本发明涉及基因检测,尤其涉及一种基因测序芯片的拍摄方法及基因测序仪。
背景技术:
1、基因测序是一种新型基因检测技术,通常是测序平台,生化反应测序样品和基因测序芯片配合使用来完成测序的,基因测序芯片是基因测序的重要载体和关键部件,其表面经过一定修饰后,能够将dna固定在其表面。然后待测dna在基因测序芯片表面发生一系列生化反应,可由相关仪器检测得到待测dna序列信息。
2、在基因测序过程中,需要按照预设的步进长度对基因测序芯片进行多轮拍摄,为了保证检测结果的准确性,需要在基因测序芯片上设置定位标,以在对基因测序芯片进行拍摄时通过定位标对相机进行定位,而现有的定位标通常设置在基因测序芯片的整个测试面上,从而使定位标占用基因测序芯片的信息区域,造成基因测序芯片的可用信息区域变少,同时还提高了基因测序芯片的制造成本。
技术实现思路
1、本申请实施例提供一种基因测序芯片的拍摄方法及基因测序仪,旨在解决由于现有的基因测序芯片可用信息区域少而导致的在拍摄过程中获取到的用于基因测序的信息少的问题。
2、第一方面,本申请实施例提供一种基因测序芯片的拍摄方法,所述基因测序芯片包括芯片主体,所述芯片主体为长方体,所述芯片主体包括腔体、定位标、样品入口、样品出口,其中,所述腔体用于容纳待测样品,所述定位标设于所述芯片主体的其中一个侧面的角落处,且设于所述侧面远离所述腔体的一侧,所述定位标为具有中心点的图形,所述拍摄方法包括:
3、获取第一外接矩形的位置和第二外接矩形的位置,所述第一外接矩形的位置为所述定位标在前一轮拍摄开始时的外接矩形的位置,所述第二外接矩形的位置为所述定位标在本轮拍摄开始时的外接矩形的位置;
4、根据所述第一外接矩形的位置和所述第二外接矩形的位置确定所述定位标在本轮拍摄开始时的位置相对于前一轮拍摄开始时的位置的偏转角度;
5、控制相机旋转所述偏转角度;
6、获取所述定位标的中心点位置,并控制所述相机移动至所述中心点位置;
7、以所述中心点位置为起始点控制所述相机按照预设的步进长度对所述基因测序芯片进行拍摄;
8、将对所述基因测序芯片进行拍摄后获得的图像进行存储,所述存储的方法,包括:
9、获取第一标识码,并根据所述第一标识码提取第一标识字符,所述第一标识码为所述基因测序芯片的唯一标识码;
10、根据所述第一标识字符获取第二标识码,并根据所述第二标识码提取第二标识字符,所述第二标识码为与所述基因测序芯片匹配的存储终端的唯一标识码;
11、根据所述第一标识字符和所述第二标识字符获取目标字符;
12、根据所述目标字符对所述基因测序芯片进行拍摄后获得的图像进行加密处理后传输至所述存储终端。
13、在一些实施例中,所述定位标为十字形定位标,所述获取所述定位标的中心点位置,包括:
14、控制相机对所述定位标进行拍摄;
15、获取所述相机拍摄的图像,并根据所述图像确定所述定位标的中心点位置。
16、在一些实施例中,所述根据所述图像确定所述定位标的中心点位置,包括:
17、对所述图像进行预处理,得到所述定位标的轮廓图像;
18、根据所述轮廓图像,计算所述定位标的中心点坐标,所述中心点坐标为所述中心点位置。
19、在一些实施例中,所述对所述图像进行预处理,包括:
20、使用匹配函数对所述图像进行模板匹配,得到所述定位标的匹配图像;
21、采用阈值化分割法去除所述匹配图像的干扰像素点,得到所述定位标的阈值化分割图像;
22、对所述阈值化分割图像依次进行平滑处理、边缘检测和轮廓处理,得到所述轮廓图像。
23、在一些实施例中,所述根据所述轮廓图像,计算所述定位标的中心点坐标,包括:
24、对所述轮廓图像进行直线拟合,得到所述定位标的直线拟合结果;
25、根据所述直线拟合结果计算所述定位标的关键点坐标;
26、根据所述关键点坐标计算所述中心点坐标。
27、在一些实施例中,在对所述轮廓图像进行直线拟合之前,所述方法还包括:
28、采用几何约束的方法去除所述轮廓图像中与所述定位标无关的干扰轮廓。
29、在一些实施例中,所述根据所述第一标识字符和所述第二标识字符获取目标字符的方法,包括:
30、对所述第一标识字符和所述第二标识字符进行交集计算,并将所述第一标识字符和所述第二标识字符中的所有共有字符进行重新组合,以获得所述目标字符;
31、或,分别提取所述第一标识字符和所述第二标识字符在预设的指定位置的字符,并将提取到的所述字符进行重新组合,以获得所述目标字符。
32、在一些实施例中,所述根据所述目标字符对所述基因测序芯片进行拍摄后获得的图像进行加密处理的方法,包括:
33、通过查阅预设的编码表,将所述目标字符编码为密码串,并采用所述密码串对所述基因测序芯片进行拍摄后获得的图像进行加密。
34、在一些实施例中,在所述将所述目标字符编码为密码串之前,所述方法还包括:
35、将所述预设的编码表的字符列的所有字符进行重新排序,并将进行重新排序后的所有所述字符按照重新排序后的次序依次填入所述字符列。
36、第二方面,本申请实施例还提供一种基因测序仪,所述基因测序仪的测序方法包括上述所述的任一种基因测序芯片的拍摄方法。
37、本申请实施例公开了基因测序芯片的拍摄方法及基因测序仪,其中,所述基因测序芯片包括芯片主体,所述芯片主体为长方体,所述芯片主体包括腔体、定位标、样品入口、样品出口,其中,所述腔体用于容纳待测样品,所述定位标设于所述芯片主体的其中一个侧面的角落处,且设于所述侧面远离所述腔体的一侧,所述定位标为具有中心点的图形。所述拍摄方法应用于所述基因测序芯片,通过对所述基因测序芯片进行拍摄,可以在基因测序过程中,获得更多的有效信息,提高基因测序结果的准确性。
1.一种基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述基因测序芯片包括芯片主体,所述芯片主体为长方体,所述芯片主体包括腔体、定位标、样品入口、样品出口,其中,所述腔体用于容纳待测样品,所述定位标设于所述芯片主体的其中一个侧面的角落处,且设于所述侧面远离所述腔体的一侧,所述定位标为具有中心点的图形,所述拍摄方法包括:
2.根据权利要求1所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述定位标为十字形定位标,所述获取所述定位标的中心点位置,包括:
3.根据权利要求2所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述根据所述图像确定所述定位标的中心点位置,包括:
4.根据权利要求3所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述对所述图像进行预处理,包括:
5.根据权利要求3所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述根据所述轮廓图像,计算所述定位标的中心点坐标,包括:
6.根据权利要求5所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,在对所述轮廓图像进行直线拟合之前,所述方法还包括:
7.根据权利要求1所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述根据所述第一标识字符和所述第二标识字符获取目标字符的方法,包括:
8.根据权利要求1所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,所述根据所述目标字符对所述基因测序芯片进行拍摄后获得的图像进行加密处理的方法,包括:
9.根据权利要求8所述的基因测序芯片的拍摄方法,其特征在于,在所述将所述目标字符编码为密码串之前,所述方法还包括:
10.一种基因测序仪,其特征在于,所述基因测序仪的测序方法包括如权利要求1至9中任一项所述的基因测序芯片的拍摄方法。