1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用的制作方法

文档序号:19160326发布日期:2019-11-16 01:16阅读:444来源:国知局
1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用的制作方法
本发明涉及snp分子标记领域,具体而言,涉及1073个snp位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用。
背景技术
:结核病(tuberculosis,tb)是由结核分枝杆菌感染引起的慢性传染病。引起结核病的病原菌为结核分枝杆菌(m.tbs),目前m.tb分为7个谱系(lineage1-lineage7),与lineage2和lineage4相比,lineage3古老、致病性弱、数量少、在全球流行区域局限,并且遗传多态性等遗传进化规律的研究极其落后。因此,有必要对结核分枝杆菌的谱系3进行细分,实现其菌株水平鉴定。目前,结核分枝杆菌的分型方法主要有:数目可变串联重复序列(variablenumbertandemrepeatsvntr)分型、单核苷酸多态性(snp)分型,以及全基因组序列(wholegenomicsequences,wgs)分析技术。vntr是最常用的分型方法,该方法实现了结核分枝杆菌菌株水平鉴定,操作简单、便捷,只需提取24个基因位点信息就可对其分型,并且结果易判读,然而,该方法存在同源异质性的缺点。wgs技术是目前m.tb最好的基因分型方法,不但具有高分辨率,而且克服了同源异质性的缺点,但是运用全部基因组信息分析运算量庞大。有鉴于此,特提出本发明。技术实现要素:本发明的第一目的在于提供1073个snp位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用,以缓解现有技术中缺少相关snp位点的问题。本发明的第二目的在于提供用于检测1073个snp位点的物质在结核分枝杆菌谱系3中的应用,以缓解现有技术中缺少结核分枝杆菌谱系3进行菌株水平鉴定或进化分析或亚谱系的产品的问题。本发明的第三目的在于提供一种对结核分枝杆菌谱系3进行亚谱系判断或菌株水平鉴定或进化分析的试剂盒和方法,实现结核分枝杆菌谱系3菌株水平的准确鉴定,具有更高的分辨率,同时克服了同源异质性和数据繁杂的缺点。为了实现本发明的上述目的,特采用以下技术方案:1073个snp位点针对结核分枝杆菌谱系3,在如下至少一种中的应用:1)亚谱系判断;2)菌株水平鉴定;3)进化分析;上述1073个snp位点的物理位置来源于accesionnumber为nc_000962.3的结核分枝杆菌h37rv的全基因组序列;具体包括:snp位点1为结核分枝杆菌的染色体的1419位点,序列为c/g;snp位点2为结核分枝杆菌的染色体的1829位点,序列为t/c;snp位点3为结核分枝杆菌的染色体的2039位点,序列为g/c;snp位点4为结核分枝杆菌的染色体的3446位点,序列为c/t;snp位点5为结核分枝杆菌的染色体的9341位点,序列为c/t;snp位点6为结核分枝杆菌的染色体的10043位点,序列为c/g;snp位点7为结核分枝杆菌的染色体的10407位点,序列为g/t;snp位点8为结核分枝杆菌的染色体的11410位点,序列为g/a;snp位点9为结核分枝杆菌的染色体的12297位点,序列为c/t;snp位点10为结核分枝杆菌的染色体的12990位点,序列为g/a;snp位点11为结核分枝杆菌的染色体的13376位点,序列为c/g;snp位点12为结核分枝杆菌的染色体的16643位点,序列为c/t;snp位点13为结核分枝杆菌的染色体的17842位点,序列为g/c;snp位点14为结核分枝杆菌的染色体的24007位点,序列为g/t;snp位点15为结核分枝杆菌的染色体的24904位点,序列为g/a;snp位点16为结核分枝杆菌的染色体的28082位点,序列为g/c;snp位点17为结核分枝杆菌的染色体的37450位点,序列为c/g;snp位点18为结核分枝杆菌的染色体的39030位点,序列为c/t;snp位点19为结核分枝杆菌的染色体的40675位点,序列为c/g;snp位点20为结核分枝杆菌的染色体的42519位点,序列为c/g;snp位点21为结核分枝杆菌的染色体的47241位点,序列为c/g;snp位点22为结核分枝杆菌的染色体的53128位点,序列为a/c;snp位点23为结核分枝杆菌的染色体的59223位点,序列为c/t;snp位点24为结核分枝杆菌的染色体的61742位点,序列为g/c;snp位点25为结核分枝杆菌的染色体的63885位点,序列为a/g;snp位点26为结核分枝杆菌的染色体的65083位点,序列为g/a;snp位点27为结核分枝杆菌的染色体的65631位点,序列为g/a;snp位点28为结核分枝杆菌的染色体的66632位点,序列为c/t;snp位点29为结核分枝杆菌的染色体的68380位点,序列为t/g;snp位点30为结核分枝杆菌的染色体的79379位点,序列为a/c;snp位点31为结核分枝杆菌的染色体的83069位点,序列为t/c;snp位点32为结核分枝杆菌的染色体的84931位点,序列为a/g;snp位点33为结核分枝杆菌的染色体的89451位点,序列为c/a;snp位点34为结核分枝杆菌的染色体的93729位点,序列为c/g;snp位点35为结核分枝杆菌的染色体的99223位点,序列为c/g;snp位点36为结核分枝杆菌的染色体的99604位点,序列为c/g;snp位点37为结核分枝杆菌的染色体的99870位点,序列为c/a;snp位点38为结核分枝杆菌的染色体的100029位点,序列为g/c;snp位点39为结核分枝杆菌的染色体的100137位点,序列为t/c;snp位点40为结核分枝杆菌的染色体的100465位点,序列为c/g;snp位点41为结核分枝杆菌的染色体的101314位点,序列为g/a;snp位点42为结核分枝杆菌的染色体的103930位点,序列为g/c;snp位点43为结核分枝杆菌的染色体的104830位点,序列为c/a;snp位点44为结核分枝杆菌的染色体的111821位点,序列为c/t;snp位点45为结核分枝杆菌的染色体的113872位点,序列为c/t;snp位点46为结核分枝杆菌的染色体的117389位点,序列为c/t;snp位点47为结核分枝杆菌的染色体的117566位点,序列为t/g;snp位点48为结核分枝杆菌的染色体的122499位点,序列为c/t;snp位点49为结核分枝杆菌的染色体的123745位点,序列为g/a;snp位点50为结核分枝杆菌的染色体的130693位点,序列为c/g;snp位点51为结核分枝杆菌的染色体的132954位点,序列为c/g;snp位点52为结核分枝杆菌的染色体的133524位点,序列为g/a;snp位点53为结核分枝杆菌的染色体的135503位点,序列为g/a;snp位点54为结核分枝杆菌的染色体的140750位点,序列为g/c;snp位点55为结核分枝杆菌的染色体的142113位点,序列为c/g;snp位点56为结核分枝杆菌的染色体的144865位点,序列为c/t;snp位点57为结核分枝杆菌的染色体的145164位点,序列为g/c;snp位点58为结核分枝杆菌的染色体的149838位点,序列为c/a;snp位点59为结核分枝杆菌的染色体的153818位点,序列为g/c;snp位点60为结核分枝杆菌的染色体的160736位点,序列为c/g;snp位点61为结核分枝杆菌的染色体的168176位点,序列为g/t;snp位点62为结核分枝杆菌的染色体的170277位点,序列为c/t;snp位点63为结核分枝杆菌的染色体的175911位点,序列为c/a;snp位点64为结核分枝杆菌的染色体的187990位点,序列为c/a;snp位点65为结核分枝杆菌的染色体的198401位点,序列为g/t;snp位点66为结核分枝杆菌的染色体的200736位点,序列为a/g;snp位点67为结核分枝杆菌的染色体的204866位点,序列为t/g;snp位点68为结核分枝杆菌的染色体的206128位点,序列为c/g;snp位点69为结核分枝杆菌的染色体的206386位点,序列为t/c;snp位点70为结核分枝杆菌的染色体的208425位点,序列为c/t;snp位点71为结核分枝杆菌的染色体的208811位点,序列为g/a;snp位点72为结核分枝杆菌的染色体的218816位点,序列为g/c;snp位点73为结核分枝杆菌的染色体的231581位点,序列为g/a;snp位点74为结核分枝杆菌的染色体的233212位点,序列为c/t;snp位点75为结核分枝杆菌的染色体的233238位点,序列为c/t;snp位点76为结核分枝杆菌的染色体的233963位点,序列为a/g;snp位点77为结核分枝杆菌的染色体的235716位点,序列为t/c;snp位点78为结核分枝杆菌的染色体的237116位点,序列为c/t;snp位点79为结核分枝杆菌的染色体的241758位点,序列为g/a;snp位点80为结核分枝杆菌的染色体的257071位点,序列为c/t;snp位点81为结核分枝杆菌的染色体的267617位点,序列为c/t;snp位点82为结核分枝杆菌的染色体的276633位点,序列为c/t;snp位点83为结核分枝杆菌的染色体的283496位点,序列为g/a;snp位点84为结核分枝杆菌的染色体的284146位点,序列为t/g;snp位点85为结核分枝杆菌的染色体的288715位点,序列为c/t;snp位点86为结核分枝杆菌的染色体的301839位点,序列为c/t;snp位点87为结核分枝杆菌的染色体的304045位点,序列为g/a;snp位点88为结核分枝杆菌的染色体的307823位点,序列为g/a;snp位点89为结核分枝杆菌的染色体的310972位点,序列为c/t;snp位点90为结核分枝杆菌的染色体的316184位点,序列为c/g;snp位点91为结核分枝杆菌的染色体的323414位点,序列为t/c;snp位点92为结核分枝杆菌的染色体的327789位点,序列为c/t;snp位点93为结核分枝杆菌的染色体的330340位点,序列为g/a;snp位点94为结核分枝杆菌的染色体的330710位点,序列为a/g;snp位点95为结核分枝杆菌的染色体的332231位点,序列为g/a;snp位点96为结核分枝杆菌的染色体的332522位点,序列为g/c;snp位点97为结核分枝杆菌的染色体的334151位点,序列为a/g;snp位点98为结核分枝杆菌的染色体的334153位点,序列为t/c;snp位点99为结核分枝杆菌的染色体的335642位点,序列为a/g;snp位点100为结核分枝杆菌的染色体的335643位点,序列为g/t;snp位点101为结核分枝杆菌的染色体的335651位点,序列为g/c;snp位点102为结核分枝杆菌的染色体的335654位点,序列为g/a;snp位点103为结核分枝杆菌的染色体的335847位点,序列为c/a;snp位点104为结核分枝杆菌的染色体的335919位点,序列为t/g;snp位点105为结核分枝杆菌的染色体的335920位点,序列为c/g;snp位点106为结核分枝杆菌的染色体的335922位点,序列为c/g;snp位点107为结核分枝杆菌的染色体的335927位点,序列为a/g;snp位点108为结核分枝杆菌的染色体的335929位点,序列为t/c;snp位点109为结核分枝杆菌的染色体的336728位点,序列为g/a;snp位点110为结核分枝杆菌的染色体的336957位点,序列为t/c;snp位点111为结核分枝杆菌的染色体的336975位点,序列为t/g;snp位点112为结核分枝杆菌的染色体的336976位点,序列为t/c;snp位点113为结核分枝杆菌的染色体的338561位点,序列为g/a;snp位点114为结核分枝杆菌的染色体的338618位点,序列为c/g;snp位点115为结核分枝杆菌的染色体的338648位点,序列为t/g;snp位点116为结核分枝杆菌的染色体的338669位点,序列为t/c;snp位点117为结核分枝杆菌的染色体的338682位点,序列为t/g;snp位点118为结核分枝杆菌的染色体的338683位点,序列为c/g;snp位点119为结核分枝杆菌的染色体的338685位点,序列为c/g;snp位点120为结核分枝杆菌的染色体的338690位点,序列为a/g;snp位点121为结核分枝杆菌的染色体的338692位点,序列为t/c;snp位点122为结核分枝杆菌的染色体的338810位点,序列为g/c;snp位点123为结核分枝杆菌的染色体的338876位点,序列为g/a;snp位点124为结核分枝杆菌的染色体的338903位点,序列为g/c;snp位点125为结核分枝杆菌的染色体的339230位点,序列为g/c;snp位点126为结核分枝杆菌的染色体的342381位点,序列为g/a;snp位点127为结核分枝杆菌的染色体的342382位点,序列为c/t;snp位点128为结核分枝杆菌的染色体的348386位点,序列为c/t;snp位点129为结核分枝杆菌的染色体的350088位点,序列为c/a;snp位点130为结核分枝杆菌的染色体的350388位点,序列为g/t;snp位点131为结核分枝杆菌的染色体的353197位点,序列为c/t;snp位点132为结核分枝杆菌的染色体的358567位点,序列为c/t;snp位点133为结核分枝杆菌的染色体的367508位点,序列为c/g;snp位点134为结核分枝杆菌的染色体的369886位点,序列为c/g;snp位点135为结核分枝杆菌的染色体的371102位点,序列为a/t;snp位点136为结核分枝杆菌的染色体的379028位点,序列为g/a;snp位点137为结核分枝杆菌的染色体的390447位点,序列为g/c;snp位点138为结核分枝杆菌的染色体的390593位点,序列为c/a;snp位点139为结核分枝杆菌的染色体的394767位点,序列为c/a;snp位点140为结核分枝杆菌的染色体的402836位点,序列为g/a;snp位点141为结核分枝杆菌的染色体的404845位点,序列为a/c;snp位点142为结核分枝杆菌的染色体的409532位点,序列为c/a;snp位点143为结核分枝杆菌的染色体的409554位点,序列为c/g;snp位点144为结核分枝杆菌的染色体的411274位点,序列为g/c;snp位点145为结核分枝杆菌的染色体的411819位点,序列为c/t;snp位点146为结核分枝杆菌的染色体的415693位点,序列为g/a;snp位点147为结核分枝杆菌的染色体的417810位点,序列为c/t;snp位点148为结核分枝杆菌的染色体的422678位点,序列为g/a;snp位点149为结核分枝杆菌的染色体的428921位点,序列为g/a;snp位点150为结核分枝杆菌的染色体的430561位点,序列为g/t;snp位点151为结核分枝杆菌的染色体的430674位点,序列为t/c;snp位点152为结核分枝杆菌的染色体的431525位点,序列为t/g;snp位点153为结核分枝杆菌的染色体的431587位点,序列为c/g;snp位点154为结核分枝杆菌的染色体的433727位点,序列为c/g;snp位点155为结核分枝杆菌的染色体的442689位点,序列为t/c;snp位点156为结核分枝杆菌的染色体的455024位点,序列为g/a;snp位点157为结核分枝杆菌的染色体的457392位点,序列为g/a;snp位点158为结核分枝杆菌的染色体的466808位点,序列为g/c;snp位点159为结核分枝杆菌的染色体的473310位点,序列为a/g;snp位点160为结核分枝杆菌的染色体的475987位点,序列为c/t;snp位点161为结核分枝杆菌的染色体的476612位点,序列为g/a;snp位点162为结核分枝杆菌的染色体的480350位点,序列为t/g;snp位点163为结核分枝杆菌的染色体的482268位点,序列为t/c;snp位点164为结核分枝杆菌的染色体的484623位点,序列为g/a;snp位点165为结核分枝杆菌的染色体的485730位点,序列为c/t;snp位点166为结核分枝杆菌的染色体的491940位点,序列为t/c;snp位点167为结核分枝杆菌的染色体的495890位点,序列为c/t;snp位点168为结核分枝杆菌的染色体的519183位点,序列为c/t;snp位点169为结核分枝杆菌的染色体的519844位点,序列为c/t;snp位点170为结核分枝杆菌的染色体的521871位点,序列为c/t;snp位点171为结核分枝杆菌的染色体的523541位点,序列为c/g;snp位点172为结核分枝杆菌的染色体的541153位点,序列为c/t;snp位点173为结核分枝杆菌的染色体的542104位点,序列为c/a;snp位点174为结核分枝杆菌的染色体的549873位点,序列为c/t;snp位点175为结核分枝杆菌的染色体的550630位点,序列为t/c;snp位点176为结核分枝杆菌的染色体的551206位点,序列为t/c;snp位点177为结核分枝杆菌的染色体的555492位点,序列为g/a;snp位点178为结核分枝杆菌的染色体的573699位点,序列为c/a;snp位点179为结核分枝杆菌的染色体的575920位点,序列为c/t;snp位点180为结核分枝杆菌的染色体的580797位点,序列为a/ag;snp位点181为结核分枝杆菌的染色体的597411位点,序列为g/c;snp位点182为结核分枝杆菌的染色体的608684位点,序列为c/g;snp位点183为结核分枝杆菌的染色体的620043位点,序列为c/g;snp位点184为结核分枝杆菌的染色体的622788位点,序列为g/c;snp位点185为结核分枝杆菌的染色体的623877位点,序列为c/t;snp位点186为结核分枝杆菌的染色体的625493位点,序列为t/g;snp位点187为结核分枝杆菌的染色体的632600位点,序列为c/t;snp位点188为结核分枝杆菌的染色体的633562位点,序列为c/t;snp位点189为结核分枝杆菌的染色体的634425位点,序列为g/a;snp位点190为结核分枝杆菌的染色体的635139位点,序列为g/c;snp位点191为结核分枝杆菌的染色体的642657位点,序列为t/g;snp位点192为结核分枝杆菌的染色体的643217位点,序列为g/t;snp位点193为结核分枝杆菌的染色体的645005位点,序列为c/t;snp位点194为结核分枝杆菌的染色体的656523位点,序列为c/t;snp位点195为结核分枝杆菌的染色体的662858位点,序列为g/t;snp位点196为结核分枝杆菌的染色体的663878位点,序列为t/c;snp位点197为结核分枝杆菌的染色体的665568位点,序列为g/a;snp位点198为结核分枝杆菌的染色体的666022位点,序列为c/g;snp位点199为结核分枝杆菌的染色体的671718位点,序列为g/a;snp位点200为结核分枝杆菌的染色体的673188位点,序列为c/g;snp位点201为结核分枝杆菌的染色体的679507位点,序列为t/g;snp位点202为结核分枝杆菌的染色体的680820位点,序列为c/t;snp位点203为结核分枝杆菌的染色体的684660位点,序列为a/c;snp位点204为结核分枝杆菌的染色体的697126位点,序列为g/a;snp位点205为结核分枝杆菌的染色体的697478位点,序列为c/t;snp位点206为结核分枝杆菌的染色体的705091位点,序列为g/a;snp位点207为结核分枝杆菌的染色体的708056位点,序列为t/c;snp位点208为结核分枝杆菌的染色体的717018位点,序列为g/a;snp位点209为结核分枝杆菌的染色体的718261位点,序列为c/a;snp位点210为结核分枝杆菌的染色体的720616位点,序列为c/t;snp位点211为结核分枝杆菌的染色体的726295位点,序列为a/t;snp位点212为结核分枝杆菌的染色体的734129位点,序列为g/t;snp位点213为结核分枝杆菌的染色体的735751位点,序列为g/a;snp位点214为结核分枝杆菌的染色体的752992位点,序列为c/t;snp位点215为结核分枝杆菌的染色体的756758位点,序列为c/t;snp位点216为结核分枝杆菌的染色体的759464位点,序列为g/a;snp位点217为结核分枝杆菌的染色体的759746位点,序列为c/t;snp位点218为结核分枝杆菌的染色体的770293位点,序列为g/c;snp位点219为结核分枝杆菌的染色体的779315位点,序列为g/t;snp位点220为结核分枝杆菌的染色体的786402位点,序列为t/g;snp位点221为结核分枝杆菌的染色体的792629位点,序列为c/g;snp位点222为结核分枝杆菌的染色体的794735位点,序列为g/a;snp位点223为结核分枝杆菌的染色体的798307位点,序列为a/g;snp位点224为结核分枝杆菌的染色体的811621位点,序列为c/t;snp位点225为结核分枝杆菌的染色体的812809位点,序列为g/a;snp位点226为结核分枝杆菌的染色体的813272位点,序列为c/g;snp位点227为结核分枝杆菌的染色体的818402位点,序列为c/t;snp位点228为结核分枝杆菌的染色体的821023位点,序列为c/a;snp位点229为结核分枝杆菌的染色体的833444位点,序列为g/c;snp位点230为结核分枝杆菌的染色体的834857位点,序列为c/t;snp位点231为结核分枝杆菌的染色体的835317位点,序列为c/g;snp位点232为结核分枝杆菌的染色体的837911位点,序列为t/g;snp位点233为结核分枝杆菌的染色体的838154位点,序列为c/t;snp位点234为结核分枝杆菌的染色体的839257位点,序列为c/t;snp位点235为结核分枝杆菌的染色体的840179位点,序列为a/g;snp位点236为结核分枝杆菌的染色体的840181位点,序列为c/g;snp位点237为结核分枝杆菌的染色体的840847位点,序列为c/t;snp位点238为结核分枝杆菌的染色体的841319位点,序列为t/g;snp位点239为结核分枝杆菌的染色体的842153位点,序列为g/a;snp位点240为结核分枝杆菌的染色体的844894位点,序列为c/g;snp位点241为结核分枝杆菌的染色体的849915位点,序列为c/g;snp位点242为结核分枝杆菌的染色体的850080位点,序列为a/c;snp位点243为结核分枝杆菌的染色体的857643位点,序列为c/g;snp位点244为结核分枝杆菌的染色体的858464位点,序列为a/g;snp位点245为结核分枝杆菌的染色体的873164位点,序列为g/c;snp位点246为结核分枝杆菌的染色体的873464位点,序列为t/c;snp位点247为结核分枝杆菌的染色体的874121位点,序列为g/a;snp位点248为结核分枝杆菌的染色体的874323位点,序列为t/a;snp位点249为结核分枝杆菌的染色体的874462位点,序列为a/t;snp位点250为结核分枝杆菌的染色体的882031位点,序列为g/a;snp位点251为结核分枝杆菌的染色体的893304位点,序列为c/g;snp位点252为结核分枝杆菌的染色体的906900位点,序列为c/t;snp位点253为结核分枝杆菌的染色体的913918位点,序列为c/g;snp位点254为结核分枝杆菌的染色体的918520位点,序列为g/a;snp位点255为结核分枝杆菌的染色体的921909位点,序列为c/t;snp位点256为结核分枝杆菌的染色体的930105位点,序列为g/a;snp位点257为结核分枝杆菌的染色体的930992位点,序列为t/c;snp位点258为结核分枝杆菌的染色体的933803位点,序列为c/t;snp位点259为结核分枝杆菌的染色体的938153位点,序列为a/g;snp位点260为结核分枝杆菌的染色体的942616位点,序列为c/a;snp位点261为结核分枝杆菌的染色体的944899位点,序列为c/g;snp位点262为结核分枝杆菌的染色体的945057位点,序列为t/c;snp位点263为结核分枝杆菌的染色体的947034位点,序列为g/a;snp位点264为结核分枝杆菌的染色体的956621位点,序列为a/g;snp位点265为结核分枝杆菌的染色体的958500位点,序列为g/t;snp位点266为结核分枝杆菌的染色体的961001位点,序列为c/t;snp位点267为结核分枝杆菌的染色体的961917位点,序列为g/a;snp位点268为结核分枝杆菌的染色体的975057位点,序列为a/g;snp位点269为结核分枝杆菌的染色体的977079位点,序列为g/a;snp位点270为结核分枝杆菌的染色体的987129位点,序列为c/a;snp位点271为结核分枝杆菌的染色体的989287位点,序列为c/g;snp位点272为结核分枝杆菌的染色体的995834位点,序列为g/a;snp位点273为结核分枝杆菌的染色体的998192位点,序列为c/t;snp位点274为结核分枝杆菌的染色体的1009204位点,序列为g/a;snp位点275为结核分枝杆菌的染色体的1016760位点,序列为a/c;snp位点276为结核分枝杆菌的染色体的1019256位点,序列为g/a;snp位点277为结核分枝杆菌的染色体的1026482位点,序列为g/a;snp位点278为结核分枝杆菌的染色体的1034381位点,序列为g/a;snp位点279为结核分枝杆菌的染色体的1035563位点,序列为g/t;snp位点280为结核分枝杆菌的染色体的1041330位点,序列为g/c;snp位点281为结核分枝杆菌的染色体的1055976位点,序列为g/t;snp位点282为结核分枝杆菌的染色体的1062484位点,序列为c/t;snp位点283为结核分枝杆菌的染色体的1077601位点,序列为c/t;snp位点284为结核分枝杆菌的染色体的1079036位点,序列为c/t;snp位点285为结核分枝杆菌的染色体的1088600位点,序列为t/c;snp位点286为结核分枝杆菌的染色体的1093788位点,序列为a/g;snp位点287为结核分枝杆菌的染色体的1093928位点,序列为g/a;snp位点288为结核分枝杆菌的染色体的1095981位点,序列为a/c;snp位点289为结核分枝杆菌的染色体的1096239位点,序列为g/a;snp位点290为结核分枝杆菌的染色体的1098916位点,序列为c/t;snp位点291为结核分枝杆菌的染色体的1108623位点,序列为c/t;snp位点292为结核分枝杆菌的染色体的1110721位点,序列为t/c;snp位点293为结核分枝杆菌的染色体的1113394位点,序列为g/a;snp位点294为结核分枝杆菌的染色体的1113733位点,序列为c/a;snp位点295为结核分枝杆菌的染色体的1117229位点,序列为a/g;snp位点296为结核分枝杆菌的染色体的1118462位点,序列为c/g;snp位点297为结核分枝杆菌的染色体的1121875位点,序列为c/t;snp位点298为结核分枝杆菌的染色体的1134206位点,序列为c/a;snp位点299为结核分枝杆菌的染色体的1145065位点,序列为c/g;snp位点300为结核分枝杆菌的染色体的1155077位点,序列为c/t;snp位点301为结核分枝杆菌的染色体的1161969位点,序列为g/a;snp位点302为结核分枝杆菌的染色体的1163529位点,序列为t/g;snp位点303为结核分枝杆菌的染色体的1166343位点,序列为a/g;snp位点304为结核分枝杆菌的染色体的1168552位点,序列为t/c;snp位点305为结核分枝杆菌的染色体的1171125位点,序列为t/c;snp位点306为结核分枝杆菌的染色体的1188978位点,序列为c/a;snp位点307为结核分枝杆菌的染色体的1188985位点,序列为g/a;snp位点308为结核分枝杆菌的染色体的1189606位点,序列为a/g;snp位点309为结核分枝杆菌的染色体的1189613位点,序列为g/a;snp位点310为结核分枝杆菌的染色体的1191274位点,序列为g/t;snp位点311为结核分枝杆菌的染色体的1191275位点,序列为c/t;snp位点312为结核分枝杆菌的染色体的1191280位点,序列为g/c;snp位点313为结核分枝杆菌的染色体的1191284位点,序列为t/c;snp位点314为结核分枝杆菌的染色体的1191450位点,序列为c/t;snp位点315为结核分枝杆菌的染色体的1191451位点,序列为g/t;snp位点316为结核分枝杆菌的染色体的1191452位点,序列为c/g;snp位点317为结核分枝杆菌的染色体的1193463位点,序列为t/a;snp位点318为结核分枝杆菌的染色体的1209900位点,序列为c/t;snp位点319为结核分枝杆菌的染色体的1212634位点,序列为g/a;snp位点320为结核分枝杆菌的染色体的1212813位点,序列为c/t;snp位点321为结核分枝杆菌的染色体的1212816位点,序列为c/a;snp位点322为结核分枝杆菌的染色体的1216759位点,序列为g/t;snp位点323为结核分枝杆菌的染色体的1217682位点,序列为a/t;snp位点324为结核分枝杆菌的染色体的1231424位点,序列为c/g;snp位点325为结核分枝杆菌的染色体的1235338位点,序列为g/t;snp位点326为结核分枝杆菌的染色体的1236433位点,序列为a/c;snp位点327为结核分枝杆菌的染色体的1241572位点,序列为a/g;snp位点328为结核分枝杆菌的染色体的1244259位点,序列为a/c;snp位点329为结核分枝杆菌的染色体的1255928位点,序列为c/t;snp位点330为结核分枝杆菌的染色体的1257390位点,序列为c/t;snp位点331为结核分枝杆菌的染色体的1262859位点,序列为c/t;snp位点332为结核分枝杆菌的染色体的1279543位点,序列为g/a;snp位点333为结核分枝杆菌的染色体的1281507位点,序列为c/t;snp位点334为结核分枝杆菌的染色体的1287100位点,序列为g/a;snp位点335为结核分枝杆菌的染色体的1287372位点,序列为g/c;snp位点336为结核分枝杆菌的染色体的1301293位点,序列为c/t;snp位点337为结核分枝杆菌的染色体的1304293位点,序列为a/g;snp位点338为结核分枝杆菌的染色体的1309158位点,序列为g/a;snp位点339为结核分枝杆菌的染色体的1313541位点,序列为g/a;snp位点340为结核分枝杆菌的染色体的1322045位点,序列为g/a;snp位点341为结核分枝杆菌的染色体的1330053位点,序列为t/c;snp位点342为结核分枝杆菌的染色体的1338497位点,序列为g/a;snp位点343为结核分枝杆菌的染色体的1338837位点,序列为a/g;snp位点344为结核分枝杆菌的染色体的1339741位点,序列为c/g;snp位点345为结核分枝杆菌的染色体的1339774位点,序列为c/g;snp位点346为结核分枝杆菌的染色体的1339823位点,序列为a/g;snp位点347为结核分枝杆菌的染色体的1339894位点,序列为c/t;snp位点348为结核分枝杆菌的染色体的1339905位点,序列为c/t;snp位点349为结核分枝杆菌的染色体的1340500位点,序列为g/t;snp位点350为结核分枝杆菌的染色体的1340544位点,序列为c/t;snp位点351为结核分枝杆菌的染色体的1355438位点,序列为g/a;snp位点352为结核分枝杆菌的染色体的1361220位点,序列为c/t;snp位点353为结核分枝杆菌的染色体的1369642位点,序列为c/t;snp位点354为结核分枝杆菌的染色体的1373892位点,序列为c/t;snp位点355为结核分枝杆菌的染色体的1374620位点,序列为t/c;snp位点356为结核分枝杆菌的染色体的1376093位点,序列为c/t;snp位点357为结核分枝杆菌的染色体的1382353位点,序列为c/t;snp位点358为结核分枝杆菌的染色体的1388548位点,序列为g/a;snp位点359为结核分枝杆菌的染色体的1390832位点,序列为t/c;snp位点360为结核分枝杆菌的染色体的1393917位点,序列为c/t;snp位点361为结核分枝杆菌的染色体的1398759位点,序列为g/a;snp位点362为结核分枝杆菌的染色体的1405848位点,序列为c/t;snp位点363为结核分枝杆菌的染色体的1411615位点,序列为g/a;snp位点364为结核分枝杆菌的染色体的1416373位点,序列为g/c;snp位点365为结核分枝杆菌的染色体的1421398位点,序列为g/a;snp位点366为结核分枝杆菌的染色体的1422666位点,序列为c/t;snp位点367为结核分枝杆菌的染色体的1422667位点,序列为c/t;snp位点368为结核分枝杆菌的染色体的1436199位点,序列为c/t;snp位点369为结核分枝杆菌的染色体的1436782位点,序列为g/a;snp位点370为结核分枝杆菌的染色体的1437284位点,序列为g/a;snp位点371为结核分枝杆菌的染色体的1438170位点,序列为c/g;snp位点372为结核分枝杆菌的染色体的1439291位点,序列为c/a;snp位点373为结核分枝杆菌的染色体的1441545位点,序列为g/a;snp位点374为结核分枝杆菌的染色体的1441576位点,序列为t/c;snp位点375为结核分枝杆菌的染色体的1441579位点,序列为a/t;snp位点376为结核分枝杆菌的染色体的1441582位点,序列为t/c;snp位点377为结核分枝杆菌的染色体的1445430位点,序列为c/a;snp位点378为结核分枝杆菌的染色体的1447136位点,序列为c/t;snp位点379为结核分枝杆菌的染色体的1447144位点,序列为g/c;snp位点380为结核分枝杆菌的染色体的1455511位点,序列为a/c;snp位点381为结核分枝杆菌的染色体的1480887位点,序列为g/a;snp位点382为结核分枝杆菌的染色体的1480945位点,序列为c/g;snp位点383为结核分枝杆菌的染色体的1480948位点,序列为c/t;snp位点384为结核分枝杆菌的染色体的1481185位点,序列为a/c;snp位点385为结核分枝杆菌的染色体的1481563位点,序列为c/t;snp位点386为结核分枝杆菌的染色体的1488428位点,序列为c/t;snp位点387为结核分枝杆菌的染色体的1489908位点,序列为t/c;snp位点388为结核分枝杆菌的染色体的1497146位点,序列为c/t;snp位点389为结核分枝杆菌的染色体的1504736位点,序列为c/t;snp位点390为结核分枝杆菌的染色体的1511949位点,序列为c/g;snp位点391为结核分枝杆菌的染色体的1513893位点,序列为a/g;snp位点392为结核分枝杆菌的染色体的1519897位点,序列为t/c;snp位点393为结核分枝杆菌的染色体的1523458位点,序列为a/c;snp位点394为结核分枝杆菌的染色体的1527673位点,序列为t/g;snp位点395为结核分枝杆菌的染色体的1530580位点,序列为c/t;snp位点396为结核分枝杆菌的染色体的1530895位点,序列为t/c;snp位点397为结核分枝杆菌的染色体的1533624位点,序列为a/c;snp位点398为结核分枝杆菌的染色体的1533625位点,序列为g/a;snp位点399为结核分枝杆菌的染色体的1534551位点,序列为c/t;snp位点400为结核分枝杆菌的染色体的1535131位点,序列为c/t;snp位点401为结核分枝杆菌的染色体的1537429位点,序列为g/t;snp位点402为结核分枝杆菌的染色体的1538467位点,序列为t/g;snp位点403为结核分枝杆菌的染色体的1551214位点,序列为g/a;snp位点404为结核分枝杆菌的染色体的1552791位点,序列为c/t;snp位点405为结核分枝杆菌的染色体的1554216位点,序列为c/t;snp位点406为结核分枝杆菌的染色体的1569602位点,序列为g/a;snp位点407为结核分枝杆菌的染色体的1574803位点,序列为g/a;snp位点408为结核分枝杆菌的染色体的1576798位点,序列为c/t;snp位点409为结核分枝杆菌的染色体的1579769位点,序列为g/c;snp位点410为结核分枝杆菌的染色体的1582748位点,序列为c/t;snp位点411为结核分枝杆菌的染色体的1597190位点,序列为c/t;snp位点412为结核分枝杆菌的染色体的1599557位点,序列为c/g;snp位点413为结核分枝杆菌的染色体的1611926位点,序列为g/a;snp位点414为结核分枝杆菌的染色体的1614242位点,序列为c/a;snp位点415为结核分枝杆菌的染色体的1616451位点,序列为g/a;snp位点416为结核分枝杆菌的染色体的1617033位点,序列为t/c;snp位点417为结核分枝杆菌的染色体的1619549位点,序列为c/g;snp位点418为结核分枝杆菌的染色体的1634550位点,序列为g/a;snp位点419为结核分枝杆菌的染色体的1635877位点,序列为g/t;snp位点420为结核分枝杆菌的染色体的1658664位点,序列为c/g;snp位点421为结核分枝杆菌的染色体的1672544位点,序列为g/a;snp位点422为结核分枝杆菌的染色体的1683398位点,序列为c/t;snp位点423为结核分枝杆菌的染色体的1686324位点,序列为g/a;snp位点424为结核分枝杆菌的染色体的1692960位点,序列为t/c;snp位点425为结核分枝杆菌的染色体的1696562位点,序列为c/g;snp位点426为结核分枝杆菌的染色体的1697172位点,序列为c/a;snp位点427为结核分枝杆菌的染色体的1701647位点,序列为c/t;snp位点428为结核分枝杆菌的染色体的1705850位点,序列为t/g;snp位点429为结核分枝杆菌的染色体的1708792位点,序列为t/c;snp位点430为结核分枝杆菌的染色体的1710329位点,序列为g/a;snp位点431为结核分枝杆菌的染色体的1715075位点,序列为a/g;snp位点432为结核分枝杆菌的染色体的1725033位点,序列为c/t;snp位点433为结核分枝杆菌的染色体的1727379位点,序列为g/c;snp位点434为结核分枝杆菌的染色体的1728161位点,序列为g/t;snp位点435为结核分枝杆菌的染色体的1735739位点,序列为t/c;snp位点436为结核分枝杆菌的染色体的1742625位点,序列为a/g;snp位点437为结核分枝杆菌的染色体的1743795位点,序列为c/a;snp位点438为结核分枝杆菌的染色体的1746123位点,序列为c/a;snp位点439为结核分枝杆菌的染色体的1750294位点,序列为t/a;snp位点440为结核分枝杆菌的染色体的1751564位点,序列为g/a;snp位点441为结核分枝杆菌的染色体的1761765位点,序列为g/a;snp位点442为结核分枝杆菌的染色体的1768994位点,序列为c/t;snp位点443为结核分枝杆菌的染色体的1781797位点,序列为t/c;snp位点444为结核分枝杆菌的染色体的1783060位点,序列为g/t;snp位点445为结核分枝杆菌的染色体的1788570位点,序列为g/t;snp位点446为结核分枝杆菌的染色体的1788574位点,序列为t/c;snp位点447为结核分枝杆菌的染色体的1788613位点,序列为c/t;snp位点448为结核分枝杆菌的染色体的1788627位点,序列为c/g;snp位点449为结核分枝杆菌的染色体的1789564位点,序列为c/t;snp位点450为结核分枝杆菌的染色体的1789565位点,序列为c/a;snp位点451为结核分枝杆菌的染色体的1789933位点,序列为g/a;snp位点452为结核分枝杆菌的染色体的1794072位点,序列为c/t;snp位点453为结核分枝杆菌的染色体的1816370位点,序列为c/t;snp位点454为结核分枝杆菌的染色体的1816590位点,序列为c/t;snp位点455为结核分枝杆菌的染色体的1832509位点,序列为c/g;snp位点456为结核分枝杆菌的染色体的1834159位点,序列为g/a;snp位点457为结核分枝杆菌的染色体的1836417位点,序列为c/a;snp位点458为结核分枝杆菌的染色体的1839685位点,序列为g/c;snp位点459为结核分枝杆菌的染色体的1846072位点,序列为g/c;snp位点460为结核分枝杆菌的染色体的1851457位点,序列为c/g;snp位点461为结核分枝杆菌的染色体的1851984位点,序列为g/a;snp位点462为结核分枝杆菌的染色体的1852877位点,序列为a/c;snp位点463为结核分枝杆菌的染色体的1853083位点,序列为c/a;snp位点464为结核分枝杆菌的染色体的1853492位点,序列为g/c;snp位点465为结核分枝杆菌的染色体的1861245位点,序列为g/c;snp位点466为结核分枝杆菌的染色体的1861334位点,序列为c/t;snp位点467为结核分枝杆菌的染色体的1873700位点,序列为g/a;snp位点468为结核分枝杆菌的染色体的1878552位点,序列为g/a;snp位点469为结核分枝杆菌的染色体的1881051位点,序列为g/c;snp位点470为结核分枝杆菌的染色体的1889978位点,序列为c/a;snp位点471为结核分枝杆菌的染色体的1900207位点,序列为t/a;snp位点472为结核分枝杆菌的染色体的1902358位点,序列为g/c;snp位点473为结核分枝杆菌的染色体的1904947位点,序列为c/t;snp位点474为结核分枝杆菌的染色体的1905674位点,序列为c/a;snp位点475为结核分枝杆菌的染色体的1913814位点,序列为c/g;snp位点476为结核分枝杆菌的染色体的1918811位点,序列为a/g;snp位点477为结核分枝杆菌的染色体的1919627位点,序列为g/a;snp位点478为结核分枝杆菌的染色体的1919896位点,序列为g/a;snp位点479为结核分枝杆菌的染色体的1925830位点,序列为g/t;snp位点480为结核分枝杆菌的染色体的1927329位点,序列为c/a;snp位点481为结核分枝杆菌的染色体的1929349位点,序列为c/t;snp位点482为结核分枝杆菌的染色体的1931459位点,序列为a/g;snp位点483为结核分枝杆菌的染色体的1931979位点,序列为c/t;snp位点484为结核分枝杆菌的染色体的1932668位点,序列为t/a;snp位点485为结核分枝杆菌的染色体的1940344位点,序列为g/a;snp位点486为结核分枝杆菌的染色体的1942128位点,序列为g/a;snp位点487为结核分枝杆菌的染色体的1946999位点,序列为t/g;snp位点488为结核分枝杆菌的染色体的1952524位点,序列为c/t;snp位点489为结核分枝杆菌的染色体的1954957位点,序列为g/t;snp位点490为结核分枝杆菌的染色体的1969241位点,序列为c/g;snp位点491为结核分枝杆菌的染色体的1973198位点,序列为c/a;snp位点492为结核分枝杆菌的染色体的1982901位点,序列为g/t;snp位点493为结核分枝杆菌的染色体的1983195位点,序列为a/g;snp位点494为结核分枝杆菌的染色体的1983198位点,序列为c/g;snp位点495为结核分枝杆菌的染色体的1998790位点,序列为c/t;snp位点496为结核分枝杆菌的染色体的1998792位点,序列为t/a;snp位点497为结核分枝杆菌的染色体的2004772位点,序列为g/a;snp位点498为结核分枝杆菌的染色体的2010880位点,序列为t/g;snp位点499为结核分枝杆菌的染色体的2014688位点,序列为g/a;snp位点500为结核分枝杆菌的染色体的2015124位点,序列为c/a;snp位点501为结核分枝杆菌的染色体的2024455位点,序列为c/g;snp位点502为结核分枝杆菌的染色体的2025977位点,序列为c/g;snp位点503为结核分枝杆菌的染色体的2030634位点,序列为g/c;snp位点504为结核分枝杆菌的染色体的2030720位点,序列为c/t;snp位点505为结核分枝杆菌的染色体的2039715位点,序列为c/t;snp位点506为结核分枝杆菌的染色体的2040061位点,序列为c/t;snp位点507为结核分枝杆菌的染色体的2053185位点,序列为c/a;snp位点508为结核分枝杆菌的染色体的2058864位点,序列为g/a;snp位点509为结核分枝杆菌的染色体的2061729位点,序列为g/c;snp位点510为结核分枝杆菌的染色体的2065914位点,序列为g/c;snp位点511为结核分枝杆菌的染色体的2074092位点,序列为c/t;snp位点512为结核分枝杆菌的染色体的2080460位点,序列为c/t;snp位点513为结核分枝杆菌的染色体的2087942位点,序列为t/c;snp位点514为结核分枝杆菌的染色体的2087943位点,序列为a/t;snp位点515为结核分枝杆菌的染色体的2096856位点,序列为c/t;snp位点516为结核分枝杆菌的染色体的2101040位点,序列为c/a;snp位点517为结核分枝杆菌的染色体的2105272位点,序列为c/t;snp位点518为结核分枝杆菌的染色体的2105602位点,序列为c/t;snp位点519为结核分枝杆菌的染色体的2113915位点,序列为c/a;snp位点520为结核分枝杆菌的染色体的2114012位点,序列为g/c;snp位点521为结核分枝杆菌的染色体的2123484位点,序列为a/g;snp位点522为结核分枝杆菌的染色体的2133791位点,序列为g/a;snp位点523为结核分枝杆菌的染色体的2151780位点,序列为g/t;snp位点524为结核分枝杆菌的染色体的2153550位点,序列为t/c;snp位点525为结核分枝杆菌的染色体的2155168位点,序列为c/g;snp位点526为结核分枝杆菌的染色体的2158066位点,序列为g/c;snp位点527为结核分枝杆菌的染色体的2158451位点,序列为g/a;snp位点528为结核分枝杆菌的染色体的2164116位点,序列为t/c;snp位点529为结核分枝杆菌的染色体的2166287位点,序列为c/t;snp位点530为结核分枝杆菌的染色体的2167310位点,序列为a/g;snp位点531为结核分枝杆菌的染色体的2170797位点,序列为t/c;snp位点532为结核分枝杆菌的染色体的2178981位点,序列为c/g;snp位点533为结核分枝杆菌的染色体的2180693位点,序列为t/c;snp位点534为结核分枝杆菌的染色体的2186127位点,序列为g/a;snp位点535为结核分枝杆菌的染色体的2188298位点,序列为c/t;snp位点536为结核分枝杆菌的染色体的2196715位点,序列为g/c;snp位点537为结核分枝杆菌的染色体的2196964位点,序列为a/c;snp位点538为结核分枝杆菌的染色体的2197293位点,序列为c/a;snp位点539为结核分枝杆菌的染色体的2197313位点,序列为a/c;snp位点540为结核分枝杆菌的染色体的2197331位点,序列为c/a;snp位点541为结核分枝杆菌的染色体的2197332位点,序列为c/a;snp位点542为结核分枝杆菌的染色体的2212049位点,序列为g/a;snp位点543为结核分枝杆菌的染色体的2216336位点,序列为c/t;snp位点544为结核分枝杆菌的染色体的2217799位点,序列为a/g;snp位点545为结核分枝杆菌的染色体的2230127位点,序列为g/a;snp位点546为结核分枝杆菌的染色体的2241241位点,序列为c/t;snp位点547为结核分枝杆菌的染色体的2243491位点,序列为g/t;snp位点548为结核分枝杆菌的染色体的2244564位点,序列为a/c;snp位点549为结核分枝杆菌的染色体的2250970位点,序列为t/g;snp位点550为结核分枝杆菌的染色体的2256544位点,序列为a/c;snp位点551为结核分枝杆菌的染色体的2258567位点,序列为g/a;snp位点552为结核分枝杆菌的染色体的2263387位点,序列为g/a;snp位点553为结核分枝杆菌的染色体的2265192位点,序列为a/c;snp位点554为结核分枝杆菌的染色体的2271938位点,序列为g/a;snp位点555为结核分枝杆菌的染色体的2278963位点,序列为c/t;snp位点556为结核分枝杆菌的染色体的2281988位点,序列为c/t;snp位点557为结核分枝杆菌的染色体的2283881位点,序列为a/g;snp位点558为结核分枝杆菌的染色体的2289047位点,序列为g/a;snp位点559为结核分枝杆菌的染色体的2296799位点,序列为g/a;snp位点560为结核分枝杆菌的染色体的2296900位点,序列为c/t;snp位点561为结核分枝杆菌的染色体的2300205位点,序列为a/ac;snp位点562为结核分枝杆菌的染色体的2306472位点,序列为t/c;snp位点563为结核分枝杆菌的染色体的2312398位点,序列为g/t;snp位点564为结核分枝杆菌的染色体的2318816位点,序列为c/t;snp位点565为结核分枝杆菌的染色体的2319936位点,序列为g/a;snp位点566为结核分枝杆菌的染色体的2321114位点,序列为g/a;snp位点567为结核分枝杆菌的染色体的2326973位点,序列为c/t;snp位点568为结核分枝杆菌的染色体的2332163位点,序列为g/a;snp位点569为结核分枝杆菌的染色体的2336584位点,序列为g/c;snp位点570为结核分枝杆菌的染色体的2338692位点,序列为c/g;snp位点571为结核分枝杆菌的染色体的2338701位点,序列为c/t;snp位点572为结核分枝杆菌的染色体的2338702位点,序列为a/g;snp位点573为结核分枝杆菌的染色体的2338704位点,序列为c/g;snp位点574为结核分枝杆菌的染色体的2338707位点,序列为c/t;snp位点575为结核分枝杆菌的染色体的2338961位点,序列为g/a;snp位点576为结核分枝杆菌的染色体的2339240位点,序列为g/a;snp位点577为结核分枝杆菌的染色体的2339255位点,序列为a/g;snp位点578为结核分枝杆菌的染色体的2339495位点,序列为g/a;snp位点579为结核分枝杆菌的染色体的2339524位点,序列为g/a;snp位点580为结核分枝杆菌的染色体的2339525位点,序列为g/t;snp位点581为结核分枝杆菌的染色体的2357939位点,序列为g/a;snp位点582为结核分枝杆菌的染色体的2372439位点,序列为c/t;snp位点583为结核分枝杆菌的染色体的2373252位点,序列为t/c;snp位点584为结核分枝杆菌的染色体的2381100位点,序列为g/a;snp位点585为结核分枝杆菌的染色体的2381169位点,序列为g/a;snp位点586为结核分枝杆菌的染色体的2383119位点,序列为g/a;snp位点587为结核分枝杆菌的染色体的2385552位点,序列为c/t;snp位点588为结核分枝杆菌的染色体的2389093位点,序列为c/t;snp位点589为结核分枝杆菌的染色体的2394489位点,序列为c/t;snp位点590为结核分枝杆菌的染色体的2403144位点,序列为c/t;snp位点591为结核分枝杆菌的染色体的2411122位点,序列为t/a;snp位点592为结核分枝杆菌的染色体的2418334位点,序列为c/t;snp位点593为结核分枝杆菌的染色体的2424181位点,序列为c/t;snp位点594为结核分枝杆菌的染色体的2427479位点,序列为c/t;snp位点595为结核分枝杆菌的染色体的2428402位点,序列为g/c;snp位点596为结核分枝杆菌的染色体的2434749位点,序列为c/t;snp位点597为结核分枝杆菌的染色体的2438445位点,序列为g/c;snp位点598为结核分枝杆菌的染色体的2439519位点,序列为g/a;snp位点599为结核分枝杆菌的染色体的2440935位点,序列为g/c;snp位点600为结核分枝杆菌的染色体的2447914位点,序列为g/a;snp位点601为结核分枝杆菌的染色体的2451717位点,序列为c/t;snp位点602为结核分枝杆菌的染色体的2454517位点,序列为c/t;snp位点603为结核分枝杆菌的染色体的2474056位点,序列为a/g;snp位点604为结核分枝杆菌的染色体的2477984位点,序列为g/a;snp位点605为结核分枝杆菌的染色体的2480809位点,序列为g/c;snp位点606为结核分枝杆菌的染色体的2483579位点,序列为a/g;snp位点607为结核分枝杆菌的染色体的2494430位点,序列为c/g;snp位点608为结核分枝杆菌的染色体的2494494位点,序列为g/a;snp位点609为结核分枝杆菌的染色体的2501453位点,序列为g/a;snp位点610为结核分枝杆菌的染色体的2510434位点,序列为c/t;snp位点611为结核分枝杆菌的染色体的2512641位点,序列为c/t;snp位点612为结核分枝杆菌的染色体的2527728位点,序列为g/a;snp位点613为结核分枝杆菌的染色体的2528567位点,序列为c/a;snp位点614为结核分枝杆菌的染色体的2529725位点,序列为g/t;snp位点615为结核分枝杆菌的染色体的2531964位点,序列为c/g;snp位点616为结核分枝杆菌的染色体的2533256位点,序列为g/c;snp位点617为结核分枝杆菌的染色体的2534186位点,序列为c/t;snp位点618为结核分枝杆菌的染色体的2540554位点,序列为t/c;snp位点619为结核分枝杆菌的染色体的2541477位点,序列为c/g;snp位点620为结核分枝杆菌的染色体的2541745位点,序列为g/a;snp位点621为结核分枝杆菌的染色体的2542543位点,序列为g/a;snp位点622为结核分枝杆菌的染色体的2542764位点,序列为c/t;snp位点623为结核分枝杆菌的染色体的2549255位点,序列为t/g;snp位点624为结核分枝杆菌的染色体的2549367位点,序列为c/a;snp位点625为结核分枝杆菌的染色体的2567539位点,序列为a/c;snp位点626为结核分枝杆菌的染色体的2576840位点,序列为g/c;snp位点627为结核分枝杆菌的染色体的2580476位点,序列为g/a;snp位点628为结核分枝杆菌的染色体的2608222位点,序列为g/c;snp位点629为结核分枝杆菌的染色体的2608929位点,序列为a/g;snp位点630为结核分枝杆菌的染色体的2609079位点,序列为c/t;snp位点631为结核分枝杆菌的染色体的2612883位点,序列为g/a;snp位点632为结核分枝杆菌的染色体的2619033位点,序列为t/g;snp位点633为结核分枝杆菌的染色体的2619953位点,序列为g/a;snp位点634为结核分枝杆菌的染色体的2624986位点,序列为t/g;snp位点635为结核分枝杆菌的染色体的2626018位点,序列为t/c;snp位点636为结核分枝杆菌的染色体的2626114位点,序列为t/a;snp位点637为结核分枝杆菌的染色体的2626513位点,序列为t/a;snp位点638为结核分枝杆菌的染色体的2626514位点,序列为t/g;snp位点639为结核分枝杆菌的染色体的2628259位点,序列为g/c;snp位点640为结核分枝杆菌的染色体的2648555位点,序列为g/a;snp位点641为结核分枝杆菌的染色体的2652254位点,序列为g/c;snp位点642为结核分枝杆菌的染色体的2654948位点,序列为g/a;snp位点643为结核分枝杆菌的染色体的2655497位点,序列为c/t;snp位点644为结核分枝杆菌的染色体的2659698位点,序列为g/a;snp位点645为结核分枝杆菌的染色体的2667139位点,序列为g/a;snp位点646为结核分枝杆菌的染色体的2671519位点,序列为g/a;snp位点647为结核分枝杆菌的染色体的2673030位点,序列为g/a;snp位点648为结核分枝杆菌的染色体的2691810位点,序列为a/t;snp位点649为结核分枝杆菌的染色体的2691846位点,序列为t/c;snp位点650为结核分枝杆菌的染色体的2719580位点,序列为t/c;snp位点651为结核分枝杆菌的染色体的2723984位点,序列为g/a;snp位点652为结核分枝杆菌的染色体的2743236位点,序列为a/g;snp位点653为结核分枝杆菌的染色体的2744850位点,序列为c/t;snp位点654为结核分枝杆菌的染色体的2760385位点,序列为g/a;snp位点655为结核分枝杆菌的染色体的2764325位点,序列为c/t;snp位点656为结核分枝杆菌的染色体的2767727位点,序列为g/t;snp位点657为结核分枝杆菌的染色体的2770740位点,序列为c/t;snp位点658为结核分枝杆菌的染色体的2771383位点,序列为a/g;snp位点659为结核分枝杆菌的染色体的2779824位点,序列为g/a;snp位点660为结核分枝杆菌的染色体的2782310位点,序列为c/g;snp位点661为结核分枝杆菌的染色体的2802550位点,序列为g/c;snp位点662为结核分枝杆菌的染色体的2804657位点,序列为g/a;snp位点663为结核分枝杆菌的染色体的2806397位点,序列为g/c;snp位点664为结核分枝杆菌的染色体的2812633位点,序列为g/a;snp位点665为结核分枝杆菌的染色体的2819912位点,序列为g/t;snp位点666为结核分枝杆菌的染色体的2823248位点,序列为g/a;snp位点667为结核分枝杆菌的染色体的2839346位点,序列为c/a;snp位点668为结核分枝杆菌的染色体的2840999位点,序列为c/g;snp位点669为结核分枝杆菌的染色体的2847062位点,序列为g/a;snp位点670为结核分枝杆菌的染色体的2850687位点,序列为g/c;snp位点671为结核分枝杆菌的染色体的2861123位点,序列为c/g;snp位点672为结核分枝杆菌的染色体的2867230位点,序列为g/a;snp位点673为结核分枝杆菌的染色体的2867231位点,序列为c/t;snp位点674为结核分枝杆菌的染色体的2867236位点,序列为a/g;snp位点675为结核分枝杆菌的染色体的2867240位点,序列为c/t;snp位点676为结核分枝杆菌的染色体的2867245位点,序列为a/c;snp位点677为结核分枝杆菌的染色体的2867251位点,序列为c/g;snp位点678为结核分枝杆菌的染色体的2870873位点,序列为c/t;snp位点679为结核分枝杆菌的染色体的2872813位点,序列为g/a;snp位点680为结核分枝杆菌的染色体的2877378位点,序列为g/c;snp位点681为结核分枝杆菌的染色体的2886685位点,序列为a/g;snp位点682为结核分枝杆菌的染色体的2892086位点,序列为c/t;snp位点683为结核分枝杆菌的染色体的2892388位点,序列为c/t;snp位点684为结核分枝杆菌的染色体的2894885位点,序列为t/g;snp位点685为结核分枝杆菌的染色体的2903710位点,序列为t/c;snp位点686为结核分枝杆菌的染色体的2907562位点,序列为g/a;snp位点687为结核分枝杆菌的染色体的2909815位点,序列为g/a;snp位点688为结核分枝杆菌的染色体的2910921位点,序列为g/a;snp位点689为结核分枝杆菌的染色体的2915602位点,序列为c/t;snp位点690为结核分枝杆菌的染色体的2926770位点,序列为g/a;snp位点691为结核分枝杆菌的染色体的2931225位点,序列为g/a;snp位点692为结核分枝杆菌的染色体的2932550位点,序列为a/c;snp位点693为结核分枝杆菌的染色体的2937885位点,序列为t/c;snp位点694为结核分枝杆菌的染色体的2948210位点,序列为g/a;snp位点695为结核分枝杆菌的染色体的2948524位点,序列为t/a;snp位点696为结核分枝杆菌的染色体的2957115位点,序列为g/a;snp位点697为结核分枝杆菌的染色体的2959272位点,序列为t/c;snp位点698为结核分枝杆菌的染色体的2960387位点,序列为g/a;snp位点699为结核分枝杆菌的染色体的2961693位点,序列为a/g;snp位点700为结核分枝杆菌的染色体的2969837位点,序列为g/a;snp位点701为结核分枝杆菌的染色体的2976563位点,序列为c/t;snp位点702为结核分枝杆菌的染色体的2982657位点,序列为g/a;snp位点703为结核分枝杆菌的染色体的2986560位点,序列为c/t;snp位点704为结核分枝杆菌的染色体的2987260位点,序列为t/c;snp位点705为结核分枝杆菌的染色体的2995548位点,序列为c/a;snp位点706为结核分枝杆菌的染色体的3006506位点,序列为g/c;snp位点707为结核分枝杆菌的染色体的3016015位点,序列为a/g;snp位点708为结核分枝杆菌的染色体的3017854位点,序列为g/c;snp位点709为结核分枝杆菌的染色体的3021600位点,序列为g/a;snp位点710为结核分枝杆菌的染色体的3025647位点,序列为c/t;snp位点711为结核分枝杆菌的染色体的3031358位点,序列为g/c;snp位点712为结核分枝杆菌的染色体的3035867位点,序列为c/g;snp位点713为结核分枝杆菌的染色体的3041415位点,序列为g/c;snp位点714为结核分枝杆菌的染色体的3044806位点,序列为c/t;snp位点715为结核分枝杆菌的染色体的3053678位点,序列为t/g;snp位点716为结核分枝杆菌的染色体的3055370位点,序列为g/a;snp位点717为结核分枝杆菌的染色体的3059820位点,序列为g/t;snp位点718为结核分枝杆菌的染色体的3059821位点,序列为c/g;snp位点719为结核分枝杆菌的染色体的3059822位点,序列为a/c;snp位点720为结核分枝杆菌的染色体的3065072位点,序列为c/t;snp位点721为结核分枝杆菌的染色体的3073343位点,序列为c/g;snp位点722为结核分枝杆菌的染色体的3075440位点,序列为a/g;snp位点723为结核分枝杆菌的染色体的3078978位点,序列为a/c;snp位点724为结核分枝杆菌的染色体的3079680位点,序列为c/t;snp位点725为结核分枝杆菌的染色体的3088509位点,序列为a/g;snp位点726为结核分枝杆菌的染色体的3089299位点,序列为c/g;snp位点727为结核分枝杆菌的染色体的3095738位点,序列为a/g;snp位点728为结核分枝杆菌的染色体的3100943位点,序列为c/a;snp位点729为结核分枝杆菌的染色体的3107859位点,序列为c/a;snp位点730为结核分枝杆菌的染色体的3112700位点,序列为c/t;snp位点731为结核分枝杆菌的染色体的3120078位点,序列为c/t;snp位点732为结核分枝杆菌的染色体的3122991位点,序列为c/g;snp位点733为结核分枝杆菌的染色体的3123474位点,序列为t/g;snp位点734为结核分枝杆菌的染色体的3131177位点,序列为g/a;snp位点735为结核分枝杆菌的染色体的3132482位点,序列为a/t;snp位点736为结核分枝杆菌的染色体的3134231位点,序列为g/a;snp位点737为结核分枝杆菌的染色体的3135272位点,序列为g/a;snp位点738为结核分枝杆菌的染色体的3135912位点,序列为g/c;snp位点739为结核分枝杆菌的染色体的3135951位点,序列为g/c;snp位点740为结核分枝杆菌的染色体的3149416位点,序列为t/c;snp位点741为结核分枝杆菌的染色体的3158019位点,序列为c/t;snp位点742为结核分枝杆菌的染色体的3168492位点,序列为g/a;snp位点743为结核分枝杆菌的染色体的3178740位点,序列为g/t;snp位点744为结核分枝杆菌的染色体的3200324位点,序列为g/t;snp位点745为结核分枝杆菌的染色体的3200478位点,序列为g/a;snp位点746为结核分枝杆菌的染色体的3201160位点,序列为g/a;snp位点747为结核分枝杆菌的染色体的3206758位点,序列为c/t;snp位点748为结核分枝杆菌的染色体的3219500位点,序列为t/a;snp位点749为结核分枝杆菌的染色体的3224446位点,序列为c/t;snp位点750为结核分枝杆菌的染色体的3227135位点,序列为c/t;snp位点751为结核分枝杆菌的染色体的3232084位点,序列为c/g;snp位点752为结核分枝杆菌的染色体的3233390位点,序列为g/a;snp位点753为结核分枝杆菌的染色体的3237369位点,序列为g/a;snp位点754为结核分枝杆菌的染色体的3240766位点,序列为c/t;snp位点755为结核分枝杆菌的染色体的3247304位点,序列为c/g;snp位点756为结核分枝杆菌的染色体的3251047位点,序列为c/a;snp位点757为结核分枝杆菌的染色体的3267120位点,序列为g/a;snp位点758为结核分枝杆菌的染色体的3272464位点,序列为t/c;snp位点759为结核分枝杆菌的染色体的3275053位点,序列为t/c;snp位点760为结核分枝杆菌的染色体的3276294位点,序列为c/t;snp位点761为结核分枝杆菌的染色体的3283728位点,序列为c/t;snp位点762为结核分枝杆菌的染色体的3285858位点,序列为a/g;snp位点763为结核分枝杆菌的染色体的3292554位点,序列为t/g;snp位点764为结核分枝杆菌的染色体的3296695位点,序列为c/t;snp位点765为结核分枝杆菌的染色体的3297340位点,序列为g/a;snp位点766为结核分枝杆菌的染色体的3299210位点,序列为t/c;snp位点767为结核分枝杆菌的染色体的3302589位点,序列为a/c;snp位点768为结核分枝杆菌的染色体的3306242位点,序列为c/t;snp位点769为结核分枝杆菌的染色体的3306960位点,序列为g/c;snp位点770为结核分枝杆菌的染色体的3316696位点,序列为c/g;snp位点771为结核分枝杆菌的染色体的3323521位点,序列为c/t;snp位点772为结核分枝杆菌的染色体的3334830位点,序列为t/g;snp位点773为结核分枝杆菌的染色体的3336646位点,序列为t/a;snp位点774为结核分枝杆菌的染色体的3336705位点,序列为a/t;snp位点775为结核分枝杆菌的染色体的3337579位点,序列为c/t;snp位点776为结核分枝杆菌的染色体的3340255位点,序列为g/a;snp位点777为结核分枝杆菌的染色体的3349917位点,序列为g/a;snp位点778为结核分枝杆菌的染色体的3353384位点,序列为c/g;snp位点779为结核分枝杆菌的染色体的3355141位点,序列为a/g;snp位点780为结核分枝杆菌的染色体的3359171位点,序列为c/t;snp位点781为结核分枝杆菌的染色体的3364670位点,序列为g/a;snp位点782为结核分枝杆菌的染色体的3365833位点,序列为c/g;snp位点783为结核分枝杆菌的染色体的3368529位点,序列为t/g;snp位点784为结核分枝杆菌的染色体的3373241位点,序列为t/g;snp位点785为结核分枝杆菌的染色体的3375565位点,序列为c/t;snp位点786为结核分枝杆菌的染色体的3381197位点,序列为c/t;snp位点787为结核分枝杆菌的染色体的3386771位点,序列为g/t;snp位点788为结核分枝杆菌的染色体的3387814位点,序列为g/a;snp位点789为结核分枝杆菌的染色体的3392898位点,序列为c/t;snp位点790为结核分枝杆菌的染色体的3413785位点,序列为c/t;snp位点791为结核分枝杆菌的染色体的3415966位点,序列为g/c;snp位点792为结核分枝杆菌的染色体的3419731位点,序列为g/a;snp位点793为结核分枝杆菌的染色体的3427275位点,序列为a/c;snp位点794为结核分枝杆菌的染色体的3427916位点,序列为c/t;snp位点795为结核分枝杆菌的染色体的3428767位点,序列为g/c;snp位点796为结核分枝杆菌的染色体的3432076位点,序列为t/g;snp位点797为结核分枝杆菌的染色体的3436904位点,序列为g/a;snp位点798为结核分枝杆菌的染色体的3439669位点,序列为c/t;snp位点799为结核分枝杆菌的染色体的3440124位点,序列为c/t;snp位点800为结核分枝杆菌的染色体的3442314位点,序列为g/a;snp位点801为结核分枝杆菌的染色体的3442593位点,序列为t/g;snp位点802为结核分枝杆菌的染色体的3450630位点,序列为g/a;snp位点803为结核分枝杆菌的染色体的3451486位点,序列为c/g;snp位点804为结核分枝杆菌的染色体的3454531位点,序列为c/a;snp位点805为结核分枝杆菌的染色体的3457895位点,序列为a/c;snp位点806为结核分枝杆菌的染色体的3466129位点,序列为g/a;snp位点807为结核分枝杆菌的染色体的3467857位点,序列为g/a;snp位点808为结核分枝杆菌的染色体的3470137位点,序列为g/a;snp位点809为结核分枝杆菌的染色体的3472951位点,序列为c/t;snp位点810为结核分枝杆菌的染色体的3473662位点,序列为g/a;snp位点811为结核分枝杆菌的染色体的3476492位点,序列为c/a;snp位点812为结核分枝杆菌的染色体的3477644位点,序列为g/c;snp位点813为结核分枝杆菌的染色体的3488122位点,序列为g/a;snp位点814为结核分枝杆菌的染色体的3493283位点,序列为t/c;snp位点815为结核分枝杆菌的染色体的3496589位点,序列为g/a;snp位点816为结核分枝杆菌的染色体的3499497位点,序列为g/c;snp位点817为结核分枝杆菌的染色体的3506650位点,序列为a/c;snp位点818为结核分枝杆菌的染色体的3508540位点,序列为g/c;snp位点819为结核分枝杆菌的染色体的3509399位点,序列为t/c;snp位点820为结核分枝杆菌的染色体的3511543位点,序列为g/a;snp位点821为结核分枝杆菌的染色体的3512912位点,序列为c/t;snp位点822为结核分枝杆菌的染色体的3514162位点,序列为t/c;snp位点823为结核分枝杆菌的染色体的3526089位点,序列为g/c;snp位点824为结核分枝杆菌的染色体的3528693位点,序列为c/t;snp位点825为结核分枝杆菌的染色体的3528971位点,序列为t/c;snp位点826为结核分枝杆菌的染色体的3546973位点,序列为t/c;snp位点827为结核分枝杆菌的染色体的3560941位点,序列为c/t;snp位点828为结核分枝杆菌的染色体的3562764位点,序列为t/c;snp位点829为结核分枝杆菌的染色体的3572558位点,序列为g/c;snp位点830为结核分枝杆菌的染色体的3578773位点,序列为g/c;snp位点831为结核分枝杆菌的染色体的3582694位点,序列为c/t;snp位点832为结核分枝杆菌的染色体的3592112位点,序列为c/a;snp位点833为结核分枝杆菌的染色体的3599432位点,序列为c/a;snp位点834为结核分枝杆菌的染色体的3603704位点,序列为t/c;snp位点835为结核分枝杆菌的染色体的3605802位点,序列为g/c;snp位点836为结核分枝杆菌的染色体的3607787位点,序列为c/t;snp位点837为结核分枝杆菌的染色体的3608592位点,序列为a/g;snp位点838为结核分枝杆菌的染色体的3620501位点,序列为c/t;snp位点839为结核分枝杆菌的染色体的3622821位点,序列为c/g;snp位点840为结核分枝杆菌的染色体的3632008位点,序列为g/a;snp位点841为结核分枝杆菌的染色体的3632383位点,序列为a/g;snp位点842为结核分枝杆菌的染色体的3634741位点,序列为a/c;snp位点843为结核分枝杆菌的染色体的3651423位点,序列为g/a;snp位点844为结核分枝杆菌的染色体的3671684位点,序列为g/a;snp位点845为结核分枝杆菌的染色体的3676855位点,序列为c/t;snp位点846为结核分枝杆菌的染色体的3676969位点,序列为c/t;snp位点847为结核分枝杆菌的染色体的3680241位点,序列为g/a;snp位点848为结核分枝杆菌的染色体的3683054位点,序列为g/t;snp位点849为结核分枝杆菌的染色体的3685124位点,序列为g/c;snp位点850为结核分枝杆菌的染色体的3697585位点,序列为c/t;snp位点851为结核分枝杆菌的染色体的3702043位点,序列为c/t;snp位点852为结核分枝杆菌的染色体的3706424位点,序列为g/a;snp位点853为结核分枝杆菌的染色体的3710382位点,序列为t/a;snp位点854为结核分枝杆菌的染色体的3718336位点,序列为t/g;snp位点855为结核分枝杆菌的染色体的3720995位点,序列为c/g;snp位点856为结核分枝杆菌的染色体的3726541位点,序列为g/a;snp位点857为结核分枝杆菌的染色体的3729597位点,序列为g/c;snp位点858为结核分枝杆菌的染色体的3732624位点,序列为a/g;snp位点859为结核分枝杆菌的染色体的3734291位点,序列为a/t;snp位点860为结核分枝杆菌的染色体的3734795位点,序列为c/t;snp位点861为结核分枝杆菌的染色体的3736205位点,序列为g/t;snp位点862为结核分枝杆菌的染色体的3737826位点,序列为t/c;snp位点863为结核分枝杆菌的染色体的3740181位点,序列为t/c;snp位点864为结核分枝杆菌的染色体的3741240位点,序列为c/t;snp位点865为结核分枝杆菌的染色体的3745124位点,序列为g/a;snp位点866为结核分枝杆菌的染色体的3745186位点,序列为a/g;snp位点867为结核分枝杆菌的染色体的3745190位点,序列为g/a;snp位点868为结核分枝杆菌的染色体的3749241位点,序列为g/c;snp位点869为结核分枝杆菌的染色体的3752006位点,序列为g/a;snp位点870为结核分枝杆菌的染色体的3754169位点,序列为g/c;snp位点871为结核分枝杆菌的染色体的3754668位点,序列为c/t;snp位点872为结核分枝杆菌的染色体的3763443位点,序列为g/c;snp位点873为结核分枝杆菌的染色体的3763901位点,序列为g/a;snp位点874为结核分枝杆菌的染色体的3765132位点,序列为g/c;snp位点875为结核分枝杆菌的染色体的3766432位点,序列为c/t;snp位点876为结核分枝杆菌的染色体的3767659位点,序列为g/c;snp位点877为结核分枝杆菌的染色体的3770919位点,序列为g/a;snp位点878为结核分枝杆菌的染色体的3771009位点,序列为t/g;snp位点879为结核分枝杆菌的染色体的3778311位点,序列为g/a;snp位点880为结核分枝杆菌的染色体的3779060位点,序列为g/a;snp位点881为结核分枝杆菌的染色体的3787466位点,序列为g/c;snp位点882为结核分枝杆菌的染色体的3787486位点,序列为g/t;snp位点883为结核分枝杆菌的染色体的3791660位点,序列为c/a;snp位点884为结核分枝杆菌的染色体的3793922位点,序列为c/t;snp位点885为结核分枝杆菌的染色体的3794315位点,序列为c/g;snp位点886为结核分枝杆菌的染色体的3797028位点,序列为a/g;snp位点887为结核分枝杆菌的染色体的3799512位点,序列为c/t;snp位点888为结核分枝杆菌的染色体的3804380位点,序列为t/c;snp位点889为结核分枝杆菌的染色体的3805410位点,序列为g/c;snp位点890为结核分枝杆菌的染色体的3805987位点,序列为t/g;snp位点891为结核分枝杆菌的染色体的3806392位点,序列为c/t;snp位点892为结核分枝杆菌的染色体的3807928位点,序列为g/a;snp位点893为结核分枝杆菌的染色体的3811694位点,序列为c/a;snp位点894为结核分枝杆菌的染色体的3820486位点,序列为g/a;snp位点895为结核分枝杆菌的染色体的3824272位点,序列为c/t;snp位点896为结核分枝杆菌的染色体的3828710位点,序列为g/a;snp位点897为结核分枝杆菌的染色体的3831749位点,序列为t/c;snp位点898为结核分枝杆菌的染色体的3838729位点,序列为g/a;snp位点899为结核分枝杆菌的染色体的3842384位点,序列为a/g;snp位点900为结核分枝杆菌的染色体的3842392位点,序列为g/c;snp位点901为结核分枝杆菌的染色体的3842394位点,序列为t/g;snp位点902为结核分枝杆菌的染色体的3842425位点,序列为t/a;snp位点903为结核分枝杆菌的染色体的3842611位点,序列为g/a;snp位点904为结核分枝杆菌的染色体的3846749位点,序列为g/c;snp位点905为结核分枝杆菌的染色体的3847215位点,序列为t/c;snp位点906为结核分枝杆菌的染色体的3847221位点,序列为t/c;snp位点907为结核分枝杆菌的染色体的3862850位点,序列为g/a;snp位点908为结核分枝杆菌的染色体的3865296位点,序列为c/t;snp位点909为结核分枝杆菌的染色体的3868506位点,序列为c/t;snp位点910为结核分枝杆菌的染色体的3876570位点,序列为t/c;snp位点911为结核分枝杆菌的染色体的3880175位点,序列为c/a;snp位点912为结核分枝杆菌的染色体的3880778位点,序列为g/a;snp位点913为结核分枝杆菌的染色体的3881709位点,序列为a/g;snp位点914为结核分枝杆菌的染色体的3882905位点,序列为a/c;snp位点915为结核分枝杆菌的染色体的3883796位点,序列为g/t;snp位点916为结核分枝杆菌的染色体的3883797位点,序列为g/a;snp位点917为结核分枝杆菌的染色体的3884697位点,序列为c/g;snp位点918为结核分枝杆菌的染色体的3892234位点,序列为t/g;snp位点919为结核分枝杆菌的染色体的3892897位点,序列为a/g;snp位点920为结核分枝杆菌的染色体的3894980位点,序列为c/t;snp位点921为结核分枝杆菌的染色体的3895146位点,序列为g/a;snp位点922为结核分枝杆菌的染色体的3895149位点,序列为a/g;snp位点923为结核分枝杆菌的染色体的3895150位点,序列为g/t;snp位点924为结核分枝杆菌的染色体的3895151位点,序列为t/g;snp位点925为结核分枝杆菌的染色体的3895157位点,序列为a/g;snp位点926为结核分枝杆菌的染色体的3895158位点,序列为g/c;snp位点927为结核分枝杆菌的染色体的3895159位点,序列为c/t;snp位点928为结核分枝杆菌的染色体的3895442位点,序列为g/a;snp位点929为结核分枝杆菌的染色体的3902119位点,序列为a/t;snp位点930为结核分枝杆菌的染色体的3929350位点,序列为t/a;snp位点931为结核分枝杆菌的染色体的3930442位点,序列为g/a;snp位点932为结核分枝杆菌的染色体的3931139位点,序列为t/c;snp位点933为结核分枝杆菌的染色体的3935494位点,序列为c/a;snp位点934为结核分枝杆菌的染色体的3937848位点,序列为a/g;snp位点935为结核分枝杆菌的染色体的3940932位点,序列为g/a;snp位点936为结核分枝杆菌的染色体的3941572位点,序列为c/g;snp位点937为结核分枝杆菌的染色体的3945928位点,序列为t/c;snp位点938为结核分枝杆菌的染色体的3947395位点,序列为g/a;snp位点939为结核分枝杆菌的染色体的3952753位点,序列为g/c;snp位点940为结核分枝杆菌的染色体的3958971位点,序列为g/a;snp位点941为结核分枝杆菌的染色体的3960322位点,序列为c/g;snp位点942为结核分枝杆菌的染色体的3964930位点,序列为c/t;snp位点943为结核分枝杆菌的染色体的3967507位点,序列为g/a;snp位点944为结核分枝杆菌的染色体的3970123位点,序列为a/g;snp位点945为结核分枝杆菌的染色体的3971609位点,序列为t/g;snp位点946为结核分枝杆菌的染色体的3976472位点,序列为c/t;snp位点947为结核分枝杆菌的染色体的3990093位点,序列为c/t;snp位点948为结核分枝杆菌的染色体的4004896位点,序列为g/a;snp位点949为结核分枝杆菌的染色体的4005360位点,序列为c/a;snp位点950为结核分枝杆菌的染色体的4007272位点,序列为g/a;snp位点951为结核分枝杆菌的染色体的4013858位点,序列为c/t;snp位点952为结核分枝杆菌的染色体的4023049位点,序列为g/a;snp位点953为结核分枝杆菌的染色体的4033364位点,序列为a/t;snp位点954为结核分枝杆菌的染色体的4034433位点,序列为c/t;snp位点955为结核分枝杆菌的染色体的4040753位点,序列为c/t;snp位点956为结核分枝杆菌的染色体的4043248位点,序列为c/t;snp位点957为结核分枝杆菌的染色体的4053050位点,序列为a/g;snp位点958为结核分枝杆菌的染色体的4058792位点,序列为t/g;snp位点959为结核分枝杆菌的染色体的4060100位点,序列为g/a;snp位点960为结核分枝杆菌的染色体的4062293位点,序列为c/a;snp位点961为结核分枝杆菌的染色体的4075145位点,序列为g/c;snp位点962为结核分枝杆菌的染色体的4078056位点,序列为g/c;snp位点963为结核分枝杆菌的染色体的4082366位点,序列为g/c;snp位点964为结核分枝杆菌的染色体的4083340位点,序列为g/a;snp位点965为结核分枝杆菌的染色体的4087495位点,序列为a/g;snp位点966为结核分枝杆菌的染色体的4087880位点,序列为g/a;snp位点967为结核分枝杆菌的染色体的4090453位点,序列为c/g;snp位点968为结核分枝杆菌的染色体的4090890位点,序列为g/t;snp位点969为结核分枝杆菌的染色体的4097569位点,序列为g/t;snp位点970为结核分枝杆菌的染色体的4099286位点,序列为g/a;snp位点971为结核分枝杆菌的染色体的4101865位点,序列为g/c;snp位点972为结核分枝杆菌的染色体的4111038位点,序列为t/a;snp位点973为结核分枝杆菌的染色体的4111598位点,序列为g/a;snp位点974为结核分枝杆菌的染色体的4124254位点,序列为c/g;snp位点975为结核分枝杆菌的染色体的4127714位点,序列为a/c;snp位点976为结核分枝杆菌的染色体的4131236位点,序列为g/a;snp位点977为结核分枝杆菌的染色体的4131262位点,序列为g/c;snp位点978为结核分枝杆菌的染色体的4132509位点,序列为g/a;snp位点979为结核分枝杆菌的染色体的4135702位点,序列为c/t;snp位点980为结核分枝杆菌的染色体的4138622位点,序列为g/a;snp位点981为结核分枝杆菌的染色体的4147047位点,序列为g/c;snp位点982为结核分枝杆菌的染色体的4147994位点,序列为t/c;snp位点983为结核分枝杆菌的染色体的4148499位点,序列为c/t;snp位点984为结核分枝杆菌的染色体的4151014位点,序列为a/g;snp位点985为结核分枝杆菌的染色体的4152025位点,序列为g/a;snp位点986为结核分枝杆菌的染色体的4153475位点,序列为g/c;snp位点987为结核分枝杆菌的染色体的4156742位点,序列为a/g;snp位点988为结核分枝杆菌的染色体的4157512位点,序列为c/t;snp位点989为结核分枝杆菌的染色体的4159398位点,序列为a/g;snp位点990为结核分枝杆菌的染色体的4161737位点,序列为c/g;snp位点991为结核分枝杆菌的染色体的4165432位点,序列为g/a;snp位点992为结核分枝杆菌的染色体的4166290位点,序列为g/a;snp位点993为结核分枝杆菌的染色体的4170240位点,序列为g/a;snp位点994为结核分枝杆菌的染色体的4171788位点,序列为a/c;snp位点995为结核分枝杆菌的染色体的4172086位点,序列为t/c;snp位点996为结核分枝杆菌的染色体的4174388位点,序列为g/c;snp位点997为结核分枝杆菌的染色体的4180075位点,序列为g/a;snp位点998为结核分枝杆菌的染色体的4183734位点,序列为g/a;snp位点999为结核分枝杆菌的染色体的4185055位点,序列为g/a;snp位点1000为结核分枝杆菌的染色体的4199398位点,序列为g/a;snp位点1001为结核分枝杆菌的染色体的4201963位点,序列为g/t;snp位点1002为结核分枝杆菌的染色体的4204478位点,序列为g/t;snp位点1003为结核分枝杆菌的染色体的4206960位点,序列为g/a;snp位点1004为结核分枝杆菌的染色体的4208317位点,序列为t/g;snp位点1005为结核分枝杆菌的染色体的4220393位点,序列为g/c;snp位点1006为结核分枝杆菌的染色体的4221849位点,序列为g/a;snp位点1007为结核分枝杆菌的染色体的4225225位点,序列为c/g;snp位点1008为结核分枝杆菌的染色体的4225865位点,序列为t/c;snp位点1009为结核分枝杆菌的染色体的4230333位点,序列为g/a;snp位点1010为结核分枝杆菌的染色体的4232273位点,序列为g/a;snp位点1011为结核分枝杆菌的染色体的4235277位点,序列为c/g;snp位点1012为结核分枝杆菌的染色体的4237558位点,序列为g/c;snp位点1013为结核分枝杆菌的染色体的4247919位点,序列为g/a;snp位点1014为结核分枝杆菌的染色体的4249195位点,序列为c/a;snp位点1015为结核分枝杆菌的染色体的4249334位点,序列为g/a;snp位点1016为结核分枝杆菌的染色体的4260135位点,序列为g/t;snp位点1017为结核分枝杆菌的染色体的4264537位点,序列为c/a;snp位点1018为结核分枝杆菌的染色体的4265151位点,序列为c/g;snp位点1019为结核分枝杆菌的染色体的4266983位点,序列为g/a;snp位点1020为结核分枝杆菌的染色体的4281944位点,序列为g/a;snp位点1021为结核分枝杆菌的染色体的4282707位点,序列为c/g;snp位点1022为结核分枝杆菌的染色体的4286937位点,序列为c/t;snp位点1023为结核分枝杆菌的染色体的4291078位点,序列为g/t;snp位点1024为结核分枝杆菌的染色体的4291979位点,序列为t/g;snp位点1025为结核分枝杆菌的染色体的4296077位点,序列为g/c;snp位点1026为结核分枝杆菌的染色体的4296231位点,序列为g/a;snp位点1027为结核分枝杆菌的染色体的4302956位点,序列为g/a;snp位点1028为结核分枝杆菌的染色体的4303333位点,序列为a/g;snp位点1029为结核分枝杆菌的染色体的4308976位点,序列为g/c;snp位点1030为结核分枝杆菌的染色体的4309137位点,序列为c/a;snp位点1031为结核分枝杆菌的染色体的4313156位点,序列为g/a;snp位点1032为结核分枝杆菌的染色体的4314018位点,序列为g/a;snp位点1033为结核分枝杆菌的染色体的4314657位点,序列为c/g;snp位点1034为结核分枝杆菌的染色体的4314765位点,序列为g/a;snp位点1035为结核分枝杆菌的染色体的4314815位点,序列为c/g;snp位点1036为结核分枝杆菌的染色体的4315395位点,序列为g/c;snp位点1037为结核分枝杆菌的染色体的4316938位点,序列为c/t;snp位点1038为结核分枝杆菌的染色体的4319179位点,序列为g/c;snp位点1039为结核分枝杆菌的染色体的4320514位点,序列为g/a;snp位点1040为结核分枝杆菌的染色体的4322555位点,序列为t/c;snp位点1041为结核分枝杆菌的染色体的4327373位点,序列为a/g;snp位点1042为结核分枝杆菌的染色体的4329783位点,序列为g/a;snp位点1043为结核分枝杆菌的染色体的4334692位点,序列为c/t;snp位点1044为结核分枝杆菌的染色体的4334957位点,序列为g/c;snp位点1045为结核分枝杆菌的染色体的4338250位点,序列为g/t;snp位点1046为结核分枝杆菌的染色体的4343784位点,序列为g/a;snp位点1047为结核分枝杆菌的染色体的4345548位点,序列为g/a;snp位点1048为结核分枝杆菌的染色体的4349642位点,序列为g/t;snp位点1049为结核分枝杆菌的染色体的4352200位点,序列为g/t;snp位点1050为结核分枝杆菌的染色体的4352600位点,序列为a/g;snp位点1051为结核分枝杆菌的染色体的4352940位点,序列为c/g;snp位点1052为结核分枝杆菌的染色体的4353835位点,序列为c/g;snp位点1053为结核分枝杆菌的染色体的4355319位点,序列为c/g;snp位点1054为结核分枝杆菌的染色体的4358148位点,序列为g/a;snp位点1055为结核分枝杆菌的染色体的4358392位点,序列为g/c;snp位点1056为结核分枝杆菌的染色体的4366689位点,序列为c/g;snp位点1057为结核分枝杆菌的染色体的4373504位点,序列为g/c;snp位点1058为结核分枝杆菌的染色体的4373689位点,序列为c/g;snp位点1059为结核分枝杆菌的染色体的4376549位点,序列为c/g;snp位点1060为结核分枝杆菌的染色体的4379438位点,序列为t/c;snp位点1061为结核分枝杆菌的染色体的4381746位点,序列为g/c;snp位点1062为结核分枝杆菌的染色体的4384064位点,序列为c/g;snp位点1063为结核分枝杆菌的染色体的4386248位点,序列为g/c;snp位点1064为结核分枝杆菌的染色体的4386834位点,序列为c/t;snp位点1065为结核分枝杆菌的染色体的4390471位点,序列为c/a;snp位点1066为结核分枝杆菌的染色体的4391008位点,序列为g/c;snp位点1067为结核分枝杆菌的染色体的4397857位点,序列为a/g;snp位点1068为结核分枝杆菌的染色体的4400863位点,序列为g/c;snp位点1069为结核分枝杆菌的染色体的4401262位点,序列为c/t;snp位点1070为结核分枝杆菌的染色体的4401509位点,序列为c/t;snp位点1071为结核分枝杆菌的染色体的4406788位点,序列为g/c;snp位点1072为结核分枝杆菌的染色体的4408175位点,序列为c/g;snp位点1073为结核分枝杆菌的染色体的4409954位点,序列为g/c。发明人从ncbi数据库获得30个结核分枝杆菌谱系3的全基因组数据,在此基础上进行比对,构建结核分枝杆菌谱系3的进化树后,通过设置fst系数筛选出最能代表结核分枝杆菌谱系3进化树上每一分枝的共1073个snp位点,该1073个snp位点以nc_000962.3的结核分枝杆菌h37rv的全基因组序列为基础进行定义和定位的。由于本发明提供的1073个snp位点在最大程度上体现了结核分枝杆菌谱系3的关键信息,所以,对待研究的结核分枝杆菌的上述上述1073个snp位点进行检测,对得到的检测数据进行分析,就可以结核分枝杆菌谱系3的分型,具体为实现菌株水平的鉴定或进化分析或是亚谱系判断。可以理解的是,对未知具体分类的结核分枝杆菌谱系3菌株进行上述1073个snp位点的检测,经对比,可以得知该菌株具体属于哪一种亚谱系,进一步精确到菌株水平的分型,同时通过进化树等手段的分析得知菌株的进化信息。用于检测1073个snp位点的物质针对结核分枝杆菌谱系3,在如下任一种中的应用:1)亚谱系判断的产品;2)菌株水平鉴定的产品;3)进化分析的产品;此处的1073个snp位点为上述具体列举的1073个snp位点。本发明提供的1073个snp位点将ncbi数据库中30个结核分枝杆菌谱系3的分为3个亚谱系。此外,本发明提供的1073个snp位点也可以实现结核分枝杆菌的菌株水平鉴定。研究证实,本发明提供的1073个snp位点和全部的8900个snp位点的分辨能力基本相当。此外,由于本发明提供的snp位点数量远远小于现有技术中所需的snp位点数量,所以又大大降低了snp的检测数量与成本。因此,开发制备用于检测该1073个snp位点的物质,并且制备成检测产品,例如试剂或试剂盒,这对结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断或是菌株水平鉴定或是进化分析都有的重要意义。在优选地实施方式中,用于检测1073个snp位点的物质包括pcr引物、芯片、生物传感器或分子探针。可以理解的是,可以采用现有技术中能够对snp位点进行检测的物质对该1073个snp位点检测,例如但不限于pcr引物、芯片、生物传感器或分子探针,不同形式的检测物质也就对应了不同的检测手段,例如pcr或芯片法的检测形式,都可以将检测引物或芯片制备成试剂或试剂盒的产品形式,试剂或试剂盒还可以包括检测用的其他常规材料,例如缓冲液、聚合酶、dntps等等。一种对结核分枝杆菌谱系3进行亚谱系判断和/或菌株水平鉴定和/或进化分析的试剂盒,包括上述用于检测1073个snp位点的物质。利用用于检测1073个snp位点的物质制备成产品形式的试剂盒,方便1073个snp位点的检测以及操作的规范和模块化,该试剂盒准确率高,实用性强。在优选地实施方式中,物质包括pcr引物、芯片、生物传感器或分子探针。一种对结核分枝杆菌谱系3进行亚谱系判断和/或菌株水平鉴定和/或进化分析的方法,对本发明提供的1073个snp位点进行检测,构建进化树进行分析。该方法将未知菌株的1073个snp位点对应位置的碱基检测提取出来,再与本发明中已知的序列构建进化树,如果是同一谱系会聚在一起,非谱系3的菌会分离自成一支。该方法具有良好的分辨率,克服了vntr分型方法的同源异质性的缺点,并且也克服了wgs分析数据繁杂的缺点,具有良好的实用价值。在优选地实施方式中,对本发明提供的1073个snp位点的检测方法可以采用现有技术中的相关手段,在此不做特殊限定。本发明中snp位点的检测方法例如可以为但不限于质谱检测法或基于凝胶电泳的snp检测法等等。其中,基于凝胶电泳的snp检测法包括但不限于:a)变性梯度凝胶电泳检测法;b)单链构象多态性检测法;c)等位基因特异性pcr检测法;d)酶切扩增多态性序列检测法等等;质谱检测法例如但不限于基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱检测法等等。与现有技术相比,本发明的有益效果为:发明人从ncbi数据库中得到30个结核分枝杆菌谱系3的全基因组序列,通过分析优化得到共1073个snp位点,这1073个snp位点为确定结核分枝杆菌谱系3的亚谱系、菌株水平和基因功能密切相关的关键snp位点。这1073个snp位点除了能够将30个结核分枝杆菌谱系3细分为3个亚谱系,还能实现菌株水平的鉴定,该领域的技术分辨率得到远远提高。现有技术中需要8900个snp位点才可以将ncbi数据库中的30株结核分枝杆菌谱系3分成3个亚谱系,并且实现菌株水平的鉴定。研究证实,本发明提供的1073个snp位点的分辨能力与现有技术中8900个snp位点的效果相同,然而,本申请的技术方案中snp位点数量远小于8900个snp位点的数量。本发明最终实现在分辨率和snp位点数量之间取得最佳平衡。该1073个snp位点对结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析,甚至是成簇菌株分析都具有重要意义,用于检测这1073个snp位点的物质及其构成的试剂盒与相关的检测方法都能实现结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析。附图说明图1为实施例2中1073个snp位点构建得到的进化树;图2为实施例2中mst图验证结果。具体实施方式下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。实施例1筛选snp位点的步骤如下:1、菌株数据下载:在ncbi数据库中进行筛查,获取具有代表性的结核分枝杆菌谱系3的测序信息,下载筛查得到的结核分枝杆菌谱系3的全基因组数据,结果共获得30株结核分枝杆菌谱系3的相关数据。2、质量评估全基因组数据:对30株结核分枝杆菌谱系3的全基因组数据(fastq文件)中的gc含量进行质检评估,工具采用软件fastqc(version0.10.1),具体标准如下:(1)删除30株结核分枝杆菌谱系3的测序数据中gc含量大于70%的测序数;(2)删除30株结核分枝杆菌谱系3的测序数据中gc含量小于60%的测序数据;(3)删除30株结核分枝杆菌谱系3的测序数据中snpmisscall值大于15%的测序数据。结果上述30株结核分枝杆菌谱系3的测序数据全部纳入本研究之中。3、统计回帖率:以结核分枝杆菌参考基因组h37rv(nc_000962.3)为参照,利用软件bwa(version0.7.12)对其余菌株的测序文件进行统计,计算得到菌株的回帖率。筛选回帖率小于85%的菌株数据进行删除。4、snpcalling:利用工具samtoolsv1.6,处理步骤3中生成的sam文件,将bam转换成bcf,同时进行排序处理和去重操作。利用变异鉴定软件bcftoolsv1.6对得到的bcf文件进行snp的鉴定,舍弃结果中基因组比对的质量小于30或者碱基的质量小于50的snp位点。随后使用plink2.0筛选maf>0.05和缺失率<0.1的位点。并使用repeatmasker(http://www.repeatmasker.org/)或phagefinder排除位于基因组重复区域的所有snp(例如,ppe/pe-pgrs家族基因,噬菌体序列,插入或移动遗传元件)。最终,从30株结核分枝杆菌菌株的基因数据中得到1073个snp位点。实施例2构建进化树包括如下步骤:1、样本过滤:利用实施例1中的方法处理数据,得到本发明提供的1073个snp位点。2、构建进化树:采用mega(version6.0)软件构建进化树,以本发明提供的1073个snp位点为处理对象,数据处理时,将m.canettii(nc_019950.1)菌株作为外群的菌株,采用邻接法生成进化树。然后,对bootstrapvalue大于95%的分枝进行分群处理,对进化树进行谱系分群,最终得到系统进化树,构建的进化树如图1所示。从图中可以看出,构建的进化树可以将30株结核分枝杆菌谱系3分为3个亚谱系,具体为亚谱系3.1,3.2,3.3。3、亚谱系判断效果评估现有技术中总共需要8900个snp位点才能实现将结核分枝杆菌谱系3分为3个亚谱系,或者实现菌株水平的鉴定。结果发现,本发明提供的1073个snp位点同样将结核分枝杆菌谱系3分成相同的3个亚谱系,并且实现菌种水平的鉴定。由此可以看出,本发明提供的1073个snp位点在数量上显著少于8900个snp位点,同时又具有良好的分辨能力,分型准确。4、1073个snp位点的菌株水平鉴定结核分枝杆菌mdr_31251的分型类型为已知,发明人在ncbi数据库上得到mdr_31251的全基因组。获取该菌株的1073个snp位点的信息,对该菌株进行分型,结果如下表1,mst图验证结果如图2所示,可以看出,1073个snp位点的菌株水平鉴定效果与参考文献一致。表1已知参考菌株基因组注释accesion预测的谱系和亚谱系mst的鉴定结果参考的谱系结果mdr_312513;3.1东非-中亚谱系东非-中亚谱系尽管已用具体实施例来说明和描述了本发明,然而应意识到,在不背离本发明的精神和范围的情况下可以作出许多其它的更改和修改。因此,这意味着在所附权利要求中包括属于本发明范围内的所有这些变化和修改。当前第1页12
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