本发明属于生物,具体地,涉及一种肝细胞癌预后评估的标志物、模型及应用。
背景技术:
1、原发性肝癌是全球第六大常见肿瘤和第三大肿瘤相关致死原因。肝细胞癌(hcc)是原发性肝癌最常见的病理类型。早期发现的局部肝癌有效的治疗方法包括手术切除、射频消融(rfa)和经动脉化疗栓塞。多种酪氨酸激酶抑制剂(mtkis)药物索拉菲尼和伦伐替尼已被批准用于不能切除的肝细胞癌患者的一线全身治疗,然而只有30%的肝细胞癌患者受益,并可能伴随严重的副作用。免疫检查点抑制剂的出现为hcc的治疗开辟了新的途径,但由于缺乏理想的预测指标,在治疗方面缺乏个体化的药物指导。
2、n-糖基化修饰是真核生物中最丰富的膜结合蛋白翻译后修饰之一,由stt3a或stt3b亚基催化组装的低聚糖转移酶(ost)复合物在内质网中启动,于高尔基体内完成。n-糖基化发生在胞膜蛋白或分泌蛋白,包括免疫检查点蛋白、粘附蛋白、细胞外基质分子、细胞表面表皮生长因子受体。研究表明,糖基化修饰在肿瘤增殖、侵袭、转移、血管生成和免疫调节等病理生理过程中起着至关重要的作用,但未见其深入研究报道。
3、因此,迫切需要一种特异性的预后预测指标,预测hcc患者的预后,进而实现肝细胞癌的精准诊疗。
技术实现思路
1、本发明的目的是提供一种肝细胞癌预后评估的标志物,该标志物包括n-糖基化修饰相关基因,n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165。该标志物能够筛选总体生存期较短、预后较不理想的肝细胞癌患者,以提高治疗效果,促进个体化精准诊疗。
2、根据本发明的一个方面,提供一种肝细胞癌预后评估的标志物,标志物包括n-糖基化修饰相关基因,n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165。本发明所提供的分子标志物能够判断肝细胞癌(hcc)和评估其预后不良风险,因此能够筛选总体生存期较短、预后较不理想的肝细胞癌患者,将该分子标志物作为预后预测指标,可用于评估hcc患者的免疫状态和免疫治疗的效果,以提高治疗效果,实现肝细胞癌的个体化精准诊疗。
3、根据本发明的另一个方面,提供一种肝细胞癌预后评估的模型,包括n-糖基化修饰相关基因,n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165;肝细胞癌预后评估的模型如下:风险评分=(0.191183173963103*ddost基因的表达水平)+(0.174577573840935*stt3a基因的表达水平)+(0.191131082938155*tmem165基因的表达水平)。
4、根据本发明的另一个方面,提供上述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
5、优选地,上述制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用包括:以肝细胞癌患者的风险评分的中位数作为中位风险评分,根据中位风险评分将肝细胞癌患者分为高风险组和低风险组;若肝细胞癌患者的风险评分低于中位风险评分,则该肝细胞癌患者属于低风险组;若肝细胞癌患者的风险评分高于中位风险评分,则该肝细胞癌患者属于高风险组。本发明所提供的肝细胞癌预后评估的模型能够根据风险评分将肝细胞癌患者分为高、低风险组,高风险组的患者预后明显较差,低风险组的患者预后明显较好。因此,由n-糖基化修饰相关基因构成的预后评估模型基于生物标志物的表达水平,可以预测肝癌患者的预后、icis治疗的疗效。
6、优选地,高风险组的总体生存期低于低风险组。
7、优选地,高风险组的免疫细胞的浸润水平高于低风险组;高风险组的免疫相关通路的激活水平高于低风险组;高风险组的免疫检查点基因的表达量高于低风险组。
8、优选地,免疫检查点基因包括cd274、pdcd1、ctla4、havcr2、hhla2、ido1、pdcd1lg2、tigit。
9、优选地,高风险组的免疫检查点抑制剂治疗应答差于低风险组;高风险组的无进展生存期低于低风险组。
10、根据本发明的另一个方面,提供上述肝细胞癌预后评估的标志物在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
11、根据本发明的另一个方面,提供特异性检测上述肝细胞癌预后评估的标志物的试剂在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
12、根据本发明的另一个方面,提供一种肝细胞癌预后评估的产品,包括特异性检测肝细胞癌预后评估的标志物的试剂,肝细胞癌预后评估的标志物包括n-糖基化修饰相关基因,n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165。
1.一种肝细胞癌预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物包括n-糖基化修饰相关基因,所述n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165。
2.一种肝细胞癌预后评估的模型,其特征在于,包括n-糖基化修饰相关基因,所述n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165;
3.如权利要求2所述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
4.如权利要求3所述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用,其特征在于,包括以肝细胞癌患者的所述风险评分的中位数作为中位风险评分,根据所述中位风险评分将所述肝细胞癌患者分为高风险组和低风险组;
5.如权利要求4所述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用,其特征在于,所述高风险组的总体生存期低于所述低风险组。
6.如权利要求4所述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用,其特征在于,所述高风险组的免疫细胞的浸润水平高于所述低风险组;所述高风险组的免疫相关通路的激活水平高于所述低风险组;所述高风险组的免疫检查点基因的表达量高于所述低风险组。
7.如权利要求4所述肝细胞癌预后评估的模型在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用,其特征在于,所述高风险组的免疫检查点抑制剂治疗应答差于所述低风险组;所述高风险组的无进展生存期低于所述低风险组。
8.如权利要求1所述肝细胞癌预后评估的标志物在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
9.特异性检测如权利要求1所述肝细胞癌预后评估的标志物的试剂在制备肝细胞癌预后评估的产品中的应用。
10.一种肝细胞癌预后评估的产品,其特征在于,包括特异性检测肝细胞癌预后评估的标志物的试剂,所述肝细胞癌预后评估的标志物包括n-糖基化修饰相关基因,所述n-糖基化修饰相关基因包括stt3a、ddost和tmem165。