医学审评的生成方法、装置、计算机设备和存储介质与流程

文档序号:30447951发布日期:2022-06-18 01:10阅读:108来源:国知局
医学审评的生成方法、装置、计算机设备和存储介质与流程

1.本说明书实施方式涉及药物警戒领域,具体涉及医学审评的生成方法、装置、计算机设备和存储介质。


背景技术:

2.临床研究个例安全性报告的医学审评对于药品的风险管理和公众的用药安全具有重要的作用。现有的医学审评报告主要是医学审评人员基于临床研究个例安全性报告,辅以查阅相关医学文献的方式进行人工撰写。但由于不同人员之间专业水平的差异,导致所撰写的医学审评参差不齐,质量无法得到保障,且在撰写过程中需要查阅大量医学文献,针对不同临床研究个例安全性报告的医学评审之间存在的公用知识,可能需要对同一文献进行多次检索,导致效率低下。


技术实现要素:

3.有鉴于此,本说明书多个实施方式致力于提供一种医学审评的生成方法、装置、计算机设备和存储介质,以提高医学审评报告的标准化程度和医学审评人员的工作效率。
4.本说明书实施方式提出了一种医学审评的生成方法,应用于第一终端,包括:接收第二终端发送的针对目标药物的医学报告文本;抽取所述医学报告文本中的关键信息;其中,所述关键信息包括表述药物不良反应事件的主要关键信息和表述导致药物不良反应事件原因的次要关键信息;其中,所述次要关键信息对应有不同的评价维度;基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果;其中,所述关联性分析结果包括存在关联性或不存在关联性;基于所述关联性分析结果和预设的相关性评价规则生成所述目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果;根据所述相关性评价结果生成医学审评报告。
5.本说明书实施方式提出了一种医学审评的生成装置,应用于第一终端,包括:医学报告文本接收模块,用于接收第二终端发送的针对目标药物的医学报告文本;关键信息获取模块,用于抽取所述医学报告文本中的关键信息;其中,所述关键信息包括表述药物不良反应事件的主要关键信息和表述导致药物不良反应事件原因的次要关键信息;其中,所述次要关键信息对应有不同的评价维度;关联分析模块,用于基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果;其中,所述关联性分析结果包括存在关联性或不存在关联性;相关性评价模块,用于基于所述关联性分析结果和预设的相关性评价规则生成所述目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果;医学审评报告生成模块,用于根据所述相关性评价结果生成医学审评报告。
6.本说明书实施方式提供了一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现所述实施方式所述的方法。
7.本说明书实施方式提出了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现所述实施方式所述的方法。
8.本说明书实施方式通过从临床研究个例安全性报告提取用于填充模板以及相关性分析所需的关键信息,并结合预设的医学审评知识库和相关性评价规则生成最后的医学审评报告,实现医学审评报告的自动化填写,从而提升了医学审评报告的标准化程度。通过关键词搜索的方法确定药物不良反应事件的相关文献,将相关文献中药物不良反应事件对应的药物不良反应原因添加到预先设置的医学审评知识库中,从而提升医学审评报告的质量和可解释性,并且能够避免查找重复的文献资料数据,从而提升了医学审评人员的工作效率。
附图说明
9.图1所示为一实施方式提供的一个场景示例中不同端交互的示意图。
10.图2所示为一实施方式提供的一个场景示例中不同端交互的示意图。
11.图3所示为一实施方式提供的医学审评报告生成方法的流程示意图。
12.图4所示为一实施方式提供的相关性评价规则示意图。
13.图5所示为一实施方式提供的医学审评报告生成装置示意图。
14.图6所示为一实施方式提供的计算机设备示意图。
具体实施方式
15.为了使本技术领域的人员更好的理解本说明书方案,下面将结合本说明书实施方式中的附图,对本说明书实施方式中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施方式仅是本说明书一部分实施方式,而不是全部的实施方式。基于本说明书中的实施方式,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施方式,都属于本说明书保护的范围。
16.请参阅图1和图2。本说明书提供一个医学审评报告生成系统的场景示例,所述医学审评报告生成系统可以包括客户端和服务器。用户可能是医疗领域的医学审评人员,需要将临床研究个例安全性报告中的信息生成医学审评报告。
17.医学审评人员首先接受从第二终端发送给第一终端的医学审评报告的临床研究个例安全性报告并向第一终端输入医学审评报告模板。其中,医学审评模板中包括了多个槽位,每个槽位可以包含着需要填写信息的属性标签。接着,客户端将临床研究个例安全性报告发送给服务器并请求返回医学审评报告。服务器在接收到临床研究个例安全性报告后,首先根据医学审评模板槽位中包括的属性信息从临床研究个例安全性报告中抽取包括表述药物不良反应事件的主要关键信息和表述导致药物不良反应事件原因的次要关键信息的关键信息。
18.当确定了关键信息之后,服务器便可以将关键信息中的药物不良反应描述作为主要关键信息和导致药物不良反应原因作为次要关键信息。接着,服务器便会在医学报告和医学审评知识库中确定主要关键信息和次要关键信息之间相关或者不相关。其中,医学审评知识库中包括了目标药物、目标药物的不良反应和目标药物不良反应的原因。在利用医学审评知识库确定主要关键信息与次要关键信息的关联性是,服务器可以将次要关键信息
和不良反应原因输入到相似度计算模型中计算次要关键信息和不良反应原因的相似度。接着,服务器会将相似度中最大值大于或等于预设阈值的不良反应原因对应的次要关键信息与主要关键信息的关联分析结果设置为相关。并且,服务器可以将相似度中最大值小于预设阈值的主要关键信息与次要关键信息的关联分析结果设置为不相关。
19.在获取到不同维度的主要关键信息与次要关键信息的关联分析结果后,服务器可以将关联分析结果与预设的相关性评价中相对应的相关程度数据作为目标药物与药物不良反应之间的相关性评价结果。随后,服务器便可以依照关键信息对应的属性标签将关键信息、主要关键信息与次要关键信息的关联分析结果和相关性评价结果填入对应的事件概述模板、相关性评价模板和评价结论模板得到药物不良反应事件概述报告、相关性评价报告和评价结论报告,从而生成包括药物不良反应事件概述报告、相关性评价报告和评价结论报告的医学审评报告。最后,服务器便会将医学审评报告返回给客户端。客户端在接收到医学审评报告后通过显示器将医学审评报告呈现给医学审评人员。当然,在客户端中安装了医学审评报告抽取系统以及下载了对应的医学审评知识库的情况下,可以直接在客户端中生成医学审评报告并通过显示器将医学审评报告呈现给医学审评人员。医学审评人员在对自动生成的医学审评报告进行校对之后发送给目标药物的申办方作为申请药物上市的材料。
20.以上所述仅为本说明书提供的一个场景示例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换等,均应包含在本发明的保护范围之内。
21.本说明书实施方式提供一种医学审评报告生成系统。所述医学审评报告生成系统可以报告客户端和服务器。所述客户端可以是具有网络访问能力的电子设备。具体的,例如,客户端可以是台式电脑、平板电脑、笔记本电脑、智能手机、数字助理、智能可穿戴设备、导购终端、电视机、智能音箱、麦克风等。其中,智能可穿戴设备包括但不限于智能手环、智能手表、智能眼镜、智能头盔、智能项链等。或者,客户端也可以为能够运行于所述电子设备中的软件。服务器可以是具有一定运算处理能力的电子设备。其可以具有网络通信模块、处理器和存储器等。当然,所述服务器也可以是指运行于所述电子设备中的软体。所述服务器还可以为分布式服务器,可以是具有多个处理器、存储器、网络通信模块等协同运作的系统。或者,服务器还可以为若干服务器形成的服务器集群。或者,随着科学技术的发展,服务器还可以是能够实现说明书实施方式相应功能的新的技术手段。例如,可以是基于量子计算实现的新形态的“服务器”。
22.请参阅图3。本说明书实施方式提供一种医学审评报告生成方法,应用于第一终端,所述方法包括以下步骤。
23.步骤s110:接收第二终端发送的针对目标药物的医学报告文本。
24.在一些实施例中,为了保证医学报告文本的安全性,针对目标药物的医学报告文本是由在研究机构进行所述目标药物临床研究的医务工作者发送给医学审评人员。因此,医学审评人员在撰写医学审评报告前需要获取第二终端发送的医学报告文本。
25.所述第一终端为医学审评人员所使用的终端设备。其中,所述第一终端可以是台式电脑、平板电脑、笔记本电脑、智能手机、数字助理、智能可穿戴设备等,用于接收第二终端发送的针对目标药物的医学报告文本以及对医学报告文本进行处理并生成医学审评报
告。其中,医学审评人员可以是负责所述目标药物的项目经理、药物警戒专员、药物警戒医学专员/经理/总监等。
26.所述第二终端为临床试验中的医学工作者所使用的终端设备,可以用于将参与目标药物试验的包括诊断过程、治疗过程、治疗结果的受试者安全性报告发送给第一终端。其中,所述第二终端可以是台式电脑、平板电脑、笔记本电脑、智能手机、数字助理、智能可穿戴设备等。
27.步骤s120:抽取所述医学报告文本中的关键信息;其中,所述关键信息包括表述药物不良反应事件的主要关键信息和表述导致药物不良反应事件原因的次要关键信息;其中,所述次要关键信息对应有不同的评价维度。
28.医学报告文本中包括了医学类型的数据和非医学类型的数据,且种类繁多,句子冗长。如果直接将医学报告文本中的所有数据都与医学审评模板槽位所需要填写的内容进行匹配的话,计算量较大,需要耗费大量的时间。因此,可以先确定医学报告文本中的关键信息,再将关键信息与医学审评模板槽位所需要填写的内容进行匹配。
29.所述医学报告文本为临床试验领域的研究个例安全性报告。具体的,例如,在一次药物临床研究事件中,所述研究个例安全性报告中可以包括患者的诊断过程、患者的治疗过程和患者的治疗结果。当然,研究个例安全性报告还可以包括患者的既往病史、并发症等相关信息。
30.所述关键信息包括了医学审评模板中所需要填写的信息。在一次关键信息抽取过程中,医学审评模板中需要填写的信息包括患者的诊断信息、患者的治疗过程信息、患者出现的不良反应事件描述等,则需要在医学报告文本中抽取对应的信息作为关键信息,并且将关键信息中表述药物不良反应事件的关键信息作为主要关键信息,表述药物不良反应事件原因的关键信息作为次要关键信息。具体的,例如,在医学报告文本中抽取到的关键信息包括:乳房恶性肿瘤、恶性胸腔积液、肺激发恶性肿瘤、吡罗西尼、恶心、呕吐、腹泻,那么就会将恶心、呕吐、腹泻作为主要关键信息,将乳房恶性肿瘤、恶性胸腔积液、肺激发恶性肿瘤作为次要关键信息。
31.所述主要关键信息为药物不良反应事件描述。具体的,例如,在医学报告文本中包括了“患者入院诊断为乳房恶性肿瘤并伴随有恶性胸腔积液,用吡罗西尼进行治疗后出现呕吐、腹泻症状”,那么这句话中的主要关键信息为“呕吐”、“腹泻”。
32.所述次要关键信息为导致药物不良反应的原因。具体的,例如,在医学报告文本中包括了“患者入院诊断为乳房恶性肿瘤并伴随有恶性胸腔积液,用吡罗西尼进行治疗后出现呕吐、腹泻症状”,那么这句话中的次要关键信息为“恶性胸腔积液”、“吡罗西尼”。
33.所述评价维度用于确定药物与药物不良反应事件之间是否存在关联性。具体的,例如,在合并用药与不良反应的关联性维度上,主要关键信息为“腹泻”,次要关键信息为“阿司匹林”、“青霉素”,经分析得到“腹泻”与阿司匹林存在关联性,与“青霉素”不存在关联性,那么在合并用药与不良反应的关联性维度上合并用药与不良反应的关联性为存在关联性。
34.所述抽取医学报告文本中的关键信息的方法可以是对医学报告文本先进行分词处理,得到医学报告文本的分词结果以及对应的词性。根据词性以及医学审评模板中所需要填写的内容抽取医学报告文本的分词结果作为关键信息,且每个关键信息都包括了医学
报告文本所需要填写的内容对应的属性标签。当然,也可以按照医学审评模板所需要填写内容的顺序从医学报告文本中抽取相应的内容填入医学审评模板的槽位中。
35.步骤s130:基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果;其中,所述关联性分析结果包括存在关联性或不存在关联性。
36.为了得到目标药物与药物不良反应之间的相关性分析结果,需要对药物不良反应事件和导致药物不良反应事件的原因之间的关联性进行分析。因此,可以对主要关键信息与次要关键信息之间进行关联分析。
37.所述得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果可以结合主要关键信息和次要关键信息在医学审评报告中的上下文确定不同评价维度上主要关键信息和次要关键信息的关联分析结果。当然,还可以将主要关键信息和次要关键信息在预设的医学审评知识库中存在着对应关系的主要关键信息与次要关键信息之间的关联分析结果设置为存在关联性。具体的,例如,在医学报告文本中包括了“受试者入组当天2021-03-16开始规律服用目标药物吡罗西尼480mg bid至今,服用目标药物期间多次出现恶心、呕吐、腹泻情况,予以对症治疗处理后恢复。”中末次用药时间与药物不良反应之间的关联分析结果为存在关联性。再例如,在医学报告文本中“住院期后给予注射用奥美拉唑钠、复方氨基酸(18aa)注射液对症支持治疗”。在医学审评知识库中搜索“恶心”、“呕吐”、“腹泻”等不良反应事件报告对应的不良反应事件原因中“奥美拉唑钠”是“呕吐”这个不良反应事件原因;“复方氨基酸(18aa)注射液”不是这三个不良反应事件的原因。那么,“奥美拉唑钠”与不良反应事件之间的关联分析结果为相关,“复方氨基酸(18aa)注射液”与不良反应事件之间的关联分析结果为不相关。
38.步骤s140:基于所述关联性分析结果和预设的相关性评价规则生成所述目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果。
39.在医学审评报告中需要生成目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价。因此,可以在预设的相关性评价规则与不同维度中关联分析结果相同的情况下,将相关性评价中对应的相关性程度数据作为目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果。
40.请参阅图4。所述相关性评价规则是为确定目标药物与药物不良反应事件之间的相关程度。具体的,例如,在相关性评价规则中在末次用药时间与药物不良反应事件相关、不良反应事件是目标药物已知的不良反应事件、停止服用研究用药以后未出现该不良反应事件、再次服用该药以后又出现该不良反应事件的情况下,目标药物与药物不良反应事件的相关性评价结果为肯定相关。
41.所述相关性评价结果用于评价目标药物与药物不良反应事件的相关程度。具体的,例如,在不同维度的主要关键信息与次要关键信息之间的关联分析结果中,末次用药时间与药物不良反应事件相关、不良反应事件是目标药物已知的不良反应事件、停止服用研究用药以后未出现该不良反应事件、再次服用该药以后又出现该不良反应事件,那么根据上述相关性评价规则中,目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果为肯定相关。
42.步骤s150:根据所述相关性评价结果生成医学审评报告。
43.医学审评报告中需要确定目标药物与药物不良反应事件之间的相关性。因此可以
基于医学审评模板槽位中对应的属性将关键信息和相关性评价模板填入对应的医学审评模板中评价结论模板的槽位中,从而得到包括评价结论报告的医学审评报告。
44.在一些实施方式中,抽取所述医学报告文本中的关键信息的步骤,可以包括:获取预设的医学审评模板;其中,所述医学审评模板包括多个槽位;其中,所述槽位中包括了需要填写的信息的属性;在医学报告文本中抽取所述属性对应的信息作为关键信息。
45.正确的抽取医学报告文本中的关键信息一方面可以缩短计算机的运行时间,从而提高效率,另一方面可以提升将关键信息填入对应的医学审评模板槽位中的准确性。因此,可以根据医学审评模板的槽位对应的属性采用命名实体识别和/或短文本分类的方法在医学报告文本中抽取关键信息。
46.所述命名实体识别为根据医学审评模板槽位对应的属性在医学报告文本中搜索所述属性的信息。具体的,例如,医学审评模板中包括“该例【年龄】岁,【性别】性,【民族】受试者。”,那么就可以根据“年龄”、“性别”、“民族”这三个属性在医学报告文本中搜索所述属性对应的信息分别为“54”、“女”、“汉族”。
47.在一些实施方式中,抽取所述医学报告文本中的关键信息的步骤,可以包括:对所述医学报告文本进行分词处理得到医学报告文本的分词结果和所述分词结果的词性;根据所述词性在所述分词结果中抽取医学审评模板所需要填写的信息作为关键信息。
48.在一些情况下,可以先对医学报告文本进行分词处理,从而获取到分词结果和词性,再根据词性和医学审评模板需要填写的内容从分词结果中进行抽取,可以在一定程度上提升关键信息抽取的准确性。
49.所述分词处理的方法可以是将医学报告文本在医学词典中进行最大匹配,得到医学分词结果及对应的词性。随后,可以将医学报告文本中在医学词典中未匹配到的内容输入到通用的分词工具中得到非医学词语的分词结果及对应的词性。例如,可以将医学报告文本中在医学词典中未匹配到的内容输入到结巴分词工具中得到非医学词语的分词结果及对应的词性信息。最后,可以将医学分词结果及对应的词性和非医学词语分词结果及对应的词性作为医学报告文本经过分词处理后的结果。
50.所述分词结果的词性为预先在医学词典或者通用分词工具中定义的词性。具体的,例如“呕吐”在医学词典中对应的词性为“症状”,则将“症状”作为“呕吐”这个词的词性。再例如,“乳房恶性肿瘤”在医学词典中对应的词性为“疾病名称”,则将“疾病名称”作为“乳房恶性肿瘤的词性”。再例如,“2019-10-02”这个非医学词语利用结巴分词工具预测的结果为“日期”,则将“日期”作为“2019-10-02”的词性。
51.所述医学审评模板包括了用于填写关键信息的槽位信息,且每个槽位都具有需要填写关键信息的属性标签。具体的,例如,医学审评模板中具有“受试者不良事件【sae名称】距离末次用药日期【末次用药日期】【存在/不存在】合理的时间相关性”这句话。其中,“【】”为医学审评模板的槽位,“sae名称”、“末次用药日期”、“存在/不存在”为每个槽位需要填写关键信息对应的属性信息。
52.在一些实施方式中,抽取所述医学报告文本中的关键信息的步骤,还可以包括:为所述关键信息添加属性标签;其中,所述属性标签与医学审评模板槽位中需要填写信息的属性存在对应关系;相应的,根据所述相关性评价结果生成医学审评报告的步骤,可以包括:将所述关键信息和所述相关性评价结果依照所述属性标签填入相关性评价模板,得到
评价结论报告;根据所述评价结论报告生成医学审评报告。
53.在一些情况下,医学报告文本中的不同关键信息对应着同一个词性,而在将关键信息填入对应的医学审评模板槽位中的时候,还需要根据每个槽位的属性填入相应的关键信息。因此,可以通过给关键信息添加对应的属性标签,将属性标签与医学审评模板槽位中定义的属性标签相同的关键信息填入对饮的医学审评模板槽位中。
54.所述为所述关键信息添加属性标签的方法可以根据医学报告文本中的上下文进行填写。具体的,例如,医学报告文本中包括“受试者于2021-05-29再次出现恶心2级、呕吐2级,于2021-05-29至今每日口服盐酸托烷司琼片5mg”这句话,则“口服盐酸托烷司琼片”这个关键信息对应属性标签为“合并用药”,“恶心”、“呕吐”这两个关键信息对应的属性标签为“药物不良反应”。
55.在一些实施方式中,在抽取针对目标药物的医学报告文本中的关键信息的步骤之后,还可以包括:获取所述医学报告文本的临床研究过程信息;其中,所述临床研究过程信息至少包括以下之一:患者的诊断过程信息、患者的治疗过程信息、患者的治疗效果分析过程信息;将与所述临床研究过程信息对应的关键信息填入事件概述模板得到药物不良反应事件概述报告;相应的,根据所述相关性评价结果生成医学审评报告的步骤,可以包括:根据所述药物不良反应事件概述报告和所述评价结论报告生成医学审评报告。
56.在一些情况下,医学审评报告模板中需要填写药物临床试验的整个发展过程信息作为药物不良反应事件概要。因此,可以通过获取医学报告文本的临床研究过程信息,以便填入对应的事件概要模板,从而得到药物不良反应事件概要。
57.所述获取所述医学报告文本的临床研究过程信息为在医学报告文本中获取与患者的诊断过程信息、患者的治疗过程信息和患者的治疗效果等信息。具体的,例如,医学报告文本中包括了“受试者jiya,女,52岁,汉族,左乳癌术后2年余,多发转移1年余,入院诊断:恶性肿瘤靶向治疗、乳房恶性肿瘤、淋巴结继发恶性肿瘤”那么,可以根据医学报告文本中的“入院诊断”相关内容作为患者的诊断过程。
58.在一些实施方式中,医学审评报告的生成方法还可以包括:将主要关键信息和次要关键信息以及主要关键信息与次要关键信息之间的关联分析结果填入关联分析模板得到关联分析报告;相应的,根据所述相关性评价结果生成医学审评报告的步骤,可以包括:根据所述不良反应事件概述报告、所述关联分析报告和所述评价结论报告生成医学审评报告。
59.在一些情况下,还需要对医学审评报告中药物不良反应与药物不良反应原因进行关联性分析。因此,可以根据相关性评价的结果和医学审评模板中的评价结论模板确定目标药物与药物不良反应之间的相关性。
60.所述关联分析报告中包括了多个维度的关联性分析结果。具体的,例如,在关联分析模板中包括了末次研究用药时间与不良反应事件的关联分析、不良反应事件与研究用药已知的不良反应事件的关联分析和患者停止使用研究用药后与不良反应事件的关联分析这三个维度的关联分析报告模板。在确定了不良反应事件与研究用药已知的不良反应事件的关联分析和患者停止使用研究用药后与不良反应事件的关联分析均存在关联关系之后,关联分析报告可以是:末次研究用药时间与不良反应事件之间存在合理的时间相关性;该不良反应事件是已知的不良反应事件;患者停止使用研究用药后未出现不良反应事件。
61.所述基于所述相关性评价结果和评价结论模板生成评价结果报告的方法可以是根据不同的评价维度的关联性分析结果确定的。具体的,例如,药物不良反应事件与末次用药时间相关,则目标药物与药物不良反应事件相关。再例如,在药物不良反应事件与末次用药时间、药物不良反应事件不是研究用药已知的不良反应事件、停止使用研究用药以后该不良反应事件仍然存在、再次使用所述研究用药以后不良反应事件消失的情况下,药物不良反应事件与合并用药相关,则目标药物与药物不良反应事件无关。
62.在一些实施方式中,所述评价维度至少包括以下之一:末次研究用药时间与不良反应事件的关联分析;或者,不良反应事件与研究用药已知的不良反应事件的关联分析;或者,患者停止使用研究用药后与不良反应事件的关联分析;或者,患者停止使用研究用药后再次使用研究用药与不良反应事件的关联分析;或者,患者在使用研究用药期间使用其它药物与不良反应事件的关联分析;或者,与目标药物具有相同药理毒性的药物与不良反应事件的关联分析;或者,患者既往/合并病史与不良反应事件的关联分析;或者,患者所患疾病的并发症与不良反应事件的关联分析。
63.在对药物不良反应事件与药物不良反应事件原因进行关联分析的时候,可以基于不同的评价维度进行分析。因此,可以通过多种不同的评价维度上的相关性来判断目标药物是否是导致该药物不良反应事件的原因。具体的,例如,通过对患者末次用药时间与不良反应事件这个维度的关联性进行分析,可以得到目标药物与药物不良反应之间的相关性评价。
64.在一些实施方式中,所述关联分析的维度包括多个,其特征在于,基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果的步骤,可以包括:获取不同评价维度上主要关键信息与次要关键信息的关联性分析结果;将所述关联性分析结果和预设的相关性评价规则中对应的相关程度数据作为目标药物与药物不良反应事件的相关性评价结果;其中,所述相关性评价规则包括不同评价维度上的关联性分析结果及其对应的相关程度数据。
65.医学审评报告模板中需要填写目标药物与药物不良反应事件之间的相关性分析的结果。由于不同的目标药物对应着不同的相关性评价规则,因此,在对目标药物与药物不良反应事件之间的相关性进行评价之前,还需要预先配置相关性评价规则。然后,可以根据相关性评价规则和主要关键信息和次要关键信息的关联性分析结果,生成目标药物与药物不良反应之间的相关性评价结果。
66.所述不同评价维度上主要关键与次要关键信息的关联性分析可以包括:末次研究用药时间与不良反应事件的关联分析、不良反应事件与研究用药已知的不良反应事件的关联分析、患者停止使用研究用药后与不良反应事件的关联分析、患者停止使用研究用药后再次使用研究用药与不良反应事件的关联分析、患者在使用研究用药期间使用其它药物与不良反应事件的关联分析、与目标药物具有相同药理毒性的药物与不良反应事件的关联分析、患者既往/合并病史与不良反应事件的关联分析和患者所患疾病的并发症与不良反应事件的关联分析。具体的,例如,患者末次用药时间与不良反应事件发生的时间为35天,大于设定的日期范围30天,则末次研究用药时间与不良反应事件无合理的时间相关性。
67.所述生成目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果的方法可以在基
于不同维度上主要关键信息与次要关键信息的关联性分析结果与相关性评价规则中定义的不同维度上的相关性都一样的情况下,则可将相关性评价规则中对应的相关程度数据作为目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果。当然,也可以不同维度上主要关键信息与次要关键信息的关联性分析结果中相关的累计之和以及预设的阈值范围确定主要关键信息与次要关键信息的相关性评价结果。
68.在一些实施方式中,基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果的步骤,可以包括:根据主要关键信息和次要关键信息在医学报告文本中的上下文确定主要关键信息和次要关键信息的关联性分析结果。
69.在一些情况下,主要关键信息与次要关键信息之间的关联性分析结果可以通过对医学报告文本进行分析得到。因此,可以通过分析主要关键信息与次要关键信息在医学报告文本中的上下文得出。具体的,例如,在医学报告文本中包括:“受试者入组当天2021-03-16开始规律服用目标药物吡罗西尼480mg bid至今,服用目标药物期间多次出现恶心、呕吐、腹泻情况,予以对症治疗处理后恢复。受试者于2021-05-29再次出现恶心2级、呕吐2级,于2021-05-29至今每日口服盐酸托烷司琼片5mg,于2021-06-01至今每日口服奥美拉唑肠溶胶囊20mg,症状无缓解。”说明药物不良反应时间与再激发之间的关联性分析结果为相关。
70.在一些实施方式中,基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果的步骤,还可以包括:在预设的医学审评知识库中确定所述主要关键信息对应的药物不良反应事件描述,作为所述目标药物不良反应事件描述;其中,所述医学审评知识库中包括目标药物、目标药物的不良反应事件和目标药物不良反应事件的原因;计算在所述医学审评知识库中所述目标药物不良反应事件描述对应的药物不良反应事件原因与所述次要关键信息的相似度;在所述相似度中最大值大于或等于预设阈值的情况下,将所述次要关键信息与所述主要关键信息之间的关联分析结果设置为存在关联关系。在所述相似度中最大值小于预设阈值的情况下,将所述次要关键信息与所述主要关键信息之间的关联分析结果设置为不存在关联关系。
71.在一些实施方式中,主要关键信息与次要关键信息之间的关联性分析结果并不能通过对医学报告文本的分析得出。因此需要通过借助医学审评知识库中进行关联性分析。当然,由于在医学报告文本中的主要关键信息与次要关键信息可能存在着描述稍有差异,但表达的意思相同。因此,可以将次要关键信息与医学审评知识库中不良反应原因的相似度大于预设的阈值就可以将主要关键信息与次要关键信息的关联性设置为相关。
72.所述医学审评知识库中包括了目标药物、药物不良反应描述和药物不良反应原因。具体的,例如目标药物“吡罗西尼”有与之对应的不良反应描述;不良反应描述也有与之对应的不良反应原因。具体的,例如,在医学报告文本中包括了“受试者入组当天2021-03-16开始规律服用目标药物吡罗西尼480mg bid至今,服用目标药物期间多次出现恶心、呕吐、腹泻情况,住院期后给予注射用奥美拉唑钠、复方氨基酸(18aa)注射液对症支持治疗”。那么,在医学审评知识图谱中确定主要关键信息和次要关键信息的关联性的方法可以是将“恶心”、“呕吐”、“腹泻”作为主要关键信息,“奥美拉唑钠”、“复方氨基酸(18aa)注射液”作
为次要关键信息,通过计算“奥美拉唑钠”与医学审评知识库中药物不良反应原因的最大相似度为100%,大于预设的阈值80%,则将“奥美拉唑钠”作为合并用药与不良反应的关联性为相关。
73.在一些情况下,主要关键信息和次要关键信息之间的关联性为不相关。因此,可以将次要关键信息与医学审评知识库中不良反应相似度最大值小于预设阈值的次要关键信息与主要关键信息之间的关联分析结果设置为不相关。具体的,例如,在医学报告文本中包括了“受试者入组当天2021-03-16开始规律服用目标药物吡罗西尼480mg bid至今,服用目标药物期间多次出现恶心、呕吐、腹泻情况,住院期后给予注射用奥美拉唑钠、复方氨基酸(18aa)注射液对症支持治疗”。那么,在医学审评知识图谱中确定主要关键信息和次要关键信息的关联性的方法可以是将“恶心”、“呕吐”、“腹泻”作为主要关键信息,“奥美拉唑钠”、“复方氨基酸(18aa)注射液”作为次要关键信息,通过计算“复方氨基酸(18aa)注射液”与医学审评知识库中药物不良反应原因的最大相似度为50%,小于预设的阈值80%,则将“复方氨基酸(18aa)注射液”作为合并用药与不良反应的关联性为不相关。
74.在一些实施方式中,所述对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果还可以包括:构建包括目标药物、目标药物的不良反应事件和目标药物不良反应事件的原因的医学审评知识库。当然,也可以根据目标药物、目标药物的不良反应事件和药物不良反应事件的原因构建医学审评知识图谱。
75.通过构建医学审评知识库可以弥补在医学报告文本中只陈述事实,但并未分析药物不良反应事件与药物不良反应事件原因之间的关联性的不足。且由于医学领域的工作者在撰写医学报告文本时,由于自身知识水平有限,不能够完全确定药物不良反应事件与描述的药物不良反应事件原因之间的相关性。通过构建医学审评知识库,将目标药物、目标药物的不良反应事件描述、目标药物的不良反应事件原因都纳入医学审评知识库中,便于提高医学审评报告中主要关键信息与次要关键信息之间的关联性评价的准确性,并且能够进一步的影响目标药物与目标药物不良反应的相关性评价结果。
76.在一些实施方式中,所述对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果还可以包括:在医学文献库中搜索与药物不良反应事件的相关文献;在所述相关文献中确定所述药物不良反应事件和所述药物不良反应事件对应的原因;将所述药物不良反应事件对应的原因存储到与所述药物不良反应事件对应的医学审评知识库中作为所述药物不良反应事件的原因。
77.随着药物临床试验的进行,药物不良反应事件报告数量可能增多,很多目标药物未知的不良反应事件可能变成了已知的不良反应事件。因此,可以通过文献查找的方法,将目标药物出现的不良反应更新到医学审评知识库中,从而进一步提升医学审评报告中主要关键信息与次要关键信息之间的关联性评价的准确性。
78.请参阅图5。在一些实施方式中可以提供一种医学审评报告生成装置,可以包括:医学报告文本接收模块、关键信息获取模块、关联分析模块、相关性评价模块和医学审评报告生成模块。
79.关键信息获取模块,用于抽取所述医学报告文本中的关键信息;其中,所述关键信息包括表述药物不良反应事件的主要关键信息和表述导致药物不良反应事件原因的次要
关键信息;其中,所述次要关键信息对应有不同的评价维度;
80.关联分析模块,用于基于所述评价维度对所述主要关键信息和所述次要关键信息进行关联分析得到不同评价维度上所述主要关键信息与所述次要关键信息之间的关联性分析结果;其中,所述关联性分析结果包括存在关联性或不存在关联性;
81.相关性评价模块,用于基于所述关联性分析结果和预设的相关性评价规则生成所述目标药物与药物不良反应事件之间的相关性评价结果;
82.医学审评报告生成模块,用于根据所述相关性评价结果生成医学审评报告。
83.关于医学审评报告生成装置实现的具体功能和效果,可以参照本说明书其他实施方式对照解释,在此不再赘述。所述医学审评报告生成装置中的各个模块可全部或部分通过软件、硬件及其组合来实现。所述各模块可以以硬件形式内嵌于或独立于计算机设备中的处理器中,也可以以软件形式存储于计算机设备中的存储器中,以便于处理器调用执行以上各个模块对应的操作。
84.请参阅图6,在一些实施方式中可以提供一种计算机设备,包括存储器和处理器,存储器中存储有计算机程序,该处理器执行计算机程序时实现所述实施方式中的方法步骤。
85.在一些实施方式中可以提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,计算机程序被处理器执行时实现所述实施方式中的方法步骤。
86.本领域普通技术人员可以理解实现所述实施方式方法中的全部或部分流程,是可以通过计算机程序来指令相关的硬件来完成,所述的计算机程序可存储于一非易失性计算机可读取存储介质中,该计算机程序在执行时,可包括如所述各方法的实施方式的流程。其中,本说明书所提供的各实施方式中所使用的对存储器、存储、数据库或其它介质的任何引用,均可包括非易失性和易失性存储器中的至少一种。非易失性存储器可包括只读存储器(read-only memory,rom)、磁带、软盘、闪存或光存储器等。易失性存储器可包括随机存取存储器(random access memory,ram)或外部高速缓冲存储器。作为说明而非局限,ram可以是多种形式,比如静态随机存取存储器(static random access memory,sram)或动态随机存取存储器(dynamic random access memory,dram)等。
87.应理解可由计算机程序指令实现流程图和/或方框图中的每一流程和/或方框、以及流程图和/或方框图中的流程和/或方框的结合。可提供这些计算机程序指令到通用计算机、专用计算机、嵌入式处理机或其他可编程数据处理设备的处理器以产生一个机器,使得通过计算机或其他可编程数据处理设备的处理器执行的指令产生用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的装置。
88.本说明书多个实施方式之间,采用递进的方式进行描述。不同的实施方式着重于描述相较于其它实施方式不相同的部分。所属领域技术人员在阅读本说明书之后,可以获知本说明书中的多个实施方式,以及实施方式揭示的多个技术特征,可以进行更多种的组合,为使描述简洁,未对所述实施方式中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述。然而,只要这些技术特征的组合不存在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
89.还需要说明的是,术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、商品或者设备不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其他要素,或者是还包括为这种过程、方法、商品或者设备所固有的要
素。在没有更多限制的情况下,由语句“包括一个
……”
限定的要素,并不排除在包括所述要素的过程、方法、商品或者设备中还存在另外的相同要素。
90.本说明书中的多个实施方式本身均着重于强调与其他实施方式不同的部分,各实施方式之间可以相互对照解释。所属领域技术人员基于一般的技术常识对本说明书中的多个实施方式的任意组合均涵盖于本说明书的揭示范围内。
91.以上所述仅为本案的实施方式而已,并不用以限制本案的权利要求保护范围。对于本领域技术人员来说,本案可以有各种更改和变化。凡在本案的精神和原理之内所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本案的权利要求范围之内。
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