与小麦不育小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用

本发明涉及一种分子标记及其应用，具体涉及一种与小麦不育小穗数主效qtl紧密连锁的分子标记及其在小麦辅助育种及遗传改良中的应用，属于小麦分子生物技术与育种。

背景技术：

1、小麦（ triticum aestivum l .）是三大谷物之一，其穗粒数、单位面积穗数、千粒重为构成产量的三要素，保证小麦的稳产高产是保护粮食安全的重要环节。研究显示，小穗数与穗粒数呈正相关，对小麦的产量影响较大，不育小穗数的产生导致穗粒数减少不育。穗部各性状间关系错综复杂，但结实小穗多、穗大粒大一直是小麦育种领域追求的重要目标。通过对不育小穗数进行qtl定位并开发与之紧密连锁的分子标记，可为小穗数遗传改良提供基因标记资源。

2、现与小麦穗部性状相关的qtl报道有200多篇，这些qtl分布于小麦21条染色体上，但是对于小麦不育小穗数的研究相对较少，与之相关的分子标记相对更少。因此，开发不育小穗数相关分子标记在小麦高产分子育种应用中具有重要的研究意义和价值。

技术实现思路

1、本发明的目的在于：提供一种与小麦不育小穗数主效qtl紧密连锁的分子标记 ssnps-7d7及其应用。

2、为了实现上述目标，本发明采用如下的技术方案：

3、一种用于鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状的引物对，为能够扩增得到如下dna片段的引物对：所述dna片段是以小麦科农9204、京411或其子代基因组dna为模板，采用如seq id no:1所示的上游引物和seq id no:2所示的下游引物进行pcr扩增所得的dna片段 ssnps-7d7，所述上游引物和下游引物均为单链dna分子，该dna片段 ssnps-7d7的核苷酸序列如seq id no:3所示，序列长度455bp。

4、前述的引物对在鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状中的应用。

5、利用前述的引物对鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状的方法，包括以下步骤：

6、步骤1：提取待测小麦品种或品系的基因组dna；

7、步骤2：以待测小麦品种或品系的基因组dna为模板，用seq id no:1所示的上游引物和seq id no:2所示的下游引物进行pcr扩增，得到pcr扩增产物；

8、步骤3：将得到的pcr扩增产物在6.0%的非变性聚丙烯酰胺凝胶上稳压电泳分离，如果出现了分子量大小为455bp的扩增片段，则该小麦品种或品系的不育小穗数较其他没有出现分子量大小为455bp的扩增片段的小麦品种或品系的不育小穗数多。

9、本发明的有益之处在于：

10、（1）本发明提供的分子标记 ssnps-7d7充分体现了小麦品种（系）的不育小穗数主效 qtl-qssnps-7d，以待测小麦品种（系）的基因组dna为模板，用seq id no:1所示的上游引物和seq id no:2所示的下游引物对小麦品种（系）进行pcr扩增，能够快捷且精准地判断小麦品种（系）是否具有不育小穗数主效 qtl-qssnps-7d，从而能够快速筛选出具有相对较少的不育小穗数的小麦品种（系），用于下一步育种研究，加快小麦高产新品种的选育进程；

11、（2）利用本发明提供的与小麦不育小穗数主效qtl紧密连锁的分子标记 ssnps-7d7辅助选育具有相对较少的不育小穗数的小麦品种（系）或鉴定小麦不育小穗数性状时，只需检测pcr扩增产物的特性，就可以辨别小麦不育小穗数主效 qtl-qssnps-7d基因位点的增效变异存在与否，从而预测小麦的不育小穗数表型，用于指导小麦产量性状改良的育种工作，除（1）中所述优点外，还具有以下优点：所鉴定材料受环境影响较小，选择目标明确，节约生产成本，小麦品种（系）的选择效率大大提高，直接实现了目标基因在小麦种质资源以及育种后代中鉴定的目的，为小麦育种提供更多新的不育小穗数基因标记资源。

技术特征：

1.用于鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状的引物对，其特征在于，为能够扩增得到如下dna片段的引物对：所述dna片段是以小麦科农9204、京411或其子代基因组dna为模板，采用如seq id no:1所示的上游引物和seq id no:2所示的下游引物进行pcr扩增所得的dna片段ssnps-7d7，所述上游引物和下游引物均为单链dna分子，该dna片段ssnps-7d7的核苷酸序列如seq id no:3所示，序列长度455bp。

2.权利要求1所述的引物对在鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状中的应用。

3.利用权利要求1所述的引物对鉴定小麦科农9204和京411及其子代不育小穗数性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：

技术总结
本发明公开了一种与小麦不育小穗数主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用，属于小麦分子生物技术与育种技术领域。其中，所述分子标记为Ssnps‑7D7，核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，序列长度455bp，可由SEQ ID NO:1所示的上游引物和SEQ ID NO:2所示的下游引物扩增得到。本发明提供的分子标记Ssnps‑7D7充分体现了小麦品种（系）的不育小穗数主效QTL‑qSsnps‑7D，其能够快捷且精准地判断小麦品种（系）是否具有不育小穗数主效QTL‑qSsnps‑7D，从而能够快速筛选出具有相对较少的不育小穗数的小麦品种（系），用于下一步育种研究，加快小麦高产新品种的选育进程。

技术研发人员：秦冉,刘志霄,郭浩儒,董一帆,管崇硕,徐宁浩,杨傲宇,田赵飒爽,董继梓,崔法,吴永振,赵春华,孙晗
受保护的技术使用者：鲁东大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/15