本公开涉及人工智能,具体涉及生物计算,尤其涉及一种抗体序列的确定方法、装置、电子设备及存储介质。
背景技术:
1、大分子药物具有高度的靶向性和特异性,大分子药物设计旨在开发具有治疗潜力的生物大分子,如蛋白质、抗体、核酸等。但目前对于抗体药物的设计依赖于湿实验发,研发成本较高,且效率低下。
技术实现思路
1、本公开提供了一种用于抗体序列的确定方法、装置、电子设备及存储介质。
2、根据本公开的一方面,提供了一种抗体序列的确定方法,包括:从抗原序列的参考抗体序列开始,对所述参考抗体序列进行迭代优化;针对第i+1次迭代,获取所述抗原序列和第i次迭代出的抗体序列i的复合体构象i,其中,i为大于或者等于1的自然数;根据所述复合体构象i,获取所述抗体序列i的抗体属性,并对所述抗体序列i的抗体属性进行期望验证;若所述抗体序列i的抗体属性通过期望验证,确定所述抗体序列i为所述抗原序列的目标抗体序列;若所述抗体序列i的抗体属性未通过期望验证,基于所述参考抗体序列确定抗体序列i+1,并继续执行第i+2次迭代。
3、根据本公开的另一方面,提供了一种抗体序列的确定装置,包括:第一迭代优化模块,用于从抗原序列的参考抗体序列开始,对所述参考抗体序列进行迭代优化;获取模块,用于针对第i+1次迭代,获取所述抗原序列和第i次迭代出的抗体序列i的复合体构象i,其中,i为大于或者等于1的自然数;验证模块,用于根据所述复合体构象i,获取所述抗体序列i的抗体属性,并对所述抗体序列i的抗体属性进行期望验证;输出模块,用于若所述抗体序列i的抗体属性通过期望验证,确定所述抗体序列i为所述抗原序列的目标抗体序列;第二迭代优化模块,用于若所述抗体序列i的抗体属性未通过期望验证,基于所述参考抗体序列确定抗体序列i+1,并继续执行第i+2次迭代。
4、根据本公开的另一方面,提供了一种电子设备,包括:至少一个处理器;以及与所述至少一个处理器通信连接的存储器;其中,所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令,所述指令被所述至少一个处理器执行,以使所述至少一个处理器能够执行上述一方面实施例所述的抗体序列的确定方法。
5、根据本公开另一方面,提供了一种存储有计算机指令的非瞬时计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序/指令,所述计算机指令用于使所述计算机执行上述一方面实施例所述的抗体序列的确定方法。
6、根据本公开的另一方面,提供了一种计算机程序产品,包括计算机程序/指令,所述计算机程序/指令被处理器执行时实现上述一方面实施例所述的抗体序列的确定方法。
7、应当理解,本部分所描述的内容并非旨在标识本公开的实施例的关键或重要特征,也不用于限制本公开的范围。本公开的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
1.一种抗体序列的确定方法,其中,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述获取所述抗原序列和第i次迭代出的抗体序列i的复合体构象i,包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述复合体构象i,获取所述抗体序列i的抗体属性,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述复合体构象i,获取所述抗体序列i的抗体属性,包括:
5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述对所述抗体序列i的抗体属性进行期望验证,包括:
6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述抗体序列i的抗体属性至少包括抗体与抗原的亲和力和抗体免疫原性。
7.根据权利要求5所述的方法,其中,所述对所述抗体序列i的抗体属性进行验证之后,还包括:
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中,所述基于所述参考抗体序列确定抗体序列i+1,包括:
9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述基于所述参考抗体序列生成至少一个候选抗体序列,包括:
10.根据权利要求8所述的方法,其中,所述从所述至少一个候选抗体序列中选取一个或多个抗体序列,作为所述抗体序列i+1,包括:
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述基于所述候选抗体序列的属性概率分布,从所述至少一个候选抗体序列中选取所述抗体序列i+1,包括:
12.一种抗体序列的确定装置,其中,所述装置包括:
13.根据权利要求12所述的装置,其中,所述获取模块,还用于:
14.根据权利要求12所述的装置,其中,所述验证模块,还用于:
15.根据权利要求12所述的装置,其中,所述验证模块,还用于:
16.根据权利要求12所述的装置,其中,所述验证模块,还用于:
17.根据权利要求16所述的装置,其中,所述抗体序列i的抗体属性至少包括抗体与抗原的亲和力和抗体免疫原性。
18.根据权利要求16所述的装置,其中,所述验证模块,还用于:
19.根据权利要求12-18中任一项所述的装置,其中,所述第二迭代优化模块,还用于:
20.根据权利要求19所述的装置,其中,所述第二迭代优化模块,还用于:
21.根据权利要求19所述的装置,其中,所述第二迭代优化模块,还用于:
22.根据权利要求21所述的装置,其中,所述第二迭代优化模块,还用于:
23.一种电子设备,包括:
24.一种存储有计算机指令的非瞬时计算机可读存储介质,其中,所述计算机指令用于使所述计算机执行根据权利要求1-11中任一项所述的方法。
25.一种计算机程序产品,包括计算机程序/指令,其特征在于,该计算机程序/指令被处理器执行时实现权利要求1-11中任一项所述的方法。