专利名称：基于est-ssr标记的草鱼分类方法
技术领域：
本发明涉及一种鱼类的分类方法，特别涉及一种基于EST-SSR标记的草鱼分类方法。
背景技术：
草鱼(Ctenophmyngodon idella)具有生长快、养殖成本低等优点，为池塘、湖泊和水库的主要养殖对象，是我国淡水渔业中最重要的养殖品种之一。草鱼分布在亚洲的各大江河水系，在中国从黑龙江到西江(除新疆和青藏高原无自然分布外)都有其分布，形成了草鱼复杂的遗传背景和丰富的种质资源。近年来，天然水环境的变化和污染使得自然界草鱼种群数量明显下降，生产中近亲繁殖导致种质退化，已影响到草鱼养殖产业的正常发展。为有效保护和利用这一淡水鱼类资源，有必要开发和利用分子遗传标记，对不同水系的草鱼群体进行遗传结构分析，搞清其遗传背景，为草鱼选育种群的选择奠定基础。目前，已有学者采用同工酶、mtDNA-RFLP、微卫星等检测技术对长江水系草鱼种群的遗传结构进行了研究，但对不同水系之间草鱼群体遗传结构的研究工作并不多。表达序列标签(expressed sequence tag，EST)中存在一定数量的微卫星或简单重复序列(EST-SSR)，它不仅具有在基因组中均勻分布、共显性和实验重复性好等优点，而且开发成本较低，已成功应用于群体遗传结构分析、QTL定位和分子标记辅助选择育种等研究领域。
发明内容
本发明的目的是提供一种基于EST-SSR标记的草鱼分类方法。本发明所采取的技术方案是
EST-SSR标记的草鱼分类方法，包括提取草鱼的DNA，使用EST-SSR标记作为引物进行扩增；根据扩增结果对草鱼进行分类，所述的EST-SSR标记对为
权利要求
1. EST-SSR标记的草鱼分类方法，包括提取草鱼的DNA，使用EST-SSR标记作为引物进行扩增；根据扩增结果对草鱼进行分类，其特征在于所述的EST-SSR标记对为
2.根据权利要求1所述的EST-SSR标记的草鱼分类方法，其特征在于PCR的反应体系为
3.根据权利要求1或2所述的EST-SSR标记的草鱼分类方法，其特征在于PCR的反应条件为1)94°C预变性 ％iin，2)94°C 变性 30s，3)退火30s，4)72°C延伸 4 ；5)循环步骤2) 4) 30 40次，6)72°C 延伸 7min。
全文摘要
本发明公开了基于EST-SSR标记的草鱼分类方法。方法包括提取草鱼的DNA，使用EST-SSR标记扩增，根据扩增结果分析出草鱼的遗传结构。本发明方法与传统的方法相比，具有目的性强，作用效果直接的优点。且操作简单、检测快速、检测成本低，便于广泛推广使用。
文档编号C12Q1/68GK102242222SQ20111020524
公开日2011年11月16日 申请日期2011年7月21日 优先权日2011年7月21日
发明者于凌云, 全迎春, 叶星, 李胜杰, 樊佳佳, 王解香, 白俊杰, 马冬梅 申请人:中国水产科学研究院珠江水产研究所