一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物及其应用的制作方法

本发明属于生物标志物诊断，具体涉及一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物及其应用。

背景技术：

1、结直肠腺瘤是一种常见的肠道疾病，被广泛认为是结直肠癌的前体病变。早期的筛查和检测结直肠腺瘤对于降低结直肠癌的发病率和死亡率至关重要。

2、目前，结直肠腺瘤的诊断主要依赖于结肠镜检查和组织病理学检测，然而，这些方法存在侵入性和不适合大规模筛查的局限性。因此，迫切需要一种非侵入性且高效准确的筛选方法，用于结直肠腺瘤的早期诊断。

技术实现思路

1、有鉴于此，本发明的目的在于提供一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物，根据肠道特定微生物的丰度可预测样本的结直肠腺癌的患病风险。

2、本发明提供了一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物，包括以下微生物：

3、甲烷短杆菌属(methanobrevibacter)、屎豆属菌(faecalitalea)、瘤胃球菌科(ruminococcus)dtu089菌属、毛霉菌属(erysipelatoclostridium)、turicibacter、candidatus soleaferrea、瘤胃梭菌属5(ruminiclostridium 5)、瘤胃球菌2(ruminococcus 2)、另枝菌属(alistipes)、霍尔德曼氏菌属(holdemania)、anaerotruncus、罕见小球菌属(subdoligranulum)、风疹菌属(tyzzerella)、伊格尔兹氏菌(eggerthella)、布鲁氏菌属(blautia)、霍氏真杆菌(eubacterium hallii group)、产粪甾醇真杆菌(eubacterium]coprostanoligenes group)、活泼瘤胃球菌(ruminococcusgnavus group)、coprococcus 3、ruminiclostridium 6、韦荣氏球菌属(veillonella)、anaerostipes、瘤胃球菌科(ruminococcaceae)ucg-004、无害牙胞梭菌(clostridiuminnocuum group)、butyricimonas、柯林斯菌属(collinsella)、链球菌属(streptococcus)、多尔氏菌属(dorea)、艾克曼菌属(akkermansia)、杆菌属(odoribacter)、family xiiiad3011 group、梭状芽胞杆菌(clostridium sensu stricto1)、艾森伯格菌(eisenbergiella)、疣微菌科(verrucomicrobiaceae)uba1819菌属、放线菌(actinomyces)、疣微菌属(ruminococcaceae ucg-005)、ruminococcaceae ucg-014、嗜胆菌属(bilophila)、普雷沃氏菌属9(prevotella 9)、萨特氏菌(sutterella)、毛螺菌属(lachnospira)、挑剔真杆菌(eubacterium eligens group)、毛螺菌科(lachnospiraceaeucg-004)、乳酸杆菌属(lactobacillus)、阴沟杆菌属(agathobacter)、埃希氏菌-志贺氏菌属(escherichia-shigella)、lachnoclostridium、梭杆菌属(fusobacterium)。

4、本发明提供了所述结直肠腺瘤肠道微生物标志物在构建结直肠腺瘤风险评估模型中的应用。

5、优选的，所述构建结直肠腺瘤风险评估模型的方法包括使用随机森林模型建模。

6、优选的，所述结直肠腺瘤风险评估模型的疾病风险评估标准如下：

7、当模型输出概率值≤0.3时，为结直肠腺瘤低风险；

8、当模型输出概率值＞0.3且＜0.8时，为结直肠腺瘤中风险；

9、当模型输出概率值≥0.8时，为结直肠腺瘤高风险。

10、本发明提供了所述结直肠腺瘤肠道微生物标志物在结直肠腺瘤患者饮食干预中的应用。

11、优选的，所述结直肠腺瘤患者饮食干预的食物组合物包括以下质量份的组分：

12、花生油28～30份、食盐2.5～3.5份、酸奶360～366份、绿豆24～26份、青鱼186～190份、生菜317～321份、草莓262～266份和燕麦片278～282份。

13、优选的，所述食物组合物包括以下质量份的组分：花生油29份、食盐3份、酸奶363份、绿豆25份、青鱼188份、生菜319份、草莓264份和燕麦片280份。

14、本发明提供了一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物，包括48种，是以40分位为下限，85分位为上限，筛选的结直肠腺瘤肠道微生物标志物。以所述微生物标志物为指标，使用随机森林模型构建结直肠腺瘤评估模型，结果表明，采用该组微生物标志物构建的评估模型比其他微生物集合构建的评估模在准确率和召回率方面均高，说明采用本发明保护的微生物标志物构建的评估模型在评估疾病患病风险方面具有更高的准确性。

技术特征：

1.一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物，其特征在于，包括以下微生物：

2.权利要求1所述结直肠腺瘤肠道微生物标志物在构建结直肠腺瘤风险评估模型中的应用。

3.根据权利要求2所述应用，其特征在于，所述构建结直肠腺瘤风险评估模型的方法包括使用随机森林模型建模。

4.根据权利要求2所述应用，其特征在于，所述结直肠腺瘤风险评估模型的疾病风险评估标准如下：

5.权利要求1所述结直肠腺瘤肠道微生物标志物在结直肠腺瘤患者饮食干预中的应用。

6.根据权利要求4所述应用，其特征在于，所述结直肠腺瘤患者饮食干预的食物组合物包括以下质量份的组分：

7.根据权利要求6所述应用，其特征在于，所述食物组合物包括以下质量份的组分：花生油29份、食盐3份、酸奶363份、绿豆25份、青鱼188份、生菜319份、草莓264份和燕麦片280份。

技术总结
本发明提供了一种结直肠腺瘤肠道微生物标志物及其应用，属于生物标志物诊断技术领域。结直肠腺瘤肠道微生物标志物是一组包括48类微生物的集合。本发明分别以不同的分位数筛选得到不同微生物集合，通过使用随机森林模型构建疾病模型来评估样本的结直肠腺瘤患病风险。采用本发明所保护的微生物标志物构建的评估模型比其他微生物集合构建的评估模在准确率和召回率方面均较高，说明采用本发明保护的微生物标志物构建的评估模型在评估疾病患病风险方面具有更高的准确性。

技术研发人员：叶朋朋,陈晓春,吴右叶,宋锡淇
受保护的技术使用者：广西爱生生命科技有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/5/8