一种基于Atg8完全进入液泡时长的土壤内可利用氮素的检测方法

文档序号:8222169阅读:418来源:国知局
一种基于Atg8完全进入液泡时长的土壤内可利用氮素的检测方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于细胞生物学和土壤学领域,涉及一种新的土壤内可利用氮素的测定方 法,更准确地说本发明涉及一种基于Atg8完全进入液泡时长的土壤内可利用氮素的检测 方法。
【背景技术】
[0002] 土壤养分参数(主要为氮、磷、钾及有机质含量)是土壤肥力的重要指标,反映了 土壤供给作物生长的能力;其中氮素是作物最重要的结构物质,也是酶的主要成分,所以氮 素对作物生理代谢和生长有重要作用。作物可利用的土壤内中主要氮素形式是铵态氮和硝 态氮;氮素的不同形态会对作物生理代谢过程和生长产生不同的影响。目前公认的土壤内 氮素营养诊断都是以实验室常规测试为主,取样、测定、数据分析等繁琐的过程需要耗费大 量的人力、物力,且未考虑氮素营养的多寡对其内生物的影响。
[0003] 细胞自噬(autophagy)是溶酶体(酵母中为液泡)参与的胞内物质代谢的过程, 是真核生物维持细胞稳态和保持健康的一类亚细胞降解途径,在真核生物中是保守的。目 前了解比较多的细胞自调控通路主要有两条:TOR(Targetofrapamycin)通路和磷脂酰 肌醇3-激酶(PI3K,Phosphoinositide3-kinase)通路,很多其他自途径都直接或间接 通过这两条通路发挥作用;Tor是细胞自噬的负调控因子,能特异性的响应胞内氮素水平, 在营养丰富的条件下,Tor激酶处于活性状态,此时细胞自噬受到抑制,而在营养缺乏等外 界条件下,Tor激酶失活而自噬活性上升;在可利用氮素营养缺乏的条件下,细胞内相关物 质会运往液泡进行降解,因而可以根据真核生物模式生物酿酒酵母耗尽培养基中的可利用 氮素,并且启动细胞自噬,从而将自噬相关蛋白如Atg8运往液泡的时间长短来建立模型和 检测土壤内氮素水平。
[0004] 目如国内外相关研宄还未有涉及该方面的成果,因而利用焚光标记的自相关蛋 白完全进入液泡的时长,可以有效的推测土壤内可利用氮素的水平。基于此,可以进行相关 技术方法的改进和测试设备的研制,具有重要的理论和现实意义。

【发明内容】

[0005] 为了解决土壤内氮素营养多寡未考虑其内生物的问题,基于细胞自噬与氮素营养 的关系,本发明提供了一种新颖的测试土壤内氮素营养的方法,即:在一定培养基中,一定 浓度的酿酒酵母细胞耗尽可利用氮素并启动细胞自噬,从而导致GFP-Atg8完全进入液泡, 根据这个过程的时长来推算土壤内可利用氮素的量。
[0006] 为解决上述问题,本发明是通过以下技术方案实现的:
[0007] (1)酿酒酵母菌株Atg8蛋白的荧光标记和相应数量关系模型的建立:自噬相关蛋 白Atg8被GFP标记酿酒酵母菌株的特征在于,可以通过荧光显微镜方便观察到Atg8的分 布情况,当培养液中氮素营养缺乏时,GFP-Atg8会送往液泡降解;而在营养丰富的条件下, GFP-Atg8会弥散在细胞质中。在不同氮素水平下,一定浓度的酵母细胞耗尽培养液中的氮 素从而启动细胞自噬所用的时间会有所不同,据此可建立氮素水平与GFP-Atg8降解为分 离的GFP和Atg8时长之间的关系。
[0008] (2)所用菌株细胞的培养技术:酵母细胞在SD-Ura等培养基中培养至对数期 OD_~ 1. 0时,取约30mL培养液经离心、洗涤后转入不同氮素水平的培养基中,并开始记录 时间,对培养不同时长的细胞进行显微荧光拍照,根据所得结果建立氮素水平与GFP-Atg8 完全转入液泡的时长之间的关系模型;并根据土壤水萃液作为唯一氮源的培养基中酵母细 胞相应的时长,推算土壤内可利用氮素的量。
[0009] 本发明的有益效果是:一种基于Atg8完全进入液泡时长的土壤内可利用氮素的 检测方法,操作简单、成本低廉,可真实反映生物对土壤内可利用氮素的响应情况。
【附图说明】
[0010] 图1是在细胞转入相同氮素水平不同时长条件下GFP-Atg8分布情况的显微荧光 照片图。
[0011] 图2是不同氮素水平相同时长条件下GFP-Atg8转换为Atg8的western-blot示 意图。
【具体实施方式】
[0012] (l)Atg8蛋白的荧光标记:利用酿酒酵母基因库关于Atg8的基因信息,设计上下 游引物,对Atg8序列片段进行扩增;对扩增的产物和含GFP的载体进行酶切、纯化、连接等 分子生物学操作,然后整合至所用的酿酒酵母基因组。
[0013] (2) 土壤测试样品水萃液的获取:对所测试区域进行采样,经干燥、研磨、过筛等 步骤,取lg待测土样,与10mL去离子水在摇床上lOOrpm振荡24h得到土壤水萃液,然后高 速离心5min,取上清液,高温灭菌后备用。
[0014] (3)氮素水平与GFP-Atg8转化为Atg8时长之间关系模型的建立:将自噬相 关蛋白Atg8已被GFP荧光蛋白标记的酵母细胞在50mL液体SD-Ura培养基中培养至 0D600 ~ 1. 0时,取30mL培养液经离心、无菌水洗涤后,转入不同氮素水平的液体培养基 中,通过显微荧光观察确定GFP-Atg8完全运往液泡的时间。如附图1所示,在初始阶段, 由于氮素营养丰富,GFP-Atg8分布在细胞质中(如图1①所示),未有运往液泡的迹象;随 着氮素营养的消耗,GFP-Atg8有向液泡集中的趋势(如图1②所示);在氮素营养完全耗 尽的条件下,酿酒酵母细胞启动细胞自噬,GFP-Atg8由细胞质运往液泡(如图1③所示); 据此可以得到氮素水平和GFP-Atg8完全运往液泡时长之间的关系模型。同样,在不同氮 素水平相同时间条件下,GFP-Atg8与分离的GFP或Atg8间的比例也有所不同(如图2所 示),图2?所示为加样对照;细胞在不同氮素水平的培养基中培养一定时间后,取样进行 western-blot,可以得到氮素水平与GFP-Atg8分布状态的示意图(如图2):在氮素营养丰 富的条件下(图2⑥所对应的一列),主要是以GFP-Atg8 (如图2⑨所对应)的形式存在, 而在氮素营养完全缺失的条件下(图2⑧所对应的一列),则主要以分离的GFP或Atg8的 形式(如图2⑩所对应)存在,在其他氮素营养梯度下(如图2⑦所对应),则分离形式的 GFP或Atg8 (即进入液泡部分)呈现一定的变化规律;因而从显微焚光及western-blot的 结果来看,培养基的氮素水平与GFP-Atg8完全降解为分离的GFP和Atg8的时长之间存在 一定的关系t吴型。
[0015] (4)测算样品的可利用氮素含量:以步骤(2)所获取的土壤水萃液作为唯一氮源, 进行细胞的培养,培养条件完全同步骤(3),根据显微荧光观察得到GFP-Atg8完全进入液 泡内的时长;然后根据步骤(3)所建立的关系模型,计算所测试土壤样品的可利用氮素含 量。
[0016] 以上已以较佳实施公开了本发明,然其并非用以限制本发明,凡采取等同替换或 等效变换所获得的技术方案,均落在本发明的保护范围内。
【主权项】
1. 一种基于At妍完全进入液泡时长的±壤内可利用氮素的检测方法,其特征在于: 建立可利用氮素水平与酵母菌株细胞中巧光标记At妍蛋白完全进入液泡的时长之间的关 系;收集Ig待测±壤,与lOmL去离子水在摇床上1(K)巧m振荡2化得到±壤水萃液,然后高 速罔屯、5min,取上清浓,局温灭园后备用;将自瞻相关蛋白At妍已被绿色夾光蛋白柄;记的 酵母细胞在50mL液体SD-Ura培养基中培养至ODe。。^ 1. 0时,取30mL培养液经离屯、、无菌 水洗漆后转入W无菌的上清液为唯一氮源的培养基中;分不同时间点,取样观察At妍是否 完全进入液泡,检测GFP-At妍完全转为At妍的时长;并根据所建立的关系推算±壤内可利 用氮素的量。
2. 根据权利要求1所述的一种基于At妍完全进入液泡时长的±壤内可利用氮素的 检测方法,其特征在于:所述的关系是可利用氮素水平与GFP-At妍进入液泡转化为分离的 GFP和At妍时长之间的关系。
3. 根据权利要求1所述的一种基于At妍完全进入液泡时长的±壤内可利用氮素的检 测方法,其特征在于;所述的检测方法是利用所测试±壤水萃液作为唯一氮源,进行细胞培 养,根据GFP-At妍完全进入液泡降解为分离的GFP和At妍的时长推算±壤内可利用氮素 的含量。
【专利摘要】本发明的一种基于Atg8完全进入液泡时长的土壤内可利用氮素的检测方法,是由酿酒酵母菌株细胞自噬相关蛋白Atg8的荧光标记、土壤水萃液的获取、酿酒酵母在营养丰富培养基和不同氮素量培养基的培养、模型的建立和土壤内可利用氮素的推算等步骤组成,其特征在于:一定浓度的酿酒酵母细胞耗尽培养基中的可利用氮素,从而启动细胞自噬,并将GFP标记的Atg8完全运往液泡进行降解的时长会因氮素量的不同而不同,据此可以建立标准模型和推算未知土壤内可利用氮素的量。该方法操作简单、成本低廉、可真实反映生物对土壤内可利用氮素的响应情况。
【IPC分类】G01N21-64
【公开号】CN104535551
【申请号】CN201510010159
【发明人】刘玉涛, 朱奇, 尚帅楠, 丁为民
【申请人】南京农业大学
【公开日】2015年4月22日
【申请日】2015年1月5日
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