PRLR基因中分子标记g.39080534G>A在检测山羊产羔数性状中的应用

本发明属于山羊分子标记辅助选择，具体涉及prlr基因中分子标记g.39080534g＞a在检测山羊产羔数性状中的应用。

背景技术：

1、我国山羊饲养历史悠久，是常见的居民肉食来源。羊肉具有健康、安全的营养特性，随着消费者对于健康饮食要求的不断增长，使得羊肉在肉类消费中的比重不断上升。提高羊肉年产量最直接的方法便是增加产羔个数，故研究如何通过选育来提高山羊产羔性能，对于提升山羊生产繁殖效益具有十分重要的意义。

2、标记辅助选择(marker assisted selection，mas)是在动物分子遗传学和现代分子生物技术的飞速发展下诞生的一种以遗传变异为原理，用来寻求提高动物遗传力方法的一种现代分子技术。目前，可用于遗传学研究的分子标记方法有生化标记和dna标记两种，但生化标记存有许多限制，所以dna标记法成为了基因遗传研究中广受欢迎的方法。dna分子标记法是在dna水平上分析的遗传标记，这些标记被用来分析物种、群体和个体之间的遗传多态性以及识别与动物经济价值性状密切相关的分子标记。

3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)是指基因组中存在的单个核苷酸的突变，这些突变可以导致核苷酸序列的多样性。单核苷酸多态性(snp)的特点包括位点多样性、广泛分布、遗传稳定性高、代表性强、易于检测、分析快捷。因此，借助snp对山羊优良性状进行辅助选择，将有利于我国山羊产业的可持续发展。pcr-rflp是一种可对多态性位点进行基因分型的技术，其原理是扩增不同个体同一dna序列时，由于碱基突变引起限制性内切酶识别位点发生变化，存在多态性的dna序列在内切酶作用后可产生不同的dna序列片段，经电泳可将大小不同的条带分开，从而可完成各基因型的鉴定。

4、催乳素受体(prlr)是催乳素(prl)的特异性受体，属于催乳素受体超家族的一员，通过与prl结合调控雌性动物繁殖性能，该基因的突变会影响雌性动物到达初情期的年龄。prlr基因首先在大鼠上被发现，紧接着在小鼠上也被发现，学者们对其他动物的prlr基因进行了克隆，如在猴、牛、马、猪、鸡、鹅等动物上也发现了prlr基因。国内外研究人员就prlr基因对畜禽泌乳和繁殖性状的影响展开大量研究。如prlr基因侧翼区一处snp突变与疆岳驴平均泌乳量和乳蛋白显著相关，可作为乳用型疆岳驴选育的有效dna标记。此外，prlr基因也可作为羔产仔数和海门山羊选育的重要候选基因。迄今为止，尚无有关山羊prlr基因作为楚宝黑头羊产羔性状的分子标记的研究的相关报道。

技术实现思路

1、本发明的目的在于提供一种prlr基因中的分子标记在检测山羊产羔数性状中的应用，该应用可以辅助选育山羊产羔数性状。

2、为了实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

3、本发明提供了prlr基因中的分子标记在检测山羊产羔数性状中的应用，所述分子标记山羊为基因组capra hircusars1中g.39080534处g＞a碱基突变。

4、本发明还提供了一种山羊prlr基因中的分子标记在检测山羊产羔数性状的应用，所述分子标记为山羊基因组中如seq id no:1所示序列的5’端第317位g＞a碱基突变。

5、本发明提供了一种检测山羊产羔数性状的方法，所述方法包括检测山羊基因组capra hircusars1中g.39080534位点处g＞a碱基突变。

6、本发明提供了一种检测山羊产羔数性状的方法，所述方法包括检测山羊基因组中如seq id no:1所示序列的5’端第317位g＞a碱基突变。

7、优选的，上述检测方法包括利用引物对进行pcr扩增，所述引物对的序列如seq idno:2-3所示。

8、优选的，所述pcr扩增的反应程序为：98℃预变性45s；98℃变性10s；退火温度设置为55℃，时长为30s；72℃延伸25s；变性、退火、延伸的循环数为34次；72℃终延伸5min。

9、优选的，上述检查方法还包括酶切分型，所述酶切分型是将seq id no:1所示的核苷酸序列用限制性内切酶bmgb i进行酶切处理。

10、优选的，酶切后的产物经2％的琼脂糖凝胶电泳检测。

11、本发明还提供了一种检测山羊产羔数的试剂盒，包括如seq id no.2～3所示的引物对。

12、优选的，所述山羊为楚宝黑头羊。

13、有益效果：

14、本发明山羊prlr基因中的分子标记，可用于检测山羊产羔数性状，辅助选育产羔数较多的山羊，可以显著提高育种效率。此外，本发明检测山羊产羔数性状的方法检出率高、耗时短，便于产业应用。

技术特征：

1.prlr基因中的分子标记在检测山羊产羔数性状中的应用，其特征在于，所述分子标记是山羊基因组capra hircusars1中g.39080534处g>a碱基突变。

2.山羊prlr基因中的分子标记在检测山羊产羔数性状的应用，其特征在于，所述分子标记为山羊基因组中如seq id no:1所示序列的5’端第317位g>a碱基突变。

3.一种检测山羊产羔数性状的方法，其特征在于，所述方法包括检测山羊基因组caprahircusars1中g.39080534位点处g>a碱基突变。

4.一种检测山羊产羔数性状的方法，其特征在于，所述方法包括检测山羊基因组中如seq id no:1所示序列的5’端第317位g>a碱基突变。

5.根据权利要求4所述方法，其特征在于，所述检测方法包括利用引物对进行pcr扩增，所述引物对的序列如seq id no:2-3所示。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述pcr扩增的反应程序为：98℃预变性45s；98℃变性10s；退火温度设置为55℃，时长为30s；72℃延伸25s；变性、退火、延伸的循环数为34次；72℃终延伸5min。

7.根据权利要求4所述方法，其特征在于，所述检测方法还包括酶切分型，所述酶切分型是将seq id no:1所示的核苷酸序列用限制性内切酶bmgb i进行酶切处理。

8.根据权利要求7所述方法，其特征在于，所述检测方法还包括，酶切后的产物经2％的琼脂糖凝胶电泳检测。

9.一种检测山羊产羔数性状的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括如seq id no.2～3所示的引物对。

10.根据权利要求1-9任一项所述应用、方法、试剂盒，其特征在于，所述山羊为楚宝黑头羊。

技术总结
本发明属于山羊分子标记辅助选择技术领域，具体涉及PRLR基因中分子标记g.39080534G>A在检测山羊产羔数性状中的应用。本发明山羊PRLR基因中的分子标记，可用于检测山羊产羔数性状，辅助选育产羔数较多的山羊，可以显著提高育种效率。实施例结果表明，g.39080534G＞A位点GG基因型母羊个体，能够获得更多的产羔数。此外，本发明检测山羊产羔数性状的方法检出率高、耗时短，便于产业应用。

技术研发人员：熊琪,马开宇,张年,张凤,上官爱哨,陶虎
受保护的技术使用者：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/6/5