去乙酰氧基头孢菌素C合成酶突变体及其编码基因与应用的制作方法

去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体及其编码基因与应用
技术领域
1.本发明属于酶工程技术领域，具体涉及去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体及其编码基因与应用。


背景技术：

2.去乙酰氧基头孢菌素c合成酶(deacetoxycephalosporin c synthase，daocs)是β-内酰胺类抗生素生物合成过程中的关键酶，其催化五元噻唑环扩环生成六元噻嗪环，从而得到相应的β-内酰胺类代谢产物。
3.头孢菌素c(cpc)是丝状真菌产黄支顶孢霉产生的一种重要的天然β-内酰胺类抗生素。在产黄支顶孢霉基因组上存在编码双功能酶——去乙酰氧基头孢菌素c合成酶(扩环酶)/去乙酰基头孢菌素c合成酶(羟化酶)(deacetoxycephalosporin/deacetylcephalosporin c synthase，daoc/dacs)的cefef基因，是产黄支顶孢霉合成cpc的限速酶，催化青霉素n(penicillin n，pen)发生扩环反应生成去乙氧基头孢菌素c(daoc)，然后催化daoc发生羟基化反应生成去乙酰基头孢菌素c(dacs)。cpc和pen n是产黄支顶孢霉所分泌的主要天然产物，在cpc发酵生产过程中，产黄支顶孢霉还会同时分泌大量的pen n；这两种化合物的分泌取决于他们在细胞水平上的生物合成；因此，提升产黄支顶孢霉扩环酶酶活可能有利于副产物pen n向产物cpc的转化。
4.另外，7-氨基-3-去乙酰氧基头孢烷酸(7-adca)是生产口服头孢类药物的重要中间体原料，主要用于合成头孢氨苄、头孢拉定、头孢羟氨苄等抗生素。以青霉素g钾盐为原料化学合成7-adca是目前在工业生产中普遍采用的方法，然而其合成过程中需要多步化学扩环，反应条件要求高、各步反应产物收率低、生产结束化学污染较重，因此，人们试图用无污染且更经济的酶转化方法来实现头孢菌素母核的合成。青霉素g产量大、价格低，相对有效的方式是利用去乙酰氧基头孢菌素c合成酶，即青霉素扩环酶使青霉素g扩环得到g-7-adca(7-苯乙酰基脱乙酰氧基头孢菌素c)，再去除其7位侧链得到7-adca。然而，野生型daocs的天然底物是目前尚无法大规模工业合成的青霉素n(penicillin n，pen)；该酶对于大量存在的非天然底物青霉素g的反应活性很低，因此实际转化率也很低，限制了去乙酰氧基头孢菌素c合成酶在工业生产上的应用。所以，对daocs进行酶学改造，增强其对大量廉价青霉素g的催化活性，增强其反应稳定性，成为将其引入工业化生产必须解决的首要问题。


技术实现要素：

5.本发明公开了去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体及其编码基因与应用，通过对棒状链霉菌中的去乙酰氧基头孢菌素c合成酶进行定点突变可提高酶的催化活性，进而有利于β-内酰胺类抗生素的合成和转化。
6.为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：
7.去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体，该突变体的氨基酸序列以seq id no.1(野生型去乙酰氧基头孢菌素c合成酶)为参考：mdttvptfslaelqqglhqdefrrclrdkglfyltdcgl
tdtelksakdlvidffehgseaekravtspvptmrrgftglesestaqitntgsysdysmcysmgtadnlfpsgdferiwtqyfdrqytasravarevlratgtepdggveafldcepllrfryfpqvpehrsaeeqplrmaphydlsmvtliqqtpcangfvslqaevggaftdlpyrpdavlvfcgaiatlvtggqvkaprhhvaaprrdqiagssrtssvfflrpnadftfsvplarecgfdvsldgetatfqdwiggnyvnirrtska；具有位于第72位苏氨酸t72、第92位甘氨酸g92中的至少一个突变；第72位苏氨酸突变为除其自身以外任意一种天然氨基酸，第92位甘氨酸突变为除其自身以外任意一种天然氨基酸。
8.进一步地，编码野生型去乙酰氧基头孢菌素c合成酶的核苷酸序列如seq id no.2所示：atggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccaccatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccggcagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaacggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggcaactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatag。
9.进一步地，去乙酰氧基头孢菌素c合成酶单位点突变体氨基酸序列如seq id no.3所示：mdttvptfslaelqqglhqdefrrclrdkglfyltdcgltdtelksakdlvidffehgseaekravtspvpxmrrgftglesestaqitntgsysdysmcysmgtadnlfpsgdferiwtqyfdrqytasravarevlratgtepdggveafldcepllrfryfpqvpehrsaeeqplrmaphydlsmvtliqqtpcangfvslqaevggaftdlpyrpdavlvfcgaiatlvtggqvkaprhhvaaprrdqiagssrtssvfflrpnadftfsvplarecgfdvsldgetatfqdwiggnyvnirrtska，其中第72位x代表除苏氨酸以外的天然氨基酸。
10.进一步地，编码去乙酰氧基头孢菌素c合成酶单位点突变体的核苷酸序列如seq id no.4所示：atggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccnnnatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccggcagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaacggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggc
aactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatag，第72位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中苏氨酸密码子acc以外的其他天然氨基酸密码子序列。
11.进一步地，去乙酰氧基头孢菌素c合成酶单位点突变体氨基酸序列如seq id no.5所示：mdttvptfslaelqqglhqdefrrclrdkglfyltdcgltdtelksakdlvidffehgseaekravtspvptmrrgftglesestaqitntxsysdysmcysmgtadnlfpsgdferiwtqyfdrqytasravarevlratgtepdggveafldcepllrfryfpqvpehrsaeeqplrmaphydlsmvtliqqtpcangfvslqaevggaftdlpyrpdavlvfcgaiatlvtggqvkaprhhvaaprrdqiagssrtssvfflrpnadftfsvplarecgfdvsldgetatfqdwiggnyvnirrtska，其中第92位x代表除甘氨酸以外的天然氨基酸。
12.进一步地，编码去乙酰氧基头孢菌素c合成酶单位点突变体的核苷酸序列如seq id no.6所示：atggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccaccatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccnnnagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaacggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggcaactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatag，第92位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中甘氨酸密码子ggc以外的其他天然氨基酸密码子序列。
13.进一步地，去乙酰氧基头孢菌素c合成酶双位点突变体氨基酸序列如seq id no.7所示：mdttvptfslaelqqglhqdefrrclrdkglfyltdcgltdtelksakdlvidffehgseaekravtspvpxmrrgftglesestaqitntxsysdysmcysmgtadnlfpsgdferiwtqyfdrqytasravarevlratgtepdggveafldcepllrfryfpqvpehrsaeeqplrmaphydlsmvtliqqtpcangfvslqaevggaftdlpyrpdavlvfcgaiatlvtggqvkaprhhvaaprrdqiagssrtssvfflrpnadftfsvplarecgfdvsldgetatfqdwiggnyvnirrtska，其中第72位x代表除苏氨酸以外的天然氨基酸，第92位x代表除甘氨酸以外的天然氨基酸。
14.进一步地，编码去乙酰氧基头孢菌素c合成酶双位点突变体的核苷酸序列如seq id no.8所示：atggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccnnnatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccnnnagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaa
cggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggcaactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatag，第72位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中苏氨酸密码子acc以外的其他天然氨基酸密码子序列，第92位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中甘氨酸密码子ggc以外的其他天然氨基酸密码子序列。
15.优选地，突变体的氨基酸序列以seq id no.1为参考，第72位苏氨酸突变为色氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、天冬氨酸、亮氨酸、组氨酸、异亮氨酸、赖氨酸或蛋氨酸。
16.更优选地，第72位苏氨酸突变为色氨酸或甘氨酸。
17.最优选地，第72位苏氨酸突变为色氨酸。
18.优选地，突变体的氨基酸序列以seq id no.1为参考，第92位甘氨酸突变为蛋氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺或组氨酸。
19.更优选地，第92位甘氨酸突变为蛋氨酸或半胱氨酸。
20.最优选地，第92位甘氨酸突变为蛋氨酸。
21.优选地，突变体的氨基酸序列以seq id no.1为参考，第72位苏氨酸突变为色氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、天冬氨酸、异亮氨酸或组氨酸；第92位甘氨酸突变为蛋氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苯丙氨酸、苏氨酸或丙氨酸。
22.更优选地，上述突变体为双位点突变体t72d/g92c、t72d/g92h、t72g/g92c、t72g/g92m、t72g/g92s、t72i/g92m、t72n/g92m、t72q/g92c、t72q/g92h、t72q/g92m、t72q/g92s、t72w/g92c、t72w/g92f、t72w/g92h、t72w/g92m、t72w/g92n、t72w/g92q、t72w/g92s或t72w/g92t。
23.更优选地，上述突变体为双位点突变体t72g/g92m、t72n/g92m、t72q/g92m、t72w/g92c、t72w/g92f、t72w/g92h、t72w/g92m、t72w/g92n、t72w/g92s或t72w/g92t。
24.最优选地，上述突变体为双位点突变体t72w/g92m。
25.进一步地，上述突变体的制备可利用本领域已知的技术，先构建含有野生型去乙酰氧基头孢菌素c合成酶基因的载体质粒，然后选择定点突变的位点以及突变后的氨基酸种类，合成相应的引物，以含野生型去乙酰氧基头孢菌素c合成酶基因的载体质粒为模板，pcr扩增突变dna片段，分离纯化，然后通过pcr将所得片段扩增为全长突变基因，再将该全长突变基因克隆到适当的载体上并转化适当的宿主细胞，经培养筛选出具有高酶活的阳性克隆，最后从阳性克隆中提取质粒dna，进行dna序列测定分析，以确定引入的突变。或者可通过基因合成的方式，合成整个含有突变酶分子dna序列的质粒载体，然后转化适当的宿主细胞，经培养筛选出具有高酶活的阳性克隆。
26.制备去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体的过程中，可采用任何合适的载体，例如，原核表达载体pet28、prset、pet-30a(+)、pgemt-easy等；真核表达载体pyd1、pyes2/gs等；还可选用puc18/19、pbluscript-sk。
27.一种生物材料，为含有上述基因的表达载体，或含有上述表达载体的酶蛋白表达宿主细胞。
28.进一步地，上述基因可在原核细胞、真核细胞内进行表达，也可采用本领域已知的
no.4、seq id no.6、seq id no.8所示。
44.去乙酰氧基头孢菌素c合成酶野生型及突变体文库由常州基宇生物科技有限公司构建，包括去乙酰氧基头孢菌素c合成酶位点72苏氨酸(t72)的单点饱和突变、92位甘氨酸(g92)的单点饱和突变、72位苏氨酸和92位甘氨酸的部分双点组合突变(t72/g92)；克隆载体选用pet-30a(+)融合蛋白表达载体(卡那霉素抗性，空载体大小为5422bp)，克隆位点为ndei-hindiii(限制性内切酶ndei识别5'-ca
↑
tatg-3'的酶切位点，限制性内切酶hindiii识别5'-a
↑
agctt-3'的酶切位点)，宿主细胞为大肠杆菌top10感受态菌株(购自北京索莱宝科技有限公司，货号c1200)。
45.棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶文库野生型插入片段核苷酸序列为seq id no.9:catatggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccaccatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccggcagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaacggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggcaactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatagtaaaagctt；棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶文库突变体插入片段核苷酸序列为seq id no.10:catatggacacgacggtgcccaccttcagcctggccgaactccagcagggcctgcaccaggacgagttccgcaggtgtctgagggacaagggcctcttctatctgacggactgcggtctgaccgacaccgagctgaagtcggccaaggacctcgtcatcgacttcttcgagcacggcagcgaggcggagaagcgcgccgtcacctcgcccgtccccnnnatgcgccgcggcttcaccgggctggagtcggagagcaccgcccagatcaccaataccnnnagctactccgactactcgatgtgctactcgatgggcaccgcggacaacctcttcccgtccggtgacttcgagcggatctggacccagtacttcgaccgccagtacaccgcctcccgcgcggtcgcccgggaggtcctgcgggcgaccgggaccgagcccgacggcggggtcgaggccttcctcgactgcgagccgctgctgcggttccgctacttcccgcaggtccccgagcaccgcagcgccgaggagcagcccctgcggatggcgccgcactacgacctgtcgatggtcaccctcatccagcagacaccctgcgccaacggcttcgtcagcctccaggccgaggtcggcggcgcgttcacggacctgccctaccgtccggacgccgtcctcgtcttctgcggcgccatcgcgaccctggtgaccggcggccaggtcaaggccccccggcaccatgtcgcggccccccgcagggaccagatagcgggcagcagccgcacctccagtgtgttcttcctccgtcccaacgcggacttcaccttctccgtcccgctggcgcgcgagtgcggcttcgatgtcagcctggacggcgagaccgccacgttccaggattggatcgggggcaactacgtgaacatccgccgcacatccaaggcatagtaaaagctt。第72位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中苏氨酸密码子acc以外的其他天然氨基酸密码子序列，第92位氨基酸的密码子序列nnn代表除野生型中甘氨酸密码子ggc以外的其他天然氨基酸密码子序列。其中，野生型酶表达质粒图谱如附图1所示，质粒大小为6192bp。
46.实施例2：去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体宿主菌株培养及诱导表达
47.从-80℃低温冰箱中取出实施例1构建的去乙酰氧基头孢菌素c合成酶野生型或突变体表达菌株，在冰浴上缓慢溶解完全，然后在无菌操作台上从菌种冻存管中吸取0.5ml菌种冻存液于含有3ml无菌冷却lb液体培养基(含50μg/ml卡那霉素)中，37℃震荡培养12h。
48.培养结束后取出0.5ml转接于含50ml无菌lb培养基的250ml三角瓶中，37℃下220rpm震荡培养1.5h，取出分别加入终浓度为100μmol/l的异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(iptg，购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司，货号：i104812-25g)诱导剂，25℃下继续220rpm振荡诱导培养10h。
49.培养结束进行sds-page蛋白电泳。
50.1)实验试剂按如下操作配制：
51.①
30％储备胶溶液：丙烯酰胺(acr)29.0g，亚甲双丙烯酰胺(bis)1.0g，混后加ddh2o溶解，定容至100ml，棕色瓶存于室温。
52.②
10
×
电泳缓冲液(ph＝8.3)：3.02g tris，18.8g甘氨酸，10ml 10％sds，加入ddh20溶解，定容至100ml。
53.③
10％过硫酸铵(ap)：100mgap加ddh20至1ml充分溶解。
54.④2×
sds电泳上样缓冲液：1mol/l的tris-hcl(ph＝6.8)2.5ml，β-巯基乙醇1.0ml，sds0.6g，甘油2.0ml，0.1％溴酚兰1.0ml，ddh2o 3.5ml。
55.2)聚丙烯酰胺凝胶的配制：
56.①
12ml分离胶(12％)的配制：ddh2o，3.96ml；30％储备胶，4.8ml；1.5mol/l的tris-hcl，3ml；10％sds，0.12ml；10％ap，0.12ml。上述溶液混匀后加入temed(n,n,n',n'-四甲基乙二胺)10μl，混匀后灌入玻璃板间，以水饱和正丁醇封顶，注意使液面平，凝胶完全聚合需30-60min。
57.②
6ml积层胶(4％)的配制：ddh2o，4.2ml；30％储备胶，0.99ml；1mol/l的tris-hcl，0.75ml；10％sds，0.06ml；10％ap，0.06ml；temed，6μl。将分离胶上的液体倒去，超纯水冲洗干净，用滤纸吸干。加入上述混合液，立即将梳子插入玻璃板间，完全聚合需15-30min。
58.3)样品处理：将样品加入等量的2
×
sds上样缓冲液，100℃加热5min，离心12000g
×
1min，同时将蛋白marker作平行处理。
59.4)上样：取10ul处理后的样品加入胶槽中，并加入20μl蛋白marker作对照。
60.5)电泳：采用垂直式电泳槽装置，在电泳槽中加入1
×
电泳缓冲液，连接电源，负极在上，正极在下，电泳时，积层胶电压150v，分离胶电压200v，电泳至溴酚兰行至电泳槽下端停止。约1h后将蛋白胶从玻璃板中取出，使用pyxis蛋白快速处理系统进行染脱色。脱色后的蛋白胶在图像处理系统下将脱色好的凝胶摄像，凝胶可保存于7％乙酸溶液中。
61.棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶野生型蛋白电泳胶图如附图2所示。
62.实施例3：去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体以青霉素g为底物转化生成g-7-adca的反应能力测试
63.1)底盘宿主细胞的破壁：按照实施例2方法对去乙酰氧基头孢菌素c合成酶野生型及突变体宿主菌株进行诱导培养，培养结束后取下摇瓶，吸取4ml于15ml离心管中，6000rpm条件下离心5min。离心结束后弃去上清并收集菌体，用4ml tris-硫酸铵缓冲液(各50mmol/l，ph＝7.4，加入终浓度1mmol/l的dtt)重悬。菌体重悬后将离心管置于冰浴上进行超声波
破碎(超声参数：45％功率，超声3s，停止2s，超声工作总计15min)。
64.2)酶与底物反应能力测试：菌体重悬液超声破碎后吸取2.4ml转移至50ml离心管中，加入终浓度为2mmol/l feso4，2mmol/l维生素c钠，5mmol/lα-酮戊二酸，5mmol/l青霉素g钾；30℃下静置反应30min。反应结束后，加入1.2ml乙腈(分析纯)溶液终止反应，获得的反应液进行hplc检测。
65.hplc检测仪器：分析天平sartorius bsa224s(0.0001g)、赛默飞u3000高效液相色谱仪、超声波清洗仪、ph计为sartorius pb-10、安捷伦c
18
色谱柱(4.6
×
250mm，粒径5μm)。
66.hplc检测试剂：
67.①
20mmol/l磷酸盐溶液(ph＝3.50)：取4.5644g三水合磷酸氢二钾加水溶解成1000ml，用磷酸调节ph至3.50。
68.②
流动相：20mmol/l磷酸盐溶液(ph＝3.5)：甲醇(50％：50％)。
69.③
系统适应性溶液：取g-7-adca标准品10mg与青霉素g标准品、α-酮戊二酸及l-抗坏血酸各2mg置于50ml容量瓶中，用流动相超声溶解并定容，摇匀。超声过程中应控制超声波内水温在2～8℃。
70.④
对照溶液：取g-7-adca标准品10mg置于50ml容量瓶中，用ph＝3.5的磷酸盐溶液超声溶解并定容，摇匀。α-酮戊二酸、硫酸亚铁和l-抗坏血酸分别配制成溶液，用流动相稀释至500μm、200μm以及400μm。超声过程中应控制超声波内水温在2～8℃。
71.⑤
供试试液：反应液用甲醇稀释4倍，混匀。
72.hplc色谱条件：柱温30℃，溶解温度2～8℃，检测波长225nm，流速0.65ml/min，进样量5μl。
73.hplc检测结果计算：
[0074][0075]c样
——供试样品中g-7-adca的浓度，mg/ml；
[0076]c标
——标准品溶液中g-7-adca的浓度，mg/ml；
[0077]a样
——供试样品中g-7-adca峰面积；
[0078]a标
——g-7-adca标准品峰面积；
[0079]
相对酶活计算：
[0080]
相对酶活＝(c
突变体
/c
野生型
)
×
100％。
[0081]c突变体
——去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体酶反应后的供试样品中g-7-adca的浓度，mg/ml；
[0082]c野生型
——去乙酰氧基头孢菌素c合成酶野生型酶反应后的供试样品中g-7-adca的浓度，mg/ml；
[0083]
结果如表1及图3所示。
[0084]
表1去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体相对酶活
[0085][0086][0087]
实施例4：高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体密码子优化
[0088]
遗传信息是由三联体密码子记载的。由于密码子的简并性，大多数氨基酸是由2～6种同义密码子编码。不同的物种编码同种氨基酸所利用的密码子种类与使用频率存在差别，这种现象称为密码子偏好性(codon usage bias)。原核微生物和真核微生物密码子偏好性存在明显的差异。因此，本实施例中将原核微生物棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶高活性突变体g13571-56基因的密码子优化为适合丝状真菌产黄支顶孢霉表达的密码子序列。
[0089]
本实施例中，丙氨酸密码子序列优化为gcc半胱氨酸密码子序列优化为tgc、天冬氨酸密码子序列优化为gac、谷氨酸密码子序列优化为gag、苯丙氨酸密码子序列优化为ttc、甘氨酸密码子序列优化为ggc、组氨酸密码子序列优化为cac、异亮氨酸密码子序列优化为atc、赖氨酸密码子序列优化为aag、亮氨酸密码子序列优化为ctc、天冬酰胺密码子序列优化为aac、脯氨酸密码子序列优化为ccc、谷氨酰胺密码子序列优化为cag、精氨酸密码子序列优化为cgc、丝氨酸密码子序列优化为agc、苏氨酸密码子序列优化为acc、缬氨酸密码子序列优化为gtc、酪氨酸密码子序列优化为taa。
[0090]
经密码子优化后的棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶高活性突变体基因g13571-56*的核苷酸序列如seq id no.11所示(因密码子序列优化而改变)：
[0091]
[0092][0093]
实施例5：经密码子偏好性优化后的高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体大肠杆菌重组表达载体的构建、转化和验证
[0094]
pet-28a(+)质粒载体全长5369bp，含有卡那霉素抗性。利用限制性内切酶(均购自上海生工生物工程股份有限公司)ndei(酶切识别位点：5'-ca
↑
tatg-3'，上海生工生物工程有限公司，货号：b600120-0500)和hindiii(5'-a
↑
agctt-3'，上海生工生物工程股份有限公司，货号：b600184)对纯化得到的pet-28a(+)质粒进行双酶切，切掉63bp的多克隆位点序列。酶切反应体系为：质粒载体，3μg；buffer，5μl；ndei限制性内切酶，hindiii 0.5μl；限制性内切酶，0.5μl；ddwater，至50μl；37℃孵育3～4小时，每隔一段时间振荡一下并离心以防液滴蒸发至管盖上。酶切后的线性质粒载体经验证后切胶纯化备用。
[0095]
g13571-56*基因序列合成由常州基宇生物科技有限公司完成，去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因上游和下游分别添加限制性内切酶ndei识别位点(5'-ca
↑
tatg-3')和hindiii识别位点(5'-a
↑
agctt-3')，合成插入片段核苷酸序列如seq id no.12所示：
[0096]
合成的插入片段经限制性内切酶ndei和hindiii酶切后，与经限制性内切酶ndei和hindiii双酶切并纯化后得到的pet-28a(+)线性质粒进行融合蛋白表达载体进行酶连接反应。连接反应体系：退火产物，2μl；线性化质粒25ng；t4 dna连接酶(上海生工生物工程股份有限公司，货号：b110041)0.5μl；连接buffer，5μl；ddwater补至10μl，16℃连接过夜。
[0097]
连接产物经纯化验证后转化大肠杆菌感受态细胞：1μl表达载体质粒加入到100μl大肠杆菌bl21商业感受态细胞中，冰浴孵育30min，取出放置42℃水浴热激2min，再立即置于冰浴上3min，加入到650μl的lb液体培养基(37℃)中，37℃下200rpm振荡培养1h，室温下5000rpm离心3min，留大约150μl涂抗性平板(50μg/ml卡那霉素)，37℃培养箱静置培养过
夜。挑取抗性平板上长好的单克隆菌落，接种到5ml含50μg/ml卡那霉素抗性的lb液体培养基中，37℃下200rpm振摇过夜。培养好后利用质粒提取试剂盒(天根质粒提取试剂盒，货号：dp103)提取质粒载体(如图4所示)，纯化后送测序公司测序。测序结果正确者-80℃低温冰箱保存备用。
[0098]
实施例6：高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体在产黄支顶孢霉中提高头孢菌素c产量的应用
[0099]
1)基因过表达质粒载体pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的构建
[0100]
产黄枝顶头孢霉异源过表达棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体g13571-56*，构建重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的示意图见图5。
[0101]
具体步骤如下：
[0102]
①
利用细菌质粒提取试剂盒提取质粒pet28-g13571-56*作为模板dna。
[0103]
②
以步骤
①
获得的cdna为模板，以primestar高保真酶和引物g13571-56*-f/g13571-56*-r进行pcr扩增，并对pcr扩增产物进行测序验证，其中引物g13571-56*-f序列：5
′‑
ggttccatggacacgacggtgcccaccttc-3
′
(seq id no.13，下划线为限制性内切酶bamhi的识别位点)和引物g13571-56*-r序列：5
′‑
gggcccctaggccttggaggtgcggcggat-3
′
(seq id no.14，下划线为限制性内切酶apai的识别位点)，获得约948bp的pcr扩增cdna产物。
[0104]
③
将步骤
②
获得的pcr扩增产物和载体peasy-blunt进行连接，得到重组质粒peasy-scdaocs-g13571-56*。
[0105]
④
用限制性内切酶bamhi和apai双酶切重组质粒peasy-scdaocs-g13571-56*，回收约948bp的dna片段scdaocs-g13571-56*。
[0106]
⑤
用限制性内切酶bamhi和apai双酶切质粒pbargpe1-hygro，回收约5936bp的载体骨架。
[0107]
⑥
将dna片段scdaocs-g13571-56*和载体骨架进行连接，得到重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*。将重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*进行测序。根据测序结果，对重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*结构描述如下：将质粒pbargpe1-hygro的限制性内切酶bamhi和apai之间的小片段取代为序列表的序列seq id no.11示的dna分子，构建成用于在产黄支顶孢霉中进行棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体过表达的重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*。重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*具有gpda启动子、经密码子优化后的棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体g13571-56*基因、trpc终止子和潮霉素抗性基因。
[0108]
2)产黄枝顶头孢霉atcc11550菌丝体的培养和原生质体制备
[0109]
①
从培养斜面上刮下适量产黄枝顶头孢霉菌atcc11550孢子，分别接种于100ml yps液体培养基(葡萄糖2％，酵母提取物0.5％，聚胨1％，mgso4·
7h2o 0.1％，k2hpo4·
3h2o 0.13％，ph＝7.0)中，28℃、230rpm振荡培养4～5d；
[0110]
②
8000rpm离心15min收集菌丝体，用无菌水洗涤一次；
[0111]
③
0.22μm无菌滤膜过滤50ml二硫苏糖醇(dtt，5mmol/l)溶液，重悬菌体，30℃、150rpm振荡孵育40～60min；
[0112]
④
8000rpm离心5min，用p buffer(kcl 44.7g/l，mgcl2·
6h2o 2.03g/l，cacl22.78g/l)常温洗涤2次；
[0113]
⑤
0.22μm无菌滤膜过滤60ml lysing酶解液(p buffer配制，10mg/ml)，重悬菌体，30℃、150rpm振荡孵育3～4h；
[0114]
⑥
镜检，当大部分菌丝释放原生质体后，加入4倍体积的pbuffer，用灭菌的装填脱脂棉的针筒过滤除去残留的菌丝体；
[0115]
⑦
3000rpm离心5min，pbuffer洗涤2次，将原生质体悬浮于适量pbuffer中，使原生质体浓度》108cfu；
[0116]
⑧
将产黄枝顶头孢霉菌atcc11550的原生质体分装于1.5ml离心管中，每管100μl。
[0117]
3)产黄枝顶头孢霉原生质体转化及鉴定
[0118]
采用peg-cacl2介导的原生质体转化法将构建的质粒转化产黄枝顶头孢霉，实验步骤如下：
[0119]
①
原生质体加入10μg的重组质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*dna，轻轻混匀，冰浴30min；
[0120]
②
加入900μl 30％的peg4000/cacl2溶液(称取cacl2·
2h2o14.7g，90ml纯水溶解于100ml容量瓶中，再加入30g的peg4000后用纯水定容至100ml，过滤除菌后分装储存至4℃)，25℃孵育15min；
[0121]
③
6000rpm
×
5min，尽量吸出peg4000/cacl2溶液，用pbuffer洗涤1次；
[0122]
④
使用100μl的pbuffer重悬原生质体，加入到45℃保温的上层软琼脂培养基(蛋白胨，1％；nacl，0.5％；酵母提取物，0.3％；蔗糖，2％；琼脂，0.75％；自然ph)中，于旋涡振荡器上轻轻振荡混匀，然后倾倒在再生琼脂平板(可溶性淀粉2.4％，甘氨酸0.12％，聚胨0.4％，硫酸铵0.6％，磷酸二氢钾0.012％，硫酸钙0.8％，硫酸镁0.06％，酵母提取物0.03％，琼脂2％，ph＝8.5，按照250ml体积分装至500ml锥形瓶，121℃灭菌15min，冷却备用)上，迅速转动平板使软琼脂均匀覆盖在下层培养基表面；于28℃培养36h，覆盖含有潮霉素的nacl软琼脂(nacl，4％；琼脂，0.75％)，使平板中潮霉素终浓度为5.0μg/ml，nacl软琼脂凝固后，于28℃培养；
⑤
培养7d后分别挑取菌株进行博来霉素抗性转化子斜面培养，7d后提取基因组dna进行pcr验证，重组质粒转化成功。
[0123]
4)高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因过表达对产黄支顶孢霉cpc增产效果的验证
[0124]
将转化后的产黄枝顶头孢霉atcc11550原生质体细胞与软琼脂混合后涂布于再生琼脂培养基上生长。根据菌落的生长状况(菌落生长3～5d后，可以看见较稀疏单菌落)，在平板铺上含有潮霉素(终浓度为5.0μg/ml)的nacl软琼脂。铺完抗生素后，28℃培养，期间应每天都注意观察转化子是否出现以及生长状况。若有转化子一般10-15d后其基本生长良好，可挑取至含有5.0μg/ml潮霉素的分单培养基上，28℃恒温培养5-7d。将得到的所有转化子进行摇瓶发酵培养，发酵5天后经hplc检测得到发酵结果，发现cpc发酵单位显著提高，证明过表达高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因对cpc产量起到上调作用。
[0125]
5)产黄枝顶头孢霉的发酵和发酵产物cpc的检测
[0126]
本实施例中的三角瓶的规格均为500ml，三角瓶底部带有直挡板，每个实验菌株有三个摇瓶重复。从培养10d的斜面上刮下适量产黄枝顶头孢霉孢子，以野生型出发菌株atcc11550为对照，含转化子的菌株为实验组，其中转化子1为转有空质粒pbargpe1-hygro
的产黄枝顶头孢霉菌菌株atcc11550-pbrgpe1-hygro，转化子2为转有高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因过表达质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的产黄枝顶头孢霉菌菌株atcc11550-pbargpe1-scdaocs-g13571-56*，分别接种于装有30ml种子培养基(葡萄糖，5g/l；蔗糖，35g/l；玉米浆10ml/l；硫酸铵，8g/l；dl-甲硫氨酸，0.5g/l；碳酸钙，5g/l；豆油，5ml/l；ph＝7.20
±
0.05；121℃
×
15min灭菌后冷却备用)的500ml摇瓶中，于旋转式摇床培养3d，转速为230rpmn，温度28℃。再以10％(v/v)的接种量转接至装量为30ml发酵培养基(玉米淀粉，30g/l，麦芽糊精，60g/l；α-淀粉酶，0.2g/l；玉米浆，10ml/l；dl-甲硫氨酸，6g/l；尿素，2g/l；硫酸铵，11g/l；mgso4·
7h2o，3g/l；k2hpo4，9g/l；碳酸钙，5g/l；豆油，10ml/l；ph＝7.20
±
0.05；121℃
×
15min灭菌后冷却备用)的250ml摇瓶中，25℃，230rpm，培养7d。发酵液经普通滤纸、0.22μm过滤，收集滤液，稀释20倍后进行hplc检测。
[0127]
hplc检测使用美国agilent 1260hplc检测器，c18色谱柱，柱温40℃，流动相为甲醇:0.2％(w/v)磷酸二氢钠＝5:95，流速为1.0ml/min，检测波长为254nm，进样量10μl，分析时间9min。根据峰面积和标准品的有效含量计算出样品中cpc含量。
[0128]
检测结果如图6所示，野生型出发对照菌株atcc11550的cpc产量为2679.45
±
138.9mg/l，转有空质粒pbargpe1-hygro转化子的突变型对照菌株atcc11550-pbrgpe1-hygro的cpc产量为2591
±
214.6mg/l，转有高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体酶过表达质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*转化子的突变型菌株atcc11550-pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的cpc产量为4357.4
±
231.9mg/l。对数据进行统计分析后可知，野生型对照菌株atcc11550与转有空质粒pbrgpe1-hygro的对照菌株atcc11550-pbrgpe1-hygro的cpc产量无显著性差异，而与转有高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因过表达质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的实验突变菌株atcc11550-pbargpe1-scdaocs-g13571-56*有显著性差异(p＝0.011)；转有空质粒pbrgpe1-hygro的对照菌株atcc11550-pbrgpe1-hygro与转有高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因过表达质粒pbargpe1-scdaocs-g13571-56*的实验突变菌株atcc11550-pbargpe1-scdaocs-g13571-56之间同样有显著性差异(p＝0.024)，后者cpc产量提高了68.2％。上述实验结果证明，对外源高活性棒状链霉菌去乙酰氧基头孢菌素c合成酶突变体基因在产黄支顶孢霉atcc11550中进行过表达，能够有效促进cpc产量的提高。
[0129]
本说明书中各个实施例采用递进的方式描述，每个实施例重点说明的都是与其他实施例的不同之处，各个实施例之间相同相似部分互相参见即可。
[0130]
对所公开的实施例的上述说明，使本领域专业技术人员能够实现或使用本发明。对上述实施例的多种修改对本领域的专业技术人员来说将是显而易见的，本文中所定义的一般原理可以在不脱离本发明的精神或范围的情况下，在其它实施例中实现。因此，本发明将不会被限制于本文所示的这些实施例，而是要符合与本文所公开的原理和新颖特点相一致的最宽的范围。