本发明涉及基因标志物,涉及linc00665作为银屑病诊断标志物的应用。
背景技术:
1、银屑病是一种免疫介导的皮肤炎症性疾病,以慢性炎症和表皮角质形成细胞过度增殖为特征,导致银白色鳞屑和皮肤增厚。银屑病是一种复杂的、多因素的疾病,既受遗传因素的影响,也受环境因素的影响。大样本转录组分析已经发现大约3500个蛋白质编码基因在银屑病患者皮损和正常人皮肤中差异表达。然而,人类基因组的测序表明蛋白质编码基因只有20000-25000个,占基因组总序列的不到2%,而相当大一部分基因被转录成了非编码rna。lncrna被定义为长度大于200个核苷酸的序列,是转录水平最高的非编码rna之一。虽然许多lncrna的功能仍未确定,但越来越多的功能研究表明,它们具有重要的生物学作用。lncrna的作用机制多种多样,它们可以通过靶向基因组、顺式或反式调控以及反义干扰,在表观遗传、转录或转录后调控中发挥重要作用。此外,lncrna有潜力作为疾病诊断标志物和治疗靶点,对它们的研究将有助于开发新型靶向治疗药物。
2、针对银屑病的诊断标志物和治疗靶点,现有技术cn112646876a公开一种可用于银屑病诊断或辅助诊断的新的生物标志物,该生物标志物选自mirnahsa-let-7d-3p、hsa-mir-134-5p、hsa-mir-485-5p、hsa-mir-941和hsa-mir-1228-5p中的至少一种;可以应用于制备用于诊断或辅助银屑病的产品。cn106324259a涉及内源性的调节肽prokineticin2(简称pk2)作为银屑病生物标志物及其应用,发现pk2具有促进伤口愈合和银屑病发生的新的生物学功能,可以通过检测银屑病人血液和皮肤中pk2的表达作为检测银屑病发生或发展的生物标志物。
3、linc00665是一种长链非编码rna,现有技术中对其研究主要存在与癌细胞相关标志及治疗靶点,如:linc00665通过let7ihmga1促进肝癌细胞增殖与侵袭、linc00665通过靶向mir-708-5pdkk3抑制食管癌细胞的增殖;cn114836538a生物标志物在hbv相关肝癌诊断及预后中的应用;但是,对于linc00665与银屑病诊断标志物和治疗靶点等未有研究。
技术实现思路
1、本发明的目的在于,提供linc00665作为银屑病诊断标志物的应用,linc00665在皮肤组织中的相对表达值可用作银屑病诊断的有效参数,linc00665作为银屑病诊断标志物和治疗靶点上的应用。
2、为实现上述技术目的,达到上述技术效果,本发明是通过以下技术方案实现:
3、linc00665作为银屑病诊断标志物的应用。
4、进一步的,所述linc00665序列表如seq id no:1所示。
5、进一步的,所述linc00665在银屑病皮损组织中的表达水平显著低于正常皮肤;其auc值0.889(95%ci:0.801-0.976)、敏感性79%、特异性92%、临界值0.716;
6、进一步的,银屑病角质形成细胞模型中linc00665的表达水平亦显著降低。
7、本发明的另一目的在于,提供一种linc00665smartsilencer序列,序列如下:
8、aso-h-linc00665_001tcgactaccatgtgggtgcc;
9、aso-h-linc00665_002ggtgcaaagtgggaagtgtg;
10、aso-h-linc00665_003cgcactggcgctgatgtagt;
11、si-h-linc00665_001ggtgcaaagtgggaagtgt;
12、si-h-linc00665_002gggtgggaaattggccatt;
13、si-h-linc00665_003ccgtattgtctccagatta。
14、进一步的,所述linc00665smartsilencer序列可降低hacat细胞中linc00665的表达。
15、进一步的,所述linc00665smartsilencer抑制linc00665显著促进pcna和ki-67的mrna表达水平。
16、进一步的,所述linc00665smartsilencer抑制linc00665表达可促进角质形成细胞的增殖。
17、进一步的,所述linc00665smartsilencer抑制linc00665显著促进hacat细胞的增殖水平。
18、进一步的,所述linc00665smartsilencer抑制linc00665可促进角质形成细胞的细胞周期进程,发挥对角质形成细胞的增殖促进作用。
19、进一步的,所述linc00665smartsilencer抑制linc00665显著促进krt6、krt16和krt17的mrna表达,降低krt10的mrna表达水平,显著促进il-1β、il-6、il-8和tnf-α的mrna表达水平,抑制linc00665可促进银屑病的进程。
20、本发明的另一目的在于,提供一种银屑病诊断产品,所述产品为检测linc00665表达水平的产品。
21、进一步的,所述产品包括但不限于试剂盒、试剂、检测引物。
22、本发明的另一目的在于,提供一种抑制linc00665表达的产品,所述产品包含上述linc00665smartsilencer。
23、本发明的有益效果为:
24、本发明公开linc00665作为银屑病诊断标志物的应用,linc00665在银屑病皮损组织中的表达水平显著低于正常皮肤;其auc值0.889(95%ci:0.801-0.976)、敏感性79%、特异性92%、临界值0.716;linc00665在皮肤组织中的相对表达值可用作银屑病诊断的有效参数,linc00665作为银屑病诊断标志物和治疗靶点,同时,检测linc00665表达水平的产品可作为银屑病诊断产品;linc00665smartsilencer可为抑制linc00665表达的产品开发提供依据。
25、当然,实施本发明的任一产品并不一定需要同时达到以上所述的所有优点。
1.linc00665作为银屑病诊断标志物在制备银屑病诊断产品中的应用。
2.如权利要求1所述的linc00665作为银屑病诊断标志物在制备银屑病诊断产品中的应用,其特征在于:所述linc00665序列表如seq id no:1所示;所述linc00665在银屑病皮损组织中的表达水平显著低于正常皮肤。
3.一种linc00665smartsilencer序列,其特征在于:所述序列如下:
4.如权利要求3所述的linc00665smartsilencer序列在降低hacat细胞中linc00665的表达中的应用。
5.如权利要求3所述的linc00665smartsilencer序列的应用,其特征在于:包括在抑制linc00665显著促进pcna和ki-67的mrna表达水平中的应用;
6.如权利要求3所述的linc00665smartsilencer序列在抑制linc00665显著促进krt6、krt16和krt17的mrna表达,降低krt10的mrna表达水平,显著促进il-1β、il-6、il-8和tnf-α的mrna表达水平,促进银屑病的进程中的应用。
7.一种银屑病诊断产品,其特征在于:所述产品为检测linc00665表达水平的产品;
8.一种抑制linc00665表达的产品,其特征在于:所述产品包含上述linc00665smartsilencer。