本发明涉及蜜蜂培育,尤其涉及一种分子标记及其在检测蜜蜂翅脉角a4性状中的应用。
背景技术:
1、中华蜜蜂( apis cerana,简称“中蜂”)是一种具有重要的生态和经济价值的蜜蜂资源,其具备适应性强、分蜂性强、抗病性强、耐寒耐热以及善于造脾等优点。中华蜜蜂的采蜜效率受到多种因素影响,例如蜜蜂的口器结构、采集技巧,花蜜的浓粘度和花冠深度,还有蜜蜂的飞行时间和距离等,提高蜜蜂的飞行效率可以缩短蜜蜂到达目的地的时间,提高蜜蜂的采集效率。
2、蜜蜂的飞行效率由多种因素影响,除了气候因素(例如温度)、流蜜强度、蜜蜂群势等因素之外,蜜蜂本身的生理构造也是关键因素之一。蜜蜂翅脉角a4性状是蜜蜂翅膀上的特定翅脉结构,它是昆虫翅膀上的一个特征性标志。在昆虫的翅膀上,翅脉(vein)对翅的表面起支撑作用,蜜蜂翅脉角a4的大小与其飞行效率密切相关,较小的蜜蜂翅脉角a4性状可能导致蜜蜂的飞行效率降低,因此对于蜜蜂翅脉角a4性状的研究在蜜蜂育种中具有重要价值。
技术实现思路
1、为了解决现有技术存在的问题,本发明提供一种分子标记及其在检测蜜蜂翅脉角a4性状中的应用。
2、第一方面,本发明提供一种分子标记,所述分子标记包括如seq id no.1所示的核苷酸序列,序列第179位具有多态性,多态性为c/t。
3、如seq id no.1所示的核苷酸序列如下:
4、tttcccacctcccaattttcgatattgcaatttgcaaattgccgattaattaagccgattaattttggctcgtttaaattgcactttatcgtgttagcgttaattatcgactaaagtggcattagaacgaaatacgtttcgagaaacgtacattaattaatattatcctttaaagataccattaggaataatatatatcgaattatctcgttttattagaatacttgtggatttttttcgaatctcgcacattagtctaaagatagaaggaaccgcgtatctcatcaccggaagaagcat
5、第二方面,本发明提供一种kasp引物组合,所述kasp引物组合用于扩增前述分子标记;所述kasp引物组合包括:
6、f1:cgtacattaattaatattatcctttaaagatac,
7、f2:cgtacattaattaatattatcctttaaagatat,
8、r:aaaacgagataattcgatatatattattcct。
9、如上引物的序列为5’至3’。
10、进一步地,所述f1和f2分别携带不同的荧光标记,所述荧光标记包括:fam、tet、hex、rox、cy3、cy5、alexa fluor、sybr green、dapi、fitc或texas red中的一种或多种。
11、例如在f1在5’连接gaaggtgaccaagttcatgct(fam),f2在5’连接gaaggtcggagtcaacggatt(hex)。
12、第三方面,本发明提供一种试剂盒,包括前述分子标记,或前述kasp引物组合。
13、第四方面,本发明提供所述的分子标记,或所述的kasp引物组合,或所述的试剂盒在检测蜜蜂的翅脉角a4性状中的应用。
14、本发明进一步提供所述的分子标记,或所述的kasp引物组合,或所述的试剂盒在下任一中的应用:
15、i)培育高飞行效率的转基因蜜蜂;
16、ii)蜜蜂种质资源的飞行效率改良;
17、iii)蜜蜂的分子标记辅助育种。
18、进一步地,所述蜜蜂为东方蜜蜂,优选为中华蜜蜂。
19、第五方面,本发明提供一种检测蜜蜂的飞行效率的方法,包括:检测待测蜜蜂所述分子标记的多态性,根据检测结果判断所述待测蜜蜂的翅脉角a4性状。
20、进一步地,包括:提取所述待测蜜蜂的基因组dna,采用前述kasp引物组合进行pcr扩增,根据扩增结果判断所述待测蜜蜂的飞行效率。
21、进一步地,以总体系为25μl计,所述扩增的体系包括:
22、模板dna 1~2μl、上游引物1~2μl、下游引物1~2μl、dntp mix 1~2μl、10×taqbuffer 2~4μl、taq酶 0.2~0.4μl,余量为水。
23、所述扩增的程序包括:
24、95℃预变性5~10min;
25、92~96℃变性30~60s,62~65℃退火30~60s,70~74℃延伸30~60s,循环10~15次,每次退火温度下降0.4~0.6℃;
26、93~96℃变性30~60s,56~60℃退火30~60s,70~74℃延伸30~60s,循环25~35次;
27、70~74℃修复延伸10~15min。
28、进一步地,采用基因测序的方法检测所述扩增产物第179位的核苷酸多态性,检测结果tt基因型的蜜蜂相较于检测结果为ct的蜜蜂具有更小的翅脉角a4性状。
29、本发明具备如下有益效果:
30、本发明采用多只蜜蜂的生理性状和基因组数据进行关联性分析,筛选得到多个和生理性状相关的snp位点,以其中一个与蜜蜂的翅脉角a4性状的snp位点作为分子标记开发了相应的检测引物。通过该snp位点的多态性检测,可以反映出蜜蜂的翅脉角a4性状,进而可以将其应用于选育较大的翅脉角a4性状蜜蜂,提高蜜蜂的飞行效率,具有重要的意义。
1.一种分子标记,其特征在于,所述分子标记包括如seq id no.1所示的核苷酸序列,序列第179位具有多态性,多态性为c/t。
2.一种kasp引物组合,其特征在于,所述kasp引物组合包括:
3.一种试剂盒,其特征在,包括权利要求1所述的分子标记,或权利要求2所述的kasp引物组合。
4.权利要求1所述的分子标记,或权利要求2所述的kasp引物组合,或权利要求3所述的试剂盒在检测蜜蜂的翅脉角a4性状中的应用。
5.权利要求1所述的分子标记,或权利要求2所述的kasp引物组合,或权利要求3所述的试剂盒在如下任一中的应用:
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,所述蜜蜂为东方蜜蜂,优选为中华蜜蜂。
7.一种检测蜜蜂的飞行效率的方法,其特征在于,包括:检测待测蜜蜂如权利要求1所述分子标记的多态性,根据检测结果判断所述待测蜜蜂的翅脉角a4性状。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,包括:提取所述待测蜜蜂的基因组dna,采用权利要求2所述的kasp引物组合进行pcr扩增,根据扩增结果判断所述待测蜜蜂的飞行效率。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,以总体系为25μl计,所述扩增的体系包括:
10.根据权利要求8或9所述的方法,其特征在于,采用基因测序的方法检测所述扩增产物第179位的核苷酸多态性,检测结果tt基因型的蜜蜂相较于检测结果为ct的蜜蜂具有更小的翅脉角a4性状。