技术编号:6385576
提示:您尚未登录,请点 登 陆 后下载,如果您还没有账户请点 注 册 ,登陆完成后,请刷新本页查看技术详细信息。本发明涉及基因工程,尤其涉及一种短序列组装中序列片段的过滤方法及系统。背景技术新测序技术产生的短序列有以下两个特点第一,序列长度短;第二,数据量大。长序列组装常用的Phrap等软件均为基于序列间的交叠(overlap)来进行拼接组装,此方法运用于短序列上会存在运算量太大的问题,没有实际的应用价值。新兴的短序列组装受到内存、时间等的限制,目前只在较小的原核生物基因组中成功应用。新一代测序分析存在以下难点第一,海量序列片段,基因组源序列的长度从十万碱基(如猪痘...
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