一种宏基因组和宏转录组样本相异度的比较方法与流程技术资料下载

技术编号:13287854

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技术领域本发明涉及信息和生物技术,尤其是涉及一种宏基因组和宏转录组样本相异度的比较方法。背景技术微生物群落间的比较对于理解微生物和环境之间的关系至关重要。高通量测序技术已经成为表征微生物群落的一个强有力的工具。对于不同基因间的比较,基于配准的序列比较方法,如Smith-Waterman算法和Blast算法已经被广泛应用。然而对于高通量测序数据,基于配准的方法变得不再适用,主要由于以下原因:首先,基于配准的方法高度依赖已知数据库或已知基因,然而许多微生物的基因是未知的,这就影响了配准的准确性。其次...
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