碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质与流程

文档序号:35668010发布日期:2023-10-07 12:16阅读:40来源:国知局
碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质与流程

本申请涉及基因测序,尤其涉及一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质。


背景技术:

1、随着科技的不断发展,高通量测序俨然已经成为了基因测序的核心技术手段,在基因序列的碱基簇与荧光染料进行化学反应后,通过微型照相机可对生成的荧光簇进行拍摄得到相应的荧光图像,再基于碱基簇亮度值识别出隶属于不同簇的碱基,其中,对于碱基的识别是实现高精度基因测序的重要环节之一。

2、碱基识别即提取出荧光图像中碱基簇的亮度,而碱基簇亮度通常由测量亮度减去背景亮度得到,所以,在荧光图像中提取出背景亮度便可得到碱基簇亮度,目前,通常将荧光图像中的荧光簇区域和背景区域进行分割,再对背景区域进行全局平均,以得到背景亮度,但是,由于对荧光图像进行分割需要对荧光图像中的所有像素点进行计算阈值,而高复杂度的计算量将导致计算耗时长,进而使得易出现限制测序通量的情况,所以,当前对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低。


技术实现思路

1、本申请的主要目的在于提供一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质,旨在解决现有技术中对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低的技术问题。

2、为实现上述目的,本申请提供一种碱基簇亮度检测方法,所述碱基簇亮度检测方法包括:

3、在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,其中,所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇;

4、根据所述局部背景像素点,确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值;

5、根据所述背景亮度值,对所述待检测碱基簇进行亮度检测,得到亮度检测结果。

6、为实现上述目的,本申请还提供一种碱基簇亮度检测装置,所述碱基簇亮度检测装置包括:

7、选取模块,用于在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,其中,所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇;

8、确定模块,用于根据所述局部背景像素点,确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值;

9、检测模块,用于根据所述背景亮度值,对所述待检测碱基簇进行亮度检测,得到亮度检测结果。

10、本申请还提供一种电子设备,所述电子设备包括:至少一个处理器以及与所述至少一个处理器通信连接的存储器,所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令,所述指令被所述至少一个处理器执行,以使所述至少一个处理器能够执行如上述的碱基簇亮度检测方法的步骤。

11、本申请还提供一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质上存储有实现碱基簇亮度检测方法的程序,所述碱基簇亮度检测方法的程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度检测方法的步骤。

12、本申请还提供一种计算机程序产品,包括计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现如上述的碱基簇亮度检测方法的步骤。

13、本申请提供了一种碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质,也即,在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,其中,所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇;根据所述局部背景像素点,确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值;根据所述背景亮度值,对所述待检测碱基簇进行亮度检测,得到亮度检测结果。

14、本申请在携带待检测检测簇的目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,进而通过局部背景像素点确定待检测碱基簇对应的背景亮度值,即可通过局部背景像素点确定目标碱基簇图像的图像整体背景亮度,最终通过背景亮度值对待检测碱基簇的进行亮度检测,也即,在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,进而通过局部背景像素点得到待检测碱基簇的亮度检测结果。

15、由于局部背景像素点即可对待检测碱基簇进行亮度检测,即,减少了在检测待检测碱基簇亮度时所提取的背景像素点数量,与此同时,局部背景像素点是在目标碱基簇图像的全局像素点中选取得到的,也即,在检测待检测碱基簇亮度时无需对携带待检测碱基簇的目标碱基簇图像进行图像分割,所以,简化了在对待检测碱基簇进行亮度检测时的检测流程,即可实现基于局部像素点所确定的背景亮度值对待检测碱基簇进行亮度检测的目的。

16、基于此,本申请通过在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,进而通过局部背景像素点确定待检测碱基簇对应的背景亮度值,最终通过背景亮度值得到待检测碱基簇的亮度检测结果,从而实现了通过目标碱基簇图像中的局部背景像素点对待检测碱基簇进行亮度检测的目的,即,克服了由于对荧光图像进行分割需要对荧光图像中的所有像素点进行计算阈值,而高复杂度的计算量将导致计算耗时长,进而使得易出现限制测序通量的情况的技术缺陷,所以,提升了对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低。



技术特征:

1.一种碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述碱基簇亮度检测方法包括:

2.如权利要求1所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点的步骤包括:

3.如权利要求2所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述通过在所述整体亮度离散图像的全局像素点中进行亮度排序,得到所述局部背景像素点的步骤包括:

4.如权利要求3所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述像素点序列包括局部像素点序列和全局像素点序列,

5.如权利要求4所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述在所述单元碱基簇图像的单元全局像素点中提取局部像素点,包括:

6.如权利要求4所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述在所述单元碱基簇图像的单元全局像素点中提取局部像素点,包括:

7.如权利要求2所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述待检测碱基簇图像为所述整体亮度均匀图像,

8.如权利要求2所述碱基簇亮度检测方法,其特征在于,所述待检测碱基簇图像为所述整体亮度离散图像,

9.一种电子设备,其特征在于,所述电子设备包括:

10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质上存储有实现碱基簇亮度检测方法的程序,所述实现碱基簇亮度检测方法的程序被处理器执行以实现如权利要求1至8中任一项所述碱基簇亮度检测方法的步骤。


技术总结
本申请公开了碱基簇亮度检测方法、电子设备及可读存储介质,应用于基因测序技术领域,所述碱基簇亮度检测方法包括:在目标碱基簇图像的全局像素点中选取局部背景像素点,其中,所述目标碱基簇图像携带待检测碱基簇;根据所述局部背景像素点,确定所述待检测碱基簇对应的背景亮度值;根据所述背景亮度值,对所述待检测碱基簇进行亮度检测,得到亮度检测结果。本申请解决了对于碱基簇进行亮度检测的检测效率低的技术问题。

技术研发人员:刘德健
受保护的技术使用者:中元汇吉生物技术股份有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/1/15
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