技术特征:
1.一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,包括以下步骤:获取ct结肠影像数据集并进行标注,得到带标注的ct影像数据集;对带标注的ct结肠影像数据集进行预处理,得到预处理后的ct影像数据集;基于预处理后的ct影像数据集训练预构建的3d inception网络和改进的u
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net网络,并以训练好的3d inception网络辅助训练改进的u
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net网络,得到训练完成的dm
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unet网络;获取待测图像并基于训练完成的dm
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unet网络进行预测,得到结肠内容物标注。2.根据权利要求1所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述获取ct结肠影像数据集并进行标注,得到带标注的ct影像数据集这一步骤,其具体包括:获取ct结肠影像数据集并采用karl 3d迭代重建法进行图像重建,得到重建影像数据集;基于itk
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snap对重建影像数据集进行标注,并以颜色区分结肠空腔区域和结肠内容物,得到带标注的ct影像数据集。3.根据权利要求2所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述对带标注的ct结肠影像数据集进行预处理,得到预处理后的ct影像数据集这一步骤,其具体包括:基于2d resnet网络识别感兴趣区域,去除从腿部到直肠的区域、从降结肠与横结肠交界处到胸腔的区域,得到感兴趣区域;将感兴趣区域中的结肠内容物标注与结肠空腔标注合并;基于灰度值先验知识与区域生长算法对标注边缘进行填充,得到预处理后的ct影像数据集。4.根据权利要求3所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述基于预处理后的ct影像数据集训练预构建的3d inception网络和改进的u
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net网络,并以训练好的3d inception网络辅助训练改进的u
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net网络,得到训练完成的dm
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unet网络这一步骤,其具体包括:基于预处理后的ct影像数据集训练3d inception网络,得到训练完成的3d inception网络;所述3d inception采用relu作为激活函数,对数据进行批标准化、拼接操作,并将四条子路的输出合并;基于预处理后的ct影像数据集训练改进的u
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net网络并以训练好的3d inception网络辅助训练,得到训练完成的dm
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unet网络;所述训练完成的dm
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unet网络包括编解码结构和边缘检测机制。5.根据权利要求4所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述3d inception网络的损失函数公式如下:上式中,θ表示可训练的网络参数,l(θ)表示损失函数,n表示样例总数,i{
·
}表示指示函数,y
(j)
表示第j层横断面的目标输出值,表示第j层横断面的实际输出值,c表示目标分割区域,p表示输入,表示实际输出y
(j)
属于目标分割区域的估计概率。
6.根据权利要求5所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述训练完成的dm
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unet网络的工作步骤如下:对输入ct影像进行四层编码,得到压缩的特征图;对压缩的特征图进行四层解码,并将同层的特征图进行拼接;通过一个1*1卷积输出预测区域;在dm
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unet外部引入边缘检测机制,通过canny算子检测ct影像数据中的横断面、实际输出与目标输出,得到实际输出边缘图与目标输出边缘图。7.根据权利要求6所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述dm
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unet网络的损失函数为:上式中,l
dice
表示dice损失函数,n表示样例总数,p
i
表示第i个像素点的目标输出,y
i
表示第i个像素点的实际输出,γ为平滑系数,实际取0.0001。8.根据权利要求7所述一种ct结肠影像内容物的标注方法,其特征在于,所述获取待测图像并基于训练完成的dm
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unet网络进行预测,得到结肠内容物标注这一步骤,其具体包括:获取待测图像并输入至训练完成的dm
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unet网络;基于dm
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unet网络识别出待测图像的标注区域和异常区域;遍历与标注区域对应的输入横断面的每个像素点,并根据预设的灰度阈值区分结肠内容物与结肠空腔两类标注。9.一种ct结肠影像内容物的标注系统,其特征在于,包括:标注模块,用于获取ct结肠影像数据集并进行标注,得到带标注的ct影像数据集;预处理模块,用于对带标注的ct结肠影像数据集进行预处理,得到预处理后的ct影像数据集;网络训练模块,用于基于预处理后的ct影像数据集训练预构建的3d inception网络和改进的u
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net网络,并以训练好的3d inception网络辅助训练改进的u
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net网络,得到训练完成的dm
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unet网络;应用模块,用于获取待测图像并基于训练完成的dm
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unet网络进行预测,得到结肠内容物标注。
技术总结
本发明公开了一种CT结肠影像内容物的标注方法及系统,该方法包括:获取CT结肠影像数据集并进行标注;对带标注的CT结肠影像数据集进行预处理;基于预处理后的CT影像数据集训练预构建的3D Inception网络和改进的U
技术研发人员:王国利 刘洋旗 郭雪梅
受保护的技术使用者:中山大学
技术研发日:2021.07.09
技术公布日:2021/9/9