一种用于诊断泡型棘球蚴病的串联蛋白及其克隆表达方法与流程

文档序号:23261140发布日期:2020-12-11 18:49阅读:141来源:国知局
本发明涉及基因工程领域及蛋白质组学领域,具体为一种用于诊断泡型棘球蚴病的串联蛋白及其克隆表达方法。
背景技术
:泡型棘球蚴病(alveolarechinococcosis,ae)是由多房棘球绦虫(echinococcusmultilocularis,em)的续绦期幼虫感染引起的一种人畜共患寄生性蠕虫疾病。该病在中国、日本、俄罗斯、中亚和北美部分地区流行严重。根治性肝切除手术是目前唯一比较可靠的治疗方法。因此,ae早期免疫诊断是降低本病死亡率的关键要求。对ae进行早期诊断并采取及时措施,可显著降低因ae造成的低死亡率。目前,对于该病的诊断,尤其是确诊该病,还主要依赖于病原学及影像学诊断。但影像学诊断需要影像学背景知识,操作复杂,却又不易识别较小和非典型的病灶,尤其又不易与脓肿或肿瘤进行区别当前,基于纯化的天然抗原em2的酶联免疫吸附试验(em2-elisa)的诊断方法已被世界卫生组织推荐用于ae的血清诊断。技术实现要素:本发明的目的一在于提供一种用于诊断泡型棘球蚴病的串联蛋白。本发明提供的串联蛋白为escherichiacolipet28a-bl21(de3)/01/emagb3-gggs-em18(以下简称为emagb3-gggs-em18),该蛋白现保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号cctccno:m2019622,保藏日期2019年8月12日。em18是ae的一个新的蛋白质表位,具有显著的抗体反应性,em18通过免疫印迹很容易就被检测到,是一种良好的血清学标记标签,可用于与其它寄生虫病的鉴别,其也可以鉴别活动期和非活动期ae的鉴别。emagb3抗原的同种型针对活动期ae的患者血清的特异性免疫反应性,克隆该基因并进行细菌的原核表达(remagb3),免疫印迹表明,该蛋白的敏感性和特异性分别为90.9%(80/88)和98.5%(597/606),表明emagb3可适用于血清学诊断和ae的随访监测。且remagb3的使用具有简易性和高重复性,可能适用于ae患者的临床诊断和流行区域的大规模流行病学调查。鉴于emagb3和em18两个蛋白质良好的免疫原性,且为了增加蛋白的抗原性,利用一个linker蛋白gggs,将这两个蛋白进行了串联表达,以提高对ae的检测率。本发明的目的二,是提供一种串联蛋白emagb3-gggs-em18的克隆表达方法,具体步骤如下:(1)扩增emagb3和em18基因:扩增emagb3基因,其中上游引物引入bamhi酶切位点,下游引物引入hindiii酶切位点,引物序列如下:emagb3f:5´-cggatccgatgatgatgaagtgacc-3´;emagb3r:5´-caagcttctactcatcctctttaat-3´;扩增em18基因,其中上下游引物引入bamhi酶切位点,引物序列如下:em18f:5´-ggatccgaaggagtctgacttagcggat-3´;em18r:5´-ggatcctatttgaggttggccagcttcgt-3´。(2)emagb3-gggs-em18的基因合成:根据emagb3和em18的基因序列,在其上游加上ndei酶切位点,在其下游加上xhoi酶切位点的序列进行生物合成,并在emagb3和em18之间加上连接蛋白gggs蛋白。(3)载体酶切:将表达载体pet28a分别进行双酶切,酶切体系为:pet28a1μg,10×fdbuffer5μl,ndei1μl(10u/μl),xhoi1μl(10u/μl),ddh2o42μl;(4)目的片段与载体连接:将回收纯化好emagb3-gggs-em18dna片段分别与线性化的pet28a载体进行连接,连接体系为:2×seamlesscloningmastermix10μl,线性pgex-6p-1/pet28a3μl,emagb3/emagb3-gggs-em185μl,sterilizedddh2o2μl;(5)转化e.colidh5α感受态细胞后筛选克隆:将上述连接液转化e.colidh5α感受态细胞中,检测筛选出阳性克隆测序鉴定后,扩繁并提取重组pet28a质粒载体;(6)诱导表达融合蛋白:取1ul鉴定重组后的pgex-6p-1/pet28a载体转化bl21(de3),将培养的菌液按1:100比例接种于2l含有相应种类和浓度抗生素的lb液体培养基中,37℃,220rpm培养,当od值达到0.6时,添加终浓度为0.5mmiptg,20℃,220rpm,诱导过夜,离心收集细胞菌体;(7)蛋白的纯化:超声破碎菌体,采用镍琼脂糖亲和层析纯化重组emagb3-gggs-em18。本发明提供的技术方案本研究通过生物工程技术,借助一个linker蛋白gggs,将emagb3蛋白和em18蛋白进行了串联表达,获得了融合蛋白emagb3-gggs-em18。通过上述方法克隆纯化后的融合蛋白emagb3-gggs-em18浓度为0.5mg/ml。串联后的蛋白,其分子量比原有蛋白增大了许多,随之抗原性也得到了增强。这为建立更加敏感和特异的血清学诊断方法、疫苗的研制和免疫预防奠定了基础。保藏说明:培养物名称:escherichiacolipet28a-bl21(de3)/01/emagb3-gggs-em18保藏机构:中国典型培养物保藏中心保藏机构简称:cctcc地址:中国湖北省武汉市武汉大学保藏日期:2019年8月12日保藏中心登记入册编号:cctccno:m2019622。具体实施方式下面结合具体实施实例对本发明进行详细说明。以下实施实例有助于此领域的技术人员进一步理解本发明,但不以任何形式限制本发明。下述实施例中使用的em青海田鼠分离株由本实验室田间分离鉴定并保存。下述实施例中所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。实施例1emagb3及em18基因的克隆及序列测定。采用easypurernakitrna提取试剂盒提取保存的原头蚴的总rna,qiaampdnaminikitdna提取原头蚴的基因组dna作为模板分别用于扩增emagb3和em18基因。(1)emagb3基因的扩增利用easyscript®one-steprt-pcrsupermixrt-pcr扩增试剂盒扩增emagb3基因。反应体系为:pcr反应总体积为20μl,其中包含2μl的模板rna、各0.5μl浓度为10μm的上下游引物(emagb3f、emagb3r)、10μl的2×one-stepreactionmix、0.5μleasyscriptone-stepenzymemix、6.5μlddh2o。反应条件为:45℃反转录30min,95℃预变性3min,接着进行45个循环扩增(95℃变性1min、60℃退火45s、72℃延伸1min)、72℃再延伸5min后4℃保存。取2μl的pcr产物进行1.5%浓度的琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。(2)em18基因的扩增利用transdirectanimaltissuepcrkit试剂盒扩增em18基因。pcr反应总体系为20μl,其中包含2μl的模板dna、各0.5μl浓度为10μm的上下游引物(em18f、em8r)、10μl的2×transdirectsupermix(+dye),9μlddh2o。反应条件分别为:反应条件为:95℃预变性5min,95℃变性1min、55℃退火45s、72℃延伸1min,进行35个循环。之后72℃再延伸10min后4℃保存。取2μl的pcr产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。(3)pcr产物胶回收纯化及t载体克隆测序将琼脂糖凝胶上的目的条带切胶后,利用gelextractionkit凝胶回收试剂盒回收、纯化emagb3和em18基因pcr产物,分别将其与pgem-t载体连接,转化至e.colidh5α感受态细胞后,涂布接种到含ampcillicin(100μg/ml)、iptg(40μg/ml)、x-gal(100μg/ml)的lb琼脂平板。正置待表面不见流动液体,翻转并在37℃培养箱培养24h,挑选白色菌落。菌落pcr鉴定后,用含ampampcillicin(100μg/ml)的lb液体培养基增菌培养后,菌液送上海生工生物工程技术服务有限公司进行测序。测序结果返回后,利用ncbi网站的blast功能将pcr产物序列与数据库中的参考序列进行在线比对。移液器吸取2μl的emagb3及em18的pcr产物进行1.5%浓度的琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,紫外凝胶成像结果,可见目的条带,大小分别为213bp及495bp。emagb3及em18的pcr产物胶回收纯化、pgem-t载体克隆测序后,经比对,其与ncbi数据库中已经报道的序列完全符合,em青海田鼠分离株emagb3及em18基因与参考序列没有任何碱基缺失和替换等碱基的不同。实施例2emagb3-gggs-em18的基因合成。在对emagb3和em18基因克隆测序并序列比对的基础上,确定正确的emagb3和em18核苷酸序列后,为了保证后续克隆表达的正确性,采用直接生物合成的方式合成需要表达的基因序列。根据emagb3基因的序列(emuj_000381600)和em18序列(登录号:ay513264),在其上游加上ndei酶切位点,在其下游加上xhoi酶切位点的序列进行生物合成。并在emagb3和em18之间加上连接蛋白gggs蛋白,加上酶切位点及gggs蛋白后,按照需要表达的核实的dna序列采用生物合成的方法合成需要表达的序列。合成基因ndei-emagb3-gggs-em18-xhoi的琼脂糖凝胶电泳结果条带清晰。实施例3载体酶切。将表达载体pet28a分别进行双酶切,50μl酶切体系如下:pet28a1μg10×fdbuffer5μlndei1μl(10u/μl)xhoi1μl(10u/μl)ddh2o42μl合计50μl将配好以上体系的pcr管放入37℃恒温水浴锅中反应2h,胶回收纯化酶切后的线性载体片段,用于下游无缝克隆。实施例4目的片段与载体连接。按照bbi无缝克隆试剂盒操作手册,将回收纯化好emagb3-gggs-em18dna片段分别与线性化的pet28a载体进行连接,连接体系如下2×seamlesscloningmastermix10μl线性pgex-6p-1/pet28a3μlemagb3/emagb3-gggs-em185μlsterilizedddh2o2μl合计20ul将含有上述连接混合液的pcr离心管放置于50℃pcr仪中连接反应20min。反应结束后,立即将离心管置于冰上。实施例5转化e.colidh5α感受态细胞后筛选克隆。将上述连接液转化e.colidh5α感受态细胞中,检测筛选出阳性克隆测序鉴定后,扩繁并提取重组pet28a质粒载体,用于转化bl21(de3)感受态细胞。实施例6诱导表达融合蛋白。1.转化取1ul鉴定重组后的pgex-6p-1/pet28a载体转化bl21(de3),42℃热休克90s后冰上静置2min后涂布含有抗生素的lb固体平板培养基上(重组pet28a克隆用含有30μg/ml卡那霉素的lb固体培养基培养),37℃培养过夜。2.小试培养选择最佳的诱导条件(1)分别配制含有终浓度为30μg/ml卡那霉素的lb液体培养基,用于培养上述转化有重组pet28a载体的bl21(de3)细菌。(2)挑取上述转化重组载体的表达菌株bl21(de3)的单菌落于含有10mllb液体的试管中,37℃,220rpm摇床上培养过夜。(3)将过夜培养的菌液按1:100的比例分别接种于含有对应抗生素的10mllb培养基中,37℃,220rpm进行培养。(4)当od值达到0.6时,添加终浓度为0.5mm的iptg,220rpm,分别20℃诱导过夜、37℃诱导4h,未加iptg诱导剂的作为阴性对照。(5)5000rpm离心10min收集菌体,弃上清,菌体用500μlpbs(ph7.4)缓冲液悬浮,超声破碎6min,超0.5s停1.5s,分别离心收集上清和沉淀,沉淀用500μl包涵体溶解液(8murea、50mmtris-hcl、300mmnacl,ph8.0)溶解,分别取40μl样品与10μl5×proteinloadingbuffer混匀,沸水欲10min。(6)sds-page检测,用5%浓缩胶、12%分离胶进行sds-page电泳。上样量10μl,浓缩胶80v20min,分离胶120v60min,电泳结束后凝胶用考马斯亮蓝r250染色,脱色后观察。通过小试样品进行sds-page分析,结果在35kda附近出现预期大小的目的蛋白条带。3.大量诱导表达融合蛋白将培养的菌液按1:100比例接种于2l含有相应种类和浓度抗生素的lb液体培养基中,37℃,220rpm培养,当od值达到0.6时,添加终浓度为0.5mmiptg,20℃,220rpm,诱导过夜,离心收集细胞菌体。实施例7蛋白的纯化。1.超声破碎菌体将收集的细菌菌体用破碎缓冲液(50mmtris、300mmnacl、0.2mmpmsf,ph8.0)悬浮,冰浴中超声破碎菌体,功率400w,20min(超声2s,暂停6s为一个循环)。超声完毕后,12000rpm,4℃,离心30min,收集上清进行下一步纯化。2.重组emagb3-gggs-em18的镍琼脂糖亲和层析(1)配制bindingbuffer(1mmtris,300mmnacl,ph8.0)、washbuffer(1mmtris,300mmnacl,20mmimidazole,ph8.0)及elutionbuffer(1mmtris,300mmnacl,500mmimidazole,ph8.0)。(2)取5mlni-nta,用10倍柱床体积的bindingbuffer清洗平衡柱子,流速5ml/min。(3)上柱,流速为2ml/min,收集滤液。(4)20倍柱床体积的bindingbuffer清洗柱子,流速5ml/min。(5)washbuffer洗杂,流速5ml/min,收集洗脱液。(6)elutionbuffer洗脱,流速2ml/min,收集洗脱液。(7)将收集到的组分进行sds-page检测,将纯度最好的4组分用透析液a(500mml-arginine,50mmtris,300mmnacl,ph8.0)透析16h后换用透析液b(250mml-arginine,50mmtris,300mmnacl,ph8.0)再透析4h,之后换成ph为7.4的1×pbs再透析6h后超滤浓缩,离心,过滤分装1ml/管,-80℃保存。emagb3-gggs-em18融合蛋白分别经镍琼脂糖亲和层析纯化后进行sds-page鉴定,在35kda附近出现预期大小的目的蛋白条带。实施例8纯化蛋白的检测。1.sds-page检测用5%浓缩胶、12%分离胶进行sds-page电泳。上样量1μg,浓缩胶80v20min,分离胶120v60min,电泳结束后凝胶用考马斯亮蓝r250染色,脱色后观察。目的蛋白经过纯化,sds-page电泳分析在相应位置出现明显条带,表明融合蛋白成功得到了表达纯化。2.westernblot检测(1)制胶:制备聚丙烯酰胺凝胶,其中浓缩胶5%、分离胶12%。(2)制样:上样量为1ug。(3)电泳:浓缩胶80v电泳30min、分离胶120v电泳60min。(4)转膜:250ma湿法转印90min。(5)封闭:5%的脱脂奶粉,37℃缓慢振荡封闭2h。(6)一抗孵育:1:500稀释的兔抗his标签的一抗,37℃恒温振荡器中缓慢振荡孵育60min。(7)二抗孵育:1:8000稀释羊抗兔二抗,37℃缓慢振荡孵育60min。(8)显色:tmb显色。实施例9蛋白浓度测定:采用sk3071非干扰型蛋白定量试剂盒测定最终获得的蛋白质浓度,待测样品体积为20μl。结果测得emagb3-gggs-em18蛋白浓度为0.5mg/ml。序列表<110>青海省畜牧兽医科学院青海省人民医院<120>一种用于诊断泡型棘球蚴病的串联蛋白及其克隆表达方法<130>1<160>2<170>siposequencelisting1.0<210>1<211>227<212>prt<213>escherichiacolipet28a-bl21(de3)/01/emagb3-gggs-em18<400>1aspaspaspgluvalthrglnthrlyslysglyvalmetlysalaile151015sergluilelyshisphepheglnseraspproleuglylyslysleu202530valgluvalmetlysgluvalglyservalcysglnmetvalarglys354045lysalaargmetalaleulysglutyrvalarglysleuilelysglu505560aspgluglyglyglysergluseraspleualaaspmetlysasnlys65707580alaseralatyrgluserlysilealagluleuglumetleuleugln859095glngluarghisalaarggluserleuglnlysserglnasplysleu100105110alaglumetasnarglysleulysglugluthralaalaseralaglu115120125argaspargleumetalaglnargaspgluvalglnarggluvalglu130135140alaglnlysvalalametalalyslysglualaglulysalaglnala145150155160glualagluleuargargmetargglulyshisaspalalyshislys165170175serglnvalasnglyserglyaspalaalaserglnaspaspgluser180185190glualalysgluleugluvalileproasnvalargargthrgluglu195200205serargvalthralavalserlysasngluthrleuglnthrlysleu210215220alaasnleu225<210>2<211>705<212>dna<213>emagb3-gggs-em18串联蛋白(escherichiacolipet28a-bl21(de3)/01/emagb3-gggs-em18)<400>2catatggatgatgatgaagtgacccagacgaagaagggtgtgatgaaggccattagcgag60atcaagcacttcttccaaagtgatccattgggcaaaaagttggttgaagtaatgaaggaa120gtggggagtgtgtgccagatggtgaggaagaaggcacgcatggcactgaaggagtatgtc180agaaagttgattaaagaggatgagtagggaggaagcgagtctgacttagcggatatgaag240aataaggcatctgcctatgagagtaagattgcggagctggagatgctgctacagcaggag300cgacatgcgcgtgagagtcttcagaagagccaagacaaactggcggagatgaacagaaag360ctgaaggaggagactgcggcatcagccgaagagcgcgaccgtctgatggcccagcgtgac420gaagtgcaacgcgaagttgaggctcagaaggtcgccatggccaagaaggaagctgaaaag480gctcaggctgaagctgagcttcgcagaatgcgtgagaaacacgatgcaaagcacaagtcc540caggtcaatggcagtggtgacgctgcttcgcaggatgatgaaagtgaagccaaggaactt600gaggtgataccaaatgtgaggcggacggaggaatcgagggtgacggccgtctctaagaat660gagacgctccagacgaagctggccaacctctaactcgagctcgag705当前第1页12
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