一种基因检测结果的自动解析方法及装置与流程

本发明涉及一种基因检测结果的自动解析方法及装置，属于数据处理领域。

背景技术：

1、基因检测是一种重要的生物医学实验室应用，它涉及到分析和解释个体基因信息，通常需要记录和管理大量待检测基因的信息以及与之相关的样本信息。

2、传统基因检测过程中，需要手动输入或记录基因信息、样本信息和条形码信息，这可能导致数据录入错误和效率低下，此外，现有的条形码扫描技术可以用于自动识别和记录条形码信息，但如果扫描失败，需要采取其他方法以确保数据的可追溯性。

技术实现思路

1、本发明提供一种基因检测结果的自动解析方法、装置、电子设备及存储介质，其主要目的在于提高基因检测过程的效率，减少手工录入的错误率并提高数据的可追溯性。

2、为实现上述目的，本发明提供的一种基因检测结果的自动解析方法，包括：

3、接收记载待检测基因的基因信息的加样表，其中，加样表还包括条形码；

4、启动条形码扫码球，其中所述条形码扫码球包括扫描器和拍照器，利用所述条形码扫码球的扫描器扫描加样表中的条形码；

5、查看是否识别出所述条形码，若未识别出所述条形码，启动所述拍照器拍摄条形码，得到加样表拍摄图；

6、对所述加样表拍摄图执行图片清晰化处理，得到加样表清晰图；

7、将加样表清晰图保存至预先构建的基因检测管理系统后，在基因检测管理系统中手动输入条形码；

8、当完成手动输入条形码后，利用基因检测管理系统确认该加样表是否需复查，若需复查则标记加样表，得到复查表，并将复查表反馈至用户处理；

9、若不需复查则对该加样表执行建档处理，得到建档表及对应的建档号后，将建档表中待检测基因的基因信息发送至基因检测仪器，并接收基因检测仪器对该待检测基因的检测结果；

10、根据建档号将检测结果加入至建档表，并生成检测结果的检测号，将检测号及建档号发给用户，完成基因检测结果的自动解析。

11、可选地，若识别出所述条形码，则直接将条形码的识别结果导入至基因检测管理系统中；

12、当导入至基因检测管理系统成功后，基于所述识别结果判断在基因检测管理系统中是否已存有加样表；

13、若在基因检测管理系统中未存有加样表，则获取加样表的所有内容，并直接执行建档处理，得到建档表及对应的建档号。

14、可选地，所述对所述加样表拍摄图执行图片清晰化处理，得到加样表清晰图，包括：

15、从加样表拍摄图中提取出条形码拍摄图，并利用数字图像处理对条形码拍摄图执行第一清晰化处理，得到条形码的第一清晰图，其中，数字图像处理包括直方图均衡化；

16、建立第一清晰图的参考坐标系，并将第一清晰图投射至参考坐标系后，在参考坐标系中计算第一清晰图的灰度分布概率密度函数；

17、求解所述灰度分布概率密度函数，得到第一清晰图每个像素点的灰度值，汇总每个灰度值得到条形码灰度图；

18、接收根据条形码灰度图大小自适应生成的像素卷积框，将所述像素卷积框按照从左下方至右上方的规则依次放置至所述条形码灰度图，并每放置一次矩形卷积框均进行卷积运算，得到以像素卷积框为积分区域的像素值；

19、汇集得到以像素卷积框为积分区域的所有像素值后得到所述加样表清晰图。

20、可选地，所述在参考坐标系中计算第一清晰图的灰度分布概率密度函数，包括：

21、

22、

23、其中，(x，y)表示第一清晰图在二维坐标系的像素坐标，p(zxy)为灰度分布概率密度函数，zxy表示坐标(x，y)经过灰度分布计算得到的像素值，s为第一清晰图在二维坐标系的图片面积，d为用户自定义的以(x，y)为中心的正方形积分区域，σ2为以(x，y)为中心的正方形积分区域所满足的像素高斯分布的方差。

24、可选地，所述每放置一次矩形卷积框均进行卷积运算，得到以像素卷积框为积分区域的像素值，包括：

25、采用如下卷积运算的计算方法：

26、

27、

28、其中，mxy表示坐标(x，y)下以像素卷积框为积分区域的像素值，f(zxy)表示像素卷积框的像素优化函数，d表示像素卷积框，(x1，x2，y1，y2)表示像素卷积框的边界，ξ表示除坐标(x，y)外像素卷积框内的其他所有像素点，θ为像素优化函数的调节因子，σd表示像素卷积框内所有像素点的方差，d(ξ，zxy)表示像素卷积框内的其他所有像素点与经过灰度分布计算得到的像素值zxy的像素差值。

29、可选地，所述将加样表清晰图保存至预先构建的基因检测管理系统后，在基因检测管理系统中手动输入条形码，包括：

30、将加样表清晰图保存至基因检测管理系统，并当保存成功后，获取发送本次待检测基因的加样表的发送端，及发送端的发送地址；

31、基于所述发送地址将加样表清晰图发送至发送端；

32、接收发送端重新发送的条形码，其中，重新发送的条形码可以是未识别出条形码的清晰版本，也可以是直接替换的条形码；

33、当成功接收到发送端重新发送的条形码后，利用条形码扫码球的扫描器自动执行识别，得到条形码识别结果，并同时生成手动输入指令发送至用户；

34、接收用户根据重新发送的条形码手动输入的条形码手动结果，判断条形码手动结果和条形码识别结果是否一致，若不一致生成条形码更换失败指令，提醒用户重新操作；

35、若一致生成条形码入库成功指令，完成加样表入库至基因检测管理系统。

36、可选地，所述利用基因检测管理系统确认该加样表是否需复查，包括：

37、启动基因检测管理系统中的文本相似度判断模型，其中，文本相似度判断模型由lstm及bert模型组成；

38、基于文本相似度判断模型在基因检测管理系统中，选择出与加样表相似度最高的入库表；

39、并将入库表发送至本次待检测基因的加样表的所述发送端；

40、接收发送端根据入库表与加样表相似度所回传的回传指令，其中，回传指令中包括是否需复查的确认信息。

41、可选地，所述将建档表中待检测基因的基因信息发送至基因检测仪器，包括：

42、获取该基因检测仪器的型号，并根据该基因检测仪器的型号确认可接收的文件格式及文件型别；

43、生成满足该文件格式及文件型别的空文件；

44、将所述加样表的内容填充至空文件得到用于基因检测仪器使用的检测文件，其中内容包括待检测基因的基因信息；

45、将所述检测文件发送至基因检测仪器。

46、可选地，所述根据建档号将检测结果加入至建档表，包括：

47、根据检测结果生成结果文件，将结果文件传输至基因检测管理系统中，并判断结果文件的格式是否满足基因检测管理系统中预先规定的要求；

48、若结果文件的格式不满足基因检测管理系统中预先规定的要求，则拒绝接收结果文件；

49、直至结果文件的格式满足基因检测管理系统中预先规定的要求后，接收结果文件并根据结果文件和建档表生成基因检测报告，其中，基因检测报告内包括基因信息、实验参数、试验设计、基因检测仪器参数及检测结果。

50、为了解决上述问题，本发明还提供一种基因检测结果的自动解析装置，所述装置包括：

51、条形码扫描模块，用于接收记载待检测基因的基因信息的加样表，其中，加样表还包括条形码，启动条形码扫码球，其中所述条形码扫码球包括扫描器和拍照器，利用所述条形码扫码球的扫描器扫描加样表中的条形码；

52、条形码拍摄模块，用于查看是否识别出所述条形码，若未识别出所述条形码，启动所述拍照器拍摄条形码，得到加样表拍摄图，对所述加样表拍摄图执行图片清晰化处理，得到加样表清晰图并发查询，得到每个所述导出数据组的导出数据；

53、基因检测模块，用于将加样表清晰图保存至预先构建的基因检测管理系统后，在基因检测管理系统中手动输入条形码，当完成手动输入条形码后，利用基因检测管理系统确认该加样表是否需复查，若需复查则标记加样表，得到复查表，并将复查表反馈至用户处理，若不需复查则对该加样表执行建档处理，得到建档表及对应的建档号后，将建档表中待检测基因的基因信息发送至基因检测仪器，并接收基因检测仪器对该待检测基因的检测结果，根据建档号将检测结果加入至建档表，并生成检测结果的检测号，将检测号及建档号发给用户，完成基因检测结果的自动解析。

54、为了解决上述问题，本发明还提供一种电子设备，所述电子设备包括：

55、至少一种处理器；以及，

56、与所述至少一个处理器通信连接的存储器；其中，

57、所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令，所述指令被所述至少一个处理器执行，以实现上述所述的基因检测结果的自动解析方法。

58、为了解决上述问题，本发明还提供一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质中存储有至少一个指令，所述至少一个指令被电子设备中的处理器执行以实现上述所述的基因检测结果的自动解析方法。

59、相比于背景技术所述问题，本发明实施例首先接收记载待检测基因的基因信息的加样表，其中，加样表还包括条形码，启动条形码扫码球，其中所述条形码扫码球包括扫描器和拍照器，利用所述条形码扫码球的扫描器扫描加样表中的条形码，查看是否识别出所述条形码，若未识别出所述条形码，启动所述拍照器拍摄条形码，得到加样表拍摄图，对所述加样表拍摄图执行图片清晰化处理，得到加样表清晰图，传统基因检测中，数据记录和识别需要手动进行，容易出现错误。权利要求1中的技术使用条形码扫码球自动识别和记录条形码信息，从而消除了手动数据输入的错误和繁琐性，提高了数据记录的准确性和效率，然后当扫描器无法成功识别条形码时，权利要求1中的技术利用拍照器拍摄条形码并进行图像处理，确保获取清晰的条形码信息。这种方法提供了一种备用的方式来解决扫描失败的情况，从而保证了数据的可追溯性；进一步地，将加样表清晰图保存至预先构建的基因检测管理系统后，在基因检测管理系统中手动输入条形码，当完成手动输入条形码后，利用基因检测管理系统确认该加样表是否需复查，若需复查则标记加样表，得到复查表，并将复查表反馈至用户处理，若不需复查则对该加样表执行建档处理，得到建档表及对应的建档号后，将建档表中待检测基因的基因信息发送至基因检测仪器，并接收基因检测仪器对该待检测基因的检测结果，由于基因检测管理系统可以协助用户判断是否需要进行复查。如果需要，系统生成复查表，从而提供了对潜在问题的警示和处理。对于不需要复查的样本，系统自动执行建档处理，确保数据的完整性和组织，即最后，根据建档号将检测结果加入至建档表，并生成检测结果的检测号，将检测号及建档号发给用户，完成基因检测结果的自动解析，可见基因检测结果的自动解析和记录能够大大减少人工干预，确保结果数据的准确性和可追溯性。这有助于加速实验室工作流程，减少错误，因此本发明提出的基因检测结果的自动解析方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质，其主要目的在于提高基因检测过程的效率，减少手工录入的错误率并提高数据的可追溯性。