本发明涉及医疗信息化技术领域，尤其是一种微生态检测报告自动生成方法和系统。
背景技术
随着医学技术的进步，尤其是微生态检测技术的进步，人们可以很方便地检测并了解自己的身体健康状况。微生态检测技术是一种通过检测样本中的微生物信息，结合数据分析来得到被检测者患有相应疾病的风险程度等医疗信息的医学技术。16srrna基因序列分析技术等现有或新的技术极大地推进了微生态检测技术的发展，微生态检测技术的结果越来越可靠，微生态检测技术已成为一种快速检测技术。微生态检测技术的检测结果通常是专业的医学术语，非专业人员难以从中快速得到有效信息，而微生态检测技术的检测结果的使用者除了专业的医学工作者之外，还包括被检测者本人，因此在应用微生态检测技术进行检测的基础上，只有快速准确地将检测结果生成易于阅读的微生态检测报告，使得被检测者以及其他非专业人员能够及时阅读微生态检测报告来了解相关健康状况，才能真正完全发挥微生态检测技术的作用。
但是，目前为止缺乏简单有效的微生态检测报告自动生成技术来将微生态检测技术的检测结果快速转换成微生态检测报告。现有的微生态检测报告普遍是通过人工阅读微生态检测技术的检测结果之后，再通过手工编写的，也就是微生态检测报告的生成环节依赖人工操作，大大降低了微生态检测报告的生成效率，
技术实现要素：
为了解决上述技术问题，本发明的第一目在于提供一种微生态检测报告自动生成方法，第二目的在于提供一种微生态检测报告自动生成系统。
本发明所采取的第一技术方案是：
一种微生态检测报告自动生成方法，包括以下步骤：
根据报告生成请求，调取被检测者的基础数据和检测数据，以及与检测数据匹配的标准参考数据；所述基础数据包括被检测者的个人信息和接受该次微生态检测时的流水信息，所述检测数据包括在该次微生态检测中检测到的微生态学参数以及患相应疾病的风险程度，所述标准参考数据用于供判断检测数据所处范围；
加载报告模板，将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板，从而生成微生态检测报告。
进一步地，所述报告模板的格式与检测数据匹配；所述报告模板的格式包括字体大小、用于填充内容的预留位置的数量和顺序。
进一步地，所述报告模板的风格与基础数据匹配；所述报告模板的风格包括字体型号、背景颜色、用于装饰微生态检测报告的插图。
进一步地，一种微生态检测报告自动生成方法还包括将背景知识填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
查找与检测数据中涉及到的微生物以及疾病相关的背景知识；
将背景知识填充到对应的微生物或疾病所填充的位置中。
进一步地，所述背景知识通过以下步骤查找获得：
从本地数据库中进行检索，返回检索到的所需的背景知识，如果所有所需的背景知识已被检索到，则结束对背景知识的查找，否则执行下一步骤；
从外部数据源中进行对上一步骤未检索到的背景知识的检索，在检索到所需背景知识时，向相关外部数据源发送引用请求，返回被允许引用的背景知识，如果所有所需的背景知识已被检索并引用，则结束对背景知识的查找，否则执行下一步骤；
返回用于提示被检测者自行查阅背景知识的信息。
进一步地，一种微生态检测报告自动生成方法还包括将参考文献信息及其标注填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
记录所填充的背景知识的来源，作为参考文献信息填充到报告模板；
对参考文献信息进行标号，并对相应的所填充的背景知识做标记。
进一步地，一种微生态检测报告自动生成方法还包括将医嘱信息填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
查找预存的与检测数据中涉及到的疾病相关的医嘱信息；
将医嘱信息填充到与其相关的微生物或疾病所填充的位置中。
进一步地，所述医嘱信息包括相应医生的介绍信息和联系方式。
本发明所采取的第二技术方案是：
一种微生态检测报告自动生成系统，包括：
数据读取模块，用于根据报告生成请求，调取被检测者的基础数据和检测数据，以及与检测数据匹配的标准参考数据；所述基础数据包括被检测者的个人信息和接受该次微生态检测时的流水信息，所述检测数据包括在该次微生态检测中检测到的微生态学参数以及患相应疾病的风险程度，所述标准参考数据用于供判断检测数据所处范围；
报告模板加载模块，用于加载报告模板；
报告生成模块，用于将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板，从而生成微生态检测报告。
本发明的有益效果是：应用本发明方法，只需要将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板的预留位置中，即可生成微生态检测报告，这个过程容易使用计算机编程实现，而基础数据、检测数据和标准参考数据的原始数据都可以是电子数据，因此非常容易利用计算机实现从微生态检测到生成报告全过程的自动化，从而快速地得到微生态检测报告。
进一步地，本发明还对微生态检测报告做进一步的处理或向其加入其它信息，极大地增强了微生态检测报告的可读性，被检测者可以从微生态检测报告中快速地得到所需的信息，从而有效地预防和对抗疾病。
附图说明
图1为本发明实施例1方法的流程图。
具体实施方式
实施例1
本发明一种微生态检测报告自动生成方法，如图1所示，包括以下步骤：
根据报告生成请求，调取被检测者的基础数据和检测数据，以及与检测数据匹配的标准参考数据；所述基础数据包括被检测者的个人信息和接受该次微生态检测时的流水信息，所述检测数据包括在该次微生态检测中检测到的微生态学参数以及患相应疾病的风险程度，所述标准参考数据用于供判断检测数据所处范围；
加载报告模板，将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板，从而生成微生态检测报告。
本发明方法中，报告模板是事先编辑好的，包括有多个可以用来填充内容的预留位置，以及用来引导阅读和说明的公式化的文字内容。应用本发明方法，只需要将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板的预留位置中，即可生成微生态检测报告，这个过程容易使用计算机编程实现，而基础数据、检测数据和标准参考数据的原始数据都可以是电子数据，因此非常容易利用计算机实现从微生态检测到生成报告全过程的自动化，从而快速地得到微生态检测报告。
用于生成微生态检测报告的基础数据，主要包含被检测者的个人信息，也就是其姓名、性别和身份证号码等，以及接受该次微生态检测时的流水信息，流水信息反映了该次微生态检测的时间、地点和流水序号等。基础数据可以用来标记和区分不同的微生态检测报告。
用于生成微生态检测报告的检测数据，主要包含微生态检测的结果，其一般包括所检测到的微生物相关数值，例如人体口腔、皮肤、泌尿和胃肠道四个微生态系统所含菌群的种类以及丰度等信息。检测数据还包括被检测者患相应疾病的风险程度等信息，这些信息可以通过现有技术，根据所检测到的微生物相关数值等信息分析出来。检测数据是通过现有的微生态检测技术获得的，是微生态检测报告的核心部分。
用于生成微生态检测报告的标准参考数据，可以是各菌种的标准丰度范围等，其可以从人类微生物组计划等数据库获得。标准参考数据是与检测数据结合使用的，用来提供检测数据的比较尺度，因此应当与检测数据匹配，也就是标准参考数据应该包括检测数据所涉及到的所有菌种的标准丰度范围等信息，且不包括检测数据不涉及到的菌种信息，避免提供多余信息。
基础数据、检测数据和标准参考数据可以充分地反映被检测者所需要的信息，利用这三种数据来生成微生态检测报告，可以提供足够的信息，避免处理多余信息，减少生成微生态检测报告所需时间和资源。
进一步作为优选的实施方式，所述报告模板的格式与检测数据匹配；所述报告模板的格式包括字体大小、用于供填充内容的预留位置的数量和顺序。
针对不同的被检测者，检测数据中所包含的微生物相关数值以及被检测者患相应疾病的风险程度等信息往往是不同的，同一份检测报告里面，不同的微生物相关数值对被检测者健康的影响也不相同，被检测者患相应疾病的风险程度高低以及疾病的危害程度也不相同，因此检测数据中的具体数据会有不同的重要性。将报告模板的格式与检测数据匹配起来，可以是将当中丰度较高的微生物的检测数据文字内容的字体放大；而预留位置的数量应该与检测数据所涉及到的菌群和疾病的种类数量相对应，使得既能容纳所有检测数据，又不会存在未被填充的预留位置从而影响报告的阅读效果；预留位置的顺序可以改变，例如，使得越重要的微生物的相关数值所涉及的检测数据填充的预留位置越靠前，而危害程度越高的疾病所涉及的检测数据填充的预留位置越靠前。通过以上处理，可以增加被检测者对一些重要的微生物和疾病的注意，从而提高微生态检测报告的预防作用。
进一步作为优选的实施方式，所述报告模板的风格与基础数据匹配；所述报告模板的风格包括字体型号、背景颜色、用于装饰微生态检测报告且与微生态检测报告内容无关的插图。
微生态检测报告是给被检测者以及其他非专业人员阅读的，不是枯燥的医学资料，因此应该考虑可读性。尤其是对于被检测者，其一般患有疾病，有一定的心理负担，因此生成微生态检测报告时应考虑其心情，为其采用相应风格的报告模板。根据基础数据可以得到被检测者的年龄、性别甚至学历和生活环境等个人信息。例如，如果被检测者是7岁的小女孩，生成的微生态检测报告中，字体型号可以使用萌系的新蒂小丸子体，背景颜色可以是粉红色，可以使用小猪佩奇作为插图；如果被检测者是23岁的文艺男青年，字体型号可以使用清新的岩田仿宋体，背景颜色可以是天空蓝，可以使用航海王动画中的各人物作为插图；如果被检测者是70岁的老年人，字体型号可以使用有力的方正苏新诗柳楷体，背景颜色可以是纯白色，可以使用中国山水画作为插图。通过以上处理，被检测者在阅读自己的微生态检测报告时，可以有轻松愉悦的感受，避免传统医学检测报告带来的恐惧感，使得微生态检测报告的可阅读性更强。
进一步作为优选的实施方式，本发明一种微生态检测报告自动生成方法还包括将背景知识填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
查找同检测数据中涉及到的微生物以及疾病相关的背景知识；
将背景知识填充到与其相关的微生物或疾病所填充的位置中。
由于检测数据中的有效信息是微生物相关数值以及被检测者患相应疾病的风险程度等信息，虽然已避免了使用专业的医学术语去描述，但是对于非专业人员来说还是难以理解的。如果被检测者不清楚其中的微生物以及相关疾病的具体概念，微生态检测报告的通知作用就会大打折扣。因此，有必要向微生态检测报告加入与这些微生物和疾病相关的背景知识，这些背景知识所填充的位置与相应的微生物或疾病是相同的，当被检测者阅读检测报告时，可以马上了解相关的微生物和疾病的概念和知识，从而对检测数据本身有更好的理解，增强微生态检测报告的可读性。
进一步作为优选的实施方式，通过以下步骤进行对背景知识的查找：
从本地数据库中进行检索，返回检索到的所需的背景知识，如果所有所需的背景知识已被检索到，则结束对背景知识的查找，否则执行下一步骤；
从外部数据源中进行对上一步骤未检索到的背景知识的检索，在检索到所需背景知识时，向相关外部数据源发送引用请求，返回被允许引用的背景知识，如果所有所需的背景知识已被检索并引用，则结束对背景知识的查找，否则执行下一步骤；
返回用于提示被检测者自行查阅背景知识的信息。
背景知识尽可能地存储在本地数据库中，并且优先使用本地数据库所存储的背景知识。如果从本地数据库中检索到需要的背景知识，就要返回并用于填充到报告模板中。本地数据库中可能没有存储所有相关的背景知识。如果一些背景知识未能从本地数据库中检索到，就要从外部数据源中检索。外部数据源包括百度百科、互动百科以及一些公开的医学数据库等。由于这些外部数据源一般有版权限制，因此应当先向外部数据源发送引用请求，如果对方允许引用，那么就返回被允许引用的背景知识并将其填充到报告模板中；如果不允许引用，那么可以换一个外部数据源再进行检索。如果一些背景知识未能从外部数据源中检索到，或者不被允许引用，那么就可以返回一条信息，提示被检测者自行查阅背景知识，这条信息可以填充到报告模板中。通过上述方法，可以快速可靠地查找背景知识，并且充分尊重了知识产权。
进一步作为优选的实施方式，本发明一种微生态检测报告自动生成方法还包括将参考文献信息及其标注填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
记录所填充的背景知识的来源，作为参考文献信息填充到报告模板；
对参考文献信息进行标号，并在相应的所填充的背景知识做标记。
在添加背景知识的基础上，可以进一步添加参考文献并填充到报告模板。上述方式与论文引用参考文献时的标注方式是相同的，也就是在背景知识所填充的位置进行编号标记，然后将背景知识的来源，例如“本地数据库”或“百度百科”等作为参考文献信息，填充到报告模板的专门位置上。通过添加参考文献信息，被检测者可以据此进行扩展阅读，进一步增强微生态检测报告的可读性，
进一步作为优选的实施方式，本发明一种微生态检测报告自动生成方法还包括将医嘱信息填充到报告模板的步骤，这一步骤具体包括：
查找预存的同检测数据中涉及到的疾病相关的医嘱信息；
将医嘱信息填充到与其相关的微生物或疾病所填充的位置中。
医嘱信息是与检测数据中涉及到的疾病相关的，例如检测数据中提到“腹泻的患病风险是50％”，那么可以在相应位置添加医嘱：“纠正水、电解质、酸碱平衡紊乱和营养失衡。酌情补充液体，补充维生素、氨基酸、脂肪乳剂等营养物质。”通过添加医嘱信息，可以使得被检测者能采取初步预防或者治疗措施对抗疾病。
进一步作为优选的实施方式，所述医嘱信息包括相应医生的介绍信息和联系方式。
医嘱信息中除了包括疾病预防和治疗方法的简要介绍之外，还可以包括该种疾病专业医生的推荐信息，也就是介绍信息和联系方式。通过提供医生推荐信息，使得被检测者在患病时可以立即找到专业对口的医生，从而帮助被检测者对抗疾病，充分发挥微生态检测报告的防病治病作用。
实施例2
本发明一种微生态检测报告自动生成系统，包括：
数据读取模块，用于根据报告生成请求，调取被检测者的基础数据和检测数据，以及与检测数据匹配的标准参考数据；所述基础数据包括被检测者的个人信息和接受该次微生态检测时的流水信息，所述检测数据包括在该次微生态检测中检测到的微生态学参数以及患相应疾病的风险程度，所述标准参考数据用于供判断检测数据所处范围；
报告模板加载模块，用于加载报告模板；
报告生成模块，用于将基础数据、检测数据和标准参考数据填充到报告模板，从而生成微生态检测报告。
上述各功能模块可以使用独立的硬件模块来实现，也可以使用计算机系统中具有相应功能的软件模块来实现，还可以使用硬件加软件的模块来实现。
本发明以上是对本发明的较佳实施进行了具体说明，但对本发明创造并不限于所述实施例，熟悉本领域的技术人员在不违背本发明精神的前提下还可做作出种种的等同变形或替换，这些等同的变形或替换均包含在本申请权利要求所限定的范围内。