用于样品收集的方法与系统与流程

用于样品收集的方法与系统
相关申请的交叉引用
1.本技术要求于2018年6月1日提交的美国临时专利申请62/679,695的权益，该美国临时专利申请的内容在此整体并入本文。


背景技术：

2.从样品中检测和鉴定生物分子，例如微生物组和代谢产物，被广泛用于疾病的诊断和监测。这种分析通常需要生物分子的稳定运输和递送。低成本且有效的生物分子的收集、储存和递送适用于医学诊断领域。本文提出了用于收集和稳定生物样品的方法和系统以及用于有效处理所收集样品的方法。


技术实现要素：

3.在一些方面，本文提供了保存生物样品的方法，包括在可溶解膜(例如，水溶性膜、乙醇可溶性膜等)上收集生物样品；以及将包含所述生物样品的所述可溶解膜溶解在稳定化溶液中，其中所述稳定化溶液被放置在可密封容器中。在一些实施方案中，所述方法还包括分析所述生物样品。
4.在一些实施方案中，所述生物样品包含微生物组群体。在一些实施方案中，所述生物样品包含代谢产物群体。在一些实施方案中，所述生物样品包括粪便样品、皮肤样品、阴道样品、耳朵样品或口腔样品。
5.在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含纤维素。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛(pvb)聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的pvb。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的pvb。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的pvb。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含pvb和聚合物增塑剂(例如，pvb和增塑剂的组合)。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物、聚合物增容剂和聚合物增塑剂或糖醇增塑剂的组合。在一些实施方案中，所述聚合物增容剂包含纤维素醚聚合物、羧甲基纤维素钠、改性淀粉或其组合。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计10％至30％的聚合物增容剂和聚合物增塑剂或糖醇增塑剂。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜在低于37℃下基本可溶于所述稳定化溶液中。在一些实施方案中，所述可溶解膜是可食用的、食品级的、化妆品级的、药物级的或适合皮肤接触的。
6.在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含防腐剂或稳定化试剂。在一些实施方案中，所述防腐剂或所述稳定化试剂是高盐试剂或乙醇基试剂。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含抗菌剂。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含溴化n-辛基吡啶溶液。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含氯化锂、三氨基甲烷、乙醇、tcep-hcl或其组合。
7.在一些实施方案中，所述可密封容器的体积大于5ml。在一些实施方案中，所述可密封容器的体积小于150ml。
8.在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品稳定长达15天。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的核酸内容物稳定长达30天或在-20℃下稳定长达3个月。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的蛋白质内容物稳定长达15天。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的代谢产物稳定长达7天或在-80℃下稳定长达3个月。
9.在一些实施方案中，所述方法还包括将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器运输或递送至实验室或测试中心。在一些实施方案中，所述可密封容器在室温下运输或递送。在一些实施方案中，所述可密封容器在干冰上、在冰箱中、在冷藏箱(例如，箱)中或用冰袋运输或递送。在一些实施方案中，在任何进一步处理之前，不将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器进行冷冻。
10.在一些实施方案中，所述可溶解膜的表面积为3cm
×
3cm至40cm
×
40cm。
11.在一些方面，本文提供了采样试剂盒，其包括：用于收集生物样品的可溶解膜和可密封容器中的稳定化溶液，所述稳定化溶液能够溶解包含所述生物样品的所述可溶解膜。
12.在一些实施方案中，所述试剂盒还包括用于将所述生物样品收集到所述可溶解膜上并将所述可溶解膜溶解在所述稳定化溶液中的说明书。
13.在一些实施方案中，所述可溶解膜是单独包装的。在一些实施方案中，所述可溶解膜以在包装中的一组堆叠片材形式提供。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛。在一些实施方案中，所述可溶解膜是干燥的。
14.在一些实施方案中，所述可密封容器是条形码化的。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含dmso-edta二钠饱和盐(dmso-disodium edta-saturated salt，dess)。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含乙醇。
15.在一些方面，本文提供了从溶液中鉴定微生物组群体的方法，所述方法包括：对包含生物样品和溶解的可溶解膜的稳定化溶液进行核酸内容物分析，并基于所述核酸内容物分析，鉴定存在于包含所述生物样品的所述稳定化溶液中的至少一种微生物。在一些实施方案中，将所述生物样品收集到所述可溶解膜上，并在进行所述核酸内容物分析之前，将所述可溶解膜溶解在所述稳定化溶液中。
16.在一些实施方案中，所述可溶解膜可以是水溶性膜，并且所述稳定化溶液可以是水基的，使得所述水溶性膜可溶解在所述水基稳定化溶液中。在一些实施方案中，所述可溶解膜可以是乙醇可溶性膜，并且所述稳定化溶液可以是乙醇基的，使得所述乙醇可溶性膜可溶解在所述乙醇基稳定化溶液中。
17.一些实施方案还包括确定所述生物样品的微生物组谱(microbiome profile)。在一些实施方案中，确定所述微生物组谱包括在所述生物样品中鉴定至少5种微生物、至少10种微生物、至少20种微生物或至少30种微生物。
18.一些实施方案还包括生成鉴定存在于所述微生物组群体中的至少一种微生物的报告。
19.在一些实施方案中，所述核酸内容物分析包括对所述生物样品的所述核酸内容物
进行测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物的测序包括下一代测序、长读测序、sanger测序、高通量测序、基于荧光的测序、基于聚合酶链反应的测序或纳米孔测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物进行测序包括对针对细菌的16s v1-v2、v3-v4或v4-v5序列；针对真菌的its1区域；或针对真核微生物的18s区域进行测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物进行测序包括对微生物的所述整个基因组进行测序。
20.在一些实施方案中，鉴定所述微生物组群体不包括冷冻所述生物样品。在一些实施方案中，鉴定所述微生物组群体不包括解冻步骤。在一些其他实施方案中，鉴定所述微生物组群体包括解冻步骤。
21.在一些实施方案中，包含所述生物样品和所述溶解的可溶解膜的所述稳定化溶液还包含完整细胞和非完整细胞。在一些实施方案中，包含所述生物样品和所述溶解的可溶解膜的所述稳定化溶液还包含非完整细胞。
22.在一些实施方案中，所述方法还包括核酸内容物的纯化。在一些实施方案中，使用核酸纯化试剂盒进行所述核酸内容物的纯化。
23.在一些方面，本文提供了从溶液中鉴定代谢产物群体的方法，所述方法包括：对包含生物样品和溶解的可溶解膜的稳定化溶液进行蛋白质或脂质内容物分析，并基于所述蛋白质或脂质分析，鉴定存在于包含所述生物样品的所述溶液中的至少一种代谢产物。
24.在一些实施方案中，将所述生物样品收集到所述可溶解膜上，并在进行所述蛋白质或脂质内容物分析之前，将所述可溶解膜溶解在所述稳定化溶液中。
25.在一些方面，本文提供了用于分析生物样品的系统，所述系统包括：采样试剂盒，所述采样试剂盒包括用于收集所述生物样品的可溶解膜，和可密封容器，其包含用于溶解所述可溶解膜的稳定化溶液；以及样品处理模块，所述样品处理模块被配置为鉴定所述生物样品中至少一种微生物或代谢产物。
26.在一些实施方案中，所述样品处理模块包括免疫测定、流式细胞仪、微芯片、测序仪、lc/ms、gc/ms或nmr。在一些实施方案中，所述样品处理模块被配置为通过检测或测量所述微生物或所述代谢产物的水平来鉴定至少一种微生物或代谢产物。在一些实施方案中，所述样品处理模块被配置为鉴定至少5种微生物或代谢产物、至少10种微生物或代谢产物、至少20种微生物或代谢产物或至少50种微生物或代谢产物。援引并入
27.本说明书中提到的所有出版物、专利和专利申请均通过引用并入本文，其程度如同特别地且单独地指出每一个单独的出版物、专利或专利申请均通过引用而并入。如果通过引用并入的出版物和专利或专利申请与说明书中包括的公开内容相抵触，本说明书旨在取代和/或优先于任何此类抵触的材料。
附图说明
28.在所附权利要求书中具体阐述了本发明的新颖特征。通过参考对在其中利用到本发明的原理的说明性实施方案加以阐述的以下详细描述和附图(本文也称为“图”)，将会获得对本发明的特征和优点的更好的理解，在附图中：
29.图1示出了流程图，该流程图描绘了确定通过本文所述的方法收集的样品的质量，随后进行簇制备、测序和生物信息学分析的过程。
30.图2示出了在门水平上存在于通过本文所述的方法或通过常规方法的样品中的微生物物种的相对丰度。
31.图3示出了在通过本文所述的方法或通过常规方法的样品中存在的微生物物种的在纲水平上的分类组成分布。
32.图4示出了在通过本文所述的方法或通过常规方法的样品中存在的微生物物种的在目水平上的分类组成分布。
具体实施方式
33.从受试者(如人类受试者)中鉴定微生物组或代谢产物群体可以有助于评估受试者的健康。有许多宿主和环境因素可以影响受试者中的微生物组和代谢产物群体。此外，为了鉴定样品中的生物分子，可以以稳定的方式保存样品，以减少或抑制生物分子例如核酸内容物随时间推移的的降解。此类生物分子的收集、保存、运输和递送可以在准确分析微生物组和代谢产物群体中发挥作用。生物分子的保存还可以在诸如在无法进行低温保存的偏远地区进行采样等情况下提供帮助，并且可以帮助降低此类分析的成本。
34.本公开设想了用于以有效、具有成本效益和/或生态的方式收集和保存生物样品例如细胞、代谢产物、核酸分子、蛋白质、碳水化合物和脂质的方法和系统。本文考虑的是使用可溶解膜收集生物样品用于进一步处理。本公开的方法和系统还考虑了方便地储存和运输生物样品，而不影响或基本不影响样品完整性。
35.此类生物样品通常源自受试者，例如人，并且可用作鉴定生物样品中微生物组和代谢产物群体的生物标记。生物样品可以指受试者的样品。生物样品可以包括任何数量的细胞，例如，微生物和受试者的细胞。生物样品也可以包括大分子，例如细胞大分子。生物样品可以包括核酸材料、代谢产物、蛋白质、脂质或碳水化合物。
36.生物样品可以源自流体样品，例如尿液样品、阴道样品、口腔样品或唾液样品。生物样品也可以源自固体样品，例如皮肤样品、粪便样品或耳朵样品。生物样品可以是细胞样品或无细胞样品。生物样品可以包括核酸内容物，其非限制性示例包括dna、rna、基因组dna、基因或基因片段的编码区或非编码区、外显子、内含子、信使rna(mrna)、转移rna、核糖体rna、短干扰rna(sirna)、短发夹rna(shrna)、微rna(mirna)、病毒rna、核酶和cdna。
37.使用本文公开的膜材料可以允许收集样品。或者，使用本文公开的膜材料可以提供样品中大分子的完整性的维持。此类大分子可以包括，例如，核酸、蛋白质、脂质和代谢产物内容物。使用可溶解膜收集生物样品
38.可以使用可溶解膜收集生物样品或其元素。使用这种膜可以从样品的自然环境中收集样品。例如，可溶解膜可以用于收集皮肤样品、阴道样品、粪便样品或任何其他合适的样品。或者，可以将收集的样品转移至本公开的膜。例如，可以将唾液样品或血液样品转移至膜。可溶解膜可以是擦拭品、餐巾、薄纸或拭子的形式。
39.可溶解膜可以是水溶的或乙醇可溶的。在一些情况下，可溶解膜可溶于水基溶液或包含乙醇的混合物中。可溶解膜可溶于其他稳定化溶液或缓冲溶液中。这种溶液的非限制性示例包括稳定化缓冲液、细胞裂解缓冲液、乙醇基缓冲液等。可以在可密封容器中提供稳定化溶液。在一些情况下，可溶解膜可以溶解在任何合适的溶剂，例如丙酮、氯仿、异丙
醇、甲醇、二乙醚、己烷、乙醇、水或其组合中。在一些情况下，溶剂可以额外地包括盐、酸、洗涤剂或另一种物质。
40.可溶解膜可以包含聚乙烯醇缩丁醛(pvb)。可溶解膜可以包含1-100％的pvb。可溶解膜可以包含至少1％的pvb。在一些情况下，可溶解膜可以包含高达100％的pvb。在一些情况下，可溶解膜可以包含1％至5％的pvb、1％至10％的pvb、1％至25％的pvb、1％至50％的pvb、1％至75％的pvb、1％至80％的pvb、1％至90％的pvb、1％至95％的pvb、1％至100％的pvb、5％至10％的pvb、5％至25％的pvb、5％至50％的pvb、5％至75％的pvb、5％至80％的pvb、5％至90％的pvb、5％至95％的pvb、5％至100％的pvb、10％至25％的pvb、10％至50％的pvb、10％至75％的pvb、10％至80％的pvb、10％至90％的pvb、10％至95％的pvb、10％至100％的pvb、25％至50％的pvb、25％至75％的pvb、25％至80％的pvb、25％至90％的pvb、25％至95％的pvb、25％至100％的pvb、50％至75％的pvb、50％至80％的pvb、50％至90％的pvb、50％至95％的pvb、50％至100％的pvb、75％至80％的pvb、75％至90％的pvb、75％至95％的pvb、75％至100％的pvb、80％至90％的pvb、80％至95％的pvb、80％至100％的pvb、90％至95％的pvb、90％至100％的pvb或95％至100％的pvb。在一些情况下，可溶解膜可以包含约1％的pvb、5％的pvb、10％的pvb、25％的pvb、50％的pvb、75％的pvb、80％的pvb、90％的pvb、95％的pvb或100％的pvb。
41.在一些情况下，除pvb外或代替pvb，可溶解膜可以包含乙醇可溶性聚合物
42.可溶解膜可以包含聚乙烯醇(pva)聚合物。可溶解膜可以包含1-100％的pva。可溶性膜可以包含至少1％的pva。在一些情况下，可溶解膜可以包含高达100％的pva。在一些情况下，可溶解膜可以包含1％至5％的pva、1％至10％的pva、1％至25％的pva、1％至50％的pva、1％至75％的pva、1％至80％的pva、1％至90％的pva、1％至95％的pva、1％至100％的pva、5％至10％的pva、5％至25％的pva、5％至50％的pva、5％至75％的pva、5％至80％的pva、5％至90％的pva、5％至95％的pva、5％至100％的pva、10％至25％的pva、10％至50％的pva、10％至75％的pva、10％至80％的pva、10％至90％的pva、10％至95％的pva、10％至100％的pva、25％至50％的pva、25％至75％的pva、25％至80％的pva、25％至90％的pva、25％至95％的pva、25％至100％的pva、50％至75％的pva、50％至80％的pva、50％至90％的pva、50％至95％的pva、50％至100％的pva、75％至80％的pva、75％至90％的pva、75％至95％的pva、75％至100％的pva、80％至90％的pva、80％至95％的pva、80％至100％的pva、90％至95％的pva、90％至100％的pva或95％至100％的pva。在一些情况下，可溶解膜可以包含约1％的pva、5％的pva、10％的pva、25％的pva、50％的pva、75％的pva、80％的pva、90％的pva、95％的pva或100％的pva。
43.在一些情况下，可溶解膜包含pva、聚合物增容剂和增塑剂(例如，聚合物增塑剂)的组合。可以将聚合物增容剂添加至可溶解膜，以增加膜的透明性。可以将增塑剂添加至可溶解膜，以促进膜的可塑性和/或柔韧性。
44.聚合物增容剂的非限制性示例包括纤维素醚，例如甲基纤维素、羧甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、羧甲基纤维素钠和改性淀粉，例如酸改性的羟乙基淀粉和羟丙基化淀粉。
45.糖醇增塑剂的非限制性示例包括甘露醇、异麦芽酮糖醇、山梨醇、核糖醇、季戊四醇、木糖醇、赤藓糖醇、卫矛醇和麦芽糖醇。在一些情况下，糖醇增塑剂可以是本文所述材料的组合。
46.在这些实施方案中，可溶解膜可以包含按重量计10-30％的聚合物增容剂和糖醇增塑剂的组合。可溶解膜可以包含约2％至约5％、约2％至约10％、约2％至约20％、约2％至约30％、约2％至约40％、约5％至约10％、约5％至约20％、约5％至约30％、约5％至约40％、约10％至约20％、约10％至约30％、约10％至约40％、约20％至约30％、约20％至约40％或约30％至约40％的聚合物增容剂和糖醇增塑剂。可溶解膜可以包含约2％、约5％、约10％、约20％、约30％或约40％的聚合物增容剂和糖醇增塑剂。
47.在一些情况下，可溶解膜可以包含至少1％、2％、5％、10％、15％、20％或25％的聚合物增容剂。在一些情况下，可溶解膜可以包含至少1％、2％、5％、10％、15％、20％或25％的糖醇增塑剂。
48.在一些情况下，可溶解膜可以包含纤维素。可溶解膜可以包含1-100％的纤维素。可溶解膜可包含至少1％的纤维素。在一些情况下，可溶解膜可以包含高达100％的纤维素。在一些情况下，可溶解膜可以包含1％至5％的纤维素、1％至10％的纤维素、1％至25％的纤维素、1％至50％的纤维素、1％至75％的纤维素、1％至80％的纤维素、1％至90％的纤维素、1％至95％的纤维素、1％至100％的纤维素、5％至10％的纤维素、5％至25％的纤维素、5％至50％的纤维素、5％至75％的纤维素、5％至80％的纤维素、5％至90％的纤维素、5％至95％的纤维素、5％至100％的纤维素、10％至25％的纤维素、10％至50％的纤维素、10％至75％的纤维素、10％至80％的纤维素、10％至90％的纤维素、10％至95％的纤维素、10％至100％的纤维素、25％至50％的纤维素、25％至75％的纤维素、25％至80％的纤维素、25％至90％的纤维素、25％至95％的纤维素、25％至100％的纤维素、50％至75％的纤维素、50％至80％的纤维素、50％至90％的纤维素、50％至95％的纤维素、50％至100％的纤维素、75％至80％的纤维素、75％至90％的纤维素、75％至95％的纤维素、75％至100％的纤维素、80％至90％的纤维素、80％至95％的纤维素、80％至100％的纤维素、90％至95％的纤维素、90％至100％的纤维素或95％至100％的纤维素。在一些情况下，可溶解膜可以包含约1％的纤维素、5％的纤维素、10％的纤维素、25％的纤维素、50％的纤维素、75％的纤维素、80％的纤维素、90％的纤维素、95％的纤维素或100％的纤维素。在一些情况下，可溶解膜可以包含pva和纤维素。
49.在一些情况下，可溶解膜可以包含天然存在的水溶性聚合物。天然存在的水溶性聚合物的非限制性示例包括黄原胶、瓜尔胶、水溶性聚合物衍生物，例如羟丙基化淀粉和乙氧基化淀粉等。
50.在一些情况下，可溶解膜可以包含乙醇可溶性聚合物。乙醇可溶聚合物的非限制性示例可以包括聚甲基丙烯酸异丁酯、聚乙二醇和乙基纤维素等。
51.在一些情况下，可溶解膜是可食用的、食品级的、化妆品级的或药物级的。可溶解膜可以安全地直接与皮肤产品接触。
52.在一些情况下，可溶解膜可以用作擦拭品，例如，用作清洁擦拭品。
53.在一些情况下，可溶解膜可以为至少3cm
×
3cm、5cm
×
5cm、10cm
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10cm、15cm
×
15cm、20cm
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20cm、25cm
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25cm或30cm
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30cm。在一些情况下，可溶解膜可以多达10cm
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10cm、15cm
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15cm、20cm
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20cm、25cm
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25cm、30cm
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30cm、35cm
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35cm或40cm
×
40cm。在一些情况下，可溶解膜可以是正方形、矩形、圆形或其他形状。这种可溶解膜的面积可以为至少10cm2、20cm2、30cm2、40cm2、50cm2、60cm2、70cm2、80cm2、90cm2、100cm2、150cm2、200cm2、
250cm2或300cm2。在一些情况下，这种可溶解膜的面积可以多达20cm2、30cm2、40cm2、50cm2、60cm2、70cm2、80cm2、90cm2、100cm2、150cm2、200cm2、250cm2、300cm2或400cm2。
54.在一些情况下，可溶解膜可以是基本透明或半透明的。例如，可以将膜流延为约50μm至3mm、50μm至2.28mm、50μm至2mm、50μm至1mm、50μm至500μm、50μm至100μm、100μm至3mm、100μm至2.28mm、100μm至2mm、100μm至1mm、100μm至500μm、500μm至3mm、500μm至2.28mm、500μm至2mm、500μm至1mm、1mm至3mm、1mm至2.28mm、1mm至2mm、2mm至3mm、2mm至2.28mm或2.28mm至3mm的厚度。
55.在一些情况下，可溶解膜可以是平的或有纹理的片。可溶解膜可以是双层的。这两个层可以在1、2、3、4、5、6或更多个边上附接。在一些情况下，附接的边数可以取决于膜的形状。例如，三角形的双层膜可以在1、2或3个边上附接。矩形的双层膜可以在1、2、3或4个边上附接。五边形的双层膜可以在1、2、3、4或5个边上附接。六边形的膜可以在1、2、3、4、5或6个边上附接。在一些情况下，双层膜可以有多于6个的边，并且可以在任何或所有边上附接。在一些情况下，双层可溶解膜可以形成连指手套、手套或小袋的形状。连指手套、手套或小袋可以容纳1个手指、2个手指、3个手指、4个手指、手的至少一部分或整只手。在这种情况下，第一层可以放在手指、多个手指或手顶部，而第二层可以放在手指、多个手指或手底部。连指手套、手套或小袋可以包括空腔和提供进入空腔的开口，其中所述开口和/或所述空腔被配置为接收手的至少一部分。在一些情况下，双层膜可以具有3、4、5或更多层。
56.在一些情况下，膜的所测量的不透明度可以为约90％、80％、70％、60％、50％、45％、40％、35％、30％、25％、20％或更低，如由色度计确定的。在一些情况下，膜可以是棕色、白色或无色。
57.在一些情况下，可溶解膜在室温下基本可溶于稳定化溶液或缓冲溶液中。可溶解膜在稳定化溶液中的水解度可以为至少50％。可溶解膜在稳定化溶液中的水解度可以为至少50％、60％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、98％或99％。可溶解膜的水解度可以为约100％。当部分水解时，稳定化溶液可以包含醋酸乙烯酯单元。
58.在一些情况下，水解度可以取决于温度。例如，在37℃的温度下，膜可以完全溶解在稳定化溶液中。在一些情况下，当流延至约1.0-2.0mm的厚度时，膜可以能够在不到2分钟的时间内在20℃-40℃的温度下溶解在稳定化溶液中。在一些情况下，厚度为1.0-2.0mm的膜可以能够在少于40秒、少于50秒、少于1分钟、少于2分钟或少于5分钟的时间内在20℃-40℃的温度下溶解在稳定化溶液中。用于保存和稳定生物样品的溶液
59.为了稳定/保存生物样品，优选将本文讨论的可溶解膜溶解或基本溶解。这可以通过将膜(例如，擦拭品)取下并将其放在稳定化溶液或缓冲溶液中来发生。
60.包含生物样品的可溶解膜可以溶解或基本溶解在稳定化溶液中，从而形成溶解的样品组合物。这种溶解可以产生包含稳定化溶液、溶解的膜和生物样品的溶解的样品组合物。
61.稳定化溶液可以包含一种或多种组分或试剂。在一种情况下，稳定化溶液可以包含稳定化试剂。稳定化试剂可以包括防腐剂、螯合剂、离液剂、有机溶剂、表面活性剂、蛋白质添加剂、离子交换剂、还原剂、氧化剂、自由基清除剂或其组合。在一些情况下，稳定化试剂可以是防腐剂，其可以包含螯合剂、离液剂、有机溶剂、表面活性剂、蛋白质添加剂、离子
交换剂、还原剂、氧化剂、自由基清除剂或其组合。稳定化溶液可以包含按体积计至少约0.01％、0.05％、0.1％、0.5％、1％、2％、3％、5％、7％、8.5％、10％、12.5％、15％、17％或20％的稳定化试剂。防腐剂的示例包括，但不限于，叠氮化钠、硫酸链霉素、对羟基苯甲酸酯、乙二醇单苯基醚和聚乙二醇。
62.防腐剂或稳定化试剂可以是高盐试剂。盐的非限制性示例包括氯化锂、氯化钠、二水乙二胺四乙酸(edta)二钠盐二水合物、柠檬酸钠三钠盐二水合物、硫酸铵、氯化钠、硫代乙醇酸钠、磷酸氢钠、异硫氰酸胍或柠檬酸钠。稳定化溶液可以具有盐的组合。稳定化溶液可以包含按体积计至少约0.01％、0.05％、0.1％、0.5％、1％、2％、3％、5％、7％、8.5％、10％、12.5％、15％、17％或20％的盐。稳定化溶液可以包含盐的组合。稳定化溶液可以包含按体积计至少约1％、5％、10％、15％、20％或30％的盐的组合。
63.在一些情况下，高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含大量氯化镁。高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含一种类型的盐(例如，氯化钠或氯化镁)或多于一种类型的盐(例如，氯化钠和氯化镁)。高盐防腐剂或稳定化试剂可以是盐饱和的或基本是盐饱和的，使得额外的盐可以不大量溶解。
64.高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含edta二钠。在一些情况下，高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含至少0.05m、0.1m、0.15m、0.2m、0.25m、0.3m或0.35m的edta二钠。在一些情况下，高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含不超过0.2m、0.25m、0.3m、0.35m、0.4m、0.45m或0.5m的edta二钠。
65.高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含至少5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％或50％的dmso。在一些情况下，高盐防腐剂或稳定化试剂可以包含不超过5％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％或50％的dmso。
66.在一些情况下，高盐稳定化试剂可以是dess(dmso-edta二钠饱和盐)试剂。例如，dess试剂可以包含0.25m的edta二钠、20％dmso和饱和氯化钠。
67.在一些情况下，高盐稳定化试剂可以溶解包含pva或纤维素的膜。在一些情况下，包含pva或纤维素的膜可以溶解在至少约1ml、5ml、10ml、15ml、20ml、25ml、30ml、35ml、40ml、45ml或50ml的高盐稳定化试剂中。在一些情况下，水基试剂可以溶解包含pva或纤维素的膜。在一些情况下，包含pva或纤维素的膜可以溶解在至少约1ml、5ml、10ml、15ml、20ml、25ml、30ml、35ml、40ml、45ml或50ml的水基试剂中。
68.稳定化溶液可以是有机溶剂基溶液。本文考虑的有机溶剂基溶液的示例包括，但不限于，包含乙醇、甲醇、dmso等的缓冲液。在一些情况下，稳定化溶液可以是水基溶液。
69.缓冲溶液或稳定化溶液可以是或包含乙醇基防腐剂或稳定化试剂。乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以包含大量乙醇。在一些情况下，乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以包含至少65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、99％或100％的乙醇。在一些情况下，乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以包含不超过70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％的乙醇。乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以包含70％至100％、80％至100％、90％至100％、70％至99％、75％至99％、80％至99％％、85％至99％、90％至99％、95％至99％、75％至95％、80％至95％、85％至95％或90％至95％的乙醇。在一些情况下，乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以额外包含乙二胺四乙酸二钠(edta)、二甲基亚砜(dmso)、氯化镁和/或氯化钠。
70.在一些情况下，乙醇基稳定化试剂可以溶解包含pvb的膜。在一些情况下，包含pvb
的膜可以溶解在至少约1ml、5ml、10ml、15ml、20ml、25ml、30ml、35ml、40ml、45ml或50ml的乙醇基稳定化试剂中。
71.包含防腐剂或稳定化试剂的缓冲溶液或稳定化溶液可以为按体积计至少5％、10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或100％的防腐剂或稳定化试剂。
72.在一些情况下，防腐剂或稳定化试剂可以是乙醇。在一些情况下，乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以为至少约70％、80％、90％、95％或100％的乙醇。在一些情况下，乙醇基防腐剂或稳定化试剂可以为不超过约70％、80％、90％、95％或100％的乙醇。
73.在一些情况下，包含缓冲溶液的稳定化溶液可以是水基的。在这种情况下，包含pva或纤维素的膜可以溶解在这种稳定化溶液中。
74.在一些情况下，包含乙醇稳定化溶液的稳定化溶液可以是乙醇基的。在这种情况下，包含pvb的膜可以溶解在这种稳定化溶液中。
75.在一些情况下，稳定化溶液或缓冲溶液是
·
gut、rnalater
tm
、longmire缓冲液、或cary-blair介质中的一种。
76.在一些情况下，稳定化溶液可以包含额外组分，例如三羟甲基氨基甲烷、tcep-hcl、溴化n-辛基吡啶溶液、抗菌剂或其组合。稳定化溶液可以包含按体积计至多1％、5％、10％、15％、20％或30％的额外组分。
77.稳定化溶液或缓冲溶液可以具有一定范围的ph。在一些情况下，稳定化溶液的ph至少或至多为4、4.5、5.0、5.5、5.9、6.0、6.2、6.5、6.8、7.0、7.2、7.4、7.6、7.8、8.0、8.2、8.4、8.6、8.8、9.0、9.2、9.5、9.7、10.0、10.2、10.5、10.7、11.0、11.2、11.5、11.7或12.0。可以使用酸性或碱性试剂调节稳定化溶液的ph。
78.稳定化溶液或缓冲溶液能够有效地稳定生物样品(例如，大分子，例如核酸、代谢产物、蛋白质、细胞和细胞成分)。有效的稳定可以提供样品完整性的维持，使得，例如，在室温或冷冻温度下将样品储存指定的或预定的时间段后，仍存在所含生物样品初始量的至少约50％。例如，大分子在室温下在稳定化溶液中可以稳定至少1天、5天、10天、15天、20天或至少30天。大分子在-20℃下在稳定化溶液中可以稳定至少10天、20天、1个月、2个月、3个月或5个月。大分子在-80℃下在稳定化溶液中可以稳定至少15天、30天、2个月、3个月、5个月、10个月或长达一年。
79.维持溶解的样品组合物中的样品完整性可以需要或可以不需要冷冻该组合物。包含稳定化溶液和生物样品的溶解的样品组合物在任何进一步处理之前可以不需要冷冻。在一些情况下，溶解的样品组合物可以冷冻一次，然后进一步处理。在一些情况下，溶解的样品组合物在冷冻时可以是稳定的。在一些情况下，溶解的样品组合物可以在处理前被冷冻和解冻多次。可以执行多个冻融循环以裂解溶液中的细胞。
80.包含生物样品的可溶解膜可以被受试者溶解到稳定化溶液中。使用机械解离方法，例如涡旋、摇动、摇摆、倒置混合、旋转和/或浸泡，可以将可溶解膜溶解在稳定化溶液中。在一些情况下，不需要额外的机械离解方法来将膜溶解到稳定化溶液中，并且浸泡包含生物样品的膜可以足以溶解或基本溶解该膜。
81.在一些情况下，可密封容器可以是在密封后在运输过程中不泄漏或基本不泄漏的任何常规使用的可密封容器。可密封容器的非限制性示例包括小瓶、管、离心管、收集管、falcon管、sarstedt粪便收集管和其他合适的容器。
82.可密封容器的容量可以为至少1ml。可密封容器的容量可以大于1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml或150ml。可密封容器的容量可以为至少1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml、150ml或200ml。可密封容器的容量可以为至多1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml、150ml或200ml。
83.在一些情况下，可密封容器可以包含至少1ml体积的缓冲溶液或稳定化溶液。稳定化溶液的体积可以为至少约1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml或150ml。稳定化溶液的体积可以不超过约1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml、150ml或200ml。稳定化试剂的体积可以为至少约1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml或150ml。稳定化试剂的体积可以不超过约1ml、5ml、10ml、20ml、50ml、100ml、150ml或200ml。
84.一定体积的缓冲溶液或稳定化溶液可以溶解膜。在一些情况下，一定体积的缓冲溶液或稳定化试剂可以溶解至少3mm
×
3mm、至少5mm
×
5mm、至少10mm
×
10mm或至少40mm
×
40mm的膜。
85.一定体积的缓冲溶液或稳定化溶液可以在至多约10秒、30秒或60秒的时间内溶解膜。一定体积的缓冲溶液或稳定化溶液可以在至多约1分钟、5分钟、10分钟、30分钟或60分钟的时间内溶解膜。
86.在一些情况下，包含稳定化溶液、生物样品和溶解的可溶解膜的溶解的样品组合物可以包含来自生物样品的完整细胞。溶解的样品组合物还可以包含非完整细胞。在一些情况下，完整的细胞不会因擦拭品的溶解而受到明显干扰。样品处理
87.本文提出的方法和系统可以用于从溶液中鉴定微生物组或代谢产物群体。微生物组群体的鉴定可以包括对生物样品进行核酸内容物分析。生物样品可以在溶解的样品组合物中。溶解的样品组合物可以包含稳定化溶液，所述稳定化溶液包含生物样品和溶解的可溶解膜。所述方法可以包括基于核酸内容物分析鉴定在溶解的样品组合物中存在的至少一种微生物。所述方法可以包括确定生物样品的微生物组谱。
88.确定生物样品的微生物组谱可以包括鉴定至少一种微生物。确定生物样品的微生物组谱可以包括鉴定至少5种微生物、至少10种微生物、至少20种微生物、至少30种微生物、至少50种微生物、至少100种微生物、至少200种微生物或至少500种微生物。确定生物样品的微生物组谱可以包括鉴定生物样品中存在的微生物属或物种。确定生物样品的微生物组谱可以包括鉴定至少一个属、至少5个属、至少10个属、至少20个属、至少30个属、至少50个属、至少100个属、至少200个属或至少500个属。
89.确定生物样品的微生物组谱可以包括核酸内容物的分析。在一些情况下，核酸内容物分析包括对生物样品的核酸内容物进行测序。测序核酸内容物可以包括下一代测序、长读测序、sanger测序、高通量测序、基于荧光的测序、基于聚合酶链反应的测序或纳米孔测序。
90.在一些情况下，测序核酸内容物包括对生物样品中微生物的整个基因组进行测序。测序核酸内容物可以包括对16s序列进行测序以鉴定细菌。在一些情况下，可以对核酸内容物中的16s序列的v1、v2、v3、v4或v5区域或其组合进行测序。测序核酸内容物可以包括对its1序列区域进行测序以鉴定真菌。测序核酸内容物可以包括对18s序列进行测序以鉴定真核微生物。在一些情况下，可以对核酸内容物中的18s序列的v4区域进行测序。
91.在一些情况下，核酸内容物的分析可能需要纯化。核酸内容物的纯化可以使用核酸纯化试剂盒进行。核酸纯化试剂盒可以是任何常规的核酸纯化试剂盒，例如dna纯化试剂盒或rna纯化试剂盒。
92.本文提出的方法和系统可以用于从溶液鉴定代谢产物群体。代谢产物群体的鉴定可以包括对生物样品进行蛋白质或脂质内容物分析。所述方法可以包括基于蛋白质或脂质内容物分析鉴定在溶解的样品组合物中存在的至少一种代谢产物。所述方法可以包括确定生物样品的代谢产物谱。
93.在一些情况下，确定生物样品的代谢产物谱可以包括鉴定至少一种代谢产物。确定生物样品的代谢产物谱可以包括鉴定至少5种代谢产物、至少10种代谢产物、至少20种代谢产物、至少30种代谢产物、至少50种代谢产物、至少100种代谢产物、至少200种代谢产物或至少500种代谢产物。
94.可以通过分析生物样品中的蛋白质或脂质内容物来进行生物样品中微生物组或代谢产物群体的确定。在一些情况下，蛋白质或脂质内容物可以被纯化。蛋白质或脂质内容物的纯化可以使用蛋白质或脂质纯化试剂盒进行。蛋白质或脂质纯化试剂盒可以是任何常规的蛋白质或脂质纯化试剂盒。
95.在一些情况下，鉴定微生物组或代谢产物群体可以不包括对生物样品或包含生物样品的溶解的样品组合物进行冷冻和解冻。或者，微生物组或代谢产物群体的鉴定可以包括一个或多个冷冻和解冻步骤。采样试剂盒
96.本文提出了一种或多种用于分析生物样品的系统。一种或多种系统可以包括采样试剂盒。在一些方面，本文提出了可用于收集和保存生物样品的采样试剂盒。采样试剂盒可以包括用于收集生物样品的可溶解膜。可溶解膜可以是如本文先前所述的水溶性膜或乙醇可溶性膜。该试剂盒还可以包括用于样品收集的可密封容器。该试剂盒可以包含缓冲溶液或稳定化溶液。在一些情况下，可密封容器可以包含缓冲溶液或稳定化溶液。试剂盒中的可溶解膜可溶于同一试剂盒中的稳定化溶液中。在一些情况下，试剂盒可以包含防腐剂或稳定化试剂。防腐剂或稳定化试剂可以与缓冲溶液或稳定化溶液预混合，或者可以与缓冲溶液或稳定化溶液分离。试剂盒中的防腐剂或稳定化试剂可溶于或混溶于同一试剂盒中的缓冲溶液或稳定化溶液中。
97.在一些情况下，试剂盒中的水溶性膜可以包含本文所述的pva或纤维素。在这种情况下，试剂盒可以包含水基缓冲溶液或稳定化溶液。在一些情况下，试剂盒可以包含dess。
98.在一些情况下，试剂盒中的乙醇可溶性膜可以包含如本文所述的pvb。在这种情况下，试剂盒可以包含乙醇基的稳定化溶液。在一些情况下，试剂盒可以包含95％的乙醇。
99.缓冲溶液或稳定化溶液可以被包装在可密封容器中。受试者可以使用可溶解膜收集生物样品，然后将膜放入包含稳定化溶液的可密封容器中。或者，可以将稳定化溶液单独包装。受试者可以使用可溶解膜收集样品，例如生物样品。可以将单独包装的稳定化溶液倒入试剂盒中的可密封容器中。然后可以将带有样品的可溶解擦拭品溶解到可密封容器中的稳定化溶液中。
100.溶解的样品组合物可以被运输或递送至实验室或测试中心。在一些情况下，可密封容器在室温下运输或递送。或者，可密封容器在干冰上、在冰箱中、在冷藏箱中或用冰袋
运输或递送。
101.试剂盒和可密封容器可以是唯一可识别的。在一些情况下，试剂盒和可密封容器是条形码化的。条形码可用于将生物样品链接至受试者。
102.在一些情况下，试剂盒包含用于一个样品收集的材料。或者，试剂盒可以包含用于多个样品收集的材料。可溶解膜可以被干燥包装。或者，可溶解膜可以被包装在不溶解该膜并且保持其在包装中稳定的溶液中。
103.在一些情况下，采样试剂盒可以供受试者个人使用。例如，个人可以自己收集样品并将其送至实验室进行诊断。或者，采样试剂盒可用于实验室或诊所或医院的环境中，其中试剂盒材料被提供给受试者或被提供用于由受过训练的专业人员从受试者收集样品。在一些情况下，可溶解膜可以被单独包装。可溶解膜可以在密封的包装袋或小袋中。或者，可溶解膜可以作为在密封包装中的堆叠或卷装的一组片材提供。
104.一种或多种系统可以包括一个或多个样品处理模块。样品处理模块可以被配置为鉴定生物样品中的至少一种微生物或代谢产物。
105.一个或多个样品处理模块可以被配置为执行用于鉴定微生物组或代谢产物群体的测定。这种测定或过程的非限制性示例包括聚合酶链反应(pcr)、实时pcr(rt-pcr)、定量实时pcr(qrt-pcr)、测序、连接酶链反应、核酸文库生成、链置换扩增、基因分型、elisa、微阵列、荧光测定、质谱、hplc或其他测定。一个或多个样品处理模块可以包括免疫测定、流式细胞仪、微芯片、测序仪、lc/ms、gc/ms或nmr。
106.鉴定微生物组的方法和系统可以包括鉴定微生物，例如细菌、古细菌、真菌和病毒。鉴定微生物组的方法和系统可以包括在属水平上的鉴定。可以鉴定的微生物属的非限制性示例包括拟杆菌属(bacteroides)、萨特氏菌属(sutterella)、粪杆菌属(faecalibacterium)、副拟杆菌属(parabacteroides)、考拉杆菌属(phascolarctobacterium)、小杆菌属(dialister)、黄杆菌属(flavonifractor)、毛螺菌属(lachnospira)、布劳特氏菌属(blautia)、巨球菌属(megasphaera)、粪球菌属(coprococcus)、厌氧棒状菌属(anaerostipes)、粪芽孢菌属(coprobacillus)、链型杆菌属(catenibacterium)、多尔氏菌属(dorea)、hungatella、霍尔德曼氏菌属(holdemanella)、erysipelatoclostridium、eisenbergiella、埃希菌属(escherichia)、lachnoclostridium、梭形杆菌属(fusobacterium)、双歧杆菌(bifidobacterium)、厌氧棍状菌属(anaerotruncus)、链球菌属(streptococcus)、普氏菌属(prevotella)、subdoligranulum、拟普雷沃菌属(alloprevotella)、巨单胞菌属(megamonas)、罗斯氏菌属(roseburia)、巴恩斯氏菌属(barnesiella)、脱硫弧菌属(desulfovibrio)、另枝菌属(alistipes)、瘤胃球菌属(ruminococcus)和臭气杆菌属(odoribacter)等。在一些情况下，可以在门水平上鉴定微生物。可以鉴定的门的非限制性示例包括拟杆菌门(bacteroidetes)、硬壁菌门(firmicutes)、变形菌门(proteobacteria)、疣微菌门(verrucomicrobia)、放线菌门(actinobacteria)、梭杆菌门(fusobacteria)和蓝细菌门(cyanobacteria)等。在一些情况下，可以在物种水平上鉴定微生物。
107.鉴定微生物组的方法和系统可以包括鉴定从受试者回收的生物样品中的代谢产物。代谢产物可以来自各种来源，例如，肠道、皮肤、口腔和粪便代谢产物。代谢产物的非限制性示例包括胆汁酸，例如胆酸、脱氧胆酸和石胆酸；甲胺，例如三甲胺(tma)、三甲胺-n-氧
化物(tmao)；多酚，例如儿茶素、肠二醇和肠内酯；吲哚类，例如3-甲基吲哚；短链脂肪酸，例如乙酸酯、丁酸酯和丙酸酯；多胺，例如亚精胺、精胺和腐胺；以及维生素，例如维生素b12、叶酸等。
108.在一些情况下，确定微生物组或代谢产物谱可以导致受试者疾病或病况的诊断。受试者可以宿主多种微生物和代谢产物。受试者在其身体上和体内的各种生境中可具有不同的微生物组和代谢产物。受试者可以被诊断或疑似患有疾病的风险。受试者可以具有促成疾病的微生物组或代谢产物状态。在一些情况下，受试者不一定被诊断或疑似患有该疾病的高风险。在一些情况下，受试者可以患有感染，或处于感染发展或传染给他人的风险中。
109.确定生物样品的微生物组和代谢产物群体后，可以生成报告。在鉴定生物样品的微生物组群体中存在的至少一种微生物或一个属之后，可以生成报告。在一些情况下，在鉴定生物样品中存在的至少一种代谢产物后，可以生成报告。报告还可以包括有关受试者的信息。在一些情况下，报告可以包括对特定病况或疾病的诊断。
110.尽管本文中已经示出并描述了本发明的优选实施方案，但对于本领域技术人员显而易见的是，这些实施方案仅以示例的方式提供。本发明并非意图由说明书中提供的特定示例来限制。尽管已经参考前述说明书对本发明进行了描述，但本文中的实施方案的描述和说明并不意味着以限制性的意义进行解释。本领域技术人员在不脱离本发明的情况下现将想到多种变化、改变和替代。此外，应当理解，本发明的所有方面不限于本文所阐述的依赖于各种条件和变量的具体描述、配置或相对比例。应当理解，本文中所述的本发明的实施方案的各种可替选方案可用于实施本发明。因此，可以预期的是，本发明还将涵盖任何这样的替选、修改、变化或等同方案。所附权利要求旨在限定本发明的范围，并由此涵盖这些权利要求范围内的方法和结构及其等同方案。实施例实施例1：粪便样品中微生物组的物种组成和丰度
111.收集了四个人粪便样品。如本文所述，使用水溶膜收集粪便样品1和3。粪便样品2和4为对照样品，其使用常规粪便样品收集方法、使用马桶帽和马桶勺收集。样品2和4不使用膜。这种方法的示例包括genotek、zymo和bgi所使用的方法。当受试者将使用厕纸时，使用水溶性膜。将每个水溶性膜溶解在稳定化溶液中。将粪便样品1和2溶解在包含dess(dmos/edta/饱和盐)dna防腐剂的稳定化溶液中。将粪便样品3和4溶解在包含bgi dna防腐剂试剂(基于溴化n-辛基吡啶的试剂；参见han等人microbiome(2018)6:43)的稳定化溶液中。
112.在将粪便样品与包含防腐剂试剂的稳定化溶液混合后，将每个样品送至实验室。使用标准方法从粪便样品提取dna。测试样品质量。如果样品质量不足，则再次提取dna。如果样品质量足够，则进行末端修复，并且进行3’a添加和衔接子连接。检查所得dna文库的质量。如果质量不佳，则再次提取dna，并且重复该过程。如果质量良好，则进行簇的制备和测序，并进行生物信息学分析。描述该过程的流程图可以见于图1中。
113.确定每个粪便样品的分类组成并将其显示为直方图。每个样品的直方图分别在门、纲和目水平上显示。直接显示每个物种在某个样品中的比例。
114.在门水平上，所有物种均用于产生直方图。在门水平上，样品中的分类组成分布在
图2中显示为相对丰度百分比。样品中存在放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、硬壁菌门、黏胶球形菌门(lentisphaerae)、变形杆菌、软壁菌门(tenericutes)、疣微菌门和未分类微生物。使用擦拭品收集的样品的结果与使用常规粪便样品收集方法收集的样品结果相似。
115.图3将在纲水平上的样品中的分类组成分布显示为相对丰度百分比。所有样品中丰度小于0.5％的物种被归类为“其他”。样品中存在4c0d-2、α变形菌纲(alphaproteobacteria)、拟杆菌纲(bacteroidia)、β变形菌(betaproteobacteria)、梭菌纲(clostridia)、柔膜菌纲(mollicutes)、疣微菌纲(verrucomicrobiae)、未分类微生物和其他微生物。使用擦拭品收集的样品的结果与使用常规粪便样品收集方法收集的样品结果相似。
116.图4将在目水平上的样品中的分类组成分布显示为相对丰度百分比。所有样品中丰度小于0.5％的物种被归类为“其他”。样品中存在拟杆菌目(bacteroidales)、伯克氏菌目(burkholderiales)、梭菌目(clostridiales)、rf32、rf39、疣微菌目(verrucomicrobiales)、ys2、未分类微生物和其他微生物。使用擦拭品收集的样品的结果与使用常规粪便样品收集方法收集的样品结果相似。