一种应用于精准用药的知识库系统的制作方法

本发明涉及基因检测技术领域，尤其涉及一种应用于精准用药的知识库系统。

背景技术：

基因与人类的生活息息相关，一个主要方面体现在基因对人类健康的重大影响，先天性的基因缺陷或后天性的基因突变与个体的身体健康，疾病的发生、发展有着密不可分的联系。随着基因与人类机体健康的关系被越来越多地发现、证实，为了满足社会对更好地预防和治疗基因相关疾病的需求，国内外涌现了众多提供基因检测技术服务的机构。

医学检测报告作为医学检测服务的产品，其准确性和时效性一直是医学检测服务行业的追求。医学分子生物学检测所涉及的检测方法或平台多种多样，对不同平台的结果进行分析，所需要的知识背景不尽相同，分析标准也不尽相同。而提供检测服务的不同机构或者是同一机构的不同项目对于检测平台的采取和检测报告的内容、样式会有自身的考虑和要求。

研究表明，基因与相关药物使用存在密切的关系，基因和药物能够构成药物基因对。例如，对于药物基因对“别嘌呤醇-hla-b”来说，因别嘌呤醇这种常用的治疗痛风药物，其不良反应与hla-b*5801显著相关，对于痛风患者能否常规使用别嘌呤醇，医院会委托基因检测公司检测该患者是否携带hla-b*5801。如果基因检测结果为不携带hla-b*5801，可以考虑使用常规的别嘌呤醇治疗方案；而若基因检测结果为携带hla-b*5801，该患者使用别嘌呤醇进行治疗时发生毒副作用的风险较高，医生则会结合临床实际，调整治疗方案。

相关技术中，提供一种基因检测系统，提出一种针对患者进行基因自动检测的技术方案，该方案针对不同的基因检测项目自动出具含用药指导提出了愿景。但是，该方案实现仍然存在缺陷，例如，针对如何具体实现用药指导，如何为用药指导提供持续有效和准确地知识数据支持，均缺乏有效的设计。

因此，有必要提供一种新的应用于精准用药的知识库系统，以解决上述技术问题。

技术实现要素：

本发明的主要目的在于提供一种应用于精准用药的知识库系统，旨在解决相关技术中，针对不同基因的用药指导缺乏持续有效的数据支持的技术问题。

为实现上述目的，本发明提供的应用于精准用药的知识库系统包括展示前端和维护后台；

所述展示前端包括知识信息展示模块，所述知识信息展示模块包括基因模块、药物模块、药物基因对模块和临床指南模块；

其中，所述展示前端中各模块用于响应用户的键鼠操作，以展示相关的信息数据，所述维护后台用于为所述展示前端中的各模块录入所述信息数据；

所述基因模块用于展示预设的基因信息，并提供与所述基因信息相关的药物基因对信息以及来自预设地域的人群基因突变频率数据；

所述药物模块用于展示预设的药物信息，并提供与所述药物信息相关的药物基因对信息以及所述药物信息的所属科室和分类；

所述药物基因对模块用于展示所述药物基因对信息以及与所述药物基因对信息相应的辅助信息；

所述临床指南模块用于展示临床指南信息，以介绍基于基因型的临床建议。

优选地，所述知识信息展示模块还包括药物标签模块、临床注释模块、临床试验模块和专利模块；

其中，所述药物标签模块用于展示药物标签注释信息；所述临床注释模块用于展示临床注释信息；所述临床试验模块用于展示临床试验信息；所述专利模块用于展示专利信息。

优选地，所述展示前端还包括平台信息公示模块，所述平台信息公示模块包括公告通知模块、最新事件模块、最新研究模块、知识库用户模块、下载模块和帮助模块；

其中，所述公告模块用于展示公告信息；所述最新事件模块用于展示行业内新闻信息；所述最新研究模块用于展示行业内前沿学术研究信息；所述知识库用户模块用于展示所有用户的公开信息；所述下载模块用于展示可供下载的数据，并提供下载服务；所述帮助模块用于展示系统使用手册。

优选地，所述应用于精确用药的知识库系统还包括检索模块，所述检索模块用于根据输入的关键词，检索获取所述展示前端中的相关信息数据。

优选地，所述维护后台包括任务发布模块、任务接收和执行模块、多级校验模块和状态显示模块，其中，所述任务发布模块用于发布用于录入所述信息数据的任务，所述任务接收和执行模块用于接收所述任务，并依据所述任务的要求录入所述信息数据，所述多级校验模块用于建立多个角色用户，以便于多个所述角色用户校验所述信息数据的录入结果，所述状态显示模块用于显示每个所述角色用户的数据校验结果。

优选地，所述角色用户包括标注员、检查员、质检员和专家。

优选地，所述维护后台还包括任务编辑模块，所述任务编辑模块用于对所述任务发布模块发布的所述任务进行编辑操作。

优选地，所述平台信息公示模块还包括任务大厅模块；所述任务大厅模块用于展示所述任务发布模块发布的所有的所述任务信息。

优选地，所述展示前端还包括任务展示模块，所述任务展示模块依据预设的排列规则展示排列靠前的所述任务信息，以指引用户选择需要优先执行的所述任务。

优选地，所述检索模块还用于显示提示信息，以提供检索提示。

本发明提供的应用于精准用药的知识库系统中；所述基因模块用于展示预设的基因信息，并提供与所述基因信息相关的药物基因对信息以及来自预设地域的人群基因突变频率数据；所述药物模块用于展示预设的药物信息，并提供与所述药物信息相关的药物基因对信息以及所述药物信息的所属科室和分类；所述药物基因对模块用于展示所述药物基因对信息以及与所述药物基因对信息相应的辅助信息；所述临床指南模块用于展示临床指南信息，以介绍基于基因型的临床建议。上述模块展示的数据信息，均更够为不同的精准用药基因检测项目提供精准用药知识数据支撑；为精准用药基因检测报告系统更准确地出具基因检测报告创造更有利的条件。

附图说明

图1为本发明提供的应用于精准用药的知识库系统的一较优实施例的架构图；

图2为图1所示的展示前端的架构图；

图3为图2所示的平台信息公示模块的架构图；

图4为图2所示的知识信息展示模块的架构图；

图5为图1所示的维护后台的架构图；

图6为图1所示的展示前端与检索模块的显示界面图；

图7为图1所示的检索模块的检索结果展示图；

图8为图1所示的任务展示模块的显示界面图；

图9为图5所示的维护后台的显示界面图。

本发明目的实现、功能特点及优点将结合实施例，参照附图做进一步说明。

具体实施方式

应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。

本发明提供一种应用于精准用药的知识库系统。

请结合参阅图1-5，为实现上述目的，本发明的一实施例中，应用于精准用药的知识库系统，包括展示前端和维护后台；

所述展示前端包括知识信息展示模块，所述知识信息展示模块包括基因模块、药物模块、药物基因对模块和临床指南模块；

其中，所述展示前端中各模块用于响应用户的键鼠操作，以展示相关的信息数据，所述维护后台用于为所述展示前端中的各模块录入所述信息数据；

所述基因模块用于展示预设的基因信息，并提供与所述基因信息相关的药物基因对信息以及来自预设地域的人群基因突变频率数据；

本实施例中，所述基因信息可以包含110多条基因，所述药物信息可以包括170多种药物，将一条基因或多条基因和一种药物或一类药物组配形成药物基因对信息(药物基因对项目)；因而，系统中必然包含很多种“药物基因对”项目内容。

例如：5-fu-dpyd、5-fu-msi、5-fu-mthfr、5-fu-tp、5-fu-tyms、阿德福韦酯-hbv-p区、阿芬太尼-cyp3a4、阿芬太尼-cyp3a5、阿立哌唑-cyp2d6、阿霉素-gatp1.gstm1、铂类-gstp1、利福平-nat2、华法林-cyp2c9.vkorc1、阿司匹林-cox1、氯吡格雷-cyp2c19、叶酸-mthfr等。

所述预设地域可以以省份为单位，例如，湖南省或北京市。

所述药物模块用于展示预设的药物信息，并提供与所述药物信息相关的药物基因对信息以及所述药物信息的所属科室和atc分类；

具体的，如上所述，所述药物信息可以包括170多种药物。

例如，药物：紫杉醇，其相关的药物基因对信息为：紫杉醇-gstp1.gstm1；所属科室为某内科；

atc编码：l01cd01；

药物iv类：紫杉生物碱类；

药物iii类：植物生物碱和其它天然药物；

药物ii类：抗肿瘤药；

药物i类：抗肿瘤药和免疫机能调节药。

所述药物基因对模块用于展示所述药物基因对信息以及与所述药物基因对信息相应的辅助信息；

所述药物基因对信息(药物基因对项目)包括药物部分和基因部分，同种药物匹配的基因不同则所得的项目不同，同种基因匹配的药物不同时所得的项目也不相同。

所述药物基因对项目信息包括5-fu-dpyd、5-fu-msi、5-fu-mthfr、5-fu-tp、5-fu-tyms、阿德福韦酯-hbv-p区、阿芬太尼-cyp3a4、阿芬太尼-cyp3a5、阿立哌唑-cyp2d6、阿霉素-gatp1.gstm1、铂类-gstp1、利福平-nat2、华法林-cyp2c9.vkorc1、阿司匹林-cox1、氯吡格雷-cyp2c19、叶酸-mthfr中的一种或多种。

本发明的项目中，多数药物基因对项目都是一种药物对应一个基因，例如上述5-fu-dpyd、5-fu-msi、5-fu-mthfr、利福平-nat2、阿司匹林-cox1、氯吡格雷-cyp2c19等等。也有一种药物对应多个基因的实例，例如，药物华法林和基因cyp2c9和基因vkorc1。还有一类药物对应一个基因的实例，例如，蒽环类药物和基因top2a(mrna)；或者是芳香族抗癫痫类药物和基因hla-b。

本发明中药物基因对项目示例：

项目1：代表第一个药物基因对，如：5-fu-msi，其中5-fu是药物5-fu(fluorouracil)。

项目2：代表第二个药物基因对，如：5-fu-dpyd。

项目3：代表第三个药物基因对，如：5-fu-tp。

项目4：代表第四个药物基因对，如：阿司匹林-cox1。

项目5：代表第五个药物基因对，如：伊立替康-ugt1a1。

项目6：代表第六个药物基因对，如：氯吡格雷-cyp2c19。

项目7：代表第七个药物基因对，如：舒芬太尼-cyp3a4。

具体的，所述辅助信息包括与药物基因对信息(药物基因对项目)相关的国内外指南，国内外药物标签，国内外临床试验，国内外专利，临床注释(基因)，临床注释(位点)，通路的信息；进一步的，所述药物基因对模块还用于提供上述信息的快速便捷检索的方式。

所述临床指南模块用于展示临床指南信息，以介绍基于基因型的临床建议。

具体的，所述临床指南信息是基于pgx药物剂量发布的指南，介绍了基于基因型的临床建议。

临床指南是由临床药物遗传学实施联盟、(cpic)，荷兰皇家药剂师协会成立的药物遗传学工作组(dpwg)，加拿大药物基因组学药品安全网(cpnds)，其他专业协会，中国专家共识基于pgx药物剂量发布的指南推荐，介绍了基于基因型的临床建议。

所述临床指南模块还用于提供可下载的指南pdf文件。

本发明提供的应用于精准用药的知识库系统中；所述基因模块用于展示预设的基因信息，并提供与所述基因信息相关的药物基因对信息以及来自预设地域的人群基因突变频率数据；所述药物模块用于展示预设的药物信息，并提供与所述药物信息相关的药物基因对信息以及所述药物信息的所属科室和分类；所述药物基因对模块用于展示所述药物基因对信息以及与所述药物基因对信息相应的辅助信息；所述临床指南模块用于展示临床指南信息，以介绍基于基因型的临床建议。上述模块展示的数据信息，均更够为不同的精准用药基因检测项目提供精准用药知识数据支撑；为精准用药基因检测报告系统更准确地出具基因检测报告创造更有利的条件。

所述知识信息展示模块还包括药物标签模块、临床注释模块、临床试验模块和专利模块；

其中，所述药物标签模块用于展示药物标签注释信息；所述药物标签注释信息提供了药物，基因注释的摘要，并使用“pgxlevel”标签解释每个标签中暗含的循证等级。

药物标签注释是由美国食品和药物管理局(fda)，欧洲药品管理局(ema)，瑞士医疗产品管理局(swiss)，日本医药品与医疗器械局(pmda)和加拿大卫生部(hcsc)，cfda批准的有关药物基因组学信息的标签。

进一步的，所述药物标签模块还用于提供可下载的药物标签pdf文件。

所述临床注释模块用于展示临床注释信息；

所述临床注释信息是基于数据库中的文献做支撑，提供药物-基因-单个基因位点/多个基因位点的信息，描述基因型/多个基因位点对药物，表型的影响。其中临床注释(位点)根据“证据等级”划分为4类等级，其中等级1为最高标准。

所述临床试验模块用于展示临床试验信息；

所述临床试验信息是由中国临床试验注册中心以及美国临床试验网站收录的有关基因多态性对药物，表型影响的试验数据，提供试验药物的作用、不良反应，或者是试验药物的吸收、分布、代谢和排泄等数据。

所述专利模块用于展示专利信息。

所述专利信息是由专利网站收录的与药物基因相关的国内外专利文献，提供并保护检测基因多态性的引物或方法等内容，用于个体化用药临床指导。可全面反映涉及药物基因科研及产业化领域的最新进展。

所述展示前端还包括平台信息公示模块，所述平台信息公示模块包括公告通知模块、最新事件模块、最新研究模块、知识库用户模块、下载模块和帮助模块；

其中，所述公告模块用于展示公告信息；

所述最新事件模块用于展示行业内新闻信息；

所述最新研究模块用于展示行业内前沿学术研究信息；

所述知识库用户模块用于展示所有用户的公开信息；

所述下载模块用于展示可供下载的数据，并提供下载服务；

所述帮助模块用于展示系统使用手册。

结合参阅图1、图6和图7，所述应用于精确用药的知识库系统还包括检索模块，所述检索模块用于根据输入的关键词，检索获取所述展示前端中的相关信息数据。

例如，输入关键词“氯吡格雷”，检索获取所述展示前端中“氯吡格雷”的临床指南、药物标签、临床试验、临床注释、专利、通路；

还能够获取“氯吡格雷”的药物基本信息：

药物中文名称:氯吡格雷；

药物英文名称:clopidogrel；

药物i：血液和造血器官；

药物ii类：抗血栓形成药；

药物iii类：抗血栓形成药；

药物vi类：非肝素类的血小板聚集抑制剂；

药物atc编码:b01ac04；

商标名：泰嘉，波立维。

所述检索模块还用于显示提示信息，以提供检索提示。

所述提示信息可以是：

热门:氯吡格雷cyp2c19氨氯地平氟西汀氯沙坦。

请再次参阅图6，所述展示前端与所述检索模块可以通过菜单栏的形式排列显示，具体的，所述平台信息公示模块、所述检索模块、所述知识信息展示模块依次呈现展示。

请结合参阅图5和图9，所述维护后台包括任务发布模块、任务接收和执行模块、多级校验模块和状态显示模块，其中，所述任务发布模块用于发布用于录入所述信息数据的任务，所述任务接收和执行模块用于接收所述任务，并依据所述任务的要求录入所述信息数据，所述多级校验模块用于建立多个角色用户，以便于多个所述角色用户校验所述信息数据的录入结果，所述状态显示模块用于显示每个所述角色用户的数据校验结果。

所述角色用户包括标注员、检查员、质检员和专家。

本实施例中，所述标注员为领取任务和完成任务的用户，检查员对标注员的任务完成情况进行质检，所述质检员对所述检查员的检查情况进行质检，所述专家对前述人员的工作进行质检，并对最终的任务完成结果进行确认。

进一步，所述状态显示模块不仅能够显示任一项任务中每个用户角色工作完成情况，当某角色用户完成对应的工作时，该角色用户对应的指示框点亮，从而能够清晰的获知该项任务的完成经度。

所述状态显示模块还能够显示该项任务的经度的完成情况。完成状态可以包括完成、检查员可领取、标注员可领取等。

所述维护后台还包括任务编辑模块，所述任务编辑模块用于对所述任务发布模块发布的所述任务进行编辑操作。

请结合参阅图3和图6；所述平台信息公示模块还包括任务大厅模块；所述任务大厅模块用于展示所述任务发布模块发布的所有的所述任务信息。

请参阅图8，所述展示前端还包括任务展示模块，所述任务展示模块依据预设的排列规则展示排列靠前的所述任务信息，以指引用户选择需要优先执行的所述任务。

本实施例中，所述管理员能够设置任务的优先级排列规则，便于指引用户选择需要优先执行的所述任务。

通过以上的实施方式的描述，本领域的技术人员可以清楚地了解到上述实施例方法可借助软件加必需的通用硬件平台的方式来实现，当然也可以通过硬件，但很多情况下前者是更佳的实施方式。基于这样的理解，本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分可以以软件产品的形式体现出来，该计算机软件产品存储在如上所述的一个计算机可读存储介质(如rom/ram、磁碟、光盘)中，包括若干指令用以使得一台终端设备进入本发明各个实施例所述的方法。

在本说明书的描述中，参考术语“一实施例”、“另一实施例”、“其他实施例”、或“第一实施例～第x实施例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中，对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施例或示例。而且，描述的具体特征、结构、材料、方法步骤或者特点可以在任何的一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。

需要说明的是，在本文中，术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含，从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者系统不仅包括那些要素，而且还包括没有明确列出的其他要素，或者是还包括为这种过程、方法、物品或者系统所固有的要素。在没有更多限制的情况下，由语句“包括一个……”限定的要素，并不排除在包括该要素的过程、方法、物品或者系统中还存在另外的相同要素。

上述本发明实施例序号仅仅为了描述，不代表实施例的优劣。

以上仅为本发明的优选实施例，并非因此限制本发明的专利范围，凡是利用本发明说明书及附图内容所作的等效结构或等效流程变换，或直接或间接运用在其他相关的技术领域，均同理包括在本发明的专利保护范围内。