pigs[j].g3(bethesda)，2016，6(11)：3615-3624.)；zhang等对不同剩余采食量湖羊肝脏长非编码核糖核酸的转录组进行分析，发现elovl2基因在不同rfi的湖羊肝脏中差异表达，并且发现elovl2基因与能量代谢有关，elovl2基因主要功能是调控动物体内脂肪酸合成和脂肪沉积，转录组学分析表明rfi与脂质代谢相关基因的表达水平显著相关，脂肪沉积会消耗能量降低饲料利用率(zhang d y，zhang x x，lig z，et al.transcriptome analysis of long noncoding rnas ribonucleic acidsfrom the livers of hu sheep with different residual feed intake[j].animal，2021，15(2)：100098.)。

3、因此elovl2基因可能是影响鸭饲料效率的重要候选基因，目前elovl2基因研究主要集中在小鼠、鱼类和人，家禽方面研究较少，研究内容主要集中在脂肪酸调控和脂质沉积方面，深入研究elovl2基因变异与表达对肉鸭饲料转化率的影响及其分子机制，对提高肉鸭的饲料效率降低肉鸭的养殖成本有重要的现实意义。

4、“强英鸭”属于白羽肉鸭，历经10年自主培育而成，促进了我国肉鸭品种国产化，“强英鸭”商品代鸭早期生长速度快、饲料转化率高、成活率高，40日龄上市，平均体重3.35kg，平均料重比为1.89：1，基于上述内容，提出一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用。

技术实现思路

1、本发明的目的就在于提供一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用，与现有技术相比，针对于鸭的饲料利用率性状相关的候选基因(elovl2基因)的snp(单核苷酸多态性)分子标记，以解决常规表型育种选育进展缓慢，实现早期鉴定饲料利用率性状这一难题。

2、本发明通过以下技术方案来实现上述目的：

3、一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，即所述elovl2基因具有如seq id no.1所示的核苷酸序列，所述分子标记为g或a，所述分子标记位于所述核苷酸序列的第480位。

4、一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。

5、一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，包括以下步骤：

6、(1)提取鸭翅静脉血液总dna；

7、(2)以所述分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列为目标序列设计特异性扩增引物，以所述总dna为模板，利用特异性扩增引物进行pcr扩增，获得扩增产物；

8、(3)对扩增产物进行基因分型检测和测序，获得待测鸭的分子标记类型；

9、(4)根据分子标记类型判断鸭饲料利用率性状。

10、作为本发明的进一步优化方案，所述特异性扩增引物的序列为：

11、seq id no.2：forward primer：ggaacccaccaggaaagac；

12、seq id no.3：reverse primer：gtgagccaaggagaccaag。

13、作为本发明的进一步优化方案，所述基因分型检测方法为通过酶切扩增产物获得酶切产物，利用琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测，根据图像进行基因分型，若酶切产物：

14、包含1条条带，则为aa型；

15、包含2条条带，则为gg型；

16、包含3条条带，则为ga型。

17、作为本发明的进一步优化方案，若待测鸭分子标记类型为aa型，该鸭饲料利用率性状较差；若待测鸭分子标记类型为gg型，该鸭饲料利用率性状最好；若待测鸭分子标记类型为ga型，该鸭饲料利用率性状中等。

18、作为本发明的进一步优化方案，利用1.5％-2.0％浓度的琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测。

19、本发明提具有如下有益效果：

20、本发明通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，根据基因型对鸭的饲料利用率性状进行选择，建立了一种家禽饲料利用率早期选择的育种方法，该法简单、快速、低成本、不需要特殊的仪器，适合分子标记辅助育种实验的需要。

技术特征：

1.一种基于elovl2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，其中，所述核苷酸序列的第480位碱基为g或a。

2.一种如权利要求1所述的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。

3.一种利用如权利要求1所述的分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：

4.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，所述特异性扩增引物的序列为：

5.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，所述基因分型检测方法为通过酶切扩增产物获得酶切产物，利用琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测，根据图像进行基因分型，若酶切产物：

6.根据权利要求5所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，

7.根据权利要求5所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，利用1.5％-2.0％浓度的琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行检测。

技术总结
本发明涉及一种基于ELOVL2基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其鉴定方法和应用，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，所述核苷酸序列的第480位碱基为G或A。本发明通过鉴定该分子标记在鸭基因组中存在的类型，根据基因型对鸭的饲料利用率性状进行选择，建立了一种家禽饲料利用率早期选择的育种方法，该法简单、快速、低成本、不需要特殊的仪器，适合分子标记辅助育种实验的需要。

技术研发人员：金四华,张泰康,耿照玉,贾富民,方毅,徐嫚,胡晓晴,王鑫,王新,刘星
受保护的技术使用者：安徽农业大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/14