亚型特异性、背景许可性TGFβ1抑制剂及其用途的制作方法

文档序号:18973832发布日期:2019-10-29 03:06阅读:547来源:国知局
亚型特异性、背景许可性TGFβ1抑制剂及其用途的制作方法
根据35u.s.c.§119(e),本国际申请请求下列申请的优先权和利益:2017年1月6日提交的美国临时专利申请号62/443,615;2017年1月31日提交的美国临时专利申请号62/452,866;2017年6月2日提交的美国临时专利申请号62/514,417;2017年7月7日提交的美国临时专利申请号62/529,616;2017年8月24日提交的美国临时专利申请号62/549,767;2017年9月13日提交的美国临时专利申请号62/558,311;2017年11月13日提交的美国临时专利申请号62/585,227;2017年11月17日提交的美国临时专利申请号62/587,964;和2017年11月20日提交的美国临时专利申请号62/588,626,其全部内容各自明确通过引用并入本文。序列表本申请包含序列表,其已经以ascii格式电子提交,并且其全部内容通过引用并入本文。在2018年1月5日创建的所述ascii拷贝命名为127036-02020_st25.txt,大小为221,821字节。
背景技术
:生长因子的转化生长因子β(tgfβ)超家族参与许多调节不同生物过程的信号级联反应,包括但不限于:细胞生长的抑制、组织稳态、细胞外基质(ecm)重塑、内皮间质转化(emt)、细胞迁移和侵袭、免疫调节/抑制,以及间质上皮转化。关于ecm重塑,tgfβ信号传导可以增加成纤维细胞群和ecm沉积(例如,胶原蛋白)。在免疫系统中,tgfβ配体调节t调节细胞功能以及免疫前体细胞生长和体内平衡的维持。在正常的上皮细胞中,tgfβ是有效的生长抑制剂和细胞分化的促进剂。然而,随着肿瘤的发展和进展,它们经常失去对tgfβ的负生长应答。在这种情况下,tgfβ可能成为肿瘤发展的促进剂,因为它能够刺激血管生成、改变基质环境,并诱导局部和全身免疫抑制。由于这些和其他原因,tgfβ已成为许多临床适应症的治疗靶标。尽管许多研究组迄今已经做出很多努力,但tgfβ治疗剂的成功临床开发一直具有挑战性。临床前研究(包括大鼠和狗)的观察结果揭示了在体内与抑制tgfβ相关的某些毒性。此外,尽管迄今已经开发了几种tgfβ抑制剂,但由于副作用,大多数靶向tgfβ的临床程序已经中断(例如,wo2017/156500中的总结)。因此,尽管有直接和间接证据表明tgfβ信号传导参与例如癌症和纤维化等疾病的进展,但市场上没有安全有效的tgfβ治疗剂。在增生性病症中,tgfβ的失调也与骨髓纤维化有关,骨髓纤维化是一种以克隆性骨髓增生、异常细胞因子产生、髓外造血和骨髓纤维化为特征的骨髓疾病。尽管已经在该疾病的发病机制中鉴定出jak2、mpl和calr中的体细胞突变,但是fda批准用于治疗骨髓纤维化的jak1/jak2抑制剂ruxolitinib(jakafi)尚未证实其在改善患者中已建立的骨髓纤维化方面的功效。因此,需要用于抑制tgfβ信号传导的改进方法和组合物,所述改进方法和组合物可用于有效和安全地治疗涉及tgfβ1的疾病和病症,包括例如增殖性病症(例如癌症)、纤维化和炎症。技术实现要素:本发明包含认为在多种来源中阻断tgfβ激活可以在治疗涉及ecm方面和tgfβ失调的免疫方面两者的许多疾病中提供更大的临床效果。因此,本文提供了用tgfβ1抑制剂治疗这种疾病的改进方法,所述tgfβ1抑制剂在其亚型选择性、疾病生态位(niche)内的分子靶标的广度、效果的耐久性和安全性方面优于常规tgfβ拮抗剂。大量证据支持的概念认为,许多疾病明显表现出对tgfβ信号传导的复杂扰动,这可能涉及通过其与所谓的呈递分子的相互作用介导而赋予tgfβ功能的不同效应的异质细胞类型的参与。至少四个这样的呈递分子已被鉴定,其可以在各种细胞外生态位中“呈递”tgfβ,以使其响应于局部刺激激活。在一个类别中,tgfβ与介导ecm相关的tgfβ活性的ecm相关的呈递分子(例如ltbp1和ltbp3)一起沉积到ecm中。在另一个类别中,tgfβ通过介导某些免疫功能的呈递分子例如garp和lrrc33而系链(tether)到免疫细胞的表面上。这些呈递分子在多种组织和细胞类型中显示有差异的表达、定位和/或功能,表明触发事件和tgfβ激活的结果将根据微环境而变化。基于多种tgfβ效应可能影响并促成疾病进展的概念,能够拮抗tgfβ多个方面的治疗剂可以提供更大的功效。此前,发明者意识到tgfβ的亚型特异性抑制(与泛抑制相反)可赋予体内拮抗tgfβ的改进的安全性特征(参见wo2017/156500)。考虑到这一点,本发明人寻求开发其是i)亚型特异性;和ii)能够广泛的靶向与不同呈递分子相关的多种tgfβ1信号传导复合物两者的tgfβ1抑制剂,如用于由多方面tgfβ1效果及其失调驱动的症状的治疗剂。因此,本发明提供了能够靶向ecm相关tgfβ1和免疫细胞相关tgfβ1两者,从而阻断多种背景中存在的多种来源tgfβ1的亚型特异性抑制剂。这样的抑制剂在本文中被称为tgfβ1的“亚型特异性、背景许可性”抑制剂。本发明还提供了这些试剂在作为治疗以与tgfβ1功能的多个方面相关的tgfβ1信号传导的失调为特征的病症的治疗剂的用途。这样的抑制剂可以作为多功能剂起作用以拮抗多种tgfβ1活性(例如,来自多种来源或背景的tgfβ1),以增强在纤维化、骨髓纤维化、癌症和其他病症的背景中的临床效果。使用背景许可性(例如背景非依赖性)tgfβ1抑制剂作为治疗剂治疗某些疾病(如本文进一步详细描述的)优于使用背景特异性tgfβ1抑制剂的基本原理包括以下:异质tgfβ1复合物参与疾病环境:首先,各种疾病涉及异质细胞群作为tgfβ1的多种来源,其共同促成疾病的发病和/或进展。多于一种类型的含tgfβ1的复合物(“背景”)可能在同一疾病微环境中共存。特别地,这样的疾病可能涉及tgfβ1信号传导的ecm组分和tgfβ1信号传导的免疫组分两者。在这种情况下,选择性靶向单个tgfβ1环境(例如,与一种类型的呈递分子相关的tgfβ1)可以提供有限的缓解。相比之下,tgfβ1的背景许可性抑制剂是有利地旨在更广泛地靶向失活(前/潜在)tgfβ1复合物并在成熟的tgfβ1可被释放用于受体结合以触发下游信号传导之前防止生长因子在多个来源下的激活,同时保持亚型的选择性以将毒性减至最少。各种疾病的共同机制:其次,在肿瘤基质和纤维化组织之间观察到组织/细胞特征的显著相似性。表明在许多病理条件下观察到:i)tgfβ1依赖性促纤维化表型;ii)tgfβ1依赖性前肿瘤表型;iii)的tgfβ依赖性免疫抑制表型两者之间或三者之间的串扰(crosstalk)。因此,广泛作用于许多这些成分的背景许可性抑制剂的使用可以在多种类型的疾病状况中提供最佳治疗效果。例如,原发性骨髓纤维化的临床表现包括在骨髓中某些细胞群的异常增殖和纤维化。抵抗药物抗性:第三,一些研究已经报道了对抗癌疗法(例如免疫检查点抑制剂)具有抗性的癌症/肿瘤。在一些情况下,这样的抗性似乎是固有的针对患者背景下的特定癌症/肿瘤类型(通常称为先天抗性、初级抗性、固有抗性或遗传抗性;这些术语在本文中可互换使用)。这样的抗性可以体现在对癌症疗法(例如免疫检查点抑制剂)响应差的患者主体中,并且可能反映免疫排除的环境。这可能至少部分地由tgfβ1依赖性通路介导。因此,本文所述的亚型选择性抑制剂可使得抗性癌症对于这样的疗法更具有响应性。或者,抗性可以随时间发展,使得对治疗显示出物质临床反应性的患者变得响应差(即,适应性或获得性抗性)。例如,据报道,pd-1疗法可导致适应性抗性,其与其他t细胞抗原(例如,tcr组分)的上调相关,表明癌细胞通过另一种机制进化以逃避pd-1阻断。随后,靶向不同t细胞受体组分(例如tim3)的第二检查点抑制剂可恢复对免疫疗法的响应性。这些观察结果表明,阻断多种途径以抵抗癌细胞的适应性应答可以降低癌细胞逃避宿主免疫力的可能性。能够靶向多种tgfβ1背景tgfβ1的背景许可性抑制剂通过在tgfβ1功能的多个点提供阻断可以有利地规避获得性药物抗性。承受表达可塑性:最后,基于这样的观点,即多种呈递分子的表达可能随时间而变化,例如,响应于局部线索(例如,细胞因子、趋化因子、ecm环境等)和/或在疾病的微环境中的变化,推测tgfβ1的背景许可性抑制剂(例如本文所述的那些)可用于承受这样的可塑性,并且即使当呈递分子的表达发生异常变化时也提供广泛的、耐用的抑制作用。在任何这些情形中,tgfβ1的背景许可性抑制剂有利地旨在靶向与各种呈递分子相关的tgfβ1的前/潜在形式,所有这些分子或其不同组合存在于疾病微环境中。更具体地,在一种方式中,抑制剂靶向ecm相关的tgfβ1(ltbp1/3-tgfβ1复合物)。在另一种方式中,抑制剂靶向免疫细胞相关的tgfβ1。这包括garp呈递的tgfβ1,例如在treg细胞上表达的garp-tgfβ1复合物和在巨噬细胞和其他骨髓/淋巴细胞以及某些癌细胞上表达的lrrc33-tgfβ1复合物。这样的抗体包括tgfβ1的亚型特异性抑制剂,其以背景许可性(或背景非依赖)的方式结合并阻止成熟tgfβ1生长因子从前/潜在tgfβ1复合物中激活(或释放),使得抗体可抑制与多种类型的呈递分子相关的tgfβ1的激活(或释放)。特别地,本发明提供了能够阻断ecm相关tgfβ1(ltbp呈递和/或ltbp3呈递)的至少一种背景和细胞相关tgfβ1(garp呈递和/或lrrc33呈递)的至少一种背景的抗体。已经提出各种疾病症状涉及tgfβ信号传导失调作为促成因素。实际上,某些人类病症的发病和/或进展似乎主要由tgfβ1活性驱动或依赖于tgfβ1活性。特别地,许多这样的疾病和病症似乎涉及tgfβ1功能的ecm组分和免疫组分两者,表明涉及tgfβ1在多种背景下的激活(例如,由多于一种类型的呈递分子介导)。此外,可以预期的是tgfβ1响应性细胞之间存在串扰。在一些情况下,tgfβ1轴的多方面活动之间的相互作用可能导致疾病进展、恶化和/或抑制宿主抵抗疾病的能力。例如,某些疾病微环境(例如肿瘤微环境(tme))可以与由多种不同的呈递分子呈递的tgfβ1相关,例如ltbp1-protgfβ1、ltbp3-protgfβ1、garp-protgfβ1、lrrc33-protgfβ1及其任何组合。一种背景下的tgfβ1活性可以反过来调节或影响另一种背景下的tgfβ1活性,增加了当失调时其可能导致疾病状况恶化的可能性。因此,期望广泛抑制tgfβ1功能的多种模式(即多种背景),同时选择性地限制这种对tgfβ1亚型的抑制作用。其目的是不干扰由其他亚型(包括tgfβ3,其在伤口愈合中起重要作用)介导的稳态tgfβ信号传导。为了解决这个问题,本公开的发明人寻求产生tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂,其对于治疗由tgfβ1信号传导或其失调驱动或依赖于tgfβ1信号传导或其失调的疾病的治疗用途可能特别有利。为满足这样的抑制剂的标准而采取的方法是:i)以亚型特异性方式抑制tgfβ1信号传导的能力(不干扰tgfβ2和/或tgfβ3活性);和ii)抑制ecm相关和免疫细胞相关tgfβ1信号传导两者的能力。该方法的基本原理是平衡tgfβ1抑制的有效性(此处指临床效果)与潜在毒性。更具体地,在治疗剂量下实现对tgfβ1的选择性超过其他亚型旨在减少或最小化与体内tgfβ的泛抑制相关的可能的毒性(例如,不想要的副作用和不良事件),其中一些可能是正常生物学功能(如伤口愈合)所需的。另一方面,tgfβ1的多个背景的包含物作为治疗靶标旨在确保或最优化在涉及tgfβ1信号传导的多个方面失调的疾病中的临床功效。本发明包括临床应用和治疗方案的各种实施方式。因此,在一个方面,本文提供了tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂,其特征在于这样的抑制剂具有抑制ecm相关的tgfβ1信号传导和免疫细胞相关的tgfβ1信号传导两者的能力。具体地,这样的抑制剂可以阻断多个背景中呈递的tgfβ1(即,由两种或更多种类型的呈递分子介导的tgfβ1),同时保持tgfβ2和tgfβ3活性完好。因此,可被这样的抑制剂抑制的tgfβ1活性包括以下两种或更多种:i)与garp呈递的tgfβ1相关的tgfβ1信号传导;ii)与lrrc33呈递的tgfβ1相关的tgfβ1信号传导;iii)与ltbp1呈递的tgfβ1相关的tgfβ1信号传导;和iv)与ltbp3呈递的tgfβ1相关的tgfβ1信号传导。在一些实施方式中,这样的抑制剂靶向至少两种,或至少三种下列复合物的前蛋白形式:i)tgfβ1-garp;ii)tgfβ1-lrrc33;iii)tgfβ1-ltbp1;和iv)tgfβ1-ltbp3。在一些实施方式中,这样的抑制剂是特异性地结合并抑制i)tgfβ1-garp;iii)tgfβ1-ltbp1;和iv)tgfβ1-ltbp3的单克隆抗体。在一些实施方式中,这样的单克隆抗体特异性地结合并抑制ii)tgfβ1-lrrc33;iii)tgfβ1-ltbp1;和iv)tgfβ1-ltbp3。在一些实施方式中,这样的单克隆抗体特异性地结合并抑制i)tgfβ1-garp;ii)tgfβ1-lrrc33;和iii)tgfβ1-ltbp1。在一些实施方式中,这样的单克隆抗体特异性地结合并抑制i)tgfβ1-garp;ii)tgfβ1-lrrc33;和iv)tgfβ1-ltbp3。在一些实施方式中,这样的单克隆抗体特异性地抑制所有以下复合物:i)tgfβ1-garp;ii)tgfβ1-lrrc33;iii)tgfβ1-ltbp1;和iv)tgfβ1-ltbp3。在一些实施方式中,这样的单克隆抗体不结合其是游离tgfβ1的成熟tgfβ1(例如,从呈递分子释放或不与呈递分子复合的生长因子)。本发明的方面包括包含这样的抑制剂的组合物,包括例如适于在待治疗的人和非人受试者中施用的药物组合物。这样的药物组合物通常是无菌的。在一些实施方式中,这样的药物组合物还可包含至少一种药学上可接受的赋形剂,例如缓冲剂和表面活性剂(例如聚山梨醇酯)。包含这样的药物组合物的试剂盒也包括在本发明中。本文所述的亚型特异性、背景许可性抑制剂适用于治疗涉及tgfβ1的多种生物学功能及其失调的疾病或病症。特别地,这样的疾病或病症涉及tgfβ1功能的ecm组分和tgfβ1功能的免疫组分两者。因此,施用这样的抑制剂可以在体内抑制tgfβ1信号传导通路的每个轴(例如,与疾病或病症相关的多个tgfβ1靶标),增强治疗效果。因此,在另一方面,本发明包括这样的抑制剂在治疗患有与tgfβ1失调相关的疾病的受试者的方法中的治疗用途。tgfβ1信号传导的亚型特异性、背景许可性或背景非依赖性抑制剂特别适用于治疗由tgfβ1的多种功能(例如,ecm组分和免疫组分两者)驱动或依赖于tgfβ1的多种功能的疾病。通常,这样的疾病涉及其中tgfβ1由多种类型(例如,多种背景)的呈递分子呈递的多种细胞类型或细胞状态。在一个相关方面,本发明提供了用于具有改善的安全性特征(例如,降低的体内毒性)的亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂的筛选、生产和制备方法。这样的方法需要测试并选择tgfβ1亚型特异性,例如,选择对tgfβ1信号传导具有抑制活性而不对tgfβ2和/或tgfβ3信号传导具有抑制活性的候选试剂。根据本发明,这样的tgfβ1活性的亚型特异性抑制剂可以抑制tgfβ1功能的多种背景(见下文)。在一些实施方式中,这样的试剂是抗体或其抗原结合片段,其特异性结合并阻断tgfβ1而不是tgfβ2和/或tgfβ3的激活。在一些实施方式中,这样的抗体或其抗原结合片段不结合不与前/潜在复合物相关联的游离成熟tgfβ1生长因子。因此,相关的生产方法可包括筛选步骤,其中评估候选试剂(例如候选抗体或其片段)抑制与特定呈递分子(例如garp、lrrc33、ltbp1和/或ltbp3)相关的tgfβ1的能力。在一些实施方式中,无活性(例如,潜在的)前体复合物,例如garp-protgfβ1、lrrc33-protgfβ1、ltbp1-protgfβ1和ltbp3-protgfβ1,可用于测定成熟的具有活性的tgfβ1生长因子的激活。在存在或不存在测试剂(即候选抑制剂)的情况下,tgfβ1的激活可以通过任何合适的手段测量,包括但不限于体外测定和基于细胞的测定。类似的筛选步骤可用于通过使用tgfβ2和/或tgfβ3对应物来测试亚型特异性。可以进行这样的筛选步骤以鉴定候选试剂(例如候选抗体或其片段)以下列方式抑制tgfβ1信号传导的能力:i)亚型特异性方式;和ii)背景许可性或背景非依赖方式。某些疾病与不限于tgfβ功能的单一背景的tgfβ信号传导的多种生物学作用的失调有关。在这样的情况下,在疾病进展的发作和/或过程中涉及的多种背景下调节tgfβ效应可能是有益的。因此,在一些实施方式中,本发明提供了用于靶向和广泛抑制多个tgfβ1背景但以亚型特异性方式作用的方法。这样的药剂在本文中称为“亚型特异性、背景许可性”tgfβ1抑制剂。因此,背景许可性tgfβ1抑制剂靶向多种背景(例如,多种类型的前/潜在tgfβ1复合物)。优选地,这样的抑制剂靶向与ecm相关的tgfβ1预激活复合物(即,由ecm相关呈递分子呈递的前/潜在tgfβ1复合物)的至少一种类型(或“背景”)和另外的连接于细胞表面的tgfβ1预激活复合物(即由细胞或膜相关呈递分子呈递的前/潜在tgfβ1复合物)的至少一种类型(或“背景”)。在一些实施方式中,背景许可性tgfβ1调节剂靶向所有类型的前/潜在tgfβ1复合物(例如,garp相关的、lrrc33相关的、ltbp相关的等),以包括不考虑特定呈递分子的所有背景。在一些实施方式中,虽然背景许可性tgfβ1抑制剂能够靶向多于一种类型的前/潜在tgfβ1复合物(即,具有不同的呈递分子),这样的抑制剂可能比其他的更有利于(或显示出偏向性)一种或多种背景。因此,在一些实施方式中,抑制tgfβ1激活的背景许可性抗体可以优先抑制由一种呈递分子而不是另一种呈递分子介导的tgfβ1激活,即使这样的抗体能够结合两种类型的前/潜在复合物。在一些实施方式中,这样的抗体是结合并抑制ltbp1/3相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活但对于ltbp1/3相关tgfβ1具有优选的抑制活性的单克隆抗体。在一些实施方式中,这样的抗体是结合并抑制ltbp1相关tgfβ1、ltbp3相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活但对于ltbp1相关tgfβ1和ltbp3相关tgfβ1具有优选的抑制活性的单克隆抗体。在一些实施方式中,这样的抗体是结合并抑制ltbp1相关tgfβ1、ltbp3相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活但对于garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1具有优选的抑制活性的单克隆抗体。在一些实施方式中,这样的抗体是结合并抑制garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活但对于garp相关tgfβ1具有优选的抑制活性的单克隆抗体。在一些实施方式中,这样的抗体是结合并抑制garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活但对于lrrc33相关tgfβ1具有优选的抑制活性的单克隆抗体。因此,根据本发明,可以产生不同程度的选择性以靶向tgfβ效果的子集。亚型特异性抑制剂tgfβ(其靶向tgfβ的单一亚型)提供比所谓的pan-tfgβ抑制剂(其靶向tgfβ的多种或所有亚型)更高的选择性。本发明包括这样的tgfβ1抑制剂在治疗与tgfβ1失调相关的疾病的方法中的用途。在其中tgfβ1亚型在驱动疾病中起主导作用(超过tgfβ2/3)和其中疾病涉及ecm成分和tgfβ1信号传导的免疫组分两者的情况中使用这样的抑制剂是特别有利的。这种方法旨在保持正常的或稳态的tgfβ功能,同时优先靶向疾病相关的tgfβ功能。这样的抑制剂优选地是tgfβ1激活抑制剂(即,tgfβ1激活步骤的抑制剂)。在优选的实施方式中,这样的抑制剂能够在激活之前靶向无活性形式的tgfβ1(前/潜在tgfβ1复合物),以实现相比于靶向已经从潜在的复合体中释放的瞬时的、已经激活的、可溶性/游离形式的生长因子更持久的抑制。疾病相关的tgfβ1的来源/背景的确定可以通过使用特异性结合包括感兴趣的特定呈递分子(例如,garp、lrrc33、ltbp1、ltbp3等)的tgfβ1潜在复合体的抗体来完成。本公开的方面涉及免疫球蛋白,例如抗体或其抗原结合部分,其特异性结合至少三种以下复合物:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。根据本发明,这样的免疫球蛋白特异性结合至少一种类型的ecm相关的(例如,ecm系链的)tgfβ1复合物(例如,ltbp1和/或ltbp3相关的tgfβ1复合物)和一种类型的细胞相关的(例如,细胞表面系链的)tgfβ1复合物(例如,garp和/或lrrc33相关的tgfβ1复合物),以在多种背景下实现广泛的抑制作用。本文所述的抗体或其抗原结合部分特异性结合tgfβ1(例如lap)或包含tgfβ1(例如lap)的蛋白质复合物的组分的表位,当tgfβ1存在于garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1中时,其可用于被抗体或其抗原结合部分结合。在一些实施方式中,当tgfβ1存在于以下两种或更多种蛋白质复合物中时,表位可用于抗体结合:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物;和其中抗体不结合与前/潜在复合物不相关的游离成熟tgfβ1生长因子。在一些实施方式中,tgfβ1是protgfβ1和/或潜在tgfβ1(例如,前/潜在tgfβ1)。在一些实施方式中,所述tgfβ1是潜在tgfβ1。在一些实施方式中,tgfβ1是protgfβ1。根据本发明的亚型特异性tgfβ1抑制剂不结合tgfβ2。根据本发明的亚型特异性tgfβ1抑制剂不结合tgfβ3。在一些实施方式中,这样的抑制剂不结合前/潜在tgfβ2。在一些实施方式中,这样的抑制剂不结合前/潜在tgfβ3。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分不妨碍tgfβ1结合整联蛋白的能力。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:87的氨基酸序列的cdr3的重链可变结构域和其包含具有seqidno:90的氨基酸序列的cdr3的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:86的氨基酸序列的cdr2的重链可变结构域和其包含具有seqidno:89的氨基酸序列的cdr2的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:85的氨基酸序列的cdr1的重链可变结构域和其包含具有seqidno:88的氨基酸序列的cdr1的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体包含与seqidno:99中所示的氨基酸序列至少90%相同的重链多肽序列。在一些实施方式中,抗体包含与seqidno:100中所示的氨基酸序列至少90%相同的轻链多肽序列。在一些实施方式中,抗体包含与seqidno:99中所示的氨基酸序列至少90%相同的重链多肽序列和与seqidno:100中所示的氨基酸序列至少90%相同的轻链多肽序列。在一些实施方式中,这样的抗体包含seqidno:85-90中所示的cdr。在一些实施方式中,抗体由seqidno:99的两种多肽和seqidno:100的两种多肽组成。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含与seqidno:95中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含与seqidno:97中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含seqidno:95中所示的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含seqidno:97中所示的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分抑制tgfβ1激活,但不抑制tgfβ2激活或tgfβ3激活。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分抑制成熟tgfβ1从garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的释放。在一个方面,本文提供一种药物组合物,其包含如本文所述的抗体或其抗原结合部分,和药学上可接受的载体。这样的药物组合物通常是无菌的并且适合于在人类受试者中施用。在一些实施方式中,这样的药物组合物可以作为试剂盒提供,其包含在本发明中。另一方面,本文提供了抑制tgfβ1激活的方法,所述方法包括将garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物暴露于抗体、其抗原结合部分或本文所述的药物组合物。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分抑制成熟tgfβ1从garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物中的释放。在一些实施方式中,所述方法在体外进行。在一些实施方式中,所述方法在体内进行。因此,本发明包括用于治疗人受试者中与tgfβ1信号的失调相关的疾病的方法。这样的方法包括以下步骤:以有效治疗所述疾病的量向有需要的人类受试者施用本文提供的药物组合物,其中当施用于患有所述疾病的患者群体时,所述量达到统计学显著的临床功效和安全性。在另一个方面,本文提供了用于减少受试者中的副作用的tgfβ抑制剂,其中tgfβ抑制剂是亚型选择性的。在一些实施方式中,tgfβ抑制剂是特异性抑制tgfβ1同时广泛靶向多种背景的抗体。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是t细胞、成纤维细胞、肌成纤维细胞、巨噬细胞、单核细胞、树突细胞、抗原呈递细胞、嗜中性粒细胞、髓系抑制性细胞(mdsc)、淋巴细胞、肥大细胞、巨核细胞、天然杀伤(nk)细胞、小胶质细胞,或任何一种这样的细胞的祖细胞。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是造血干细胞。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或所述lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是神经嵴衍生细胞。t细胞可以是调节性t细胞(例如,免疫抑制性t细胞)。t细胞可以是cd4阳性(cd4+)t细胞和/或cd8阳性(cd8+)t细胞。嗜中性粒细胞可以是激活的嗜中性粒细胞。巨噬细胞可能是极化的巨噬细胞,包括促纤维化和/或肿瘤相关巨噬细胞(tam),例如m2c亚型和m2d亚型的巨噬细胞。巨噬细胞可以被一种或多种可溶性因子激活,例如生长因子、细胞因子、趋化因子和/或存在于特定疾病微环境(例如tme)中的其他分子,其可以自分泌、旁分泌和/或内分泌方式起作用。在一些实施方式中,巨噬细胞被m-csf激活,例如由实体瘤分泌的m-csf。在一些实施方式中,巨噬细胞被tgfβ1激活。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是癌细胞,例如,循环癌细胞和肿瘤细胞。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞被募集到疾病部位,例如tme(例如,肿瘤浸润)。在一些实施方式中,garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的表达由疾病微环境(例如,tme)诱导。在一些实施方式中,实体瘤包括升高的白细胞浸润物,例如cd45+。预期肿瘤相关的cd45+细胞包括表达garp的和/或表达lrrc33的细胞。在一些实施方式中,ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物结合至细胞外基质(即,ecm的组分)。在一些实施方式中,细胞外基质包含原纤蛋白和/或纤连蛋白。在一些实施方式中,细胞外基质包含含有rgd基序的蛋白质。在一些实施方式中,产生和沉积ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物的细胞存在于实体瘤中,例如癌细胞和基质细胞。在一些实施方式中,产生和沉积ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物的细胞存在于纤维化组织中。在一些实施方式中,产生和沉积ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物的细胞存在于骨髓中。在一些实施方式中,产生和沉积ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物的细胞是肌成纤维细胞或肌成纤维细胞样细胞,包括例如癌相关成纤维细胞(caf)。在另一个方面,本文提供了用于在受试者中减少tgfβ1激活的方法,所述方法包括向受试者施用有效量的如本文所述的抗体、其抗原结合部分或药物组合物,从而减少受试者中的tgfβ1激活。在一些实施方式中,受试者患有纤维化病症或处于患纤维化病症的风险。在一些实施方式中,纤维化病症包括受影响的组织/器官的慢性炎症。在一些实施方式中,受试者患有肌营养不良症。在一些实施方式中,受试者患有杜氏肌营养不良症(dmd)。在一些实施方式中,受试者患有肝纤维化、肾纤维化、肺纤维化(例如,特发性肺纤维化)、子宫内膜异位症或子宫纤维化,或处于患这些病症的风险。在一些实施方式中,受试者患有癌症(例如,实体瘤、血癌和骨髓纤维化)或处于患这些癌症的风险。在一些实施方式中,受试者患有痴呆症或处于患痴呆症的风险。在一些实施方式中,受试者还接受另外的疗法。在一些实施方式中,另外的疗法选自肌生成抑制蛋白抑制剂、vegf激动剂、igf1激动剂、fxr激动剂、ccr2抑制剂、ccr5抑制剂、双重ccr2/ccr5抑制剂、赖氨酰氧化酶样-2抑制剂、ask1抑制剂、乙酰辅酶a羧化酶(acc)抑制剂、p38激酶抑制剂、吡非尼酮(pirfenidone),尼达尼布(nintedanib)、gdf11抑制剂、jak抑制剂(例如,jak2抑制剂),或其任何组合。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分减少了调节性t细胞(treg细胞)的抑制活性。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分不诱导受试者中的器官毒性。在一些实施方式中,器官毒性包括心血管毒性、胃肠毒性、免疫毒性、骨毒性、软骨毒性、生殖系统毒性或肾毒性。在一个方面,本文提供了用于在有需要的受试者中治疗癌症的方法,所述方法包括向受试者施用有效量的如本文所述的抗体、其抗原结合部分,或药物组合物,从而治疗受试者中的癌症。在另一个方面,本文提供了一种减少有需要的受试者中的肿瘤生长的方法,所述方法包括向受试者施用有效量的如本文所述的抗体、其抗原结合部分,或药物组合物,从而减少受试者中的肿瘤生长。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分与另外的试剂或另外的疗法组合施用。在一些实施方式中,另外的试剂是检查点抑制剂。在一些实施方式中,另外的试剂选自pd-1拮抗剂、pdl1拮抗剂、pd-l1或pdl2融合蛋白、ctla4拮抗剂等。这样的联合疗法可有利地使用较低剂量的所施用治疗剂,因此避免了与各种单一疗法或常规联合疗法相关的可能的毒性或并发症,所述单一疗法或常规联合疗法缺乏本发明实现的选择性/特异性程度。在一些实施方式中,所述方法还包括确定(例如,测试或确认)tgfβ1在所述疾病中相对于tgfβ2和tgfβ3的参与程度。在一些实施方式中,所述方法还包括以下步骤:鉴定疾病相关tgfβ1的来源(或背景)。在一些实施方式中,通过确定tgfβ呈递分子(例如ltbp1、ltbp3、garp和lrrc33)的表达来评估取自患者的临床样品中的来源/背景。在另一个方面,本文提供制备(例如,产生、制造)用于抑制tgfβ信号传导的药物组合物的方法,所述方法包括以下步骤:提供抑制至少一种tgfβ亚型的一种或多种试剂;测量一种或多种试剂对tgfβ的所有亚型的活性;选择对tgfβ1具有选择性的试剂;配制成包含亚型特异性tgfβ1抑制剂和药学上可接受的赋形剂(例如合适的缓冲液)的药物组合物。还提供了通过这样的方法产生的药物组合物。在一些实施方式中,所述方法还包括确定(例如,测量、测定)一种或多种试剂的背景依赖性抑制活性的步骤。本发明的主题还涉及2013年11月6日提交的pct/us2013/068613、2014年5月6日提交的pct/us2014/036933和2017年3月10日提交的pct/us2017/021972的主题,其全部内容各自通过引用并入本文。附图说明图1提供了描绘组织微环境中潜在复合物内tgfβ1的示意图。图2a-2c阐明了tgfβ1功能的多种背景:garp呈递的tgfβ1在调节性t细胞上表达,其参与免疫调节(图2a);ltbp1/3呈递的tgfβ1由成纤维细胞和其他细胞沉积到ecm中(图2b);和lrrc33呈递的tgfβ1在骨髓细胞上表达,包括巨噬细胞(图2c)。图3阐明了用于制备garp-tgfβ1复合物和ltbp-tgfβ1复合物的蛋白质表达平台。基于hek293的表达系统使用ni-nta亲和纯化和凝胶过滤来获得数毫克量的纯化蛋白。显示野生型protgfβ1、ltpb1、sgarp和protgfβ1c4s的示意图。图4a描绘了ab3与潜在tgfβ1的特异性结合。图4b显示示例性单克隆抗体的结合特异性。图4b描绘了通过elisa测量的ab1和ab2特异性结合protgfβ1,但不结合protgfβ2、protgfβ3或成熟tgfβ1。图4c描绘了特异性结合(通过elisa测量)至ltbp1-protgfβ1复合物的抗体的实例。图5提供了现有技术制备的抗成熟tgfβ生长因子的抗体,及其对于所有三个亚型各自的结合特征(profile)的图。图6a-6b提供了通过octet测量的亚型特异性、背景许可性/非依赖性的tgfβ1抑制剂ab1、ab2和ab3的结合特征。图7a-7h提供了基于细胞的抑制测定。图8显示了ab3在体外对激肽释放酶诱导的tgfβ1激活的抑制效果。图9a-9b显示了ab1和ab3对效应t细胞增殖的调节性t细胞依赖性抑制的抑制效果。图10a-10c显示了在极化巨噬细胞中细胞表面lrrc33表达的上调。图11提供了从t细胞共转移结肠炎模型得到的结果。图12a-12k显示了ab2对uuo的tgfb1依赖性机制疾病模型的抑制效果。图13a-13c显示了ab3对uuo的tgfb1依赖性机制疾病模型的抑制效果。图14提供了ab3对四氯化碳诱导的肝纤维化模型的抑制效果。图15提供了ab3对alport小鼠中纤维化的转化模型的抑制效果。图16显示了ab2对mc38癌中肿瘤生长的抑制效果。图17提供了ab3与pd-1拮抗剂的组合对在emt-6肿瘤模型的存活的效果。图18a-18f提供了表明ab2在大鼠中改善安全性特征的毒理学/耐受性数据。图19a-19b提供了表明ab3在大鼠中改善安全性特征的毒理学/耐受性数据。图20提供了表明ab3在稳态大鼠bal细胞中的体内亚型选择性。图21a-21d提供了tgfβ亚型的相对表达。图21a显示tgfβ亚型表达相对于正常比较物(按癌症类型分)。图21b显示按人癌症类型分的tgfβ亚型表达的频率。图21c显示按癌症类型分的个体肿瘤样本中tgfβ亚型的表达。图21d显示小鼠同系癌细胞模型系中的tgfβ亚型的表达。图22描绘了来自1周的研究中来自pan-tfgβ抗体的显微心脏发现。具体实施方式在哺乳动物中,转化生长因子-β(tgfβ)超家族由至少33种基因产物组成。这些包括骨形态发生蛋白(bmp)、激活素、生长和分化因子(gdf),以及tgfβ家族的三种亚型:tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3。tgfβ被认为在多种过程中起关键作用,例如抑制细胞增殖、细胞外基质(ecm)重塑和免疫稳态。通过观察到tgfβ1-/-小鼠仅存活3-4周、由于大量免疫激活而导致多器官衰竭,揭示了tgfβ1对t细胞稳态的重要性(kulkarni,a.b.,等,,procnatlacadsciusaa,1993.90(2):p.770-4;shull,m.m.,等,nature,1992.359(6397):p.693-9)。tgfβ2和tgfβ3的作用尚不清楚。虽然三种tgfβ亚型具有不同的时间和空间表达模式,但它们通过相同的受体tgfβri和tgfβrii发出信号,尽管在某些情况下(例如tgfβ2信号传导)也需要iii型受体如β聚糖(feng,x.h.andr.derynck,annurevcelldevbiol,2005.21:p.659-93;massague,j.,annurevbiochem,1998.67:p.753-91)。配体诱导的tgfβri/ii寡聚化触发smad转录因子的磷酸化,导致靶基因的转录,例如col1a1、col3a1、acta2和serpine1(massague,j.,j.seoane,andd.wotton,genesdev,2005.19(23):p.2783-810)。还描述了smad非依赖性tgfβ信号传导通路,例如在癌症或marfan小鼠的主动脉病变中(derynck,r.andy.e.zhang,nature,2003.425(6958):p.577-84;holm,t.m.,等,science,2011.332(6027):p.358-61)。tgfβ通路在人体中的生物学重要性已经通过遗传疾病得到验证。导致骨发育不良的camurati-engelman病是由于tgfb1基因中的常染色体显性突变,引起tgfβ1信号传导的组成型激活(janssens,k.,等,jmedgenet,2006.43(1):p.1-11)。患有loeys/dietz综合征的患者携带tgfβ信号通路组分中的常染色体显性突变,其导致主动脉瘤、高血压和双歧悬雍垂(vanlaer,l.,h.dietz,andb.loeys,advexpmedbiol,2014.802:p.95-105)。由于tgfβ通路失调与多种疾病相关,因此已开发出几种靶向tgfβ通路的药物并在患者中进行了测试,但成效有限。tgfβ信号传导的失调与多种人类疾病相关。实际上,在许多疾病状况中,这样的失调可能涉及tgfβ功能的多个方面。患病组织(例如纤维化和/或发炎的组织和肿瘤)可能产生其中tgfβ激活可导致疾病的恶化或进展的局部环境,这可能至少部分地由多种tgfβ响应细胞之间的相互作用介导,其是以自分泌和/或旁分泌的方式与在特定疾病环境中起作用的许多其他细胞因子、趋化因子和生长因子一起激活。例如,除了癌症(即恶性)细胞之外,肿瘤微环境(tme)还包含表达tgfβ1的多种细胞类型,例如激活的肌成纤维细胞样成纤维细胞、基质细胞、浸润性巨噬细胞、mdsc和其他免疫细胞。因此,tme代表表达和/或响应于tgfβ1但与生态位内的一种以上类型的呈递分子(例如ltbp1、ltbp3、lrrc33和garp)相关的异质细胞群。为了有效地抑制涉及多种细胞类型和信号传导“背景”的失调或疾病驱动的tgfβ1活性,本发明的发明人寻求开发一类具有抑制多种tgfβ1功能但以亚型特异性方式作用的能力的试剂。如本文所定义,这样的试剂被称为tgfβ1的“亚型特异性、背景许可性”抑制剂。在一些实施方式中,这样的抑制剂是tgfβ1的亚型特异性、背景非依赖性抑制剂。预期使用tgfβ1的亚型特异性、背景许可性或背景非依赖性抑制剂可以对涉及表达和/或响应tgfβ1信号传导的各种细胞类型的相互作用的疾病中tgfβ1功能的多种模式发挥其抑制作用,从而通过靶向多种类型的tgfβ1前体复合物来增强治疗效果。因此,这样的抑制剂的治疗靶标包括至少三种以下复合物:i)由garp呈递的protgfβ1;ii)由lrrc33呈递的protgfβ1;iii)由ltbp1呈递的protgfβ1;iv)由ltbp3呈递的protgfβ1。通常,上述复合物(i)和(ii)存在于细胞表面上,因为garp和lrrc33两者都是能够在细胞外表面上呈递tgfβ1的跨膜蛋白,而复合物(iii)和(iv)是细胞外基质的组分。许多研究揭示了tgfβ1激活的机制。三种整联蛋白αvβ6、αvβ8和αvβ1已被证明是潜在tgfβ1的关键激活因子(reed,n.i.,等,scitranslmed,2015.7(288):p.288ra79;travis,m.a.andd.sheppard,annurevimmunol,2014.32:p.51-82;munger,j.s.,等,cell,1999.96(3):p.319-28)。αv整联蛋白以高亲和力结合tgfβ1和tgfβ1lap中存在的rgd序列(dong,x.,等,natstructmolbiol,2014.21(12):p.1091-6)。具有阻止整联蛋白结合但不阻止分泌的tgfβ1rgd位点的突变的转基因小鼠模拟tgfβ1-/-小鼠的表型(yang,z.,等,jcellbiol,2007.176(6):p.787-93)。缺乏β6和β8整联蛋白两者的小鼠再现了tgfβ1和tgfβ3敲除小鼠的所有基本表型,包括多器官炎症和腭裂,证实了这两种整联蛋白对发育和内稳态中tgfβ1激活的重要作用(aluwihare,p.,等,jcellsci,2009.122(pt2):p.227-32)。整联蛋白依赖性激活潜在tgfβ1的关键是共价连接至呈递分子;通过诱变破坏garp和tgfβ1lap之间的二硫键不会损害复合物的形成,但完全消除αvβ6对tgfβ1的激活(wang,r.,等,molbiolcell,2012.23(6):p.1129-39)。潜在tgfβ1的最近结构阐明了整联蛋白如何能够从潜在复合物中释放活性tgfβ1:潜在tgfβ1与其呈递分子的共价连接将潜在tgfβ1通过ltbp锚定至ecm,或通过garp或lrrc33锚定至细胞骨架。整联蛋白与rgd序列的结合导致lap结构的外力依赖性变化,允许具有活性的tgfβ1释放并结合附近的受体(shi,m.,等,nature,2011.474(7351):p.343-9)。疾病中整联蛋白依赖性tgfβ1的激活的重要性也得到了很好的验证。αvβ1的小分子抑制剂可防止博来霉素诱导的肺纤维化和四氯化碳诱导的肝纤维化(rreed,n.i.,等,scitranslmed,2015.7(288):p.288ra79),并且用抗体阻断αvβ6或整联蛋白β6表达丧失抑制博来霉素诱导的肺纤维化和放射诱导的纤维化(munger,j.s.,等,cell,1999.96(3):p.319-28);horan,g.s.,等,amjrespircritcaremed,2008.177(1):p.56-65)。除整联蛋白外,tgfβ1激活的其他机制也有涉及,包括血小板反应蛋白-1和通过蛋白酶例如基质金属蛋白酶(mmp)、组织蛋白酶d或激肽释放酶的激活。然而,这些研究中的大多数是使用纯化的蛋白质在体外进行的;这些分子在体内研究中的作用的证据较少。血小板反应蛋白-1的敲除再现了某些组织中tgfβ1-/-表型的某些方面,但在博来霉素诱导的肺纤维化(已知其为tgfβ依赖性)中不具有保护作用((ezzie,m.e.,等,amjrespircellmolbiol,2011.44(4):p.556-61)。另外,敲除候选蛋白酶不会导致tgfβ1表型(worthington,j.j.,j.e.klementowicz,andm.a.travis,trendsbiochemsci,2011.36(1):p.47-54)。这可以通过重复(redundance)或这些机制在特定疾病中而不是发展和内稳态中具有关键性来解释。因此,本文所述的亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂包括通过防止tgfβ1激活的步骤起作用的抑制剂。在一些实施方式中,这样的抑制剂可抑制整联蛋白依赖性(例如,机械或外力驱动)的tgfβ1激活(参见图2)。在一些实施方式中,这样的抑制剂可抑制蛋白酶依赖性或蛋白酶诱导的tgfβ1激活。后者包括以整联蛋白非依赖性方式抑制tgfβ1激活步骤的抑制剂。在一些实施方式中,这样的抑制剂可抑制tgfβ1激活,而与激活模式无关,例如,抑制tgfβ1的整联蛋白依赖性激活和蛋白酶依赖性激活两者。可激活tgfβ1的蛋白酶的非限制性实例包括丝氨酸蛋白酶,例如激肽释放酶、化学胰蛋白酶、胰蛋白酶、弹性蛋白酶、纤溶酶,以及锌金属蛋白酶(mmp家族)例如mmp-2、mmp-9和mmp-13。激肽释放酶包括血浆激肽释放酶和组织激肽释放酶,例如klk1、klk2、klk3、klk4、klk5、klk6、klk7、klk8、klk9、klk10、klk11、klk12、klk13、klk14和klk15。图8提供了tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂的一个实例,其可在体外抑制激肽释放酶依赖性tgfβ1激活。在一些实施方式中,本发明的抑制剂防止具有活性(成熟)的tgfβ1生长因子从潜在复合物中的释放或解离。在一些实施方式中,这样的抑制剂可通过稳定复合物的不具有活性(例如潜在)的构象起作用。tgfβ已涉及许多生物过程,包括纤维化、免疫调节和癌症进展。tgfβ1是tgfβ蛋白质超家族中第一个被鉴定的成员。与tgfβ超家族的其他成员一样,tgfβ1与tgfβ2和tgfβ3亚型最初表达为无活性前体的前蛋白形式(称为protgfβ)。tgfβ蛋白(例如tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3)被前蛋白转化酶(例如弗林蛋白酶)进行蛋白水解切割,产生潜在形式(称为潜在tgfβ)。在一些实施方式中,tgfβ蛋白的前蛋白形式或潜在形式(例如,tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3)可称为“前/潜在tgfβ蛋白”。tgfβ1可以与多种分子形成复合物呈递给其他分子,所述多种分子包括例如garp(以形成garp-tgfβ1复合物)、lrrc33(以形成lrrc33-tgfβ1复合物)、ltbp1(以形成ltbp1-tgfβ1复合物),和/或ltbp3(以形成ltbp3-tgfβ1复合物)。存在于这些复合物中的tgfβ1可以是潜在形式(潜在tgfβ1)或前体形式(protgfβ1)。本发明对与不限于tgfβ1功能的单一背景的tgfβ1信号传导的多种生物学角色相关的某些疾病的治疗是特别有用的。在这样的情况下,它可能对抑制多背景的tgfβ1效应是有益的。因此,在一些实施方式中,本发明提供了以亚型特异性方式而非背景特异性方式靶向和抑制tgfβ1的方法。这样的试剂可称为“亚型特异性、背景许可性”tgfβ1调节剂。在一些实施方式中,背景许可性tgfβ1调节剂靶向多种背景(例如,多种类型的原/潜在tgfβ1复合物)。在一些实施方式中,背景许可性tgfβ1调节剂靶向所有类型的前/潜在tgfβ1复合物(例如,garp相关、lrrc33相关、ltbp相关等),以包含所有背景。虽然背景许可性tgfβ1抑制剂能够靶向多于一个类型的前/潜在tgfβ1复合物(即,具有不同的呈递分子),在一些实施方式中,这样的抑制剂可能有利于超过其他的一种或多种背景。因此,在一些实施方式中,抑制tgfβ1激活的背景许可性抗体可以优先抑制由一种呈递分子介导的tgfβ1激活超过另一种呈递分子,即使这种抗体能够结合两种类型的前/潜在复合物。在一些实施方式中,这样的抗体是单克隆抗体,其结合并抑制ltbp相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活,但具有对ltbp相关tgfβ1的优先抑制活性。在一些实施方式中,这样的抗体是单克隆抗体,其结合并抑制ltbp1相关tgfβ1、ltbp3相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活,但具有对ltbp1相关和ltbp3相关的tgfβ1的优先抑制活性。在一些实施方式中,这样的抗体是单克隆抗体,其结合并抑制ltbp1相关tgfβ1、ltbp3相关tgfβ1、garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活,但具有对garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的优先抑制活性。在一些实施方式中,这样的抗体是单克隆抗体,其结合并抑制garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活,但具有对garp相关tgfβ1的优先抑制活性。在一些实施方式中,这样的抗体是单克隆抗体,其结合并抑制garp相关tgfβ1和lrrc33相关tgfβ1的激活,但具有对lrrc33相关tgfβ1的优先抑制活性。因此,根据本发明,可以为靶向tgfβ效应的子集而产生的不同程度的选择性。tgfβ1的亚型特异性抑制剂(其靶向tgfβ的单一亚型,例如tgfβ1)提供比pan-tfgβ抑制剂(其靶向tgfβ的多种或所有亚型)更高的选择性。tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂(其靶向tgfβ1的单一亚型的多种背景)提供比亚型特异性抑制剂更高的选择性。tgfβ1的亚型特异性、背景非依赖性抑制剂(其靶向和抑制tgfβ1功能而不管与哪种呈递分子相关)提供亚型特异性,同时允许对tgfβ1多种活性的更广泛覆盖的抑制作用。定义为了使本发明更易于理解,首先定义某些术语。应根据本公开的其余部分并且如本领域普通技术人员所理解的那样阅读这些定义。除非另有定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本领域普通技术人员通常理解的含义相同的含义。在整个详细描述中阐述了另外的定义。抗体:术语“抗体”包括任何天然存在的、重组的、修饰或工程化的免疫球蛋白或免疫球蛋白样结构或其抗原结合片段或部分,或它们的衍生物,如本文别处进一步所述。因此,该术语意指特异性结合至靶抗原的免疫球蛋白分子,并且包括例如嵌合、人源化、完全人源和双特异性抗体。完整抗体通常包含至少两条全长重链和两条全长轻链,但在一些情况下可包括更少的链,例如天然存在于骆驼科动物中可以仅包含重链的抗体。抗体可以仅源自单一来源,或者可以是“嵌合的”,即抗体的不同部分可以来源于两种不同的抗体。抗体或其抗原结合部分可以通过重组dna技术或通过对完整抗体的酶促或化学切割在杂交瘤中产生。如本文所用,术语抗体分别包括单克隆抗体、双特异性抗体、微抗体、结构域抗体、合成抗体(本文中有时称为“抗体模拟物”)、嵌合抗体、人源化抗体、人抗体,抗体融合物(本文中有时称为“抗体缀合物”)。在一些实施方式中,该术语还包括肽体。抗原:术语“抗原”是指提供表位的一种分子结构,例如,能够被选择性结合剂例如抗原结合蛋白(包括例如抗体)结合的分子或分子的一部分,或分子或分子的一部分的复合体。因此,选择性结合剂可以特异性结合至由复合物中的两种或更多种组分形成的抗原。在一些实施方式中,所述抗原能够在动物中使用以产生能够结合至该抗原的抗体。抗原可具有能够与不同抗原结合蛋白(例如抗体)相互作用的一个或多个表位。抗原结合部分/片段:如本文所用,术语抗体的“抗原结合部分”或“抗原结合片段”意指保留特异性结合抗原(例如,tgfβ1)的能力的抗体的一个或多个片段。抗原结合部分包括但不限于特异性结合至抗原以形成复合物的任何天然存在的、可酶促获得的、合成的或基因工程化的多肽或糖蛋白。在一些实施方式中,抗体的抗原结合部分可以例如使用任何合适的标准技术从完整抗体分子衍生而来,例如蛋白水解消化或涉及操纵和表达编码抗体可变和任选恒定结构域的dna的重组基因工程技术。抗原结合部分的非限制性实例包括:(i)fab片段,由vl、vh、cl和ch1结构域组成的单价片段;(ii)f(ab')2片段,包含通过铰链区的二硫键连接的两个fab片段的二价片段;(iii)由vh和ch1结构域组成的fd片段;(iv)由抗体单臂的vl和vh结构域组成的fv片段;(v)单链fv(scfv)分子(参见,例如,bird等(1988)science242:423-426;andhuston等(1988)proc.nat'l.acad.sci.usa85:5879-5883);(vi)dab片段(参见,例如,ward等(1989)nature341:544-546);和(vii)由抗体的模拟高变区的氨基酸残基组成的最小识别单位(例如,分离的互补决定区(cdr))。还包括其他形式的单链抗体,例如双抗体。术语抗体的抗原结合部分包括“单链fab片段”,也称为“scfab”,其包含抗体重链可变结构域(vh)、抗体恒定结构域1(ch1)、抗体轻链可变结构域(vl),抗体轻链恒定结构域(cl)和接头,其中抗体结构域和接头在n末端至c末端方向具有以下顺序之一:a)vh-ch1-接头-vl-cl,b)vl-cl-接头-vh-ch1,c)vh-cl-接头-vl-ch1或d)vl-ch1-接头-vh-cl;和其中所述接头是至少30个氨基酸,优选是32至50个氨基酸的多肽。癌症:如本文所用,术语“癌症”意指在多细胞真核生物中的生理状况,其典型特征是不受调节的细胞增殖和恶性肿瘤。因此,该术语广泛地包括实体瘤、血癌(例如,白血病),以及骨髓纤维化和多发性骨髓瘤。细胞相关tgfβ1:该术语意指膜结合(例如,与细胞表面系链)的tgfβ1或其信号传导复合物(例如,前/潜在tgfβ1)。通常,这样的细胞是免疫细胞。由garp或lrrc33呈递的tgfβ1是细胞相关tgfβ1。检查点抑制剂:在本公开的背景中,检查点抑制剂意指免疫检查点抑制剂并且具有如本领域理解的含义。通常,靶标是t细胞或nk细胞上的受体分子,或是抗原呈递细胞(apc)或肿瘤细胞上的相应细胞表面配体。免疫检查点在免疫细胞中被激活以防止针对“自身”的炎性免疫发展。因此,通过检查点抑制来改变免疫系统的平衡应该允许它被完全激活以检测和消除癌症。涉及免疫应答控制的最著名的抑制性受体是细胞毒性t淋巴细胞抗原4(ctla-4)、程序性细胞死亡蛋白1(pd-1)、t细胞免疫球蛋白结构域和粘蛋白结构域-3(tim3)、淋巴细胞激活基因3(lag3)、杀伤细胞免疫球蛋白样受体(kir)、糖皮质激素诱导的肿瘤坏死因子受体(gitr)和含有v结构域免疫球蛋白(ig)的t细胞激活抑制因子(vista)。检查点抑制剂的非限制性实例包括:纳武单抗、派姆单抗、、bms-936559、阿特珠单抗、avelumab、度伐单抗、易普利姆玛、tremelimumab、imp-321、bms-986016和lirilumab。临床益处:如本文所用,术语“临床益处”旨在包括治疗的有效性和安全性两者。因此,实现期望的临床益处的治疗性处理是既有效又安全(例如,具有可耐受或可接受的毒性或不良事件)。联合疗法:“联合疗法”是指用于临床适应症的治疗方案,其包含两种或更多种治疗剂。因此,该术语意指一种治疗方案,其中包含第一组合物(例如,活性成分)的第一疗法与包含第二组合物(活性成分)的第二疗法共同(inconjunctionwith)施用至患者,旨在治疗相同或重叠的疾病或临床状况。第一和第二组合物可以都作用于相同的细胞靶标或不同的细胞靶标。在联合疗法的情形中,短语“共同”意指第一疗法的治疗效果在接受联合疗法的受试者中在时间和/或空间上与第二疗法的治疗效果重叠。因此,联合疗法可以配制成单一制剂,用于同时施用,或者配制成单独的制剂,用于疗法的顺序施用。组合表位(combinatoryorcombinatorialepitope):在一些实施方式中,本发明的抑制性抗体可结合由前/潜在tgfβ1复合物的两种或多种组分(例如,部分或区段)形成的表位。这样的表位被称为组合表位。因此,组合表位可包含来自复合物的第一组分的氨基酸残基,和来自复合物的第二组分的氨基酸残基,等等。每种组分可以是抗原复合物的单一蛋白质或两种或更多种蛋白质。抗体与组合表位的结合不仅取决于抗原的一级氨基酸序列。相反,组合表位由来自抗原或抗原复合物的两种或更多种组分(例如,部分或区段,例如氨基酸残基)的结构贡献而形成。竞争或交叉竞争:在竞争相同表位的抗原结合蛋白的背景中使用时,术语“竞争”(例如,抗体或其抗原结合部分)意为由测定所测量的抗原结合蛋白之间的竞争,其中所测试的抗原结合蛋白阻止或抑制(例如,降低)参考抗原结合蛋白与共同抗原(例如,tgfβ1或其片段)的特异性结合。许多类型的竞争性结合测定可用于确定一种抗原结合蛋白是否与另一种竞争结合,例如:固相直接或间接放射免疫测定(ria)、固相直接或间接酶免疫测定(eia)、夹心竞争测试、固相直接生物素-抗生物素蛋白eia、固相直接标记测试和固相直接标记夹心测试。通常,当竞争性抗原结合蛋白过量存在时,它会抑制(例如,降低)至少40-45%、45-50%、50-55%,55-60%、60-65%、65-70%、70-75%或75%或更多的参考抗原结合蛋白与共同抗原的特异性结合。在一些情况下,至少80-85%、85-90%、90-95%、95-97%或97%或更多的结合被抑制。在一些实施方式中,第一抗体或其抗原结合部分和第二抗体或其抗原结合部分就相同抗原彼此交叉阻断,例如,由biacor或octet所测定,使用标准测试条件例如,根据制造商的说明(例如,在室温下测定结合,~20-25℃)。在一些实施方式中,第一抗体或其片段和第二抗体或其片段可具有相同的表位。在其他实施方式中,第一抗体或其片段和第二抗体或其片段可具有不完全相同但重叠的表位。在更进一步的实施方式中,第一抗体或其片段和第二抗体或其片段可以具有在三维空间中非常接近的分开的(不同的)表位,使得抗体结合通过空间位阻交叉阻断。“交叉阻断”是指第一抗体与抗原的结合阻止第二抗体与相同抗原的结合,并且类似地,第二抗体与抗原的结合阻止第一抗体与相同抗原的结合。互补决定区:如本文所用,术语“cdr”意指抗体可变序列内的互补决定区。在重链和轻链的每个可变区中存在三个cdr,对于每个可变区,其被称为cdr1、cdr2和cdr3。如本文所用,术语“cdr组”意指在可以结合抗原的单个可变区中存在的三个cdr的组。这些cdr的确切边界根据不同的系统被不同地界定。由kabat描述的系统(kabat等(1987;1991)sequencesofproteinsofimmunologicalinterest(nationalinstitutesofhealth,bethesda,md.))不仅提供了适用于抗体任何可变区的明确残基编号系统,而且还提供了限定三个cdr的精确残基边界。这些cdr可以称为kabatcdrs。chothia和同事((chothia&lesk(1987)j.mol.biol.196:901-917;andchothia等(1989)nature342:877-883)发现kabatcdr中的某些子部分采用了几乎相同的肽骨架构象,尽管其在氨基酸序列水平上具有很大的多样性。这些子部分被命名为l1、l2和l3或h1、h2和h3,其中“l”和“h”分别表示轻链和重链区域。这些区域可以称为chothiacdr,其具有与kabatcdr重叠的边界。定义与kabatcdrs重叠的cdr的其他边界已在padlan(1995)fasebj.9:133-139和maccallum(1996)j.mol.biol.262(5):732-45中有所描述。其他cdr边界定义可能并不严格遵循本文系统中的任一个,但仍将与kabatcdr重叠,尽管它们可以基于特定残基或残基组甚至整个cdr不显著影响抗原结合的预测或实验发现而缩短或延长。本文使用的方法可以利用根据任何这些系统定义的cdr,尽管某些实施方式使用kabat或chothia定义的cdr。构象表位:在一些实施方式中,本发明的抑制性抗体可结合构象-特异性的的表位。这样的表位被称为构象表位、构象特异性表位、构象依赖性表位或构象敏感表位。特异性结合这样的表位的相应抗体或其片段可称为构象特异性抗体、构象选择性抗体或构象依赖性抗体。抗原与构象表位的结合取决于所述抗原或抗原复合物的三维结构(构象)。恒定区:免疫球蛋白恒定结构域意指重链或轻链的恒定结构域。人igg重链和轻链恒定结构域氨基酸序列是本领域已知的。背景许可性;背景非依赖性:“背景许可性”和“背景非依赖性”tgfβ抑制剂是广泛背景的抑制剂,其可作用于一种以上的tgfβ功能模式。tgfβ的“背景许可性抑制剂”是能够抑制tgfβ功能的多种背景的药剂,例如与以下至少两种相关的tgfβ活性:garp(也称为lrrc32)、lrrc33、ltbp1和ltbp3。在其中试剂能够抑制tgfβ活性而与特定的呈递分子无关的背景许可性抑制剂中,这样的抑制剂被称为“背景非依赖性”的抑制剂。因此,tgfβ的背景非依赖性抑制剂可以抑制与以下所有相关的tgfβ活性:garp、lrrc33、ltbp1和ltbp3。在一些实施方式中,背景许可性和背景非依赖性抑制剂可对一种或多种背景施加优先或有偏见的抑制活性超过其他的背景。ecm相关tgfβ1:该术语意指是(例如,沉积入)细胞外基质的组分的tgfβ1或其信号传导复合物(例如,前/潜在tgfβ1)。由ltbp1或ltbp3呈递的tgfβ1是ecm相关的tgfβ1。有效量:“有效量”(或治疗有效量)是在患者群体中达到统计学显著临床益处的剂量或剂量方案。表位:术语“表位”包括可特异性结合于结合剂、免疫球蛋白或t细胞受体的任何分子决定簇(例如,多肽决定簇)。在某些实施方式中,表位决定簇包括分子的化学活性表面基团,例如氨基酸、糖侧链、磷酰基或磺酰基,并且在某些实施方式中,可以具有特定的三维结构特征和/或特定的电荷特征。表位是由结合蛋白结合的抗原区域。因此,表位由已知结合至特异性结合配偶体(partner)上的互补位点的抗原(或其片段)区域的氨基酸残基组成。抗原片段可含有一个以上的表位。在某些实施方式中,抗体是当其在蛋白质和/或大分子的复合混合物中识别其靶抗原时特异性结合至抗原的。例如,如果抗体交叉竞争(一种阻止另一种的结合或调节作用),则称抗体“结合至相同的表位”。此外,表位的结构定义(重叠、相似、相同)是说明性的,但功能定义通常更相关,因为它们包括结构(结合)和功能(调节、竞争)参数。纤维化:术语“纤维化”或“纤维化症状/病症”意指其特征在于组织或器官内细胞外基质(ecm)组分(例如胶原蛋白)病理性积累的过程或表现。garp-tgfβ1复合物:如本文所用,术语“garp-tgfβ1复合物”是指包含前蛋白形式或潜在形式的转化生长因子β1(tgfβ1)蛋白和糖蛋白a为主的重复序列(garp)或其片段或变体的蛋白质复合物。在一些实施方式中,tgfβ1蛋白的前蛋白形式或潜在形式可被称为“前/潜在tgfβ1蛋白”。在一些实施方式中,garp-tgfβ1复合物包含通过一个或多个二硫键与前/潜在tgfβ1共价连接的garp。在其他实施方式中,garp-tgfβ1复合物包含与前/潜在tgfβ1非共价连接的garp。在一些实施方式中,garp-tgfβ1复合物是天然存在的复合物,例如细胞中的garp-tgfβ1复合物。示例性的garp-tgfβ1复合物示于图3中。人抗体:如本文所用,术语“人抗体”旨在包括来源于人种系免疫球蛋白序列的具有可变和恒定区域的抗体。本发明中的人抗体可包含不由人种系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基(例如,通过体外随机或位点特异性诱变或通过体内体细胞突变引入的突变),例如在cdr中,特别是cdr3中。然而,如本文所用,术语“人抗体”不旨在包括其中衍生自另一种哺乳动物物种(例如小鼠)的种系的cdr序列已经移植到人框架序列上的抗体。人源化抗体:术语“人源化抗体”意指这样的抗体,其包含来自非人物种(例如,小鼠)的重链和轻链可变结构域序列,但其中至少一部分vh和/或vl序列已被改变为更类似“人样”,即更类似于人种系的可变序列。一种类型的人源化抗体是cdr移植抗体,其中将人cdr序列引入非人vh和vl序列中以替换相应的非人cdr序列。此外,“人源化抗体”是抗体、或其变体、衍生物、类似物或片段,其免疫特异性地结合至感兴趣的抗原并且其包含基本上具有人抗体的氨基酸序列的fr区和具有基本上非人抗体的氨基酸序列的cdr区。如本文所用,术语“基本上”在cdr的背景中意指具有与非人抗体cdr的氨基酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%相同的氨基酸序列的cdr。人源化抗体基本上包含至少一个、通常是两个可变结构域(fab、fab'、f(ab')2、fabc、fv)的全部,其中所有或基本上所有cdr区对应于非人免疫球蛋白(即供体抗体)的那些,并且所有或基本上所有fr区是人免疫球蛋白共有序列的那些。在一个实施方式中,人源化抗体还包含免疫球蛋白fc区的至少一部分,通常是人免疫球蛋白的fc区的一部分。在一些实施方式中,人源化抗体含有轻链以及至少重链的可变结构域。所述抗体还可包括重链的ch1、铰链、ch2、ch3和ch4区。在一些实施方式中,人源化抗体仅含有人源化轻链。在一些实施方式中,人源化抗体仅含有人源化重链。在具体的实施方式中,人源化抗体仅含有人源化的轻链可变结构域和/或人源化的重链。亚型特异性:术语“亚型特异性”意指试剂区分一种亚型与其他结构上相关的亚型(即,选择性)的能力。亚型特异性tgfβ抑制剂在给定浓度下对tgfβ的一种亚型发挥其抑制活性,但不对tgfβ的其他亚型发挥抑制活性。例如,亚型特异性tgfβ1抗体选择性地结合tgfβ1。tgfβ1特异性抑制剂(抗体)以显著更高的亲和力优先于tgfβ2或tgfβ3靶向(结合从而抑制)tgfβ1亚型。例如,在这种背景下的选择性可以指通过体外结合测定例如octet和biacor测量的相应亲和力的至少500-1000倍的差异。在一些实施方式中,所述选择性是指当抑制剂以有效抑制体内tgfβ1的剂量使用时不抑制tgfβ2和tgfβ3。例如,抗体可以~1pm的亲和力优先结合tgfβ1,而相同的抗体可以约0.5-50nm结合tgfβ2和/或tgfβ3。为了使这样的抑制剂可用作治疗剂,达到期望效果的剂量(例如,治疗有效量)必须落入所述抑制剂可有效抑制tgfβ1亚型而不抑制tgfβ2或tgfβ3的窗口内。分离的:如本文所用,“分离的”抗体意指基本上不含有其他抗体的抗体,所述其他抗体具有不同的抗原特异性。在一些实施方式中,分离的抗体基本上不含有其他非预期的细胞物质和/或化学物质。局部的:在本公开的上下文中,术语“局部的”(如在“局部肿瘤”)意指在解剖学上分离的或可分离的异常物,如实体瘤,而非全身性疾病。例如,某些白血病可能具有疾病的局部组分(例如骨髓)和全身组分(例如循环的血细胞)两者。lrrc33-tgfβ1复合物:如本文所用,术语“lrrc33-tgfβ1复合物”意指前蛋白形式或潜在形式的转化生长因子-β1(tgfβ1)蛋白与富亮氨酸的重复序列蛋白33(lrrc33;也称为活性氧物质或nrros的负调节剂)或其片段或变体之间形成的复合物。在一些实施方式中,lrrc33-tgfβ1复合物包含通过一个或多个二硫键与前/潜在tgfβ1共价连接的lrrc33。在其他实施方式中,lrrc33-tgfβ1复合物包含与前/潜在tgfβ1非共价连接的lrrc33。在一些实施方式中,lrrc33-tgfβ1复合物是天然存在的复合物,例如细胞中的lrrc33-tgfβ1复合物。ltbp1-tgfβ1复合物:如本文所用,术语“ltbp1-tgfβ1复合物”意指包含前蛋白形式或潜在形式的转化生长因子-β1(tgfβ1)蛋白与潜在tgf-β结合蛋白1(ltbp1)或其片段或变体的蛋白质复合物。在一些实施方式中,ltbp1-tgfβ1复合物包含通过一个或多个二硫键与前/潜在tgfβ1共价连接的ltbp1。在其他实施方式中,ltbp1-tgfβ1复合物包含与前/潜在tgfβ1非共价连接的ltbp1。在一些实施方式中,ltbp1-tgfβ1复合物是天然存在的复合物,例如细胞中的ltbp1-tgfβ1复合物。示例性的ltbp1-tgfβ1复合物显示于图3中。ltbp3-tgfβ1复合物:如本文所用,术语“ltbp3-tgfβ1复合物”意指包含前蛋白形式或潜在形式的转化生长因子-β1(tgfβ1)蛋白和潜在tgf-β结合蛋白3(ltbp3)或其片段或变体的蛋白质复合物。在一些实施方式中,ltbp3-tgfβ1复合物包含通过一个或多个二硫键与前/潜在tgfβ1共价连接的ltbp3。在其他实施方式中,ltbp3-tgfβ1复合物包含与前/潜在tgfβ1非共价连接的ltbp1。在一些实施方式中,ltbp3-tgfβ1复合物是天然存在的复合物,例如细胞中的ltbp3-tgfβ1复合物。示例性ltbp3-tgfβ1复合物显示于图3中。骨髓纤维化:“骨髓纤维化”,也称为骨髓纤维化,是一种相对罕见的骨髓增生性疾病(例如,癌症),其属于一组被称为骨髓增生异常的疾病。骨髓纤维化被分类为骨髓增生性肿瘤的费城染色体阴性(-)分支。骨髓纤维化的特征在于骨髓中和其他部位的造血干细胞的异常克隆的增殖导致纤维化,或是瘢痕组织替代骨髓。除非另有说明,否则术语骨髓纤维化是指原发性骨髓纤维化(pmf)。这也可以称为慢性特发性骨髓纤维化(cimf)(术语特发性和原发性意味着在这些情况下该疾病是未知的或自发的起源)。这与继发于真性红细胞增多症或原发性血小板增多症的骨髓纤维化形成对比。骨髓纤维化是骨髓化生的一种形式,其指的是骨髓的血液形成组织中细胞类型的变化,并且通常这两个术语同义使用。同源性髓样化生和骨髓纤维化伴髓样化生(mmm)的术语也可用于指原发性骨髓纤维化。pan-tfgβ抑制剂:术语“pan-tfgβ抑制剂”意指能够抑制或拮抗tgfβ多种亚型的任何试剂。这样的抑制剂可以是tgfβ亚型的小分子抑制剂。该术语包括pan-tfgβ抗体,其是指能够结合至一种以上tgfβ亚型的任何试剂,例如tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3中的至少两种。在一些实施方式中,pan-tfgβ抗体结合所有三种亚型,即tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3。在一些实施方式中,pan-tfgβ抗体结合并中和所有三种亚型,即tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3。呈递分子:术语tgfβ的“呈递分子(presentingmolecule或presentationmolecule)”是能够结合/连接到tgfβ的无活性形式从而在细胞外结构域“呈递”前蛋白的蛋白质实体。迄今已鉴定得到四种tgfβ呈递分子:潜在tgfβ结合蛋白-1(ltbp1)和ltbp3沉积到细胞外基质(即,ecm的组分),而糖蛋白a为主的重复序列(garp/lrrc32)和富亮氨酸重复序列蛋白33(lrrc33)含有跨膜结构域,并在某些细胞(如免疫细胞)的表面上呈递潜在tgfβ1。tgfβ1亚型单独涉及正常和疾病状况中的许多生物学过程。这些包括但不限于维持组织内稳态、炎症反应、ecm重组如伤口愈合,和免疫应答的调节,以及器官纤维化、癌症和自身免疫。protgfβ1:如本文所用,术语“protgfβ1”旨在涵盖包含复合物中tgfβ1的前结构域序列的不具有活性的tgfβ1复合物的前体形式。因此,该术语可包括tgfβ1的前体以及潜在形式。表述“前/潜在tgfβ1”可互换使用。tgfβ1的“前体”形式存在于弗林位点处蛋白水解切割之前。一旦切割,所得的形式称为tgfβ1的“潜在”形式。“潜在”复合物保持关联直到进一步激活触发,例如整联蛋白驱动的激活事件。如图3所示,protgfβ1复合物由与二硫键连接的二聚体tgfβ1前蛋白多肽组成。应当注意,在整联蛋白介导的或其他激活事件之前,形容词“潜在的”通常可用于描述tgfβ1的“无活性”状态。调节性t细胞:“调节性t细胞”或treg的特征在于表达生物标志物cd4、foxp3和cd25。treg有时被称为抑制性t细胞,代表调节免疫系统、维持对自身抗原的耐受性并预防自身免疫疾病的t细胞亚群。treg是免疫抑制性的并且通常抑制或下调效应t(teff)细胞的诱导和增殖。treg可以在胸腺中发展(所谓的cd4+foxp3+“天然”treg)或从外周的幼稚cd4+t细胞中分化,例如,在暴露于tgfβ或视黄酸之后。实体瘤:术语“实体瘤”意指导致异常生长或通常不含有囊肿或液体区域的组织块的增殖性疾病。实体瘤可以是良性(非癌性)或恶性(癌性)。实体瘤可以包括癌性(恶性)细胞、包括caf的基质细胞和浸润性白细胞,例如巨噬细胞和淋巴细胞。特异性结合:如本文所用,术语“特异性结合(specificbinding或specificallybinds)”意指抗体或其抗原结合部分与抗原的相互作用依赖于特定结构(例如,抗原决定簇或表位)的存在。例如,所述抗体或其抗原结合部分结合至特定蛋白质而不是多种蛋白质。在一些实施方式中,如果抗体对靶标的kd为至少约10-4m,10-5m,10-6m,10-7m,10-8m,10-9m,10-10m,10-11m,10-12m,10-13m或更小,则抗体或其抗原结合部分特异性结合至靶标,例如tgfβ1。在一些实施方式中,如本文所用,术语“特异性结合tgfβ1的表位”或“特异性结合tgfβ1”意指抗体或其抗原结合部分,其结合至tgfβ1并通过表面等离振子共振测定具有1.0×10-7m或更低的解离常数(kd)。在一个实施方式中,抗体或其抗原结合部分可以特异性结合至tgfβ1的人和非人(例如小鼠)两者的直系同源物。受试者:术语“受试者”在治疗应用的背景下意指接收临床照料或干预(如治疗、诊断等)的个体。合适的受试者包括脊椎动物,包括但不限于哺乳动物(例如,人类和非人类哺乳动物)。在受试者是人受试者的情况下,术语“患者”可以互换使用。在临床背景下,术语“患者群体”或“患者亚群”用于指代属于一组标准的一组个体,例如临床标准(例如,疾病表现、疾病阶段、对某些症状的易感性、对治疗的响应性等)、病史、健康状况、性别、年龄组、遗传标准(如某些突变的携带者、多态性、基因重复、dna序列重复等)和生活方式因素(如吸烟、饮酒、运动等)。tgfβ1相关病症:“tgfβ1相关病症”意指其中至少部分发病机制和/或进展可归因于tgfβ1信号传导或其失调的任何疾病或病症。tgfβ抑制剂:术语“tgfβ抑制剂”意指能够拮抗tgfβ生长因子(例如,tgfβ1、tgfβ2和/或tgfβ3)的生物活性或功能的任何试剂。该术语不旨在限制其作用机制,并且包括例如中和抑制剂、受体拮抗剂、可溶性配体捕获剂和tgfβ的激活抑制剂。所述“tgfβ家族”是tgfβ超家族中的一类,包含三个亚型:tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3,其在结构上相似。毒性:如本文所用,术语“毒性(toxicity或toxicities)”意指在患者中与施用至患者的疗法相关的有害体内作用,例如非理想的副作用和不良事件。“耐受性”意指与治疗或治疗方案相关的毒性水平,其可由患者合理耐受,而不会由于毒性而中断治疗。治疗(treat/treatment):术语“治疗”包括疗法性治疗、预防性治疗和其中一种降低受试者将发展障碍或其它风险因素的风险的应用。因此,该术语旨在广泛地意指:通过例如提高或增强身体的免疫力而在患者中引起治疗益处;减少或逆转免疫抑制;减少、移除或消除体内有害细胞或物质;减轻疾病负担(例如,肿瘤负担);预防再发或复发;延长不应期,和/或提高生存。该术语包括疗法性治疗、预防性治疗和其中一种降低受试者发展病症或其他风险因素的风险的应用。治疗不要求病症的完全治愈,并且包括其中减轻症状或潜在风险因素的实施方式。在联合疗法的背景下,该术语还可以指:i)第二疗法降低第一疗法的有效剂量以减少副作用和增加耐受性的能力;ii)第二疗法使患者对第一疗法更敏感的能力;和/或iii)实现累加或协同临床益处的能力。肿瘤相关巨噬细胞:“肿瘤相关巨噬细胞(tam)”是具有前肿瘤表型的极化/激活巨噬细胞。tam可以是募集至肿瘤部位的骨髓来源的单核细胞/巨噬细胞或来源于红细胞-髓系祖细胞的组织驻留的巨噬细胞。单核细胞/巨噬细胞向tam的分化受许多因素的影响,包括局部化学信号,如细胞因子、趋化因子、生长因子和其他作为配体的分子,以及单核细胞/巨噬细胞之间存在于生态位(肿瘤微环境)中的细胞-细胞相互作用。通常,单核细胞/巨噬细胞可以被极化成所谓的“m1”或“m2”亚型,后者与更多的前肿瘤表型相关。在实体肿瘤中,高达50%的肿瘤质量可能对应于巨噬细胞,其优选地是m2极化的。肿瘤微环境:术语“肿瘤微环境(tme)”意指局部疾病生态位,其中肿瘤(例如,实体瘤)驻留在体内。可变区:术语“可变区”或“可变结构域”意指抗体的轻链和/或重链的一部分,典型地大致包括在重链中氨基端120到130个氨基酸和轻链中约100至110个氨基端氨基酸。在某些实施方式中,甚至在相同物种的抗体之间不同抗体的可变区在氨基酸序列上差异很大。抗体的所述可变区通常决定特定抗体对其靶标的特异性。除了在操作实施方式中或另有说明,本文使用的表达成分或反应条件的数量的所有数字应当在所有情况下都理解为被术语“大约”修饰。当与百分比结合使用时,术语“大约”可以表示±1%。如本文在说明书和权利要求中使用的不定冠词“一个/一种(a/an)”,除非明确指出相反意义,应被理解为意指“至少一个/一种”。如本文在说明书和权利要求中使用的短语“和/或”应当被理解为意指如此连接的所述元素的“任一或两者”,即,共同存在于某些情况下和分别存在于其他情况下的元素。除了与“和/或”条款具体标识的元素之外,任选地存在其他元素,无论是否与具体标识的那些元素相关或不相关,除非明确相反指出。因此,作为非限制性示例,当与例如“包含”的开放式语言结合使用时,在一个实施方式对“a和/或b”的引用可意指a而没有b(任选地包括除b以外的其他元素);在另一个实施方式中,可意指b而没有a(任选地包括除a以外的其他元素);在另一个实施方式中,可意指a和b两者(任选地包括其他元素);等等。如本文在说明书和权利要求中使用的,关于一个或多个元素的列表,短语“至少一个”应理解为表示选自元素列表中任何一个或多个元素中的至少一个元素,但不一定包括元素列表中具体列出的每一个元素中的至少一个,并且不排除元素列表中元素的任何组合。该定义还允许任选地存在除了在短语“至少一个”所指的元素列表内具体标识的元素之外的元素,无论与具体标识的那些元素相关还是不相关。因此,作为非限制性示例,“a和b中的至少一个”(或等效地,“a或b中的至少一个”,或等效地“a和/或b中的至少一个”)可意指在一个实施方式中,至少一个、任选地包括多于一个a、不存在b(并且任选地包括除b以外的元素);在另一个实施方式中,至少一个、任选地包括多于一个b、不存在a(并且任选地包括除a以外的元素);在另一个实施方式中,至少一个、任选地包括多于一个a,和至少一个、任选地包括多于一个b(和任选地包括其他元素);等等。在权利要求中使用例如“第一”、“第二”、“第三”等序数术语来修饰权利要求元素,本身并不意味着任何优先级、先后次序,或一个权利要求元素的级别或者执行方法的动作的时间顺序高于另一个,仅用作标记以将具有特定名称的一个权利要求元素与具有相同名称(但是对于序数术语的使用)的另一个元素进行区分,以区分权利要求元素。本文提供的范围应理解为简写所有范围内的值的。例如,1至50的范围应理解为包括源自于由1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、1112、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50组成的组中的任意数字、数字组合或子范围,例如10至20、1至10、30至40等。亚型选择性、背景许可性/背景非依赖的tgfβ1抗体本发明提供了抗体及其抗原结合部分,其结合两个或更多种包含前/潜在tgfβ1的下列复合物:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。因此,本发明的一些方面涉及抗体或其抗原结合部分,其特异性结合至这样的tgfβ1复合物内部的表位,其中当tgfβ1存在于garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中时,所述表位可用于被所述抗体或其抗原结合部分结合。在一些实施方式中,表位由于tgfβ1在与garp、ltbp1、ltbp3和/或lrrc33复合时发生构象变化而可用。在一些实施方式中,当tgfβ1不与garp、ltbp1、ltbp3和/或lrrc33复合时,抗体或其抗原结合部分结合的tgfβ1中的表位不可用。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分不特异性结合至tgfβ2。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分不特异性结合至tgfβ3。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分不阻止tgfβ1与整联蛋白结合。例如,在一些实施方式中,所述抗体或其抗原结合部分不掩盖tgfβ1的整联蛋白结合位点。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分抑制tgfβ1的激活。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分抑制成熟tgfβ1从garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的释放。本文提供的抗体或其抗原结合部分特异性结合至多个(即,两个或更多个)tgfβ1复合物的表位,其中当tgfβ1存在于garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp2-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物、ltbp4-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中时,表位可用于被所述抗体结合或其抗原结合部分结合。在一些实施方式中,tgfβ1包含天然存在的哺乳动物氨基酸序列。在一些实施方式中,tgfβ1包含天然存在的人氨基酸序列。在一些实施方式中,tgfβ1包含人、猴、大鼠或小鼠氨基酸序列。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分不特异性结合至tgfβ2。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分不特异性结合至tgfβ3。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分不特异性结合至tgfβ2或tgfβ3。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分特异性结合至包含seqidno:21所示氨基酸序列的tgfβ1。tgfβ2的氨基酸序列和tgfβ3的氨基酸序列分别由seqidno:22和23所示。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分特异性结合至包含非天然存在的氨基酸序列的tgfβ1(或者在本文中称为非天然存在的tgfβ1)。例如,相对于天然存在的tgfβ1氨基酸序列,非天然存在的tgfβ1可包含一个或多个重组产生的突变。在一些实施方式中,tgfβ1、tgfβ2或tgfβ3的氨基酸序列包含seqidno:24至35所示的氨基酸序列,如表1中所示。在一些实施方式中,tgfβ1、tgfβ2或tgfβ3的氨基酸序列包含seqidno:36至43所示的氨基酸序列,如表2所示。tgfβ1lstcktidmelvkrkrieairgqilsklrlasppsqgevppgplpeavlalynstrdrvagesaepepepeadyyakevtrvlmvethneiydkfkqsthsiymffntselreavpepvllsraelrllrlklkveqhvelyqkysnnswrylsnrllapsdspewlsfdvtgvvrqwlsrggeiegfrlsahcscdsrdntlqvdingfttgrrgdlatihgmnrpflllmatpleraqhlqssrhrraldtnycfssteknccvrqlyidfrkdlgwkwihepkgyhanfclgpcpyiwsldtqyskvlalynqhnpgasaapccvpqaleplpivyyvgrkpkveqlsnmivrsckcs(seqidno:21)tgfβ2slstcstldmdqfmrkrieairgqilsklkltsppedypepeevppevisiynstrdllqekasrraaacerersdeeyyakevykidmppffpsenaipptfyrpyfrivrfdvsameknasnlvkaefrvfrlqnpkarvpeqrielyqilkskdltsptqryidskvvktraegewlsfdvtdavhewlhhkdrnlgfkislhcpcctfvpsnnyiipnkseelearfagidgtstytsgdqktikstrkknsgktphlllmllpsyrlesqqtnrrkkraldaaycfrnvqdncclrplyidfkrdlgwkwihepkgynanfcagacpylwssdtqhsrvlslyntinpeasaspccvsqdlepltilyyigktpkieqlsnmivksckcs(seqidno:22)tgfβ3slslstcttldfghikkkrveairgqilsklrltsppeptvmthvpyqvlalynstrelleemhgereegctqenteseyyakeihkfdmiqglaehnelavcpkgitskvfrfnvssveknrtnlfraefrvlrvpnpsskrneqrielfqilrpdehiakqryiggknlptrgtaewlsfdvtdtvrewllrresnlgleisihcpchtfqpngdilenihevmeikfkgvdneddhgrgdlgrlkkqkdhhnphlilmmipphrldnpgqggqrkkraldtnycfrnleenccvrplyidfrqdlgwkwvhepkgyyanfcsgpcpylrsadtthstvlglyntlnpeasaspccvpqdlepltilyyvgrtpkveqlsnmvvksckcs(seqidno:23)表1.示例性tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3氨基酸序列表2.示例性非人氨基酸序列在一些实施方式中,抗原性蛋白复合物(例如,ltbp-tgfβ1复合物)可包含一种或多种ltbp蛋白(例如,ltbp1、ltbp2、ltbp3和ltbp4)或其片段。在一些实施方式中,如本文中所述,抗体或其抗原结合部分能够结合至ltbp1-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,ltbp1蛋白是天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,ltbp1蛋白是非天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,ltbp1蛋白是重组蛋白。这样的重组ltbp1蛋白可包含ltbp1、其可变剪接变体和/或其片段。还可以修饰重组ltbp1蛋白以包含一种或多种可检测标记。在一些实施方式中,ltbp1蛋白包含前导序列(例如,天然或非天然前导序列)。在一些实施方式中,ltbp1蛋白不包含前导序列(即,前导序列已被加工或切割)。这样的可检测标记可包括但不限于生物素标记、多组氨酸标记、myc标记、ha标记和/或荧光标记。在一些实施方式中,ltbp1蛋白是哺乳动物ltbp1蛋白。在一些实施方式中,ltbp1蛋白是人、猴、小鼠或大鼠ltbp1蛋白。在一些实施方式中,ltbp1蛋白包含表2中seqidno:46和47所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,ltbp1蛋白包含表3中seqidno:50所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,如本文中所述,抗体或其抗原结合部分能够结合至ltbp3-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,ltbp3蛋白是天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,ltbp3蛋白是非天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,ltbp3蛋白是重组蛋白。这样的重组ltbp3蛋白可包含ltbp3、其可变剪接变体和/或其片段。在一些实施方式中,ltbp3蛋白包含前导序列(例如,天然或非天然前导序列)。在一些实施方式中,所述ltbp3蛋白不包含前导序列(即,前导序列已被加工或切割)。还可以修饰重组ltbp3蛋白质以包含一种或多种可检测标记。这样的可检测标记可包括但不限于生物素标记、多组氨酸标记、myc标记、ha标记和/或荧光标记。在一些实施方式中,ltbp3蛋白是哺乳动物ltbp3蛋白。在一些实施方式中,ltbp3蛋白是人、猴、小鼠或大鼠ltbp3蛋白。在一些实施方式中,ltbp3蛋白包含表2中seqidno:44和45所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,ltbp1蛋白包含表3中seqidno:51所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,如本文中所述,抗体或其抗原结合部分能够结合至garp-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,garp蛋白是天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,garp蛋白是非天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,garp蛋白是重组蛋白。这样的garp可以是重组的,在本文中称为重组garp。与野生型garp相比,一些重组garp可包含一个或多个修饰、截短和/或突变。可以将重组garp修饰为可溶的。在一些实施方式中,garp蛋白包含前导序列(例如,天然或非天然前导序列)。在一些实施方式中,garp蛋白不包含前导序列(即,前导序列已被加工或切割)。在其他实施方式中,修饰重组garp以包含一种或多种可检测标记。在进一步的实施方式中,这样的可检测标记可包括但不限于生物素标记、多组氨酸标记、myc标记、ha标记和/或荧光标记。在一些实施方式中,所述garp蛋白是人、猴、小鼠或大鼠garp蛋白。在一些实施方式中,所述garp蛋白包含表2中seqidno:48-49所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,所述garp蛋白包含表4中seqidno:52和53中所示的氨基酸序列。在一些实施方式中,如本文中所述,抗体或其抗原结合部分不以背景依赖的方式结合至tgfβ1,例如只在当tgfβ1分子与特定的呈递分子(例如garp)复合时才会发生与tgfβ1的结合。相反,抗体及其抗原结合部分以背景非依赖的方式结合tgfβ1。换句话说,当结合至任何呈递分子(garp、ltbp1、ltbp3和/或lrcc33)时,抗体或其抗原结合部分与tgfβ1结合。在一些实施方式中,如本文中所述,抗体或其抗原结合部分能够结合至lrrc33-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,lrrc33蛋白是天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,lrrc33蛋白是非天然存在的蛋白或其片段。在一些实施方式中,lrrc33蛋白是重组蛋白。这样的lrrc33可以是重组的,在本文中称为重组lrrc33。与野生型lrrc33相比,一些重组lrrc33蛋白可包含一个或多个修饰、截短和/或突变。可以将重组lrrc33蛋白修饰为可溶的。例如,在一些实施方式中,lrrc33的胞外域可以用c-末端his-标签表达,以表达可溶性lrrc33蛋白(slrrc33;参见例如seqidno:84)。在一些实施方式中,lrrc33蛋白包含前导序列(例如,天然或非天然前导序列)。在一些实施方式中,lrrc33蛋白不包含前导序列(即,前导序列已被加工或切割)。在其他实施方式中,修饰重组lrrc33蛋白质以包含一种或多种可检测标记。在进一步的实施方式中,这样的可检测标记可包括但不限于生物素标记、多组氨酸标记、flag标记、myc标记、ha标记和/或荧光标记。在一些实施方式中,lrrc33蛋白是哺乳动物lrrc33蛋白。在一些实施方式中,lrrc33蛋白是人、猴、小鼠或大鼠lrrc33蛋白。在一些实施方式中,lrrc33蛋白包含表4中seqidno:83、84和101中所示的氨基酸序列。表3.示例性ltbp氨基酸序列表4.示例性garp和lrrc33氨基酸序列tgfβ1拮抗剂为了实施本发明中的方法,可以采用任何合适的tgfβ1抑制剂,条件是这样的试剂以对tgfβ1亚型足够的选择性抑制或拮抗tgfβ1的多个生物效应(例如,从多个细胞来源的tgfβ1)。优选地,这样的tgfβ1抑制剂在施用至人受试者时,在提供临床益处(例如,治疗功效和可接受的毒性特征)的剂量下对tgfβ2和tgfβ3没有可测量的抑制活性。合适的抑制剂包括小分子、基于核酸的试剂、生物制剂(例如,基于多肽的试剂,例如抗体和其他发现试剂(finding-agents))及其任何组合。在一些实施方式中,这样的试剂是抗体或其片段,如下文中进一步描述的。这些包括结合tgfβ1生长因子从而中和其作用的中和抗体。选择性抑制tgfβ1的功能性抗体在一个方面,本发明包括使用功能性抗体。如本文中所用,“功能性抗体”凭借其结合抗原的能力赋予一种或多种生物活性。因此,功能性抗体包括能够调节靶分子(即抗原)的活性/功能的抗体。这样的调节抗体包括抑制抗体(或抑制性抗体)和激活抗体。本公开内容包括tgfβ抗体,其可以抑制由与tgfβ1多种背景相关的tgfβ1信号传导介导的生物学过程。用于实施本发明的抑制剂,例如本文所述的抗体,旨在是tgfβ1选择性的,并且当以治疗有效剂量(在可接受达的毒性水平上到足够功效的剂量)下施用时不靶向或干扰tgfβ2和tgfβ3。基于本发明申请人的较早认识(参见pct/us2017/021972),常规tgfβ拮抗剂的亚型特异性的缺乏可成为与tgfβ抑制相关的毒性来源,本发明人寻求进一步实现广谱tgfβ1抑制,用于治疗表现出多方面tgfβ1失调的各种疾病,同时保持亚型选择性抑制剂的安全性/耐受性。在广义上,术语“抑制抗体”意指拮抗或中和靶标功能的抗体,例如,生长因子活性。有利地,本公开的优选的抑制性抗体能够抑制成熟生长因子从潜在复杂体中释放,从而减少生长因子信号传导。抑制抗体包括靶向任何表位的抗体,所述表位当与这些抗体结合时降低生长因子释放或活性。这样的表位可位于tgfβ蛋白(例如tgfβ1)的前体蛋白、生长因子或其他当被抗体结合时导致生长因子活性降低的表位上。本发明的抑制抗体包括但不限于抑制tgfβ1的抗体。在一些实施方式中,本公开的抑制性抗体特异性结合组合表位,即由抗原或抗原复合物的两种或更多种组分/部分形成的表位。例如,组合表位可以由来自单个蛋白质的多个部分的贡献形成,即来自相同蛋白质的多于一个的非连续区段的氨基酸残基。或者,组合表位可以由来自抗原复合物的多种蛋白质组分的贡献形成。在一些实施方式中,本公开的抑制性抗体特异性结合构象表位(或构象特异性表位),例如对抗原或抗原复合物的三维结构(即构象)敏感的表位。拮抗tgfβ信号传导的传统方法已经用于:i)在已经变得具有活性之后直接中和成熟生长因子,从而以耗尽可用于受体结合的游离配体(例如,从它的潜在前体复合物中释放);ii)使用能够螯合游离配体的可溶性受体片段(例如,所谓的配体捕获物);或者,iii)靶向其细胞表面受体以阻断配体-受体相互作用。这些常规方法中的每一种都需要拮抗剂与内源对应物竞争。此外,上述前两种方法(i和ii)靶向活性配体,其是一种过渡形式。因此,这样的拮抗剂必须能够在短暂的窗口期内从动力学上超过内源性受体。相比之下,第三种方法可能提供更持久的效果,但是无意中导致不希望的抑制效应(由此可能的毒性),因为许多生长因子(例如,高达~20种)通过相同的受体转导信号。为提供对这些缺点的解决方案,并进一步实现更大的选择性和局部化的作用,抑制性抗体潜在的优选作用机制例如本文描述的作用于tgfβ1激活和配体-受体相互作用的上游的那些。因此,预期适合于实施本发明的tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂应当优选地靶向其激活之前的无活性(例如,潜在的)protgfβ1复合物(例如,包含前/潜在tgfβ1的复合物),以在其来源处(例如在疾病微环境中)阻断激活步骤。根据本发明的优选实施方式,这样的抑制剂靶向ecm相关的和/或细胞表面系链的前/潜在tgfβ1复合物,而不是瞬时可用于受体结合的游离配体。因此,本发明的一些实施方式采用了特异性结合至含有tgfβ1的复合物、从而以亚型选择性的方式抑制tgfβ1的功能的试剂。这样的试剂优选是结合在包含前/潜在tgfβ1(例如,无活性tgfβ1前体)的蛋白质复合物内的表位的抗体。在一些实施方式中,当tgfβ1存在于以下两种或更多种时,所述表位可用于抗体结合:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,这样的抗体结合两种或更多种上文提供的含tgfβ1的复合物(例如,“背景许可性”),而在其他实施方式中,这样的抗体结合上文提供的所有四种含tgfβ1的复合物(例如,“背景非依赖性”)。在一些实施方式中,任何这样的抗体可显示有差异的物种选择性。表位可以在tgfβ1复合物的前结构域内。表位可以是组合表位,使得表位由复合物的一种或多种组分的两个或更多个部分/区段(例如,氨基酸残基)形成。表位可以是构象表位,使得表位对抗原(例如,tgfβ1复合物)的特定三维结构敏感。特异性结合至构象表位的抗体或其片段称为构象抗体或构象特异性抗体。本公开的实施方式包括在溶液中、在细胞培养物中和/或在受试者中使用抑制抗体以修改生长因子信号传导包括出于赋予患者临床益处的目的的方法。编码用于实施本发明的抗体的示例性抗体和相应的核酸序列包括在表5中所示的cdr氨基酸序列的一个或多个。表5.显示抗体ab1、ab2和ab3的使用kabat编号方案确定的重链(cdrh)和轻链(cdrl)的互补决定区在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本发明的抗体包括任何抗体或其抗原结合部分,其包含cdrh1、cdrh2、cdrh3、cdrl1、cdrl2或cdrl3或其组合,如表5中所示的为任何一种抗体所提供的。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体包括表5中所示的任何一种抗体的cdrh1、cdrh2、cdrh3、cdrl1、cdrl2和cdrl3。本发明还提供编码包含如表5中所示的为任何一种抗体所提供的cdrh1、cdrh2、cdrh3、cdrl1、cdrl2或cdrl3的分子的任何核酸序列。抗体重链和轻链cdr3结构域可在抗体对抗原的结合特异性/亲和力中起特别重要的作用。因此,特异性结合至本公开的garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体,或编码这些抗体或其抗原结合部分的核酸分子可包含至少如表5中所示的抗体的重链和/或轻链cdr3。本发明的方面涉及单克隆抗体或其抗原结合部分,其特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物,并且其包含六个互补决定区(cdr):cdrh1、cdrh2、cdrh3、cdrl1、cdrl2和cdrl3。在一些实施方式中,cdrh1包含seqidno:1、2和85中的任一项所示的序列。在一些实施方式中,cdrh2包含seqidno:3、4和86中的任一项所示的序列。在一些实施方式中,cdrh3包含seqidno:5、6和87中任一项所示的序列。cdrl1包含seqidno:7、8和88中任一项所示的序列。在一些实施方式中,cdrl2包含seqidno:9、10和89中任一项所示的序列。在一些实施方式中,cdrl3包含seqidno:11、12和90中任一项所示的序列。在一些实施方式中(例如,对于抗体ab1,如表5中所示),特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含:包含seqidno:1所示的氨基酸序列的cdrh1、包含seqidno:3所示的氨基酸序列的cdrh2、包含seqidno:5所示的氨基酸序列的cdrh3、包含seqidno:7所示的氨基酸序列的cdrl1、包含seqidno:9所示的氨基酸序列的cdrl2,和包含seqidno:11所示的氨基酸序列的cdrl3。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:5的氨基酸序列的互补决定区3(cdr3)的重链可变区,和其包含具有seqidno:11的氨基酸序列的cdr3的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:3的氨基酸序列的互补决定区2(cdr2)的重链可变区,和其包含具有seqidno:9的氨基酸序列的cdr2的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:1的氨基酸序列的互补决定区1(cdr1)的重链可变区,和其包含具有seqidno:7的氨基酸序列的cdr1的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含与seqidno:13中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含与seqidno:14中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含seqidno:13中所示的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含seqidno:14中所示的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含由与seqidno:91所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列,和由与seqidno:92所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含由seqidno:91所示的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列和由seqidno:92所示的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施方式中(例如,对于抗体ab2,如表5中所示)特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含:包含seqidno:2所示的氨基酸序列的cdrh1、包含seqidno:3所示的氨基酸序列的cdrh2、包含seqidno:6所示的氨基酸序列的cdrh3、包含seqidno:8所示的氨基酸序列的cdrl1、包含seqidno:10所示的氨基酸序列的cdrl2,和包含seqidno:12所示的氨基酸序列的cdrl3。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:6的氨基酸序列的cdr3的重链可变区,和其包含具有seqidno:12的氨基酸序列的cdr3的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:4的氨基酸序列的cdr2的重链可变区,和其包含具有seqidno:10的氨基酸序列的cdr2的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:2的氨基酸序列的cdr1的重链可变区,和其包含具有seqidno:8的氨基酸序列的cdr1的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含与seqidno:15中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含与seqidno:16中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含seqidno:15中所示的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含seqidno:16中所示的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含由与seqidno:93所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列,和由与seqidno:94所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含由seqidno:93所示的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列和由seqidno:94所示的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施方式中(例如,对于抗体ab3,如表5中所示)特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含:包含seqidno:85所示的氨基酸序列的cdrh1、包含seqidno:86所示的氨基酸序列的cdrh2、包含seqidno:87所示的氨基酸序列的cdrh3、包含seqidno:88所示的氨基酸序列的cdrl1、包含seqidno:89所示的氨基酸序列的cdrl2,和包含seqidno:90所示的氨基酸序列的cdrl3。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含具有seqidno:87的氨基酸序列的cdr3的重链可变区,和其包含具有seqidno:90的氨基酸序列的cdr3的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:86的氨基酸序列的cdr2的重链可变区,和其包含具有seqidno:89的氨基酸序列的cdr2的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含具有seqidno:85的氨基酸序列的cdr1的重链可变区,和其包含具有seqidno:88的氨基酸序列的cdr1的轻链可变区。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含与seqidno:95中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含与seqidno:97中所示的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含其包含seqidno:95中所示的氨基酸序列的重链可变结构域和其包含seqidno:97中所示的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分包含由与seqidno:96所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列,和由与seqidno:98所示的核苷酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含由seqidno:96所示的核酸序列编码的重链可变结构域氨基酸序列和由seqidno:98所示的核酸序列编码的轻链可变结构域氨基酸序列。在一些实施例中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的任何抗体包括具有基本上类似于cdrh1、cdrh2、cdrh3、cdrl1、cdrl2和/或cdrl3的一个或多个cdr(例如,cdrh或cdrl)序列的任何抗体(包括其抗原结合部分)。例如,抗体可包括表5中所示的一个或多个cdr序列(seqidno:1-12和85-90),与seqidno:1-12和85-90中任一个的相应cdr区相比,其含有至多5、4、3、2或1个氨基酸残基变异。表5中列出的抗体(例如,ab1、ab2和ab3)的重链可变区和轻链可变区的完整氨基酸序列以及编码抗体的重链可变区和轻链可变区的核酸序列提供如下:ab1—重链可变区氨基酸序列evqlvesggglvqpgrslrlscaasgftfssygmhwvrqapgkglewvavisydgsnkyyadsvkgrftisrdnskntlylqmnslraedtavyycardirpygdysaafdiwgqgtlvtvss(seqidno:13)ab1—重链可变区核酸序列gaggtgcaactcgtggagtcaggcggtggacttgttcagcctgggcgaagtctgagactctcatgtgcagcaagtggattcactttctccagttacggcatgcactgggtgagacaggcgcctggaaagggtttggaatgggtcgctgtgatctcttacgacgggtcaaacaaatattacgcggattcagtgaaagggcggttcactatttcacgggataactccaagaacaccctgtatctgcagatgaatagcctgagggcagaggacaccgctgtgtactattgtgcccgggacataaggccttacggcgattacagcgccgcatttgatatttggggacaaggcacccttgtgacagtatcttct(seqidno:91)ab1—轻链可变区氨基酸序列nfmltqphsvsespgktvtisctgssgsiasnyvqwyqqrpgsapsivifednqrpsgapdrfsgsidsssnsasltisglktedeadyycqsydssnhggvfgggtqltvl(seqidno:14)ab1—轻链可变区核酸序列aattttatgcttacccaaccacatagtgtgagtgagtctcccggcaagactgtaacaatttcatgtaccggcagcagtggctccatcgctagcaattatgtgcaatggtaccaacagcgccccgggagcgcaccttcaatagtgatattcgaggataaccaacggcctagtggggctcccgatagatttagtgggagtatagatagctcctccaactctgcctctctcaccattagcgggctgaaaacagaggatgaagccgactattactgccaaagctatgattctagcaaccacggcggagtgtttggcggaggaacacagctgacagtcctagg(seqidno:92)ab1—重链氨基酸序列evqlvesggglvqpgrslrlscaasgftfssygmhwvrqapgkglewvavisydgsnkyyadsvkgrftisrdnskntlylqmnslraedtavyycardirpygdysaafdiwgqgtlvtvssastkgpsvfplapcsrstsestaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtktytcnvdhkpsntkvdkrveskygppcppcpapeflggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvsqedpevqfnwyvdgvevhnaktkpreeqfnstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkglpssiektiskakgqprepqvytlppsqeemtknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflysrltvdksrwqegnvfscsvmhealhnhytqkslslslg(seqidno:15)ab1—轻链氨基酸序列nfmltqphsvsespgktvtisctgssgsiasnyvqwyqqrpgsapsivifednqrpsgapdrfsgsidsssnsasltisglktedeadyycqsydssnhggvfgggtqltvlgqpkaapsvtlfppsseelqankatlvclisdfypgavtvawkadsspvkagvetttpskqsnnkyaassylsltpeqwkshrsyscqvthegstvektvaptecs(seqidno:16)ab2—重链可变区氨基酸序列evqlvqsgaemkkpgeslkisckgsgynfasdwigwvrqtpgkglewmgviypgdsdtrysasfqgqvtisadksintaylqwsslkasdtamyycasaagiaaaghvtafdiwgqgtmvtvss(seqidno:17)ab2—重链可变区核酸序列gaggtgcaactggtgcaatccggagccgagatgaaaaagccaggggagagcctgaagatctcttgtaagggctctggctataacttcgctagtgattggatcggatgggtgaggcaaacccccggaaagggcctcgagtggatgggcgtgatctaccccggcgactccgacacacgctatagcgcctcattccagggccaggtcaccataagtgctgataaatcaataaatacagcctacttgcaatggtcaagtctgaaagcctcagatactgccatgtactattgtgcctctgccgccggcattgccgcggccggtcacgtcaccgccttcgacatttggggtcagggcactatggtcactgtaagctcc(seqidno:93)ab2—轻链可变区氨基酸序列divmtqspdslavslgeratinckssqsvlyssnnknylawyqqkpgqppklliywastresgvpdrfsgsgsgtdftltisslqaedvavyycqqyystpvtfgqgtkleik(seqidno:18)ab2—轻链可变区核酸序列gacatagtcatgacccagtcacctgactctttggccgtgtctctgggggagagagccacaataaattgcaagtcatcacagagcgtcctgtactcctccaataataaaaattacctggcctggtaccagcaaaagcccgggcaaccccccaaattgttgatttactgggctagtacaagggaatctggagtgccagaccggttttctggttctggatctggtactgacttcaccctgacaatcagctccctgcaggccgaagacgtggctgtgtactattgtcagcagtactatagtacaccagttactttcggccaaggcactaaactcgaaatcaag(seqidno:94)ab2—重链氨基酸序列evqlvqsgaemkkpgeslkisckgsgynfasdwigwvrqtpgkglewmgviypgdsdtrysasfqgqvtisadksintaylqwsslkasdtamyycasaagiaaaghvtafdiwgqgtmvtvssastkgpsvfplapcsrstsestaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtktytcnvdhkpsntkvdkrveskygppcppcpapeflggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvsqedpevqfnwyvdgvevhnaktkpreeqfnstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkglpssiektiskakgqprepqvytlppsqeemtknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflysrltvdksrwqegnvfscsvmhealhnhytqkslslslg(seqidno:19)ab2—轻链氨基酸序列divmtqspdslavslgeratinckssqsvlyssnnknylawyqqkpgqppklliywastresgvpdrfsgsgsgtdftltisslqaedvavyycqqyystpvtfgqgtkleikrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:20)ab3—重链可变区氨基酸序列evqllesggglvqpggslrlscaasgftfrnyamswvrqapgkglewvssisgsggatyyadsvkgrftisrdnskntlylqmnslraedtavyycarvssghwdfdywgqgtlvtvss(seqidno:95)ab3—重链可变区核酸序列gaggttcagcttctggagagcggcggtggtcttgtacaacctggaggatcactcaggttgtcatgtgccgcaagcgggtttacattcaggaactatgcaatgagctgggtcagacaggctcccggcaagggacttgagtgggtatcttccatcagcggatctggaggagcaacatattatgcagatagtgtcaaaggcaggttcacaataagccgcgacaattctaaaaatactctttatcttcaaatgaatagccttagggctgaggatacggcggtgtattattgtgcccgcgtctcaagcgggcattgggacttcgattattgggggcagggtactctggttactgtttcctcc(seqidno:96)ab3—轻链可变区氨基酸序列diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqsissylnwyqqkpgkapklliydasslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpedfatyycqqsysapftfgqgtkveik(seqidno:97)ab3—轻链可变区核酸序列gacatccaaatgacacagagcccgtcttccctctcagcttcagtcggtgatcgagtgacgattacgtgccgcgccagccaaagcatctcctcctatcttaactggtatcagcagaaacccggaaaggccccaaagttgcttatttacgacgcatcctcccttcaatctggtgtgcccagcaggttctcaggcagcggttcaggaacggattttactcttaccatttctagtcttcaacctgaggattttgcgacgtattactgtcaacagagctacagtgcgccgttcacctttgggcagggtactaaggttgagataaagc(seqidno:98)ab3—重链氨基酸序列evqllesggglvqpggslrlscaasgftfrnyamswvrqapgkglewvssisgsggatyyadsvkgrftisrdnskntlylqmnslraedtavyycarvssghwdfdywgqgtlvtvssastkgpsvfplapcsrstsestaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtktytcnvdhkpsntkvdkrveskygppcppcpapeflggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvsqedpevqfnwyvdgvevhnaktkpreeqfnstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkglpssiektiskakgqprepqvytlppsqeemtknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflysrltvdksrwqegnvfscsvmhealhnhytqkslslslg(seqidno:99)ab3—轻链氨基酸序列diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqsissylnwyqqkpgkapklliydasslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpedfatyycqqsysapftfgqgtkveikrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:100)在一些实施例中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体包含其包含seqidno:13、17或95的重链可变结构域或seqidno:14、18或97的轻链可变结构域的任何抗体。在一些实施例中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体包含其包含seqidno:13和14;17和18;和95和97的重链可变和轻链可变对的任何抗体。本公开的各方面提供了特异性结合至两个或更多个以下复合物的抗体:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物,其具有与本文所述的那些中任一种同源的重链可变和/或轻链可变氨基酸序列。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物的抗体包含与seqidno:13、17或95的重链可变氨基酸序列或seqidno:14、18或97的轻链可变序列至少75%(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)相同的重链可变序列或轻链可变序列。在一些实施方式中,同源重链可变和/或轻链可变氨基酸序列在本文提供的任何cdr序列内不变化。例如,在一些实施方式中,序列变异的程度(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)可以在除了任何本文提供的cdr序列以外的重链可变和/或轻链可变氨基酸序列内发生。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体包含其包含seqidno:15或19的重链或seqidno:16或20的轻链的任何抗体或其抗原其结合部分。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体包含其包含seqidno:15和16;或19和20的重链和轻链对的任何抗体。本公开的各方面提供了特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物中的两个或多个的抗体,其具有与本文所述任何一种同源的重链和/或轻链氨基酸序列。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体包含与seqidno:15或19的重链序列或seqidno:16或20的轻链序列至少75%(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)相同的重链序列或轻链序列。在一些实施方式中,同源重链和/或轻链氨基酸序列在本文提供的任何cdr序列内不变化。例如,在一些实施方式中,序列变异的程度(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)可以在除了任何本文提供的cdr序列以外的重链和/或轻链氨基酸序列内发生。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的两个或多个的本公开的抗体包含其包含seqidno:15或19的重链,或seqidno:16或20的轻链的任何抗体或其抗原结合部分。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体包含其包含seqidno:15和16;或19和20的重链和轻链对的任何抗体。本公开的各方面提供了特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物中的两个或多个的抗体,其具有与本文所述任何一种同源的重链和/或轻链氨基酸序列。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体包含与seqidno:15或19的重链序列或seqidno:16或20的轻链序列至少75%(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)相同的重链序列或轻链序列。在一些实施方式中,同源重链和/或轻链氨基酸序列在本文提供的任何cdr序列内不变化。例如,在一些实施方式中,序列变异的程度(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)可以在除了任何本文提供的cdr序列以外的重链和/或轻链氨基酸序列内发生。在一些实施方式中,两个氨基酸序列的“同一性百分比”是使用karlinandaltschulproc.natl.acad.sci.usa87:2264-68,1990、修改如karlinandaltschulproc.natl.acad.sci.usa90:5873-77,1993的算法来确定。这种算法被并入altschul,等j.mol.biol.215:403-10,1990的nblast和xblast程序(2.0版)中。可以用xblast程序进行blast蛋白质搜索,得分=50,字长=3,以获得与目标蛋白质分子同源的氨基酸序列。当两个序列之间存在空位时,可以如altschul等,nucleicacidsres.25(17):3389-3402,1997中所述使用gappedblast。当使用blast和gappedblast程序时,可以使用相应程序(例如,xblast和nblast)的默认参数。在本文所述的任何抗体或抗原结合片段中,可以在残基不太可能参与抗体-抗原相互作用的位置处将一个或多个保守突变引入cdr或框架序列中。在一些实施方式中,可以在基于晶体结构确定的残基不太可能参与与garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物的相互作用的位置处将这样的保守突变引入cdr或框架序列中。在一些实施方式中,可以从共享结构相似性的另一抗原的已知结构信息推导出可能的界面(例如,参与抗原-抗体相互作用的残基)。如本文所用,“保守氨基酸置换”意指不改变其中进行氨基酸置换的蛋白相对电荷或大小特征的氨基酸置换。可以根据本领域普通技术人员已知的改变多肽序列的方法制备变体,例如可在汇总这样的方法的参考文献中找到的,例如molecularcloning:alaboratorymanual,j.sambrook,等,eds.,secondedition,coldspringharborlaboratorypress,press,coldspringharbor,newyork,1989或currentprotocolsinmolecularbiologybiology,f.m.ausubel,等,eds.,johnwiley&sons,inc.,newyork。氨基酸的保守置换包括在下列组中的氨基酸之间进行的置换:(a)m、i、l、v;(b)f、y、w;(c)k、r、h;(d)a、g;(e)s、t;(f)q、n;和(g)e、d。在一些实施方式中,本文提供的抗体包含赋予抗体期望性质的突变。例如,为了避免由于已知天然发生在igg4mab中的fab臂交换引起的潜在并发症,本文提供的抗体可以包含稳定化“adair”突变((angal等,"asingleaminoacidsubstitutionabolishestheheterogeneityofchimericmouse/human(lgg4)antibody,"molimmunol30,105-108;1993),其中丝氨酸228(eu编号;其kabat编号为残基241)被转化为脯氨酸,导致igg1样(cppcp(seqidno:54))铰链序列。因此,任何所述抗体可包括稳定化'adair'突变或氨基酸序列cppcp(seqidno:54)。本公开的tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂(其包括背景非依赖性抑制剂),例如,特异性结合至以下两种或更多种的抗体:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物,lrrc33-tgfβ1复合物,可任选包含抗体恒定区或其部分。例如,vl结构域可以在其c-末端连接至轻链恒定结构域,如cκ或cλ。类似地,vh结构域或其部分可以连接到重链的全部或部分,如iga、igd、ige、igg和igm,以及任何亚型亚类。抗体可包含合适的恒定区(参见,例如,kabat等,sequencesofproteinsofimmunologicalinterest,no.91-3242,nationalinstitutesofhealthpublications,bethesda,md.(1991))。因此,在本公开范围内的抗体可以包含与任何合适的恒定区组合的vh和vl结构域或其抗原结合部分。此外或可替代地,这样的抗体可以包含或可以不包含seqidno:13-20的抗体的框架区。在一些实施方式中,特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体是鼠抗体,并且包含鼠框架区序列。在一些实施方式中,这样的抗体以相对高的亲和力结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物,例如,kd小于10-6m、10-7m、10-8m、10-9m、10-10m、10-11m或更低。例如,这样的抗体可以以5pm和500nm之间(例如在50pm和100nm之间,例如在500pm和50nm之间)的亲和力结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物。本公开还包括抗体或抗原结合片段,其与本文所述的任何抗体竞争结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物,并且具有50nm或更低(例如,20nm或更低、10nm或更低、500pm或更低、50pm或更低,或5pm或更低)的亲和力。可以使用任何合适的方法测试特异性结合至garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的亲和力和结合动力学,包括但不限于生物传感器技术(例如,octet或biacore)。在一些实施方式中,根据本发明的细胞相关tgfβ1(例如,garp呈递的tgfβ1和lrrc33呈递的tgfβ1)的抑制剂包括特异性结合这样的复合物(例如,garp-前/潜在tgfβ1和lrrc33-前/潜在tgfβ1)并触发复合物的内化的抗体或其片段。这种作用模式导致从细胞表面(例如,treg、巨噬细胞等)移除或耗尽无活性tgfβ1复合物,由此减少可用于激活的tgfβ1。在一些实施方式中,这样的抗体或其片段以ph依赖性方式结合靶复合物,使得在中性或生理ph下发生结合,但抗体在酸性ph下与其抗原解离。这样的抗体或其片段可以作为再循环抗体起作用。多肽本公开的一些方面涉及具有选自seqidno:13、seqidno:17、seqidno:95、seqidno:15和seqidno:19的序列的多肽。在一些实施方式中,多肽是可变重链结构域或重链结构域。在一些实施方式中,多肽与seqidno:13、seqidno:17、seqidno:95、seqidno:15和seqidno:19中所示的氨基酸序列的任一种是至少75%(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)相同。本公开的一些方面涉及具有选自seqidno:14、seqidno:18、seqidno:97、seqidno:16和seqidno:20的序列的多肽。在一些实施方式中,多肽是可变轻链结构域或轻链结构域。在一些实施方式中,多肽与seqidno:14、seqidno:18、seqidno:97、seqidno:16和seqidno:20中所示的氨基酸序列的任一种是至少75%(例如,80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)相同。与tgf-β1的亚型特异性、背景许可性抑制抗体竞争的抗体本公开的方面涉及与本文提供的任何抗体竞争或交叉竞争的抗体。如本文所用,与抗体有关的术语“竞争”是指第一抗体以与第二抗体的结合充分相似的方式结合至表位(例如,garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的表位),使得在第二抗体存在下第一抗体与其表位结合的结果与第二抗体不存在时第一抗体的结合相比可检测地降低。或者,可以但不必是,在第一抗体存在下第二抗体与其表位的结合也可检测地降低。也就是说,第一抗体可以抑制第二抗体与其表位的结合,而不发生第二抗体抑制第一抗体与其各自表位的结合。然而,当每种抗体可检测地抑制另一种抗体与其表位或配体的结合时,无论其程度相同、更大还是更小,所述抗体被称为彼此“交叉竞争”以结合它们各自的表位。竞争和交叉竞争抗体都在本公开的范围内。无论这样的竞争或交叉竞争发生的机制如何(例如,空间位阻、构象变化或与共同表位或其部分结合),技术人员将理解这样的竞争性和/或交叉竞争抗体包括在本文中并可用于本文提供的方法和/或组合物。本发明的方面涉及与本文提供的任何特定的抗体或其抗原结合部分竞争或交叉竞争的抗体。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分与本文提供的任何抗体在相同表位处或附近结合。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分如果结合在表位的15个或更少氨基酸残基内,则其结合在表位附近。在一些实施方式中,本文提供的任何抗体或其抗原结合部分在与本文提供的任何抗体结合的表位的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个氨基酸残基内结合。在另一个实施方式中,本文提供的是抗体或其抗原结合部分,其以抗体和蛋白质之间的平衡解离常数kd小于10-6m竞争或交叉竞争结合本文提供的任何抗原(例如,garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物)。在其他实施方式中,抗体以10-11m至10-6m范围的kd竞争或交叉竞争结合本文提供的任何抗原。在一些实施方式中,本文提供的是抗tgfβ1抗体或其抗原结合部分,其竞争结合本文中所述抗体或其抗原结合部分。在一些实施方式中,本文提供的是抗tgfβ1抗体或其抗原结合部分,其结合至与本文所述的抗体或其抗原结合部分相同的表位。本文提供的任何抗体可使用任何合适的方法来表征。例如,一种方法是鉴定抗原所结合的表位,或“表位映射”。有许多合适的方法用于映射和表征蛋白质上表位的位置,包括解析抗体-抗原复合物的晶体结构、竞争测定、基因片段表达测定和基于合成肽的测定,例如,在harlowandlane,usingantibodies,alaboratorymanual,coldspringharborlaboratorypress,coldspringharbor,n.y.,1999中所述。在另外的实例中,表位映射可用于确定抗体所结合的序列。所述表位可以是线性表位,即包含在单条氨基酸链中,或由可以不必包含在单条氨基酸链(一级结构线性序列)中的氨基酸的三维相互作用形成的构象表位。在一些实施方式中,表位是tgfβ1表位,当tgfβ1在garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中时,其仅可用于被本文所述的抗体或其抗原结合部分结合。可以分离或合成(例如,重组)不同长度(例如,至少4-6个氨基酸长)的肽,并用于与抗体的结合测定。在另一个实例中,可以通过使用源自靶抗原序列的重叠肽并通过抗体确定结合来在系统筛选中确定所述抗体结合的所述表位。根据基因片段表达测定,编码靶抗原的开放阅读框随机或通过特定的遗传构建进行片段化,并确定所述抗原的表达片段与待测抗体的反应性。例如,基因片段可以通过pcr产生,然后在放射性氨基酸存在下在体外转录并翻译成蛋白质。然后通过免疫沉淀和凝胶电泳确定所述抗体与放射性标记的抗原片段的结合。还可以通过使用在噬菌体颗粒表面上展示的大型随机肽序列文库(噬菌体文库)来鉴定某些表位。或者,可以在简单结合测定中测试限定的重叠肽片段文库与测试抗体的结合。在另外的实例中,可以进行抗原结合结构域的诱变、结构域交换实验和丙氨酸扫描诱变,以鉴定表位结合所必需的、充分的和/或需要的残基。例如,可以使用靶抗原的突变体进行结构域交换实验,其中garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的各种片段已经被来自密切相关但抗原性不同的蛋白质的序列替换(交换),例如tgfβ蛋白质家族的另一成员(例如gdf11)。通过评估所述抗体与garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的突变体的结合,可以评估特定抗原片段对抗体结合的重要性。或者,竞争测定法可使用已知结合至相同抗原的其它抗体来确定抗体是否结合至与其他抗体相同的表位来进行。竞争测定法是本领域技术人员所熟知的。此外,本文中提供的任何抗体与garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的一个或多个残基的相互作用可以通过常规技术确定。例如,可以确定晶体结构,并且可以据此确定garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的残基与抗体中的一个或多个残基之间的距离。基于这样的距离,可以确定garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的特定残基是否与抗体中的一个或多个残基相互作用。此外,可以应用合适的方法,例如竞争测定和靶向诱变测定,以确定候选抗体的优先结合。抗体的各种修饰和变异由本公开涵盖的任何抗体或其抗原结合片段的非限制性变异、修饰和特征简要讨论如下。还提供了相关分析方法的实施方式。天然存在的抗体结构单元通常包括一个四聚体。每个这样的四聚体通常由两对相同的多肽链组成,每对多肽链具有一个全长的“轻”链(在某些实施方式中,约25kda)和一个全长的“重”链(在某些实施方式中,约50-70kda)。每条链的氨基末端部分通常包含约100至110个或更多个氨基酸的可变区,其通常负责抗原识别。每条链的羧基末端部分通常定义可以负责效应子功能的恒定区。人抗体轻链通常分类为κ和λ轻链。重链通常分类为μ、δ、γ、α或ε,并定义抗体的亚型。抗体可以是任何类型(例如,igm、igd、igg、iga、igy和ige)和类别(例如,igg1、igg2、igg3、igg4、igm1、igm2、iga1和iga2)。通常,在全长轻链和重链内,可变区和恒定区通过约12个或更多个氨基酸的“j”区连接,重链还包括约10个以上氨基酸的“d”区(参见,例如,fundamentalimmunology,ch.7(paul,w.,ed.,2nded.ravenpress,n.y.(1989))(通过引用全文整体并入))。每个轻/重链对的可变区通常形成抗原结合位点。可变区通常显示出由三个高变区连接的相对保守的框架区(fr)的相同的一般结构,也称为互补决定区或cdr。来自每对的两条链的cdr通常通过框架区对齐,其使得可以结合至特定的表位。从n末端到c末端,轻链和重链两者的可变结构域通常包含结构域fr1、cdr1、fr2、cdr2、fr3、cdr3和fr4。每个结构域的氨基酸分配通常符合kabatsequencesofproteinsofimmunologicalinterest(nationalinstitutesofhealth,bethesda,md.(1987and1991))或chothia&lesk(1987)j.mol.biol.196:901-917;chothiaetal(1989)nature342:878-883中的定义。轻链的cdr也可以称为cdr-l1、cdr-l2和cdr-l3,重链的cdr也可以称为cdr-h1、cdr-h2和cdr-h3。在一些实施方式中,抗体可包含来自重链羧基末端的少量氨基酸缺失。在一些实施方式中,抗体包含在重链羧基末端具有1-5个氨基酸缺失的重链。在某些实施方式中,对cdr的明确界定和包含抗体结合位点的残基的鉴定通过解析抗体的结构和/或解析抗体-配体复合物的结构来完成。在某些实施方式中,其可以通过本领域技术人员已知的多种技术中的任何一种来实现,例如x射线晶体学。在一些实施方式中,可以采用各种分析方法来鉴定或粗略估算cdr区。这样的方法的实例包括但不限于kabat定义、chothia定义、abm定义和接触定义。“亲和力成熟”抗体是在其一个或多个cdr中具有一个或多个改变的抗体,所述一个或多个改变导致其相比于其不具有这些改变的亲本抗体,抗体对抗原的亲和力提高。示例性亲和力成熟抗体对靶抗原具有纳摩尔或甚至皮摩尔的亲和力。通过本领域已知的方法产生亲和力成熟抗体。marks等(1992)bio/technology10:779-783描述了通过vh和vl结构域混排的亲和力成熟。barbas,等(1994)procnat.acad.sci.usa91:3809-3813、schier等(1995)gene169:147-155、yelton等,(1995)j.immunol.155:1994-2004、jackson等(1995)j.immunol.154(7):3310-9和hawkins等(1992)j.mol.biol.226:889-896描述了cdr和/或框架残基的随机诱变;美国专利号6,914,128中描述了在具有活性增强氨基酸残基的选择性诱变位置、接触或超突变位置上的选择性突变。术语“cdr嫁接抗体”意指其包含来自一个物种的重链和轻链可变区序列,但是其中vh和/或vl的一个或多个cdr区的序列被另一物种的cdr序列所置换的抗体,例如具有鼠重链和轻链可变区的抗体,其中一个或多个鼠cdr(例如cdr3)已被人cdr序列取代。术语“嵌合抗体”意指其包含来自一个物种的重链和轻链可变区序列和来自另一个物种的恒定区序列的抗体,例如具有连接至人恒定区的鼠重链和轻链可变区的抗体。如本文所用,术语“框架”或“框架序列”意指可变区减去cdr的剩余序列。因为cdr序列的确切定义可以由不同系统确定,所以框架序列的含义受到相应不同解释的影响。六个cdr(轻链的cdr-l1、-l2和-l3和重链的cdr-h1、-h2和-h3)也在每条链上将轻链和重链上的框架区划分为四个亚区(fr1、fr2、fr3和fr4),其中cdr1位于fr1和fr2之间,cdr2位于fr2和fr3之间,cdr3位于fr3和fr4之间。如其他人所提及的,在没有将特定的亚区指定为fr1、fr2、fr3或fr4的情况下,框架区域表示单个天然存在的免疫球蛋白链的可变区域内的组合的fr。如本文所用,单数fr表示四个亚区中的一个,复数fr表示构成框架区的四个亚区中的两个或更多个。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含人igm恒定结构域、人igg恒定结构域、人igg1恒定结构域、人igg2恒定结构域、人igg2a恒定结构域、人igg2b恒定结构域、人igg2恒定结构域、人igg3恒定结构域、人igg3恒定结构域、人igg4恒定结构域,人iga恒定结构域、人iga1恒定结构域,人iga2恒定结构域、人igd恒定结构域或人ige恒定结构域的重链免疫球蛋白恒定结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含人igg1恒定结构域或人igg4恒定结构域的重链免疫球蛋白恒定结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含人igg4恒定结构域的重链免疫球蛋白恒定结构域。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分包含人igg4恒定结构域的重链免疫球蛋白恒定结构域,其具有产生igg1样铰链并允许形成链间二硫键的ser至pro的骨架置换。在一些实施方式中,抗体或其抗原结合部分还包含轻链免疫球蛋白恒定结构域,其包含人igλ恒定结构域或人igκ恒定结构域。在一些实施方式中,抗体是具有其是两个重链和两个轻链的四个多肽链的igg。在一些实施方式中,其中抗体是人源化抗体、双抗体,或嵌合抗体。在一些实施方式中,抗体是人源化抗体。在一些实施方式中,抗体是人抗体。在一些实施方式中,抗体包含具有人种系氨基酸序列的框架。在一些实施方式中,抗原结合部分是fab片段、f(ab')2片段、scfab片段或scfv片段。如本文所用,术语“种系抗体基因”或“基因片段”意指由未经历成熟过程的非淋巴细胞编码的免疫球蛋白序列,其导致遗传重排和突变以表达特定免疫球蛋白。(参见,例如,shapiro等(2002)crit.rev.immunol.22(3):183-200;marchalonis等(2001)adv.exp.med.biol.484:13-30)。本公开的各种实施方式提供的优点之一源于认识到种系抗体基因比成熟抗体基因更可能保存物种中个体特有的必需氨基酸序列结构,因此在该物种中用于治疗时更不可能被认为是来自外界来源。如本文所用,“中和”意指当结合蛋白特异性结合至抗原时抵消抗原的生物学活性。在一个实施方式中,中和结合蛋白结合至抗原/靶标,例如细胞因子、激酶、生长因子、细胞表面蛋白、可溶性蛋白、磷酸酶或受体配体,并将其生物学活性降低至少约20%、40%、60%、80%、85%、90%、95%、96%、97%。98%、99%或更多。如本文所用,术语“结合蛋白”包括特异性结合至抗原(例如,tgfβ1)的任何多肽,包括但不限于抗体或者其抗原结合部分、dvd-igtm、tvd-ig、rab-ig、双特异性抗体和双特异性抗体。术语“单克隆抗体”或“mab”在包含相同的组合物情况下使用时可能意指从基本上同质的抗体群体中获得的抗体制备物,即,除了可能以少量存在的可能天然变异以外,构成群体的个体抗体相同。单克隆抗体是高度特异性的,定向针对单一抗原。此外,与通常包括针对不同决定子(表位)的不同抗体的多克隆抗体制备物相反,每种单克隆抗体定向针对抗原上的单一决定子。修饰语“单克隆”不应解释为需要通过任何特定方法产生抗体。如本文所用,术语“重组人抗体”旨在包括通过重组方法制备、表达、产生或分离的所有人抗体,如使用转染到宿主细胞中的重组表达载体表达的抗体(在下文ii部分c中进一步描述)、从重组的组合人抗体文库中分离的抗体(hoogenboom,h.r.(1997)tibtech.15:62-70;azzazy,h.andhighsmith,w.e.(2002)clin.biochem.35:425-445;gavilondo,j.v.andlarrick,jw.(2002)biotechniques29:128-145;hoogenboom,h.andchames,p.(2000)immunol.today21:371-378,其全部内容各自通过引用并入本文)、从其是转人免疫球蛋白基因的动物(例如小鼠)分离的抗体(参见taylor,l.d.等(1992)nucl.acidsres.20:6287-6295;kellermann,s-a.andgreen,l.l.(2002)cur.opin.inbiotechnol.13:593-597;little,m.等(2000)immunol.today21:364-370),或是通过涉及将人免疫球蛋白基因序列剪接到其他dna序列的任何其他方法制备、表达、产生或分离的抗体。这样的重组人抗体具有来源于人种系免疫球蛋白序列的可变区和恒定区。然而,在某些实施方式中,对这样的重组人抗体进行体外诱变(或者,当使用表达人ig序列的转基因动物时,进行体内体细胞诱变),因此重组抗体的vh和vl区的氨基酸序列是这样的序列:虽然来源于人种系vh和vl序列并与之相关,但其可能不天然存在于体内人抗体种系库中。如本文所用,“双重可变结构域免疫球蛋白”或“dvd-igtm”及类似术语是其包含成对的重链dvd多肽和轻链dvd多肽的结合蛋白,每个成对的重链和轻链提供两个抗原结合位点。每个结合位点包含每个抗原结合位点参与抗原结合的总共6个cdr。dvd-igtm通常具有至少部分地通过ch3结构域的二聚化彼此结合的两个臂,其中dvd的每个臂是双特异性的,提供具有四个结合位点的免疫球蛋白。dvd-igtm在美国专利公开号2010/0260668和2009/0304693中提供,其全部内容包括序列表各自通过引用并入本文。如本文所用,“三重可变结构域免疫球蛋白”或“tvd-ig”及类似术语是其包含成对的重链tvd结合蛋白多肽和轻链tvd结合蛋白多肽的结合蛋白,每个成对的重链和轻链提供三个抗原结合位点。每个结合位点包括每个抗原结合位点参与抗原结合的总共6个cdr。tvd结合蛋白可以具有至少部分地通过ch3结构域的二聚化彼此结合的两个臂,其中tvd结合蛋白的每个臂是三特异性的,提供具有六个结合位点的结合蛋白。如本文所用,“受体抗体免疫球蛋白”或“rab-ig”及类似术语是包含重链rab多肽和轻链rab多肽的结合蛋白,其共同形成总共三个抗原结合位点。通过配对每个重链rab多肽和轻链rab多肽中存在的重链和轻链抗体可变结构域以形成提供第一抗原结合位点的具有总共6个cdr的单个结合位点,从而形成一个抗原结合位点。每个重链rab多肽和轻链rab多肽包括独立结合配体、提供第二和第三“抗原”结合位点的受体序列。rab-ig通常具有两个至少部分地通过ch3结构域的二聚化彼此结合的臂,rab-ig的每个臂是三特异性的,提供具有六个结合位点的免疫球蛋白。rab-igs在美国专利申请公开号2002/0127231中描述,其全部内容包括序列表各自通过引用并入本文。如本文所用,与“双特异性半ig结合蛋白”或“双特异性(半ig)结合蛋白”相区别,术语“双特异性抗体”,是指由四价体瘤(quadroma)技术产生的全长抗体(参见milstein,c.andcuello,a.c.(1983)nature305(5934):p.537-540),其通过两种不同的单克隆抗体的化学缀合(参见staerz,u.d.等(1985)nature314(6012):628-631),或通过在fc区中引入不抑制ch3-ch3二聚化的突变的杵臼或类似方法(参见holliger,p.等(1993)proc.natl.acad.sciusa90(14):6444-6448)而产生多种不同的免疫球蛋白种类,其中只有一种是功能性双特异性抗体。通过分子功能,双特异性抗体在其两个结合臂(一对hc/lc)中的一个上结合一个抗原(或表位),并在其第二臂(一对不同的hc/lc)上结合不同的抗原(或表位)。通过该定义,双特异性抗体具有两个不同的抗原结合臂(在特异性和cdr序列两者方面),并且对于其结合的每种抗原是单价的。如本文所用,并且与双特异性半ig结合蛋白或双特异性结合蛋白相区别,术语“双重特异性抗体”意指可以在其两个结合臂(一对hc/lc)的每个中结合两个不同抗原(或表位)的全长抗体(参见pct公开号wo02/02773)。因此,双特异性结合蛋白具有两个相同的抗原结合臂,其具有相同的特异性和相同的cdr序列,并且对于其结合的每种抗原是二价的。如本文所用,术语“kon”旨在指代结合蛋白(例如,抗体)与抗原结合以形成本领域所知的例如抗体/抗原复合物的速率常数。已知术语“结合速率常数”或“ka”也称为“kon”,在本文中可互换使用。该值表示抗体与其靶抗原的结合速率或抗体和抗原之间形成复合物的速率,也由下式表示:抗体(“ab”)+抗原(“ag”)→ab-ag。如本文所用,术语“koff”旨在指代结合蛋白(例如,抗体)从本领域所知的例如抗体/抗原复合物中解离的解离速率常数。已知术语“解离速率常数”或“kd”也称为“koff”,在本文中可互换使用。该值表示抗体与其靶抗原的解离速率,或是ab-ag复合物分离成游离的抗体和抗原的时间,由下式表示:ab+ag←ab-ag。术语“平衡解离常数”或“kd”,在本文中可互换使用,意指在平衡状态下滴定测量中获得的值,或是通过用解离速率常数(koff)除以结合速率常数(kon)。结合速率常数、解离速率常数和平衡解离常数用于表示结合蛋白(例如抗体)对抗原的结合亲和力。确定结合和解离速率常数的方法是本领域熟知的。使用基于荧光的技术提供高灵敏度和在平衡状态下检查生理缓冲液中的样品的能力。可以使用其他的实验方法和仪器,例如(生物分子相互作用分析)测定(例如,仪器可从gehealthcare公司的biacoreinternationalab,uppsala,sweden获得)。另外,还可以使用购自sapidyneinstruments(boise,idaho)的(动力学排除测定)测定。如本文所用,术语“晶体(crystal/crystallized)”意指以晶体形式存在的结合蛋白(例如,抗体)或其抗原结合部分。晶体是固态物质的一种形式,其不同于其他例如无定形固态或液晶态的形式。晶体由原子、离子、分子(例如,例如抗体的蛋白质)或分子组合(例如,抗原/抗体复合物)的规则的、重复的、三维的阵列组成。这些三维阵列根据本领域熟知的特定数学关系排列。在晶体中重复的基本单元或构建块称为不对称单元。所述不对称单元在符合给定的、明确定义的晶体学对称性的排布中的重复提供晶体的“晶胞”。所述晶胞通过在所有三个维度上的常规平移重复提供晶体。参见giegegiege,r.andducruix,a.barrett,crystallizationofnucleicacidsandproteins,apracticalapproach,2ndea.,pp.201-16,oxforduniversitypress,newyork,newyork,(1999)。术语“接头”用于表示包含通过肽键连接的两个或更多个氨基酸残基并用于连接一个或多个抗原结合部分的多肽。这样的接头多肽是本领域熟知的(参见,例如,holliger,p.等(1993)proc.natl.acad.sci.usa90:6444-6448;poljak,r.j.等(1994)structure2:1121-1123)。示例性接头包括但不限于:astkgpsvfplap(seqidno:55)、astkgp(seqidno:56);tvaapsvfifpp(seqidno:57);tvaap(seqidno:58);akttpkleegefsear(seqidno:59);akttpkleegefsearv(seqidno:60);akttpklgg(seqidno:61);sakttpklgg(seqidno:62);sakttp(seqidno:63);radaap(seqidno:64);radaaptvs(seqidno:65);radaaaaggpgs(seqidno:66);radaaaa(g4s)4(seqidno:67);sakttpkleegefsearv(seqidno:68);adaap(seqidno:69);adaaptvsifpp(seqidno:70);qpkaap(seqidno:71);qpkaapsvtlfpp(seqidno:72);akttpp(seqidno:73);akttppsvtplap(seqidno:74);akttap(seqidno:75);akttapsvyplap(seqidno:76);ggggsggggsggggs(seqidno:77);genkveyapalmals(seqidno:78);gpakeltplkeakvs(seqidno:79);gheaaavmqvqypas(seqidno:80);tvaapsvfifpptvaapsvfifpp(seqidno:81);和astkgpsvfplapastkgpsvfplap(seqidno:82)。“标记”和“可检测标记”或“可检测部分”意指附着在特定结合配偶体,例如抗体或分析物,例如以使特定结合对的成员(如抗体和分析物)和特异性结合配偶体(例如抗体或分析物)之间的反应可检测的,如此标记被称为“可检测标记”。因此,如本文所用的术语“标记的结合蛋白”意指具有掺入的用于鉴定结合蛋白的标记的蛋白。在一个实施方式中,标记是可检测的标识物,其可以产生可通过视觉或仪器手段检测的信号,例如掺入放射性标记的氨基酸或附着于生物素基部分的多肽,其可以通过标记的亲和素蛋白(例如,含有荧光标记物或酶活性的链球菌亲和素蛋白,其可通过光学或比色法检测)检测。多肽标记的实例包括但不限于以下:放射性同位素或放射性核素(例如,3h、14c、35s、90y、99tc、111in、125i、131i、177lu、166ho和153sm);发色团;荧光标记(例如,fitc、罗丹明和镧系元素荧光粉);酶标记(例如,辣根过氧化物酶、荧光素酶和碱性磷酸酶);化学发光标记;生物素基团;由第二报告分子识别的预先确定的多肽表位(例如,亮氨酸拉链对序列、第二抗体的结合位点、金属结合结构域和表位标签);和磁性试剂,如钆螯合物。通常用于免疫测定的标记的代表性实例包括产生光的部分,例如吖啶化合物,和产生荧光的部分,例如荧光素。本文描述了其他标记。在这方面,所述部分本身可能没有被可检测地标记,但在与另一部分反应时可能变得可检测。“可检测标记”的使用旨在包括后一种类型的可检测标记。在一些实施方式中,使用octet测定法测定抗体或其抗原结合部分与抗原(例如,蛋白复合物)的结合亲和力,例如garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,octet测定是确定可指示抗体和抗原之间结合的一个或更多个动力学参数的测定法。在一些实施方式中,使用octet系统(fortebio,menlopark,ca)测定抗体或其抗原结合部分与garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的结合亲和力。例如,可以使用fortébiooctetqkedip和使用生物层干涉测量法的无标记读取测定系统来确定抗体的结合亲和力。在一些实施方式中,抗原固定至生物传感器(例如,链球菌亲和素蛋白包被的生物传感器)上,并且抗体和复合物(例如,生物素化的garp-tgfβ1复合物和生物素化的ltbp-tgfβ1复合物)以高浓度(50μg/ml)存在于溶液中,以测量结合相互作用。在一些实施方式中,使用表6中概述的方案测量抗体或其抗原结合部分与garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的结合亲和力。如本文所用,术语“表面等离振子共振”意指一种光学现象,其允许通过检测生物传感器基质内蛋白质浓度的改变对双特异性相互作用进行实时分析,例如,使用系统(gehealthcare公司的biacoreinternationalab,uppsala,swedenandpiscataway,nj)。进一步的描述请参阅u.等(1993)ann.biol.clin.51:19-26;u.等(1991)biotechniques11:620-627;johnsson,b.等(1995)j.mol.recognit.8:125-131;andjohnnson,b.等(1991)anal.biochem.198:268-277。tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂的鉴定和生产/制备本发明包含抗体或其片段的筛选方法、生产方法和制备过程,以及包含其的药物组合物和相关试剂盒,所述抗体或其片段结合两个或多个:garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物。许多方法可以用于获得本公开的抗体或其抗原结合片段。例如,可以使用重组dna方法产生抗体。单克隆抗体也可以按照已知方法通过生成杂交瘤产生(参见例如,kohlerandmilstein(1975)nature,256:495-499)。然后使用标准方法筛选以这种方式形成的杂交瘤,例如酶联免疫吸附测定(elisa)和表面等离子体共振(例如,octet或biacore)分析,以鉴定产生特异性结合至指定抗原的抗体的一种或多种杂交瘤。任何形式的指定抗原可用作免疫原,例如重组抗原、天然存在形式、其任何变体或片段,以及其抗原性肽(例如,如本文所述作为线性表位或在支架中作为构象表位的任何表位)。制备抗体的一种示例性方法包括筛选表达抗体或其片段(例如scfv)的蛋白质表达文库,例如噬菌体或核糖体展示文库。噬菌体展示描述于例如ladner等,u.s.pat.no.5,223,409;smith(1985)science228:1315-1317;clackson等(1991)nature,352:624-628;marks等(1991)j.mol.biol.,222:581-597;wo92/18619;wo91/17271;wo92/20791;wo92/15679;wo93/01288;wo92/01047;wo92/09690;和wo90/02809。除了使用展示文库,指定的抗原(例如,garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物)可用于免疫非人宿主,例如兔、豚鼠、大鼠、小鼠、仓鼠、绵羊、山羊、鸡、骆驼科动物,以及非哺乳动物宿主,例如鲨鱼。在一个实施方式中,所述非人动物是小鼠。在另一个实施方式中,利用合适的重组dna技术从非人动物获得单克隆抗体,然后修饰,例如,嵌合抗体。已经描述了多种制备嵌合抗体的方法。参见,例如,morrison等,proc.natl.acad.sci.u.s.a.81:6851,1985;takeda等,nature314:452,1985,cabilly等,美国专利号4,816,567;boss等,美国专利号4,816,397;tanaguchi等,欧洲专利公开号ep171496;欧洲专利公开号0173494,英国专利号gb2177096b。关于其他抗体生产技术,参见antibodies:alaboratorymanual,eds.harlow等,coldspringharborlaboratory,1988。本公开不必限于抗体的任何特定来源、生产方法或其他特征。本公开的某些方面涉及到以多核苷酸或载体转化的宿主细胞。宿主细胞可以是原核或真核细胞。存在于宿主细胞中的多核苷酸或载体或者可以整合到宿主细胞的基因组中,或者可以维持在染色体外。所述宿主细胞可以是任何原核或真核细胞,例如细菌、昆虫、真菌、植物、动物或人细胞。在一些实施方式中,真菌细胞是例如酿酒酵母属的那些,特别是酿酒酵母菌种的真菌细胞。术语“原核”包括可以用dna或rna分子转化或转染用于表达抗体或相应的免疫球蛋白链的所有细菌。原核宿主可包括革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌,例如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌、粘质沙雷氏菌和枯草芽孢杆菌。术语“真核”包括酵母、高等植物、昆虫和脊椎动物细胞,例如哺乳动物细胞,例如nso和cho细胞。取决于重组生产方法中使用的宿主,由多核苷酸编码的抗体或免疫球蛋白链可以是糖基化的或可以是非糖基化的。抗体或相应的免疫球蛋白链还可包含初始甲硫氨酸氨基酸残基。在一些实施方式中,一旦载体被引入合适的宿主中,宿主可以在适合该核苷酸序列高水平表达的条件下维持,并且,理想状态下,可进行免疫球蛋白轻链、重链、轻链/重链二聚体或完整抗体、抗原结合片段或其他免疫球蛋白形式的收集和纯化;参见,beychok,cellsofimmunoglobulinsynthesis,academicpress,n.y.,(1979)。因此,将多核苷酸或载体引入细胞中,其进而产生抗体或抗原结合片段。此外,包含上述宿主细胞的转基因动物(优选地为哺乳动物)可用于大规模生产所述抗体或抗体片段。转化的宿主细胞可以在发酵罐中生长并且使用任何合适的技术培养,以实现最佳细胞生长。一旦表达,可以根据本领域的标准程序纯化完整抗体、其二聚体、单个轻链和重链、其他免疫球蛋白形式或抗原结合片段,包括硫酸铵沉淀、亲和柱、柱层析、凝胶电泳和类似技术;参见,scopes,“proteinpurification",springerverlag,n.y.(1982)。然后可以从生长培养基、细胞裂解物或细胞膜级分中分离所述抗体或抗原结合片段。例如,微生物表达的抗体或抗原结合片段的分离和纯化可以通过任何常规手段进行,例如制备色谱分离和免疫分离,例如涉及使用定向针对例如抗抗体恒定区的单克隆或多克隆抗体的那些。本公开的各方面涉及提供无限持续的单克隆抗体来源的杂交瘤。作为直接从杂交瘤培养物中获得免疫球蛋白的替代方案,永生化杂交瘤细胞可用作重排的重链和轻链基因座的来源用于随后的表达和/或遗传操作。重排的抗体基因可以从适当的mrna逆转录以产生cdna。在一些实施方式中,重链恒定区可以与不同亚型的重链恒定区交换或完全消除。可以连接可变区以编码单链fv区。可以连接多个fv区以赋予对一个以上靶标的结合能力,或者可以使用嵌合重链和轻链组合。任何合适的方法可用于克隆抗体可变区和产生重组抗体。在一些实施方式中,获得编码重链和/或轻链的可变区的合适的核酸,并插入到其可以被转染进入标准的重组宿主细胞中的表达载体。各种这样的宿主细胞可以使用。在一些实施方式中,哺乳动物宿主细胞可有利于有效加工和生产。可用于此目的的典型哺乳动物细胞系包括cho细胞、293细胞或ns0细胞。抗体或抗原结合片段的产生可以通过在适于宿主细胞生长和编码序列表达的培养条件下培养修饰的重组宿主来进行。可以通过从培养物中分离抗体或抗原结合片段来回收它们。表达系统可以设计成包括信号肽,以便所得抗体分泌到培养基中;然而,也可能是在细胞内产生。本发明还包括编码本文所述的抗体的免疫球蛋白链的至少一个可变区的多核苷酸。在一些实施方式中,由所述多核苷酸编码的所述可变区包含由任何一种上述杂交瘤产生的抗体的可变区的vh和/或vl的至少一个互补决定区(cdr)。编码抗体或抗原结合片段的多核苷酸可以是,例如,dna、cdna、rna或合成产生的dna或rna或包含任何单独或组合的那些多核苷酸的重组产生的嵌合核酸分子。在一些实施方式中,多核苷酸是载体的一部分。这样的载体可以包含其他基因,例如标记基因,其允许在合适的宿主细胞中和在合适的条件下选择载体。在一些实施方式中,多核苷酸被可操作地连接至允许在原核或真核细胞中表达的表达控制序列。多核苷酸的表达包括将多核苷酸转录成可翻译的mrna。确保在真核细胞,优选地为哺乳动物细胞中表达的调节元件是本领域技术人员熟知的。它们可包括促进转录起始的调节序列和任选的促进转录终止和转录物稳定的poly-a信号。另外的调节元件可包括转录以及翻译的增强子,和/或天然相关或异源的启动子区。允许在原核宿主细胞中表达的可能的调节元件包括例如大肠杆菌中的pl、lac、trp或tac启动子,允许在真核宿主细胞中表达的调节元件的实例是酵母中的aox1或gal1启动子或哺乳动物中的cmv启动子、sv40启动子、rsv启动子(劳氏肉瘤病毒)、cmv增强子、sv40增强子或哺乳动物和其他动物细胞中的球蛋白内含子。除了负责转录的起始,这种调节元件也可包括转录终止信号,例如多核苷酸下游的sv40-poly-a位点或tk-poly-a位点。此外,取决于所用的表达系统,能够将多肽导向细胞区室或将其分泌到培养基中的前导序列可以添加到多核苷酸的编码序列中,之前已有过描述。前导序列在适当的阶段与翻译、起始和终止序列组装,优选地,前导序列能够指导翻译的蛋白质或其部分分泌到例如细胞外培养基中。任选地,可以使用编码融合蛋白的异源多核苷酸序列,所述融合蛋白包括赋予目标特征的c-或n-末端识别肽,例如表达的重组产物的稳定化或简化纯化。在一些实施方式中,编码至少轻链和/或重链的可变结构域的多核苷酸可以编码免疫球蛋白链两者或仅一者的可变结构域。同样地,多核苷酸可以在相同启动子的控制下,或者可以单独控制以进行表达。此外,一些方面涉及载体,特别是遗传工程中常规使用的质粒、粘粒、病毒和噬菌体,其包含编码抗体或抗原结合片段的免疫球蛋白链的可变结构域的多核苷酸;任选地,与编码抗体的另一免疫球蛋白链的可变结构域的多核苷酸组合。在一些实施方式中,表达控制序列是在能够转化或转染真核宿主细胞的载体中作为真核启动子系统提供的,但也可使用原核宿主的控制序列。来自病毒例如逆转录病毒、痘苗病毒、腺病毒相关病毒、疱疹病毒或牛乳头瘤病毒的表达载体可用于将多核苷酸或载体递送到靶细胞群中(例如,以工程化细胞以表达抗体或抗原结合片段)。多种合适的方法可用于构建重组病毒载体。在一些实施方式中,多核苷酸和载体可以重构在脂质体中以递送至靶细胞。含有多核苷酸(例如,编码序列和表达控制序列的免疫球蛋白链的重链和/或轻链可变结构域)的载体可以通过合适的方法转移到宿主细胞中,所述方法根据细胞宿主的类型而变化。筛选方法可以包括评估或确认抗体或其片段的理想活性的步骤。在一些实施方式中,步骤包括选择抑制靶标功能的能力,例如抑制成熟tgfβ1从潜在复合物中的释放。在一些实施方式中,步骤包括:选择促进内化和随后从细胞表面移除抗体-抗原复合物的抗体或其片段。在一些实施方式中,步骤包括选择诱导adcc的抗体或其片段。在一些实施方式中,步骤包括选择累积至体内理想位点(例如,细胞类型、组织或器官)的抗体或其片段。在一些实施方式中,步骤包括选择具有穿过血脑屏障的能力的抗体或其片段。方法任选地包括优化一种或多种抗体或其片段,以提供具有理想特性的变体对应物的步骤,所述理想特性由例如稳定性、结合亲和力、功能(例如,抑制活性,fc功能等)、免疫原性、ph敏感性和可展性(例如,高溶解度、低自缔合等)的标准确定。这样的步骤可包括抗体或其片段的亲和力成熟。得到的优化抗体优选地是适合向人类施用的完全人抗体或人源化抗体。包含这样的抗体或其片段的药物组合物的制备方法可包括纯化、配制、无菌过滤、包装等步骤。例如,根据由相关监管机构,如fda制定的指南进行某些步骤,例如无菌过滤。这样的组合物可以以一次性容器的形式获得,例如预填充注射器,或多剂量容器,例如小瓶。修饰本公开的抗体或其抗原结合部分可用可检测的标记或可检测部分进行修饰,包括但不限于:酶、辅基、荧光材料、发光材料、生物发光材料、放射性材料、正电子发射金属、非放射性顺磁金属离子和用于检测和分离garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的亲和标记。可检测物质或部分可以直接偶联或缀合至本公开的多肽或使用合适的技术通过中间体(例如,接头(例如,可切割的接头))间接偶联或缀合。合适的酶的非限制性实例包括辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶或乙酰胆碱酯酶;合适的辅基复合物的非限制性实例包括链球菌亲和素/生物素和亲和素/生物素;合适的荧光材料的非限制性实例包括生物素、伞形酮、荧光素、异硫氰酸荧光素、罗丹明、二氯三嗪基胺荧光素、丹磺酰氯或藻红蛋白;发光材料的例子包括鲁米诺;生物发光材料的非限制性实例包括荧光素酶、荧光素和水母发光蛋白;和合适的放射性物质的实例包括放射性金属离子,例如α-发射体或其他放射性同位素,例如碘(131i、125i、123i、121i)、碳(14c)、硫(35s)、氚(3h)、铟(115min、113min、112in、111in)、锝(99tc、99mtc)、铊(201ti)、镓(68ga、67ga)、钯(103pd)、钼(99mo)、氙(133xe)、氟(18f)、153sm、lu、159gd、149pm、140la、175yb、166ho、90y、47sc、86r、188re、142pr、105rh、97ru、68ge、57co、65zn、85sr、32p、153gd、169yb、51cr、54mn、75se和锡(113sn、117sn)。可检测物质可以直接偶联或缀合至特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的本公开的抗体,或使用合适的技术通过中间体(例如,接头)偶联或缀合。本文提供的与可检测物质缀合的任何抗体可用于任何合适的诊断测定,例如本文所述的那些。此外,本公开的抗体或其抗原结合部分也可用药物修饰。所述药物可以使用合适的技术直接偶联或缀合至本公开的多肽,或通过中间体(例如,接头(例如,可切割的接头))间接偶联或缀合。靶向剂在一些实施方式中,出于调节成熟tgfβ从garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中释放的目的,本公开的方法包括使用一种或多种靶向剂以将本公开的抗体或其抗原结合部分靶向至受试者中的特定位点。例如,ltbp1-tgfβ1和ltbp3-tgfβ1复合物通常定位于细胞外基质。因此,在一些实施方式中,出于将抗体定位于ltbp1-tgfβ1和ltbp3-tgfβ1复合物所在的位点的目的,本公开的抗体可与细胞外基质靶向剂缀合。在这样的实施方式中,抗体的选择性靶向导致ltbp1-tgfβ1和/或ltbp3-tgfβ1复合物的选择性调节。在一些实施方式中,抗体的选择性靶向导致ltbp1-tgfβ1和/或ltbp3-tgfβ1复合物的选择性抑制(例如,出于治疗纤维化的目的)。在一些实施方式中,细胞外基质靶向剂包括肝素结合剂、基质金属蛋白酶结合剂、赖氨酰氧化酶结合结构域、原纤维蛋白结合剂、透明质酸结合剂等。类似地,garp-tgfβ1复合物通常定位于细胞表面,例如,激活的foxp3+调节性t细胞(treg细胞)。因此,在一些实施方式中,出于将抗体定位于garp-tgfβ1复合物所在的位点的目的,本公开的抗体可以缀合至免疫细胞(例如,treg细胞)结合剂。在这样的实施方式中,抗体的选择性靶向导致garp-tgfβ1复合物的选择性调节。在一些实施方式中,抗体的选择性靶向导致garp-tgfβ1复合物的选择性抑制(例如,出于免疫调节的目的,例如在癌症的治疗中,选择性抑制成熟tgfβ1的释放)。在这样的实施方式中,treg细胞靶向剂可包含例如ccl22和cxcl12蛋白或其片段。在一些实施方式中,可以使用双特异性抗体,其具有选择性结合garp-tgfβ1复合物和ltbp-tgfβ1复合物的第一部分和选择性结合靶位点组分的第二部分,例如,ecm组合(例如,原纤蛋白)或treg细胞的组分(例如,ctla-4)。药物组合物本发明还提供作为适合用于在人类和非人类受试者中施用的药物的药物组合物。可以将特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的一种或多种抗体与药学上可接受的载体(赋形剂)(包括例如,缓冲液)一起配制或混合以形成药物组合物。这样的制剂可用于治疗涉及tgfβ信号传导的疾病或病症。在一些实施方式中,与tgfβ信号传导相关的这样的疾病或病症涉及一种或多种背景,即tgfβ与特定类型的呈递分子相关。在一些实施方式中,这样的背景以细胞类型特异性和/或组织特异性方式发生。在一些实施方式中,例如,tgfβ信号传导的这种背景依赖性作用部分地通过garp、lrrc33、ltbp1和/或ltbp3介导。在一些实施方式中,本发明的抗体特异性地结合至tgfβ的两个或多个背景,使得抗体结合与选自garp、lrrc33、ltbp1和ltbp3中两个或更多个的呈递分子的复合物中的tgfβ结合。因此,可以将这样的药物组合物施用至患者以减轻tgfβ相关适应症(例如,纤维化、免疫疾病和/或癌症)。“可接受的”意指载体与组合物的活性成分相容(并且优选地,能够稳定活性成分)并且对待治疗的受试者无害。药学上可接受的赋形剂(载体)(包括缓冲剂)的实例对于本领域技术人员而言是显而易见的并且已在前面描述过。参见,例如,remington:thescienceandpracticeofpharmacy20thed.(2000)lippincottwilliamsandwilkir,ed.k.e.hoover。在一个实例中,本文所述的药物组合物含有一种以上特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体,其中抗体识别garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的不同表位/残基。本方法中使用的药物组合物可以包含药学上可接受的载体、赋形剂或冻干制剂或水溶液形式的稳定剂(remington:thescienceandpracticeofpharmacy20thed.(2000)lippincottwilliamsandwilkir,ed.k.e.hoover)。可接受的载体、赋形剂或稳定剂在使用的剂量和浓度下对接受者无毒,并且可包含缓冲剂,例如磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸和蛋氨酸;防腐剂(如十八烷基二甲基苄基氯化铵;六甲基氯化铵;苯扎氯铵、苄索氯铵;苯酚、丁基或苄醇;对羟基苯甲酸烷基酯、如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯;儿茶酚;间苯二酚;环己醇;3-戊醇;和间甲酚);低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸;单糖、二糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或葡聚糖;螯合剂如edta;糖,如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨糖醇;成盐抗衡离子如钠;金属配合物(如锌-蛋白质配合物);和/或非离子表面活性剂,例如吐温tm、普郎尼克tm或聚乙二醇(peg)。本文进一步描述了药学上可接受的赋形剂。在一些实例中,本文描述的药物组合物包含可以通过任何合适的方法制备的含有特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的脂质体,例如epstein等,proc.natl.acad.sci.usa82:3688(1985);hwang等proc.natl.acad.sci.usa77:4030(1980);和美国专利号4,485,045和4,544,545。具有增强的循环时间的脂质体公开于美国专利号5,013,556。特别有用的脂质体可以通过反相蒸发法用包含磷脂酰胆碱、胆固醇和peg衍生的磷脂酰乙醇胺(peg-pe)的脂质组合物产生。通过具有确定孔径的过滤器挤出脂质体,以产生具有所需直径的脂质体。在一些实施方式中,本发明的药物组合物可包含佐剂或可与佐剂一起使用。预期某些佐剂可以增强受试者对例如肿瘤抗原的免疫应答,并促进效应t细胞(teffector)的功能、单核细胞的dc分化、抗原摄取和apc的呈递增强等。合适的佐剂包括但不限于基于视黄酸的佐剂及其衍生物、基于水包油乳剂的佐剂,例如mf59和其他含角鲨烯的佐剂、toll样受体(trl)配体、α-生育酚(维生素e)及其衍生物。特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体也可以包埋在例如通过凝聚技术或通过界面聚合制备的微胶囊中,例如分别在胶体药物递送系统(例如,脂质体、白蛋白微球、微乳液、纳米颗粒和纳米胶囊)或粗乳液中的羟甲基纤维素或明胶-微胶囊和聚(甲-甲基丙烯酸酯)微胶囊。示例性技术在之前已有描述,参见例如remington:thescienceandpracticeofpharmacy20thed.mackpublishing(2000)。在其它实例中,本文描述的药物组合物可以配制成持续释放的形式。持续释放制剂的合适实例包括含有抗体的固体疏水聚合物的半透性基质,所述基质是成型制品的形式,例如薄膜或微胶囊。持续释放基质的实例包括聚酯、水凝胶(例如,聚(2-羟乙基-甲基丙烯酸酯),或聚(乙烯醇))、聚交酯(美国专利号no.3,773,919)、l-谷氨酸和7-乙基的共聚物、不可降解的乙烯-乙酸乙烯酯、可降解的乳酸-乙醇酸共聚物,例如luprondepottm(由乳酸-乙醇酸共聚物和醋酸亮丙瑞林组成的可注射微球)、乙酸异丁酸蔗糖酯和聚-d-(-)-3-羟基丁酸。用于体内施用的药物组合物必须是无菌的。这可以通过例如无菌过滤膜过滤而容易地实现。通常将治疗性抗体组合物置于具有无菌通道的容器中,例如具有可由皮下注射针刺穿的塞子的静脉内溶液袋或小瓶。本文所述的药物组合物可以是单位剂型,例如用于经口、肠胃外或直肠施用,或经吸入或吹入施用的片剂、丸剂、胶囊剂、粉剂、颗粒剂、溶液或悬浮液,或栓剂。对于制备固体组合物如片剂,可将主要的活性成分与药物载体(例如常规的片剂制备成分,如玉米淀粉、乳糖、蔗糖、山梨醇、滑石粉、硬脂酸、硬脂酸镁、磷酸二钙或树胶)和其它药物稀释剂(例如水)混合,以形成固体预配制组合物,其含有本公开化合物或其无毒的药学上可接受的盐的均匀混合物。当将这些预制剂组合物称为均匀时,意指活性成分均匀地分散在整个组合物中,使得组合物可以容易地细分成等效的单位剂型,例如片剂、丸剂和胶囊剂。然后将该固体预配制组合物细分为含有0.1mg至约500mg本发明的活性成分的上述类型的单位剂型。可以将新组合物的片剂或丸剂包衣或以其它方式混合,以提供具有延长作用优点的剂型。例如,片剂或丸剂可包含内部剂量和外部剂量组分,后者在前者上形成包膜。这两种组分可以通过用于抵抗胃中的分解并允许内部组分完整地进入十二指肠或延迟释放的肠溶层分开。多种材料可用于这种肠溶层或涂层,这样的材料包括许多聚合酸以及聚合酸和例如虫胶、鲸蜡醇和乙酸纤维素的材料的混合物。合适的表面活性剂包括,特别是,非离子试剂,例如聚氧乙烯山梨聚糖(例如吐温tm20、40、60、80或85)和其它山梨聚糖(例如spantm20、40、60、80或85)。具有表面活性剂的组合物将方便地包含0.05至5%的表面活性剂,并且可以为0.1至2.5%。应当理解,如果需要,可以加入其他成分,例如甘露醇或其他药学上可接受的载体。合适的乳液可使用市售的脂肪乳剂,如intralipidtm、liposyntm、infonutroltm、lipofundintm和lipiphysantm来制备。活性成分可以溶解在预混合的乳液组合物中,或者可以溶解在油(例如大豆油、红花油、棉籽油、芝麻油、玉米油或杏仁油)并且在与磷脂(例如卵磷脂、大豆磷脂或大豆卵磷脂)和水混合时形成乳液。应当理解,可以加入其他成分,例如甘油或葡萄糖,以调节乳液的张力。合适的乳液通常含有高达20%的油,例如5至20%之间。乳液组合物可以是通过将特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体与intralipidtm或其组分(豆油、鸡蛋磷脂、甘油和水)混合来制备的那些。用于吸入或吹入的药物组合物包括在药学上可接受的溶液和悬浮液、水性或有机溶剂,或其混合物,和粉末。液体或固体组合物可含有如上所述的合适的药学上可接受的赋形剂。在一些实施方式中,组合物通过口服或鼻呼吸途径施用以产生局部或全身作用。优选无菌的药学上可接受的溶剂中的组合物可以通过使用气体进行雾化。雾化溶液可以直接从雾化装置呼吸,或者雾化装置可以连接到面罩、帐篷(tent)或间歇正压呼吸机。溶液、悬浮液或粉末组合物可以从以适当方式递送制剂的装置施用,优选口服或经鼻施用。对包含tgf-β1选择性、广泛-抑制剂的疗法有可能响应的治疗适应症和/或受试者的选择可进行两个询问以识别/选择对本文描述的tgfβ1的异构体特异的背景许可性抑制剂可能具有有益效果的合适的适应症和/或患者人群:1)疾病是否主要由tgfβ1亚型驱动或依赖于tgfβ1亚型超过人类中的其他亚型;和ii)该疾病是否涉及tgfβ1功能的多个方面的失调。已经在各种组织的正常(健康;稳态)以及疾病状况中观察到三个已知的tgfβ亚型(即tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3)的差异表达。然而,亚型选择性的概念既没有被充分利用也没有通过倾向于对跨多种亚型的tgfβ的泛抑制的常规方法实现。此外,亚型的表达模式可能受到差异性调节,不仅在正常(稳态)和异常(病理)条件下,而且在不同的患者亚群中。因为大多数的临床前研究在有限数量的动物模型中进行,使用这样的模型获得的数据可能有偏差,从而在对人类症状的适用性方面导致数据的误读或误导性结论。因此,本发明包括认识到在预测特定抑制剂的有效性以及在向人类症状的可转移性方面解读临床前数据时必须考虑到tgfβ亚型的差异表达的影响。如图21所示,tgfβ1和tgfβ3在某广泛用于临床前研究的鼠同系癌症模型(例如,emt-6和4t1)中是共显性的。相比之下,许多其他癌症模型(例如,s91、b16和mbt-2)几乎只表达tgfβ1,与许多人类肿瘤中观察到的类似,其中tgfβ1似乎相比于tgfβ2/3更经常地是主导亚型。此外,在稳态条件下主要表达的tgfβ亚型可能不是疾病相关的亚型。例如,在健康大鼠的正常肺组织中,强直性tgfβ信号传导似乎主要由tgfβ3介导。然而,tgfβ1似乎在疾病状况下显著上调,如肺纤维化。总之,在临床样品中测试或确认tgfβ亚型的相对表达是有益的,以便选择患者可能响应的合适疗法。如本文中所述,亚型选择性tgfβ1抑制剂在用于治疗其中tgfβ1亚型相对于其他亚型主要表达时是尤其有利的。例如,图21d提供了带有tgfβ1(左)、tgfβ2(中)和tgf-β3(右)的相对表达水平的人癌症临床样本的非限制性列表。跨三种亚型的每条水平线代表单个患者。可以看出,tgfβ1在大多数这些人肿瘤中的整体表达显著高于跨越许多肿瘤类型中的其他两种亚型,表明tgfβ1的选择性抑制可能是有益的。但是,应注意某些例外情况。首先,这种趋势并不总是适用于某些个体患者。也就是说,即使在表现出几乎一致的tgfβ1超过tgfβ2/3的主导优势的癌症类型中,也有一些个体不遵循这种一般性规律。因此,属于少数族亚群的患者可能在以对大多数患者有效的方式进行的亚型特异性抑制剂治疗无响应。第二,存在一些可能的癌症类型,其中tgfβ1与另一种亚型共显性或其中tgfβ2和/或tgfβ3表达显著高于tgfβ1。在这些情况下,如本文所述的那些tgfβ1选择性抑制剂不太可能是有效的。因此,测试或确认从个体患者收集的临床样品中三种tgfβ亚型(即tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3)的相对表达水平是有益的。这样的信息可以对个体患者中进行特定治疗的有效性提供更好的预测,其可以帮助确保选择适当的治疗(例如,个性化的治疗),以增加临床反应的可能性。因此,本发明包括一种方法,用于选择可能对包含亚型特异性的、背景许可性tgfβ1抑制剂疗法响应的患者群体或受试者。这样的方法包括以下步骤:提供从受试者收集的生物样品(例如,临床样品),测定(例如,测量或测定)样品中tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3的相对水平,并且,如果tgfβ1是超过tgfβ2和tgfβ3的主要亚型,和/或如果tgfβ1与对照相比显著过表达或上调,则向受试者施用包含亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂组合物。亚型的相对水平可以通过基于rna的测定和/或基于蛋白质的测定来确定,其是本领域公知的。在一些实施方式中,施用步骤还可以包括另一种疗法,例如免疫检查点抑制剂,或本文其他地方提供的其他试剂。这样的方法任选地包括通过在两个或更多个时间点监测tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3的相对水平的变化来评估治疗反应的步骤。在一些实施方式中,在施用之前和之后收集临床样品(例如活组织检查样品)。在一些实施方式中,在治疗后多次收集临床样品(例如活组织检查样品)以评估体内效应随时间的变化。除了针对亚型选择性方面的第一个询问,第二个询问审查了涉及特定疾病的tgfβ1功能的广度。这可以通过tgfβ1背景的数量来表示,即,呈递分子介导疾病相关的tgfβ1功能。tgfβ1特异性、广谱背景抑制剂,例如背景许可性和背景非依赖性的抑制剂,对于治疗涉及ecm组分和tgfβ1功能的免疫组分两者的疾病是有利的。这样的疾病可能与ecm中的失调以及免疫细胞功能或免疫应答的扰动有关。因此,本文所述的tgfβ1抑制剂能够靶向ecm相关的tgfβ1(例如,由ltbp1或ltbp3呈递)以及免疫细胞相关的tgfβ1(例如,由garp或lrrc33呈递)。在一些实施方式中,这样的抑制剂靶向至少三种以下治疗靶标(例如,“背景许可性”抑制剂):garp相关的前/潜在tgfβ1;lrrc33相关的前/潜在tgfβ1;ltbp1相关的前/潜在tgfβ1;和ltbp3相关的前/潜在tgfβ1。在一些实施方式中,这样的抑制剂抑制所有四种治疗靶标(例如,“背景非依赖性”抑制剂):garp相关的前/潜在tgfβ1;lrrc33相关的前/潜在tgfβ1;ltbp1相关的前/潜在tgfβ1;和ltbp3相关的前/潜在tgfβ1,以便在这些背景下广泛抑制tgfβ1功能。在患者的特定病症是否涉及或由tgfβ1功能的多个方面驱动可以通过评估从患者收集的临床样品中的呈递分子的表达谱进行评价。各种测定在本领域是已知,包括可以进行以获得表达谱的基于rna的测定和基于蛋白质的测定。样品中ltbp1、ltbp3、garp和lrrc33的相对表达水平(和/或其变化/改变)可以指示与该病症相关的tgfβ1活性的来源和/或背景。例如,取自实体瘤的活组织检查样品可能表现出所有四种呈递分子的高表达。例如,ltbp1和ltbp3可能在肿瘤基质内的caf中高表达,而garp和lrrc33可能由肿瘤相关免疫细胞高表达,例如分别是treg和白细胞浸润。因此,本发明包括确定(例如,测试或确认)tgfβ1在疾病中相对于tgfβ2和tgfβ3的参与度的方法。在一些实施方式中,所述方法还包括以下步骤:鉴定疾病相关tgfβ1的来源(或背景)。在一些实施方式中,来源/背景通过测定取自患者的临床样品中tgfβ呈递分子(例如ltbp1、ltbp3、garp和lrrc33)的表达来评估。亚型选择性tgfβ1抑制剂,例如本文所述的那些,可用于治疗与人受试者中tgfβ1失调相关的多种疾病、病症和/或状况(即tgfβ1相关适应症)。如本文所用,“与tgfβ1失调相关疾病(病症或状况)”或“tgfβ1相关适应症”意指与tgfβ的表达、活性和/或代谢相关的任何疾病、病症和/或状况,或可能从tgfβ1活性和/或水平的抑制中受益的任何疾病、病症和/或状况。因此,本发明包括在用于治疗人受试者中与tgfβ1失调相关的疾病的方法中使用亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂。这样的抑制剂通常配制成还包含药学上可接受的赋形剂的药物组合物。有利地,所述抑制剂在体内靶向ecm相关的tgfβ1和免疫细胞相关的tgfβ1两者,但不靶向tgfβ2或tgfβ3。在一些实施方式中,抑制剂抑制tgfβ1的激活步骤。疾病的特征在于以下属性中的至少两种的失调或损伤:a)调节性t细胞(treg);b)效应t细胞(teff)增殖或功能;c)骨髓细胞增殖或分化;d)单核细胞募集或分化;e)巨噬细胞功能;f)上皮间质转化(emt)和/或内皮间质转化(endmt);g)在选自以下的一种或多种标志物基因中的基因表达:pai-1、acta2、ccl2、col1a1、col3a1、fn-1、ctgf和tgfβ1;h)ecm组分或功能;i)成纤维细胞分化。将治疗有效量的这样的抑制剂施用至患有或被诊断患有所述疾病的受试者。在一些实施方式中,所述疾病涉及包含显示出增加的i型胶原蛋白的沉积的ecm组分或功能的失调或损伤。在一些实施方式中,成纤维细胞分化的失调或损伤包含增加的肌成纤维细胞或肌成纤维细胞样细胞。在一些实施方式中,肌成纤维细胞或肌成纤维细胞样细胞是癌症相关的成纤维细胞(caf)。在一些实施方式中,caf与肿瘤基质相关并可产生ccl2/mcp-1和/或cxcl12/sdf-1。在一些实施方式中,调节性t细胞的失调或损伤包含增加的treg活性。在一些实施方式中,效应t细胞(teff)增殖或功能的失调或损伤包含受抑制的cd4+/cd8+细胞的增殖。在一些实施方式中,骨髓细胞增殖或分化的失调或损伤包含增加的骨髓祖细胞的增殖。所述增加的骨髓祖细胞的增殖可能发生在骨髓中。在一些实施方式中,单核细胞分化的失调或损伤包含在疾病部位增加的骨髓来源和/或组织驻留单核细胞向巨噬细胞的分化,例如,纤维化组织和/或实体瘤。在一些实施方式中,单核细胞募集的失调或损伤包含在疾病部位(例如tme)增加的骨髓来源的单核细胞募集,导致增加的巨噬细胞分化和m2极化,随后是增加的tam。在一些实施方式中,巨噬细胞功能的失调或损伤包含增加的巨噬细胞向m2表型的极化。在一些实施方式中,骨髓细胞增殖或分化的失调或损伤包含增加数量的treg、mdsc和/或tan。tgfβ相关适应症可包括其包含免疫排除疾病微环境的病症,例如肿瘤或癌组织,其通过排除效应免疫细胞(例如cd4+和/或cd8+t细胞)部分抑制机体的正常防御机制/免疫。在一些实施方式中,这样的免疫排除条件与对治疗的差响应性相关。无意受特定理论的束缚,可以预期的是tgfβ抑制剂,例如本文所述的那些,可帮助对抗肿瘤通过恢复t细胞获得而排除抗癌免疫力的能力。tgfβ相关适应症的非限制性实例包括:纤维化,包括器官纤维化(例如,肾纤维化、肝纤维化、心脏/心血管纤维化和肺纤维化),硬皮病,alport综合征,癌症(包括但不限于:血癌如白血病、骨髓纤维化、多发性骨髓瘤、结肠癌、肾癌、乳腺癌、恶性黑色素瘤、胶质母细胞瘤),与实体肿瘤相关的纤维化(如癌症发育不全、如促纤维增生性黑色素瘤、胰腺癌相关的结缔组织病和乳腺癌发育不良),间质纤维化(如乳腺间质纤维化),放射性纤维化(如放射性纤维化综合征),促进化疗后快速造血,骨愈合,伤口愈合,痴呆,骨髓纤维化,骨髓增生异常(如,骨髓增生异常综合征或mds),肾脏疾病(例如,终末期肾病或esrd),单侧输尿管闭塞(uuo),牙齿脱落和/或变性,内皮增殖症,哮喘和过敏,胃肠功能紊乱,衰老贫血,主动脉瘤,孤儿适应症(如马凡氏综合征和进行性骨干发育不良),肥胖,糖尿病,关节炎,多发性硬化,肌营养不良,肌萎缩侧索硬化(als),帕金森病,骨质疏松症,骨关节炎,骨质减少,代谢综合征,营养障碍,器官萎缩,慢性阻塞性肺病(copd)和厌食症。其他适应症可包括美国专利公开号2013/0122007、美国专利号8,415,459或国际专利公开号wo2011/151432中公开的任何内容,其全部内容各自通过引用并入本文。在优选的实施方式中,抗体、其抗原结合部分,和本公开的组合物可用于治疗多种与tgfβ1信号传导相关的疾病、病症和/或状况。在一些实施方式中,靶组织/细胞优选地表达tgfβ1亚型超过其他亚型。因此,本发明包括使用包含本文所述的抗体或其抗原结合部分的药物组合物治疗与tgfβ1表达相关的这样的状况(例如,tgfβ1信号传导失调和/或tgfβ1表达上调)的方法。在一些实施方式中,疾病涉及与多个细胞来源相关的tgfβ1(例如,由其呈递在或从中沉积)。在一些实施方式中,这样的疾病涉及tgfβ1功能的免疫组分和ecm组分两者。在一些实施方式中,这样的疾病涉及:i)ecm的失调(例如,ecm组分的过量产生/沉积,例如胶原蛋白和蛋白酶;所述ecm底物的硬度的改变;成纤维细胞的异常或病理激活或分化,例如肌成纤维细胞和caf);ii)由于增加的treg和/或抑制的效应t细胞(teff)引起的免疫抑制,例如treg/teff的比率升高;导致cd4和/或cd8t细胞的抑制白细胞浸润增加(例如,巨噬细胞和mdsc);和/或iii)骨髓细胞的异常或病理激活、分化和/或募集,例如巨噬细胞(例如,骨髓来源的单核细胞/巨噬细胞和组织驻留的巨噬细胞)、单核细胞、髓系抑制性细胞(mdsc)、中性粒细胞、树突细胞和nk细胞。在一些实施方式中,状况涉及由一个以上类型的呈递分子(例如,两个或更多个:gapr、lrrc33、ltbp1和/或ltbp3)呈递的tgfβ1。在一些实施方式中,受影响的组织/器官/细胞包括来自多种细胞来源的tgfβ1。仅举一例,实体肿瘤(其可能还包括涉及骨髓的增殖性疾病,例如,骨髓纤维化和多发性骨髓瘤)可包括涉及不同类型的呈递分子的来自多种来源的tgfβ1,例如癌细胞、基质细胞、周围的健康细胞和/或浸润免疫细胞(例如,cd45+白细胞)。相关的免疫细胞包括但不限于骨髓细胞和淋巴样细胞,例如,嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、淋巴细胞(例如,b细胞、t细胞和nk细胞)和单核细胞。背景非依赖性或背景许可性tgfβ1抑制剂可用于治疗这些状况。可使用tgfβ1的亚型特异性背景许可性抑制剂(如本文所述的抗体或其片段)进行治疗的状况或病症的非限制性实例提供如下。基因表达异常的疾病:已经观察到,在各种疾病状况中tgfβ1信号转导通路的异常激活与多种标志物的基因表达的改变相关。这些基因表达标志物(例如,通过mrna测量)包括但不限于:serpine1(编码pai-1)、mcp-1(也称为ccl2)、col1a1、col3a1、fn1、tgfβ1、ctgf和acta2(编码α-sma)。有趣的是,许多这些基因涉及在多种疾病状况中发挥作用,包括各种类型的器官纤维化,以及许多癌症,包括骨髓纤维化。实际上,已经提出了纤维化病症与异常细胞增殖、肿瘤发生和转移之间的病理生理学联系。参见,例如,coxanderler(2014)clinicalcncerresearch20(14):3637-43"molecularpathways:connectingfibrosisandsolidtumormetastasis";shiga等(2015)cancers7:2443-2458"cancer-associatedfibroblasts:theircharacteristicsandtheirrolesintumorgrowth";wynnandbarron(2010)semin.liverdis.30(3):245-257"macrophages:masterregulatorsofinflammationandfibrosis",其全部内容各自通过引用并入本文。无意受特定理论的束缚,本公开的发明人考虑到tgfβ1信号传导通路实际上可能是这些广泛病理之间的关键联系。例如,mcp-1/ccl2被认为在纤维化和癌症两者中发挥作用。mcp-1/ccl2的特征在于作为促纤维化趋化因子,并且是单核细胞化学引诱物,并且证据表明其可能参与病症的启动和进展两者。在纤维化中,mcp-1/ccl2已显示在纤维化的炎症阶段中起重要作用。例如,mcp-1的中和导致肾小球新月体形成和i型胶原沉积的显著减少。mcp-1/ccl2募集单核细胞/巨噬细胞的能力对癌症进展具有重要影响。肿瘤来源的mcp-1/ccl2可以促进巨噬细胞中的“前癌”表型。例如,在肺癌中,已显示mcp-1/ccl2由基质细胞产生并促进转移。在人胰腺癌中,肿瘤分泌ccl2,免疫抑制性ccr2阳性巨噬细胞浸润这些肿瘤。具有显示出高ccl2表达/低cd8t细胞浸润的肿瘤患者存活率显著降低。类似地,pai-1/serpine1的参与涉及多种癌症、血管生成、炎症、神经变性疾病(例如,阿尔茨海默氏病)。肿瘤和/或血清中pai-1的表达升高与各种癌症(例如乳腺癌和膀胱癌(例如,移行细胞癌))以及骨髓纤维化的不良预后(例如,存活更短、转移增加)相关。在纤维化状况的背景下,pai-1已被认为是tgfβ1诱导的纤维化的重要的下游效应物,并且在各种形式的组织纤维化中观察到pai-1表达增加,包括肺纤维化(例如ipf)、肾纤维化、肝纤维化和硬皮病。在一些实施方式中,tgfβ1抑制剂疗法的体内效果可通过测量基因标志物中的变化来评估。合适的标志物包括tgfβ(例如,tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3)。在一些实施方式中,合适的标志物包括间充质转化基因(例如,axl、ror2、wnt5a、loxl2、twist2、tagln和/或fap)、免疫抑制基因(例如,il10、vegfa、vegfc)、单核细胞和巨噬细胞趋化基因(例如,ccl2、ccl7、ccl8和ccl13),和/或本文讨论的各种纤维化标志物。优选的标志物是血浆标志物。如本文实例中所示,本文所述的tgfβ1的亚型特异性、背景非依赖性抑制剂在已经显示是tgfβ1依赖型的机械的动物模型(例如uuo)中可以减少许多这些标志物的表达水平。因此,这样的抑制剂可用于治疗以一种或多种基因表达标志物的异常表达(例如,过表达/上调或低表达/下调)为特征的疾病或病症。因此,在一些实施方式中,tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂可用于治疗与以下中一种或多种过表达相关的疾病:pai-1(也称为serpine1)、mcp-1(也称为ccl2)、col1a1、col3a1、fn1、tgfβ1、ctgf、α-sma、itga11和acta2,其中所述治疗包括将抑制剂以有效量施用至患有疾病的受试者以治疗该疾病。在一些实施方式中,抑制剂用于治疗与pai-1、mcp-1/ccl2、ctgf和/或α-sma过表达相关的疾病。在一些实施方式中,疾病是骨髓纤维化。在一些实施方式中,疾病是癌症,例如包含实体瘤的癌症。在一些实施方式中,疾病是器官纤维化,例如,肝脏、肾脏、肺和/或心脏或心血管组织的纤维化。涉及蛋白酶的疾病:tgfβ从其潜在复合物中的激活可以由整联蛋白以外力依赖性方式和/或通过蛋白酶触发。证据表明某些类型的蛋白酶可能参与该过程,包括但不限于丝氨酸/苏氨酸(ser/thr)蛋白酶,如激肽释放酶、趋化蛋白、弹性蛋白酶、纤溶酶,以及mmp家族的锌金属蛋白酶,如mmp-2、mmp-9和mmp-13。mmp-2降解基底膜中最丰富的成分,胶原蛋白iv,提高了它在ecm相关的tgfβ1调节中起作用的可能性。已表明mmp-9在肿瘤进展、血管生成、基质重塑和转移中起重要作用。因此,tgfβ1在ecm中的蛋白酶依赖性激活对于治疗癌症可能是重要的。激肽释放酶(klk)是胰蛋白酶或胰凝乳蛋白酶样丝氨酸蛋白酶,其包括血浆激肽释放酶和组织激肽释放酶。所述ecm作为结构和信号传导支架和抑制恶性生长的屏障在组织稳态中起作用。klk可能在降解ecm蛋白和其他可能促进肿瘤扩张和侵袭的成分中发挥作用。例如,klk1在某些乳腺癌中高度上调,并且可以激活前mmp-2和前mmp-9。klk2激活潜在tgfβ1,使得与成纤维细胞相邻的前列腺癌允许癌症生长。klk3作为前列腺癌(psa)的诊断标志物已被广泛研究。klk3可以通过将纤溶酶原加工成纤溶酶直接激活tgfβ1,所述纤溶酶通过蛋白水解切割lap。klk6可能是阿尔茨海默病的潜在标志物。此外,实施例8中提供的数据表明,这样的蛋白酶可以是激肽释放酶。因此,本发明包括在治疗与激肽释放酶或激肽释放酶样蛋白酶相关的疾病的方法中使用tgfβ的亚型特异性、背景非依赖性或兼容性的抑制剂。已知的tgfβ1激活剂,例如纤溶酶、tsp-1和αvβ6整联蛋白,都与lap直接相互作用。据推测,lap的蛋白水解切割可能使lap-tgfβ相互作用不稳定,从而释放活性的tgfβ1。有人提出,含有54-lsklrl-59的区域对于维持tgfβ1潜伏状态非常重要。因此,稳定相互作用或阻断lap蛋白水解切割的试剂(例如,抗体)可能阻止tgfβ激活。涉及上皮间质转化(emt)的疾病:emt(上皮间质转化)是具有紧密连接的上皮细胞转化为间质特性(表型)如松散的细胞-细胞接触的过程。所述过程在许多正常生物过程以及病理情况中观察到,包括胚胎发生、伤口愈合、癌症转移和纤维化(例如,在shiga等(2015)"cancer-associatedfibroblasts:theircharacteristicsandtheirrolesintumorgrowth."cancers,7:2443-2458中的综述)。通常,认为emt信号主要由tgfβ诱导。例如,许多类型的癌症似乎涉及细胞向间质表型(例如caf)的转分化,其与较差的预后相关。因此,tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂,例如本文所述的那些,可用于治疗由emt引发或驱动的疾病。实际上,本文示例的数据(例如,图12和13)显示这样的抑制剂具有在体内抑制caf标志物表达的能力,例如α-sma、col1(i型胶原蛋白)和fn(纤连蛋白)。涉及内皮间质转化(endmt)的疾病:类似地,tgfβ也是在正常发育(如心脏形成)中观察到的内皮间质转化(endmt)的关键调节物。然而,在许多疾病中也观察到相同或类似的现象,例如癌基质。在一些疾病过程中,内皮标志物如cd31在tgfβ1暴露后下调,并且反而诱导间质标志物如fsp-1、α-sma和纤连蛋白的表达。实际上,基质caf可以源自血管内皮细胞。因此,tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂,例如本文所述的那些,可用于治疗由endmt启动或驱动的疾病。涉及基质硬化和重塑的疾病:纤维化状况的进展涉及沉积到ecm和/或ecm的维持/重塑中的基质组分水平增加。tgfβ1至少部分有助于该过程。例如,通过观察到ecm组分(例如胶原蛋白)的沉积增加可以改变ecm的机械物理性质(例如,基质/底物的硬度)并且这种现象与tgfβ1信号传导相关支持了上述观点。为了证实这一观点,本发明人评估了基质硬度在用protgfβ和ltbp1转染的原代成纤维细胞中影响整联蛋白依赖性tgfβ激活的作用,并且在具有确定硬度(例如,5kpa、15kpa或100kpa)的硅基质上生长。如下文实施例部分所总结的,具有更大硬度的基质增强tgfβ1激活,并且这可以通过tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂例如本文所述的那些来抑制。这些观察结果表明tgfβ1影响ecm特性(例如硬度),这反过来可以进一步诱导tgfβ1激活,反映疾病进展。因此,tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂(例如本文所述的那些)可用于阻断该过程以抵抗涉及ecm改变的疾病进展,例如纤维化、肿瘤生长、侵染、淤滞和结缔组织形成。这样的抑制剂的ltbp臂可直接阻断由ltbp1和/或ltbp3呈递的ecm相关前/潜在tgfβ复合物,从而防止从疾病生态位中的复合物中激活/释放生长因子。在一些实施方式中,例如本文所述的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可使ecm硬度正常化以治疗涉及整联蛋白依赖性信号传导的疾病。在一些实施方式中,所述整联蛋白包含α11链、β1链或两者。纤维化:根据本发明,如本文所述的那些tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂用于受试者中纤维化(例如,纤维化指征、纤维化状况)的治疗。用于实施本发明的合适的抑制剂包括可用于改变或改善纤维化的根据本发明的抗体和/或组合物。更具体地,这样的抗体和/或组合物是tgfβ1的选择性拮抗剂,其能够靶向由各种类型的呈递分子呈递的tgfβ1。tgfβ1被认为是纤维化反应的中心协调物。靶向tgfβ的抗体在许多临床前模型中减少纤维化。这样的抗体和/或基于抗体的化合物包括ly2382770(elililly,indianapolis,in)。还包括在美国专利号us6,492,497、us7,151,169、us7,723,486和美国专利申请公开号2011/0008364中描述的那些,其全部内容各自通过引用并入本文。现有技术的tgfβ拮抗剂包括,例如,靶向和阻断整联蛋白依赖性tgfβ激活的药剂。然而,证据表明,这样的现有技术的试剂可能不介导亚型特异性的抑制,并且可能通过无意中阻断tgfβ2和/或tgfβ3的正常功能造成不良影响。实际上,本文提供的数据支持这一观点。正常(未患病)肺部组织含有相对低但可测量的tgfβ2和tgfβ3水平,但tgfβ1显著较少。相比之下,在某些疾病状况如纤维化中,tgfβ1相对于其他亚型变得优选地上调。优选地,在这类状况的治疗中使用的tgfβ拮抗剂仅针对所述疾病引起的或疾病相关的亚型发挥其抑制活性,同时保持在组织中正常表达以介导强直性信号传导的其它亚型的功能。如下文实施例20中所示,本发明所涵盖的亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂对健康大鼠的支气管肺泡灌洗(bal)几乎没有作用,支持了强直性tgfβ信号传导(例如,tgfβ2和/或tgfβ3)未受扰动的观点。相比之下,现有技术的抑制剂(ly2109761、小分子tgfβ受体拮抗剂和靶向αvβ6整联蛋白的单克隆抗体)均显示在非患病大鼠bal中抑制tgfβ下游的强直性信号传导,提高了这些抑制剂可能引起不必要的副作用的可能性。或者或另外地,靶向和阻断tgfβ的整联蛋白依赖性激活可能能够在由各种细胞类型表达并在发病机理中起作用的大量的整联蛋白类型中只阻断负责疾病相关tgfβ1激活的整联蛋白的子集。此外,即使这样的拮抗剂可能选择性地阻断整联蛋白介导的tgfβ1亚型的激活,它可能在阻断由其他模式触发的tgfβ1激活(例如蛋白酶依赖性激活)方面无效。相反,如本文所述的那些tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂旨在阻止tgfβ1的激活步骤而不管特定的激活模式,同时保持亚型的选择性。对于本发明的抗体和/或组合物可用于治疗的纤维化适应症包括但不限于肺适应症(纤维化指征例如特发性肺纤维化(ipf)、慢性阻塞性肺病(copd)、过敏性哮喘、急性肺损伤、嗜酸性粒细胞性食管炎、肺动脉高压和化学性气体损伤),肾适应症(例如,糖尿病肾小球硬化、局灶性节段性肾小球硬化症(fsgs)、慢性肾脏疾病(ckd)、与肾移植相关的纤维化和慢性排斥反应、iga肾病,和溶血性尿毒症综合征),肝纤维化(例如,非酒精性脂肪性肝炎(nash)、慢性病毒性肝炎、寄生虫血症、先天性代谢紊乱、毒素介导的纤维化如酒精性纤维化、非酒精性脂肪性肝炎-肝细胞癌(nash-hcc)、原发性胆汁性肝硬化和硬化性胆管炎),心血管纤维化(例如,心肌病、肥厚性心肌病、动脉粥样硬化和再狭窄)心肌梗死),系统性硬化症,皮肤纤维化(例如,系统性硬化症中的皮肤纤维化、弥漫性皮肤系统性硬化症、硬皮病、病理性皮肤瘢痕、瘢痕疙瘩、手术后瘢痕形成、瘢痕修复手术、放射诱导瘢痕形成和慢性伤口)和癌症或继发性纤维化(例如,骨髓纤维化、头颈癌、m7急性巨核细胞白血病和粘膜炎)。可以使用本公开的化合物和/或组合物治疗的与纤维化相关的其他疾病、病症或状况(包括退行性病症)包括但不限于子宫内膜异位症、马凡氏综合征、皮肤僵硬综合征、硬皮病、类风湿性关节炎、骨髓纤维化、克罗恩病、溃疡性结肠炎、系统性红斑狼疮、肌营养不良(如dmd),帕金森病、肌萎缩侧索硬化症(als)、杜普瑞氏挛缩、卡穆拉蒂-恩格尔曼病、神经瘢痕、痴呆、增生性玻璃体视网膜病变、角膜损伤、青光眼引流术后并发症,和多发性硬化症。许多这样的纤维化适应症也与受影响组织的炎症有关,表明免疫组分的参与。在一些实施方式中,可以用本文描述的组合物和/或方法治疗的纤维化适应症包括器官纤维化,例如肺的纤维化(例如,ipf)、肾的纤维化(例如,与ckd相关的纤维化)、肝的纤维化、心或心脏组织的纤维化、皮肤的纤维化(例如,硬皮病)、子宫的纤维化(例如,子宫内膜、子宫肌层),和骨髓的纤维化。在一些实施方式中,这样的疗法可能减少或延迟患者器官移植的需要。在一些实施方式中,这样的疗法可能延长患者的存活期。为了治疗ipf,可能从治疗中受益的患者包括具有家族性ipf的那些和具有分散性ipf的那些。施用治疗有效量的tgfβ1亚型特异性、背景许可性抑制剂可以减少肺组织中的肌成纤维细胞积聚、减少胶原蛋白沉积、减少ipf症状、改善或维持肺功能,并延长存活。在一些实施方式中,抑制剂阻断ipf的纤维化环境内ecm相关tgfβ1(例如,由ltbp1/3呈递的前/潜在tgfβ1)的激活。抑制剂可任选地进一步阻断巨噬细胞相关的tgfβ1(例如,由lrrc33呈递的前/潜在tgfβ1)的激活,例如,肺泡巨噬细胞。其结果是,抑制剂可能抑制纤连蛋白释放和其他纤维化相关因子。如本文提供的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可用于治疗肝脏的纤维化状况,如脂肪肝(例如,nash)。脂肪肝可能是或可能不是炎症状态。由于脂肪肝(即脂肪性肝炎)导致的肝脏炎症可能发展成瘢痕形成(纤维化),然后往往发展为肝硬化(扭曲肝脏结构并损害其功能的瘢痕形成)。因此,抑制剂可用于治疗这些状况。在一些实施方式中,抑制剂阻断肝脏纤维化环境内ecm相关tgfβ1(例如,由ltbp1/3呈递的前/潜在tgfβ1)的激活。抑制剂任选地进一步阻断巨噬细胞相关tgfβ1(例如,由lrrc33呈递的前/潜在tgfβ1)的激活,例如库普弗细胞(也称为星状巨噬细胞)以及浸润的单核细胞衍生的巨噬细胞和mdsc。其结果是,抑制剂可能抑制纤维化相关因子。在具有这样的状况的受试者中施用抑制剂与未用抑制剂治疗的对照群体相比可能减轻一种或多种症状、预防或延缓疾病的进展、减少或稳定肝脏中的脂肪积累、减少与疾病相关的生物标志物(例如血清胶原蛋白片段)、减少肝脏瘢痕形成、降低肝硬度,和/或在使用抑制剂治疗的患者群体中产生的临床上有意义的结果。在一些实施方式中,有效量的抑制剂可能在nash患者中实现肝脏脂肪降低和纤维化(例如,瘢痕形成)减少两者。在一些实施方式中,有效量的抑制剂可能通过至少一个阶段的脂肪性肝炎无恶化在nash患者中实现纤维化的改善。在一些实施方式中,有效量的抑制剂可能降低nash患者中肝衰竭和/或肝癌的发生率。在一些实施方式中,有效量的抑制剂与对照相比可使多种炎症或纤维化的血清生物标志物的水平正常化,如在治疗开始后(例如,12-36周)进行评估。在nash患者的一些实施方式中,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可以在接受一种或多种其他疗法的患者中施用,包括但不限于肌肉生长抑制素抑制剂,其通常可以增强具有代谢综合征(包括nash)临床表现的患者的代谢调节。如本文提供的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可用于治疗肾脏的纤维化状况,例如以细胞外基质积聚为特征的疾病(iga肾病、局灶节段性肾小球硬化、新月体性肾小球肾炎、狼疮性肾炎和糖尿病肾病),其中已观察到肾小球和肾小管间质中tgfβ的表达显著增加。虽然由tgfβ、纤连蛋白eda+和pai-1诱导的两种基质组分的肾小球和肾小管间质沉积在具有基质累积的所有疾病中显著升高,相关性分析已揭示主要与tgfβ1亚型存在密切关联。因此,所述亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可用作其中tgfβ与细胞外基质的病理积累相关的人肾小球病症谱的治疗剂。在一些实施方式中,肾的纤维化状况与慢性肾病(ckd)相关。ckd主要由高血压或糖尿病引起,每年夺去超过一百万人的生命。ckd患者需要终身医疗护理,从严格的饮食和药物到透析和移植。在一些实施方式中,本文所述的tgfβ1抑制剂疗法可减少或延迟透析和/或移植的需要。在一些实施方式中,这样的疗法可减少其他治疗的需要(例如,剂量、频率)。在一些实施方式中,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可以在接受一种或多种其他疗法的患者中施用,包括但不限于肌肉生长抑制素抑制剂,其通常可以增强ckd患者的代谢调节。可用本文提供的方法治疗的器官纤维化包括心脏(例如,心血管)纤维化。在一些实施方式中,心脏纤维化与心力衰竭相关,例如慢性心力衰竭(chf)。在一些实施方式中,心力衰竭可能与心肌疾病和/或代谢疾病有关。在一些实施方式中,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可以在接受一种或多种其他疗法的患者中施用,包括但不限于涉及心脏纤维化和代谢紊乱的心脏功能障碍患者中的肌肉生长抑制素抑制剂。在一些实施方式中,可用本文所述的组合物和/或方法治疗的纤维化状况包括结缔组织。结缔组织可能发生在赘生物周围,导致所述肿瘤(例如,促纤维母细胞瘤)周围的致密纤维化,或腹部手术后腹部内的瘢痕组织。在一些实施方式中,结缔组织与恶性肿瘤相关。由于其围绕恶性肿瘤的致密形成,常规的抗癌疗法(例如,化学疗法)可能无法有效地穿透以到达癌细胞的临床效果。例如本文所述的那些tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂可用于破坏所述结缔组织,从而可以松散纤维化形成以有助于抗癌疗法的效果。在一些实施方式中,tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂可以用作单一疗法(更多描述见下文)。为了治疗具有纤维化状况的患者,tgfβ1亚型特异性、背景许可性抑制剂以有效治疗纤维化的量施用至受试者。这样的抗体的有效量是在受试者中实现治疗功效和临床安全性两者的有效量。在一些实施方式中,抑制剂是背景许可性抗体,其可以阻断定位(例如,连接)于ecm中的ltbp介导的tgfβ1和定位(例如,连接在)于免疫细胞上的garp介导的tgfβ1两者。在一些实施方式中,抗体是背景许可性抗体,其可以阻断定位于ecm中的ltbp介导的tgfβ1和定位于(例如,拴系在)单核细胞/巨噬细胞上的lrrc33介导的tgfβ1的激活。在一些实施方式中,ltbp是ltbp1和/或ltbp3。在一些实施方式中,靶向和抑制由纤维化微环境中的原纤维化m2样巨噬细胞上的lrrc33呈递的tgfβ1可能是有益的。在确定本公开所述抗体和/或组合物的功效中有用的测定包括但不限于:组织学测定法,用于计数成纤维细胞和在本领域中熟知的基本免疫组化的分析。骨髓纤维化:骨髓纤维化,也称为骨髓纤维瘤,是一种比较少见的骨髓增殖性病症(癌症),其属于被称为骨髓增生性病症的一组疾病。骨髓纤维化分类为骨髓增生性肿瘤的费城染色体阴性(-)分支。骨髓纤维化的特征在于克隆性骨髓增生、异常细胞因子生产、髓外造血和骨髓纤维化。骨髓和其他部位中造血干细胞的异常克隆的增殖导致纤维化,或以瘢痕组织替代骨髓。除非另有说明,否则术语骨髓纤维化是指原发性骨髓纤维化(pmf)。这也可以称为慢性特发性骨髓纤维化(cimf)(术语特发性和原发性意为在这些情况下所述疾病是未知的或自发的起源)。这与由真性红细胞增多症或原发性血小板增多症继发的骨髓纤维化形成对比。骨髓纤维化是骨髓化生的一种形式,其意指骨髓的血液形成组织中细胞类型的变化,并且通常这两个术语同义使用。术语原因不明的骨髓化生和具有骨髓化生的骨髓纤维化(mmm)也用于指原发性骨髓纤维化。在一些实施方式中,可根据本发明治疗的血液学增殖性疾病包括骨髓增生性病症,例如骨髓纤维化。所谓的bcr-abl(ph)阴性慢性骨髓增生性病症“经典”组包括原发性血小板增多症(et)、真性红细胞增多症(pv)和原发性骨髓纤维化(pmf)。骨髓纤维化破坏了机体正常的血细胞生成。其结果是在骨髓中广泛形成瘢痕,导致严重的贫血症、虚弱、疲劳和经常的脾脏肿大。通过异常造血细胞克隆(特别是巨核细胞)产生细胞因子如成纤维细胞生长因子导致由结缔组织通过胶原纤维化取代骨髓的造血组织。造血组织的减少损害了患者产生新的血细胞的能力,导致进行性全血细胞减少,即所有血细胞类型的短缺。然而,成纤维细胞的增殖和胶原蛋白的沉积被认为是次要现象,并且成纤维细胞本身可能不是异常细胞克隆的一部分。骨髓纤维化可能是由骨髓中的异常血液干细胞引起的。所述异常干细胞产生成熟和分化不良的细胞,这些细胞快速生长并接管骨髓,导致纤维化(瘢痕组织形成)和慢性炎症两者。原发性骨髓纤维化与janus激酶2(jak2)、血小板生成素受体(mpl)和钙网蛋白(calr)的突变有关,其可导致骨髓发生jak-stat通路的组成型激活、进行性瘢痕形成或纤维化。患者可能发生髓外造血,即在骨髓以外的部位发生血细胞形成,因为血细胞被迫迁移到其他区域,特别是肝脏和脾脏。这导致这些器官的增大。在肝脏中,大小异常被称为肝肿大。增大的脾脏称为脾肿大,其也有助于引起全血细胞减少症,特别是血小板减少症和贫血症。髓外造血的另一个并发症是粒细胞增多症,或存在异常形状的红细胞。在骨髓纤维化中髓外造血的主要部位是脾脏,其在患有骨髓纤维化的患者中通常显著地增大。由于脾脏的大量增大,脾脏中经常发生多被膜下梗塞,这意味着由于脾脏的供氧中断,部分或完全的组织发生死亡。在细胞水平上,脾脏含有红细胞前体、粒细胞前体和巨核细胞,其中巨核细胞的数量和异常形状显著。巨核细胞可能参与导致在这种状况下看到的二次纤维化。有人提出tgfβ可能参与骨髓纤维化发病机理的纤维化方面(参见,例如,agarwal等,"bonemarrowfibrosisinprimarymyelofibrosis:pathogenicmechanismsandtheroleoftgfβ"(2016)stemcellinvestig3:5)。原发性骨髓纤维化中的骨髓病理学特征在于纤维化、新生成和骨硬化,并且所述纤维化与沉积在ecm中的胶原蛋白的产生增加有关。许多改变指示或与该疾病相关的生物标志物已被描述。在一些实施方式中,生物标志物是细胞标志物。这样的疾病相关生物标志物可用于诊断和/或监测疾病进展以及疗法的有效性(例如,患者对所述疗法的响应性)。这些生物标志物包括许多纤维化标志物,以及细胞标志物。例如,在肺癌中,据报道肺癌患者的支气管肺泡灌洗液(bal)中的tgfβ1浓度显著高于良性疾病患者(~2+倍增加),其也可作为用于诊断和/或监测肺癌的进展或治疗效果的生物标志物。由于原发性骨髓纤维化与异常的巨核细胞发育相关,巨核细胞的某些细胞标记以及它们的干细胞系的祖细胞可以用作标志物来诊断和/或监测疾病的进展以及疗法的有效性。在一些实施方式中,有用的标志物包括但不限于:分化的巨核细胞的细胞标志物(例如,cd41、cd42和tpor)、巨核细胞-红细胞祖细胞的细胞标志物(例如,cd34、cd38和cd45ra-)、常见骨髓祖细胞的细胞标志物(如il-3α/cd127、cd34、scfr/c-kit和flt-3/flk-2),以及造血干细胞的细胞标志物(如cd34、cd38-、flt-3/flk-2)。在一些实施方式中,有用的生物标志物包括纤维化标志物。这些包括但不限于:tgfβ1、pai-1(也称为serpine1)、mcp-1(也称为ccl2)、col1a1、col3a1、fn1、ctgf、α-sma、acta2、timp1、mmp8和mmp9。在一些实施方式中,有用的生物标志物是血清标志物(例如,在血清样品中发现和检测到的蛋白质或片段)。基于tgfβ是白血病骨髓生态位的组分的发现,可以预期用tgfβ抑制剂靶向与骨髓微环境可能是一个有前景的方法,以在受影响组织中减少表达调节局部tgfβ可用性的呈递分子的白血病细胞。实际上,由于病理学的多面性本质,其显现出在骨髓增生和纤维化两者中的tgfβ依赖性失调(作为术语“骨髓纤维化”自身所表明的),例如本文所述的那些tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂可以为患有骨髓纤维化的患者提供特别有利的治疗效果。预期这种抑制剂的ltbp臂可以靶向骨髓中的ecm相关tgfβ1复合物,而抑制剂的lrrc33臂可以阻断骨髓细胞相关tgfβ1。此外,与骨髓纤维化相关的异常巨核细胞生物学可能涉及garp和ltbp两者介导的tgfβ1活性。tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂能够靶向这样的复合物,从而抑制生态位中活性tgfβ1的释放。因此,这样的tgfβ1抑制剂可用于治疗对其他(或标准治疗)治疗(例如羟基脲和jak抑制剂)响应不足或不耐受的患有真性红细胞增多症的患者。这样的抑制剂还可用于治疗患有中度或高风险骨髓纤维化(mf)的患者,包括原发性mf、真性红细胞增多症mf和原发性血小板增多症mf。因此,本发明的一个方面涉及用于治疗原发性骨髓纤维化的方法。所述方法包括向患有原发性骨髓纤维化的患者施用治疗有效量的包含导致tgfβ可用性降低的tgfβ抑制剂的组合物。在一些实施方式中,向患有骨髓纤维化的患者施用tgfβ1激活的亚型特异性、背景许可性单克隆抗体抑制剂。这样的抗体可以以剂量范围为0.1至100mg/kg之间施用,例如1至30mg之间,例如,1mg/kg、3mg/kg、5mg/kg、10mg/kg、15mg/kg、20mg/kg等。包含抗体的药物组合物的优选施用途径是静脉内或皮下施用。当组合物以静脉内施用时,可以在合适的时间段内给予患者治疗,例如,每次治疗间隔约60分钟,然后每隔几周重复一次,例如每3周、4周、6周等,共几个周期,例如,4个周期、6个周期、8个周期、10个周期、12个周期等。在一些实施方式中,患者通过静脉内施用接受剂量水平为1至10mg/kg(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10mg/kg)的包含抑制性抗体的组合物每28天(4周)一次持续6个周期或12个周期的治疗。在一些实施方式中,这样的治疗作为慢性(长期)疗法施用(例如,只要被认为是有益的,则无限期地继续)以代替在一定数量的施用周期后中断。在一些实施方式中,tgfβ抑制剂是结合非活性(例如,潜在)protgfβ复合物的抗体或其抗原结合部分,从而防止活性或成熟tgfβ从复合物的释放,有效地抑制激活步骤。在一些实施方式中,这样的抗体或抗原结合部分特异性结合与lrrc33、garp、ltbp1、ltbp3相关的protgfβ复合物或其任何组合。在一些实施方式中,这样的抗体或抗原结合部分特异性结合细胞系链的protgfβ复合物。在一些实施方式中,抗体或其部分选择性结合与lrrc33和/或garp(但不与ltbp1或ltbp3)相关的protgfβ复合物。在一些实施方式中,抗体或其部分特异性结合与lrrc33相关的protgfβ复合物。在一些实施方式中,抗体或其部分特异性结合与garp相关的protgfβ复合物。在一些实施方式中,抗体或其部分特异性结合与lrrc33相关的protgfβ复合物以及与garp相关的protgfβ复合物。替代地或除以上讨论的实施方式之外,tgfβ抑制剂是结合lrrc33和/或garp并且包含用于另外的效应功能的结构域的抗体或其抗原结合部分。在一些实施方式中,用于另外的效应功能的结构域可以是fc或fc样结构域以介导靶细胞中的adcc。优选地,adcc诱导抗体不会触发或促进内化,从而足以允许adcc介导的靶细胞杀伤。替代地或除以上讨论的实施方式之外,抗体或其抗原结合部分可以包含用于携带感兴趣“有效负载”的其他部分(例如,抗体-药物缀合物,或adc)。合适的有效负载的实例包括但不限于:治疗剂/药物、毒素、标志物和检测/成像标记等。这样的有效负载可以是化学实体、小分子、多肽、核酸、放射性同位素等。优选地,适合于adc介导的作用机制的抗体可以在结合至细胞表面靶标时触发抗原-抗体复合物的有效内化,从而将有效负载递送到细胞中。由于骨髓纤维化是其在多个受影响的组织或器官中表现病理的许多方面的进行性疾病,治疗方法可以根据疾病的进展而变化。例如,在疾病的原发部位(骨髓),预期合适的疗法包括本文所述的可靶向表达lrrc33的造血细胞的lrrc33抑制剂。这可以通过施用包含结合lrrc33呈递的protgfβ复合物并抑制tgfβ在患者中的激活的抗体的组合物来实现。它还可以通过施用包含结合lrrc33并诱导杀死患者体内靶细胞的抗体的组合物来实现。或者,可以组合这些方法以使用是tgfβ激活抑制剂并且还含有其他部分以介导细胞的细胞毒性的抗体。例如,另外的部分可以是fc或fc样结构域以诱导adcc或与抗体缀合的毒素作为有效负载(例如,抗体-药物缀合物或adc)。虽然骨髓纤维化可以被认为是白血病的一种,但是它的特点在于纤维化的表现。因为已知tgfβ调节ecm内稳态的方面,其失调可导致组织纤维化,预期在一些实施方式中,期望抑制与ecm相关的tgfβ活性。因此,本发明包括结合并抑制由ltbp(例如ltbp1和ltbp3)呈递的protgfβ的抗体或其片段。在一些实施方式中,适合于治疗骨髓纤维化的抗体或其片段是“背景许可性的”,因为它们可以结合protgfβ复合物的多种背景,例如与lrrc33、garp、ltbp1、ltbp3相关的那些或其任何组合。在一些实施方式中,这样的抗体是tgfβ激活的背景非依赖性抑制剂,其特征在于抗体可结合并抑制任何以下潜在复合物:ltbp1-protgfβ、ltbp3-protgfβ、garp-protgfβ和lrrc33-protgfβ。在一些实施方式中,这样的抗体是亚型特异性抗体,其结合并抑制包含一种tgfβ亚型但不包含tgfβ的其他亚型的潜在复合物。这些包括例如ltbp1-protgfβ1、ltbp3-protgfβ1、garp-protgfβ1和lrrc33-protgfβ1。在一些实施方式中,这样的抗体是优选地结合并抑制一种或多种tgfβ亚型的亚型选择性抗体。预期能够以背景许可性或背景非依赖性方式抑制tgfβ1激活的抗体有利于在骨髓纤维化的治疗中使用。可以用本文所述的组合物和方法治疗的合适的骨髓增生性肿瘤的患者群体可包括但不限于:a)其是费城(+)的患者群体;b)其是费城(-)的患者群体;c)被归类为“经典”(pv、et和pmf)的患者群体;d)携带突变jak2v617f(+)的患者群体;e)携带jak2v617f(-)的患者群体;f)具有jak2外显子12(+)的患者群体;g)具有mpl(+)的患者群体;h)具有calr(+)的患者群体。在一些实施方式中,患者群体包括具有中度-2或高风险的骨髓纤维化。在一些实施方式中,患者群体包含具有对现有治疗方案不耐受或不适合的骨髓纤维化的受试者。在一些实施方式中,受试者具有的血小板计数在100-200×109/l之间。在一些实施方式中,受试者在接受治疗之前具有的血小板计数>200×109/l。在一些实施方式中,接受(和可能受益于接受)亚型特异性、背景许可性tgf-β1抑制疗法的受试者被诊断为患有中度-1或更高级的原发性骨髓纤维化(pmf),或继发真性红细胞增多/原发性血小板增多症骨髓纤维化(post-pv/etmf)。在一些实施方式中,受试者在治疗之前有骨髓纤维化记录。在一些实施方式中,受试者在治疗之前通过欧洲共识分级评分被评估为mf-2或更高,通过改良的bauermeister分级评分被评估为3级或更高。在一些实施方式中,受试者在治疗之前具有1的ecog表现状态。在一些实施方式中,受试者在治疗之前具有5至120的白细胞计数(109/l)。在一些实施方式中,受试者具有范围为10%至100%的jak2v617f等位基因负担。在一些实施方式中,接受(和可能受益于接受)亚型特异性、背景许可性tgf-β1抑制疗法的受试者是输血依赖性(在治疗之前),其特征在于受试者在上个月内具有至少两个单位的红细胞输血历史,因为与临床明显出血无关的血红蛋白水平低于8.5g/dl。在一些实施方式中,接受(和可能受益于接受)亚型特异性、背景许可性tgf-β1抑制疗法的受试者之前接收过用于治疗骨髓纤维化的疗法。在一些实施方式中,受试者已经用一种或多种疗法进行治疗,包括但不限于:azd1480、帕比司他、epo、ifnα、羟基脲、聚乙二醇化干扰素、沙利度胺、泼尼松和jak2抑制剂(例如,来他替尼、cep-701)。在一些实施方式中,患者具有髓外造血。在一些实施方式中,髓外造血是在肝、肺、脾和/或淋巴结中。在一些实施方式中,本发明的药物组合物局部施用至疾病表现的一个或多个局部部位。亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂以有效治疗骨髓纤维化的量施用至患者。治疗有效量是足以缓解患者中骨髓纤维化的一种或多种症状和/或并发症的量,包括但不限于:骨髓基质中ecm的过度沉积、新血管生成、骨硬化、脾肿大、血肿、贫血、出血、骨痛和其他骨相关的患病状态、髓外造血、血小板增多症、白细胞减少症、恶病质、感染离子、血栓形成和死亡。在一些实施方式中,所述量有效降低患者中tgfβ1表达和/或分泌(例如巨核细胞的)。因此,这样的抑制剂可降低被治疗患者中的tgfβ1mrna水平。在一些实施方式中,这样的抑制剂降低骨髓中的tgfβ1mrna水平,例如在单核细胞中。pmf患者通常表现出升高的血浆tgfβ1水平,高于~2,500pg/ml,例如高于3,000、3,500、4,000、4,500、5,000、6,000、7,000、8,000、9,000和10,000pg/ml(相比之下,通过elisa测量的正常范围为~600-2,000pg/ml)(参见,例如,mascaremhas等(leukemia&lymphoma,2014,55(2):450-452))。zingariello(blood,2013,121(17):3345-3363)对pmf患者和对照个体的血浆中的生物活性和总tgfβ1含量进行了量化。根据该参考文献,pmf患者中生物活性tgf-β1的中值为43ng/ml(其范围为4-218ng/ml)和总tgfβ1为153ng/ml(32-1000ng/ml),而在相应的对照中,其数值分别为18(0.05-144)和52(8-860)。因此,基于这些报道,与对照或健康血浆样品相比,pmf患者中的血浆tgfβ1含量升高数倍,例如2倍、3倍、4倍、5倍等。用所述抑制剂治疗,例如,施用4至12个周期(例如,2、4、6、8、10、12个周期)或慢性或长期治疗,例如每4周一次,剂量为0.1-100mg/kg,例如,1-30mg/kg本文所述的单克隆抗体可相比于相应基线(治疗前)减少至少10%的血浆tgfβ1水平,例如,至少15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%和50%。一些治疗效果可以在开始治疗后被相对快速地观察到,例如,1周、2周、3周、4周、5周或6周之后。例如,抑制剂可能在1-8周内有效地增加用抑制剂治疗的患者的骨髓内干细胞和/或前体细胞的数量。这些包括造血干细胞和血液前体细胞。可以进行骨髓活组织检查以评估骨髓细胞的频率/数量的变化。相应地,患者可能表现出改善的症状,例如骨痛和疲劳。骨髓纤维化的形态学标志之一是骨髓中(例如,骨髓基质)的纤维化,其特征部分地在于异常ecm。在一些实施方式中,所述量有效减少过量的胶原蛋白沉积,例如通过间充质基质细胞(mesenchymalstromalcell)。在一些实施方式中,与未接受治疗的对照受试者相比,抑制剂有效减少治疗受试者中cd41-阳性细胞(例如巨核细胞)的数量。在一些实施方式中,由随机选择分区法测定的pmf骨髓中巨核细胞的基线频率的范围可以是每平方毫米(mm2)200至700个细胞,和pmf脾脏中每平方毫米(mm2)40至300个巨核细胞。相反,正常供体的骨髓和脾脏中的巨核细胞频率分别小于140和小于10。用抑制剂治疗可以减少骨髓和/或脾脏中巨核细胞的数量(例如,频率)。在一些实施方式中,用抑制剂治疗可导致下游效应子信号传导水平降低,例如smad2/3的磷酸化。骨髓纤维化患者可能患有脾脏肿大。因此,可以通过监测脾脏大小的变化来评估治疗剂的临床效果。脾脏大小可以通过已知技术检查,例如通过触诊评估脾脏长度和/或通过超声评估脾脏体积。在一些实施方式中,待用亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂治疗的受试者具有5cm或更大的基线脾长度(治疗前),例如,通过触诊评估为5至30cm范围内。在一些实施方式中,通过超声波评估的待用tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂治疗的受试者具有300ml或更高的基线脾脏体积(治疗前),例如,范围为300至1500ml。用抑制剂治疗,例如施用4至12个周期(例如,2、4、6、8、10、12个周期),例如每4周一次,剂量为0.1至30mg/kg本文所述的单克隆抗体可以减少受试者的脾脏大小。在一些实施方式中,抑制剂的有效量足以减少接受抑制剂治疗的患者群体中的脾脏大小,相对于相应的基线值至少减少10%、20%、30%、35%、40%、50%和60%。例如,与安慰剂对照相比,通过mri或ct扫描测量,治疗对于在12至24周内实现脾脏体积相对于基线减少≥35%是有效的。在一些实施方式中,与最佳可用疗法对照相比,通过mri或ct扫描测量,治疗对于在24至48周内实现脾脏体积相对于基线减少≥35%是有效的。最佳可用疗法可包括羟基脲、糖皮质激素,以及无药物治疗、阿那格雷,依伯汀α、沙利度胺、来那度胺、巯嘌呤、硫鸟嘌呤、达那唑、聚乙二醇干扰素α-2a、干扰素-α、美法仑、乙酰水杨酸、阿糖胞苷和秋水仙碱。在一些实施方式中,患者群体用本文所述的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂治疗,显示出统计学改善的治疗响应,如通过例如国际骨髓纤维化研究与治疗工作组(iwg-mrt)标准评估,骨髓纤维化等级的变化程度通过改良的bauermeister评分和欧洲共识分级系统(例如,4、6、8或12个周期)测量,症状响应使用骨髓增生性肿瘤症状评估表格(mpn-saf)。在一些实施方式中,用本文所述的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂的治疗实现了统计学改善的治疗响应,如通过例如改进的骨髓纤维化症状评估表(mfsaf)进行评估,其中通过mfsaf工具(如2.0)测量症状,一种使用0至10分级捕获骨髓纤维化的衰弱的症状(腹部不适、早饱、下左侧肋骨疼痛、瘙痒、盗汗和骨/肌肉疼痛)的daukt日记,其中0表示不存在,10表示可以想象的最差情况。在一些实施方式中,治疗有效地在例如12至24周内实现总mfsaf评分从基线降低≥50%。在一些实施方式中,与服用安慰剂的患者相比,接受治疗的相当一部分患者实现总症状评分≥50%的改善。例如,达到≥50%的患者池的比率可以超过40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%或80%。在一些实施方式中,抑制剂的治疗有效量是足以达到临床改善的量,其通过贫血响应评估。例如,改善的贫血反应可包括在4至12个周期(例如6个周期)的治疗之后不依赖输血的更长持续时间,例如8周或更长。在一些实施方式中,抑制剂的治疗有效量是足以在一段时间内保持稳定的病情的量,例如,6周、8周、12周、6个月等。在一些实施方式中,疾病的进展可以通过总体骨髓细胞性的变化、网状蛋白或胶原蛋白纤维化的程度,和/或jak2v617f等位基因负荷的变化来评估。在一些实施方式中,用本文所述的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂治疗的患者群体与未接受治疗的对照群体相比,显示出统计学改善的生存。例如,在对照组中,pmf患者的中位生存期约为6年(在高风险患者中约为16个月),并且预计有不到20%的患者在诊断后存活10年或更长时间。用本文所述的那些亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂治疗可以将存活时间延长至少6个月、12个月、18个月、24个月、30个月、36个月或48个月。在一些实施方式中,与接受安慰剂的患者相比,治疗有效地在26周、52周、78周、104周、130周、144周或156周实现改善的总体存活。可能在具有或不具有新发作贫血的患者中看出治疗的临床益处,如上述例举的那些。亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂相比于缺乏选择性的常规tgfβ拮抗剂的一个优越特征是它们保持通过亚型选择性实现的改善的安全特性。因此,与用常规tgfβ拮抗剂治疗的同等患者群体相比,预期用本文所述的那些亚型特异性、背景许可性抑制剂的治疗可以在不良事件的频率和/或严重程度方面减少患者群体中的不良事件。因此,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂可以提供关于治疗剂量和/或持续时间的更大治疗窗口。不良事件可以由本领域公认的合适的方法分级,例如不良事件通用术语标准(ctcae)版本4。此前报道的接受tgfβ拮抗剂(如gc1008)的人类患者中的不良事件包括:白细胞增多(3级)、疲劳(3级)、缺氧(3级)、心搏停止(5级)、白细胞减少(1级)、复发、短暂、皮肤红斑、结节性皮肤病变、化脓性皮炎和带状疱疹。与骨髓纤维化患者中的jak抑制剂疗法相比,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂疗法可引起频率较少和/或程度较轻的不良事件(副作用),例如、贫血、血小板减少、中性粒细胞减少、高胆固醇血症、丙氨酸转氨酶升高(alt)、天冬氨酸转氨酶升高(ast)、瘀伤、头晕和头痛,从而提供更安全的治疗选择。可以预期,tgfβ1信号传导的抑制剂可以与用于治疗骨髓纤维化的一种或多种治疗剂结合使用作为联合疗法。在一些实施方式中,本文所述的tgfβ1激活抑制剂施用至已接受jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂的患有骨髓纤维化的患者。在一些实施方式中,这样的患者对jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂疗法有响应,而在其他实施方式中,这样的患者对jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂疗法的响应性差或不响应。在一些实施方式中,使用本文所述的tgfβ1的亚型特异性抑制剂可使得对jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂疗法响应差或不响应的那些患者更具响应性。在一些实施方式中,使用本文所述的tgfβ1的亚型特异性抑制剂可以允许减少jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂的剂量,其仍然在患者中产生同等的临床功效但是药物相关毒性或者不良事件(如上面列出的那些)的程度较少或较低。在一些实施方式中,用本文所述的tgfβ1激活抑制剂的疗法与用jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂的疗法联合使用可以在患者中产生协同或另外的治疗效果。在一些实施方式中,用本文所述的tgfβ1激活抑制剂的治疗可以增强jak1抑制剂、jak2抑制剂或jak1/jak2抑制剂或用于治疗骨髓炎的其他疗法的益处。在一些实施方式中,患者可另外接受治疗剂以治疗与骨髓纤维化相关的贫血症。癌症:各种癌症涉及tgfβ1活性和可与本发明的抗体和/或组合物来治疗。如本文所用,术语“癌症”是指各种恶性肿瘤中的任何一种,其特征在于倾向于侵入周围组织并转移至新的身体部位的间变性细胞的增殖,并且还指以这种恶性肿瘤生长为特征的病理状况。癌症可以是局部的(例如,实体瘤)或全身性的。在本公开的上下文中,术语“局部化”(如在“局部肿瘤”中)是指解剖学上分离的或可分离的异常,例如实体恶性肿瘤,与全身性疾病相反。某些癌症,例如某些白血病(例如,骨髓纤维化)和多发性骨髓瘤,例如可能具有疾病的局部组分(例如骨髓)和全身组分(例如循环血细胞)。在一些实施方式中,癌症可以是全身性的,例如血液恶性肿瘤。可根据本公开治疗的癌症包括但不限于所有类型的淋巴瘤/白血病,癌和肉瘤,例如在肛门、膀胱、胆管、骨、脑、乳腺、子宫颈、结肠/直肠、子宫内膜、食道、眼、胆囊、头颈部、肝脏、肾脏、喉、肺、纵隔(胸部)、口腔、卵巢、胰腺、阴茎、前列腺、皮肤、小肠、胃、脊髓、尾骨、睾丸、甲状腺和子宫中发现的癌症或肿瘤。在癌症中,tgfβ(例如,tgfβ1)可以是生长促进剂或生长抑制剂。例如,在胰腺癌中,smad4野生型肿瘤可响应tgfβ而经历抑制的生长,但随着疾病的进展,通常存在组成型激活的ii类受体。另外,存在smad4缺失的胰腺癌。在一些实施方式中,设计本公开的抗体、其抗原结合部分和/或组合物以选择性地靶向在一种或多种形式的癌症中独特地起作用的tgfβ信号传导通路的组分。白血病,或以白细胞(即白血球)异常增殖为特征的血液或骨髓癌可分为四种主要类型,包括急性淋巴细胞白血病(all)、慢性淋巴细胞白血病(cll)、急性白血病骨髓性白血病或急性髓性白血病(aml)(带有第10和11号染色体之间[t(10,11)]、第8和21号染色体之间[t(8;21)]、染色体15和17之间[t(15;17)]易位的和第16号染色体反转[inv(16)]的aml;多线性发育不良的aml,其包括患有转变为aml的既往骨髓增生异常综合征(mds)或骨髓增生性疾病的患者;治疗相关的aml和骨髓增生异常综合征(mds),其类别包括先前已接受过化疗和/或放疗并随后发生aml或mds的患者;d)未另行分类的aml,其包括不属于上述类别的aml亚型;和e)模糊谱系的急性白血病,其当白血病细胞不能被分类为骨髓细胞或淋巴样细胞或存在两种类型的细胞时发生;和慢性粒细胞白血病(cml)。如本文所述的那些tgfβ1的亚型特异性、背景许可性抑制剂可用于治疗多发性骨髓瘤。多发性骨髓瘤是在骨髓中发展和扩展,导致破坏性骨损伤(即,溶骨性病变)的b淋巴细胞(例如,浆细胞、浆母细胞、记忆b细胞)的癌症。通常,该疾病表现出增强的破骨细胞骨吸收,抑制成骨细胞分化(例如,分化停滞)和骨形成受损,其部分特征在于溶骨性病变、骨质减少、骨质疏松症、高钙血症,以及浆细胞瘤、血小板减少症、中性粒细胞减少症和神经病。本文所述的tgfβ1选择性、背景许可性抑制剂疗法可有效改善患者中的一种或多种这样的临床表现或症状。tgfβ1抑制剂可以施用至接受另外的一种或多种疗法以治疗多发性骨髓瘤的患者,包括本文其他地方列出的那些。在一些实施方式中,可以用tgfβ1抑制剂(例如亚型特异性背景许可性抑制剂)与肌肉生长抑制素抑制剂或il-6抑制剂组合治疗多发性骨髓瘤。在一些实施方式中,tgfβ1抑制剂可以与传统的多发性骨髓瘤疗法联合使用,例如硼替佐米、来那度胺、卡非佐米、泊马度胺、沙利度胺、多柔比星、皮质类固醇(例如,地塞米松和泼尼松)、化学疗法(例如,美法仑)、放射疗法、干细胞移植、plitidepsin、艾洛珠单抗、伊沙佐米、马赛替尼和/或帕比司他。可通过本发明的方法治疗的癌的类型包括但不限于,乳头状瘤/癌、绒毛膜癌、内胚窦瘤、畸胎瘤、腺瘤/腺癌、黑色素瘤、纤维瘤、脂肪瘤、平滑肌瘤、横纹肌瘤、间皮瘤、血管瘤、骨瘤、软骨瘤、胶质瘤、淋巴瘤/白血病、鳞状细胞癌、小细胞癌、大细胞未分化癌、基底细胞癌和鼻腔鼻窦未分化癌。肉瘤的类型包括但不限于,软组织肉瘤,例如肺泡软组织肉瘤、血管肉瘤、皮肤纤维肉瘤、硬纤维瘤、增生性小圆细胞瘤、骨外软骨肉瘤、骨外骨肉瘤、纤维肉瘤、血管外皮细胞瘤、血管肉瘤、卡波西氏肉瘤、平滑肌肉瘤、脂肪肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、神经纤维肉瘤、横纹肌肉瘤、滑膜肉瘤和阿斯金氏肿瘤、尤因氏肉瘤(原始神经外胚层肿瘤)、恶性血管内皮瘤、恶性神经鞘瘤、骨肉瘤和软骨肉瘤。如本文所述的那些亚型选择性、背景许可性/非依赖性tgfβ1激活的抑制剂可适用于治疗涉及神经嵴来源的细胞恶性肿瘤。神经嵴谱系的癌症(即神经嵴衍生肿瘤)包括但不限于:黑色素瘤(黑素细胞癌)、神经母细胞瘤(交感神经肾上腺癌)、神经节细胞瘤(周围神经系统神经节癌)、延髓甲状腺癌(甲状腺c细胞癌)、嗜铬细胞瘤(肾上腺髓质嗜铬细胞癌)和mpnst(雪旺氏细胞癌)。在一些实施方式中,本公开的抗体和方法可用于治疗一种或多种类型的癌症或癌症相关病症,其可包括但不限于结肠癌、肾癌、乳腺癌、恶性黑色素瘤和成胶质细胞瘤(schlingensiepen等,2008;ouhtit等,2013)。越来越多的证据揭示巨噬细胞在肿瘤/癌症进展中的作用。本发明包括这样的观点,即这是由疾病环境例如tme中的tgfβ1激活部分地介导的。为响应于肿瘤来源的细胞因子/趋化因子,骨髓来源的单核细胞(例如,cd11b+)被募集到肿瘤位点,单核细胞在这里经历分化和极化以获得前癌表型(例如,m2偏向的、tam或tam样细胞)。如在本公开中提供的实施例中所示,从人pbmc分离的单核细胞可以被诱导以极化成巨噬细胞的不同的亚型,例如,m1(促纤维化、抗癌)和m2(前癌)。许多肿瘤中的大多数tam是m2偏向的。在m2样巨噬细胞中,发现m2c和m2d亚型而非m1,在细胞表面上表达升高的lrrc33。此外,巨噬细胞可通过m-csf暴露进一步偏向或激活,导致lrrc33表达的显著增加,其与tgfβ1表达一致。患有骨髓增生性疾病(例如,骨髓纤维化)的患者中也观察到增加的循环m-csf(即,血清m-csf浓度)。通常,具有高巨噬细胞(tam)和/或mdsc浸润的肿瘤与不良预后相关。类似地,升高的m-csf水平也表明预后不良。如上所述,tgfβ激活的背景许可性/非依赖性抑制剂可在黑色素瘤的治疗中使用。可用这样的抑制剂治疗的黑色素瘤类型包括但不限于:恶性黑色素;恶性雀斑样痣黑色素瘤;浅表性黑色素瘤;肢端黑色素瘤;粘膜黑色素瘤;结节性黑色素瘤;息肉样黑色素瘤和促纤维增生性黑色素瘤。在一些实施方式中,黑色素瘤是转移性黑色素瘤。最近,免疫检查点抑制剂已被用于有效地治疗晚期黑色素瘤患者。特别地,抗程序性死亡(pd)-1抗体(例如,纳武单抗和派姆单抗)现已成为对某些类型癌症的治疗标准,如晚期黑色素瘤,其已经证实显著活性和持久响应,具有可管理的毒性特征。然而,pd-1拮抗剂的有效临床应用受到高比率(约60-70%)的先天性抗性的阻碍(参见hugo等(2016)cell165:35-44),说明持续的挑战继续包括患者的选择和响应与抵抗的预测因子以及优化组合策略的问题(perrot等(2013)anndermatol25(2):135-144)。此外,研究表明,最初对抗pd-1疗法有响应的黑色素瘤患者中大约有25%最终产生获得性抗性(ribas等(2016);jama315:1600-9)。表达pd-1和/或ctla-4的肿瘤浸润性cd8+t细胞的数量似乎是检查点抑制成功的关键指标,并且pd-1和ctla-4两者的阻断均可增加浸润性t细胞。然而,在具有较高巨噬细胞浸润的患者中,cd8细胞的抗癌作用可能被抑制。可以预期,lrrc33表达细胞(例如髓样细胞,包括骨髓前体、mdsc和tam)可以通过抑制t细胞(例如,t细胞耗尽),例如cd4和/或cd8t细胞创建或支持免疫抑制环境(如tme和骨髓纤维化骨髓),其可以至少部分地强化在某些患者群体中观察到的抗pd-1抗性。实际上,证据表明抗pd-1单一疗法的抗性表现为未能积累cd8+细胞毒性t细胞和恢复teff/treg比率。值得注意的是,本发明的发明人已经认识到某些癌症患者中存在分歧,如黑色素瘤患者群体,在lrrc33表达水平方面:一组表现出高lrrc33表达(lrrc33高),而另一组显示出相对低的lrrc33表达(lrrc33低)。因此,本发明包括以下概念:lrrc33高患者群体可代表对免疫检查点抑制剂治疗响应差或对其具有抗性的那些人。因此,例如本文所述的那些抑制lrrc33的试剂可特别有益于治疗对检查点抑制剂治疗具有抗性的癌症(例如,抗pd-1),例如黑色素瘤、淋巴瘤和骨髓增生性疾病。在一些实施方式中,癌症/肿瘤先天地抵抗或不响应免疫检查点抑制剂。仅举一例,某些淋巴瘤似乎对免疫检查点抑制(如抗pd-1治疗)的响应差。类似地,已知黑色素瘤患者群体的子集显示出对免疫检查点抑制剂的抗性。无意受特定理论的束缚,本公开的发明人考虑到这可能至少部分地归因于tgfβ1信号传导通路的上调,其可能产生检查点抑制剂在这里不能发挥其作用的免疫抑制微环境。tgfβ1抑制可以使这种癌症对检查点抑制剂疗法更具响应性。可以从免疫检查点抑制剂和tgfβ1抑制剂的组合中受益的癌症类型的非限制性实例包括:骨髓纤维化、黑色素瘤、肾细胞瘤、膀胱癌、结肠癌、恶性血液病、非小细胞癌、非小细胞肺癌(nsclc)、淋巴瘤(经典霍奇金和非霍奇金)、头颈部癌、膀胱上皮癌、直肠癌的高微不稳定、癌错配修复缺陷、胃癌、肾癌和肝癌。然而,其中tgfβ1是过表达的或者是超过tgfβ2/3的主导亚型的任何癌症(例如,患有这样的癌症的患者),如通过例如活检确定,可以按照本公开的tgfβ1的亚型选择性抑制剂进行治疗。在一些实施方式中,癌症/肿瘤随时间变得具有抗性。这种现象称为获得性抗性或适应性抗性。与固有抗性一样,在一些实施方式中,获得性抗性至少部分由tgfβ1依赖性途径介导,本文所述的亚型特异性tgfβ1抑制剂在这些病例中可有效恢复抗癌免疫力。在一些实施方式中,其包含免疫检查点抑制剂和lrrc33抑制剂(如本文所述)的联合疗法对治疗这样的癌症有效的。此外,高lrrc33阳性细胞浸润的肿瘤,或者具有异常细胞增殖的位点/组织,可以用作宿主的免疫抑制和免疫检查点抗性的生物标志物。类似地,效应t细胞可以从限制了机体对抗癌症的能力的免疫抑制性生态位中排除。此外,如下文实施例部分所示,表达garp呈递的tgfβ1的treg抑制效应t细胞增殖。总之,tgfβ1可能是产生和维护免疫抑制性疾病微环境(如tme)中的关键驱动,并且多种tgfβ1呈递背景与肿瘤相关。在一些实施方式中,联合疗法可以实现更有利的teff/treg比率。在一些实施方式中,特异性结合本文所述的garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分可在治疗有此需要的受试者的癌症的方法中使用,所述方法包括将抗体或其抗原结合部分施用至受试者以治疗癌症。在某些实施方式中,癌症是结肠癌。在一些实施方式中,特异性地结合本文所述的garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物,和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分可在治疗实体瘤的方法中使用。在一些实施方式中,实体瘤可以是通常是致密的并且难以使治疗性分子穿透的增生性肿瘤。通过靶向这样的肿瘤的ecm组分,这样的抗体可“松散”致密肿瘤组织以使其崩解,促进治疗途径以发挥其抗癌作用。因此,可以组合使用其他治疗剂,例如任何已知的抗肿瘤药物。另外地或可替代地,如本文中公开的那些能够抑制tgfβ1活性的亚型特异性、背景许可性抗体或其片段可与嵌合抗原受体t细胞(“car-t”)技术共同使用作为基于细胞的免疫疗法,例如用于抵抗癌症的癌症免疫疗法。在一些实施方式中,如本文所述的特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分可在患有实体瘤的受试者中用于抑制或减少实体瘤生长的方法中使用,所述方法包括将抗体或其抗原结合部分施用至受试者,从而使肿瘤生长得到抑制或减少。在某些实施方式中,实体瘤是结肠癌肿瘤。在一些实施方式中,可用于治疗癌症的抗体或其抗原结合部分是tgfβ1激活的亚型特异性、背景许可性抑制剂。在一些实施方式中,这样的抗体靶向garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,这样的抗体靶向garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物和ltbp3-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,这样的抗体靶向ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。在一些实施方式中,这样的抗体靶向garp-tgfβ1复合物和lrrc33-tgfβ1复合物。本发明包括在治疗受试者中包含实体瘤的癌症中使用背景许可性(背景非依赖性)、亚型特异性的tgfβ1抑制剂。在一些实施方式中,这样的背景许可性(背景非依赖性)、亚型特异性抑制剂可抑制tgfβ1的激活。在优选的实施方式中,这样的激活抑制剂是结合protgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分。当复合物与任何一种呈递分子例如ltbp1、ltbp3、garp或lrrc33相关时,可以发生结合,从而抑制成熟tgfβ1生长因子从复合物中释放。在一些实施方式中,实体瘤的特征在于具有富含cd8+t细胞的基质,其与caf和胶原蛋白纤维直接接触。这样的肿瘤可产生免疫抑制环境,其阻止抗肿瘤免疫细胞(例如,效应t细胞)有效地浸润所述肿瘤,限制机体抵抗癌症的能力。相反,这样的细胞可能在肿瘤基质内或附近积聚。这些特征可能使这样的肿瘤对免疫检查点抑制剂疗法响应差。如下文中更详细讨论的,本文公开的tgfβ1抑制剂可以解除抑制,从而允许效应细胞到达并杀死癌细胞,例如,与免疫检查点抑制剂共同使用。tgfβ1预期在肿瘤微环境中发挥多方面作用,包括肿瘤生长、宿主免疫抑制、恶性细胞增生、血管、血管生成、迁移、侵入、转移和化疗抗性。因此,环境中tgfβ1呈递的每个“背景”可以参与疾病进展的调节(或失调)。例如,garp轴在调节效应t细胞应答用于介导宿主免疫应答以抵抗癌细胞的treg应答中尤其重要。ltbp1/3轴可调节ecm,包括基质,其中癌相关成纤维细胞(caf)在癌症的发病机制和进展中起作用。lrrc33轴可能在将循环单核细胞募集至肿瘤微环境中,随后分化成肿瘤相关巨噬细胞(tam),并且渗入肿瘤组织和疾病恶化的过程中起关键作用。在一些实施方式中,表达tgfβ1的细胞浸润肿瘤产生免疫抑制的局部环境。观察到这样的浸润的程度可能与较差的预后相关。在一些实施方式中,较高的浸润指示对另一种癌症疗法(例如免疫检查点抑制剂)的较差的治疗响应。在一些实施方式中,肿瘤微环境中表达tgfβ1的细胞包含treg和/或骨髓细胞。在一些实施方式中,骨髓细胞包括但不限于:巨噬细胞、单核细胞(组织驻留或骨髓衍生的)和mdsc。在一些实施方式中,tme中表达lrrc33的细胞是髓系抑制性细胞(mdsc)。mdsc浸润(例如,实体肿瘤浸润)可以通过产生宿主的抗肿瘤免疫细胞被排除在外的免疫抑制性生态位来强调至少一种免疫逃逸机制。证据表明,mdsc通过炎症相关信号动员,例如肿瘤相关炎症因子。动员后,mdsc可通过损害抵抗疾病的细胞(如cd8+t细胞和nk细胞)来影响免疫抑制作用。此外,mdsc可通过分泌tgfβ和il-10诱导treg分化。因此,可以向患有免疫逃避(例如,免疫监视受损)的患者施用亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂,例如本文所述的那些,以重新引发或增强身体抵抗疾病(例如,肿瘤)的能力。如本文中更详细描述的,这可以进一步增强(例如,恢复或加强)机体对另一种疗法(例如癌症疗法)的响应性或敏感性。在一些实施方式中,患者中循环mdsc频率(例如,数量)的升高预示着对检查点阻断疗法(如pd-1拮抗剂和pd-l1拮抗剂)响应差。例如,生物标志物研究显示,循环的预治疗hla-drlo/cd14+/cd11b+髓系抑制性细胞(mdsc)与进展和更差的os相关(p=0.0001和0.0009)。此外,在发炎的头颈癌(hnc)中对pd-1检查点阻断的抗性与gm-csf和髓系抑制性细胞(mdsc)标志物的表达相关。该观察结果表明消耗mdsc的策略(例如化学疗法)应该考虑与抗-pd-1组合或顺序。由于在免疫抑制性骨髓细胞上的选择性表达,lrrc33或lrrc33-tgfβ复合物代表了癌症免疫疗法的新靶标。因此,无意受特定理论的束缚,靶向这种复合物可能增强患者群体中标准护理检查点抑制剂疗法的有效性。本发明因此提供了本文所述的亚型特异性、背景许可性或背景非依赖性tgf-β1抑制剂用于治疗包含实体瘤的癌症的治疗中的用途。这样的治疗包括将亚型特异性、背景许可性或背景非依赖性tgf-β1抑制剂以有效治疗癌症的量施用至诊断患有包括至少一种局部肿瘤(实体瘤)的癌症的受试者。证据表明癌症进展(例如,肿瘤增殖/生长、侵入、血管生成和转移)可能至少部分地由肿瘤-基质相互作用驱动。特别地,caf可通过各种细胞因子和生长因子的分泌和ecm的重塑有助于这一过程。涉及该过程的因素包括但不限于基质细胞衍生因子1(scd-1)、mmp2、mmp9、mmp3、mmp-13、tnf-α、tgfβ1、vegf、il-6、m-csf。此外,caf可通过将例如ccl2/mcp-1和sdf-1/cxcl12等因子分泌至肿瘤部位来募集tam;随后,在tam优先附着的地方产生pro-tam生态位(例如,富含透明质酸的基质区域)。由于已经提出tgfβ1促进正常成纤维细胞激活变成肌成纤维细胞样caf,因此施用如本文所述的那些亚型特异性、背景许可性或背景非依赖性tgfβ1抑制剂可有效计数caf的促癌活性。实际上,本文提供的数据表明,阻断tgfβ1激活的亚型特异性、背景非依赖性抗体可抑制uuo诱导也与许多癌症有关的标志基因例如ccl2/mcp-1,α-sma.fn1和col1的上调。在某些实施方式中,如本文所述,特异性地结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分单独或与其他药剂例如抗pd-1抗体(例如,抗pd-1拮抗剂)组合施用至患有癌症或肿瘤的受试者。包括在本发明中的其他联合疗法是施用本文所述的抗体或其抗原结合部分与放射或化学治疗剂。示例性的其他药剂包括但不限于pd-1拮抗剂、pdl1拮抗剂、pd-l1或pdl2融合蛋白、ctla4拮抗剂、gitr激动剂、抗icos抗体、抗icosl抗体、抗b7h3抗体、抗b7h4抗体、抗tim3抗体、抗lag3抗体、抗ox40抗体、抗cd27抗体、抗cd70抗体、抗cd47抗体、抗-41bb抗体、抗pd-1抗体、抗cd20抗体、溶瘤病毒和parp抑制剂。在一些实施方式中,确定或选择适合特定癌症类型或患者群体的联合疗法的治疗方法可能涉及以下内容:a)关于有可用的标准护理疗法(例如,已批准的适应症的免疫疗法)的癌症类型的考量;b)关于治疗抗性亚群体的考量;和c)关于至少部分是“tgfβ1途径活性”或者至少部分地是tgfβ1依赖性(例如,抑制tgfβ1敏感)的癌症/肿瘤的考量。例如,许多癌症样本显示tgfβ1是主要的亚型,例如通过tcgarnaseq分析。在一些实施方式中,来自每种肿瘤类型的超过50%(例如,超过50%、60%、70%、80%和90%)的样本的tgfβ1亚型表达呈阳性。在一些实施方式中,“tgfβ1途径活性”或者至少部分地是tgfβ1依赖性(例如,tgfβ1抑制敏感性)的癌症/肿瘤含有至少一个ras突变,例如k-ras、n-ras和/或h-ras中的突变。在一些实施方式中,癌/肿瘤包含至少一种k-ras突变。在一些实施方式中,亚型特异性、背景许可性tgfβ1抑制剂与检查点抑制剂疗法联合施用至诊断患有癌症的患者,其中一种或多种检查点抑制剂疗法已获得批准。这些包括但不限于:膀胱尿路上皮癌、鳞状细胞癌(例如头颈部)、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、肝细胞癌、肺腺癌、皮肤皮肤黑色素瘤和胃腺癌。在优选的实施方式中,这样的患者对检查点抑制剂治疗响应差或无响应。tgfβ在肌肉骨骼状况的作用:在由骨骼、肌肉、软骨、肌腱、韧带、关节和支撑并将组织和器官结合在一起的其他结缔组织组成的肌肉骨骼系统中,tgfβ起着多种作用,包括抑制增殖和分化、诱导萎缩和纤维化的发展。tgfβ减少卫星细胞增殖并阻止分化(通过抑制myod和肌细胞生成素)(allen,r.e.andl.k.jcellphysiol,1987.133(3):p.567-72;brennan,t.j.,等,procnatlacadsciusa,1991.88(9):p.3822-6;massague,j.,等,procnatlacadsciusa,1986.83(21):p.8206-10;olson,e.n.,等,jcellbiol,1986.103(5):p.1799-805)。在这些早期论文中没有指定tgfβ的亚型(即tgfβ1、2或3),但推测其为tgfβ1。tgfβ也有助于肌肉纤维化;直接注射重组tgfβ1导致骨骼肌纤维化,并且pan-tfgβ抑制减少急性和慢性损伤肌肉中的纤维化(li,y.,等,amjpathol,2004.164(3):p.1007-19;mendias,c.l.,等,musclenerve,2012.45(1):p.55-9;nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21)。tgfβ1由骨骼肌内的肌纤维、巨噬细胞、调节性t细胞、成纤维细胞和纤维细胞表达(li,y.,等,amjpathol,2004.164(3):p.1007-19;lemos,d.r.,等,natmed,2015.21(7):p.786-94;villalta,s.a.,等,scitranslmed,2014.6(258):p.258ra142;wangx.,等,jimmunol,2016.197(12):p.4750-4761);并且在损伤和疾病条件下表达增加(li,y.,等,amjpathol,2004.164(3):p.1007-19;nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21;bernasconi,p.,等,jclininvest,1995.96(2):p.1137-44;ishitobi,m.,等,neuroreport,2000.11(18):p.4033-5)。tgfβ2和tgfβ3也在mdx肌肉中上调(在mrna水平上),尽管程度小于tgfβ1(nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21;zhou,l.,等,neuromusculdisord,2006.16(1):p.32-8)。pessina等人最近使用谱系示踪实验来证明营养不良肌肉中多种来源的细胞通过tgfβ依赖性途径采取纤维化去向(pessina,p.,等,stemcellreports,2015.4(6):p.1046-60)。骨骼是机体内tgfβ的最大贮藏库。实际上,认为tgfβ途径至少部分地通过调节成骨细胞的分化和/或破骨细胞的骨吸收在骨骼内稳态和重塑中起重要作用。该过程涉及在正常和异常情况两者,当失调时,其可能会导致或加剧疾病,例如骨相关状况和癌症。因此,例如本文所述的那些tgfβ1选择性抑制剂可用于治疗这样的状况。在一些实施方式中,施用这样的抑制剂可有效恢复或正常化骨形成-再吸收平衡。在一些实施方式中,tgfβ1抑制剂与另一种疗法(例如肌肉生长抑制素抑制剂和/或骨增强剂)作为联合疗法共同施用至受试者。骨状况(例如,骨骼疾病)包括骨质疏松症、异型增生和骨癌。除了起源于骨骼的原发性骨癌外,已知许多恶性肿瘤转移至骨骼;这些包括但不限于,乳腺癌、肺癌(例如,鳞状细胞癌)、甲状腺癌、睾丸癌、肾癌、前列腺癌和多发性骨髓瘤。在一些实施方式中,这样的状况与肌无力相关联。tgfβ1可能在受影响组织的伴随慢性炎症纤维化病症中起作用,例如人肌营养不良。杜氏肌营养不良症(dmd)是由缺乏肌营养不良蛋白引起的严重、进行性和最终致命的疾病(bushby,k.,等,lancetneurol,2010.9(1):p.77-93)。肌营养不良蛋白的缺乏导致对收缩诱导的损伤的易感性增加,导致持续的肌肉退化((petrof,b.j.,等,procnatlacadsciusa,1993.90(8):p.3710-4;dellorusso,c.,等,jmusclerescellmotil,2001.22(5):p467-75;pratt,s.j.,等,cellmollifesci,2015.72(1):p.153-64)。重复的修复有助于慢性炎症、纤维化、卫星细胞池的耗尽,最终丧失活动性和死亡(bushby,k.,等,lancetneurol,2010.9(1):p.77-93;mcdonald,c.m.,等,musclenerve,2013.48(3):p.343-56)。在dmd患者中tgfβ1的表达显著增加,并且与在这些患者中观察到的纤维化程度相关(bernasconi,p.,等,jclininvest,1995.96(2):p.1137-44;chen,y.w.,等,neurology,2005.65(6):p.826-34)。过量的ecm沉积对肌肉的收缩性质具有不利影响,并且由于肌纤维从其血液供应中分离,可限制营养的获取(klingler,w.,等,actamyol,2012.31(3):p.184-95)。最近,更多的数据进一步表明tgfβ1在肌营养不良症中的作用。已发现ltbp4中的变体可改变小鼠和人的疾病严重程度。在小鼠中,ltbp4的变体在缺乏肌营养不良蛋白或γ-肌聚糖的小鼠中具有保护作用(coley,w.d.,等,hummolgenet,2016.25(1):p.130-45;heydemann,a.,等,jclininvest,2009.119(12):p3703-12)。在人中,两个研究组独立地确定了ltbp4的变体在dmd中是保护性的,将转移的丧失延迟了几年(flanigan,k.m.,等,annneurol,2013.73(4):p.481-8;vandenbergen,j.c.,等,jneurolneurosurgpsychiatry,2015.86(10):p.1060-5)。虽然小鼠和人的遗传变异的性质不同,但在两个物种中,保护性变体均导致tgfβ信号传导减少(heydemann,a.,等,jclininvest,2009.119(12):p.3703-12);ceco,e.,等,scitranslmed,2014.6(259):p.259ra144)。已经从将纯化的活性生长因子注射到动物中或添加到在培养的细胞的实验中推断出tgfβ1在骨骼肌生物学中的许多功能(massague,j.,等,procnatlacadsciusa,1986.83(21):p.8206-10;li,y.,等,amjpathol,2004.164(3):p.1007-19;mendias,c.l.,等,musclenerve,2012.45(1):p.55-9)。鉴于细胞背景对tgfβ1特定功能的重要性(参见,例如,hinck等,coldspringharb.perspect.biol,2016.8(12)),在这些实验中观察到的一些效应可能不反映细胞因子在体内的内源作用。例如,用重组tgfβ1、肌肉生长抑制素或gdf11处理人皮肤成纤维细胞导致这些细胞中基因表达几乎相同的变化,尽管在体内这些蛋白质的作用是完全不同的(tanner,j.w.,khalil,a.,hill,j.,franti,m.,macdonnell,s.m.,growthdifferentiationfactor11potentiatesmyofibroblastactivation,infibrosis:frombasicmechanismstotargetedtherapies.2016:keystone,co)。多名研究人员已使用tgfβ抑制剂来阐明生长因子在体内的作用。用pan-tfgβ中和抗体1d11治疗mdx小鼠,明显导致纤维化减少(通过组织学和羟脯氨酸含量)、减少肌肉损伤(血清肌酸激酶减少和肌纤维密度增加),并改善肌肉功能(通过体积描记法,分离edl肌肉的力生成和前肢握力的增加)(nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21;andreetta,f.,等,jneuroimmunol,2006.175(1-2):p.77-86;gumucio,j.p.,等,japplphysiol(1985),2013.115(4):p.539-45)。此外,显性阴性的tgfβii型受体的肌纤维特异性表达可在心脏毒素损伤后和在δ-肌聚糖-/-小鼠中防止肌肉损伤(accornero,f.,等,hummolgenet,2014.23(25):p.6903-15):p.6903-15)。在骨骼肌中含量丰富并抑制tgfβ活性的蛋白多糖核心蛋白聚糖在mdx小鼠中减少肌肉纤维化和随后的撕裂损伤(li,y.,等,molther,2007.15(9):p.1616-22;gosselin,l.e.,等,musclenerve,2004.30(5):p.645-53)。其他具有tgfβ抑制活性的分子,如苏拉明(一种抗肿瘤药)和氯沙坦(一种血管紧张素受体阻滞剂),可在小鼠的损伤、马凡氏综合征和肌营养不良症模型中有效改善肌肉病理学并且减少减少纤维化(spurney,c.f.,等,jcardiovascpharmacolther,2011.16(1):p.87-95;taniguti,a.p.,等,musclenerve,2011.43(1):p.82-7;bedair,h.s.,等,amjsportsmed,2008.36(8):p.1548-54;cohn,r.d.,等,natmed,2007.13(2):p.204-10)。虽然上述所有治疗剂都抑制tgfβ1或其信号传导,但它们都不是对tgfβ1亚型特异的。例如,1d11结合并抑制tgfβ1、2和3亚型(dasch,j.r.,等,jimmunol,1989.142(5):p.1536-41)。除tgfβ1外,苏拉明还抑制多种生长因子结合至其受体的能力,包括pdgf、fgf和egf(hosang,m.,jcellbiochem,1985.29(3):p.265-73;olivier,s.,等,eurjcancer,1990.26(8):p.867-71;scher,h.i.andw.d.heston,cancertreatres,1992.59:p.131-51)。核心蛋白聚糖还通过直接结合和通过肌生成抑制蛋白抑制剂卵泡抑素的上调两者来抑制肌生成抑制蛋白活性(miura,t.,等,biochembiophysrescommun,2006.340(2):p.675-80;brandan,e.,c.cabello-verrugio,andc.vial,matrixbiol,2008.27(8):p.700-8;zhu,j.,等,jbiolchem,2007.282(35):p.25852-63)。氯沙坦通过其对肾素-血管紧张素-醛固酮系统的影响影响其他的信号传导通路,包括igf-1/akt/mtor途径(burks,t.n.,等,scitranslmed,2011.3(82):p.82ra37;sabharwal,r.andm.w.chapleau,expphysiol,2014.99(4):p.627-31;mcintyre,m.,等,pharmacolther,1997.74(2):p.181-94)。因此,所有这些疗法都抑制可能有助于其治疗效果以及毒性的其他分子。考虑到tgfβ在肌肉内稳态、修复和再生中的作用,药剂,例如如本文所述选择性调节tgfβ1信号传导的单克隆抗体可能对治疗受损肌肉纤维(例如在慢性/遗传性肌营养不良和急性肌肉损伤中)有效,而没有与迄今为止开发的更广泛作用的tgfβ抑制剂相关的毒性。因此,本发明提供了使用优选地调节体内tgfβ效应的子集而非全部的药剂用于治疗受损肌肉纤维的方法。这样的药剂可以选择性地调节tgfβ1信号传导(“亚型特异性调节”)。慢性肌肉疾病中肌肉纤维的修复:本发明包括通过限制纤维化并促进肌肉的形态和功能的正常化来改善在dmd患者肌肉质量和功能的方法。由于tgfβ1也抑制肌细胞生成,tgfβ1阻断可促进营养不良肌肉的再生,进一步增加治疗益处。tgfβ1抑制剂可以与肌营养不良蛋白上调疗法组合使用,例如exondys51(eteplirsen)。鉴于tgfβ1抑制在肌营养不良中的潜在治疗益处,至关重要的是:(1)区分tgfβ1与tgfβ2和tgfβ3的作用,和(2)澄清tgfβ1抑制在哪种分子背景中最有益。如前所述,pan-tfgβ抑制剂与显著的毒性相关,限制了这些化合物的临床应用(anderton,m.j.,等,toxicolpathol,2011.39(6):p.916-24;stauber,a.,等,clinicaltoxicology,2014.4(3):p.1-10)。目前尚不清楚哪种tgfβ亚型引起这些毒性。一些毒性可能是由于免疫系统中的tgfβ1抑制。例如,虽然1d11显著降低膈肌中的纤维化水平,但治疗也增加了肌肉中cd4+和cd8+t细胞的数量,表明pan-tfgβ抑制条件下炎症反应增加,其可能在长期治疗中有害(andreetta,f.,等,jneuroimmunol,2006.175(1-2):p.77-86)。实际上,肌肉中t细胞的消耗改善了mdx小鼠的肌肉病理学,表明t细胞介导的炎症反应对营养不良肌肉有害(spencer,m.j.,等,clinimmunol,2001.98(2):p.235-43)。施用1d11的条件下t细胞数量的增加可能是由于tgfβ1对调节性t(treg)细胞的作用。treg通过garp在其细胞表面呈递tgfβ1,并且从该复合物释放tgfβ1,增强treg抑制活性,从而限制t细胞介导的炎症(wang,r.,等,molbiolcell,2012.23(6):p.1129-39;edwards,j.p.,a.m.thornton,ande.m.shevach,jimmunol,2014.193(6):p.2843-9;nakamura,k.,等,jimmunol,2004.172(2):p.834-42;nakamura,k.,a.kitani,andw.strober,jexpmed,2001.194(5):p.629-44)。实际上,使用pc61抗体消耗treg,导致mdx小鼠膈肌炎症和肌肉损伤增加,而treg数量和活性的增加减少肌肉损伤(villalta,s.a.,等,scitranslmed,2014.6(258):p.258ra142)。有趣的是,最近已鉴定出免疫抑制性t细胞的其他群体,tr1细胞。这些细胞产生大量的抑制活性所必需的tgfβ3(gagliani,n.,等,natmed,2013.19(6):p.739-46;okamura,t.,等,procnatlacadsciusa,2009.106(33):p.13974-9;okamura,t.,等,natcommun,2015.6:p.6329)。虽然tr1细胞在骨骼肌中的作用尚不清楚,但存在这样的可能性:1d11对tgfβ1和tgfβ3两者的抑制可通过抑制treg和tr1细胞两者而具有累加的促炎作用。上述关于tgfβ1的潜伏和激活的结构见解允许特异性靶向tgfβ1药物发现的新方法(shi,m.,等,nature,2011.474(7351):p.343-9)。三种成熟tgfβ生长因子之间所具有的高度序列同一性不被潜在复合物所共享,从而允许发现对protgfβ1精准特异的抗体。使用抗体发现的专有方法,本发明人已经鉴定了与protgfβ1特异性结合的抗体(ab1、ab2和ab3)(参见例如图4b)。使用体外共培养系统,证实这些抗体抑制整联蛋白介导的tgfβ1释放。在该系统中,来源于人皮肤或小鼠骨骼肌的成纤维细胞是潜在tgfβ1的来源,表达αvβ6的细胞系允许释放活性tgfβ1,然后使用表达smad2/3响应性荧光素酶报告基因的第三细胞系测量(图7g-7h)。已经在体内测试了这些抗体之一ab1,并且在uuo(单侧输尿管闭塞)小鼠肾纤维化模型中显示出功效。在该模型中,以9mg/kg/周的ab1处理小鼠(n=10),阻止tgfβ1响应基因的上调(图12a-12j)并且减少损伤后纤维化的程度(通过天狼星红染色)(图12k)。与pan-tfgβ抑制剂相比,tgfβ1特异性疗法可具有改善的功效和安全性,这是对于将在dmd群体中长期使用的治疗剂的关键方面。tgfβ1抑制性抗体可用于确定特异性tgfβ1抑制是否具有作为dmd或其他肌肉疾病的治疗剂的潜力,并阐明tgfβ1在骨骼肌再生中的作用。慢性与急性肌纤维损伤和最佳治疗剂的选择:在急性损伤(例如对原本健康的肌肉或运动神经元的创伤性损伤)后的正常但可再生的肌肉中,认为炎性巨噬细胞的初始浸润对于清除受损组织并分泌卫星细胞激活所必需的因子(例如,细胞因子)是必需的。随后,这些细胞切换(switch)到m2表型以驱动伤口愈合。相比之下,在慢性病症中,例如dmd等疾病中,促炎性巨噬细胞始终占主导地位,并且不会发生切换至m2(或至少不够有效),并且促炎性巨噬细胞继续存在以驱动炎症和肌肉损害。在dmd中,nfkb途径永久活跃,导致组成型炎症。因此,在一些实施方式中,可以向dmd患者施用nfkb抑制剂以减少慢性炎症。因此,在例如dmd的慢性病症中,治疗焦点可以是肌肉修复而不是肌肉再生。这是因为dmd肌纤维有缺陷但没有被毁坏——它们被膜中的泪液、钙瞬变的失调和来自巨噬细胞的ros损害所损害。相比之下,在健康肌肉受伤的情况下,治疗重点可能是再生。例如,在心脏毒素模型中,肌肉纤维被杀死并且必须再生。这模拟了创伤性损伤后的恢复过程,例如挤压损伤。证据表明lrrc33在巯基乙酸盐诱导的具有m2样表型(特征在于它们表达高水平的精氨酸酶,无inos和高水平的cd206)的腹膜巨噬细胞中表达。在lrrc33主要在m2细胞上表达并且其tgfβ1的呈递(“背景”)对这些细胞的促伤口愈合作用很重要的情况下,激活lrrc33介导的tgfβ1以促进修复和/或肌细胞生成(myogenesis)可能是有益的。另一方面,在lrrc33也在促炎m1细胞上表达的情况下,鉴于炎症驱动纤维化,特别是在营养不良的情况下,例如dmd,抑制lrrc33介导的tgfβ1可能是有益的。因此,鉴定疾病相关tgfβ1的来源/背景可能是选择tgfβ信号传导的正确调节剂的重要步骤,这将告知应考虑何种水平的选择性(例如,异构体特异性、背景允许的tgfβ1调节剂、或者背景特异性tgfβ1调节剂;tgfβ1抑制剂或激活剂等)。除了慢性炎症外,dmd的标志是过度的、进行性的纤维化。在晚期疾病中,纤维化是如此严重以至于它实际上可以将个体肌纤维与其血液供应隔离。它还会改变肌肉的收缩特性。在人类患者中,tgfβ1上调的程度与纤维化之间存在很强的相关性,并且纤维化程度与负迁移结果之间存在密切关联。因此,在一些实施方式中,ltbp-protgfβ1抑制剂可以施用于营养不良患者,用于预防和/或减少纤维化,以选择性地靶向疾病中ecm相关的tgfβ1效应。在一些实施方式中,本文所述的各种亚型和/或背景选择性药剂可用于实现tgfβ1信号传导的抑制以阻止纤维化和促进肌生成,但不会对免疫系统产生不希望的影响(例如,通过garp或lrrc33)。治疗、施用为了实施本文所公开的方法,有效量的前文所述的药物组合物可以通过合适的途径施用给需要治疗的受试者(例如,人),例如静脉内施用,例如通过肌肉注射、腹膜内注射、脑脊髓内注射、皮下注射、关节内注射、滑膜内注射、鞘内注射、口服、吸入或局部途径推注(bolus)或连续输注一段时间。用于液体制剂的市售喷雾器,包括喷射雾化器和超声雾化器,可用于施用。液体制剂可以直接雾化,并且冻干粉末可以在重构后雾化。或者,特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分可以使用碳氟化合物制剂和计量剂量吸入器雾化,或作为冻干和研磨的粉末吸入。本文所述的方法待处理的受试者可以是哺乳动物,更优选人。哺乳动物包括但不限于农场动物、运动动物、宠物、灵长类动物、马、狗、猫、小鼠和大鼠。需要治疗的人类受试者可以是患有tgfβ相关适应症、处于tgfβ相关适应症的风险或怀疑具有tgfβ相关适应症的人类患者,例如前文提到的那些。患有tgfβ相关适应症的受试者可通过常规医学检查鉴定,例如实验室测试、器官功能测试、ct扫描或超声波。怀疑患有任何这样的适应症的受试者可能显示该适应症的一种或多种病症。患有适应症的风险的受试者可以是患有该适应症的一种或多种风险因素的受试者。如本文所用,术语“有效量”和“有效剂量”是指足以实现其预期目的(在组织或受试者中以可接受的益处/风险比率的期望的生物或药物应答)的化合物或组合物的任何量或剂量。例如,在本发明的某些实施方式中,预期目的可以是抑制体内tgfβ-1激活,以实现与tgfβ-1抑制相关的临床上有意义的结果。如本领域技术人员所认识到的,有效量根据所治疗的具体病症、病症的严重程度、个体患者参数(包括年龄、身体状况、大小、性别和体重、治疗持续时间、同时治疗的性质(如果有的话)、特定的施用途径以及健康从业者的知识和专业知识中的相似因素而变化。这些因素是本领域普通技术人员所熟知的,并且可以仅通过常规实验来解决。通常优选使用个体组分或其组合的最大剂量,即根据合理的医学判断的最高安全剂量。然而,本领域普通技术人员将理解,出于医学原因,心理原因或实际上任何其他原因,患者可坚持较低剂量或可耐受剂量。经验考虑,例如半衰期,通常将有助于确定剂量。例如,与人免疫系统相容的抗体,例如人源化抗体或完全人抗体,可用于延长抗体的半衰期并防止抗体被宿主的免疫系统攻击。施用频率可以在治疗过程中确定和调整,并且通常但不是必须基于tgfβ相关适应症的治疗和/或抑制和/或改善和/或延迟。或者,特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的持续连续释放制剂可能是合适的。用于实现持续释放的各种制剂和装置对于本领域技术人员而言是显而易见的,并且在本公开的范围内。在一个实例中,特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物,和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的剂量如本文所述可以在已经给予一次或多次抗体施用的个体上凭经验确定。向个体给予增量剂量的拮抗剂。为了评估功效,可以遵循tgfβ相关适应症的指标。例如,用于测量肌纤维损伤、肌纤维修复、肌肉中的炎症水平和/或肌肉中的纤维化水平的方法是本领域普通技术人员所公知的。本发明包括这样的认识:能够以亚型特异性方式调节tgfβ的激活步骤的药剂当作为药物使用时,可以提供改进的安全性概况。因此,本发明包括特异性结合和抑制tgfβ1激活但不抑制tgfβ2或tgfβ3激活的抗体及其抗原结合片段,从而赋予体内tgfβ1信号传导的特异性抑制,同时最小化影响tgfβ2和/或tgfβ3信号传导的不需要的副作用。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分当施用于受试者时没有毒性。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分在施用于受试者时表现出与特异性结合tgfβ1和tgfβ2的抗体相比降低的毒性。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分在施用于受试者时表现出与特异性结合tgfβ1和tgfβ3的抗体相比降低的毒性。在一些实施方式中,本文所述的抗体或其抗原结合部分在施用至受试者时表现出与特异性结合tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3的抗体相比降低的毒性。通常,对于任何本文所述的抗体的施用,初始候选剂量可以是约2ml/kg。出于本公开的目的,典型的日剂量可以为约任何0.1μg/kg至3μg/kg至30μg/kg至300μg/kg至3mg/kg,至30mg/kg至100mg/kg或更多,取决于前文提到的因素。对于数天或更长时间的重复给药,取决于病症,持续治疗直至出现所期望的症状抑制或直至达到足够的治疗水平以减轻tgfβ相关适应症或其症状。示例性给药方案包括施用约2mg/kg的初始剂量,然后施用约1mg/kg抗体的每周维持剂量,或者每隔一周施用约1mg/kg的维持剂量。然而,取决于从业者希望实现的药代动力学衰变的模式,其他剂量方案可能是有用的。例如,考虑每周给药一至四次。在一些实施方式中,可以使用约3μg/mg至约2mg/kg(例如约3μg/mg、约10μg/mg、约30μg/mg、约100μg/mg、约300μg/mg、约1mg/kg和约2mg/kg)的剂量范围。药代动力学实验已显示本文公开的抗体(例如,ab2)的血清浓度在施用于临床前动物模型(例如,小鼠模型)后保持稳定至少7天。不希望受任何特定理论的束缚,施用后的这种稳定性可能是有利的,因为可以较不频繁地施用抗体,同时在施用抗体的受试者(例如,人受试者)中维持临床有效的血清浓度。在一些实施方式中,给药频率是每周一次、每两周一次、每四周一次、每五周一次、每六周一次、每七周一次、每8周一次、每9周一次或每10周一次;或每月一次、每2个月一次、或每3个月或更长时间一次。通过常规技术和测定可以容易地监测该疗法的进展。给药方案(包括使用的抗体)可随时间变化。在一些实施方式中,对于正常体重的成年患者,可以施用约0.3至5.00ml/kg的剂量范围。具体的剂量方案,例如剂量、时间和重复,将取决于具体的个体和该个体的病史以及个体药剂的性质(例如药剂的半衰期、以及其他相关的考虑因素)。出于本公开的目的,特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的适当剂量将取决于使用的特异性抗体(或其组合物)、适应症的类型和严重程度、抗体是否用于预防或治疗目的、先前的治疗、患者的临床病史和对拮抗剂的响应以及主治医师的判断。在一些实施方式中,临床医生将施用特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体直至剂量达到实现所期望的结果。特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的施用可以是连续的或间歇的,这取决于例如接受体的生理状况、给药的目的是治疗性的还是预防性的、以及技术人员已知的其他因素。特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体的施用可以在预选的一段时间内基本连续,或者可以是一系列的间隔剂量,例如,在发展tgfβ相关适应症之前、期间或之后。如本文所用,术语“治疗”是指出于治愈、痊愈、减轻、缓解、改变、补救、改善、改进或影响适应症、适应症的症状或朝向适应症的倾向的目的,将包含一种或多种活性药剂的组合物应用或施用至具有tgfβ-相关适应症、适应症的症状或朝向适应症的倾向的受试者。使用特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体缓解tgfβ相关适应症包括延迟适应症的发展或进展、或减少适应症的严重程度。缓解适应症并不一定需要治愈效果。如其中所使用的,“延迟”与tgfβ相关适应症相关的适应症的发展意味着推迟、阻碍、减缓、延缓、稳定和/或推后适应症的进展。该延迟可以具有不同的时间长度,取决于适应症的历史和/或被治疗的个体。“延迟”或缓解适应症的发展或延迟适应症的开始的方法是与不使用该方法相比在给定时间范围内降低发展适应症的一种或多种症状的可能性和/或在给定的时间范围内减轻症状的程度的方法。这样的比较通常基于临床研究,使用足以给出统计学显著结果的许多受试者。dba2/j小鼠在ltbp4等位基因中具有40bp的缺失。与潜在tgfb1相关的ecm的失调可能暴露ab1结合的表位。可能存在其中ab1结合的表位暴露的疾病,并且如果指示tgfb1抑制,那些疾病可能是ab1的治疗机会。联合疗法本公开还包括作为联合疗法用于治疗可以从体内tgfβ抑制受益的受试者的药物组合物和相关方法。在任何这些实施方式中,这样的受试者可以接受联合疗法,所述联合疗法包括含有至少一种tgfβ抑制剂的第一组合物,例如本文所述的抗体或其抗原结合部分,以及包含至少一种用于治疗相同或重叠的疾病或临床病症的另外的治疗剂的第二组合物。第一和第二组合物两者可以作用于相同的细胞靶标或离散的细胞靶标。在一些实施方式中,第一和第二组合物可以治疗或减轻疾病或临床病症的症状或方面的相同或重叠组。在一些实施方式中,第一和第二组合物可以治疗或减轻疾病或临床病症的症状或方面的单独组。仅举一个实例,第一组合物可以治疗与tgfβ信号传导有关的疾病或病症,而第二组合物可以治疗与同一疾病有关的炎症或纤维化等。这样的联合疗法可以相互结合给药。在联合疗法的上下文中,短语“与...组合”意指在接受联合疗法的受试者中第一疗法的治疗效果暂时和/或空间地与第二疗法的治疗效果重叠。因此,联合疗法可以配制成用于同时施用的单一制剂,或者配制成用于疗法的顺序施用的单独制剂。在优选的实施方式中,联合疗法在疾病的治疗中产生协同效应。术语“协同”是指大于每种单一疗法总计的累加效应(例如,更高的功效)的效应。在一些实施方式中,包含本文所述的药物组合物的联合疗法产生整体相当于由另一种疗法产生的(例如第二药剂的单一疗法)功效,但与第二药剂的单一疗法相比与较少的不希望的第二药剂的不利影响或较不严重的第二药剂的毒性相关联。在一些实施方式中,这样的联合疗法允许较低剂量的第二药剂但保持总体功效。这样的联合疗法可能特别适用于需要长期治疗和/或涉及儿科患者的患者群体。因此,如本文所述,本发明提供在用于减少tgf-β1蛋白激活和治疗或预防与tgfβ1信号传导相关的疾病或病症的联合疗法中使用的药物组合物和方法。因此,该方法或药物组合物还包含第二疗法。在一些实施方式中,第二疗法可用于治疗或预防与tgfβ1信号传导相关的疾病或病症。第二疗法可以减少或治疗与靶疾病相关的至少一种症状。第一和第二疗法可以通过相似或不相关的作用机制发挥其生物学作用;或者,第一和第二疗法中的一种或两种可以通过多种作用机制发挥其生物学作用。应当理解的是,本文所述的药物组合物可含有在相同的药学上可接受的载体中或在对各个所述的实施方式不同的药学上可接受的载体中的第一和第二疗法。还应当理解,第一和第二疗法可在所述实施方式中同时或顺序施用。本发明的一种或多种抗tgfβ抗体、或其抗原结合部分可以与一种或多种另外的治疗剂组合。可以与本发明的抗tgfβ抗体一起使用的另外的治疗剂的实例包括但不限于:tgfβ超家族成员的调节剂,例如肌肉生长抑制素抑制剂和gdf11抑制剂;vegf激动剂;igf1激动剂;fxr激动剂;ccr2抑制剂;ccr5抑制剂;双ccr2/ccr5抑制剂;赖氨酰氧化酶样-2抑制剂;ask1抑制剂;乙酰辅酶a羧化酶(acc)抑制剂;p38激酶抑制剂;吡非尼酮;尼达尼布(nintedanib);m-csf抑制剂(例如,m-csf受体拮抗剂和m-csf中和剂);mapk抑制剂(例如,erk抑制剂)、免疫检查点激动剂或拮抗剂;il-11拮抗剂;和il-6拮抗剂等。可以与tgfβ抑制剂一起使用的另外的治疗剂的实例包括但不限于,吲哚胺2,3双加氧酶(ido)抑制剂、酪氨酸激酶抑制剂、丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂、双特异性激酶抑制剂。在一些实施方式中,这样的药剂可以是pi3k抑制剂、pkc抑制剂或jak抑制剂。在一些实施方式中,另外的活性剂是检查点抑制剂。在一些实施方式中,另外的药剂选自pd-1拮抗剂、pdl1拮抗剂、pd-l1或pdl2融合蛋白、ctla4拮抗剂、gitr激动剂、抗icos抗体、抗icosl抗体、抗b7h3抗体、抗b7h4抗体、抗tim3抗体、抗lag3抗体、抗ox40抗体、抗cd27抗体、抗cd70抗体、抗cd47抗体、抗41bb抗体、抗pd-1抗体、溶瘤病毒和parp抑制剂。在一些实施方式中,另外的药剂结合t细胞共刺激分子,例如抑制性共刺激分子和激活性共刺激分子。在一些实施方式中,另外的药剂选自抗cd40抗体、抗cd38抗体、抗kir抗体、抗cd33抗体、抗cd137抗体和抗cd74抗体。在一些实施方式中,另外的疗法是放射。在一些实施方式中,另外的药剂是化学治疗剂。在一些实施方式中,化学治疗剂是紫杉醇。在一些实施方式中,另外的药剂是抗炎剂。在一些实施方式中,另外的药剂抑制单核细胞/巨噬细胞募集和/或组织浸润的过程。在一些实施方式中,另外的药剂是肝星状细胞激活的抑制剂。在一些实施方式中,另外的药剂是趋化因子受体拮抗剂,例如ccr2拮抗剂和ccr5拮抗剂。在一些实施方式中,这样的趋化因子受体拮抗剂是双特异性拮抗剂,例如ccr2/ccr5拮抗剂。在一些实施方式中,作为联合疗法施用的另外的药剂是或包含tgfβ生长因子超家族的成员或其调节剂。在一些实施方式中,这样的药剂选自gdf8/肌肉生长抑制素和gdf11的调节剂(例如,抑制剂和激活剂)。在一些实施方式中,这样的药剂是gdf8/肌肉生长抑制素信号传导的抑制剂。在一些实施方式中,这样的药剂是单克隆抗体,其特异性结合前体/潜在的肌肉生长抑制素复合物并阻断肌肉生长抑制素的激活。在一些实施方式中,特异性结合前体/潜在肌肉生长抑制素复合物并阻断肌肉生长抑制素激活的单克隆抗体不结合游离的成熟的肌肉生长抑制素。在一些实施方式中,另外的疗法包括car-t疗法。这样的联合治疗可以有利地利用施用的治疗剂的较低剂量,从而避免与各种单一疗法相关的可能的毒性或并发症。在一些实施方式中,使用本文所述的tgfβ1的亚型特异性抑制剂可使得对疗法(例如,标准护理)响应性差或无响应的那些人更具响应性。在一些实施方式中,使用本文所述的tgfβ1的亚型特异性抑制剂可以允许减少的治疗剂量(例如,标准护理),其仍然在患者中产生等同的临床功效但是较少或较低程度的药物相关毒性或不良事件。抑制tgfβ1活性本公开的方法包括在一个或多个生物系统中抑制tgfβ1生长因子活性的方法。这样的方法可包括使一种或多种生物系统与本公开的抗体和/或组合物接触。在一些情况下,这些方法包括改变生物系统(例如细胞生态位或受试者)中的游离生长因子的水平。根据这样的方法的抗体和/或组合物可包括但不限于生物分子,包括但不限于本文所述的重组蛋白、蛋白复合物和/或抗体或其抗原部分。在一些实施方式中,本公开的方法可用于减少或消除生长因子的活性,在此称为“抑制方法”。一些这样的方法可包括tgfβ复合物中的成熟生长因子保留(例如,与garp、ltbp1、ltbp3和/或lrrc33复合的tgfβ1)和/或促进生长因子与tgfβ复合物的重新结合。在一些情况下,抑制方法可包括使用特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体。根据一些抑制方法,提供了一种或多种抑制性抗体。在一些实施方式中,本公开的抗体、其抗原结合部分和组合物可用于抑制tgfβ1激活。在一些实施方式中,本文提供用于抑制tgfβ1激活的方法,其包括将garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物暴露于本文所述的抗体、其抗原结合部分、或药物组合物。在一些实施方式中,抗体、其抗原结合部分或药物组合物抑制成熟tgfβ1从garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物中的释放。在一些实施方式中,该方法在体外进行。在一些实施方式中,该方法在体内进行。在一些实施方式中,该方法离体进行。在一些实施方式中,garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物存在于细胞的外表面。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是t细胞、成纤维细胞、肌成纤维细胞、巨噬细胞、单核细胞、树突细胞、抗原呈递细胞、中性粒细胞、髓系抑制性细胞(mdsc)、淋巴细胞、肥大细胞或小胶质细胞。t细胞可以是调节性t细胞(例如,免疫抑制性t细胞)。嗜中性粒细胞可以是激活的嗜中性粒细胞。巨噬细胞可以是激活的(例如,极化的)巨噬细胞,包括促纤维化和/或肿瘤相关的巨噬细胞(tam),例如m2c亚型和m2d亚型巨噬细胞。在一些实施方式中,巨噬细胞暴露于可在巨噬细胞中进一步诱导前癌表型的肿瘤衍生因子(例如,细胞因子、生长因子等)。在一些实施方式中,这样的肿瘤衍生因子是csf-1/m-csf。在一些实施方式中,表达garp-tgfβ1复合物或lrrc33-tgfβ1复合物的细胞是癌细胞,例如循环肿瘤细胞和肿瘤细胞。在一些实施方式中,ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物结合到细胞外基质(即,ecm的组分)。在一些实施方式中,细胞外基质包含原纤蛋白和/或纤连蛋白。在一些实施方式中,细胞外基质包含含有rgd基序的蛋白质。lrrc33在选择性细胞类型中表达,特别是骨髓谱系的细胞类型,包括单核细胞和巨噬细胞。单核细胞起源于骨髓中的祖细胞并在血流中循环并到达外周组织。然后循环的单核细胞可以迁移到组织中,在那里它们暴露于包含一系列触发单核细胞分化成巨噬细胞的各种因子(例如细胞因子和趋化因子)的局部环境(例如,组织特异性、疾病相关的等)。这些包括,例如,肺中的肺泡巨噬细胞、骨髓中的破骨细胞、cns中的小胶质细胞、结缔组织中的组织细胞、肝脏中的库普弗细胞和棕色脂肪组织中的棕色脂肪组织巨噬细胞。在实体瘤中,浸润的巨噬细胞可以是肿瘤相关的巨噬细胞(tam)、肿瘤相关的中性粒细胞(tan)和髓系抑制性细胞(mdsc)等。这样的巨噬细胞可以激活和/或与激活的成纤维细胞相关,例如瘤相关(或癌症相关)成纤维细胞(caf)和/或基质。因此,本文所述的抑制成熟tgfβ1从含lrrc33的复合物中释放的tgfβ1激活的抑制剂可以靶向在细胞表面上表达lrrc33-protgfβ1的任何这些细胞。在一些实施方式中,lrrc33-tgfβ1复合物存在于促纤维化(m2样)巨噬细胞的外表面。在一些实施方式中,促纤维化(m2样)巨噬细胞存在于纤维化微环境中。在一些实施方式中,与单独靶向ltbp1-tgfβ1和/或ltbp1-tgfβ1复合物相比,在促纤维化(m2样)巨噬细胞的外表面上靶向lrrc33-tgfβ1复合物提供了优异的效果。在一些实施方式中,m2样巨噬细胞进一步极化(poralized)成具有差异表型的多种亚型,例如m2c和m2dtam样巨噬细胞。在一些实施方式中,巨噬细胞可以被肿瘤微环境中存在的各种因子(例如,生长因子、趋化因子、细胞因子和ecm重塑分子)激活,包括但不限于tgfβ1、ccl2(mcp-1)、ccl22、sdf-1/cxcl12、m-csf(csf-1)、il-6、il-8、il-10、il-11、cxcr4、vegf、pdgf、前列腺素调节剂例如花生四烯酸和环氧合酶-2(cox-2)、甲状旁腺激素相关蛋白(pthrp)、runx2,hif1α和金属蛋白酶。暴露于一种或多种这样的因子可以进一步驱使单核细胞/巨噬细胞进入前肿瘤表型。反过来,这些激活的肿瘤相关细胞还可以促进其他细胞募集和/或分化成促肿瘤细胞,例如caf、tan、mdsc等。基质细胞还可以响应于巨噬细胞激活并影响ecm重塑,并最终影响血管形成、侵袭和转移。在一些实施方式中,garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物结合到细胞外基质。在一些实施方式中,细胞外基质包含原纤蛋白。在一些实施方式中,细胞外基质包含含有rgd基序的蛋白质。在一些实施方式中,本文提供的是用于减少受试者的tgfβ1蛋白激活的方法,其包括向受试者施用本文所述的抗体、其抗原结合部分或药物组合物,从而减少受试者tgfβ1蛋白激活。在一些实施方式中,受试者患有纤维化或处于患纤维化的风险。在一些实施方式中,受试者患有癌症或处于患癌症的风险中。在一些实施方式中,受试者患有痴呆症或处于患痴呆症的风险。在一些实施方式中,如本文所述的抗体或其抗原结合部分降低调节性t细胞(treg细胞)的抑制活性。用于缓解与tgfβ相关适应症相关的疾病/病症的试剂盒本公开还提供用于减轻与tgfβ-相关适应症相关的疾病/病症的试剂盒。这样的试剂盒可以包括一个或多个容器,所述容器包含特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物(例如,任何本文所述的那些)的抗体或其抗原结合部分。在一些实施方式中,试剂盒可以包括根据本文所述的任何方法的使用说明书。所包含的说明书可包括施用特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分以治疗、延迟发作、或减轻本文所述的靶疾病的描述。试剂盒还可以包括基于鉴定该个体是否患有靶疾病来选择适合于治疗的个体的描述。在其他实施方式中,说明书包括向处于靶疾病风险的个体施用抗体或其抗原结合部分的描述。关于特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体或其抗原结合部分的使用的说明书一般包括关于预期治疗的剂量、给药方案和给药途径的信息。容器可以是单位剂量、批量包装(例如,多剂量包装)或亚单位剂量。本公开的试剂盒中提供的说明书通常是标签或包装插页(例如,试剂盒中包括的纸张)上的书面说明书,但机器可读说明书(例如,磁性或光学存储盘上携带的说明书)也是可以接受的。标签或包装插页指示该组合物用于治疗、延迟发作和/或缓解与tgfβ-相关适应症相关的疾病或病症。可以提供用于实践本文所述的任何方法的说明书。本发明的试剂盒是在合适的包装中。合适的包装包括但不限于小瓶、瓶子、广口瓶、软包装(例如,密封的聚酯薄膜或塑料袋)等。还考虑了与特定装置组合使用的包装,例如吸入器、鼻腔施用装置(例如雾化器)或输液装置,例如微型泵。试剂盒可以具有无菌进入口(例如,容器可以是静脉内溶液袋或具有可由皮下注射针刺穿的塞子的小瓶)。容器还可以具有无菌进入口(例如,容器可以是静脉内溶液袋或具有可由皮下注射针刺穿的塞子的小瓶)。组合物中的至少一种活性剂是特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物(如本文所述的那些)的抗体或其抗原结合部分。试剂盒可以任选地提供附加的组分,例如缓冲液和解释性信息。通常,试剂盒包括容器和在容器上或与容器相关的标签或包装插页。在一些实施方式中,本公开提供了包含上述试剂盒的内容物的制品。用于检测garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的测定在一些实施方式中,本文提供的方法和组合物涉及用于检测从受试者获得的样品的garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物、和/或lrrc33-tgfβ1复合物的方法。如本文所用,“受试者”是指个体生物,例如个体哺乳动物。在一些实施方式中,受试者是人。在一些实施方式中,受试者是非人哺乳动物。在一些实施方式中,受试者是非人灵长类动物。在一些实施方式中,受试者是啮齿动物。在一些实施方式中,受试者是绵羊、山羊、牛、家禽、猫或狗。在一些实施方式中,受试者是脊椎动物、两栖动物、爬行动物、鱼、昆虫、苍蝇或线虫。在一些实施方式中,受试者是研究动物。在一些实施方式中,受试者是基因工程化的、例如基因工程化的非人受试者。受试者可以是任一性别和任何发育阶段。在一些实施方式中,受试者是患者或健康志愿者。在一些实施方式中,用于检测从受试者获得的样品的garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的方法涉及:(a)在适合抗体与抗原结合的条件下,使特异性结合garp-tgfβ1复合物、ltbp1-tgfβ1复合物、ltbp3-tgfβ1复合物和/或lrrc33-tgfβ1复合物的抗体与样品接触,如果抗原存在于样品中,则由此形成结合复合物;和(b)确定与抗原结合的抗体水平(例如,确定结合复合物的水平)。在一个实施方式中,筛选测定利用固定在表面上的生物素化的潜在tgfβ1复合物,这允许通过系链由整联蛋白激活潜在tgfβ1。其他非整联蛋白也可以在该系统中测试。读取结果可以通过报告细胞或其他tgfβ依赖性细胞响应。用于测量tgfβ激活的基于细胞的测定可以通过本领域中已知的任何合适的方法来测量tgfβ的激活(和tgfβ测试抑制剂例如抗体对其的抑制)。例如,整联蛋白介导的tgfβ激活可用于基于细胞的测定,例如本文更详细描述的“caga12”荧光素酶测定。如所示,这样的测定系统可包含以下组分:i)tgfβ来源(重组、内源或转染);ii)激活子来源,例如整联蛋白(重组、内源或转染);iii)响应于tgfβ激活的报告系统,例如表达能够响应于tgfβ的tgfβ受体并将信号转化为可读输出(例如,caga12细胞或其他报告细胞系中的荧光素酶活性)的细胞。在一些实施方式中,报告细胞系包含在tgfβ响应性启动子(例如pai-1启动子)控制下的报告基因(例如,荧光素酶基因)。在一些实施方式中,赋予敏感性的某些启动子元件可以整合到报告系统中。在一些实施方式中,这样的启动子元件是caga12元件。已经描述了可用于测定的报告细胞系,例如,abe等(1994)analbiochem.216(2):276-84,其全部内容通过引用并入本文。在一些实施方式中,前述测定组分中各自由相同的来源(例如,相同的细胞)提供。在一些实施方式中,前述测定组分中的两种由相同的来源提供,并且第三测定组分由不同的来源提供。在一些实施方式中,所有三种测定组分均由不同的来源提供。例如,在一些实施方式中,整联蛋白和潜在tgfβ复合物(protgfβ和呈递分子)由相同的来源(例如,相同的转染细胞系)提供用于测定。在一些实施方式中,整联蛋白和tgf由单独的来源(例如,两种不同的细胞系、纯化的整联蛋白和转染的细胞的组合)提供用于测定。当细胞用作一种或多种测定组分的来源时,测定的这样的组分可以是细胞内源的、在细胞中稳定表达的、瞬时转染或其任何组合。本文公开了用于测量tgfβ激活的基于细胞的测定的非限制性示例性实施方式的结果证实使用抗体ab1和ab2对garp-protgfβ1复合物或lrrc33-protgfβ1复合物的抑制。在该示例性测定中,用于garp-tgfβ1复合物的ab1的ic50(μg/ml)为0.445,并且用于lrrc33-tgfβ1复合物的ab1的ic50(μg/ml)为1.325。本领域技术人员可以容易地将这样的测定适应于各种合适的配置。例如,可以考虑多种tgfβ来源。在一些实施方式中,tgfβ来源是表达和沉积tgfβ的细胞(例如,原代细胞、增殖细胞、永生化细胞或细胞系等)。在一些实施方式中,使用合适的方法纯化tgfβ来源和/或将重组tgfβ固定在测定系统中。在一些实施方式中,固定在测定系统中的tgfβ呈递于具有或不具有去细胞化的测定板上的细胞外基质(ecm)组合物中,模拟成纤维细胞来源的tgfβ。在一些实施方式中,tgfβ呈递于测定中使用的细胞的细胞表面上。另外,选择的呈递分子可以被包括在测定系统中以提供合适的潜在tgfβ复合物。本领域普通技术人员可以容易地确定哪些呈递分子可以在某些细胞或细胞类型中存在或表达。使用这样的测定系统,可以容易地测量在存在或不存在测试试剂(例如抗体)的情况下tgfβ激活的相对变化以评价测试试剂对体外tgfβ激活的影响。来自示例性的基于细胞的测定的数据在下文的实施例部分中提供。这样的基于细胞的测定可以依赖于正在研究的tgfβ亚型、潜在复合物的类型(例如,呈递分子)等以许多方式被修改或者定制。在一些实施方式中,已知表达能够激活tgfβ的整联蛋白的细胞可用作测定中整联蛋白的来源。这样的细胞包括sw480/β6细胞(例如,克隆1e7)。在一些实施方式中,表达整联蛋白的细胞可以与编码感兴趣的呈递分子(例如garp、lrrc33、ltbp(例如,ltbp1或ltbp3)等)的质粒和编码感兴趣的tgfβ亚型(例如protgfβ1)的前体形式的质粒共转染。转染后,将细胞孵育足够的时间以允许转染基因的表达(例如,约24小时),洗涤细胞,并与连续稀释的测试试剂(例如抗体)一起孵育。然后,将报告细胞系(例如,caga12细胞)加入到测定系统中,然后进行适当的孵育时间以允许tgfβ信号传导。在加入测试试剂后的孵育期(例如,约18-20小时)后,使用合适的方法(例如,对于表达荧光素酶的报告细胞系,可以使用bright-glo试剂(promega))检测信号/读取结果(例如,荧光素酶活性)。在一些实施方式中,可以使用具有自动增益(autogain)设置的biotek(synergyh1)平板读数器检测荧光素酶荧光。本文图7提供基于细胞的tgfβ测定的代表性结果。数据证实本发明的示例性抗体能够以背景非依赖性的方式选择性地抑制tgfβ1的激活。核酸在一些实施方式中,本公开的抗体、其抗原结合部分和/或本发明的组合物可以由核酸分子编码。这样的核酸分子包括但不限于dna分子、rna分子、多核苷酸、寡核苷酸、mrna分子、载体、质粒等。在一些实施方式中,本公开可包含编程或产生以表达编码本公开的化合物和/或组合物的核酸分子的细胞。在一些情况下,本公开的核酸包括密码子优化的核酸。产生密码子优化的核酸的方法是本领域已知的,并且可以包括但不限于美国专利号5,786,464和6,114,148中描述的那些,其全部内容各自通过引用并入本文。本发明通过以下实施例进一步说明,其并非旨在以任何方式进行限制。本申请中引用的所有参考文献、专利和公开的专利申请的全部内容以及附图通过引用并入本文。本发明进一步通过以下不应当被解释为限制性的实施例进行说明。实施例实施例1:tgfβ1的抑制tgfβ超家族包含与具有活性的生长因子复合的前肽(图1)。开发了选择策略以获得稳定复合物的抗体,从而产生更具选择性和有效的抑制作用。使用基于hek293的表达系统,进行ninta亲和力和凝胶过滤以获得多毫克量的纯化蛋白,其用于产生与ltbp复合的tgfβ1(ltbp-tgfβ1复合物)和与garp复合的tgfβ1(garp-tgfβ1复合物)(图3)。生产的蛋白质的多样性使得能够测试物种交叉反应性和表位映射(mapping)。使用体外发光测定测试候选抗体。在筛选中,当面对用于正常激活的刺激时,抑制生长因子释放的抗体使报告细胞“关闭”。显示ab1和ab2是潜在tgfβ1复合物激活的抑制剂,并且与小鼠交叉反应。在表达人tgfβ1的细胞中ab1的初始剂量-响应分析曲线显示tgfβ1活性的抑制。使用更灵敏的caga12报告细胞系,ab1显示出对人protgfβ1活性的类似抑制。此外,如通过测量从健康供体血液中分离的t细胞的分裂t效应细胞(teff)的百分比,抑制garp复合物显示阻断t调节细胞(treg)的抑制活性(图9a)。对于ab3观察到类似的结果。人肝星状细胞和人皮肤成纤维细胞的ab3的剂量-响应分析曲线显示tgfβ1活性的抑制(图7f),并且ab3也显示抑制抑制性treg的活性(图9b)。通过对人garp-protgfβ1细胞的octet测定来测量garp-protgfβ1抑制剂的亲和力,而通过caga12报告细胞测试人garp-protgfβ1抑制来测量活性。用于测量抗体ab1和ab2对本文提供的复合物的亲和力的方案总结在表6中。结果显示在表7中。表6:用于进行octet结合测定的方案表7:garp-protgfβ1抑制剂的亲和力和活性进一步筛选克隆的结合选择性(表8)和物种交叉反应交叉反应性(表9)。ab1和ab2不与tgfβ1、tgfβ2或tgfβ3结合,但确实与protgfβ1复合物结合并显示出物种交叉反应性。表8:garp-protgfβ1抑制剂的选择性克隆garp-protgfβ1ltbp1-protgfβ1ltbp3-protgfβ1ab1+++++++++ab2+++++++++表9:garp-protgfβ1抑制剂的物种交叉反应性克隆hugarp-protgfβ1mugarp-protgfβ1cygarp-protgfβ1ab1++++++++ab2++++++++++++kd<1nm,++kd1–10nm+kd10–100nm-无结合通过octet结合测定进一步测试ab3的结合特异性。如图4a所示,ab3与潜在的tgfβ1特异性结合,但不与潜在的tgfβ2或潜在的tgfβ3结合,而pan-tgfbeta抗体不是亚型特异性的(图5)。这些数据表明ab3以亚型特异性方式结合tgfβ。实施例2:ab1、ab2和ab3特异性结合来自多个物种的protgfβ1复合物为了确定ab1、ab2和ab3是否能够特异性结合来自多个物种的protgfβ1复合物,如表6中所述进行octet结合测定。如表10(下文)所示,所有三种抗体(即ab1、ab2和ab3)特异性结合人和小鼠ltbp1-protgfβ1复合物、人ltbp3-protgfβ1复合物和人garp-protgfβ1复合物。然而,只有ab2和ab3特异性结合大鼠ltbp1-protgfβ1复合物。表10.ab1、ab2和ab3对来自多个物种的protgfβ1复合物的亲和力ab1(kd)ab2(kd)ab3(kd)人ltbp1-protgfβ116±1.35.8±0.61.1±0.07人ltbp3-protgfβ185±5.0122±3.90.12±0.04小鼠ltbp1-protgfβ1203±1361±4.00.68±0.06大鼠ltbp1-protgfβ1未检测到结合38±6.80.93±0.03人garp-protgfβ1293±2258±6.24.9±0.11实施例3:ab2和ab3与lrrc33-protgfβ1结合为了确定ab1、ab2和ab3是否结合与lrrc33复合的protgfβ1,进行octet结合测定。如图12c所示,ab1、ab2和ab3能够结合lrrc33-protgfβ1蛋白复合物。然而,ab1显示出结合lrrc33-protgfβ1蛋白复合物的缓慢结合速率(on-rate)。使用elisa进一步确认ab1、ab2和ab3与lrrc33-protgfβ1蛋白复合物的结合。实施例4:ab1、ab2和ab3抑制garp-protgfβ1和lrrc33-protgfβ1两者的活性为了确定ab1、ab2和ab3是否抑制garp-protgf-β1和/或lrrc33-protgf-β1的活性,进行了体外基于细胞的测定。在该测定系统中,用表达protgf-β1的构建体和表达呈递分子(即garp或lrrc33)的构建体共转染用β6整联蛋白稳定转染的工程化人结肠癌细胞系(sw480/β6细胞)。为了表达呈递分子,使用编码嵌合lrrc33-garp(seqidno:101)或garp的构建体。孵育转染的细胞以允许组分(整联蛋白和分别与呈递分子复合的protgfβ1)的充分表达和沉积。使用表达与tgfβ受体下游信号转导通路偶联的tgfβ受体的报告细胞(caga12细胞)测定在存在或不存在ab1或ab2或ab3的情况下tgfβ1的激活,以测量抗体的抑制活性。如图7a和7b所示,ab1、ab2和ab3抑制garp-protgf-β1和lrrc33-protgf-β1两者。使用抗体ab1和ab2进行另外的基于细胞的测定以检测garp-protgfβ1复合物或lrrc33-protgfβ1复合物的抑制。ab1和ab2抑制garp-protgf-β1和lrrc33-protgf-β1两者。在该测定中,ab1对garp-tgfβ1复合物的ic50(μg/ml)为0.445,并且ab1对lrrc33-tgfβ1复合物的ic50(μg/ml)为1.325。实施例5:用于检测ltbp-tgfβ1特异性激活的测定在一些实施方式中,本文提供的方法和组合物涉及在样品中检测ltbp-tgfβ1复合物例如ltbp1-tgfβ1复合物或ltbp3-tgfβ1复合物。a.ecm中沉积的潜在tgfβ1的激活在该测定中,在整联蛋白表达细胞中共转染呈递分子与protgfβ1。在抑制剂存在下将瞬时转染的细胞接种在测定板中。潜在的ltbp-protgfβ1复合物嵌入ecm中。然后将tgfβ报告细胞加入系统中;游离生长因子(由整联蛋白释放)发出信号并被荧光素酶测定检测到。下面的方案是用于通过整联蛋白细胞测量细胞外基质(ltbp呈递)激活的一个实施例。材料包括:mvlu1-caga12细胞(克隆4a4);sw480/β6细胞(克隆1e7)(αv亚基以高水平内源性表达;β6亚基是稳定地过表达);ln229细胞系(高水平的内源性αvβ8整联蛋白);costar白色壁tc处理96孔测定板#3903;greinerbio-onehighbinding白色不透明96孔测定板#655094;人纤连蛋白(corning#354008);p200多通道移液器;各自具有无菌过滤吸头的p20、p200和p1000移液器;无菌微量离心管和支架;无菌试剂池;0.4%台盼蓝;2ml、5ml、10ml和25ml无菌移液器;组织培养处理的100mm或150mm板;70%乙醇;opti-mem减少血清培养基(lifetech#31985-070);lipofectamine3000(lifetech#l3000015);bright-glo荧光素酶测定试剂(promega#e2620);0.25%tryspin+0.53mmedta;protgfb1表达质粒,人(sr005);ltbp1s表达质粒,人(sr044);ltbp3表达质粒,人(sr117);lrrc32(garp)表达质粒,人(sr116);和lrrc33表达质粒,人(sr386)。使用的设备包括:bioteksynergyh1读板器;tc罩;台式顶部离心机;co2培养箱37℃5%co2;37℃的水/珠浴;平台振动台;显微镜;和血细胞计数器/计数器。“caga124a4细胞”是mvlu1细胞(水貂肺上皮细胞)用caga12合成启动子稳定转染、驱动荧光素酶基因表达的衍生物。“dmem-0.1%bsa”是一种测定培养基;基础培养基是dmem(gibcocat#11995-065),培养基还含有稀释至0.1%w/v的bsa、青霉素/链霉素和4mm谷氨酰胺。“d10”是指dmem10%fbs、p/s、4mm谷氨酰胺、1%neaa、1×glutamax(gibcocat#35050061)。“sw480/β6培养基”是指d10+1000ug/mlg-418。“caga12(4a4)培养基”是指d10+0.75ug/ml嘌呤霉素。在第0天,接种细胞用于转染。用胰蛋白酶分离sw480/β6(克隆1e7)细胞并沉淀(旋转5分钟@200×g)。将细胞沉淀重悬于d10培养基中,计数每毫升的活细胞。将细胞接种在5.0e6个细胞/12ml/100mmtc培养皿中。对于caga12细胞,将细胞以1.0百万每t75瓶的密度传代用于第三天的测定。将培养物在37℃和5%co2孵育。在第1天,转染表达整联蛋白的细胞。遵循制造商用lipofectamine3000试剂转染的方案。简而言之,将以下稀释到optimemi中,每孔125ul:7.5ugdna(呈递分子)+7.5ugdna(protgfβ1),30ulp3000,和用optimemi至125ul。通过将dna移液到一起来混合孔,然后添加optimem。添加p3000,并且通过移液将所有东西混合均匀。制备lipofectamine3000的主混合物用于加入到dna混合物中:对于ltbp1测定:每孔15ullipofectamine3000,用optimemi至125ul;对于ltbp3测定:每孔45ullipofectamine3000,用optimemi至125ul。将稀释的lipofectamine3000加入到dna中,通过移液充分混合,并在室温下孵育15分钟。孵育后,通过移液将溶液混合几次,然后每皿逐滴加入250μldna:lipofectamine3000(2×125ul)。将每个培养皿轻轻旋转混合,并且将培养皿放回组织培养箱中约24小时。对于共转染,等量的各质粒通常是最佳的。然而,可以通过改变用于呈递分子和protgfβ1的质粒dna的比率来优化共转染。在第1-2天,测定板涂覆有人纤连蛋白。具体地,将冻干的纤连蛋白在超纯蒸馏水(无菌)中稀释至1mg/ml。将1mg/ml储备溶液在pbs(无菌)中稀释至19.2ug/ml。将50μl/孔加入到测定板(高结合)并在组织培养箱(37℃和5%co2)中孵育过夜。最终浓度为3.0ug/cm2。在第2天,将转染细胞铺板用于测定和抑制剂加入。首先,通过将200ul/孔pbs加入到测定板中已经存在的纤连蛋白溶液中来洗涤纤连蛋白包被。使用多通道移液器手动移除洗涤。重复洗涤,共洗涤两次。在加入细胞之前,盖上盖子使板在室温下干燥。然后通过用胰蛋白酶分离和沉淀(旋转5分钟@200×g)来铺板细胞。将沉淀重悬于测定培养基中,计数每毫升的活细胞。对于ltbp1测定,将细胞稀释至0.10e6个细胞/ml,并且每孔接种50ul(每孔5,000个细胞)。对于ltbp3测定,将细胞稀释至0.05e6个细胞/ml,并且每孔接种50ul(每孔2,500个细胞)。为了制备功能性抗体稀释液,将抗体预先稀释至载剂中的一致工作浓度。将储备抗体在载剂(pbs是最佳的,避免柠檬酸钠缓冲液)中连续稀释。将连续稀释的每个点稀释到测定培养基中以获得4×终浓度的抗体。加入每孔25ul4×抗体,并将培养物在37℃和5%co2孵育~24小时。在第3天,加入tgfβ报告细胞。用胰蛋白酶分离并沉淀(旋转5分钟@200×g)用于测定的caga12(克隆4a4)细胞。将沉淀重悬于测定培养基中,计数每毫升的活细胞。将细胞稀释至0.4e6个细胞/ml,并且每孔接种50ul(每孔20,000个细胞)。将细胞放回培养箱。在第4天,读取测定(抗体和/或报告细胞加入后16-20小时)。在读数之前,允许bright-glo试剂和测试板达到室温。使用tmlc_std方案设置bioteksynergyh1上的读取设置-此方法具有自动增益(auto-gain)设置。选择阳性对照孔用于自动比例(autoscale)(高)。每孔加入100ulbright-glo试剂。在室温下振动孵育2分钟;保护板免受光照。该板在bioteksynergyh1上读取。从该测定产生的数据反映ltbp1-tgfβ1和/或ltbp3-tgfβ1在细胞上清液中的结合活性。b.细胞表面上呈递的潜在tgfβ1的激活为了检测存在于细胞表面上的潜在tgfβ1的激活,在整联蛋白表达细胞中共转染呈递分子与protgfβ1。潜在tgfβ1通过garp或lrrc33在细胞表面表达。然后将tgfβ报告细胞和抑制剂加入到该系统中;游离生长因子(由整联蛋白释放)发出信号并通过荧光素酶测定法检测到。该测定或“直接转染”方案对于通过整联蛋白细胞激活细胞表面呈递的tgfβ1(garp或lrrc33呈递物)是最佳的。使用的材料包括:mvlu1-caga12细胞(克隆4a4);sw480/β6细胞(克隆1e7)(αv亚基以高水平内源性表达;β6亚基是稳定地过表达);ln229细胞系(高水平的内源性αvβ8整联蛋白);costar白色壁tc处理96孔测定板#3903;greinerbio-onehighbinding白色不透明96孔测定板#655094;人纤连蛋白(corning#354008);p200多通道移液器;各自具有无菌过滤吸头的p20、p200和p1000移液器;无菌微量离心管和支架;无菌试剂池;0.4%台盼蓝;2ml、5ml、10ml和25ml无菌移液器;组织培养处理100mm或150mm板;70%乙醇;opti-mem减少血清培养基(lifetech#31985-070);lipofectamine3000(lifetech#l3000015);bright-glo荧光素酶测定试剂(promega#e2620);0.25%tryspin+0.53mmedta;protgfb1表达质粒,人(sr005);ltbp1s表达质粒,人(sr044);ltbp3表达质粒,人(sr117);lrrc32(garp)表达质粒,人(sr116);和lrrc33表达质粒,人(sr386)。使用的设备包括:bioteksynergyh1读板器;tc罩;台式顶部离心机;co2培养箱37℃5%co2;37℃的水/珠浴;平台振动台;显微镜;和血细胞计数器/计数器。术语“caga124a4细胞”是指mvlu1细胞(水貂肺上皮细胞)用caga12合成启动子稳定转染、驱动荧光素酶基因表达的衍生物。“dmem-0.1%bsa”是指一种测定培养基;基础培养基是dmem(gibcocat#11995-065),培养基还含有稀释至0.1%w/v的bsa、青霉素/链霉素和4mm谷氨酰胺。“d10”是指dmem10%fbs、p/s、4mm谷氨酰胺、1%neaa、1×glutamax(gibcocat#35050061)。“sw480/β6培养基”是指d10+1000ug/mlg-418。“caga12(4a4)培养基”是指d10+0.75ug/ml嘌呤霉素。在第0天,接种整联蛋白表达细胞用于转染。用胰蛋白酶分离细胞并沉淀(旋转5分钟@200×g)。将细胞沉淀重悬于d10培养基中,计数每毫升的活细胞。将细胞稀释至0.1e6个细胞/ml并每孔100ul(每孔10,000个细胞)接种到测定板中。对于caga12细胞,以1.5百万每t75瓶的密度传代用于第二天的测定。将培养物在37℃和5%co2孵育。在第1天,转染细胞。遵循制造商的方案用lipofectamine3000试剂转染。简而言之,将以下稀释到optimemi中,每孔5ul:0.1ugdna(呈递分子)+0.1ugdna(protgfβ1),0.4ulp3000,和用optimemi至5ul。通过将dna移液到一起来混合孔,然后添加optimem。添加p3000,并且通过移液将所有东西混合均匀。制备lipofectamine3000的主混合物用于加入到dna混合物中:每孔0.2ullipofectamine3000,用optimemi至5ul。将稀释的lipofectamine3000加入到dna中,通过移液充分混合,并在室温下孵育15分钟。孵育后,通过移液将溶液混合几次,然后每孔加入10μldna:lipofectamine3000(2×5ul)。将细胞板放回组织培养箱中约24小时。在第2天,加入该抗体和tgfβ报告细胞。为了制备功能性抗体稀释液,将载剂(pbs是最佳的)中的储备抗体连续稀释。然后将每个点稀释到测定培养基中得到2×终浓度的抗体。制备抗体后,用测定培养基通过抽吸(真空吸气器)然后加入100μl/孔测定培养基洗涤细胞板两次。第二次洗涤后,用每孔50μl的2×抗体替换测定培养基。将细胞板放回培养箱中约15-20分钟。为了制备用于测定的caga12(克隆4a4)细胞,用胰蛋白酶分离和沉淀(旋转5分钟@200×g)细胞。将沉淀重悬于测定培养基中,计数每毫升的活细胞。将细胞稀释至0.3e6个细胞/ml,并且每孔接种50μl(每孔15,000个细胞)。将细胞放回培养箱。在第3天,在加入抗体和/或报告细胞后约16-20小时,读取该测定。在读数之前,允许bright-glo试剂和测试板达到室温。使用tmlc_std方案设置bioteksynergyh1上的读取设置-此方法具有自动增益(auto-gain)设置。设置阳性对照孔用于自动比例(autoscale)(高)。每孔加入100ulbright-glo试剂。在室温下摇动孵育2分钟;保护板免受光照。该板在bioteksynergyh1上读取。从该测定产生的数据反映了在细胞上清液中tgfβ1的活性。原始数据单位是相对光单位(rlu)。具有高rlu值的样品含有大量游离tgfβ1,具有低rlu值的样品含有低水平的tgfβ1。实施例6:ab1和ab2抑制人和鼠成纤维细胞中的内源tgfβ1为了确定ab1和ab2是否能够抑制不同来源的原代培养成纤维细胞分泌的内源性tgf-β1,进行了定量体外测定,其中通过测量稳定转染包含与caga12合成启动子融合的荧光素酶报告基因的核酸并与用ab1或ab2处理的成纤维细胞共培养的水貂肺上皮细胞产生的荧光素酶水平来确定分泌的tgf-β1的活性。如图7g和7h所示,ab1和ab2两者均抑制正常人皮肤成纤维细胞、鼠c57bl.6j肺成纤维细胞和dba2/j肌成纤维细胞分泌内源性tgf-β1。用每种抗体观察到的最大抑制的差异是细胞系特异性的。实施例7:在体外整联蛋白诱导的tgfβ1激活中基质硬度的作用和tgfβ1特异性、背景非依赖性抗体的影响为了检测具有不同程度硬度的基质是否可以调节tgfβ1激活,将控制硬度(5kpa、15kpa和100kpa)的硅基质用于测量接种在其上的初级成纤维细胞中的tgfβ1的整联蛋白依赖性激活。简言之,用protgfβ1和ltbp1共转染sw480细胞以允许细胞外呈递潜在的tgfβ1复合物。将过表达αvβ6整联蛋白的细胞加入到测定系统中以触发tgfβ1的激活。通过测量tgfβ响应性报告基因激活来确定tgfβ1激活。在这种情况下,在其他条件相同的情况下,αvβ6整联蛋白在测试的高硬度(100kpa)的硅基质上铺板的细胞中相比于在具有较低(5或15kpa)硬度的硅基质上培养的细胞中引起ltbp1介导的tgfβ1激活大约增加两倍。本发明人已经发现,在所测试的所有硬度下与没有抗体的对照相比,tgfβ1激活的亚型特异性、背景许可性抑制剂(例如本文所述的那些)可以抑制这种效应,将tgfβ1激活降低至约一半水平。实施例8:tgfβ1特异性、背景非依赖性抗体对体外蛋白酶诱导的tgfβ1激活的影响为了测试体外tgfβ1的整联蛋白非依赖性、蛋白酶依赖性激活,纯化的重组ltbp3-protgfβ1复合物与激肽释放酶(klk)一起孵育,并且使用所描述的报告细胞系统测量tgfβ1激活。在与klk孵育后而不是与单独的载剂孵育后,tgfβ1从潜在复合物中释放,表明ecm相关的tgfβ1活性可以以蛋白酶依赖性方式触发。为了进一步测试亚型特异性、背景非依赖性抑制剂抗体抑制tgfβ1激活的替代模式(例如整联蛋白非依赖性)的能力,建立体外测定以评估tgfβ1的激肽释放酶激活。简而言之,在测定开始前24小时接种caga报告细胞。将protgfβ-c4s滴定到caga细胞上。以1μg/ml或500ng/ml的固定浓度添加血浆-klk蛋白酶。将测定混合物孵育约18小时。tgfβ激活通过荧光素酶测定测量。数据显示在图8中。在klk的存在下,protgfβ1被激活(阳性对照)。该tgfβ激活通过加入ab3被有效地抑制,这表明,除了tgfβ1的整联蛋白依赖性激活,亚型特异性、背景非依赖性抑制性抗体也可以在体外阻断tgfβ1的klk依赖性激活。类似地,加入ab1也观察到klk激活的tgfβ1的抑制(数据未显示)。实施例9:lrrc33在极化和激活的巨噬细胞中的表达。以前描述了tgfβ信号传导参与巨噬细胞的成熟和分化和最终表型。已经提出单核细胞衍生的巨噬细胞表达lrrc33。对极化巨噬细胞的进一步研究表明,并非所有极化巨噬细胞都表达lrrc33。我们发现所谓的经典m1型巨噬细胞显示lrrc33的低表达,而m2巨噬细胞显示lrrc33表达升高。出乎意料的是,在m2巨噬细胞的亚型中,我们仅在m2c和m2d、tam样巨噬细胞中观察到lrrc33表达。前者是所谓的“促纤维化”巨噬细胞,后者是“tam样”或模仿肿瘤相关表型。这些结果表明lrrc33表达局限于极化巨噬细胞的选择性子集。证据表明肿瘤细胞和/或周围的肿瘤基质细胞分泌许多细胞因子、生长因子和趋化因子,这可能影响tme中各种细胞的表型(例如,激活、分化)。例如,巨噬细胞集落刺激因子(m-csf也称为csf-1)是已知的肿瘤衍生因子,其可以调节tam激活和表型。进行荧光激活细胞分选(facs)分析以检查m-csf暴露对巨噬细胞中lrrc33表达的影响。简而言之,从健康供体收集人pbmc。将原代细胞在含有10%人血清和gm-csf或m-csf的培养基中培养一周。为了诱导各种m2巨噬细胞表型,在il-10和tgfβ存在下将细胞培养另外2-3天用于m2c亚型,并在il-6存在下将细胞培养另外2-3天用于m2d亚型。将如图中所示的针对细胞表面标志物的抗体用于facs分析。cd14+免疫磁性选择表明单核细胞。令人惊讶的是,结果显示,暴露于m-csf(也称为csf-1)后,巨噬细胞上的细胞表面lrrc33的上调显著增加。图10a显示m-csf处理的巨噬细胞均匀地是m2极化的巨噬细胞。此外,m-csf暴露导致巨噬细胞在细胞表面上均匀地表达lrrc33(参见图10b)。如图10c中总结的,观察到在m-csf激活的巨噬细胞上的稳健lrrc33表达。这些结果表明肿瘤衍生因子例如m-csf可诱导局部巨噬细胞激活以支持肿瘤生长。实施例10:ab3对体内调节性t(treg)细胞活性的影响garp已显示在调节性t细胞上表达。使用t细胞转移结肠炎模型评估ab3对体内调节性t细胞活性的影响(powrie等,1993internationalimmunology,5(11):1464-1474;powrie等,1994immunity,1:553-562;powrie等,1996j.exp.med.,186:2669-2674)。已知将cd45rbhit细胞转移到严重的联合免疫缺陷(scid)小鼠中诱导结肠炎,并且cd45rblocd25+调节性t细胞(treg)的共转移抑制结肠炎发展并对小鼠表现出保护作用。如图11所示,接受30mg/kgab3的小鼠消除了cd45rblocd25+treg的共转移所表明的保护作用。具体地,与igg对照相比,接受30mg/kgab3的小鼠证实在近端结肠炎症评分和结肠重量与长度的比率显著增加,并且体重增加显著减少。这些数据表明ab3能够抑制体内调节性t细胞活性。实施例11:单独的ab1和ab2或与抗pd-1抗体组合对mc38小鼠结肠癌同系(syngeneic)小鼠模型中肿瘤进展的影响为了评价单独的ab1和ab2或与抗pd-1抗体组合对降低结肠癌肿瘤进展的影响,使用了mc38鼠结肠癌c57bl/6小鼠同系模型。肿瘤细胞培养mc38小鼠结肠癌细胞在含有10%胎牛血清、100单位/ml青霉素g钠、100μg/ml硫酸链霉素,25μg/ml庆大霉素和2mm谷氨酰胺的dulbecco’smodifiedeagle’smedium(dmem)中生长。在潮湿的培养箱中于37℃下在5%co2和95%空气的气氛中,将细胞培养物保持在组织培养瓶中。体内植入和肿瘤生长对数期生长期间收获用于植入的mc38细胞并再悬浮于磷酸盐缓冲盐水(pbs)。在肿瘤植入当天,将每只测试小鼠在右侧腹皮下注射5×105个细胞(0.1ml细胞悬浮液),并随着平均尺寸接近80至120mm3的目标范围监测肿瘤生长。11天后,指定为研究的第1天,根据计算的肿瘤大小将小鼠分成各由个体肿瘤体积为63至196mm3的范围、组平均肿瘤体积为95至98mm3的12只动物组成的组。使用卡尺在两个维度上测量肿瘤,并使用以下公式计算体积:其中w=肿瘤的宽度(mm)和l=长度(mm)。可以假设1mg相当于1mm3肿瘤体积来估计肿瘤重量。处理简言之,在第1天对携带皮下mc38肿瘤(63-172mm3)的8周龄雌性c57bl/6小鼠(n=12)腹膜内(i.p.)施用ab1、ab2、鼠igg1对照抗体(各自为30mg/kg,剂量体积为10ml/kg),每周两次,持续4周。当对照组中肿瘤达到150mm3(第6天),向小鼠腹膜内施用大鼠抗小鼠pd-1抗体(rmp1-14)或大鼠igg2a对照抗体,每周两次,持续两周(抗体各自为5mg/kg,剂量体积为10ml/kg)。第1组作为肿瘤生长的对照,并且接受鼠igg1同种型对照抗体与大鼠igg2a对照抗体的组合。第2组接受ab1与大鼠igg2a对照抗体的组合。第3组接受ab2与大鼠igg2a对照抗体的组合。第3组接受鼠igg1对照抗体与抗pd-1抗体的组合。第4组接受ab1与抗pd-1抗体的组合。第5组接受ab2与抗pd-1抗体的组合。第6组(n=16)未接受处理,并作为样品对照组。终点和肿瘤生长延迟(tgd)分析每周两次使用卡尺测量肿瘤,并且当动物肿瘤达到1000mm3终点体积或在研究结束时(第60天)(以较早发生者为准)动物各自安乐死。因为肿瘤体积终点退出研究的小鼠记录为因为肿瘤进展(tp)安乐死以及安乐死日期。根据2017年9月13日提交的美国临时申请号62/558,311中描述的方法计算每只小鼠的终点时间(tte)用于分析。mtv和消退响应标准处理功效可以从最后一天的研究中残留的动物的肿瘤体积来确定。mtv(n)定义为研究最后一天在其肿瘤未达到终点体积的残留的动物的数量(n)中的中位(median)肿瘤体积。处理功效也可以从研究中观察到的发病率和消退响应幅度来确定。处理可能导致动物肿瘤的部分消退(pr)或完全消退(cr)。在pr响应中,在研究过程中连续三次测量的肿瘤体积为其第1天体积的50%或更少,并且对于这三次测量中的一次或多次测量,肿瘤体积等于或大于13.5mm3。在cr响应中,在研究过程中连续三次测量的肿瘤体积小于13.5mm3。在研究结束时具有cr应答的动物另外被分类为无肿瘤存活者(tfs)。监测动物的消退响应。肿瘤生长抑制肿瘤生长抑制(tgi)分析评估处理的和对照小鼠的中位肿瘤体积(mtv)之差。对于该研究,确定tgi的终点是第29天,这是对照小鼠的平均肿瘤体积达到1500mm3的当天。测定各组的mtv(n),即tgi分析当天的动物数量n的中位肿瘤体积。肿瘤生长抑制百分比(%tgi)定义为指定对照组的mtv与药物处理组的mtv之间的差异,表示为对照组的mtv的百分比:用于tgi分析的数据组包括在组中的所有小鼠,除了在tgi分析的当天之前死于处理相关(tr)或非处理相关(ntr)原因的小鼠。在本研究中,在mc38鼠结肠癌c57bl/6小鼠同系模型中评估ab1和ab2单独和与抗pd-1的组合。施用ab2与抗pd-1的组合的小鼠导致显著的第29天tgi(p<0.05,mann-whitneyu检验),产生使用logrank存活分析与载剂处理的对照在统计学上显著不同的存活益处(p<0.05,logrank)(参见图16)。接受ab1或ab2与大鼠igg2a对照抗体的组合的小鼠分别具有1cr和1pr的消退响应。与抗pd-1组合,ab1和ab2的消退响应分别为1pr和1cr,以及4cr。ab2与抗pd-1组合在第29天产生显著的短期功效,并且在mc38鼠结肠癌c57bl/6小鼠同系模型中的这60天tgd研究中产生总体存活益处。实施例12:ab3与pd-1抑制剂的组合对tgfβ1/3模型的存活的体内效果emt-6是一种原位(orthotopic)小鼠肿瘤模型,其中单独的免疫检查点抑制剂处理对肿瘤生长和存活显示出有限的效果。发明人已经认识到,多种tgfβ亚型在某些同系肿瘤模型中表达,如通过rnaseq所评估。tgfβ1和tgfβ3两者在emt-6中是共同显性(参见图21),其以几乎相等的量表达。因此,本发明人推断,在该特定模型中,tgfβ亚型的泛(pan)抑制剂与亚型选择性抑制剂相比可提供更广泛的体内功效。研究设计为了测试该假设,8-12周龄雌性balb/c小鼠用在0%matrigel中的含有5×106emt6乳腺癌细胞的0.1ml在侧腹皮下注射。在整个研究中每两周监测动物的体重和肿瘤卡尺测量。当肿瘤达到30-80mm3的体积时,将动物随机分成6组,并如下开始给药:组1:huneg-rigg1/huneg-migg1;组2:抗pd1-rigg1/huneg-migg1;组3:抗pd1-rigg1/pan-tgfβab-migg1;组4:抗pd1-rigg1/ab3-migg1;组5:huneg-rigg1/pan-tgfβab-migg1;和组6:huneg-rigg1/ab3-migg1。抗pd1克隆是rmp1-14(bioxcell)并以5mg/kg施用,每周两次。huneg-rigg1用作同种型对照并且类似地给药。ab3-migg1以30mg/kg给药,每周一次,并且huneg-migg1被类似地给药。pan-tgfβab-migg1以5mg/kg给药,一周两次。所有给药均以10ml/kg腹膜内进行。当肿瘤超过2000mm3时,处死动物,收集血清,取出肿瘤并快速冷冻用于最终分析。没有动物因为显著的体重减轻而被处死,组2中的一只动物被发现死亡(未确定与处理相关)。结果emt6是一种快速进展的同系肿瘤模型。组1和组6动物的中位生存期为18天,这在该模型中是典型不具有处理效果。已知抗pd-1在该模型中具有有限的效果,并且因此,当单独施用时(组2)中位存活增加到19.5天。组5的中位生存期也微小增加至21天。组4的生存期适度增加至25天,其中两只动物在第34天仍存活。组3在第34天前只有3例死亡事件,表示这种组合的显著存活效果。通过单独施用ab3-migg1抑制tgfβ1对肿瘤体积生长没有影响,然而与抗pd15一起动物显示出较慢的肿瘤生长并且一只动物表现出完全响应。单独的pan-tgfβab减慢3只动物的肿瘤生长,但与抗pd1组合,4只动物观察到肿瘤生长显著减慢,并且5只动物表现出完全响应。这些发现与公开可用的信息例如整个肿瘤rnaseq数据库(crownbiosciencemubase)一致,其显示emt6肿瘤表现出接近相等水平的tgfβ1和tgfβ3表达。实施例13:ab2和ab3对单侧输尿管闭塞(uuo)小鼠模型中肾脏生物标志物和纤维化的影响单侧输尿管闭塞小鼠模型已被广泛用于研究间质纤维化,这是一种可能导致终末期肾病的共同病理过程(参见isaka等(2008)contrib.nephrol.159:109-21,和chevalier(1999)pediatr.nephrol.13:612-9)。uuo小鼠的特征在于肾肌成纤维细胞激活、肾小管萎缩和具有最小肾小球病变的间质纤维化(参见lian等(2011)actapharmacol.sin.32:1513-21)。增加tgfβ1的表达被认为在uuo小鼠中观察到的表型中起作用。为了评估ab2对uuo小鼠模型中间质纤维化的表现的影响,进行了以下实验。简言之,7-8周龄雄性cd-1小鼠(charlesriverlaboratories)为4组小鼠(n=10),在手术干预前,腹膜内(i.p.)施用ab2(3mg/kg或30mg/kg;给药体积为10ml/kg)、鼠igg1对照抗体(30mg/kg;给药体积为10ml/kg)或pbs作为载剂对照。在手术前一天(d-1)、手术后一天(d1)和手术后3天(d3)施用处理。在第0天(d0),在鼻锥上用异氟烷麻醉麻醉小鼠,并进行剖腹手术,然后进行永久性右侧单侧uuo手术。如上所述给另外的对照组小鼠(n=8)施用pbs,但仅进行假手术(即没有输尿管闭塞的剖腹手术)。在完成手术程序后,所有小鼠立即接受一次皮下注射0.001mg/kg丁丙诺啡。手术后5天处死小鼠并收获组织用于分析。收获后,将两个肾置于冰冷的0.9%nacl中,去胶囊化并称重。评估羟脯氨酸水平以评估肾组织的胶原含量。与接受假手术的小鼠相比,接受手术干预的小鼠肾脏羟脯氨酸水平(组织纤维化和胶原沉积的标志物)显著增加。每个右肾的中间横向部分浸没固定于10%中性缓冲福尔马林中48小时,然后将其转移到70%乙醇中进行组织学处理和分析。将固定的肾切片石蜡包埋、切片(每只动物肾相距200-250μm获得三个5μm连续切片以使得能够获得更大的采样和肾损伤的代表),用天狼星红染色,并使用色谱分割进行定量组织学分析以确定皮质胶原蛋白体积分数(fraction)(cvf)。通过确定三个连续切片中的每一个的平均cvf得分,计算每只动物的一个复合cvf得分。使用非配对t检验进行统计学分析。如图12k所示,与对照假处理的小鼠相比,通过cvf确定的肾脏皮质纤维化在uuo阻塞的肾脏中增加。与接受载剂对照(pbs)或igg对照的小鼠相比,接受3mg/kg或30mg/kgab2的小鼠显示出uuo诱导的cvf增加的显著减弱。确定收获的肾组织中纤溶酶原激活物抑制剂-1(pai-1)、结缔组织生长因子(ctgf)、tgfβ1、纤维连接蛋白-1、α-平滑肌肌动蛋白(α-sma)、单核细胞趋化蛋白1(mcp)、i型胶原蛋白α1(col1a1)和iii型胶原蛋白α1链(col3a1)的相对mrna表达水平(图12a-12h)。使用管家基因次黄嘌呤磷酸核糖转移酶1(hprt1)mrna水平来标准化mrna水平。此外,与接受30mg/kgigg1对照的小鼠相比,在手术干预前接受3mg/kg或30mg/kgab2的小鼠中pai-1、ctgf、tgfβ1、纤连蛋白1、col1a1和col3a1的mrna水平显著降低。与接受30mg/kgigg1对照的小鼠相比,在手术干预之前接受3mg/kgab2的小鼠中α-sma的mrna水平显著降低。此外,与接受30mg/kgigg1对照的小鼠相比,在手术干预之前接受30mg/kgab2的小鼠中mcp-1的mrna水平显著下降。也评估了ab3对已知的纤维化标志物的mrna表达水平的影响。如图12i和12j所示,与接受igg1对照的小鼠相比,在手术干预之前接受3mg/kg或30mg/kgab3的小鼠中pai-1和col1a1的mrna水平显著降低。总之,在在uuo小鼠模型中在用ab2或ab3处理的小鼠中观察到显著效果,羟脯氨酸水平例外。如图12a-12h和12k所示,ab2处理显著减弱uuo诱导的cvf增加,并显著降低已知纤维化标志物例如pai-1、ctgf、tgfβ1、纤连蛋白1、col1a1和col3a1的基因表达。类似地,如图12i-12j所示,ab3处理显著降低已知纤维化标志物例如pai-1和col1a1的基因表达。这些数据表明tgfβ1是在肾脏疾病中发挥作用的tgfβ的主要形式,并且令人惊讶的是,tgfβ2和tgfβ3可能不参与发病机制。实施例14:tgfβ1特异性、背景非依赖性抗体对肾纤维化的鼠alport模型的影响鼠col4a3-/-模型是已建立的常染色体隐性遗传alport综合症的遗传模型。alport小鼠缺乏功能性胶原蛋白4a3(col4a3-/-),并且因此不能形成需要α3、α4和α5链的iv型胶原蛋白。col4a3-/-发展与人类患者的肾纤维化一致的肾脏纤维化,包括肾小球硬化、间质纤维化和肾小管萎缩,并且取决于小鼠的遗传背景,所有col4a3-/-小鼠在10至30周龄之间发展为终末期肾病(esrd)。col4a3-/-小鼠的肾脏病理学的结构和功能表现结合esrd的进展使col4a3-/-小鼠成为理解肾纤维化的理想模型。以前的报道指出tgfβ信号通路在这个过程中的重要性,并且已经报道用αvβ6整联蛋白(一种已知的tgfβ激活剂)或tgfβ配体陷阱的处理可预防alport小鼠的肾纤维化和炎症(hahm等(2007)theamericanjournalofpathology,170(1):110-125)。如下所示测试ab3(tgfβ1激活的亚型特异性、背景非依赖性的抑制剂)抑制或缓解alport小鼠肾纤维化的能力。来自129:bi6杂合x杂合杂交(中等进展模型)的f1后代被用于该研究。ab3的抗体给药以5mg/kg在出生后6周开始,每周两次(即10mg/kg/周),持续6周的测试持续时间。使用pan-tgfβ中和抗体作为阳性对照(以5mg/kg给药,每周两次),而igg用作阴性对照。通过腹膜内注射施用所有抗体。在抗体处理六周后(出生后12周),处死动物,并且收集肾脏用于分析。这是有据可查的,tgfβ受体激活导致细胞内事件的下游信号传导级联,包括smad2/3的磷酸化。因此,根据制造商的说明书通过elisa(cellsignaling)测定测量smad2/3的相对磷酸化水平而在肾裂解物样品中评估ab3抗体处理的效果。图15提供了显示磷酸化相对于总(磷酸化和未磷酸化)smad2/3的相对比率的图。与阴性对照相比,从用ab3处理的动物样品制备的全肾裂解物显示smad2/3的相对磷酸化显著降低。平均比率等同于杂合对照的平均比率。如上所述12周龄的alportf1小鼠在研究完成时表现出肾纤维化的早期证据,如通过胶原沉积物(天狼星红定量)和血尿素氮(bun)的累积两者来测量,每个都表明纤维化。与在下游tgfβ受体信号传导中观察到的ab3的抑制活性一致,ab3处理的组织显示纤维化迹象减少。例如,未接受ab3处理的对照alport动物的平均bun水平超过50mg/dl,而ab3处理的动物的平均bun水平降低至低于30mg/dl,表明ab3可能能够改善纤维化。实施例15:tgfβ1特异性、背景非依赖性抗体对四氯化碳诱导的肝纤维化的影响已经暗示tgfβ活性在器官纤维化的病理中发挥作用,例如肝纤维化。先前报道了可溶性tgfbrii剂在肝纤维化的四氯化碳(ccl4)模型中预防肝纤维化(yata等,hepatology,2002)。类似地,tgfβ1的反义抑制(通过腺病毒递送)改善了由于胆管结扎引起的肝纤维化(arias等,bmcgastroenterology,2003)。此外,1d11(中和tgfβ所有亚型的pan-tfgβ抗体)已经显示在taa处理的大鼠中减少肝纤维化和胆管癌(ling等,plosone,2013)。在此,四氯化碳(ccl4)诱导的肝纤维化模型小鼠用于评估tgfβ1激活的背景非依赖性抑制剂对体内纤维化的影响。通过腹膜内注射ccl4每周两次持续六周在雄性balb/c小鼠中诱导肝纤维化。在ccl4处理的前两周后,用治疗性每周一次给药的ab3(30mg/kg)处理动物。两周后开始用抗体治疗性给药并持续四周。动物基于血液化学数据随机化。在研究的ab3给药的四周期间,抽取血液样品用于血清ast/alt和总胆红素分析。每周对动物称重两次以在研究期间监测体重。在六周研究后,收集肝脏和脾脏并称重以确定肝脏:脾脏重量比。通过对天狼星红染色肝切片的组织学评估肝脏病理学。根据masson或天狼星红染色切片并在10或20×物镜观察整个切片按下列标准对肝纤维化程度进行评分表14.纤维化评分标准然后使用公式sss=clv+ps+pt+2×(ns×ws)计算纤维化分数,其中考虑到中央静脉增厚、间正弦、门和受影响的区域和组织层。如图14所总结的,每周四次给药的ab3处理显著降低ccl4诱导的肝纤维化。类似地,通过对肝的单个叶的福尔马林固定的、石蜡包埋的切片的天狼星红染色的组织定量(%面积)检测ab2和ab3以多种剂量(3、10和30mg/kg)的抗纤维化效果。定量由病理学家以盲目方式进行。与上面提供的观察结果一致,来自抗体处理的动物的肝切片显示出通过天狼星红染色测量的ccl4诱导的纤维化显著降低,其对应于组织胶原蛋白的相对量。结果显示,即使在最低测试剂量(3mg/kg)下,ab2和ab3中的每一种都有效减少肝纤维化。更具体地,与igg对照(3.356%)相比,接受于3mg/kg的ab2处理的ccl4处理的动物将胶原体积分数(%面积)降低至2.03%(p<0.0005)。类似地,与igg对照(3.356%)相比,接受于3mg/kg的ab3处理的ccl4处理的动物将胶原蛋白体积分数(%面积)降低至1.92%(p<0.0005)。未接受ccl4处理的双阴性对照动物显示背景胶原蛋白体积分数为1.14%。此外,初步数据表明,ab3处理引起磷酸化smad2/3水平的显著降低,如通过elisa测量的磷酸化相对于总smad2/3的比率,表明tgfβ下游信号转导通路在体内被tgfβ1的背景非依赖性抑制剂的施用而抑制。实施例16:tgfβ1在肌营养不良中的作用tgfβ在骨骼肌功能中起着多重作用,包括抑制肌生成、调节炎症和肌肉配对、和促进纤维化。虽然对tgfβ抑制作为广泛疾病(包括肌营养不良症)的疗法有相当大的兴趣,但这些疗法不管分子背景如何都抑制tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3。这些抑制剂缺乏特异性/选择性可能导致不希望的副作用,导致功效不足的临床给药。虽然已报道pan-tgfβ抑制分子改善mdx小鼠的肌肉功能并减少纤维化,但这些作用是否归因于tgfβ1、β2或β3的失活尚未得到解决。为此目的,已经产生特异性阻断整联蛋白介导的潜在tgfβ1的激活同时不伤害tgfβ2和β3的抗体。用protgfβ1特异性抗体处理d2.mdx小鼠,从而特异性确定tgf-β1在肌营养不良的肌肉修复中的作用。评估tgfβ1抑制对保护免受收缩诱导性损伤以及从相同的损伤方法恢复的功能性作用。组织学评估包括处理是否影响肌肉损伤、纤维化和炎症。另外,可以评估可能的毒性以确定观察到的报道的pan-tfgβ抑制剂在肌肉中的负面影响(例如,炎症增加、肌肉功能的长期缺陷)是否是由于tgfβ1或tgfβ2/3的抑制。为了了解在特定分子环境中抑制tgfβ1是否更有效和/或具有更少的负面作用(不良作用),可以评估ltbp-protgfβ1抑制剂在该模型中的功效,以从细胞外基质(ecm)呈递中理解(deconvolute)免疫细胞呈递的tgfβ1的作用,可能导致更安全和/或更有效的抗纤维化疗法。营养不良肌肉极易受到收缩诱导性损伤。损伤后,与wt相比,来自mdx小鼠的肌肉显示出力产生的显著减少和evan'sblue染料的摄取增加,表明肌肉纤维的物理损伤/损害(lovering,r.m.,等,archphysmedrehabil,2007.88(5):p.617-25)。降低收缩诱导性损伤的程度或改善损伤后恢复的治疗剂对肌营养不良患者具有显著的临床益处(bushby,k.,等,lancetneurol,2010.9(1):p.77-93)。可评估测试抑制剂,例如ab1、ab2和ab3的以下能力:i)预防收缩诱导性损伤,以及ii)促进从损伤中恢复。d2.mdx品系可用于我们的实验,而不是b10背景上的传统mdx品系。通过将mdx与dba2/j背景杂交而产生的这些小鼠具有上述ltbp4的非保护性变体,因此表现出比标准mdx品系更严重、进行性和类似于人类疾病的疾病病理学(coley,w.d.,等,hummolgenet,2016.25(1):p.130-45)。由于正在使用d2.mdx小鼠,dba2/j小鼠可用作野生型对照。由于dmd主要影响雄性,研究可能集中在雄性小鼠身上。为了检查ab1和ab2预防/限制收缩诱导性损伤的能力,用10mg/kg/周的igg对照、ab1或ab2处理6周龄雄性d2.mdx小鼠(n=10),持续6周。为了与使用pan-tgfβ抑制剂的已发表的工作进行比较,第四组用10mg/kg/周的1d11给药。所有抗体都是migg1同种型,并且此剂量先前已显示在uuo模型中有效(图12a-12k)。还包括用igg对照给药的wt组。在处死前24小时,给小鼠施用pbs中的1%evan'sblue染料(ebd)(体重的1%体积)以允许通过荧光显微镜评估肌纤维损伤。在处理结束时,对小鼠进行体内偏心收缩方案。腓肠肌的偏心损伤可以用305b肌肉杠杆系统(aurorascientific)进行,如(khairallah,r.j.,等,scisignal,2012.5(236):p.ra56)所述。简言之,进行20次偏心收缩,其间有1分钟的暂停,并且偏心期之前峰值等长(isometric)力的减小可以作为肌肉损伤的指示。可以确定力损失的程度和ebd阳性纤维的百分比。经过该方案的dba2/j小鼠在20次偏心收缩后失去30-40%的初始力。相反,d2.mdx小鼠在相同的方案后失去80%的初始力,如先前所述(pratt,s.j.,等,cellmollifesci,2015.72(1):p.153-64;khairallah,r.j.,等,scisignal,2012.5(236):p.ra56)。可以评估ab1和ab2在损伤后减少力损失的能力。在实验结束时处死小鼠,并且可以收集受伤和未受伤的腓肠肌两者以进行组织学分析。可以从两个肌肉评估ebd摄取。可测量肌纤维横截面积和纤维化程度。对于横截面积确定,来自肌肉中腹部的切片可以用缀合荧光团的小麦胚芽凝集素染色以显现细胞膜。可以使用荧光显微术将切片数字化,使用预测软件追踪细胞边界,并通过无偏自动测量确定横截面积。为了分析纤维化,可以用天狼星红(psr)染色切片,并计算每片的psr+面积。对ab1、ab2或ab3加速从收缩诱导性损伤的恢复的能力进行评估。12周龄dba2/j和d2.mdx小鼠可以经历如上所述相同的偏心收缩方案。损伤后,将小鼠分成处理组(n=10)并施用igg对照(对于wt和d2.mdx小鼠)、1d11、ab1、ab2或ab3(仅d2.mdx)。在实验期间,抗体可以10mg/kg/周给药。在损伤后7天和14天,可以测量最大峰值等长力、抽搐相对于强直(twitch-to-tetanic)的比率和力-频率关系以评估处理对损伤恢复的影响。虽然ab1、ab2和ab3抑制tgfβ1的释放而不管呈递分子如何,但是由于tgfβ1驱动的treg活性的保留,从细胞外基质(即ltbp呈递)中选择性释放tgfβ1可以在dmd中具有更大的益处。为了解决这个问题,还可以评估特异性ltbp-protgfβ1抑制性抗体的预防收缩诱导性损伤和加快损伤恢复两者的能力。实施例17:tgfβ1在急性损伤后的骨骼肌中的作用可以研究在肌损伤后tgfβ1在肌纤维再生中的特异性作用。tgfβ1特异性抗体可用于心脏毒素损伤模型以确定肌纤维再生过程中tgfβ1的特异性作用。可以组织学地评估再生,并且可以进行肌肉力量和质量的功能性评估。鉴于tgfβ1的抑制对肌肉再生的潜在益处,具有有益效果且没有观察到pan-tfgβ抑制的毒性的疗法将是非常有益的。这允许研究tgfβ1特异性抑制对卫星细胞功能的影响,并且可以提供对卫星细胞移植研究的见解。如上所述,tgfβ似乎对肌肉生物学具有多重作用,包括抑制成肌细胞的增殖和分化,以及促进萎缩和纤维化(allen,r.e.和l.k.boxhorn,jcellphysiol,1987.133(3):p.567-72;brennan,t.j.,等,procnatlacadsciusa,1991.88(9):p.3822-6;massague,j.,等,procnatlacadsciusa,1986.83(21):p.8206-10;olson,e.n.,等,jcellbiol,1986.103(5):p.1799-805;li,y.,等,amjpathol,2004.164(3):p.1007-19;mendias,c.l.,等,musclenerve,2012.45(1):p.55-9;nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21)。然而,这些研究或者在培养物中使用重组tgfβ1或者注射到由于生长因子从其分子背景中被去除而可能具有非生理学结果的小鼠中。或者,研究人员使用对tgfβ1无选择性的tgfβ抑制剂。为了评估tgfβ1的亚型特异性、背景许可性影响,可以检测多种protgfβ1抗体(例如,ab3)在ctx诱导性损伤后影响肌肉再生的能力。这些抗体是tgfβ1激活的“亚型特异性”和“背景允许性”抑制剂,使得它们特异性地抑制来自任何呈递分子的tgfβ1(而不是tgfβ2或tgfβ3)的释放,并且不结合成熟生长因子(图4b)。肌肉再生可以经由ctx注射到右腓肠肌而在雄性dba2/j小鼠(n=10)中被诱导。在损伤前一天,可以向小鼠施用10mg/kgigg对照、1d11、ab1或ab2。每周继续给药抗体直至研究结束。在损伤后第7天和第14天,可以用305c肌肉杠杆系统(aurorascientificinc.,aurora,can)在体内测量肌肉力测量。简而言之,对于跖屈肌群,通过经麻醉的小鼠经皮电刺激坐骨神经引起收缩,然后以增加的刺激频率(0.2ms脉冲,500ms训练持续时间)进行一系列刺激:1、10、20、40、60、80、100、150hz,之后是1hz的最终刺激。将确定最大峰值等长力、抽搐相对于强直的比率以及力-频率关系。在力测量之后,收集受伤的腓肠肌和比目鱼肌并准备用于组织学。肌纤维横截面积和psr+面积%可如上文实施例8中所述测定。用ab3处理可能导致降低的纤维化和改善的肌肉功能。然而,鉴于tgfβ1在调节免疫激活中的作用,我们可能会观察到用抗体增加炎症,正如用1d11处理所报道的那样(andreetta,f.,等,jneuroimmunol,2006.175(1-2):p.77-86)。如果炎症增加可以限制tgfβ1抑制的治疗效果,则可以随后评估背景特异性抗体以提供可以限制毒性的进一步的特异性程度。例如,可以使用仅抑制从ltbp释放tgfβ1的抗体,使用如上所述的读出和方法。这些抗体可以仅限制来自ecm的tgfβ1的释放,而不影响来自treg或巨噬细胞的释放。实施例18:肌肉病症中合适的tgfβ1抑制剂的选择在健康、再生和患病肌肉中protgfβ1及其呈递分子的表达分析可以提供有用的信息以帮助选择最佳治疗方法。鉴于tgfβ1的抑制在肌肉再生和修复中的潜在益处,了解在不同条件下(健康、急性损伤和慢性损伤)的骨骼肌中protgfβ1呈递(例如,在ecm或免疫细胞中)的背景可以帮助通知抗体的治疗效用,并最终提供了实现临床疗效和安全性两者所必需的特异性/选择性程度的见解。tgfβ1呈递的性质可以根据肌肉的健康状况和疾病过程而变化,这可能对任何tgfβ1靶向疗法有影响。了解这些分子的表达谱也有助于为潜在的治疗分子选择合适的给药时间。使用免疫印迹、免疫组织化学和免疫沉淀,可以在正常、急性损伤(心脏毒素损伤)和慢性再生(d2.mdx小鼠)肌肉中评估protgfβ1及其呈递分子的表达。可以在如上所述不同条件下在关键细胞类型或细胞类型子集(例如,卫星细胞、巨噬细胞、纤维-脂肪形成祖细胞等)中特异性地研究这些分子的表达。虽然tgfβ亚型的表达已经从mdx小鼠的肌肉中检测出,先前的工作集中于成熟生长因子的表达(nelson,c.a.,等,amjpathol,2011.178(6):p.2611-21;zhou,l.,等,neuromusculdisord,2006.16(1):p.32-8)。考虑到本文所述的tgfβ1抗体的靶特异性,重要的是不仅要检测用于成熟和protgfβ1的表达模式,还要检测呈递分子的表达模式,其应提供关于感兴趣的tgfβ1库的来源和/或背景的信息。理想地,期望了解潜在复合物的表达模式,而不仅仅是每种组分的表达模式。针对感兴趣的靶标筛选抗体用于蛋白质印迹和ihc。抗小鼠tgfβ1-lap、ltbp1、ltbp3和ltbp4的抗体是可商购的。抗tgfβ1-lap抗体(克隆tw7-16b4)已被广泛表征,并且在流式细胞术和蛋白质印迹两者中均有效(oida,t.和h.l.weiner,plosone,2010.5(11):p.e15523)。针对ltbp1(proteintech#22065-1-ap)和ltbp3(millipore#abt316)的抗体已经使用转染有ltbp1-protgfβ1或ltbp3-protgfβ1的sw480细胞在内部进行了验证,并且显示出对其靶标具有特异性。可以确定这些抗体用于ihc的效用。对来自健康和d2.mdx小鼠的肌肉进行切片,并在冷冻和ffpe切片上测试抗体。可以通过包括具有100×过量的纯化的靶蛋白或复合物(内部制造)的条件来验证抗体,以确保观察到的信号是特异性的。先前的工作已经鉴定特异性结合给定的潜在复合物但没有抑制活性的抗体。通过elisa证实了这些抗体的抗原结合(图4c),并且还可以评估它们在ihc中的效用(鉴于这些表位的三维结构,这些抗体作为蛋白质印迹试剂不太可能有效)。还可以通过蛋白质印迹或免疫沉淀评估来自大块组织的潜在tgfβ1复合物的存在。通过在还原和非还原条件下运行相同样品通过蛋白质印迹鉴定潜在复合物。在还原条件下,tgfβ1、lap和呈递分子分离,并且可以在相同的印迹上但使用双色蛋白质印迹方法鉴定三种分子。在非还原条件下,lap:呈递分子复合物保持相关联,而tgfβ1被释放;复合物比空呈递分子迁移得慢,并与tgfβ1-lap一起迁移。还评估了各种抗体从肌肉中免疫沉淀潜在复合物的能力,以证明tgfβ1与特定呈递分子的直接结合。一旦合适的抗体已经鉴定,取决于可用的抗体,通过western和/或ihc评估在健康、再生、和营养不良的肌肉中的表达。可以在4、8和12周龄时从dba2/j和d2.mdx小鼠收集胫骨前肌(ta)和膈肌。为了再生肌肉,可以将心脏毒素注射到12周龄dba2/j小鼠的ta中,并在损伤后3、7和14天收集肌肉。来自至少4只小鼠的组织可用于每个条件/时间点。还可以进行共染色实验以鉴定表达各种分子的细胞群(例如:巨噬细胞的cd11b、tregs的foxp3、肌原细胞的myod)。实施例19:与alk5激酶抑制剂ly2109761和pan-tgfβ抗体相比,ab2和ab3表现出降低的毒性为了评估ab2和ab3相比于小分子tgfβi型受体(alk5)激酶抑制剂ly2109761和pan-tgfβ抗体(higg4)的毒性,在大鼠中进行毒性研究。基于之前的报道即大鼠相比于小鼠对tgfβ抑制更敏感,选择大鼠作为该安全性研究的物种。在其他哺乳动物物种中也观察到在大鼠中观察到的类似毒性,例如狗、非人灵长类动物以及人类。a.研究i期简言之,向雌性f344/nhsd大鼠施用3mg/kg(1组,n=5)、30mg/kg(1组,n=5)或100mg/kg(1组,n=5)的ab2;3mg/kg(1组,n=5)、30mg/kg(1组,n=5),或100mg/kg(1组,n=5)的pan-tgfβ抗体;200mg/kg(1组,n=5)或300mg/kg(1组,n=5)的ly2109761;或pbs(ph7.4)载剂对照(1组,n=5)。接受ab2、pan-tgfβ抗体或载剂对照的动物静脉内给药一次(第1天),接受ly2109761的大鼠每天一次通过口服强饲给药7天(7个剂量)。在给药期的第1、3和7天测定动物体重。在第8天处死动物并进行尸检。如图17a的存活数据所示,与其他处理组相比,ab2表现出降低的毒性。施用300mg/kgalk5激酶抑制剂ly2109761的所有动物在垂死的条件下处死或在研究的第3、6或7天被发现死亡。在研究的第7天发现两只施用200mg/kgly2109761的动物死亡。在研究的第6天发现一只施用100mg/kgpan-tgfβ抗体的动物死亡。施用至多100mg/kgab2的所有动物存活直至终末处死。类似地,如图19a的存活数据所示,用ab3处理的大鼠相比于其它处理组表现出降低的毒性。在研究的第6天发现施用100mg/kgpan-tgfβ抗体的动物死亡。施用至多100mg/kgab3的所有动物存活至终末处死。此外,处理的毒性通过在给药阶段监测动物的体重来评估。如图18b-18e所示,以200mg/kg或300mg/kg接受ly2109761的动物在研究过程中表现出体重降低。还在死后评估动物器官重量。如表11所示,在施用≥200mg/kgly2109761的动物中观察到心脏重量增加。在施用≥30mg/kgpan-tgfβ抗体的动物中也观察到心脏重量增加。在施用至多100mg/kgab2或ab3的动物中未观察到对器官重量的影响。表11.处理组的器官重量变化ne=由于早期死亡未评估。注:各处理组的绝对体重和器官重量的比率(相对于身体或脑)的值表示为对照平均值百分比。a载剂对照=磷酸盐缓冲盐水(pbs),ph7.4。虽然在施用至多100mg/kgab2或pan-tgfβ抗体的动物中未观察到肉眼可见的结果,但在接受200mg/kg或300mg/kgly2109761的各处理组的4只动物中观察到异常形状的胸骨。在一只施用300mg/kgly2109761的动物中观察到胸腔中的2.5ml透明液体和由于过量液体(即,水肿)而增大的胸腺,在研究的第3天发现其死亡。如表12所示,在微观水平上,施用≥200mg/kgly2109761的动物表现出心脏瓣膜的发现(即心脏瓣膜病)。由于出血、内皮增生、混合的炎性细胞浸润、和/或间质增生(参见图18f,右上图),瓣膜病的特征是心脏瓣膜增厚。大多数动物有多个瓣膜受影响。此外,观察到心房发现包括极小至轻微混合炎性细胞浸润、最小出血和/或最小内皮(心内膜)增生,导致苏木精和曙红染色切片中心房嗜碱性染色增加。心肌发现也主要在心脏基部观察到,包括极小至轻微的变性/坏死、轻微的出血和/或轻微混合的炎性细胞浸润。一只施用300mg/kgly2109761的动物具有轻度坏死,伴有冠状动脉炎症。此外,两只施用200mg/kgly2109761的动物在主动脉根中具有最小的混合炎性细胞浸润或出血。表12.接受ly2109761的动物的显微心脏发现如表13和图22所示,施用≥3mg/kgpan-tgfβ抗体的动物显示出与如上所述施用ly2109761的动物中描述的类似的心脏瓣膜发现(即瓣膜病)(也参见图17f,左下图)。施用≥30mg/kgpan-tgfβ抗体的动物表现出与施用ly2109761的动物中描述的类似的心房发现。施用100mg/kgpan-tgfβ抗体的动物表现出与施用ly2109761的动物中描述的类似的心肌发现,并且施用30mg/kgpan-tgfβ抗体的动物在心肌中具有出血。一只施用100mg/kgpan-tgfβ抗体的动物具有伴有冠状动脉出血的中度壁内坏死,其与轻微的血管周围混合炎性细胞浸润有关。施用pan-tgfβ抗体和ly2109761的动物的骨发现由肉眼可见的异常形状的胸骨和胸骨终板中的肥大区和股骨和胫骨的生理的微观增加的厚度组成。与pan-tgfβ抗体相比,这些发现在施用ly2109761的动物中具有更高的发生率和/或严重性。表13.接受pan-tgfβ抗体的动物的显微心脏发现虽然少数施用ab2的动物发生最小或轻微的心脏瓣膜发现,但由于发生率低(动物和动物内心脏瓣膜的数量)、缺乏剂量响应和/或缺乏并发的骨骼发现,这些发现被认为不太可能与试验品相关。b.研究ii期在该研究的第二期,将雌性大鼠分组,并以3mg/kg(1组,n=5)、30mg/kg(1组,n=5)或100mg/kg(1组,n=5)施用ab2;以为3mg/kg(1组,n=5)、30mg/kg(1组,n=5)、100mg/kg(1组,n=5)或60mg/kg(1组,n=5)施用ab3;以200mg/kg(1组,n=5)施用ly2109761;或pbs(ph7.4)(1组,n=5),如上所述。接受ab2、ab3或载剂对照的动物每周一次静脉内给药,持续4周,体积为10ml/kg,接受ly2109761的大鼠每天一次口服强饲给药,持续5天。处死动物并进行尸检。与研究的第一期中的观察类似,在施用200ml/kgly2109761的动物中与试验品相关的心脏发现发生持续较短的时间(即5天而不是7天)。对于施用200ml/kgly2109761或≥3mg/kgpan-tgfβ抗体的动物,微观心脏发现与增加的心脏重量相关。虽然在少数施用ab2或ab3的ii期动物中发生最小会轻微的心脏瓣膜发现,但由于发生率低(动物和动物内心脏瓣膜的数量)、缺乏剂量响应和/或缺乏并发的骨骼发现。这些研究结果被认为不太可能与试验品相关。在ii期评估了其他组织;没有微观发现归因于ab2或ab3。然而,微观发现发生在施用200mg/kgly2109761的ii期动物的骨骼(胸骨、股骨和胫骨)、肝脏、胰腺(动脉)、胸腺、甲状腺、雌性生殖组织(卵巢、子宫、子宫颈和阴道)和乳腺中。胸腺发现由皮质中淋巴细胞的最小或轻微下降组成,这与肉眼可见的小胸腺和胸腺重量减少有关。胸腺淋巴细胞减少与初级试验品效果一致,或者是次级应激效果(即内源性糖皮质激素增加)。与甲状腺重量增加相关的最小的甲状腺滤泡细胞肥大与肝酶诱导相一致,这导致甲状腺素代谢增加。施用ly2109761的动物的肝脏重量增加提示肝酶诱导,但它们缺乏微观相关性。雌性生殖组织和乳腺的显微发现与发情周期减少一致,并与子宫重量减少相关。一些动物还具有乳腺发现,其特征在于肺泡和/或导管上皮细胞的小叶增生/肥大(即,雄性化),这与雌激素减少一致。c.研究结论总之,用ab2和ab3以测试的所有剂量(3ml/kg,30ml/kg或100ml/kg)处理的动物在4周期间没有表现出任何以下参数的超过背景的毒害作用:心肌细胞变性或坏死、心房出血、心肌出血、瓣膜出血、瓣膜内皮增生、瓣膜间质增生、心脏瓣膜混合炎性细胞浸润、矿化,冠状动脉出血坏死、主动脉根部炎症坏死、坏死或炎性细胞浸润心肌细胞和瓣膜病。因此,与pan-tgfβ抑制剂处理(例如,alk5激酶抑制剂ly2109761或pan-tgfβ抗体)相比,用tgfβ1激活的亚型特异性抑制剂处理令人惊讶地导致显著改善的安全性特征,例如降低的死亡率和降低的心脏毒性。实施例20:体内ab3的亚型选择性为了确认体内tgfβ1的亚型选择性抑制,进行药效研究,其中在从健康大鼠收集的支气管肺泡灌洗(bal)细胞中评估ab3对强直性(tonic)磷酸化smad2/3水平的影响。据文献报道,在稳态条件下,bal细胞主要表达tgfβ2/3,但tgfβ1少,而后者在病理条件下优先升高。将健康的spraguedawley大鼠(大约6-8周龄,在研究开始时重200-250g;charlesriver)通过体重随机分组到研究组中并如下所述给药。动物通过腹膜内注射在第1天、第8天、第15天接受测试抗体(huneg-migg1、抗整联蛋白β6抗体、或ab3)。在第16天对动物实施安乐死用于bal和血清收集。向一组对照动物以100mg/kg给药单次口服强饲(po)剂量的ly2109761(小分子alk5抑制剂),并在给药后2小时(+/-20分钟)进行安乐死用于bal收集。为了收集bal样品,全肺用5.0毫升冰冷的dulbecco磷酸盐缓冲盐水灌洗三次。合并灌洗液并立即置于湿冰上直至如下处理。将各样品的小部分(100-150μl)置于冰上以进行细胞计数。将剩余样品在1,300g(2-8℃)下离心≥10分钟。立即将细胞沉淀置于冰上。使用250μl新鲜制备的冰冷的psmad裂解缓冲液裂解沉淀。将裂解的样品以14,000g离心10分钟(2-8℃)。将得到的上清液等分并立即在液氮或干冰中快速冷冻。血清样品通过2,500g,2-8℃离心持续10分钟来处理。将血清样品在-70至-90℃冷冻。根据制造商的说明书用elisa(cellsingallingtechnologies)进行磷酸化smad2/3测定。通过磷酸化相对于总smad2/3的比率评估结果。如图20所示,在用小分子pan-tgfβ抑制剂ly2109761或针对整联蛋白β6链的单克隆抗体(其阻断整联蛋白介导的tgfβ1/3的激活)治疗的动物中,强直性smad2/3信号传导被显著抑制。相比之下,用tgfβ1亚型特异性抗体ab3处理的动物维持bal细胞中的强直性磷酸化水平,支持ab3能够选择性抑制tgfβ1激活而不干扰体内tgfβ2或tgfβ3的稳态功能的观点。实施例21:ab3:具有抗纤维化活性的新型和高度特异性tgfβ1抑制性抗体转化生长因子β1(tgfβ1)具有不同的生物学功能,包括免疫应答和组织稳态的调节。失调的tgfβ1激活与许多疾病相关,包括肾纤维化,其中慢性激活是关键的疾病驱动因素。然而,由于tgfβ1生长因子与其近亲tgfβ2和tgfβ3之间的高度同源性,真正的tgfβ1特异性抑制剂仍然难以捉摸。另一方面,pan-tgfβ抑制可引起剂量限制性心脏瓣膜病,导致长期给药的毒性问题。tgfβ表达为被蛋白水解切割成n末端前结构域(prodomain)和c末端生长因子的前蛋白(proprotein)。前结构域与生长因子保持非共价结合,阻止受体结合。这种潜在的tgfβ复合物存在于细胞或细胞外基质中,直至复合物被整联蛋白激活,释放生长因子并允许受体结合。为了鉴定tgfβ1特异性抗体,靶向相比于生长因子与tgfβ2和tgfβ3共享低得多的同源性的前结构域。鉴定了特异性结合潜在tgfβ1而与潜在tgfβ2或tgfβ3没有可检测的结合的单克隆抗体ab3。显示ab3阻断通过αvβ6或αvβ8整联蛋白对潜在tgfβ1的激活,提供了靶向tgfβ1生长因子/受体相互作用的生物制剂未实现的特异性。ab3结合并抑制在与所有四种已知的tgfβ-呈递分子的复合物中的潜在tgfβ1,允许在多种组织中靶向潜在tgfβ1。ab3阻断许多原代细胞中内源性tgfβ1的激活,包括真皮肌成纤维细胞和肝星状细胞。最后,在肾纤维化的uuo模型中测试了通过这种新机制抑制tgfβ1的体内功效,表明ab3抑制纤维化标志物至与在pan-tgfβ抗体处理的动物中实现的水平类似的水平。总之,这些数据证实潜在tgfβ1激活的抑制在临床前纤维化模型中是有效的,并且与pan-tgfβ抑制相比具有优异的安全性。实施例22:ab1(具有抗纤维化活性的抗体)对tgfβ1激活的高度特异性抑制转化生长因子β1(tgfβ1)是具有至关重要且多种多样的生物学功能(包括免疫应答和组织稳态调节)的细胞因子。tgfβ表达为被蛋白水解切割成n末端前结构域和c末端生长因子的前蛋白。分泌的生长因子与前结构域保持非共价结合,阻止受体结合和信号传导。潜在tgfβ1通过连接潜在tgfβ1与细胞外基质或细胞表面的二硫键与呈递分子共价相关联。迄今为止,已经鉴定了四种tgfβ呈递分子(ltbp1、ltbp3、garp和lrrc33)。这些呈递分子在潜在复合物的激活中起关键作用,因为它们为整联蛋白提供锚定以对潜在的tgfβ1施加牵引力,从而释放活性生长因子。失调的tgfβ1激活与许多病理有关,包括纤维化疾病,其中慢性tgfβ1的激活驱动肌成纤维细胞转分化和细胞外基质蛋白的过表达。tgfβ1在驱动纤维化中的作用已经导致开发多种抑制其活性的治疗剂。然而,发现用有效的抗pan-tgfβ抗体的抑制引起剂量限制性心脏瓣膜病,导致对该治疗方法的毒性的担心。特异性靶向tgfβ1的替代策略由于tgfβ1生长因子与其近亲tgfβ2和tgfβ3之间的高度同源性而变得复杂。靶向与tgfβ2和tgfβ3的前结构域具有低得多的同源性的tgfβ1前结构域,并且鉴定出ab3,其为特异性结合并抑制潜在tgfβ1的激活而与潜在tgfβ2或tgfβ3没有可检测的结合的完全人单克隆抗体。这种新机制允许结合并阻断tgfβ1生长因子/受体相互作用的生物制剂未实现的亚型特异性,并且防止αvβ6和αvβ8整联蛋白的潜在tgfβ1激活。ab3结合并抑制在所有四种已知的tgfβ呈递分子的复合物中的潜在tgfβ1,允许在多种组织中靶向潜在tgfβ1。ab3在体外抑制许多原代细胞中的内源性tgfβ1,包括真皮肌成纤维细胞和肝星状细胞。此外,在肾纤维化的单侧输尿管闭塞模型中测试了通过这种新机制抑制tgfβ1的体内功效。发现ab3抑制促纤维化基因的诱导至与在pan-tgfβ抗体处理的动物中实现的水平相似的水平。总之,这些数据证实潜在tgfβ1激活的抑制在临床前纤维化模型中是有效的,并且与pan-tgfβ抑制相比具有潜在的优异的安全性。实施例23:tgfβ1、tgfβ2和tgfβ3的相对表达的生物信息学分析为了评估在癌症肿瘤中tgfβ亚型的表达,对来自公开可用数据集的基因表达(rnaseq)数据进行了检查。使用公开可用的在线界面工具(firebrowse)检查cancergenomeatlas(tcga)中tgfβ亚型的表达,首先检查在正常组织和癌症组织两者中编码tgfβ亚型的rna的差异表达。选择在tcga数据库中的所有肿瘤rnaseq数据集,其有正常组织比较物,并且对tgfb1、tgfb2和tgfb3基因的表达进行了检查(图21a)。来自firebrowse界面的数据表示为每千碱基百万的读取结果的log2(rpkm)。这些数据表明在大多数肿瘤类型(灰色)中,tgfb1是tgfβ亚型中表达最丰富的转录物,相对于tgfb2的0-2和相对于tgfb3的2-4,其log2(rpkm)值一般在4-6的范围内。我们还注意到,在几种肿瘤类型中,tgfb1和tgfb3两者表达的平均水平相对于正常比较样品(黑色)升高,表明这些tgfβ亚型的表达增加可能与癌细胞相关。由于tgfβ信号传导在抑制癌症微环境中的宿主免疫系统中的潜在作用,我们有兴趣注意到tgfb1转录物在癌症类型中升高,其中抗pd1或抗pdl1疗法被批准—这些适应症在图21a上标记为灰色。注意虽然rpkm>1通常被认为是与生物学相关的基因表达相关的最小值(hebenstreit等,2011;wagner等,2013),但是对于后续分析,使用更严格的rpkm截止值(或相关测量fpkm(参见conesa等,2016))>10或>30以避免假阳性。为了比较,在图21a中指示了所有这三个阈值。图21a中的大的四分位数范围表明个体患者中tgfβ亚型表达的显著变化。为了鉴定其中至少患者群的子集具有差异表达tgfb1亚型的肿瘤的癌症,对来自tcga数据集中个别肿瘤样品的rnaseq数据进行分析,计算每千碱基百万(fpkm)片段的数目。rpkm和fpkm大致相同,尽管fpkm校正了相同转录物的相反两端的双重计数读取结果(conesa等,2016)。如果转录物的fpkm值为>30,将肿瘤样品评分为tgfb1、tgfb2、tgfb3表达阳性,并且计算表达各tgfβ亚型的各癌症类型的患者的分数(fraction)(表示为%)(图21b)。如图21b所示,tgca数据集中的大多数肿瘤类型表明是tgfb1阳性的个体样品的显著百分比,一些癌症类型包括急性髓性白血病、弥漫性大b细胞淋巴瘤、和头和颈部鳞状细胞癌在80%以上的所有肿瘤样本中表达tgfb1。与图21a中的数据一致,较少的癌症类型对tgfb2或tgfb3呈阳性,尽管几种癌症显示相同或更高百分比的tgfb3阳性的肿瘤样品,包括乳腺浸润癌、间皮瘤和肉瘤。这些数据表明癌症类型可以针对tgfβ亚型表达进行分层,并且这样的分层可用于鉴定用tgfβ亚型特异性抑制剂治疗的候选患者。为了进一步研究此假设,来自个体肿瘤样本的子集的log2(fpkm)rnaseq数据在热图中绘制(图21c),设置颜色的阈值以反映fpkm>30作为被评分为tgfb亚型阳性的最小转录物水平。每个样品被表示为在热图的单个行,并且样品通过tgfb1表达的水平排列(最高的表达水平在顶部)。与图21b中的分析一致,每种癌症类型中的大量样品对tgfb1表达呈阳性。然而,该表示还突出了许多肿瘤仅表达tgfb1转录物的事实,特别是在食管癌、膀胱尿路上皮、肺腺癌和皮肤黑色素瘤癌症类型中。有趣的是,这样的tgfb1倾斜不是所有癌症的特征,因为来自乳腺浸润癌的样品显示出比tgfb1阳性更多数量的tgfb3阳性样品。尽管如此,该分析表明β1亚型是主要的,并且在大多数情况下,是来自大量癌症患者的肿瘤中存在的唯一的tgfβ家族成员。与表明tgfβ信号传导在癌症微环境中的免疫抑制中起重要作用的数据一起,这些发现还指出tgfβ1特异性抑制在治疗这些肿瘤中的效用。为了鉴定在其中测试tgfβ1特异性抑制作为癌症治疗剂的功效的小鼠模型,对来自在小鼠同系肿瘤模型中的各种细胞系的rnaseq数据的tgfβ亚型的表达进行了分析。对于该分析,生成了数据的两个表示。首先,类似于图3中的数据,我们生成了衍生自各细胞系的肿瘤的log2(fpkm)值的热图(图21d,左)。因为该分析用于鉴定表达高tgfb1而tgfb2和tgfb3阴性的同系模型,我们主要关注避免假阴性,并且我们将我们的“阳性”阈值设为fpkm>1,远低于图21b和21c中的表示。如在图21d(左)中的数据所清楚显示,一些同系肿瘤包括mc-38、4t-1、和emt6通常共同表达显著水平的tgfβ1和tgfβ3两者。相反,a20和el4模型几乎仅仅表达tgfβ1,并且s91和p815肿瘤显示出对tgfβ1表达的强烈偏向。为了进一步评估tgfb1相对于tgfb2和/或tgfb3的差异表达,计算minδtgfb1,定义为log2(fpkmtgfb1)-log2(fpkmtgfb2)或log2(fpkmtgfb1)-log2(fpkmtgfb3)的较小值。各模型的minδtgfb1在图21d(右)中显示为热图,并且强调了图21d(左)的结论,即来自a20、el4、s91和/或p815细胞系的同系肿瘤可以代表用于检测tgfβ1特异性抑制剂功效的优异模型。在上文各个部分提到的本发明的各种特征和实施方式视情况而定加以必要的变更适用于其它部分。因此,一个部分中指定的特征视情况而定可以与其他部分中指定的特征组合。本领域技术人员将认识到或能够通过不超过常规的实验确定本文所述的本发明的具体实施方式的许多等同物。这样的等同物旨在由以下权利要求涵盖。当前第1页12
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