专利名称：使用和鉴定δ样4的调节子的方法
使用和鉴定S样4的调节子的方法相关申请的交叉引用本申请要求申请日为2007年12月20日的美国专利申请系列号12/005，054的优 先权，美国专利申请系列号12/005,054是申请日为2006年9月1日的美国专利申请系列 号11/514，773的部分继续申请，美国专利申请系列号11/514，773要求申请日为2005年9 月1日的美国临时申请系列号60/713，637的优先权。美国专利申请系列号12/005，054还 要求申请日为2006年12月20日的美国临时申请系列号60/876，444的优先权和申请日为 2007年2月16日的美国临时申请系列号60/901，754的优先权。以上提及的所有申请的教 导均通过引用并入本文。
背景技术：
血管生成，即从预先存在的脉管系统的内皮发育出新的血管，是宿主内的实体瘤 生长、进展和转移的关键过程。在生理学上正常的血管生成过程中，血管内皮与其邻近基质 成分的自分泌、旁分泌和双分泌相互作用在空间和时间上均受到严格调控。另外，促血管生 成和抑制血管生成的细胞因子和生长因子的水平和活性保持平衡。相反，活性肿瘤生长所 需的病理性血管生成是持续且持久的，这代表了正常血管生成系统的失调。实体瘤和造血 系统肿瘤类型尤其与高水平的不正常的血管生成相关联。最近，显而易见的是，某些类型的 白血病也受到血管生成中涉及的信号传导的影响。抑制血管生成的试剂在治疗癌症中是有用的。AVaStinTM(贝伐珠单抗)，其为与 血管内皮生长因子(VEGF)结合的单克隆抗体，被证明在治疗多种癌症中是有效的。SDF/ CXCR4信号传导途径的拮抗剂抑制肿瘤血管新生并且对于抵抗小鼠模型中的癌症是有效的 (Guleng 等人，Cancer Res. 2005 Jull ；65 (13) :5864_71)。已经完成了异香豆素 2-(8-羟 基-6-甲氧基-1-氧-1H-2-苯并呲喃-3-基)丙酸(NM-3)作为口服生物可利用的血管生 成抑制剂的I期临床评估。NM-3在体外直接杀死内皮和肿瘤细胞，并且在治疗小鼠中的多 种人类肿瘤异种移植中是有效的(Agata等人，Cancer Chemother Pharmacol. 2005 JunlO ； 电子出片反([Epub ahead of print]))。血管生成是其它的非致瘤性紊乱的特征。各种视觉紊乱，特别是增殖性视网膜病 和年龄相关性黄斑变性，以及炎性紊乱，例如类风湿性关节炎和牛皮癣，均具有受影响组织 的血管化增加的特征。抗血管生成剂对于治疗这些紊乱是有效的。Macugen ，一种与VEGF 结合的适体(aptamer)，已被证明在治疗血管新生(wet)年龄相关性黄斑变性中是有效的。 TNF-α拮抗剂在治疗类风湿性关节炎中的成功部分归功于对于炎性关节组织的抗血管生 成效应(Feldmann 等人 Annu Rev Immunol. 2001 ；19 163-96)。动脉生成，一个与血管生成相关但不同的过程，当预先存在的血管的腔增大而形 成侧支时，发生动脉生成。心肌梗塞或外周缺血(例如肢体、肾脏等)后，微动脉变成传导 力更加显著的血管，从而在供给受影响组织的主动脉阻塞之后维持血流。因此，促进动脉生 成的试剂可用于治疗心肌梗塞和其它缺血事件，并且可以在检测到或怀疑发生部分动脉阻 塞时用于预防缺血事件。
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Notch途径，特别是Notchl和Notch4，参与血管生成过程。Notch信号传导通 常参与多种不同过程的调节，如细胞增殖、分化、特化和存活(Artavanis-Tsakonas等人， 1999)。多种Notch受体和配体的存在显示了其在脊椎动物中的复杂性，每个均具有不同的 表达模式。在哺乳动物中有4种Notch受体(notchl-4)和5种配体(jaggedl、2和Dili、 3和4)。在小鼠中，Notch受体和配体的突变导致来自所有三个种系的各种器官，包括血 管系统的异常(Iso等人，2003)。Notch途径通过局部细胞的相互作用发挥作用，存在于 一个细胞表面上的配体的细胞外结构域与邻近细胞上的受体的细胞外结构域发生相互作 用。这种相互作用允许Notch的细胞外结构域上的两种ADAM蛋白酶发挥作用，然后跨膜 结构域上的Y-分泌酶发挥作用而将细胞内结构域从细胞膜释放，从而允许所述细胞内 结构域被导入细胞核，在细胞核内，所述细胞内结构域与CSL发生作用以激活分裂增强子 (enhancer-of-split)家族的转录抑制子的表达(Mumm & Kopan，2000)。长期以来，人们认为动脉相对于静脉的分化主要依赖于物理因素，例如血压和氧 浓度。但是，最近，鉴定了很多在产生循环很久之前即在动脉或静脉内皮细胞中特异性表 达的基因，这似乎表明内皮细胞的遗传决定在动脉和静脉之间的初级分化事件中的重要作 用。这些基因中有一种为eph-B4，其在静脉内皮细胞中特异性表达(Adams等人，1999)， 另外还有印hrin-B2 (Adams 等人，1999 ；Gale 等人，2001)、notchl (Krebs 等人，2000)、 notch4 (Uyttendaele等人，1996)和dll4 (Shutter等人，2000)，这些基因在动脉内皮细胞 中特异性表达。以斑马鱼Notch同源物的突变进行的研究证明了该途径在血管内皮生长因子 和sonic-hedgehog的下游和^hrin途径的上游调节动脉相对于静脉内皮分化的重要性 (Lawson等人，2002)，成为在内皮动脉特异性模式中最早表达的基因。在斑马鱼和小鼠中有 越来越多的证据表明Notch功能对于动脉内皮细胞最终归宿的建立是必不可少的(Lawson 等人，2002 ；Fischer 等人，2004 ；Duarte 等人，2004)。本公开的目标是提供用于调节血管生成、动脉生成和血管特性(identity)的试 剂和治疗性处理。发明概述在一些方面，本公开提供了 Notch配体δ样4(Delta-like 4，D114)的激动剂和 拮抗剂的用途和鉴定Notch配体δ样4(D114)的激动剂和拮抗剂的方法。令人惊奇的是， 如本文所教导，D114的激动剂和拮抗剂均可用于治疗正在发生血管生成的肿瘤，或者，在其 它情况下，如果需要的话，用于抑制或破坏血管生成。此外，本公开提供了通过给予D114激 动剂刺激动脉生成的方法。动脉生成是副动脉形成和生长的过程，通常是在缺血组织中。因 此，D114激动剂可用于治疗患有或具有患上缺血事件(例如外周或冠状动脉缺血)风险的 患者。本公开还涉及以下发现D114的上调引起内皮细胞采纳(adopt)动脉特性，而D114 的抑制则引起内皮细胞采纳静脉特性。因此，本公开提供了通过使用D114的激动剂或拮抗 剂(视情况)而改变静脉或动脉特性的方法。另外，本公开提供了可用于评价目标试剂是 否是D114信号传导的激动剂或拮抗剂的生物标志物。在一个实施方式中，本公开描述了用于治疗癌症的方法，包括给予有此需要的受 试者有效量的D114的拮抗剂。该拮抗剂可以是多肽，特别是包含D114的细胞外区域的肽。 在一个方面，多肽可以是单体，但也可以作为二体发挥作用。仅仅为了举例说明，包含D114
5的细胞外区域的多肽的例子可以选自SEQ ID NO :1的DSL结构域、氨基酸27-524、氨基酸 1-486、氨基酸27-486、氨基酸1-442和氨基酸27-442、或其变体。此外，多肽可以包含D114 的以下结构域中的至少一个，或其组合MNNL、DSL、EGF5、EGF5(参见图20A)。另外，D114 的拮抗剂可以包含与D114的细胞外区域结合的抗体或其片段。这样的抗体可以是单克隆 的、人类的或人源化的。在特定的实施方式中，所述抗体可以包含SEQ ID N0:4-7中的至少 一个。以上提及的所有的D114拮抗剂均可以与本文通篇所公开的赋予增强的药物动力学 性质的部分共价连接。特别地，所述部分可以选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯(例如 PEG)。
在另一个实施方式中，D114的拮抗剂在哺乳动物内皮细胞中以有效浓度刺激动脉 表型的表达。这样的表型可以选自，例如，EphrinB2和连接蛋白(cormexin) 37的表达。或 者，D114的拮抗剂在哺乳动物内皮细胞中以有效浓度抑制静脉表型的表达。这样的表型的 例子可以是EphB4的表达。此外，静脉表型可以包括Notch调节的基因例如Heyl、Hey2、 Hesl和Hes2的抑制。本公开还提供了用于在血管例如静脉移植物或隐静脉移植物中促进采纳 (adoption)动脉特性的方法。该方法包括给予有此需要的受试者有效量的治疗性多肽，所 述多肽包含D114的细胞外结构域。所述包含D114的细胞外结构域的多肽可以选自SEQ ID NO 1的DSL结构域、氨基酸27-524、氨基酸1-486、氨基酸27-486、氨基酸1-442和氨基 酸27-442，所有这些均可以与本文通篇所公开的赋予增强的药物动力学性质的部分共价连 接。特别地，所述部分可以选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯(例如PEG)。这样的治疗 性多肽可以是单体或二体，如上所述。在进一步的实施方式中，本公开提供了用于抑制血管生成的方法，该方法包括给 予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的拮抗剂。但是，在一些方面，该方法还可用 于破坏血管生成。即，“抑制”血管生成可以不仅仅定义为阻止血管形成，还可定义为阻止功 能性血管的形成。可用于抑制血管生成的拮抗剂可以是多肽，特别是包含D114的细胞外区 域的肽。在一个方面，所述多肽可以是单体，但也可以作为二体发挥作用。包含D114的细 胞外区域的多肽的一些例子可以选自SEQ ID NO :1的DSL结构域、氨基酸27-524、氨基酸 1-486、氨基酸27-486、氨基酸1-442和氨基酸27-442、或其变体。此外，多肽可以包含D114 的以下结构域中的至少一个，或其组合MNNL、DSL、EGF5、EGF5(参见图20A)。另外，D114 的拮抗剂可以包含与D114的细胞外区域结合的抗体或其片段。这样的抗体可以是单克隆 的、人类的或人源化的。在特定的实施方式中，所述抗体可以包含SEQ ID N0:4-7中的至少 一个。以上提及的所有的D114拮抗剂均可以与本文通篇所公开的赋予增强的药物动力学 性质的部分共价连接。特别地，所述部分可以选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯(例如 PEG)。D114-Fc偶合物的一些特定的例子的序列显示于图25。此外，以上提及的任何D114信号传导的拮抗剂在哺乳动物内皮细胞中以有效的 浓度抑制VEGF刺激的血管生成，并且可以通过给予该拮抗剂来治疗血管生成相关疾病。血 管生成相关疾病的例子包括依赖于血管生成的癌症、良性肿瘤、炎性紊乱、慢性关节风湿病 和牛皮癣、视觉血管生成性疾病、Osier-Webber综合征、心肌血管生成、斑块血管新生、毛细 管扩张、血友病性关节病、血管纤维瘤、创面肉芽(wound granulation)、伤口愈合、毛细管 扩张性牛皮癣硬皮病、化脓性肉芽瘤、红变、关节炎和糖尿病性血管新生。另外，可以通过进一步同时或依次给予至少一种另外的抗血管生成剂来抑制血管生成，所述另外的抗血管生 成剂与所述拮抗剂一起以加成或协同方式抑制血管生成。在特定的实施方式中，所述另外 的抗血管生成剂可以是Notch受体的抑制剂。本公开还证明了包含D114的细胞外结构域的部分的单体多肽在低浓度时促进血 管生成而在较高浓度时抑制VEGF介导的血管生成。可溶性D114多肽在所有的浓度促进动 脉化或动脉生成。因此，通过选择单体可溶性D114多肽的合适剂量，可以达到对于血管生 成的不同效应。在一些实施方式中，可溶性D114多肽包含SEQ ID NO 1的DSL结构域(氨 基酸173-233)但缺少跨膜和细胞内部分(氨基酸552-685)。任选地，Dl 14多肽包含SEQ ID NO 1的氨基酸27-528的区域中的至少200个氨基酸。任选地，D114多肽包含SEQ ID NO 1的氨基酸27-486并且优选地包含氨基酸27-524。在一些实施方式中，可溶性Dl 14多 肽包括赋予需要的药物动力学性质的部分，例如Fc结构域或聚氧化烯部分(例如PEG)。在一些实施方式中，本公开提供了用于刺激动脉生成的方法。该方法可以包括给 予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的激动剂。所述受试者可以患有或具有患上 缺血性病症的风险。该受试者可以患有冠状动脉疾病，包括，例如，绞痛，或可以患有心肌梗 塞。该受试者可以患有外周动脉疾病，例如肢体、脑或器官例如肾脏中的缺血事件或部分阻 塞。该受试者可以被诊断为具有患上缺血事件的风险。在一些实施方式中，本公开提供了用于促进在血管中采纳动脉特性的方法。这样 的方法可以包括离体(ex vivo)给予血管或给予有此需要的受试者有效量的D114信号传 导的激动剂。血管可以是静脉移植物，例如隐静脉移植物。在一些实施方式中，本公开提供了破坏血管生成的方法。这样的方法可以包括给 予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的激动剂。在一些实施方式中，本公开提供了破坏肿瘤脉管系统的方法。这样的方法可以包 括给予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的激动剂。在一些实施方式中，本公开提供了用于评估测试试剂对于D114信号传导的效应 的方法。该方法可以包括(a)使内皮谱系的细胞与测试试剂接触；和(b)检测与动脉或静 脉表型相关的表型。促进采纳动脉表型的测试试剂或抑制采纳静脉表型的试剂是D114信 号传导的激动剂，而抑制采纳动脉表型或促进采纳静脉表型的试剂是D114信号传导的拮 抗剂。本公开提供了可用于区分D114信号传导的激动剂和拮抗剂的特征。一般地，D114 信号传导的激动剂在哺乳动物内皮细胞中刺激动脉表型的表达并且抑制静脉表型的表达。 一般地，D114信号传导的拮抗剂在哺乳动物内皮细胞中抑制动脉表型的表达并且刺激静脉 表型的表达。可以为了评价动脉和静脉表型的目的而检测任何已知的区分动脉和静脉内皮 细胞的特征。例如，EphrinB2的表达和连接蛋白37的表达可用作动脉表型的指征。作为 另一个例子，EphB4的表达可用作静脉表型的指征。在一些方面，本公开提供了抑制α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)阳性细胞向血管 募集的方法，该方法包括给予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的抑制剂。在 一些实施方式中，所述抑制剂选自D114的抗体、D114-His融合物或D114_Fc融合物。在 一些实施方式中，α-SMA阳性细胞选自周细胞(pericyte)、平滑肌细胞或周内皮细胞 (periendothelial cell)。在一些实施方式中，血管是静脉移植物。在一些实施方式中，静脉移植物是隐静脉移植物。在一些实施方式中，受试者患有血管生成相关疾病。在一些实施方式中，血管生成相关疾病选自如上所述的疾病。在一些实施方式中，该方法还包括给予 至少一种另外的抗血管生成剂，所述抗血管生成剂与所述D114信号传导抑制剂一起以加 成或协同方式抑制血管生成。在其它方面，本公开提供了与位于D114的细胞外部分中的表位结合的分离的单 克隆抗体或抗原结合部分的组合物。位于D114的细胞外部分中的表位的例子包括MNNL和 DSL结构域，以及任意一个或多个EGF重复，如图20A所示。这样的抗体可以包括但不限于 SEQ ID N0:4-7的任意一个。所述抗体还可以是人源化抗体。
图1显示了人类δ样4蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO 1 ；GenBank ΝΡ_061947)。 以下划线标出了信号序列氨基酸1-26。以粗体标出了跨膜结构域氨基酸532-552。成熟 蛋白的细胞外结构域是氨基酸27-531，虽然信号肽处理的不准确性会导致稍长或稍短的蛋 白。细胞内结构域是氨基酸553-685。图2显示了编码人类δ样4蛋白的核酸序列(cDNA) (SEQ ID NO 2 ；GenBank NM_019074)。编码序列是核酸321-2378。图3显示了 pZ/EG_mD114转基因载体和Cre活性的结果。图 4. (a)在 Ε8· 0 时 ZEG_mD114 胚胎的 LacZ 染色；(b)在 E8. 5 时 dt 胚胎中 EGFP 的表达；(3)在E9. 0时dt胚胎中的出血和心包水肿。图5. E9. 0和E9. 5时dt和对照胚胎的全固定(Wholemount)PECAMl免疫染色。(a) E9. O时的对照胚胎；(b)E9. O时的dt胚胎，其显示了肥大的背主动脉(左下箭头)、分支的 ACV (右下箭头)和头部区域中未成熟的血管丛(上面的箭头)；(c) E9. 5时的对照胚胎；(d) E9. 5时的dt胚胎，其显示了肥大的背主动脉、几乎没有ACV的迹象、头部区域中未成熟的血 管丛和肥大的静脉窦和心室。将E9. 5时的染色的胚胎切成一半，显示了 dt胚胎(f)的主 动脉恰好在其与静脉窦的结点的后面萎缩(下面的箭头)，而在对照胚胎(e)中，在整个胚 胎中保持相同的口径。dt胚胎(h)的体节间血管(上面的箭头)出现轻微的扩张并且比对 照胚胎(g)的短。在dt胚胎的背侧区域(下面的箭头)没有发生血管生成。(i)E9.5对照 胚胎的卵黄囊，(j)dt胚胎的卵黄囊，与对照胚胎的脉管结构的高度组织化结构不同，dt胚 胎的卵黄囊显示缺少初级丛的重塑。图6.冷冻切片和微血管造影中的PECAMl免疫染色。(a_g)为E9. 5dt胚胎的连 续切片(由前至后)，其显示了即将与静脉窦(下面的箭头)连接之前，主动脉(右上的箭 头)和ACV(左上的箭头)之间的融合。在切片(a)中，ACV由小的毛细血管(左上的箭头)的丛组成，在即将与背主动脉融合之 前，这些小的毛细血管结合在一起形成了具有大的腔的单一血管。切片(e)显示静脉窦后 面的区域中的主动脉萎缩。(f、g)E9. 5野生型胚胎的连续切片显示了如上所述的相同区域。 以印度墨汁注射的微血管造影确认了 dt胚胎(i)的背主动脉和ACV之间的功能性连接的 存在，墨汁从主动脉(左手侧的箭头)直接流向静脉窦(右手侧的箭头)，这与对照胚胎(h) 中观察到的常规血流是不同的。图7. dt胚胎中动脉标志物的静脉表达。以印hrin_B2 (a、b、c)和连接蛋白37 (d、e、f)特异性核糖核酸探针(riboprobe)与来自E9. Odt胚胎的冷冻切片进行原位杂交。突 变的胚胎显示在背主动脉(AD)和前主静脉(VCA)中均同时表达这些动脉特异性标志物。 如所预计的那样，在对照胚胎(c、f)中，表达被限制在主动脉中。图8.突变胚胎的静脉内皮中Notch信号传导的上调。以heyl(a、b、C)和 Notchl (d、e、f)特异性核糖核酸探针与来自E9. Odt胚胎的冷冻切片进行原位杂交。在前 主静脉(VCA)中，两个基因均显示出上调。如所预计的那样，在对照胚胎(c、f)中，表达被 限制在主动脉中。图9. dt胚胎中静脉特异性标志物的下调。来自E9. Odt胚胎的冷冻切片的原位杂 交和免疫染色(a)抗-Eph-B4免疫染色，(c) eph-b4mRNA ；来自E9. 0对照胚胎的冷冻切片 的原位杂交和免疫染色(b)抗-Eph-B4免疫染色，(d)印h-b4mRNA。图10显示了人类D114结构域结构的示意图(上端)和带注解的人类D114氨基 酸(SEQ ID N0:1)(下端)。以下划线标出并指明了信号序列和DSL结构域。阴影部分是 第8个EGF8结构域(EGF8)。Δ XB ( Δ EGF8)构建体在C末端在EGF8重复的CAS残基之后 含有另外的19个氨基酸(RSPSCIYRRSWRSRGAQIL) (SEQ ID NO 3)。P524_His构建体结束于 跨膜结构域之前4个氨基酸的P524，在C末端有6xHis标签。两个构建体均含有受体_结 合结构域DSL结构域。全长构建体具有Myc标签或无标签。图11显示了经过镍柱纯化(SDS-PAGE :CBB_G250染色)的纯化的 hD114-P524-6xHis 蛋白(组氨酸标签化的 hD114_P524)。图12. hD114抑制人类动脉内皮细胞(HUAEC)中管的形成。使用50ng/ml的VEGF 作为阳性对照。在较低的浓度时(30ng/ml或lOOng/ml)，D114促进管的形成，而在500ng/ ml时，D114抑制管的形成(数据未显示)。定量分析了 sD114处理的HUVEC中管的长度和 结点数目(Bioquant Image Analysis ；平均值来自2次重复实验的一式三份的孔)。在以 人类动脉内皮细胞进行的检验中观察到了相似的结果(数据未显示)。图13. hD114抑制人类动脉内皮细胞(HUAEC)中的萌发(sprouting)。使用20ng/ ml的VEGF作为阳性对照。在100ng/ml或200ng/ml时，D114促进萌发，而在500ng/ml时， D114抑制萌发(数据未显示)。显示了血管区域的定量分析(Bioquant Image Analysis ； 平均值来自2次重复实验的一式三份的孔)。在以sD114-Fc进行的检验中观察到了相似的 结果(数据未显示)。图14. hD114在高浓度时抑制人类动脉内皮细胞(HUAEC)中VEGF刺激的萌发。以 20ng/ml使用VEGF。在100ng/ml时Dl 14几乎没有效应，而在200ng/ml时Dl 14抑制VEGF 刺激的萌发。图15. Dl 14+/"突变体小鼠显示出血管增殖的缺陷型增长㈧使用PECAM全固定 免疫染色检测野生型和D114+/-胚胎的脉管系统。将背主动脉和主静脉标记为a和ν。相 对于野生型，在E10. 5时的D114v_胚胎中观察到了血管分支及密度的增加以及大血管的缺 失。(B)按照(A)的方式检测了肿瘤移植后D114+/-成年小鼠的血管反应。野生型小鼠显 示出肿瘤中有组织的血管增殖(左半部分)，而突变体小鼠显示出显著增加的血管反应，其 缺少组织化和血管层级。(C)通过β -gal染色检测D114v_突变体小鼠的肿瘤和正常区域 中D114的表达。在正常组织中的一些不连续血管中观察到了 D114的表达，而肿瘤区域显示 出很多类似表观的β -gal阳性血管，其指征了肿瘤血管中D114的诱导。(D)通过α -SMA定位检测新形成的血管周围的周细胞覆盖。在野生型小鼠中，血管显示出PECAM和α-SMA 的共定位(左侧图板)。但是，在D114+小鼠肿瘤血管中，内皮细胞沿线的(lining) α-SMA 阳性细胞的数目显著降低(右侧图板)。(E)在肿瘤的多数但不是全部血管中，D114是激 活的。邻近肿瘤切片的β-gal (左侧图板)和PECAM免疫染色(右侧图板)显示内皮细 胞特异性PECAM染色比IacZ D114-受体表达丰富得多。
图16. SD114的生物化学性质(A)将Notch-Fc融合蛋白直接包被在ELISA平板 上。使SD114-AP与Notch-Fc结合，通过加入AP底物定量检测所结合的D114。sD114_AP与 Notchl有效结合但不与Notch3有效结合(左侧图板)。检测了 sD114-Fc和sD114-His与 Notch 1的结合。(B)以sD114-Fc、sD114-His的表达载体或仅以载体本身转染HUVEC细胞。 sD114蛋白不诱导响应Notch的Hes-2基因的表达。(C)当HUVEC细胞与表达D114-FL(全 长)的choK共同培养时，通过Hes-l、Hey_l和Hes-2诱导测定的Notch激活。重组sD114_Fc 和sD114-His的加入减少了响应Notch的基因的诱导。两个独立实验产生相似的结果。图17.在鼠Matrigel检验中，sDl 14诱导血管反应但是缺少灌注(A)通过皮下向 Balb/C nu/nu小鼠注射Matrigel。6天之后，取下胶塞(plug)并在石蜡中处理。以H&E将 单独的切片染色，显示了来自2个独立实验的一式三份胶塞的20倍放大的代表性图像。(B) 以 PECAM 将 Matrigel 胶塞染色。以 Nikon Coolpix 5000 照相机在 Nikon Eclipse E400 显微镜下获取显微图像，使用4x/0. 13NA物镜和10倍目镜。将来自所有胶塞的血管化区域 的定量的平均值(士SEM)显示于条形图中(Scion Image软件)。P值<0.01。图18. SD114抑制鼠肿瘤异种移植模型中的肿瘤生长(A)将含有1χ106ΗΤ29个细 胞(处于含有PBS或sD114-Fc或sD114_His (5 μ g/ml)的Matrigel制备物中)的植入物 给予小鼠(η = 6/组)，2周之后测定肿瘤体积，收集并分析肿瘤。在SD114壁中肿瘤体积 显著较小(图6Α)。实验重复进行2次。(B)在评价sD114的内源性表达的效应时，以含有 D114-FL、sD114-Fc、sD114-His的表达载体或仅以载体本身转染HT29细胞。进行截短的 CD4的共表达以允许进行转染细胞的分选。在小鼠中植入相同数目的转染的细胞(η = 6/ 组)。测定肿瘤的体积(图6Β)。在sD114组中肿瘤体积显著较小。(C)按照“方法”部分 的描述，通过PECAM免疫染色测定微脉管系统并定量测定血管体积。(D)在收集肿瘤之前， 注入缺氧(hypoxy)探针，然后按照“方法”中的描述，以单克隆抗体和荧光标记的二抗探测 肿瘤切片。按照“方法”中的描述，使用ImageJ定量测定缺氧区域。所有的数值均表示为 平均值士SEM。*P <. 01 ,Studentt 检验。以 Nikon Coolpix 5000 照相机和 NikonEclipse E400显微镜获取显微图像，使用10倍目镜。放大倍率是20x/0.5NA物镜。(E)通过在杀死 小鼠之前10-15分钟注射荧光标记的植物凝集素并收集肿瘤来测定血管灌注。植物凝集素 定位于灌注区而PECAM染色部分代表血管。在对照组中，植物凝集素和PECAM共定位，而 SD114组显示出显著的灌注缺失。(F)肿瘤血管中α-SMA的定位。对照组显示出α-SMA 和PECAM的共定位，而sD114组中的微血管中具有极少量的α -SMA阳性细胞。图19.可溶性D114在鼠异种移植(zenograft)模型中抑制体内肿瘤生长。从移 植后第5天开始，通过腹膜内给予缺少EGF样结构域7和8的D114-E6(SEQ ID N0:1的残 基1-422)，浓度为5mg/kg，一周三次。在高浓度时VEGF刺激人类动脉内皮细胞(HUAEC)的 萌发。还检测了 Dl 14-E6与VEGF中和抗体(Avastin)的组合效应。从移植后第5天开始， 还通过腹膜内给予Avastin，浓度为10mg/kg，一周三次。
图20.抗-D114抗体的表位作图(A)与碱性磷酸酶融合的D114截短突变体的完 整系列。鉴定了 4个单独的克隆，每个具有针对D114的特异性结合区域。(B)在4°C在PBS 中将4μβ/πι1(100μ 1)的D114抗体包被至ELISA平板过夜。以0. 5%的BSA将平板封闭2 个小时，然后加入20ng与碱性磷酸酶融合的可溶性D114蛋白。在室温孵育45分钟后，以 PBST洗涤平板并在37°C与PNPP孵育20分钟。该实验至少重复三次。图21.人类 D114(hD114)、小鼠 D114(mD114)和人类 Dili (hDlll)的蛋白序列比 对。从N末端至C末端，第一个阴影区域表示抗体克隆#2-6的表位。第二个阴影区域代表 DSL区域。包含EGF样3 (E3)结构域的第三个阴影区域表示抗体克隆#61B的表位。图22.抗D114抗体的表征㈧在小鼠中通过以可溶性人类D114_His蛋白(SEQ ID NO :1的氨基酸1-524)进行免疫接种来产生人类D114抗体。总结了四个抗体克隆。(B) 两个被命名为#2-6和#61B的抗体有效地中和D114-Notchl的相互作用。在4°C在PBS中 将0. 5 μ g/ml (100 μ l)Notchl-Fc包被至ELISA平板过夜。以0. 5%的BSA将平板封闭2个 小时，然后加入所示数量D114抗体，所述D114抗体预先与50ng的与碱性磷酸酶融合的可 溶性D114混合。在室温孵育45分钟后，以PBST洗涤平板并在37°C与PNPP孵育1. 5小时。 该实验至少重复三次。图23.命名为#61B的D114抗体克隆的可变区Vh(SEQ ID NO :4)禾口 Vl (SEQ ID NO: 5)的序列。图24.命名为#2-6的D114抗体克隆的可变区Vh(SEQ ID NO :6)禾口 Vl (SEQ ID NO: 7)的序列。图25.D114-FC融合蛋白连接子工程化。融合蛋白之间的连接子区域可能影响目 标蛋白的功能。测试了 D114(E6)和人类IgGlFc (从Fc铰链区的EPKS开始)之间的三个不 同的连接子。Ll和L2融合蛋白之间有三倍的差异。选择了 D114-L2-FC进行肿瘤异种移植研 究。在4°C在PBS中将0. 5 μ g/ml (100 μ l)Notchl-Fc包被至ELISA平板过夜，然后以0. 5% 的BSA将平板封闭2个小时。将所示数量的D114-FC蛋白或BSA与50ng的D114(E8)_AP 预先混合，然后加入。在室温孵育45分钟后，以PBST洗涤平板并在37°C与PNPP孵育1小 时。发明详述本发明部分基于以下发现δ样4的功能对于体内血管生成而言是非常重要的， 并且，此外，δ样4活性的增加与动脉内皮细胞的增殖增加和内皮细胞采纳动脉特性的增 加相关联。本申请人产生了小鼠D114敲除突变体，其显示出剂量敏感的血管生成上的缺 陷。此外，本申请人产生了小鼠D114过表达模型并且证明在一些情况下，D114表达的增加 引起动脉组织的肥大，并且，此外，还引起静脉组织采纳动脉特性。基于这些结果，显而易见 的是血管生成，其中产生动脉和静脉微血管系统，对D114活性高度敏感，并且可以通过抑 制或过度激活D114而被扰乱(例如，抑制或使其以紊乱或无效的方式发生)。因此，令人惊 奇的是，D114的激动剂和拮抗剂均可用于治疗正在发生血管生成的肿瘤。此外，本发明涉 及以下发现D114的过表达能够刺激动脉生长并且因此可用于刺激动脉生成。动脉生成是 副动脉形成和生长的过程，通常是在缺血组织中。因此，D114激动剂可用于治疗患有或具 有患上缺血事件(例如外周或冠状动脉缺血)风险的患者。此外，本公开证明可溶性单体 或二体Dl 14多肽能够分别以低浓度或高浓度抑制或促进血管生成。
D114激动剂/拮抗剂的确定(determinant)本发明还涉及可以用于评价目标试剂是否是D114信号传导的激动剂或拮抗剂的 生物标志物。一般性涉及δ蛋白(包括D114)的科学文献没有明确阐明某特定试剂激活 或是抑制D114介导的信号传导。例如，已经在众多分析中测试了 D114和δ细胞外结构域 (例如可溶性单体或二体形式，具有缺失的细胞内结构域的形式和可溶性Fc融合物)，但是 仍然不清楚所观测到的效应中是否有任何效应是由激动剂或拮抗剂活性引起的，或者究竟 是否存在任何有意义的活性。此外，反应剂可能以多种方式影响D114的信号传导。例如，反 应剂可能影响Notchl和/或Notch4的激活，或反向(retrograde)Dl 14信号传导的激活， 其可能由D114细胞内结构域介导。反应剂还可能影响早老素(preseniline)蛋白酶活性 的活性，其可能同时影响Notchl和Notch4。本公开证明D114的过度激活引起内皮细胞采 纳动脉表型，表现为EphrinB2和连接蛋白37的表达；而D114功能的丧失引起内皮细胞采 纳静脉特性，表现为EphB4的表达。这种关于D114活性的遗传决定的体内效应的信息将允 许鉴定已知的和新发现的试剂作为D114信号传导的激动剂或拮抗剂。试剂 因此，在一些方面，本公开提供了多种多肽化合物(试剂)，其可用于治疗癌症以 及与血管生成相关的失调和与不想要的血管生成相关的过程。D114是一种Notch配体，其含有信号序列、DSL结构域、8个表皮生长因子样重复、 跨膜结构域和细胞内区域，这些均具有δ蛋白家族成员的特征。δ-4mRNA的组织分布类似 于以前描述过的NotCh-4(Int-3)转录本。δ-4的细胞外部分的可溶性形式抑制人类主动 脉内皮细胞的明显增殖，但不抑制人类肺部动脉内皮细胞的增殖。Yoneya等人J. Biochem. Vol. 129，pp. 27-34(2001)。Notch蛋白家族成员是跨膜受体，其含有特征性的多个表皮生长因子(EGF)样重 复以及保守结构域，例如RAM、ankyrin样重复和PEST序列。Notch蛋白的受体包括黑腹 果也黾(Drosophila melanogaster)中的 δ 禾口 Serrate ；秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中的LAG-2和APX-1 ；以及脊椎动物中的δ和Serrate (或Jagged)。这些配体也 是跨膜蛋白并且在数目可变的EGF样重复的上游含有高度保守的DSL( δ -Serrate-LAG-2) 基序。DSL结构域是Notch配体的特征性特征，对于蛋白功能是重要的；因此，LAG-2中的 DSL结构域的点突变导致活性的丧失。虽然脊椎动物的δ和Jagged (Serrate)蛋白显示出 类似的结构，但是每组蛋白还具有几个不同的特征。因此，虽然脊椎动物δ蛋白含有8个 EGF样重复，但是Jagged蛋白含有16个这样的重复。此外，在Jagged蛋白中，EGF结构域 之后跟随着富含半胱氨酸的结构域，但在δ蛋白中没有。然而，这些结构差异的结果仍然 是未知的。Uyttendaele等人(1996)克隆了对应于小鼠Notch4基因的完全编码区的cDNA。 原位杂交显示在胚胎和成人阶段，Notch4转录本主要被限制在内皮细胞中，这提示了 Notch4在脊椎动物内皮发育过程中的作用。Li 等人(Genomics. I998Jul 1 ；51 (1) 45-58)报道人类 N0TCH4 基因含有 30 个 外显子并跨越大约30kb。他们分离了对应于6. 7-kb N0TCH4 (S)和9. 3_kb N0TCH4 (L)mRNA 异构体的cDNA。他们推测出N0TCH4(S)编码的蛋白长度为2，003个氨基酸并且含有特征性 Notch基序信号肽、29个表皮生长因子(EGF)样重复、3个Notch/lin-12重复、跨膜区域、6个cdclO (603151)/ankyrin重复以及在C末端具有PEST保守区域。小鼠和人类N0TCH4 蛋白的序列具有82%的同一性。不完全剪接的N0TCH4 (L)cDNA潜在编码2个不同蛋白。一 个由7个EGF重复组成。第二个含有跨膜结构域和细胞内区域并且类似于小鼠int3原癌 蛋白。Northern印迹分析显示N0TCH4(S)是主要的转录本并且在多种组织中表达。Krebs等人(2000)通过基因打靶产生了 Notch4缺陷型小鼠。该突变的胚胎纯合 子发育正常，纯合子突变成体是可以存活的且不育的。但是，Notch4突变显示出与相关的 Notchl基因的靶突变的遗传相互作用。Notchl突变体和N0tchl/N0tch4双突变体胚胎均 显示出血管生成性血管重塑的严重缺陷。编码Notch家族受体的配体的基因的表达模式的 分析表明只有D114基因的表达模式与编码早期胚胎脉管系统中Notchl和Notch4受体的 配体的预期表达模式相符。因此，Notch信号传导途径在调节血管形态形成和重塑中具有 必不可少的作用，并且表明尽管Notch4基因在胚胎发育过程中虽然不是必不可少的，但 是Notch4和Notchl基因在小鼠胚胎形成过程中具有部分重叠的作用。如上所述，本公开提供了使用和鉴定D114信号传导的激动剂和拮抗剂的方法。 一般地，候选的激动剂和拮抗剂将是任何与参与D114信号传导途径的蛋白(包括，例如， Dl 14、NotchU Notch4和早老素)结合的抗体或其可溶性部分。候选的激动剂和拮抗剂还 可以是与该途径的成员结合或影响该途径成员的小分子或其它试剂。反义或RNAi核酸可 用作D114、N0tchl、N0tch4或早老素或该信号传导途径的其它成员的拮抗剂。试剂的例子包括(a)与Dl 14选择性结合的抗体；(b)与Notchl选择性结合的抗体；(c)与Notch4选择性结合的抗体；(d)与Notchl和Notch4选择性结合的抗体；(e)包含Dl 14的Notch受体结合部分的多肽单体；(f)包含Dl 14的Notch受体结合部分的多肽二体；(g)包含两个或更多个含有D114的Notch受体结合部分的多肽的多肽多体 (multimer)；(h)包含Notchl或Notch4的D114结合部分的多肽单体；(i)包含两个或更多个含有Notchl或Notch4的D114结合部分的多肽的多肽多 体。预计干扰早老素活性或其它金属蛋白酶(例如kuzbanian)的试剂将调节D114信 号传导。可以按照本文的描述检测这些试剂中的每一个的激动剂或拮抗剂活性。Dl 14 多肽在一些方面，试剂是包含D114蛋白的细胞外结构域的可溶性多肽，例如SEQ ID NO 1的氨基酸27-531所示。在具体的实施方式中，D114可溶性多肽包含D114蛋白的DSL 结构域。在另一个实施方式中，D114可溶性多肽是包含至少EGF样结构域的结构域5或6 的截短物。本文使用的本发明的可溶性多肽包括D114可溶性多肽的片段、功能性变体和修 饰形式。可以通过测定对于内皮细胞中的动脉或静脉表型的效应来测定本发明的可溶性多 肽的这些片段、功能性变体和修饰形式作为D114的激动剂或拮抗剂的活性。
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在一些实施方式中，可以通过筛选由相应的编码D114的核酸片段重组产生的多 肽获得本发明的可溶性多肽的分离的片段。此外，可以通过使用本领域已知的技术例如常 规Merrifield固相f_Moc或t_Boc化学通过化学方式合成所述片段。可以产生(重组地 或通过化学合成)并测试所述片段以鉴定那些能够调节D114信号传导的肽片段。在一些实施方式中，D114可溶性多肽的 功能性变体包含与SEQ ID NO=I的氨基酸 序列的残基27-531具有至少90%、95%、97%、99%、或100%同一性的氨基酸序列。在一些实施方式中，本发明考虑到通过修饰本发明的可溶性多肽的结构而制备功 能性变体，所述修饰的目的是例如增强治疗性或预防性功效，或者稳定性(例如体外保质 期和体内抵抗蛋白水解降解的抗性)。可以通过例如氨基酸取代、删除或添加来产生修饰 的可溶性多肽。例如，可以合理预计例如，以异亮氨酸或缬氨酸单独替换亮氨酸、以谷氨酸 替换天冬氨酸、以丝氨酸替换苏氨酸、或以结构上相关的氨基酸进行的相似的氨基酸替换 (例如保守性突变)将不会对所产生的分子的生物学活性产生重大影响。保守性替换是那 些发生在具有相关侧链的氨基酸家族内的替换。本发明还考虑到产生D114多肽的组合突变系列以及截短突变体的方法，这对于 鉴定功能性变体序列是特别有用的。筛选这种组合文库的目的可以是为了产生例如可以作 为D114的激动剂或拮抗剂的可溶性多肽变体。可以产生源于组合的变体，其相对于天然产 生的可溶性多肽具有选择性功能。当从重组DNA构建体表达时，这样的变体蛋白可用于基 因治疗程序。同样地，诱变可以产生具有与相应的野生型可溶性多肽显著不同的体内半衰 期的变体。例如，可以使得改变的蛋白针对蛋白水解降解或其它细胞过程更加稳定或更不 稳定，所述其它细胞过程导致目标蛋白(例如可溶性多肽)的破坏或灭活。这样的变体以 及编码它们的基因可用于通过调节本发明的可溶性多肽的半衰期而改变他们的水平。短的 半衰期能够产生更短暂的生物学效应，并且当作为可诱导表达系统的一部分时，能够允许 更加严格地控制细胞内重组可溶性多肽的水平。如上所述，这样的蛋白，特别是它们的重组 核酸构建体，可用于基因治疗程序。有很多从简并寡核苷酸序列产生潜在同源物文库的方法。可以使用自动化DNA 合成仪进行简并基因序列的化学合成，然后将合成的基因连接至合适的基因以进行表达。 基因的简并系列的目的是在一个混合物中提供编码潜在的可溶性多肽序列的想要的系 列的所有序列。简并寡核苷酸的合成在本领域是熟知的(参见，例如，Narang, SA(1983) Tetrahedron 39 :3 ;Itakura等人，(1981)Recombinant DNA,Proc. 3rd Cleveland Sympos. Macromolecules, ed. AG Walton, Amsterdam :Elsevier pp273_289 ；Itakura 等人，(1984) Annu. Rev. Biochem. 53 :323 ;Itakura 等人，(1984) Science 198 :1056 ;Ike 等人，(1983) Nucleic Acid Res. 11:477)。这样的技术已经被应用于其它蛋白的指导性演化(参见， 例如，Scott 等人，(1990) Science 249 :386_390 ；Roberts 等人，(1992) PNAS USA 89 2429-2433 ；Devlin 等人，(1990) Science 249 404-406 ；Cwirla 等人，(1990) PNAS USA 87 6378-6382 ；以及美国专利号5，223，409,5, 198，346、和 5，096，815)。或者，其它形式的诱变可用于产生组合文库。例如，可以使用例如丙氨酸扫描 诱变等技术(Ruf 等人，(1994)Biochemistry 33 :1565_1572 ;Wang 等人，(1994) J. Biol. Chem. 269 :3095_3099 ；Balint 等人，(1993)Gene 137 :109_118 ；Grodberg 等人，(1993) Eur. J. Biochem. 218 :597_601 ；Nagashima 等人，(1993) J. Biol. Chem. 268 :2888_2892 ；Lowman 等人，(1991) Biochemistry 30 10832-10838 ；和 Cunningham 等人，(1989) Science 244 :1081-1085)，通过连接子扫描诱变(Gustin 等人，(1993)Virology 193:653-660; Brown 等人，(1992)Mol. Cell Biol. 12 :2644_2652 ;McKnight 等人，(1982) Science 232 316)；通过饱和诱变(Meyers 等人，(1986) Science 232:613)；通过 PCR 诱变(Leung 等人， (1989)Method Cell Mol Biol 1 :11_19)；或通过随机诱变，包括化学诱变等等(Miller等 人’ (1992)A Short Course in Bacterial Genetics, CSHL Press, Cold Spring Harbor, NY ；和 Greener 等人，(1994) Strategies in Mol Biol7 :32_34)通过筛选从文库中产生并 分离可溶性多肽变体(例如拮抗剂形式)。连接子扫描诱变，特别是组合环境中的连接子扫 描诱变，是用于鉴定截短(生物活性)形式的本发明的可溶性多肽的理想方法。本领域已知有众多用于筛选通过点突变和截短制备的组合文库的基因产物的技 术，以及，就此而言，用于筛选cDNA文库中的具有特定性质的基因产物的技术。这样的技术 一般可以适用于迅速筛选通过本发明的可溶性多肽的组合诱变产生的基因文库。最广泛使 用的用于筛选大的基因文库的技术通常包括将基因文库克隆进入可复制的表达载体、以 产生的载体文库转化合适的细胞、在一定条件下表达组合基因，所述条件为所需要的活性 的检测促进编码被检测的产物的基因的载体的相对容易的分离。以下描述的每个示例性检 验均可适用于筛选大量的通过组合诱变技术产生的简并序列所需要的高通量分析。在一些实施方式中，本发明的可溶性多肽还可以包括翻译后修饰。这样的修饰包 括但不限于乙酰化、羧化、糖基化、磷酸化、脂化、和酰化。结果是，修饰的可溶性多肽可能还 有非氨基酸元件，例如聚乙二醇、脂、多糖或单糖、和磷酸盐(phosphate)。可以就其对D114 的激动剂或拮抗剂效应来测试这样的非氨基酸元件对于可溶性多肽功能的效应。在一些方面，本发明的可溶性多肽的功能性变体或修饰形式包括具有至少一部分 可溶性多肽和一个或多个融合结构域的融合蛋白。这样的融合结构域的众所周知的例子 包括但不限于，聚组氨酸、Glu-Glu、谷胱甘肽S转移酶(GST)、硫氧化还原蛋白、蛋白A、蛋 白G、和免疫球蛋白重链恒定区(Fe)、麦芽糖结合蛋白(MBP)，其对于通过亲和层析分离融 合蛋白是特别有用的。为了亲和纯化的目的，使用了用于亲和层析的相关基质，例如谷胱甘 肽_、淀粉酶、和镍_或钴_偶联的树脂。本领域熟知的另一种融合结构域是绿色荧光蛋白 (GFP)。融合结构域还包括“表位标签”，其通常为短的肽序列，针对该表位标签的特异性抗 体是可以获得的。熟知的表位标签(针对该表位标签可以容易地获得单克隆抗体)包括 FLAG、流感病毒血凝素(HA)和c-myc标签。在一些情况下，融合结构域具有蛋白酶切割位 点，例如因子Xa或凝血酶，这允许相关的蛋白酶部分消化融合蛋白从而从其中释放重组蛋 白。然后可以通过后续的层析分离法从融合结构域中分离被释放的蛋白。在一些实施方式 中，本发明的可溶性多肽含有一个或多个修饰，所述修饰能够使可溶性多肽稳定。例如，这 样的修饰增强可溶性多肽的体外半衰期、增强可溶性多肽的循环半衰期或减少可溶性多肽 的蛋白水解降解。在一些实施方式中，可以通过多种本领域已知的技术产生本发明的可溶性多肽 (未修饰的或经修饰的)。例如，可以使用标准蛋白化学技术合成这样的可溶性多肽，例如 在 Bodansky，Μ. Principles of Peptide Synthesis, Springer Verlag，Berlin (1993)禾口 Grant G. A. (ed.)，Synthetic Peptides :AUser' s Guide，W. H. Freeman and Company, New York(1992)中描述的那些技术。另外，可以通过商业渠道获得自动化肽合成仪(例如，Advanced ChemTech Model 396 ；Milligen/Biosearch 9600)。或者，可以使用各种本领域 熟知的各种表达系统通过重组方式产生可溶性多肽、其片段或变体(参见下文)。基因治疗在一些方面，本发明 涉及分离的和/或重组的编码D114多肽的核酸。本发明的核 酸可以是单链的或双链的DNA或RNA分子。这些核酸可用作治疗剂。例如，这些核酸可用 于制备重组的可溶性多肽，所述多肽作为治疗剂给予细胞或个体。或者，可以在例如基因治 疗中将这些核酸作为治疗剂直接给予细胞或个体。在一些实施方式中，本发明提供了分离的或重组的核酸序列，其与SEQID NO :2所 示的核苷酸序列的区域具有至少80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%或100%的同一 性。本领于普通技术人员将认识到，与本发明的核酸互补的核酸序列以及本发明核酸的变 体也落在本发明的范围内。在进一步的实施方式中，本发明的核酸序列可以被分离、重组、 和/或与异源核苷酸序列融合，或处于DNA文库中。在其它的实施方式中，本发明的核酸还包括在高度严谨条件下与SEQID NO :2所 示的核苷酸序列杂交的核苷酸序列，或其互补序列。如上所述，本领于普通技术人员将容 易地理解促进DNA杂交的合适的严谨条件是可以变化的。本领于普通技术人员将容易地 理解促进DNA杂交的合适的严谨条件是可以变化的。例如，可以在大约45°C在6. Ox氯化 钠/柠檬酸纳(SSC)中进行杂交，然后在50°C以2. Ox SSC进行洗涤。例如，洗涤步骤中的 盐浓度可以选自在50°C大约2. Ox SSC的低度严谨至在50°C大约0. 2x SSC的高度严谨。 此外，洗涤步骤中的温度可以从在室温，大约22°C的低度严谨条件升高至大约65°C的高度 严谨条件。温度和盐都是可以变化的，或者可以将温度或盐浓度保持不变而改变其它变量。 在一个实施方式中，本发明提供了在室温在6x SSC的低度严谨条件下杂交然后在室温在2x SSC中进行洗涤的核酸。由于遗传密码的简并性而与本发明的核酸不同的分离的核酸也落在本发明的范 围内。例如，很多氨基酸由不止一个三元组(triplet)代表。指定同一个氨基酸的密码子 或同义物(例如，CAU和CAC是组氨酸的同义物)可能引起不影响蛋白的氨基酸序列的“沉 默”突变。但是，预计那些确实引起本发明的蛋白的氨基酸序列改变的DNA序列多态性将存 在于哺乳动物细胞中。本领域技术人员将认识到编码特定蛋白的核酸的一个或多个核苷酸 (多达大约3-5%的核苷酸)中的这些变异可能由于天然等位基因变异而存在于给定物种 的个体中。任意的以及所有的这样的核苷酸变异和由此导致的氨基酸多态性均落在本发明 的范围内。在一些实施方式中，本发明的重组核酸可以在表达构建体中与一个或多个调控核 苷酸序列可操作地连接。调控核苷酸序列通常适合于用于表达的宿主细胞。对于多种宿主 细胞，本领域已知有多种类型的合适的表达载体和适合的调控序列。通常来讲，所述一个或 多个调控核苷酸序列可以包括但不限于，启动子序列、引导或信号序列、核糖体结合位点、 转录起始和终止序列、翻译起始和终止序列、以及增强子或激活子序列。本发明考虑到本领 域已知的组成型或可诱导的启动子。启动子可以是天然产生的启动子或组合了一种以上的 启动子元件的杂启动子。表达构建体可以存在于细胞中的游离体例如质粒上，或者表达构 建体可以被插入到染色体中。在优选的实施方式中，表达载体含有可选择的标记物基因以 允许对转化的宿主细胞进行选择。可选择的标记物基因在本领域是熟知的并且可以根据所用的宿主细胞而变化。在本发明的一个方面，在表达载体中提供了本发明的核酸，所述表达载体包含编 码D14多肽且与至少一个调控序列可操作连接的核苷酸序列。调控序列是本领域可认识 到的且被选择用于指导可溶性多肽的表达。因此，术语调控序列包括启动子、增强子和其 它表达控制兀件° 在 Goeddel ；Gene Expression Technology :Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego, CA(1990)中描述了示例性的调控序列。例如，控制DNA序列 表达(当与之可操作地连接时)的众多表达控制序列中的任意一个均可用于这些载体中以 表达编码可溶性多肽的DNA序列。这样的有用的表达控制序列包括例如SV40早期和晚期 启动子、tet启动子、腺病毒或细胞巨化病毒立即早期启动子、Iac系统、trp系统、TAC或 TRC系统、表达受到T7 RNA聚合酶指导的T7启动子、噬菌体λ的主要操纵子和启动子区 域、fd包被蛋白的控制区域、3-磷酸甘油酸盐激酶或其它糖分解酶的启动子、酸性磷酸酶 例如Pho5的启动子、酵母α-杂交因子的启动子、杆状病毒系统的多面体启动子和其它已 知的控制原核或真核细胞或其病毒的基因表达的序列，及其各种组合。应该理解，表达载体 的设计可以取决于这样的因素，例如待转化的宿主细胞的选择和/或想要表达的蛋白的类 型。此外，还应该考虑到载体的拷贝数、控制该拷贝数的能力和该载体编码的任何其它蛋白 例如抗生素标志物的表达。本发明还涉及经过重组基因转染的宿主细胞，所述重组基因包括一种或多种本发 明的可溶性多肽的编码序列。宿主细胞可以是任何原核或真核细胞。例如，可以在细菌细 胞例如大肠杆菌、昆虫细胞(例如使用杆状病毒表达系统)、酵母、或哺乳动物细胞中表达 本发明的可溶性多肽。其它合适的宿主细胞对本领域技术人员是已知的。产生可溶性多肽的方法因此，本发明还涉及产生本发明的可溶性多肽的方法。例如，可以在合适的条件下 培养经过编码D114可溶性多肽的表达载体转染的宿主细胞以允许实现D114可溶性多肽的 表达。D114可溶性多肽可以被分泌，并且从细胞与含有可溶性多肽的培养基的混合物中分 离出来。或者，可以将可溶性多肽保持在胞质内或细胞膜组分内并且收获、裂解细胞并分离 蛋白。细胞培养物包括宿主细胞、培养基和其它的副产物。用于细胞培养的合适的培养基 在本领域是熟知的。可以使用本领域已知的用于蛋白纯化的技术从细胞培养基、宿主细胞 或二者之中分离可溶性多肽，所述技术包括离子交换层析、凝胶过滤层析、超滤、电泳、和以 可溶性多肽的特定表位特异性的抗体进行免疫亲和纯化。在优选的实施方式中，可溶性多 肽是包含促进其纯化的结构域的融合蛋白。可以通过将克隆的基因或其部分连接进入适合于在原核细胞、真核细胞(酵母、 禽类、昆虫或哺乳动物)或二者中表达的载体中来产生本发明的重组核酸。用于生产重组 可溶性多肽的表达载体包括质粒和其它载体。例如，合适的载体包括以下类型的质粒用于 在原核细胞例如大肠杆菌中表达的PBR322衍生的质粒、pEMBL衍生的质粒、pEX衍生的质 粒、pBTac衍生的质粒、和pUC衍生的质粒。优选的哺乳动物表达载体同时包含促进该载体在细菌中繁殖的原核序列和在真 核细胞中表达的一个或多个真核转录单元。适合于转染真核细胞的哺乳动物表达载体的例 子有pcDNAI/amp、pcDNAI/neo、pRc/CMV、pSV2gpt、pSV2neo、pSV2_dhfr、pTk2、pRSVneo、 pMSG、pSVT7、pko-neo和pHyg衍生的载体。这些载体中有一些经过来自细菌质粒例如
17PBR322的序列的修饰，以促进在原核和真核细胞中的复制和药物抗性选择。或者，病毒例 如牛乳头瘤病毒(BPV-I)或Epstein-Barr病毒的衍生物(pHEBo、pREP衍生的和p205)可 用于真核细胞中蛋白的瞬间表达。可以在以下关于基因治疗输送系统的描述中找到其它 病毒(包括逆转录病毒)表达系统的例子。用于制备质粒和转化宿主生物的各种方法在 本领域是熟知的。关于原核和真核细胞的其它合适的表达系统以及一般性的重组程序，参 见 Molecular Cloning A Laboratory Manual,2nd Ed. , ed. by Sambrook, Fritsch and Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press，1989)，第 16 和 17 章。在一些情况下， 可能需要通过使用杆状病毒表达系统表达重组SLC5A8多肽。这样的杆状病毒表达系统的 例子包括PVL衍生的载体(例如pVL1392、pVL1393和pVL941)、pAcUff衍生的载体(例如 pAcUffl)和 pBlueBac 衍生的载体(例如含有 β-gal WpBlueBac III)。制备融合基因的技术是熟知的。本质上讲，根据常规技术进行编码不同 多肽序列 的各种DNA片段的连接，其中应用了平结尾或交错结尾的末端以进行连接、限制性酶切消 化以提供合适的末端、视情况进行的粘末端的填满、碱性磷酸酶处理以避免不想要的连接、 以及酶学的连接。在另一个实施方式中，可以通过常规技术合成融合基因，所述常规技术包 括自动化DNA合成仪。或者，可以使用锚定引物进行基因片段的PCR扩增，其产生两个连续 基因片段之间的互补性悬突，然后可以使互补性悬突退火以产生嵌合基因序列(参见，例 如，Current Protocols in Molecular Biology, eds. Ausubel 等人，John Wiley & Sons 1992)。抗体在一些方面，本发明提供了对D114信号传导具有激动剂或拮抗剂效应的抗体。这 样的抗体可以与抗原例如D114、Notchl或Notch4结合。优选地，所述抗体与这样的抗原 的细胞外结构域结合。可以理解抗体可以是多克隆的或单克隆的；完整的或截短的，例如 F(ab' ) 2, Fab, Fv ；异种的、同种的、合成的、全长的人类抗体或其修饰的形式，例如人源化 的、嵌合的。全长人类抗体可以从表达人类免疫球蛋白基因的转基因动物中选择或从表达 抗体片段的重组文库中组装。例如，可以通过标准程序(参见，例如，Antibodies :A Laboratory Manual ed. by Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press : 1988))通过使用源自 D114、Notchl 或 Notch4的免疫原来制备抗-蛋白/抗-肽抗血清或单克隆抗体。可以使用免疫原性形式的 肽(例如，能够引发抗体反应的多肽或抗原性片段，或融合蛋白)免疫接种哺乳动物，例如 小鼠、仓鼠或兔子。赋予蛋白或肽以免疫原性的技术包括与载体偶联或其它本领域熟知的 技术。可以在存在佐剂的情况下给予抗原的免疫原性部分。可以通过检测血浆或血清中的 抗体滴度来监测免疫的进展。可以使用免疫原作为抗原通过标准的ELISA或其它免疫检验 法来评价抗体的水平。以抗原性制备物免疫接种动物之后，可以获得抗血清，如果需要的话，可以从血 清中分离多克隆抗体。为了产生单克隆抗体，可以从经免疫的动物收集产生抗体的细胞 (淋巴细胞)并通过标准体细胞融合程序与无限增殖细胞例如骨髓瘤细胞融合以产生杂 交瘤细胞。这样的技术在本领域是熟知的，并且包括，例如，杂交瘤技术(最初由Kohler 和 Milstein，(1975)Nature，256 :495_497 开发)、人类 B 细胞杂交瘤技术(Kozbar 等人， (1983) Immunology Today, 4 72)和产生人类单克隆抗体的EBV-杂交瘤技术(Cole等人，(1985)Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R. Liss, Inc. pp. 77-96)。可以 通过免疫化学方式筛选杂交瘤细胞以产生与Dl 14、Notchl、Notch4或其它靶多肽特异性反 应的抗体，和分离自包含这样的杂交瘤细胞的培养物的单克隆抗体。本文使用的术语“抗体”旨在包括其片段，所述片段也与抗原特异性反应。可以 使用常规技术将抗体片段化，并且按照如上针对完整抗体所述的相同的方式筛选所述片段 的效用。例如，可以通过使用胃蛋白酶处理抗体以产生F(ab)2片段。可以处理所产生的 F(ab)2片段以还原二硫桥，从而产生Fab片段。本发明的抗体还包括双特异性的、单链的 和嵌合的及人源化的具有抗原亲和性的分子，所述亲和性由抗体的至少一个CDR区域所赋 予。产生单链抗体的技术(美国专利号4，946，778)也可以适用于产生单链抗体。同样，转 基因小鼠或其它生物包括其它哺乳动物可用于表达人源化抗体。在优选的实施方式中，抗 体还包括连接在抗体上并且能够被检测的标记(例如，标记可以是放射性同位素、荧光化 合物、酶或酶的辅因子)。在一些优选的实施方式中，本发明的抗体是单克隆抗体，在一些实施方式中，本发 明提供了用于产生新型抗体的方法。例如，用于产生与D114、Notchl或Notch4特异性结合 的单克隆抗体的方法可以包括给予小鼠一定量的免疫原性组合物，所述组合物包含有效 刺激可检测的免疫反应的抗原多肽；从小鼠获得产生抗体的细胞(例如来自脾脏的细胞) 并将产生抗体的细胞与骨髓瘤细胞融合以获得产生抗体的杂交瘤；并且测试产生抗体的杂 交瘤以鉴定产生与抗原特异性结合的单克隆抗体的杂交瘤。一旦获得杂交瘤，即可以在细 胞培养物中繁殖杂交瘤，任选地在源自杂交瘤的细胞生产单克隆抗体的培养条件下进行。 可以从细胞培养物纯化单克隆抗体。在一些实施方式中，本公开提供了本文公开的任意抗体的人源化形式，以及包含 至少一个源自本文公开的抗体的CDR部分，特别是CDR3的抗体及其抗原结合部分。在优选 的实施方式中，抗体是单克隆抗体，其与待给予该抗体的受试者是免疫相容的，优选地，是 临床上可以接受的给予人类的抗体。在一些实施方式中，单链抗体和嵌合的、人源化的或灵长类化(CDR接合)的抗 体，以及嵌合的或CDR接合的单链抗体，其包含源自不同物种的部分，也包括在本发明中作 为抗体的抗原结合部分。可以通过化学方式或常规技术将这些抗体的不同部分连接在一 起，或者可以使用遗传工程技术作为连续蛋白进行制备。例如，可以表达编码嵌合或人源 化链的核酸以产生连续蛋白。参见，例如，Cabilly等人，美国专利号4，816，567 ;Cabilly 等人，欧洲专利号0，125，023B1 ；Boss等人，美国专利号4，816，397 ；Boss等人，欧洲专利 号 0，120，694B1 ；Neuberger, M. S.等人，WO 86/01533 ；Neuberger, M. S.等人，欧洲专利号 0，194，276 Bl ；Winter，美国专利号 5，225，539 ；和 Winter，欧洲专利号 0，239，400 Bi。另夕卜 关于灵长类化的抗体，参见，Newman，R.等人，BioTechnology，10 1455-1460 (1992)。关于 单链抗体，参见，例如Ladner等人，美国专利号4，946，778 ；and Bird, R. Ε.等人，Science, 242 423-426(1988)。此外，还可以产生抗体的功能性片段，包括嵌合的、人源化的、灵长类化的或单链 抗体的片段。本发明抗体的功能性片段保持其所源自的全长抗体的至少一个结合功能和/ 或调节功能。优选的功能片段保持相应的全长抗体的抗原结合功能(例如针对D114的特 异性)。一些优选的功能片段保持抑制D114的一种或多种功能特性的能力，例如结合活性、
19信号传导活性和/或对细胞反应的刺激如以下实施例所示，本申请人已产生了针对D114的单克隆抗体以及产生D114单 克隆抗体的杂交瘤细胞系。进一步以多种方式对这些抗体进行了表征，例如它们抑制D114 与Notch之间的相互作用的能力以及它们的交叉反应性。此外，表位作图研究揭示这些 D114抗体可以与D114的一个或多个区域特异性结合。例如，如图21所示，命名为#2-6的 抗体克隆与跨越包括MNNL结构域的区域的区域结合；而命名为#61B的克隆与包括EGF样 3结构域的区域结合。鉴定的其它抗体克隆与其它EGF样结构域结合，如图20A所示。此外，用于筛选抗体以鉴定想要的抗体的技术可能影响所获得的抗体的性质。例 如，用于某些治疗目的的抗体将优选能够靶向特定的细胞类型。因此，为了获得这种类型 的抗体，可能需要筛选与表达目标抗原的细胞结合的抗体(例如，通过荧光激活的细胞分 选法)。同样地，如果抗体是用于与溶液中的抗原结合，可能需要测试溶液结合。存在多 种不同的用于测定抗体抗原相互作用从而鉴定特定的想要的抗体的技术。这样的技术 包括ELISA、表面等离子共振结合检验(例如Biacore结合检验，Bia-core AB, Uppsala, Sweden)、三明治检验(例如，IGEN International, Inc. ，Gaithersburg, Maryland 的顺磁 性珠子系统)、western印迹、免疫沉淀检验和免疫组化。反义和RNAi在一些方面，本公开提供了分离的核酸化合物，其至少包括在生理条件下与D114 转录本杂交并减少细胞中D114表达的部分。这样的核酸可用作如本文描述的D114拮抗剂。 D114转录本可以是任何剪接前转录本(即，包括内含子)、剪接后转录本、以及任何剪接变 体。在一些实施方式中，D114转录本具有对应于如SEQ ID NO :2所示的cDNA (特别是其编 码部分)的序列。在一些方面，本公开提供了分离的核酸化合物，其至少包括在生理条件下 与Notchl或Notch4转录本杂交并减少细胞中Notchl或Notch4表达的部分。这些也可用 作D114拮抗剂。Notchl或Notch4转录本可以是任何剪接前转录本(S卩，包括内含子)、剪 接后转录本、以及任何剪接变体。核酸化合物的类别的例子包括反义核酸、RNAi构建体和催化性核酸构建体。核酸 化合物可以是单链或双链的。双链化合物还可以包括悬突或非互补性区域，其中一条链或 另一条链是单链的。单链化合物可以包括自我互补的区域，意思是该化合物形成所谓的“发 夹”或“茎-环”结构，其具有双链螺旋结构区域。核酸化合物可以包含与由D114、Notchl 或Notch4核酸序列的不超过1000个、不超过500个、不超过250个、不超过100个、或不超 过50个核苷酸组成的区域互补的核苷酸序列。互补性区域将优选为至少8个核苷酸，任选 地是至少10个或至少15个核苷酸。互补性区域可以落在靶转录本的内含子、编码序列或非 编码序列之内，例如编码序列部分。一般地，核酸化合物的长度为大约8个至大约500个核 苷酸或碱基对，任选地其长度为大约14至大约50个核苷酸。核酸可以是DNA(特别是用作 反义)、RNA或RNA =DNA杂交体。任何一条链都可以包括DNA和RNA的混合物，以及不能被 简单地分类为DNA或RNA的修饰的形式。同样地，双链化合物可以是DNA :DNA,DNA =RNA或 RNA =RNA,并且任何一条链也可以包括DNA和RNA的混合物，以及不能被简单地分类为DNA 或RNA的修饰的形式。核酸化合物可以包括多种修饰物中的任意一个，包括对于骨架(天然 核酸中的糖-磷酸盐部分，包括核苷酸之间的键)或碱基部分(天然核酸的嘌呤或嘧啶部 分)的一种或多种修饰。反义核酸化合物将优选具有大约15至大约30个核苷酸的长度，并且通常将包括一种或多种修饰以改善在血清、细胞或该化合物可能被输送的位点(例如 在口服输送化合物的情况下为胃；在通过吸入方式输送化合物的情况下为肺)中的特性， 例如稳定性。一般地，在RNAi构建体的情况下，与靶转录本互补的链是RNA或其修饰形式。 另一条链可以是RNA、DNA或任何其它变体。双链的螺旋部分或单链“发夹” RNAi构建体优 选将具有18至40个核苷酸的长度，任选地其长度为大约21至23个核苷酸，只要其被用作 Dicer底物。催化性或酶核酸可以是核酶或DNA酶并且也可以包括修饰的形式。当在生理 条件下并且以无意义或有意义对照物几乎没有或没有效应的浓度与细胞接触时，核酸化合 物可以将靶标的表达抑制大约50 %、75 %、90 %或更多。用于测试核酸化合物的效应的优选 浓度是1、5和10微摩。还可以测试核酸化合物对于细胞表型例如动脉或静脉特性的效应。筛选/检验方法存在很多筛选作为D114信号传导的激动剂或拮抗剂的候选试剂的方法。本公开 提供了可用于区分D114信号传导的激动剂或拮抗剂的特征。一般而言，D114信号传导的 激动剂刺激哺乳动物内皮细胞中动脉表型的表达并且抑制静脉表型的表达。一般而言， D114信号传导的拮抗剂抑制哺乳动物内皮细胞中动脉表型的表达并且刺激静脉表型的表 达。为了评价动脉和静脉表型，可以检测任何已知的区分动脉和静脉内皮细胞的特征。例 如，EphrinB2的表达和连接蛋白37的表达可用作动脉表型的指示。作为另一个例子，EphB4 的表达可用作静脉表型的指示。还可以按照与Dl 14、Notchl或Notch4的结合活性或者刺激或抑制产生 Notchl (Ni⑶)、Notch4或D114的活性细胞内结构域的能力来筛选试剂。从发状/分裂增 强子(HES)敏感性启动子的表达也可用于确定Notch信号传导是否被激活。NI⑶刺激HES 和HES驱动的启动子的表达。然后，可以在动物中测试通过任何筛选系统鉴定的化合物以评价它们对于血管生 成、动脉生成、或体内抗肿瘤活性的效应，以及对于体内动脉或静脉特性的效应。可以进行化合物或分子的高通量筛选以鉴定抑制血管生成或抑制肿瘤生长的试 剂或药物。测试试剂可以是任何化学物质(元素、分子、化合物、药物)，通过合成制备的、通 过重组技术制备的或从天然来源分离的。例如，测试试剂可以是肽、多肽、拟肽、糖、激素、或 核酸分子。此外，测试试剂可以是小分子或通过组合化学制备的具有更高复杂度的分子，例 如，并编辑进入文库。这些文库可以包括例如醇、烷基卤化物、胺、酰胺、酯、醛、醚和其它种 类的有机化合物。测试试剂还可以是分离自细胞——细菌、动物或植物——裂解液或培养 基的天然的或经遗传工程化改造的产物，或者可以是细胞裂解液或培养基本身。可以以单 独的形式或作为化合物混合物将测试化合物呈递至测试系统中，尤其是在最初的筛选步骤 中。例如，可以进行一项检验以筛选特异性抑制D114(配体)与N0tchl/N0tch4(受 体)结合，或者相反的结合的化合物，例如，通过抑制标记的配体_或受体-Fc融合蛋白与 无限增殖细胞的结合。在用于鉴定干扰两个细胞表面分子(例如Notchl和D114)之间的相互作用的物 质的检验的一个实施方式中，将表达一种类型的细胞表面分子的细胞样品与标记的配体或 标记的配体+测试化合物(或测试化合物组)接触。确定与细胞结合的标记的配体的量。 在与测试化合物接触的样品中较少量的标记(其中所述标记可以是例如放射性同位素、荧
21光或颜色标记)是该测试化合物干扰结合的指征。使用表达配体的细胞的反式检验可用于测试干扰Eph受体或其可溶性部分的结合的物质。可以使用与固体支持物连接的成分(例如细胞、纯化的蛋白，包括融合蛋白和具 有结合活性的部分)来进行鉴定干扰Dl 14和N0tchl/N0tch4之间的相互作用的物质的检 验，其中所述成分不与测试化合物相互竞争。固体支持物可以是任意合适的固相或基质，例 如珠子、平板壁或其它合适的表面(例如，微量滴定板的孔)、柱孔玻璃(CPG)或可以浸入溶 液例如孔中的溶液中的钉。可以直接或者通过一个或多个连接子分子将细胞或纯化的蛋白 连接至固体支持物。在一个实施方式中，可以通过标准技术例如化学交联，或通过针对分离的或纯化 的蛋白产生的抗体将分离的或纯化的蛋白固定于合适的亲和基质并结合至固体支持物上。 可以将基质装于柱子中或其它合适的容器中并在适合于化合物与蛋白结合的条件下与待 测的一种或多种化合物(例如混合物)接触。例如，可以使含有化合物的溶液流过基质。 可以以合适的洗涤缓冲液洗涤基质以除掉未结合的化合物和非特异性结合的化合物。可以 通过合适的洗脱缓冲液释放那些保持结合的化合物。例如，洗脱缓冲液的离子强度或PH的 变化将引起化合物的释放。或者，洗脱缓冲液可以包含设计为破坏化合物结合的释放成分 (例如，视情况可以是破坏测试化合物与蛋白结合或竞争性抑制其结合的一种或多种配体 或受体，或其类似物)。可以制备包含与第二个部分(在天然发现的该蛋白中不存在所述部分)相连的蛋 白的全部或一部分的融合蛋白以用于本方法的另一个实施方式。为此目的的合适的融合蛋 白包括其中所述第二个部分包含亲和配体(例如酶、抗原、表位)的那些。可以通过将蛋 白或其部分插入到合适的编码亲和配体的表达载体来产生所述融合蛋白。可以将所述表达 载体引入合适的宿主细胞以进行表达。将宿主细胞破坏，可以在足以使融合蛋白的亲和配 体部分与亲和基质结合的条件下将细胞材料与亲和基质接触，从而使包含融合蛋白的细胞 材料结合至合适的亲和基质。在该实施方式的一个方面，可以在足以使融合蛋白的亲和配体部分与基质结合的 条件下将融合蛋白固定于合适的亲和基质，并且在适合于化合物与结合的融合蛋白的受体 或配体蛋白部分结合的条件下与待测的一种或多种化合物(例如混合物)接触。然后，可 以以合适的洗涤缓冲液洗涤具有结合的融合蛋白的亲和基质以除掉未结合的化合物和非 特异性结合的化合物，但不显著破坏特异性结合的化合物的结合。可以通过将其中结合了 融合蛋白的亲和基质与合适的洗脱缓冲液(化合物洗脱缓冲液)接触来释放那些保持结合 的化合物。在这个方面，可以将化合物洗脱缓冲液配制为允许通过亲和基质保留融合蛋白， 但是可以配制为干扰待测化合物与融合蛋白的受体或配体蛋白部分的结合。例如，洗脱缓 冲液的离子强度或PH的变化可以引起化合物的释放，或者，洗脱缓冲液可以包含设计为破 坏化合物与融合蛋白的受体或配体蛋白部分结合的释放成分(例如，可以破坏化合物与融 合蛋白的受体或配体蛋白部分结合的一种或多种配体或受体，或其类似物)。固定可以在融 合蛋白与化合物接触之前、同时或之后进行，视情况而定。本方法的各种变体是可能的，这 取决于一些因素，例如所测的化合物、所选的亲和基质和洗脱缓冲液制剂。例如，在洗涤步 骤之后，可以通过合适的洗脱缓冲液(基质洗脱缓冲液)将其中结合了化合物的融合蛋白 从亲和基质上洗脱下来。当融合蛋白包含可切割的连接子(例如凝血酶切割位点)时，从亲和配体上切割可以释放一部分的其中结合了化合物的融合物。然后，可以通过合适的方 法(例如提取)将结合的化合物从融合蛋白或其切割产物上释放。治疗性应用在一些实施方式中，本发明提供了抑制血管生成的方法和治疗与血管生成相关的 疾病的方法。在其它实施方式中，本发明提供了抑制或减少肿瘤生长的方法和治疗患有癌 症的个体的方法。这些方法涉及给予个体治疗上有效量的一种或多种上文描述的D114信 号传导调节剂。这些方法特别旨在动物的治疗性和预防性治疗，更特别的是人类。如本文所述，与血管生成相关的疾病包括但不限于，依赖于血管生成的癌症，包 括，例如，实体瘤、血液产生的肿瘤例如白血病、和肿瘤转移；良性肿瘤，例如血管瘤、听觉神 经瘤、神经纤维瘤、沙眼和化脓性肉芽瘤；炎性失调，例如免疫和非免疫炎症；慢性关节风 湿病和牛皮癣；视觉血管生成性疾病，例如糖尿病性视网膜病、早熟性视网膜病、黄斑变性、 角膜移植排斥、血管新生性青光眼、晶状体后纤维增生症、红变；Osier-Webber综合征、角 膜疾病、红变、关节炎和糖尿病性血管新生。特别地，本发明的治疗剂可用于治疗或预防癌症(肿瘤)，包括但不限于结肠癌、 乳腺癌、间皮瘤、前列腺癌、膀胱癌、头和颈部鳞状细胞瘤(HNSCC)、卡波西肉瘤和白血病。在 一些实施方式中，本发明的方法可单独使用。或者，本方法可以与其它旨在治疗或预防增殖 性失调(例如肿瘤)的常规抗肿瘤治疗方法联合。例如，这样的方法可用于预防性癌症预 防、手术后癌症复发和转移的预防，以及作为其它常规癌症治疗的辅佐。本发明认识到可以 通过使用本发明的多肽治疗剂增强常规癌症治疗(例如，化疗、放疗、光疗、免疫疗法和手 术)的有效性。在该方法的一些实施方式中，可以一起(同时)或在不同时间(依次)给 予本公开的一种或多种治疗剂。此外，所述治疗剂可以与另一种类型的用于治疗癌症或用 于抑制血管生成的化合物一起给药。已经表明了多种常规化合物具有抗肿瘤活性。这些化合物已经被用作化疗中的 药物试剂以使实体瘤收缩、预防转移和进一步生长、或减少白血病或骨髓恶性肿瘤中的恶 性细胞的数目。虽然在治疗各种类型的恶性肿瘤中化疗已经是有用的，但是很多抗肿瘤化 合物诱导不想要的副作用。已经表明当把两种或更多种不同治疗组合起来时，治疗可以 协同作用并允许减少每种治疗的剂量，从而减少每种化合物在较高剂量时导致的有害副作 用。在其它情况下，对某个治疗呈抗性的恶性肿瘤可能对于两种或更多治疗的组合治疗起 反应。当本发明的治疗剂与另一种常规抗肿瘤试剂联合给药时(无论同时或依次)，显 示出这样的治疗剂增强抗肿瘤试剂的治疗效应或克服细胞对这样的抗肿瘤试剂的抗性。这 使得可以降低抗肿瘤试剂的剂量，从而减少不想要的副作用，或恢复抗肿瘤试剂在抗性细 胞中的有效性。可用于组合型抗肿瘤治疗的药物化合物包括，仅仅举例来讲氨鲁米特、安吖啶、 阿那曲唑、天冬酰胺酶、beg、比卡鲁胺、博来霉素、布舍瑞林、白消安、喜树碱、卡培他滨、卡 钼、卡莫司汀、苯丁酸氮芥、顺钼、克拉屈滨、氯贝丁酯、秋水仙碱、环磷酰胺、环丙孕酮、阿糖 胞苷、达卡巴嗪、放线菌素D、柔红霉素、己二烯雌酚、己烯雌酚、多西他赛、多柔比星、表柔 比星、雌二醇、雌莫司汀、依托泊苷、依西美坦、非格司亭、氟达拉滨、氟氢可的松、氟尿嘧啶、 氟甲睾酮、氟他胺、吉西他滨、三羟基黄酮、戈舍瑞林、羟基脲、伊达比星、异环磷酰胺、伊马替尼、干扰素、伊立替康、伊立替康、来曲唑、亚叶酸、亮丙立德、左旋咪唑、洛莫司汀、氮芥、 甲羟孕酮、甲地孕酮、美法仑、巯嘌呤、美司钠、甲氨喋呤、丝裂霉素、米托坦、米托蒽醌、尼鲁 米特、诺考达唑、奥曲肽、奥沙利钼、紫杉醇、帕米膦酸盐、喷司他丁、普卡霉素、P卜吩姆、丙卡 巴胼、雷替曲塞、利妥昔单抗、链佐星、苏拉明、他莫昔芬、替莫唑胺、替尼泊苷、睾酮、硫鸟嘌 呤、塞替派、二茂钛二氯化物、托泊替康、曲妥珠单抗、维A酸、长春碱、长春新碱、长春地辛、 和长春瑞滨。
这些化疗抗肿瘤化合物可以根据它们的作用机理分成例如以下的组抗代谢/抗 癌试剂，例如嘧啶类似物(5-氟尿嘧啶、氟尿苷、卡培他滨、吉西他滨和阿糖胞苷)和嘌呤类 似物、叶酸盐拮抗剂及相关的抑制剂(巯嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁、和2-氯脱氧腺苷(克 拉屈滨))；抗增殖/抗有丝分裂试剂，包括天然的产物，例如长春花生物碱类(长春碱、长 春新碱、和长春瑞滨)，微管阻断剂，例如紫杉烷(紫杉醇、多西他赛)、长春新碱、长春碱、诺 考达唑、埃博霉素和诺维本，鬼臼乙叉甙(依托泊苷、替尼泊苷)，DNA损伤剂(放线菌素、 安吖啶、安慈拉环素、博来霉素、白消安、喜树碱、卡钼、不孕苯丁酸、顺钼、环磷酰胺、环磷酰 胺、放线菌素D、柔红霉素、多柔比星、表柔比星、六甲基三聚氰胺奥沙利钼、异环磷酰胺、美 法仑、雌莫司汀、丝裂霉素、米托蒽醌、亚硝基脲、普卡霉素、丙卡巴胼、泰克索、泰索帝、替尼 泊苷、三亚乙基硫代磷酰胺和依托泊苷(VP16))；抗生素，例如放线菌素D(放线菌素D)、柔 红霉素、多柔比星(阿霉素)、伊达比星、安慈拉环素、米托蒽醌、博来霉素、普卡霉素(普卡 霉素)和丝裂霉素；酶(L-天冬酰胺酶，其全身性代谢L-天冬酰胺并剥夺那些不具有合成 其自身的天冬酰胺能力的细胞)；抗血小板试剂；抗增殖/抗有丝分裂烷化剂，例如氮芥子 气(二氯甲基二乙胺、环磷酰胺和类似物、美法仑、不孕苯丁酸)、乙基三聚氰胺和甲基三聚 氰胺(六甲蜜胺和塞替派)、烷基磺酸酯-白消安、亚硝基脲(卡莫司汀(BCNU)和类似物、 链佐星)、三氮烯类-氮烯唑胺(DTIC)；抗增殖/抗有丝分裂抗代谢剂，例如叶酸类似物(甲 氨喋呤)；钼配合物(顺钼、卡钼)、丙卡巴胼、羟基脲、米托坦、氨鲁米特；激素、激素类似物 (雌性激素、他莫昔芬、戈舍瑞林、比卡鲁胺、尼鲁米特)和芳香酶抑制剂(来曲唑、阿那曲 唑)；抗凝血剂(肝素、合成的肝素盐和其它的凝血酶抑制剂)；纤溶剂(例如组织纤溶酶 原激活剂、链激酶和尿激酶)、阿司匹林、双嘧达莫、噻氯匹定、氯吡格雷、阿昔单抗；抗迁移 试剂；抗分泌试剂(breveldin)；免疫抑制剂(环胞素、他克莫司(Π(-506)、西罗莫司(雷 帕霉素)、硫唑嘌呤、霉酚酸酯)；抗血管生成化合物(ΤΝΡ-470、染料木素)和生长因子抑制 剂(血管内皮细胞生长因子(VEGF)抑制剂、成纤维细胞生长因子(FGF)抑制剂)；血管紧 张素受体阻断剂；氧化氮供体；反义寡核苷酸；抗体(曲妥珠单抗)；细胞周期抑制剂和分 化诱导剂(维A酸)；mTOR抑制剂、拓扑异构酶抑制剂(多柔比星(阿霉素)、安吖啶、喜树 碱、柔红霉素、放线菌素D、依尼泊胺、表柔比星、依托泊苷、伊达比星和米托蒽醌、托泊替康、 伊立替康)、皮质类固醇(可的松、地塞米松、氢化可的松、甲基泼尼松龙、泼尼松、和泼尼松 龙)；生长因子信号转导激酶抑制剂；线粒体失调诱导剂和胱天蛋白酶激活剂；和染色质破 坏剂。在一些实施方式中，可用于组合型抗血管生成治疗的药物化合物包括(1) “血 管生成分子”释放的抑制剂，例如bFGF(碱性成纤维细胞生长因子)；(2)血管生成分子 的中和剂，例如抗-PbFGF抗体；和(3)内皮细胞对于血管生成刺激的反应的抑制剂，包 括胶原酶抑制剂、基底膜翻转抑制剂、抑制血管生成的类固醇、源自真菌的血管生成抑制剂、血小板因子4、凝血酶敏感蛋白、关节炎药物例如D-青霉胺和硫代苹果酸金、维生素D3 类似物、α干扰素、等等。对于另外的推荐的血管生成抑制剂，参见Blood等人，Bioch. Biophys. Acta.，1032 :89_118 (1990)，Moses 等人，Science, 248 1408-1410 (1990)，Ingber 等人，Lab. Invest. ,59 :44_51 (1988)，和美国专利号 5, 092, 885,5, 112, 946,5, 192，744、 5，202，352和6573256。此外，存在众多可用于抑制血管生成的化合物，例如阻断VEGF介 导的血管生成途径的肽或试剂、内皮抑制素蛋白或衍生物、血管抑制素的赖氨酸结合片 段、黑色素或促进黑色素的化合物、纤溶酶原片段(例如纤溶酶原的Kringle 1_3)、肌钙 蛋白(tropoin)亚基、玻璃粘连蛋白ανβ3的拮抗剂、源自皂角素B的肽、抗生素或类似 物(例如四环素或新霉素)、含有地诺孕素的组合物、包含与肽结合的MetAP-2抑制性核 心的化合物、化合物EM-138、查耳酮及其类似物、和naaladase抑制剂。参见，例如美国专 利号 6，395，718,6, 462，075,6, 465，431,6, 475，784,6, 482，802,6, 482，810,6, 500，431、 6，500，924,6，518，298,6，521，439,6，525，019,6，538，103,6，544，758,6，544，947, 6，548，477,6, 559，126、和 6，569，845。取决于组合型治疗的性质，可以在给予其它治疗的时候和/或之后继续本发明的 治疗剂的给药。多肽治疗剂的给药可以以单剂或以多剂进行。在一些情况下，在常规治疗 之前至少几天开始治疗剂的给药，而在其它情况下，在常规治疗临开始之前或进行常规治 疗的时候开始治疗剂的给药。在一些实施方式中，本公开提供了用于刺激动脉生成的方法。该方法可以包括给 予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的激动剂。所述受试者可以患有或具有患上 缺血性病症的风险。该受试者可以患有冠状动脉疾病，包括，例如，绞痛，或可以患有心肌梗 塞。该受试者可以患有外周动脉疾病，例如肢体、脑或器官例如肾脏中的缺血事件或部分阻 塞。该受试者可以被诊断为具有患上缺血事件的风险。在一些实施方式中，本公开提供了用于促进在血管中采纳动脉特性的方法。这样 的方法可以包括离体给予血管或给予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的激动 剂。血管可以是静脉移植物，例如隐静脉移植物，例如可用于冠状动脉旁路移植术。制剂在一些实施方式中，本发明的治疗剂与药学上可接受的载体一起配制。可以单独 给予这样的治疗剂或作为药物制剂(组合物)的成分给予。可以将化合物配制为以任何方 便用于人类或兽用医药的方式给药。组合物中还可以存在润湿剂、乳化剂和润滑剂，例如 十二烷基硫酸钠和硬脂酸镁，以及着色剂、释放剂、包衣剂、甜味剂、矫味剂和芳香剂、防腐 剂和抗氧化剂。在一些方面，本公开提供了药物组合物，其包含任意的靶向D114、NotchU Notch4 或该途径的其它成员的多种核酸化合物。药物组合物一般将包括药学上可接受的载体。适合于非肠道给药的药物组合物可以包含一种或多种多肽治疗剂，其与一种或多 种药学上可接受的无菌的等渗的水性或非水性溶液、分散液、悬浮液或乳液、或无菌粉末组 合，所述粉末可以在临近使用前复原为无菌可注射的溶液或分散液，其可以含有抗氧化剂、 缓冲剂、抑菌剂、使所述制剂与预期受体的血液等渗的溶质、或悬浮剂或增稠剂。可用于本 发明的药物组合物的合适的水性和非水性载体的例子包括水，乙醇，多元醇(例如甘油、丙 二醇、聚乙二醇、等等)，及其合适的混合物，植物油，例如橄榄油和可注射的有机酯，例如油酸乙酯。可以通过使用包衣材料，例如卵磷脂，或通过维持需要的颗粒大小(如果是分散 剂)，以及通过使用表面活性剂来维持合适的流动性。这些组合物还可以含有佐剂，例如防腐剂、润湿剂、乳化剂和分散剂。可以通过加 入各种抗细菌剂和抗真菌剂，例如，对羟基苯甲酸酯、三氯叔丁醇、苯酚山梨酸等来确保对 微生物的阻止作用。还可能需要在组合物中包括等渗试剂，例如糖、氯化钠等等。此外，可 以通过加入延迟吸收的试剂，例如单硬脂酸铝和白明胶而产生可注射药物形式的延缓的吸 收。可以通过在生物可降解的聚合物例如聚丙交 酯-聚乙交酯中形成一种或多种多 肽治疗剂的微胶囊基质来制备可注射的长效(Cbpot)形式。取决于药物与聚合物的比例以 及所用的特定聚合物的性质，可以控制药物释放的速率。其它的生物可降解聚合物的例子 包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。还可以通过将药物装入与身体组织相容的脂质体或微乳 剂来制备长效可注射制剂。本发明的肽治疗剂的制剂包括适合于口服/鼻服、局部、非肠道、直肠和/或阴道 内给药的那些制剂。可以方便地将制剂配制为单元剂型，并可以通过药剂学领域熟知的任 何方法来制备。与载体材料混合以产生单一剂型的活性成分的量将根据所治疗的主体、特 定的给药模式而变化。与载体材料混合以产生单一剂型的活性成分的量通常是产生治疗效 应的化合物的量。在一些实施方式中，制备这些制剂或组合物的方法包括将另一种类型的抗肿瘤 或抗血管生成治疗剂与载体和任选的一种或多种辅助性成分混合。一般地，可以用液体载 体或精细分割的固体载体或二者来制备制剂，然后，如果必要的话，将产品塑形。用于口服给药的制剂可以是以下形式胶囊、扁囊剂、药丸、药片、锭剂(使用香味 基底，通常是蔗糖和阿拉伯树胶或黄芪胶)、粉末、颗粒或作为水性或非水性液体中的溶液 或悬浮液，或作为水包油或油包水液体乳液，或作为酏剂或糖浆，或作为锭剂(使用惰性基 底，例如白明胶和甘油，或蔗糖和阿拉伯树胶)和/或口腔洗液等等，每种包含预定数量的 本发明的治疗剂作为活性成分。在用于口服给药的固体剂型(胶囊、药片、药丸、糖衣丸、粉末、颗粒等等)中，可以 将一种或多种本发明的多肽治疗剂与一种或多种药学上可接受的载体混合，所述载体例如 柠檬酸钠或磷酸二钙，和/或以下任意的(1)填充剂或补充剂，例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄 糖、甘露醇和/或硅酸；(2)粘合剂，例如，如，羧甲基纤维素、藻酸盐、白明胶、聚乙烯吡咯烷 酮、蔗糖、和/或阿拉伯树胶；⑶湿润剂，例如甘油；⑷崩解剂，例如琼脂、碳酸钙、马铃薯 或木薯淀粉、藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠；(5)溶液阻滞剂，例如石蜡；(6)吸收加速剂，例如 季胺化合物；(7)润湿剂，例如，如，十六烷基醇和单硬脂酸甘油；(8)吸附剂，例如高岭土和 斑脱土粘土； (9)润滑剂，例如云母、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、十二烷基硫酸钠、 及其混合物；和(10)着色剂。如果是胶囊、药片和药丸，则药物组合物还可以包含缓冲剂。 相似类型的固体成分也可以用作软和硬填充的白明胶胶囊中的填充剂，所述胶囊使用赋形 剂例如乳糖或奶糖，以及高分子量的聚乙二醇等等。用于口服给药的液体剂型包括药学上可接受的乳液、微乳液、溶液、悬浮液、糖浆 和酏剂。除了活性成分之外，液体剂型可以包含本领域常用的惰性稀释剂，例如水或其它溶 齐U、溶解剂和乳化剂，例如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1，3_ 丁二醇、油(特别是，棉花籽油、落花生油、玉米胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘 油、四氢呋喃醇、聚乙二醇和山梨聚糖的脂肪酸酯，及其混合物。除了惰性稀释剂之外，口服 组合物还可以包括佐剂，例如润湿剂、乳化剂和悬浮剂、甜味剂、矫味剂、着色剂、香料和防 腐剂。除了活性化合物之外，悬浮液中可以含有悬浮剂，例如乙氧基化异硬脂酸醇、聚氧 乙烯山梨醇和山梨聚糖酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝、斑脱土、琼脂、和黄芪胶、及其混合物。本发明的治疗剂可通过局部施用到皮肤或粘膜，例如子宫颈和阴道的粘膜。局部 制剂可以进一步包括众多已知可以有效作为皮肤或角质层刺透增强剂中的一种多种。这些 试剂的例子有2-吡咯烷酮、N-甲基-2-吡咯烷酮、二甲基乙酰胺、二甲基甲酰胺、丙二醇、 甲醇或异丙醇、二甲基亚砜和氮酮。还可以包括另外的试剂以配制美容上可接受的制剂。这 些试剂的例子包括脂肪、蜡、油、染料、香料、防腐剂、稳定剂和表面活性剂。还可以包括角质 层分离剂，例如本领域已知的那些。其例子有水杨酸和硫磺。用于局部或透皮给药的剂型包括粉末、喷雾剂、软膏、糊剂、霜剂、洗液、凝胶、溶 液、贴片和吸入剂。本发明的多肽治疗剂可以在无菌条件下与药学上可接受的载体以及任 意的可能需要的防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。除了本发明的多肽试剂之外，软膏、糊剂、霜 剂和凝胶中可以含有赋形剂，例如动物和植物脂肪、油、蜡、石蜡、淀粉、黄芪胶、纤维素衍生 物、聚乙二醇、硅树脂、斑脱土、硅酸、云母和氧化锌，或其混合物。除了本发明的多肽治疗剂之外，粉末和喷雾剂可以含有赋形剂，例如乳酸、云母、 硅酸、氢氧化铝、硅酸钙和聚胺粉末，或这些物质的混合物。喷雾剂还可以包含惯用的推进 剂，例如氯氟烃和挥发性未取代的烃，例如丁烷和丙烷。阴道内或直肠给药的制剂可配制为栓剂，其是这样制备的将本发明的一种或多 种化合物与一种或多种合适的非刺激性赋形剂或载体混合，所述赋形剂或载体包括例如可 可油、聚乙二醇、栓剂用的蜡或水杨酸盐，其在室温是固态的而在体温时是液态的，因此，在 直肠或阴道腔内将融化并释放活性化合物。在其它实施方式中，可以在细胞内从真核启动子表达本发明的多肽治疗剂。例如， 可以在真核细胞中从合适的载体表达D114或N0tchl/N0tch4的可溶性多肽。载体优选为 DNA质粒或病毒载体。可以基于(但不限于)腺相关病毒、逆转录病毒、腺病毒或甲病毒来 构建病毒载体。优选地，载体稳定地进入靶细胞中并维持在其中。或者，病毒载体可用于提 供瞬间表达。如果需要的话，可以重复给予这样的载体。编码本发明的多肽治疗剂的载体的 输送可以是全身性的，例如通过静脉内或肌内给药，或者施用至从患者移植出来的靶细胞， 然后再将其重新导入该患者中，或者可以通过其它任何允许将其引入需要的靶细胞中的方 式(参见综述Couture 等人，1996，TIG.，12，510)。
实施例对本发明进行了一般性描述，将通过参考以下实施例更容易地理解本发明，以下 实施例的目的仅仅是为了解释本发明的一些方面和实施方式，不是为了限制本发明。实施例1 小鼠动脉发育过程中对D114的剂量敏感性需求Duarte 等人(Genes Dev. 2004 Oct 15 ； 18 (20) :2474_8)证明小鼠 D114 中丧失 功能的突变导致血管发生和血管生成的缺陷，并且这些缺陷是剂量依赖性的，D114+/-小鼠
27比纯合子D114+小鼠显示出更轻的表型。此外，D114功能的丧失导致动脉血管特性的丧 失。这些结果证明了对于D114信号传导的敏感性水平，这在Notch途径中是史无前例的。 血管发育对D114剂量的敏感性表明了 D114-Notchl/4信号传导途径的拮抗剂在抑制血管 生成中将是高度有效的。实施例2 :mDLL4的过表达导致发育中的小鼠胚胎中的动脉肥大和静脉特性的丧 失。在本研究中，本申请人通过产生并鉴定小鼠的功能获得性突变体进一步研究了 mD114在哺乳动物血管发育中的作用。为了产生一般化的mD114的过表达，产生了条件化转 基因小鼠系ZEG-mD114。当与组成型ere系CAG-Cre小鼠(Sakai等人，1997)杂交时，这些 小鼠在鸡β肌动蛋白启动子和CMV增强子的控制之下表达天然形式的mD114。下文描述了 观察到的功能获得性表型。将mD114 cDNA 克隆进入 pCALL2_MigR(Lobe 等人，1999)以产生 pZ/EG_mD114 转基 因载体(图7)，将该载体通过电穿孔导入Rl小鼠胚胎干(ES)细胞。将通过标准方法(Nagy & ROSSant，2000)从电穿孔的ES细胞获得的转基因小鼠系与组成型ere系CAG-Cre杂交。 按照第二报告分子EGFP的荧光分析得到的胚胎，所述第二报告分子EGFP在那些发生了 Cre 重组的细胞中与mD114共表达。发现在双转基因胚胎(dt)中EGFP的表达是强烈的和一般 性的(图8)，在E8. 5至E9. 5时以正常的孟德尔比例发生。在E9. 0时，这些胚胎显示出头 部、心脏、鳃弓和后腹区的严重出血，心包水肿和不完全翻转(图Sc)。在E10. 5之后，没有 双转基因胚胎得到恢复。在双转基因胚胎的全固定和冷冻切片中以PECAMl抗血清进行的免疫染色显示了 早在E8. 5时即发生的动静脉畸形，特别是背主动脉和前主静脉之间的融合区(图10)。在 这个阶段，还存在程度明显的主动脉肥大，其逐渐变得更严重，直至E9. 5，这提示了 Notch 途径在调节内皮细胞增殖中的作用(图9)。与该假设相一致，BrdU掺入研究显示在双转 基因胚胎的前侧背主动脉中，内皮细胞的增殖平均增加了 40% (未显示)。另一方面，前主 静脉(ACV)出现了分支，仿佛它们未经过正确的血管生成重塑(图9)或几乎没有重塑，除 了直接连接至静脉窦的区域之外(图10)。在卵黄囊和头部区域中同样没有发生血管生成 重塑，在这两种情况下持续存在初级毛细血管丛(图9)。体节间血管比正常的稍大、稍短， 这可能是由于动脉和静脉血管之间的融合以及在背的最末端未发生分支的缘故(图9)。有 时可见到侵入的体节，这提示它们的生长途径方向的破坏(未显示)。在E9.5时，发现dt 胚胎的主动脉直接与静脉窦区域连接(图10)，在心脏末端之间产生了动脉微循环。在主动 脉与静脉窦连接后主动脉变得严重萎缩，推测这是由于血流不足的结果(图9和10)。以墨 汁注射进行的微血管造影研究显示在这些突变体中血液从主动脉弓流向主动脉，然后直 接流向静脉窦，几乎没有血液到达后侧背主动脉(图10)。对动脉和静脉特异性标志物表达的表征揭示了显著的突变表型，其中胚胎中的 所有血管都只呈现出动脉标志物。双转基因胚胎的静脉显示出动脉特异性标志物例如 印hrin-B2、连接蛋白37、heyl和notchl的异常表达(图11和12)。另一方面，在这些突 变体中检测不到静脉标志物(例如EphB4)的表达(图13)。此外，在E9. 0时在突变胚胎的 静脉窦区域中检测到了造血簇(未显示)，其通常在主动脉_生殖腺_中肾区域的主要动脉 中是特异的，这提供了静脉结构的功能性动脉化的证据。
mD114的过表达导致动脉肥大和动脉静脉分路、定位性血管生成停滞、内皮细胞动 脉特性标志物在静脉血管中的异常表达以及内皮细胞静脉特性标志物的下调。这些结果证明了 mD114在建立内皮动脉细胞特性中的作用，并且提示其参与成血 管细胞/内皮细胞增殖和血管生成的调节。实施例3 人类δ样(hdll4)调节内皮细胞管的形成和内皮细胞的萌发将人类dll4(SEQ ID NO :1的氨基酸26-524)的细胞外结构域克隆进入具有His 标签或Fc标签的哺乳动物表达载体，并在293细胞和CHO-K细胞中作为分泌蛋白表达。首 先显示纯化的dll4与Notchl结合，然后测试当在matrigel上培养时，其对于内皮细胞的 体外活性。参见图10和11。在8-24小时内，内皮细胞组织起来以形成管状结构，在生长因 子剥夺的条件下管的形成是最少的。以20ng/ml加入VEGF诱导了管的形成。当在缺少生 长因子的条件下测试时，D114以较低的剂量水平(100和200ng/ml)诱导管的形成；而在较 高的剂量水平500ng/ml时，不能诱导管的形成(图12)。但是，当向含有VEGF的培养物中 加入D114时，其不诱导管的形成。还在萌发检验中测试了人类dll4，其中以不同剂量水平的dll4处理内皮细胞球 形体(图13和14)。在较低的剂量水平时诱导了萌发而在较高的剂量水平时不能促进萌发 (图13)。与此相反，较低水平的dll4对于VEGF处理的内皮细胞萌发的影响是最小的，但 是在较高的剂量水平时萌发显示出显著降低(图14)。实施例3的方法和材料内皮细胞、平滑肌细胞和共培养球形体的产生产生确定细胞数目的内皮细胞和平滑肌细胞球形体。简而言之，将SM或HUVE细 胞悬浮于相应的含有0.25% (w/v)羧甲基纤维素的培养基中并培植于非粘附性圆底96孔 板。在这些条件下，所有的悬浮细胞均促成每孔中确定大小和细胞数目的单一球形体的形 成(标准大小2250个细胞/球形体；体外血管生成750-1000细胞/球形体)。为了产生 共培养球形体，将等量的悬浮的SM和HUVE细胞(标准大小1125个SMC和1125个HUVEC/ 球形体；体外血管生成500个SMC和500个HUVEC/球形体)混合并培植于如上所述的非 粘附性圆底96孔板中。将球形体培养至少24小时并用于相应的实验。体外血管生成检验按照以前的描述，使用内皮细胞、平滑肌细胞和共培养球形体定量测定胶原凝胶 中的体外血管生成。简而言之，过夜产生含有750-1000个细胞的球形体，然后将其包埋于 胶原凝胶中。在使用之前制备胶原贮存液将8体积的大鼠尾的酸性胶原提取物(在4°C 平衡至 2mg/ml)与 1 体积的 IOx EBSS(Gibco BRL, Eggenstein, Germany)混合；以 1 体积 0. IN的NaOH将pH调节至7. 4。将此贮存液(0. 5ml)与0. 5ml室温培养基(ECGM基础培养基 [PromoCell]，其中含有40%FCS，含有0. 5% (w/v)的羧甲基纤维素以防止球形体在胶原凝 胶聚合之前沉降)、50个球形体和相应的测试物质混合。将含有凝胶的球形体迅速转移至 预热的24孔平板并让其聚合(1分钟)，然后将0. Iml的ECGM基础培养基加到凝胶上面。在 370C，5% C02和100%湿度孵育凝胶。24小时后，通过使用数码成像软件DP-Soft (Olympus) 测定从每个球形体(100倍放大的目镜网格)生长出来的萌发的长度来数码地定量测定体 外血管生成，每个实验组和实验分析至少10个球形体。荧光细胞标记
按照生产商的说明书，使用荧光染料PKH26(红色荧光)和PKH67(绿色荧光)标 记SMC和HUVEC。经胰蛋白酶作用后，使用HBSS将悬浮的细胞洗涤一次，以PKH26或PKH67 将膜标记5分钟，并使用相应的培养液洗涤三次。使用荧光显微镜检测细胞标记的质量。超结构分析
将球形体固定于Karnovsky固定液中，在1. 0%四氧化锇中后固定，在系列梯度的 乙醇中脱水，并包埋于Epon。切取0. 5 μ m的切片并以azurell亚甲蓝染色以进行光学显微 镜分析。切取超薄切片(50-80nm)，收集在铜网格中，并以乙酸双氧铀和柠檬酸铅进行自动 染色，以进行Zeiss EM 10电子显微镜观察。为了定量测定表面球形体内皮细胞上的内皮细胞间连接复合体，对两个独立制备 物中随机挑选的20个球形体/实验组中的所有连接复合体进行计数。结果表示为连接复 合体的数目/100个表面单层内皮细胞(每个实验组分析至少200个EC)。形态学和免疫组化分析收集球形体并在200g离心3分钟。通过胰蛋白酶作用收集培养的单层细胞并通 过离心将其收集。将球形体和沉淀的单层细胞固定于含有4%多聚甲醛的HBSS中并进行 石蜡包埋处理；脱水后(系列梯度的乙醇和异丙醇，每个进行1小时)，首先将样品于60°C 在石蜡1(熔解温度为42°C)中浸没12小时。再次通过离心收集球形体和单层细胞并于 70°C在石蜡11(熔解温度为56°C)中浸没12小时。最后，将得到的石蜡块冷却至室温并裁 减，以进行切片。对于组织化学分析，切取石蜡切片(4 μ m)、去石蜡并复水化。然后将切片 与3%的H2O2在水中孵育以抑制内源过氧化物酶。在磷酸盐缓冲液中洗涤之后，将切片与 封闭溶液(10%正常的山羊血清)孵育30分钟，然后在4°C湿室中与相应的一抗孵育过夜。 然后，将其与二抗(生物素化的山羊抗兔子免疫球蛋白或生物素化的山羊抗小鼠免疫球蛋 白抗体；Zymed，San Francisco,Calif)孵育，暴露于链霉亲和素过氧化物酶，以作为底物的 二氨基联苯胺显色，以苏木精进行弱复染。球形体中细胞凋亡的检测按照生产商的说明书，应用原位细胞死亡检测试剂盒，通过对核小体片段化产物 的组织化学检测(TUNEL)来显示凋亡细胞。简而言之，进行去石蜡处理并以蛋白酶K消化 之后，通过使用末端脱氧核苷酸转移酶在3’端以荧光素-dUTP标记来检测包埋于石蜡中的 球形体的切片中的核小体片段化产物。通过直接进行荧光显微镜镜检，或者将切片与过氧 化物酶标记的抗荧光素抗体孵育并以作为底物的二氨基联苯胺显色后间接进行荧光显微 镜镜检来显示所述标记。DNA片段酶联免疫检验(ELISA)通过ELISA进行片段化的DNA的定量测定(细胞死亡检测ELISA试剂盒)。在室 温进行60分钟的裂解，剧烈摇动，以此来提取10个球形体的片段化DNA。在13，OOOg将提 取物离心10分钟，按照生产商的说明书，将300 μ 1的上清液与过氧化物酶标记的抗DNA抗 体和生物素化的抗组蛋白抗体在链霉亲和素包被的平板中孵育。洗涤之后，通过与过氧化 物酶底物ABTS (2，2'-联氮-双[3-乙基苯并噻唑-磺酸盐])显色来显示单-和寡聚核 小体DNA的结合。在405nm使用自动化微量滴定板读数器分析平板。统计学分析所有的结果均表示为平均值士SD。通过非配对Student t检验分析实验组之间的差异。P值<0.05被认为是统计学上显著的。实施例4 胚胎和成体Dl 14+/_突变体小鼠中的血管增殖由于血管发育的缺陷，D114v_和多数D114v_小鼠在子宫内即死亡。D114v_胚胎 的封闭检测显示直至E8. 75之前其一直具有正常的血管发生，到E8. 75时首次血管缺陷 变得明显。具有增加的血管增殖，其显示出蜂巢模样并且缺少分级的动脉分支和成熟(图 15A)。我们接下来研究了成体D114v_突变体和野生型小鼠中的血管反应和重塑。将S180 肿瘤细胞植入小鼠(6周龄)。通过PECAM和α -SMA免疫定位检测10天之后收集的肿瘤和 邻近组织的血管反应。野生型小鼠显示出肿瘤中的增加的血管反应(图15Β)，并且血管具 有组织化的网络结构。与此相比，D114+小鼠显示出血管反应的更高的增长(1.5倍增长， P < 0. 05)。此外，血管显示出缺少组织架构并且缺少分级。因此，血管反应增加了，但是缺少成熟化。新形成的血管的成熟伴随周细胞的募 集。我们假设D114+小鼠中新形成的血管在周细胞募集方面可能是缺陷的。因此，在野生 型小鼠的肿瘤血管中，周细胞与α-SMA抗体的共定位显示出丰富的信号；而D114+小鼠的 肿瘤血管显示出周细胞覆盖的显著缺陷(图15D)。周细胞的募集减少可能促成D114+小 鼠肿瘤血管中血管分级的缺失。此外，这些发现揭示出D114在周细胞向新形成的血管募集 中的新作用。我们接下来想确定成体小鼠中血管反应的缺陷是否导致基因表达的改变，特 别是dll4表达的改变。为此，我们使用包括LacZ报告分子的靶载体产生突变体小鼠以观 察D114启动子的活性。D114v_突变体小鼠在邻近肿瘤的正常组织中显示出高度结构化的 表达LacZ的血管(图15C)，而在肿瘤血管内的血管中LacZ的活性显著升高(图15C)，这 表明肿瘤脉管系统中D114的激活。进行了肿瘤血管的连续切片中的PECAM定位以确定肿 瘤脉管系统中D114激活的程度。D114在多数肿瘤血管中表达，而不是所有肿瘤血管都有表 达(图15E)。实施例5 可溶性Dl 14抑制D114_Notch信号传导我们接下来想确定可溶性D114是否能够拮抗Notch的激活。在哺乳动物细 胞中表达了与AP、Fc或His标签融合的人类D114的细胞外结构域，经纯化后确定其与 Notchl-Fc (图16A)和Notch4_Fc (数据未显示)结合，但不与Notch3_Fc (图16A)或单独 的Fc (数据未显示)结合。Notch的激活依赖于细胞环境中D114的表达。为了测定可溶解 形式的D114不诱导Notch的激活，我们将各种D114构建体引入内皮细胞中并通过RT-PCR 检测下游响应Notch的基因(Heyl、Hey2、Hesl和Hes2)的诱导。D114_Fc或D114_His没有 诱导Hes2，这显示了 Notch激活的缺失的代表性数据(图16B)。Hes2在Notch的下游，当 全长D114存在于细胞环境中时，全长D114诱导Hes2(图16C)。我们接下来确定了 sD114 是否能够抑制细胞Dl 14在诱导Notch信号传导中的活性。为此，将全长D114(D114-FL)引 入choK细胞中并与表达靶Notchl和Notch 4的HUVEC细胞共培养。在人类内皮细胞中， 使用人类基因特异性引物对，D114-FL诱导Notch调节的基因Heyl、Hey2、HeSl和Hes2(图 16C)。在相同的实验中，加入人类sD114-Fc和sD114_His阻止了 D114-FL诱导的Heyl、 Hey2,Hesl和Hes2的激活(图16C)。因此，可溶性D114作为D114-Notch信号传导的拮抗 剂发挥作用。基因表达的定量显示D114-Fc将Heyl、Hey2、Hesl和Hes2分别抑制到对照的 69 %、26 %、29 %和46 %，而sDl 14_Hi s将它们的表达分别减少至48 %、3 %、10 %和28 %。实施例6 :sD114在体内诱导Matrigel胶塞的血管化
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为了进一步证明SD114能够直接在体内抑制血管生成，我们进行了小鼠Matrigel 胶塞实验。以VEGF、sD114-Fc、sD114_His或各种组合补充Matrigel，并注射进入Balb/C nu/nu小鼠的腹部皮下组织中。6天之后，不含生长因子的Matrigel胶塞几乎没有血管化 (图17A)，而VEGF募集内皮细胞并遍布胶塞形成各种阶段的血管结构，包括那些具有开口 腔的血管结构，所述腔中含有红血细胞。在VEGF的环境中，sD114显示出血管结构的显著 增加(图17)，其类似于细绳状，多数缺乏腔。类似地，在没有VEGF的情况下，单独的SD114 也能够诱导血管生成。以PECAM进行的免疫化学检测进一步证明了 VEGF诱导的填充了红 血细胞的大血管与sD114诱导的表达PECAM但缺少腔和缺少灌注(由红血细胞的存在定 义)的血管之间的差异(图17B)。还使用Drabkin反应剂试剂盒通过Drabkin方法特异性 地定量测定了血红蛋白。将倍数变化与表示为1的对照测量值比较。因此，在对照、VEGF、 D114-FC和D114-His组中血红蛋白水平的中位数分别为1、9· 7,2. 5和3。与只含VEGF相 比，含有sD114的Matrigel胶塞中的血红蛋白浓度几乎降低了 4倍。实施例7 :sD114抑制无胸腺小鼠中人类肿瘤的生长肿瘤血管相对于静止血管而言具有不同的基因表达模式。D114是一些人类和鼠 肿瘤的肿瘤血管中诱导的基因之一(图15C)。D114诱导可能是肿瘤血管的一般性特征，一 种可能对肿瘤生长有益的特征。发现D114主要在肿瘤脉管系统中表达。为了确定sD114 对肿瘤细胞的效应，在体外以各种浓度的sD114测试了肿瘤细胞的存活性(HT29、MCF-7、 SCC-15、B16、PC3和KS-SLK细胞系)，没有观察到效应(数据未显示)。鉴于D114在体内 具有显著影响血管生成的能力，以及观察到的血管反应的sD114变化，我们推论SD114可能 在体内调节肿瘤生长。因此，我们在肿瘤异种移植模型中检测了 sD114的体内活性。以含 有载体或sD114的Matrigel预固定HT29 (人类结肠癌细胞系)和KS-SLK (人类卡波西肉 瘤细胞系)细胞并通过皮下进行移植。与对照肿瘤相比，补充了 sD114的异种移植物在2 周内显示出显著减少的肿瘤生长(图18A)。在KS-SLK中获得了相似的结果。在2周时对 照肿瘤的肿瘤体积中位数是583mm3 ；而在含有sD114_His的Matrigel中是267mm3。我们接下来研究了当肿瘤细胞产生sD114时，SD114的效应。以表达载体转染 HT29和KS-SLK细胞以产生D114-FL、sD114_Fc、sD114_His，以Western印迹检验确认每种 蛋白的表达(数据未显示)。截短的CD4的共表达允许将转染的细胞分选至90%以上的纯 度。将等数目的细胞(每个注射位点IxlO6个细胞)植入无胸腺小鼠(每组6-8个肿瘤) 并在2周的时间内测定肿瘤体积。在仅有载体的组以及D114-FL组中，肿瘤体积是相似的； 而sD114-Fc和sD114-His显著减小肿瘤体积(sD114_His减小70%以上)(图18B)。使用 PECAM免疫染色测定收获时的肿瘤的血管密度。表达D114-FL或仅有载体的肿瘤显示出高 度结构化的血管(图18C)。相反，表达SD114的肿瘤显示出血管构架中的显著变化。与仅 有载体或D114-FC的组相比，表达SD114的肿瘤脉管结构中具有多得多的分支点(图18)。 在KS-SLK肿瘤异种移植物中获得了相似的结果。血管显著较细并且经常缺少明显的腔。这 些特征使人联想到D114v_小鼠以及注入了 sD114的Matrigel胶塞中的血管分支。与不完 善形成的缺少腔的细血管一致，我们检测了缺氧区域。缺氧分析仅集中在存活的肿瘤区域。 在sD114-Fc和sD114-His中存在大的和宽的缺氧区域。这些区域的定量检测显示出与表 达D114-FL和载体的肿瘤相比，表达sD114的肿瘤的缺氧区域显著增加(图18D)。还使用 荧光标记的与血管腔表面结合的植物凝集素测定了肿瘤灌注。与D114-FL和载体转染的细
32胞相比，在表达sD114的肿瘤中具有非常有限的灌注(图18E)。此外，我们通过定位α-SMA的表达测定了新形成的肿瘤血管中周细胞的存在。野生型小鼠中的肿瘤血管显示出正常的 周细胞覆盖，而D114v_小鼠中的肿瘤血管呈现出周细胞覆盖的显著减少，如内皮细胞沿线 (lining)的α-SMA阳性细胞的数目所确定。类似地，sD114减少了带有人类肿瘤的无胸腺 小鼠的肿瘤血管中的周细胞数目。材料和方法实施例4-7中使用的材料和方法如下所述胚胎和成体中D114种系突变体小鼠的分析按照以前的描述16，在CDl背景下产 生了 D114敲除小鼠。D114+和多数D114v_小鼠胚胎具有致死表型。以血小板内皮细胞粘 附分子(PECAM)和α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)染色显示了 D114v_胚胎的脉管结构。研究 了存活至成年的D114v_小鼠的脉管结构中的变化。将5xl06个肿瘤细胞(S180小鼠肉瘤细 胞系)移植进入D114+CD1雄性小鼠和野生型小鼠(6-8周龄)。2周后收集肿瘤进行分析。 通过使用包括LacZ报告分子的靶载体研究了 D114v_小鼠的肿瘤组织和邻近的正常组织中 D114的表达。通过标准技术18进行全固定胚胎免疫组化(PECAM抗体来自Pharmingen)和 IacZ染色。RT-PCR 分析使用 superscript Preamplification System kit (GIBC0BRL)从 总RNA合成cDNA的第一条链，并使用(0. 1 μ g)及D114、GAPDH、β -肌动蛋白、Heyl、Hey2、 HeSl、HeS2特异性探针进行PCR(本研究中使用的引物对备索)，通过溴化乙啶染色显示PCR产物。抗体及其它反应剂抗-PECAM(M20)来自Santa Cruz Biotechnology (Santa Cruz, CA)，抗-α -SMA(Dako，Carpinteria, CA)、IgG-Fc 片段和抗人类 Fc 来自 Jackson Laboratories (Bar Harbor, ME)，Notchl-Fc 禾口 Notch3_Fc 来自 R&D (R&D systems)，缺氧探 针-1 来自 Chemicon(Chemicon International, Temecula, CA)，若丹明标记的蓖麻凝集素 I (RCA)来自 Vector labs (Vector labs, Burlingame, CAsi)，碱性磷酸酶底物 PNPP 购自 Sigma (Sigma Chemicals, St. Louis, MO)。细胞培养正常人类脐带静脉内皮细胞(HUVEC)和人类脐带动脉内皮细胞 (HUAEC)获自 Cambrex(Walkersville，MD)并维持在补充了 EGM2 的培养基(Invitrogen) 中。对于所有的实验，使用4个或更少传代的HUVEC和HUAEC，并且从汇合平皿收集。ChoK 细胞系获自American Type Culture Collection (Manassas, VA)并在推荐的条件下培养。D114构建体通过从由胎儿肺组织制备的人类CDNA(CloneteCh)进行PCR扩增 来克隆全长的人类D114基因。全长(氨基酸残基1-685)和C末端His标记的细胞外结 构域(氨基酸残基1-486)蛋白均表达自pcDNA3. 1表达质粒(Invitrogen)。AP融合蛋白 表达自pAPtag-2载体(GeneHunter Corp.)。所有的蛋白均在ChoK细胞(ATCC)中使用 Lipofectamine 2000 (Invitrogen)进行瞬间表达。从镍-NTA柱和蛋白A-S印harose柱纯 化His标记的和Fc融合的D114蛋白。Notch受体结合和激活途径在4 °C在PBS中将5 μ g/ml的Notchl-Fc和 Notch3-Fc在96孔板中进行过夜包被。在PBS和0. 1 % Tween-20 (PBST)中稀释D114-AP，将 50 μ 1的每种稀释液与Notch-Fc—起孵育并以PBS中的5%牛奶封闭1个小时。以PBST将 孔洗涤三次，以PNPP显色并在OD4tl5读数。通常，人类脐带静脉内皮细胞(HUVEC)在100-mm的平皿中生长至80%的汇合度并与瞬间表达全长D114的choK细胞共培养(1 1比例) 或仅转染了载体的choK细胞共培养。以rD114-His或rD114_Fc处理共培养物24小时的 时间，收集细胞并分离总RNA以进行进一步分析2°。细胞分选按照生产商的指示使用MACSelect 4. 1转染细胞选择试剂盒进行转染 细胞的分选。简而言之，以含有目标质粒的表达载体和PMACS 4.1质粒共转染细胞。36小 时后，以5mM的EDTA收集细胞并在4°C与MACSelect 4Microbead 一起孵育15分钟。然后 将细胞悬浮液通过磁场中的MS+柱。3次洗涤之后，将柱从磁场中取出来并在培养液中洗脱 所选择的细胞。使用荧光D114单克隆抗体通过FACS分析所分选的细胞从而确定选择效率 (数据未显示)。EC 管形成检验将 Matrigel (250 μ L ；BD Biosciences, Palo Alto, CA)置于冰冷 的24孔板的每个孔中。将平板在室温中放置15分钟，在37 °C中放置30分钟以使Matrigel 聚合。将EGM2培养基中的HUVEC以IxlO4个细胞/孔的浓度与各种浓度的测试材料一 起培植于平板中，一式三份。孵育6小时和24小时之后，使用Bioquant Image Analysis system(Bioquant,Nashville,TN)获取每个浓度的图像。使用 ImageJ软件(NIH,Bethesda, MD)比较不同小组之间形成的索的长度和结点的数目。实验重复进行两次19。血管萌发内皮细胞球形体按照如下方式产生将含有0. 25% (w/v)羧甲基纤维 素的培养基中的等量内皮细胞(1000个细胞/孔)悬浮并培植于非粘附性圆底96孔板中。 使内皮细胞悬浮以在每个孔中形成单一的球形体。将球形体包埋于胶原凝胶中并培养至少 24小时。使用数码成像DP-Soft (Olympus)数码地记录萌发(100倍放大的目镜网格)，每 个实验组和实验分析至少10个球形体。还通过使用ImageJ测定萌发的长度来定量确定萌
O^ 19
反 ο小鼠Matrigel胶塞血管生成检验使用Matrigel胶塞检验分析了体内血管生成。 Matrigel在体温时迅速形成固态凝胶，将因子捕获以允许缓慢释放和向周围组织的延长性 暴露。在4°C将液体形式的Matrigel (8. 13mg/mL,0. 5mL)与单独的载体(含有0. 25% BSA 的PBS)或VEGF,或sD114，或VEGF和sD114混合。沿着腹膜中线将Matrigel (0. 5mL)注射 进入雌性Balb/Cnu/nu小鼠(6周龄，每组5只)的腹部皮下组织。在第6天，将小鼠进行人 道主义处死并回收胶塞、称重并分割以进行血红蛋白测定和免疫组化分析。通过PECAM免 疫染色建立渗透细胞的血管特性。实验重复进行三次。使用ImageJ计算每个切片中的血 管化区域。使用生产商推荐的程序通过Drabkin方法(Drabkin reagent kit 525 ；Sigma, St. Louis, MO)测定一半Matrigel胶塞中的血红蛋白。免疫组化和免疫荧光使用标准方法16’19处理福尔马林固定的石蜡包埋的组织的 切片(5ym)。在4°C将切片与一抗孵育过夜并在室温与合适的二抗孵育1个小时。根据生 产商的指示使用来自Vector Laboratories (Burlingame, CA)的ABC染色试剂盒定位抗体 的结合，使用DAB底物溶液(Vector Laboratories)检测过氧化物酶活性。常规的阴性对 照为仅有一抗和二抗以及以正常的IgG同种型替换一抗。使用ImageJ建立阳性染色区域 并通过Student t检验进行分析。以相似的方式进行荧光免疫染色以检测EC特异性标志物包括PECAM的表达水平。 使用合适的荧光素偶联的二抗(Sigma-Aldrich，St Louis，M0)并以4'，6-联脒-2-苯基吲 哚二盐酸盐(DAPI)复染细胞核。以Vectashield抗衰减封固溶液(Vector Laboratories)封固玻片，使用 Olympus AX70 荧光显微镜和 Spot v2. 2. 2 (Diagnostic Instruments, Sterling Heights, MI)数码成像系统获得图像。小鼠肿瘤异种移植物将肿瘤细胞(1.5χ106)ΗΤ29(人类结肠癌细胞系)或 KS-IMM(人类卡波西肉瘤细胞系)通过皮下移植进入雄性无胸腺BalbC nu/nu (6_8周龄，每 组6只小鼠并重复两次)的腰窝。为了评价sD114的局部效应，将肿瘤细胞与含有或不含有 5 μ g/ml sD114 的 Matrigel 混合(1 1 体积 / 体积；BD Biosciences)。在第 14 天按照 0. 52xaxb2的估计测定肿瘤体积，其中a和b是明显肿瘤的最大和最小长度。使用Student t检验比较肿瘤体积，P < . 05被认为是统计学上显著的。将动物进行人道主义处死并收集 肿瘤和邻近的正常组织。将收集的组织分割以进行福尔马林固定或OCT冷冻以进行分析。 使用在收集肿瘤之前1个小时根据推荐的程序以60mg/kg的剂量在腹膜内注入并定位的缺 氧探针-1(HP1-100，Chemicon)研究缺氧的分布和强度。使用在收集肿瘤之前10-15分钟 注入的若丹明标记的蓖麻凝集素I(Vectorlabs)研究血管灌注并根据生产商推荐的程序 进行分析。所有的程序经过我们的机构动物管理和使用委员会批准并根据动物关怀条例的 规定进行。参考文献 Adams, R. H. ，Wilkinson, G. Α. ，Weiss, C. ，Diella, F. ，Gale, N. W. ，Deutsch, U.， Risau, W. and Klein, R. (1999). Genes Dev 13，295-306.Artavanis-Tsakonas, S. ，Rand,Μ.D. and Lake,R. J. (1999). Science 284,770-6.Duarte, A. , Hirashima, Μ. , Benedito, R. , Trindade, A. , Diniz, P. , Bekman, Ε., Costa, L. , Henrique, D. , Rossant, J. (2004) Genes Devl8, 2474-8.Fischer, A. , Schumacher, N. , Maier, Μ. , Sendtner, M. and Gessler, M. (2004). Genes Dev 18,901-11.Gale, N. W.，Baluk, P.，Pan, L.，Kwan, Μ.，Holash, J.，DeChiara, Τ. Μ.，McDonald, D. Μ. and Yancopoulos, G.D. (2001). Dev Biol 230，151-60.Iso, Τ. , Hamamori, Y. and Kedes, L. (2003) Arterioscler Thromb Vasc Biol23, 543-53.Krebs, L. Τ. , Xue, Y. , Norton, C. R. , Shutter, J. R. , Maguire,M. , Sundberg, J. P., GalIahan, D. , Closson, V. , Kitajewski, J. , Callahan, R.等人(2000)Genes Dev 14, 1343-52.Lawson, N. D.，Vogel, Α. Μ. and ffeinstein, B. Μ. (2002)Dev Cell3,127-36.Nagy, Α. and Rossant, J. (2000). In Gene targeting :a practical approach, (ed. A. L. Joyner), pp.177-206. New York :0xford University Press.Mumm, J. S. and Kopan, R. (2000) Dev Biol 228，151—65.Sakai, K. and Miyazaki, J. (1997)Biochem Biophys Res Commun 237,318-24.Shutter, J. R. , Scully, S. ,Fan, W. , Richards, W. G. , Kitajewski, J. , Deblandre, G. A.，Kintner, C. R. and Stark, K. L. (2000) Genes Dev 14，1313-8.Uyttendaele, H. , Marazzi, G. , Wu, G. , Yan, Q. , Sassoon, D. and Kitajewski, J. (1996)Development 122，2251-9.Yoneya 等人 J. Biochem. Vol. 129，pp. 27-34 (2001)
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，但是以上说明书仅是为了解释而不是为 了限制。在阅读了本说明书和以下权利要求书之后，本发明的很多变体对于本领域技术人 员将是显而易见 。本发明的完整范围应该通过参见以下权利要求书以及其等同物的完整 范围和说明书以及这样的变体而确定。
权利要求
一种用于治疗癌症的方法，所述方法包括给予有此需要的受试者有效量的Dll4拮抗剂。
2.权利要求1的方法，其中所述D114拮抗剂是包含D114的细胞外区域的多肽。
3.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂与赋予增强的药物动力学性质的部分共价连接。
4.权利要求3的方法，其中所述部分选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯部分。
5.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的DSL结构域或其变体。
6.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO :1的氨基酸27-524，或其变体。
7.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸1_486，或其变体。
8.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO :1的氨基酸27-486，或其变体。
9.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸1_442，或其变体。
10.权利要求2的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO :1的氨基酸27-442，或其变体。
11.权利要求1的方法，其中所述拮抗剂是与D114的细胞外区域结合的抗体或其片段。
12.权利要求11的方法，其中所述抗体是单克隆抗体。
13.权利要求11的方法，其中所述抗体是人类的或人源化抗体。
14.权利要求11的方法，其中所述抗体与赋予增强的药物动力学性质的部分共价连接。
15.权利要求14的方法，其中所述部分选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯部分。
16.权利要求11的方法，其中所述抗体包含SEQID NO :4或SEQ IDNO :5。
17.权利要求11的方法，其中所述抗体包含SEQID NO :6或SEQ IDNO :7。
18.一种用于抑制血管生成的方法，所述方法包括给予有此需要的受试者有效量的 Dl 14信号传导的拮抗剂。
19.权利要求18的方法，其中所述D114的拮抗剂是包含D114的细胞外区域的多肽。
20.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂与赋予增强的药物动力学性质的部分共价连接。
21.权利要求20的方法，其中所述部分选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯部分。
22.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO=I的DSL结构域或其变体。
23.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸27-524，或其变体。
24.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸1-486，或其变体。
25.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸27-486，或其变体。
26.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO 1的氨基酸1-442，或其变体。
27.权利要求19的方法，其中所述拮抗剂包含SEQID NO :1的氨基酸27-442，或其变体。
28.权利要求18的方法，其中所述拮抗剂是与D114的细胞外区域结合的抗体或其片段。
29.权利要求28的方法，其中所述抗体是单克隆抗体。
30.权利要求28的方法，其中所述抗体是人类的或人源化抗体。
31.权利要求28的方法，其中所述抗体与赋予增强的药物动力学性质的部分共价连接。
32.权利要求31的方法，其中所述部分选自Fc结构域、His标签或聚氧化烯部分。
33.权利要求28的方法，其中所述抗体包含SEQID NO 4或SEQ IDNO :5。
34.权利要求28的方法，其中所述抗体包含SEQID NO 6或SEQ IDNO :7。
35.权利要求18的方法，其中所述拮抗剂在哺乳动物内皮细胞中以有效的浓度抑制 VEGF刺激的血管生成。
36.权利要求18的方法，其中所述受试者患有血管生成相关疾病。
37.权利要求18的方法，还包括给予至少一种另外的抗血管生成剂，述另外的抗血管 生成剂与所述拮抗剂一起以加成或协同方式抑制血管生成。
38.权利要求37的方法，其中所述另外的抗血管生成剂是Notch受体的抑制剂。
39.权利要求18的方法，其中所述D114信号传导的拮抗剂抑制哺乳动物内皮细胞中动 脉表型的表达。
40.权利要求39的方法，其中所述动脉表型选自EphrinB2的表达和连接蛋白37的表达。
41.权利要求18的方法，其中所述D114信号传导的拮抗剂抑制Notch调节的基因。
42.一种用于抑制α平滑肌肌动蛋白(a-SM)阳性细胞向血管募集的方法，该方法包 括给予有此需要的受试者有效量的D114信号传导的抑制剂。
43.权利要求42的方法，其中所述抑制剂选自D114的抗体或其片段、可溶性 D114-His融合物或可溶性D114-FC融合物。
44.权利要求42的方法，其中所述a-SM阳性细胞选自周细胞、平滑肌细胞或周内 皮细胞。
45.权利要求42的方法，其中所述血管是静脉移植物。
46.权利要求42的方法，其中所述静脉移植物是隐静脉移植物。
47.权利要求42的方法，其中所述受试者患有血管生成相关疾病。
48.一种与位于D114的细胞外部分中的表位结合的分离的单克隆抗体或其抗原结合 部分。
49.权利要求48的分离的单克隆抗体，其中所述抗体或其抗原结合部分与位于选自以 下的结构域中的表位结合MNNL、DSL、以及一个或多个EGF重复。
50.权利要求48的分离的单克隆抗体，其中所述抗体是人源化抗体。
51.权利要求48的分离的单克隆抗体，其中所述抗体包含含有SEQIDNO :4或SEQ ID NO 5的氨基酸序列。
52.权利要求48的分离的单克隆抗体，其中所述抗体包含含有SEQIDNO :6或SEQ ID NO 7的氨基酸序列。
全文摘要
在一些实施方式中，本发明提供了鉴定和使用δ样4(Dll4)信号传导的激动剂和拮抗剂的方法。
文档编号A61K39/395GK101970004SQ200880127172
公开日2011年2月9日 申请日期2008年12月19日 优先权日2007年12月20日
发明者P·吉尔, R·刘, V·克拉斯诺佩洛夫 申请人:瓦斯基因治疗公司